SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS05495 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS05495 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4y96A Crystal structure of triosephosphate isomerase from gemmata obscuriglobus (see paper)
51% identity, 98% coverage: 2:242/245 of query aligns to 2:245/250 of 4y96A

query
sites
4y96A
R
 
R
Q
 
K
K
 
K
L
 
F
V
 
V
I
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
T
S
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
E
N
 
A
V
 
K
T
 
A
L
 
L
L
 
G
E
 
A
A
 
A
I
 
V
K
 
A
A
 
K
A
 
G
P
 
V
A
 
T
S
 
D
A
 
D
R
 
R
L
 
V
-
 
T
-
 
V
A
 
A
V
 
V
C
 
F
A
 
P
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
Y
 
W
L
 
L
A
 
T
Q
 
A
C
 
V
Q
 
G
A
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
K
G
 
G
S
 
S
A
 
P
V
 
V
A
 
A
W
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
V
 
V
S
 
S
A
 
S
E
 
E
A
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
P
S
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
L
E
 
E
F
 
T
G
 
G
A
 
C
S
 
K
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
S
 
H
Y
 
I
H
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
S
D
 
E
A
 
T
T
 
F
V
 
I
A
 
N
A
 
H
K
 
K
A
 
V
V
 
H
R
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
F
 
E
G
 
G
I
 
L
V
 
S
P
 
V
V
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
M
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
R
G
 
G
E
 
L
T
 
Q
E
 
E
A
 
R
V
 
V
V
 
F
G
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
L
 
V
G
 
Y
A
 
A
V
 
A
L
 
C
E
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
T
L
 
D
D
 
E
Q
 
Q
L
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
S
 
T
S
 
P
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
V
 
A
H
 
H
A
 
A
F
 
F
L
 
V
R
 
R
A
 
S
Q
 
K
V
 
L
A
 
R
-
 
L
A
 
L
R
 
Y
D
 
G
A
 
D
G
 
K
V
 
I
A
 
A
A
 
D
R
 
S
M
 
T
A
 
P
M
 
I
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
P
D
 
D
N
 
N
A
 
T
A
 
V
E
 
G
L
 
L
F
 
M
S
 
S
M
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
A
D
 
D
D
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
I

4mvaA 1.43 angstrom resolution crystal structure of triosephosphate isomerase (tpia) from escherichia coli in complex with acetyl phosphate. (see paper)
48% identity, 99% coverage: 1:242/245 of query aligns to 1:245/255 of 4mvaA

query
sites
4mvaA
M
 
M
R
 
R
Q
 
H
K
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
S
 
S
L
 
R
A
 
H
A
 
M
N
 
V
V
 
H
T
 
E
L
 
L
L
 
V
E
 
S
A
 
N
I
 
L
K
 
R
-
 
K
-
 
E
-
 
L
A
 
A
A
 
G
P
 
V
A
 
A
S
 
G
A
 
C
R
 
A
L
 
V
A
 
A
V
 
I
C
 
A
A
 
P
P
 
P
F
 
E
P
 
M
Y
 
Y
L
 
I
A
 
D
Q
 
M
C
 
A
Q
 
K
A
 
R
L
 
E
L
 
A
A
 
E
G
 
G
S
 
S
A
 
H
V
 
I
A
 
M
W
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
V
S
 
D
A
 
L
E
 
N
A
 
L
R
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
A
 
S
A
 
A
S
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
K
E
 
D
F
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
I
L
 
I
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
S
 
T
Y
 
Y
H
 
H
G
 
K
E
 
E
T
 
S
D
 
D
A
 
E
T
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
K
K
 
K
A
 
F
V
 
A
R
 
V
A
 
L
L
 
K
E
 
E
F
 
Q
G
 
G
I
 
L
V
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
E
A
 
A
Q
 
E
R
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
K
T
 
T
E
 
E
A
 
E
V
 
V
V
 
C
G
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
G
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
L
E
 
K
A
 
T
L
 
Q
S
 
G
L
 
A
D
 
A
Q
 
A
L
 
F
G
 
E
R
 
G
I
 
A
V
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
A
S
 
T
S
 
P
E
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
H
 
H
A
 
K
F
 
F
L
 
I
R
 
R
A
 
D
Q
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
K
R
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
N
V
 
I
A
 
A
A
 
E
R
 
Q
M
 
V
A
 
I
M
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
D
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
S
 
A
M
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
A
D
 
D
D
 
A
F
 
F
L
 
A
A
 
V
I
 
I

B1XB85 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Escherichia coli (strain K12 / DH10B) (see paper)
48% identity, 99% coverage: 1:242/245 of query aligns to 1:245/255 of B1XB85

query
sites
B1XB85
M
 
M
R
 
R
Q
 
H
K
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
S
 
S
L
 
R
A
 
H
A
 
M
N
 
V
V
 
H
T
 
E
L
 
L
L
 
V
E
 
S
A
 
N
I
 
L
K
 
R
-
 
K
-
 
E
-
 
L
A
 
A
A
 
G
P
 
V
A
 
A
S
 
G
A
 
C
R
 
A
L
 
V
A
 
A
V
 
I
C
 
A
A
 
P
P
 
P
F
 
E
P
 
M
Y
 
Y
L
 
I
A
 
D
Q
 
M
C
 
A
Q
 
K
A
 
R
L
 
E
L
 
A
A
 
E
G
 
G
S
 
S
A
 
H
V
 
I
A
 
M
W
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
V
S
 
D
A
 
L
E
 
N
A
 
L
R
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
A
 
S
A
 
A
S
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
K
E
 
D
F
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
I
L
 
I
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
S
 
T
Y
 
Y
H
 
H
G
 
K
E
 
E
T
 
S
D
 
D
A
 
E
T
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
K
K
 
K
A
 
F
V
 
A
R
 
V
A
 
L
L
 
K
E
 
E
F
 
Q
G
 
G
I
 
L
V
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
E
A
 
A
Q
 
E
R
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
K
T
 
T
E
 
E
A
 
E
V
 
V
V
 
C
G
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
G
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
L
E
 
K
A
 
T
L
 
Q
S
 
G
L
 
A
D
 
A
Q
 
A
L
 
F
G
 
E
R
 
G
I
 
A
V
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
A
S
 
T
S
 
P
E
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
H
 
H
A
 
K
F
 
F
L
 
I
R
 
R
A
 
D
Q
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
K
R
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
N
V
 
I
A
 
A
A
 
E
R
 
Q
M
 
V
A
 
I
M
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
D
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
S
 
A
M
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
A
D
 
D
D
 
A
F
 
F
L
 
A
A
 
V
I
 
I

P50921 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Moritella marina (Vibrio marinus) (see paper)
49% identity, 96% coverage: 1:234/245 of query aligns to 1:239/256 of P50921

query
sites
P50921
M
 
M
R
 
R
Q
 
H
K
 
P
L
 
V
V
 
V
I
 
M
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
S
 
S
L
 
K
A
 
E
A
 
M
N
 
V
V
 
V
T
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
N
A
 
G
I
 
L
K
 
N
A
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
E
A
 
G
P
 
V
A
 
T
S
 
G
A
 
V
R
 
D
L
 
V
A
 
A
V
 
V
C
 
A
A
 
P
P
 
P
-
 
A
-
 
L
F
 
F
P
 
V
Y
 
D
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
C
 
R
Q
 
T
A
 
L
L
 
T
L
 
E
A
 
A
G
 
G
S
 
S
A
 
A
V
 
I
A
 
I
W
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
T
S
 
D
A
 
L
E
 
N
A
 
N
R
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
M
A
 
S
A
 
P
S
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
K
E
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
A
S
 
T
Y
 
H
A
 
I
L
 
I
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
S
 
E
Y
 
Y
H
 
H
G
 
A
E
 
E
T
 
S
D
 
D
A
 
E
T
 
F
V
 
V
A
 
A
A
 
K
K
 
K
A
 
F
V
 
A
R
 
F
A
 
L
L
 
K
E
 
E
F
 
N
G
 
G
I
 
L
V
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
D
A
 
A
Q
 
Q
R
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
M
A
 
A
V
 
V
V
 
C
G
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
G
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
I
E
 
N
A
 
T
L
 
Q
S
 
G
L
 
V
D
 
E
Q
 
A
L
 
L
G
 
E
R
 
G
I
 
A
V
 
I
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
A
A
 
A
S
 
T
S
 
A
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
A
 
R
V
 
I
H
 
H
A
 
A
F
 
Q
L
 
I
R
 
R
A
 
A
Q
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
E
R
 
K
D
 
S
A
 
E
G
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
K
R
 
N
M
 
V
A
 
V
M
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
E
N
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
A
L
 
Y
F
 
F
S
 
A
M
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
x
A
L
 
L

1aw1A Triosephosphate isomerase of vibrio marinus complexed with 2- phosphoglycolate (see paper)
48% identity, 95% coverage: 2:234/245 of query aligns to 1:238/255 of 1aw1A

query
sites
1aw1A
R
 
R
Q
 
H
K
 
P
L
 
V
V
 
V
I
 
M
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
S
 
S
L
 
K
A
 
E
A
 
M
N
 
V
V
 
V
T
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
N
A
 
G
I
 
L
K
 
N
A
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
E
A
 
G
P
 
V
A
 
T
S
 
G
A
 
V
R
 
D
L
 
V
A
 
A
V
 
V
C
 
A
A
 
P
P
 
P
-
 
A
-
 
L
F
 
F
P
 
V
Y
 
D
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
C
 
R
Q
 
T
A
 
L
L
 
T
L
 
E
A
 
A
G
 
G
S
 
S
A
 
A
V
 
I
A
 
I
W
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
T
S
 
D
A
 
L
E
 
N
A
 
N
R
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
M
A
 
S
A
 
P
S
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
K
E
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
A
S
 
T
Y
 
H
A
 
I
L
 
I
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
S
 
E
Y
 
Y
H
 
H
G
 
A
E
 
E
T
 
S
D
 
D
A
 
E
T
 
F
V
 
V
A
 
A
A
 
K
K
 
K
A
 
F
V
 
A
R
 
F
A
 
L
L
 
K
E
 
E
F
 
N
G
 
G
I
 
L
V
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
D
A
 
A
Q
 
Q
R
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
M
A
 
A
V
 
V
V
 
C
G
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
G
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
I
E
 
N
A
 
T
L
 
Q
S
 
G
L
 
V
D
 
E
Q
 
A
L
 
L
G
 
E
R
 
G
I
 
A
V
 
I
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
A
A
 
A
S
 
T
S
 
A
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
A
 
R
V
 
I
H
 
H
A
 
A
F
 
Q
L
 
I
R
 
R
A
 
A
Q
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
E
R
 
K
D
 
S
A
 
E
G
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
K
R
 
N
M
 
V
A
 
V
M
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
E
N
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
A
L
 
Y
F
 
F
S
 
A
M
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
A
L
 
L

P36204 Bifunctional PGK/TIM; EC 2.7.2.3; EC 5.3.1.1 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
44% identity, 96% coverage: 2:236/245 of query aligns to 402:640/654 of P36204

query
sites
P36204
R
 
R
Q
 
K
K
 
L
L
 
I
V
 
L
I
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
K
S
 
T
L
 
I
A
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
K
A
 
K
N
 
F
V
 
V
T
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
V
A
 
N
I
 
E
K
 
L
A
 
H
A
 
D
P
 
V
A
 
K
S
 
E
A
 
F
R
 
E
L
 
I
A
 
V
V
 
V
C
 
C
A
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
T
Y
 
A
L
 
L
A
 
S
Q
 
E
C
 
V
Q
 
G
A
 
E
L
 
I
L
 
L
A
 
S
G
 
G
S
 
R
A
 
N
V
 
I
A
 
K
W
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
V
S
 
F
A
 
Y
E
 
E
A
 
D
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
P
S
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
Q
E
 
E
F
 
I
G
 
G
A
 
V
S
 
E
Y
 
Y
A
 
V
L
 
I
V
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
S
 
R
Y
 
I
H
 
F
G
 
K
E
 
E
T
 
D
D
 
D
A
 
E
T
 
F
V
 
I
A
 
N
A
 
R
K
 
K
A
 
V
V
 
K
R
 
A
A
 
V
L
 
L
E
 
E
F
 
K
G
 
G
I
 
M
V
 
T
P
 
P
V
 
I
V
 
L
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
E
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
K
G
 
G
E
 
L
T
 
T
E
 
F
A
 
C
V
 
V
V
 
V
G
 
E
R
 
K
Q
 
Q
L
 
V
G
 
R
A
 
E
V
 
G
L
 
F
E
 
Y
A
 
G
L
 
L
S
 
D
L
 
K
D
 
E
Q
 
E
L
 
A
G
 
K
R
 
R
I
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
R
T
 
V
A
 
A
S
 
T
S
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
A
F
 
F
L
 
I
R
 
R
A
 
K
Q
 
L
V
 
L
A
 
S
A
 
E
R
 
M
-
 
Y
D
 
D
A
 
E
G
 
E
V
 
T
A
 
A
A
 
G
R
 
S
M
 
I
A
 
R
M
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
I
K
 
K
P
 
P
D
 
D
N
 
N
A
 
F
A
 
L
E
 
G
L
 
L
F
 
I
S
 
V
M
 
Q
P
 
K
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
E

Sites not aligning to the query:

P27876 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
43% identity, 99% coverage: 1:242/245 of query aligns to 1:246/253 of P27876

query
sites
P27876
M
 
M
R
 
R
Q
 
K
K
 
P
L
 
I
V
 
I
I
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
H
 
N
G
 
K
S
 
T
L
 
L
A
 
G
A
 
E
N
 
A
V
 
V
T
 
S
L
 
F
L
 
V
E
 
E
A
 
E
I
 
V
K
 
K
A
 
S
A
 
S
-
 
I
P
 
P
A
 
A
S
 
A
-
 
D
-
 
K
A
 
A
R
 
E
L
 
A
A
 
V
V
 
V
C
 
C
A
 
A
P
 
P
F
 
A
P
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
E
Q
 
K
C
 
L
Q
 
A
A
 
S
L
 
A
L
 
V
A
 
K
G
 
G
S
 
T
A
 
D
V
 
L
A
 
K
W
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
M
S
 
H
A
 
F
E
 
E
A
 
E
R
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
P
S
 
V
M
 
A
L
 
L
A
 
K
E
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
D
Y
 
Y
A
 
C
L
 
V
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
S
 
E
Y
 
M
H
 
F
G
 
A
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
 
T
V
 
V
A
 
N
A
 
K
K
 
K
A
 
A
V
 
H
R
 
A
A
 
A
L
 
F
E
 
K
F
 
H
G
 
G
I
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
E
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
K
T
 
T
E
 
N
A
 
D
V
 
L
V
 
V
G
 
A
R
 
D
Q
 
Q
L
 
V
G
 
K
A
 
K
V
 
G
L
 
L
E
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
E
D
 
E
Q
 
Q
L
 
V
G
 
A
R
 
A
I
 
S
V
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
S
 
T
S
 
A
E
 
K
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
D
V
 
V
H
 
C
A
 
A
F
 
H
L
 
I
R
 
R
A
 
K
Q
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
E
R
 
S
D
 
F
A
 
S
G
 
Q
V
 
E
A
 
A
A
 
A
-
 
D
R
 
K
M
 
L
A
 
R
M
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
A
N
 
N
A
 
I
A
 
K
E
 
E
L
 
Y
F
 
M
S
 
A
M
 
E
P
 
S
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
S
 
P
D
 
Q
D
 
S
F
 
F
L
 
V
A
 
Q
I
 
L

P00943 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see 2 papers)
43% identity, 99% coverage: 1:242/245 of query aligns to 1:246/253 of P00943

query
sites
P00943
M
 
M
R
 
R
Q
 
K
K
 
P
L
 
I
V
 
I
I
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
H
|
H
G
x
K
S
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
E
N
 
A
V
 
V
T
 
Q
L
 
F
L
 
V
E
 
E
A
 
D
I
 
V
K
 
K
-
 
G
-
 
H
A
 
V
A
 
P
P
 
P
A
 
A
S
 
D
A
 
E
R
 
V
L
 
I
A
 
S
V
 
V
-
 
V
C
 
C
A
 
A
P
 
P
F
 
F
P
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
D
Q
 
R
C
 
L
Q
 
V
A
 
Q
L
 
A
L
 
A
A
 
D
G
 
G
S
 
T
A
 
D
V
 
L
A
 
K
W
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
T
V
 
M
S
 
H
A
 
F
E
 
A
A
 
D
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
P
S
 
V
M
 
M
L
 
L
A
 
K
E
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
T
Y
 
Y
A
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
S
 
Q
Y
 
M
H
 
F
G
 
A
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
 
T
V
 
V
A
 
N
A
 
K
K
 
K
A
 
V
V
 
L
R
 
A
A
 
A
L
 
F
E
 
T
F
 
R
G
 
G
I
 
L
V
 
I
P
 
P
V
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
C
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
E
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
E
 
N
A
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
A
R
 
S
Q
 
Q
L
 
V
G
 
E
A
 
K
V
 
A
L
 
L
E
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
T
L
 
P
D
 
E
Q
 
Q
L
 
V
G
 
K
R
 
Q
I
 
A
V
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
S
 
T
S
 
P
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
S
V
 
V
H
 
C
A
 
G
F
 
H
L
 
I
R
 
R
A
 
S
Q
 
V
V
 
V
A
 
S
A
 
R
R
 
L
D
 
F
A
 
G
G
 
P
V
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
E
-
 
A
M
 
I
A
 
R
M
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
D
N
 
N
A
 
I
A
 
R
E
 
D
L
 
F
F
 
L
S
 
A
M
 
Q
P
 
Q
D
 
Q
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
P
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
S
 
P
D
 
A
D
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
Q
I
 
L

1btmA Triosephosphate isomerase (tim) complexed with 2-phosphoglycolic acid (see paper)
43% identity, 98% coverage: 2:242/245 of query aligns to 1:245/251 of 1btmA

query
sites
1btmA
R
 
R
Q
 
K
K
 
P
L
 
I
V
 
I
I
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
H
G
 
K
S
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
E
N
 
A
V
 
V
T
 
Q
L
 
F
L
 
V
E
 
E
A
 
D
I
 
V
K
 
K
-
 
G
-
 
H
A
 
V
A
 
P
P
 
P
A
 
A
S
 
D
A
 
E
R
 
V
L
 
I
A
 
S
V
 
V
-
 
V
C
 
C
A
 
A
P
 
P
F
 
F
P
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
D
Q
 
R
C
 
L
Q
 
V
A
 
Q
L
 
A
L
 
A
A
 
D
G
 
G
S
 
T
A
 
D
V
 
L
A
 
K
W
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
T
V
 
M
S
 
H
A
 
F
E
 
A
A
 
D
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
P
S
 
V
M
 
M
L
 
L
A
 
K
E
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
T
Y
 
Y
A
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
S
 
Q
Y
 
M
H
 
F
G
 
A
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
 
T
V
 
V
A
 
N
A
 
K
K
 
K
A
 
V
V
 
L
R
 
A
A
 
A
L
 
F
E
 
T
F
 
R
G
 
G
I
 
L
V
 
I
P
 
P
V
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
C
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
E
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
E
 
N
A
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
A
R
 
S
Q
 
Q
L
 
V
G
 
E
A
 
K
V
 
A
L
 
L
E
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
T
L
 
P
D
 
E
Q
 
Q
L
 
V
G
 
K
R
 
Q
I
 
A
V
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
S
 
T
S
 
P
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
S
V
 
V
H
 
C
A
 
G
F
 
H
L
 
I
R
 
R
A
 
S
Q
 
V
V
 
V
A
 
S
A
 
R
R
 
L
D
 
F
A
 
G
G
 
P
V
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
E
-
 
A
M
 
I
A
 
R
M
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
D
N
 
N
A
 
I
A
 
R
E
 
D
L
 
F
F
 
L
S
 
A
M
 
Q
P
 
Q
D
 
Q
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
P
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
S
 
P
D
 
A
D
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
Q
I
 
L

6bveA Triosephosphate isomerase of synechocystis in complex with 2- phosphoglycolic acid (see paper)
43% identity, 100% coverage: 1:244/245 of query aligns to 1:239/242 of 6bveA

query
sites
6bveA
M
 
M
R
 
R
Q
 
K
K
 
I
L
 
I
V
 
I
I
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
H
G
 
K
S
 
T
L
 
Q
A
 
A
A
 
E
N
 
A
V
 
Q
T
 
A
L
 
F
L
 
L
E
 
Q
A
 
G
I
 
F
K
 
K
A
 
P
-
 
L
-
 
I
-
 
E
-
 
D
A
 
A
P
 
A
A
 
E
S
 
S
A
 
R
R
 
E
L
 
V
A
 
V
V
 
L
C
 
C
A
 
V
P
 
P
F
 
F
P
 
T
Y
 
D
L
 
L
A
 
S
Q
 
G
C
 
M
Q
 
S
A
 
Q
L
 
Q
L
 
L
A
 
H
G
 
G
S
 
G
A
 
R
V
 
V
A
 
R
W
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
V
S
 
H
A
 
W
E
 
E
A
 
A
R
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
A
S
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
T
E
 
E
F
 
I
G
 
G
A
 
I
S
 
H
Y
 
Y
A
 
V
L
 
V
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
S
 
Q
Y
 
Y
H
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
 
T
V
 
A
A
 
N
A
 
L
K
 
R
A
 
V
V
 
L
R
 
A
A
 
A
L
 
Q
E
 
K
F
 
A
G
 
G
I
 
L
V
 
I
P
 
P
V
 
I
V
 
L
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
K
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
E
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
E
A
 
Q
V
 
V
V
 
I
G
 
V
R
 
D
Q
 
Q
L
 
V
G
 
K
A
 
K
V
 
G
L
 
L
E
 
-
A
 
-
L
 
V
S
 
N
L
 
V
D
 
D
Q
 
Q
L
 
-
G
 
S
R
 
N
I
 
L
V
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
D
T
 
T
A
 
C
S
 
A
S
 
A
E
 
T
Q
 
E
A
 
A
Q
 
N
A
 
R
V
 
V
H
 
I
A
 
G
F
 
L
L
 
I
R
 
R
A
 
E
Q
 
Q
V
 
L
A
 
T
A
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
N
A
 
S
R
 
Q
M
 
V
A
 
T
M
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
D
 
N
N
 
N
A
 
V
A
 
D
E
 
E
L
 
I
F
 
M
S
 
A
M
 
Q
P
 
P
D
 
E
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
S
 
P
D
 
Q
D
 
S
F
 
F
L
 
A
A
 
R
I
 
I
G
 
V
N
 
N

3uwuA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-3-phosphate (see paper)
42% identity, 99% coverage: 1:242/245 of query aligns to 1:248/253 of 3uwuA

query
sites
3uwuA
M
 
M
R
 
R
Q
 
T
K
 
P
L
 
I
V
 
I
I
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
K
S
 
T
L
 
V
A
 
Q
A
 
E
N
 
A
V
 
K
T
 
D
L
 
F
L
 
V
E
 
N
A
 
A
I
 
L
K
 
P
A
 
T
A
 
L
P
 
P
A
 
D
S
 
S
A
 
K
R
 
E
L
 
V
-
 
E
-
 
S
A
 
V
V
 
I
C
 
C
A
 
A
P
 
P
F
 
A
P
 
I
Y
 
Q
L
 
L
-
 
D
A
 
A
Q
 
L
C
 
T
Q
 
T
A
 
A
L
 
V
L
 
K
A
 
E
G
 
G
S
 
K
A
 
A
-
 
Q
-
 
G
V
 
L
A
 
E
W
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
T
S
 
Y
A
 
F
E
 
E
A
 
D
R
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
A
 
S
A
 
P
S
 
V
M
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
K
Y
 
Y
A
 
V
L
 
V
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
S
 
E
Y
 
L
H
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
 
E
V
 
I
A
 
N
A
 
K
K
 
K
A
 
A
V
 
H
R
 
A
A
 
I
L
 
F
E
 
K
F
 
H
G
 
G
I
 
M
V
 
T
P
 
P
V
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
D
A
 
E
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
K
T
 
A
E
 
N
A
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
E
Q
 
Q
L
 
V
G
 
K
A
 
K
V
 
A
L
 
V
E
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
E
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
G
 
K
R
 
S
I
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
S
 
T
S
 
S
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
E
V
 
M
H
 
C
A
 
A
F
 
F
L
 
V
R
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
A
 
A
Q
 
D
V
 
L
A
 
S
A
 
S
R
 
K
D
 
E
A
 
V
G
 
S
V
 
E
A
 
A
A
 
T
R
 
R
M
 
I
A
 
Q
M
 
-
L
 
-
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
N
N
 
N
A
 
I
A
 
K
E
 
E
L
 
Y
F
 
M
S
 
A
M
 
Q
P
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
V
D
 
E
D
 
D
F
 
F
L
 
V
A
 
Q
I
 
L

Q6GIL6 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Staphylococcus aureus (strain MRSA252) (see paper)
42% identity, 99% coverage: 1:242/245 of query aligns to 1:248/253 of Q6GIL6

query
sites
Q6GIL6
M
 
M
R
 
R
Q
 
T
K
 
P
L
 
I
V
 
I
I
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
K
S
 
T
L
 
V
A
 
Q
A
 
E
N
 
A
V
 
K
T
 
D
L
 
F
L
 
V
E
 
N
A
 
A
I
 
L
K
 
P
A
 
T
A
 
L
P
 
P
A
 
D
S
 
S
A
 
K
R
 
E
L
 
V
-
 
E
-
 
S
A
 
V
V
 
I
C
 
C
A
 
A
P
 
P
F
 
A
P
 
I
Y
 
Q
L
 
L
-
 
D
A
 
A
Q
 
L
C
 
T
Q
 
T
A
 
A
L
 
V
L
 
K
A
 
E
G
 
G
S
 
K
A
 
A
-
 
Q
-
 
G
V
 
L
A
 
E
W
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
T
S
 
Y
A
 
F
E
 
E
A
 
D
R
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
A
 
S
A
 
P
S
 
V
M
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
K
Y
 
Y
A
 
V
L
 
V
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
S
 
E
Y
 
L
H
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
 
E
V
 
I
A
 
N
A
 
K
K
 
K
A
 
A
V
 
H
R
 
A
A
 
I
L
 
F
E
 
K
F
 
H
G
 
G
I
 
M
V
 
T
P
 
P
V
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
D
A
 
E
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
K
T
 
A
E
 
N
A
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
E
Q
 
Q
L
 
V
G
 
K
A
 
K
V
 
A
L
 
V
E
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
E
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
G
 
K
R
 
S
I
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
S
 
T
S
 
S
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
E
V
 
M
H
 
C
A
 
A
F
 
F
L
 
V
R
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
A
 
A
Q
 
D
V
 
L
A
 
S
A
 
S
R
 
K
D
 
E
A
 
V
G
 
S
V
 
E
A
 
A
A
 
T
R
 
R
M
 
I
A
 
Q
M
 
-
L
 
-
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
N
N
 
N
A
 
I
A
 
K
E
 
E
L
 
Y
F
 
M
S
 
A
M
 
Q
P
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
V
D
 
E
D
 
D
F
 
F
L
 
V
A
 
Q
I
 
L

3uwzA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-2-phosphate (see paper)
42% identity, 99% coverage: 1:242/245 of query aligns to 2:249/254 of 3uwzA

query
sites
3uwzA
M
 
M
R
 
R
Q
 
T
K
 
P
L
 
I
V
 
I
I
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
K
S
 
T
L
 
V
A
 
Q
A
 
E
N
 
A
V
 
K
T
 
D
L
 
F
L
 
V
E
 
N
A
 
A
I
 
L
K
 
P
A
 
T
A
 
L
P
 
P
A
 
D
S
 
S
A
 
K
R
 
E
L
 
V
-
 
E
-
 
S
A
 
V
V
 
I
C
 
C
A
 
A
P
 
P
F
 
A
P
 
I
Y
 
Q
L
 
L
-
 
D
A
 
A
Q
 
L
C
 
T
Q
 
T
A
 
A
L
 
V
L
 
K
A
 
E
G
 
G
S
 
K
A
 
A
-
 
Q
-
 
G
V
 
L
A
 
E
W
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
T
S
 
Y
A
 
F
E
 
E
A
 
D
R
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
A
 
S
A
 
P
S
 
V
M
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
K
Y
 
Y
A
 
V
L
 
V
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
S
 
E
Y
 
L
H
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
 
E
V
 
I
A
 
N
A
 
K
K
 
K
A
 
A
V
 
H
R
 
A
A
 
I
L
 
F
E
 
K
F
 
H
G
 
G
I
 
M
V
 
T
P
 
P
V
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
D
A
 
E
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
K
T
 
A
E
 
N
A
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
E
Q
 
Q
L
 
V
G
 
K
A
 
K
V
 
A
L
 
V
E
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
E
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
G
 
K
R
 
S
I
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
S
 
T
S
 
S
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
E
V
 
M
H
 
C
A
 
A
F
 
F
L
 
V
R
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
A
 
A
Q
 
D
V
 
L
A
 
S
A
 
S
R
 
K
D
 
E
A
 
V
G
 
S
V
 
E
A
 
A
A
 
T
R
 
R
M
 
I
A
 
Q
M
 
-
L
 
-
Y
 
Y
G
|
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
N
N
 
N
A
 
I
A
 
K
E
 
E
L
 
Y
F
 
M
S
 
A
M
 
Q
P
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
V
D
 
E
D
 
D
F
 
F
L
 
V
A
 
Q
I
 
L

3uwwA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 3-phosphoglyceric acid (see paper)
42% identity, 99% coverage: 1:242/245 of query aligns to 2:249/254 of 3uwwA

query
sites
3uwwA
M
 
M
R
 
R
Q
 
T
K
 
P
L
 
I
V
 
I
I
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
K
S
 
T
L
 
V
A
 
Q
A
 
E
N
 
A
V
 
K
T
 
D
L
 
F
L
 
V
E
 
N
A
 
A
I
 
L
K
 
P
A
 
T
A
 
L
P
 
P
A
 
D
S
 
S
A
 
K
R
 
E
L
 
V
-
 
E
-
 
S
A
 
V
V
 
I
C
 
C
A
 
A
P
 
P
F
 
A
P
 
I
Y
 
Q
L
 
L
-
 
D
A
 
A
Q
 
L
C
 
T
Q
 
T
A
 
A
L
 
V
L
 
K
A
 
E
G
 
G
S
 
K
A
 
A
-
 
Q
-
 
G
V
 
L
A
 
E
W
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
T
S
 
Y
A
 
F
E
 
E
A
 
D
R
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
A
 
S
A
 
P
S
 
V
M
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
K
Y
 
Y
A
 
V
L
 
V
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
S
 
E
Y
 
L
H
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
 
E
V
 
I
A
 
N
A
 
K
K
 
K
A
 
A
V
 
H
R
 
A
A
 
I
L
 
F
E
 
K
F
 
H
G
 
G
I
 
M
V
 
T
P
 
P
V
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
D
A
 
E
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
K
T
 
A
E
 
N
A
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
E
Q
 
Q
L
 
V
G
 
K
A
 
K
V
 
A
L
 
V
E
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
E
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
G
 
K
R
 
S
I
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
S
 
T
S
 
S
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
E
V
 
M
H
 
C
A
 
A
F
 
F
L
 
V
R
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
A
 
A
Q
 
D
V
 
L
A
 
S
A
 
S
R
 
K
D
 
E
A
 
V
G
 
S
V
 
E
A
 
A
A
 
T
R
 
R
M
 
I
A
 
Q
M
 
-
L
 
-
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
N
N
 
N
A
 
I
A
 
K
E
 
E
L
 
Y
F
 
M
S
 
A
M
 
Q
P
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
V
D
 
E
D
 
D
F
 
F
L
 
V
A
 
Q
I
 
L

3uwvA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 2-phosphoglyceric acid (see paper)
42% identity, 99% coverage: 1:242/245 of query aligns to 3:250/255 of 3uwvA

query
sites
3uwvA
M
 
M
R
 
R
Q
 
T
K
 
P
L
 
I
V
 
I
I
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
K
S
 
T
L
 
V
A
 
Q
A
 
E
N
 
A
V
 
K
T
 
D
L
 
F
L
 
V
E
 
N
A
 
A
I
 
L
K
 
P
A
 
T
A
 
L
P
 
P
A
 
D
S
 
S
A
 
K
R
 
E
L
 
V
-
 
E
-
 
S
A
 
V
V
 
I
C
 
C
A
 
A
P
 
P
F
 
A
P
 
I
Y
 
Q
L
 
L
-
 
D
A
 
A
Q
 
L
C
 
T
Q
 
T
A
 
A
L
 
V
L
 
K
A
 
E
G
 
G
S
 
K
A
 
A
-
 
Q
-
 
G
V
 
L
A
 
E
W
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
T
S
 
Y
A
 
F
E
 
E
A
 
D
R
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
A
 
S
A
 
P
S
 
V
M
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
K
Y
 
Y
A
 
V
L
 
V
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
S
 
E
Y
 
L
H
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
 
E
V
 
I
A
 
N
A
 
K
K
 
K
A
 
A
V
 
H
R
 
A
A
 
I
L
 
F
E
 
K
F
 
H
G
 
G
I
 
M
V
 
T
P
 
P
V
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
D
A
 
E
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
K
T
 
A
E
 
N
A
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
E
Q
 
Q
L
 
V
G
 
K
A
 
K
V
 
A
L
 
V
E
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
E
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
G
 
K
R
 
S
I
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
S
 
T
S
 
S
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
E
V
 
M
H
 
C
A
 
A
F
 
F
L
 
V
R
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
A
 
A
Q
 
D
V
 
L
A
 
S
A
 
S
R
 
K
D
 
E
A
 
V
G
 
S
V
 
E
A
 
A
A
 
T
R
 
R
M
 
I
A
 
Q
M
 
-
L
 
-
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
|
K
P
 
P
D
 
N
N
 
N
A
 
I
A
 
K
E
 
E
L
 
Y
F
 
M
S
 
A
M
 
Q
P
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
V
D
 
E
D
 
D
F
 
F
L
 
V
A
 
Q
I
 
L

6neeB Crystal structure of a reconstructed ancestor of triosephosphate isomerase from eukaryotes (see paper)
43% identity, 100% coverage: 2:245/245 of query aligns to 4:250/252 of 6neeB

query
sites
6neeB
R
 
R
Q
 
K
K
 
F
L
 
F
V
 
V
I
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
S
 
T
L
 
L
A
 
E
A
 
S
N
 
I
V
 
K
T
 
A
L
 
L
L
 
V
E
 
E
A
 
T
I
 
L
K
 
N
A
 
S
A
 
A
-
 
Q
-
 
L
P
 
D
A
 
P
S
 
N
A
 
T
R
 
E
L
 
V
A
 
V
V
 
V
C
 
A
A
 
P
P
 
P
F
 
A
P
 
I
Y
 
Y
L
 
L
A
 
P
Q
 
F
C
 
A
Q
 
R
A
 
S
L
 
K
L
 
L
A
 
K
G
 
K
-
 
P
S
 
K
A
 
E
V
 
I
A
 
Q
W
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
S
 
Y
A
 
T
E
 
K
A
 
P
R
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
A
S
 
E
M
 
M
L
 
L
A
 
K
E
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
P
Y
 
W
A
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
S
 
T
Y
 
I
H
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
S
D
 
D
A
 
E
T
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
E
K
 
K
A
 
V
V
 
K
R
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
D
F
 
Q
G
 
G
I
 
L
V
 
K
P
 
V
V
 
I
V
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
E
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
K
T
 
T
E
 
M
A
 
E
V
 
V
V
 
V
G
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
I
L
 
L
E
 
K
A
 
A
L
 
I
-
 
A
-
 
D
S
 
K
L
 
I
D
 
K
Q
 
D
L
 
W
G
 
S
R
 
N
I
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
S
 
T
S
 
P
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
A
F
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
K
Q
 
W
V
 
L
A
 
K
A
 
E
R
 
N
-
 
V
D
 
S
A
 
P
G
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
E
R
 
S
M
 
T
A
 
R
M
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
D
 
A
N
 
N
A
 
C
A
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
S
 
K
M
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
A
D
 
P
D
 
E
F
 
F
L
 
V
A
 
D
I
 
I
G
 
I
N
 
N
A
 
A

2y63A Crystal structure of leishmanial e65q-tim complexed with bromohydroxyacetone phosphate (see paper)
45% identity, 96% coverage: 3:237/245 of query aligns to 4:240/249 of 2y63A

query
sites
2y63A
Q
 
Q
K
 
P
L
 
I
V
 
A
I
 
A
G
 
A
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
C
H
 
N
G
 
G
S
 
T
L
 
T
A
 
A
A
 
S
N
 
I
V
 
E
T
 
K
L
 
L
L
 
V
E
 
Q
A
 
V
I
 
F
K
 
N
A
 
E
A
 
H
P
 
T
A
 
I
S
 
S
A
 
H
R
 
D
L
 
V
-
 
Q
A
 
C
V
 
V
C
 
V
A
 
A
P
 
P
-
 
T
F
 
F
P
 
V
Y
 
H
L
 
I
A
 
P
Q
 
L
C
 
V
Q
 
Q
A
 
A
L
 
K
L
 
L
A
 
R
G
 
N
S
 
P
A
 
K
V
 
Y
A
 
V
W
 
I
G
 
S
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
A
S
 
I
A
 
A
E
 
K
A
 
S
R
 
-
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
M
S
 
P
M
 
I
L
 
L
A
 
K
E
 
D
F
 
I
G
 
G
A
 
V
S
 
H
Y
 
W
A
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
S
 
T
Y
 
Y
H
 
Y
G
 
G
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
Q
K
 
K
A
 
V
V
 
S
R
 
E
A
 
A
L
 
C
E
 
K
F
 
Q
G
 
G
I
 
F
V
 
M
P
 
V
V
 
I
V
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
N
E
 
Q
T
 
T
E
 
A
A
 
K
V
 
V
V
 
V
G
 
L
R
 
S
Q
 
Q
L
 
T
G
 
S
A
 
A
V
 
I
L
 
A
E
 
A
A
 
K
L
 
L
S
 
T
L
 
K
D
 
D
Q
 
A
L
 
W
G
 
N
R
 
Q
I
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
S
 
T
S
 
P
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
L
F
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
K
Q
 
W
V
 
V
A
 
S
A
 
E
R
 
N
-
 
I
D
 
G
A
 
T
G
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
L
A
 
R
M
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
D
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
T
L
 
L
F
 
Y
S
 
A
M
 
K
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
N
G
 
G
G
 
F
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
P
D
 
E

2y61A Crystal structure of leishmanial e65q-tim complexed with s-glycidol phosphate (see paper)
45% identity, 96% coverage: 3:237/245 of query aligns to 4:240/249 of 2y61A

query
sites
2y61A
Q
 
Q
K
 
P
L
 
I
V
 
A
I
 
A
G
 
A
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
C
H
 
N
G
 
G
S
 
T
L
 
T
A
 
A
A
 
S
N
 
I
V
 
E
T
 
K
L
 
L
L
 
V
E
 
Q
A
 
V
I
 
F
K
 
N
A
 
E
A
 
H
P
 
T
A
 
I
S
 
S
A
 
H
R
 
D
L
 
V
-
 
Q
A
 
C
V
 
V
C
 
V
A
 
A
P
 
P
-
 
T
F
 
F
P
 
V
Y
 
H
L
 
I
A
 
P
Q
 
L
C
 
V
Q
 
Q
A
 
A
L
 
K
L
 
L
A
 
R
G
 
N
S
 
P
A
 
K
V
 
Y
A
 
V
W
 
I
G
 
S
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
A
S
 
I
A
 
A
E
 
K
A
 
S
R
 
-
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
M
S
 
P
M
 
I
L
 
L
A
 
K
E
 
D
F
 
I
G
 
G
A
 
V
S
 
H
Y
 
W
A
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
S
 
T
Y
 
Y
H
 
Y
G
 
G
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
Q
K
 
K
A
 
V
V
 
S
R
 
E
A
 
A
L
 
C
E
 
K
F
 
Q
G
 
G
I
 
F
V
 
M
P
 
V
V
 
I
V
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
N
E
 
Q
T
 
T
E
 
A
A
 
K
V
 
V
V
 
V
G
 
L
R
 
S
Q
 
Q
L
 
T
G
 
S
A
 
A
V
 
I
L
 
A
E
 
A
A
 
K
L
 
L
S
 
T
L
 
K
D
 
D
Q
 
A
L
 
W
G
 
N
R
 
Q
I
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
S
 
T
S
 
P
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
L
F
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
K
Q
 
W
V
 
V
A
 
S
A
 
E
R
 
N
-
 
I
D
 
G
A
 
T
G
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
L
A
 
R
M
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
D
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
T
L
 
L
F
 
Y
S
 
A
M
 
K
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
N
G
 
G
G
 
F
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
P
D
 
E

2vxnA E65q-tim complexed with phosphoglycolohydroxamate at 0.82 a resolution (see paper)
45% identity, 96% coverage: 3:237/245 of query aligns to 4:240/249 of 2vxnA

query
sites
2vxnA
Q
 
Q
K
 
P
L
 
I
V
 
A
I
 
A
G
 
A
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
C
H
 
N
G
 
G
S
 
T
L
 
T
A
 
A
A
 
S
N
 
I
V
 
E
T
 
K
L
 
L
L
 
V
E
 
Q
A
 
V
I
 
F
K
 
N
A
 
E
A
 
H
P
 
T
A
 
I
S
 
S
A
 
H
R
 
D
L
 
V
-
 
Q
A
 
C
V
 
V
C
 
V
A
 
A
P
 
P
-
 
T
F
 
F
P
 
V
Y
 
H
L
 
I
A
 
P
Q
 
L
C
 
V
Q
 
Q
A
 
A
L
 
K
L
 
L
A
 
R
G
 
N
S
 
P
A
 
K
V
 
Y
A
 
V
W
 
I
G
 
S
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
A
S
 
I
A
 
A
E
 
K
A
 
S
R
 
-
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
M
S
 
P
M
 
I
L
 
L
A
 
K
E
 
D
F
 
I
G
 
G
A
 
V
S
 
H
Y
 
W
A
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
S
 
T
Y
 
Y
H
 
Y
G
 
G
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
Q
K
 
K
A
 
V
V
 
S
R
 
E
A
 
A
L
 
C
E
 
K
F
 
Q
G
 
G
I
 
F
V
 
M
P
 
V
V
 
I
V
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
N
E
 
Q
T
 
T
E
 
A
A
 
K
V
 
V
V
 
V
G
 
L
R
 
S
Q
 
Q
L
 
T
G
 
S
A
 
A
V
 
I
L
 
A
E
 
A
A
 
K
L
 
L
S
 
T
L
 
K
D
 
D
Q
 
A
L
 
W
G
 
N
R
 
Q
I
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
S
 
T
S
 
P
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
L
F
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
K
Q
 
W
V
 
V
A
 
S
A
 
E
R
 
N
-
 
I
D
 
G
A
 
T
G
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
L
A
 
R
M
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
D
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
T
L
 
L
F
 
Y
S
 
A
M
 
K
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
N
G
 
G
G
 
F
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
P
D
 
E

1if2A X-ray structure of leishmania mexicana triosephosphate isomerase complexed with ipp (see paper)
45% identity, 96% coverage: 3:237/245 of query aligns to 4:240/249 of 1if2A

query
sites
1if2A
Q
 
Q
K
 
P
L
 
I
V
 
A
I
 
A
G
 
A
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
C
H
 
N
G
 
G
S
 
T
L
 
T
A
 
A
A
 
S
N
 
I
V
 
E
T
 
K
L
 
L
L
 
V
E
 
Q
A
 
V
I
 
F
K
 
N
A
 
E
A
 
H
P
 
T
A
 
I
S
 
S
A
 
H
R
 
D
L
 
V
-
 
Q
A
 
C
V
 
V
C
 
V
A
 
A
P
 
P
-
 
T
F
 
F
P
 
V
Y
 
H
L
 
I
A
 
P
Q
 
L
C
 
V
Q
 
Q
A
 
A
L
 
K
L
 
L
A
 
R
G
 
N
S
 
P
A
 
K
V
 
Y
A
 
V
W
 
I
G
 
S
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
A
S
 
I
A
 
A
E
 
K
A
 
S
R
 
-
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
M
S
 
P
M
 
I
L
 
L
A
 
K
E
 
D
F
 
I
G
 
G
A
 
V
S
 
H
Y
 
W
A
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
S
 
T
Y
 
Y
H
 
Y
G
 
G
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
Q
K
 
K
A
 
V
V
 
S
R
 
E
A
 
A
L
 
C
E
 
K
F
 
Q
G
 
G
I
 
F
V
 
M
P
 
V
V
 
I
V
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
N
E
 
Q
T
 
T
E
 
A
A
 
K
V
 
V
V
 
V
G
 
L
R
 
S
Q
 
Q
L
 
T
G
 
S
A
 
A
V
 
I
L
 
A
E
 
A
A
 
K
L
 
L
S
 
T
L
 
K
D
 
D
Q
 
A
L
 
W
G
 
N
R
 
Q
I
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
S
 
T
S
 
P
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
L
F
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
K
Q
 
W
V
 
V
A
 
S
A
 
E
R
 
N
-
 
I
D
 
G
A
 
T
G
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
L
A
 
R
M
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
D
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
T
L
 
L
F
 
Y
S
 
A
M
 
K
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
N
G
 
G
G
 
F
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
P
D
 
E

Query Sequence

>RR42_RS05495 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS05495
MRQKLVIGNWKMHGSLAANVTLLEAIKAAPASARLAVCAPFPYLAQCQALLAGSAVAWGA
QDVSAEARGAFTGEVAASMLAEFGASYALVGHSERRSYHGETDATVAAKAVRALEFGIVP
VVCVGESLAQREAGETEAVVGRQLGAVLEALSLDQLGRIVLAYEPVWAIGTGKTASSEQA
QAVHAFLRAQVAARDAGVAARMAMLYGGSVKPDNAAELFSMPDIDGGLIGGASLKSDDFL
AIGNA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory