SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS19270 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS19270 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
37% identity, 94% coverage: 3:247/262 of query aligns to 4:254/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
G
 
N
L
 
L
R
 
T
D
 
D
K
 
K
V
 
T
A
 
V
I
 
L
I
 
I
S
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
T
x
S
L
x
G
I
|
I
G
 
G
A
 
Y
G
 
A
V
 
A
A
 
V
S
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
E
 
G
A
 
Q
G
 
Q
T
 
A
R
 
N
V
 
V
A
 
V
I
 
V
L
 
A
D
|
D
I
|
I
D
 
D
A
 
E
S
 
A
G
 
Q
G
 
G
E
 
E
R
 
A
A
 
M
A
 
V
-
 
R
A
 
K
A
 
E
L
 
N
G
 
N
E
 
D
R
 
R
A
 
L
L
 
H
F
 
F
V
 
V
H
 
Q
T
|
T
D
 
D
I
|
I
T
 
T
D
 
D
D
 
E
A
 
A
Q
 
A
V
 
C
A
 
Q
A
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
E
R
 
S
V
 
A
S
 
V
Q
 
H
H
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
L
D
 
D
Y
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
L
x
N
A
 
A
C
x
G
T
 
I
Y
 
E
L
 
I
D
 
V
D
 
A
G
 
P
F
 
I
K
 
H
S
 
E
A
 
M
R
 
E
-
 
L
R
 
S
D
 
D
W
 
W
L
 
N
A
 
K
A
 
V
L
 
L
D
 
Q
V
 
V
N
 
N
V
 
L
V
 
T
S
 
G
G
 
M
V
 
F
M
 
L
L
 
M
A
 
S
Q
 
K
A
 
H
V
 
A
H
 
L
P
 
K
A
 
H
M
 
M
R
 
L
A
 
A
R
 
A
G
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
x
T
T
 
C
S
|
S
I
 
V
S
 
G
A
 
G
N
 
L
V
 
V
G
 
A
Q
 
W
T
 
P
G
 
D
R
 
I
W
 
P
L
 
A
Y
|
Y
P
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
I
 
V
R
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
M
 
M
A
 
A
M
 
V
D
 
D
L
 
Y
A
 
A
P
 
K
D
 
H
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
S
 
C
P
|
P
G
|
G
W
x
I
T
x
I
W
 
D
C
 
T
R
 
P
L
 
L
M
 
N
D
 
E
-
 
K
-
 
S
-
 
F
-
 
L
E
 
E
V
 
N
S
 
N
G
 
E
G
 
G
N
 
T
R
 
L
E
 
E
R
 
E
T
 
I
D
 
K
R
 
K
V
 
E
A
 
K
A
 
A
D
 
K
F
 
V
H
 
N
L
 
P
L
 
L
G
 
L
R
 
R
V
 
L
G
 
G
E
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
Q
 
N
V
 
V
V
 
M
L
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
L
A
 
S
S
 
S
F
 
Y
V
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
S
D
 
A
Y
 
I
A
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
S
 
T
A
 
A

7krmC Putative fabg bound to nadh from acinetobacter baumannii
37% identity, 92% coverage: 4:244/262 of query aligns to 3:240/244 of 7krmC

query
sites
7krmC
L
 
L
R
 
Q
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
I
 
I
S
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
T
x
S
L
 
E
I
 
R
G
|
G
A
x
I
G
 
G
V
 
R
A
 
A
S
 
T
A
 
A
-
 
E
-
 
I
F
 
F
V
 
A
E
 
Q
A
 
Q
G
 
G
T
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
I
I
 
I
L
 
V
D
|
D
I
x
L
D
 
D
A
 
L
S
 
A
G
 
Q
G
 
S
E
 
Q
R
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
G
A
 
H
L
 
M
F
 
G
V
 
L
H
 
A
T
x
A
D
x
N
I
x
V
T
 
A
D
 
N
D
 
E
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
E
R
 
Q
V
 
A
S
 
L
Q
 
Q
H
 
H
F
 
Y
G
 
G
G
 
K
V
 
I
D
 
D
Y
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
L
x
N
A
 
A
-
 
G
C
 
I
T
 
T
Y
 
Q
L
 
P
D
 
I
D
 
K
G
 
T
F
 
L
K
 
D
S
 
I
A
 
Q
R
 
R
R
 
S
D
 
D
W
 
Y
L
 
D
A
 
R
A
 
V
L
 
L
D
 
D
V
|
V
N
 
S
V
 
L
V
 
R
S
 
G
G
 
T
V
 
L
M
 
I
L
 
M
A
 
S
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
H
 
I
P
 
P
A
 
S
M
 
M
R
 
K
A
 
A
R
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
C
F
 
L
T
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
S
A
 
A
N
 
Q
V
 
R
G
 
G
Q
 
G
-
 
G
-
 
I
T
 
F
G
 
G
R
 
G
W
 
P
L
 
H
Y
|
Y
P
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
R
 
L
Q
 
G
L
 
L
T
 
A
R
 
K
S
 
A
M
 
M
A
 
A
M
 
R
D
 
E
L
 
F
A
 
G
P
 
G
D
 
D
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
L
S
 
T
P
 
P
G
 
G
W
 
L
T
x
I
W
 
Q
C
x
T
R
 
D
L
 
M
M
 
N
D
 
D
E
 
D
V
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
R
R
 
R
T
 
H
D
 
D
R
 
I
V
 
L
A
 
A
A
 
G
D
 
I
F
 
P
H
 
-
L
 
-
L
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
E
 
K
P
 
A
D
 
Q
E
 
D
V
 
V
A
 
A
Q
 
N
V
 
A
V
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
L
A
 
S
S
 
A
F
 
Y
V
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
V
D
 
T
Y
 
L
A
 
D
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
34% identity, 93% coverage: 1:244/262 of query aligns to 2:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
M
 
M
K
 
S
G
 
R
L
 
L
R
 
Q
D
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
S
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
T
x
N
L
x
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
G
 
E
V
 
A
A
 
A
S
 
R
A
 
V
F
 
F
V
 
M
E
 
K
A
 
E
G
 
G
T
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
I
L
 
A
D
|
D
I
x
F
D
 
N
A
 
E
S
 
A
G
 
A
G
 
G
E
 
K
R
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
-
G
 
N
E
 
P
R
 
G
A
 
V
L
 
V
F
 
F
V
 
I
H
 
R
T
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
D
 
R
A
 
E
Q
 
S
V
 
V
A
 
H
A
 
R
A
 
L
V
 
V
A
 
E
R
 
N
V
 
V
S
 
A
Q
 
E
H
 
R
F
 
F
G
 
G
G
 
K
V
 
I
D
 
D
Y
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
L
x
N
A
|
A
C
x
G
T
x
I
Y
 
T
L
 
R
D
|
D
D
 
S
G
 
M
F
 
L
K
 
S
S
x
K
A
 
M
R
 
T
R
 
V
D
 
D
-
 
Q
W
 
F
L
 
Q
A
 
Q
A
 
V
L
 
I
D
 
N
V
 
V
N
|
N
V
 
L
V
 
T
S
 
G
G
 
V
V
 
F
M
 
H
L
 
C
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
H
 
L
P
 
P
A
 
Y
M
 
M
R
 
A
A
 
E
R
 
Q
G
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
x
T
T
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
T
A
 
G
N
 
T
V
 
Y
G
 
G
Q
x
N
T
x
V
G
 
G
R
x
Q
W
 
T
L
 
N
Y
|
Y
P
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
R
 
I
Q
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
K
S
 
T
M
 
W
A
 
A
M
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
R
D
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
A
P
|
P
G
 
G
W
x
F
T
|
T
W
 
E
C
x
T
R
 
A
L
x
M
M
 
V
D
 
A
E
 
E
V
 
V
S
 
P
G
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
E
E
 
K
R
 
V
T
 
I
D
 
E
R
x
K
V
 
M
A
 
K
A
 
A
D
 
Q
F
 
V
H
 
P
L
 
-
L
 
M
G
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
E
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
Q
 
N
V
 
A
V
 
Y
L
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
H
H
 
E
A
 
S
S
 
D
F
 
Y
V
 
V
T
 
N
G
 
G
A
 
H
D
 
V
Y
 
L
A
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7xqmB Indel-mutant short chain dehydrogenase bound to sah (see paper)
39% identity, 92% coverage: 7:247/262 of query aligns to 7:244/253 of 7xqmB

query
sites
7xqmB
K
 
K
V
 
G
A
 
V
I
 
L
I
 
V
S
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
G
T
 
-
L
 
-
I
|
I
G
 
G
A
 
A
G
 
-
V
 
I
A
 
A
S
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
A
E
 
R
A
 
E
G
 
G
T
 
A
R
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
L
L
 
C
D
|
D
I
x
L
D
x
R
A
 
P
S
 
E
G
 
G
G
 
K
E
 
E
R
 
V
A
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
I
L
 
G
G
 
G
E
 
A
R
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
F
V
 
F
H
 
Q
T
x
V
D
 
D
I
x
L
T
 
E
D
 
D
D
 
E
A
 
R
Q
 
E
V
 
R
A
 
V
A
 
R
A
 
F
V
 
V
A
 
E
R
 
E
V
 
A
S
 
A
Q
 
Y
H
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
R
V
 
V
D
 
D
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
L
x
N
A
|
A
C
x
A
T
 
I
Y
 
A
L
 
A
D
 
P
D
 
G
G
 
S
F
 
A
K
 
L
S
 
T
A
 
V
R
 
R
-
 
L
R
 
P
D
 
E
W
 
W
L
 
R
A
 
R
A
 
V
L
 
L
D
 
E
V
 
V
N
 
N
V
 
L
V
 
T
S
 
A
G
 
P
V
 
M
M
 
H
L
 
L
A
 
S
Q
 
A
A
 
L
V
 
A
H
 
A
P
 
R
A
 
E
M
 
M
R
 
R
A
 
K
R
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
F
 
V
T
 
A
S
 
S
I
 
V
S
 
Q
A
 
G
N
 
L
V
 
F
G
 
A
Q
 
E
T
 
Q
G
 
E
R
 
N
W
 
A
L
 
A
Y
|
Y
P
 
N
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
G
A
 
G
I
 
L
R
 
V
Q
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
S
M
 
L
A
 
A
M
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
D
 
L
G
 
R
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
A
T
 
I
W
 
A
C
 
T
R
 
E
L
 
A
M
 
V
D
 
L
E
 
E
V
 
A
S
 
I
G
 
A
-
 
L
-
 
S
G
 
P
N
 
D
R
 
P
E
 
E
R
 
R
T
 
T
D
 
R
R
 
R
V
 
D
A
 
W
A
 
E
D
 
D
F
 
L
H
 
H
L
 
A
L
 
L
G
 
R
R
 
R
V
 
L
G
 
G
E
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
V
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
E
H
 
K
A
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
I
Y
 
L
A
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
M
S
 
T
A
 
A

2d1yA Crystal structure of tt0321 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
38% identity, 92% coverage: 7:247/262 of query aligns to 6:238/240 of 2d1yA

query
sites
2d1yA
K
 
K
V
 
G
A
 
V
I
 
L
I
 
V
S
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
T
x
R
L
x
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
G
 
A
V
 
I
A
 
A
S
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
A
E
 
R
A
 
E
G
 
G
T
 
A
R
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
L
L
 
C
D
|
D
I
x
L
D
x
R
A
 
P
S
 
E
G
 
G
G
 
K
E
 
E
R
 
V
A
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
I
L
 
G
G
 
G
E
 
A
R
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
F
V
 
F
H
 
Q
T
x
V
D
|
D
I
x
L
T
 
E
D
 
D
D
 
E
A
 
R
Q
 
E
V
 
R
A
 
V
A
 
R
A
 
F
V
 
V
A
 
E
R
 
E
V
 
A
S
 
A
Q
 
Y
H
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
R
V
 
V
D
 
D
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
L
x
N
A
|
A
C
x
A
T
x
I
Y
 
A
L
 
A
D
 
P
D
 
G
G
 
S
F
 
A
K
 
L
S
 
T
A
 
V
R
 
R
R
 
L
-
 
P
D
 
E
W
 
W
L
 
R
A
 
R
A
 
V
L
 
L
D
 
E
V
 
V
N
 
N
V
 
L
V
 
T
S
 
A
G
 
P
V
 
M
M
 
H
L
 
L
A
 
S
Q
 
A
A
 
L
V
 
A
H
 
A
P
 
R
A
 
E
M
 
M
R
 
R
A
 
K
R
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
F
x
V
T
 
A
S
|
S
I
 
V
S
 
Q
A
 
G
N
 
L
V
 
F
G
 
A
Q
 
E
T
 
Q
G
 
E
R
x
N
W
 
A
L
 
A
Y
|
Y
P
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
I
 
L
R
 
V
Q
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
S
M
 
L
A
 
A
M
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
D
 
L
G
 
R
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
A
T
x
I
W
 
A
C
x
T
R
 
E
L
x
A
M
x
V
D
 
L
E
 
E
V
 
A
S
 
I
G
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
A
D
 
R
R
 
R
V
 
D
A
 
W
A
 
E
D
 
D
F
 
L
H
 
H
L
 
A
L
 
L
G
 
R
R
 
R
V
 
L
G
 
G
E
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
V
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
E
H
 
K
A
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
I
Y
 
L
A
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
M
S
 
T
A
 
A

1nfqA Rv2002 gene product from mycobacterium tuberculosis (see paper)
40% identity, 93% coverage: 4:247/262 of query aligns to 4:239/244 of 1nfqA

query
sites
1nfqA
L
 
L
R
 
T
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
I
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A
T
x
R
L
x
G
I
x
M
G
 
G
A
 
A
G
 
S
V
 
H
A
 
V
S
 
R
A
 
A
F
 
M
V
 
V
E
 
A
A
 
E
G
 
G
T
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
F
L
 
G
D
|
D
I
 
I
D
x
L
A
 
D
S
 
E
G
 
E
G
 
G
E
 
K
R
 
A
A
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
E
L
 
L
G
 
A
E
 
D
R
 
A
A
 
A
L
 
R
F
 
Y
V
 
V
H
 
H
T
x
L
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
Q
D
 
P
A
 
A
Q
 
Q
V
 
W
A
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
D
R
 
T
V
 
A
S
 
V
Q
 
T
H
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
L
D
 
H
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
-
x
N
-
x
A
-
 
G
-
 
I
L
|
L
A
 
N
C
 
I
T
 
G
Y
 
T
L
 
I
D
 
E
D
 
D
G
 
-
F
 
-
K
 
-
S
 
Y
A
 
A
R
 
L
R
 
T
D
 
E
W
 
W
L
 
Q
A
 
R
A
 
I
L
 
L
D
 
D
V
 
V
N
 
N
V
 
L
V
 
-
S
 
T
G
 
G
V
 
V
M
 
F
L
 
L
A
 
G
-
 
I
Q
 
R
A
 
A
V
 
V
H
 
V
P
 
K
A
 
P
M
 
M
R
 
K
A
 
E
R
 
A
G
 
G
G
 
R
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
x
I
T
 
S
S
|
S
I
 
I
S
x
E
A
 
G
N
 
L
V
 
A
G
 
G
Q
 
T
T
 
V
G
 
A
R
x
C
W
 
H
L
 
G
Y
|
Y
P
 
T
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
I
 
V
R
 
R
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
M
 
T
A
 
A
M
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
P
D
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
I
S
 
H
P
|
P
G
 
G
W
 
L
T
x
V
W
 
K
C
x
T
R
x
P
L
x
M
M
x
T
D
 
D
E
 
W
V
|
V
S
 
P
G
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
E
R
 
D
T
x
I
D
x
F
R
 
Q
V
 
T
A
 
A
A
 
-
D
 
-
F
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
A
G
 
A
E
 
E
P
 
P
D
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
S
Q
 
N
V
 
L
V
 
V
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
E
A
 
S
S
 
S
F
 
Y
V
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
E
Y
 
F
A
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
T
S
 
V
A
 
A

1nffA Crystal structure of rv2002 gene product from mycobacterium tuberculosis (see paper)
40% identity, 93% coverage: 4:247/262 of query aligns to 4:239/244 of 1nffA

query
sites
1nffA
L
 
L
R
 
T
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
I
 
V
S
 
S
G
|
G
G
 
G
A
 
A
T
x
R
L
x
G
I
x
M
G
 
G
A
 
A
G
 
S
V
 
H
A
 
V
S
 
R
A
 
A
F
 
M
V
 
V
E
 
A
A
 
E
G
 
G
T
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
F
L
 
G
D
|
D
I
|
I
D
x
L
A
 
D
S
 
E
G
 
E
G
 
G
E
 
K
R
 
A
A
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
E
L
 
L
G
 
A
E
 
D
R
 
A
A
 
A
L
 
R
F
 
Y
V
 
V
H
 
H
T
x
L
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
Q
D
 
P
A
 
A
Q
 
Q
V
 
W
A
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
D
R
 
T
V
 
A
S
 
V
Q
 
T
H
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
L
D
 
H
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
-
x
N
-
x
A
-
x
G
-
x
I
L
 
L
A
 
N
C
 
I
T
 
G
Y
 
T
L
 
I
D
 
E
D
 
D
G
 
-
F
 
-
K
 
-
S
 
Y
A
 
A
R
 
L
R
 
T
D
 
E
W
 
W
L
 
Q
A
 
R
A
 
I
L
 
L
D
 
D
V
 
V
N
 
N
V
 
L
V
 
-
S
 
T
G
 
G
V
 
V
M
 
F
L
 
L
A
 
G
-
 
I
Q
 
R
A
 
A
V
 
V
H
 
V
P
 
K
A
 
P
M
 
M
R
 
K
A
 
E
R
 
A
G
 
G
G
 
R
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
x
I
T
 
S
S
|
S
I
 
I
S
 
E
A
 
G
N
 
L
V
 
A
G
 
G
Q
 
T
T
 
V
G
 
A
R
 
C
W
 
H
L
 
G
Y
|
Y
P
 
T
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
I
 
V
R
 
R
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
M
 
T
A
 
A
M
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
P
D
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
I
S
 
H
P
|
P
G
 
G
W
 
L
T
x
V
W
 
K
C
x
T
R
x
P
L
x
M
M
x
T
D
 
D
E
 
W
V
 
V
S
 
P
G
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
E
R
 
D
T
 
I
D
 
F
R
 
Q
V
 
T
A
 
A
A
 
-
D
 
-
F
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
A
G
 
A
E
 
E
P
 
P
D
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
S
Q
 
N
V
 
L
V
 
V
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
E
A
 
S
S
 
S
F
 
Y
V
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
E
Y
 
F
A
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
T
S
 
V
A
 
A

P9WGT1 3-alpha-(or 20-beta)-hydroxysteroid dehydrogenase; NADH-dependent 3alpha, 20beta-hydroxysteroid dehydrogenase; EC 1.1.1.53 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
40% identity, 93% coverage: 4:247/262 of query aligns to 5:240/260 of P9WGT1

query
sites
P9WGT1
L
 
L
R
x
I
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
I
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A
T
x
R
L
x
G
I
x
M
G
 
G
A
 
A
G
 
S
V
 
H
A
 
V
S
 
R
A
 
A
F
 
M
V
 
V
E
 
A
A
 
E
G
 
G
T
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
F
L
 
G
D
|
D
I
 
I
D
 
L
A
 
D
S
 
E
G
 
E
G
 
G
E
 
K
R
 
A
A
x
V
A
 
A
A
 
A
A
 
E
L
 
L
G
 
A
E
 
D
R
 
A
A
 
A
L
 
R
F
 
Y
V
 
V
H
 
H
T
 
L
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
Q
D
 
P
A
 
A
Q
 
Q
V
 
W
A
x
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
D
R
 
T
V
 
A
S
 
V
Q
 
T
H
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
L
D
 
H
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
-
x
N
-
 
A
-
 
G
-
 
I
L
 
L
A
 
N
C
 
I
T
 
G
Y
 
T
L
 
I
D
 
E
D
 
D
G
 
-
F
 
-
K
 
-
S
 
Y
A
 
A
R
 
L
R
 
T
D
 
E
W
 
W
L
 
Q
A
 
R
A
 
I
L
 
L
D
 
D
V
 
V
N
 
N
V
 
L
V
 
-
S
 
T
G
 
G
V
 
V
M
 
F
L
 
L
A
 
G
-
 
I
Q
 
R
A
 
A
V
 
V
H
 
V
P
 
K
A
 
P
M
 
M
R
 
K
A
 
E
R
 
A
G
 
G
G
 
R
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
 
I
T
 
S
S
|
S
I
 
I
S
 
E
A
 
G
N
 
L
V
 
A
G
 
G
Q
 
T
T
 
V
G
 
A
R
 
C
W
 
H
L
 
G
Y
|
Y
P
 
T
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
I
 
V
R
 
R
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
M
 
T
A
 
A
M
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
P
D
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
I
S
 
H
P
|
P
G
|
G
W
x
L
T
x
V
W
x
K
C
x
T
R
x
P
L
x
M
M
x
T
D
 
D
E
 
W
V
 
V
S
 
P
G
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
E
R
 
D
T
 
I
D
 
F
R
 
Q
V
 
T
A
 
A
A
 
-
D
 
-
F
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
A
G
 
A
E
 
E
P
 
P
D
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
S
Q
 
N
V
 
L
V
 
V
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
E
A
 
S
S
 
S
F
 
Y
V
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
E
Y
 
F
A
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
T
S
 
V
A
 
A

Q6WVP7 NADP-dependent (R)-specific alcohol dehydrogenase; (R)-specific ADH; Ketoreductase; KRED; EC 1.1.1.- from Lentilactobacillus kefiri (Lactobacillus kefiri) (see paper)
34% identity, 93% coverage: 4:247/262 of query aligns to 5:251/252 of Q6WVP7

query
sites
Q6WVP7
L
 
L
R
 
K
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
G
A
x
T
T
x
L
L
x
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
G
 
A
V
 
I
A
 
A
S
 
D
A
 
K
F
 
F
V
 
V
E
 
E
A
 
E
G
 
G
T
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
I
L
 
T
D
 
G
I
x
R
D
x
H
A
 
A
S
 
D
G
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
S
L
 
I
G
 
G
E
 
G
R
 
T
A
 
D
L
 
V
-
 
I
-
 
R
F
 
F
V
 
V
H
 
Q
T
 
H
D
|
D
I
x
A
T
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
Q
 
G
V
 
W
A
 
T
A
 
K
A
 
L
V
 
F
A
 
D
R
 
T
V
 
T
S
 
E
Q
 
E
H
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
P
V
 
V
D
 
T
Y
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
N
L
x
N
A
 
A
C
 
G
T
 
I
Y
 
A
L
 
V
D
 
S
D
 
K
G
 
S
F
 
V
K
 
E
-
 
D
S
 
T
A
 
T
R
 
T
R
 
E
D
 
E
W
 
W
L
 
R
A
 
K
A
 
L
L
 
L
D
 
S
V
 
V
N
 
N
V
 
L
V
 
-
S
 
D
G
 
G
V
 
V
M
 
F
L
 
F
A
 
G
Q
 
T
A
 
R
V
 
L
H
 
G
-
 
I
P
 
Q
A
 
R
M
 
M
R
 
K
A
 
N
R
 
K
G
 
G
-
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
 
M
T
 
S
S
 
S
I
 
I
S
 
E
A
 
G
N
 
F
V
 
V
G
 
G
Q
 
D
T
 
P
G
 
T
R
 
L
W
 
G
L
 
A
Y
|
Y
P
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
I
 
V
R
 
R
Q
 
I
L
 
M
T
 
S
R
 
K
S
 
S
M
 
A
A
 
A
M
 
L
D
 
D
-
 
C
-
 
A
L
 
L
A
 
K
P
 
D
D
 
Y
G
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
S
 
H
P
 
P
G
 
G
W
 
Y
T
x
I
W
x
K
C
x
T
R
x
P
L
|
L
M
 
V
D
 
D
E
 
D
V
 
L
S
 
E
G
 
G
G
 
A
N
 
E
R
 
E
E
 
M
R
 
M
T
 
S
D
 
Q
R
 
R
V
 
T
A
 
K
A
 
T
D
 
P
F
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
M
G
 
G
R
 
H
V
 
I
G
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
N
E
 
D
V
 
I
A
 
A
Q
 
W
V
 
I
V
 
C
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
E
A
 
S
S
 
K
F
 
F
V
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
E
Y
 
F
A
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
S
 
T
A
 
A

Sites not aligning to the query:

5itvD Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
35% identity, 93% coverage: 4:247/262 of query aligns to 5:226/227 of 5itvD

query
sites
5itvD
L
 
L
R
 
T
D
 
D
K
 
K
V
 
T
A
 
V
I
 
L
I
 
I
S
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
T
x
S
L
x
G
I
|
I
G
 
G
A
 
Y
G
 
A
V
 
A
A
 
V
S
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
E
 
G
A
 
Q
G
 
Q
T
 
A
R
 
N
V
 
V
A
 
V
I
 
V
L
 
A
D
|
D
I
|
I
D
 
D
A
 
E
S
 
A
G
 
Q
G
 
G
E
 
E
R
 
A
A
 
M
A
 
V
-
 
R
A
 
K
A
 
E
L
 
N
G
 
N
E
 
D
R
 
R
A
 
L
L
 
H
F
 
F
V
 
V
H
 
Q
T
|
T
D
|
D
I
|
I
T
 
T
D
 
D
D
 
E
A
 
A
Q
 
A
V
 
C
A
 
Q
A
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
E
R
 
S
V
 
A
S
 
V
Q
 
H
H
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
L
D
 
D
Y
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
L
x
N
A
 
A
C
 
G
T
 
I
Y
 
E
L
 
I
D
 
V
D
 
A
G
 
P
F
 
I
K
 
H
S
 
E
A
 
M
R
 
E
-
 
L
R
 
S
D
 
D
W
 
W
L
 
N
A
 
K
A
 
V
L
 
L
D
 
Q
V
 
V
N
 
N
V
 
L
V
 
T
S
 
G
G
 
M
V
 
F
M
 
L
L
 
M
A
 
S
Q
 
K
A
 
H
V
 
A
H
 
L
P
 
K
A
 
H
M
 
M
R
 
L
A
 
A
R
 
A
G
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
x
T
T
 
C
S
|
S
I
 
V
S
 
G
A
 
G
N
 
L
V
 
V
G
 
A
Q
 
W
T
 
P
G
 
D
R
 
I
W
 
P
L
 
A
Y
|
Y
P
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
I
 
V
R
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
M
 
M
A
 
A
M
 
V
D
 
D
L
 
Y
A
 
A
P
 
K
D
 
H
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
S
 
C
P
|
P
G
|
G
W
 
-
T
 
-
W
 
-
C
 
-
R
 
-
L
 
I
M
x
I
D
 
D
E
 
T
V
 
L
S
 
-
G
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
R
V
 
L
G
 
G
E
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
Q
 
N
V
 
V
V
 
M
L
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
L
A
 
S
S
 
S
F
 
Y
V
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
S
D
 
A
Y
 
I
A
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
S
 
T
A
 
A

7djsD Crystal structure of isopiperitenol dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa complexed with NAD
39% identity, 94% coverage: 2:248/262 of query aligns to 1:251/251 of 7djsD

query
sites
7djsD
K
 
K
G
 
L
L
 
L
R
 
S
D
 
G
K
 
Q
V
 
V
A
 
A
I
 
L
I
 
V
S
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
T
 
A
L
x
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
G
 
A
V
 
T
A
 
A
S
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
A
E
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
V
R
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
V
L
 
A
D
|
D
I
x
L
D
 
D
A
 
S
S
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
G
A
 
T
A
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
I
-
 
R
-
 
Q
-
 
A
G
 
G
E
 
G
R
 
E
A
 
A
L
 
V
F
 
F
V
 
I
H
 
R
T
x
C
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
R
D
 
D
A
 
A
Q
 
E
V
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
L
V
 
V
A
 
E
R
 
G
V
 
C
S
 
A
Q
 
A
H
 
A
F
 
Y
G
 
G
G
 
R
V
 
L
D
 
D
Y
 
Y
L
 
A
V
 
F
N
 
N
L
x
N
A
|
A
C
 
G
T
 
I
Y
 
E
L
 
I
D
 
E
D
 
Q
G
 
G
F
 
K
-
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
G
K
 
N
S
 
E
A
 
A
R
 
E
R
 
F
D
 
D
W
 
A
L
 
I
A
 
M
A
 
A
L
 
V
D
 
N
V
 
V
N
 
K
V
 
G
V
 
V
S
 
W
G
 
L
V
 
C
M
 
M
L
 
K
A
 
H
Q
 
Q
A
 
I
V
 
-
H
 
-
P
 
P
A
 
L
M
 
M
R
 
L
A
 
A
R
 
Q
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
F
x
T
T
 
A
S
|
S
I
 
V
S
 
A
A
 
G
N
 
L
V
 
G
G
 
A
Q
 
A
T
 
P
G
 
K
R
 
M
W
 
S
L
 
I
Y
|
Y
P
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
H
A
 
A
I
 
V
R
 
I
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
M
 
A
A
 
A
M
 
I
D
 
E
L
 
Y
A
 
A
P
 
K
D
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
C
P
 
P
G
x
A
W
x
V
T
 
I
W
 
D
C
 
T
R
 
D
L
 
M
M
 
F
D
 
R
E
 
R
V
 
A
S
 
Y
G
 
E
G
 
A
N
 
D
R
 
-
E
 
P
R
 
R
T
 
K
D
 
A
R
 
E
V
 
F
A
 
A
A
 
A
D
 
A
F
 
M
H
 
H
L
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
V
G
 
G
E
 
R
P
 
V
D
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
Q
 
A
V
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
Y
L
 
L
C
 
C
S
 
S
D
 
D
H
 
N
A
 
A
S
 
G
F
 
F
V
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
I
D
 
A
Y
 
L
A
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
A
S
 
T
A
 
A
M
 
I

1zk1A Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (mutant g37d) from lactobacillus brevis in complex with phenylethanol and NAD (see paper)
33% identity, 93% coverage: 4:247/262 of query aligns to 4:250/251 of 1zk1A

query
sites
1zk1A
L
 
L
R
 
D
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
S
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
T
T
x
L
L
x
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
G
 
A
V
 
I
A
 
A
S
 
T
A
 
K
F
 
F
V
 
V
E
 
E
A
 
E
G
 
G
T
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
M
I
 
I
L
 
T
D
|
D
I
 
R
D
 
H
A
 
S
S
 
D
G
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
S
L
 
V
G
 
G
-
 
T
-
 
P
E
 
D
R
 
Q
A
 
I
L
 
Q
F
 
F
V
 
F
H
 
Q
T
x
H
D
|
D
I
x
S
T
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
D
Q
 
G
V
 
W
A
 
T
A
 
K
A
 
L
V
 
F
A
 
D
R
 
A
V
 
T
S
 
E
Q
 
K
H
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
P
V
 
V
D
 
S
Y
 
T
L
 
L
V
 
V
N
 
N
L
x
N
A
|
A
C
 
G
T
x
I
Y
x
A
L
 
V
D
x
N
D
 
K
G
 
S
F
 
V
K
 
E
-
 
E
S
 
T
A
 
T
R
 
T
R
 
A
D
 
E
W
 
W
L
 
R
A
 
K
A
 
L
L
 
L
D
 
A
V
 
V
N
 
N
V
 
L
V
 
-
S
 
D
G
 
G
V
 
V
M
 
F
L
 
F
A
 
G
Q
 
T
A
 
R
V
 
L
H
 
G
-
 
I
P
 
Q
A
 
R
M
 
M
R
 
K
A
 
N
R
 
K
G
 
G
-
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
x
M
T
 
S
S
|
S
I
 
I
S
 
E
A
 
G
N
 
F
V
 
V
G
 
G
Q
 
D
T
 
P
G
 
S
R
 
L
W
 
G
L
 
A
Y
|
Y
P
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
I
 
V
R
 
R
Q
 
I
L
 
M
T
 
S
R
 
K
S
 
S
M
 
A
A
 
A
M
 
L
D
 
D
-
 
C
-
 
A
L
 
L
A
 
K
P
 
D
D
 
Y
G
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
S
 
H
P
 
P
G
|
G
W
x
Y
T
x
I
W
 
K
C
 
T
R
 
P
L
|
L
M
 
V
D
 
D
E
 
D
V
 
L
S
 
P
G
 
G
G
 
A
N
 
E
R
 
E
E
 
A
R
 
M
T
 
S
D
 
Q
R
 
R
V
 
T
A
 
K
A
 
T
D
 
P
F
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
M
G
 
G
R
 
H
V
 
I
G
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
N
E
 
D
V
 
I
A
 
A
Q
 
Y
V
 
I
V
 
C
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
N
H
 
E
A
 
S
S
 
K
F
 
F
V
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
S
D
 
E
Y
 
F
A
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
S
 
T
A
 
A

1zjzA Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (mutant g37d) from lactobacillus brevis in complex with phenylethanol and NAD (see paper)
33% identity, 93% coverage: 4:247/262 of query aligns to 4:250/251 of 1zjzA

query
sites
1zjzA
L
 
L
R
 
D
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
S
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
T
T
x
L
L
x
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
G
 
A
V
 
I
A
 
A
S
 
T
A
 
K
F
 
F
V
 
V
E
 
E
A
 
E
G
 
G
T
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
M
I
 
I
L
 
T
D
|
D
I
 
R
D
 
H
A
 
S
S
 
D
G
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
S
L
 
V
G
 
G
-
 
T
-
 
P
E
 
D
R
 
Q
A
 
I
L
 
Q
F
 
F
V
 
F
H
 
Q
T
 
H
D
|
D
I
 
S
T
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
D
Q
 
G
V
 
W
A
 
T
A
 
K
A
 
L
V
 
F
A
 
D
R
 
A
V
 
T
S
 
E
Q
 
K
H
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
P
V
 
V
D
 
S
Y
 
T
L
 
L
V
 
V
N
 
N
L
x
N
A
|
A
C
x
G
T
x
I
Y
x
A
L
 
V
D
x
N
D
 
K
G
 
S
F
 
V
K
 
E
-
 
E
S
 
T
A
 
T
R
 
T
R
 
A
D
 
E
W
 
W
L
 
R
A
 
K
A
 
L
L
 
L
D
 
A
V
 
V
N
 
N
V
 
L
V
 
-
S
 
D
G
 
G
V
 
V
M
 
F
L
 
F
A
 
G
Q
 
T
A
 
R
V
 
L
H
 
G
-
 
I
P
 
Q
A
 
R
M
 
M
R
 
K
A
 
N
R
 
K
G
 
G
-
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
 
M
T
 
S
S
|
S
I
 
I
S
 
E
A
 
G
N
 
F
V
 
V
G
 
G
Q
 
D
T
 
P
G
 
S
R
x
L
W
 
G
L
 
A
Y
|
Y
P
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
I
 
V
R
 
R
Q
 
I
L
 
M
T
 
S
R
 
K
S
 
S
M
 
A
A
 
A
M
 
L
D
 
D
-
 
C
-
 
A
L
 
L
A
 
K
P
 
D
D
 
Y
G
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
S
 
H
P
 
P
G
|
G
W
 
Y
T
x
I
W
 
K
C
 
T
R
 
P
L
|
L
M
 
V
D
 
D
E
 
D
V
 
L
S
 
P
G
 
G
G
 
A
N
 
E
R
 
E
E
 
A
R
 
M
T
 
S
D
 
Q
R
 
R
V
 
T
A
 
K
A
 
T
D
 
P
F
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
M
G
 
G
R
 
H
V
 
I
G
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
N
E
 
D
V
 
I
A
 
A
Q
 
Y
V
 
I
V
 
C
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
N
H
 
E
A
 
S
S
 
K
F
 
F
V
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
S
D
 
E
Y
 
F
A
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
S
 
T
A
 
A

1zjyA Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (mutant g37d) from lactobacillus brevis in complex with phenylethanol and nadh (see paper)
33% identity, 93% coverage: 4:247/262 of query aligns to 4:250/251 of 1zjyA

query
sites
1zjyA
L
 
L
R
 
D
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
S
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
T
T
x
L
L
x
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
G
 
A
V
 
I
A
 
A
S
 
T
A
 
K
F
 
F
V
 
V
E
 
E
A
 
E
G
 
G
T
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
M
I
 
I
L
 
T
D
|
D
I
 
R
D
 
H
A
 
S
S
 
D
G
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
S
L
 
V
G
 
G
-
 
T
-
 
P
E
 
D
R
 
Q
A
 
I
L
 
Q
F
 
F
V
 
F
H
 
Q
T
 
H
D
|
D
I
 
S
T
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
D
Q
 
G
V
 
W
A
 
T
A
 
K
A
 
L
V
 
F
A
 
D
R
 
A
V
 
T
S
 
E
Q
 
K
H
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
P
V
 
V
D
 
S
Y
 
T
L
 
L
V
 
V
N
 
N
L
x
N
A
|
A
C
x
G
T
x
I
Y
x
A
L
 
V
D
x
N
D
 
K
G
 
S
F
 
V
K
 
E
-
 
E
S
 
T
A
 
T
R
 
T
R
 
A
D
 
E
W
 
W
L
 
R
A
 
K
A
 
L
L
 
L
D
 
A
V
 
V
N
 
N
V
 
L
V
 
-
S
 
D
G
 
G
V
 
V
M
 
F
L
 
F
A
 
G
Q
 
T
A
 
R
V
 
L
H
 
G
-
 
I
P
 
Q
A
 
R
M
 
M
R
 
K
A
 
N
R
 
K
G
 
G
-
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
 
M
T
 
S
S
|
S
I
 
I
S
 
E
A
 
G
N
 
F
V
 
V
G
 
G
Q
 
D
T
 
P
G
 
S
R
x
L
W
 
G
L
 
A
Y
|
Y
P
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
I
 
V
R
 
R
Q
 
I
L
 
M
T
 
S
R
 
K
S
 
S
M
 
A
A
 
A
M
 
L
D
 
D
-
 
C
-
 
A
L
 
L
A
 
K
P
 
D
D
 
Y
G
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
S
 
H
P
 
P
G
|
G
W
x
Y
T
x
I
W
 
K
C
 
T
R
 
P
L
|
L
M
 
V
D
 
D
E
 
D
V
 
L
S
 
P
G
 
G
G
 
A
N
 
E
R
 
E
E
 
A
R
 
M
T
 
S
D
 
Q
R
 
R
V
 
T
A
 
K
A
 
T
D
 
P
F
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
M
G
 
G
R
 
H
V
 
I
G
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
N
E
 
D
V
 
I
A
 
A
Q
 
Y
V
 
I
V
 
C
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
N
H
 
E
A
 
S
S
 
K
F
 
F
V
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
S
D
 
E
Y
 
F
A
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
S
 
T
A
 
A

3ai2A The crystal structure of l-sorbose reductase from gluconobacter frateurii complexed with NADPH (see paper)
33% identity, 92% coverage: 3:244/262 of query aligns to 4:258/263 of 3ai2A

query
sites
3ai2A
G
 
G
L
 
I
R
 
S
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
V
I
 
I
S
 
T
G
|
G
G
 
S
A
x
S
T
x
S
L
x
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
G
 
A
V
 
I
A
 
A
S
 
E
A
 
G
F
 
F
V
 
A
E
 
K
A
 
E
G
 
G
T
 
A
R
 
H
V
 
I
A
 
V
I
 
L
L
 
V
D
x
A
I
x
R
D
x
Q
A
 
V
S
 
D
G
 
R
G
 
L
E
 
H
R
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
R
A
 
S
L
 
L
G
 
K
E
 
E
-
 
K
-
 
F
-
 
G
-
 
V
R
 
R
A
 
V
L
 
L
F
 
E
V
 
V
H
 
A
T
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
A
D
 
T
D
 
P
A
 
E
Q
 
G
V
 
V
A
 
D
A
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
E
R
 
S
V
 
V
S
 
R
Q
 
S
H
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
D
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
L
x
N
A
 
A
C
x
G
T
 
T
Y
 
G
L
 
S
D
 
N
D
 
E
G
 
T
-
 
I
F
 
M
K
 
E
S
 
A
A
 
A
R
 
D
R
 
E
D
 
K
W
 
W
L
 
Q
A
 
F
A
 
Y
L
 
W
D
 
E
V
 
L
N
 
H
V
 
V
V
 
M
S
 
A
G
 
A
V
 
V
M
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
A
 
G
V
 
L
H
 
V
P
 
P
A
 
G
M
 
M
R
 
R
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
H
F
x
N
T
 
A
S
|
S
I
 
I
S
 
C
A
 
A
N
 
V
V
 
Q
G
 
P
Q
 
L
T
 
W
G
 
Y
R
 
E
W
 
P
L
 
I
Y
|
Y
P
 
N
A
 
V
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
I
 
L
R
 
M
Q
 
M
L
 
F
T
 
S
R
 
K
S
 
T
M
 
L
A
 
A
M
 
T
D
 
E
L
 
V
A
 
I
P
 
K
D
 
D
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
I
S
 
N
P
|
P
G
 
G
W
 
L
T
x
I
-
 
L
-
x
T
-
 
P
-
 
D
W
|
W
C
 
I
R
 
K
L
 
T
M
 
A
D
 
K
E
 
E
V
 
L
S
 
T
-
 
K
-
 
D
-
 
N
G
 
G
G
 
G
N
 
D
R
 
W
E
 
K
R
 
G
T
 
Y
D
 
L
R
 
Q
V
 
S
A
 
V
A
 
A
D
 
D
F
 
E
H
 
H
L
 
A
-
 
P
L
 
I
G
 
K
R
 
R
V
 
F
G
 
A
E
 
S
P
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
L
A
 
A
Q
 
N
V
 
F
V
 
F
L
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
S
D
 
E
H
 
R
A
 
A
S
 
T
F
 
Y
V
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
S
D
 
A
Y
 
Y
A
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7ejiB Crystal structure of kred f147l/l153q/y190p/l199a/m205f/m206f variant and methyl methacrylate complex
34% identity, 94% coverage: 4:248/262 of query aligns to 4:251/251 of 7ejiB

query
sites
7ejiB
L
 
L
R
 
K
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
V
S
 
T
G
|
G
G
 
G
A
x
T
T
x
L
L
x
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
G
 
A
V
 
I
A
 
A
S
 
D
A
 
K
F
 
F
V
 
V
E
 
E
A
 
E
G
 
G
T
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
I
L
 
T
D
 
G
I
x
R
D
x
H
A
 
A
S
 
D
G
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
S
L
 
I
G
 
G
E
 
G
R
 
T
A
 
D
L
 
V
-
 
I
-
 
R
F
 
F
V
 
V
H
 
Q
T
 
H
D
|
D
I
x
A
T
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
Q
 
G
V
 
W
A
 
T
A
 
K
A
 
L
V
 
F
A
 
D
R
 
T
V
 
T
S
 
E
Q
 
E
H
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
P
V
 
V
D
 
T
Y
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
N
L
x
N
A
|
A
C
 
G
T
 
I
Y
 
A
L
 
V
D
 
S
D
 
K
G
 
S
F
 
V
K
 
E
-
 
D
S
 
T
A
 
T
R
 
T
R
 
E
D
 
E
W
 
W
L
 
R
A
 
K
A
 
L
L
 
L
D
 
S
V
|
V
N
 
N
V
 
L
V
 
-
S
 
D
G
 
G
V
 
V
M
 
F
L
 
F
A
 
G
Q
 
T
A
 
R
V
 
L
H
 
G
-
 
I
P
 
Q
A
 
R
M
 
M
R
 
K
A
 
N
R
 
K
G
 
G
-
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
x
M
T
 
S
S
|
S
I
|
I
S
 
E
A
 
G
N
 
L
V
 
V
G
 
G
Q
 
D
T
 
P
G
 
T
R
 
Q
W
 
G
L
 
A
Y
|
Y
P
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
I
 
V
R
 
R
Q
 
I
L
 
M
T
 
S
R
 
K
S
 
S
M
 
A
A
 
A
M
 
L
D
 
D
-
 
C
-
 
A
L
 
L
A
 
K
P
 
D
D
 
Y
G
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
S
 
H
P
|
P
G
 
G
W
x
P
T
x
I
W
 
K
C
x
T
R
x
P
L
|
L
M
 
V
D
 
D
E
 
D
V
 
A
S
 
E
G
 
G
G
 
A
N
 
E
R
 
E
E
 
F
R
x
F
T
 
S
D
 
Q
R
 
R
V
 
T
A
 
K
A
 
T
D
 
P
F
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
M
G
 
G
R
 
H
V
 
I
G
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
N
E
 
D
V
 
I
A
 
A
Q
 
W
V
 
I
V
 
C
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
E
A
 
S
S
 
K
F
 
F
V
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
E
Y
 
F
A
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
S
 
T
A
 
A
M
 
Q

7ejhA Crystal structure of kred mutant-f147l/l153q/y190p/l199a/m205f/m206f and 2-hydroxyisoindoline-1,3-dione complex
34% identity, 94% coverage: 4:248/262 of query aligns to 6:253/253 of 7ejhA

query
sites
7ejhA
L
 
L
R
 
K
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
V
S
 
T
G
|
G
G
 
G
A
x
T
T
 
L
L
 
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
G
 
A
V
 
I
A
 
A
S
 
D
A
 
K
F
 
F
V
 
V
E
 
E
A
 
E
G
 
G
T
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
I
L
 
T
D
 
G
I
x
R
D
x
H
A
 
A
S
 
D
G
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
S
L
 
I
G
 
G
E
 
G
R
 
T
A
 
D
L
 
V
-
 
I
-
 
R
F
 
F
V
 
V
H
 
Q
T
 
H
D
|
D
I
x
A
T
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
Q
 
G
V
 
W
A
 
T
A
 
K
A
 
L
V
 
F
A
 
D
R
 
T
V
 
T
S
 
E
Q
 
E
H
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
P
V
 
V
D
 
T
Y
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
N
L
x
N
A
|
A
C
 
G
T
 
I
Y
 
A
L
 
V
D
 
S
D
 
K
G
 
S
F
 
V
K
 
E
-
 
D
S
 
T
A
 
T
R
 
T
R
 
E
D
 
E
W
 
W
L
 
R
A
 
K
A
 
L
L
 
L
D
 
S
V
|
V
N
 
N
V
 
L
V
 
-
S
 
D
G
 
G
V
 
V
M
 
F
L
 
F
A
 
G
Q
 
T
A
 
R
V
 
L
H
 
G
-
 
I
P
 
Q
A
 
R
M
 
M
R
 
K
A
 
N
R
 
K
G
 
G
-
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
x
M
T
 
S
S
|
S
I
|
I
S
x
E
A
 
G
N
 
L
V
 
V
G
 
G
Q
 
D
T
 
P
G
 
T
R
 
Q
W
 
G
L
 
A
Y
|
Y
P
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
I
 
V
R
 
R
Q
 
I
L
 
M
T
 
S
R
 
K
S
 
S
M
 
A
A
 
A
M
 
L
D
 
D
L
 
C
A
 
A
P
 
L
D
 
K
G
 
D
-
 
Y
-
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
S
 
H
P
|
P
G
|
G
W
x
P
T
x
I
W
 
K
C
x
T
R
x
P
L
|
L
M
x
V
D
 
D
E
 
D
V
 
A
S
 
E
G
 
G
G
 
A
N
 
E
R
 
E
E
 
F
R
x
F
T
 
S
D
 
Q
R
 
R
V
 
T
A
 
K
A
 
T
D
 
P
F
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
M
G
 
G
R
 
H
V
 
I
G
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
N
E
 
D
V
 
I
A
 
A
Q
 
W
V
 
I
V
 
C
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
E
A
 
S
S
 
K
F
 
F
V
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
E
Y
 
F
A
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
S
 
T
A
 
A
M
 
Q

3ai3C The crystal structure of l-sorbose reductase from gluconobacter frateurii complexed with NADPH and l-sorbose (see paper)
33% identity, 92% coverage: 3:244/262 of query aligns to 4:258/263 of 3ai3C

query
sites
3ai3C
G
 
G
L
 
I
R
 
S
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
V
I
 
I
S
 
T
G
|
G
G
 
S
A
x
S
T
x
S
L
x
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
G
 
A
V
 
I
A
 
A
S
 
E
A
 
G
F
 
F
V
 
A
E
 
K
A
 
E
G
 
G
T
 
A
R
 
H
V
 
I
A
 
V
I
 
L
L
 
V
D
x
A
I
x
R
D
x
Q
A
 
V
S
 
D
G
x
R
G
 
L
E
 
H
R
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
R
A
 
S
L
 
L
G
 
K
E
 
E
-
 
K
-
 
F
-
 
G
-
 
V
R
 
R
A
 
V
L
 
L
F
 
E
V
 
V
H
 
A
T
 
V
D
|
D
I
x
V
T
 
A
D
 
T
D
 
P
A
 
E
Q
 
G
V
 
V
A
 
D
A
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
E
R
 
S
V
 
V
S
 
R
Q
 
S
H
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
D
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
L
x
N
A
 
A
C
x
G
T
 
T
Y
x
G
L
 
S
D
 
N
D
 
E
G
 
T
-
 
I
F
 
M
K
 
E
S
 
A
A
 
A
R
 
D
R
 
E
D
 
K
W
 
W
L
 
Q
A
 
F
A
 
Y
L
 
W
D
 
E
V
 
L
N
 
L
V
 
V
V
 
M
S
 
A
G
 
A
V
 
V
M
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
A
 
G
V
 
L
H
 
V
P
 
P
A
 
G
M
 
M
R
 
R
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
H
F
x
N
T
 
A
S
|
S
I
 
I
S
 
C
A
 
A
N
 
V
V
 
Q
G
 
P
Q
 
L
T
 
W
G
 
Y
R
x
E
W
 
P
L
 
I
Y
|
Y
P
 
N
A
 
V
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
I
 
L
R
 
M
Q
 
M
L
 
F
T
 
S
R
 
K
S
 
T
M
 
L
A
 
A
M
 
T
D
 
E
L
 
V
A
 
I
P
 
K
D
 
D
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
I
S
 
N
P
|
P
G
|
G
W
 
L
T
x
I
-
 
L
-
x
T
-
 
P
-
 
D
W
|
W
C
 
I
R
 
K
L
 
T
M
 
A
D
 
K
E
 
E
V
 
L
S
 
T
-
 
K
-
 
D
-
 
N
G
 
G
G
 
G
N
 
D
R
 
W
E
 
K
R
 
G
T
 
Y
D
 
L
R
 
Q
V
 
S
A
 
V
A
 
A
D
 
D
F
 
E
H
 
H
L
 
A
-
 
P
L
 
I
G
 
K
R
 
R
V
 
F
G
 
A
E
 
S
P
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
L
A
 
A
Q
 
N
V
 
F
V
 
F
L
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
S
D
 
E
H
 
R
A
 
A
S
 
T
F
 
Y
V
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
S
D
x
A
Y
 
Y
A
x
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3ai3A The crystal structure of l-sorbose reductase from gluconobacter frateurii complexed with NADPH and l-sorbose (see paper)
33% identity, 92% coverage: 3:244/262 of query aligns to 4:258/263 of 3ai3A

query
sites
3ai3A
G
 
G
L
 
I
R
 
S
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
V
I
 
I
S
 
T
G
|
G
G
 
S
A
x
S
T
x
S
L
x
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
G
 
A
V
 
I
A
 
A
S
 
E
A
 
G
F
 
F
V
 
A
E
 
K
A
 
E
G
 
G
T
 
A
R
 
H
V
 
I
A
 
V
I
 
L
L
 
V
D
x
A
I
x
R
D
x
Q
A
 
V
S
 
D
G
x
R
G
 
L
E
 
H
R
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
R
A
 
S
L
 
L
G
 
K
E
 
E
-
 
K
-
 
F
-
 
G
-
 
V
R
 
R
A
 
V
L
 
L
F
 
E
V
 
V
H
 
A
T
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
A
D
 
T
D
 
P
A
 
E
Q
 
G
V
 
V
A
 
D
A
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
E
R
 
S
V
 
V
S
 
R
Q
 
S
H
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
D
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
L
x
N
A
 
A
C
x
G
T
 
T
Y
x
G
L
 
S
D
 
N
D
 
E
G
 
T
-
 
I
F
 
M
K
 
E
S
 
A
A
 
A
R
 
D
R
 
E
D
 
K
W
 
W
L
 
Q
A
 
F
A
 
Y
L
 
W
D
 
E
V
 
L
N
 
L
V
 
V
V
 
M
S
 
A
G
 
A
V
 
V
M
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
A
 
G
V
 
L
H
 
V
P
 
P
A
 
G
M
 
M
R
 
R
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
H
F
x
N
T
 
A
S
|
S
I
 
I
S
 
C
A
 
A
N
 
V
V
 
Q
G
 
P
Q
x
L
T
 
W
G
 
Y
R
x
E
W
 
P
L
 
I
Y
|
Y
P
 
N
A
 
V
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
I
 
L
R
 
M
Q
 
M
L
 
F
T
 
S
R
 
K
S
 
T
M
 
L
A
 
A
M
 
T
D
 
E
L
 
V
A
 
I
P
 
K
D
 
D
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
I
S
 
N
P
|
P
G
|
G
W
 
L
T
x
I
-
 
L
-
x
T
-
 
P
-
 
D
W
|
W
C
 
I
R
 
K
L
 
T
M
 
A
D
 
K
E
 
E
V
 
L
S
 
T
-
 
K
-
 
D
-
 
N
G
 
G
G
 
G
N
 
D
R
 
W
E
 
K
R
 
G
T
 
Y
D
 
L
R
 
Q
V
 
S
A
 
V
A
 
A
D
 
D
F
 
E
H
 
H
L
 
A
-
 
P
L
 
I
G
 
K
R
 
R
V
 
F
G
 
A
E
 
S
P
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
L
A
 
A
Q
 
N
V
 
F
V
 
F
L
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
S
D
 
E
H
 
R
A
 
A
S
 
T
F
 
Y
V
 
S
T
 
V
G
 
G
A
 
S
D
 
A
Y
 
Y
A
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

5t2uA Short chain dehydrogenase/reductase family protein (see paper)
40% identity, 92% coverage: 4:244/262 of query aligns to 4:237/241 of 5t2uA

query
sites
5t2uA
L
 
L
R
 
E
D
 
G
K
 
L
V
 
T
A
 
A
I
 
L
I
 
V
S
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
T
T
 
S
L
x
G
I
 
I
G
 
G
A
 
L
G
 
E
V
 
S
A
 
A
S
 
R
A
 
L
F
 
M
V
 
A
E
 
A
A
 
E
G
 
G
T
 
A
R
 
D
V
 
V
A
 
V
I
 
I
L
 
T
D
 
G
I
x
R
D
|
D
A
 
A
S
 
Q
G
x
R
G
 
G
E
 
E
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
D
L
 
I
G
 
G
E
 
H
R
 
G
A
 
A
L
 
R
F
 
F
V
 
V
H
 
Q
T
 
A
D
|
D
I
x
L
T
 
G
D
 
D
D
 
L
A
 
D
Q
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
D
A
 
L
V
 
A
A
 
A
R
 
Q
V
 
A
S
 
P
Q
 
D
H
 
-
F
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
V
D
 
D
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
L
x
N
A
|
A
C
 
G
T
 
I
Y
|
Y
L
 
P
D
 
Q
-
 
A
D
 
S
G
 
T
F
 
F
K
 
D
S
 
Q
A
 
D
R
 
V
R
 
A
D
 
G
W
 
F
L
 
Q
A
 
Q
A
 
L
L
 
F
D
 
D
V
 
T
N
 
N
V
 
V
V
 
R
S
 
G
G
 
T
V
 
Y
M
 
F
L
 
L
A
 
V
Q
 
A
A
 
A
V
 
A
H
 
A
P
 
K
A
 
G
M
 
M
R
 
V
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
H
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
F
x
I
T
 
T
S
x
T
I
 
L
S
 
A
A
 
A
N
 
H
V
 
K
G
 
G
Q
 
F
T
 
P
G
 
G
R
x
T
W
 
S
L
 
V
Y
|
Y
P
 
G
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
I
 
L
R
 
E
Q
 
S
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
T
M
 
W
A
 
A
M
 
A
D
 
E
L
 
F
A
 
G
P
 
A
D
 
N
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
V
S
 
S
P
|
P
G
 
G
W
x
P
T
|
T
W
 
R
C
x
T
R
 
P
L
x
T
M
x
T
D
 
L
E
 
E
V
 
Q
S
 
L
G
 
G
G
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
D
R
 
F
T
 
I
D
 
D
R
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
G
F
 
L
H
 
P
L
 
L
L
 
R
G
 
-
R
 
R
V
 
T
G
 
A
E
 
A
P
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
Q
 
Q
V
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
P
H
 
R
A
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
D
 
T
Y
 
L
A
 
Y
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>RR42_RS19270 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS19270
MKGLRDKVAIISGGATLIGAGVASAFVEAGTRVAILDIDASGGERAAAALGERALFVHTD
ITDDAQVAAAVARVSQHFGGVDYLVNLACTYLDDGFKSARRDWLAALDVNVVSGVMLAQA
VHPAMRARGGGAIVNFTSISANVGQTGRWLYPASKAAIRQLTRSMAMDLAPDGIRVNAVS
PGWTWCRLMDEVSGGNRERTDRVAADFHLLGRVGEPDEVAQVVLFLCSDHASFVTGADYA
VDGGYSAMGPEQNVPAIPRLAG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory