SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS01630 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS01630 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
33% identity, 81% coverage: 56:304/307 of query aligns to 4:253/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
I
 
I
L
 
L
D
 
R
L
 
T
Q
 
E
N
 
N
I
 
I
S
 
V
L
 
K
A
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
V
x
F
K
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
G
I
 
V
S
 
S
F
 
I
D
 
S
V
 
V
R
 
N
E
 
K
H
 
G
E
 
D
I
 
V
R
 
T
A
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
I
N
 
N
V
 
V
I
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
F
Y
 
L
H
 
K
P
 
A
Q
 
D
Q
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
Y
F
 
F
R
 
E
G
 
N
E
 
K
E
 
D
R
 
I
R
 
T
K
 
N
M
 
K
H
 
E
P
 
P
T
 
A
A
 
E
A
 
L
A
 
Y
R
 
H
Q
 
Y
G
 
G
I
 
I
A
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
P
A
 
Q
L
 
P
F
 
L
K
 
K
G
 
E
M
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
N
I
 
L
M
 
L
T
 
I
G
 
G
R
 
E
N
 
I
T
 
C
R
 
P
F
 
G
R
 
E
S
 
S
G
 
P
L
 
L
L
 
-
A
 
-
N
 
N
A
 
S
L
 
L
W
 
F
W
 
Y
G
 
K
P
 
K
A
 
W
R
 
I
N
 
P
E
 
K
E
 
E
M
 
E
Q
 
E
H
 
M
R
 
V
R
 
E
K
 
K
V
 
A
E
 
F
E
 
K
V
 
I
I
 
L
D
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
K
I
 
L
Q
 
S
A
 
H
I
 
L
R
 
Y
K
 
D
T
 
R
P
 
K
V
 
A
G
 
G
R
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
M
K
 
K
R
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
A
 
T
E
 
N
P
 
P
S
 
K
M
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
A
V
 
P
E
 
G
E
 
L
K
 
A
Q
 
H
D
 
D
M
 
I
C
 
F
R
 
N
F
 
H
I
 
V
L
 
L
D
 
E
V
 
L
N
 
K
H
 
A
Q
 
K
F
 
-
G
 
G
T
 
I
T
 
T
I
 
F
V
 
L
L
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
G
 
D
V
 
I
V
 
V
M
 
L
D
 
N
I
 
Y
S
 
I
D
 
D
R
 
H
V
 
L
V
 
Y
V
 
V
L
 
M
D
 
F
Y
 
N
G
 
G
K
 
Q
K
 
I
I
 
I
G
 
A
D
 
E
G
 
G
T
 
R
P
 
G
E
 
E
A
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
V
 
V
K
 
L
A
 
S
N
 
D
P
 
P
D
 
K
V
 
V
I
 
V
R
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
33% identity, 81% coverage: 56:304/307 of query aligns to 4:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
I
 
I
L
 
L
D
 
R
L
 
T
Q
 
E
N
 
N
I
 
I
S
 
V
L
 
K
A
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
V
x
F
K
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
G
I
 
V
S
 
S
F
 
I
D
 
S
V
 
V
R
 
C
E
 
K
H
 
G
E
 
D
I
 
V
R
 
T
A
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
I
N
 
N
V
 
V
I
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
F
Y
 
L
H
 
K
P
 
A
Q
 
D
Q
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
Y
F
 
F
R
 
E
G
 
N
E
 
K
E
 
D
R
 
I
R
 
T
K
 
N
M
 
K
H
 
E
P
 
P
T
 
A
A
 
E
A
 
L
A
 
Y
R
 
H
Q
 
Y
G
 
G
I
 
I
A
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
P
A
 
Q
L
 
P
F
 
L
K
 
K
G
 
E
M
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
N
I
 
L
M
 
L
T
 
I
G
 
G
R
 
E
N
 
I
T
 
N
R
 
P
F
 
G
R
 
E
S
 
S
G
 
P
L
 
L
L
 
-
A
 
-
N
 
N
A
 
S
L
 
L
W
 
F
W
 
Y
G
 
K
P
 
K
A
 
W
R
 
I
N
 
P
E
 
K
E
 
E
M
 
E
Q
 
E
H
 
M
R
 
V
R
 
E
K
 
K
V
 
A
E
 
F
E
 
K
V
 
I
I
 
L
D
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
K
I
 
L
Q
 
S
A
 
H
I
 
L
R
 
Y
K
 
D
T
 
R
P
 
K
V
 
A
G
 
G
R
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
M
K
 
K
R
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
A
 
T
E
 
N
P
 
P
S
 
K
M
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
A
V
 
P
E
 
G
E
 
L
K
 
A
Q
 
H
D
 
D
M
 
I
C
 
F
R
 
N
F
 
H
I
 
V
L
 
L
D
 
E
V
 
L
N
 
K
H
 
A
Q
 
K
F
 
-
G
 
G
T
 
I
T
 
T
I
 
F
V
 
L
L
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
G
 
D
V
 
I
V
 
V
M
 
L
D
 
N
I
 
Y
S
 
I
D
 
D
R
 
H
V
 
L
V
 
Y
V
 
V
L
 
M
D
 
F
Y
 
N
G
 
G
K
 
Q
K
 
I
I
 
I
G
 
A
D
 
E
G
 
G
T
 
R
P
 
G
E
 
E
A
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
V
 
V
K
 
L
A
 
S
N
 
D
P
 
P
D
 
K
V
 
V
I
 
V
R
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
30% identity, 81% coverage: 56:304/307 of query aligns to 2:235/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
I
 
I
L
 
L
D
 
K
L
 
A
Q
 
Q
N
 
H
I
 
L
S
 
A
L
 
K
A
 
S
F
 
Y
G
 
K
G
 
K
V
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
V
T
 
S
D
 
D
I
 
V
S
 
S
F
 
L
D
 
Q
V
 
V
R
 
E
E
 
S
H
 
G
E
 
Q
I
 
I
R
 
V
A
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
S
 
T
M
 
S
L
 
F
N
 
Y
V
 
M
I
 
I
N
 
V
G
 
G
V
 
L
Y
 
V
H
 
A
P
 
R
Q
 
D
Q
 
E
G
 
G
R
 
T
I
 
I
V
 
T
F
 
I
R
 
D
G
 
D
E
 
N
E
 
D
R
 
I
R
 
S
K
 
I
M
 
L
H
 
P
P
 
M
T
 
H
A
 
S
A
 
R
A
 
S
R
 
R
Q
 
M
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
N
 
E
I
 
A
A
 
S
L
 
I
F
 
F
K
 
R
G
 
K
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
E
D
 
D
N
 
N
I
 
I
M
 
M
T
 
A
G
 
V
R
 
L
N
 
Q
T
 
T
R
 
R
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
-
W
 
-
W
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
N
 
-
E
 
E
E
 
E
M
 
L
Q
 
T
H
 
H
R
x
E
R
 
E
K
 
R
V
 
Q
E
x
D
E
 
K
V
 
L
I
 
E
D
 
D
F
 
L
L
 
L
E
 
E
-
 
E
-
 
F
-
 
H
I
 
I
Q
 
Q
A
 
H
I
 
I
R
 
R
K
 
K
T
 
S
P
 
A
V
 
G
G
 
M
R
 
A
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
E
Q
 
R
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
N
P
 
P
S
 
Q
M
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
V
 
P
E
 
I
E
 
S
K
 
V
Q
 
I
D
 
D
M
 
I
C
 
K
R
 
K
F
 
I
I
 
I
L
 
E
D
 
H
V
 
L
N
 
R
H
 
D
Q
 
R
F
 
-
G
 
G
T
 
L
T
 
G
I
 
V
V
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
G
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
D
I
 
V
S
 
C
D
 
E
R
 
K
V
 
A
V
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
K
 
R
K
 
L
I
 
I
G
 
A
D
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
A
 
D
V
 
V
K
 
L
A
 
N
N
 
N
P
 
E
D
 
Q
V
 
V
I
 
K
R
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
31% identity, 81% coverage: 56:303/307 of query aligns to 2:236/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
I
 
I
L
 
I
D
 
R
L
 
I
Q
 
R
N
 
N
I
 
L
S
 
H
L
 
K
A
 
W
F
|
F
G
 
G
G
 
P
V
 
L
K
 
H
A
x
V
L
 
L
T
 
K
D
 
G
I
 
I
S
 
H
F
 
L
D
 
E
V
 
V
R
 
A
E
 
P
H
 
G
E
 
E
I
 
K
R
 
L
A
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
I
N
 
R
V
 
T
I
 
I
N
 
N
G
 
R
V
 
L
Y
 
E
H
 
D
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
V
V
 
V
F
 
V
R
 
D
G
 
G
E
 
L
E
 
S
R
 
V
R
 
K
K
 
D
M
 
D
H
 
R
P
 
A
T
 
L
A
 
R
A
 
E
A
 
I
R
 
R
Q
 
R
G
 
E
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
Q
I
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
F
K
 
P
G
 
H
M
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
N
I
 
V
M
 
T
T
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
-
W
 
-
W
 
L
G
 
A
P
 
P
A
 
M
R
 
R
N
 
V
E
 
R
E
 
R
M
 
W
Q
 
P
H
 
R
R
 
E
R
 
K
K
 
A
V
 
E
E
 
K
E
 
K
V
 
A
I
 
L
D
 
E
F
 
L
L
 
L
E
 
E
-
 
R
-
 
V
-
 
G
-
 
I
I
 
L
Q
 
D
A
 
Q
I
 
A
R
 
R
K
 
K
T
 
Y
P
 
P
V
 
-
G
 
A
R
 
Q
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
M
E
 
E
P
 
P
S
 
K
M
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
V
 
P
E
 
E
E
 
-
K
 
-
Q
 
-
D
 
-
M
 
M
C
 
V
R
 
G
F
 
E
I
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
N
 
M
H
 
R
-
 
D
-
 
L
-
 
A
Q
 
Q
F
 
G
G
 
G
T
 
M
T
 
T
I
 
M
V
 
V
L
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
F
V
 
A
M
 
R
D
 
E
I
 
V
S
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
F
L
 
M
D
 
D
Y
 
G
G
 
G
K
 
Q
K
 
I
I
 
V
G
 
E
D
 
E
G
 
G
T
 
R
P
 
P
E
 
E
A
 
E
V
 
I
K
 
F
A
 
T
N
 
R
P
 
P
-
 
K
-
 
E
D
 
E
V
 
R
I
 
T
R
 
R
A
 
S
Y
 
F
L
 
L

2awnB Crystal structure of the adp-mg-bound e. Coli malk (crystallized with atp-mg) (see paper)
31% identity, 78% coverage: 57:296/307 of query aligns to 3:224/374 of 2awnB

query
sites
2awnB
L
 
V
D
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
A
 
A
F
x
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
x
V
L
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
D
 
D
V
 
I
R
 
H
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
F
R
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
H
 
T
P
 
I
Q
 
T
Q
 
S
G
 
G
R
 
D
I
 
L
V
 
-
F
 
F
R
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
K
R
 
R
R
 
-
K
 
-
M
 
M
H
 
N
P
 
D
T
 
T
A
 
P
A
 
P
A
 
A
R
 
E
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
I
 
M
M
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
L
W
 
K
W
 
L
G
 
A
P
 
G
A
 
A
R
 
K
N
 
K
E
 
E
E
 
V
M
 
I
Q
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
-
K
 
-
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
L
Q
 
A
A
 
H
I
 
L
R
 
L
K
 
D
T
 
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
R
 
A
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
M
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
D
 
Q
M
 
M
C
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
V
 
L
N
 
H
H
 
K
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
K
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
L
A
 
E
V
 
L
K
 
Y
A
 
H
N
 
Y
P
 
P

3puyA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to amp-pnp after crystal soaking of the pretranslocation state (see paper)
31% identity, 78% coverage: 57:296/307 of query aligns to 3:224/371 of 3puyA

query
sites
3puyA
L
 
V
D
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
A
 
A
F
x
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
 
V
L
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
D
 
D
V
 
I
R
 
H
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
F
R
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
H
 
T
P
 
I
Q
 
T
Q
 
S
G
 
G
R
 
D
I
 
L
V
 
-
F
 
F
R
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
K
R
 
R
R
 
-
K
 
-
M
 
M
H
 
N
P
 
D
T
 
T
A
 
P
A
 
P
A
 
A
R
 
E
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
I
 
M
M
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
L
W
 
K
W
 
L
G
 
A
P
 
G
A
 
A
R
 
K
N
 
K
E
 
E
E
 
V
M
 
I
Q
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
-
K
 
-
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
L
Q
 
A
A
 
H
I
 
L
R
 
L
K
 
D
T
x
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
R
x
A
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
|
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
M
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
D
 
Q
M
 
M
C
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
V
 
L
N
 
H
H
 
K
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
K
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
L
A
 
E
V
 
L
K
 
Y
A
 
H
N
 
Y
P
 
P

3puxA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-bef3 (see paper)
31% identity, 78% coverage: 57:296/307 of query aligns to 3:224/371 of 3puxA

query
sites
3puxA
L
 
V
D
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
A
 
A
F
x
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
 
V
L
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
D
 
D
V
 
I
R
 
H
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
F
R
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
H
 
T
P
 
I
Q
 
T
Q
 
S
G
 
G
R
 
D
I
 
L
V
 
-
F
 
F
R
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
K
R
 
R
R
 
-
K
 
-
M
 
M
H
 
N
P
 
D
T
 
T
A
 
P
A
 
P
A
 
A
R
 
E
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
I
 
M
M
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
L
W
 
K
W
 
L
G
 
A
P
 
G
A
 
A
R
 
K
N
 
K
E
 
E
E
 
V
M
 
I
Q
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
-
K
 
-
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
L
Q
 
A
A
 
H
I
 
L
R
 
L
K
 
D
T
x
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
R
 
A
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
|
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
M
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
D
 
Q
M
 
M
C
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
V
 
L
N
 
H
H
 
K
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
K
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
L
A
 
E
V
 
L
K
 
Y
A
 
H
N
 
Y
P
 
P

3puwA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-alf4 (see paper)
31% identity, 78% coverage: 57:296/307 of query aligns to 3:224/371 of 3puwA

query
sites
3puwA
L
 
V
D
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
A
 
A
F
x
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
x
V
L
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
D
 
D
V
 
I
R
 
H
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
F
R
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
H
 
T
P
 
I
Q
 
T
Q
 
S
G
 
G
R
 
D
I
 
L
V
 
-
F
 
F
R
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
K
R
 
R
R
 
-
K
 
-
M
 
M
H
 
N
P
 
D
T
 
T
A
 
P
A
 
P
A
 
A
R
 
E
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
I
 
M
M
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
L
W
 
K
W
 
L
G
 
A
P
 
G
A
 
A
R
 
K
N
 
K
E
 
E
E
 
V
M
 
I
Q
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
-
K
 
-
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
L
Q
 
A
A
 
H
I
 
L
R
 
L
K
 
D
T
x
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
R
x
A
L
 
L
P
x
S
Y
x
G
G
|
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
M
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
D
 
Q
M
 
M
C
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
V
 
L
N
 
H
H
 
K
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
K
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
L
A
 
E
V
 
L
K
 
Y
A
 
H
N
 
Y
P
 
P

3puvA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-vo4 (see paper)
31% identity, 78% coverage: 57:296/307 of query aligns to 3:224/371 of 3puvA

query
sites
3puvA
L
 
V
D
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
A
 
A
F
x
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
x
V
L
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
D
 
D
V
 
I
R
 
H
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
F
R
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
H
 
T
P
 
I
Q
 
T
Q
 
S
G
 
G
R
 
D
I
 
L
V
 
-
F
 
F
R
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
K
R
 
R
R
 
-
K
 
-
M
 
M
H
 
N
P
 
D
T
 
T
A
 
P
A
 
P
A
 
A
R
 
E
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
I
 
M
M
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
L
W
 
K
W
 
L
G
 
A
P
 
G
A
 
A
R
 
K
N
 
K
E
 
E
E
 
V
M
 
I
Q
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
-
K
 
-
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
L
Q
 
A
A
 
H
I
 
L
R
 
L
K
 
D
T
x
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
R
x
A
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
 
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
M
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
D
 
Q
M
 
M
C
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
V
 
L
N
 
H
H
 
K
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
K
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
L
A
 
E
V
 
L
K
 
Y
A
 
H
N
 
Y
P
 
P

P68187 Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein MalK; EC 7.5.2.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 5 papers)
31% identity, 78% coverage: 57:296/307 of query aligns to 4:225/371 of P68187

query
sites
P68187
L
 
V
D
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
A
 
A
F
 
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
 
V
L
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
D
 
D
V
 
I
R
 
H
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
F
R
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
S
S
 
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
H
 
T
P
 
I
Q
 
T
Q
 
S
G
 
G
R
 
D
I
 
L
V
 
-
F
 
F
R
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
K
R
 
R
R
 
-
K
 
-
M
 
M
H
 
N
P
 
D
T
 
T
A
 
P
A
 
P
A
 
A
R
 
E
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
Y
A
|
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
I
 
M
M
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
L
W
 
K
W
 
L
G
 
A
P
 
G
A
 
A
R
x
K
N
 
K
E
 
E
E
 
V
M
 
I
Q
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
-
K
 
-
V
|
V
E
 
N
E
 
Q
V
|
V
I
 
A
D
x
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
L
Q
x
A
A
 
H
I
 
L
R
 
L
K
 
D
T
 
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
R
 
A
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
|
G
L
 
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
M
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
D
 
Q
M
 
M
C
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
V
 
L
N
 
H
H
 
K
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
K
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
L
A
 
E
V
 
L
K
 
Y
A
 
H
N
 
Y
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1q12A Crystal structure of the atp-bound e. Coli malk (see paper)
31% identity, 78% coverage: 57:296/307 of query aligns to 1:222/367 of 1q12A

query
sites
1q12A
L
 
V
D
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
A
 
A
F
x
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
 
V
L
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
D
 
D
V
 
I
R
 
H
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
F
R
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
H
 
T
P
 
I
Q
 
T
Q
 
S
G
 
G
R
 
D
I
 
L
V
 
-
F
 
F
R
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
K
R
 
R
R
 
-
K
 
-
M
 
M
H
 
N
P
 
D
T
 
T
A
 
P
A
 
P
A
 
A
R
 
E
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
I
 
M
M
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
L
W
 
K
W
 
L
G
 
A
P
 
G
A
 
A
R
 
K
N
 
K
E
 
E
E
 
V
M
 
I
Q
 
N
H
 
Q
R
 
R
R
 
-
K
 
-
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
L
Q
 
A
A
 
H
I
 
L
R
 
L
K
 
D
T
x
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
R
x
A
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
|
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
M
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
D
 
Q
M
 
M
C
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
V
 
L
N
 
H
H
 
K
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
K
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
L
A
 
E
V
 
L
K
 
Y
A
 
H
N
 
Y
P
 
P

5x40A Structure of a cbio dimer bound with amppcp (see paper)
33% identity, 78% coverage: 56:295/307 of query aligns to 4:230/280 of 5x40A

query
sites
5x40A
I
 
I
L
 
L
D
 
A
L
 
A
Q
 
E
N
 
A
I
 
L
S
 
T
L
 
Y
A
 
A
F
|
F
-
 
P
G
 
G
G
 
G
V
|
V
K
 
K
A
|
A
L
 
L
T
 
D
D
 
D
I
 
L
S
 
S
F
 
L
D
 
A
V
 
V
R
 
P
E
 
K
H
 
G
E
 
E
I
 
S
R
 
L
A
 
A
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
L
V
 
H
I
 
L
N
 
N
G
 
G
V
 
T
Y
 
L
H
 
R
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
L
F
 
L
R
 
G
G
 
G
E
 
T
-
 
A
-
 
T
-
 
G
E
 
H
R
 
S
R
 
R
K
 
K
M
 
D
H
 
L
P
 
T
T
 
G
A
 
W
A
 
R
A
 
R
R
 
R
Q
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
V
R
 
L
T
x
Q
F
 
D
Q
 
A
N
 
D
I
 
D
A
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
-
G
 
A
M
 
T
T
 
T
V
 
V
L
 
F
D
 
E
N
 
D
I
 
V
M
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
P
F
 
L
R
 
N
S
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
-
W
 
-
W
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
N
 
-
E
 
S
E
 
E
M
 
A
Q
 
E
H
 
A
R
 
R
R
 
A
K
 
R
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
A
I
 
L
D
 
A
F
 
A
L
 
L
E
 
S
I
 
I
Q
 
S
A
 
D
I
 
L
R
 
R
K
 
D
T
 
R
P
 
P
V
 
T
G
x
H
R
x
M
L
|
L
P
x
S
Y
 
G
G
|
G
L
x
Q
Q
 
K
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
G
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
M
E
 
R
P
 
P
S
 
E
M
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
P
 
P
M
 
T
A
 
A
G
 
G
M
 
L
N
 
D
V
 
L
E
 
A
E
 
G
K
 
T
Q
 
E
D
 
Q
M
 
L
C
 
L
R
 
T
F
 
L
I
 
L
L
 
R
D
 
G
V
 
L
N
 
R
H
 
A
Q
 
A
F
 
-
G
 
G
T
 
M
T
 
T
I
 
L
V
 
V
L
 
F
I
 
S
E
 
T
H
|
H
D
 
D
M
 
V
G
 
E
V
 
L
V
 
A
M
 
A
D
 
A
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
A
V
 
L
L
 
F
D
 
R
Y
 
T
G
 
G
K
 
R
K
 
V
I
 
L
G
 
A
D
 
E
G
 
G
T
 
A
P
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
L
A
 
S
N
 
D

6z5uK Cryo-em structure of the a. Baumannii mlabdef complex bound to appnhp (see paper)
30% identity, 78% coverage: 56:294/307 of query aligns to 2:228/253 of 6z5uK

query
sites
6z5uK
I
 
L
L
 
I
D
 
E
L
 
V
Q
 
K
N
 
N
I
 
L
S
 
S
L
 
F
A
 
N
F
x
R
G
 
G
G
 
E
V
 
R
K
 
V
A
 
I
L
 
Y
T
 
D
D
 
N
I
 
I
S
 
S
F
 
L
D
 
N
V
 
I
R
 
R
E
 
R
H
 
G
E
 
Q
I
 
I
R
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
T
G
|
G
K
|
K
S
x
T
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
L
I
 
I
N
 
G
G
 
G
V
 
Q
Y
 
L
H
 
V
P
 
P
Q
 
D
Q
 
Q
G
 
G
R
 
E
I
 
V
V
 
L
F
 
L
R
 
D
G
 
G
E
 
K
E
 
D
R
 
I
R
 
A
K
 
Q
M
 
M
-
 
S
-
 
R
H
 
Q
P
 
E
T
 
L
A
 
F
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
A
G
 
R
I
 
M
A
 
G
R
 
M
T
 
L
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
I
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
K
 
T
G
 
D
M
 
M
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
V
M
 
-
T
 
-
G
 
A
R
 
F
N
 
P
T
 
I
R
 
R
F
 
A
R
 
H
S
 
T
G
 
K
L
 
L
L
 
S
A
 
E
N
 
N
A
 
L
L
 
I
W
 
A
W
 
E
G
 
L
P
 
V
A
 
A
R
 
L
N
 
K
E
 
L
E
 
E
M
 
S
Q
 
V
H
 
G
R
 
L
R
 
R
K
 
G
V
 
T
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
I
 
M
D
 
P
F
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
-
Q
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
T
R
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
M
Q
 
N
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
L
E
 
D
P
 
P
S
 
D
M
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
N
 
D
V
 
P
E
 
I
E
 
V
K
 
K
Q
 
G
D
 
V
M
 
L
C
 
T
R
 
R
F
 
L
I
 
I
L
 
R
D
 
S
V
 
L
N
 
R
H
 
E
Q
 
A
F
 
L
G
 
D
T
 
L
T
 
T
I
 
T
V
 
I
L
 
I
I
 
V
E
 
S
H
|
H
D
 
D
M
 
V
G
 
P
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
S
I
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
V
 
Y
V
 
V
L
 
V
D
 
A
Y
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
I
I
 
Q
G
 
G
D
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
E
V
 
L
K
 
Q
A
 
A

7d0aB Acinetobacter mlafedb complex in adp-vanadate trapped vclose conformation (see paper)
30% identity, 78% coverage: 56:294/307 of query aligns to 4:230/263 of 7d0aB

query
sites
7d0aB
I
 
L
L
 
I
D
 
E
L
 
V
Q
 
K
N
 
N
I
 
L
S
 
S
L
 
F
A
 
N
F
 
R
G
 
G
G
 
E
V
 
R
K
 
V
A
 
I
L
 
Y
T
 
D
D
 
N
I
 
I
S
 
S
F
 
L
D
 
N
V
 
I
R
 
R
E
 
R
H
 
G
E
 
Q
I
 
I
R
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
 
G
A
x
T
G
|
G
K
|
K
S
 
T
S
 
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
L
I
 
I
N
 
G
G
 
G
V
 
Q
Y
 
L
H
 
V
P
 
P
Q
 
D
Q
 
Q
G
 
G
R
 
E
I
 
V
V
 
L
F
 
L
R
 
D
G
 
G
E
 
K
E
 
D
R
 
I
R
 
A
K
 
Q
M
 
M
-
 
S
-
 
R
H
 
Q
P
 
E
T
 
L
A
 
F
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
A
G
 
R
I
 
M
A
 
G
R
 
M
T
 
L
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
K
 
T
G
 
D
M
 
M
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
V
M
 
-
T
 
-
G
 
A
R
 
F
N
 
P
T
 
I
R
 
R
F
 
A
R
 
H
S
 
T
G
 
K
L
 
L
L
 
S
A
 
E
N
 
N
A
 
L
L
 
I
W
 
A
W
 
E
G
 
L
P
 
V
A
 
A
R
 
L
N
 
K
E
 
L
E
 
E
M
 
S
Q
 
V
H
 
G
R
 
L
R
 
R
K
 
G
V
 
T
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
I
 
M
D
 
P
F
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
-
Q
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
T
R
x
E
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
 
G
L
x
M
Q
 
N
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
L
E
 
D
P
 
P
S
 
D
M
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
N
 
D
V
 
P
E
 
I
E
 
V
K
 
K
Q
 
G
D
 
V
M
 
L
C
 
T
R
 
R
F
 
L
I
 
I
L
 
R
D
 
S
V
 
L
N
 
R
H
 
E
Q
 
A
F
 
L
G
 
D
T
 
L
T
 
T
I
 
T
V
 
I
L
 
I
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
V
G
 
P
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
S
I
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
V
 
Y
V
 
V
L
 
V
D
 
A
Y
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
I
I
 
Q
G
 
G
D
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
E
V
 
L
K
 
Q
A
 
A

7d08B Acinetobacter mlafedb complex in atp-bound vtrans1 conformation (see paper)
30% identity, 78% coverage: 56:294/307 of query aligns to 4:230/263 of 7d08B

query
sites
7d08B
I
 
L
L
 
I
D
 
E
L
 
V
Q
 
K
N
 
N
I
 
L
S
 
S
L
 
F
A
 
N
F
x
R
G
 
G
G
 
E
V
x
R
K
 
V
A
 
I
L
 
Y
T
 
D
D
 
N
I
 
I
S
 
S
F
 
L
D
 
N
V
 
I
R
 
R
E
 
R
H
 
G
E
 
Q
I
 
I
R
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
T
G
 
G
K
|
K
S
x
T
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
L
I
 
I
N
 
G
G
 
G
V
 
Q
Y
 
L
H
 
V
P
 
P
Q
 
D
Q
 
Q
G
 
G
R
 
E
I
 
V
V
 
L
F
 
L
R
 
D
G
 
G
E
 
K
E
 
D
R
 
I
R
 
A
K
 
Q
M
 
M
-
 
S
-
 
R
H
 
Q
P
 
E
T
 
L
A
 
F
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
A
G
 
R
I
 
M
A
 
G
R
 
M
T
 
L
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
K
 
T
G
 
D
M
 
M
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
V
M
 
-
T
 
-
G
 
A
R
 
F
N
 
P
T
 
I
R
 
R
F
 
A
R
 
H
S
 
T
G
 
K
L
 
L
L
 
S
A
 
E
N
 
N
A
 
L
L
 
I
W
 
A
W
 
E
G
 
L
P
 
V
A
 
A
R
 
L
N
 
K
E
 
L
E
 
E
M
 
S
Q
 
V
H
 
G
R
 
L
R
 
R
K
 
G
V
 
T
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
I
 
M
D
 
P
F
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
-
Q
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
T
R
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
M
Q
 
N
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
L
E
 
D
P
 
P
S
 
D
M
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
N
 
D
V
 
P
E
 
I
E
 
V
K
 
K
Q
 
G
D
 
V
M
 
L
C
 
T
R
 
R
F
 
L
I
 
I
L
 
R
D
 
S
V
 
L
N
 
R
H
 
E
Q
 
A
F
 
L
G
 
D
T
 
L
T
 
T
I
 
T
V
 
I
L
 
I
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
V
G
 
P
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
S
I
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
V
 
Y
V
 
V
L
 
V
D
 
A
Y
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
I
I
 
Q
G
 
G
D
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
E
V
 
L
K
 
Q
A
 
A

1oxvD Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
31% identity, 78% coverage: 59:296/307 of query aligns to 6:232/353 of 1oxvD

query
sites
1oxvD
L
 
V
Q
 
K
N
 
N
I
 
V
S
 
S
L
 
K
A
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
V
 
V
K
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
N
I
 
V
S
 
N
F
 
I
D
 
N
V
 
I
R
 
E
E
 
N
H
 
G
E
 
E
I
 
R
R
 
F
A
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
S
x
T
M
 
F
L
 
M
N
 
R
V
 
I
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
D
H
 
V
P
 
P
Q
 
S
Q
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
L
V
 
Y
F
 
F
R
 
D
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
V
G
 
A
E
 
S
E
 
N
R
 
G
R
 
K
K
 
L
M
 
I
H
 
V
P
 
P
T
 
P
A
 
E
A
 
D
A
 
R
R
 
K
Q
 
I
G
 
G
I
 
M
A
 
-
R
 
-
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
T
I
 
W
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
N
M
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
F
D
 
E
N
 
N
I
 
I
M
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
A
N
 
F
A
 
P
L
 
L
W
 
T
W
 
N
G
 
M
P
 
K
A
 
M
R
 
S
N
 
K
E
 
E
E
 
E
M
 
I
Q
 
-
H
 
-
R
 
R
R
 
K
K
 
R
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
V
I
 
A
D
 
K
F
 
I
L
 
L
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
A
 
H
I
 
V
R
 
L
K
 
N
T
 
H
P
 
F
V
 
P
G
 
R
R
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
K
E
 
D
P
 
P
S
 
S
M
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
R
E
 
M
K
 
R
Q
 
D
D
 
S
M
 
A
C
 
R
R
 
A
F
 
L
I
 
V
L
 
K
D
 
E
V
 
V
N
 
Q
H
 
S
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
V
T
 
T
I
 
L
V
 
L
L
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
G
 
A
V
 
D
V
 
I
M
 
F
D
 
A
I
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
G
V
 
V
L
 
L
D
 
V
Y
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
L
I
 
V
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
A
 
D
V
 
L
K
 
Y
A
 
D
N
 
N
P
 
P

1oxvA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
31% identity, 78% coverage: 59:296/307 of query aligns to 6:232/353 of 1oxvA

query
sites
1oxvA
L
 
V
Q
 
K
N
 
N
I
 
V
S
 
S
L
 
K
A
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
V
 
V
K
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
N
I
 
V
S
 
N
F
 
I
D
 
N
V
 
I
R
 
E
E
 
N
H
 
G
E
 
E
I
 
R
R
 
F
A
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
S
x
T
M
 
F
L
 
M
N
 
R
V
 
I
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
D
H
 
V
P
 
P
Q
 
S
Q
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
L
V
 
Y
F
 
F
R
 
D
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
V
G
 
A
E
 
S
E
 
N
R
 
G
R
 
K
K
 
L
M
 
I
H
 
V
P
 
P
T
 
P
A
 
E
A
 
D
A
 
R
R
 
K
Q
 
I
G
 
G
I
 
M
A
 
-
R
 
-
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
W
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
N
M
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
F
D
 
E
N
 
N
I
 
I
M
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
A
N
 
F
A
 
P
L
 
L
W
 
T
W
 
N
G
 
M
P
 
K
A
 
M
R
 
S
N
 
K
E
 
E
E
 
E
M
 
I
Q
 
-
H
 
-
R
 
R
R
 
K
K
 
R
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
V
I
 
A
D
 
K
F
 
I
L
 
L
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
A
 
H
I
 
V
R
 
L
K
 
N
T
 
H
P
 
F
V
 
P
G
 
R
R
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
K
E
 
D
P
 
P
S
 
S
M
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
R
E
 
M
K
 
R
Q
 
D
D
 
S
M
 
A
C
 
R
R
 
A
F
 
L
I
 
V
L
 
K
D
 
E
V
 
V
N
 
Q
H
 
S
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
V
T
 
T
I
 
L
V
 
L
L
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
G
 
A
V
 
D
V
 
I
M
 
F
D
 
A
I
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
G
V
 
V
L
 
L
D
 
V
Y
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
L
I
 
V
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
A
 
D
V
 
L
K
 
Y
A
 
D
N
 
N
P
 
P

1oxuA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
31% identity, 78% coverage: 59:296/307 of query aligns to 6:232/353 of 1oxuA

query
sites
1oxuA
L
 
V
Q
 
K
N
 
N
I
 
V
S
 
S
L
 
K
A
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
V
 
V
K
 
V
A
|
A
L
 
L
T
 
D
D
 
N
I
 
V
S
 
N
F
 
I
D
 
N
V
 
I
R
 
E
E
 
N
H
 
G
E
 
E
I
 
R
R
 
F
A
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
S
x
T
M
 
F
L
 
M
N
 
R
V
 
I
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
D
H
 
V
P
 
P
Q
 
S
Q
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
L
V
 
Y
F
 
F
R
 
D
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
V
G
 
A
E
 
S
E
 
N
R
 
G
R
 
K
K
 
L
M
 
I
H
 
V
P
 
P
T
 
P
A
 
E
A
 
D
A
 
R
R
 
K
Q
 
I
G
 
G
I
 
M
A
 
-
R
 
-
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
W
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
N
M
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
F
D
 
E
N
 
N
I
 
I
M
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
A
N
 
F
A
 
P
L
 
L
W
 
T
W
 
N
G
 
M
P
 
K
A
 
M
R
 
S
N
 
K
E
 
E
E
 
E
M
 
I
Q
 
-
H
 
-
R
 
R
R
 
K
K
 
R
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
V
I
 
A
D
 
K
F
 
I
L
 
L
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
A
 
H
I
 
V
R
 
L
K
 
N
T
 
H
P
 
F
V
 
P
G
 
R
R
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
K
E
 
D
P
 
P
S
 
S
M
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
R
E
 
M
K
 
R
Q
 
D
D
 
S
M
 
A
C
 
R
R
 
A
F
 
L
I
 
V
L
 
K
D
 
E
V
 
V
N
 
Q
H
 
S
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
V
T
 
T
I
 
L
V
 
L
L
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
G
 
A
V
 
D
V
 
I
M
 
F
D
 
A
I
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
G
V
 
V
L
 
L
D
 
V
Y
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
L
I
 
V
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
A
 
D
V
 
L
K
 
Y
A
 
D
N
 
N
P
 
P

Q97UY8 Glucose import ATP-binding protein GlcV; EC 7.5.2.- from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
31% identity, 78% coverage: 59:296/307 of query aligns to 6:232/353 of Q97UY8

query
sites
Q97UY8
L
 
V
Q
 
K
N
 
N
I
 
V
S
 
S
L
 
K
A
 
V
F
 
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
V
 
V
K
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
N
I
 
V
S
 
N
F
 
I
D
 
N
V
 
I
R
 
E
E
 
N
H
 
G
E
 
E
I
 
R
R
 
F
A
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
S
 
T
M
 
F
L
 
M
N
 
R
V
 
I
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
D
H
 
V
P
 
P
Q
 
S
Q
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
L
V
 
Y
F
 
F
R
 
D
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
V
G
 
A
E
 
S
E
 
N
R
 
G
R
 
K
K
 
L
M
 
I
H
 
V
P
 
P
T
 
P
A
 
E
A
 
D
A
 
R
R
 
K
Q
 
I
G
 
G
I
 
M
A
 
-
R
 
-
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
W
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
N
M
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
F
D
 
E
N
 
N
I
 
I
M
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
A
N
 
F
A
 
P
L
 
L
W
 
T
W
 
N
G
 
M
P
 
K
A
 
M
R
 
S
N
 
K
E
 
E
E
 
E
M
 
I
Q
 
-
H
 
-
R
 
R
R
 
K
K
 
R
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
V
I
 
A
D
 
K
F
 
I
L
 
L
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
A
 
H
I
 
V
R
 
L
K
 
N
T
 
H
P
 
F
V
 
P
G
 
R
R
 
E
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
|
G
L
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
K
E
 
D
P
 
P
S
 
S
M
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
R
E
 
M
K
 
R
Q
 
D
D
 
S
M
 
A
C
 
R
R
 
A
F
 
L
I
 
V
L
 
K
D
 
E
V
 
V
N
 
Q
H
 
S
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
V
T
 
T
I
 
L
V
 
L
L
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
G
 
A
V
 
D
V
 
I
M
 
F
D
 
A
I
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
G
V
 
V
L
 
L
D
 
V
Y
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
L
I
 
V
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
A
 
D
V
 
L
K
 
Y
A
 
D
N
 
N
P
 
P

P04983 Ribose import ATP-binding protein RbsA; EC 7.5.2.7 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
30% identity, 76% coverage: 54:286/307 of query aligns to 2:222/501 of P04983

query
sites
P04983
D
 
E
V
 
A
I
 
L
L
 
L
D
 
Q
L
 
L
Q
 
K
N
 
G
I
 
I
S
 
D
L
 
K
A
 
A
F
 
F
G
 
P
G
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
S
D
 
G
I
 
A
S
 
A
F
 
L
D
 
N
V
 
V
R
 
Y
E
 
P
H
 
G
E
 
R
I
 
V
R
 
M
A
 
A
I
 
L
I
 
V
G
 
G
P
 
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
S
 
T
M
 
M
L
 
M
N
 
K
V
 
V
I
 
L
N
 
T
G
 
G
V
 
I
Y
 
Y
H
 
T
P
 
R
Q
 
D
Q
 
A
G
 
G
R
 
T
I
 
L
V
 
L
F
 
W
R
 
L
G
 
G
E
 
K
E
 
E
R
 
T
R
 
T
K
 
F
M
 
T
H
 
G
P
 
P
T
 
K
A
 
S
A
 
S
A
 
Q
R
 
E
Q
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
I
T
 
I
F
 
H
Q
 
Q
N
 
E
I
 
L
A
 
N
L
 
L
F
 
I
K
 
P
G
 
Q
M
 
L
T
 
T
V
 
I
L
 
A
D
 
E
N
 
N
I
 
I
M
 
F
T
 
L
G
 
G
R
 
R
N
 
E
T
 
F
R
 
V
F
 
N
R
 
R
S
 
F
G
 
G
L
 
K
L
 
I
A
 
D
N
 
W
A
 
K
L
 
T
W
 
M
W
 
Y
G
 
A
P
 
E
A
 
A
R
 
-
N
 
-
E
 
-
E
 
-
M
 
-
Q
 
-
H
 
-
R
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
E
 
D
E
 
K
V
 
L
I
 
L
D
 
A
F
 
K
L
 
L
E
 
N
I
 
L
Q
 
R
A
 
F
I
 
K
R
 
S
K
 
D
T
 
K
P
 
L
V
 
V
G
 
G
R
 
D
L
 
L
P
 
S
Y
 
I
G
 
G
L
 
D
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
M
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
V
L
 
L
A
 
S
A
 
F
E
 
E
P
 
S
S
 
K
M
 
V
L
 
I
L
 
I
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
T
A
 
D
G
 
A
M
 
L
N
 
T
V
 
D
E
 
T
E
 
E
K
 
T
Q
 
E
D
 
S
M
 
L
C
 
F
R
 
R
F
 
V
I
 
I
L
 
R
D
 
E
V
 
L
N
 
K
H
 
S
Q
 
Q
F
 
-
G
 
G
T
 
R
T
 
G
I
 
I
V
 
V
L
 
Y
I
 
I
E
 
S
H
 
H
D
 
R
M
 
M
G
 
K
V
 
E
V
 
I
M
 
F
D
 
E
I
 
I
S
 
C
D
 
D
R
 
D
V
 
V
V
 
T
V
 
V
L
 
F
D
 
R
Y
 
D
G
 
G
K
 
Q
K
 
F
I
 
I
G
 
A
D
 
E

Query Sequence

>RR42_RS01630 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS01630
MSRGERMTQMAWQGVGRGGDGQPAWSGASAGAGATAQALGGVQMEHAQVRQAGDVILDLQ
NISLAFGGVKALTDISFDVREHEIRAIIGPNGAGKSSMLNVINGVYHPQQGRIVFRGEER
RKMHPTAAARQGIARTFQNIALFKGMTVLDNIMTGRNTRFRSGLLANALWWGPARNEEMQ
HRRKVEEVIDFLEIQAIRKTPVGRLPYGLQKRVELARALAAEPSMLLLDEPMAGMNVEEK
QDMCRFILDVNHQFGTTIVLIEHDMGVVMDISDRVVVLDYGKKIGDGTPEAVKANPDVIR
AYLGAGH

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory