SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PfGW456L13_84 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_84 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
30% identity, 83% coverage: 49:290/290 of query aligns to 4:254/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
I
 
I
L
 
L
T
 
R
L
 
T
E
 
E
D
 
N
I
 
I
S
 
V
V
 
K
S
 
Y
F
|
F
D
 
G
G
 
E
F
|
F
R
 
K
A
 
A
L
 
L
N
 
D
N
 
G
L
 
V
N
 
S
L
 
I
Y
 
S
I
 
V
G
 
N
V
 
K
G
 
G
E
 
D
L
 
V
R
 
T
C
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
M
 
I
D
 
N
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
K
 
F
T
 
L
R
 
K
P
 
A
S
 
D
H
 
E
G
 
G
K
 
R
A
 
V
W
 
Y
F
 
F
G
 
-
E
 
E
T
 
N
L
 
K
D
 
D
L
 
I
T
 
T
Q
 
N
M
 
K
S
 
E
E
 
P
V
 
A
Q
 
E
I
 
L
A
 
Y
Q
 
H
A
 
Y
G
 
G
I
 
I
G
 
V
R
 
R
K
 
T
F
 
F
Q
 
Q
K
 
T
P
 
P
T
 
Q
V
 
P
F
 
L
E
 
K
A
 
E
L
 
M
S
 
T
V
 
V
F
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
L
E
 
L
L
 
I
A
 
G
Q
 
E
K
 
I
T
 
C
D
 
P
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
P
-
 
L
K
 
N
S
 
S
V
 
L
W
 
F
A
 
Y
S
 
K
L
 
K
R
 
W
A
 
I
R
 
P
L
 
K
S
 
E
G
 
E
E
 
E
Q
 
M
K
 
V
D
 
E
R
 
K
I
 
A
A
 
F
Q
 
K
V
 
I
L
 
L
D
 
E
T
 
F
I
 
L
R
 
K
L
 
L
T
 
S
S
 
H
S
 
L
V
 
Y
N
 
D
R
 
R
P
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
E
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
M
Q
 
K
F
 
L
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
M
 
R
L
 
A
L
 
L
M
 
M
Q
 
T
D
 
N
P
 
P
Q
 
K
L
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
T
 
A
D
 
P
A
 
G
E
 
-
T
 
-
E
 
-
F
 
L
T
 
A
A
 
H
E
 
D
L
 
I
F
 
F
K
 
N
S
 
H
L
 
V
-
 
L
-
 
E
-
 
L
-
 
K
A
 
A
G
 
K
K
 
G
H
 
I
S
 
T
L
 
F
M
 
L
V
 
I
V
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
G
 
D
F
 
I
V
 
V
G
 
L
S
 
N
I
 
Y
A
 
I
D
 
D
H
 
H
V
 
L
T
 
Y
V
 
V
L
 
M
H
 
F
Q
 
N
G
 
G
S
 
Q
V
 
I
L
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
E
S
 
E
L
 
I
E
 
K
Q
 
N
V
 
V
Q
 
L
D
 
S
N
 
D
E
 
P
R
 
K
V
 
V
I
 
V
E
 
E
V
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G
R
 
E

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
30% identity, 83% coverage: 49:289/290 of query aligns to 4:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
I
 
I
L
 
L
T
 
R
L
 
T
E
 
E
D
 
N
I
 
I
S
 
V
V
 
K
S
 
Y
F
|
F
D
 
G
G
 
E
F
|
F
R
 
K
A
 
A
L
 
L
N
 
D
N
 
G
L
 
V
N
 
S
L
 
I
Y
 
S
I
 
V
G
 
C
V
 
K
G
 
G
E
 
D
L
 
V
R
 
T
C
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
M
 
I
D
 
N
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
K
 
F
T
 
L
R
 
K
P
 
A
S
 
D
H
 
E
G
 
G
K
 
R
A
 
V
W
 
Y
F
 
F
G
 
-
E
 
E
T
 
N
L
 
K
D
 
D
L
 
I
T
 
T
Q
 
N
M
 
K
S
 
E
E
 
P
V
 
A
Q
 
E
I
 
L
A
 
Y
Q
 
H
A
 
Y
G
 
G
I
 
I
G
 
V
R
 
R
K
 
T
F
 
F
Q
 
Q
K
 
T
P
 
P
T
 
Q
V
 
P
F
 
L
E
 
K
A
 
E
L
 
M
S
 
T
V
 
V
F
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
L
E
 
L
L
 
I
A
 
G
Q
 
E
K
 
I
T
 
N
D
 
P
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
P
-
 
L
K
 
N
S
 
S
V
 
L
W
 
F
A
 
Y
S
 
K
L
 
K
R
 
W
A
 
I
R
 
P
L
 
K
S
 
E
G
 
E
E
 
E
Q
 
M
K
 
V
D
 
E
R
 
K
I
 
A
A
 
F
Q
 
K
V
 
I
L
 
L
D
 
E
T
 
F
I
 
L
R
 
K
L
 
L
T
 
S
S
 
H
S
 
L
V
 
Y
N
 
D
R
 
R
P
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
E
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
M
Q
 
K
F
 
L
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
M
 
R
L
 
A
L
 
L
M
 
M
Q
 
T
D
 
N
P
 
P
Q
 
K
L
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
V
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
T
 
A
D
 
P
A
 
G
E
 
-
T
 
-
E
 
-
F
 
L
T
 
A
A
 
H
E
 
D
L
 
I
F
 
F
K
 
N
S
 
H
L
 
V
-
 
L
-
 
E
-
 
L
-
 
K
A
 
A
G
 
K
K
 
G
H
 
I
S
 
T
L
 
F
M
 
L
V
 
I
V
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
G
 
D
F
 
I
V
 
V
G
 
L
S
 
N
I
 
Y
A
 
I
D
 
D
H
 
H
V
 
L
T
 
Y
V
 
V
L
 
M
H
 
F
Q
 
N
G
 
G
S
 
Q
V
 
I
L
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
E
S
 
E
L
 
I
E
 
K
Q
 
N
V
 
V
Q
 
L
D
 
S
N
 
D
E
 
P
R
 
K
V
 
V
I
 
V
E
 
E
V
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

1oxvD Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
33% identity, 77% coverage: 64:286/290 of query aligns to 20:237/353 of 1oxvD

query
sites
1oxvD
A
 
A
L
 
L
N
 
D
N
 
N
L
 
V
N
 
N
L
 
I
Y
 
N
I
 
I
G
 
E
V
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
R
R
 
F
C
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
F
M
 
M
D
 
R
V
 
I
I
 
I
T
 
A
G
 
G
K
 
L
T
 
D
R
 
V
P
 
P
S
 
S
H
 
T
G
 
G
K
 
E
A
 
L
W
 
Y
F
 
F
G
 
D
E
 
D
T
 
R
L
 
L
D
 
V
L
 
A
T
 
S
Q
 
N
M
 
G
S
 
K
E
 
L
V
 
I
Q
 
V
I
 
P
A
 
P
Q
 
E
-
 
D
A
 
R
G
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
M
K
 
V
F
 
F
Q
|
Q
K
 
T
P
 
W
T
 
A
V
 
L
F
 
Y
E
 
P
A
 
N
L
 
L
S
 
T
V
 
A
F
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
I
E
 
A
L
 
F
A
 
P
Q
 
L
K
 
T
T
 
N
D
 
M
K
 
K
S
 
M
V
 
S
W
 
K
A
 
E
S
 
E
L
 
I
R
 
R
A
 
K
R
 
R
L
 
V
S
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
-
K
 
-
D
 
E
R
 
E
I
 
V
A
 
A
Q
 
K
V
 
I
L
 
L
D
 
D
T
 
I
I
 
H
R
 
H
L
 
V
T
 
L
S
 
N
S
 
H
V
 
F
N
 
P
R
 
R
P
 
E
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
F
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
G
 
A
M
 
R
L
 
A
L
 
L
M
 
V
Q
 
K
D
 
D
P
 
P
Q
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
V
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
T
 
D
D
 
A
A
 
R
E
 
M
T
 
R
E
 
D
F
 
S
T
 
A
A
 
R
E
 
A
L
 
L
F
 
V
K
 
K
S
 
E
L
 
V
A
 
Q
G
 
S
K
 
R
H
 
L
-
 
G
-
 
V
S
 
T
L
 
L
M
 
L
V
 
V
V
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
G
 
A
F
 
D
V
 
I
G
 
F
S
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
H
 
R
V
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
H
 
V
Q
 
K
G
 
G
S
 
K
V
 
L
L
 
V
A
 
Q
E
 
V
G
 
G
S
 
K
L
 
P
E
 
E
Q
 
D
V
 
L
Q
 
Y
D
 
D
N
 
N
E
 
P
R
 
V
V
 
S
I
 
I
E
 
Q
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1oxvA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
33% identity, 77% coverage: 64:286/290 of query aligns to 20:237/353 of 1oxvA

query
sites
1oxvA
A
 
A
L
 
L
N
 
D
N
 
N
L
 
V
N
 
N
L
 
I
Y
 
N
I
 
I
G
 
E
V
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
R
R
 
F
C
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
F
M
 
M
D
 
R
V
 
I
I
 
I
T
 
A
G
 
G
K
 
L
T
 
D
R
 
V
P
 
P
S
 
S
H
 
T
G
 
G
K
 
E
A
 
L
W
 
Y
F
 
F
G
 
D
E
 
D
T
 
R
L
 
L
D
 
V
L
 
A
T
 
S
Q
 
N
M
 
G
S
 
K
E
 
L
V
 
I
Q
 
V
I
 
P
A
 
P
Q
 
E
-
 
D
A
 
R
G
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
M
K
 
V
F
 
F
Q
 
Q
K
 
T
P
 
W
T
 
A
V
 
L
F
 
Y
E
 
P
A
 
N
L
 
L
S
 
T
V
 
A
F
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
I
E
 
A
L
 
F
A
 
P
Q
 
L
K
 
T
T
 
N
D
 
M
K
 
K
S
 
M
V
 
S
W
 
K
A
 
E
S
 
E
L
 
I
R
 
R
A
 
K
R
 
R
L
 
V
S
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
-
K
 
-
D
 
E
R
 
E
I
 
V
A
 
A
Q
 
K
V
 
I
L
 
L
D
 
D
T
 
I
I
 
H
R
 
H
L
 
V
T
 
L
S
 
N
S
 
H
V
 
F
N
 
P
R
 
R
P
 
E
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
F
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
G
 
A
M
 
R
L
 
A
L
 
L
M
 
V
Q
 
K
D
 
D
P
 
P
Q
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
V
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
T
 
D
D
 
A
A
 
R
E
 
M
T
 
R
E
 
D
F
 
S
T
 
A
A
 
R
E
 
A
L
 
L
F
 
V
K
 
K
S
 
E
L
 
V
A
 
Q
G
 
S
K
 
R
H
 
L
-
 
G
-
 
V
S
 
T
L
 
L
M
 
L
V
 
V
V
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
G
 
A
F
 
D
V
 
I
G
 
F
S
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
H
 
R
V
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
H
 
V
Q
 
K
G
 
G
S
 
K
V
 
L
L
 
V
A
 
Q
E
 
V
G
 
G
S
 
K
L
 
P
E
 
E
Q
 
D
V
 
L
Q
 
Y
D
 
D
N
 
N
E
 
P
R
 
V
V
 
S
I
 
I
E
 
Q
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1oxuA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
33% identity, 77% coverage: 64:286/290 of query aligns to 20:237/353 of 1oxuA

query
sites
1oxuA
A
|
A
L
 
L
N
 
D
N
 
N
L
 
V
N
 
N
L
 
I
Y
 
N
I
 
I
G
 
E
V
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
R
R
 
F
C
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
F
M
 
M
D
 
R
V
 
I
I
 
I
T
 
A
G
 
G
K
 
L
T
 
D
R
 
V
P
 
P
S
 
S
H
 
T
G
 
G
K
 
E
A
 
L
W
 
Y
F
 
F
G
 
D
E
 
D
T
 
R
L
 
L
D
 
V
L
 
A
T
 
S
Q
 
N
M
 
G
S
 
K
E
 
L
V
 
I
Q
 
V
I
 
P
A
 
P
Q
 
E
-
 
D
A
 
R
G
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
M
K
 
V
F
 
F
Q
 
Q
K
 
T
P
 
W
T
 
A
V
 
L
F
 
Y
E
 
P
A
 
N
L
 
L
S
 
T
V
 
A
F
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
I
E
 
A
L
 
F
A
 
P
Q
 
L
K
 
T
T
 
N
D
 
M
K
 
K
S
 
M
V
 
S
W
 
K
A
 
E
S
 
E
L
 
I
R
 
R
A
 
K
R
 
R
L
 
V
S
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
-
K
 
-
D
 
E
R
 
E
I
 
V
A
 
A
Q
 
K
V
 
I
L
 
L
D
 
D
T
 
I
I
 
H
R
 
H
L
 
V
T
 
L
S
 
N
S
 
H
V
 
F
N
 
P
R
 
R
P
 
E
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
F
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
G
 
A
M
 
R
L
 
A
L
 
L
M
 
V
Q
 
K
D
 
D
P
 
P
Q
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
T
 
D
D
 
A
A
 
R
E
 
M
T
 
R
E
 
D
F
 
S
T
 
A
A
 
R
E
 
A
L
 
L
F
 
V
K
 
K
S
 
E
L
 
V
A
 
Q
G
 
S
K
 
R
H
 
L
-
 
G
-
 
V
S
 
T
L
 
L
M
 
L
V
 
V
V
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
G
 
A
F
 
D
V
 
I
G
 
F
S
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
H
 
R
V
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
H
 
V
Q
 
K
G
 
G
S
 
K
V
 
L
L
 
V
A
 
Q
E
 
V
G
 
G
S
 
K
L
 
P
E
 
E
Q
 
D
V
 
L
Q
 
Y
D
 
D
N
 
N
E
 
P
R
 
V
V
 
S
I
 
I
E
 
Q
V
 
V

Sites not aligning to the query:

Q97UY8 Glucose import ATP-binding protein GlcV; EC 7.5.2.- from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
33% identity, 77% coverage: 64:286/290 of query aligns to 20:237/353 of Q97UY8

query
sites
Q97UY8
A
 
A
L
 
L
N
 
D
N
 
N
L
 
V
N
 
N
L
 
I
Y
 
N
I
 
I
G
 
E
V
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
R
R
 
F
C
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
F
M
 
M
D
 
R
V
 
I
I
 
I
T
 
A
G
 
G
K
 
L
T
 
D
R
 
V
P
 
P
S
 
S
H
 
T
G
 
G
K
 
E
A
 
L
W
 
Y
F
 
F
G
 
D
E
 
D
T
 
R
L
 
L
D
 
V
L
 
A
T
 
S
Q
 
N
M
 
G
S
 
K
E
 
L
V
 
I
Q
 
V
I
 
P
A
 
P
Q
 
E
-
 
D
A
 
R
G
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
M
K
 
V
F
 
F
Q
 
Q
K
 
T
P
 
W
T
 
A
V
 
L
F
 
Y
E
 
P
A
 
N
L
 
L
S
 
T
V
 
A
F
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
I
E
 
A
L
 
F
A
 
P
Q
 
L
K
 
T
T
 
N
D
 
M
K
 
K
S
 
M
V
 
S
W
 
K
A
 
E
S
 
E
L
 
I
R
 
R
A
 
K
R
 
R
L
 
V
S
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
-
K
 
-
D
 
E
R
 
E
I
 
V
A
 
A
Q
 
K
V
 
I
L
 
L
D
 
D
T
 
I
I
 
H
R
 
H
L
 
V
T
 
L
S
 
N
S
 
H
V
 
F
N
 
P
R
 
R
P
 
E
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
L
S
|
S
H
 
G
G
|
G
Q
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
F
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
G
 
A
M
 
R
L
 
A
L
 
L
M
 
V
Q
 
K
D
 
D
P
 
P
Q
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
V
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
T
 
D
D
 
A
A
 
R
E
 
M
T
 
R
E
 
D
F
 
S
T
 
A
A
 
R
E
 
A
L
 
L
F
 
V
K
 
K
S
 
E
L
 
V
A
 
Q
G
 
S
K
 
R
H
 
L
-
 
G
-
 
V
S
 
T
L
 
L
M
 
L
V
 
V
V
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
G
 
A
F
 
D
V
 
I
G
 
F
S
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
H
 
R
V
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
H
 
V
Q
 
K
G
 
G
S
 
K
V
 
L
L
 
V
A
 
Q
E
 
V
G
 
G
S
 
K
L
 
P
E
 
E
Q
 
D
V
 
L
Q
 
Y
D
 
D
N
 
N
E
 
P
R
 
V
V
 
S
I
 
I
E
 
Q
V
 
V

5x40A Structure of a cbio dimer bound with amppcp (see paper)
32% identity, 83% coverage: 49:288/290 of query aligns to 4:239/280 of 5x40A

query
sites
5x40A
I
 
I
L
 
L
T
 
A
L
 
A
E
 
E
D
 
A
I
 
L
S
 
T
V
 
Y
S
 
A
F
|
F
D
 
P
G
 
G
-
 
G
F
x
V
R
 
K
A
|
A
L
 
L
N
 
D
N
 
D
L
 
L
N
 
S
L
 
L
Y
 
A
I
 
V
G
 
P
V
 
K
G
 
G
E
 
E
L
 
S
R
 
L
C
 
A
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
M
 
L
D
 
L
V
 
H
I
 
L
T
 
N
G
 
G
K
 
T
T
 
L
R
 
R
P
 
P
S
 
Q
H
 
S
G
 
G
K
 
R
A
 
V
W
 
L
F
 
L
G
 
G
E
 
G
T
 
T
L
 
A
D
 
T
L
 
G
T
 
H
Q
 
S
M
 
R
S
 
K
E
 
D
V
 
L
Q
 
T
I
 
G
A
 
W
Q
 
R
A
 
R
G
 
R
I
 
V
G
 
G
R
 
L
K
 
V
F
 
L
Q
|
Q
K
 
D
P
 
A
-
 
D
-
 
D
T
 
Q
V
 
L
F
 
F
E
 
-
A
 
A
L
 
T
S
 
T
V
 
V
F
 
F
E
 
E
N
 
D
L
 
V
E
 
S
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
K
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
S
 
-
V
 
-
W
 
F
A
 
G
S
 
P
L
 
L
R
 
N
A
 
L
R
 
G
L
 
L
S
 
S
-
 
E
G
 
A
E
 
E
Q
 
A
K
 
R
D
 
A
R
 
R
I
 
V
A
 
E
Q
 
E
V
 
A
L
 
L
D
 
A
T
 
A
I
 
L
R
 
S
L
 
I
T
 
S
S
 
D
S
 
L
V
 
R
N
 
D
R
 
R
P
 
P
A
 
T
G
x
H
L
x
M
L
|
L
S
|
S
H
 
G
G
|
G
Q
|
Q
K
 
K
Q
 
R
F
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
A
M
 
G
L
 
A
L
 
V
M
 
A
Q
 
M
D
 
R
P
 
P
Q
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
P
 
P
V
 
T
A
 
A
G
 
G
M
 
L
T
 
D
D
 
L
A
 
A
E
 
G
T
 
T
E
 
E
F
 
Q
T
 
L
A
 
L
E
 
T
L
 
L
F
 
L
K
 
R
S
 
G
L
 
L
-
 
R
A
 
A
G
 
A
K
 
G
H
 
M
S
 
T
L
 
L
M
 
V
V
 
F
V
 
S
E
 
T
H
|
H
D
 
D
M
 
V
G
 
E
F
 
L
V
 
A
G
 
A
S
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
D
H
 
R
V
 
V
T
 
A
V
 
L
L
 
F
H
 
R
Q
 
T
G
 
G
S
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
E
G
 
G
S
 
A
L
 
A
E
 
E
Q
 
A
V
 
V
-
 
L
Q
 
S
D
 
D
N
 
R
E
 
A
R
 
T
V
 
L
I
 
A
E
 
K
V
 
V
Y
 
A
L
 
L

P04983 Ribose import ATP-binding protein RbsA; EC 7.5.2.7 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
29% identity, 83% coverage: 49:290/290 of query aligns to 4:240/501 of P04983

query
sites
P04983
I
 
L
L
 
L
T
 
Q
L
 
L
E
 
K
D
 
G
I
 
I
S
 
D
V
 
K
S
 
A
F
 
F
D
 
P
G
 
G
F
 
V
R
 
K
A
 
A
L
 
L
N
 
S
N
 
G
L
 
A
N
 
A
L
 
L
Y
 
N
I
 
V
G
 
Y
V
 
P
G
 
G
E
 
R
L
 
V
R
 
M
C
 
A
I
 
L
I
 
V
G
 
G
P
 
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
T
 
S
T
 
T
L
 
M
M
 
M
D
 
K
V
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
-
 
I
K
 
Y
T
 
T
R
 
R
P
 
D
S
 
A
H
 
G
G
 
T
K
 
L
A
 
L
W
 
W
F
 
L
G
 
G
E
 
K
T
 
E
L
 
T
D
 
T
L
 
F
T
 
T
Q
 
G
M
 
P
S
 
K
E
 
S
V
 
S
Q
 
Q
I
 
-
A
 
-
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
I
K
 
I
F
 
H
Q
 
Q
K
 
E
P
 
L
T
 
N
V
 
L
F
 
I
E
 
P
A
 
Q
L
 
L
S
 
T
V
 
I
F
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
I
-
 
F
-
 
L
-
 
G
-
 
R
E
 
E
L
 
F
A
 
V
Q
 
N
K
 
R
T
 
F
D
 
G
K
 
K
S
 
I
V
 
D
W
 
W
A
 
K
S
 
T
L
 
M
R
 
Y
A
 
A
R
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
E
K
 
A
D
 
D
R
 
K
I
 
L
A
 
L
Q
 
A
V
 
K
L
 
L
D
 
N
T
 
-
I
 
L
R
 
R
L
 
F
T
 
K
S
 
S
S
 
-
V
 
-
N
 
D
R
 
K
P
 
L
A
 
V
G
 
G
L
 
D
L
 
L
S
 
S
H
 
I
G
 
G
Q
 
D
K
 
Q
Q
 
Q
F
 
M
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
A
M
 
K
L
 
V
L
 
L
M
 
S
Q
 
F
D
 
E
P
 
S
Q
 
K
L
 
V
L
 
I
L
 
I
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
T
A
 
D
G
 
A
M
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
T
E
 
E
T
 
T
E
 
E
F
 
S
T
 
L
A
 
F
E
 
R
L
 
V
F
 
I
K
 
R
S
 
E
L
 
L
A
 
K
G
 
S
K
 
Q
-
 
G
H
 
R
S
 
G
L
 
I
M
 
V
V
 
Y
V
 
I
E
 
S
H
 
H
D
 
R
M
 
M
G
 
K
F
 
E
V
 
I
G
 
F
S
 
E
I
 
I
A
 
C
D
 
D
H
 
D
V
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
F
H
 
R
Q
 
D
G
 
G
S
 
Q
V
 
F
L
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
R
S
 
E
L
 
V
E
 
A
Q
 
S
V
 
L
Q
 
T
D
 
E
N
 
D
E
 
S
R
 
-
V
 
L
I
 
I
E
 
E
V
 
M
Y
 
M
L
 
V
G
 
G
R
 
R

1ji0A Crystal structure analysis of the abc transporter from thermotoga maritima
29% identity, 83% coverage: 49:289/290 of query aligns to 6:238/240 of 1ji0A

query
sites
1ji0A
I
 
V
L
 
L
T
 
E
L
 
V
E
 
Q
D
 
S
I
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
Y
F
x
Y
D
 
G
G
 
A
F
 
I
R
 
H
A
 
A
L
 
I
N
 
K
N
 
G
L
 
I
N
 
D
L
 
L
Y
 
K
I
 
V
G
 
P
V
 
R
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
R
 
V
C
 
T
I
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
M
 
L
D
 
S
V
 
A
I
 
I
T
 
A
G
 
G
K
 
L
T
 
V
R
 
R
P
 
A
S
 
Q
H
 
K
G
 
G
K
 
K
A
 
I
W
 
I
F
 
F
G
 
N
E
 
G
T
 
Q
L
 
-
D
 
D
L
 
I
T
 
T
Q
 
N
M
 
K
S
 
P
E
 
A
V
 
H
Q
 
V
I
 
I
A
 
N
Q
 
R
A
 
M
G
 
G
I
 
I
G
 
A
R
 
L
K
 
V
F
 
P
Q
x
E
K
 
G
P
 
R
T
 
R
V
 
I
F
 
F
E
 
P
A
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
V
F
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
L
E
 
M
L
 
M
A
 
G
Q
 
A
K
 
Y
T
 
N
D
 
R
K
 
K
S
 
D
V
 
-
W
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
-
K
 
K
D
 
E
R
 
G
I
 
I
A
 
K
Q
 
R
V
 
D
L
 
L
D
 
E
T
 
W
I
 
I
-
 
F
-
 
S
-
 
L
-
 
F
-
 
P
R
 
R
L
 
L
T
 
K
S
 
E
S
 
R
V
 
L
N
 
K
R
 
Q
P
 
L
A
 
G
G
 
G
L
 
T
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
Q
 
E
K
 
Q
Q
 
Q
F
 
M
L
 
L
E
 
A
I
 
I
G
 
G
M
 
R
L
 
A
L
 
L
M
 
M
Q
 
S
D
 
R
P
 
P
Q
 
K
L
 
L
L
 
L
L
 
M
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
V
 
S
A
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
A
D
 
P
A
 
I
E
 
L
T
 
V
E
 
S
F
 
E
T
 
V
A
 
F
E
 
E
L
 
V
F
 
I
K
 
Q
S
 
K
L
 
I
-
 
N
-
 
Q
A
 
E
G
 
G
K
 
T
H
 
T
S
 
I
L
 
L
M
 
L
V
 
V
V
 
E
E
 
Q
H
 
N
D
 
A
M
 
L
G
 
G
F
 
A
V
 
L
G
 
-
S
 
K
I
 
V
A
 
A
D
 
H
H
 
Y
V
 
G
T
 
Y
V
 
V
L
 
L
H
 
E
Q
 
T
G
 
G
S
 
Q
V
 
I
L
 
V
A
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
K
L
 
A
E
 
S
Q
 
E
V
 
L
Q
 
L
D
 
D
N
 
N
E
 
E
R
 
M
V
 
V
I
 
R
E
 
K
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
29% identity, 74% coverage: 62:277/290 of query aligns to 18:228/343 of P30750

query
sites
P30750
F
 
I
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
N
 
N
L
 
V
N
 
S
L
 
L
Y
 
H
I
 
V
G
 
P
V
 
A
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
R
 
Y
C
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
M
 
I
D
 
R
V
 
C
I
 
V
T
 
N
G
 
L
K
 
L
T
 
E
R
 
R
P
 
P
S
 
T
H
 
E
G
 
G
K
 
S
A
 
V
W
 
L
F
 
V
-
 
D
G
 
G
E
 
Q
T
 
E
L
 
L
D
 
T
L
 
T
T
 
L
Q
 
S
M
 
E
S
 
S
E
 
E
V
 
L
Q
 
T
I
 
K
A
 
A
Q
 
R
A
 
R
G
 
Q
I
 
I
G
 
G
R
 
M
K
 
I
F
 
F
Q
 
Q
K
 
H
P
 
F
T
 
N
V
 
L
F
 
L
E
 
S
A
 
S
L
 
R
S
 
T
V
 
V
F
 
F
E
 
G
N
 
N
L
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
P
Q
 
L
K
 
E
T
 
L
D
 
D
K
 
N
S
 
T
V
 
P
W
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
S
 
K
G
 
D
E
 
E
Q
 
V
K
 
K
D
 
R
R
 
R
I
 
V
A
 
T
Q
 
E
V
 
L
L
 
L
D
 
S
T
 
L
I
 
V
R
 
G
L
 
L
T
 
G
S
 
D
S
 
K
V
 
H
N
 
D
R
 
S
P
 
Y
A
 
P
G
 
S
L
 
N
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
F
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
A
M
 
R
L
 
A
L
 
L
M
 
A
Q
 
S
D
 
N
P
 
P
Q
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
V
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
T
 
D
D
 
P
A
 
A
E
 
T
T
 
T
E
 
R
F
 
S
T
 
I
A
 
L
E
 
E
L
 
L
F
 
L
K
 
K
S
 
D
L
 
I
A
 
N
G
 
R
K
 
R
-
 
L
-
 
G
H
 
L
S
 
T
L
 
I
M
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
G
 
D
F
 
V
V
 
V
G
 
K
S
 
R
I
 
I
A
 
C
D
 
D
H
 
C
V
 
V
T
 
A
V
 
V
L
 
I
H
 
S
Q
 
N
G
 
G
S
 
E
V
 
L
L
 
I
A
 
E
E
 
Q
G
 
D
S
 
T
L
 
V
E
 
S
Q
 
E
V
 
V

Sites not aligning to the query:

7d0aB Acinetobacter mlafedb complex in adp-vanadate trapped vclose conformation (see paper)
30% identity, 78% coverage: 52:278/290 of query aligns to 5:229/263 of 7d0aB

query
sites
7d0aB
L
 
I
E
 
E
D
 
V
I
 
K
S
 
N
V
 
L
S
 
S
F
 
F
D
 
N
-
 
R
G
 
G
F
 
E
R
 
R
A
 
V
L
 
I
-
 
Y
N
 
D
N
 
N
L
 
I
N
 
S
L
 
L
Y
 
N
I
 
I
G
 
R
V
 
R
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
R
 
T
C
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
 
G
A
x
T
G
|
G
K
|
K
T
 
T
T
 
T
L
 
L
M
 
L
D
 
R
V
 
L
I
 
I
T
 
G
G
 
G
K
 
Q
T
 
L
R
 
V
P
 
P
S
 
D
H
 
Q
G
 
G
K
 
E
A
 
V
W
 
L
F
 
L
G
 
-
E
 
D
T
 
G
L
 
K
D
 
D
L
 
I
T
 
A
Q
 
Q
M
 
M
S
 
S
-
 
R
-
 
Q
E
 
E
V
 
L
Q
 
F
I
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
G
 
R
I
 
M
G
 
G
R
 
M
K
 
L
F
 
F
Q
 
Q
K
 
S
P
 
G
T
 
A
V
 
L
F
 
F
E
 
T
A
 
D
L
 
M
S
 
S
V
 
V
F
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
V
E
 
A
L
 
F
A
 
P
Q
 
I
K
 
R
T
 
A
D
 
H
K
 
T
S
 
K
V
 
L
W
 
S
A
 
E
S
 
N
L
 
L
R
 
I
A
 
A
R
 
E
L
 
L
S
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
-
K
 
-
D
 
-
R
 
-
I
 
V
A
 
A
Q
 
L
V
 
K
L
 
L
D
 
E
T
 
S
I
 
V
R
 
G
L
 
L
T
 
R
S
 
G
S
 
T
V
 
E
N
 
Q
R
 
L
P
 
M
A
 
P
G
 
T
L
x
E
L
 
L
S
|
S
H
 
G
G
 
G
Q
x
M
K
 
N
Q
 
R
F
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
G
 
A
M
 
R
L
 
A
L
 
I
M
 
A
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
L
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
T
 
D
D
 
P
A
 
I
E
 
V
T
 
K
E
 
G
F
 
V
T
 
L
A
 
T
E
 
R
L
 
L
F
 
I
K
 
R
S
 
S
L
 
L
-
 
R
-
 
E
A
 
A
G
 
L
K
 
D
H
 
L
S
 
T
L
 
T
M
 
I
V
 
I
V
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
V
G
 
P
F
 
E
V
 
T
G
 
L
S
 
S
I
 
I
A
 
A
D
 
D
H
 
Y
V
 
I
T
 
Y
V
 
V
L
 
V
H
 
A
Q
 
E
G
 
G
S
 
K
V
 
I
L
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
S
 
T
L
 
P
E
 
E
Q
 
E
V
 
L
Q
 
Q

7d08B Acinetobacter mlafedb complex in atp-bound vtrans1 conformation (see paper)
30% identity, 78% coverage: 52:278/290 of query aligns to 5:229/263 of 7d08B

query
sites
7d08B
L
 
I
E
 
E
D
 
V
I
 
K
S
 
N
V
 
L
S
 
S
F
 
F
D
 
N
-
x
R
G
 
G
F
 
E
R
|
R
A
 
V
L
 
I
-
 
Y
N
 
D
N
 
N
L
 
I
N
 
S
L
 
L
Y
 
N
I
 
I
G
 
R
V
 
R
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
R
 
T
C
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
T
G
 
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
L
M
 
L
D
 
R
V
 
L
I
 
I
T
 
G
G
 
G
K
 
Q
T
 
L
R
 
V
P
 
P
S
 
D
H
 
Q
G
 
G
K
 
E
A
 
V
W
 
L
F
 
L
G
 
-
E
 
D
T
 
G
L
 
K
D
 
D
L
 
I
T
 
A
Q
 
Q
M
 
M
S
 
S
-
 
R
-
 
Q
E
 
E
V
 
L
Q
 
F
I
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
G
 
R
I
 
M
G
 
G
R
 
M
K
 
L
F
 
F
Q
 
Q
K
 
S
P
 
G
T
 
A
V
 
L
F
 
F
E
 
T
A
 
D
L
 
M
S
 
S
V
 
V
F
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
V
E
 
A
L
 
F
A
 
P
Q
 
I
K
 
R
T
 
A
D
 
H
K
 
T
S
 
K
V
 
L
W
 
S
A
 
E
S
 
N
L
 
L
R
 
I
A
 
A
R
 
E
L
 
L
S
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
-
K
 
-
D
 
-
R
 
-
I
 
V
A
 
A
Q
 
L
V
 
K
L
 
L
D
 
E
T
 
S
I
 
V
R
 
G
L
 
L
T
 
R
S
 
G
S
 
T
V
 
E
N
 
Q
R
 
L
P
 
M
A
 
P
G
 
T
L
 
E
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
N
Q
 
R
F
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
G
 
A
M
 
R
L
 
A
L
 
I
M
 
A
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
L
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
V
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
T
 
D
D
 
P
A
 
I
E
 
V
T
 
K
E
 
G
F
 
V
T
 
L
A
 
T
E
 
R
L
 
L
F
 
I
K
 
R
S
 
S
L
 
L
-
 
R
-
 
E
A
 
A
G
 
L
K
 
D
H
 
L
S
 
T
L
 
T
M
 
I
V
 
I
V
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
V
G
 
P
F
 
E
V
 
T
G
 
L
S
 
S
I
 
I
A
 
A
D
 
D
H
 
Y
V
 
I
T
 
Y
V
 
V
L
 
V
H
 
A
Q
 
E
G
 
G
S
 
K
V
 
I
L
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
S
 
T
L
 
P
E
 
E
Q
 
E
V
 
L
Q
 
Q

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
28% identity, 74% coverage: 62:277/290 of query aligns to 19:229/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
F
 
I
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
N
 
N
L
 
V
N
 
S
L
 
L
Y
 
H
I
 
V
G
 
P
V
 
A
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
R
 
Y
C
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
M
 
I
D
 
R
V
 
C
I
 
V
T
 
N
G
 
L
K
 
L
T
 
E
R
 
R
P
 
P
S
 
T
H
 
E
G
 
G
K
 
S
A
 
V
W
 
L
F
 
V
-
 
D
G
 
G
E
 
Q
T
 
E
L
 
L
D
 
T
L
 
T
T
 
L
Q
 
S
M
 
E
S
 
S
E
 
E
V
 
L
Q
 
T
I
 
K
A
 
A
Q
 
R
A
 
R
G
 
Q
I
 
I
G
 
G
R
 
M
K
 
I
F
 
F
Q
 
Q
K
 
H
P
 
F
T
 
N
V
 
L
F
 
L
E
 
S
A
 
S
L
 
R
S
 
T
V
 
V
F
 
F
E
 
G
N
 
N
L
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
P
Q
 
L
K
 
E
T
 
L
D
 
D
K
 
N
S
 
T
V
 
P
W
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
S
 
K
G
 
D
E
 
E
Q
 
V
K
 
K
D
 
R
R
 
R
I
 
V
A
 
T
Q
 
E
V
 
L
L
 
L
D
 
S
T
 
L
I
 
V
R
 
G
L
 
L
T
 
G
S
 
D
S
 
K
V
 
H
N
 
D
R
 
S
P
 
Y
A
 
P
G
 
S
L
 
N
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
F
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
A
M
 
R
L
 
A
L
 
L
M
 
A
Q
 
S
D
 
N
P
 
P
Q
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
V
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
T
 
D
D
 
P
A
 
A
E
 
T
T
 
T
E
 
R
F
 
S
T
 
I
A
 
L
E
 
E
L
 
L
F
 
L
K
 
K
S
 
D
L
 
I
A
 
N
G
 
R
K
 
R
-
 
L
-
 
G
H
 
L
S
 
T
L
 
I
M
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
G
 
D
F
 
V
V
 
V
G
 
K
S
 
R
I
 
I
A
 
C
D
 
D
H
 
C
V
 
V
T
 
A
V
 
V
L
 
I
H
 
S
Q
 
N
G
 
G
S
 
E
V
 
L
L
 
I
A
 
E
E
 
Q
G
 
D
S
 
T
L
 
V
E
 
S
Q
 
E
V
 
V

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
28% identity, 74% coverage: 62:277/290 of query aligns to 19:229/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
F
 
I
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
N
 
N
L
 
V
N
 
S
L
 
L
Y
 
H
I
 
V
G
 
P
V
 
A
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
R
 
Y
C
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
M
 
I
D
 
R
V
 
C
I
 
V
T
 
N
G
 
L
K
 
L
T
 
E
R
 
R
P
 
P
S
 
T
H
 
E
G
 
G
K
 
S
A
 
V
W
 
L
F
 
V
-
 
D
G
 
G
E
 
Q
T
 
E
L
 
L
D
 
T
L
 
T
T
 
L
Q
 
S
M
 
E
S
 
S
E
 
E
V
 
L
Q
 
T
I
 
K
A
 
A
Q
 
R
A
 
R
G
 
Q
I
 
I
G
 
G
R
 
M
K
 
I
F
 
F
Q
 
Q
K
 
H
P
 
F
T
 
N
V
 
L
F
 
L
E
 
S
A
 
S
L
 
R
S
 
T
V
 
V
F
 
F
E
 
G
N
 
N
L
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
P
Q
 
L
K
 
E
T
 
L
D
 
D
K
 
N
S
 
T
V
 
P
W
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
S
 
K
G
 
D
E
 
E
Q
 
V
K
 
K
D
 
R
R
 
R
I
 
V
A
 
T
Q
 
E
V
 
L
L
 
L
D
 
S
T
 
L
I
 
V
R
 
G
L
 
L
T
 
G
S
 
D
S
 
K
V
 
H
N
 
D
R
 
S
P
 
Y
A
 
P
G
 
S
L
 
N
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
F
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
A
M
 
R
L
 
A
L
 
L
M
 
A
Q
 
S
D
 
N
P
 
P
Q
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
V
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
T
 
D
D
 
P
A
 
A
E
 
T
T
 
T
E
 
R
F
 
S
T
 
I
A
 
L
E
 
E
L
 
L
F
 
L
K
 
K
S
 
D
L
 
I
A
 
N
G
 
R
K
 
R
-
 
L
-
 
G
H
 
L
S
 
T
L
 
I
M
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
G
 
D
F
 
V
V
 
V
G
 
K
S
 
R
I
 
I
A
 
C
D
 
D
H
 
C
V
 
V
T
 
A
V
 
V
L
 
I
H
 
S
Q
 
N
G
 
G
S
 
E
V
 
L
L
 
I
A
 
E
E
 
Q
G
 
D
S
 
T
L
 
V
E
 
S
Q
 
E
V
 
V

Sites not aligning to the query:

6z5uK Cryo-em structure of the a. Baumannii mlabdef complex bound to appnhp (see paper)
30% identity, 78% coverage: 52:278/290 of query aligns to 3:227/253 of 6z5uK

query
sites
6z5uK
L
 
I
E
 
E
D
 
V
I
 
K
S
 
N
V
 
L
S
 
S
F
 
F
D
 
N
-
x
R
G
 
G
F
 
E
R
 
R
A
 
V
L
 
I
-
 
Y
N
 
D
N
 
N
L
 
I
N
 
S
L
 
L
Y
 
N
I
 
I
G
 
R
V
 
R
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
R
 
T
C
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
T
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
L
M
 
L
D
 
R
V
 
L
I
 
I
T
 
G
G
 
G
K
 
Q
T
 
L
R
 
V
P
 
P
S
 
D
H
 
Q
G
 
G
K
 
E
A
 
V
W
 
L
F
 
L
G
 
-
E
 
D
T
 
G
L
 
K
D
 
D
L
 
I
T
 
A
Q
 
Q
M
 
M
S
 
S
-
 
R
-
 
Q
E
 
E
V
 
L
Q
 
F
I
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
G
 
R
I
 
M
G
 
G
R
 
M
K
 
L
F
 
F
Q
|
Q
K
 
S
P
 
G
T
 
A
V
 
L
F
 
F
E
 
T
A
 
D
L
 
M
S
 
S
V
 
V
F
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
V
E
 
A
L
 
F
A
 
P
Q
 
I
K
 
R
T
 
A
D
 
H
K
 
T
S
 
K
V
 
L
W
 
S
A
 
E
S
 
N
L
 
L
R
 
I
A
 
A
R
 
E
L
 
L
S
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
-
K
 
-
D
 
-
R
 
-
I
 
V
A
 
A
Q
 
L
V
 
K
L
 
L
D
 
E
T
 
S
I
 
V
R
 
G
L
 
L
T
 
R
S
 
G
S
 
T
V
 
E
N
 
Q
R
 
L
P
 
M
A
 
P
G
 
T
L
 
E
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
N
Q
 
R
F
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
G
 
A
M
 
R
L
 
A
L
 
I
M
 
A
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
L
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
V
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
T
 
D
D
 
P
A
 
I
E
 
V
T
 
K
E
 
G
F
 
V
T
 
L
A
 
T
E
 
R
L
 
L
F
 
I
K
 
R
S
 
S
L
 
L
-
 
R
-
 
E
A
 
A
G
 
L
K
 
D
H
 
L
S
 
T
L
 
T
M
 
I
V
 
I
V
 
V
E
 
S
H
|
H
D
 
D
M
 
V
G
 
P
F
 
E
V
 
T
G
 
L
S
 
S
I
 
I
A
 
A
D
 
D
H
 
Y
V
 
I
T
 
Y
V
 
V
L
 
V
H
 
A
Q
 
E
G
 
G
S
 
K
V
 
I
L
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
S
 
T
L
 
P
E
 
E
Q
 
E
V
 
L
Q
 
Q

4yerA Crystal structure of an abc transporter atp-binding protein (tm_1403) from thermotoga maritima msb8 at 2.35 a resolution
28% identity, 78% coverage: 49:273/290 of query aligns to 4:219/285 of 4yerA

query
sites
4yerA
I
 
I
L
 
I
T
 
V
L
 
V
E
 
E
D
 
N
I
 
L
S
 
V
V
 
K
S
 
K
F
|
F
D
 
G
G
 
D
F
|
F
R
 
E
A
 
A
L
 
V
N
 
K
N
 
G
L
 
V
N
 
S
L
 
F
Y
 
S
I
 
V
G
 
K
V
 
K
G
 
G
E
 
E
L
 
I
R
 
F
C
 
A
I
 
F
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
M
 
I
D
 
H
V
 
M
I
 
L
T
 
T
G
 
T
K
 
L
T
 
L
R
 
K
P
 
P
S
 
T
H
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
A
W
 
W
F
 
V
G
 
A
E
 
G
T
 
H
L
 
D
D
 
V
L
 
L
T
 
K
Q
 
E
M
 
P
S
 
R
E
 
E
V
 
V
Q
 
-
I
 
-
A
 
-
Q
 
R
A
 
R
G
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
I
K
 
V
F
 
F
Q
 
Q
K
 
D
P
 
Q
T
 
S
V
 
L
F
 
D
E
 
R
A
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
A
F
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
M
E
 
Y
L
 
I
A
 
H
Q
 
G
K
 
K
T
 
-
D
 
-
K
 
-
S
 
-
V
 
I
W
 
Y
A
 
G
S
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
Y
S
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
K
-
 
L
K
 
K
D
 
K
R
 
R
I
 
I
A
 
L
Q
 
E
V
 
L
L
 
L
D
 
E
T
 
F
I
 
V
R
 
E
L
 
L
T
 
L
S
 
E
S
 
F
V
 
K
N
 
D
R
 
K
P
 
P
A
 
V
G
 
K
L
x
T
L
x
F
S
|
S
H
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
A
Q
 
R
F
 
R
L
 
L
E
 
E
I
 
I
G
 
A
M
 
R
L
 
S
L
 
L
M
 
I
Q
 
H
D
 
E
P
 
P
Q
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
T
A
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
D
D
 
P
A
 
H
E
 
T
T
 
R
E
 
A
F
 
H
T
 
M
A
 
W
E
 
E
L
 
Y
F
 
I
K
 
S
S
 
K
L
 
M
A
 
K
G
 
K
K
 
E
H
 
H
S
 
N
L
 
M
M
 
T
V
 
I
-
 
F
-
 
L
V
 
T
E
 
T
H
 
H
D
 
Y
M
 
M
G
 
D
F
 
E
V
 
A
G
 
E
S
 
Q
I
 
L
A
 
A
D
 
D
H
 
R
V
 
V
T
 
A
V
 
I
L
 
I
H
 
D
Q
 
H
G
 
G
S
 
K
V
 
I
L
 
I
A
 
A
E
 
L
G
 
G
S
 
T

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
28% identity, 74% coverage: 62:277/290 of query aligns to 19:229/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
F
x
I
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
N
 
N
L
 
V
N
 
S
L
 
L
Y
 
H
I
 
V
G
 
P
V
 
A
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
R
 
Y
C
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
M
 
I
D
 
R
V
 
C
I
 
V
T
 
N
G
 
L
K
 
L
T
 
E
R
 
R
P
 
P
S
 
T
H
 
E
G
 
G
K
 
S
A
 
V
W
 
L
F
 
V
-
 
D
G
 
G
E
 
Q
T
 
E
L
 
L
D
 
T
L
 
T
T
 
L
Q
 
S
M
 
E
S
 
S
E
 
E
V
 
L
Q
 
T
I
 
K
A
 
A
Q
 
R
A
 
R
G
 
Q
I
 
I
G
 
G
R
 
M
K
 
I
F
 
F
Q
 
Q
K
 
H
P
 
F
T
 
N
V
 
L
F
 
L
E
 
S
A
 
S
L
 
R
S
 
T
V
 
V
F
 
F
E
 
G
N
 
N
L
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
P
Q
 
L
K
 
E
T
 
L
D
 
D
K
 
N
S
 
T
V
 
P
W
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
S
 
K
G
 
D
E
 
E
Q
 
V
K
 
K
D
 
R
R
 
R
I
 
V
A
 
T
Q
 
E
V
 
L
L
 
L
D
 
S
T
 
L
I
 
V
R
 
G
L
 
L
T
 
G
S
 
D
S
 
K
V
 
H
N
 
D
R
 
S
P
 
Y
A
 
P
G
 
S
L
x
N
L
 
L
S
|
S
H
 
G
G
 
G
Q
|
Q
K
 
K
Q
 
Q
F
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
A
M
 
R
L
 
A
L
 
L
M
 
A
Q
 
S
D
 
N
P
 
P
Q
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
V
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
T
 
D
D
 
P
A
 
A
E
 
T
T
 
T
E
 
R
F
 
S
T
 
I
A
 
L
E
 
E
L
 
L
F
 
L
K
 
K
S
 
D
L
 
I
A
 
N
G
 
R
K
 
R
-
 
L
-
 
G
H
 
L
S
 
T
L
 
I
M
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
T
H
|
H
D
 
E
M
 
M
G
 
D
F
 
V
V
 
V
G
 
K
S
 
R
I
 
I
A
 
C
D
 
D
H
 
C
V
 
V
T
 
A
V
 
V
L
 
I
H
 
S
Q
 
N
G
 
G
S
 
E
V
 
L
L
 
I
A
 
E
E
 
Q
G
 
D
S
 
T
L
 
V
E
 
S
Q
 
E
V
 
V

Sites not aligning to the query:

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
26% identity, 83% coverage: 49:289/290 of query aligns to 2:235/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
I
 
I
L
 
L
T
 
K
L
 
A
E
 
Q
D
 
H
I
 
L
S
 
A
V
 
K
S
 
S
F
 
Y
D
 
K
G
 
K
F
 
R
R
 
K
A
 
V
L
 
V
N
 
S
N
 
D
L
 
V
N
 
S
L
 
L
Y
 
Q
I
 
V
G
 
E
V
 
S
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
R
 
V
C
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
S
M
 
F
D
 
Y
V
 
M
I
 
I
T
 
V
G
 
G
K
 
L
T
 
V
R
 
A
P
 
R
S
 
D
H
 
E
G
 
G
K
 
T
A
 
I
W
 
T
F
 
I
G
 
D
E
 
D
T
 
N
L
 
-
D
 
D
L
 
I
T
 
S
Q
 
I
M
 
L
S
 
P
E
 
M
V
 
H
Q
 
S
I
 
R
A
 
S
Q
 
R
A
 
M
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
Y
K
 
L
F
 
P
Q
 
Q
K
 
E
P
 
A
T
 
S
V
 
I
F
 
F
E
 
R
A
 
K
L
 
L
S
 
S
V
 
V
F
 
E
E
 
D
N
 
N
L
 
I
E
 
M
L
 
A
A
 
V
Q
 
L
K
 
Q
T
 
T
D
 
-
K
 
-
S
 
-
V
 
-
W
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
R
A
 
E
R
 
E
L
 
L
S
 
T
G
 
H
E
|
E
Q
 
E
K
 
R
-
 
Q
D
|
D
R
 
K
I
 
L
A
 
E
Q
 
D
V
 
L
L
 
L
D
 
E
T
 
E
I
 
F
R
 
H
L
 
I
T
 
-
S
 
Q
S
 
H
V
 
I
N
 
R
R
 
K
P
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
M
-
 
A
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
Q
 
E
K
 
R
Q
 
R
F
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
A
M
 
R
L
 
A
L
 
L
M
 
A
Q
 
A
D
 
N
P
 
P
Q
 
Q
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
V
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
T
 
D
D
 
P
A
 
I
E
 
S
T
 
V
E
 
I
F
 
D
T
 
I
A
 
K
E
 
K
L
 
I
F
 
I
K
 
E
S
 
H
L
 
L
A
 
R
G
 
D
K
 
R
H
 
G
-
 
L
S
 
G
L
 
V
M
 
L
V
 
I
V
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
G
 
R
F
 
E
V
 
T
G
 
L
S
 
D
I
 
V
A
 
C
D
 
E
H
 
K
V
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
H
 
S
Q
 
Q
G
 
G
S
 
R
V
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
G
S
 
T
L
 
P
E
 
Q
Q
 
D
V
 
V
Q
 
L
D
 
N
N
 
N
E
 
E
R
 
Q
V
 
V
I
 
K
E
 
Q
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

P19566 Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein MalK; EC 7.5.2.1 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
29% identity, 77% coverage: 50:273/290 of query aligns to 4:217/369 of P19566

query
sites
P19566
L
 
V
T
 
Q
L
 
L
E
 
R
D
 
N
I
 
V
S
 
T
V
 
K
S
 
A
F
 
W
D
 
G
G
 
D
F
 
V
R
 
V
A
 
V
L
 
S
N
 
K
N
 
D
L
 
I
N
 
N
L
 
L
Y
 
D
I
 
I
G
 
H
V
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
F
R
 
V
C
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
L
D
 
R
V
 
M
I
 
I
T
 
A
G
 
G
K
 
L
T
 
E
R
 
T
P
 
I
S
 
T
H
 
S
G
 
G
K
 
D
A
 
L
W
 
F
F
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
T
Q
 
R
M
 
M
S
 
N
E
 
D
V
 
I
Q
 
P
I
 
P
A
 
A
Q
 
E
A
 
R
G
 
G
I
 
V
G
 
G
R
 
M
K
 
V
F
 
F
Q
 
Q
K
 
S
P
 
Y
T
 
A
V
x
L
F
 
Y
E
 
P
A
 
H
L
 
L
S
 
S
V
 
V
F
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
M
E
 
S
L
 
F
A
 
G
Q
 
L
K
 
K
T
 
-
D
 
-
K
 
-
S
 
-
V
 
-
W
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
L
S
 
A
G
 
G
E
 
A
Q
 
K
K
 
K
D
 
E
-
 
V
-
 
M
-
 
N
-
 
Q
R
 
R
I
 
V
A
 
N
Q
 
Q
V
 
V
L
 
A
D
 
E
T
 
V
I
 
L
R
 
Q
L
 
L
T
 
A
S
 
H
S
 
L
V
 
L
N
 
E
R
 
R
P
 
K
A
 
P
G
 
K
L
 
A
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
R
Q
 
Q
F
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
G
M
 
R
L
 
T
L
 
L
M
 
V
Q
 
A
D
 
E
P
 
P
Q
 
R
L
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
|
P
V
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
T
 
-
D
|
D
A
 
A
E
 
A
T
 
L
E
 
R
F
 
V
T
 
Q
A
 
M
E
 
R
L
 
I
F
 
E
K
 
I
S
 
S
L
 
R
A
 
L
G
 
H
K
 
K
-
 
R
-
 
L
-
 
G
H
 
R
S
 
T
L
 
M
M
 
I
V
 
Y
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
F
 
E
V
 
A
G
 
M
S
 
T
I
 
L
A
 
A
D
 
D
H
 
K
V
 
I
T
 
V
V
 
V
L
 
L
H
 
D
Q
 
A
G
 
G
S
 
R
V
 
V
L
 
A
A
 
Q
E
 
V
G
 
G
S
 
K

Sites not aligning to the query:

P0AAH0 Phosphate import ATP-binding protein PstB; ABC phosphate transporter; Phosphate-transporting ATPase; EC 7.3.2.1 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
28% identity, 76% coverage: 50:269/290 of query aligns to 11:231/257 of P0AAH0

query
sites
P0AAH0
L
 
I
T
 
Q
L
 
V
E
 
R
D
 
N
I
 
L
S
 
N
V
 
F
S
 
Y
F
 
Y
D
 
G
G
 
K
F
 
F
R
 
H
A
 
A
L
 
L
N
 
K
N
 
N
L
 
I
N
 
N
L
 
L
Y
 
D
I
 
I
G
 
A
V
 
K
G
 
N
E
 
Q
L
 
V
R
 
T
C
 
A
I
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
|
G
K
|
K
T
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
L
D
 
R
V
 
T
I
 
F
T
 
N
G
 
K
K
 
M
T
 
F
R
 
E
P
 
L
S
 
Y
H
 
P
G
 
E
K
 
Q
A
 
R
W
 
A
F
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
I
L
 
L
-
 
L
-
 
D
-
 
G
-
 
D
-
 
N
D
 
I
L
 
L
T
 
T
Q
 
N
M