SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS01630 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS01630 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
33% identity, 81% coverage: 56:304/307 of query aligns to 4:253/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
I
 
I
L
 
L
D
 
R
L
 
T
Q
 
E
N
 
N
I
 
I
S
 
V
L
 
K
A
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
V
x
F
K
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
G
I
 
V
S
 
S
F
 
I
D
 
S
V
 
V
R
 
N
E
 
K
H
 
G
E
 
D
I
 
V
R
 
T
A
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
I
N
 
N
V
 
V
I
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
F
Y
 
L
H
 
K
P
 
A
Q
 
D
Q
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
Y
F
 
F
R
 
E
G
 
N
E
 
K
E
 
D
R
 
I
R
 
T
K
 
N
M
 
K
H
 
E
P
 
P
T
 
A
A
 
E
A
 
L
A
 
Y
R
 
H
Q
 
Y
G
 
G
I
 
I
A
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
P
A
 
Q
L
 
P
F
 
L
K
 
K
G
 
E
M
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
N
I
 
L
M
 
L
T
 
I
G
 
G
R
 
E
N
 
I
T
 
C
R
 
P
F
 
G
R
 
E
S
 
S
G
 
P
L
 
L
L
 
-
A
 
-
N
 
N
A
 
S
L
 
L
W
 
F
W
 
Y
G
 
K
P
 
K
A
 
W
R
 
I
N
 
P
E
 
K
E
 
E
M
 
E
Q
 
E
H
 
M
R
 
V
R
 
E
K
 
K
V
 
A
E
 
F
E
 
K
V
 
I
I
 
L
D
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
K
I
 
L
Q
 
S
A
 
H
I
 
L
R
 
Y
K
 
D
T
 
R
P
 
K
V
 
A
G
 
G
R
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
M
K
 
K
R
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
A
 
T
E
 
N
P
 
P
S
 
K
M
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
A
V
 
P
E
 
G
E
 
L
K
 
A
Q
 
H
D
 
D
M
 
I
C
 
F
R
 
N
F
 
H
I
 
V
L
 
L
D
 
E
V
 
L
N
 
K
H
 
A
Q
 
K
F
 
-
G
 
G
T
 
I
T
 
T
I
 
F
V
 
L
L
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
G
 
D
V
 
I
V
 
V
M
 
L
D
 
N
I
 
Y
S
 
I
D
 
D
R
 
H
V
 
L
V
 
Y
V
 
V
L
 
M
D
 
F
Y
 
N
G
 
G
K
 
Q
K
 
I
I
 
I
G
 
A
D
 
E
G
 
G
T
 
R
P
 
G
E
 
E
A
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
V
 
V
K
 
L
A
 
S
N
 
D
P
 
P
D
 
K
V
 
V
I
 
V
R
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
33% identity, 81% coverage: 56:304/307 of query aligns to 4:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
I
 
I
L
 
L
D
 
R
L
 
T
Q
 
E
N
 
N
I
 
I
S
 
V
L
 
K
A
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
V
x
F
K
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
G
I
 
V
S
 
S
F
 
I
D
 
S
V
 
V
R
 
C
E
 
K
H
 
G
E
 
D
I
 
V
R
 
T
A
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
I
N
 
N
V
 
V
I
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
F
Y
 
L
H
 
K
P
 
A
Q
 
D
Q
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
Y
F
 
F
R
 
E
G
 
N
E
 
K
E
 
D
R
 
I
R
 
T
K
 
N
M
 
K
H
 
E
P
 
P
T
 
A
A
 
E
A
 
L
A
 
Y
R
 
H
Q
 
Y
G
 
G
I
 
I
A
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
P
A
 
Q
L
 
P
F
 
L
K
 
K
G
 
E
M
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
N
I
 
L
M
 
L
T
 
I
G
 
G
R
 
E
N
 
I
T
 
N
R
 
P
F
 
G
R
 
E
S
 
S
G
 
P
L
 
L
L
 
-
A
 
-
N
 
N
A
 
S
L
 
L
W
 
F
W
 
Y
G
 
K
P
 
K
A
 
W
R
 
I
N
 
P
E
 
K
E
 
E
M
 
E
Q
 
E
H
 
M
R
 
V
R
 
E
K
 
K
V
 
A
E
 
F
E
 
K
V
 
I
I
 
L
D
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
K
I
 
L
Q
 
S
A
 
H
I
 
L
R
 
Y
K
 
D
T
 
R
P
 
K
V
 
A
G
 
G
R
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
M
K
 
K
R
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
A
 
T
E
 
N
P
 
P
S
 
K
M
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
A
V
 
P
E
 
G
E
 
L
K
 
A
Q
 
H
D
 
D
M
 
I
C
 
F
R
 
N
F
 
H
I
 
V
L
 
L
D
 
E
V
 
L
N
 
K
H
 
A
Q
 
K
F
 
-
G
 
G
T
 
I
T
 
T
I
 
F
V
 
L
L
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
G
 
D
V
 
I
V
 
V
M
 
L
D
 
N
I
 
Y
S
 
I
D
 
D
R
 
H
V
 
L
V
 
Y
V
 
V
L
 
M
D
 
F
Y
 
N
G
 
G
K
 
Q
K
 
I
I
 
I
G
 
A
D
 
E
G
 
G
T
 
R
P
 
G
E
 
E
A
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
V
 
V
K
 
L
A
 
S
N
 
D
P
 
P
D
 
K
V
 
V
I
 
V
R
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
30% identity, 81% coverage: 56:304/307 of query aligns to 2:235/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
I
 
I
L
 
L
D
 
K
L
 
A
Q
 
Q
N
 
H
I
 
L
S
 
A
L
 
K
A
 
S
F
 
Y
G
 
K
G
 
K
V
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
V
T
 
S
D
 
D
I
 
V
S
 
S
F
 
L
D
 
Q
V
 
V
R
 
E
E
 
S
H
 
G
E
 
Q
I
 
I
R
 
V
A
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
S
 
T
M
 
S
L
 
F
N
 
Y
V
 
M
I
 
I
N
 
V
G
 
G
V
 
L
Y
 
V
H
 
A
P
 
R
Q
 
D
Q
 
E
G
 
G
R
 
T
I
 
I
V
 
T
F
 
I
R
 
D
G
 
D
E
 
N
E
 
D
R
 
I
R
 
S
K
 
I
M
 
L
H
 
P
P
 
M
T
 
H
A
 
S
A
 
R
A
 
S
R
 
R
Q
 
M
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
N
 
E
I
 
A
A
 
S
L
 
I
F
 
F
K
 
R
G
 
K
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
E
D
 
D
N
 
N
I
 
I
M
 
M
T
 
A
G
 
V
R
 
L
N
 
Q
T
 
T
R
 
R
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
-
W
 
-
W
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
N
 
-
E
 
E
E
 
E
M
 
L
Q
 
T
H
 
H
R
x
E
R
 
E
K
 
R
V
 
Q
E
x
D
E
 
K
V
 
L
I
 
E
D
 
D
F
 
L
L
 
L
E
 
E
-
 
E
-
 
F
-
 
H
I
 
I
Q
 
Q
A
 
H
I
 
I
R
 
R
K
 
K
T
 
S
P
 
A
V
 
G
G
 
M
R
 
A
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
E
Q
 
R
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
N
P
 
P
S
 
Q
M
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
V
 
P
E
 
I
E
 
S
K
 
V
Q
 
I
D
 
D
M
 
I
C
 
K
R
 
K
F
 
I
I
 
I
L
 
E
D
 
H
V
 
L
N
 
R
H
 
D
Q
 
R
F
 
-
G
 
G
T
 
L
T
 
G
I
 
V
V
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
G
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
D
I
 
V
S
 
C
D
 
E
R
 
K
V
 
A
V
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
K
 
R
K
 
L
I
 
I
G
 
A
D
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
A
 
D
V
 
V
K
 
L
A
 
N
N
 
N
P
 
E
D
 
Q
V
 
V
I
 
K
R
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
31% identity, 81% coverage: 56:303/307 of query aligns to 2:236/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
I
 
I
L
 
I
D
 
R
L
 
I
Q
 
R
N
 
N
I
 
L
S
 
H
L
 
K
A
 
W
F
|
F
G
 
G
G
 
P
V
 
L
K
 
H
A
x
V
L
 
L
T
 
K
D
 
G
I
 
I
S
 
H
F
 
L
D
 
E
V
 
V
R
 
A
E
 
P
H
 
G
E
 
E
I
 
K
R
 
L
A
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
I
N
 
R
V
 
T
I
 
I
N
 
N
G
 
R
V
 
L
Y
 
E
H
 
D
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
V
V
 
V
F
 
V
R
 
D
G
 
G
E
 
L
E
 
S
R
 
V
R
 
K
K
 
D
M
 
D
H
 
R
P
 
A
T
 
L
A
 
R
A
 
E
A
 
I
R
 
R
Q
 
R
G
 
E
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
Q
I
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
F
K
 
P
G
 
H
M
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
N
I
 
V
M
 
T
T
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
-
W
 
-
W
 
L
G
 
A
P
 
P
A
 
M
R
 
R
N
 
V
E
 
R
E
 
R
M
 
W
Q
 
P
H
 
R
R
 
E
R
 
K
K
 
A
V
 
E
E
 
K
E
 
K
V
 
A
I
 
L
D
 
E
F
 
L
L
 
L
E
 
E
-
 
R
-
 
V
-
 
G
-
 
I
I
 
L
Q
 
D
A
 
Q
I
 
A
R
 
R
K
 
K
T
 
Y
P
 
P
V
 
-
G
 
A
R
 
Q
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
M
E
 
E
P
 
P
S
 
K
M
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
V
 
P
E
 
E
E
 
-
K
 
-
Q
 
-
D
 
-
M
 
M
C
 
V
R
 
G
F
 
E
I
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
N
 
M
H
 
R
-
 
D
-
 
L
-
 
A
Q
 
Q
F
 
G
G
 
G
T
 
M
T
 
T
I
 
M
V
 
V
L
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
F
V
 
A
M
 
R
D
 
E
I
 
V
S
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
F
L
 
M
D
 
D
Y
 
G
G
 
G
K
 
Q
K
 
I
I
 
V
G
 
E
D
 
E
G
 
G
T
 
R
P
 
P
E
 
E
A
 
E
V
 
I
K
 
F
A
 
T
N
 
R
P
 
P
-
 
K
-
 
E
D
 
E
V
 
R
I
 
T
R
 
R
A
 
S
Y
 
F
L
 
L

2awnB Crystal structure of the adp-mg-bound e. Coli malk (crystallized with atp-mg) (see paper)
31% identity, 78% coverage: 57:296/307 of query aligns to 3:224/374 of 2awnB

query
sites
2awnB
L
 
V
D
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
A
 
A
F
x
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
x
V
L
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
D
 
D
V
 
I
R
 
H
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
F
R
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
H
 
T
P
 
I
Q
 
T
Q
 
S
G
 
G
R
 
D
I
 
L
V
 
-
F
 
F
R
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
K
R
 
R
R
 
-
K
 
-
M
 
M
H
 
N
P
 
D
T
 
T
A
 
P
A
 
P
A
 
A
R
 
E
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
I
 
M
M
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
L
W
 
K
W
 
L
G
 
A
P
 
G
A
 
A
R
 
K
N
 
K
E
 
E
E
 
V
M
 
I
Q
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
-
K
 
-
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
L
Q
 
A
A
 
H
I
 
L
R
 
L
K
 
D
T
 
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
R
 
A
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
M
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
D
 
Q
M
 
M
C
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
V
 
L
N
 
H
H
 
K
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
K
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
L
A
 
E
V
 
L
K
 
Y
A
 
H
N
 
Y
P
 
P

3puyA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to amp-pnp after crystal soaking of the pretranslocation state (see paper)
31% identity, 78% coverage: 57:296/307 of query aligns to 3:224/371 of 3puyA

query
sites
3puyA
L
 
V
D
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
A
 
A
F
x
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
 
V
L
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
D
 
D
V
 
I
R
 
H
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
F
R
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
H
 
T
P
 
I
Q
 
T
Q
 
S
G
 
G
R
 
D
I
 
L
V
 
-
F
 
F
R
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
K
R
 
R
R
 
-
K
 
-
M
 
M
H
 
N
P
 
D
T
 
T
A
 
P
A
 
P
A
 
A
R
 
E
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
I
 
M
M
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
L
W
 
K
W
 
L
G
 
A
P
 
G
A
 
A
R
 
K
N
 
K
E
 
E
E
 
V
M
 
I
Q
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
-
K
 
-
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
L
Q
 
A
A
 
H
I
 
L
R
 
L
K
 
D
T
x
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
R
x
A
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
|
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
M
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
D
 
Q
M
 
M
C
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
V
 
L
N
 
H
H
 
K
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
K
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
L
A
 
E
V
 
L
K
 
Y
A
 
H
N
 
Y
P
 
P

3puxA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-bef3 (see paper)
31% identity, 78% coverage: 57:296/307 of query aligns to 3:224/371 of 3puxA

query
sites
3puxA
L
 
V
D
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
A
 
A
F
x
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
 
V
L
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
D
 
D
V
 
I
R
 
H
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
F
R
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
H
 
T
P
 
I
Q
 
T
Q
 
S
G
 
G
R
 
D
I
 
L
V
 
-
F
 
F
R
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
K
R
 
R
R
 
-
K
 
-
M
 
M
H
 
N
P
 
D
T
 
T
A
 
P
A
 
P
A
 
A
R
 
E
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
I
 
M
M
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
L
W
 
K
W
 
L
G
 
A
P
 
G
A
 
A
R
 
K
N
 
K
E
 
E
E
 
V
M
 
I
Q
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
-
K
 
-
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
L
Q
 
A
A
 
H
I
 
L
R
 
L
K
 
D
T
x
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
R
 
A
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
|
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
M
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
D
 
Q
M
 
M
C
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
V
 
L
N
 
H
H
 
K
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
K
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
L
A
 
E
V
 
L
K
 
Y
A
 
H
N
 
Y
P
 
P

3puwA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-alf4 (see paper)
31% identity, 78% coverage: 57:296/307 of query aligns to 3:224/371 of 3puwA

query
sites
3puwA
L
 
V
D
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
A
 
A
F
x
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
x
V
L
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
D
 
D
V
 
I
R
 
H
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
F
R
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
H
 
T
P
 
I
Q
 
T
Q
 
S
G
 
G
R
 
D
I
 
L
V
 
-
F
 
F
R
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
K
R
 
R
R
 
-
K
 
-
M
 
M
H
 
N
P
 
D
T
 
T
A
 
P
A
 
P
A
 
A
R
 
E
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
I
 
M
M
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
L
W
 
K
W
 
L
G
 
A
P
 
G
A
 
A
R
 
K
N
 
K
E
 
E
E
 
V
M
 
I
Q
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
-
K
 
-
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
L
Q
 
A
A
 
H
I
 
L
R
 
L
K
 
D
T
x
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
R
x
A
L
 
L
P
x
S
Y
x
G
G
|
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
M
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
D
 
Q
M
 
M
C
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
V
 
L
N
 
H
H
 
K
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
K
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
L
A
 
E
V
 
L
K
 
Y
A
 
H
N
 
Y
P
 
P

3puvA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-vo4 (see paper)
31% identity, 78% coverage: 57:296/307 of query aligns to 3:224/371 of 3puvA

query
sites
3puvA
L
 
V
D
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
A
 
A
F
x
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
x
V
L
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
D
 
D
V
 
I
R
 
H
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
F
R
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
H
 
T
P
 
I
Q
 
T
Q
 
S
G
 
G
R
 
D
I
 
L
V
 
-
F
 
F
R
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
K
R
 
R
R
 
-
K
 
-
M
 
M
H
 
N
P
 
D
T
 
T
A
 
P
A
 
P
A
 
A
R
 
E
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
I
 
M
M
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
L
W
 
K
W
 
L
G
 
A
P
 
G
A
 
A
R
 
K
N
 
K
E
 
E
E
 
V
M
 
I
Q
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
-
K
 
-
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
L
Q
 
A
A
 
H
I
 
L
R
 
L
K
 
D
T
x
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
R
x
A
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
 
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
M
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
D
 
Q
M
 
M
C
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
V
 
L
N
 
H
H
 
K
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
K
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
L
A
 
E
V
 
L
K
 
Y
A
 
H
N
 
Y
P
 
P

P68187 Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein MalK; EC 7.5.2.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 5 papers)
31% identity, 78% coverage: 57:296/307 of query aligns to 4:225/371 of P68187

query
sites
P68187
L
 
V
D
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
A
 
A
F
 
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
 
V
L
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
D
 
D
V
 
I
R
 
H
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
F
R
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
S
S
 
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
H
 
T
P
 
I
Q
 
T
Q
 
S
G
 
G
R
 
D
I
 
L
V
 
-
F
 
F
R
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
K
R
 
R
R
 
-
K
 
-
M
 
M
H
 
N
P
 
D
T
 
T
A
 
P
A
 
P
A
 
A
R
 
E
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
Y
A
|
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
I
 
M
M
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
L
W
 
K
W
 
L
G
 
A
P
 
G
A
 
A
R
x
K
N
 
K
E
 
E
E
 
V
M
 
I
Q
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
-
K
 
-
V
|
V
E
 
N
E
 
Q
V
|
V
I
 
A
D
x
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
L
Q
x
A
A
 
H
I
 
L
R
 
L
K
 
D
T
 
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
R
 
A
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
|
G
L
 
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
M
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
D
 
Q
M
 
M
C
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
V
 
L
N
 
H
H
 
K
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
K
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
L
A
 
E
V
 
L
K
 
Y
A
 
H
N
 
Y
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1q12A Crystal structure of the atp-bound e. Coli malk (see paper)
31% identity, 78% coverage: 57:296/307 of query aligns to 1:222/367 of 1q12A

query
sites
1q12A
L
 
V
D
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
A
 
A
F
x
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
 
V
L
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
D
 
D
V
 
I
R
 
H
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
F
R
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
H
 
T
P
 
I
Q
 
T
Q
 
S
G
 
G
R
 
D
I
 
L
V
 
-
F
 
F
R
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
K
R
 
R
R
 
-
K
 
-
M
 
M
H
 
N
P
 
D
T
 
T
A
 
P
A
 
P
A
 
A
R
 
E
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
I
 
M
M
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
L
W
 
K
W
 
L
G
 
A
P
 
G
A
 
A
R
 
K
N
 
K
E
 
E
E
 
V
M
 
I
Q
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
-
K
 
-
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
L
Q
 
A
A
 
H
I
 
L
R
 
L
K
 
D
T
x
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
R
x
A
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
|
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
M
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
D
 
Q
M
 
M
C
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
V
 
L
N
 
H
H
 
K
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
K
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
L
A
 
E
V
 
L
K
 
Y
A
 
H
N
 
Y
P
 
P

5x40A Structure of a cbio dimer bound with amppcp (see paper)
33% identity, 78% coverage: 56:295/307 of query aligns to 4:230/280 of 5x40A

query
sites
5x40A
I
 
I
L
 
L
D
 
A
L
 
A
Q
 
E
N
 
A
I
 
L
S
 
T
L
 
Y
A
 
A
F
|
F
-
 
P
G
 
G
G
 
G
V
|
V
K
 
K
A
|
A
L
 
L
T
 
D
D
 
D
I
 
L
S
 
S
F
 
L
D
 
A
V
 
V
R
 
P
E
 
K
H
 
G
E
 
E
I
 
S
R
 
L
A
 
A
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
L
V
 
H
I
 
L
N
 
N
G
 
G
V
 
T
Y
 
L
H
 
R
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
L
F
 
L
R
 
G
G
 
G
E
 
T
-
 
A
-
 
T
-
 
G
E
 
H
R
 
S
R
 
R
K
 
K
M
 
D
H
 
L
P
 
T
T
 
G
A
 
W
A
 
R
A
 
R
R
 
R
Q
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
V
R
 
L
T
x
Q
F
 
D
Q
 
A
N
 
D
I
 
D
A
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
-
G
 
A
M
 
T
T
 
T
V
 
V
L
 
F
D
 
E
N
 
D
I
 
V
M
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
P
F
 
L
R
 
N
S
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
-
W
 
-
W
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
N
 
-
E
 
S
E
 
E
M
 
A
Q
 
E
H
 
A
R
 
R
R
 
A
K
 
R
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
A
I
 
L
D
 
A
F
 
A
L
 
L
E
 
S
I
 
I
Q
 
S
A
 
D
I
 
L
R
 
R
K
 
D
T
 
R
P
 
P
V
 
T
G
x
H
R
x
M
L
|
L
P
x
S
Y
 
G
G
|
G
L
x
Q
Q
 
K
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
G
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
M
E
 
R
P
 
P
S
 
E
M
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
P
 
P
M
 
T
A
 
A
G
 
G
M
 
L
N
 
D
V
 
L
E
 
A
E
 
G
K
 
T
Q
 
E
D
 
Q
M
 
L
C
 
L
R
 
T
F
 
L
I
 
L
L
 
R
D
 
G
V
 
L
N
 
R
H
 
A
Q
 
A
F
 
-
G
 
G
T
 
M
T
 
T
I
 
L
V
 
V
L
 
F
I
 
S
E
 
T
H
|
H
D
 
D
M
 
V
G
 
E
V
 
L
V
 
A
M
 
A
D
 
A
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
A
V
 
L
L
 
F
D
 
R
Y
 
T
G
 
G
K
 
R
K
 
V
I
 
L
G
 
A
D
 
E
G
 
G
T
 
A
P
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
L
A
 
S
N
 
D

6z5uK Cryo-em structure of the a. Baumannii mlabdef complex bound to appnhp (see paper)
30% identity, 78% coverage: 56:294/307 of query aligns to 2:228/253 of 6z5uK

query
sites
6z5uK
I
 
L
L
 
I
D
 
E
L
 
V
Q
 
K
N
 
N
I
 
L
S
 
S
L
 
F
A
 
N
F
x
R
G
 
G
G
 
E
V
 
R
K
 
V
A
 
I
L
 
Y
T
 
D
D
 
N
I
 
I
S
 
S
F
 
L
D
 
N
V
 
I
R
 
R
E
 
R
H
 
G
E
 
Q
I
 
I
R
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
T
G
|
G
K
|
K
S
x
T
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
L
I
 
I
N
 
G
G
 
G
V
 
Q
Y
 
L
H
 
V
P
 
P
Q
 
D
Q
 
Q
G
 
G
R
 
E
I
 
V
V
 
L
F
 
L
R
 
D
G
 
G
E
 
K
E
 
D
R
 
I
R
 
A
K
 
Q
M
 
M
-
 
S
-
 
R
H
 
Q
P
 
E
T
 
L
A
 
F
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
A
G
 
R
I
 
M
A
 
G
R
 
M
T
 
L
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
I
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
K
 
T
G
 
D
M
 
M
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
V
M
 
-
T
 
-
G
 
A
R
 
F
N
 
P
T
 
I
R
 
R
F
 
A
R
 
H
S
 
T
G
 
K
L
 
L
L
 
S
A
 
E
N
 
N
A
 
L
L
 
I
W
 
A
W
 
E
G
 
L
P
 
V
A
 
A
R
 
L
N
 
K
E
 
L
E
 
E
M
 
S
Q
 
V
H
 
G
R
 
L
R
 
R
K
 
G
V
 
T
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
I
 
M
D
 
P
F
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
-
Q
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
T
R
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
M
Q
 
N
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
L
E
 
D
P
 
P
S
 
D
M
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
N
 
D
V
 
P
E
 
I
E
 
V
K
 
K
Q
 
G
D
 
V
M
 
L
C
 
T
R
 
R
F
 
L
I
 
I
L
 
R
D
 
S
V
 
L
N
 
R
H
 
E
Q
 
A
F
 
L
G
 
D
T
 
L
T
 
T
I
 
T
V
 
I
L
 
I
I
 
V
E
 
S
H
|
H
D
 
D
M
 
V
G
 
P
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
S
I
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
V
 
Y
V
 
V
L
 
V
D
 
A
Y
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
I
I
 
Q
G
 
G
D
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
E
V
 
L
K
 
Q
A
 
A

7d0aB Acinetobacter mlafedb complex in adp-vanadate trapped vclose conformation (see paper)
30% identity, 78% coverage: 56:294/307 of query aligns to 4:230/263 of 7d0aB

query
sites
7d0aB
I
 
L
L
 
I
D
 
E
L
 
V
Q
 
K
N
 
N
I
 
L
S
 
S
L
 
F
A
 
N
F
 
R
G
 
G
G
 
E
V
 
R
K
 
V
A
 
I
L
 
Y
T
 
D
D
 
N
I
 
I
S
 
S
F
 
L
D
 
N
V
 
I
R
 
R
E
 
R
H
 
G
E
 
Q
I
 
I
R
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
 
G
A
x
T
G
|
G
K
|
K
S
 
T
S
 
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
L
I
 
I
N
 
G
G
 
G
V
 
Q
Y
 
L
H
 
V
P
 
P
Q
 
D
Q
 
Q
G
 
G
R
 
E
I
 
V
V
 
L
F
 
L
R
 
D
G
 
G
E
 
K
E
 
D
R
 
I
R
 
A
K
 
Q
M
 
M
-
 
S
-
 
R
H
 
Q
P
 
E
T
 
L
A
 
F
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
A
G
 
R
I
 
M
A
 
G
R
 
M
T
 
L
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
K
 
T
G
 
D
M
 
M
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
V
M
 
-
T
 
-
G
 
A
R
 
F
N
 
P
T
 
I
R
 
R
F
 
A
R
 
H
S
 
T
G
 
K
L
 
L
L
 
S
A
 
E
N
 
N
A
 
L
L
 
I
W
 
A
W
 
E
G
 
L
P
 
V
A
 
A
R
 
L
N
 
K
E
 
L
E
 
E
M
 
S
Q
 
V
H
 
G
R
 
L
R
 
R
K
 
G
V
 
T
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
I
 
M
D
 
P
F
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
-
Q
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
T
R
x
E
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
 
G
L
x
M
Q
 
N
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
L
E
 
D
P
 
P
S
 
D
M
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
N
 
D
V
 
P
E
 
I
E
 
V
K
 
K
Q
 
G
D
 
V
M
 
L
C
 
T
R
 
R
F
 
L
I
 
I
L
 
R
D
 
S
V
 
L
N
 
R
H
 
E
Q
 
A
F
 
L
G
 
D
T
 
L
T
 
T
I
 
T
V
 
I
L
 
I
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
V
G
 
P
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
S
I
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
V
 
Y
V
 
V
L
 
V
D
 
A
Y
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
I
I
 
Q
G
 
G
D
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
E
V
 
L
K
 
Q
A
 
A

7d08B Acinetobacter mlafedb complex in atp-bound vtrans1 conformation (see paper)
30% identity, 78% coverage: 56:294/307 of query aligns to 4:230/263 of 7d08B

query
sites
7d08B
I
 
L
L
 
I
D
 
E
L
 
V
Q
 
K
N
 
N
I
 
L
S
 
S
L
 
F
A
 
N
F
x
R
G
 
G
G
 
E
V
x
R
K
 
V
A
 
I
L
 
Y
T
 
D
D
 
N
I
 
I
S
 
S
F
 
L
D
 
N
V
 
I
R
 
R
E
 
R
H
 
G
E
 
Q
I
 
I
R
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
T
G
 
G
K
|
K
S
x
T
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
L
I
 
I
N
 
G
G
 
G
V
 
Q
Y
 
L
H
 
V
P
 
P
Q
 
D
Q
 
Q
G
 
G
R
 
E
I
 
V
V
 
L
F
 
L
R
 
D
G
 
G
E
 
K
E
 
D
R
 
I
R
 
A
K
 
Q
M
 
M
-
 
S
-
 
R
H
 
Q
P
 
E
T
 
L
A
 
F
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
A
G
 
R
I
 
M
A
 
G
R
 
M
T
 
L
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
K
 
T
G
 
D
M
 
M
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
V
M
 
-
T
 
-
G
 
A
R
 
F
N
 
P
T
 
I
R
 
R
F
 
A
R
 
H
S
 
T
G
 
K
L
 
L
L
 
S
A
 
E
N
 
N
A
 
L
L
 
I
W
 
A
W
 
E
G
 
L
P
 
V
A
 
A
R
 
L
N
 
K
E
 
L
E
 
E
M
 
S
Q
 
V
H
 
G
R
 
L
R
 
R
K
 
G
V
 
T
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
I
 
M
D
 
P
F
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
-
Q
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
T
R
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
M
Q
 
N
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
L
E
 
D
P
 
P
S
 
D
M
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
N
 
D
V
 
P
E
 
I
E
 
V
K
 
K
Q
 
G
D
 
V
M
 
L
C
 
T
R
 
R
F
 
L
I
 
I
L
 
R
D
 
S
V
 
L
N
 
R
H
 
E
Q
 
A
F
 
L
G
 
D
T
 
L
T
 
T
I
 
T
V
 
I
L
 
I
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
V
G
 
P
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
S
I
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
V
 
Y
V
 
V
L
 
V
D
 
A
Y
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
I
I
 
Q
G
 
G
D
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
E
V
 
L
K
 
Q
A
 
A

1oxvD Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
31% identity, 78% coverage: 59:296/307 of query aligns to 6:232/353 of 1oxvD

query
sites
1oxvD
L
 
V
Q
 
K
N
 
N
I
 
V
S
 
S
L
 
K
A
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
V
 
V
K
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
N
I
 
V
S
 
N
F
 
I
D
 
N
V
 
I
R
 
E
E
 
N
H
 
G
E
 
E
I
 
R
R
 
F
A
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
S
x
T
M
 
F
L
 
M
N
 
R
V
 
I
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
D
H
 
V
P
 
P
Q
 
S
Q
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
L
V
 
Y
F
 
F
R
 
D
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
V
G
 
A
E
 
S
E
 
N
R
 
G
R
 
K
K
 
L
M
 
I
H
 
V
P
 
P
T
 
P
A
 
E
A
 
D
A
 
R
R
 
K
Q
 
I
G
 
G
I
 
M
A
 
-
R
 
-
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
T
I
 
W
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
N
M
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
F
D
 
E
N
 
N
I
 
I
M
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
A
N
 
F
A
 
P
L
 
L
W
 
T
W
 
N
G
 
M
P
 
K
A
 
M
R
 
S
N
 
K
E
 
E
E
 
E
M
 
I
Q
 
-
H
 
-
R
 
R
R
 
K
K
 
R
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
V
I
 
A
D
 
K
F
 
I
L
 
L
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
A
 
H
I
 
V
R
 
L
K
 
N
T
 
H
P
 
F
V
 
P
G
 
R
R
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
K
E
 
D
P
 
P
S
 
S
M
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
R
E
 
M
K
 
R
Q
 
D
D
 
S
M
 
A
C
 
R
R
 
A
F
 
L
I
 
V
L
 
K
D
 
E
V
 
V
N
 
Q
H
 
S
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
V
T
 
T
I
 
L
V
 
L
L
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
G
 
A
V
 
D
V
 
I
M
 
F
D
 
A
I
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
G
V
 
V
L
 
L
D
 
V
Y
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
L
I
 
V
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
A
 
D
V
 
L
K
 
Y
A
 
D
N
 
N
P
 
P

1oxvA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
31% identity, 78% coverage: 59:296/307 of query aligns to 6:232/353 of 1oxvA

query
sites
1oxvA
L
 
V
Q
 
K
N
 
N
I
 
V
S
 
S
L
 
K
A
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
V
 
V
K
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
N
I
 
V
S
 
N
F
 
I
D
 
N
V
 
I
R
 
E
E
 
N
H
 
G
E
 
E
I
 
R
R
 
F
A
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
S
x
T
M
 
F
L
 
M
N
 
R
V
 
I
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
D
H
 
V
P
 
P
Q
 
S
Q
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
L
V
 
Y
F
 
F
R
 
D
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
V
G
 
A
E
 
S
E
 
N
R
 
G
R
 
K
K
 
L
M
 
I
H
 
V
P
 
P
T
 
P
A
 
E
A
 
D
A
 
R
R
 
K
Q
 
I
G
 
G
I
 
M
A
 
-
R
 
-
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
W
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
N
M
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
F
D
 
E
N
 
N
I
 
I
M
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
A
N
 
F
A
 
P
L
 
L
W
 
T
W
 
N
G
 
M
P
 
K
A
 
M
R
 
S
N
 
K
E
 
E
E
 
E
M
 
I
Q
 
-
H
 
-
R
 
R
R
 
K
K
 
R
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
V
I
 
A
D
 
K
F
 
I
L
 
L
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
A
 
H
I
 
V
R
 
L
K
 
N
T
 
H
P
 
F
V
 
P
G
 
R
R
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
K
E
 
D
P
 
P
S
 
S
M
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
R
E
 
M
K
 
R
Q
 
D
D
 
S
M
 
A
C
 
R
R
 
A
F
 
L
I
 
V
L
 
K
D
 
E
V
 
V
N
 
Q
H
 
S
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
V
T
 
T
I
 
L
V
 
L
L
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
G
 
A
V
 
D
V
 
I
M
 
F
D
 
A
I
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
G
V
 
V
L
 
L
D
 
V
Y
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
L
I
 
V
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
A
 
D
V
 
L
K
 
Y
A
 
D
N
 
N
P
 
P

1oxuA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
31% identity, 78% coverage: 59:296/307 of query aligns to 6:232/353 of 1oxuA

query
sites
1oxuA
L
 
V
Q
 
K
N
 
N
I
 
V
S
 
S
L
 
K
A
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
V
 
V
K
 
V
A
|
A
L
 
L
T
 
D
D
 
N
I
 
V
S
 
N
F
 
I
D
 
N
V
 
I
R
 
E
E
 
N
H
 
G
E
 
E
I
 
R
R
 
F
A
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
S
x
T
M
 
F
L
 
M
N
 
R
V
 
I
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
D
H
 
V
P
 
P
Q
 
S
Q
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
L
V
 
Y
F
 
F
R
 
D
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
V
G
 
A
E
 
S
E
 
N
R
 
G
R
 
K
K
 
L
M
 
I
H
 
V
P
 
P
T
 
P
A
 
E
A
 
D
A
 
R
R
 
K
Q
 
I
G
 
G
I
 
M
A
 
-
R
 
-
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
W
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
N
M
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
F
D
 
E
N
 
N
I
 
I
M
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
A
N
 
F
A
 
P
L
 
L
W
 
T
W
 
N
G
 
M
P
 
K
A
 
M
R
 
S
N
 
K
E
 
E
E
 
E
M
 
I
Q
 
-
H
 
-
R
 
R
R
 
K
K
 
R
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
V
I
 
A
D
 
K
F
 
I
L
 
L
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
A
 
H
I
 
V
R
 
L
K
 
N
T
 
H
P
 
F
V
 
P
G
 
R
R
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
K
E
 
D
P
 
P
S
 
S
M
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
R
E
 
M
K
 
R
Q
 
D
D
 
S
M
 
A
C
 
R
R
 
A
F
 
L
I
 
V
L
 
K
D
 
E
V
 
V
N
 
Q
H
 
S
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
V
T
 
T
I
 
L
V
 
L
L
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
G
 
A
V
 
D
V
 
I
M
 
F
D
 
A
I
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
G
V
 
V
L
 
L
D
 
V
Y
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
L
I
 
V
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
A
 
D
V
 
L
K
 
Y
A
 
D
N
 
N
P
 
P