SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS09405 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS09405 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6ie0B X-ray crystal structure of 2r,3r-butanediol dehydrogenase from bacillus subtilis
42% identity, 98% coverage: 1:351/357 of query aligns to 2:346/347 of 6ie0B

query
sites
6ie0B
M
 
M
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
R
W
 
W
R
 
H
G
 
N
R
 
Q
H
 
K
D
 
D
V
 
I
R
 
R
V
 
I
E
 
E
E
 
H
V
 
I
R
 
E
V
 
E
P
 
P
D
 
-
K
 
K
P
 
T
A
 
E
E
 
P
G
 
G
W
 
K
V
 
V
K
 
K
I
 
I
R
 
K
V
 
V
H
 
K
W
 
W
C
 
C
G
 
G
I
 
I
C
|
C
G
 
G
S
|
S
D
 
D
L
 
L
H
|
H
E
 
E
Y
 
Y
V
 
L
A
 
G
G
 
G
P
 
P
V
 
I
F
 
F
I
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
D
H
 
K
P
 
P
H
 
H
P
 
P
L
 
L
T
 
T
G
 
N
L
 
E
K
 
T
G
 
A
Q
 
P
C
 
V
I
 
T
L
 
M
G
 
G
H
|
H
E
 
E
F
 
F
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
V
A
 
V
E
 
E
L
 
V
G
 
G
A
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
E
G
 
N
F
 
Y
K
 
K
V
 
V
G
 
G
E
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
V
A
 
V
D
 
E
A
 
P
C
 
I
Q
 
-
H
 
-
C
 
-
G
 
-
K
 
-
C
 
-
Y
 
-
Y
 
F
C
 
A
T
 
T
H
 
H
-
 
G
-
 
H
-
 
Q
G
 
G
L
 
A
Y
 
Y
N
 
N
I
 
L
C
 
D
E
 
E
S
 
Q
L
 
M
-
 
G
A
 
F
F
 
L
T
 
G
G
 
L
L
 
A
M
 
G
N
 
G
N
 
G
G
 
G
A
 
G
F
 
F
A
 
S
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
N
 
S
V
 
V
P
 
D
A
 
E
E
 
E
L
 
L
L
 
L
Y
 
F
K
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
D
N
 
E
F
 
L
P
 
S
T
 
Y
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
E
P
 
P
L
 
S
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
L
H
 
Y
A
 
A
V
 
V
K
 
R
K
 
S
A
 
S
G
 
K
N
 
L
I
 
K
V
 
A
G
 
G
Q
 
D
T
 
K
V
 
A
V
 
A
V
 
V
V
 
F
G
 
G
A
 
C
G
 
G
T
 
P
I
 
I
G
 
G
L
 
L
C
 
L
T
 
V
I
 
I
M
 
E
C
 
A
A
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
T
R
 
D
I
 
I
I
 
Y
A
 
A
L
 
V
E
 
E
M
 
L
S
 
S
S
 
P
A
 
E
R
 
R
K
 
Q
K
 
Q
K
 
K
A
 
A
L
 
E
E
 
E
V
 
L
G
 
G
A
 
A
N
 
-
V
 
I
V
 
I
I
 
V
D
 
D
P
 
P
-
 
S
K
 
K
E
 
T
C
 
D
D
 
D
A
 
V
I
 
V
A
 
A
Q
 
E
V
 
I
K
 
A
A
 
E
L
 
R
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
-
G
 
G
A
 
V
D
 
D
V
 
V
S
 
A
F
 
F
E
 
E
C
 
V
I
 
T
G
 
G
N
 
V
K
 
P
A
 
V
T
 
V
A
 
L
K
 
R
L
 
Q
A
 
A
I
 
I
D
 
Q
V
 
S
I
 
T
R
 
T
K
 
I
A
 
A
G
 
G
K
 
E
C
 
T
V
 
V
M
 
I
V
 
V
G
 
S
I
 
I
F
 
W
E
 
E
E
 
K
P
 
G
S
 
A
A
 
E
F
 
I
N
 
H
F
 
P
F
 
N
E
 
D
I
 
I
V
 
V
S
 
I
T
 
K
E
 
E
K
 
R
E
 
T
I
 
V
I
 
K
G
 
G
S
 
I
L
 
I
A
 
G
Y
 
Y
N
 
R
G
 
D
E
 
I
F
 
F
A
 
P
D
 
A
V
 
V
I
 
L
R
 
S
F
 
L
I
 
M
A
 
K
D
 
E
G
 
G
R
 
Y
I
 
F
D
 
S
V
 
A
Q
 
D
P
 
K
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
K
R
 
K
I
 
I
S
 
V
L
 
L
A
 
D
D
 
D
I
 
L
V
 
I
S
 
E
Q
 
E
G
 
G
F
 
F
E
 
G
E
 
A
L
 
L
V
 
I
N
 
K
N
 
E
K
 
K
D
 
-
G
 
S
N
 
Q
V
 
V
K
 
K
I
 
I
I
 
L
V
 
V
Q
 
R
P
 
P

5vm2A Crystal structure of eck1772, an oxidoreductase/dehydrogenase of unknown specificity involved in membrane biogenesis from escherichia coli
38% identity, 92% coverage: 23:350/357 of query aligns to 24:344/347 of 5vm2A

query
sites
5vm2A
P
 
P
A
 
K
E
 
E
G
 
D
W
 
E
V
 
V
K
 
L
I
 
I
R
 
K
V
 
V
H
 
E
W
 
Y
C
 
V
G
 
G
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
L
 
V
H
|
H
E
 
G
Y
 
F
V
 
E
A
 
S
G
 
G
P
 
P
V
 
-
F
 
F
I
 
I
P
 
P
V
 
P
D
 
K
H
 
D
P
 
P
H
 
N
P
 
Q
L
 
E
T
 
I
G
 
G
L
 
L
K
 
-
G
 
-
Q
 
-
C
 
-
I
 
-
L
 
-
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
C
S
 
A
G
 
G
E
 
T
I
 
V
A
 
V
E
 
A
L
 
V
G
 
G
A
 
S
G
 
R
V
 
V
T
 
R
G
 
K
F
 
F
K
 
K
V
 
P
G
 
G
E
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
N
A
 
I
D
 
E
A
 
P
C
 
G
Q
 
V
H
 
P
C
|
C
G
 
G
K
 
H
C
|
C
Y
 
R
Y
 
Y
C
|
C
T
 
L
H
 
E
G
 
G
L
 
K
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
C
|
C
E
 
P
S
 
D
L
 
V
A
x
D
F
 
F
T
 
M
G
 
A
L
 
T
M
 
Q
N
 
P
N
 
N
-
 
Y
-
 
R
G
 
G
A
 
A
F
 
L
A
 
T
E
 
H
Y
 
Y
V
 
L
N
 
C
V
 
H
P
 
P
A
 
E
E
 
S
L
 
F
L
 
T
Y
 
Y
K
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
D
N
 
N
F
 
M
P
 
D
T
 
T
E
 
M
A
 
E
G
 
G
A
 
T
L
 
L
I
 
V
E
|
E
P
|
P
L
 
A
A
 
A
V
 
V
G
|
G
L
 
M
H
 
H
A
 
A
V
 
A
K
 
M
K
 
L
A
 
A
G
 
D
N
 
V
I
 
K
V
 
P
G
 
G
Q
 
K
T
 
K
V
 
I
V
 
I
V
 
I
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
C
I
 
I
G
 
G
L
 
L
C
 
M
T
 
T
I
 
L
M
 
Q
C
 
A
A
 
C
K
 
K
A
 
C
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
T
R
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
V
L
 
V
E
 
D
M
 
V
S
 
L
S
 
E
A
 
K
R
 
R
K
 
L
K
 
A
K
 
M
A
 
A
L
 
E
E
 
Q
V
 
L
G
 
G
A
 
A
N
 
T
V
 
V
V
 
V
I
 
I
D
 
N
P
 
G
K
 
A
E
 
K
C
 
E
D
 
D
A
 
T
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
V
 
C
K
 
Q
A
 
Q
L
 
F
T
 
T
G
 
E
G
 
D
Y
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
I
S
 
V
F
 
F
E
 
E
C
 
T
I
 
A
G
 
G
N
 
S
K
 
A
A
 
V
T
 
T
A
 
V
K
 
K
L
 
Q
A
 
A
I
 
P
D
 
Y
V
 
L
I
 
V
R
 
M
K
 
R
A
 
G
G
 
G
K
 
K
C
 
I
V
 
M
M
 
I
V
 
V
G
 
G
I
 
T
F
 
V
E
 
P
E
 
G
P
 
A
S
 
S
A
 
A
F
 
I
N
 
N
F
 
F
F
 
L
E
 
K
I
 
I
V
 
-
S
 
N
T
 
R
E
 
E
K
 
V
E
 
T
I
 
I
I
 
Q
G
 
T
S
 
V
L
 
F
A
 
R
Y
 
Y
N
 
A
G
 
N
E
 
R
F
 
Y
A
 
P
D
 
V
V
 
T
I
 
I
R
 
E
F
 
A
I
 
I
A
 
S
D
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
F
D
 
D
V
 
V
Q
 
K
P
 
S
L
 
M
I
 
V
T
 
T
G
 
H
R
 
I
I
 
Y
S
 
D
L
 
Y
A
 
R
D
 
D
I
 
-
V
 
V
S
 
Q
Q
 
Q
G
 
A
F
 
F
E
 
E
E
 
E
L
 
S
V
 
V
N
 
N
N
 
N
K
 
K
D
 
R
G
 
D
N
 
I
V
 
I
K
|
K
I
 
G
I
 
V
V
 
I
Q
 
K

1e3jA Ketose reductase (sorbitol dehydrogenase) from silverleaf whitefly (see paper)
31% identity, 97% coverage: 3:350/357 of query aligns to 4:345/348 of 1e3jA

query
sites
1e3jA
A
 
S
A
 
A
V
 
V
W
 
L
R
 
Y
G
 
K
R
 
Q
H
 
N
D
 
D
V
 
L
R
 
R
V
 
L
E
 
E
E
 
Q
V
 
R
R
 
P
V
 
I
P
 
P
D
 
E
K
 
-
P
 
P
A
 
K
E
 
E
G
 
D
W
 
E
V
 
V
K
 
L
I
 
L
R
 
Q
V
 
M
H
 
A
W
 
Y
C
 
V
G
 
G
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
L
 
V
H
|
H
E
 
Y
Y
 
Y
V
 
E
A
 
H
G
 
G
P
 
R
V
 
I
-
 
A
-
 
D
F
 
F
I
 
I
P
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
V
K
 
K
G
 
D
Q
 
P
C
 
M
I
 
V
L
 
I
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
A
S
 
S
G
 
G
E
 
T
I
 
V
A
 
V
E
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
K
G
 
N
V
 
V
T
 
K
G
 
H
F
 
L
K
 
K
V
 
K
G
 
G
E
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
A
A
 
V
D
 
E
A
 
P
C
 
G
Q
 
V
H
 
P
C
|
C
G
 
R
K
 
R
C
|
C
Y
 
Q
Y
 
F
C
|
C
T
 
K
H
 
E
G
 
G
L
 
K
Y
 
Y
N
 
N
I
 
L
C
|
C
E
 
P
S
 
D
L
 
L
A
x
T
F
 
F
T
 
C
G
 
A
L
 
T
M
 
P
-
 
P
N
 
D
N
 
D
G
 
G
A
 
N
F
 
L
A
 
A
E
 
R
Y
 
Y
V
 
Y
N
 
V
V
 
H
P
 
A
A
 
A
E
 
D
L
 
F
L
 
C
Y
 
H
K
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
D
N
 
N
F
 
V
P
 
S
T
 
L
E
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
E
 
E
P
|
P
L
 
L
A
 
S
V
 
V
G
|
G
L
 
V
H
 
H
A
 
A
V
 
C
K
 
R
K
 
R
A
 
A
G
 
G
N
 
V
I
 
Q
V
 
L
G
 
G
Q
 
T
T
 
T
V
 
V
V
 
L
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
|
A
G
 
G
T
 
P
I
 
I
G
 
G
L
 
L
C
 
V
T
 
S
I
 
V
M
 
L
C
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
Y
G
 
G
A
 
-
G
 
-
R
 
-
I
 
-
I
 
-
A
 
A
L
 
F
E
 
V
M
 
V
S
 
C
S
 
T
A
|
A
R
|
R
K
x
S
K
 
P
K
 
R
A
x
R
L
 
L
E
 
E
V
 
V
G
 
A
A
 
K
N
 
N
-
 
C
-
 
G
-
 
A
-
 
D
-
 
V
-
 
T
V
 
L
V
 
V
I
 
V
D
 
D
P
 
P
-
 
A
-
 
K
-
 
E
K
 
E
E
 
E
C
 
S
D
 
S
A
 
I
I
 
I
A
 
E
Q
 
R
V
 
I
K
 
R
A
 
S
L
 
A
T
 
I
G
 
G
G
 
D
Y
 
L
G
 
-
A
 
P
D
 
N
V
 
V
S
 
T
F
 
I
E
 
D
C
 
C
I
 
S
G
 
G
N
 
N
K
 
E
A
 
K
T
 
C
A
 
I
K
 
T
L
 
I
A
 
G
I
 
I
D
 
N
V
 
I
I
 
T
R
 
R
K
 
T
A
 
G
G
 
G
K
 
T
C
 
L
V
 
M
M
 
L
V
 
V
G
 
G
I
 
M
F
 
G
E
 
S
E
 
Q
P
 
M
S
 
V
A
 
T
F
 
V
N
 
P
F
 
L
F
 
V
E
 
N
I
 
A
V
 
C
S
 
A
T
 
R
E
 
E
K
 
I
E
 
D
I
 
I
I
 
K
G
 
S
S
 
V
L
 
F
A
 
R
Y
 
Y
N
 
C
G
 
N
E
 
D
F
 
Y
A
 
P
D
 
I
V
 
A
I
 
L
R
 
E
F
 
M
I
 
V
A
 
A
D
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
C
D
 
N
V
 
V
Q
 
K
P
 
Q
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
H
R
 
S
I
 
F
S
 
K
L
 
L
A
 
E
D
 
Q
I
 
T
V
 
V
S
 
D
Q
 
-
G
 
A
F
 
F
E
 
E
E
 
A
L
 
A
V
 
R
N
 
K
N
 
K
K
 
A
D
 
D
G
 
N
N
 
T
V
 
I
K
|
K
I
 
V
I
 
M
V
 
I
Q
 
S

2dfvA Hyperthermophilic threonine dehydrogenase from pyrococcus horikoshii (see paper)
34% identity, 94% coverage: 16:350/357 of query aligns to 19:346/346 of 2dfvA

query
sites
2dfvA
E
 
E
V
 
V
R
 
D
V
 
V
P
 
P
D
 
-
K
 
K
P
 
P
A
 
G
E
 
P
G
 
G
W
 
E
V
 
V
K
 
L
I
 
I
R
 
K
V
 
V
H
 
L
W
 
A
C
 
T
G
 
S
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
x
T
D
 
D
L
 
L
H
|
H
E
 
I
Y
 
Y
V
 
E
A
 
W
G
 
-
P
 
-
V
 
-
F
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
N
P
 
E
H
 
W
P
 
A
L
 
Q
T
 
S
G
 
R
L
 
I
K
 
K
G
 
P
Q
 
P
C
 
Q
I
 
I
L
 
M
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
V
S
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
V
A
 
V
E
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
E
G
 
G
F
 
I
K
 
E
V
 
V
G
 
G
E
 
D
R
 
Y
V
 
V
T
 
S
A
 
V
D
 
E
A
 
T
C
 
H
Q
 
I
H
 
V
C
|
C
G
 
G
K
 
K
C
|
C
Y
 
Y
Y
 
A
C
|
C
T
 
R
H
 
R
G
 
G
L
 
Q
Y
 
Y
N
 
H
I
 
V
C
|
C
E
 
Q
S
 
N
L
 
T
A
x
K
F
 
I
T
 
F
G
 
G
L
 
V
M
 
D
N
 
T
N
 
D
G
 
G
A
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
A
N
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
Q
L
 
N
L
 
I
Y
 
W
K
 
K
L
 
N
P
 
P
E
 
K
N
 
S
F
 
I
P
 
P
T
 
P
E
 
E
A
 
Y
G
 
A
A
 
T
L
 
L
I
 
Q
E
 
E
P
|
P
L
 
L
A
 
G
V
 
N
G
x
A
L
 
V
H
 
D
A
 
T
V
 
V
K
 
-
K
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
P
I
 
I
V
 
S
G
 
G
Q
 
K
T
 
S
V
 
V
V
 
L
V
 
I
V
 
T
G
 
G
A
 
A
G
|
G
T
x
P
I
x
L
G
 
G
L
 
L
C
 
L
T
 
G
I
 
I
M
 
A
C
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
Y
R
 
P
I
 
V
I
 
I
A
 
V
L
 
S
E
|
E
M
x
P
S
 
S
S
 
D
A
 
F
R
|
R
K
 
R
K
 
E
K
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
K
V
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
D
V
 
Y
V
 
V
I
 
I
D
 
N
P
 
P
K
 
F
E
 
E
C
 
E
D
 
D
A
 
V
I
 
V
A
 
K
Q
 
E
V
 
V
K
 
M
A
 
D
L
 
I
T
 
T
G
 
D
G
 
G
Y
 
N
G
 
G
A
 
V
D
 
D
V
 
V
S
 
F
F
 
L
E
 
E
C
x
F
I
x
S
G
 
G
N
x
A
K
 
P
A
 
K
T
 
A
A
 
L
K
 
E
L
 
Q
A
 
G
I
 
L
D
 
Q
V
 
A
I
 
V
R
 
T
K
 
P
A
 
A
G
 
G
K
 
R
C
 
V
V
 
S
M
 
L
V
x
L
G
|
G
I
x
L
F
 
Y
E
 
P
E
 
G
P
 
K
S
 
V
A
 
T
F
 
I
N
 
D
F
 
F
F
 
N
E
 
N
I
 
L
V
 
I
-
 
I
-
 
F
-
 
K
-
 
A
S
 
L
T
 
T
E
 
I
K
 
Y
E
 
G
I
|
I
I
x
T
G
 
G
S
 
R
L
 
H
A
 
L
Y
 
W
N
 
E
G
 
T
E
 
W
F
 
Y
A
 
T
D
 
-
V
 
V
I
 
S
R
 
R
F
 
L
I
 
L
A
 
Q
D
 
S
G
 
G
R
 
K
I
 
L
D
 
N
V
 
L
Q
 
D
P
 
P
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
H
R
 
K
I
 
Y
S
 
K
L
 
G
A
 
F
D
 
D
I
 
K
V
 
Y
S
 
E
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
E
 
E
E
 
L
L
 
M
V
 
R
N
 
A
N
 
G
K
 
K
D
 
T
G
 
G
N
x
K
V
 
V
K
 
V
I
 
F
I
 
M
V
 
L
Q
 
K

O58389 L-threonine 3-dehydrogenase; L-ThrDH; TDH; L-threonine dehydrogenase; EC 1.1.1.103 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3) (see 2 papers)
34% identity, 94% coverage: 16:350/357 of query aligns to 21:348/348 of O58389

query
sites
O58389
E
 
E
V
 
V
R
 
D
V
 
V
P
 
P
D
 
-
K
 
K
P
 
P
A
 
G
E
 
P
G
 
G
W
 
E
V
 
V
K
 
L
I
 
I
R
 
K
V
 
V
H
 
L
W
 
A
C
 
T
G
 
S
I
 
I
C
|
C
G
 
G
S
x
T
D
 
D
L
 
L
H
 
H
E
 
I
Y
 
Y
V
 
E
A
 
W
G
 
-
P
 
-
V
 
-
F
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
N
P
 
E
H
 
W
P
 
A
L
 
Q
T
 
S
G
 
R
L
 
I
K
 
K
G
 
P
Q
 
P
C
 
Q
I
 
I
L
 
M
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
V
S
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
V
A
 
V
E
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
E
G
 
G
F
 
I
K
 
E
V
 
V
G
 
G
E
 
D
R
 
Y
V
 
V
T
 
S
A
 
V
D
 
E
A
 
T
C
 
H
Q
 
I
H
 
V
C
|
C
G
 
G
K
 
K
C
|
C
Y
 
Y
Y
 
A
C
|
C
T
 
R
H
 
R
G
 
G
L
 
Q
Y
 
Y
N
 
H
I
 
V
C
|
C
E
 
Q
S
 
N
L
 
T
A
 
K
F
 
I
T
 
F
G
 
G
L
 
V
M
 
D
N
 
T
N
 
D
G
 
G
A
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
A
N
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
Q
L
 
N
L
 
I
Y
 
W
K
 
K
L
 
N
P
 
P
E
 
K
N
 
S
F
 
I
P
 
P
T
 
P
E
 
E
A
 
Y
G
 
A
A
 
T
L
 
L
I
 
Q
E
|
E
P
 
P
L
 
L
A
 
G
V
 
N
G
 
A
L
 
V
H
 
D
A
 
T
V
 
V
K
 
-
K
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
P
I
 
I
V
 
S
G
 
G
Q
 
K
T
 
S
V
 
V
V
 
L
V
 
I
V
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
P
I
x
L
G
 
G
L
 
L
C
 
L
T
 
G
I
 
I
M
 
A
C
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
Y
R
 
P
I
 
V
I
 
I
A
 
V
L
 
S
E
|
E
M
 
P
S
 
S
S
 
D
A
 
F
R
|
R
K
 
R
K
 
E
K
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
K
V
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
D
V
 
Y
V
 
V
I
 
I
D
 
N
P
 
P
K
 
F
E
 
E
C
 
E
D
 
D
A
 
V
I
 
V
A
 
K
Q
 
E
V
 
V
K
 
M
A
 
D
L
 
I
T
 
T
G
 
D
G
 
G
Y
 
N
G
 
G
A
 
V
D
 
D
V
 
V
S
 
F
F
 
L
E
 
E
C
 
F
I
 
S
G
 
G
N
 
A
K
 
P
A
 
K
T
 
A
A
 
L
K
 
E
L
 
Q
A
 
G
I
 
L
D
 
Q
V
 
A
I
 
V
R
 
T
K
 
P
A
 
A
G
 
G
K
 
R
C
 
V
V
 
S
M
 
L
V
x
L
G
|
G
I
x
L
F
 
Y
E
 
P
E
 
G
P
 
K
S
 
V
A
 
T
F
 
I
N
 
D
F
 
F
F
 
N
E
 
N
I
 
L
V
 
I
-
 
I
-
 
F
-
 
K
-
 
A
S
 
L
T
 
T
E
 
I
K
 
Y
E
 
G
I
|
I
I
x
T
G
 
G
S
x
R
L
 
H
A
 
L
Y
 
W
N
 
E
G
 
T
E
 
W
F
 
Y
A
 
T
D
 
-
V
 
V
I
 
S
R
 
R
F
 
L
I
 
L
A
 
Q
D
 
S
G
 
G
R
 
K
I
 
L
D
 
N
V
 
L
Q
 
D
P
 
P
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
H
R
 
K
I
 
Y
S
 
K
L
 
G
A
 
F
D
 
D
I
 
K
V
 
Y
S
 
E
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
E
 
E
E
 
L
L
 
M
V
 
R
N
 
A
N
 
G
K
 
K
D
 
T
G
 
G
N
 
K
V
 
V
K
 
V
I
 
F
I
 
M
V
 
L
Q
 
K

3gfbA L-threonine dehydrogenase (tktdh) from the hyperthermophilic archaeon thermococcus kodakaraensis (see paper)
33% identity, 92% coverage: 16:345/357 of query aligns to 19:341/347 of 3gfbA

query
sites
3gfbA
E
 
E
V
 
V
R
 
D
V
 
V
P
 
P
D
 
-
K
 
K
P
 
P
A
 
G
E
 
P
G
 
G
W
 
E
V
 
V
K
 
L
I
 
I
R
 
K
V
 
V
H
 
L
W
 
A
C
 
T
G
 
S
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
x
T
D
 
D
L
 
L
H
|
H
E
 
I
Y
 
Y
V
 
E
A
 
W
G
 
-
P
 
-
V
 
-
F
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
N
P
 
E
H
 
W
P
 
A
L
 
Q
T
 
S
G
 
R
L
 
I
K
 
K
G
 
P
Q
 
P
C
 
Q
I
 
I
L
 
M
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
V
S
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
V
A
 
V
E
 
E
L
 
V
G
 
G
A
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
E
G
 
D
F
 
L
K
 
Q
V
 
V
G
 
G
E
 
D
R
 
Y
V
 
I
T
 
S
A
 
V
D
 
E
A
 
T
C
 
H
Q
 
I
H
 
V
C
|
C
G
 
G
K
 
K
C
|
C
Y
 
Y
Y
 
A
C
|
C
T
 
K
H
 
H
G
 
N
L
 
R
Y
 
Y
N
 
H
I
 
V
C
|
C
E
 
Q
S
 
N
L
 
T
A
x
K
F
 
I
T
 
F
G
 
G
L
 
V
M
 
D
N
 
M
N
 
D
G
 
G
A
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
H
Y
 
Y
V
 
A
N
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
K
L
 
N
L
 
A
Y
 
W
K
 
K
L
 
N
P
 
P
E
 
K
N
 
D
F
 
M
P
 
P
T
 
P
E
 
E
A
 
Y
G
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
Q
E
 
E
P
|
P
L
 
L
A
 
G
V
 
N
G
x
A
L
 
V
H
 
D
A
 
T
V
 
V
K
 
-
K
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
P
I
 
I
V
 
A
G
 
G
Q
 
R
T
 
S
V
 
T
V
 
L
V
 
I
V
 
T
G
|
G
A
 
A
G
|
G
T
x
P
I
x
L
G
 
G
L
 
L
C
 
L
T
 
G
I
 
I
M
 
A
C
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
Y
R
 
P
I
 
V
I
 
I
A
 
V
L
x
S
E
|
E
M
x
P
S
 
S
S
 
E
A
 
F
R
|
R
K
 
R
K
 
K
K
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
K
V
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
D
V
 
Y
V
 
V
I
 
V
D
 
N
P
 
P
K
 
F
E
 
E
C
 
E
D
 
D
A
 
P
I
 
V
A
 
K
Q
 
F
V
 
V
K
 
M
A
 
D
L
 
I
T
 
T
G
 
D
G
 
G
Y
 
A
G
 
G
A
 
V
D
 
E
V
 
V
S
 
F
F
 
L
E
 
E
C
x
F
I
x
S
G
 
G
N
x
A
K
 
P
A
 
K
T
 
A
A
 
L
K
 
E
L
 
Q
A
 
G
I
 
L
D
 
K
V
 
A
I
 
V
R
 
T
K
 
P
A
 
G
G
 
G
K
 
R
C
 
V
V
 
S
M
 
L
V
x
L
G
|
G
I
x
L
F
 
F
E
 
P
E
 
R
P
 
E
S
 
V
A
 
T
F
 
I
N
 
D
F
 
F
F
 
N
E
 
N
I
 
L
V
 
I
S
 
-
T
 
-
E
 
-
K
 
-
E
 
-
I
 
I
I
 
F
G
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
E
Y
 
V
N
 
H
G
 
G
-
x
I
-
x
T
-
 
G
-
 
R
-
 
H
-
 
L
-
 
W
-
 
E
E
 
T
F
 
W
A
 
Y
D
 
T
V
 
V
I
 
S
R
 
S
F
 
L
I
 
I
A
 
Q
D
 
S
G
 
G
R
 
K
I
 
L
D
 
N
V
 
L
Q
 
D
P
 
P
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
H
R
 
K
I
 
Y
S
 
K
L
 
G
A
 
F
D
 
D
I
 
K
V
 
F
S
 
E
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
E
 
E
E
 
L
L
 
M
V
 
R
N
 
A
N
 
G
K
 
K
D
 
T
G
 
G
N
x
K
V
 
V

Q5JI69 L-threonine 3-dehydrogenase; TDH; L-threonine dehydrogenase; EC 1.1.1.103 from Thermococcus kodakarensis (strain ATCC BAA-918 / JCM 12380 / KOD1) (Pyrococcus kodakaraensis (strain KOD1)) (see paper)
33% identity, 92% coverage: 16:345/357 of query aligns to 21:343/350 of Q5JI69

query
sites
Q5JI69
E
 
E
V
 
V
R
 
D
V
 
V
P
 
P
D
 
-
K
 
K
P
 
P
A
 
G
E
 
P
G
 
G
W
 
E
V
 
V
K
 
L
I
 
I
R
 
K
V
 
V
H
 
L
W
 
A
C
 
T
G
 
S
I
 
I
C
 
C
G
 
G
S
 
T
D
 
D
L
 
L
H
 
H
E
 
I
Y
 
Y
V
 
E
A
 
W
G
 
-
P
 
-
V
 
-
F
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
N
P
 
E
H
 
W
P
 
A
L
 
Q
T
 
S
G
 
R
L
 
I
K
 
K
G
 
P
Q
 
P
C
 
Q
I
 
I
L
 
M
G
 
G
H
 
H
E
 
E
F
 
V
S
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
V
A
 
V
E
 
E
L
 
V
G
 
G
A
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
E
G
 
D
F
 
L
K
 
Q
V
 
V
G
 
G
E
 
D
R
 
Y
V
 
I
T
 
S
A
 
V
D
 
E
A
 
T
C
 
H
Q
 
I
H
 
V
C
 
C
G
 
G
K
 
K
C
 
C
Y
 
Y
Y
 
A
C
 
C
T
 
K
H
 
H
G
 
N
L
 
R
Y
 
Y
N
 
H
I
 
V
C
 
C
E
 
Q
S
 
N
L
 
T
A
 
K
F
 
I
T
 
F
G
 
G
L
 
V
M
 
D
N
 
M
N
 
D
G
 
G
A
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
H
Y
 
Y
V
 
A
N
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
K
L
 
N
L
 
A
Y
 
W
K
 
K
L
 
N
P
 
P
E
 
K
N
 
D
F
 
M
P
 
P
T
 
P
E
 
E
A
 
Y
G
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
Q
E
 
E
P
 
P
L
 
L
A
 
G
V
 
N
G
 
A
L
 
V
H
 
D
A
 
T
V
 
V
K
 
-
K
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
P
I
 
I
V
 
A
G
 
G
Q
 
R
T
 
S
V
 
T
V
 
L
V
 
I
V
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
P
I
x
L
G
 
G
L
 
L
C
 
L
T
 
G
I
 
I
M
 
A
C
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
Y
R
 
P
I
 
V
I
 
I
A
 
V
L
 
S
E
|
E
M
 
P
S
 
S
S
 
E
A
 
F
R
|
R
K
 
R
K
 
K
K
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
K
V
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
D
V
 
Y
V
 
V
I
 
V
D
 
N
P
 
P
K
 
F
E
 
E
C
 
E
D
 
D
A
 
P
I
 
V
A
 
K
Q
 
F
V
 
V
K
 
M
A
 
D
L
 
I
T
 
T
G
 
D
G
 
G
Y
 
A
G
 
G
A
 
V
D
 
E
V
 
V
S
 
F
F
 
L
E
 
E
C
 
F
I
 
S
G
 
G
N
 
A
K
 
P
A
 
K
T
 
A
A
 
L
K
 
E
L
 
Q
A
 
G
I
 
L
D
 
K
V
 
A
I
 
V
R
 
T
K
 
P
A
 
G
G
 
G
K
 
R
C
 
V
V
 
S
M
 
L
V
x
L
G
|
G
I
x
L
F
 
F
E
 
P
E
 
R
P
 
E
S
 
V
A
 
T
F
 
I
N
 
D
F
 
F
F
 
N
E
 
N
I
 
L
V
 
I
S
 
-
T
 
-
E
 
-
K
 
-
E
 
-
I
 
I
I
 
F
G
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
E
Y
 
V
N
 
H
G
 
G
-
x
I
-
x
T
-
 
G
-
 
R
-
 
H
-
 
L
-
 
W
-
 
E
E
 
T
F
 
W
A
 
Y
D
 
T
V
 
V
I
 
S
R
 
S
F
 
L
I
 
I
A
 
Q
D
 
S
G
 
G
R
 
K
I
 
L
D
 
N
V
 
L
Q
 
D
P
 
P
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
H
R
 
K
I
 
Y
S
 
K
L
 
G
A
 
F
D
 
D
I
 
K
V
 
F
S
 
E
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
E
 
E
E
 
L
L
 
M
V
 
R
N
 
A
N
 
G
K
 
K
D
 
T
G
 
G
N
 
K
V
 
V

Q00796 Sorbitol dehydrogenase; SDH; (R,R)-butanediol dehydrogenase; L-iditol 2-dehydrogenase; Polyol dehydrogenase; Ribitol dehydrogenase; RDH; Xylitol dehydrogenase; XDH; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.4; EC 1.1.1.14; EC 1.1.1.56; EC 1.1.1.9 from Homo sapiens (Human) (see 10 papers)
32% identity, 93% coverage: 5:335/357 of query aligns to 13:336/357 of Q00796

query
sites
Q00796
V
 
V
W
 
V
R
 
H
G
 
G
R
 
P
H
 
G
D
 
D
V
 
L
R
 
R
V
 
L
E
 
E
E
 
N
V
 
Y
R
 
P
V
 
I
P
 
P
D
 
E
K
 
-
P
 
P
A
 
G
E
 
P
G
 
N
W
 
E
V
 
V
K
 
L
I
 
L
R
 
R
V
 
M
H
 
H
W
 
S
C
 
V
G
 
G
I
 
I
C
|
C
G
 
G
S
 
S
D
 
D
L
 
V
H
 
H
E
 
Y
Y
 
W
V
 
E
A
 
Y
G
 
G
P
 
R
V
 
I
-
 
G
-
 
N
F
 
F
I
 
I
P
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
V
K
 
K
G
 
K
Q
 
P
C
 
M
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
A
S
 
S
G
 
G
E
 
T
I
 
V
A
 
E
E
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
S
G
 
S
V
 
V
T
 
K
G
 
H
F
 
L
K
 
K
V
 
P
G
 
G
E
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
A
A
 
I
D
 
E
A
 
P
C
 
G
Q
 
A
H
 
P
C
 
R
G
 
E
K
 
N
C
 
D
Y
 
E
Y
 
F
C
 
C
T
 
K
H
 
M
G
 
G
L
x
R
Y
 
Y
N
 
N
I
 
L
C
 
S
E
 
P
S
 
S
L
 
I
A
 
F
F
 
F
T
 
C
G
 
A
L
 
T
M
 
P
-
 
P
N
 
D
N
 
D
G
 
G
A
 
N
F
 
L
A
 
C
E
 
R
Y
 
F
V
 
Y
N
 
K
V
x
H
P
 
N
A
 
A
E
 
A
L
 
F
L
 
C
Y
 
Y
K
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
D
N
 
N
F
 
V
P
 
T
T
 
F
E
 
E
A
 
E
G
 
G
A
|
A
L
 
L
I
 
I
E
 
E
P
 
P
L
 
L
A
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
I
H
 
H
A
 
A
V
 
C
K
 
R
K
 
R
A
 
G
G
 
G
N
 
V
I
 
T
V
 
L
G
 
G
Q
 
H
T
 
K
V
 
V
V
 
L
V
 
V
V
 
C
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
P
I
|
I
G
 
G
L
 
M
C
 
V
T
 
T
I
 
L
M
 
L
C
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
M
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
Q
I
 
V
I
 
V
A
 
V
L
 
T
E
x
D
M
 
L
S
 
S
S
 
A
A
 
T
R
|
R
K
 
L
K
 
S
K
 
K
A
 
A
L
 
K
E
 
E
V
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
D
V
 
L
V
 
V
I
 
L
D
 
Q
P
 
I
K
 
S
E
 
K
C
 
E
D
 
S
A
 
P
I
 
Q
A
 
E
Q
 
I
V
 
A
K
 
R
A
 
K
L
 
V
T
 
E
G
 
G
G
x
Q
Y
 
L
G
 
G
-
 
C
-
 
K
A
 
P
D
 
E
V
 
V
S
 
T
F
 
I
E
 
E
C
 
C
I
 
T
G
 
G
N
 
A
K
 
E
A
 
A
T
 
S
A
 
I
K
 
Q
L
 
A
A
 
G
I
 
I
D
 
Y
V
 
A
I
 
T
R
 
R
K
 
S
A
 
G
G
 
G
K
x
N
C
 
L
V
 
V
M
 
L
V
|
V
G
|
G
I
x
L
F
 
G
E
 
S
E
 
E
P
 
M
S
 
T
A
 
T
F
 
V
N
 
P
F
 
L
F
 
L
E
 
H
I
 
A
V
 
A
S
 
I
T
 
R
E
 
E
K
 
V
E
 
D
I
 
I
I
 
K
G
 
G
S
x
V
L
x
F
A
x
R
Y
 
Y
N
 
C
G
 
N
E
 
T
F
 
W
A
 
P
D
 
V
V
 
A
I
 
I
R
 
S
F
 
M
I
 
L
A
 
A
D
 
S
G
 
K
R
 
S
I
 
V
D
 
N
V
 
V
Q
 
K
P
 
P
L
 
L
I
x
V
T
 
T
G
 
H
R
 
R
I
 
F
S
 
P
L
 
L
A
 
E
D
 
K
I
 
A
V
 
L
S
 
-
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1pl6A Human sdh/nadh/inhibitor complex (see paper)
32% identity, 97% coverage: 5:350/357 of query aligns to 12:348/356 of 1pl6A

query
sites
1pl6A
V
 
V
W
 
V
R
 
H
G
 
G
R
 
P
H
 
G
D
 
D
V
 
L
R
 
R
V
 
L
E
 
E
E
 
N
V
 
Y
R
 
P
V
 
I
P
 
P
D
 
E
K
 
-
P
 
P
A
 
G
E
 
P
G
 
N
W
 
E
V
 
V
K
 
L
I
 
L
R
 
R
V
 
M
H
 
H
W
 
S
C
 
V
G
 
G
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
L
 
V
H
|
H
E
 
Y
Y
 
W
V
 
E
A
 
Y
G
 
G
P
 
R
V
x
I
-
 
G
-
 
N
F
|
F
I
 
I
P
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
V
K
 
K
G
 
K
Q
 
P
C
 
M
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
A
S
 
S
G
 
G
E
 
T
I
 
V
A
 
E
E
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
S
G
 
S
V
 
V
T
 
K
G
 
H
F
 
L
K
 
K
V
 
P
G
 
G
E
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
A
A
 
I
D
 
E
A
 
P
C
 
G
Q
 
A
H
 
P
C
x
R
G
 
E
K
 
N
C
x
D
Y
 
E
Y
 
F
C
|
C
T
 
K
H
 
M
G
 
G
L
 
R
Y
 
Y
N
 
N
I
 
L
C
x
S
E
 
P
S
 
S
L
 
I
A
x
F
F
 
F
T
 
C
G
 
A
L
 
T
M
 
P
-
 
P
N
 
D
N
 
D
G
 
G
A
 
N
F
 
L
A
 
C
E
 
R
Y
 
F
V
 
Y
N
 
K
V
 
H
P
 
N
A
 
A
E
 
A
L
 
F
L
 
C
Y
 
Y
K
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
D
N
 
N
F
 
V
P
 
T
T
 
F
E
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
|
E
P
|
P
L
 
L
A
 
S
V
 
V
G
|
G
L
 
I
H
 
H
A
 
A
V
 
C
K
 
R
K
 
R
A
 
G
G
 
G
N
 
V
I
 
T
V
 
L
G
 
G
Q
 
H
T
 
K
V
 
V
V
 
L
V
 
V
V
 
C
G
 
G
A
 
A
G
|
G
T
x
P
I
|
I
G
 
G
L
 
M
C
 
V
T
 
T
I
 
L
M
 
L
C
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
M
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
Q
I
 
V
I
 
V
A
 
V
L
 
T
E
x
D
M
x
L
S
 
S
S
 
A
A
 
T
R
|
R
K
 
L
K
 
S
K
 
K
A
 
A
L
 
K
E
 
E
V
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
D
V
 
L
V
 
V
I
 
L
D
 
Q
P
 
I
K
 
S
E
 
K
C
 
E
D
 
S
A
 
P
I
 
Q
A
 
E
Q
 
I
V
 
A
K
 
R
A
 
K
L
 
V
T
 
E
G
 
G
G
 
Q
Y
 
L
G
 
G
-
 
C
-
 
K
A
 
P
D
 
E
V
 
V
S
 
T
F
 
I
E
 
E
C
|
C
I
x
T
G
 
G
N
 
A
K
 
E
A
 
A
T
 
S
A
 
I
K
 
Q
L
 
A
A
 
G
I
 
I
D
 
Y
V
 
A
I
 
T
R
 
R
K
 
S
A
 
G
G
 
G
K
 
T
C
 
L
V
 
V
M
 
L
V
|
V
G
|
G
I
x
L
F
 
G
E
 
S
E
 
E
P
 
M
S
 
T
A
 
T
F
 
V
N
 
P
F
 
L
F
 
L
E
 
H
I
 
A
V
 
A
S
 
I
T
 
R
E
 
E
K
 
V
E
 
D
I
 
I
I
 
K
G
 
G
S
 
V
L
x
F
A
x
R
Y
 
Y
N
 
C
G
 
N
E
 
T
F
 
W
A
 
P
D
 
V
V
 
A
I
 
I
R
 
S
F
 
M
I
 
L
A
 
A
D
 
S
G
 
K
R
 
S
I
 
V
D
 
N
V
 
V
Q
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
H
R
 
R
I
 
F
S
 
P
L
 
L
A
 
E
D
 
K
I
 
A
V
 
L
S
 
-
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
E
 
E
E
 
T
L
 
F
V
 
-
N
 
-
N
 
K
K
 
K
D
 
G
G
 
L
N
 
G
V
 
L
K
|
K
I
 
I
I
 
M
V
 
L
Q
 
K

4ej6A Crystal structure of a putative zinc-binding dehydrogenase (target psi-012003) from sinorhizobium meliloti 1021
32% identity, 98% coverage: 1:351/357 of query aligns to 4:342/343 of 4ej6A

query
sites
4ej6A
M
 
M
K
 
K
A
 
A
A
 
V
V
 
R
W
 
L
R
 
E
G
 
S
R
 
V
H
 
G
D
 
N
V
 
I
R
 
S
V
 
V
E
 
R
E
 
N
V
 
V
R
 
G
V
 
I
P
 
P
D
 
E
K
 
-
P
 
P
A
 
G
E
 
P
G
 
D
W
 
D
V
 
L
K
 
L
I
 
V
R
 
K
V
 
V
H
 
E
W
 
A
C
 
C
G
 
G
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
x
T
D
 
D
L
 
R
H
|
H
-
 
L
-
 
L
-
 
H
-
 
G
E
 
E
Y
 
F
V
 
P
A
 
S
G
 
T
P
 
P
V
 
-
F
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
P
L
 
V
T
 
T
G
 
-
L
 
-
K
 
-
G
 
-
Q
 
-
C
 
-
I
 
-
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
F
S
 
C
G
 
G
E
 
I
I
 
V
A
 
V
E
 
E
L
 
A
G
 
G
A
 
S
G
 
A
V
 
V
T
 
R
G
 
D
F
 
I
K
 
A
V
 
P
G
 
G
E
 
A
R
 
R
V
 
I
T
 
T
A
 
G
D
 
D
A
 
P
C
 
N
Q
 
I
H
 
S
C
|
C
G
 
G
K
 
R
C
|
C
Y
 
P
Y
 
Q
C
|
C
T
 
Q
H
 
A
G
 
G
L
 
R
Y
 
V
N
 
N
I
 
L
C
|
C
E
 
R
S
 
N
L
 
L
A
x
R
F
 
A
T
 
I
G
 
G
L
 
I
M
 
H
N
 
R
N
 
D
G
 
G
A
 
G
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
N
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
R
E
 
K
L
 
Q
L
 
A
Y
 
F
K
 
E
L
 
I
P
 
P
E
 
L
N
 
T
F
 
L
P
 
D
T
 
P
E
 
V
A
 
H
G
 
G
A
 
A
L
 
F
I
 
C
E
 
E
P
|
P
L
 
L
A
 
A
V
 
C
G
x
C
L
 
L
H
 
H
A
 
G
V
 
V
K
 
D
K
 
L
A
 
S
G
 
G
N
 
I
I
 
K
V
 
A
G
 
G
Q
 
S
T
 
T
V
 
V
V
 
A
V
 
I
V
 
L
G
 
G
A
 
G
G
 
G
T
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
C
 
L
T
 
T
I
 
V
M
 
Q
C
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
T
R
 
T
I
 
V
I
 
I
A
 
L
L
 
S
E
 
T
M
 
R
S
 
Q
S
 
A
A
 
T
R
 
K
K
 
R
K
 
R
K
 
L
A
 
A
L
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
T
V
 
A
V
 
T
I
 
V
D
 
D
P
 
P
K
 
S
E
 
A
C
 
G
D
 
D
A
 
V
I
 
V
A
 
E
Q
 
A
V
 
I
K
 
A
A
 
G
L
 
P
T
 
V
G
 
G
G
 
L
Y
 
V
-
 
P
-
 
G
G
 
G
A
 
V
D
 
D
V
 
V
S
 
V
F
 
I
E
 
E
C
 
C
I
 
A
G
 
G
N
 
V
K
 
A
A
 
E
T
 
T
A
 
V
K
 
K
L
 
Q
A
 
S
I
 
T
D
 
R
V
 
L
I
 
A
R
 
K
K
 
A
A
 
G
G
 
G
K
 
T
C
 
V
V
 
V
M
 
I
V
 
L
G
 
G
I
 
V
F
 
L
E
 
P
-
 
Q
-
 
G
E
 
E
P
 
K
S
 
V
A
 
E
F
 
I
N
 
E
F
 
P
F
 
F
E
 
D
I
 
I
V
 
L
S
 
F
T
 
R
E
 
E
K
 
L
E
 
R
I
 
V
I
 
L
G
 
G
S
 
S
L
 
F
A
 
I
Y
 
N
N
 
P
G
 
F
E
 
V
F
 
H
A
 
R
D
 
R
V
 
A
I
 
A
R
 
D
F
 
L
I
 
V
A
 
A
D
 
T
G
 
G
R
 
A
I
 
I
D
 
E
V
 
I
Q
 
D
P
 
R
L
 
M
I
 
I
T
 
S
G
 
R
R
 
R
I
 
I
S
 
S
L
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
A
A
 
P
D
 
D
I
 
V
V
 
I
S
 
S
Q
 
N
G
 
-
F
 
-
E
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
N
 
P
N
 
A
K
 
A
D
 
A
G
 
G
N
 
E
V
 
V
K
|
K
I
 
V
I
 
L
V
 
V
Q
 
I
P
 
P

4ejmA Crystal structure of a putative zinc-binding dehydrogenase (target psi-012003) from sinorhizobium meliloti 1021 bound to NADP
32% identity, 98% coverage: 1:351/357 of query aligns to 4:342/342 of 4ejmA

query
sites
4ejmA
M
 
M
K
 
K
A
 
A
A
 
V
V
 
R
W
 
L
R
 
E
G
 
S
R
 
V
H
 
G
D
 
N
V
 
I
R
 
S
V
 
V
E
 
R
E
 
N
V
 
V
R
 
G
V
 
I
P
 
P
D
 
E
K
 
-
P
 
P
A
 
G
E
 
P
G
 
D
W
 
D
V
 
L
K
 
L
I
 
V
R
 
K
V
 
V
H
 
E
W
 
A
C
 
C
G
 
G
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
x
T
D
 
D
L
 
R
H
|
H
-
 
L
-
 
L
-
 
H
-
 
G
E
 
E
Y
 
F
V
 
P
A
 
S
G
 
T
P
 
P
V
 
-
F
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
P
L
 
V
T
 
T
G
 
-
L
 
-
K
 
-
G
 
-
Q
 
-
C
 
-
I
 
-
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
F
S
 
C
G
 
G
E
 
I
I
 
V
A
 
V
E
 
E
L
 
A
G
 
G
A
 
S
G
 
A
V
 
V
T
 
R
G
 
D
F
 
I
K
 
A
V
 
P
G
 
G
E
 
A
R
 
R
V
 
I
T
 
T
A
 
G
D
 
D
A
 
P
C
 
N
Q
 
I
H
 
S
C
|
C
G
 
G
K
 
R
C
|
C
Y
 
P
Y
 
Q
C
|
C
T
 
Q
H
 
A
G
 
G
L
 
R
Y
 
V
N
 
N
I
 
L
C
|
C
E
 
R
S
 
N
L
 
L
A
x
R
F
 
A
T
 
I
G
 
G
L
 
I
M
 
H
N
 
R
N
 
D
G
 
G
A
 
G
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
N
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
R
E
 
K
L
 
Q
L
 
A
Y
 
F
K
 
E
L
 
I
P
 
P
E
 
L
N
 
T
F
 
L
P
 
D
T
 
P
E
 
V
A
 
H
G
 
G
A
 
A
L
 
F
I
 
C
E
 
E
P
|
P
L
 
L
A
 
A
V
 
C
G
x
C
L
 
L
H
 
H
A
 
G
V
 
V
K
 
D
K
 
L
A
 
S
G
 
G
N
 
I
I
 
K
V
 
A
G
 
G
Q
 
S
T
 
T
V
 
V
V
 
A
V
 
I
V
 
L
G
|
G
A
 
G
G
|
G
T
x
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
C
 
L
T
 
T
I
 
V
M
 
Q
C
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
T
R
 
T
I
 
V
I
 
I
A
 
L
L
 
S
E
x
T
M
x
R
S
x
Q
S
 
A
A
 
T
R
x
K
K
 
R
K
 
R
K
 
L
A
 
A
L
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
T
V
 
A
V
 
T
I
 
V
D
 
D
P
 
P
K
 
S
E
 
A
C
 
G
D
 
D
A
 
V
I
 
V
A
 
E
Q
 
A
V
 
I
K
 
A
A
 
G
L
 
P
T
 
V
G
 
G
G
 
L
Y
 
V
-
 
P
-
 
G
G
 
G
A
 
V
D
 
D
V
 
V
S
 
V
F
 
I
E
 
E
C
|
C
I
 
A
G
 
G
N
 
V
K
 
A
A
x
E
T
|
T
A
 
V
K
 
K
L
 
Q
A
 
S
I
 
T
D
 
R
V
 
L
I
 
A
R
 
K
K
 
A
A
 
G
G
 
G
K
 
T
C
 
V
V
 
V
M
 
I
V
x
L
G
 
G
I
x
V
F
 
L
E
 
P
-
 
Q
-
 
G
E
 
E
P
 
K
S
 
V
A
 
E
F
 
I
N
 
E
F
 
P
F
 
F
E
 
D
I
 
I
V
 
L
S
 
F
T
 
R
E
 
E
K
 
L
E
 
R
I
 
V
I
 
L
G
 
G
S
 
S
L
 
F
A
x
I
Y
 
N
N
 
P
G
 
F
E
 
V
F
 
H
A
 
R
D
 
R
V
 
A
I
 
A
R
 
D
F
 
L
I
 
V
A
 
A
D
 
T
G
 
G
R
 
A
I
 
I
D
 
E
V
 
I
Q
 
D
P
 
R
L
 
M
I
 
I
T
 
S
G
 
R
R
 
R
I
 
I
S
 
S
L
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
A
A
 
P
D
 
D
I
 
V
V
 
I
S
 
S
Q
 
N
G
 
-
F
 
-
E
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
N
 
P
N
 
A
K
 
A
D
 
A
G
 
G
N
 
E
V
 
V
K
|
K
I
 
V
I
 
L
V
 
V
Q
 
I
P
 
P

3qe3A Sheep liver sorbitol dehydrogenase (see paper)
30% identity, 97% coverage: 5:350/357 of query aligns to 7:343/351 of 3qe3A

query
sites
3qe3A
V
 
V
W
 
V
R
 
H
G
 
G
R
 
P
H
 
G
D
 
D
V
 
L
R
 
R
V
 
L
E
 
E
E
 
N
V
 
Y
R
 
P
V
 
I
P
 
P
D
 
E
K
 
-
P
 
P
A
 
G
E
 
P
G
 
N
W
 
E
V
 
V
K
 
L
I
 
L
R
 
K
V
 
M
H
 
H
W
 
S
C
 
V
G
 
G
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
L
 
V
H
|
H
E
x
Y
Y
 
W
V
 
Q
A
 
H
G
 
G
P
 
R
V
 
I
-
 
G
-
 
D
F
|
F
I
 
V
P
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
V
K
 
K
G
 
K
Q
 
P
C
 
M
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
A
S
 
S
G
 
G
E
 
T
I
 
V
A
 
V
E
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
S
G
 
L
V
 
V
T
 
R
G
 
H
F
 
L
K
 
Q
V
 
P
G
 
G
E
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
A
A
 
I
D
 
Q
A
 
P
C
 
G
Q
 
A
H
 
P
C
x
R
G
 
Q
K
 
T
C
x
D
Y
 
E
Y
 
F
C
|
C
T
 
K
H
 
I
G
 
G
L
 
R
Y
 
Y
N
 
N
I
 
L
C
x
S
E
 
P
S
 
T
L
 
I
A
x
F
F
 
F
T
 
C
G
 
A
L
x
T
M
 
P
-
 
P
N
 
D
N
 
D
G
 
G
A
 
N
F
 
L
A
 
C
E
 
R
Y
 
F
V
 
Y
N
 
K
V
 
H
P
 
N
A
 
A
E
 
N
L
 
F
L
 
C
Y
 
Y
K
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
D
N
 
N
F
 
V
P
 
T
T
 
F
E
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
E
P
|
P
L
 
L
A
 
S
V
 
V
G
|
G
L
 
I
H
 
H
A
 
A
V
 
C
K
 
R
K
 
R
A
 
A
G
 
G
N
 
V
I
 
T
V
 
L
G
 
G
Q
 
N
T
 
K
V
 
V
V
 
L
V
 
V
V
 
C
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
P
I
 
I
G
 
G
L
 
L
C
 
V
T
 
N
I
 
L
M
 
L
C
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
M
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
Q
I
 
V
I
 
V
A
 
V
L
 
T
E
 
D
M
 
L
S
 
S
S
 
A
A
 
S
R
 
R
K
 
L
K
 
S
K
 
K
A
 
A
L
 
K
E
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
D
V
 
F
V
 
I
I
 
L
D
 
E
P
 
I
K
 
S
E
 
N
C
 
E
D
 
S
A
 
P
I
 
E
A
 
E
Q
 
I
V
 
A
K
 
K
A
 
K
L
 
V
T
 
E
G
 
G
G
 
L
Y
 
L
G
 
G
A
 
S
-
 
K
-
 
P
D
 
E
V
 
V
S
 
T
F
 
I
E
 
E
C
 
C
I
 
T
G
 
G
N
 
V
K
 
E
A
 
T
T
 
S
A
 
I
K
 
Q
L
 
A
A
 
G
I
 
I
D
 
Y
V
 
A
I
 
T
R
 
H
K
 
S
A
 
G
G
 
G
K
 
T
C
 
L
V
 
V
M
 
L
V
 
V
G
 
G
I
 
L
F
 
G
E
 
S
E
 
E
P
 
M
S
 
T
A
 
S
F
 
V
N
 
P
F
 
L
F
 
V
E
 
H
I
 
A
V
 
A
S
 
T
T
 
R
E
 
E
K
 
V
E
 
D
I
 
I
I
 
K
G
 
G
S
 
V
L
 
F
A
x
R
Y
 
Y
N
 
C
G
 
N
E
 
T
F
 
W
A
 
P
D
 
M
V
 
A
I
 
I
R
 
S
F
 
M
I
 
L
A
 
A
D
 
S
G
 
K
R
 
S
I
 
V
D
 
N
V
 
V
Q
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
H
R
 
R
I
 
F
S
 
P
L
 
L
A
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
S
 
E
Q
 
K
G
 
A
F
 
L
E
 
E
E
 
A
L
 
F
V
 
E
N
 
T
N
 
S
K
 
K
D
 
K
G
 
G
-
 
L
N
 
G
V
 
L
K
|
K
I
 
V
I
 
M
V
 
I
Q
 
K

P07846 Sorbitol dehydrogenase; SDH; L-iditol 2-dehydrogenase; Polyol dehydrogenase; Xylitol dehydrogenase; XDH; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.14; EC 1.1.1.9 from Ovis aries (Sheep) (see paper)
31% identity, 97% coverage: 5:350/357 of query aligns to 11:346/354 of P07846

query
sites
P07846
V
 
V
W
 
V
R
 
H
G
 
G
R
 
P
H
 
G
D
 
D
V
 
L
R
 
R
V
 
L
E
 
E
E
 
N
V
 
Y
R
 
P
V
 
I
P
 
P
D
 
E
K
 
-
P
 
P
A
 
G
E
 
P
G
 
N
W
 
E
V
 
V
K
 
L
I
 
L
R
 
K
V
 
M
H
 
H
W
 
S
C
 
V
G
 
G
I
 
I
C
|
C
G
 
G
S
 
S
D
 
D
L
 
V
H
 
H
E
 
-
Y
|
Y
V
 
W
A
 
Q
G
 
G
P
 
R
V
 
I
-
 
G
-
 
D
F
 
F
I
 
V
P
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
V
K
 
K
G
 
K
Q
 
P
C
 
M
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
A
S
 
S
G
 
G
E
 
T
I
 
V
A
 
V
E
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
S
G
 
L
V
 
V
T
 
R
G
 
H
F
 
L
K
 
Q
V
 
P
G
 
G
E
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
A
A
 
I
D
 
Q
A
 
P
C
 
G
Q
 
A
H
 
P
C
 
R
G
 
Q
K
 
T
C
 
D
Y
 
E
Y
 
F
C
 
C
T
 
K
H
 
I
G
 
G
L
 
R
Y
 
Y
N
 
N
I
 
L
C
 
S
E
 
P
S
 
T
L
 
I
A
 
F
F
 
F
T