SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS03865 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS03865 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q65CJ7 Hydroxyphenylpyruvate reductase; HPPR; EC 1.1.1.237 from Plectranthus scutellarioides (Coleus) (Solenostemon scutellarioides) (see paper)
44% identity, 100% coverage: 1:313/313 of query aligns to 1:313/313 of Q65CJ7

query
sites
Q65CJ7
M
 
M
S
 
E
Q
 
A
A
 
I
T
 
G
L
 
V
I
 
L
Q
 
M
I
 
M
G
 
C
P
 
P
L
 
M
A
 
S
P
 
T
Q
 
Y
I
 
L
N
 
E
S
 
Q
R
 
E
L
 
L
R
 
D
E
 
K
Q
 
R
Y
 
F
Q
 
K
A
 
L
V
 
F
P
 
R
L
 
Y
W
 
W
E
 
T
Q
 
Q
P
 
P
E
 
A
P
 
Q
L
 
R
A
 
D
W
 
F
L
 
L
R
 
A
E
 
L
H
 
Q
A
 
A
Q
 
E
Q
 
S
A
 
I
R
 
R
V
 
A
A
 
V
V
 
V
T
 
G
S
 
N
A
 
S
R
 
N
H
 
A
G
 
G
I
 
A
T
 
D
A
 
A
E
 
E
A
 
L
I
 
I
A
 
D
A
 
A
M
 
L
P
 
P
R
 
K
L
 
L
A
 
E
A
 
I
I
 
V
V
 
S
S
 
S
F
 
F
G
 
S
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
S
 
K
I
 
V
A
 
D
L
 
L
D
 
I
A
 
K
A
 
C
R
 
E
A
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
Q
 
R
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
L
N
 
T
D
 
D
C
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
F
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
A
A
 
V
A
 
L
R
 
R
G
 
R
I
 
I
A
 
C
H
 
E
G
 
C
D
 
D
R
 
K
F
 
Y
V
 
V
R
 
R
A
 
R
G
 
G
K
 
A
W
 
W
G
 
K
R
 
F
D
 
G
S
 
D
F
 
F
P
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
R
 
K
V
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
L
K
 
A
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
R
 
R
A
 
A
T
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
D
M
 
C
D
 
P
I
 
I
A
 
S
Y
 
Y
H
 
F
N
x
S
R
|
R
R
x
S
A
 
K
R
 
K
D
 
P
G
 
N
A
 
T
P
 
N
W
 
Y
R
 
T
H
 
Y
E
 
Y
P
 
G
D
 
S
L
 
V
K
 
V
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
S
W
 
N
A
 
S
D
 
D
F
 
I
L
 
L
A
 
V
V
 
V
T
 
A
C
 
C
V
 
P
G
 
L
G
 
T
P
 
P
E
 
E
T
 
T
E
 
T
G
 
H
L
 
I
V
 
I
S
 
N
A
 
R
G
 
E
I
 
V
I
 
I
E
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
S
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
P
V
 
H
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
P
A
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
V
N
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
A
 
R
E
 
E
P
 
P
Q
 
E
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
G
L
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
L
P
 
P
H
 
H
V
 
V
A
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
H
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
R
A
 
K
A
 
V
M
 
M
A
 
A
A
 
D
L
 
L
V
 
V
F
 
V
D
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
E
A
 
A
F
 
H
L
 
F
G
 
S
T
 
G
G
 
K
K
 
P
V
 
L
I
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
V

3bazA Structure of hydroxyphenylpyruvate reductase from coleus blumei in complex with NADP+ (see paper)
45% identity, 98% coverage: 6:313/313 of query aligns to 4:311/311 of 3bazA

query
sites
3bazA
L
 
V
I
 
L
Q
 
M
I
 
M
G
 
C
P
 
P
L
 
M
A
 
S
P
 
T
Q
 
Y
I
 
L
N
 
E
S
 
Q
R
 
E
L
 
L
R
 
D
E
 
K
Q
 
R
Y
 
F
Q
 
K
A
 
L
V
 
F
P
 
R
L
 
Y
W
 
W
E
 
T
Q
 
Q
P
 
P
E
 
A
P
 
Q
L
 
R
A
 
D
W
 
F
L
 
L
R
 
A
E
 
L
H
 
Q
A
 
A
Q
 
E
Q
 
S
A
 
I
R
 
R
V
 
A
A
 
V
V
 
V
T
 
G
S
 
N
A
 
S
R
 
N
H
 
A
G
 
G
I
 
A
T
 
D
A
 
A
E
 
E
A
 
L
I
 
I
A
 
D
A
 
A
M
 
L
P
 
P
R
 
K
L
 
L
A
 
E
A
 
I
I
 
V
V
 
S
S
 
S
F
 
F
G
 
S
V
|
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
S
 
K
I
 
V
A
 
D
L
 
L
D
 
I
A
 
K
A
 
C
R
 
E
A
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
Q
 
R
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
N
 
T
D
 
D
C
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
F
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
A
A
 
V
A
 
L
R
 
R
G
 
R
I
 
I
A
 
C
H
 
E
G
 
C
D
 
D
R
 
K
F
 
Y
V
 
V
R
 
R
A
 
R
G
 
G
K
 
A
W
 
W
G
 
K
R
 
F
D
 
G
S
 
D
F
 
F
P
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
R
 
K
V
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
|
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
L
K
 
A
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
R
 
R
A
 
A
T
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
D
M
 
C
D
 
P
I
 
I
A
 
S
Y
 
Y
H
 
F
N
x
S
R
|
R
R
x
S
A
 
K
R
 
K
D
 
P
G
 
N
A
 
T
P
 
N
W
 
Y
R
 
T
H
 
Y
E
 
Y
P
 
G
D
 
S
L
 
V
K
 
V
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
S
W
 
N
A
 
S
D
 
D
F
 
I
L
 
L
A
 
V
V
 
V
T
 
A
C
|
C
V
x
P
G
 
L
G
 
T
P
 
P
E
 
E
T
|
T
E
 
T
G
 
H
L
 
I
V
 
I
S
 
N
A
 
R
G
 
E
I
 
V
I
 
I
E
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
S
x
G
R
|
R
G
 
G
S
 
P
V
 
H
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
P
A
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
V
N
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
|
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
A
 
R
E
|
E
P
 
P
Q
 
E
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
G
L
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
A
x
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
H
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
R
A
 
K
A
 
V
M
 
M
A
 
A
A
 
D
L
 
L
V
 
V
F
 
V
D
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
E
A
 
A
F
 
H
L
 
F
G
 
S
T
 
G
G
 
K
K
 
P
V
 
L
I
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
V

5v6qB Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and malonate (see paper)
43% identity, 100% coverage: 1:312/313 of query aligns to 1:310/319 of 5v6qB

query
sites
5v6qB
M
 
M
S
 
S
Q
 
R
A
 
P
T
 
R
L
 
I
I
 
L
Q
 
V
I
 
P
G
 
G
P
 
K
L
 
I
A
 
N
P
 
P
Q
 
R
I
 
V
N
 
L
S
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
P
E
 
E
Q
 
M
Y
 
F
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
P
 
R
L
 
I
W
 
E
E
 
R
Q
 
A
P
 
D
E
 
A
P
 
A
L
 
L
A
 
V
W
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
H
 
T
A
 
A
Q
 
D
Q
 
M
A
 
R
R
 
D
V
 
V
A
 
S
V
 
G
T
 
I
S
 
A
A
 
V
R
 
S
H
 
G
G
 
K
I
 
L
T
 
P
A
 
V
E
 
P
A
 
L
I
 
M
A
 
D
A
 
A
M
 
F
P
 
P
R
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
I
I
 
V
V
 
A
S
 
N
F
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
G
I
 
V
A
 
D
L
 
V
D
 
S
A
 
R
A
 
A
R
 
A
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Q
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
N
 
T
D
 
E
C
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
A
F
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
N
A
 
T
A
 
L
R
 
R
G
 
L
I
 
L
A
 
P
H
 
Q
G
 
A
D
 
E
R
 
Q
F
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
Q
G
 
G
K
 
R
W
 
W
G
 
V
R
 
R
D
 
E
-
 
G
S
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
S
T
 
P
-
 
L
R
 
S
V
 
L
S
 
R
G
 
G
K
 
R
K
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
x
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
L
K
 
A
V
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
A
 
L
T
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
V
D
 
S
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
N
x
T
R
|
R
R
 
T
A
 
P
R
 
R
D
 
E
G
 
G
A
 
L
P
 
G
W
 
F
R
 
T
H
 
Y
E
 
H
P
 
P
D
 
T
L
 
L
K
 
V
A
 
G
L
 
M
A
 
A
G
 
E
W
 
A
A
 
V
D
 
D
F
 
T
L
 
L
A
 
I
V
 
V
T
 
I
C
x
V
V
x
P
G
 
G
G
 
T
P
 
A
E
x
S
T
|
T
E
 
L
G
 
K
L
 
A
V
 
V
S
 
N
A
 
A
G
 
D
I
 
V
I
 
L
E
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
|
V
S
x
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
N
 
N
G
 
G
R
 
T
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
A
 
N
E
|
E
P
 
P
Q
 
N
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
S
L
 
F
D
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
S
L
 
L
A
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
A
|
A
S
 
S
G
 
A
T
 
S
H
 
V
E
 
V
T
 
T
R
 
R
A
 
N
A
 
A
M
 
M
A
 
S
A
 
D
L
 
L
V
 
V
F
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
L
D
 
K
A
 
A
F
 
W
L
 
F
G
 
S
T
 
T
G
 
G
K
 
E
V
 
A
I
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V

5v7nA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and 2-keto-d-gluconic acid (see paper)
43% identity, 99% coverage: 2:312/313 of query aligns to 1:309/319 of 5v7nA

query
sites
5v7nA
S
 
S
Q
 
R
A
 
P
T
 
R
L
 
I
I
 
L
Q
 
V
I
 
P
G
 
G
P
 
K
L
 
I
A
 
N
P
 
P
Q
 
R
I
 
V
N
 
L
S
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
P
E
 
E
Q
 
M
Y
 
F
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
P
 
R
L
 
I
W
 
E
E
 
R
Q
 
A
P
 
D
E
 
A
P
 
A
L
 
L
A
 
V
W
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
H
 
T
A
 
A
Q
 
D
Q
 
M
A
 
R
R
 
D
V
 
V
A
 
S
V
 
G
T
 
I
S
 
A
A
 
V
R
 
S
H
 
G
G
 
K
I
 
L
T
 
P
A
 
V
E
 
P
A
 
L
I
 
M
A
 
D
A
 
A
M
 
F
P
 
P
R
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
I
I
 
V
V
 
A
S
 
N
F
 
F
G
|
G
V
|
V
G
|
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
G
I
 
V
A
 
D
L
 
V
D
 
S
A
 
R
A
 
A
R
 
A
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Q
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
N
 
T
D
 
E
C
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
A
F
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
N
A
 
T
A
 
L
R
 
R
G
 
L
I
 
L
A
 
P
H
 
Q
G
 
A
D
 
E
R
 
Q
F
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
Q
G
 
G
K
 
R
W
 
W
G
 
V
R
 
R
D
 
E
-
 
G
S
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
S
T
 
P
-
 
L
R
 
S
V
 
L
S
 
R
G
 
G
K
 
R
K
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
 
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
L
K
 
A
V
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
A
 
L
T
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
V
D
 
S
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
N
x
T
R
|
R
R
 
T
A
 
P
R
 
R
D
 
E
G
 
G
A
 
L
P
 
G
W
 
F
R
 
T
H
 
Y
E
 
H
P
 
P
D
 
T
L
 
L
K
 
V
A
 
G
L
 
M
A
 
A
G
 
E
W
 
A
A
 
V
D
 
D
F
 
T
L
 
L
A
 
I
V
 
V
T
 
I
C
x
V
V
x
P
G
 
G
G
 
T
P
 
A
E
x
S
T
|
T
E
 
L
G
 
K
L
 
A
V
 
V
S
 
N
A
 
A
G
 
D
I
 
V
I
 
L
E
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
|
V
S
x
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
N
 
N
G
 
G
R
 
T
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
A
 
N
E
|
E
P
 
P
Q
 
N
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
S
L
 
F
D
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
S
L
 
L
A
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
A
|
A
S
|
S
G
 
A
T
 
S
H
 
V
E
 
V
T
 
T
R
|
R
A
 
N
A
 
A
M
 
M
A
 
S
A
 
D
L
 
L
V
 
V
F
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
L
D
 
K
A
 
A
F
 
W
L
 
F
G
 
S
T
 
T
G
 
G
K
 
E
V
 
A
I
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V

5j23A Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with 2'-phospho-adp-ribose (see paper)
44% identity, 97% coverage: 10:312/313 of query aligns to 8:308/318 of 5j23A

query
sites
5j23A
G
 
G
P
 
K
L
 
I
A
 
N
P
 
P
Q
 
R
I
 
V
N
 
L
S
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
P
E
 
E
Q
 
M
Y
 
F
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
P
 
R
L
 
I
W
 
E
E
 
R
Q
 
A
P
 
D
E
 
A
P
 
A
L
 
L
A
 
V
W
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
H
 
T
A
 
A
Q
 
D
Q
 
M
A
 
R
R
 
D
V
 
V
A
 
S
V
 
G
T
 
I
S
 
A
A
 
V
R
 
S
H
 
G
G
 
K
I
 
L
T
 
P
A
 
V
E
 
P
A
 
L
I
 
M
A
 
D
A
 
A
M
 
F
P
 
P
R
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
I
I
 
V
V
 
A
S
 
N
F
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
G
I
 
V
A
 
D
L
 
V
D
 
S
A
 
R
A
 
A
R
 
A
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Q
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
N
 
T
D
 
E
C
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
A
F
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
N
A
 
T
A
 
L
R
 
R
G
 
L
I
 
L
A
 
P
H
 
Q
G
 
A
D
 
E
R
 
Q
F
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
Q
G
 
G
K
 
R
W
 
W
G
 
V
R
 
R
D
 
E
-
 
G
S
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
S
T
 
P
-
 
L
R
 
S
V
 
L
S
 
R
G
 
G
K
 
R
K
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
 
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
L
K
 
A
V
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
A
 
L
T
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
V
D
 
S
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
N
x
T
R
|
R
R
 
T
A
 
P
R
 
R
D
 
E
G
 
G
A
 
L
P
 
G
W
 
F
R
 
T
H
 
Y
E
 
H
P
 
P
D
 
T
L
 
L
K
 
V
A
 
G
L
 
M
A
 
A
G
 
E
W
 
A
A
 
V
D
 
D
F
 
T
L
 
L
A
 
I
V
 
V
T
 
I
C
 
V
V
x
P
G
 
G
G
 
T
P
 
A
E
x
S
T
|
T
E
 
L
G
 
K
L
 
A
V
 
V
S
 
N
A
 
A
G
 
D
I
 
V
I
 
L
E
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
 
V
S
 
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
N
 
N
G
 
G
R
 
T
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
A
 
N
E
|
E
P
 
P
Q
 
N
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
S
L
 
F
D
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
S
L
 
L
A
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
A
T
 
S
H
 
V
E
 
V
T
 
T
R
 
R
A
 
N
A
 
A
M
 
M
A
 
S
A
 
D
L
 
L
V
 
V
F
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
L
D
 
K
A
 
A
F
 
W
L
 
F
G
 
S
T
 
T
G
 
G
K
 
E
V
 
A
I
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V

5v7gA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADPH and oxalate (see paper)
44% identity, 97% coverage: 10:312/313 of query aligns to 8:308/317 of 5v7gA

query
sites
5v7gA
G
 
G
P
 
K
L
 
I
A
 
N
P
 
P
Q
 
R
I
 
V
N
 
L
S
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
P
E
 
E
Q
 
M
Y
 
F
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
P
 
R
L
 
I
W
 
E
E
 
R
Q
 
A
P
 
D
E
 
A
P
 
A
L
 
L
A
 
V
W
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
H
 
T
A
 
A
Q
 
D
Q
 
M
A
 
R
R
 
D
V
 
V
A
 
S
V
 
G
T
 
I
S
 
A
A
 
V
R
 
S
H
 
G
G
 
K
I
 
L
T
 
P
A
 
V
E
 
P
A
 
L
I
 
M
A
 
D
A
 
A
M
 
F
P
 
P
R
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
I
I
 
V
V
 
A
S
 
N
F
 
F
G
|
G
V
|
V
G
|
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
G
I
 
V
A
 
D
L
 
V
D
 
S
A
 
R
A
 
A
R
 
A
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Q
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
N
 
T
D
 
E
C
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
A
F
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
N
A
 
T
A
 
L
R
 
R
G
 
L
I
 
L
A
 
P
H
 
Q
G
 
A
D
 
E
R
 
Q
F
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
Q
G
 
G
K
 
R
W
 
W
G
 
V
R
 
R
D
 
E
-
 
G
S
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
S
T
 
P
-
 
L
R
 
S
V
 
L
S
 
R
G
 
G
K
 
R
K
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
x
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
L
K
 
A
V
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
A
 
L
T
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
V
D
 
S
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
N
x
T
R
|
R
R
 
T
A
 
P
R
 
R
D
 
E
G
 
G
A
 
L
P
 
G
W
 
F
R
 
T
H
 
Y
E
 
H
P
 
P
D
 
T
L
 
L
K
 
V
A
 
G
L
 
M
A
 
A
G
 
E
W
 
A
A
 
V
D
 
D
F
 
T
L
 
L
A
 
I
V
 
V
T
 
I
C
x
V
V
x
P
G
 
G
G
 
T
P
 
A
E
x
S
T
|
T
E
 
L
G
 
K
L
 
A
V
 
V
S
 
N
A
 
A
G
 
D
I
 
V
I
 
L
E
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
|
V
S
x
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
N
 
N
G
 
G
R
 
T
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
A
 
N
E
|
E
P
 
P
Q
 
N
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
S
L
 
F
D
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
S
L
 
L
A
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
A
|
A
S
 
S
G
 
A
T
 
S
H
 
V
E
 
V
T
 
T
R
 
R
A
 
N
A
 
A
M
 
M
A
 
S
A
 
D
L
 
L
V
 
V
F
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
L
D
 
K
A
 
A
F
 
W
L
 
F
G
 
S
T
 
T
G
 
G
K
 
E
V
 
A
I
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
42% identity, 86% coverage: 35:302/313 of query aligns to 35:311/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
P
 
P
L
 
R
A
 
E
W
 
K
L
 
L
R
 
L
E
 
E
H
 
K
A
 
V
Q
 
K
Q
 
D
A
 
V
R
 
D
V
 
A
A
 
L
V
 
V
T
 
T
S
x
M
A
x
L
R
 
S
H
 
E
G
 
R
I
 
I
T
 
D
A
 
Q
E
 
E
A
 
V
I
 
F
A
 
E
A
 
N
M
 
A
P
 
P
R
 
R
L
 
L
A
 
R
A
 
I
I
 
V
V
 
A
S
 
N
F
x
Y
G
x
A
V
|
V
G
|
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
N
I
 
I
A
 
D
L
 
V
D
 
E
A
 
E
A
 
A
R
 
T
A
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Q
 
Y
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
N
 
T
D
 
N
C
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
L
 
H
A
 
A
F
 
F
G
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
A
A
 
T
A
 
A
R
 
R
G
 
H
I
 
V
A
 
V
H
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
K
F
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
K
 
E
W
 
W
G
 
K
R
 
R
D
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
S
 
K
F
 
W
P
 
F
L
 
L
T
 
G
T
 
Y
R
 
E
V
 
L
S
 
Y
G
 
G
K
 
K
K
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
 
G
L
x
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
Q
K
 
A
V
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
A
 
A
T
 
K
G
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
D
 
R
I
 
I
A
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
N
x
S
R
|
R
R
 
T
A
 
R
R
 
K
D
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
E
-
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
E
W
 
Y
R
 
R
H
 
-
E
 
-
P
 
-
D
 
P
L
 
L
K
 
E
A
 
E
L
 
V
A
 
L
G
 
K
W
 
E
A
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
V
A
 
I
V
 
L
T
x
A
C
x
V
V
x
P
G
 
L
G
 
T
P
 
K
E
 
E
T
|
T
E
 
M
G
 
Y
L
 
M
V
 
I
S
 
N
A
 
E
G
 
E
I
 
R
I
 
L
E
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
P
K
 
T
G
 
A
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
V
x
I
S
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
D
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
K
N
 
E
G
 
G
R
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
A
 
E
E
|
E
P
 
P
Q
 
Y
V
 
Y
P
 
N
E
 
E
A
 
E
L
 
L
F
 
F
A
 
S
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
A
x
G
S
 
S
G
 
A
T
 
T
H
 
F
E
 
E
T
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
M
 
M
A
 
A
A
 
E
L
 
L
V
 
V
F
 
A
D
 
R
N
 
N
L
 
L
D
 
I
A
 
A
F
 
F

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
43% identity, 86% coverage: 35:302/313 of query aligns to 34:310/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
P
 
P
L
 
R
A
 
E
W
 
V
L
 
L
R
 
L
E
 
E
H
 
K
A
 
V
Q
 
K
Q
 
D
A
 
V
R
 
D
V
 
A
A
 
L
V
 
V
T
 
T
S
 
M
A
 
L
R
 
S
H
 
E
G
 
K
I
 
I
T
 
D
A
 
R
E
 
E
A
 
V
I
 
F
A
 
D
A
 
A
M
 
A
P
 
P
R
 
R
L
 
L
A
 
R
A
 
I
I
 
V
V
 
A
S
 
N
F
 
Y
G
 
A
V
|
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
N
I
 
I
A
 
D
L
 
I
D
 
E
A
 
E
A
 
A
R
 
T
A
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Q
 
Y
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
N
 
T
D
 
D
C
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
F
 
W
G
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
G
 
H
I
 
V
A
 
V
H
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
K
F
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
K
 
E
W
 
W
G
 
K
R
 
R
D
 
R
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
S
 
K
F
 
M
P
 
F
L
 
L
T
 
G
T
 
Y
R
 
D
V
 
V
S
 
Y
G
 
G
K
 
K
K
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
|
G
L
x
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
Q
K
 
A
V
 
I
A
 
A
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
T
 
K
G
 
G
F
 
F
G
 
G
M
 
M
D
 
R
I
 
I
A
 
L
Y
 
Y
H
 
T
N
x
A
R
|
R
R
x
S
A
 
R
R
x
K
D
 
P
G
 
E
A
 
A
P
 
E
W
 
K
R
 
E
H
 
L
E
 
G
P
 
A
D
 
E
L
 
F
K
 
K
A
 
P
L
 
L
A
 
E
G
 
E
W
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
E
A
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
V
A
 
V
V
 
L
T
 
A
C
x
V
V
x
P
G
 
L
G
 
T
P
 
K
E
|
E
T
|
T
E
 
Y
G
 
H
L
 
M
V
 
I
S
 
N
A
 
E
G
 
E
I
 
R
I
 
L
E
 
R
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
P
K
 
T
G
 
A
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
V
|
V
S
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
D
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
K
N
 
E
G
 
G
R
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
A
 
E
E
|
E
P
 
P
Q
 
Y
V
 
Y
P
 
D
E
 
E
A
 
E
L
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
A
x
G
S
 
S
G
 
A
T
 
T
H
 
F
E
 
G
T
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
G
M
 
M
A
 
A
A
 
E
L
 
L
V
 
V
F
 
A
D
 
K
N
 
N
L
 
L
D
 
I
A
 
A
F
 
F

O58320 Glyoxylate reductase; EC 1.1.1.26 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3)
40% identity, 92% coverage: 14:302/313 of query aligns to 12:311/334 of O58320

query
sites
O58320
P
 
P
Q
 
E
I
 
V
N
 
G
S
 
I
R
 
K
L
 
M
R
 
L
E
 
E
Q
 
D
Y
 
E
Q
 
F
A
 
E
V
 
V
P
 
E
L
 
V
W
 
W
-
 
G
-
 
D
E
 
E
Q
 
K
P
 
E
E
 
I
P
 
P
L
 
R
A
 
E
W
 
I
L
 
L
R
 
L
E
 
K
H
 
K
A
 
V
Q
 
K
Q
 
E
A
 
V
R
 
D
V
 
A
A
 
L
V
 
V
T
 
T
S
 
M
A
 
L
R
 
S
H
 
E
G
 
R
I
 
I
T
 
D
A
 
K
E
 
E
A
 
V
I
 
F
A
 
E
A
 
N
M
 
A
P
 
P
R
 
K
L
 
L
A
 
R
A
 
I
I
 
V
V
 
A
S
 
N
F
 
Y
G
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
N
I
 
I
A
 
D
L
 
I
D
 
E
A
 
E
A
 
A
R
 
T
A
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Q
 
Y
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
L
N
 
T
D
 
D
C
 
A
V
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
F
 
F
G
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
A
A
 
T
A
 
A
R
 
R
G
 
H
I
 
V
A
 
V
H
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
R
F
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
K
 
E
W
 
W
G
 
K
R
 
K
D
 
R
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
S
 
K
F
 
W
P
 
F
L
 
L
T
 
G
T
 
Y
R
 
D
V
 
V
S
 
Y
G
 
G
K
 
K
K
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
Q
K
 
A
V
 
I
A
 
A
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
T
 
K
G
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
D
 
R
I
 
I
A
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
N
x
S
R
|
R
R
x
T
A
 
R
R
 
K
D
 
E
G
 
E
A
 
V
P
 
E
W
 
R
R
 
E
H
 
L
E
 
N
P
 
A
D
 
E
L
 
F
K
 
K
A
 
P
L
 
L
A
 
E
G
 
D
W
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
E
A
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
V
A
 
V
V
 
L
T
 
A
C
 
V
V
 
P
G
 
L
G
 
T
P
 
R
E
 
E
T
 
T
E
 
Y
G
 
H
L
 
L
V
 
I
S
 
N
A
 
E
G
 
E
I
 
R
I
 
L
E
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
K
K
 
T
G
 
A
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
S
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
D
 
N
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
K
N
 
E
G
 
G
R
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
A
 
E
E
 
E
P
 
P
Q
 
Y
V
 
Y
P
 
N
E
 
E
A
 
E
L
 
L
F
 
F
A
 
K
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
T
P
 
P
H
|
H
V
x
I
A
x
G
S
 
S
G
 
A
T
 
S
H
 
F
E
 
G
T
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
G
M
 
M
A
 
A
A
 
E
L
 
L
V
 
V
F
 
A
D
 
K
N
 
N
L
 
L
D
 
I
A
 
A
F
 
F

2dbqA Crystal structure of glyoxylate reductase (ph0597) from pyrococcus horikoshii ot3, complexed with NADP (i41) (see paper)
40% identity, 92% coverage: 14:302/313 of query aligns to 12:311/333 of 2dbqA

query
sites
2dbqA
P
 
P
Q
 
E
I
 
V
N
 
G
S
 
I
R
 
K
L
 
M
R
 
L
E
 
E
Q
 
D
Y
 
E
Q
 
F
A
 
E
V
 
V
P
 
E
L
 
V
W
 
W
-
 
G
-
 
D
E
 
E
Q
 
K
P
 
E
E
 
I
P
 
P
L
 
R
A
 
E
W
 
I
L
 
L
R
 
L
E
 
K
H
 
K
A
 
V
Q
 
K
Q
 
E
A
 
V
R
 
D
V
 
A
A
 
L
V
 
V
T
 
T
S
 
M
A
 
L
R
 
S
H
 
E
G
 
R
I
 
I
T
 
D
A
 
K
E
 
E
A
 
V
I
 
F
A
 
E
A
 
N
M
 
A
P
 
P
R
 
K
L
 
L
A
 
R
A
 
I
I
 
V
V
 
A
S
 
N
F
 
Y
G
 
A
V
|
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
N
I
 
I
A
 
D
L
 
I
D
 
E
A
 
E
A
 
A
R
 
T
A
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Q
 
Y
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
N
 
T
D
 
D
C
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
F
 
F
G
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
A
A
 
T
A
 
A
R
 
R
G
 
H
I
 
V
A
 
V
H
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
R
F
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
K
 
E
W
 
W
G
 
K
R
 
K
D
 
R
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
S
 
K
F
 
W
P
 
F
L
 
L
T
 
G
T
 
Y
R
 
D
V
 
V
S
 
Y
G
 
G
K
 
K
K
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
Q
K
 
A
V
 
I
A
 
A
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
T
 
K
G
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
D
 
R
I
 
I
A
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
N
x
S
R
|
R
R
x
T
A
 
R
R
 
K
D
 
E
G
 
E
A
 
V
P
 
E
W
 
R
R
 
E
H
 
L
E
 
N
P
 
A
D
 
E
L
 
F
K
 
K
A
 
P
L
 
L
A
 
E
G
 
D
W
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
E
A
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
V
A
 
V
V
 
L
T
x
A
C
x
V
V
x
P
G
 
L
G
 
T
P
 
R
E
 
E
T
|
T
E
 
Y
G
 
H
L
 
L
V
 
I
S
 
N
A
 
E
G
 
E
I
 
R
I
 
L
E
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
K
K
 
T
G
 
A
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
S
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
D
 
N
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
K
N
 
E
G
 
G
R
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
A
 
E
E
|
E
P
 
P
Q
 
Y
V
 
Y
P
 
N
E
 
E
A
 
E
L
 
L
F
 
F
A
 
K
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
A
x
G
S
 
S
G
 
A
T
 
S
H
 
F
E
 
G
T
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
G
M
 
M
A
 
A
A
 
E
L
 
L
V
 
V
F
 
A
D
 
K
N
 
N
L
 
L
D
 
I
A
 
A
F
 
F

Q9UBQ7 Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase; EC 1.1.1.79; EC 1.1.1.81 from Homo sapiens (Human) (see paper)
38% identity, 77% coverage: 63:303/313 of query aligns to 70:317/328 of Q9UBQ7

query
sites
Q9UBQ7
A
 
A
A
 
A
M
 
G
P
 
A
R
 
N
L
 
L
A
 
K
A
 
V
I
 
I
V
 
S
S
 
T
F
 
M
G
 
S
V
|
V
G
|
G
Y
 
I
D
 
D
S
 
H
I
 
L
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
E
A
 
I
R
 
K
A
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Q
 
R
V
 
V
S
 
G
N
 
Y
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
L
N
 
T
D
 
D
C
 
T
V
 
T
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
V
G
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
T
A
 
T
A
 
C
R
 
R
G
 
R
I
 
L
A
 
P
H
 
E
G
 
A
D
 
I
R
 
E
F
 
E
V
 
V
R
 
K
A
 
N
G
 
G
K
 
G
W
 
W
G
 
T
-
 
S
-
 
W
R
 
K
D
 
P
S
 
L
F
 
W
P
 
L
L
 
C
T
 
G
T
 
Y
R
 
G
V
 
L
S
 
T
G
 
Q
K
 
S
K
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
L
 
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
Q
K
 
A
V
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
A
 
L
T
 
K
G
 
P
F
 
F
G
 
G
M
 
V
D
 
Q
-
 
R
I
 
F
A
 
L
Y
 
Y
H
 
T
N
 
G
R
|
R
R
x
Q
A
x
P
R
|
R
-
 
P
-
 
E
D
 
E
G
 
A
A
 
A
P
 
E
W
 
F
R
 
Q
H
 
A
E
 
E
-
 
F
P
 
V
D
 
S
L
 
T
K
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
A
W
 
Q
A
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
I
A
 
V
V
 
V
T
 
A
C
 
C
V
x
S
G
 
L
G
 
T
P
 
P
E
 
A
T
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
C
S
 
N
A
 
K
G
 
D
I
 
F
I
 
F
E
 
Q
A
 
K
L
 
M
G
 
K
P
 
E
K
 
T
G
 
A
I
 
V
L
 
F
V
 
I
N
 
N
V
x
I
S
 
S
R
|
R
G
 
G
S
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
D
 
D
A
 
D
L
 
L
V
 
Y
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
A
N
 
S
G
 
G
R
 
K
L
 
I
G
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
T
R
 
S
A
 
P
E
 
E
P
 
P
-
 
L
Q
 
P
V
 
T
P
 
N
E
 
H
A
 
P
L
 
L
F
 
L
A
 
T
L
 
L
D
 
K
N
 
N
V
 
C
V
 
V
L
 
I
A
 
L
P
 
P
H
|
H
V
x
I
A
x
G
S
|
S
G
 
A
T
 
T
H
 
H
E
 
R
T
 
T
R
 
R
A
 
N
A
 
T
M
 
M
A
 
S
A
 
L
L
 
L
V
 
A
F
 
A
D
 
N
N
 
N
L
 
L
D
 
L
A
 
A
F
 
G
L
 
L

2gcgA Ternary crystal structure of human glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase (see paper)
38% identity, 77% coverage: 63:303/313 of query aligns to 66:313/324 of 2gcgA

query
sites
2gcgA
A
 
A
A
 
A
M
 
G
P
 
A
R
 
N
L
 
L
A
 
K
A
 
V
I
 
I
V
 
S
S
 
T
F
 
M
G
x
S
V
|
V
G
|
G
Y
 
I
D
 
D
S
 
H
I
 
L
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
E
A
 
I
R
 
K
A
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Q
 
R
V
 
V
S
 
G
N
 
Y
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
N
 
T
D
 
D
C
 
T
V
x
T
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
V
G
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
T
A
 
T
A
 
C
R
 
R
G
 
R
I
 
L
A
 
P
H
 
E
G
 
A
D
 
I
R
 
E
F
 
E
V
 
V
R
 
K
A
 
N
G
 
G
K
 
G
W
 
W
G
 
T
-
 
S
-
 
W
R
 
K
D
 
P
S
 
L
F
 
W
P
 
L
L
 
C
T
 
G
T
 
Y
R
 
G
V
 
L
S
 
T
G
 
Q
K
 
S
K
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
|
G
L
 
L
G
|
G
R
 
R
I
|
I
G
 
G
E
 
Q
K
 
A
V
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
A
 
L
T
 
K
G
 
P
F
 
F
G
 
G
M
 
V
D
 
Q
-
 
R
I
 
F
A
 
L
Y
 
Y
H
 
T
N
x
G
R
|
R
R
 
Q
A
 
P
R
|
R
-
 
P
-
 
E
D
 
E
G
 
A
A
 
A
P
 
E
W
 
F
R
 
Q
H
 
A
E
 
E
-
 
F
P
 
V
D
 
S
L
 
T
K
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
A
W
 
Q
A
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
I
A
 
V
V
 
V
T
 
A
C
|
C
V
x
S
G
 
L
G
 
T
P
 
P
E
 
A
T
|
T
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
C
S
 
N
A
 
K
G
 
D
I
 
F
I
 
F
E
 
Q
A
 
K
L
 
M
G
 
K
P
 
E
K
 
T
G
 
A
I
 
V
L
 
F
V
 
I
N
 
N
V
x
I
S
 
S
R
|
R
G
 
G
S
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
D
 
D
A
 
D
L
 
L
V
 
Y
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
A
N
 
S
G
 
G
R
 
K
L
 
I
G
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
T
R
 
S
A
 
P
E
|
E
P
 
P
-
 
L
Q
 
P
V
 
T
P
 
N
E
 
H
A
 
P
L
 
L
F
 
L
A
 
T
L
 
L
D
 
K
N
 
N
V
 
C
V
 
V
L
 
I
A
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
I
A
x
G
S
 
S
G
 
A
T
 
T
H
 
H
E
 
R
T
 
T
R
 
R
A
 
N
A
 
T
M
 
M
A
 
S
A
 
L
L
 
L
V
 
A
F
 
A
D
 
N
N
 
N
L
 
L
D
 
L
A
 
A
F
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
38% identity, 74% coverage: 57:289/313 of query aligns to 59:293/533 of O43175

query
sites
O43175
I
 
V
T
 
T
A
 
A
E
 
D
A
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
M
 
A
P
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
Q
A
 
V
I
 
V
V
 
G
S
 
R
F
 
A
G
 
G
V
x
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
S
 
N
I
 
V
A
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
S
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
N
V
 
G
L
 
N
N
 
S
D
 
L
C
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
T
F
 
C
G
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
D
 
C
A
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
Q
I
 
I
A
 
P
H
 
Q
G
 
A
D
 
T
R
 
A
F
 
S
V
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
G
 
E
R
|
R
D
 
K
S
 
K
F
 
F
P
 
-
L
 
M
T
 
G
T
 
T
R
 
E
V
 
L
S
 
N
G
 
G
K
 
K
K
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
R
K
 
E
V
 
V
A
 
A
Q
 
T
R
 
R
A
 
M
T
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
D
 
K
-
 
T
I
 
I
A
 
G
Y
 
Y
H
x
D
N
 
P
R
 
I
R
 
I
A
 
S
R
 
P
D
 
E
G
 
V
A
 
S
P
 
A
W
 
S
R
 
F
H
 
G
E
 
V
P
 
Q
D
 
Q
L
 
L
K
 
P
A
 
L
L
 
E
A
 
E
G
 
I
W
 
W
-
 
P
-
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
A
 
T
V
 
V
T
 
H
C
x
T
V
 
P
G
 
L
G
 
L
P
 
P
E
 
S
T
 
T
E
 
T
G
 
G
L
 
L
V
 
L
S
 
N
A
 
D
G
 
N
I
 
T
I
 
F
E
 
-
A
 
A
L
 
Q
G
 
C
P
 
K
K
 
K
G
 
G
I
 
V
-
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
V
x
C
S
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
N
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
|
D
V
|
V
F
 
F
R
 
T
A
 
E
E
 
E
P
 
P
Q
 
P
V
 
R
P
 
D
E
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
V
A
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
A
 
C
P
 
P
H
|
H
V
x
L
A
x
G
S
x
A
G
 
S
T
 
T
H
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
A
 
S

Sites not aligning to the query:

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
38% identity, 74% coverage: 57:289/313 of query aligns to 54:288/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
I
 
V
T
 
T
A
 
A
E
 
D
A
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
M
 
A
P
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
Q
A
 
V
I
 
V
V
 
G
S
 
R
F
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
S
 
N
I
 
V
A
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
S
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
N
V
 
G
L
 
N
N
 
S
D
 
L
C
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
T
F
 
C
G
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
D
 
C
A
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
Q
I
 
I
A
 
P
H
 
Q
G
 
A
D
 
T
R
 
A
F
 
S
V
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
G
 
E
R
 
R
D
 
K
S
 
K
F
 
F
P
 
-
L
 
M
T
 
G
T
 
T
R
 
E
V
 
L
S
 
N
G
 
G
K
 
K
K
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
|
L
G
|
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
|
G
E
 
R
K
 
E
V
 
V
A
 
A
Q
 
T
R
 
R
A
 
M
T
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
D
 
K
-
 
T
I
 
I
A
 
G
Y
 
Y
H
x
D
N
 
P
R
 
I
R
 
I
A
 
S
R
 
P
D
 
E
G
 
V
A
 
S
P
 
A
W
 
S
R
 
F
H
 
G
E
 
V
P
 
Q
D
 
Q
L
 
L
K
 
P
A
 
L
L
 
E
A
 
E
G
 
I
W
 
W
-
 
P
-
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
A
 
T
V
 
V
T
x
H
C
x
T
V
x
P
G
 
L
G
 
L
P
 
P
E
 
S
T
 
T
E
 
T
G
 
G
L
 
L
V
 
L
S
 
N
A
 
D
G
 
N
I
 
T
I
 
F
E
 
-
A
 
A
L
 
Q
G
 
C
P
 
K
K
 
K
G
 
G
I
 
V
-
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
N
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
R
 
T
A
 
E
E
 
E
P
 
P
Q
 
P
V
 
R
P
 
D
E
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
V
A
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
A
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
A
 
G
S
 
A
G
 
S
T
 
T
H
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
A
 
S

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
38% identity, 74% coverage: 57:289/313 of query aligns to 54:288/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
I
 
V
T
 
T
A
 
A
E
 
D
A
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
M
 
A
P
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
Q
A
 
V
I
 
V
V
 
G
S
 
R
F
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
S
 
N
I
 
V
A
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
S
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
N
V
 
G
L
 
N
N
 
S
D
 
L
C
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
T
F
 
C
G
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
D
 
C
A
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
Q
I
 
I
A
 
P
H
 
Q
G
 
A
D
 
T
R
 
A
F
 
S
V
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
G
 
E
R
 
R
D
 
K
S
 
K
F
 
F
P
 
-
L
 
M
T
 
G
T
 
T
R
 
E
V
 
L
S
 
N
G
 
G
K
 
K
K
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
E
 
R
K
 
E
V
 
V
A
 
A
Q
 
T
R
 
R
A
 
M
T
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
D
 
K
-
 
T
I
 
I
A
 
G
Y
|
Y
H
x
D
N
x
P
R
x
I
R
x
I
A
 
S
R
 
P
D
 
E
G
 
V
A
 
S
P
 
A
W
 
S
R
 
F
H
 
G
E
 
V
P
 
Q
D
 
Q
L
 
L
K
 
P
A
 
L
L
 
E
A
 
E
G
 
I
W
 
W
-
 
P
-
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
A
 
T
V
 
V
T
 
H
C
x
T
V
x
P
G
 
L
G
 
L
P
 
P
E
 
S
T