SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS17660 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS17660 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
52% identity, 100% coverage: 2:246/246 of query aligns to 4:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
K
 
R
L
 
L
Q
 
Q
G
 
D
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
A
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
L
A
 
E
T
 
A
A
 
A
Q
 
R
R
 
V
F
 
F
A
 
M
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
I
C
 
A
D
|
D
V
x
F
Q
 
N
E
 
E
E
 
-
R
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
A
A
 
A
A
 
G
E
 
K
T
 
E
L
 
A
A
 
V
A
 
E
S
 
A
G
 
N
A
 
P
T
 
G
V
 
V
S
 
V
A
 
F
Y
 
I
K
 
R
V
|
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
D
R
 
R
D
 
E
E
 
S
V
 
V
D
 
H
A
 
R
M
 
L
V
 
V
A
 
E
A
 
N
T
 
V
L
 
A
A
 
E
R
 
R
H
 
F
G
 
G
R
 
K
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
K
 
R
D
|
D
A
 
S
R
 
M
L
 
L
T
 
S
K
|
K
M
 
M
T
 
T
E
 
V
A
 
D
Q
 
Q
F
 
F
D
 
Q
A
 
Q
V
 
V
I
 
I
D
 
N
V
 
V
N
|
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
H
C
 
C
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
L
D
 
P
I
 
Y
M
 
M
T
 
A
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
K
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
x
T
S
 
S
S
|
S
V
 
V
V
 
T
G
 
G
L
 
T
Y
 
Y
G
 
G
N
|
N
F
x
V
G
 
G
Q
|
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
K
T
 
T
W
 
W
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
R
K
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
F
|
F
V
x
T
A
 
E
T
|
T
E
 
A
I
x
M
L
 
V
Q
 
A
T
 
E
V
 
V
P
 
P
E
 
E
K
 
K
V
 
V
L
 
I
D
 
E
G
x
K
M
 
M
K
 
K
S
 
A
S
 
Q
C
 
V
W
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
K
P
 
P
A
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
I
 
A
Y
 
Y
T
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
D
 
E
A
 
S
S
 
D
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
H
A
 
V
I
 
L
E
 
H
A
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
I
S
 
M
L
 
M

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
52% identity, 100% coverage: 2:246/246 of query aligns to 2:239/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
K
 
K
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
A
x
K
G
|
G
I
x
L
G
 
G
F
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
A
Q
 
L
R
 
A
F
 
Y
A
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
G
D
|
D
V
x
L
Q
 
G
E
 
D
E
 
-
R
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
L
A
 
T
A
 
Y
S
 
S
G
 
H
A
 
P
T
 
N
V
 
V
S
 
E
A
 
G
Y
 
M
K
 
Y
V
x
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
R
 
D
R
 
V
D
 
T
E
 
G
V
 
V
D
 
E
A
 
K
M
 
F
V
 
Y
A
 
Q
A
 
S
T
 
V
L
 
I
A
 
D
R
 
K
H
 
Y
G
 
G
R
 
K
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
T
 
T
K
 
K
D
 
D
A
 
A
R
 
M
L
 
T
T
 
R
K
 
K
M
 
M
T
 
T
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
F
 
W
D
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
C
 
L
A
 
T
Q
 
R
A
 
L
V
 
V
A
 
G
D
 
P
I
 
Q
M
 
M
T
 
Q
E
 
T
Q
 
N
G
 
G
K
 
Y
G
 
G
V
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
x
I
S
 
S
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
F
G
 
G
N
 
N
F
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
T
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
M
T
 
T
W
 
W
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
F
G
 
A
P
 
L
K
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
N
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
Y
V
x
I
A
 
M
T
|
T
E
 
D
I
 
I
L
 
L
Q
 
K
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
K
 
D
V
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
K
M
 
F
K
 
A
S
 
A
S
 
L
C
 
T
W
 
M
L
 
L
R
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
Q
P
 
P
A
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
K
I
 
V
Y
 
A
T
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
T
I
 
I
E
 
N
A
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
R
L
 
L

4nbwA Crystal structure of fabg from plesiocystis pacifica (see paper)
54% identity, 97% coverage: 6:244/246 of query aligns to 2:249/253 of 4nbwA

query
sites
4nbwA
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
A
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
R
A
 
A
T
 
T
A
 
A
Q
 
L
R
 
E
F
 
F
A
 
A
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
A
 
Y
L
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
A
C
 
W
D
|
D
V
x
L
Q
 
A
E
 
E
E
 
E
R
 
A
V
 
G
R
 
A
A
 
A
A
 
L
A
 
I
E
 
A
T
 
E
L
 
I
A
 
A
A
 
D
S
 
A
G
 
G
A
 
G
T
 
S
V
 
A
S
 
D
A
 
F
Y
 
A
K
 
R
V
|
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
A
R
 
A
D
 
E
E
 
S
V
 
V
D
 
E
A
 
A
M
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
E
T
 
I
L
 
I
A
 
A
R
 
E
H
 
H
G
 
G
R
 
R
V
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
T
 
L
K
 
H
D
 
D
A
 
G
R
 
Q
L
 
L
T
 
V
K
 
K
-
 
V
-
 
K
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
V
-
 
K
-
 
K
M
 
M
T
 
A
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
F
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
S
V
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
L
C
 
C
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
P
I
 
H
M
 
M
T
 
I
E
 
A
Q
 
A
G
 
K
K
 
Y
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
L
N
 
N
A
 
A
S
 
S
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
K
T
 
V
W
 
W
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
R
K
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
V
x
I
A
 
