SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS13625 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS13625 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1ffuC Carbon monoxide dehydrogenase from hydrogenophaga pseudoflava which lacks the mo-pyranopterin moiety of the molybdenum cofactor (see paper)
37% identity, 96% coverage: 4:279/288 of query aligns to 6:279/287 of 1ffuC

query
sites
1ffuC
F
 
F
E
 
E
F
 
Y
L
 
H
E
 
A
P
 
P
G
 
K
S
 
S
V
 
V
P
 
G
E
 
E
A
 
A
S
 
V
R
 
A
M
 
L
L
 
L
A
 
G
D
 
Q
L
 
L
G
 
G
D
 
S
E
 
D
C
 
A
R
x
K
V
x
L
I
 
L
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
x
H
A
x
S
L
|
L
M
 
L
L
 
P
G
 
M
M
 
M
R
 
K
Q
 
L
R
 
R
M
 
F
L
 
A
M
 
Q
P
 
P
T
 
E
H
 
H
L
 
L
V
 
I
S
 
D
L
x
I
G
 
N
Q
 
R
L
 
I
D
 
P
A
 
E
L
 
L
R
 
R
K
 
G
I
 
I
E
 
R
F
 
E
D
 
E
P
 
G
R
 
S
T
 
T
G
 
-
L
 
V
R
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
M
A
 
T
L
 
V
H
 
E
A
 
N
Q
 
D
V
 
L
A
 
I
R
 
S
S
 
S
P
 
P
L
 
I
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
H
 
R
Y
 
L
P
 
P
M
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
E
M
 
A
A
 
A
G
 
K
R
 
L
V
x
I
A
|
A
N
 
D
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
R
 
R
N
 
N
Q
 
R
G
|
G
T
|
T
I
 
I
G
 
G
G
|
G
N
x
D
L
 
I
C
x
A
Y
 
H
A
 
G
D
 
D
P
 
P
A
 
G
T
x
N
D
|
D
P
 
H
P
 
P
G
 
A
C
 
L
L
 
S
M
 
I
A
 
A
L
 
V
G
 
E
A
 
A
Q
 
H
V
 
F
V
 
V
L
 
L
A
 
E
G
 
G
R
 
P
S
 
N
G
 
G
E
 
R
R
 
R
V
 
T
L
 
V
E
 
P
M
 
A
E
 
D
A
 
G
F
 
F
L
 
F
V
 
L
D
 
G
Y
 
T
Y
 
Y
T
 
M
T
 
T
A
 
L
L
|
L
E
 
E
P
 
E
D
 
N
E
 
E
I
x
V
V
x
M
T
 
V
E
 
E
I
 
I
R
 
R
I
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
F
A
 
A
P
 
A
D
 
G
A
 
T
L
 
G
G
 
W
H
 
A
Y
 
Y
A
 
E
R
 
K
F
 
L
L
 
K
R
 
R
T
 
K
A
 
T
A
 
G
E
 
D
H
x
W
R
 
-
P
 
A
L
 
T
A
 
A
S
 
G
V
 
C
S
 
A
L
 
V
L
 
V
A
 
M
R
 
R
R
 
K
T
 
S
G
 
G
A
 
G
T
 
T
C
 
V
I
 
S
E
 
H
A
 
I
R
 
R
L
 
I
A
 
A
V
 
L
G
 
T
A
 
N
S
 
V
T
 
A
P
 
P
I
 
T
P
 
A
A
 
L
R
 
R
L
 
A
R
 
E
R
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
F
 
A
L
 
L
A
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
F
T
 
T
P
 
K
E
 
E
V
 
A
A
 
V
A
 
Q
E
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
D
I
 
A
V
 
A
A
 
I
A
 
A
D
 
I
I
 
C
D
 
E
P
 
P
V
 
A
S
 
E
D
 
D
M
 
L
R
 
R
G
 
G
N
 
D
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
R
 
K
R
 
T
E
 
A
M
 
M
V
 
A
R
 
G
T
 
Q
V
 
M
A
 
V
R
 
K
R
 
R
S
 
A
I
 
L

7dqxE Crystal structure of xanthine dehydrogenase family protein
33% identity, 97% coverage: 3:280/288 of query aligns to 5:281/293 of 7dqxE

query
sites
7dqxE
N
 
S
F
 
F
E
 
D
F
 
Y
L
 
V
E
 
V
P
 
A
G
 
D
S
 
S
V
 
V
P
 
E
E
 
H
A
 
A
S
 
L
R
 
R
M
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
G
G
 
G
D
 
D
E
 
D
C
 
A
R
x
K
V
x
I
I
|
I
A
 
A
G
|
G
G
|
G
T
x
Q
A
x
S
L
|
L
M
 
V
L
 
P
G
 
L
M
 
L
R
 
N
Q
 
F
R
 
R
M
 
M
L
 
S
M
 
R
P
 
P
T
 
S
H
 
L
L
 
L
V
 
V
S
 
D
L
 
I
G
 
N
Q
 
R
L
 
V
D
 
P
A
 
G
L
 
L
R
 
A
K
 
N
I
 
I
E
 
R
F
 
K
D
 
S
P
 
D
R
 
Q
T
 
T
G
 
-
L
 
I
R
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
T
L
 
R
H
|
H
A
 
A
Q
 
K
V
 
L
A
 
T
R
 
T
S
 
S
P
 
K
L
 
T
V
 
I
Q
 
S
A
 
Q
H
 
N
Y
 
L
P
 
P
M
 
I
L
 
L
A
 
S
S
 
E
M
 
A
A
 
A
G
 
A
R
 
W
V
x
I
A
|
A
N
 
H
P
 
P
Q
 
Q
V
x
I
R
 
R
N
 
N
Q
 
R
G
|
G
T
|
T
I
 
I
G
|
G
G
|
G
N
x
S
L
 
L
C
x
A
Y
 
H
A
 
A
D
 
D
P
 
A
A
 
A
T
x
A
D
x
E
P
 
L
P
 
P
G
 
V
C
 
V
L
 
L
M
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
D
A
 
A
Q
 
Y
V
 
V
V
 
T
L
 
A
A
 
Q
G
 
S
R
 
L
S
 
Q
G
 
G
E
 
E
R
 
R
V
 
K
L
 
I
E
 
P
M
 
L
E
 
K
A
 
E
F
 
L
L
 
L
V
 
V
D
 
S
Y
 
H
Y
 
F
T
 
V
T
 
S
A
 
S
L
 
I
E
 
L
P
 
P
D
 
G
E
 
E
I
 
L
V
x
I
T
 
V
E
 
E
I
 
V
R
 
N
I
 
V
P
 
P
A
 
Q
L
 
L
A
 
P
P
 
H
D
 
G
A
 
S
L
 
G
G
 
A
H
 
A
Y
 
F
A
 
D
R
 
E
F
 
F
L
 
S
R
 
R
T
 
R
A
 
H
A
 
G
E
 
D
H
x
Y
R
 
A
P
 
I
L
 
G
A
 
G
S
 
A
V
 
A
S
 
S
L
 
L
L
 
V
A
 
T
R
 
L
R
 
D
T
 
E
G
 
Q
A
 
G
T
 
K
C
 
C
I
 
S
E
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
T
V
 
V
-
 
L
-
 
G
G
 
G
A
 
G
S
 
S
T
 
T
P
 
A
I
 
I
P
 
-
A
 
-
R
 
R
L
 
C
R
 
Q
R
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
N
F
 
I
L
 
L
A
 
I
G
 
D
K
 
S
A
 
T
V
 
L
T
 
S
P
 
S
E
 
H
V
 
D
A
 
I
A
 
A
E
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
H
I
 
A
V
 
A
A
 
V
A
 
Q
D
 
G
I
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
S
 
P
D
 
T
M
 
V
R
 
H
G
 
G
N
 
S
A
 
A
D
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
R
 
A
E
 
Q
M
 
V
V
 
I
R
 
R
T
 
T
V
 
M
A
 
V
R
 
E
R
 
R
S
 
T
I
 
L
A
 
A

4zohB Crystal structure of glyceraldehyde oxidoreductase (see paper)
31% identity, 97% coverage: 4:281/288 of query aligns to 6:271/274 of 4zohB

query
sites
4zohB
F
 
F
E
 
G
F
 
Y
L
 
V
E
 
I
P
 
P
G
 
D
S
 
N
V
 
L
P
 
N
E
 
E
A
 
A
S
 
L
R
 
E
M
 
F
L
 
L
A
 
E
D
 
E
L
 
H
G
 
Q
D
 
D
E
 
-
C
 
A
R
|
R
V
x
P
I
 
L
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
x
H
A
x
S
L
|
L
M
 
I
L
 
P
G
 
M
M
 
L
R
 
K
Q
 
L
R
 
R
M
 
L
L
 
I
M
 
R
P
 
P
T
 
S
H
 
Y
L
 
I
V
 
V
S
 
E
L
 
I
G
 
R
Q
 
R
L
 
F
D
 
S
A
 
N
L
 
L
R
 
S
K
 
Y
I
 
I
E
 
T
F
 
K
D
 
D
P
 
G
R
 
N
T
 
L
G
 
-
L
 
Y
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
T
L
 
T
H
|
H
A
 
Y
Q
 
N
V
 
I
A
 
S
R
 
K
S
 
S
P
 
S
L
 
I
V
 
-
Q
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
P
 
P
M
 
L
L
 
L
A
 
S
S
 
E
M
 
T
A
 
A
G
 
S
R
 
N
V
x
I
A
x
G
N
 
D
P
 
P
Q
 
Q
V
|
V
R
 
R
N
 
N
Q
 
M
G
 
G
T
|
T
I
 
I
G
 
G
G
|
G
N
x
S
L
 
I
C
x
S
Y
 
H
A
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
S
T
x
A
D
|
D
P
 
Y
P
 
P
G
 
A
C
 
A
L
 
L
M
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
D
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
K
L
 
I
A
 
T
G
 
S
R
 
R
S
 
K
G
 
G
E
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
V
E
 
N
M
 
F
E
 
K
A
 
S
F
 
F
L
 
A
V
 
K
D
 
D
Y
 
M
Y
 
F
T
 
T
T
 
P
A
 
D
L
 
L
E
 
N
P
 
P
D
 
G
E
 
E
I
x
L
V
|
V
T
 
T
E
 
E
I
 
I
R
 
Q
I
 
V
P
 
P
A
 
T
L
 
F
A
 
E
P
 
G
D
 
Y
A
 
K
L
 
F
G
 
S
H
 
-
Y
 
Y
A
 
Q
R
 
K
F
 
L
L
 
E
R
 
R
T
 
R
A
 
A
A
 
G
E
x
D
H
x
F
R
 
-
P
 
A
L
 
I
A
 
V
S
 
G
V
 
V
S
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
L
R
 
K
R
 
L
T
 
S
G
 
G
A
 
D
T
 
V
C
 
I
I
 
E
E
 
D
A
 
V
R
 
R
L
 
I
A
 
G
V
 
L
G
 
T
A
 
A
S
 
V
T
 
N
P
 
N
I
 
V
P
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
A
R
 
K
R
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
E
F
 
E
L
 
L
A
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
R
V
 
L
T
 
N
P
 
D
E
 
E
V
 
I
A
 
I
A
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
T
I
 
R
V
 
A
A
 
M
A
 
E
D
 
S
I
 
A
D
 
N
P
 
P
V
 
T
S
 
S
D
 
-
M
 
-
R
 
-
G
 
G
N
 
S
A
 
A
D
 
E
Y
|
Y
R
 
K
R
 
K
E
 
K
M
 
M
V
 
V
R
 
K
T
 
V
V
 
L
A
 
T
R
 
K
R
 
R
S
 
A
I
 
I
A
 
I
T
 
T

P19920 Carbon monoxide dehydrogenase medium chain; CO dehydrogenase subunit M; CO-DH M; EC 1.2.5.3 from Afipia carboxidovorans (strain ATCC 49405 / DSM 1227 / KCTC 32145 / OM5) (Oligotropha carboxidovorans) (see 2 papers)
31% identity, 96% coverage: 3:279/288 of query aligns to 5:279/288 of P19920

query
sites
P19920
N
 
S
F
 
F
E
 
D
F
 
Y
L
 
H
E
 
R
P
 
P
G
 
K
S
 
S
V
 
I
P
 
A
E
 
D
A
 
A
S
 
V
R
 
A
M
 
L
L
 
L
A
 
T
D
 
K
L
 
L
G
 
G
D
 
E
E
 
D
C
 
A
R
 
R
V
 
P
I
 
L
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
x
H
A
x
S
L
 
L
M
 
I
L
 
P
G
 
I
M
 
M
R
 
K
Q
 
T
R
 
R
M
 
L
L
 
A
M
 
T
P
 
P
T
 
E
H
 
H
L
 
L
V
 
V
S
 
D
L
 
L
G
 
R
Q
 
D
L
 
I
D
 
G
A
 
D
L
 
L
R
 
V
K
 
G
I
 
I
E
 
R
F
 
-
D
 
E
P
 
E
R
 
G
T
 
T
G
 
D
L
 
V
R
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
M
A
 
T
L
 
T
H
 
Q
A
 
H
Q
 
A
V
 
L
A
 
I
R
 
G
S
 
S
P
 
D
L
 
F
V
 
L
Q
 
A
A
 
A
H
 
K
Y
 
L
P
 
P
M
 
I
L
 
I
A
 
R
S
 
E
M
 
T
A
 
S
G
 
L
R
 
L
V
 
I
A
 
A
N
 
D
P
 
P
Q
 
Q
V
 
I
R
 
R
N
 
Y
Q
 
M
G
 
G
T
|
T
I
|
I
G
|
G
G
|
G
N
|
N
L
 
A
C
 
A
Y
 
N
A
 
G
D
 
D
P
 
P
A
 
G
T
 
N
D
 
D
P
 
M
P
 
P
G
 
A
C
 
L
L
 
M
M
 
Q
A
 
C
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
Y
V
 
E
L
 
L
A
 
T
G
 
G
R
 
P
S
 
E
G
 
G
E
 
A
R
 
R
V
 
I
L
 
V
E
 
A
M
 
A
E
 
R
A
 
D
F
 
Y
L
 
Y
V
 
Q
D
 
G
Y
 
A
Y
 
Y
T
 
F
T
 
T
A
 
A
L
 
I
E
 
E
P
 
P
D
 
G
E
 
E
I
 
L
V
 
L
T
 
T
E
 
A
I
 
I
R
 
R
I
 
I
P
 
P
A
 
-
L
 
V
A
 
P
P
 
P
D
 
T
A
 
G
L
 
H
G
 
G
H
 
Y
-
 
A
Y
 
Y
A
 
E
R
 
K
F
 
L
L
 
K
R
 
R
T
 
K
A
 
I
A
 
G
E
 
D
H
 
Y
R
 
A
P
 
T
L
 
A
A
 
A
S
 
A
V
 
A
S
 
V
L
 
V
L
 
L
A
 
T
R
 
-
R
 
M
T
 
S
G
 
G
A
 
G
T
 
K
C
 
C
I
 
V
E
 
T
A
 
A
R
 
S
L
 
I
A
 
G
V
 
L
G
 
T
A
 
N
S
 
V
T
 
A
P
 
N
I
 
T
P
 
P
A
 
L
R
 
W
L
 
A
R
 
E
R
 
E
A
 
A
E
 
G
A
 
K
F
 
V
L
 
L
A
 
V
G
 
G
K
 
T
A
 
A
V
 
L
T
 
D
P
 
K
E
 
P
V
 
A
A
 
L
A
 
D
E
 
K
A
 
A
A
 
V
D
 
A
I
 
L
V
 
A
A
 
E
A
 
A
D
 
I
I
 
T
D
 
A
P
 
P
V
 
A
S
 
S
D
 
D
M
 
G
R
 
R
G
 
G
N
 
P
A
 
A
D
 
E
Y
 
Y
R
 
R
R
 
T
E
 
K
M
 
M
V
 
A
R
 
G
T
 
V
V
 
M
A
 
L
R
 
R
R
 
R
S
 
A
I
 
V

1n5wC Crystal structure of the cu,mo-co dehydrogenase (codh); oxidized form (see paper)
31% identity, 96% coverage: 3:279/288 of query aligns to 5:279/287 of 1n5wC

query
sites
1n5wC
N
 
S
F
 
F
E
 
D
F
 
Y
L
 
H
E
 
R
P
 
P
G
 
K
S
 
S
V
 
I
P
 
A
E
 
D
A
 
A
S
 
V
R
 
A
M
 
L
L
 
L
A
 
T
D
 
K
L
 
L
G
 
G
D
 
E
E
 
D
C
 
A
R
 
R
V
 
P
I
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
x
H
A
 
S
L
 
L
M
 
I
L
 
P
G
 
I
M
 
M
R
 
K
Q
 
T
R
 
R
M
 
L
L
 
A
M
 
T
P
 
P
T
 
E
H
 
H
L
 
L
V
 
V
S
 
D
L
 
L
G
 
R
Q
 
D
L
 
I
D
 
G
A
 
D
L
 
L
R
 
V
K
 
G
I
 
I
E
 
R
F
 
-
D
 
E
P
 
E
R
 
G
T
 
T
G
 
D
L
 
V
R
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
M
A
 
T
L
 
T
H
 
Q
A
 
H
Q
 
A
V
 
L
A
 
I
R
 
G
S
 
S
P
 
D
L
 
F
V
 
L
Q
 
A
A
 
A
H
 
K
Y
 
L
P
 
P
M
 
I
L
 
I
A
 
R
S
 
E
M
 
T
A
 
S
G
 
L
R
 
L
V
x
I
A
|
A
N
 
D
P
 
P
Q
 
Q
V
 
I
R
 
R
N
 
Y
Q
 
M
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
G
 
G
N
|
N
L
 
A
C
 
A
Y
 
N
A
 
G
D
 
D
P
 
P
A
 
G
T
x
N
D
|
D
P
 
M
P
 
P
G
 
A
C
 
L
L
 
M
M
 
Q
A
 
C
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
Y
V
 
E
L
 
L
A
 
T
G
 
G
R
 
P
S
 
E
G
 
G
E
 
A
R
 
R
V
 
I
L
 
V
E
 
A
M
 
A
E
 
R
A
 
D
F
 
Y
L
 
Y
V
 
Q
D
 
G
Y
 
A
Y
 
Y
T
 
F
T
 
T
A
 
A
L
 
I
E
 
E
P
 
P
D
 
G
E
 
E
I
 
L
V
 
L
T
 
T
E
 
A
I
 
I
R
 
R
I
 
I
P
 
P
A
 
-
L
 
V
A
 
P
P
 
P
D
 
T
A
 
G
L
 
H
G
 
G
H
 
Y
-
 
A
Y
 
Y
A
 
E
R
 
K
F
 
L
L
 
K
R
 
R
T
 
K
A
 
I
A
 
G
E
 
D
H
x
Y
R
 
A
P
 
T
L
 
A
A
 
A
S
 
A
V
 
A
S
 
V
L
 
V
L
 
L
A
 
T
R
 
-
R
 
M
T
 
S
G
 
G
A
 
G
T
 
K
C
 
C
I
 
V
E
 
T
A
 
A
R
 
S
L
 
I
A
 
G
V
 
L
G
 
T
A
 
N
S
 
V
T
 
A
P
 
N
I
 
T
P
 
P
A
 
L
R
 
W
L
 
A
R
 
E
R
 
E
A
 
A
E
 
G
A
 
K
F
 
V
L
 
L
A
 
V
G
 
G
K
 
T
A
 
A
V
 
L
T
 
D
P
 
K
E
 
P
V
 
A
A
 
L
A
 
D
E
 
K
A
 
A
A
 
V
D
 
A
I
 
L
V
 
A
A
 
E
A
 
A
D
 
I
I
 
T
D
 
A
P
 
P
V
 
A
S
 
S
D
 
D
M
 
G
R
 
R
G
 
G
N
 
P
A
 
A
D
 
E
Y
 
Y
R
 
R
R
 
T
E
 
K
M
 
M
V
 
A
R
 
G
T
 
V
V
 
M
A
 
L
R
 
R
R
 
R
S
 
A
I
 
V

1t3qC Crystal structure of quinoline 2-oxidoreductase from pseudomonas putida 86 (see paper)
31% identity, 96% coverage: 4:279/288 of query aligns to 6:276/285 of 1t3qC

query
sites
1t3qC
F
 
F
E
 
S
F
 
Y
L
 
R
E
 
A
P
 
P
G
 
A
S
 
S
V
 
L
P
 
Q
E
 
E
A
 
V
S
 
I
R
 
Q
M
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
D
G
 
P
D
 
D
E
 
-
C
 
A
R
 
R
V
x
I
I
 
I
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
x
Q
A
x
S
L
|
L
M
 
L
L
 
P
G
 
L
M
 
L
R
 
A
Q
 
F
R
 
R
M
 
L
L
 
V
M
 
Y
P
 
P
T
 
S
H
 
C
L
 
L
V
 
V
S
 
D
L
 
L
G
 
R
Q
 
N
L
 
V
D
 
S
A
 
E
L
 
L
R
 
-
K
 
-
I
 
F
E
 
E
F
 
I
D
 
S
P
 
Q
R
 
S
T
 
A
G
 
G
-
 
I
L
 
L
R
 
S
I
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
M
A
 
V
L
 
T
H
 
H
A
 
F
Q
 
R
V
 
N
A
 
K
R
 
T
S
 
D
P
 
P
L
 
T
V
 
V
Q
 
A
A
 
K
H
 
C
Y
 
V
P
 
P
M
 
I
L
 
L
A
 
P
S
 
K
M
 
V
A
 
L
G
 
A
R
 
H
V
|
V
A
|
A
N
 
H
P
 
Q
Q
 
A
V
|
V
R
 
R
N
 
N
Q
 
R
G
 
G
T
|
T
I
 
L
G
 
G
G
|
G
N
x
S
L
 
L
C
x
A
Y
 
H
A
 
A
D
 
D
P
 
A
A
 
G
T
x
A
D
x
E
P
 
M
P
 
P
G
 
F
C
 
L
L
 
M
M
 
A
A
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
V
 
M
V
 
Y
L
 
I
A
 
A
G
 
S
R
 
S
S
 
A
G
 
G
E
 
V
R
 
R
V
 
S
L
 
V
E
 
S
M
 
A
E
 
T
A
 
D
F
 
F
L
 
M
V
 
K
D
 
G
Y
 
H
Y
 
Y
T
 
F
T
 
T
A
 
D
L
 
L
E
 
E
P
 
A
D
 
G
E
 
E
I
 
V
V
x
L
T
 
V
E
 
R
I
 
V
R
 
E
I
 
I
P
 
P
A
 
-
L
 
-
A
 
I
P
 
P
D
 
A
A
 
L
L
 
H
G
 
W
H
 
E
Y
 
F
A
 
D
R
 
E
F
 
Y
L
 
A
R
 
R
T
 
R
A
 
K
A
 
G
E
 
D
H
x
Y
R
 
A
P
 
L
L
 
V
A
 
M
S
 
A
V
 
A
S
 
A
L
 
G
L
 
L
A
 
S
R
 
M
R
 
Q
T
 
-
G
 
G
A
 
G
T
 
R
C
 
C
I
 
V
E
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
A
V
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
V
T
 
E
P
 
E
I
 
R
P
 
A
A
 
H
R
 
Q
L
 
A
R
 
I
R
 
R
A
 
A
E
 
N
A
 
D
F
 
F
L
 
L
A
 
V
G
 
G
K
 
K
A
 
V
V
 
I
T
 
D
P
 
E
E
 
S
V
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
L
V
 
A
A
 
T
A
 
E
D
 
G
I
 
L
D
 
E
P
 
P
V
 
R
S
 
S
D
 
D
M
 
I
R
 
H
G
 
G
N
 
S
A
 
R
D
 
D
Y
 
L
R
 
R
R
 
L
E
 
S
M
 
L
V
 
A
R
 
K
T
 
A
V
 
I
A
 
T
R
 
Q
R
 
R
S
 
V
I
 
I

3hrdG Crystal structure of nicotinate dehydrogenase (see paper)
31% identity, 96% coverage: 1:277/288 of query aligns to 1:281/292 of 3hrdG

query
sites
3hrdG
M
 
M
R
 
K
N
 
D
F
 
F
E
 
E
F
 
F
L
 
F
E
 
A
P
 
P
G
 
K
S
 
T
V
 
L
P
 
E
E
 
E
A
 
A
S
 
K
R
 
G
M
 
L
L
 
L
A
 
H
D
 
Q
L
 
Y
G
 
K
D
 
D
-
 
V
E
 
P
C
 
P
R
 
A
V
x
I
I
 
I
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
|
T
A
x
D
L
 
L
M
 
V
L
 
I
G
 
E
M
 
I
R
 
N
Q
 
D
R
 
R
M
 
W
L
 
E
M
 
K
P
 
P
T
 
D
H
 
V
L
 
V
V
 
I
S
 
D
L
 
I
G
 
K
Q
 
K
L
 
L
D
 
K
A
 
E
L
 
L
R
 
E
K
 
Y
I
 
I
E
 
R
F
 
V
D
 
E
P
 
E
R
 
N
T
 
T
G
 
-
L
 
I
R
 
H
I
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
S
L
 
T
H
x
F
A
 
T
Q
 
Q
V
 
I
A
 
E
R
 
N
S
 
H
P
 
P
L
 
F
V
 
I
Q
 
R
A
 
S
H
 
H
Y
 
V
P
 
R
M
 
A
L
 
L
A
 
Y
S
 
K
M
 
A
A
 
A
G
 
S
R
 
Q
V
|
V
A
x
G
N
 
S
P
 
P
Q
 
Q
V
x
I
R
 
R
N
 
N
Q
 
L
G
 
G
T
|
T
I
 
I
G
 
G
G
|
G
N
|
N
L
 
L
C
x
S
Y
x
T
A
 
S
D
 
S
P
 
V
A
 
A
T
x
G
D
|
D
P
 
G
P
 
V
G
 
S
C
 
A
L
 
M
M
 
T
A
 
T
L
 
L
G
 
D
A
 
A
Q
 
T
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
E
G
 
S
R
 
V
S
 
R
G
 
G
E
 
T
R
 
R
V
 
Q
L
 
M
E
 
K
M
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
L
V
 
T
D
 
D
Y
 
F
Y
 
F
T
 
D
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
F
-
 
K
-
 
R
-
 
R
T
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
E
P
 
A
D
 
D
E
 
E
I
|
I
V
x
M
T
 
T
E
 
E
I
 
V
R
 
I
I
 
I
P
 
D
A
 
-
L
 
-
A
 
R
P
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
-
G
 
-
H
 
H
Y
 
S
A
 
A
R
 
S
F
 
A
L
 
F
R
 
Y
T
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
K
H
 
R
R
 
K
P
 
S
L
 
L
A
 
A
S
 
-
V
 
I
S
 
S
L
 
V
L
 
I
A
 
G
R
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
V
R
 
D
T
 
D
G
 
A
A
 
G
T
 
V
C
 
C
I
 
T
E
 
W
A
 
A
R
 
S
L
 
M
A
 
R
V
 
G
G
 
G
A
 
C
S
 
I
T
 
G
P
 
R
I
 
Y
P
 
P
A
 
L
R
 
H
L
 
F
R
 
K
R
 
Q
A
 
A
E
 
E
A
 
E
F
 
M
L
 
L
A
 
V
G
 
G
K
 
A
A
 
P
V
 
L
T
 
T
P
 
M
E
 
E
V
 
T
A
 
M
A
 
E
E
 
A
A
 
T
A
 
L
D
 
P
I
 
I
V
 
L
A
 
H
A
 
-
D
 
-
I
 
-
D
 
D
P
 
T
V
 
V
S
 
Y
D
 
D
M
 
M
-
 
A
-
 
R
-
 
A
R
 
R
G
 
P
N
 
S
A
 
V
D
 
L
Y
 
Y
R
 
K
R
 
K
E
 
E
M
 
S
V
 
V
R
 
Q
T
 
G
V
 
V
A
 
F
R
 
K
R
 
K

Q0QLF4 Nicotinate dehydrogenase FAD-subunit; NDH; Nicotinic acid hydroxylase FAD-subunit; NAH; EC 1.17.1.5 from Eubacterium barkeri (Clostridium barkeri) (see paper)
31% identity, 96% coverage: 1:277/288 of query aligns to 1:281/296 of Q0QLF4

query
sites
Q0QLF4
M
 
M
R
 
K
N
 
D
F
 
F
E
 
E
F
 
F
L
 
F
E
 
A
P
 
P
G
 
K
S
 
T
V
 
L
P
 
E
E
 
E
A
 
A
S
 
K
R
 
G
M
 
L
L
 
L
A
 
H
D
 
Q
L
 
Y
G
 
K
D
 
D
-
 
V
E
 
P
C
 
P
R
 
A
V
x
I
I
|
I
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
|
T
A
x
D
L
|
L
M
 
V
L
 
I
G
 
E
M
 
I
R
 
N
Q
 
D
R
 
R
M
 
W
L
 
E
M
 
K
P
 
P
T
 
D
H
 
V
L
 
V
V
 
I
S
 
D
L
 
I
G
 
K
Q
 
K
L
 
L
D
 
K
A
 
E
L
 
L
R
 
E
K
 
Y
I
 
I
E
 
R
F
 
V
D
 
E
P
 
E
R
 
N
T
 
T
G
 
-
L
 
I
R
 
H
I
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
S
L
 
T
H
 
F
A
 
T
Q
 
Q
V
 
I
A
 
E
R
 
N
S
 
H
P
 
P
L
 
F
V
 
I
Q
 
R
A
 
S
H
 
H
Y
 
V
P
 
R
M
 
A
L
 
L
A
 
Y
S
 
K
M
 
A
A
 
A
G
 
S
R
 
Q
V
 
V
A
x
G
N
 
S
P
 
P
Q
 
Q
V
 
I
R
 
R
N
 
N
Q
 
L
G
 
G
T
|
T
I
|
I
G
|
G
G
|
G
N
|
N
L
 
L
C
 
S
Y
 
T
A
 
S
D
 
S
P
 
V
A
 
A
T
 
G
D
|
D
P
 
G
P
 
V
G
 
S
C
 
A
L
 
M
M
 
T
A
 
T
L
 
L
G
 
D
A
 
A
Q
 
T
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
E
G
 
S
R
 
V
S
 
R
G
 
G
E
 
T
R
 
R
V
 
Q
L
 
M
E
 
K
M
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
L
V
 
T
D
 
D
Y
 
F
Y
 
F
T
 
D
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
F
-
 
K
-
 
R
-
x
R
T
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
E
P
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
I
V
x
M
T
 
T
E
 
E
I
 
V
R
 
I
I
 
I
P
 
D
A
 
-
L
 
-
A
 
R
P
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
-
G
 
-
H
 
H
Y
 
S
A
 
A
R
 
S
F
 
A
L
 
F
R
 
Y
T
x
K
A
 
L
A
 
A
E
 
K
H
 
R
R
 
K
P
 
S
L
 
L
A
 
A
S
 
-
V
 
I
S
 
S
L
 
V
L
 
I
A
 
G
R
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
V
R
 
D
T
 
D
G
 
A
A
 
G
T
 
V
C
 
C
I
 
T
E
 
W
A
 
A
R
 
S
L
 
M
A
 
R
V
 
G
G
 
G
A
 
C
S
 
I
T
 
G
P
 
R
I
 
Y
P
 
P
A
 
L
R
 
H
L
 
F
R
 
K
R
 
Q
A
 
A
E
 
E
A
 
E
F
 
M
L
 
L
A
 
V
G
 
G
K
 
A
A
 
P
V
 
L
T
 
T
P
 
M
E
 
E
V
 
T
A
 
M
A
 
E
E
 
A
A
 
T
A
 
L
D
 
P
I
 
I
V
 
L
A
 
H
A
 
-
D
 
-
I
 
-
D
 
D
P
 
T
V
 
V
S
 
Y
D
 
D
M
 
M
-
 
A
-
 
R
-
 
A
R
 
R
G
 
P
N
 
S
A
 
V
D
 
L
Y
 
Y
R
 
K
R
 
K
E
 
E
M
 
S
V
 
V
R
 
Q
T
 
G
V
 
V
A
 
F
R
 
K
R
 
K

2w54A Crystal structure of xanthine dehydrogenase from rhodobacter capsulatus in complex with bound inhibitor pterin-6-aldehyde (see paper)
31% identity, 98% coverage: 6:286/288 of query aligns to 164:442/450 of 2w54A

query
sites
2w54A
F
 
F
L
 
T
E
 
L
P
 
P
G
 
A
S
 
F
V
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
T
S
 
S
R
 
D
M
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
W
-
 
Y
-
 
L
-
 
A
G
 
H
D
 
P
E
 
E
C
 
A
R
 
T
V
x
L
I
 
I
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
|
T
A
x
D
L
x
V
M
 
S
L
 
L
G
x
W
M
 
V
R
 
T
Q
 
K
R
 
A
M
 
L
L
 
R
M
 
D
P
 
L
T
 
P
H
 
E
L
 
V
V
 
A
S
 
F
L
|
L
G
 
S
Q
 
H
L
 
C
D
 
K
A
 
D
L
 
L
R
 
A
K
 
Q
I
 
I
E
 
R
F
 
E
D
 
T
P
 
P
R
 
-
T
 
D
G
 
G
L
 
Y
R
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
G
A
 
V
L
 
T
H
 
I
A
 
A
Q
 
-
V
 
-
A
 
A
R
 
L
S
 
R
P
 
A
L
 
F
V
 
A
Q
 
E
A
 
G
H
 
P
Y
 
H
P
 
P
M
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
G
M
 
L
A
 
L
G
 
R
R
 
R
V
x
F
A
|
A
N
 
S
P
 
E
Q
 
Q
V
 
V
R
 
R
N
 
Q
Q
 
V
G
x
A
T
|
T
I
 
I
G
 
G
G
|
G
N
|
N
L
 
I
C
x
A
Y
x
N
A
 
G
D
 
S
P
 
P
A
 
I
T
x
G
D
|
D
P
 
G
P
 
P
G
 
P
C
 
A
L
 
L
M
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
A
 
A
Q
 
S
V
 
L
V
 
T
L
 
L
A
 
R
G
 
R
R
 
G
S
 
Q
G
 
E
E
 
R
R
 
R
V
 
R
L
 
M
E
 
P
M
 
L
E
 
E
A
 
D
F
 
F
L
 
F
V
 
L
D
 
E
Y
 
Y
Y
 
R
T
 
K
T
 
Q
A
 
D
L
x
R
E
 
R
P
 
P
D
 
G
E
 
E
I
 
F
V
|
V
T
 
E
E
 
S
I
 
V
R
 
T
I
 
L
P
 
P
A
 
K
L
 
S
A
 
A
P
 
P
D
 
-
A
 
G
L
 
L
G
 
R
H
 
C
Y
 
Y
A
 
K
R
 
L
F
 
S
L
 
K
R
 
R
T
 
F
A
 
D
A
x
Q
E
 
D
H
 
I
R
 
S
P
 
A
L
 
V
A
 
C
S
 
G
V
 
C
S
 
L
L
 
N
L
 
L
A
 
T
R
 
L
R
 
K
T
 
-
G
 
G
A
 
S
T
 
K
C
 
I
I
 
E
E
 
T
A
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
A
V
 
F
G
 
G
A
 
G
S
 
M
T
 
A
P
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
K
R
 
R
L
 
A
R
 
A
R
 
A
A
 
F
E
 
E
A
 
A
F
 
A
L
 
L
A
 
I
G
 
G
K
 
Q
A
 
D
V
 
F
T
 
R
P
 
E
E
 
D
V
 
T
A
 
I
A
 
A
E
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
P
I
 
L
V
 
L
A
 
A
A
 
Q
D
 
D
I
 
F
D
 
T
P
 
P
V
 
L
S
 
S
D
 
D
M
 
M
R
 
R
G
 
A
N
 
S
A
 
A
D
 
A
Y
 
Y
R
 
R
R
 
M
E
 
N
M
 
A
V
 
A
R
 
Q
T
 
A
V
 
M
A
 
A
R
 
L
R
 
R
S
 
Y
I
 
V
A
 
R
T
 
E
L
 
L
F
 
S
G
 
G
L
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1jroA Crystal structure of xanthine dehydrogenase from rhodobacter capsulatus (see paper)
31% identity, 98% coverage: 6:286/288 of query aligns to 164:442/450 of 1jroA

query
sites
1jroA
F
 
F
L
 
T
E
 
L
P
 
P
G
 
A
S
 
F
V
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
T
S
 
S
R
 
D
M
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
W
-
 
Y
-
 
L
-
 
A
G
 
H
D
 
P
E
 
E
C
 
A
R
 
T
V
x
L
I
 
I
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
|
T
A
x
D
L
x
V
M
 
S
L
 
L
G
 
W
M
 
V
R
 
T
Q
 
K
R
 
A
M
 
L
L
 
R
M
 
D
P
 
L
T
 
P
H
 
E
L
 
V
V
 
A
S
 
F
L
 
L
G
 
S
Q
 
H
L
 
C
D
 
K
A
 
D
L
 
L
R
 
A
K
 
Q
I
 
I
E
 
R
F
 
E
D
 
T
P
 
P
R
 
-
T
 
D
G
 
G
L
 
Y
R
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
G
A
 
V
L
 
T
H
 
I
A
 
A
Q
 
-
V
 
-
A
 
A
R
 
L
S
 
R
P
 
A
L
 
F
V
 
A
Q
 
E
A
 
G
H
 
P
Y
 
H
P
 
P
M
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
G
M
 
L
A
 
L
G
 
R
R
 
R
V
x
F
A
|
A
N
 
S
P
 
E
Q
 
Q
V
 
V
R
 
R
N
 
Q
Q
 
V
G
 
A
T
|
T
I
 
I
G
 
G
G
|
G
N
|
N
L
 
I
C
x
A
Y
 
N
A
 
G
D
 
S
P
 
P
A
 
I
T
x
G
D
|
D
P
 
G
P
 
P
G
 
P
C
 
A
L
 
L
M
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
A
 
A
Q
 
S
V
 
L
V
 
T
L
 
L
A
 
R
G
 
R
R
 
G
S
 
Q
G
 
E
E
 
R
R
 
R
V
 
R
L
 
M
E
 
P
M
 
L
E
 
E
A
 
D
F
 
F
L
 
F
V
 
L
D
 
E
Y
 
Y
Y
 
R
T
 
K
T
 
Q
A
 
D
L
x
R
E
 
R
P
 
P
D
 
G
E
 
E
I
 
F
V
|
V
T
 
E
E
 
S
I
 
V
R
 
T
I
 
L
P
 
P
A
 
K
L
 
S
A
 
A
P
 
P
D
 
-
A
 
G
L
 
L
G
 
R
H
 
C
Y
 
Y
A
 
K
R
 
L
F
 
S
L
 
K
R
 
R
T
 
F
A
 
D
A
 
Q
E
 
D
H
 
I
R
 
S
P
 
A
L
 
V
A
 
C
S
 
G
V
 
C
S
 
L
L
 
N
L
 
L
A
 
T
R
 
L
R
 
K
T
 
-
G
 
G
A
 
S
T
 
K
C
 
I
I
 
E
E
 
T
A
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
A
V
 
F
G
 
G
A
 
G
S
 
M
T
 
A
P
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
K
R
 
R
L
 
A
R
 
A
R
 
A
A
 
F
E
 
E
A
 
A
F
 
A
L
 
L
A
 
I
G
 
G
K
 
Q
A
 
D
V
 
F
T
 
R
P
 
E
E
 
D
V
 
T
A
 
I
A
 
A
E
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
P
I
 
L
V
 
L
A
 
A
A
 
Q
D
 
D
I
 
F
D
 
T
P
 
P
V
 
L
S
 
S
D
 
D
M
 
M
R
 
R
G
 
A
N
 
S
A
 
A
D
 
A
Y
 
Y
R
 
R
R
 
M
E
 
N
M
 
A
V
 
A
R
 
Q
T
 
A
V
 
M
A
 
A
R
 
L
R
 
R
S
 
Y
I
 
V
A
 
R
T
 
E
L
 
L
F
 
S
G
 
G
L
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

5y6qB Crystal structure of an aldehyde oxidase from methylobacillus sp. Ky4400 (see paper)
26% identity, 87% coverage: 1:250/288 of query aligns to 1:298/330 of 5y6qB

query
sites
5y6qB
M
 
M
R
 
N
N
 
P
F
 
F
E
 
H
F
 
W
L
 
K
E
 
V
P
 
A
G
 
Q
S
 
S
V
 
A
P
 
S
E
 
E
A
 
A
S
 
A
R
 
A
M
 
L
L
 
K
A
 
Q
D
 
Q
L
 
S
G
 
G
D
 
S
E
 
Q
C
 
-
R
 
-
V
x
I
I
 
L
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
|
T
A
x
T
L
x
Q
M
 
L
L
 
D
G
 
L
M
 
M
R
 
K
Q
 
C
R
 
G
M
 
V
L
 
F
M
 
N
P
 
P
T
 
P
H
 
Q
L
 
L
V
 
I
S
 
G
L
 
I
G
 
N
Q
 
G
L
 
L
D
 
S
A
 
E
L
 
L
R
 
R
K
 
S
I
 
L
E
 
S
F
 
F
D
 
D
P
 
-
R
 
N
T
 
D
G
 
K
L
 
I
R
 
S
I
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
I
L
 
T
H
 
M
A
 
S
Q
 
Q
V
 
L
A
 
A
R
 
D
S
 
H
P
 
P
L
 
D
V
 
C
Q
 
Q
A
 
Q
H
 
H
Y
 
A
P
 
P
M
 
A
L
 
I
A
 
Y
S
 
G
M
 
S
A
 
L
G
 
W
R
 
Q
V
x
A
A
|
A
N
 
S
P
 
P
Q
 
Q
V
x
I
R
 
R
N
 
N
Q
 
M
G
x
A
T
|
T
I
 
L
G
 
G
G
|
G
N
|
N
L
 
L
-
x
R
-
x
Q
-
 
R
-
 
T
-
 
R
C
|
C
-
 
A
-
 
Y
Y
|
Y
A
 
R
D
 
D
P
 
P
A
 
A
T
 
T
-
 
F
-
 
S
-
 
A
-
x
C
-
x
N
-
 
K
-
 
R
D
 
N
P
 
P
-
 
G
P
 
S
G
 
G
C
|
C
-
 
A
-
x
A
-
 
R
-
 
Q
-
 
G
-
 
V
-
 
N
-
 
S
-
 
N
-
 
H
-
 
A
-
 
I
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
S
-
 
D
-
 
S
-
x
C
-
x
I
-
x
A
-
 
V
-
 
Y
-
 
P
-
x
G
-
x
D
-
 
L
-
 
A
-
 
V
-
 
A
L
 
L
M
 
V
A
 
A
L
 
F
G
 
D
A
 
A
Q
 
V
V
 
V
V
 
I
L
 
V
A
 
Q
G
 
N
R
 
P
S
 
Q
G
 
G
E
 
E
-
 
T
-
 
R
R
 
R
V
 
I
L
 
A
E
 
I
M
 
D
E
 
D
A
 
F
F
 
F
L
 
L
V
 
L
D
 
P
Y
 
G
Y
 
E
T
 
T
-
 
P
-
 
D
-
 
Q
-
 
E
T
 
H
A
 
D
L
 
L
E
 
R
P
 
D
D
 
D
E
 
E
I
|
I
V
x
I
T
 
V
E
 
A
I
 
I
R
 
E
I
 
V
P
 
P
A
 
Q
L
 
T
A
 
A
P
 
S
D
 
L
A
 
Q
L
 
R
G
 
S
H
 
H
Y
 
Y
A
 
L
R
x
K
F
 
V
L
 
R
-
 
D
R
 
R
T
 
S
A
 
S
A
 
Y
E
 
E
H
x
F
R
 
A
P
 
A
L
 
A
A
 
S
S
 
A
V
 
A
S
 
A
L
 
G
L
 
F
A
 
T
R
 
L
R
 
E
T
 
N
G
 
G
A
 
V
T
 
M
C
 
-
I
 
R
E
 
Q
A
 
V
R
 
H
L
 
I
A
 
A
V
 
L
G
 
G
A
 
G
S
 
V
T
 
A
P
 
T
I
 
K
P
 
P
A
 
W
R
 
R
L
 
A
R
 
T
R
 
R
A
 
V
E
 
E
A
 
Q
F
 
A
L
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
Q
A
 
P
V
 
F
T
 
N
P
 
E
E
 
E
V
 
T
A
 
V
A
 
F
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
L
V
 
I

O33820 4-hydroxybenzoyl-CoA reductase subunit beta; 4-HBCR subunit beta; EC 1.1.7.1 from Thauera aromatica (see paper)
24% identity, 98% coverage: 1:283/288 of query aligns to 4:321/324 of O33820

query
sites
O33820
M
 
L
R
 
T
N
 
D
F
 
F
E
 
R
F
 
T
L
 
H
E
 
R
P
 
P
G
 
A
S
 
T
V
 
L
P
 
A
E
 
D
A
 
A
S
 
V
R
 
N
M
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
-
L
 
-
G
 
A
D
 
E
E
 
A
C
 
T
R
 
L
V
x
P
I
x
L
A
x
G
G
x
A
G
|
G
T
|
T
A
x
D
L
|
L
M
 
L
L
 
P
G
 
N
M
 
L
R
 
R
Q
 
R
R
 
G
M
 
L
L
 
G
M
 
H
P
 
P
T
 
A
H
 
A
L
 
L
V
 
V
S
 
D
L
 
L
G
 
T
Q
 
G
L
 
I
D
 
D
A
 
G
L
 
L
R
 
A
K
 
T
I
 
I
E
 
S
F
 
T
D
 
L
P
 
A
R
 
D
T
 
G
G
 
S
L
 
L
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
G
A
 
A
L
 
T
H
 
L
A
 
E
Q
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
E
S
 
H
P
 
D
L
 
A
V
 
I
Q
 
R
A
 
T
H
 
T
Y
 
W
P
 
P
M
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
Q
M
 
A
A
 
A
G
 
E
R
 
S
V
 
V
A
 
A
N
 
G
P
 
P
Q
 
T
V
 
H
R
 
R
N
 
A
Q
 
A
G
 
A
T
|
T
I
 
L
G
 
G
G
 
G
N
|
N
L
 
L
-
 
C
-
x
Q
-
 
D
-
 
T
-
 
R
-
 
C
-
 
T
-
 
F
-
 
Y
-
 
N
-
 
Q
-
 
S
-
 
E
-
 
W
-
 
W
-
 
R
-
 
S
-
 
G
-
 
N
-
 
G
-
 
Y
-
 
C
-
 
L
-
 
K
-
 
Y
-
 
K
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
C
-
 
H
-
 
V
-
 
I
-
 
V
-
 
K
-
 
S
-
 
D
-
 
R
C
 
C
Y
 
Y
A
 
A
D
 
T
P
 
Y
A
 
H
T
 
G
D
|
D
P
 
V
P
 
A
G
 
P
C
 
A
L
 
L
M
 
M
A
 
V
L
 
L
G
 
D
A
 
A
Q
 
R
V
 
A
V
 
E
L
 
I
A
 
V
G
 
G
R
 
P
S
 
A
G
 
G
E
 
K
R
 
R
V
 
T
L
 
V
E
 
P
M
 
V
E
 
A
A
 
Q
F
 
L
L
 
F
-
 
R
-
 
E
-
 
S
-
 
G
V
 
A
D
 
E
Y
 
H
Y
 
L
T
 
T
T
 
-
A
 
-
L
 
L
E
 
E
P
 
K
D
 
G
E
 
E
I
 
L
V
 
L
T
 
A
E
 
A
I
 
I
R
 
E
I
 
V
P
 
P
A
 
P
L
 
T
A
 
G
P
 
A
D
 
W
A
 
S
L
 
A
G
 
A
H
 
Y
Y
 
S
A
x
K
R
 
V
F
 
R
L
 
I
R
 
R
T
 
D
A
 
A
A
 
V
E
 
D
H
 
F
R
 
-
P
 
P
L
 
L
A
 
A
S
 
G
V
 
V
S
 
A
L
 
A
L
 
A
A
 
L
R
 
Q
R
 
R
T
 
D
G
 
G
A
 
D
T
 
R
C
 
I
I
 
A
E
 
G
A
 
L
R
 
R
L
 
V
A
 
A
V
 
I
G
 
T
A
 
G
S
 
S
T
 
N
P
 
S
I
 
A
P
 
P
A
 
L
R
 
-
L
 
M
R
 
V
R
 
P
A
 
V
E
 
D
A
 
A
F
 
L
L
 
L
A
 
G
G
 
G
K
 
N
A
 
-
V
 
-
T
 
W
P
 
D
E
 
D
V
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
T
-
 
L
A
 
A
D
 
Q
I
 
L
V
 
V
A
 
R
A
 
K
D
 
T
I
 
S
D
 
N
P
 
V
V
 
L
S
 
R
D
 
T
M
 
T
R
 
I
G
 
T
N
 
G
A
 
V
D
 
K
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
E
 
R
M
 
V
V
 
L
R
 
L
T
 
A
V
 
I
A
 
S
R
 
R
R
 
K
S
 
V
I
 
V
A
 
D
T
 
Q
L
 
L
F
 
W

1rm6B Structure of 4-hydroxybenzoyl-coa reductase from thauera aromatica (see paper)
24% identity, 98% coverage: 1:283/288 of query aligns to 4:321/323 of 1rm6B

query
sites
1rm6B
M
 
L
R
 
T
N
 
D
F
 
F
E
 
R
F
 
T
L
 
H
E
 
R
P
 
P
G
 
A
S
 
T
V
 
L
P
 
A
E
 
D
A
 
A
S
 
V
R
 
N
M
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
-
L
 
-
G
 
A
D
 
E
E
 
A
C
 
T
R
 
L
V
x
P
I
 
L
A
x
G
G
x
A
G
|
G
T
|
T
A
x
D
L
|
L
M
 
L
L
 
P
G
 
N
M
 
L
R
 
R
Q
 
R
R
 
G
M
 
L
L
 
G
M
 
H
P
 
P
T
 
A
H
 
A
L
 
L
V
 
V
S
 
D
L
|
L
G
 
T
Q
 
G
L
 
I
D
 
D
A
 
G
L
 
L
R
 
A
K
 
T
I
 
I
E
 
S
F
 
T
D
 
L
P
 
A
R
 
D
T
 
G
G
 
S
L
 
L
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
G
A
 
A
L
 
T
H
 
L
A
 
E
Q
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
E
S
 
H
P
 
D
L
 
A
V
 
I
Q
 
R
A
 
T
H
 
T
Y
 
W
P
 
P
M
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
Q
M
 
A
A
 
A
G
 
E
R
 
S
V
|
V
A
|
A
N
 
G
P
 
P
Q
 
T
V
 
H
R
 
R
N
 
A
Q
 
A
G
x
A
T
|
T
I
 
L
G
 
G
G
|
G
N
|
N
L
 
L
-
x
C
-
x
Q
-
 
D
-
 
T
-
 
R
-
x
C
-
 
T
-
x
F
-
 
Y
-
 
N
-
 
Q
-
 
S
-
 
E
-
 
W
-
 
W
-
 
R
-
 
S
-
 
G
-
 
N
-
 
G
-
 
Y
-
x
C
-
 
L
-
 
K
-
 
Y
-
 
K
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
x
C
-
x
H
-
x
V
-
 
I
-
 
V
-
 
K
-
 
S
-
 
D
-
 
R
C
|
C
Y
|
Y
A
|
A
D
 
T
P
 
Y
A
 
H
T
 
G
D
|
D
P
 
V
P
 
A
G
 
P
C
 
A
L
 
L
M
 
M
A
 
V
L
 
L
G
 
D
A
 
A
Q
 
R
V
 
A
V
 
E
L
 
I
A
 
V
G
 
G
R
 
P
S
 
A
G
 
G
E
 
K
R
 
R
V
 
T
L
 
V
E
 
P
M
 
V
E
 
A
A
 
Q
F
 
L
L
 
F
-
 
R
-
 
E
-
 
S
-
 
G
V
 
A
D
 
E
Y
 
H
Y
 
L
T
 
T
T
 
-
A
 
-
L
 
L
E
 
E
P
 
K
D
 
G
E
 
E
I
 
L
V
x
L
T
 
A
E
 
A
I
 
I
R
 
E
I
 
V
P
 
P
A
 
P
L
 
T
A
 
G
P
 
A
D
 
W
A
 
S
L
 
A
G
 
A
H
 
Y
Y
 
S
A
 
K
R
 
V
F
 
R
L
 
I
R
 
R
T
 
D
A
 
A
A
x
V
E
x
D
H
x
F
R
 
-
P
 
P
L
 
L
A
 
A
S
 
G
V
 
V
S
 
A
L
 
A
L
 
A
A
 
L
R
 
Q
R
 
R
T
 
D
G
 
G
A
 
D
T
 
R
C
 
I
I
 
A
E
 
G
A
 
L
R
 
R
L
 
V
A
 
A
V
 
I
G
 
T
A
 
G
S
 
S
T
 
N
P
 
S
I
 
A
P
 
P
A
 
L
R
 
-
L
 
M
R
 
V
R
 
P
A
 
V
E
 
D
A
 
A
F
 
L
L
 
L
A
 
G
G
 
G
K
 
N
A
 
-
V
 
-
T
 
W
P
 
D
E
 
D
V
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
T
-
 
L
A
 
A
D
 
Q
I
 
L
V
 
V
A
 
R
A
 
K
D
 
T
I
 
S
D
 
N
P
 
V
V
 
L
S
 
R
D
 
T
M
 
T
R
 
I
G
 
T
N
 
G
A
 
V
D
 
K
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
E
 
R
M
 
V
V
 
L
R
 
L
T
 
A
V
 
I
A
 
S
R
 
R
R
 
K
S
 
V
I
 
V
A
 
D
T
 
Q
L
 
L
F
 
W

Q8GUQ8 Xanthine dehydrogenase 1; AtXDH1; EC 1.17.1.4 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
22% identity, 85% coverage: 25:270/288 of query aligns to 282:541/1361 of Q8GUQ8

query
sites
Q8GUQ8
E
 
D
C
 
A
R
 
K
V
 
L
I
 
L
A
 
V
G
 
G
G
 
N
T
 
T
A
 
E
L
 
V
M
 
G
L
 
I
G
 
E
M
 
M
R
 
R
Q
 
L
R
 
K
M
 
R
L
 
L
M
 
Q
P
 
Y
T
 
Q
H
 
V
L
 
L
V
 
I
S
 
S
L
 
V
G
 
A
Q
 
Q
L
 
V
D
 
P
A
 
E
L
 
L
R
 
N
K
 
A
I
 
L
E
 
N
F
 
V
D
 
N
P
 
D
R
 
-
T
 
N
G
 
G
L
 
I
R
 
E
I
 
V
G
 
G
-
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
R
L
 
L
H
 
S
A
 
E
Q
 
L
V
 
L
A
 
R
R
 
L
S
 
F
P
 
R
L
 
K
V
 
I
Q
 
V
A
 
K
H
 
E
Y
 
R
P
 
P
M
 
A
L
 
H
A
 
E
S
 
T
M
 
S
A
 
A
G
 
C
R
 
K
V
 
A
-
 
F
-
 
I
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
K
-
x
W
-
 
F
A
 
A
N
 
G
P
 
T
Q
 
Q
V
 
I
R
 
R
N
 
N
Q
 
V
G
 
A
T
 
C
I
 
I
G
 
G
G
 
G
N
 
N
L
 
I
C
 
C
Y
 
T
A
 
A
D
 
S
P
 
P
A
 
I
T
 
S
D
 
D
P
 
L
P
 
N
G
 
P
C
 
L
L
 
W
M
 
M
A
 
A
L
 
S
G
 
R
A
 
A
Q
 
E
V
 
F
V
 
R
L
 
I
A
 
T
G
 
N
R
 
C
S
 
N
G
 
G
E
 
D
-
 
V
R
 
R
V
 
S
L
 
I
E
 
P
M
 
A
E
 
K
A
 
D
F
 
F
L
 
F
V
 
L
D
 
G
Y
|
Y
Y
 
R
T
 
K
T
 
V
A
 
D
L
 
M
E
 
G
P
 
S
D
 
N
E
 
E
I
 
I
V
 
L
T
 
L
E
 
S
I
 
V
R
 
F
I
 
L
P
 
P
A
 
W
L
 
T
A
 
R
P
 
P
D
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
E
H
 
Y
Y
 
V
A
 
K
R
 
E
F
 
F
L
 
K
R
 
Q
T
 
A
A
 
H
A
 
R
E
 
R
H
 
D
R
 
D
P
 
D
L
 
I
A
 
A
S
 
I
V
 
V
S
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
R
-
 
V
-
 
F
L
 
L
L
 
E
A
 
D
R
 
K
R
 
G
T
 
Q
G
 
Q
A
 
L
T
 
F
C
 
V
I
 
S
E
 
D
A
 
A
R
 
S
L
 
I
A
 
A
V
 
Y
G
 
G
A
 
G
S
 
V
T
 
A
P
 
P
I
 
L
P
 
S
A
 
L
R
 
C
L
 
A
R
 
R
R
 
K
A
 
T
E
 
E
A
 
E
F
 
F
L
 
L
A
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
N
V
 
W
T
 
N
P
 
K
E
 
D
V
 
L
A
 
L
A
 
Q
E
 
D
A
 
A
A
 
L
D
 
K
I
 
V
V
 
I
A
 
Q
A
 
S
D
 
D
I
 
V
D
 
V
P
 
I
V
 
K
S
 
E
D
 
D
M
 
A
R
 
P
G
 
G
N
 
G
-
 
M
A
 
V
D
 
E
Y
 
F
R
 
R
R
 
K
E
 
S
M
 
L

Sites not aligning to the query:

5g5gB Escherichia coli periplasmic aldehyde oxidase (see paper)
36% identity, 40% coverage: 1:115/288 of query aligns to 1:113/316 of 5g5gB

query
sites
5g5gB
M
 
M
R
 
K
N
 
A
F
 
F
E
 
T
F
 
Y
L
 
-
E
 
E
P
 
R
G
 
V
S
 
N
V
 
T
P
 
P
E
 
A
A
 
E
S
 
A
R
 
A
M
 
L
L
 
S
A
 
A
D
 
Q
L
 
R
G
 
V
D
 
P
E
 
G
C
 
A
R
x
K
V
x
F
I
 
I
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
|
T
A
x
N
L
|
L
M
 
L
L
 
D
G
 
L
M
 
M
R
 
K
Q
 
L
R
 
E
M
 
I
L
 
E
M
 
T
P
 
P
T
 
T
H
 
H
L
 
L
V
 
I
S
 
D
L
 
V
G
 
N
Q
 
G
L
 
L
D
 
-
A
 
G
L
 
L
R
 
D
K
 
K
I
 
I
E
 
E
F
 
V
D
 
T
P
 
D
R
 
A
T
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
V
L
 
R
H
 
N
A
 
T
Q
 
D
V
 
L
A
 
A
R
 
A
S
 
H
P
 
E
L
 
R
V
 
V
Q
 
R
A
 
R
H
 
D
Y
 
Y
P
 
A
M
 
V
L
 
L
A
 
S
S
 
R
M
 
A
A
 
L
G
 
L
R
 
A
V
x
G
A
|
A
N
 
S
P
 
G
Q
 
Q
V
x
L
R
 
R
N
 
N
Q
 
Q
G
x
A
T
|
T
I
 
T
G
x
A
G
|
G
N
|
N
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P77324 Aldehyde oxidoreductase FAD-binding subunit PaoB; EC 1.2.99.6 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
36% identity, 40% coverage: 1:115/288 of query aligns to 1:113/318 of P77324

query
sites
P77324
M
 
M
R
 
K
N
 
A
F
 
F
E
 
T
F
 
Y
L
 
-
E
 
E
P
 
R
G
 
V
S
 
N
V
 
T
P
 
P
E
 
A
A
 
E
S
 
A
R
 
A
M
 
L
L
 
S
A
 
A
D
 
Q
L
 
R
G
 
V
D
 
P
E
 
G
C
 
A
R
x
K
V
x
F
I
|
I
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
|
T
A
x
N
L
|
L
M
 
L
L
 
D
G
 
L
M
 
M
R
 
K
Q
 
L
R
 
E
M
 
I
L
 
E
M
 
T
P
 
P
T
 
T
H
 
H
L
 
L
V
 
I
S
 
D
L
 
V
G
 
N
Q
 
G
L
 
L
D
 
-
A
 
G
L
 
L
R
 
D
K
 
K
I
 
I
E
 
E
F
 
V
D
 
T
P
 
D
R
 
A
T
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
V
L
 
R
H
 
N
A
 
T
Q
 
D
V
 
L
A
 
A
R
 
A
S
 
H
P
 
E
L
 
R
V
 
V
Q
 
R
A
 
R
H
 
D
Y
 
Y
P
 
A
M
 
V
L
 
L
A
 
S
S
 
R
M
 
A
A
 
L
G
 
L
R
 
A
V
 
G
A
 
A
N
 
S
P
 
G
Q
 
Q
V
 
L
R
 
R
N
 
N
Q
 
Q
G
 
A
T
|
T
I
 
T
G
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
L

Sites not aligning to the query:

2ckjA Human milk xanthine oxidoreductase
27% identity, 51% coverage: 25:172/288 of query aligns to 225:381/1264 of 2ckjA

query
sites
2ckjA
E
 
D
C
 
A
R
 
K
V
x
L
I
 
V
A
x
V
G
|
G
G
x
N
T
|
T
A
x
E
L
 
I
M
 
G
L
 
I
G
 
E
M
 
M
R
 
K
Q
 
F
R
 
K
M
 
N
L
 
M
M
 
L
P
 
F
T
 
P
H
 
M
L
 
I
V
 
V
S
 
C
L
 
P
G
 
A
Q
 
W
L
 
I
D
 
P
A
 
E
L
 
L
R
 
N
K
 
S
I
 
V
E
 
E
F
 
H
D
 
G
P
 
P
R
 
-
T
 
D
G
 
G
L
 
I
R
 
S
I
 
F
G
 
G
A
 
A
L
 
-
A
 
A
L
 
C
H
 
P
A
 
L
Q
 
S
V
 
I
A
 
V
R
 
E
S
 
K
P
 
T
L
 
L
V
 
V
Q
 
D
A
 
A
-
 
V
-
 
A
H
 
K
Y
 
L
P
 
P
M
 
A
L
 
Q
A
 
K
S
 
T
M
 
E
A
 
V
G
 
F
R
 
R
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
R
-
 
W
V
x
F
A
|
A
N
 
G
P
 
K
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
N
 
S
Q
 
V
G
x
A
T
x
S
I
 
V
G
 
G
G
|
G
N
|
N
L
 
I
C
x
I
Y
x
T
A
 
A
D
 
S
P
 
P
A
 
I
T
 
S
D
|
D
P
 
L
P
 
N
G
 
P
C
 
V
L
 
F
M
 
M
A
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
L
V
 
T
L
 
L
A
 
V
G
 
S
R
 
R
S
 
G
G
 
T
E
 
R
R
 
R
V
 
T
L
 
V
E
 
Q
M
 
M
E
 
D
-
 
H
A
 
T
F
 
F
L
 
F
V
 
P
D
 
G
Y
 
Y
Y
 
R
T
 
K
T
 
T
A
 
L
L
 
L
E
 
S
P
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
I
V
x
L
T
 
L
E
 
S
I
 
I
R
 
E
I
 
I
P
 
P

Sites not aligning to the query:

P47989 Xanthine dehydrogenase/oxidase; EC 1.17.1.4; EC 1.17.3.2 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
27% identity, 51% coverage: 25:172/288 of query aligns to 254:410/1333 of P47989

query
sites
P47989
E
 
D
C
 
A
R
 
K
V
x
L
I
x
V
A
x
V
G
|
G
G
x
N
T
|
T
A
x
E
L
x
I
M
 
G
L
 
I
G
 
E
M
 
M
R
 
K
Q
 
F
R
 
K
M
 
N
L
 
M
M
 
L
P
 
F
T
 
P
H
 
M
L
 
I
V
 
V
S
 
C
L
 
P
G
 
A
Q
 
W
L
 
I
D
 
P
A
 
E
L
 
L
R
 
N
K
 
S
I
 
V
E
 
E
F
 
H
D
 
G
P
 
P
R
 
-
T
 
D
G
 
G
L
 
I
R
 
S
I
 
F
G
 
G
A
 
A
L
 
-
A
 
A
L
 
C
H
 
P
A
 
L
Q
 
S
V
 
I
A
 
V
R
 
E
S
 
K
P
 
T
L
 
L
V
 
V
Q
 
D
A
 
A
-
 
V
-
 
A
H
 
K
Y
 
L
P
 
P
M
 
A
L
 
Q
A
 
K
S
 
T
M
 
E
A
 
V
G
 
F
R
 
R
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
R
-
 
W
V
x
F
A
 
A
N
 
G
P
 
K
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
N
 
S
Q
 
V
G
 
A
T
x
S
I
x
V
G
|
G
G
|
G
N
|
N
L
 
I
C
 
I
Y
 
T
A
 
A
D
 
S
P
 
P
A
 
I
T
 
S
D
|
D
P
 
L
P
 
N
G
 
P
C
 
V
L
 
F
M
 
M
A
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
L
V
 
T
L
 
L
A
 
V
G
 
S
R
 
R
S
 
G
G
 
T
E
 
R
R
 
R
V
 
T
L
 
V
E
 
Q
M
 
M
E
 
D
-
 
H
A
 
T
F
 
F
L
 
F
V
 
P
D
 
G
Y
 
Y
Y
 
R
T
x
K
T
 
T
A
 
L
L
 
L
E
 
S
P
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
I
V
 
L
T
 
L
E
 
S
I
 
I
R
 
E
I
 
I
P
 
P

Sites not aligning to the query:

2e1qA Crystal structure of human xanthine oxidoreductase mutant, glu803val (see paper)
27% identity, 51% coverage: 25:172/288 of query aligns to 228:384/1307 of 2e1qA

query
sites
2e1qA
E
 
D
C
 
A
R
x
K
V
x
L
I
x
V
A
x
V
G
|
G
G
x
N
T
|
T
A
x
E
L
x
I
M
 
G
L
 
I
G
 
E
M
 
M
R
 
K
Q
 
F
R
 
K
M
 
N
L
 
M
M
 
L
P
 
F
T
 
P
H
 
M
L
 
I
V
 
V
S
 
C
L
 
P
G
 
A
Q
 
W
L
 
I
D
 
P
A
 
E
L
 
L
R
 
N
K
 
S
I
 
V
E
 
E
F
 
H
D
 
G
P
 
P
R
 
-
T
 
D
G
 
G
L
 
I
R
 
S
I
 
F
G
 
G
A
 
A
L
 
-
A
 
A
L
 
C
H
 
P
A
 
L
Q
 
S
V
 
I
A
 
V
R
 
E
S
 
K
P
 
T
L
 
L
V
 
V
Q
 
D
A
 
A
-
 
V
-
 
A
H
 
K
Y
 
L
P
 
P
M
 
A
L
 
Q
A
 
K
S
 
T
M
 
E
A
 
V
G
 
F
R
 
R
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
R
-
 
W
V
x
F
A
|
A
N
 
G
P
 
K
Q
 
Q
V
|
V
R
 
K
N
 
S
Q
 
V
G
x
A
T
x
S
I
 
V
G
 
G
G
|
G
N
|
N
L
 
I
C
x
I
Y
x
T
A
 
A
D
 
S
P
 
P
A
 
I
T
x
S
D
|
D
P
 
L
P
 
N
G
 
P
C
 
V
L
 
F
M
 
M
A
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
L
V
 
T
L
 
L
A
 
V
G
 
S
R
 
R
S
 
G
G
 
T
E
 
R
R
 
R
V
 
T
L
 
V
E
 
Q
M
 
M
E
 
D
-
 
H
A
 
T
F
 
F
L
 
F
V
 
P
D
 
G
Y
 
Y
Y
 
R
T
 
K
T
 
T
A
 
L
L
 
L
E
 
S
P
 
P
D
 
E
E
 
E
I
|
I
V
x
L
T
 
L
E
 
S
I
 
I
R
 
E
I
 
I
P
 
P

Sites not aligning to the query:

2e3tA Crystal structure of rat xanthine oxidoreductase mutant (w335a and f336l) (see paper)
28% identity, 51% coverage: 25:172/288 of query aligns to 226:382/1291 of 2e3tA

query
sites
2e3tA
E
 
D
C
 
A
R
x
K
V
x
L
I
x
V
A
x
V
G
|
G
G
x
N
T
|
T
A
x
E
L
x
I
M
 
G
L
 
I
G
 
E
M
 
M
R
 
K
-
 
F
Q
 
K
R
 
N
M
 
M
L
 
L
M
 
F
P
 
P
T
 
L
H
 
-
L
 
I
V
 
V
S
 
C
L
 
P
G
 
A
Q
 
W
L
 
I
D
 
P
A
 
E
L
 
L
R
 
N
K
 
S
I
 
V
E
 
V
F
 
H
D
 
G
P
 
P
R
 
E
T
 
-
G
 
G
L
 
I
R
 
S
I
 
F
G
 
G
A
 
A
L
 
S
-
 
C
-
 
P
-
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
S
A
 
V
L
 
L
H
 
A
A
 
E
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
K
S
 
L
P
 
P
-
 
E
-
 
Q
-
 
K
-
 
T
-
 
E
L
 
V
V
 
F
Q
 
R
A
 
G
H
 
V
Y
 
M
P
 
E
M
 
Q
L
 
L
A
 
R
S
 
A
M
x
L
A
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
-
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
N
 
S
Q
 
V
G
x
A
T
x
S
I
 
I
G
 
G
G
|
G
N
|
N
L
 
I
C
x
I
Y
x
T
A
 
A
D
 
S
P
 
P
A
 
I
T
x
S
D
|
D
P
 
L
P
 
N
G
 
P
C
 
V
L
 
F
M
 
M
A
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
L
V
 
T
L
 
L
A
 
V
G
 
S
R
 
R
S
 
G
G
 
T
E
 
R
R
 
R
V
 
T
L
 
V
E
 
R
M
 
M
E
 
D
-
 
H
A
 
T
F
 
F
L
 
F
V
 
P
D
 
G
Y
 
Y
Y
 
R
T
 
K
T
 
T
A
 
L
L
 
L
E
 
R
P
 
P
D
 
E
E
 
E
I
|
I
V
x
L
T
 
L
E
 
S
I
 
I
R
 
E
I
 
I
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>RR42_RS13625 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS13625
MRNFEFLEPGSVPEASRMLADLGDECRVIAGGTALMLGMRQRMLMPTHLVSLGQLDALRK
IEFDPRTGLRIGALALHAQVARSPLVQAHYPMLASMAGRVANPQVRNQGTIGGNLCYADP
ATDPPGCLMALGAQVVLAGRSGERVLEMEAFLVDYYTTALEPDEIVTEIRIPALAPDALG
HYARFLRTAAEHRPLASVSLLARRTGATCIEARLAVGASTPIPARLRRAEAFLAGKAVTP
EVAAEAADIVAADIDPVSDMRGNADYRREMVRTVARRSIATLFGLATD

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory