SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS17475 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS17475 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q9X1K9 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
36% identity, 90% coverage: 16:289/303 of query aligns to 9:290/294 of Q9X1K9

query
sites
Q9X1K9
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
F
Q
 
K
G
 
N
G
 
G
E
 
E
P
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
E
C
 
S
A
 
Y
Q
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
V
A
 
R
H
 
Y
Y
 
Q
V
 
L
A
 
E
S
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
N
G
 
A
L
 
L
V
 
I
I
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
S
G
 
P
L
 
T
L
 
V
T
 
N
R
 
E
D
 
D
E
 
E
R
 
R
L
 
E
M
 
K
F
 
L
T
 
V
A
 
S
A
 
R
V
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
K
L
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
G
 
T
V
 
N
D
 
S
T
 
T
R
 
E
V
 
K
V
 
T
C
 
L
E
 
K
Q
 
L
V
 
V
R
 
K
Q
 
Q
L
 
A
D
 
E
R
 
K
F
 
L
D
 
G
L
 
A
A
 
N
G
 
G
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
P
 
V
P
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
L
 
N
R
 
K
P
 
P
G
 
T
D
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
W
 
Q
H
 
H
V
 
Y
E
 
K
R
 
Y
V
 
I
A
 
S
D
 
E
A
 
R
T
 
T
W
 
D
R
 
L
P
 
G
L
 
I
M
 
V
L
 
V
Y
 
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
K
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
C
 
V
N
 
N
M
 
V
S
 
L
P
 
P
A
 
E
L
 
T
V
 
A
Q
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
A
A
 
A
H
 
D
-
 
L
P
 
K
R
 
N
V
 
V
V
 
V
A
 
G
V
 
I
K
 
K
E
 
E
C
 
A
D
 
N
-
 
P
-
x
D
-
x
I
-
x
D
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
-
 
R
A
 
T
A
 
V
G
 
S
L
 
L
R
 
T
A
 
K
L
 
Q
A
 
A
G
 
R
N
 
S
D
 
D
R
 
-
L
 
F
A
 
M
V
 
V
F
 
W
C
 
S
G
 
G
E
 
N
D
 
D
A
 
D
A
 
R
M
 
T
L
 
F
D
 
Y
H
 
L
L
 
L
L
 
C
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
I
P
 
S
A
 
V
C
 
V
A
 
S
H
 
N
I
 
V
R
 
A
P
 
P
D
 
K
L
 
Q
F
 
M
V
 
V
R
 
E
L
 
L
L
 
C
Q
 
A
L
 
E
V
 
Y
A
 
F
Q
 
S
G
 
G
R
 
N
V
 
L
A
 
E
A
 
K
A
 
S
R
 
R
A
 
E
L
 
V
F
 
H
A
 
R
S
 
K
L
 
L
A
 
R
P
 
P
L
 
L
I
 
M
S
 
K
L
 
A
L
 
L
F
 
F
S
 
V
E
 
E
P
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
N
L
 
L
C
 
M
G
 
G
L
 
F
A
 
I
S
 
E
S
 
N
E
 
E
V
 
L
R
 
R
R
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
S
R
 
E
A
 
K
L
 
T
R
 
V
E
 
E
R
 
L
L
 
L
D
 
R
Q
 
N
V
 
V
I
 
L
A
 
K
S
 
E

1o5kA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase (tm1521) from thermotoga maritima at 1.80 a resolution
36% identity, 90% coverage: 16:289/303 of query aligns to 10:291/295 of 1o5kA

query
sites
1o5kA
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
F
Q
 
K
G
 
N
G
 
G
E
 
E
P
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
E
C
 
S
A
 
Y
Q
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
V
A
 
R
H
 
Y
Y
 
Q
V
 
L
A
 
E
S
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
N
G
 
A
L
 
L
V
 
I
I
 
V
L
 
L
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
S
G
 
P
L
 
T
L
 
V
T
 
N
R
 
E
D
 
D
E
 
E
R
 
R
L
 
E
M
 
K
F
 
L
T
 
V
A
 
S
A
 
R
V
 
T
L
 
L
E
|
E
A
 
I
V
 
V
D
|
D
G
 
G
A
 
K
L
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
G
 
T
V
 
N
D
 
S
T
 
T
R
 
E
V
 
K
V
 
T
C
 
L
E
 
K
Q
 
L
V
 
V
R
 
K
Q
 
Q
L
 
A
D
 
E
R
 
K
F
 
L
D
 
G
L
 
A
A
 
N
G
 
G
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
P
 
V
P
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
L
 
N
R
 
K
P
 
P
G
 
T
D
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
W
 
Q
H
 
H
V
 
Y
E
 
K
R
 
Y
V
 
I
A
 
S
D
 
E
A
 
R
T
 
T
W
 
D
R
 
L
P
 
G
L
 
I
M
 
V
L
 
V
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
K
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
C
 
V
N
 
N
M
 
V
S
 
L
P
 
P
A
 
E
L
 
T
V
 
A
Q
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
A
A
 
A
H
 
D
-
 
L
P
 
K
R
 
N
V
 
V
V
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
E
 
E
C
 
A
D
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
I
-
 
D
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
-
 
R
A
 
T
A
 
V
G
 
S
L
 
L
R
 
T
A
 
K
L
 
Q
A
 
A
G
 
R
N
 
S
D
 
D
R
 
-
L
 
F
A
 
M
V
 
V
F
 
W
C
 
S
G
 
G
E
 
N
D
 
D
A
 
D
A
 
R
M
 
T
L
 
F
D
 
Y
H
 
L
L
 
L
L
 
C
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
D
G
 
G
V
 
V
V
x
I
P
 
S
A
 
V
C
 
V
A
 
S
H
 
N
I
 
V
R
 
A
P
 
P
D
 
K
L
 
Q
F
 
M
V
 
V
R
 
E
L
 
L
L
 
C
Q
 
A
L
 
E
V
 
Y
A
 
F
Q
 
S
G
 
G
R
 
N
V
 
L
A
 
E
A
 
K
A
 
S
R
 
R
A
 
E
L
 
V
F
 
H
A
 
R
S
 
K
L
 
L
A
 
R
P
 
P
L
 
L
I
 
M
S
 
K
L
 
A
L
 
L
F
 
F
S
 
V
E
 
E
P
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
N
L
 
L
C
 
M
G
 
G
L
 
F
A
 
I
S
 
E
S
 
N
E
 
E
V
 
L
R
 
R
R
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
S
R
 
E
A
 
K
L
 
T
R
 
V
E
 
E
R
 
L
L
 
L
D
 
R
Q
 
N
V
 
V
I
 
L
A
 
K
S
 
E

4fhaA Structure of dihydrodipicolinate synthase from streptococcus pneumoniae,bound to pyruvate and lysine
34% identity, 90% coverage: 16:287/303 of query aligns to 14:290/307 of 4fhaA

query
sites
4fhaA
L
 
F
V
 
I
T
 
T
P
 
P
M
 
F
-
 
H
Q
 
E
G
 
D
G
 
G
E
 
S
P
 
I
D
 
N
L
 
F
A
 
D
C
 
A
A
 
I
Q
 
P
R
 
A
L
 
L
A
 
I
A
 
E
H
 
H
Y
 
L
V
 
L
A
 
A
S
 
H
G
 
H
V
 
T
D
 
D
G
 
G
L
 
I
V
 
L
I
 
L
L
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
A
E
 
E
G
x
S
G
x
P
L
 
T
L
|
L
T
 
T
R
x
H
D
 
D
E
 
E
R
x
E
L
 
L
M
 
E
F
 
L
T
 
F
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
Q
E
 
K
A
 
V
V
 
V
D
 
N
G
 
G
A
 
R
L
 
V
P
 
P
V
 
L
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
T
V
 
N
D
 
D
T
 
T
R
 
R
V
 
D
V
 
S
C
 
I
E
 
E
Q
 
F
V
 
V
R
 
K
Q
 
E
L
 
V
D
 
A
R
 
E
F
 
F
D
 
G
-
 
G
L
 
F
A
 
A
G
 
A
Y
 
G
L
 
L
V
 
A
P
 
I
P
 
V
P
 
P
Y
|
Y
Y
 
Y
L
 
N
R
 
K
P
 
P
G
 
S
D
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
M
A
 
Y
W
 
Q
H
 
H
V
 
F
E
 
K
R
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
W
 
D
R
 
L
P
 
P
L
 
I
M
 
I
L
 
I
Y
 
Y
N
 
N
V
 
I
P
 
P
K
 
G
R
 
R
T
 
V
G
 
V
C
 
V
N
 
E
M
 
L
S
 
T
P
 
P
A
 
E
L
 
T
V
 
M
Q
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
D
H
 
H
P
 
P
R
 
N
V
 
I
V
 
I
A
 
G
V
 
V
K
 
K
E
 
E
C
 
C
D
 
T
A
 
S
-
 
L
A
 
A
G
 
N
L
 
M
R
 
A
A
 
Y
L
 
L
A
 
I
G
 
E
N
 
H
-
 
K
-
 
P
D
 
E
R
 
E
L
 
F
A
 
L
V
 
I
F
 
Y
C
 
T
G
 
G
E
 
E
D
 
D
A
 
G
A
 
D
M
 
A
L
 
F
D
 
H
H
 
A
L
 
M
L
 
N
A
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
I
P
 
S
A
 
V
C
 
A
A
 
S
H
 
H
I
 
T
R
 
N
P
 
G
D
 
D
L
 
E
F
 
M
V
 
H
R
 
E
L
 
M
L
 
F
Q
 
T
L
 
A
V
 
I
A
 
A
Q
 
E
G
 
S
R
 
D
V
 
M
A
 
K
A
 
K
A
 
A
R
 
A
A
 
A
L
 
I
F
 
Q
A
 
R
S
 
K
L
 
F
A
 
I
P
 
P
L
 
K
I
 
V
S
 
N
L
 
A
L
 
L
F
 
F
S
 
S
E
 
Y
P
 
P
N
 
S
P
 
P
A
 
A
P
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
A
A
 
I
L
 
L
A
 
N
L
 
Y
C
 
M
G
 
G
L
 
F
A
 
E
S
 
A
S
 
G
E
 
P
V
 
T
R
 
R
R
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
P
R
 
E
A
 
E
L
 
D
R
 
V
E
 
K
R
 
R
L
 
I
D
 
I
Q
 
K
V
 
V
I
 
V

5t25A Kinetic, spectral and structural characterization of the slow binding inhibitor acetopyruvate with dihydrodipicolinate synthase from escherichia coli.
35% identity, 88% coverage: 16:283/303 of query aligns to 10:283/293 of 5t25A

query
sites
5t25A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
M
-
 
D
Q
 
E
G
 
K
G
 
G
E
 
N
P
 
V
D
 
C
L
 
R
A
 
A
C
 
S
A
 
L
Q
 
K
R
 
K
L
 
L
A
 
I
A
 
D
H
 
Y
Y
 
H
V
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
T
D
 
S
G
 
A
L
 
I
V
 
V
I
 
S
L
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
S
G
x
A
L
 
T
L
|
L
T
 
N
R
x
H
D
 
D
E
 
E
R
 
H
L
 
A
M
 
D
F
 
V
T
 
V
A
 
M
A
 
M
V
 
T
L
 
L
E
 
D
A
 
L
V
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
R
L
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
V
x
N
D
 
A
T
 
T
R
 
A
V
x
E
V
 
A
C
 
I
E
 
S
Q
 
L
V
 
T
R
 
Q
Q
 
R
L
 
F
D
 
N
R
 
D
F
 
S
D
 
G
L
 
I
A
 
V
G
 
G
Y
 
C
L
 
L
V
 
T
P
 
V
P
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
L
 
N
R
 
R
P
 
P
G
 
S
D
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
W
 
Q
H
 
H
V
 
F
E
 
K
R
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
H
T
 
T
W
 
D
R
 
L
P
 
P
L
 
Q
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
K
 
S
R
|
R
T
 
T
G
 
G
C
 
C
N
 
D
M
 
L
S
 
L
P
 
P
A
 
E
L
 
T
V
 
V
Q
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
K
H
 
V
P
 
K
R
 
N
V
 
I
V
 
I
A
 
G
V
 
I
K
|
K
E
 
E
C
 
A
D
 
T
A
 
G
-
 
N
-
 
L
-
 
T
-
 
R
-
 
V
A
 
N
G
 
Q
L
 
I
R
 
K
A
 
E
L
 
L
A
 
V
G
 
S
N
 
D
D
 
D
R
 
-
L
 
F
A
 
V
V
 
L
F
 
L
C
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
S
M
 
A
L
 
L
D
 
D
H
 
F
L
 
M
L
 
Q
A
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
H
G
 
G
V
 
V
V
x
I
P
 
S
A
 
V
C
 
T
A
 
A
H
 
N
I
 
V
R
 
A
P
 
A
D
 
R
L
 
D
F
 
M
V
 
A
R
 
Q
L
 
M
L
 
C
Q
 
K
L
 
L
V
 
A
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
R
 
H
V
 
F
A
 
A
A
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
V
L
 
I
F
 
N
A
 
Q
S
 
R
L
 
L
A
 
M
P
 
P
L
 
L
I
 
H
S
 
N
L
 
K
L
 
L
F
 
F
S
 
V
E
 
E
P
 
P
N
 
N
P
 
P
A
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
W
A
 
A
L
 
C
A
 
K
L
 
E
C
 
L
G
 
G
L
 
L
-
 
V
A
 
A
S
 
T
S
 
D
E
 
T
V
 
L
R
 
R
R
 
L
P
 
P
L
 
M
V
 
T
P
 
P
A
 
I
S
 
T
R
 
D
A
 
S
L
 
G
R
 
R
E
 
E
R
 
T
L
 
V

2atsA Dihydrodipicolinate synthase co-crystallised with (s)-lysine
35% identity, 88% coverage: 16:283/303 of query aligns to 9:282/292 of 2atsA

query
sites
2atsA
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
M
-
 
D
Q
 
E
G
 
K
G
 
G
E
 
N
P
 
V
D
 
C
L
 
R
A
 
A
C
 
S
A
 
L
Q
 
K
R
 
K
L
 
L
A
 
I
A
 
D
H
 
Y
Y
 
H
V
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
T
D
 
S
G
 
A
L
 
I
V
 
V
I
 
S
L
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
S
G
x
A
L
 
T
L
|
L
T
 
N
R
x
H
D
 
D
E
 
E
R
x
H
L
 
A
M
 
D
F
 
V
T
 
V
A
 
M
A
 
M
V
 
T
L
 
L
E
 
D
A
 
L
V
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
R
L
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
V
x
N
D
 
A
T
 
T
R
 
A
V
x
E
V
 
A
C
 
I
E
 
S
Q
 
L
V
 
T
R
 
Q
Q
 
R
L
 
F
D
 
N
R
 
D
F
 
S
D
 
G
L
 
I
A
 
V
G
 
G
Y
 
C
L
 
L
V
 
T
P
 
V
P
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
L
 
N
R
 
R
P
 
P
G
 
S
D
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
W
 
Q
H
 
H
V
 
F
E
 
K
R
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
H
T
 
T
W
 
D
R
 
L
P
 
P
L
 
Q
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
K
 
S
R
|
R
T
 
T
G
 
G
C
 
C
N
 
D
M
 
L
S
 
L
P
 
P
A
 
E
L
 
T
V
 
V
Q
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
K
H
 
V
P
 
K
R
 
N
V
 
I
V
 
I
A
 
G
V
 
I
K
|
K
E
 
E
C
 
A
D
 
T
A
 
G
-
 
N
-
 
L
-
 
T
-
 
R
-
 
V
A
 
N
G
 
Q
L
 
I
R
 
K
A
 
E
L
 
L
A
 
V
G
 
S
N
 
D
D
 
D
R
 
-
L
 
F
A
 
V
V
 
L
F
 
L
C
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
S
M
 
A
L
 
L
D
 
D
H
 
F
L
 
M
L
 
Q
A
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
H
G
 
G
V
 
V
V
x
I
P
 
S
A
 
V
C
 
T
A
 
A
H
 
N
I
 
V
R
 
A
P
 
A
D
 
R
L
 
D
F
 
M
V
 
A
R
 
Q
L
 
M
L
 
C
Q
 
K
L
 
L
V
 
A
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
R
 
H
V
 
F
A
 
A
A
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
V
L
 
I
F
 
N
A
 
Q
S
 
R
L
 
L
A
 
M
P
 
P
L
 
L
I
 
H
S
 
N
L
 
K
L
 
L
F
 
F
S
 
V
E
 
E
P
 
P
N
 
N
P
 
P
A
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
W
A
 
A
L
 
C
A
 
K
L
 
E
C
 
L
G
 
G
L
 
L
-
 
V
A
 
A
S
 
T
S
 
D
E
 
T
V
 
L
R
 
R
R
 
L
P
 
P
L
 
M
V
 
T
P
 
P
A
 
I
S
 
T
R
 
D
A
 
S
L
 
G
R
 
R
E
 
E
R
 
T
L
 
V

P0A6L2 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Escherichia coli (strain K12) (see 7 papers)
35% identity, 88% coverage: 16:283/303 of query aligns to 9:282/292 of P0A6L2

query
sites
P0A6L2
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
M
-
 
D
Q
 
E
G
 
K
G
 
G
E
 
N
P
 
V
D
 
C
L
 
R
A
 
A
C
 
S
A
 
L
Q
 
K
R
 
K
L
 
L
A
 
I
A
 
D
H
 
Y
Y
 
H
V
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
T
D
 
S
G
 
A
L
 
I
V
 
V
I
 
S
L
 
V
G
 
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
G
 
S
G
 
A
L
 
T
L
 
L
T
 
N
R
 
H
D
 
D
E
 
E
R
 
H
L
 
A
M
 
D
F
 
V
T
 
V
A
 
M
A
 
M
V
 
T
L
 
L
E
 
D
A
 
L
V
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
R
L
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
N
D
 
A
T
 
T
R
 
A
V
 
E
V
 
A
C
 
I
E
 
S
Q
 
L
V
 
T
R
 
Q
Q
 
R
L
 
F
D
 
N
R
 
D
F
 
S
D
 
G
L
 
I
A
 
V
G
 
G
Y
 
C
L
 
L
V
 
T
P
 
V
P
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
L
 
N
R
 
R
P
 
P
G
 
S
D
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
W
 
Q
H
 
H
V
 
F
E
 
K
R
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
H
T
 
T
W
 
D
R
 
L
P
 
P
L
 
Q
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
K
 
S
R
|
R
T
 
T
G
 
G
C
 
C
N
 
D
M
 
L
S
 
L
P
 
P
A
 
E
L
 
T
V
 
V
Q
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
K
H
 
V
P
 
K
R
 
N
V
 
I
V
 
I
A
 
G
V
 
I
K
|
K
E
 
E
C
 
A
D
 
T
A
 
G
-
 
N
-
 
L
-
 
T
-
 
R
-
 
V
A
 
N
G
 
Q
L
 
I
R
 
K
A
 
E
L
 
L
A
 
V
G
 
S
N
 
D
D
 
D
R
 
-
L
 
F
A
 
V
V
 
L
F
 
L
C
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
S
M
 
A
L
 
L
D
 
D
H
 
F
L
 
M
L
 
Q
A
x
L
G
 
G
G
 
G
G
 
H
G
 
G
V
 
V
V
x
I
P
 
S
A
 
V
C
 
T
A
 
A
H
 
N
I
 
V
R
 
A
P
 
A
D
 
R
L
 
D
F
 
M
V
 
A
R
 
Q
L
 
M
L
 
C
Q
 
K
L
 
L
V
 
A
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
R
 
H
V
 
F
A
 
A
A
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
V
L
 
I
F
 
N
A
 
Q
S
 
R
L
 
L
A
 
M
P
 
P
L
 
L
I
 
H
S
 
N
L
 
K
L
 
L
F
 
F
S
 
V
E
 
E
P
 
P
N
 
N
P
 
P
A
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
W
A
 
A
L
 
C
A
 
K
L
 
E
C
 
L
G
 
G
L
 
L
-
 
V
A
 
A
S
 
T
S
 
D
E
 
T
V
 
L
R
 
R
R
 
L
P
 
P
L
 
M
V
 
T
P
 
P
A
 
I
S
 
T
R
 
D
A
 
S
L
 
G
R
 
R
E
 
E
R
 
T
L
 
V

3i7sA Dihydrodipicolinate synthase mutant - k161a - with the substrate pyruvate bound in the active site. (see paper)
35% identity, 88% coverage: 16:283/303 of query aligns to 9:282/292 of 3i7sA

query
sites
3i7sA
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
M
-
 
D
Q
 
E
G
 
K
G
 
G
E
 
N
P
 
V
D
 
C
L
 
R
A
 
A
C
 
S
A
 
L
Q
 
K
R
 
K
L
 
L
A
 
I
A
 
D
H
 
Y
Y
 
H
V
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
T
D
 
S
G
 
A
L
 
I
V
 
V
I
 
S
L
 
V
G
 
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
G
 
S
G
 
A
L
 
T
L
 
L
T
 
N
R
 
H
D
 
D
E
 
E
R
 
H
L
 
A
M
 
D
F
 
V
T
 
V
A
 
M
A
 
M
V
 
T
L
 
L
E
 
D
A
 
L
V
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
R
L
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
N
D
 
A
T
 
T
R
 
A
V
 
E
V
 
A
C
 
I
E
 
S
Q
 
L
V
 
T
R
 
Q
Q
 
R
L
 
F
D
 
N
R
 
D
F
 
S
D
 
G
L
 
I
A
 
V
G
 
G
Y
 
C
L
 
L
V
 
T
P
 
V
P
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
L
 
N
R
 
R
P
 
P
G
 
S
D
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
W
 
Q
H
 
H
V
 
F
E
 
K
R
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
H
T
 
T
W
 
D
R
 
L
P
 
P
L
 
Q
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
K
 
S
R
|
R
T
 
T
G
 
G
C
 
C
N
 
D
M
 
L
S
 
L
P
 
P
A
 
E
L
 
T
V
 
V
Q
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
K
H
 
V
P
 
K
R
 
N
V
 
I
V
 
I
A
 
G
V
 
I
K
x
R
E
 
E
C
 
A
D
 
T
A
 
G
-
 
N
-
 
L
-
 
T
-
 
R
-
 
V
A
 
N
G
 
Q
L
 
I
R
 
K
A
 
E
L
 
L
A
 
V
G
 
S
N
 
D
D
 
D
R
 
-
L
 
F
A
 
V
V
 
L
F
 
L
C
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
S
M
 
A
L
 
L
D
 
D
H
 
F
L
 
M
L
 
Q
A
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
H
G
 
G
V
 
V
V
x
I
P
 
S
A
 
V
C
 
T
A
 
A
H
 
N
I
 
V
R
 
A
P
 
A
D
 
R
L
 
D
F
 
M
V
 
A
R
 
Q
L
 
M
L
 
C
Q
 
K
L
 
L
V
 
A
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
R
 
H
V
 
F
A
 
A
A
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
V
L
 
I
F
 
N
A
 
Q
S
 
R
L
 
L
A
 
M
P
 
P
L
 
L
I
 
H
S
 
N
L
 
K
L
 
L
F
 
F
S
 
V
E
 
E
P
 
P
N
 
N
P
 
P
A
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
W
A
 
A
L
 
C
A
 
K
L
 
E
C
 
L
G
 
G
L
 
L
-
 
V
A
 
A
S
 
T
S
 
D
E
 
T
V
 
L
R
 
R
R
 
L
P
 
P
L
 
M
V
 
T
P
 
P
A
 
I
S
 
T
R
 
D
A
 
S
L
 
G
R
 
R
E
 
E
R
 
T
L
 
V

Sites not aligning to the query:

5ktlA Dihydrodipicolinate synthase from the industrial and evolutionarily important cyanobacteria anabaena variabilis. (see paper)
34% identity, 92% coverage: 11:290/303 of query aligns to 7:292/295 of 5ktlA

query
sites
5ktlA
T
 
T
L
 
V
W
 
L
L
 
T
P
 
A
L
 
M
V
 
I
T
 
T
P
 
P
M
 
F
Q
 
K
G
 
A
-
 
D
G
 
G
E
 
S
P
 
V
D
 
N
L
 
Y
A
 
A
C
 
V
A
 
A
Q
 
A
R
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
H
 
H
Y
 
L
V
 
V
A
 
D
S
 
N
G
 
G
V
 
T
D
 
D
G
 
T
L
 
L
V
 
V
I
 
V
L
 
C
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
x
S
G
 
P
L
 
T
L
|
L
T
 
S
R
 
W
D
 
D
E
 
E
R
x
E
L
 
Y
M
 
N
F
 
L
T
 
F
A
 
V
A
x
E
V
 
V
L
 
L
E
x
Q
A
 
T
V
 
V
D
 
A
G
 
G
A
 
K
L
 
A
P
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
C
G
 
G
G
 
S
V
 
N
D
 
S
T
 
T
R
 
K
V
 
E
V
 
A
C
 
I
E
 
A
Q
 
A
V
 
T
R
 
Q
Q
 
K
L
 
A
D
 
A
R
 
K
F
 
I
D
 
G
L
 
V
A
 
H
G
 
G
Y
 
T
L
 
L
V
 
Q
P
 
V
P
 
V
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
L
 
N
R
 
K
P
 
P
G
 
P
D
 
Q
E
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
W
 
Q
H
 
H
V
 
F
E
 
Q
R
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
T
 
C
W
 
P
R
 
D
-
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
L
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
K
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
C
 
Q
N
 
N
M
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
E
L
 
T
V
 
V
Q
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
E
H
 
I
P
 
D
R
 
N
V
 
I
V
 
I
A
 
G
V
 
V
K
|
K
E
 
E
C
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
N
-
 
L
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
E
R
 
I
A
 
R
L
 
R
A
 
S
G
 
T
N
 
P
D
 
K
R
 
E
L
 
F
A
 
Q
V
 
I
F
 
Y
C
 
A
G
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
S
A
 
L
M
 
T
L
 
L
D
 
P
H
 
L
L
 
L
L
 
A
A
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
K
G
 
G
V
 
V
V
|
V
P
 
S
A
 
V
C
 
A
A
 
S
H
 
H
I
 
L
R
 
V
P
 
G
D
 
N
L
 
Q
F
 
L
V
 
Q
R
 
Q
L
 
M
L
 
I
Q
 
Q
L
 
A
V
 
F
A
 
N
Q
 
S
G
 
G
R
 
Q
V
 
V
A
 
T
A
 
V
A
 
A
R
 
S
A
 
D
L
 
I
F
 
H
A
 
L
S
 
R
L
 
L
A
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
F
S
 
K
L
 
A
L
 
L
F
 
F
S
 
I
E
 
T
P
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
I
P
 
P
V
 
I
K
 
K
S
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
K
L
 
L
C
 
Q
G
 
G
L
 
W
A
 
E
S
 
V
S
 
G
E
 
S
V
 
T
R
 
R
R
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
S
P
 
D
A
 
A
S
 
D
R
 
A
A
 
E
L
 
V
R
 
S
E
 
Q
R
 
K
L
 
L
D
 
E
Q
 
A
V
 
V
I
 
M
A
 
K
S
 
H
L
 
L

4dxvA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with mg and cl ions at 1.80 a resolution
32% identity, 88% coverage: 16:283/303 of query aligns to 9:281/291 of 4dxvA

query
sites
4dxvA
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
M
-
 
L
Q
 
K
G
 
D
G
 
G
E
 
G
P
 
V
D
 
D
L
 
W
A
 
K
C
 
S
A
 
L
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
V
A
 
E
H
 
W
Y
 
H
V
 
I
A
 
E
S
 
Q
G
 
G
V
 
T
D
 
N
G
 
S
L
 
I
V
 
V
I
 
A
L
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
A
G
 
S
L
 
T
L
 
L
T
 
S
R
 
M
D
 
E
E
 
E
R
 
H
L
 
T
M
 
Q
F
 
V
T
 
I
A
 
K
A
 
E
V
 
I
L
 
I
E
 
R
A
 
V
V
 
A
D
 
N
G
 
K
A
 
R
L
 
I
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
N
D
 
S
T
 
T
R
 
R
V
 
E
V
 
A
C
 
I
E
 
E
Q
 
L
V
 
T
R
 
K
Q
 
A
L
 
A
D
 
K
R
 
D
F
 
L
D
 
G
L
 
A
A
 
D
G
 
A
Y
 
A
L
 
L
V
 
L
P
 
V
P
x
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
L
 
N
R
 
K
P
 
P
G
 
T
D
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
W
 
Q
H
 
H
V
 
Y
E
 
K
R
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
W
 
E
R
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
|
N
V
|
V
P
|
P
K
 
G
R
|
R
T
|
T
G
 
G
C
 
V
N
 
D
M
 
L
S
 
S
P
 
N
A
 
D
L
 
T
V
 
A
Q
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
E
H
 
I
P
 
P
R
 
N
V
 
I
V
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
E
 
D
C
 
A
-
 
T
-
 
G
D
 
D
A
 
V
A
 
P
G
 
R
L
 
G
R
 
K
A
 
A
L
 
L
-
 
I
-
 
D
A
 
A
G
 
L
N
 
N
D
 
G
R
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
C
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
E
A
 
T
M
 
A
L
 
W
D
 
E
H
 
L
L
 
M
L
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
D
G
 
G
V
 
N
V
x
I
P
 
S
A
 
V
C
 
T
A
 
A
H
 
N
I
 
I
R
 
A
P
 
P
D
 
K
L
 
A
F
 
M
V
 
S
R
 
E
L
 
V
L
 
C
Q
 
A
L
 
V
V
 
A
A
 
I
Q
 
A
G
 
K
R
 
D
V
 
E
A
 
Q
A
 
Q
A
 
A
R
 
K
A
 
T
L
 
L
F
 
N
A
 
N
S
 
K
L
 
I
A
 
A
P
 
N
L
 
L
I
 
H
S
 
N
L
 
I
L
 
L
F
 
F
S
 
C
E
 
E
P
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
W
A
 
A
L
 
L
A
 
H
L
 
E
C
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
I
S
 
D
S
 
T
E
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
T
P
 
P
A
 
L
S
 
A
R
 
E
A
 
Q
L
 
Y
R
 
R
E
 
E
R
 
P
L
 
L

3u8gA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with oxalic acid at 1.80 a resolution
32% identity, 88% coverage: 16:283/303 of query aligns to 9:281/291 of 3u8gA

query
sites
3u8gA
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
M
-
 
L
Q
 
K
G
 
D
G
 
G
E
 
G
P
 
V
D
 
D
L
 
W
A
 
K
C
 
S
A
 
L
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
V
A
 
E
H
 
W
Y
 
H
V
 
I
A
 
E
S
 
Q
G
 
G
V
 
T
D
 
N
G
 
S
L
 
I
V
 
V
I
 
A
L
 
V
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
G
 
A
G
 
S
L
 
T
L
 
L
T
 
S
R
 
M
D
 
E
E
 
E
R
 
H
L
 
T
M
 
Q
F
 
V
T
 
I
A
 
K
A
 
E
V
 
I
L
 
I
E
 
R
A
 
V
V
 
A
D
 
N
G
 
K
A
 
R
L
 
I
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
N
D
 
S
T
 
T
R
 
R
V
 
E
V
 
A
C
 
I
E
 
E
Q
 
L
V
 
T
R
 
K
Q
 
A
L
 
A
D
 
K
R
 
D
F
 
L
D
 
G
L
 
A
A
 
D
G
 
A
Y
 
A
L
|
L
V
 
L
P
 
V
P
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
L
 
N
R
 
K
P
 
P
G
 
T
D
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
W
 
Q
H
 
H
V
 
Y
E
 
K
R
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
W
 
E
R
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
K
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
C
 
V
N
 
D
M
 
L
S
 
S
P
 
N
A
 
D
L
 
T
V
 
A
Q
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
E
H
 
I
P
 
P
R
 
N
V
 
I
V
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
E
 
D
C
 
A
-
 
T
-
 
G
D
 
D
A
 
V
A
 
P
G
 
R
L
 
G
R
 
K
A
 
A
L
 
L
-
 
I
-
 
D
A
 
A
G
 
L
N
 
N
D
 
G
R
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
C
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
E
A
 
T
M
 
A
L
 
W
D
 
E
H
 
L
L
 
M
L
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
D
G
 
G
V
 
N
V
x
I
P
 
S
A
 
V
C
 
T
A
 
A
H
 
N
I
 
I
R
 
A
P
 
P
D
 
K
L
 
A
F
 
M
V
 
S
R
 
E
L
 
V
L
 
C
Q
 
A
L
 
V
V
 
A
A
 
I
Q
 
A
G
 
K
R
 
D
V
 
E
A
 
Q
A
 
Q
A
 
A
R
 
K
A
 
T
L
 
L
F
 
N
A
 
N
S
 
K
L
 
I
A
 
A
P
 
N
L
 
L
I
 
H
S
 
N
L
 
I
L
 
L
F
 
F
S
 
C
E
 
E
P
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
W
A
 
A
L
 
L
A
 
H
L
 
E
C
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
I
S
 
D
S
 
T
E
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
T
P
 
P
A
 
L
S
 
A
R
 
E
A
 
Q
L
 
Y
R
 
R
E
 
E
R
 
P
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3tdfA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 2-ketobutanoic acid at 1.99 a resolution
32% identity, 88% coverage: 16:283/303 of query aligns to 9:281/291 of 3tdfA

query
sites
3tdfA
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
M
-
 
L
Q
 
K
G
 
D
G
 
G
E
 
G
P
 
V
D
 
D
L
 
W
A
 
K
C
 
S
A
 
L
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
V
A
 
E
H
 
W
Y
 
H
V
 
I
A
 
E
S
 
Q
G
 
G
V
 
T
D
 
N
G
 
S
L
 
I
V
 
V
I
 
A
L
 
V
G
 
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
G
 
A
G
 
S
L
 
T
L
 
L
T
 
S
R
 
M
D
 
E
E
 
E
R
 
H
L
 
T
M
 
Q
F
 
V
T
 
I
A
 
K
A
 
E
V
 
I
L
 
I
E
 
R
A
 
V
V
 
A
D
 
N
G
 
K
A
 
R
L
 
I
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
N
D
 
S
T
 
T
R
 
R
V
 
E
V
 
A
C
 
I
E
 
E
Q
 
L
V
 
T
R
 
K
Q
 
A
L
 
A
D
 
K
R
 
D
F
 
L
D
 
G
L
 
A
A
 
D
G
 
A
Y
 
A
L
 
L
V
 
L
P
 
V
P
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
L
 
N
R
 
K
P
 
P
G
 
T
D
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
W
 
Q
H
 
H
V
 
Y
E
 
K
R
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
W
 
E
R
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
K
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
C
 
V
N
 
D
M
 
L
S
 
S
P
 
N
A
 
D
L
 
T
V
 
A
Q
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
E
H
 
I
P
 
P
R
 
N
V
 
I
V
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
E
 
D
C
 
A
-
 
T
-
 
G
D
 
D
A
 
V
A
 
P
G
 
R
L
 
G
R
 
K
A
 
A
L
 
L
-
 
I
-
 
D
A
 
A
G
 
L
N
 
N
D
 
G
R
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
C
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
E
A
 
T
M
 
A
L
 
W
D
 
E
H
 
L
L
 
M
L
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
D
G
 
G
V
 
N
V
x
I
P
 
S
A
 
V
C
 
T
A
 
A
H
 
N
I
 
I
R
 
A
P
 
P
D
 
K
L
 
A
F
 
M
V
 
S
R
 
E
L
 
V
L
 
C
Q
 
A
L
 
V
V
 
A
A
 
I
Q
 
A
G
 
K
R
 
D
V
 
E
A
 
Q
A
 
Q
A
 
A
R
 
K
A
 
T
L
 
L
F
 
N
A
 
N
S
 
K
L
 
I
A
 
A
P
 
N
L
 
L
I
 
H
S
 
N
L
 
I
L
 
L
F
 
F
S
 
C
E
 
E
P
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
W
A
 
A
L
 
L
A
 
H
L
 
E
C
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
I
S
 
D
S
 
T
E
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
T
P
 
P
A
 
L
S
 
A
R
 
E
A
 
Q
L
 
Y
R
 
R
E
 
E
R
 
P
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3tceA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 5-hydroxylysine at 2.6 a resolution
32% identity, 88% coverage: 16:283/303 of query aligns to 9:281/291 of 3tceA

query
sites
3tceA
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
M
-
 
L
Q
 
K
G
 
D
G
 
G
E
 
G
P
 
V
D
 
D
L
 
W
A
 
K
C
 
S
A
 
L
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
V
A
 
E
H
 
W
Y
 
H
V
 
I
A
 
E
S
 
Q
G
 
G
V
 
T
D
 
N
G
 
S
L
 
I
V
 
V
I
 
A
L
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
A
G
x
S
L
 
T
L
|
L
T
 
S
R
 
M
D
 
E
E
 
E
R
x
H
L
 
T
M
 
Q
F
 
V
T
 
I
A
 
K
A
 
E
V
 
I
L
 
I
E
 
R
A
 
V
V
 
A
D
 
N
G
 
K
A
 
R
L
 
I
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
N
D
 
S
T
 
T
R
 
R
V
 
E
V
 
A
C
 
I
E
 
E
Q
 
L
V
 
T
R
 
K
Q
 
A
L
 
A
D
 
K
R
 
D
F
 
L
D
 
G
L
 
A
A
 
D
G
 
A
Y
 
A
L
 
L
V
 
L
P
 
V
P
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
L
 
N
R
 
K
P
 
P
G
 
T
D
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
W
 
Q
H
 
H
V
 
Y
E
 
K
R
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
W
 
E
R
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
K
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
C
 
V
N
 
D
M
 
L
S
 
S
P
 
N
A
 
D
L
 
T
V
 
A
Q
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
E
H
 
I
P
 
P
R
 
N
V
 
I
V
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
E
 
D
C
 
A
-
 
T
-
 
G
D
 
D
A
 
V
A
 
P
G
 
R
L
 
G
R
 
K
A
 
A
L
 
L
-
 
I
-
 
D
A
 
A
G
 
L
N
 
N
D
 
G
R
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
C
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
E
A
 
T
M
 
A
L
 
W
D
 
E
H
 
L
L
 
M
L
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
D
G
 
G
V
 
N
V
x
I
P
 
S
A
 
V
C
 
T
A
 
A
H
 
N
I
 
I
R
 
A
P
 
P
D
 
K
L
 
A
F
 
M
V
 
S
R
 
E
L
 
V
L
 
C
Q
 
A
L
 
V
V
 
A
A
 
I
Q
 
A
G
 
K
R
 
D
V
 
E
A
 
Q
A
 
Q
A
 
A
R
 
K
A
 
T
L
 
L
F
 
N
A
 
N
S
 
K
L
 
I
A
 
A
P
 
N
L
 
L
I
 
H
S
 
N
L
 
I
L
 
L
F
 
F
S
 
C
E
 
E
P
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
W
A
 
A
L
 
L
A
 
H
L
 
E
C
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
I
S
 
D
S
 
T
E
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
T
P
 
P
A
 
L
S
 
A
R
 
E
A
 
Q
L
 
Y
R
 
R
E
 
E
R
 
P
L
 
L

3rk8A Crystal structure of the chloride inhibited dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with pyruvate at 1.8 a resolution
32% identity, 88% coverage: 16:283/303 of query aligns to 9:281/291 of 3rk8A

query
sites
3rk8A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
M
-
 
L
Q
 
K
G
 
D
G
 
G
E
 
G
P
 
V
D
 
D
L
 
W
A
 
K
C
 
S
A
 
L
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
V
A
 
E
H
 
W
Y
 
H
V
 
I
A
 
E
S
 
Q
G
 
G
V
 
T
D
 
N
G
 
S
L
 
I
V
 
V
I
 
A
L
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
A
G
 
S
L
 
T
L
 
L
T
 
S
R
 
M
D
 
E
E
 
E
R
 
H
L
 
T
M
 
Q
F
 
V
T
 
I
A
 
K
A
 
E
V
 
I
L
 
I
E
 
R
A
 
V
V
 
A
D
 
N
G
 
K
A
 
R
L
 
I
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
N
D
 
S
T
 
T
R
 
R
V
 
E
V
 
A
C
 
I
E
 
E
Q
 
L
V
 
T
R
 
K
Q
 
A
L
 
A
D
 
K
R
 
D
F
 
L
D
 
G
L
 
A
A
 
D
G
 
A
Y
 
A
L
 
L
V
 
L
P
 
V
P
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
L
 
N
R
 
K
P
 
P
G
 
T
D
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
W
 
Q
H
 
H
V
 
Y
E
 
K
R
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
W
 
E
R
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
K
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
C
 
V
N
 
D
M
 
L
S
 
S
P
 
N
A
 
D
L
 
T
V
 
A
Q
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
E
H
 
I
P
 
P
R
 
N
V
 
I
V
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
E
 
D
C
 
A
-
 
T
-
 
G
D
 
D
A
 
V
A
 
P
G
 
R
L
 
G
R
 
K
A
 
A
L
 
L
-
 
I
-
 
D
A
 
A
G
 
L
N
 
N
D
 
G
R
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
C
 
S
G
|
G
E
 
D
D
 
D
A
 
E
A
 
T
M
 
A
L
 
W
D
 
E
H
 
L
L
 
M
L
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
D
G
 
G
V
 
N
V
x
I
P
 
S
A
 
V
C
 
T
A
 
A
H
 
N
I
 
I
R
 
A
P
 
P
D
 
K
L
 
A
F
 
M
V
 
S
R
 
E
L
 
V
L
 
C
Q
 
A
L
 
V
V
 
A
A
 
I
Q
 
A
G
 
K
R
 
D
V
 
E
A
 
Q
A
 
Q
A
 
A
R
 
K
A
 
T
L
 
L
F
 
N
A
 
N
S
 
K
L
 
I
A
 
A
P
 
N
L
 
L
I
 
H
S
 
N
L
 
I
L
 
L
F
|
F
S
 
C
E
 
E
P
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
W
A
 
A
L
 
L
A
 
H
L
 
E
C
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
I
S
 
D
S
 
T
E
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
T
P
 
P
A
 
L
S
 
A
R
 
E
A
 
Q
L
 
Y
R
 
R
E
 
E
R
 
P
L
 
L

3pueB Crystal structure of the complex of dhydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with lysine at 2.6a resolution
32% identity, 88% coverage: 16:283/303 of query aligns to 9:281/291 of 3pueB

query
sites
3pueB
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
M
-
 
L
Q
 
K
G
 
D
G
 
G
E
 
G
P
 
V
D
 
D
L
 
W
A
 
K
C
 
S
A
 
L
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
V
A
 
E
H
 
W
Y
 
H
V
 
I
A
 
E
S
 
Q
G
 
G
V
 
T
D
 
N
G
 
S
L
 
I
V
 
V
I
 
A
L
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
A
G
 
S
L
 
T
L
 
L
T
 
S
R
 
M
D
 
E
E
 
E
R
 
H
L
 
T
M
 
Q
F
 
V
T
 
I
A
 
K
A
 
E
V
 
I
L
 
I
E
 
R
A
 
V
V
 
A
D
 
N
G
 
K
A
 
R
L
 
I
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
N
D
 
S
T
 
T
R
 
R
V
 
E
V
 
A
C
 
I
E
 
E
Q
 
L
V
 
T
R
 
K
Q
 
A
L
 
A
D
 
K
R
 
D
F
 
L
D
 
G
L
 
A
A
 
D
G
 
A
Y
 
A
L
 
L
V
 
L
P
 
V
P
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
L
 
N
R
 
K
P
 
P
G
 
T
D
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
W
 
Q
H
 
H
V
 
Y
E
 
K
R
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
W
 
E
R
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
K
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
C
 
V
N
 
D
M
 
L
S
 
S
P
 
N
A
 
D
L
 
T
V
 
A
Q
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
E
H
 
I
P
 
P
R
 
N
V
 
I
V
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
E
 
D
C
 
A
-
 
T
-
 
G
D
 
D
A
 
V
A
 
P
G
 
R
L
 
G
R
 
K
A
 
A
L
 
L
-
 
I
-
 
D
A
 
A
G
 
L
N
 
N
D
 
G
R
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
C
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
E
A
 
T
M
 
A
L
 
W
D
 
E
H
 
L
L
 
M
L
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
D
G
 
G
V
 
N
V
x
I
P
 
S
A
 
V
C
 
T
A
 
A
H
 
N
I
 
I
R
 
A
P
 
P
D
 
K
L
 
A
F
 
M
V
 
S
R
 
E
L
 
V
L
 
C
Q
 
A
L
 
V
V
 
A
A
 
I
Q
 
A
G
 
K
R
 
D
V
 
E
A
 
Q
A
 
Q
A
 
A
R
 
K
A
 
T
L
 
L
F
 
N
A
 
N
S
 
K
L
 
I
A
 
A
P
 
N
L
 
L
I
 
H
S
 
N
L
 
I
L
 
L
F
|
F
S
 
C
E
 
E
P
 
S
N
|
N
P
 
P
A
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
W
A
 
A
L
 
L
A
 
H
L
 
E
C
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
I
S
 
D
S
 
T
E
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
T
P
 
P
A
 
L
S
 
A
R
 
E
A
 
Q
L
 
Y
R
 
R
E
 
E
R
 
P
L
 
L

P9WP25 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
35% identity, 93% coverage: 11:292/303 of query aligns to 14:295/300 of P9WP25

query
sites
P9WP25
T
 
T
L
 
L
W
 
L
L
 
T
P
 
A
L
 
M
V
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
-
 
D
G
 
G
E
 
S
P
 
L
D
 
D
L
 
T
A
 
A
C
 
T
A
 
A
Q
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
N
H
 
H
Y
 
L
V
 
V
A
 
D
S
 
Q
G
 
G
V
 
C
D
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
I
 
V
L
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
S
G
 
P
L
 
T
L
 
T
T
 
T
R
 
D
D
 
G
E
 
E
R
 
K
L
 
I
M
 
E
F
 
L
T
 
L
A
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
G
G
 
D
A
 
R
L
 
A
P
 
R
V
 
V
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
G
 
T
V
 
Y
D
 
D
T
 
T
R
 
A
V
 
H
V
 
S
C
 
I
E
 
R
Q
 
L
V
 
A
R
 
K
Q
 
A
L
 
C
D
 
A
R
 
A
F
 
E
D
 
G
L
 
A
A
 
H
G
 
G
Y
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
V
P
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
L
 
S
R
 
K
P
 
P
G
 
P
D
 
Q
E
 
R
G
 
G
I
 
L
A
 
Q
W
 
A
H
 
H
V
 
F
E
 
T
R
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
T
 
T
W
 
E
R
 
L
P
 
P
L
 
M
M
 
L
L
 
L
Y
 
Y
N
 
D
V
 
I
P
 
P
K
 
G
R
 
R
T
 
S
G
 
A
C
 
V
N
 
P
M
 
I
S
 
E
P
 
P
A
 
D
L
 
T
V
 
I
Q
 
R
R
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
S
H
 
H
P
 
P
R
 
N
V
 
I
V
 
V
A
 
G
V
 
V
K
|
K
E
 
D
C
 
A
D
 
K
A
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
H
A
 
S
G
 
G
L
 
A
R
 
Q
A
 
I
L
 
M
A
 
A
G
 
-
N
 
D
D
 
T
R
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
Y
F
 
Y
C
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
L
M
 
N
L
 
L
D
 
P
H
 
W
L
 
L
L
x
A
A
 
M
G
 
G
G
 
A
G
 
T
G
 
G
V
 
F
V
 
I
P
 
S
A
 
V
C
 
I
A
 
A
H
 
H
I
 
L
R
 
A
P
 
A
D
 
G
L
 
Q
F
 
L
V
 
R
R
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
S
L
 
A
V
 
F
A
 
G
Q
 
S
G
 
G
R
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
K
L
 
I
F
 
N
A
 
I
S
 
A
L
 
V
A
 
A
P
 
P
L
 
L
I
 
C
S
 
N
L
 
A
L
 
M
F
 
S
S
 
R
E
 
L
P
 
G
N
 
G
P
 
V
A
 
T
P
 
L
V
 
S
K
 
K
S
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
R
L
 
L
C
 
Q
G
 
G
L
 
I
A
 
-
S
 
-
S
 
-
E
 
D
V
 
V
R
 
G
R
 
D
P
 
P
L
 
R
V
 
L
P
 
P
A
 
Q
S
 
V
R
 
A
A
 
A
L
 
T
R
 
P
E
 
E
R
 
Q
L
 
I
D
 
D
Q
 
A
V
 
L
I
 
A
A
 
A
S
 
D
L
 
M
P
 
R
A
 
A

1xxxA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase (dapa, rv2753c) from mycobacterium tuberculosis (see paper)
35% identity, 93% coverage: 11:292/303 of query aligns to 10:291/296 of 1xxxA

query
sites
1xxxA
T
 
T
L
 
L
W
 
L
L
 
T
P
 
A
L
 
M
V
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
-
 
D
G
 
G
E
 
S
P
 
L
D
 
D
L
 
T
A
 
A
C
 
T
A
 
A
Q
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
N
H
 
H
Y
 
L
V
 
V
A
 
D
S
 
Q
G
 
G
V
 
C
D
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
I
 
V
L
 
S
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
S
G
 
P
L
 
T
L
 
T
T
 
T
R
 
D
D
 
G
E
 
E
R
 
K
L
 
I
M
 
E
F
 
L
T
 
L
A
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
G
G
 
D
A
 
R
L
 
A
P
 
R
V
 
V
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
G
 
T
V
 
Y
D
 
D
T
 
T
R
 
A
V
 
H
V
 
S
C
 
I
E
 
R
Q
 
L
V
 
A
R
 
K
Q
 
A
L
 
C
D
 
A
R
 
A
F
 
E
D
 
G
L
 
A
A
 
H
G
 
G
Y
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
V
P
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
L
 
S
R
 
K
P
 
P
G
 
P
D
 
Q
E
 
R
G
 
G
I
 
L
A
 
Q
W
 
A
H
 
H
V
 
F
E
 
T
R
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
T
 
T
W
 
E
R
 
L
P
 
P
L
 
M
M
 
L
L
 
L
Y
|
Y
N
 
D
V
 
I
P
 
P
K
 
G
R
|
R
T
 
S
G
 
A
C
 
V
N
 
P
M
 
I
S
 
E
P
 
P
A
 
D
L
 
T
V
 
I
Q
 
R
R
 
A
L
 
L
A
|
A
A
 
S
H
|
H
P
 
P
R
 
N
V
x
I
V
 
V
A
 
G
V
 
V
K
|
K
E
 
D
C
 
A
D
 
K
A
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
H
A
 
S
G
 
G
L
 
A
R
 
Q
A
 
I
L
 
M
A
 
A
G
 
-
N
 
D
D
 
T
R
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
Y
F
 
Y
C
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
L
M
 
N
L
 
L
D
 
P
H
 
W
L
 
L
L
 
A
A
 
M
G
 
G
G
 
A
G
 
T
G
 
G
V
 
F
V
x
I
P
 
S
A
 
V
C
 
I
A
 
A
H
 
H
I
 
L
R
 
A
P
 
A
D
 
G
L
 
Q
F
 
L
V
 
R
R
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
S
L
 
A
V
 
F
A
 
G
Q
 
S
G
 
G
R
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
K
L
 
I
F
 
N
A
 
I
S
 
A
L
 
V
A
 
A
P
 
P
L
 
L
I
 
C
S
 
N
L
 
A
L
 
M
F
 
S
S
 
R
E
 
L
P
 
G
N
 
G
P
 
V
A
 
T
P
 
L
V
 
S
K
 
K
S
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
R
L
 
L
C
 
Q
G
 
G
L
 
I
A
 
-
S
 
-
S
 
-
E
 
D
V
 
V
R
 
G
R
 
D
P
 
P
L
 
R
V
 
L
P
 
P
A
 
Q
S
 
V
R
 
A
A
 
A
L
 
T
R
 
P
E
 
E
R
 
Q
L
 
I
D
 
D
Q
 
A
V
 
L
I
 
A
A
 
A
S
 
D
L
 
M
P
 
R
A
 
A

5j5dA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from mycobacterium tuberculosis in complex with alpha-ketopimelic acid (see paper)
35% identity, 93% coverage: 11:292/303 of query aligns to 11:292/297 of 5j5dA

query
sites
5j5dA
T
 
T
L
 
L
W
 
L
L
 
T
P
x
A
L
 
M
V
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
-
 
D
G
 
G
E
 
S
P
 
L
D
 
D
L
 
T
A
 
A
C
 
T
A
 
A
Q
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
N
H
 
H
Y
 
L
V
 
V
A
 
D
S
 
Q
G
 
G
V
 
C
D
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
I
 
V
L
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
G
 
S
G
 
P
L
 
T
L
 
T
T
 
T
R
 
D
D
 
G
E
 
E
R
 
K
L
 
I
M
 
E
F
 
L
T
 
L
A
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 <