A
T
|
T
E
 
E
I
 
M
L
 
V
Q
 
Q
T
 
Q
V
 
M
P
 
P
E
 
E
K
 
R
V
 
V
L
 
L
D
 
E
G
 
A
M
 
M
K
 
V
S
 
A
S
 
R
C
 
T
W
 
P
L
 
V
R
 
G
R
 
R
L
 
I
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
A
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
R
I
 
A
Y
 
Y
T
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
D
 
E
A
 
S
S
 
G
Y
 
F
V
 
I
N
 
S
G
 
G
V
 
T
A
 
T
I
 
L
E
 
S
A
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
48% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 4:247/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
M
 
M
K
 
K
L
 
L
Q
 
A
G
 
S
R
 
K
V
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
A
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
F
A
 
G
T
 
I
A
 
A
Q
 
Q
R
 
V
F
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
I
C
 
A
D
|
D
V
 
-
Q
x
R
E
 
D
E
 
A
R
 
H
V
 
G
R
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
R
A
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
Q
V
 
A
S
 
L
A
 
F
Y
 
I
K
 
S
V
x
C
D
 
N
V
x
I
T
 
A
R
 
E
R
 
K
D
 
T
E
 
Q
V
 
V
D
 
E
A
 
A
M
 
L
V
 
F
A
 
S
A
 
Q
T
 
A
L
 
E
A
 
E
R
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
P
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
T
 
N
K
 
R
D
 
D
A
 
A
R
 
M
L
 
L
T
 
H
K
 
K
M
 
L
T
 
T
E
 
E
A
 
A
Q
 
D
F
 
W
D
 
D
A
 
T
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
|
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
N
 
L
C
 
C
A
 
M
Q
 
Q
A
 
Q
V
 
A
A
 
A
D
 
I
I
 
R
M
 
M
T
 
R
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
K
 
A
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
 
I
S
 
A
S
 
S
V
 
A
V
 
S
G
 
W
L
 
L
Y
 
-
G
 
G
N
 
N
F
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
K
T
 
T
W
 
A
A
 
C
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
K
K
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
C
P
 
P
G
 
G
F
 
F
V
x
I
A
 
D
T
|
T
E
 
D
I
 
M
L
x
T
Q
 
R
T
 
G
V
 
V
P
 
P
E
 
E
K
 
N
V
 
V
L
 
W
D
 
Q
G
 
I
M
 
M
K
 
V
S
 
S
S
 
K
C
 
I
W
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
Y
L
 
A
A
 
G
Q
 
E
P
 
A
A
 
K
E
 
D
I
 
V
A
 
G
S
 
E
I
 
C
Y
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
A
S
 
R
Y
 
Y
V
 
I
N
 
N
G
 
G
V
 
E
A
 
V
I
 
I
E
 
N
A
 
V
S
 
G
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
V
L
 
L

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
46% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 1:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
M
K
 
T
L
 
L
Q
 
Q
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
S
A
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
R
A
 
D
T
 
I
A
 
A
Q
 
I
R
 
N
F
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
N
V
 
I
V
 
F
L
 
F
-
x
N
C
x
Y
D
x
N
V
x
G
Q
x
S
E
 
P
E
 
E
R
 
A
V
 
A
R
 
E
A
 
E
A
 
T
A
 
A
E
 
K
T
 
L
L
 
V
A
 
A
A
 
E
S
 
H
G
 
G
A
 
V
T
 
E
V
 
V
S
 
E
A
 
A
Y
 
M
K
 
K
V
 
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
R
 
I
R
 
A
D
 
E
E
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
M
 
F
V
 
F
A
 
K
A
 
Q
T
 
A
L
 
I
A
 
E
R
 
R
H
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
T
 
T
K
 
R
D
 
D
A
 
N
R
 
L
L
 
L
T
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
E
A
 
D
Q
 
E
F
 
W
D
 
D
A
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
N
V
x
I
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
N
 
L
C
 
C
A
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
S
D
 
R
I
 
T
M
 
M
T
 
M
E
 
K
Q
 
Q
G
 
R
K
 
A
G
 
G
V
 
K
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
 
M
S
 
A
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
I
G
 
G
N
 
N
F
 
A
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
T
 
T
W
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
K
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
F
 
F
V
x
I
A
 
T
T
|
T
E
 
D
I
 
M
L
 
T
Q
 
D
T
 
K
V
 
L
P
 
D
E
 
E
K
 
K
V
 
T
L
 
K
D
 
E
G
 
A
M
 
M
K
 
L
S
 
A
S
 
Q
C
 
I
W
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
A
L
 
Y
A
 
G
Q
 
T
P
 
T
A
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
I
 
A
Y
 
V
T
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
A
A
 
S
S
 
K
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
T
I
 
L
E
 
S
A
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
V
L
 
M

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
44% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 1:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
M
 
M
K
 
K
L
 
M
Q
 
T
G
 
-
R
 
K
V
 
S
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
A
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
F
 
R
A
 
S
T
 
I
A
 
A
Q
 
L
R
 
Q
F
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
L
 
N
V
 
V
V
 
A
L
 
V
C
 
N
D
 
Y
V
 
A
-
 
G
Q
 
S
E
 
K
E
 
E
R
 
K
V
 
A
R
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
V
E
 
E
T
 
E
L
 
I
A
 
K
A
 
A
S
 
K
G
 
G
A
 
V
T
 
D
V
 
S
S
 
F
A
 
A
Y
 
I
K
 
Q
V
 
A
D
 
N
V
 
V
T
 
A
R
 
D
R
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
D
 
K
A
 
A
M
 
M
V
 
I
A
 
K
A
 
E
T
 
V
L
 
V
A
 
S
R
 
Q
H
 
F
G
 
G
R
 
S
V
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
K
 
R
D
 
D
A
 
N
R
 
L
L
 
L
T
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
E
A
 
Q
Q
 
E
F
 
W
D
 
D
A
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
C
 
C
A
 
I
Q
 
Q
A
 
K
V
 
A
A
 
T
D
 
P
I
 
Q
M
 
M
T
 
L
E
 
R
Q
 
Q
G
 
R
K
 
S
G
 
G
V
 
A
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
 
L
S
 
S
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
A
Y
 
V
G
 
G
N
 
N
F
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
T
 
S
W
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
I
A
 
V
T
 
S
E
 
D
I
 
M
L
 
T
Q
 
D
T
 
A
V
 
L
P
 
S
E
 
D
K
 
E
V
 
L
L
 
K
D
 
E
G
 
Q
M
 
M
K
 
L
S
 
T
S
 
Q
C
 
I
W
 
P
L
 
L
R
 
A
R
 
R
L
 
F
A
 
G
Q
 
Q
P
 
D
A
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
I
 
T
Y
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
K
A
 
A
S
 
K
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
T
I
 
I
E
 
H
A
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
Y
L
 
M

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
44% identity, 98% coverage: 6:246/246 of query aligns to 2:239/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
R
 
K
V
 
S
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
A
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
R
A
 
S
T
 
I
A
 
A
Q
 
L
R
 
Q
F
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
L
 
N
V
 
V
V
 
A
L
 
V
C
x
N
D
x
Y
V
x
A
-
x
G
Q
x
S
E
 
K
E
 
E
R
 
K
V
 
A
R
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
V
E
 
E
T
 
E
L
 
I
A
 
K
A
 
A
S
 
K
G
 
G
A
 
V
T
 
D
V
 
S
S
 
F
A
 
A
Y
 
I
K
 
Q
V
x
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
R
 
D
R
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
D
 
K
A
 
A
M
 
M
V
 
I
A
 
K
A
 
E
T
 
V
L
 
V
A
 
S
R
 
Q
H
 
F
G
 
G
R
 
S
V
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
K
 
R
D
 
D
A
 
N
R
 
L
L
 
L
T
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
E
A
 
Q
Q
 
E
F
 
W
D
 
D
A
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
x
T
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
C
 
C
A
 
I
Q
 
Q
A
 
K
V
 
A
A
 
T
D
 
P
I
 
Q
M
 
M
T
 
L
E
 
R
Q
 
Q
G
 
R
K
 
S
G
 
G
V
 
A
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
 
L
S
 
S
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
A
Y
 
V
G
 
G
N
 
N
F
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
T
 
S
W
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
V
 
I
A
 
V
T
 
S
E
 
D
I
 
M
L
 
T
Q
 
D
T
 
E
V
 
L
P
 
K
E
 
E
K
 
Q
V
 
M
L
 
L
D
 
-
G
 
-
M
 
-
K
 
-
S
 
T
S
 
Q
C
 
I
W
 
P
L
 
L
R
 
A
R
 
R
L
 
F
A
 
G
Q
 
Q
P
 
D
A
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
I
 
T
Y
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
K
A
 
A
S
 
K
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
T
I
 
I
E
 
H
A
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
Y
L
 
M

4cqlI Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD (see paper)
42% identity, 99% coverage: 2:244/246 of query aligns to 5:249/251 of 4cqlI

query
sites
4cqlI
K
 
R
L
 
L
Q
 
R
G
 
S
R
 
A
V
 
L
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
G
A
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
R
A
 
A
T
 
V
A
 
S
Q
 
V
R
 
R
F
 
L
A
 
A
A
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
T
V
 
V
V
 
A
L
 
A
C
 
C
D
|
D
V
x
L
Q
 
D
E
 
R
E
 
A
R
 
A
V
 
A
R
 
Q
A
 
E
A
 
T
A
 
V
E
 
R
T
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
G
S
 
P
G
 
G
A
 
S
T
 
N
V
 
H
S
 
A
A
 
A
Y
 
F
K
 
Q
V
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
E
R
 
A
D
 
R
E
 
A
V
 
A
D
 
R
A
 
C
M
 
L
V
 
L
A
 
E
A
 
Q
T
 
V
L
 
Q
A
 
A
R
 
C
H
 
F
G
 
S
R
 
R
V
 
P
-
 
P
D
 
S
I
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
S
N
x
C
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
K
 
Q
D
 
D
A
 
E
R
 
F
L
 
L
T
 
L
K
 
H
M
 
M
T
 
S
E
 
E
A
 
D
Q
 
D
F
 
W
D
 
D
A
 
K
V
 
V
I
 
I
D
 
A
V
|
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
N
 
L
C
 
V
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
A
D
 
Q
I
 
A
M
 
L
T
 
V
E
 
S
Q
 
N
G
 
G
-
 
C
K
 
R
G
 
G
V
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
x
I
S
 
S
S
|
S
V
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
K
Y
 
V
G
 
G
N
 
N
F
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
Q
T
 
T
W
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
R
K
 
H
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
S
V
 
V
C
 
L
P
|
P
G
|
G
F
 
F
V
x
I
A
 
A
T
|
T
E
 
P
I
x
M
L
 
T
Q
 
Q
T
 
K
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
K
 
K
V
 
V
L
 
V
D
 
D
G
 
K
M
 
I
K
 
T
S
 
E
S
 
M
C
 
I
W
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
H
L
 
L
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
A
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
S
 
D
I
 
V
Y
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
D
 
D
A
 
S
S
 
G
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
T
A
 
S
I
 
V
E
 
E
A
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
G
M
 
L

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
43% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 1:245/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
M
|
M
K
 
G
L
 
I
Q
 
Q
G
 
N
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
A
A
x
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
F
 
K
A
 
Q
T
 
T
A
 
A
Q
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
I
C
 
N
D
|
D
V
 
I
Q
 
D
E
 
A
E
 
E
R
 
K
V
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
T
A
 
V
E
 
D
T
 
E
L
 
F
A
 
S
A
 
A
S
 
R
G
 
G
A
 
H
T
 
R
V
 
V
S
 
L
A
 
G
Y
 
A
K
 
V
V
 
A
D
|
D
V
x
I
T
 
G
R
 
N
R
 
K
D
 
A
E
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
G
M
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
Q
T
 
T
L
 
I
A
 
D
R
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
M
T
 
E
K
 
R
D
 
A
A
 
G
R
 
A
L
 
L
T
 
R
K
 
K
M
 
L
T
 
S
E
 
E
A
 
A
Q
 
D
F
 
W
D
 
D
A
 
V
V
 
T
I
 
I
D
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
N
 
L
C
 
C
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
H
D
 
G
I
 
H
M
 
M
T
 
V
E
 
E
Q
 
N
G
 
K
K
 
H
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
V
N
 
N
A
 
I
S
 
A
S
 
S
V
 
R
V
 
A
G
 
W
L
 
L
Y
 
-
G
 
G
N
 
G
F
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
S
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
R
T
 
A
W
 
L
A
 
A
R
 
I
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
R
K
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
L
V
 
I
A
 
H
T
 
T
E
 
P
I
 
M
L
 
W
Q
 
D
T
 
E
V
 
L
P
 
P
E
 
E
K
 
K
V
 
D
L
 
Q
D
 
Q
G
 
F
M
 
L
K
 
L
S
 
S
S
 
R
C
 
Q
W
 
P
L
 
T
R
 
G
R
 
K
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
P
 
P
A
 
D
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
I
 
T
Y
 
L
T
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
D
 
D
A
 
S
S
 
G
Y
 
F
V
 
V
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
V
I
 
L
E
 
Y
A
 
V
S
 
C
G
 
G
G
 
G
M
 
R
S
 
S
L
 
L

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
43% identity, 99% coverage: 3:246/246 of query aligns to 2:244/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
Q
 
Q
G
 
N
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
A
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
F
 
K
A
 
Q
T
 
T
A
 
A
Q
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
I
C
 
N
D
|
D
V
x
I
Q
 
D
E
 
A
E
 
E
R
 
K
V
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
T
A
 
V
E
 
D
T
 
E
L
 
F
A
 
S
A
 
A
S
 
R
G
 
G
A
 
H
T
 
R
V
 
V
S
 
L
A
 
G
Y
 
A
K
 
V
V
 
A
D
 
D
V
x
I
T
 
G
R
 
N
R
 
K
D
 
A
E
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
G
M
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
Q
T
 
T
L
 
I
A
 
D
R
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
M
T
 
E
K
 
R
D
 
A
A
 
G
R
 
A
L
 
L
T
 
R
K
 
K
M
 
L
T
 
S
E
 
E
A
 
A
Q
 
D
F
 
W
D
 
D
A
 
V
V
 
T
I
 
I
D
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
N
 
L
C
 
C
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
H
D
 
G
I
 
H
M
 
M
T
 
V
E
 
E
Q
 
N
G
 
K
K
 
H
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
V
N
 
N
A
x
I
S
 
A
S
|
S
V
 
R
V
 
A
G
 
W
L
 
L
Y
 
-
G
 
G
N
 
G
F
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
S
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
R
T
 
A
W
 
L
A
 
A
R
 
I
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
R
K
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
L
V
x
I
A
 
H
T
 
T
E
 
P
I
 
M
L
 
W
Q
 
D
T
 
E
V
 
L
P
 
P
E
 
E
K
 
K
V
 
D
L
 
Q
D
 
Q
G
 
F
M
 
L
K
 
L
S
 
S
S
 
R
C
 
Q
W
 
P
L
 
T
R
 
G
R
 
K
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
P
 
P
A
 
D
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
I
 
T
Y
 
L
T
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
D
 
D
A
 
S
S
 
G
Y
 
F
V
 
V
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
V
I
 
L
E
 
Y
A
 
V
S
 
C
G
 
G
G
 
G
M
 
R
S
 
S
L
 
L

4cqmA Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD and NADP (see paper)
42% identity, 99% coverage: 2:244/246 of query aligns to 3:246/248 of 4cqmA

query
sites
4cqmA
K
 
R
L
 
L
Q
 
R
G
 
S
R
 
A
V
 
L
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
A
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
R
A
 
A
T
 
V
A
 
S
Q
 
V
R
 
R
F
 
L
A
 
A
A
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
T
V
 
V
V
 
A
L
 
A
C
 
C
D
|
D
V
x
L
Q
 
D
E
 
R
E
 
A
R
 
A
V
 
A
R
 
Q
A
 
E
A
 
T
A
 
V
E
 
R
T
 
L
L
 
L
A
 
P
A
 
P
S
 
R
G
 
G
A
 
-
T
 
N
V
 
H
S
 
A
A
 
A
Y
 
F
K
 
Q
V
x
A
D
 
D
V
|
V
T
 
S
R
 
E
R
 
A
D
 
R
E
 
A
V
 
A
D
 
R
A
 
C
M
 
L
V
 
L
A
 
E
A
 
Q
T
 
V
L
 
Q
A
 
A
R
 
C
H
 
F
G
 
S
R
 
R
V
 
P
-
 
P
D
 
S
I
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
S
N
x
C
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
K
 
Q
D
 
D
A
 
E
R
 
F
L
 
L
T
 
L
K
 
H
M
 
M
T
 
S
E
 
E
A
 
D
Q
 
D
F
 
W
D
 
D
A
 
K
V
 
V
I
 
I
D
 
A
V
|
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
N
 
L
C
 
V
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
A
D
 
Q
I
 
A
M
 
L
T
 
V
E
 
S
Q
 
N
G
 
G
-
 
C
K
 
R
G
 
G
V
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
x
I
S
 
S
S
|
S
V
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
K
Y
 
V
G
 
G
N
 
N
F
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
Q
T
 
T
W
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
R
K
 
H
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
S
V
 
V
C
 
L
P
|
P
G
|
G
F
 
F
V
x
I
A
 
A
T
|
T
E
x
P
I
x
M
L
x
T
Q
 
Q
T
 
K
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
K
 
K
V
 
V
L
 
V
D
 
D
G
 
K
M
 
I
K
 
T
S
 
E
S
 
M
C
 
I
W
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
H
L
 
L
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
A
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
S
 
D
I
 
V
Y
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
D
 
D
A
 
S
S
 
G
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
T
A
 
S
I
 
V
E
 
E
A
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
G
M
 
L

Q92506 (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase; 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 8; 17-beta-HSD 8; HSD17B8; 3-ketoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase alpha subunit; KAR alpha subunit; 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; Estradiol 17-beta-dehydrogenase 8; Protein Ke6; Ke6; Short chain dehydrogenase/reductase family 30C member 1; Testosterone 17-beta-dehydrogenase 8; EC 1.1.1.n12; EC 1.1.1.62; EC 1.1.1.239 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
41% identity, 99% coverage: 2:244/246 of query aligns to 8:259/261 of Q92506

query
sites
Q92506
K
 
R
L
 
L
Q
 
R
G
 
S
R
 
A
V
 
L
A
 
A
I
x
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
A
x
G
A
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
R
A
 
A
T
 
V
A
 
S
Q
 
V
R
 
R
F
 
L
A
 
A
A
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
T
V
 
V
V
 
A
L
 
A
C
 
C
D
|
D
V
x
L
Q
 
D
E
 
R
E
 
A
R
 
A
V
 
A
R
 
Q
A
 
E
A
 
T
A
 
V
E
 
R
T
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
G
S
 
P
G
 
G
A
 
S
-
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
P
-
 
P
-
 
R
-
 
G
T
 
N
V
 
H
S
 
A
A
 
A
Y
 
F
K
 
Q
V
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
E
R
 
A
D
 
R
E
 
A
V
 
A
D
 
R
A
 
C
M
 
L
V
 
L
A
 
E
A
 
Q
T
 
V
L
 
Q
A
 
A
R
 
C
H
 
F
G
 
S
R
 
R
V
 
P
-
 
P
D
 
S
I
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
S
N
 
C
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
K
 
Q
D
 
D
A
 
E
R
 
F
L
 
L
T
 
L
K
 
H
M
 
M
T
 
S
E
 
E
A
 
D
Q
 
D
F
 
W
D
 
D
A
 
K
V
 
V
I
 
I
D
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
N
 
L
C
 
V
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
A
D
 
Q
I
 
A
M
 
L
T
 
V
E
 
S
Q
 
N
G
 
G
-
 
C
K
x
R
G
 
G
V
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
 
I
S
 
S
S
 
S
V
 
I
V
|
V
G
 
G
L
 
K
Y
 
V
G
 
G
N
 
N
F
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
|
A
A
|
A
S
|
S
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
Q
T
 
T
W
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
x
R
K
 
H
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
S
V
 
V
C
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
F
V
x
I
A
|
A
T
|
T
E
 
P
I
 
M
L
 
T
Q
 
Q
T
 
K
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
K
 
K
V
 
V
L
 
V
D
 
D
G
 
K
M
 
I
K
 
T
S
 
E
S
 
M
C
 
I
W
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
H
L
 
L
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
A
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
S
 
D
I
 
V
Y
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
D
 
D
A
 
S
S
 
G
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
T
A
 
S
I
 
V
E
 
E
A
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
G
M
 
L

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
45% identity, 99% coverage: 3:246/246 of query aligns to 4:246/247 of P73574

query
sites
P73574
L
 
L
Q
 
T
G
 
A
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
|
A
A
 
S
A
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
F
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
A
Q
 
L
R
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
T
G
 
G
A
 
M
L
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
V
C
 
N
D
 
Y
V
 
A
Q
 
Q
E
 
S
E
 
S
R
 
T
V
 
A
R
 
A
A
 
D
A
 
A
-
 
V
-
 
V
A
 
A
E
 
E
T
 
I
L
 
I
A
 
A
A
 
N
S
 
G
G
 
G
A
 
E
T
 
A
V
 
I
S
 
-
A
 
A
Y
 
V
K
 
Q
V
 
A
D
 
N
V
 
V
T
 
A
R
 
N
R
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
D
 
D
A
 
Q
M
 
L
V
 
I
A
 
K
A
 
T
T
 
T
L
 
L
A
 
D
R
 
K
H
 
F
G
 
S
R
 
R
V
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
K
 
R
D
 
D
A
 
T
R
 
L
L
 
L
T
 
L
K
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
L
A
 
E
Q
 
D
F
 
W
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
L
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
L
C
 
C
A
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
S
D
 
K
I
 
L
M
 
M
T
 
L
E
 
K
Q
 
Q
G
 
K
K
 
S
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
 
I
S
 
T
S
 
S
V
 
V
V
 
A
G
 
G
L
 
M
Y
 
M
G
 
G
N
 
N
F
x
P
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
T
 
T
W
 
V
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
|
F
V
 
I
A
 
A
T
 
T
E
 
D
I
 
M
L
 
T
Q
 
E
T
 
N
V
 
L
-
x
N
P
 
A
E
 
E
K
 
P
V
 
I
L
 
L
D
 
Q
G
 
F
M
 
I
K
 
P
S
 
-
S
 
-
C
 
-
W
 
-
L
 
L
R
 
A
R
 
R
L
 
Y
A
 
G
Q
 
Q
P
 
P
A
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
G
I
 
T
Y
 
I
T
 
R
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
T
D
 
D
D
 
P
-
 
A
A
 
A
S
 
A
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
T
I
 
F
E
 
N
A
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
V
L
 
M

4dmmB 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from synechococcus elongatus pcc 7942 in complex with NADP
43% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 1:239/240 of 4dmmB

query
sites
4dmmB
M
 
L
K
 
P
L
 
L
Q
 
T
G
 
D
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
A
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
Q
 
L
R
 
E
F
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
V
C
 
N
D
 
Y
V
x
A
Q
x
S
E
x
S
E
 
A
-
 
G
R
 
A
V
 
A
R
 
D
A
 
E
A
 
V
A
 
V
E
 
A
T
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
A
S
 
A
G
 
G
A
 
G
T
 
E
V
 
A
S
 
F
A
 
A
Y
 
V
K
 
K
V
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
Q
R
 
E
D
 
S
E
 
E
V
 
V
D
 
E
A
 
A
M
 
L
V
 
F
A
 
A
A
 
A
T
 
V
L
 
I
A
 
E
R
 
R
H
 
W
G
 
G
R
 
R
V
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
K
 
R
D
 
D
A
 
T
R
 
L
L
 
L
T
 
L
K
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
R
A
 
D
Q
 
D
F
 
W
D
 
Q
A
 
S
V
 
V
I
 
L
D
 
D
V
x
L
N
 
N
L
 
L
K
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
L
C
 
C
A
 
S
Q
 
R
A
 
A
V
 
A
A
 
A
D
 
K
I
 
I
M
 
M
T
 
L
E
 
K
Q
 
Q
G
 
R
K
 
S
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
x
I
S
 
A
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
E
Y
 
M
G
 
G
N
 
N
F
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
T
 
T
W
 
V
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
V
x
I
A
 
A
T
|
T
E
 
D
-
x
M
-
 
T
-
 
S
I
 
L
L
 
L
Q
 
E
T
 
V
V
 
I
P
 
P
E
 
-
K
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
M
 
-
K
 
-
S
 
-
S
 
-
C
 
-
W
 
-
L
 
L
R
 
G
R
 
R
L
 
Y
A
 
G
Q
 
E
P
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
G
I
 
V
Y
 
V
T
 
R
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
A
D
 
D
D
 
P
-
 
A
A
 
A
S
 
A
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
V
I
 
I
E
 
N
A
 
I
S
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
L
S
 
V
L
 
M

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
39% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 1:243/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
M
 
M
K
 
S
L
 
F
Q
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
I
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
A
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
F
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
Q
 
E
R
 
T
F
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
G
C
 
T
D
 
A
V
x
T
Q
 
S
E
 
E
E
 
S
R
 
G
V
 
A
R
 
Q
A
 
A
A
 
I
A
 
S
E
 
D
T
 
Y
L
 
L
A
 
G
A
 
A
S
 
N
G
 
G
A
 
-
T
 
-
V
 
-
S
 
K
A
 
G
Y
 
L
K
 
M
V
x
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
R
 
D
R
 
P
D
 
A
E
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
S
M
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
N
T
 
V
L
 
R
A
 
A
R
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
E
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
K
 
R
D
 
D
A
 
N
R
 
L
L
 
L
T
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
D
A
 
D
Q
 
E
F
 
W
D
 
N
A
 
D
V
 
I
I
 
I
D
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
N
 
R
C
 
L
A
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
M
D
 
R
I
 
A
M
 
M
T
 
M
E
 
K
Q
 
K
G
 
R
K
 
H
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
T
A
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
T
Y
 
M
G
 
G
N
 
N
F
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
F
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
S
K
 
K
T
 
S
W
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
I
A
 
E
T
 
T
E
 
D
I
 
M
L
 
T
Q
 
R
T
 
A
V
 
L
P
 
T
E
 
D
K
 
E
V
 
Q
L
 
R
D
 
A
G
 
G
M
 
T
K
 
L
S
 
A
S
 
A
C
 
V
W
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
T
P
 
P
A
 
N
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
S
I
 
A
Y
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
E
A
 
T
I
 
L
E
 
H
A
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
Y
L
 
M

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
40% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 4:246/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
M
 
M
K
 
N
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
A
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
F
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
Q
 
E
R
 
L
F
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
G
C
 
T
D
 
A
V
x
T
Q
 
S
E
 
E
E
 
S
R
 
G
V
 
A
R
 
Q
A
 
A
A
 
I
A
 
S
E
 
D
T
 
Y
L
 
L
A
 
G
A
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
K
T
 
G
V
 
M
S
 
A
A
 
-
Y
 
-
K
 
-
V
 
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
R
 
N
R
 
P
D
 
E
E
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
A
M
 
V
V
 
L
A
 
K
A
 
A
T
 
I
L
 
T
A
 
D
R
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
T
 
T
K
 
R
D
 
D
A
 
N
R
 
L
L
 
L
T
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
E
A
 
E
Q
 
E
F
 
W
D
 
S
A
 
D
V
 
I
I
 
M
D
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
S
V
 
I
F
 
F
N
 
R
C
 
L
A
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
L
D
 
R
I
 
G
M
 
M
T
 
M
E
 
K
Q
 
K
G
 
R
K
 
Q
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
x
V
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
T
Y
 
M
G
 
G
N
 
N
F
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
T
 
S
W
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
V
x
I
A
 
E
T
|
T
E
 
D
I
x
M
L
 
T
Q
 
K
T
 
A
V
 
L
P
 
N
E
 
D
K
 
E
V
 
Q
L
 
R
D
 
T
G
 
A
M
 
T
K
 
L
S
 
A
S
 
Q
C
 
V
W
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
A
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
S
I
 
A
Y
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
D
 
E
A
 
A
S
 
A
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
E
A
 
T
I
 
L
E
 
H
A
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
Y
L
 
M

1edoA The x-ray structure of beta-keto acyl carrier protein reductase from brassica napus complexed with NADP+ (see paper)
42% identity, 98% coverage: 7:246/246 of query aligns to 3:244/244 of 1edoA

query
sites
1edoA
V
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
A
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
Q
 
L
R
 
S
F
 
L
A
 
G
A
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
C
L
 
K
V
 
V
V
 
L
L
 
-
C
 
-
D
 
-
V
 
V
Q
x
N
E
x
Y
E
x
A
R
|
R
V
x
S
R
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
T
 
E
L
 
V
A
 
S
-
 
K
-
 
Q
-
 
I
-
 
E
A
 
A
S
 
Y
G
 
G
A
 
G
T
 
Q
V
 
A
S
 
I
A
 
T
Y
 
F
K
 
G
V
 
G
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
K
R
 
E
D
 
A
E
 
D
V
 
V
D
 
E
A
 
A
M
 
M
V
 
M
A
 
K
A
 
T
T
 
A
L
 
I
A
 
D
R
 
A
H
 
W
G
 
G
R
 
T
V
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
K
 
R
D
 
D
A
 
T
R
 
L
L
 
L
T
 
I
K
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
K
A
 
S
Q
 
Q
F
 
W
D
 
D
A
 
E
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
L
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
L
C
 
C
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
T
D
 
K
I
 
I
M
 
M
T
 
M
E
 
K
Q
 
K
G
 
R
K
 
K
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
 
I
S
 
A
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
I
G
 
G
N
 
N
F
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
S
K
 
K
T
 
T
W
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
G
G
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
N
V
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
F
 
F
V
x
I
A
 
A
T
x
S
E
 
D
I
x
M
L
 
T
Q
 
A
T
 
K
V
 
L
P
 
G
E
 
E
K
 
D
V
 
M
L
 
E
D
 
K
G
 
K
M
 
I
K
 
L
S
 
G
S
 
T
C
 
I
W
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
R
L
 
T
A
 
G
Q
 
Q
P
 
P
A
 
E
E
 
N
I
 
V
A
 
A
S
 
G
I
 
L
Y
 
V
T
 
E
F
 
F
L
 
L
A
 
A
-
 
L
S
 
S
D
 
P
D
 
A
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
A
I
 
F
E
 
T
A
 
I
S
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
I
S
 
A
L
 
I

6wprA Crystal structure of a putative 3-oxoacyl-acp reductase (fabg) with NADP(h) from acinetobacter baumannii (see paper)
37% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 1:243/244 of 6wprA

query
sites
6wprA
M
 
M
K
 
T
L
 
Q
Q
 
E
G
 
R
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
A
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
F
 
A
A
 
A
T
 
I
A
 
A
Q
 
Q
R
 
Q
F
 
L
A
 
I
A
 
Q
E
 
D
G
 
G
A
 
Y
L
 
F
V
 
V
V
 
V
L
 
G
C
 
T
D
 
A
V
x
T
Q
 
S
E
 
E
E
 
S
R
 
G
V
 
A
R
 
Q
A
 
K
A
 
L
A
 
T
E
 
D
T
 
S
L
 
F
A
 
G
A
 
E
S
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
G
V
 
L
S
 
A
A
 
-
Y
 
-
K
 
-
V
x
L
D
|
D
V
|
V
T
 
R
R
 
N
R
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
I
D
 
E
A
 
A
M
 
V
V
 
V
A
 
S
A
 
H
T
 
I
L
 
E
A
 
Q
R
 
N
H
 
Y
G
 
G
R
 
P
V
 
V
D
 
L
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
K
 
K
D
 
D
A
 
N
R
 
L
L
 
L
T
 
L
K
 
R
M
 
M
T
 
S
E
 
E
A
 
D
Q
 
D
F
 
W
D
 
D
A
 
D
V
 
I
I
 
L
D
 
N
V
 
I
N
 
H
L
 
L
K
 
K
G
 
A
V
 
V
F
 
Y
N
 
R
C
 
L
A
 
S
Q
 
K
A
 
R
V
 
V
A
 
L
D
 
K
I
 
G
M
 
M
T
 
T
E
 
K
Q
 
A
G
 
R
K
 
F
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
x
I
S
 
S
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
A
L
 
H
Y
 
F
G
 
A
N
 
N
F
 
P
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
I
I
 
E
G
 
A
L
 
F
T
 
S
K
 
R
T
 
S
W
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
M
G
 
G
P
 
S
K
 
R
G
 
Q
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
F
 
F
V
 
I
A
 
A
T
 
T
E
 
E
I
 
M
L
 
T
Q
 
D
T
 
A
V
 
L
P
 
S
E
 
E
K
 
D
V
 
I
L
 
R
D
 
K
G
 
K
M
 
M
K
 
S
S
 
D
S
 
Q
C
 
V
W
 
A
L
 
L
R
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
P
 
P
A
 
Q
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
I
 
A
Y
 
V
T
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
K
A
 
A
S
 
G
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
T
A
 
V
I
 
L
E
 
H
A
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
L
S
 
Y
L
 
M

6t62A Crystal structure of acinetobacter baumannii fabg in complex with NADPH at 1.8 a resolution (see paper)
37% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 1:243/244 of 6t62A

query
sites
6t62A
M
 
M
K
 
A
L
 
Q
Q
 
E
G
 
R
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
A
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
F
 
A
A
 
A
T
 
I
A
 
A
Q
 
Q
R
 
Q
F
 
L
A
 
I
A
 
Q
E
 
D
G
 
G
A
 
Y
L
 
F
V
 
V
V
 
V
L
 
G
C
 
T
D
x
A
V
x
T
Q
 
S
E
 
E
E
 
S
R
 
G
V
 
A
R
 
Q
A
 
K
A
 
L
A
 
T
E
 
D
T
 
S
L
 
F
A
 
G
A
 
E
S
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
G
V
 
L
S
 
A
A
 
-
Y
 
-
K
 
-
V
x
L
D
|
D
V
|
V
T
 
R
R
 
N
R
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
I
D
 
E
A
 
A
M
 
V
V
 
V
A
 
S
A
 
H
T
 
I
L
 
E
A
 
Q
R
 
N
H
 
Y
G
 
G
R
 
P
V
 
V
D
 
L
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
K
 
K
D
 
D
A
 
N
R
 
L
L
 
L
T
 
L
K
 
R
M
 
M
T
 
S
E
 
E
A
 
D
Q
 
D
F
 
W
D
 
D
A
 
D
V
 
I
I
 
L
D
 
N
V
 
I
N
 
H
L
 
L
K
 
K
G
 
A
V
 
V
F
 
Y
N
 
R
C
 
L
A
 
S
Q
 
K
A
 
R
V
 
V
A
 
L
D
 
K
I
 
G
M
 
M
T
 
T
E
 
K
Q
 
A
G
 
R
K
 
F
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
x
I
S
|
S
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
A
L
 
H
Y
 
F
G
 
A
N
 
N
F
 
P
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
I
I
 
E
G
 
A
L
 
F
T
 
S
K
 
R
T
 
S
W
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
M
G
 
G
P
 
S
K
 
R
G
 
Q
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
V
x
I
A
 
A
T
 
T
E
 
E
I
x
M
L
 
T
Q
 
D
T
 
A
V
 
L
P
 
S
E
 
E
K
 
D
V
 
I
L
 
R
D
 
K
G
 
K
M
 
M
K
 
S
S
 
D
S
 
Q
C
 
V
W
 
A
L
 
L
R
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
P
 
P
A
 
Q
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
I
 
A
Y
 
V
T
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
K
A
 
A
S
 
G
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
T
A
 
V
I
 
L
E
 
H
A
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
L
S
 
Y
L
 
M

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
40% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 4:242/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
M
 
M
K
 
N
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
A
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
Q
 
E
R
 
L
F
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
G
C
 
T
D
 
A
V
x
T
Q
 
S
E
 
E
E
 
S
R
 
G
V
 
A
R
 
Q
A
 
A
A
 
I
A
 
S
E
 
D
T
 
Y
L
 
L
A
 
G
A
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
K
T
 
G
V
 
M
S
 
A
A
 
-
Y
 
-
K
 
-
V
 
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
R
 
N
R
 
P
D
 
E
E
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
A
M
 
V
V
 
L
A
 
K
A
 
A
T
 
I
L
 
T
A
 
D
R
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
K
 
R
D
 
D
A
 
N
R
 
L
L
 
L
T
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
E
A
 
E
Q
 
E
F
 
W
D
 
S
A
 
D
V
 
I
I
 
M
D
 
E
V
 
T
N
|
N
L
 
L
K
 
T
G
 
S
V
 
I
F
 
F
N
 
R
C
 
L
A
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
L
D
 
R
I
 
G
M
 
M
T
 
M
E
 
K
Q
 
K
G
 
R
K
 
Q
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
 
V
S
x
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
T
Y
 
M
G
 
G
N
 
N
F
 
A
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
T
 
S
W
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
V
 
I
A
 
E
T
|
T
E
 
D
I
 
M
L
 
N
Q
 
D
T
 
E
V
 
Q
P
 
R
E
 
T
K
 
A
V
 
T
L
 
L
D
 
A
G
 
Q
M
 
V
K
 
P
S
 
A
S
 
G
C
 
-
W
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
A
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
S
I
 
A
Y
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
D
 
E
A
 
A
S
 
A
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
E
A
 
T
I
 
L
E
 
H
A
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
Y
L
 
M

Query Sequence

>RR42_RS17660 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS17660
MKLQGRVAIITGAAAGIGFATAQRFAAEGALVVLCDVQEERVRAAAETLAASGATVSAYK
VDVTRRDEVDAMVAATLARHGRVDILVNNAGITKDARLTKMTEAQFDAVIDVNLKGVFNC
AQAVADIMTEQGKGVILNASSVVGLYGNFGQTNYAASKFGVIGLTKTWARELGPKGVRVN
AVCPGFVATEILQTVPEKVLDGMKSSCWLRRLAQPAEIASIYTFLASDDASYVNGVAIEA
SGGMSL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory