SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS02380 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS02380 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6lpxA Crystal structure of human d-2-hydroxyglutarate dehydrogenase in complex with 2-oxoglutarate (2-og) (see paper)
23% identity, 28% coverage: 193:566/1324 of query aligns to 49:358/466 of 6lpxA

query
sites
6lpxA
V
 
V
V
 
L
L
 
L
T
 
R
P
 
P
D
 
R
T
 
T
E
 
S
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
S
G
 
H
M
 
I
V
 
L
K
 
R
G
 
H
C
 
C
F
 
H
E
 
E
L
 
R
G
 
N
L
 
L
T
 
A
I
 
V
I
 
N
P
|
P
R
x
Q
G
|
G
G
|
G
G
x
N
T
|
T
G
|
G
Y
x
M
T
 
V
G
 
G
G
|
G
A
x
S
V
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
F
P
 
D
M
 
-
S
 
E
A
 
I
V
 
I
I
 
L
N
 
S
T
 
T
E
 
A
K
 
R
L
 
M
E
 
N
Q
 
R
L
 
V
G
 
L
P
 
S
V
 
F
E
 
H
Q
 
S
T
 
V
D
 
S
L
 
-
P
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
G
T
 
I
I
 
L
F
 
V
S
 
C
G
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
V
T
 
L
R
 
E
R
 
E
V
 
L
A
 
S
D
 
R
A
 
Y
A
 
V
D
 
E
K
 
E
A
 
R
G
 
D
L
 
F
V
 
I
F
 
M
A
 
P
V
 
L
D
 
D
P
x
L
T
x
G
S
x
A
I
 
K
D
 
G
A
 
S
S
x
C
C
 
H
I
 
I
G
 
G
G
|
G
N
|
N
V
 
V
A
|
A
M
x
T
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
|
G
K
 
L
K
 
R
A
 
F
V
 
L
L
 
R
W
 
Y
G
 
G
T
 
S
A
 
L
L
 
H
D
 
G
N
 
T
L
 
V
A
 
L
W
 
G
W
 
L
R
 
E
M
 
V
V
 
V
D
 
L
P
 
A
E
 
D
G
 
G
N
 
T
W
 
V
L
 
L
E
 
D
V
 
C
T
 
L
R
 
-
L
 
-
D
 
-
H
 
-
N
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
-
H
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
W
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
T
K
 
S
F
 
L
R
 
R
K
 
K
E
 
D
G
 
N
L
 
T
G
 
G
K
 
Y
D
 
D
V
 
L
T
 
K
D
 
Q
K
 
L
F
 
F
L
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
I
Q
 
G
K
 
S
E
 
E
G
|
G
C
 
T
D
 
L
G
 
G
I
 
I
I
|
I
T
 
T
S
 
T
A
 
V
R
 
S
W
 
I
I
 
L
L
 
-
H
 
-
R
 
-
M
 
C
P
 
P
A
 
P
H
 
K
V
 
P
R
 
R
T
 
A
V
 
V
C
 
N
L
 
V
E
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
G
Q
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
C
P
 
P
S
 
G
I
 
F
V
 
A
E
 
E
I
 
V
K
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
L
D
 
Q
A
 
T
E
 
F
S
 
S
R
 
T
T
 
C
P
 
K
G
 
G
-
 
M
-
 
L
G
 
G
A
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
S
G
 
A
L
 
F
E
 
E
H
 
F
L
 
M
D
 
D
E
 
A
R
 
V
Y
 
C
L
 
M
R
 
Q
A
 
L
V
 
V
G
 
G
-
 
R
-
 
H
Y
 
L
A
 
H
T
 
L
K
 
A
S
 
S
K
 
P
R
 
V
N
 
Q
A
 
E
F
 
S
P
 
P
K
 
F
M
 
Y
V
 
V
L
 
L
I
 
I
-
 
E
-
 
T
-
 
S
G
 
G
D
 
S
I
 
N
V
 
A
G
 
G
D
 
H
D
 
D
Q
 
A
D
 
E
A
 
K
V
 
L
A
 
G
R
 
H
A
 
F
T
 
L
S
 
E
E
 
H
V
 
A
I
 
-
R
 
-
M
 
L
A
 
G
N
 
S
G
 
G
K
 
L
S
 
V
G
 
T
E
 
D
G
 
G
F
 
T
V
 
M
A
 
A
V
 
T
S
 
D
P
 
Q
E
 
R
A
 
K
R
 
V
K
 
K
K
 
M
F
 
L
W
 
W
L
 
A
D
 
L
R
|
R
S
 
E
R
 
R
-
 
I
T
|
T
A
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
S
R
 
R
H
 
D
T
 
G
N
 
Y
A
 
V
F
 
Y
K
|
K
I
 
Y
N
 
-
E
 
-
D
 
D
V
 
L
V
 
S
I
 
L
P
 
P
L
 
V
P
 
E
R
 
R
M
 
L

Sites not aligning to the query:

6lpuA Crystal structure of human d-2-hydroxyglutarate dehydrogenase in complex with l-2-hydroxyglutarate (l-2-hg) (see paper)
23% identity, 28% coverage: 193:566/1324 of query aligns to 49:358/466 of 6lpuA

query
sites
6lpuA
V
 
V
V
 
L
L
 
L
T
 
R
P
 
P
D
 
R
T
 
T
E
 
S
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
S
G
 
H
M
 
I
V
 
L
K
 
R
G
 
H
C
 
C
F
 
H
E
 
E
L
 
R
G
 
N
L
 
L
T
 
A
I
 
V
I
 
N
P
|
P
R
 
Q
G
|
G
G
|
G
G
x
N
T
|
T
G
|
G
Y
 
M
T
 
V
G
 
G
G
|
G
A
x
S
V
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
F
P
 
D
M
 
-
S
 
E
A
 
I
V
 
I
I
 
L
N
 
S
T
 
T
E
 
A
K
 
R
L
 
M
E
 
N
Q
 
R
L
 
V
G
 
L
P
 
S
V
 
F
E
 
H
Q
 
S
T
 
V
D
 
S
L
 
-
P
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
G
T
 
I
I
 
L
F
 
V
S
 
C
G
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
V
T
 
L
R
 
E
R
 
E
V
 
L
A
 
S
D
 
R
A
 
Y
A
 
V
D
 
E
K
 
E
A
 
R
G
 
D
L
 
F
V
 
I
F
 
M
A
 
P
V
 
L
D
 
D
P
x
L
T
x
G
S
x
A
I
 
K
D
 
G
A
 
S
S
x
C
C
x
H
I
 
I
G
|
G
G
|
G
N
|
N
V
 
V
A
|
A
M
x
T
N
 
N
A
|
A
G
 
G
G
 
G
K
 
L
K
 
R
A
 
F
V
 
L
L
 
R
W
 
Y
G
 
G
T
 
S
A
 
L
L
 
H
D
 
G
N
 
T
L
 
V
A
 
L
W
 
G
W
 
L
R
 
E
M
 
V
V
 
V
D
 
L
P
 
A
E
 
D
G
 
G
N
 
T
W
 
V
L
 
L
E
 
D
V
 
C
T
 
L
R
 
-
L
 
-
D
 
-
H
 
-
N
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
-
H
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
W
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
T
K
 
S
F
 
L
R
 
R
K
 
K
E
 
D
G
 
N
L
 
T
G
 
G
K
 
Y
D
 
D
V
 
L
T
 
K
D
 
Q
K
 
L
F
 
F
L
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
I
Q
 
G
K
 
S
E
|
E
G
|
G
C
 
T
D
 
L
G
 
G
I
|
I
I
|
I
T
 
T
S
 
T
A
 
V
R
 
S
W
 
I
I
 
L
L
 
-
H
 
-
R
 
-
M
 
C
P
 
P
A
 
P
H
 
K
V
 
P
R
 
R
T
 
A
V
 
V
C
 
N
L
 
V
E
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
G
Q
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
C
P
 
P
S
 
G
I
 
F
V
 
A
E
 
E
I
 
V
K
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
L
D
 
Q
A
 
T
E
 
F
S
 
S
R
 
T
T
 
C
P
 
K
G
 
G
-
 
M
-
 
L
G
 
G
A
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
S
G
 
A
L
 
F
E
 
E
H
 
F
L
 
M
D
 
D
E
 
A
R
 
V
Y
 
C
L
 
M
R
 
Q
A
 
L
V
 
V
G
 
G
-
 
R
-
 
H
Y
 
L
A
 
H
T
 
L
K
 
A
S
 
S
K
 
P
R
 
V
N
 
Q
A
 
E
F
 
S
P
 
P
K
 
F
M
 
Y
V
 
V
L
 
L
I
 
I
-
 
E
-
 
T
-
 
S
G
 
G
D
 
S
I
 
N
V
 
A
G
 
G
D
 
H
D
 
D
Q
 
A
D
 
E
A
 
K
V
 
L
A
 
G
R
 
H
A
 
F
T
 
L
S
 
E
E
 
H
V
 
A
I
 
-
R
 
-
M
 
L
A
 
G
N
 
S
G
 
G
K
 
L
S
 
V
G
 
T
E
 
D
G
 
G
F
 
T
V
 
M
A
 
A
V
 
T
S
 
D
P
 
Q
E
 
R
A
 
K
R
 
V
K
 
K
K
 
M
F
 
L
W
 
W
L
 
A
D
 
L
R
|
R
S
 
E
R
 
R
-
 
I
T
|
T
A
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
S
R
 
R
H
 
D
T
 
G
N
 
Y
A
 
V
F
 
Y
K
|
K
I
 
Y
N
 
-
E
 
-
D
 
D
V
 
L
V
 
S
I
 
L
P
 
P
L
 
V
P
 
E
R
 
R
M
 
L

Sites not aligning to the query:

6lpqA Crystal structure of human d-2-hydroxyglutarate dehydrogenase in complex with d-malate (d-mal) (see paper)
23% identity, 28% coverage: 193:566/1324 of query aligns to 49:358/466 of 6lpqA

query
sites
6lpqA
V
 
V
V
 
L
L
 
L
T
 
R
P
 
P
D
 
R
T
 
T
E
 
S
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
S
G
 
H
M
 
I
V
 
L
K
 
R
G
 
H
C
 
C
F
 
H
E
 
E
L
 
R
G
 
N
L
 
L
T
 
A
I
 
V
I
 
N
P
|
P
R
 
Q
G
|
G
G
|
G
G
x
N
T
|
T
G
|
G
Y
x
M
T
 
V
G
 
G
G
|
G
A
x
S
V
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
F
P
 
D
M
 
-
S
 
E
A
 
I
V
 
I
I
 
L
N
 
S
T
 
T
E
 
A
K
 
R
L
 
M
E
 
N
Q
 
R
L
 
V
G
 
L
P
 
S
V
 
F
E
 
H
Q
 
S
T
 
V
D
 
S
L
 
-
P
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
G
T
 
I
I
 
L
F
 
V
S
 
C
G
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
V
T
 
L
R
 
E
R
 
E
V
 
L
A
 
S
D
 
R
A
 
Y
A
 
V
D
 
E
K
 
E
A
 
R
G
 
D
L
 
F
V
 
I
F
 
M
A
 
P
V
 
L
D
 
D
P
x
L
T
x
G
S
x
A
I
 
K
D
 
G
A
 
S
S
x
C
C
x
H
I
 
I
G
 
G
G
|
G
N
|
N
V
 
V
A
|
A
M
x
T
N
 
N
A
|
A
G
 
G
G
|
G
K
 
L
K
 
R
A
 
F
V
 
L
L
 
R
W
 
Y
G
 
G
T
 
S
A
 
L
L
 
H
D
 
G
N
 
T
L
 
V
A
 
L
W
 
G
W
 
L
R
 
E
M
 
V
V
 
V
D
 
L
P
 
A
E
 
D
G
 
G
N
 
T
W
 
V
L
 
L
E
 
D
V
 
C
T
 
L
R
 
-
L
 
-
D
 
-
H
 
-
N
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
-
H
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
W
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
T
K
 
S
F
 
L
R
 
R
K
 
K
E
 
D
G
 
N
L
 
T
G
 
G
K
 
Y
D
 
D
V
 
L
T
 
K
D
 
Q
K
 
L
F
 
F
L
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
I
Q
 
G
K
 
S
E
|
E
G
|
G
C
 
T
D
 
L
G
 
G
I
|
I
I
|
I
T
 
T
S
 
T
A
 
V
R
 
S
W
 
I
I
 
L
L
 
-
H
 
-
R
 
-
M
 
C
P
 
P
A
 
P
H
 
K
V
 
P
R
 
R
T
 
A
V
 
V
C
 
N
L
 
V
E
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
G
Q
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
C
P
 
P
S
 
G
I
 
F
V
 
A
E
 
E
I
 
V
K
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
L
D
 
Q
A
 
T
E
 
F
S
 
S
R
 
T
T
 
C
P
 
K
G
 
G
-
 
M
-
 
L
G
 
G
A
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
S
G
 
A
L
 
F
E
 
E
H
 
F
L
 
M
D
 
D
E
 
A
R
 
V
Y
 
C
L
 
M
R
 
Q
A
 
L
V
 
V
G
 
G
-
 
R
-
 
H
Y
 
L
A
 
H
T
 
L
K
 
A
S
 
S
K
 
P
R
 
V
N
 
Q
A
 
E
F
 
S
P
 
P
K
 
F
M
 
Y
V
 
V
L
 
L
I
 
I
-
 
E
-
 
T
-
 
S
G
 
G
D
 
S
I
 
N
V
 
A
G
 
G
D
 
H
D
 
D
Q
 
A
D
 
E
A
 
K
V
 
L
A
 
G
R
 
H
A
 
F
T
 
L
S
 
E
E
 
H
V
 
A
I
 
-
R
 
-
M
 
L
A
 
G
N
 
S
G
 
G
K
 
L
S
 
V
G
 
T
E
 
D
G
 
G
F
 
T
V
 
M
A
 
A
V
 
T
S
 
D
P
 
Q
E
 
R
A
 
K
R
 
V
K
 
K
K
 
M
F
 
L
W
 
W
L
 
A
D
 
L
R
|
R
S
 
E
R
 
R
-
 
I
T
|
T
A
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
S
R
 
R
H
 
D
T
 
G
N
 
Y
A
 
V
F
 
Y
K
|
K
I
 
Y
N
 
-
E
 
-
D
 
D
V
 
L
V
 
S
I
 
L
P
 
P
L
 
V
P
 
E
R
 
R
M
 
L

Sites not aligning to the query:

6lppA Crystal structure of human d-2-hydroxyglutarate dehydrogenase in complex with d-2-hydroxyglutarate (d-2-hg) (see paper)
23% identity, 28% coverage: 193:566/1324 of query aligns to 49:358/466 of 6lppA

query
sites
6lppA
V
 
V
V
 
L
L
 
L
T
 
R
P
 
P
D
 
R
T
 
T
E
 
S
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
S
G
 
H
M
 
I
V
 
L
K
 
R
G
 
H
C
 
C
F
 
H
E
 
E
L
 
R
G
 
N
L
 
L
T
 
A
I
 
V
I
 
N
P
|
P
R
 
Q
G
|
G
G
|
G
G
x
N
T
|
T
G
|
G
Y
x
M
T
 
V
G
 
G
G
|
G
A
x
S
V
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
F
P
 
D
M
 
-
S
 
E
A
 
I
V
 
I
I
 
L
N
 
S
T
 
T
E
 
A
K
 
R
L
 
M
E
 
N
Q
 
R
L
 
V
G
 
L
P
 
S
V
 
F
E
 
H
Q
 
S
T
 
V
D
 
S
L
 
-
P
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
G
T
 
I
I
 
L
F
 
V
S
 
C
G
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
V
T
 
L
R
 
E
R
 
E
V
 
L
A
 
S
D
 
R
A
 
Y
A
 
V
D
 
E
K
 
E
A
 
R
G
 
D
L
 
F
V
 
I
F
 
M
A
 
P
V
 
L
D
 
D
P
x
L
T
x
G
S
x
A
I
 
K
D
 
G
A
 
S
S
x
C
C
 
H
I
 
I
G
 
G
G
|
G
N
|
N
V
 
V
A
|
A
M
x
T
N
 
N
A
|
A
G
 
G
G
|
G
K
 
L
K
 
R
A
 
F
V
 
L
L
 
R
W
 
Y
G
 
G
T
 
S
A
 
L
L
 
H
D
 
G
N
 
T
L
 
V
A
 
L
W
 
G
W
 
L
R
 
E
M
 
V
V
 
V
D
 
L
P
 
A
E
 
D
G
 
G
N
 
T
W
 
V
L
 
L
E
 
D
V
 
C
T
 
L
R
 
-
L
 
-
D
 
-
H
 
-
N
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
-
H
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
W
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
T
K
 
S
F
 
L
R
 
R
K
 
K
E
 
D
G
 
N
L
 
T
G
 
G
K
 
Y
D
 
D
V
 
L
T
 
K
D
 
Q
K
 
L
F
 
F
L
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
I
Q
 
G
K
 
S
E
 
E
G
|
G
C
 
T
D
 
L
G
 
G
I
 
I
I
|
I
T
 
T
S
 
T
A
 
V
R
 
S
W
 
I
I
 
L
L
 
-
H
 
-
R
 
-
M
 
C
P
 
P
A
 
P
H
 
K
V
 
P
R
 
R
T
 
A
V
 
V
C
 
N
L
 
V
E
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
G
Q
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
C
P
 
P
S
 
G
I
 
F
V
 
A
E
 
E
I
 
V
K
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
L
D
 
Q
A
 
T
E
 
F
S
 
S
R
 
T
T
 
C
P
 
K
G
 
G
-
 
M
-
 
L
G
 
G
A
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
S
G
 
A
L
 
F
E
 
E
H
 
F
L
 
M
D
 
D
E
 
A
R
 
V
Y
 
C
L
 
M
R
 
Q
A
 
L
V
 
V
G
 
G
-
 
R
-
 
H
Y
 
L
A
 
H
T
 
L
K
 
A
S
 
S
K
 
P
R
 
V
N
 
Q
A
 
E
F
 
S
P
 
P
K
 
F
M
 
Y
V
 
V
L
 
L
I
 
I
-
 
E
-
 
T
-
 
S
G
 
G
D
 
S
I
 
N
V
 
A
G
 
G
D
 
H
D
 
D
Q
 
A
D
 
E
A
 
K
V
 
L
A
 
G
R
 
H
A
 
F
T
 
L
S
 
E
E
 
H
V
 
A
I
 
-
R
 
-
M
 
L
A
 
G
N
 
S
G
 
G
K
 
L
S
 
V
G
 
T
E
 
D
G
 
G
F
 
T
V
 
M
A
 
A
V
 
T
S
 
D
P
 
Q
E
 
R
A
 
K
R
 
V
K
 
K
K
 
M
F
 
L
W
 
W
L
 
A
D
 
L
R
|
R
S
 
E
R
 
R
-
 
I
T
|
T
A
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
S
R
 
R
H
 
D
T
 
G
N
 
Y
A
 
V
F
 
Y
K
|
K
I
 
Y
N
 
-
E
 
-
D
 
D
V
 
L
V
 
S
I
 
L
P
 
P
L
 
V
P
 
E
R
 
R
M
 
L

Sites not aligning to the query:

6lpnB Crystal structure of human d-2-hydroxyglutarate dehydrogenase in apo form (see paper)
23% identity, 28% coverage: 193:566/1324 of query aligns to 50:359/467 of 6lpnB

query
sites
6lpnB
V
 
V
V
 
L
L
 
L
T
 
R
P
 
P
D
 
R
T
 
T
E
 
S
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
S
G
 
H
M
 
I
V
 
L
K
 
R
G
 
H
C
 
C
F
 
H
E
 
E
L
 
R
G
 
N
L
 
L
T
 
A
I
 
V
I
 
N
P
|
P
R
 
Q
G
|
G
G
|
G
G
x
N
T
|
T
G
|
G
Y
x
M
T
 
V
G
 
G
G
|
G
A
x
S
V
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
F
P
 
D
M
 
-
S
 
E
A
 
I
V
 
I
I
 
L
N
 
S
T
 
T
E
 
A
K
 
R
L
 
M
E
 
N
Q
 
R
L
 
V
G
 
L
P
 
S
V
 
F
E
 
H
Q
 
S
T
 
V
D
 
S
L
 
-
P
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
G
T
 
I
I
 
L
F
 
V
S
 
C
G
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
V
T
 
L
R
 
E
R
 
E
V
 
L
A
 
S
D
 
R
A
 
Y
A
 
V
D
 
E
K
 
E
A
 
R
G
 
D
L
 
F
V
 
I
F
 
M
A
 
P
V
 
L
D
 
D
P
x
L
T
 
G
S
x
A
I
 
K
D
 
G
A
 
S
S
x
C
C
x
H
I
 
I
G
 
G
G
|
G
N
|
N
V
 
V
A
|
A
M
x
T
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
L
K
 
R
A
 
F
V
 
L
L
 
R
W
 
Y
G
 
G
T
 
S
A
 
L
L
 
H
D
 
G
N
 
T
L
 
V
A
 
L
W
 
G
W
 
L
R
 
E
M
 
V
V
 
V
D
 
L
P
 
A
E
 
D
G
 
G
N
 
T
W
 
V
L
 
L
E
 
D
V
 
C
T
 
L
R
 
-
L
 
-
D
 
-
H
 
-
N
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
-
H
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
W
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
T
K
 
S
F
 
L
R
 
R
K
 
K
E
 
D
G
 
N
L
 
T
G
 
G
K
 
Y
D
 
D
V
 
L
T
 
K
D
 
Q
K
 
L
F
 
F
L
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
I
Q
 
G
K
 
S
E
 
E
G
|
G
C
 
T
D
 
L
G
 
G
I
|
I
I
|
I
T
 
T
S
 
T
A
 
V
R
 
S
W
 
I
I
 
L
L
 
-
H
 
-
R
 
-
M
 
C
P
 
P
A
 
P
H
 
K
V
 
P
R
 
R
T
 
A
V
 
V
C
 
N
L
 
V
E
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
G
Q
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
C
P
 
P
S
 
G
I
 
F
V
 
A
E
 
E
I
 
V
K
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
L
D
 
Q
A
 
T
E
 
F
S
 
S
R
 
T
T
 
C
P
 
K
G
 
G
-
 
M
-
 
L
G
 
G
A
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
S
G
 
A
L
 
F
E
 
E
H
 
F
L
 
M
D
 
D
E
 
A
R
 
V
Y
 
C
L
 
M
R
 
Q
A
 
L
V
 
V
G
 
G
-
 
R
-
 
H
Y
 
L
A
 
H
T
 
L
K
 
A
S
 
S
K
 
P
R
 
V
N
 
Q
A
 
E
F
 
S
P
 
P
K
 
F
M
 
Y
V
 
V
L
 
L
I
 
I
-
 
E
-
 
T
-
 
S
G
 
G
D
 
S
I
 
N
V
 
A
G
 
G
D
 
H
D
 
D
Q
 
A
D
 
E
A
 
K
V
 
L
A
 
G
R
 
H
A
 
F
T
 
L
S
 
E
E
 
H
V
 
A
I
 
-
R
 
-
M
 
L
A
 
G
N
 
S
G
 
G
K
 
L
S
 
V
G
 
T
E
 
D
G
 
G
F
 
T
V
 
M
A
 
A
V
 
T
S
 
D
P
 
Q
E
 
R
A
 
K
R
 
V
K
 
K
K
 
M
F
 
L
W
 
W
L
 
A
D
 
L
R
 
R
S
 
E
R
 
R
-
 
I
T
 
T
A
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
S
R
 
R
H
 
D
T
 
G
N
 
Y
A
 
V
F
 
Y
K
 
K
I
 
Y
N
 
-
E
 
-
D
 
D
V
 
L
V
 
S
I
 
L
P
 
P
L
 
V
P
 
E
R
 
R
M
 
L

Sites not aligning to the query:

8jdrA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxy-3-methyl- valeric acid (see paper)
26% identity, 33% coverage: 176:611/1324 of query aligns to 25:389/456 of 8jdrA

query
sites
8jdrA
R
 
R
V
 
E
S
 
Q
H
 
H
V
 
G
T
 
H
D
 
D
A
 
E
T
 
S
D
 
M
W
 
H
R
 
R
V
 
C
E
 
Q
Y
 
P
P
 
P
F
 
D
V
 
A
V
 
V
L
 
V
T
 
W
P
 
P
D
 
Q
T
 
N
E
 
V
E
 
D
E
 
Q
I
 
V
A
 
S
G
 
R
M
 
V
V
 
A
K
 
S
G
 
L
C
 
C
F
 
Y
E
 
N
L
 
Q
G
 
G
L
 
V
T
 
P
I
 
I
I
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
G
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
Y
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
V
 
C
P
 
A
L
 
V
T
 
Q
P
 
G
M
 
-
S
 
G
A
 
V
V
 
C
I
 
I
N
 
N
T
x
L
E
 
T
K
 
H
L
 
M
E
 
D
Q
 
Q
L
 
I
G
 
T
P
 
E
V
 
L
E
 
N
Q
 
T
T
 
E
D
 
D
L
 
F
P
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
S
I
 
V
F
 
V
S
 
V
G
 
E
A
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
R
 
K
R
 
A
V
 
L
A
 
N
D
 
T
A
 
H
A
 
L
D
 
R
K
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
W
F
 
F
A
 
P
V
 
V
D
 
D
P
|
P
T
x
G
S
x
A
I
 
D
D
 
A
A
 
S
S
 
L
C
 
C
I
 
-
G
 
-
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
M
x
T
N
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
K
 
T
K
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
R
W
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
M
L
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
V
A
 
I
W
 
N
W
 
L
R
 
E
M
 
V
V
 
V
D
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
N
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
R
L
 
L
D
 
L
H
 
H
N
 
T
L
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
-
H
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
W
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
G
R
 
R
K
 
H
F
 
Y
R
 
R
K
 
K
E
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
G
K
 
Y
D
 
N
V
 
L
T
 
T
D
 
G
K
 
L
F
 
F
L
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
V
Q
 
G
K
 
S
E
|
E
G
|
G
C
 
T
D
 
L
G
 
G
I
 
I
I
|
I
T
 
T
S
 
S
A
 
T
R
 
T
W
 
L
I
 
R
L
 
L
H
 
H
R
 
P
M
 
A
P
 
P
-
 
E
A
 
A
H
 
T
V
 
V
R
 
A
T
 
A
V
 
T
C
 
C
L
 
A
E
 
-
F
 
-
F
 
F
G
 
P
Q
 
S
A
 
V
R
 
Q
D
 
A
A
 
A
I
 
V
P
 
D
S
 
S
I
 
T
V
 
V
E
 
Q
I
 
I
K
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
L
E
 
Q
S
 
A
R
 
A
T
 
V
P
 
P
G
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
V
A
 
A
G
 
R
L
 
I
E
 
E
H
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
D
R
 
V
Y
 
M
L
 
M
R
 
D
A
 
A
V
 
C
G
 
N
Y
 
R
A
 
H
T
 
S
K
 
K
S
 
L
K
 
N
R
 
C
N
 
P
A
 
V
F
 
A
P
 
P
K
 
T
M
 
L
V
 
F
L
 
L
I
 
-
G
 
-
D
 
E
I
 
F
V
 
H
G
 
G
D
 
S
D
 
Q
Q
 
Q
D
 
T
A
 
L
V
 
A
A
 
E
R
 
Q
A
 
L
T
 
Q
-
 
R
S
 
T
E
 
E
V
 
A
I
 
I
R
 
T
M
 
Q
A
 
D
N
 
N
G
 
G
K
 
G
S
 
S
G
 
H
E
 
F
G
 
S
F
 
W
V
 
A
A
 
A
V
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
E
A
 
K
R
 
R
K
 
N
K
 
E
F
 
L
W
 
W
L
 
A
D
 
A
R
|
R
S
 
H
R
 
N
T
 
A
-
x
W
-
x
Y
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
L
H
 
S
T
 
P
N
 
G
A
 
S
F
 
K
K
 
A
I
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
C
I
 
V
P
 
P
L
 
I
P
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
P
E
 
E
Y
 
I
T
 
L
D
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
V
N
 
E
I
 
T
E
 
K
L
 
E
S
 
E
I
 
I
K
 
K
N
 
A
K
 
S
L
 
-
Q
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
G
A
 
A
L
 
I
E
 
V
A
 
G
F
x
H
F
 
V
A
 
G
R
 
D
G
 
G
N
 
N
L
 
F
P
 
A
-
 
C
-
 
I
-
 
L
L
 
L
G
 
V
R
 
D
S
 
P
D
 
D
D
 
D
A
 
A
N
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

8jdqA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyisocaproic acid (see paper)
26% identity, 33% coverage: 176:611/1324 of query aligns to 25:389/456 of 8jdqA

query
sites
8jdqA
R
 
R
V
 
E
S
 
Q
H
 
H
V
 
G
T
 
H
D
 
D
A
 
E
T
 
S
D
 
M
W
 
H
R
 
R
V
 
C
E
 
Q
Y
 
P
P
 
P
F
 
D
V
 
A
V
 
V
L
 
V
T
 
W
P
 
P
D
 
Q
T
 
N
E
 
V
E
 
D
E
 
Q
I
 
V
A
 
S
G
 
R
M
 
V
V
 
A
K
 
S
G
 
L
C
 
C
F
 
Y
E
 
N
L
 
Q
G
 
G
L
 
V
T
 
P
I
 
I
I
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
G
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
Y
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
V
 
C
P
 
A
L
 
V
T
 
Q
P
 
G
M
 
-
S
 
G
A
 
V
V
 
C
I
 
I
N
 
N
T
x
L
E
 
T
K
 
H
L
 
M
E
 
D
Q
 
Q
L
 
I
G
 
T
P
 
E
V
 
L
E
 
N
Q
 
T
T
 
E
D
 
D
L
 
F
P
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
S
I
 
V
F
 
V
S
 
V
G
 
E
A
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
R
 
K
R
 
A
V
 
L
A
 
N
D
 
T
A
 
H
A
 
L
D
 
R
K
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
W
F
 
F
A
 
P
V
 
V
D
 
D
P
|
P
T
x
G
S
x
A
I
 
D
D
 
A
A
 
S
S
 
L
C
 
C
I
 
-
G
 
-
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
M
x
T
N
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
K
 
T
K
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
R
W
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
M
L
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
V
A
 
I
W
 
N
W
 
L
R
 
E
M
 
V
V
 
V
D
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
N
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
R
L
 
L
D
 
L
H
 
H
N
 
T
L
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
-
H
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
W
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
G
R
 
R
K
 
H
F
 
Y
R
 
R
K
 
K
E
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
G
K
 
Y
D
 
N
V
 
L
T
 
T
D
 
G
K
 
L
F
 
F
L
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
V
Q
 
G
K
 
S
E
|
E
G
|
G
C
 
T
D
 
L
G
 
G
I
 
I
I
|
I
T
 
T
S
 
S
A
 
T
R
 
T
W
 
L
I
 
R
L
 
L
H
 
H
R
 
P
M
 
A
P
 
P
-
 
E
A
 
A
H
 
T
V
 
V
R
 
A
T
 
A
V
 
T
C
 
C
L
 
A
E
 
-
F
 
-
F
 
F
G
 
P
Q
 
S
A
 
V
R
 
Q
D
 
A
A
 
A
I
 
V
P
 
D
S
 
S
I
 
T
V
 
V
E
 
Q
I
 
I
K
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
L
E
 
Q
S
 
A
R
 
A
T
 
V
P
 
P
G
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
V
A
 
A
G
 
R
L
 
I
E
 
E
H
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
D
R
 
V
Y
 
M
L
 
M
R
 
D
A
 
A
V
 
C
G
 
N
Y
 
R
A
 
H
T
 
S
K
 
K
S
 
L
K
 
N
R
 
C
N
 
P
A
 
V
F
 
A
P
 
P
K
 
T
M
 
L
V
 
F
L
 
L
I
 
-
G
 
-
D
 
E
I
 
F
V
 
H
G
 
G
D
 
S
D
 
Q
Q
 
Q
D
 
T
A
 
L
V
 
A
A
 
E
R
 
Q
A
 
L
T
 
Q
-
 
R
S
 
T
E
 
E
V
 
A
I
 
I
R
 
T
M
 
Q
A
 
D
N
 
N
G
 
G
K
 
G
S
 
S
G
 
H
E
 
F
G
 
S
F
 
W
V
 
A
A
 
A
V
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
E
A
 
K
R
 
R
K
 
N
K
 
E
F
 
L
W
 
W
L
 
A
D
 
A
R
|
R
S
 
H
R
 
N
T
 
A
-
x
W
-
 
Y
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
L
H
 
S
T
 
P
N
 
G
A
 
S
F
 
K
K
 
A
I
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
C
I
 
V
P
 
P
L
 
I
P
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
P
E
 
E
Y
 
I
T
 
L
D
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
V
N
 
E
I
 
T
E
 
K
L
 
E
S
 
E
I
 
I
K
 
K
N
 
A
K
 
S
L
 
-
Q
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
G
A
 
A
L
 
I
E
 
V
A
 
G
F
x
H
F
 
V
A
 
G
R
 
D
G
 
G
N
 
N
L
 
F
P
 
A
-
 
C
-
 
I
-
 
L
L
 
L
G
 
V
R
 
D
S
 
P
D
 
D
D
 
D
A
 
A
N
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

8jdoA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyhexanoic acid (see paper)
26% identity, 33% coverage: 176:611/1324 of query aligns to 25:389/456 of 8jdoA

query
sites
8jdoA
R
 
R
V
 
E
S
 
Q
H
 
H
V
 
G
T
 
H
D
 
D
A
 
E
T
 
S
D
 
M
W
 
H
R
 
R
V
 
C
E
 
Q
Y
 
P
P
 
P
F
 
D
V
 
A
V
 
V
L
 
V
T
 
W
P
 
P
D
 
Q
T
 
N
E
 
V
E
 
D
E
 
Q
I
 
V
A
 
S
G
 
R
M
 
V
V
 
A
K
 
S
G
 
L
C
 
C
F
 
Y
E
 
N
L
 
Q
G
 
G
L
 
V
T
 
P
I
 
I
I
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
G
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
Y
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
V
 
C
P
 
A
L
 
V
T
 
Q
P
 
G
M
 
-
S
 
G
A
 
V
V
 
C
I
 
I
N
 
N
T
x
L
E
 
T
K
 
H
L
 
M
E
 
D
Q
 
Q
L
 
I
G
 
T
P
 
E
V
 
L
E
 
N
Q
 
T
T
 
E
D
 
D
L
 
F
P
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
S
I
 
V
F
 
V
S
 
V
G
 
E
A
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
R
 
K
R
 
A
V
 
L
A
 
N
D
 
T
A
 
H
A
 
L
D
 
R
K
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
W
F
 
F
A
 
P
V
 
V
D
 
D
P
|
P
T
x
G
S
x
A
I
 
D
D
 
A
A
 
S
S
 
L
C
 
C
I
 
-
G
 
-
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
M
x
T
N
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
K
 
T
K
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
R
W
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
M
L
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
V
A
 
I
W
 
N
W
 
L
R
 
E
M
 
V
V
 
V
D
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
N
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
R
L
 
L
D
 
L
H
 
H
N
 
T
L
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
-
H
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
W
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
G
R
 
R
K
 
H
F
 
Y
R
 
R
K
 
K
E
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
G
K
 
Y
D
 
N
V
 
L
T
 
T
D
 
G
K
 
L
F
 
F
L
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
V
Q
 
G
K
 
S
E
|
E
G
|
G
C
 
T
D
 
L
G
 
G
I
 
I
I
|
I
T
 
T
S
 
S
A
 
T
R
 
T
W
 
L
I
 
R
L
 
L
H
 
H
R
 
P
M
 
A
P
 
P
-
 
E
A
 
A
H
 
T
V
 
V
R
 
A
T
 
A
V
 
T
C
 
C
L
 
A
E
 
-
F
 
-
F
 
F
G
 
P
Q
 
S
A
 
V
R
 
Q
D
 
A
A
 
A
I
 
V
P
 
D
S
 
S
I
 
T
V
 
V
E
 
Q
I
 
I
K
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
L
E
 
Q
S
 
A
R
 
A
T
 
V
P
 
P
G
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
V
A
 
A
G
 
R
L
 
I
E
 
E
H
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
D
R
 
V
Y
 
M
L
 
M
R
 
D
A
 
A
V
 
C
G
 
N
Y
 
R
A
 
H
T
 
S
K
 
K
S
 
L
K
 
N
R
 
C
N
 
P
A
 
V
F
 
A
P
 
P
K
 
T
M
 
L
V
 
F
L
 
L
I
 
-
G
 
-
D
 
E
I
 
F
V
 
H
G
 
G
D
 
S
D
 
Q
Q
 
Q
D
 
T
A
 
L
V
 
A
A
 
E
R
 
Q
A
 
L
T
 
Q
-
 
R
S
 
T
E
 
E
V
 
A
I
 
I
R
 
T
M
 
Q
A
 
D
N
 
N
G
 
G
K
 
G
S
 
S
G
 
H
E
 
F
G
 
S
F
 
W
V
 
A
A
 
A
V
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
E
A
 
K
R
 
R
K
 
N
K
 
E
F
 
L
W
 
W
L
 
A
D
 
A
R
|
R
S
 
H
R
 
N
T
 
A
-
x
W
-
x
Y
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
L
H
 
S
T
 
P
N
 
G
A
 
S
F
 
K
K
 
A
I
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
C
I
 
V
P
 
P
L
 
I
P
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
P
E
 
E
Y
 
I
T
 
L
D
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
V
N
 
E
I
 
T
E
 
K
L
 
E
S
 
E
I
 
I
K
 
K
N
 
A
K
 
S
L
 
-
Q
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
G
A
 
A
L
 
I
E
 
V
A
 
G
F
x
H
F
 
V
A
 
G
R
 
D
G
 
G
N
 
N
L
 
F
P
 
A
-
 
C
-
 
I
-
 
L
L
 
L
G
 
V
R
 
D
S
 
P
D
 
D
D
 
D
A
 
A
N
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

8jdnA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyvaleric acid (see paper)
26% identity, 33% coverage: 176:611/1324 of query aligns to 25:389/456 of 8jdnA

query
sites
8jdnA
R
 
R
V
 
E
S
 
Q
H
 
H
V
 
G
T
 
H
D
 
D
A
 
E
T
 
S
D
 
M
W
 
H
R
 
R
V
 
C
E
 
Q
Y
 
P
P
 
P
F
 
D
V
 
A
V
 
V
L
 
V
T
 
W
P
 
P
D
 
Q
T
 
N
E
 
V
E
 
D
E
 
Q
I
 
V
A
 
S
G
 
R
M
 
V
V
 
A
K
 
S
G
 
L
C
 
C
F
 
Y
E
 
N
L
 
Q
G
 
G
L
 
V
T
 
P
I
 
I
I
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
G
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
Y
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
V
 
C
P
 
A
L
 
V
T
 
Q
P
 
G
M
 
-
S
 
G
A
 
V
V
 
C
I
 
I
N
 
N
T
x
L
E
 
T
K
 
H
L
 
M
E
 
D
Q
 
Q
L
 
I
G
 
T
P
 
E
V
 
L
E
 
N
Q
 
T
T
 
E
D
 
D
L
 
F
P
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
S
I
 
V
F
 
V
S
 
V
G
 
E
A
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
R
 
K
R
 
A
V
 
L
A
 
N
D
 
T
A
 
H
A
 
L
D
 
R
K
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
W
F
 
F
A
 
P
V
 
V
D
 
D
P
|
P
T
x
G
S
x
A
I
 
D
D
 
A
A
 
S
S
 
L
C
 
C
I
 
-
G
 
-
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
M
x
T
N
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
K
 
T
K
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
R
W
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
M
L
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
V
A
 
I
W
 
N
W
 
L
R
 
E
M
 
V
V
 
V
D
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
N
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
R
L
 
L
D
 
L
H
 
H
N
 
T
L
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
-
H
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
W
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
G
R
 
R
K
 
H
F
 
Y
R
 
R
K
 
K
E
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
G
K
 
Y
D
 
N
V
 
L
T
 
T
D
 
G
K
 
L
F
 
F
L
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
V
Q
 
G
K
 
S
E
|
E
G
|
G
C
 
T
D
 
L
G
 
G
I
 
I
I
|
I
T
 
T
S
 
S
A
 
T
R
 
T
W
 
L
I
 
R
L
 
L
H
 
H
R
 
P
M
 
A
P
 
P
-
 
E
A
 
A
H
 
T
V
 
V
R
 
A
T
 
A
V
 
T
C
 
C
L
 
A
E
 
-
F
 
-
F
 
F
G
 
P
Q
 
S
A
 
V
R
 
Q
D
 
A
A
 
A
I
 
V
P
 
D
S
 
S
I
 
T
V
 
V
E
 
Q
I
 
I
K
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
L
E
 
Q
S
 
A
R
 
A
T
 
V
P
 
P
G
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
V
A
 
A
G
 
R
L
 
I
E
 
E
H
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
D
R
 
V
Y
 
M
L
 
M
R
 
D
A
 
A
V
 
C
G
 
N
Y
 
R
A
 
H
T
 
S
K
 
K
S
 
L
K
 
N
R
 
C
N
 
P
A
 
V
F
 
A
P
 
P
K
 
T
M
 
L
V
 
F
L
 
L
I
 
-
G
 
-
D
 
E
I
 
F
V
 
H
G
 
G
D
 
S
D
 
Q
Q
 
Q
D
 
T
A
 
L
V
 
A
A
 
E
R
 
Q
A
 
L
T
 
Q
-
 
R
S
 
T
E
 
E
V
 
A
I
 
I
R
 
T
M
 
Q
A
 
D
N
 
N
G
 
G
K
 
G
S
 
S
G
 
H
E
 
F
G
 
S
F
 
W
V
 
A
A
 
A
V
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
E
A
 
K
R
 
R
K
 
N
K
 
E
F
 
L
W
 
W
L
 
A
D
 
A
R
|
R
S
 
H
R
 
N
T
 
A
-
x
W
-
 
Y
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
L
H
 
S
T
 
P
N
 
G
A
 
S
F
 
K
K
 
A
I
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
C
I
 
V
P
 
P
L
 
I
P
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
P
E
 
E
Y
 
I
T
 
L
D
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
V
N
 
E
I
 
T
E
 
K
L
 
E
S
 
E
I
 
I
K
 
K
N
 
A
K
 
S
L
 
-
Q
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
G
A
 
A
L
 
I
E
 
V
A
 
G
F
x
H
F
 
V
A
 
G
R
 
D
G
 
G
N
 
N
L
 
F
P
 
A
-
 
C
-
 
I
-
 
L
L
 
L
G
 
V
R
 
D
S
 
P
D
 
D
D
 
D
A
 
A
N
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

8jdgA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxybutanoic acid (see paper)
26% identity, 33% coverage: 176:611/1324 of query aligns to 25:389/456 of 8jdgA

query
sites
8jdgA
R
 
R
V
 
E
S
 
Q
H
 
H
V
 
G
T
 
H
D
 
D
A
 
E
T
 
S
D
 
M
W
 
H
R
 
R
V
 
C
E
 
Q
Y
 
P
P
 
P
F
 
D
V
 
A
V
 
V
L
 
V
T
 
W
P
 
P
D
 
Q
T
 
N
E
 
V
E
 
D
E
 
Q
I
 
V
A
 
S
G
 
R
M
 
V
V
 
A
K
 
S
G
 
L
C
 
C
F
 
Y
E
 
N
L
 
Q
G
 
G
L
 
V
T
 
P
I
 
I
I
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
G
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
Y
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
V
 
C
P
 
A
L
 
V
T
 
Q
P
 
G
M
 
-
S
 
G
A
 
V
V
 
C
I
 
I
N
 
N
T
x
L
E
 
T
K
 
H
L
 
M
E
 
D
Q
 
Q
L
 
I
G
 
T
P
 
E
V
 
L
E
 
N
Q
 
T
T
 
E
D
 
D
L
 
F
P
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
S
I
 
V
F
 
V
S
 
V
G
 
E
A
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
R
 
K
R
 
A
V
 
L
A
 
N
D
 
T
A
 
H
A
 
L
D
 
R
K
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
W
F
 
F
A
 
P
V
 
V
D
 
D
P
|
P
T
x
G
S
x
A
I
 
D
D
 
A
A
 
S
S
 
L
C
 
C
I
 
-
G
 
-
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
M
x
T
N
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
K
 
T
K
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
R
W
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
M
L
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
V
A
 
I
W
 
N
W
 
L
R
 
E
M
 
V
V
 
V
D
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
N
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
R
L
 
L
D
 
L
H
 
H
N
 
T
L
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
-
H
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
W
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
G
R
 
R
K
 
H
F
 
Y
R
 
R
K
 
K
E
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
G
K
 
Y
D
 
N
V
 
L
T
 
T
D
 
G
K
 
L
F
 
F
L
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
V
Q
 
G
K
 
S
E
|
E
G
|
G
C
 
T
D
 
L
G
 
G
I
 
I
I
|
I
T
 
T
S
 
S
A
 
T
R
 
T
W
 
L
I
 
R
L
 
L
H
 
H
R
 
P
M
 
A
P
 
P
-
 
E
A
 
A
H
 
T
V
 
V
R
 
A
T
 
A
V
 
T
C
 
C
L
 
A
E
 
-
F
 
-
F
 
F
G
 
P
Q
 
S
A
 
V
R
 
Q
D
 
A
A
 
A
I
 
V
P
 
D
S
 
S
I
 
T
V
 
V
E
 
Q
I
 
I
K
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
L
E
 
Q
S
 
A
R
 
A
T
 
V
P
 
P
G
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
V
A
 
A
G
 
R
L
 
I
E
 
E
H
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
D
R
 
V
Y
 
M
L
 
M
R
 
D
A
 
A
V
 
C
G
 
N
Y
 
R
A
 
H
T
 
S
K
 
K
S
 
L
K
 
N
R
 
C
N
 
P
A
 
V
F
 
A
P
 
P
K
 
T
M
 
L
V
 
F
L
 
L
I
 
-
G
 
-
D
 
E
I
 
F
V
 
H
G
 
G
D
 
S
D
 
Q
Q
 
Q
D
 
T
A
 
L
V
 
A
A
 
E
R
 
Q
A
 
L
T
 
Q
-
 
R
S
 
T
E
 
E
V
 
A
I
 
I
R
 
T
M
 
Q
A
 
D
N
 
N
G
 
G
K
 
G
S
 
S
G
 
H
E
 
F
G
 
S
F
 
W
V
 
A
A
 
A
V
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
E
A
 
K
R
 
R
K
 
N
K
 
E
F
 
L
W
 
W
L
 
A
D
 
A
R
|
R
S
 
H
R
 
N
T
 
A
-
 
W
-
 
Y
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
L
H
 
S
T
 
P
N
 
G
A
 
S
F
 
K
K
 
A
I
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
C
I
 
V
P
 
P
L
 
I
P
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
P
E
 
E
Y
 
I
T
 
L
D
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
V
N
 
E
I
 
T
E
 
K
L
 
E
S
 
E
I
 
I
K
 
K
N
 
A
K
 
S
L
 
-
Q
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
G
A
 
A
L
 
I
E
 
V
A
 
G
F
x
H
F
 
V
A
 
G
R
 
D
G
 
G
N
 
N
L
 
F
P
 
A
-
 
C
-
 
I
-
 
L
L
 
L
G
 
V
R
 
D
S
 
P
D
 
D
D
 
D
A
 
A
N
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

8jdbA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyoctanoic acid (see paper)
26% identity, 33% coverage: 176:611/1324 of query aligns to 25:389/456 of 8jdbA

query
sites
8jdbA
R
 
R
V
 
E
S
 
Q
H
 
H
V
 
G
T
 
H
D
 
D
A
 
E
T
 
S
D
 
M
W
 
H
R
 
R
V
 
C
E
 
Q
Y
 
P
P
 
P
F
 
D
V
 
A
V
 
V
L
 
V
T
 
W
P
 
P
D
 
Q
T
 
N
E
 
V
E
 
D
E
 
Q
I
 
V
A
 
S
G
 
R
M
 
V
V
 
A
K
 
S
G
 
L
C
 
C
F
 
Y
E
 
N
L
 
Q
G
 
G
L
 
V
T
 
P
I
 
I
I
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
G
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
Y
x
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
V
 
C
P
 
A
L
 
V
T
 
Q
P
 
G
M
 
-
S
 
G
A
 
V
V
 
C
I
 
I
N
 
N
T
x
L
E
 
T
K
 
H
L
 
M
E
 
D
Q
 
Q
L
 
I
G
 
T
P
 
E
V
 
L
E
 
N
Q
 
T
T
 
E
D
 
D
L
 
F
P
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
S
I
 
V
F
 
V
S
 
V
G
 
E
A
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
R
 
K
R
 
A
V
 
L
A
 
N
D
 
T
A
 
H
A
 
L
D
 
R
K
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
W
F
 
F
A
 
P
V
 
V
D
 
D
P
|
P
T
x
G
S
x
A
I
 
D
D
 
A
A
 
S
S
 
L
C
 
C
I
 
-
G
 
-
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
M
x
T
N
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
K
 
T
K
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
R
W
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
M
L
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
V
A
 
I
W
 
N
W
 
L
R
 
E
M
 
V
V
 
V
D
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
N
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
R
L
 
L
D
 
L
H
 
H
N
 
T
L
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
-
H
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
W
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
G
R
 
R
K
 
H
F
 
Y
R
 
R
K
 
K
E
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
G
K
 
Y
D
 
N
V
 
L
T
 
T
D
 
G
K
 
L
F
 
F
L
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
V
Q
 
G
K
 
S
E
|
E
G
|
G
C
 
T
D
 
L
G
 
G
I
 
I
I
|
I
T
 
T
S
 
S
A
 
T
R
 
T
W
 
L
I
 
R
L
 
L
H
 
H
R
 
P
M
 
A
P
 
P
-
 
E
A
 
A
H
 
T
V
 
V
R
 
A
T
 
A
V
 
T
C
 
C
L
 
A
E
 
-
F
 
-
F
 
F
G
 
P
Q
 
S
A
 
V
R
 
Q
D
 
A
A
 
A
I
 
V
P
 
D
S
 
S
I
 
T
V
 
V
E
 
Q
I
 
I
K
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
L
E
 
Q
S
 
A
R
 
A
T
 
V
P
 
P
G
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
V
A
 
A
G
 
R
L
 
I
E
 
E
H
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
D
R
 
V
Y
 
M
L
 
M
R
 
D
A
 
A
V
 
C
G
 
N
Y
 
R
A
 
H
T
 
S
K
 
K
S
 
L
K
 
N
R
 
C
N
 
P
A
 
V
F
 
A
P
 
P
K
 
T
M
 
L
V
 
F
L
 
L
I
 
-
G
 
-
D
 
E
I
 
F
V
 
H
G
 
G
D
 
S
D
 
Q
Q
 
Q
D
 
T
A
 
L
V
 
A
A
 
E
R
 
Q
A
 
L
T
 
Q
-
 
R
S
 
T
E
 
E
V
 
A
I
 
I
R
 
T
M
 
Q
A
 
D
N
 
N
G
 
G
K
 
G
S
 
S
G
 
H
E
 
F
G
 
S
F
 
W
V
 
A
A
 
A
V
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
E
A
 
K
R
 
R
K
 
N
K
 
E
F
 
L
W
 
W
L
 
A
D
 
A
R
|
R
S
 
H
R
 
N
T
 
A
-
x
W
-
x
Y
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
L
H
 
S
T
 
P
N
 
G
A
 
S
F
 
K
K
 
A
I
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
C
I
 
V
P
 
P
L
 
I
P
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
P
E
 
E
Y
 
I
T
 
L
D
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
V
N
 
E
I
 
T
E
 
K
L
 
E
S
 
E
I
 
I
K
 
K
N
 
A
K
 
S
L
 
-
Q
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
G
A
 
A
L
 
I
E
 
V
A
 
G
F
x
H
F
 
V
A
 
G
R
 
D
G
 
G
N
 
N
L
 
F
P
 
A
-
 
C
-
 
I
-
 
L
L
 
L
G
 
V
R
 
D
S
 
P
D
 
D
D
 
D
A
 
A
N
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

8jdsA Crystal structure of mldhd in complex with pyruvate (see paper)
26% identity, 33% coverage: 176:611/1324 of query aligns to 25:389/456 of 8jdsA

query
sites
8jdsA
R
 
R
V
 
E
S
 
Q
H
 
H
V
 
G
T
 
H
D
 
D
A
x
E
T
 
S
D
 
M
W
 
H
R
 
R
V
 
C
E
 
Q
Y
 
P
P
 
P
F
 
D
V
 
A
V
 
V
L
 
V
T
 
W
P
 
P
D
 
Q
T
 
N
E
 
V
E
 
D
E
 
Q
I
 
V
A
 
S
G
 
R
M
 
V
V
 
A
K
 
S
G
 
L
C
 
C
F
 
Y
E
 
N
L
 
Q
G
 
G
L
 
V
T
 
P
I
 
I
I
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
G
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
Y
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
V
 
C
P
 
A
L
 
V
T
 
Q
P
 
-
M
 
G
S
 
G
A
 
V
V
 
C
I
 
I
N
 
N
T
x
L
E
 
T
K
 
H
L
 
M
E
 
D
Q
 
Q
L
 
I
G
 
T
P
 
E
V
 
L
E
 
N
Q
 
T
T
 
E
D
 
D
L
 
F
P
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
S
I
 
V
F
 
V
S
 
V
G
 
E
A
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
R
 
K
R
 
A
V
 
L
A
 
N
D
 
T
A
 
H
A
 
L
D
 
R
K
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
W
F
 
F
A
 
P
V
 
V
D
 
D
P
|
P
T
x
G
S
x
A
I
 
D
D
 
A
A
 
S
S
 
L
C
 
C
I
 
-
G
 
-
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
M
x
T
N
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
K
 
T
K
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
R
W
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
M
L
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
V
A
 
I
W
 
N
W
 
L
R
 
E
M
 
V
V
 
V
D
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
N
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
R
L
 
L
D
 
L
H
 
H
N
 
T
L
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
-
H
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
W
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
G
R
 
R
K
 
H
F
 
Y
R
 
R
K
 
K
E
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
G
K
 
Y
D
 
N
V
 
L
T
 
T
D
 
G
K
 
L
F
 
F
L
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
V
Q
 
G
K
 
S
E
|
E
G
|
G
C
 
T
D
 
L
G
 
G
I
 
I
I
|
I
T
 
T
S
 
S
A
 
T
R
 
T
W
 
L
I
 
R
L
 
L
H
 
H
R
 
P
M
 
A
P
 
P
-
 
E
A
 
A
H
 
T
V
 
V
R
 
A
T
 
A
V
 
T
C
 
C
L
 
A
E
 
-
F
 
-
F
 
F
G
 
P
Q
 
S
A
 
V
R
 
Q
D
 
A
A
 
A
I
 
V
P
 
D
S
 
S
I
 
T
V
 
V
E
 
Q
I
 
I
K
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
L
E
 
Q
S
 
A
R
 
A
T
 
V
P
 
P
G
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
V
A
 
A
G
 
R
L
 
I
E
 
E
H
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
D
R
 
V
Y
 
M
L
 
M
R
 
D
A
 
A
V
 
C
G
 
N
Y
 
R
A
 
H
T
 
S
K
 
K
S
 
L
K
 
N
R
 
C
N
 
P
A
 
V
F
 
A
P
 
P
K
 
T
M
 
L
V
 
F
L
 
L
I
 
-
G
 
-
D
 
E
I
 
F
V
 
H
G
 
G
D
 
S
D
 
Q
Q
 
Q
D
 
T
A
 
L
V
 
A
A
 
E
R
 
Q
A
 
L
T
 
Q
-
 
R
S
 
T
E
 
E
V
 
A
I
 
I
R
 
T
M
 
Q
A
 
D
N
 
N
G
 
G
K
 
G
S
 
S
G
 
H
E
 
F
G
 
S
F
 
W
V
 
A
A
 
A
V
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
E
A
 
K
R
 
R
K
 
N
K
 
E
F
 
L
W
 
W
L
 
A
D
 
A
R
|
R
S
 
H
R
 
N
T
 
A
-
x
W
-
 
Y
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
L
H
 
S
T
 
P
N
 
G
A
 
S
F
 
K
K
 
A
I
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
C
I
 
V
P
 
P
L
 
I
P
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
P
E
 
E
Y
 
I
T
 
L
D
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
V
N
 
E
I
 
T
E
 
K
L
 
E
S
 
E
I
 
I
K
 
K
N
 
A
K
 
S
L
 
-
Q
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
G
A
 
A
L
 
I
E
 
V
A
 
G
F
x
H
F
 
V
A
 
G
R
 
D
G
 
G
N
 
N
-
 
F
-
x
H
-
 
C
L
 
I
P
 
L
L
 
L
G
 
V
R
 
D
S
 
P
D
 
D
D
 
D
A
 
A
N
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

8jdvA Crystal structure of mldhd in complex with 2-ketohexanoic acid (see paper)
26% identity, 33% coverage: 176:611/1324 of query aligns to 25:387/454 of 8jdvA

query
sites
8jdvA
R
 
R
V
 
E
S
 
Q
H
 
H
V
 
G
T
 
H
D
 
D
A
 
E
T
 
S
D
 
M
W
 
H
R
 
R
V
 
C
E
 
Q
Y
 
P
P
 
P
F
 
D
V
 
A
V
 
V
L
 
V
T
 
W
P
 
P
D
 
Q
T
 
N
E
 
V
E
 
D
E
 
Q
I
 
V
A
 
S
G
 
R
M
 
V
V
 
A
K
 
S
G
 
L
C
 
C
F
 
Y
E
 
N
L
 
Q
G
 
G
L
 
V
T
 
P
I
 
I
I
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
G
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
Y
x
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
V
 
C
P
 
A
L
 
V
T
 
Q
P
 
G
M
 
-
S
 
G
A
 
V
V
 
C
I
 
I
N
 
N
T
x
L
E
 
T
K
 
H
L
 
M
E
 
D
Q
 
Q
L
 
I
G
 
T
P
 
E
V
 
L
E
 
N
Q
 
T
T
 
E
D
 
D
L
 
F
P
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
S
I
 
V
F
 
V
S
 
V
G
 
E
A
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
R
 
K
R
 
A
V
 
L
A
 
N
D
 
T
A
 
H
A
 
L
D
 
R
K
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
W
F
 
F
A
 
P
V
 
V
D
 
D
P
|
P
T
x
G
S
x
A
I
 
D
D
 
A
A
 
S
S
 
L
C
 
C
I
 
-
G
 
-
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
M
x
T
N
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
K
 
T
K
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
R
W
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
M
L
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
V
A
 
I
W
 
N
W
 
L
R
 
E
M
 
V
V
 
V
D
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
N
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
R
L
 
L
D
 
L
H
 
H
N
 
T
L
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
-
H
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
W
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
G
R
 
R
K
 
H
F
 
Y
R
 
R
K
 
K
E
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
G
K
 
Y
D
 
N
V
 
L
T
 
T
D
 
G
K
 
L
F
 
F
L
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
V
Q
 
G
K
 
S
E
|
E
G
|
G
C
 
T
D
 
L
G
 
G
I
 
I
I
|
I
T
 
T
S
 
S
A
 
T
R
 
T
W
 
L
I
 
R
L
 
L
H
 
H
R
 
P
M
 
A
P
 
P
-
 
E
A
 
A
H
 
T
V
 
V
R
 
A
T
 
A
V
 
T
C
 
C
L
 
A
E
 
-
F
 
-
F
 
F
G
 
P
Q
 
S
A
 
V
R
 
Q
D
 
A
A
 
A
I
 
V
P
 
D
S
 
S
I
 
T
V
 
V
E
 
Q
I
 
I
K
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
L
E
 
Q
S
 
A
R
 
A
T
 
V
P
 
P
G
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
V
A
 
A
G
 
R
L
 
I
E
 
E
H
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
D
R
 
V
Y
 
M
L
 
M
R
 
D
A
 
A
V
 
C
G
 
N
Y
 
R
A
 
H
T
 
S
K
 
K
S
 
L
K
 
N
R
 
C
N
 
P
A
 
V
F
 
A
P
 
P
K
 
T
M
 
L
V
 
F
L
 
L
I
 
-
G
 
-
D
 
E
I
 
F
V
 
H
G
 
G
D
 
S
D
 
Q
Q
 
Q
D
 
T
A
 
L
V
 
A
A
 
E
R
 
Q
A
 
L
T
 
Q
-
 
R
S
 
T
E
 
E
V
 
A
I
 
I
R
 
T
M
 
Q
A
 
D
N
 
N
G
 
G
K
 
G
S
 
S
G
 
-
E
 
-
G
 
-
F
 
-
V
 
-
A
 
H
V
 
F
S
 
S
P
 
A
E
 
E
A
 
K
R
 
R
K
 
N
K
 
E
F
 
L
W
 
W
L
 
A
D
 
A
R
|
R
S
 
H
R
 
N
T
 
A
-
x
W
-
x
Y
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
L
H
 
S
T
 
P
N
 
G
A
 
S
F
 
K
K
 
A
I
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
C
I
 
V
P
 
P
L
 
I
P
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
P
E
 
E
Y
 
I
T
 
L
D
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
V
N
 
E
I
 
T
E
 
K
L
 
E
S
 
E
I
 
I
K
 
K
N
 
A
K
 
S
L
 
-
Q
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
G
A
 
A
L
 
I
E
 
V
A
 
G
F
x
H
F
 
V
A
 
G
R
 
D
G
 
G
N
 
N
-
 
F
-
x
H
-
 
C
L
 
I
P
 
L
L
 
L
G
 
V
R
 
D
S
 
P
D
 
D
D
 
D
A
 
A
N
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Q8N465 D-2-hydroxyglutarate dehydrogenase, mitochondrial; EC 1.1.99.39 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
23% identity, 28% coverage: 193:566/1324 of query aligns to 102:411/521 of Q8N465

query
sites
Q8N465
V
 
V
V
 
L
L
 
L
T
 
R
P
 
P
D
 
R
T
 
T
E
x
S
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
S
G
 
H
M
 
I
V
 
L
K
 
R
G
 
H
C
 
C
F
 
H
E
 
E
L
 
R
G
 
N
L
 
L
T
 
A
I
 
V
I
x
N
P
 
P
R
 
Q
G
 
G
G
|
G
G
 
N
T
 
T
G
 
G
Y
 
M
T
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
F
P
 
D
M
 
-
S
 
E
A
 
I
V
x
I
I
 
L
N
 
S
T
 
T
E
 
A
K
 
R
L
x
M
E
 
N
Q
 
R
L
 
V
G
 
L
P
 
S
V
 
F
E
 
H
Q
 
S
T
 
V
D
 
S
L
 
-
P
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
G
T
 
I
I
 
L
F
 
V
S
 
C
G
x
Q
A
|
A
G
|
G
V
x
C
V
|
V
T
x
L
R
x
E
R
x
E
V
x
L
A
x
S
D
x
R
A
x
Y
A
x
V
D
x
E
K
x
E
A
x
R
G
x
D
L
x
F
V
x
I
F
x
M
A
x
P
V
x
L
D
|
D
P
x
L
T
x
G
S
x
A
I
x
K
D
x
G
A
x
S
S
x
C
C
x
H
I
|
I
G
|
G
G
|
G
N
|
N
V
|
V
A
|
A
M
x
T
N
|
N
A
|
A
G
|
G
G
|
G
K
x
L
K
x
R
A
x
F
V
x
L
L
x
R
W
x
Y
G
|
G
T
x
S
A
x
L
L
x
H
D
x
G
N
x
T
L
x
V
A
x
L
W
x
G
W
x
L
R
x
E
M
x
V
V
|
V
D
x
L
P
x
A
E
x
D
G
|
G
N
x
T
W
x
V
L
|
L
E
x
D
V
x
C
T
x
L
R
 
-
L
 
-
D
 
-
H
 
-
N
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
-
H
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
W
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
-
R
x
T
K
x
S
F
x
L
R
|
R
K
|
K
E
x
D
G
x
N
L
x
T
G
|
G
K
x
Y
D
|
D
V
x
L
T
x
K
D
x
Q
K
x
L
F
|
F
L
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
I
|
I
Q
x
G
K
x
S
E
|
E
G
|
G
C
x
T
D
x
L
G
|
G
I
|
I
I
|
I
T
|
T
S
x
T
A
x
V
R
x
S
W
x
I
I
x
L
L
 
-
H
 
-
R
 
-
M
x
C
P
|
P
A
x
P
H
x
K
V
x
P
R
|
R
T
x
A
V
|
V
C
x
N
L
x
V
E
x
A
F
|
F
F
x
L
G
|
G
Q
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
I
x
C
P
|
P
S
x
G
I
x
F
V
x
A
E
|
E
I
x
V
K
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
|
L
D
x
Q
A
x
T
E
x
F
S
|
S
R
x
T
T
x
C
P
x
K
G
|
G
-
x
M
-
x
L
G
|
G
A
x
E
I
|
I
L
|
L
A
x
S
G
x
A
L
x
F
E
|
E
H
x
F
L
x
M
D
|
D
E
x
A
R
x
V
Y
x
C
L
x
M
R
x
Q
A
x
L
V
|
V
G
|
G
-
x
R
-
x
H
Y
x
L
A
x
H
T
x
L
K
x
A
S
|
S
K
x
P
R
x
V
N
x
Q
A
x
E
F
x
S
P
|
P
K
x
F
M
x
Y
V
|
V
L
|
L
I
|
I
-
x
E
-
x
T
-
x
S
G
|
G
D
x
S
I
x
N
V
x
A
G
|
G
D
x
H
D
|
D
Q
x
A
D
x
E
A
x
K
V
x
L
A
x
G
R
x
H
A
x
F
T
x
L
S
x
E
E
x
H
V
x
A
I
 
-
R
 
-
M
x
L
A
x
G
N
x
S
G
|
G
K
x
L
S
x
V
G
x
T
E
x
D
G
|
G
F
x
T
V
x
M
A
|
A
V
x
T
S
x
D
P
x
Q
E
x
R
A
x
K
R
x
V
K
|
K
K
x
M
F
x
L
W
|
W
L
x
A
D
x
L
R
|
R
S
x
E
R
|
R
-
x
I
T
|
T
A
x
E
A
|
A
I
x
L
A
x
S
R
|
R
H
x
D
T
x
G
N
x
Y
A
x
V
F
x
Y
K
|
K
I
x
Y
N
 
-
E
 
-
D
|
D
V
x
L
V
x
S
I
x
L
P
|
P
L
x
V
P
x
E
R
|
R
M
x
L

Sites not aligning to the query:

8jdtA Crystal structure of mldhd in complex with 2-ketobutanoic acid (see paper)
26% identity, 33% coverage: 176:611/1324 of query aligns to 25:388/455 of 8jdtA

query
sites
8jdtA
R
 
R
V
 
E
S
 
Q
H
 
H
V
 
G
T
 
H
D
 
D
A
 
E
T
 
S
D
 
M
W
 
H
R
 
R
V
 
C
E
 
Q
Y
 
P
P
 
P
F
 
D
V
 
A
V
 
V
L
 
V
T
 
W
P
 
P
D
 
Q
T
 
N
E
 
V
E
 
D
E
 
Q
I
 
V
A
 
S
G
 
R
M
 
V
V
 
A
K
 
S
G
 
L
C
 
C
F
 
Y
E
 
N
L
 
Q
G
 
G
L
 
V
T
 
P
I
 
I
I
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
G
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
Y
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
V
 
C
P
 
A
L
 
V
T
 
Q
P
 
-
M
 
G
S
 
G
A
 
V
V
 
C
I
 
I
N
 
N
T
x
L
E
 
T
K
 
H
L
 
M
E
 
D
Q
 
Q
L
 
I
G
 
T
P
 
E
V
 
L
E
 
N
Q
 
T
T
 
E
D
 
D
L
 
F
P
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
S
I
 
V
F
 
V
S
 
V
G
 
E
A
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
R
 
K
R
 
A
V
 
L
A
 
N
D
 
T
A
 
H
A
 
L
D
 
R
K
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
W
F
 
F
A
 
P
V
 
V
D
 
D
P
|
P
T
x
G
S
x
A
I
 
D
D
 
A
A
 
S
S
 
L
C
 
C
I
 
-
G
 
-
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
M
x
T
N
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
K
 
T
K
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
R
W
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
M
L
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
V
A
 
I
W
 
N
W
 
L
R
 
E
M
 
V
V
 
V
D
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
N
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
R
L
 
L
D
 
L
H
 
H
N
 
T
L
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
-
H
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
W
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
G
R
 
R
K
 
H
F
 
Y
R
 
R
K
 
K
E
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
G
K
 
Y
D
 
N
V
 
L
T
 
T
D
 
G
K
 
L
F
 
F
L
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
V
Q
 
G
K
 
S
E
|
E
G
|
G
C
 
T
D
 
L
G
 
G
I
 
I
I
|
I
T
 
T
S
 
S
A
 
T
R
 
T
W
 
L
I
 
R
L
 
L
H
 
H
R
 
P
M
 
A
P
 
P
-
 
E
A
 
A
H
 
T
V
 
V
R
 
A
T
 
A
V
 
T
C
 
C
L
 
A
E
 
-
F
 
-
F
 
F
G
 
P
Q
 
S
A
 
V
R
 
Q
D
 
A
A
 
A
I
 
V
P
 
D
S
 
S
I
 
T
V
 
V
E
 
Q
I
 
I
K
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
L
E
 
Q
S
 
A
R
 
A
T
 
V
P
 
P
G
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
V
A
 
A
G
 
R
L
 
I
E
 
E
H
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
D
R
 
V
Y
 
M
L
 
M
R
 
D
A
 
A
V
 
C
G
 
N
Y
 
R
A
 
H
T
 
S
K
 
K
S
 
L
K
 
N
R
 
C
N
 
P
A
 
V
F
 
A
P
 
P
K
 
T
M
 
L
V
 
F
L
 
L
I
 
-
G
 
-
D
 
E
I
 
F
V
 
H
G
 
G
D
 
S
D
 
Q
Q
 
Q
D
 
T
A
 
L
V
 
A
A
 
E
R
 
Q
A
 
L
T
 
Q
-
 
R
S
 
T
E
 
E
V
 
A
I
 
I
R
 
T
M
 
Q
A
 
D
N
 
N
G
 
G
K
 
G
S
 
S
G
 
H
E
 
F
G
 
S
F
 
W
V
 
A
A
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
E
A
 
K
R
 
R
K
 
N
K
 
E
F
 
L
W
 
W
L
 
A
D
 
A
R
|
R
S
 
H
R
 
N
T
 
A
-
x
W
-
 
Y
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
L
H
 
S
T
 
P
N
 
G
A
 
S
F
 
K
K
 
A
I
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
C
I
 
V
P
 
P
L
 
I
P
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
P
E
 
E
Y
 
I
T
 
L
D
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
V
N
 
E
I
 
T
E
 
K
L
 
E
S
 
E
I
 
I
K
 
K
N
 
A
K
 
S
L
 
-
Q
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
G
A
 
A
L
 
I
E
 
V
A
 
G
F
x
H
F
 
V
A
 
G
R
 
D
G
 
G
N
 
N
-
 
F
-
x
H
-
 
C
L
 
I
P
 
L
L
 
L
G
 
V
R
 
D
S
 
P
D
 
D
D
 
D
A
 
A
N
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

8jduA Crystal structure of mldhd in complex with 2-ketovaleric acid (see paper)
25% identity, 33% coverage: 176:611/1324 of query aligns to 25:388/455 of 8jduA

query
sites
8jduA
R
 
R
V
 
E
S
 
Q
H
 
H
V
 
G
T
 
H
D
 
D
A
 
E
T
 
S
D
 
M
W
 
H
R
 
R
V
 
C
E
 
Q
Y
 
P
P
 
P
F
 
D
V
 
A
V
 
V
L
 
V
T
 
W
P
 
P
D
 
Q
T
 
N
E
 
V
E
 
D
E
 
Q
I
 
V
A
 
S
G
 
R
M
 
V
V
 
A
K
 
S
G
 
L
C
 
C
F
 
Y
E
 
N
L
 
Q
G
 
G
L
 
V
T
 
P
I
 
I
I
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
G
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
Y
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
V
 
C
P
 
A
L
 
V
T
 
Q
P
 
G
M
 
-
S
 
G
A
 
V
V
 
C
I
 
I
N
 
N
T
x
L
E
 
T
K
 
H
L
 
M
E
 
D
Q
 
Q
L
 
I
G
 
T
P
 
E
V
 
L
E
 
N
Q
 
T
T
 
E
D
 
D
L
 
F
P
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
S
I
 
V
F
 
V
S
 
V
G
 
E
A
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
R
 
K
R
 
A
V
 
L
A
 
N
D
 
T
A
 
H
A
 
L
D
 
R
K
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
W
F
 
F
A
 
P
V
 
V
D
 
D
P
|
P
T
x
G
S
x
A
I
 
D
D
 
A
A
 
S
S
 
L
C
 
C
I
 
-
G
 
-
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
M
x
T
N
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
K
 
T
K
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
R
W
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
M
L
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
V
A
 
I
W
 
N
W
 
L
R
 
E
M
 
V
V
 
V
D
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
N
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
R
L
 
L
D
 
L
H
 
H
N
 
T
L
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
-
H
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
W
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
G
R
 
R
K
 
H
F
 
Y
R
 
R
K
 
K
E
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
G
K
 
Y
D
 
N
V
 
L
T
 
T
D
 
G
K
 
L
F
 
F
L
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
V
Q
 
G
K
 
S
E
|
E
G
|
G
C
 
T
D
 
L
G
 
G
I
 
I
I
|
I
T
 
T
S
 
S
A
 
T
R
 
T
W
 
L
I
 
R
L
 
L
H
 
H
R
 
P
M
 
A
P
 
P
-
 
E
A
 
A
H
 
T
V
 
V
R
 
A
T
 
A
V
 
T
C
 
C
L
 
A
E
 
-
F
 
-
F
 
F
G
 
P
Q
 
S
A
 
V
R
 
Q
D
 
A
A
 
A
I
 
V
P
 
D
S
 
S
I
 
T
V
 
V
E
 
Q
I
 
I
K
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
L
E
 
Q
S
 
A
R
 
A
T
 
V
P
 
P
G
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
V
A
 
A
G
 
R
L
 
I
E
 
E
H
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
D
R
 
V
Y
 
M
L
 
M
R
 
D
A
 
A
V
 
C
G
 
N
Y
 
R
A
 
H
T
 
S
K
 
K
S
 
L
K
 
N
R
 
C
N
 
P
A
 
V
F
 
A
P
 
P
K
 
T
M
 
L
V
 
F
L
 
L
I
 
-
G
 
-
D
 
E
I
 
F
V
 
H
G
 
G
D
 
S
D
 
Q
Q
 
Q
D
 
T
A
 
L
V
 
A
A
 
E
R
 
Q
A
 
L
T
 
Q
S
 
R
E
 
T
V
 
E
I
 
A
R
 
I
M
 
T
A
 
Q
N
 
N
G
 
G
K
 
G
S
 
S
G
 
H
E
 
F
G
 
S
F
 
W
V
 
A
A
 
A
V
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
E
A
 
K
R
 
R
K
 
N
K
 
E
F
 
L
W
 
W
L
 
A
D
 
A
R
|
R
S
 
H
R
 
N
T
 
A
-
x
W
-
 
Y
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
L
H
 
S
T
 
P
N
 
G
A
 
S
F
 
K
K
 
A
I
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
C
I
 
V
P
 
P
L
 
I
P
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
P
E
 
E
Y
 
I
T
 
L
D
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
V
N
 
E
I
 
T
E
 
K
L
 
E
S
 
E
I
 
I
K
 
K
N
 
A
K
 
S
L
 
-
Q
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
G
A
 
A
L
 
I
E
 
V
A
 
G
F
x
H
F
 
V
A
 
G
R
 
D
G
 
G
N
 
N
-
 
F
-
x
H
-
 
C
L
 
I
P
 
L
L
 
L
G
 
V
R
 
D
S
 
P
D
 
D
D
 
D
A
 
A
N
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

8jdeA Crystal structure of mldhd in complex with d-lactate (see paper)
25% identity, 33% coverage: 176:611/1324 of query aligns to 25:388/455 of 8jdeA

query
sites
8jdeA
R
 
R
V
 
E
S
 
Q
H
 
H
V
 
G
T
 
H
D
 
D
A
 
E
T
 
S
D
 
M
W
 
H
R
 
R
V
 
C
E
 
Q
Y
 
P
P
 
P
F
 
D
V
 
A
V
 
V
L
 
V
T
 
W
P
 
P
D
 
Q
T
 
N
E
 
V
E
 
D
E
 
Q
I
 
V
A
 
S
G
 
R
M
 
V
V
 
A
K
 
S
G
 
L
C
 
C
F
 
Y
E
 
N
L
 
Q
G
 
G
L
 
V
T
 
P
I
 
I
I
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
G
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
Y
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
V
 
C
P
 
A
L
 
V
T
 
Q
P
 
G
M
 
-
S
 
G
A
 
V
V
 
C
I
 
I
N
 
N
T
x
L
E
 
T
K
 
H
L
 
M
E
 
D
Q
 
Q
L
 
I
G
 
T
P
 
E
V
 
L
E
 
N
Q
 
T
T
 
E
D
 
D
L
 
F
P
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
S
I
 
V
F
 
V
S
 
V
G
 
E
A
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
R
 
K
R
 
A
V
 
L
A
 
N
D
 
T
A
 
H
A
 
L
D
 
R
K
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
W
F
 
F
A
 
P
V
 
V
D
 
D
P
|
P
T
x
G
S
x
A
I
 
D
D
 
A
A
 
S
S
 
L
C
 
C
I
 
-
G
 
-
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
M
x
T
N
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
K
 
T
K
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
R
W
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
M
L
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
V
A
 
I
W
 
N
W
 
L
R
 
E
M
 
V
V
 
V
D
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
N
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
R
L
 
L
D
 
L
H
 
H
N
 
T
L
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
-
H
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
W
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
G
R
 
R
K
 
H
F
 
Y
R
 
R
K
 
K
E
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
G
K
 
Y
D
 
N
V
 
L
T
 
T
D
 
G
K
 
L
F
 
F
L
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
V
Q
 
G
K
 
S
E
|
E
G
|
G
C
 
T
D
 
L
G
 
G
I
 
I
I
|
I
T
 
T
S
 
S
A
 
T
R
 
T
W
 
L
I
 
R
L
 
L
H
 
H
R
 
P
M
 
A
P
 
P
-
 
E
A
 
A
H
 
T
V
 
V
R
 
A
T
 
A
V
 
T
C
 
C
L
 
A
E
 
-
F
 
-
F
 
F
G
 
P
Q
 
S
A
 
V
R
 
Q
D
 
A
A
 
A
I
 
V
P
 
D
S
 
S
I
 
T
V
 
V
E
 
Q
I
 
I
K
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
L
E
 
Q
S
 
A
R
 
A
T
 
V
P
 
P
G
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
V
A
 
A
G
 
R
L
 
I
E
 
E
H
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
D
R
 
V
Y
 
M
L
 
M
R
 
D
A
 
A
V
 
C
G
 
N
Y
 
R
A
 
H
T
 
S
K
 
K
S
 
L
K
 
N
R
 
C
N
 
P
A
 
V
F
 
A
P
 
P
K
 
T
M
 
L
V
 
F
L
 
L
I
 
-
G
 
-
D
 
E
I
 
F
V
 
H
G
 
G
D
 
S
D
 
Q
Q
 
Q
D
 
T
A
 
L
V
 
A
A
 
E
R
 
Q
A
 
L
T
 
Q
-
 
R
S
 
T
E
 
E
V
 
A
I
 
I
R
 
T
M
 
Q
A
 
D
N
 
N
G
 
G
K
 
G
S
 
S
G
 
H
E
 
F
G
 
S
F
 
W
V
 
A
A
 
A
V
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
E
R
 
K
K
 
N
K
 
E
F
 
L
W
 
W
L
 
A
D
 
A
R
|
R
S
 
H
R
 
N
T
 
A
-
x
W
-
 
Y
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
L
H
 
S
T
 
P
N
 
G
A
 
S
F
 
K
K
 
A
I
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
C
I
 
V
P
 
P
L
 
I
P
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
P
E
 
E
Y
 
I
T
 
L
D
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
V
N
 
E
I
 
T
E
 
K
L
 
E
S
 
E
I
 
I
K
 
K
N
 
A
K
 
S
L
 
-
Q
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
G
A
 
A
L
 
I
E
 
V
A
 
G
F
x
H
F
 
V
A
 
G
R
 
D
G
 
G
N
 
N
-
 
F
-
x
H
-
 
C
L
 
I
P
 
L
L
 
L
G
 
V
R
 
D
S
 
P
D
 
D
D
 
D
A
 
A
N
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

8jdxA Crystal structure of mldhd in complex with 2-ketoisovaleric acid (see paper)
26% identity, 33% coverage: 176:611/1324 of query aligns to 25:388/455 of 8jdxA

query
sites
8jdxA
R
 
R
V
 
E
S
 
Q
H
 
H
V
 
G
T
 
H
D
 
D
A
x
E
T
 
S
D
 
M
W
 
H
R
 
R
V
 
C
E
 
Q
Y
 
P
P
 
P
F
 
D
V
 
A
V
 
V
L
 
V
T
 
W
P
 
P
D
 
Q
T
 
N
E
 
V
E
 
D
E
 
Q
I
 
V
A
 
S
G
 
R
M
 
V
V
 
A
K
 
S
G
 
L
C
 
C
F
 
Y
E
 
N
L
 
Q
G
 
G
L
 
V
T
 
P
I
 
I
I
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
G
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
Y
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
V
 
C
P
 
A
L
 
V
T
 
Q
P
 
G
M
 
-
S
 
G
A
 
V
V
 
C
I
 
I
N
 
N
T
x
L
E
 
T
K
 
H
L
 
M
E
 
D
Q
 
Q
L
 
I
G
 
T
P
 
E
V
 
L
E
 
N
Q
 
T
T
 
E
D
 
D
L
 
F
P
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
S
I
 
V
F
 
V
S
 
V
G
 
E
A
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
R
 
K
R
 
A
V
 
L
A
 
N
D
 
T
A
 
H
A
 
L
D
 
R
K
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
W
F
 
F
A
 
P
V
 
V
D
 
D
P
|
P
T
x
G
S
x
A
I
 
D
D
 
A
A
 
S
S
 
L
C
 
C
I
 
-
G
 
-
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
M
x
T
N
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
K
 
T
K
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
R
W
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
M
L
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
V
A
 
I
W
 
N
W
 
L
R
 
E
M
 
V
V
 
V
D
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
N
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
R
L
 
L
D
 
L
H
 
H
N
 
T
L
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
-
H
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
W
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
G
R
 
R
K
 
H
F
 
Y
R
 
R
K
 
K
E
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
G
K
 
Y
D
 
N
V
 
L
T
 
T
D
 
G
K
 
L
F
 
F
L
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
V
Q
 
G
K
 
S
E
|
E
G
|
G
C
 
T
D
 
L
G
 
G
I
 
I
I
|
I
T
 
T
S
 
S
A
 
T
R
 
T
W
 
L
I
 
R
L
 
L
H
 
H
R
 
P
M
 
A
P
 
P
-
 
E
A
 
A
H
 
T
V
 
V
R
 
A
T
 
A
V
 
T
C
 
C
L
 
A
E
 
-
F
 
-
F
 
F
G
 
P
Q
 
S
A
 
V
R
 
Q
D
 
A
A
 
A
I
 
V
P
 
D
S
 
S
I
 
T
V
 
V
E
 
Q
I
 
I
K
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
L
E
 
Q
S
 
A
R
 
A
T
 
V
P
 
P
G
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
V
A
 
A
G
 
R
L
 
I
E
 
E
H
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
D
R
 
V
Y
 
M
L
 
M
R
 
D
A
 
A
V
 
-
G
 
-
Y
 
-
A
 
C
T
 
N
K
 
R
S
 
H
K
 
S
R
 
L
N
 
N
A
 
C
F
 
P
P
 
V
K
 
A
M
 
P
V
 
T
L
 
L
I
 
F
G
 
L
D
 
E
I
 
F
V
 
H
G
 
G
D
 
S
D
 
Q
Q
 
Q
D
 
T
A
 
L
V
 
A
A
 
E
R
 
Q
A
 
L
T
 
Q
-
 
R
S
 
T
E
 
E
V
 
A
I
 
I
R
 
T
M
 
Q
A
 
D
N
 
N
G
 
G
K
 
G
S
 
S
G
 
H
E
 
F
G
 
S
F
 
W
V
 
A
A
 
A
V
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
E
A
 
K
R
 
R
K
 
N
K
 
E
F
 
L
W
 
W
L
 
A
D
 
A
R
|
R
S
 
H
R
 
N
T
 
A
-
x
W
-
 
Y
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
L
H
 
S
T
 
P
N
 
G
A
 
S
F
 
K
K
 
A
I
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
C
I
 
V
P
 
P
L
 
I
P
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
P
E
 
E
Y
 
I
T
 
L
D
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
V
N
 
E
I
 
T
E
 
K
L
 
E
S
 
E
I
 
I
K
 
K
N
 
A
K
 
S
L
 
-
Q
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
G
A
 
A
L
 
I
E
 
V
A
 
G
F
x
H
F
 
V
A
 
G
R
 
D
G
 
G
N
 
N
-
 
F
-
x
H
-
 
C
L
 
I
P
 
L
L
 
L
G
 
V
R
 
D
S
 
P
D
 
D
D
 
D
A
 
A
N
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

8jdpA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyisovaleric acid (see paper)
26% identity, 33% coverage: 176:611/1324 of query aligns to 25:388/455 of 8jdpA

query
sites
8jdpA
R
 
R
V
 
E
S
 
Q
H
 
H
V
 
G
T
 
H
D
 
D
A
 
E
T
 
S
D
 
M
W
 
H
R
 
R
V
 
C
E
 
Q
Y
 
P
P
 
P
F
 
D
V
 
A
V
 
V
L
 
V
T
 
W
P
 
P
D
 
Q
T
 
N
E
 
V
E
 
D
E
 
Q
I
 
V
A
 
S
G
 
R
M
 
V
V
 
A
K
 
S
G
 
L
C
 
C
F
 
Y
E
 
N
L
 
Q
G
 
G
L
 
V
T
 
P
I
 
I
I
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
G
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
Y
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
V
 
C
P
 
A
L
 
V
T
 
Q
P
 
-
M
 
G
S
 
G
A
 
V
V
 
C
I
 
I
N
 
N
T
x
L
E
 
T
K
 
H
L
 
M
E
 
D
Q
 
Q
L
 
I
G
 
T
P
 
E
V
 
L
E
 
N
Q
 
T
T
 
E
D
 
D
L
 
F
P
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
S
I
 
V
F
 
V
S
 
V
G
 
E
A
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
R
 
K
R
 
A
V
 
L
A
 
N
D
 
T
A
 
H
A
 
L
D
 
R
K
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
W
F
 
F
A
 
P
V
 
V
D
 
D
P
|
P
T
x
G
S
x
A
I
 
D
D
 
A
A
 
S
S
 
L
C
 
C
I
 
-
G
 
-
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
M
x
T
N
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
K
 
T
K
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
R
W
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
M
L
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
V
A
 
I
W
 
N
W
 
L
R
 
E
M
 
V
V
 
V
D
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
N
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
R
L
 
L
D
 
L
H
 
H
N
 
T
L
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
-
H
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
W
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
G
R
 
R
K
 
H
F
 
Y
R
 
R
K
 
K
E
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
G
K
 
Y
D
 
N
V
 
L
T
 
T
D
 
G
K
 
L
F
 
F
L
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
V
Q
 
G
K
 
S
E
|
E
G
|
G
C
 
T
D
 
L
G
 
G
I
 
I
I
|
I
T
 
T
S
 
S
A
 
T
R
 
T
W
 
L
I
 
R
L
 
L
H
 
H
R
 
P
M
 
A
P
 
P
-
 
E
A
 
A
H
 
T
V
 
V
R
 
A
T
 
A
V
 
T
C
 
C
L
 
A
E
 
-
F
 
-
F
 
F
G
 
P
Q
 
S
A
 
V
R
 
Q
D
 
A
A
 
A
I
 
V
P
 
D
S
 
S
I
 
T
V
 
V
E
 
Q
I
 
I
K
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
L
E
 
Q
S
 
A
R
 
A
T
 
V
P
 
P
G
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
V
A
 
A
G
 
R
L
 
I
E
 
E
H
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
D
R
 
V
Y
 
M
L
 
M
R
 
D
A
 
A
V
 
C
G
 
N
Y
 
R
A
 
H
T
 
S
K
 
K
S
 
L
K
 
N
R
 
C
N
 
P
A
 
V
F
 
A
P
 
P
K
 
T
M
 
L
V
 
F
L
 
L
I
 
-
G
 
-
D
 
E
I
 
F
V
 
H
G
 
G
D
 
S
D
 
Q
Q
 
Q
D
 
T
A
 
L
V
 
A
A
 
E
R
 
Q
A
 
L
T
 
Q
-
 
R
S
 
T
E
 
E
V
 
A
I
 
I
R
 
T
M
 
Q
A
 
D
N
 
N
G
 
G
K
 
G
S
 
S
G
 
H
E
 
F
G
 
S
F
 
W
V
 
A
A
 
A
V
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
E
A
 
K
R
 
R
K
 
N
K
 
E
F
 
L
W
 
W
L
 
A
D
 
A
R
|
R
S
 
H
R
 
N
T
 
A
-
 
W
-
 
Y
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
L
H
 
-
T
 
S
N
 
P
A
 
S
F
 
K
K
 
A
I
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
C
I
 
V
P
 
P
L
 
I
P
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
P
E
 
E
Y
 
I
T
 
L
D
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
V
N
 
E
I
 
T
E
 
K
L
 
E
S
 
E
I
 
I
K
 
K
N
 
A
K
 
S
L
 
-
Q
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
G
A
 
A
L
 
I
E
 
V
A
 
G
F
x
H
F
 
V
A
 
G
R
 
D
G
 
G
N
 
N
L
 
F
P
 
A
-
 
C
-
 
I
-
 
L
L
 
L
G
 
V
R
 
D
S
 
P
D
 
D
D
 
D
A
 
A
N
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

8jdzA Crystal structure of mldhd in complex with 2-keto-3-methylvaleric acid (see paper)
25% identity, 30% coverage: 176:568/1324 of query aligns to 25:348/454 of 8jdzA

query
sites
8jdzA
R
 
R
V
 
E
S
 
Q
H
 
H
V
 
G
T
 
H
D
 
D
A
x
E
T
 
S
D
 
M
W
 
H
R
 
R
V
 
C
E
 
Q
Y
 
P
P
 
P
F
 
D
V
 
A
V
 
V
L
 
V
T
 
W
P
 
P
D
 
Q
T
 
N
E
 
V
E
 
D
E
 
Q
I
 
V
A
 
S
G
 
R
M
 
V
V
 
A
K
 
S
G
 
L
C
 
C
F
 
Y
E
 
N
L
 
Q
G
 
G
L
 
V
T
 
P
I
 
I
I
 
I
P
|
P
R
 
F
G
|
G
G
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
Y
 
V
T
 
E
G
 
G
G
|
G
A
x
V
V
 
C
P
 
A
L
 
V
T
 
Q
P
 
G
M
 
-
S
 
G
A
 
V
V
 
C
I
 
I
N
 
N
T
x
L
E
 
T
K
 
H
L
 
M
E
 
D
Q
 
Q
L
 
I
G
 
T
P
 
E
V
 
L
E
 
N
Q
 
T
T
 
E
D
 
D
L
 
F
P
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
S
I
 
V
F
 
V
S
 
V
G
 
E
A
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
T
T
 
R
R
 
K
R
 
A
V
 
L
A
 
N
D
 
T
A
 
H
A
 
L
D
 
R
K
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
W
F
 
F
A
 
P
V
 
V
D
 
D
P
|
P
T
x
G
S
x
A
I
 
D
D
 
A
A
 
S
S
 
L
C
 
C
I
 
-
G
 
-
G
|
G
N
x
M
V
 
A
A
|
A
M
x
T
N
 
G
A
|
A
G
x
S
G
 
G
K
 
T
K
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
R
W
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
M
L
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
V
A
 
I
W
 
N
W
 
L
R
 
E
M
 
V
V
 
V
D
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
N
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
R
L
 
L
D
 
L
H
 
H
N
 
T
L
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
-
H
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
W
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
G
R
 
R
K
 
H
F
 
Y
R
 
R
K
 
K
E
 
S
G
 
A
L
 
A
G
 
G
K
 
Y
D
 
N
V
 
L
T
 
T
D
 
G
K
 
L
F
 
F
L
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
V
Q
 
G
K
 
S
E
|
E
G
|
G
C
 
T
D
 
L
G
 
G
I
 
I
I
|
I
T
 
T
S
 
S
A
 
T
R
 
T
W
 
L
I
 
R
L
 
L
H
 
H
R
 
P
M
 
A
P
 
P
-
 
E
A
 
A
H
 
T
V
 
V
R
 
A
T
 
A
V
 
T
C
 
C
L
 
A
E
 
-
F
 
-
F
 
F
G
 
P
Q
 
S
A
 
V
R
 
Q
D
 
A
A
 
A
I
 
V
P
 
D
S
 
S
I
 
T
V
 
V
E
 
Q
I
 
I
K
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
L
E
 
Q
S
 
A
R
 
A
T
 
V
P
 
P
G
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
V
A
 
A
G
 
R
L
 
I
E
 
E
H
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
D
R
 
V
Y
 
M
L
 
M
R
 
D
A
 
A
V
 
-
G
 
-
Y
 
-
A
 
C
T
 
N
K
 
R
S
 
H
K
 
S
R
 
L
N
 
N
A
 
C
F
 
P
P
 
V
K
 
A
M
 
P
V
 
T
L
 
L
I
 
F
G
 
L
D
 
E
I
 
F
V
 
H
G
 
G
D
 
S
D
 
Q
Q
 
Q
D
 
T
A
 
L
V
 
A
A
 
E
R
 
Q
A
 
L
T
 
Q
-
 
R
S
 
T
E
 
E
V
 
A
I
 
I
R
 
T
M
 
Q
A
 
D
N
 
N
G
 
G
K
 
G
S
 
S
G
 
H
E
 
F
G
 
S
F
 
W
V
 
A
A
 
A
V
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
E
A
 
K
R
 
R
K
 
N
K
 
E
F
 
L
W
 
W
L
 
A
D
 
A
R
|
R
S
 
H
R
 
N
T
 
A
-
x
W
-
 
Y
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
L
H
 
S
T
 
P
N
 
G
A
 
S
F
 
K
K
 
A
I
 
Y
N
 
S
E
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
C
I
 
V
P
 
P
L
 
I
P
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
P
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>RR42_RS02380 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS02380
MNAPLVLDAKLAAQDAPARLREIPYNYTSFSDREIVIRLLGEEAWRILAELRGERRTGRS
ARMLYEVLGDIWVVRRNPYLQDDLLENPKRRQMLVTALHHRLSEVEKRRAADRAEHAEPA
AEDRSHRVEQLVSFAKQAIEDFKQEFAHAYDLRKRTQRVLGRITQKDNIKFDGLSRVSHV
TDATDWRVEYPFVVLTPDTEEEIAGMVKGCFELGLTIIPRGGGTGYTGGAVPLTPMSAVI
NTEKLEQLGPVEQTDLPGVSHKVGTIFSGAGVVTRRVADAADKAGLVFAVDPTSIDASCI
GGNVAMNAGGKKAVLWGTALDNLAWWRMVDPEGNWLEVTRLDHNLGKIHDVAVATFELKW
SDGNRAPGEKPLRTETLAIEGRKFRKEGLGKDVTDKFLAGLPGIQKEGCDGIITSARWIL
HRMPAHVRTVCLEFFGQARDAIPSIVEIKDYLDAESRTPGGAILAGLEHLDERYLRAVGY
ATKSKRNAFPKMVLIGDIVGDDQDAVARATSEVIRMANGKSGEGFVAVSPEARKKFWLDR
SRTAAIARHTNAFKINEDVVIPLPRMGEYTDGIERINIELSIKNKLQLTDALEAFFARGN
LPLGRSDDANEIPSAELLEDRVQHALQLLREIRSRWTYLQDHLDTPLATARASLIGHGLG
LLGQAFEARLEQQPDATVFHLLQDRTIRVSWKSEVRAELRNIFNGGEFKPILDEAQKIHK
QVLRGRVFVALHMHAGDGNVHTNIPVNSDDYDMLQDAHRAVARIMALARSLDGVISGEHG
IGITKLEFLTEDEIGEFREYKQRVDPQGRFNKGKLLPGADLRNAYTPSFGLMGHESIIMQ
QSDIGAIADSVKDCLRCGKCKPVCATHVPRANLLYSPRNKILATSLLVEAFLYEEQTRRG
ISIKHWDEFSDVADHCTVCHKCVTPCPVKIDFGDVSMNMRNLLRKMGQKKFNPGTAASMF
FLNATNPQTINMTRKVMIDWGYKAQRLGNDVLKKFARKQTAHPPATVGRAPVQEQVIHFI
NKKMPGNLPKKTARALLDIEDNEIVPIIRDPKRTSPETEAVFYFPGCGSERLFSQVGLAT
QAMLWHVGVQTVLPPGYLCCGYPQRGNGQFDKAEKMVTDNRVLFHRVANTLNYLDIKTVV
VSCGTCYDQLAGYEFDKIFPGCRIIDIHEYLLEKGVKLEGVTGTRYMYHDPCHTPIKTMD
PTKLVNELMGGNEGGSKIEKNERCCGESGTLAVSRPDVSTQIRFRKEEEMTKGADKLRTD
GFVGDVKILTSCPSCLQGLSRYKEDATVTADYIVVEMAKHLLGENWMPDYVAKANSGGIE
RVLV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory