SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS17660 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS17660 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
52% identity, 100% coverage: 2:246/246 of query aligns to 4:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
K
 
R
L
 
L
Q
 
Q
G
 
D
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
|
A
A
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
L
A
 
E
T
 
A
A
 
A
Q
 
R
R
 
V
F
 
F
A
 
M
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
I
C
 
A
D
|
D
V
x
F
Q
x
N
E
 
E
E
 
-
R
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
A
A
 
A
A
 
G
E
 
K
T
 
E
L
 
A
A
 
V
A
 
E
S
 
A
G
 
N
A
 
P
T
 
G
V
 
V
S
 
V
A
 
F
Y
 
I
K
 
R
V
|
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
D
R
 
R
D
 
E
E
 
S
V
 
V
D
 
H
A
 
R
M
 
L
V
 
V
A
 
E
A
 
N
T
 
V
L
 
A
A
 
E
R
 
R
H
 
F
G
 
G
R
 
K
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
|
T
K
 
R
D
|
D
A
 
S
R
 
M
L
 
L
T
 
S
K
|
K
M
 
M
T
 
T
E
 
V
A
 
D
Q
 
Q
F
 
F
D
 
Q
A
 
Q
V
 
V
I
 
I
D
 
N
V
|
V
N
|
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
H
C
 
C
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
L
D
 
P
I
 
Y
M
 
M
T
 
A
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
K
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
x
T
S
|
S
S
|
S
V
 
V
V
x
T
G
 
G
L
 
T
Y
 
Y
G
 
G
N
|
N
F
x
V
G
|
G
Q
|
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
K
T
 
T
W
 
W
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
R
K
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
F
|
F
V
x
T
A
 
E
T
|
T
E
x
A
I
x
M
L
x
V
Q
 
A
T
 
E
V
 
V
P
 
P
E
 
E
K
 
K
V
 
V
L
 
I
D
 
E
G
x
K
M
 
M
K
 
K
S
 
A
S
 
Q
C
 
V
W
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
K
P
 
P
A
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
I
 
A
Y
 
Y
T
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
D
 
E
A
 
S
S
 
D
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
H
A
 
V
I
 
L
E
 
H
A
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
I
S
 
M
L
 
M

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
52% identity, 100% coverage: 2:246/246 of query aligns to 2:239/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
K
 
K
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
A
x
K
G
|
G
I
x
L
G
 
G
F
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
A
Q
 
L
R
 
A
F
 
Y
A
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
G
D
|
D
V
x
L
Q
 
G
E
 
D
E
 
-
R
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
L
A
 
T
A
 
Y
S
 
S
G
 
H
A
 
P
T
 
N
V
 
V
S
 
E
A
 
G
Y
 
M
K
 
Y
V
x
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
R
 
D
R
 
V
D
 
T
E
 
G
V
 
V
D
 
E
A
 
K
M
 
F
V
 
Y
A
 
Q
A
 
S
T
 
V
L
 
I
A
 
D
R
 
K
H
 
Y
G
 
G
R
 
K
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
K
 
K
D
 
D
A
 
A
R
 
M
L
 
T
T
 
R
K
 
K
M
 
M
T
 
T
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
F
 
W
D
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
|
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
C
 
L
A
 
T
Q
 
R
A
 
L
V
 
V
A
 
G
D
 
P
I
 
Q
M
 
M
T
 
Q
E
 
T
Q
 
N
G
 
G
K
 
Y
G
 
G
V
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
x
I
S
|
S
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
F
G
 
G
N
 
N
F
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
T
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
M
T
 
T
W
 
W
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
F
G
 
A
P
 
L
K
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
N
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
A
P
|
P
G
|
G
F
x
Y
V
x
I
A
 
M
T
|
T
E
 
D
I
 
I
L
 
L
Q
 
K
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
K
 
D
V
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
K
M
 
F
K
 
A
S
 
A
S
 
L
C
 
T
W
 
M
L
 
L
R
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
Q
P
 
P
A
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
K
I
 
V
Y
 
A
T
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
T
I
 
I
E
 
N
A
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
R
L
 
L

4nbwA Crystal structure of fabg from plesiocystis pacifica (see paper)
54% identity, 97% coverage: 6:244/246 of query aligns to 2:249/253 of 4nbwA

query
sites
4nbwA
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
|
A
A
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
R
A
 
A
T
 
T
A
 
A
Q
 
L
R
 
E
F
 
F
A
 
A
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
A
 
Y
L
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
A
C
 
W
D
|
D
V
x
L
Q
 
A
E
 
E
E
 
E
R
 
A
V
 
G
R
 
A
A
 
A
A
 
L
A
 
I
E
 
A
T
 
E
L
 
I
A
 
A
A
 
D
S
 
A
G
 
G
A
 
G
T
 
S
V
 
A
S
 
D
A
 
F
Y
 
A
K
 
R
V
|
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
A
R
 
A
D
 
E
E
 
S
V
 
V
D
 
E
A
 
A
M
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
E
T
 
I
L
 
I
A
 
A
R
 
E
H
 
H
G
 
G
R
 
R
V
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
L
K
 
H
D
 
D
A
 
G
R
 
Q
L
 
L
T
 
V
K
 
K
-
 
V
-
 
K
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
V
-
 
K
-
 
K
M
 
M
T
 
A
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
F
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
S
V
|
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
L
C
 
C
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
P
I
 
H
M
 
M
T
 
I
E
 
A
Q
 
A
G
 
K
K
 
Y
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
L
N
 
N
A
|
A
S
|
S
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
K
T
 
V
W
 
W
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
R
K
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
V
x
I
A
 
A
T
|
T
E
 
E
I
 
M
L
 
V
Q
 
Q
T
 
Q
V
 
M
P
 
P
E
 
E
K
 
R
V
 
V
L
 
L
D
 
E
G
 
A
M
 
M
K
 
V
S
 
A
S
 
R
C
 
T
W
 
P
L
 
V
R
 
G
R
 
R
L
 
I
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
A
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
R
I
 
A
Y
 
Y
T
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
D
 
E
A
 
S
S
 
G
Y
 
F
V
 
I
N
 
S
G
 
G
V
 
T
A
 
T
I
 
L
E
 
S
A
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
48% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 4:247/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
M
 
M
K
 
K
L
 
L
Q
 
A
G
 
S
R
 
K
V
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
|
A
A
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
F
A
 
G
T
 
I
A
 
A
Q
 
Q
R
 
V
F
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
I
C
 
A
D
|
D
V
 
-
Q
x
R
E
 
D
E
 
A
R
 
H
V
 
G
R
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
R
A
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
Q
V
 
A
S
 
L
A
 
F
Y
 
I
K
 
S
V
x
C
D
x
N
V
x
I
T
 
A
R
 
E
R
 
K
D
 
T
E
 
Q
V
 
V
D
 
E
A
 
A
M
 
L
V
 
F
A
 
S
A
 
Q
T
 
A
L
 
E
A
 
E
R
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
P
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
N
K
 
R
D
 
D
A
 
A
R
 
M
L
 
L
T
 
H
K
 
K
M
 
L
T
 
T
E
 
E
A
 
A
Q
 
D
F
 
W
D
 
D
A
 
T
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
|
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
N
 
L
C
 
C
A
 
M
Q
 
Q
A
 
Q
V
 
A
A
 
A
D
 
I
I
 
R
M
 
M
T
 
R
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
K
 
A
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
x
I
S
 
A
S
|
S
V
 
A
V
 
S
G
 
W
L
 
L
Y
 
-
G
 
G
N
 
N
F
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
K
T
 
T
W
 
A
A
 
C
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
K
K
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
F
|
F
V
x
I
A
 
D
T
|
T
E
 
D
I
x
M
L
x
T
Q
 
R
T
 
G
V
 
V
P
 
P
E
 
E
K
 
N
V
 
V
L
 
W
D
 
Q
G
 
I
M
 
M
K
 
V
S
 
S
S
 
K
C
 
I
W
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
Y
L
 
A
A
 
G
Q
 
E
P
 
A
A
 
K
E
 
D
I
 
V
A
 
G
S
 
E
I
 
C
Y
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
A
S
 
R
Y
 
Y
V
 
I
N
 
N
G
 
G
V
 
E
A
 
V
I
 
I
E
 
N
A
 
V
S
 
G
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
V
L
 
L

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
46% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 1:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
M
K
 
T
L
 
L
Q
 
Q
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
S
A
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
R
A
 
D
T
 
I
A
 
A
Q
 
I
R
 
N
F
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
N
V
 
I
V
 
F
L
 
F
-
x
N
C
x
Y
D
x
N
V
x
G
Q
x
S
E
 
P
E
 
E
R
 
A
V
 
A
R
 
E
A
 
E
A
 
T
A
 
A
E
 
K
T
 
L
L
 
V
A
 
A
A
 
E
S
 
H
G
 
G
A
 
V
T
 
E
V
 
V
S
 
E
A
 
A
Y
 
M
K
 
K
V
x
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
R
 
I
R
 
A
D
 
E
E
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
M
 
F
V
 
F
A
 
K
A
 
Q
T
 
A
L
 
I
A
 
E
R
 
R
H
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
K
 
R
D
 
D
A
 
N
R
 
L
L
 
L
T
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
E
A
 
D
Q
 
E
F
 
W
D
 
D
A
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
N
V
x
I
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
N
 
L
C
 
C
A
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
S
D
 
R
I
 
T
M
 
M
T
 
M
E
 
K
Q
 
Q
G
 
R
K
 
A
G
 
G
V
 
K
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
 
M
S
x
A
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
I
G
 
G
N
 
N
F
 
A
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
T
 
T
W
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
K
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
V
x
I
A
 
T
T
|
T
E
 
D
I
 
M
L
 
T
Q
 
D
T
 
K
V
 
L
P
 
D
E
 
E
K
 
K
V
 
T
L
 
K
D
 
E
G
 
A
M
 
M
K
 
L
S
 
A
S
 
Q
C
 
I
W
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
A
L
 
Y
A
 
G
Q
 
T
P
 
T
A
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
I
 
A
Y
 
V
T
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
A
A
 
S
S
 
K
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
T
I
 
L
E
 
S
A
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
V
L
 
M

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
44% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 1:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
M
 
M
K
 
K
L
 
M
Q
 
T
G
 
-
R
 
K
V
 
S
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
A
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
F
 
R
A
 
S
T
 
I
A
 
A
Q
 
L
R
 
Q
F
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
L
 
N
V
 
V
V
 
A
L
 
V
C
 
N
D
 
Y
V
 
A
-
 
G
Q
 
S
E
 
K
E
 
E
R
 
K
V
 
A
R
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
V
E
 
E
T
 
E
L
 
I
A
 
K
A
 
A
S
 
K
G
 
G
A
 
V
T
 
D
V
 
S
S
 
F
A
 
A
Y
 
I
K
 
Q
V
 
A
D
 
N
V
 
V
T
 
A
R
 
D
R
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
D
 
K
A
 
A
M
 
M
V
 
I
A
 
K
A
 
E
T
 
V
L
 
V
A
 
S
R
 
Q
H
 
F
G
 
G
R
 
S
V
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
K
 
R
D
 
D
A
 
N
R
 
L
L
 
L
T
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
E
A
 
Q
Q
 
E
F
 
W
D
 
D
A
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
C
 
C
A
 
I
Q
 
Q
A
 
K
V
 
A
A
 
T
D
 
P
I
 
Q
M
 
M
T
 
L
E
 
R
Q
 
Q
G
 
R
K
 
S
G
 
G
V
 
A
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
 
L
S
 
S
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
A
Y
 
V
G
 
G
N
 
N
F
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
T
 
S
W
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
I
A
 
V
T
 
S
E
 
D
I
 
M
L
 
T
Q
 
D
T
 
A
V
 
L
P
 
S
E
 
D
K
 
E
V
 
L
L
 
K
D
 
E
G
 
Q
M
 
M
K
 
L
S
 
T
S
 
Q
C
 
I
W
 
P
L
 
L
R
 
A
R
 
R
L
 
F
A
 
G
Q
 
Q
P
 
D
A
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
I
 
T
Y
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
K
A
 
A
S
 
K
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
T
I
 
I
E
 
H
A
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
Y
L
 
M

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
44% identity, 98% coverage: 6:246/246 of query aligns to 2:239/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
R
 
K
V
 
S
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
A
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
R
A
 
S
T
 
I
A
 
A
Q
 
L
R
 
Q
F
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
L
 
N
V
 
V
V
 
A
L
 
V
C
x
N
D
x
Y
V
x
A
-
x
G
Q
x
S
E
 
K
E
 
E
R
 
K
V
 
A
R
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
V
E
 
E
T
 
E
L
 
I
A
 
K
A
 
A
S
 
K
G
 
G
A
 
V
T
 
D
V
 
S
S
 
F
A
 
A
Y
 
I
K
 
Q
V
x
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
R
 
D
R
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
D
 
K
A
 
A
M
 
M
V
 
I
A
 
K
A
 
E
T
 
V
L
 
V
A
 
S
R
 
Q
H
 
F
G
 
G
R
 
S
V
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
K
 
R
D
 
D
A
 
N
R
 
L
L
 
L
T
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
E
A
 
Q
Q
 
E
F
 
W
D
 
D
A
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
x
T
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
C
 
C
A
 
I
Q
 
Q
A
 
K
V
 
A
A
 
T
D
 
P
I
 
Q
M
 
M
T
 
L
E
 
R
Q
 
Q
G
 
R
K
 
S
G
 
G
V
 
A
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
x
L
S
|
S
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
A
Y
 
V
G
 
G
N
 
N
F
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
T
 
S
W
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
F
|
F
V
x
I
A
 
V
T
 
S
E
 
D
I
 
M
L
 
T
Q
 
D
T
 
E
V
 
L
P
 
K
E
 
E
K
 
Q
V
 
M
L
 
L
D
 
-
G
 
-
M
 
-
K
 
-
S
 
T
S
 
Q
C
 
I
W
 
P
L
 
L
R
 
A
R
 
R
L
 
F
A
 
G
Q
 
Q
P
 
D
A
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
I
 
T
Y
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
K
A
 
A
S
 
K
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
T
I
 
I
E
 
H
A
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
Y
L
 
M

4cqlI Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD (see paper)
42% identity, 99% coverage: 2:244/246 of query aligns to 5:249/251 of 4cqlI

query
sites
4cqlI
K
 
R
L
 
L
Q
 
R
G
 
S
R
 
A
V
 
L
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
G
A
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
R
A
 
A
T
 
V
A
 
S
Q
 
V
R
 
R
F
 
L
A
 
A
A
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
T
V
 
V
V
 
A
L
 
A
C
 
C
D
|
D
V
x
L
Q
 
D
E
 
R
E
 
A
R
 
A
V
 
A
R
 
Q
A
 
E
A
 
T
A
 
V
E
 
R
T
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
G
S
 
P
G
 
G
A
 
S
T
 
N
V
 
H
S
 
A
A
 
A
Y
 
F
K
 
Q
V
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
E
R
 
A
D
 
R
E
 
A
V
 
A
D
 
R
A
 
C
M
 
L
V
 
L
A
 
E
A
 
Q
T
 
V
L
 
Q
A
 
A
R
 
C
H
 
F
G
 
S
R
 
R
V
 
P
-
 
P
D
 
S
I
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
S
N
x
C
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
K
 
Q
D
 
D
A
 
E
R
 
F
L
 
L
T
 
L
K
 
H
M
 
M
T
 
S
E
 
E
A
 
D
Q
 
D
F
 
W
D
 
D
A
 
K
V
 
V
I
 
I
D
 
A
V
|
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
N
 
L
C
 
V
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
A
D
 
Q
I
 
A
M
 
L
T
 
V
E
 
S
Q
 
N
G
 
G
-
 
C
K
 
R
G
 
G
V
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
x
I
S
 
S
S
|
S
V
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
K
Y
 
V
G
 
G
N
 
N
F
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
Q
T
 
T
W
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
R
K
 
H
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
S
V
 
V
C
 
L
P
|
P
G
|
G
F
|
F
V
x
I
A
 
A
T
|
T
E
x
P
I
x
M
L
x
T
Q
 
Q
T
 
K
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
K
 
K
V
 
V
L
 
V
D
 
D
G
 
K
M
 
I
K
 
T
S
 
E
S
 
M
C
 
I
W
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
H
L
 
L
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
A
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
S
 
D
I
 
V
Y
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
D
 
D
A
 
S
S
 
G
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
T
A
 
S
I
 
V
E
 
E
A
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
G
M
 
L

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
43% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 1:245/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
M
|
M
K
 
G
L
 
I
Q
 
Q
G
 
N
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
A
A
x
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
F
 
K
A
 
Q
T
 
T
A
 
A
Q
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
I
C
 
N
D
|
D
V
 
I
Q
 
D
E
 
A
E
 
E
R
 
K
V
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
T
A
 
V
E
 
D
T
 
E
L
 
F
A
 
S
A
 
A
S
 
R
G
 
G
A
 
H
T
 
R
V
 
V
S
 
L
A
 
G
Y
 
A
K
 
V
V
 
A
D
|
D
V
x
I
T
 
G
R
 
N
R
 
K
D
 
A
E
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
G
M
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
Q
T
 
T
L
 
I
A
 
D
R
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
M
T
 
E
K
 
R
D
 
A
A
 
G
R
 
A
L
 
L
T
 
R
K
 
K
M
 
L
T
 
S
E
 
E
A
 
A
Q
 
D
F
 
W
D
 
D
A
 
V
V
 
T
I
 
I
D
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
N
 
L
C
 
C
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
H
D
 
G
I
 
H
M
 
M
T
 
V
E
 
E
Q
 
N
G
 
K
K
 
H
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
V
N
 
N
A
 
I
S
 
A
S
 
S
V
 
R
V
 
A
G
 
W
L
 
L
Y
 
-
G
 
G
N
 
G
F
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
S
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
R
T
 
A
W
 
L
A
 
A
R
 
I
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
R
K
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
L
V
 
I
A
 
H
T
 
T
E
 
P
I
 
M
L
 
W
Q
 
D
T
 
E
V
 
L
P
 
P
E
 
E
K
 
K
V
 
D
L
 
Q
D
 
Q
G
 
F
M
 
L
K
 
L
S
 
S
S
 
R
C
 
Q
W
 
P
L
 
T
R
 
G
R
 
K
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
P
 
P
A
 
D
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
I
 
T
Y
 
L
T
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
D
 
D
A
 
S
S
 
G
Y
 
F
V
 
V
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
V
I
 
L
E
 
Y
A
 
V
S
 
C
G
 
G
G
 
G
M
 
R
S
 
S
L
 
L

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
43% identity, 99% coverage: 3:246/246 of query aligns to 2:244/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
Q
 
Q
G
 
N
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
A
x
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
F
 
K
A
 
Q
T
 
T
A
 
A
Q
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
I
C
 
N
D
|
D
V
x
I
Q
 
D
E
 
A
E
 
E
R
 
K
V
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
T
A
 
V
E
 
D
T
 
E
L
 
F
A
 
S
A
 
A
S
 
R
G
 
G
A
 
H
T
 
R
V
 
V
S
 
L
A
 
G
Y
 
A
K
 
V
V
x
A
D
|
D
V
x
I
T
 
G
R
 
N
R
 
K
D
 
A
E
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
G
M
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
Q
T
 
T
L
 
I
A
 
D
R
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
M
T
 
E
K
 
R
D
 
A
A
 
G
R
 
A
L
 
L
T
 
R
K
 
K
M
 
L
T
 
S
E
 
E
A
 
A
Q
 
D
F
 
W
D
 
D
A
 
V
V
 
T
I
 
I
D
 
N
V
|
V
N
|
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
N
 
L
C
 
C
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
H
D
 
G
I
 
H
M
 
M
T
 
V
E
 
E
Q
 
N
G
 
K
K
 
H
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
V
N
 
N
A
x
I
S
x
A
S
|
S
V
 
R
V
 
A
G
 
W
L
 
L
Y
 
-
G
 
G
N
 
G
F
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
S
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
R
T
 
A
W
 
L
A
 
A
R
 
I
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
R
K
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
L
V
x
I
A
 
H
T
 
T
E
 
P
I
x
M
L
 
W
Q
 
D
T
 
E
V
 
L
P
 
P
E
 
E
K
 
K
V
 
D
L
 
Q
D
 
Q
G
 
F
M
 
L
K
 
L
S
 
S
S
 
R
C
 
Q
W
 
P
L
 
T
R
 
G
R
 
K
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
P
 
P
A
 
D
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
I
 
T
Y
 
L
T
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
D
 
D
A
 
S
S
 
G
Y
 
F
V
 
V
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
V
I
 
L
E
 
Y
A
 
V
S
 
C
G
 
G
G
 
G
M
 
R
S
 
S
L
 
L

4cqmA Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD and NADP (see paper)
42% identity, 99% coverage: 2:244/246 of query aligns to 3:246/248 of 4cqmA

query
sites
4cqmA
K
 
R
L
 
L
Q
 
R
G
 
S
R
 
A
V
 
L
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
G
A
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
R
A
 
A
T
 
V
A
 
S
Q
 
V
R
 
R
F
 
L
A
 
A
A
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
T
V
 
V
V
 
A
L
 
A
C
 
C
D
|
D
V
x
L
Q
 
D
E
 
R
E
 
A
R
 
A
V
 
A
R
 
Q
A
 
E
A
 
T
A
 
V
E
 
R
T
 
L
L
 
L
A
 
P
A
 
P
S
 
R
G
 
G
A
 
-
T
 
N
V
 
H
S
 
A
A
 
A
Y
 
F
K
 
Q
V
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
E
R
 
A
D
 
R
E
 
A
V
 
A
D
 
R
A
 
C
M
 
L
V
 
L
A
 
E
A
 
Q
T
 
V
L
 
Q
A
 
A
R
 
C
H
 
F
G
 
S
R
 
R
V
 
P
-
 
P
D
 
S
I
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
S
N
x
C
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
K
 
Q
D
 
D
A
 
E
R
 
F
L
 
L
T
 
L
K
 
H
M
 
M
T
 
S
E
 
E
A
 
D
Q
 
D
F
 
W
D
 
D
A
 
K
V
 
V
I
 
I
D
 
A
V
|
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
N
 
L
C
 
V
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
A
D
 
Q
I
 
A
M
 
L
T
 
V
E
 
S
Q
 
N
G
 
G
-
 
C
K
 
R
G
 
G
V
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
x
I
S
|
S
S
|
S
V
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
K
Y
 
V
G
 
G
N
 
N
F
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
Q
T
 
T
W
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
R
K
 
H
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
S
V
 
V
C
 
L
P
|
P
G
|
G
F
|
F
V
x
I
A
 
A
T
|
T
E
x
P
I
x
M
L
x
T
Q
 
Q
T
 
K
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
K
 
K
V
 
V
L
 
V
D
 
D
G
 
K
M
 
I
K
 
T
S
 
E
S
 
M
C
 
I
W
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
H
L
 
L
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
A
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
S
 
D
I
 
V
Y
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
D
 
D
A
 
S
S
 
G
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
T
A
 
S
I
 
V
E
 
E
A
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
G
M
 
L

Q92506 (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase; 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 8; 17-beta-HSD 8; HSD17B8; 3-ketoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase alpha subunit; KAR alpha subunit; 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; Estradiol 17-beta-dehydrogenase 8; Protein Ke6; Ke6; Short chain dehydrogenase/reductase family 30C member 1; Testosterone 17-beta-dehydrogenase 8; EC 1.1.1.n12; EC 1.1.1.62; EC 1.1.1.239 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
41% identity, 99% coverage: 2:244/246 of query aligns to 8:259/261 of Q92506

query
sites
Q92506
K
 
R
L
 
L
Q
 
R
G
 
S
R
 
A
V
 
L
A
 
A
I
x
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
A
x
G
A
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
R
A
 
A
T
 
V
A
 
S
Q
 
V
R
 
R
F
 
L
A
 
A
A
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
T
V
 
V
V
 
A
L
 
A
C
 
C
D
|
D
V
x
L
Q
 
D
E
 
R
E
 
A
R
 
A
V
 
A
R
 
Q
A
 
E
A
 
T
A
 
V
E
 
R
T
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
G
S
 
P
G
 
G
A
 
S
-
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
P
-
 
P
-
 
R
-
 
G
T
 
N
V
 
H
S
 
A
A
 
A
Y
 
F
K
 
Q
V
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
E
R
 
A
D
 
R
E
 
A
V
 
A
D
 
R
A
 
C
M
 
L
V
 
L
A
 
E
A
 
Q
T
 
V
L
 
Q
A
 
A
R
 
C
H
 
F
G
 
S
R
 
R
V
 
P
-
 
P
D
 
S
I
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
S
N
 
C
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
K
 
Q
D
 
D
A
 
E
R
 
F
L
 
L
T
 
L
K
 
H
M
 
M
T
 
S
E
 
E
A
 
D
Q
 
D
F
 
W
D
 
D
A
 
K
V
 
V
I
 
I
D
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
N
 
L
C
 
V
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
A
D
 
Q
I
 
A
M
 
L
T
 
V
E
 
S
Q
 
N
G
 
G
-
 
C
K
x
R
G
 
G
V
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
 
I
S
 
S
S
 
S
V
 
I
V
|
V
G
 
G
L
 
K
Y
 
V
G
 
G
N
 
N
F
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
|
A
A
|
A
S
|
S
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
Q
T
 
T
W
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
x
R
K
 
H
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
S
V
 
V
C
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
F
V
x
I
A
|
A
T
|
T
E
 
P
I
 
M
L
 
T
Q
 
Q
T
 
K
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
K
 
K
V
 
V
L
 
V
D
 
D
G
 
K
M
 
I
K
 
T
S
 
E
S
 
M
C
 
I
W
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
H
L
 
L
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
A
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
S
 
D
I
 
V
Y
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
D
 
D
A
 
S
S
 
G
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
T
A
 
S
I
 
V
E
 
E
A
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
G
M
 
L

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
45% identity, 99% coverage: 3:246/246 of query aligns to 4:246/247 of P73574

query
sites
P73574
L
 
L
Q
 
T
G
 
A
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
|
A
A
 
S
A
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
F
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
A
Q
 
L
R
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
T
G
 
G
A
 
M
L
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
V
C
 
N
D
 
Y
V
 
A
Q
 
Q
E
 
S
E
 
S
R
 
T
V
 
A
R
 
A
A
 
D
A
 
A
-
 
V
-
 
V
A
 
A
E
 
E
T
 
I
L
 
I
A
 
A
A
 
N
S
 
G
G
 
G
A
 
E
T
 
A
V
 
I
S
 
-
A
 
A
Y
 
V
K
 
Q
V
 
A
D
 
N
V
 
V
T
 
A
R
 
N
R
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
D
 
D
A
 
Q
M
 
L
V
 
I
A
 
K
A
 
T
T
 
T
L
 
L
A
 
D
R
 
K
H
 
F
G
 
S
R
 
R
V
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
K
 
R
D
 
D
A
 
T
R
 
L
L
 
L
T
 
L
K
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
L
A
 
E
Q
 
D
F
 
W
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
L
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
L
C
 
C
A
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
S
D
 
K
I
 
L
M
 
M
T
 
L
E
 
K
Q
 
Q
G
 
K
K
 
S
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
 
I
S
 
T
S
 
S
V
 
V
V
 
A
G
 
G
L
 
M
Y
 
M
G
 
G
N
 
N
F
x
P
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
T
 
T
W
 
V
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
|
F
V
 
I
A
 
A
T
 
T
E
 
D
I
 
M
L
 
T
Q
 
E
T
 
N
V
 
L
-
x
N
P
 
A
E
 
E
K
 
P
V
 
I
L
 
L
D
 
Q
G
 
F
M
 
I
K
 
P
S
 
-
S
 
-
C
 
-
W
 
-
L
 
L
R
 
A
R
 
R
L
 
Y
A
 
G
Q
 
Q
P
 
P
A
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
G
I
 
T
Y
 
I
T
 
R
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
T
D
 
D
D
 
P
-
 
A
A
 
A
S
 
A
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
T
I
 
F
E
 
N
A
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
V
L
 
M

4dmmB 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from synechococcus elongatus pcc 7942 in complex with NADP
43% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 1:239/240 of 4dmmB

query
sites
4dmmB
M
 
L
K
 
P
L
 
L
Q
 
T
G
 
D
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
A
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
Q
 
L
R
 
E
F
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
V
C
x
N
D
x
Y
V
x
A
Q
x
S
E
x
S
E
 
A
-
 
G
R
 
A
V
 
A
R
 
D
A
 
E
A
 
V
A
 
V
E
 
A
T
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
A
S
 
A
G
 
G
A
 
G
T
 
E
V
 
A
S
 
F
A
 
A
Y
 
V
K
 
K
V
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
Q
R
 
E
D
 
S
E
 
E
V
 
V
D
 
E
A
 
A
M
 
L
V
 
F
A
 
A
A
 
A
T
 
V
L
 
I
A
 
E
R
 
R
H
 
W
G
 
G
R
 
R
V
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
K
 
R
D
 
D
A
 
T
R
 
L
L
 
L
T
 
L
K
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
R
A
 
D
Q
 
D
F
 
W
D
 
Q
A
 
S
V
 
V
I
 
L
D
 
D
V
x
L
N
 
N
L
 
L
K
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
L
C
 
C
A
 
S
Q
 
R
A
 
A
V
 
A
A
 
A
D
 
K
I
 
I
M
 
M
T
 
L
E
 
K
Q
 
Q
G
 
R
K
 
S
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
x
I
S
x
A
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
E
Y
 
M
G
 
G
N
 
N
F
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
T
 
T
W
 
V
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
F
|
F
V
x
I
A
 
A
T
|
T
E
x
D
-
x
M
-
x
T
-
 
S
I
 
L
L
 
L
Q
 
E
T
 
V
V
 
I
P
 
P
E
 
-
K
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
M
 
-
K
 
-
S
 
-
S
 
-
C
 
-
W
 
-
L
 
L
R
 
G
R
 
R
L
 
Y
A
 
G
Q
 
E
P
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
G
I
 
V
Y
 
V
T
 
R
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
A
D
 
D
D
 
P
-
 
A
A
 
A
S
 
A
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
V
I
 
I
E
 
N
A
 
I
S
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
L
S
 
V
L
 
M

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
39% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 1:243/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
M
 
M
K
 
S
L
 
F
Q
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
I
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
A
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
F
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
Q
 
E
R
 
T
F
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
G
C
 
T
D
x
A
V
x
T
Q
 
S
E
 
E
E
 
S
R
 
G
V
 
A
R
 
Q
A
 
A
A
 
I
A
 
S
E
 
D
T
 
Y
L
 
L
A
 
G
A
 
A
S
 
N
G
 
G
A
 
-
T
 
-
V
 
-
S
 
K
A
 
G
Y
 
L
K
 
M
V
x
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
R
 
D
R
 
P
D
 
A
E
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
S
M
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
N
T
 
V
L
 
R
A
 
A
R
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
E
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
K
 
R
D
 
D
A
 
N
R
 
L
L
 
L
T
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
D
A
 
D
Q
 
E
F
 
W
D
 
N
A
 
D
V
 
I
I
 
I
D
 
E
V
x
T
N
 
N
L
 
L
K
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
N
 
R
C
 
L
A
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
M
D
 
R
I
 
A
M
 
M
T
 
M
E
 
K
Q
 
K
G
 
R
K
 
H
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
T
A
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
T
Y
 
M
G
 
G
N
 
N
F
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
F
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
S
K
 
K
T
 
S
W
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
I
A
 
E
T
 
T
E
 
D
I
 
M
L
 
T
Q
 
R
T
 
A
V
 
L
P
 
T
E
 
D
K
 
E
V
 
Q
L
 
R
D
 
A
G
 
G
M
 
T
K
 
L
S
 
A
S
 
A
C
 
V
W
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
T
P
 
P
A
 
N
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
S
I
 
A
Y
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
E
A
 
T
I
 
L
E
 
H
A
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
Y
L
 
M

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
40% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 4:246/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
M
 
M
K
 
N
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
A
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
Q
 
E
R
 
L
F
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
G
C
 
T
D
x
A
V
x
T
Q
 
S
E
 
E
E
 
S
R
 
G
V
 
A
R
 
Q
A
 
A
A
 
I
A
 
S
E
 
D
T
 
Y
L
 
L
A
 
G
A
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
K
T
 
G
V
 
M
S
 
A
A
 
-
Y
 
-
K
 
-
V
x
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
R
 
N
R
 
P
D
 
E
E
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
A
M
 
V
V
 
L
A
 
K
A
 
A
T
 
I
L
 
T
A
 
D
R
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
K
 
R
D
 
D
A
 
N
R
 
L
L
 
L
T
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
E
A
 
E
Q
 
E
F
 
W
D
 
S
A
 
D
V
 
I
I
 
M
D
 
E
V
x
T
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
S
V
 
I
F
 
F
N
 
R
C
 
L
A
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
L
D
 
R
I
 
G
M
 
M
T
 
M
E
 
K
Q
 
K
G
 
R
K
 
Q
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
x
V
S
x
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
T
Y
 
M
G
 
G
N
 
N
F
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
T
 
S
W
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
F
|
F
V
x
I
A
 
E
T
|
T
E
x
D
I
x
M
L
 
T
Q
 
K
T
 
A
V
 
L
P
 
N
E
 
D
K
 
E
V
 
Q
L
 
R
D
 
T
G
 
A
M
 
T
K
 
L
S
 
A
S
 
Q
C
 
V
W
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
A
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
S
I
 
A
Y
 
V
T
 
A