SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS20365 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS20365 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3tcyA Crystallographic structure of phenylalanine hydroxylase from chromobacterium violaceum (cpah) bound to phenylalanine in a site distal to the active site (see paper)
74% identity, 83% coverage: 39:296/310 of query aligns to 20:277/277 of 3tcyA

query
sites
3tcyA
D
 
D
F
 
F
T
 
T
I
 
L
A
 
P
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
E
 
D
R
 
R
Y
 
Y
T
 
S
D
 
A
T
 
E
D
 
D
H
 
H
A
 
A
V
 
T
W
 
W
A
 
A
K
 
T
L
 
L
Y
 
Y
D
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
A
 
C
S
 
K
M
 
L
L
 
L
R
 
P
G
 
G
R
 
R
V
 
A
C
 
C
D
 
D
E
 
E
F
 
F
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
S
 
E
T
 
R
L
 
L
G
 
E
M
 
V
E
 
D
R
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
P
 
P
S
 
D
F
 
F
D
 
N
Q
 
K
L
 
L
N
 
N
E
 
E
T
 
K
L
 
L
M
 
M
R
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
W
 
W
Q
 
K
V
 
I
V
 
V
A
 
A
V
 
V
P
 
P
G
 
G
L
 
L
V
 
I
P
 
P
D
 
D
A
 
D
V
 
V
F
 
F
F
 
F
E
 
E
H
 
H
L
 
L
A
 
A
N
 
N
R
 
R
R
 
R
F
 
F
P
 
P
A
 
V
S
 
T
W
 
W
W
 
W
M
 
L
R
 
R
K
 
E
P
 
P
E
 
H
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
P
 
P
D
 
D
C
 
V
F
 
F
H
|
H
D
 
D
V
 
L
F
 
F
G
 
G
H
|
H
V
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
P
 
P
V
 
V
F
 
F
A
 
A
N
 
D
Y
 
Y
M
 
L
E
 
E
A
|
A
Y
|
Y
G
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
L
 
V
K
|
K
A
 
A
A
 
K
S
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
P
M
 
M
L
|
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
W
 
W
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
N
T
 
T
P
 
P
E
 
A
G
 
G
L
 
M
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
S
|
S
S
 
S
Q
 
K
G
 
S
E
 
E
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
S
 
C
L
 
L
D
 
D
S
 
S
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
N
R
 
R
I
 
V
G
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
L
R
 
M
R
 
R
I
 
I
M
 
M
R
 
N
T
 
T
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
D
 
D
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
I
 
I
D
 
D
S
 
S
F
 
F
D
 
K
Q
 
Q
L
 
L
F
 
F
D
 
D
A
 
A
T
|
T
R
 
A
P
|
P
D
|
D
F
|
F
A
 
A
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
E
 
L
E
 
Q
L
 
L
R
 
A
A
 
D
Q
 
A
P
 
Q
T
 
P
L
 
W
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
I
G
 
A
Q
 
P
S
 
D
D
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
L

1ltvA Crystal structure of chromobacterium violaceum phenylalanine hydroxylase, structure with bound oxidized fe(iii) (see paper)
74% identity, 83% coverage: 39:296/310 of query aligns to 18:275/275 of 1ltvA

query
sites
1ltvA
D
 
D
F
 
F
T
 
T
I
 
L
A
 
P
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
E
 
D
R
 
R
Y
 
Y
T
 
S
D
 
A
T
 
E
D
 
D
H
 
H
A
 
A
V
 
T
W
 
W
A
 
A
K
 
T
L
 
L
Y
 
Y
D
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
A
 
C
S
 
K
M
 
L
L
 
L
R
 
P
G
 
G
R
 
R
V
 
A
C
 
C
D
 
D
E
 
E
F
 
F
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
S
 
E
T
 
R
L
 
L
G
 
E
M
 
V
E
 
D
R
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
P
 
P
S
 
D
F
 
F
D
 
N
Q
 
K
L
 
L
N
 
N
E
 
E
T
 
K
L
 
L
M
 
M
R
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
W
 
W
Q
 
K
V
 
I
V
 
V
A
 
A
V
 
V
P
 
P
G
 
G
L
 
L
V
 
I
P
 
P
D
 
D
A
 
D
V
 
V
F
 
F
F
 
F
E
 
E
H
 
H
L
 
L
A
 
A
N
 
N
R
 
R
R
 
R
F
 
F
P
 
P
A
 
V
S
 
T
W
 
W
W
 
W
M
 
L
R
 
R
K
 
E
P
 
P
E
 
H
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
P
 
P
D
 
D
C
 
V
F
 
F
H
|
H
D
 
D
V
 
L
F
 
F
G
 
G
H
|
H
V
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
P
 
P
V
 
V
F
 
F
A
 
A
N
 
D
Y
 
Y
M
 
L
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
L
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
K
S
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
P
M
 
M
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
W
 
W
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
N
T
 
T
P
 
P
E
 
A
G
 
G
L
 
M
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
S
|
S
S
 
S
Q
 
K
G
 
S
E
 
E
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
S
 
C
L
 
L
D
 
D
S
 
S
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
N
R
 
R
I
 
V
G
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
L
R
 
M
R
 
R
I
 
I
M
 
M
R
 
N
T
 
T
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
D
 
D
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
I
 
I
D
 
D
S
 
S
F
 
F
D
 
K
Q
 
Q
L
 
L
F
 
F
D
 
D
A
 
A
T
 
T
R
 
A
P
 
P
D
 
D
F
 
F
A
 
A
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
E
 
L
E
 
Q
L
 
L
R
 
A
A
 
D
Q
 
A
P
 
Q
T
 
P
L
 
W
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
I
G
 
A
Q
 
P
S
 
D
D
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
L

4etlA Crystallographic structure of phenylalanine hydroxylase from chromobacterium violaceum f258a mutation (see paper)
74% identity, 83% coverage: 39:296/310 of query aligns to 20:277/277 of 4etlA

query
sites
4etlA
D
 
D
F
 
F
T
 
T
I
 
L
A
 
P
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
E
 
D
R
 
R
Y
 
Y
T
 
S
D
 
A
T
 
E
D
 
D
H
 
H
A
 
A
V
 
T
W
 
W
A
 
A
K
 
T
L
 
L
Y
 
Y
D
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
A
 
C
S
 
K
M
 
L
L
 
L
R
 
P
G
 
G
R
 
R
V
 
A
C
 
C
D
 
D
E
 
E
F
 
F
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
S
 
E
T
 
R
L
 
L
G
 
E
M
 
V
E
 
D
R
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
P
 
P
S
 
D
F
 
F
D
 
N
Q
 
K
L
 
L
N
 
N
E
 
E
T
 
K
L
 
L
M
 
M
R
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
W
 
W
Q
 
K
V
 
I
V
 
V
A
 
A
V
 
V
P
 
P
G
 
G
L
 
L
V
 
I
P
 
P
D
 
D
A
 
D
V
 
V
F
 
F
F
 
F
E
 
E
H
 
H
L
 
L
A
 
A
N
 
N
R
 
R
R
 
R
F
 
F
P
 
P
A
 
V
S
 
T
W
 
W
W
 
W
M
 
L
R
 
R
K
 
E
P
 
P
E
 
H
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
P
 
P
D
 
D
C
 
V
F
 
F
H
|
H
D
 
D
V
 
L
F
 
F
G
 
G
H
|
H
V
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
P
 
P
V
 
V
F
 
F
A
 
A
N
 
D
Y
 
Y
M
 
L
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
L
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
K
S
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
P
M
 
M
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
W
 
W
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
N
T
 
T
P
 
P
E
 
A
G
 
G
L
 
M
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
S
|
S
S
 
S
Q
 
K
G
 
S
E
 
E
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
S
 
C
L
 
L
D
 
D
S
 
S
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
N
R
 
R
I
 
V
G
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
L
R
 
M
R
 
R
I
 
I
M
 
M
R
 
N
T
 
T
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
D
 
D
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
I
 
I
D
 
D
S
 
S
F
 
F
D
 
K
Q
 
Q
L
 
L
F
 
F
D
 
D
A
 
A
T
 
T
R
 
A
P
 
P
D
 
D
F
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
E
 
L
E
 
Q
L
 
L
R
 
A
A
 
D
Q
 
A
P
 
Q
T
 
P
L
 
W
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
I
G
 
A
Q
 
P
S
 
D
D
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
L

1ltzA Crystal structure of chromobacterium violaceum phenylalanine hydroxylase, structure has bound iron (iii) and oxidized cofactor 7, 8-dihydrobiopterin (see paper)
73% identity, 83% coverage: 39:296/310 of query aligns to 20:274/274 of 1ltzA

query
sites
1ltzA
D
 
D
F
 
F
T
 
T
I
 
L
A
 
P
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
E
 
D
R
 
R
Y
 
Y
T
 
S
D
 
A
T
 
E
D
 
D
H
 
H
A
 
A
V
 
T
W
 
W
A
 
A
K
 
T
L
 
L
Y
 
Y
D
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
A
 
C
S
 
K
M
 
L
L
 
L
R
 
P
G
 
G
R
 
R
V
 
A
C
 
C
D
 
D
E
 
E
F
 
F
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
S
 
E
T
 
R
L
 
L
G
 
E
M
 
V
E
 
D
R
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
P
 
P
S
 
D
F
 
F
D
 
N
Q
 
K
L
 
L
N
 
N
E
 
E
T
 
K
L
 
L
M
 
M
R
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
W
 
W
Q
 
K
V
 
I
V
 
V
A
 
A
V
 
V
P
 
P
G
 
G
L
 
L
V
x
I
P
 
P
D
|
D
A
 
D
V
 
V
F
|
F
F
 
F
E
 
E
H
 
H
L
 
L
A
 
A
N
 
N
R
 
R
R
 
R
F
 
F
P
 
P
A
 
V
S
 
T
W
 
W
W
 
W
M
 
L
R
 
R
K
 
E
P
 
P
E
 
H
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
P
 
P
D
 
D
C
 
V
F
 
F
H
|
H
D
 
D
V
 
L
F
 
F
G
 
G
H
|
H
V
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
P
 
P
V
 
V
F
 
F
A
 
A
N
 
D
Y
 
Y
M
 
L
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
L
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
K
S
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
P
M
 
M
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
Y
|
Y
W
 
W
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
N
T
 
T
P
 
P
E
 
A
G
 
G
L
 
M
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
S
|
S
S
 
S
Q
 
K
G
 
S
E
 
E
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
S
 
C
L
 
L
D
 
D
S
 
S
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
N
R
 
R
I
 
V
G
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
L
R
 
M
R
 
R
I
 
I
M
 
M
R
 
N
T
 
T
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
D
 
D
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
I
 
I
D
 
D
S
 
S
F
 
F
D
 
K
Q
 
Q
L
 
L
F
 
F
D
 
D
A
 
A
T
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
D
F
 
F
A
 
A
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
E
 
L
E
 
Q
L
 
L
R
 
A
A
 
D
Q
 
A
P
 
Q
T
 
P
L
 
W
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
I
G
 
A
Q
 
P
S
 
D
D
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
L

2v27B Structure of the cold active phenylalanine hydroxylase from colwellia psychrerythraea 34h (see paper)
44% identity, 70% coverage: 48:263/310 of query aligns to 16:230/272 of 2v27B

query
sites
2v27B
R
 
E
Y
 
W
T
 
S
D
 
T
T
 
E
D
 
E
H
 
N
A
 
L
V
 
I
W
 
W
A
 
Q
K
 
E
L
 
L
Y
 
F
D
 
T
R
 
R
Q
 
Q
A
 
I
S
 
A
M
 
C
L
 
I
R
 
K
G
 
D
R
 
K
V
 
A
C
 
C
D
 
D
E
 
E
F
 
Y
L
 
H
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
S
 
A
T
 
K
L
 
L
G
 
N
M
 
L
E
 
P
R
 
T
D
 
D
R
 
R
V
 
I
P
 
P
S
 
Q
F
 
L
D
 
D
Q
 
E
L
 
V
N
 
S
E
 
K
T
 
V
L
 
L
M
 
K
R
 
V
A
 
S
T
 
T
G
 
G
W
 
W
Q
 
E
V
 
C
V
 
Y
A
 
P
V
 
V
P
 
P
G
 
A
L
 
L
V
 
I
P
 
G
D
 
F
A
 
G
V
 
E
F
 
F
F
 
F
E
 
R
H
 
L
L
 
L
A
 
S
N
 
E
R
 
K
R
 
K
F
 
F
P
 
P
A
 
V
S
 
A
W
 
T
W
 
F
M
 
I
R
 
R
K
 
S
P
 
R
E
 
E
Q
 
E
L
 
M
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
P
 
P
D
 
D
C
 
I
F
 
F
H
|
H
D
 
E
V
 
I
F
 
F
G
 
G
H
|
H
V
 
C
P
 
P
L
 
L
L
 
L
I
 
T
N
 
N
P
 
S
V
 
S
F
 
F
A
 
A
N
 
N
Y
 
Y
M
 
T
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
G
 
M
G
 
G
L
 
L
K
 
N
A
 
A
A
 
T
S
 
K
L
 
E
G
 
Q
A
 
R
L
 
V
D
 
-
M
 
F
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
W
 
W
Y
 
F
T
 
T
V
 
I
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
I
 
L
R
 
D
T
 
T
P
 
P
E
 
K
G
 
G
L
 
L
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
A
 
G
G
 
G
I
 
V
L
 
L
S
|
S
S
 
S
Q
 
P
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
D
Y
 
Y
S
 
A
L
 
M
D
 
N
S
 
N
A
 
T
S
 
D
P
 
V
N
 
D
R
 
R
I
 
K
G
 
P
F
 
F
D
 
D
V
 
I
R
 
L
R
 
D
I
 
V
M
 
L
R
 
R
T
 
T
R
 
P
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
D
 
D
T
 
I
F
 
M
Q
 
Q
K
 
P
T
 
I
Y
 
Y
F
 
Y
V
 
M
I
 
L
D
 
T
S
 
K
F
 
V
D
 
S
Q
 
D
L
 
L

5jk5A Phenylalanine hydroxylase from dictyostelium - bh2 complex
35% identity, 71% coverage: 49:268/310 of query aligns to 153:374/400 of 5jk5A

query
sites
5jk5A
Y
 
Y
T
 
T
D
 
E
T
 
E
D
 
E
H
 
I
A
 
K
V
 
T
W
 
W
A
 
G
K
 
V
L
 
V
Y
 
Y
D
 
N
R
 
R
Q
 
L
A
 
K
S
 
E
M
 
L
L
 
F
R
 
P
G
 
T
R
 
N
V
 
A
C
 
C
D
 
H
E
 
Q
F
 
H
L
 
A
Q
 
Y
G
 
I
L
 
F
S
 
P
T
 
L
L
 
L
-
 
E
-
 
Q
-
 
N
-
 
C
G
 
G
M
 
Y
E
 
S
R
 
P
D
 
D
R
 
N
V
 
I
P
 
P
S
 
Q
F
 
L
D
 
Q
Q
 
D
L
 
I
N
 
S
E
 
N
T
 
F
L
 
L
M
 
Q
R
 
E
A
 
C
T
|
T
G
 
G
W
 
W
Q
 
R
V
 
I
V
 
R
A
 
P
V
 
V
P
 
Q
G
|
G
L
|
L
V
x
L
P
 
S
D
 
A
A
 
R
V
 
D
F
|
F
F
x
L
E
 
N
H
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
F
R
 
R
R
 
V
F
 
F
P
 
H
A
 
A
S
 
T
W
 
Q
W
 
Y
M
 
I
R
 
R
K
 
H
P
 
P
E
 
S
Q
 
V
L
 
P
D
 
L
Y
 
Y
L
 
T
Q
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
D
C
 
C
F
 
C
H
|
H
D
 
E
V
 
L
F
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
L
I
 
A
N
 
D
P
|
P
V
 
D
F
 
F
A
 
A
N
x
D
Y
 
F
M
 
S
E
 
Q
A
 
E
Y
 
I
G
 
G
K
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
S
D
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
I
-
 
Q
M
 
L
L
 
L
A
x
S
R
 
T
L
 
C
Y
|
Y
W
 
W
Y
 
F
T
 
T
V
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
I
 
C
R
 
K
T
 
E
P
 
G
E
 
D
G
 
T
L
 
I
R
 
R
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
S
|
S
S
 
S
Q
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
M
I
 
E
Y
 
H
S
 
F
L
 
L
D
 
T
S
 
D
A
 
K
S
 
A
P
 
-
N
 
K
R
 
K
I
 
L
G
 
P
F
 
F
D
 
N
V
 
P
R
 
F
R
 
D
I
 
A
M
 
C
R
 
N
T
 
T
R
 
E
Y
 
Y
R
 
P
I
 
I
D
 
T
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
K
 
P
T
 
L
Y
 
Y
F
 
Y
V
 
V
I
 
A
D
 
E
S
 
S
F
 
F
D
 
Q
Q
 
K
L
 
A
F
 
K
D
 
E
A
 
Q
T
 
M
R
|
R

5jk8A Phenylalanine hydroxylase from dictyostelium - bh2, norleucine complex
35% identity, 71% coverage: 49:268/310 of query aligns to 144:365/390 of 5jk8A

query
sites
5jk8A
Y
 
Y
T
 
T
D
 
E
T
 
E
D
 
E
H
 
I
A
 
K
V
 
T
W
 
W
A
 
G
K
 
V
L
 
V
Y
 
Y
D
 
N
R
 
R
Q
 
L
A
 
K
S
 
E
M
 
L
L
 
F
R
 
P
G
 
T
R
 
N
V
 
A
C
 
C
D
 
H
E
 
Q
F
 
H
L
 
A
Q
 
Y
G
 
I
L
 
F
S
 
P
T
 
L
L
 
L
-
 
E
-
 
Q
-
 
N
-
 
C
G
 
G
M
 
Y
E
 
S
R
 
P
D
 
D
R
 
N
V
 
I
P
 
P
S
 
Q
F
 
L
D
 
Q
Q
 
D
L
 
I
N
 
S
E
 
N
T
 
F
L
 
L
M
 
Q
R
 
E
A
 
C
T
|
T
G
 
G
W
 
W
Q
 
R
V
 
I
V
 
R
A
 
P
V
 
V
P
 
Q
G
 
G
L
 
L
V
x
L
P
 
S
D
x
A
A
 
R
V
 
D
F
|
F
F
 
L
E
 
N
H
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
F
R
|
R
R
 
V
F
 
F
P
 
H
A
 
A
S
 
T
W
 
Q
W
 
Y
M
 
I
R
 
R
K
 
H
P
 
P
E
 
S
Q
 
V
L
 
P
D
 
L
Y
|
Y
L
x
T
Q
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
D
C
 
C
F
 
C
H
|
H
D
 
E
V
 
L
F
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
L
I
 
A
N
 
D
P
 
P
V
 
D
F
 
F
A
 
A
N
x
D
Y
 
F
M
 
S
E
 
Q
A
 
E
Y
 
I
G
 
G
K
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
S
D
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
I
-
 
Q
M
 
L
L
 
L
A
x
S
R
 
T
L
 
C
Y
|
Y
W
 
W
Y
 
F
T
 
T
V
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
I
 
C
R
 
K
T
 
E
P
 
G
E
 
D
G
 
T
L
 
I
R
 
R
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
S
|
S
S
|
S
Q
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
M
I
 
E
Y
 
H
S
 
F
L
 
L
D
 
T
S
 
D
A
 
K
S
 
A
P
 
-
N
 
K
R
 
K
I
 
L
G
 
P
F
 
F
D
 
N
V
 
P
R
 
F
R
 
D
I
 
A
M
 
C
R
 
N
T
 
T
R
 
E
Y
 
Y
R
 
P
I
 
I
D
 
T
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
K
 
P
T
 
L
Y
 
Y
F
 
Y
V
 
V
I
 
A
D
 
E
S
 
S
F
 
F
D
 
Q
Q
 
K
L
 
A
F
 
K
D
 
E
A
 
Q
T
 
M
R
|
R

Sites not aligning to the query:

P04177 Tyrosine 3-monooxygenase; Tyrosine 3-hydroxylase; TH; EC 1.14.16.2 from Rattus norvegicus (Rat) (see 7 papers)
33% identity, 85% coverage: 45:306/310 of query aligns to 221:485/498 of P04177

query
sites
P04177
P
 
P
L
 
H
E
 
V
R
 
E
Y
 
Y
T
 
T
D
 
A
T
 
E
D
 
E
H
 
I
A
 
A
V
 
T
W
 
W
A
 
K
K
 
E
L
 
V
Y
 
Y
D
 
V
R
 
T
Q
 
L
A
 
K
S
 
G
M
 
L
L
 
Y
R
 
A
G
 
T
R
 
H
V
 
A
C
 
C
D
 
R
E
 
E
F
 
H
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
L
 
F
S
 
Q
T
 
L
L
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
Y
-
 
C
G
 
G
M
 
Y
E
 
R
R
 
E
D
 
D
R
 
S
V
 
I
P
 
P
S
 
Q
F
 
L
D
 
E
Q
 
D
L
 
V
N
 
S
E
 
R
T
 
F
L
 
L
M
 
K
R
 
E
A
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Q
 
Q
V
 
L
V
 
R
A
 
P
V
 
V
P
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
L
P
 
S
D
 
A
A
 
R
V
 
D
F
 
F
F
 
L
E
 
A
H
 
S
L
 
L
A
 
A
N
 
F
R
 
R
R
 
V
F
 
F
P
x
Q
A
 
C
S
 
T
W
 
Q
W
 
Y
M
 
I
R
 
R
K
 
H
P
 
A
E
 
S
Q
 
S
L
 
P
D
 
M
Y
x
H
L
 
S
Q
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
D
C
 
C
F
 
C
H
|
H
D
 
E
V
 
L
F
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
V
P
 
P
L
 
M
L
 
L
I
 
A
N
 
D
P
 
R
V
 
T
F
 
F
A
 
A
N
 
Q
Y
 
F
M
 
S
E
 
Q
A
 
D
Y
 
I
G
 
G
K
 
L
G
 
A
G
 
S
L
 
L
K
 
-
A
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
D
G
 
E
A
 
E
L
 
I
D
 
E
M
 
K
L
 
L
A
 
S
R
 
T
L
 
V
Y
 
Y
W
|
W
Y
 
F
T
 
T
V
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
I
 
C
R
 
K
T
 
Q
P
 
N
E
 
G
G
 
E
L
 
L
R
 
K
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
Q
 
Y
G
 
G
E
 
E
S
 
L
I
 
L
Y
 
H
S
 
S
L
 
L
D
 
-
S
 
S
A
 
E
S
 
E
P
 
P
N
 
E
R
 
V
I
 
R
G
 
A
F
 
F
D
 
D
V
 
P
R
 
D
R
 
T
I
 
A
M
 
A
R
 
V
T
 
Q
R
 
P
Y
 
Y
R
 
Q
I
x
D
D
 
Q
T
 
T
F
 
Y
Q
 
Q
K
 
P
T
 
V
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
I
 
S
D
 
E
S
 
S
F
 
F
D
 
N
Q
 
D
L
 
A
F
 
K
D
 
D
A
 
K
T
 
L
R
 
R
P
 
-
D
 
N
F
 
Y
A
 
A
P
 
S
L
 
R
Y
 
I
E
 
Q
-
 
R
-
 
P
-
 
F
E
 
S
L
 
V
R
 
K
A
 
F
Q
 
D
P
 
P
T
 
Y
L
 
T
G
 
L
A
 
A
G
 
I
D
 
D
V
 
V
G
 
L
Q
 
D
S
 
S
D
 
P
L
 
H
V
 
T
L
 
I
Q
 
Q
R
 
R
G
 
-
S
 
S
R
 
L
E
 
E
G
 
G
W
 
V
A
 
Q
D
 
D

Sites not aligning to the query:

2tohA Tyrosine hydroxylase catalytic and tetramerization domains from rat (see paper)
33% identity, 85% coverage: 45:306/310 of query aligns to 59:323/336 of 2tohA

query
sites
2tohA
P
 
P
L
 
H
E
 
V
R
 
E
Y
 
Y
T
 
T
D
 
A
T
 
E
D
 
E
H
 
I
A
 
A
V
 
T
W
 
W
A
 
K
K
 
E
L
 
V
Y
 
Y
D
 
V
R
 
T
Q
 
L
A
 
K
S
 
G
M
 
L
L
 
Y
R
 
A
G
 
T
R
 
H
V
 
A
C
 
C
D
 
R
E
 
E
F
 
H
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
L
 
F
S
 
Q
T
 
L
L
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
Y
-
 
C
G
 
G
M
 
Y
E
 
R
R
 
E
D
 
D
R
 
S
V
 
I
P
 
P
S
 
Q
F
 
L
D
 
E
Q
 
D
L
 
V
N
 
S
E
 
R
T
 
F
L
 
L
M
 
K
R
 
E
A
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Q
 
Q
V
 
L
V
 
R
A
 
P
V
|
V
P
 
A
G
 
G
L
|
L
V
x
L
P
 
S
D
 
A
A
 
R
V
 
D
F
x
Y
F
 
L
E
 
A
H
 
S
L
 
L
A
 
A
N
 
F
R
 
R
R
 
V
F
 
F
P
 
Q
A
 
C
S
 
T
W
 
Q
W
 
Y
M
 
I
R
 
R
K
 
H
P
 
A
E
 
S
Q
 
S
L
 
P
D
 
M
Y
 
H
L
 
S
Q
 
P
E
 
E
P
|
P
D
 
D
C
 
C
F
 
C
H
|
H
D
x
E
V
 
L
F
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
V
P
 
P
L
 
M
L
 
L
I
 
A
N
 
D
P
 
R
V
 
T
F
 
F
A
 
A
N
 
Q
Y
 
F
M
 
S
E
 
Q
A
 
D
Y
 
I
G
 
G
K
 
L
G
 
A
G
 
S
L
 
L
K
 
-
A
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
D
G
 
E
A
 
E
L
 
I
D
 
E
M
 
K
L
 
L
A
 
S
R
 
T
L
 
V
Y
|
Y
W
 
W
Y
 
F
T
 
T
V
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
I
 
C
R
 
K
T
 
Q
P
 
N
E
 
G
G
 
E
L
 
L
R
 
K
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
L
S
|
S
S
 
S
Q
 
Y
G
 
G
E
 
E
S
 
L
I
 
L
Y
 
H
S
 
S
L
 
L
D
 
-
S
 
S
A
 
E
S
 
E
P
 
P
N
 
E
R
 
V
I
 
R
G
 
A
F
 
F
D
 
D
V
 
P
R
 
D
R
 
T
I
 
A
M
 
A
R
 
V
T
 
Q
R
 
P
Y
 
Y
R
 
Q
I
 
D
D
 
Q
T
 
T
F
 
Y
Q
 
Q
K
 
P
T
 
V
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
I
 
S
D
 
E
S
 
S
F
 
F
D
 
N
Q
 
D
L
 
A
F
 
K
D
 
D
A
 
K
T
 
L
R
 
R
P
 
-
D
 
N
F
 
Y
A
 
A
P
 
S
L
 
R
Y
 
I
E
 
Q
-
 
R
-
 
P
-
 
F
E
 
S
L
 
V
R
 
K
A
 
F
Q
 
D
P
 
P
T
 
Y
L
 
T
G
 
L
A
 
A
G
 
I
D
 
D
V
 
V
G
 
L
Q
 
D
S
 
S
D
 
P
L
 
H
V
 
T
L
 
I
Q
 
Q
R
 
R
G
 
-
S
 
S
R
 
L
E
 
E
G
 
G
W
 
V
A
 
Q
D
 
D

6zvpD Atomic model of the em-based structure of the full-length tyrosine hydroxylase in complex with dopamine (residues 40-497) in which the regulatory domain (residues 40-165) has been included only with the backbone atoms (see paper)
33% identity, 72% coverage: 45:268/310 of query aligns to 181:406/458 of 6zvpD

query
sites
6zvpD
P
 
P
L
 
R
E
 
V
R
 
E
Y
 
Y
T
 
T
D
 
A
T
 
E
D
 
E
H
 
I
A
 
A
V
 
T
W
 
W
A
 
K
K
 
E
L
 
V
Y
 
Y
D
 
T
R
 
T
Q
 
L
A
 
K
S
 
G
M
 
L
L
 
Y
R
 
A
G
 
T
R
 
H
V
 
A
C
 
C
D
 
G
E
 
E
F
 
H
L
 
L
Q
 
E
G
 
A
L
 
F
S
 
A
T
 
L
L
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
S
G
 
G
M
 
Y
E
 
R
R
 
E
D
 
D
R
 
N
V
 
I
P
 
P
S
 
Q
F
 
L
D
 
E
Q
 
D
L
 
V
N
 
S
E
 
R
T
 
F
L
 
L
M
 
K
R
 
E
A
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Q
 
Q
V
 
L
V
 
R
A
 
P
V
 
V
P
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
L
P
 
S
D
 
A
A
 
R
V
 
D
F
 
F
F
 
L
E
 
A
H
 
S
L
 
L
A
 
A
N
 
F
R
 
R
R
 
V
F
 
F
P
 
Q
A
 
C
S
 
T
W
 
Q
W
 
Y
M
 
I
R
 
R
K
 
H
P
 
A
E
 
S
Q
 
S
L
 
P
D
 
M
Y
 
H
L
 
S
Q
 
P
E
 
E
P
|
P
D
 
D
C
 
C
F
 
C
H
|
H
D
 
E
V
 
L
F
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
V
P
 
P
L
 
M
L
 
L
I
 
A
N
 
D
P
 
R
V
 
T
F
 
F
A
 
A
N
 
Q
Y
 
F
M
 
S
E
 
Q
A
 
D
Y
 
I
G
 
G
K
 
L
G
 
A
G
 
S
L
 
L
K
 
-
A
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
D
G
 
E
A
 
E
L
 
I
D
 
E
M
 
K
L
 
L
A
 
S
R
 
T
L
 
L
Y
|
Y
W
 
W
Y
 
F
T
 
T
V
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
I
 
C
R
 
K
T
 
Q
P
 
N
E
 
G
G
 
E
L
 
V
R
 
K
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
|
A
G
 
G
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
Q
 
Y
G
 
G
E
 
E
S
 
L
I
 
L
Y
 
H
S
 
C
L
 
L
D
 
-
S
 
S
A
 
E
S
 
E
P
 
P
N
 
E
R
 
I
I
 
R
G
 
A
F
 
F
D
 
D
V
 
P
R
 
E
R
 
A
I
 
A
M
 
A
R
 
V
T
 
Q
R
 
P
Y
 
Y
R
 
Q
I
 
D
D
 
Q
T
 
T
F
 
Y
Q
 
Q
K
 
S
T
 
V
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
I
 
S
D
 
E
S
 
S
F
 
F
D
 
S
Q
 
D
L
 
A
F
 
K
D
 
D
A
 
K
T
 
L
R
 
R

Sites not aligning to the query:

6zn2A Partial structure of tyrosine hydroxylase in complex with dopamine showing the catalytic domain and an alpha-helix from the regulatory domain involved in dopamine binding. (see paper)
33% identity, 72% coverage: 45:268/310 of query aligns to 58:283/335 of 6zn2A

query
sites
6zn2A
P
 
P
L
 
R
E
 
V
R
 
E
Y
 
Y
T
 
T
D
 
A
T
 
E
D
 
E
H
 
I
A
 
A
V
 
T
W
 
W
A
 
K
K
 
E
L
 
V
Y
 
Y
D
 
T
R
 
T
Q
 
L
A
 
K
S
 
G
M
 
L
L
 
Y
R
 
A
G
 
T
R
 
H
V
 
A
C
 
C
D
 
G
E
 
E
F
 
H
L
 
L
Q
 
E
G
 
A
L
 
F
S
 
A
T
 
L
L
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
S
G
 
G
M
 
Y
E
 
R
R
 
E
D
 
D
R
 
N
V
 
I
P
 
P
S
 
Q
F
 
L
D
 
E
Q
 
D
L
 
V
N
 
S
E
 
R
T
 
F
L
 
L
M
 
K
R
 
E
A
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Q
 
Q
V
 
L
V
 
R
A
 
P
V
 
V
P
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
L
P
 
S
D
x
A
A
 
R
V
 
D
F
 
F
F
 
L
E
 
A
H
 
S
L
 
L
A
 
A
N
 
F
R
 
R
R
 
V
F
 
F
P
 
Q
A
 
C
S
 
T
W
 
Q
W
 
Y
M
 
I
R
 
R
K
 
H
P
 
A
E
 
S
Q
 
S
L
 
P
D
 
M
Y
 
H
L
 
S
Q
 
P
E
 
E
P
|
P
D
 
D
C
 
C
F
 
C
H
|
H
D
 
E
V
 
L
F
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
V
P
 
P
L
 
M
L
 
L
I
 
A
N
 
D
P
 
R
V
 
T
F
 
F
A
 
A
N
 
Q
Y
 
F
M
 
S
E
 
Q
A
 
D
Y
 
I
G
 
G
K
 
L
G
 
A
G
 
S
L
 
L
K
 
-
A
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
D
G
 
E
A
 
E
L
 
I
D
x
E
M
 
K
L
 
L
A
x
S
R
 
T
L
 
L
Y
|
Y
W
|
W
Y
 
F
T
 
T
V
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
I
 
C
R
 
K
T
 
Q
P
 
N
E
 
G
G
 
E
L
 
V
R
 
K
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
Q
 
Y
G
 
G
E
 
E
S
 
L
I
 
L
Y
 
H
S
 
C
L
 
L
D
 
-
S
 
S
A
 
E
S
 
E
P
 
P
N
 
E
R
 
I
I
 
R
G
 
A
F
 
F
D
 
D
V
 
P
R
 
E
R
 
A
I
 
A
M
 
A
R
 
V
T
 
Q
R
 
P
Y
|
Y
R
 
Q
I
 
D
D
 
Q
T
 
T
F
 
Y
Q
 
Q
K
 
S
T
 
V
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
I
 
S
D
 
E
S
 
S
F
 
F
D
 
S
Q
 
D
L
 
A
F
 
K
D
 
D
A
 
K
T
 
L
R
 
R

P07101 Tyrosine 3-monooxygenase; Tyrosine 3-hydroxylase; TH; EC 1.14.16.2 from Homo sapiens (Human) (see 32 papers)
33% identity, 72% coverage: 45:268/310 of query aligns to 251:476/528 of P07101

query
sites
P07101
P
 
P
L
 
R
E
 
V
R
 
E
Y
 
Y
T
 
T
D
 
A
T
 
E
D
x
E
H
 
I
A
 
A
V
 
T
W
 
W
A
 
K
K
 
E
L
 
V
Y
 
Y
D
 
T
R
 
T
Q
 
L
A
 
K
S
 
G
M
 
L
L
 
Y
R
 
A
G
x
T
R
 
H
V
 
A
C
 
C
D
 
G
E
 
E
F
 
H
L
 
L
Q
 
E
G
 
A
L
 
F
S
 
A
T
 
L
L
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
S
G
 
G
M
 
Y
E
 
R
R
 
E
D
 
D
R
 
N
V
 
I
P
|
P
S
 
Q
F
 
L
D
 
E
Q
 
D
L
 
V
N
 
S
E
 
R
T
x
F
L
 
L
M
 
K
R
 
E
A
 
R
T
|
T
G
 
G
W
 
F
Q
 
Q
V
 
L
V
x
R
A
 
P
V
 
V
P
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
L
P
 
S
D
 
A
A
x
R
V
 
D
F
 
F
F
 
L
E
 
A
H
 
S
L
 
L
A
 
A
N
 
F
R
|
R
R
 
V
F
 
F
P
 
Q
A
 
C
S
 
T
W
 
Q
W
 
Y
M
 
I
R
 
R
K
 
H
P
 
A
E
 
S
Q
 
S
L
 
P
D
 
M
Y
 
H
L
 
S
Q
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
D
C
|
C
F
 
C
H
 
H
D
 
E
V
 
L
F
 
L
G
 
G
H
 
H
V
 
V
P
 
P
L
 
M
L
 
L
I
 
A
N
 
D
P
 
R
V
 
T
F
|
F
A
|
A
N
 
Q
Y
 
F
M
 
S
E
 
Q
A
 
D
Y
 
I
G
 
G
K
 
L
G
 
A
G
 
S
L
|
L
K
 
-
A
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
D
G
 
E
A
 
E
L
x
I
D
 
E
M
 
K
L
 
L
A
 
S
R
x
T
L
 
L
Y
 
Y
W
 
W
Y
 
F
T
 
T
V
 
V
E
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
I
 
C
R
 
K
T
x
Q
P
 
N
E
x
G
G
 
E
L
 
V
R
 
K
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
Q
 
Y
G
|
G
E
 
E
S
 
L
I
 
L
Y
 
H
S
 
C
L
 
L
D
 
-
S
 
S
A
 
E
S
 
E
P
 
P
N
 
E
R
 
I
I
x
R
G
 
A
F
 
F
D
 
D
V
 
P
R
 
E
R
 
A
I
 
A
M
 
A
R
 
V
T
 
Q
R
 
P
Y
 
Y
R
 
Q
I
 
D
D
 
Q
T
 
T
F
 
Y
Q
 
Q
K
 
S
T
 
V
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
I
 
S
D
 
E
S
|
S
F
 
F
D
 
S
Q
 
D
L
 
A
F
 
K
D
 
D
A
 
K
T
 
L
R
 
R

Sites not aligning to the query:

2xsnA Crystal structure of human tyrosine hydroxylase catalytic domain
33% identity, 72% coverage: 45:268/310 of query aligns to 59:284/335 of 2xsnA

query
sites
2xsnA
P
 
P
L
 
R
E
 
V
R
 
E
Y
 
Y
T
 
T
D
 
A
T
 
E
D
 
E
H
 
I
A
 
A
V
 
T
W
 
W
A
 
K
K
 
E
L
 
V
Y
 
Y
D
 
T
R
 
T
Q
 
L
A
 
K
S
 
G
M
 
L
L
 
Y
R
 
A
G
 
T
R
 
H
V
 
A
C
 
C
D
 
G
E
 
E
F
 
H
L
 
L
Q
 
E
G
 
A
L
 
F
S
 
A
T
 
L
L
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
S
G
 
G
M
 
Y
E
 
R
R
 
E
D
 
D
R
 
N
V
 
I
P
 
P
S
 
Q
F
 
L
D
 
E
Q
 
D
L
 
V
N
 
S
E
 
R
T
 
F
L
 
L
M
 
K
R
 
E
A
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Q
 
Q
V
 
L
V
 
R
A
 
P
V
 
V
P
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
L
P
 
S
D
 
A
A
 
R
V
 
D
F
 
F
F
 
L
E
 
A
H
 
S
L
 
L
A
 
A
N
 
F
R
 
R
R
 
V
F
 
F
P
 
Q
A
 
C
S
 
T
W
 
Q
W
 
Y
M
 
I
R
 
R
K
 
H
P
 
A
E
 
S
Q
 
S
L
 
P
D
 
M
Y
 
H
L
 
S
Q
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
D
C
 
C
F
 
C
H
|
H
D
 
E
V
 
L
F
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
V
P
 
P
L
 
M
L
 
L
I
 
A
N
 
D
P
 
R
V
 
T
F
 
F
A
 
A
N
 
Q
Y
 
F
M
 
S
E
 
Q
A
 
D
Y
 
I
G
 
G
K
 
L
G
 
A
G
 
S
L
 
L
K
 
-
A
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
D
G
 
E
A
 
E
L
 
I
D
 
E
M
 
K
L
 
L
A
 
S
R
 
T
L
 
L
Y
 
Y
W
 
W
Y
 
F
T
 
T
V
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
I
 
C
R
 
K
T
 
Q
P
 
N
E
 
G
G
 
E
L
 
V
R
 
K
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
L
S
|
S
S
 
S
Q
 
Y
G
 
G
E
 
E
S
 
L
I
 
L
Y
 
H
S
 
C
L
 
L
D
 
-
S
 
S
A
 
E
S
 
E
P
 
P
N
 
E
R
 
I
I
 
R
G
 
A
F
 
F
D
 
D
V
 
P
R
 
E
R
 
A
I
 
A
M
 
A
R
 
V
T
 
Q
R
 
P
Y
 
Y
R
 
Q
I
 
D
D
 
Q
T
 
T
F
 
Y
Q
 
Q
K
 
S
T
 
V
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
I
 
S
D
 
E
S
 
S
F
 
F
D
 
S
Q
 
D
L
 
A
F
 
K
D
 
D
A
 
K
T
 
L
R
 
R

P70080 Tryptophan 5-hydroxylase 1; Tryptophan 5-monooxygenase 1; EC 1.14.16.4 from Gallus gallus (Chicken) (see paper)
34% identity, 74% coverage: 45:272/310 of query aligns to 163:391/445 of P70080

query
sites
P70080
P
 
P
L
 
E
E
 
I
R
 
E
Y
 
F
T
 
T
D
 
E
T
 
E
D
 
E
H
 
I
A
 
K
V
 
T
W
 
W
A
 
G
K
 
T
L
 
V
Y
 
Y
D
 
R
R
 
E
Q
 
L
A
 
N
S
 
K
M
 
L
L
 
Y
R
 
P
G
 
T
R
 
H
V
 
A
C
 
C
D
 
R
E
 
E
F
 
Y
L
 
L
Q
 
K
G
 
N
L
 
L
S
 
P
T
 
L
L
 
L
-
 
T
-
 
K
-
 
Y
-
 
C
G
 
G
M
 
Y
E
 
R
R
 
E
D
 
D
R
 
N
V
 
I
P
 
P
S
 
Q
F
 
L
D
 
E
Q
 
D
L
 
V
N
 
S
E
 
R
T
 
F
L
 
L
M
 
K
R
 
E
A
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Q
 
T
V
 
I
V
 
R
A
 
P
V
 
V
P
 
A
G
 
G
L
x
Y
V
 
L
P
 
S
D
 
P
A
 
R
V
 
D
F
 
F
F
 
L
E
 
A
H
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
F
R
 
R
R
 
V
F
 
F
P
 
H
A
 
C
S
 
T
W
 
Q
W
 
Y
M
 
V
R
|
R
K
 
H
P
 
S
E
 
S
Q
 
D
L
 
P
D
 
L
Y
 
Y
L
x
T
Q
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
D
C
 
T
F
 
C
H
|
H
D
 
E
V
 
L
F
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
L
I
 
A
N
 
E
P
 
P
V
 
S
F
 
F
A
 
A
N
 
Q
Y
 
F
M
 
S
E
 
Q
A
 
E
Y
 
I
G
 
G
K
 
L
G
 
A
G
 
S
L
 
L
K
 
-
A
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
D
G
 
E
A
 
A
L
 
V
D
 
Q
M
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
T
L
 
C
Y
 
Y
W
 
F
Y
 
F
T
 
T
V
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
I
 
C
R
 
K
T
 
Q
P
 
E
E
 
G
G
 
Q
L
 
L
R
 
R
I
 
V
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
L
S
|
S
S
 
S
Q
 
I
G
 
S
E
 
E
S
 
L
I
 
K
Y
 
H
S
 
S
L
 
L
D
 
-
S
 
S
A
 
G
S
 
S
P
 
A
N
 
K
R
 
V
I
 
K
G
 
P
F
 
F
D
 
D
V
 
P
R
 
K
R
 
V
I
 
T
M
 
C
R
 
K
T
 
Q
R
 
E
Y
 
C
R
 
L
I
|
I
D
 
T
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
K
 
E
T
 
V
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
I
 
S
D
 
E
S
 
S
F
 
F
D
 
E
Q
 
E
L
 
A
F
 
K
D
 
E
A
 
K
T
 
M
R
 
R
P
 
-
D
 
E
F
 
F
A
 
A

3e2tA The catalytic domain of chicken tryptophan hydroxylase 1 with bound tryptophan (see paper)
34% identity, 74% coverage: 45:272/310 of query aligns to 59:287/307 of 3e2tA

query
sites
3e2tA
P
 
P
L
 
E
E
 
I
R
 
E
Y
 
F
T
 
T
D
 
E
T
 
E
D
 
E
H
 
I
A
 
K
V
 
T
W
 
W
A
 
G
K
 
T
L
 
V
Y
 
Y
D
 
R
R
 
E
Q
 
L
A
 
N
S
 
K
M
 
L
L
 
Y
R
 
P
G
 
T
R
 
H
V
 
A
C
 
C
D
 
R
E
 
E
F
 
Y
L
 
L
Q
 
K
G
 
N
L
 
L
S
 
P
T
 
L
L
 
L
-
 
T
-
 
K
-
 
Y
-
 
C
G
 
G
M
 
Y
E
 
R
R
 
E
D
 
D
R
 
N
V
 
I
P
 
P
S
 
Q
F
 
L
D
 
E
Q
 
D
L
 
V
N
 
S
E
 
R
T
 
F
L
 
L
M
 
K
R
 
E
A
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Q
 
T
V
 
I
V
 
R
A
 
P
V
 
V
P
 
A
G
 
G
L
 
Y
V
 
L
P
 
S
D
 
P
A
 
R
V
 
D
F
 
F
F
 
L
E
 
A
H
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
F
R
 
R
R
 
V
F
 
F
P
 
H
A
 
C
S
 
T
W
 
Q
W
 
Y
M
 
V
R
|
R
K
 
H
P
 
S
E
 
S
Q
 
D
L
 
P
D
 
L
Y
|
Y
L
x
T
Q
 
P
E
|
E
P
|
P
D
 
D
C
 
T
F
 
C
H
|
H
D
 
E
V
 
L
F
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
L
I
 
A
N
 
E
P
 
P
V
 
S
F
 
F
A
 
A
N
 
Q
Y
 
F
M
 
S
E
 
Q
A
 
E
Y
 
I
G
 
G
K
 
L
G
 
A
G
 
S
L
 
L
K
 
-
A
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
D
G
 
E
A
 
A
L
 
V
D
 
Q
M
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
T
L
 
C
Y
 
Y
W
 
F
Y
 
F
T
 
T
V
 
V
E
|
E
F
|
F
G
 
G
L
 
L
I
 
C
R
 
K
T
 
Q
P
 
E
E
 
G
G
 
Q
L
 
L
R
 
R
I
 
V
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
L
S
|
S
S
 
S
Q
 
I
G
 
S
E
 
E
S
 
L
I
 
K
Y
 
H
S
 
S
L
 
L
D
 
-
S
 
S
A
 
G
S
 
S
P
 
A
N
 
K
R
 
V
I
 
K
G
 
P
F
 
F
D
 
D
V
 
P
R
 
K
R
 
V
I
 
T
M
 
C
R
 
K
T
 
Q
R
 
E
Y
 
C
R
 
L
I
|
I
D
 
T
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
K
 
E
T
 
V
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
I
 
S
D
 
E
S
 
S
F
 
F
D
 
E
Q
 
E
L
 
A
F
 
K
D
 
E
A
 
K
T
 
M
R
 
R
P
 
-
D
 
E
F
 
F
A
 
A

P17289 Tyrosine 3-monooxygenase; Tyrosine 3-hydroxylase; TH; EC 1.14.16.2 from Bos taurus (Bovine) (see 2 papers)
33% identity, 72% coverage: 45:268/310 of query aligns to 214:439/491 of P17289

query
sites
P17289
P
 
P
L
 
H
E
 
V
R
 
E
Y
 
Y
T
 
T
D
 
A
T
 
E
D
 
E
H
 
T
A
 
A
V
 
T
W
 
W
A
 
K
K
 
E
L
 
V
Y
 
Y
D
 
S
R
 
T
Q
 
L
A
 
R
S
 
G
M
 
L
L
 
Y
R
 
P
G
 
T
R
 
H
V
 
A
C
 
C
D
 
R
E
 
E
F
 
H
L
 
L
Q
 
E
G
 
A
L
 
F
S
 
E
T
 
L
L
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
C
G
 
G
M
 
Y
E
 
R
R
 
E
D
 
D
R
 
R
V
 
I
P
 
P
S
 
Q
F
 
L
D
 
E
Q
 
D
L
 
V
N
 
S
E
 
R
T
 
F
L
 
L
M
 
K
R
 
E
A
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Q
 
Q
V
 
L
V
 
R
A
 
P
V
 
A
P
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
L
P
 
S
D
 
A
A
 
R
V
 
D
F
 
F
F
 
L
E
 
A
H
 
S
L
 
L
A
 
A
N
 
F
R
 
R
R
 
V
F
 
F
P
 
Q
A
 
C
S
 
T
W
 
Q
W
 
Y
M
 
I
R
 
R
K
 
H
P
 
A
E
 
S
Q
 
S
L
 
P
D
 
M
Y
 
H
L
 
S
Q
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
E
C
 
C
F
 
C
H
 
H
D
 
E
V
 
L
F
 
L
G
 
G
H
 
H
V
 
V
P
 
P
L
 
M
L
 
L
I
 
A
N
 
D
P
 
R
V
 
T
F
 
F
A
 
A
N
 
Q
Y
 
F
M
 
S
E
 
Q
A
 
D
Y
 
I
G
 
G
K
 
L
G
 
A
G
 
S
L
 
L
K
 
-
A
 
G
A
 
V
S
 
S
L
 
D
G
 
E
A
 
E
L
 
I
D
 
E
M
 
K
L
 
L
A
 
S
R
 
T
L
 
L
Y
 
Y
W
 
W
Y
 
F
T
 
T
V
 
V
E
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
I
 
C
R
 
K
T
 
Q
P
 
N
E
 
G
G
 
E
L
 
V
R
 
K
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
Q
 
Y
G
 
G
E
 
E
S
 
L
I
 
L
Y
 
H
S
 
S
L
 
L
D
 
-
S
 
S
A
 
E
S
 
E
P
 
P
N
 
E
R
 
I
I
 
R
G
 
A
F
 
F
D
 
D
V
 
P
R
 
D
R
 
A
I
 
A
M
 
A
R
 
V
T
 
Q
R
 
P
Y
 
Y
R
 
Q
I
 
D
D
 
Q
T
 
T
F
 
Y
Q
 
Q
K
 
P
T
 
V
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
I
 
S
D
 
E
S
 
S
F
 
F
D
 
S
Q
 
D
L
 
A
F
 
K
D
 
D
A
 
K
T
 
L
R
 
R

Sites not aligning to the query:

P00439 Phenylalanine-4-hydroxylase; PAH; Phe-4-monooxygenase; EC 1.14.16.1 from Homo sapiens (Human) (see 43 papers)
31% identity, 75% coverage: 39:272/310 of query aligns to 167:403/452 of P00439

query
sites
P00439
D
 
N
F
 
Y
T
 
R
I
x
H
A
x
G
Q
 
Q
P
|
P
L
x
I
E
 
P
R
|
R
-
x
V
-
x
E
Y
 
Y
T
 
M
D
 
E
T
 
E
D
 
E
H
 
K
A
 
K
V
 
T
W
 
W
A
 
G
K
 
T
L
x
V
Y
 
F
D
 
K
R
 
T
Q
 
L
A
 
K
S
 
S
M
 
L
L
 
Y
R
 
K
G
 
T
R
x
H
V
 
A
C
 
C
D
x
Y
E
 
E
F
 
Y
L
x
N
Q
 
H
G
 
I
L
 
F
S
x
P
T
 
L
L
|
L
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
C
G
|
G
M
 
F
E
 
H
R
x
E
D
|
D
R
 
N
V
x
I
P
|
P
S
 
Q
F
 
L
D
 
E
Q
 
D
L
x
V
N
 
S
E
 
Q
T
x
F
L
 
L
M
 
Q
R
 
T
A
 
C
T
|
T
G
 
G
W
 
F
Q
x
R
V
 
L
V
x
R
A
x
P
V
|
V
P
 
A
G
|
G
L
 
L
V
x
L
P
 
S
D
 
S
A
x
R
V
 
D
F
 
F
F
x
L
E
 
G
H
 
G
L
 
L
A
|
A
N
 
F
R
|
R
R
 
V
F
 
F
P
 
H
A
 
C
S
 
T
W
 
Q
W
 
Y
M
x
I
R
|
R
K
 
H
P
 
G
E
x
S
Q
 
K
L
x
P
D
x
M
Y
|
Y
L
 
T
Q
 
P
E
|
E
P
|
P
D
|
D
C
x
I
F
 
C
H
 
H
D
 
E
V
 
L
F
 
L
G
 
G
H
 
H
V
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
F
I
 
S
N
 
D
P
x
R
V
 
S
F
|
F
A
|
A
N
 
Q
Y
 
F
M
x
S
E
 
Q
A
 
E
Y
x
I
G
 
G
K
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
L
A
|
A
S
|
S
L
|
L
G
 
G
A
 
A
-
x
P
-
 
D
-
 
E
-
 
Y
L
x
I
D
 
E
M
 
K
L
 
L
A
|
A
R
 
T
L
 
I
Y
 
Y
W
 
W
Y
 
F
T
 
T
V
 
V
E
 
E
F
|
F
G
 
G
L
 
L
I
 
C
R
 
K
T
 
Q
P
 
G
E
x
D
G
 
S
L
 
I
R
 
K
I
x
A
Y
 
Y
G
 
G
A
|
A
G
 
G
I
 
L
L
|
L
S
|
S
S
|
S
Q
 
F
G
 
G
E
 
E
S
 
L
I
 
Q
Y
 
Y
S
 
C
L
 
L
D
 
-
S
 
S
A
 
E
S
 
K
P
 
P
N
 
K
R
x
L
I
 
L
G
 
P
F
 
L
D
 
E
V
 
L
R
 
E
R
 
K
I
 
T
M
 
A
R
 
I
T
 
Q
R
 
N
Y
|
Y
R
 
T
I
 
V
D
x
T
T
 
E
F
 
F
Q
 
Q
K
 
P
T
 
L
Y
 
Y
F
x
Y
V
|
V
I
 
A
D
x
E
S
 
S
F
 
F
D
 
N
Q
 
D
L
x
A
F
 
K
D
 
E
A
 
K
T
 
V
R
 
R
P
 
-
D
 
N
F
 
F
A
|
A

Sites not aligning to the query:

P90986 Tyrosine 3-monooxygenase; Abnormal catecholamine distribution protein 2; Tyrosine 3-hydroxylase; TH; EC 1.14.16.2 from Caenorhabditis elegans (see 4 papers)
31% identity, 68% coverage: 49:260/310 of query aligns to 241:454/519 of P90986

query
sites
P90986
Y
 
Y
T
 
T
D
 
E
T
 
E
D
 
E
H
 
H
A
 
A
V
 
T
W
 
W
A
 
K
K
 
A
L
 
V
Y
 
Y
D
 
E
R
 
K
Q
 
L
A
 
G
S
 
D
M
 
L
L
 
H
R
 
L
G
 
S
R
 
H
V
 
T
C
 
C
D
 
A
E
 
V
F
 
Y
L
 
R
Q
 
Q
G
 
N
L
 
L
S
 
K
T
 
I
L
 
L
G
x
Q
M
x
E
E
|
E
R
x
K
-
x
V
-
x
L
-
x
T
-
x
A
D
|
D
R
|
R
V
x
I
P
|
P
S
x
Q
F
x
I
D
x
R
Q
x
D
L
x
V
N
|
N
E
x
K
T
x
F
L
|
L
M
x
Q
R
x
K
A
x
K
T
|
T
G
|
G
W
x
F
Q
x
E
V
x
L
V
x
R
A
x
P
V
x
C
P
x
S
G
|
G
L
|
L
V
x
L
P
x
S
D
x
A
A
x
R
V
x
D
F
|
F
F
x
L
E
x
A
H
x
S
L
|
L
A
|
A
N
x
F
R
|
R
R
x
V
F
|
F
P
x
Q
A
x
T
S
x
T
W
x
T
W
x
Y
M
x
L
R
|
R
K
x
H
P
x
H
E
x
K
Q
x
S
L
x
P
D
x
H
Y
x
H
L
x
S
Q
x
P
E
|
E
P
|
P
D
|
D
C
x
L
F
x
I
H
|
H
D
x
E
V
x
L
F
x
L
G
|
G
H
|
H
V
|
V
P
|
P
L
x
M
L
x
F
I
x
S
N
x
D
P
|
P
V
x
L
F
x
L
A
|
A
N
x
Q
Y
x
M
M
x
S
E
x
Q
A
x
D
Y
x
I
G
|
G
K
x
L
G
x
M
G
x
S
L
|
L
K
 
-
A
x
G
A
|
A
S
|
S
L
x
D
G
x
E
A
x
H
L
x
I
D
x
E
M
x
K
L
|
L
A
x
S
R
x
T
L
x
V
Y
|
Y
W
|
W
Y
x
F
T
x
I
V
|
V
E
|
E
F
|
F
G
|
G
L
|
L
I
x
C
R
x
K
T
x
E
P
x
D
E
x
G
G
x
K
L
|
L
R
x
K
I
x
A
Y
x
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
I
x
L
L
|
L
S
|
S
S
x
A
Q
x
Y
G
|
G
E
|
E
S
x
L
I
x
M
Y
x
H
S
x
A
L
x
C
D
x
S
S
x
D
A
|
A
S
 
-
P
|
P
N
x
E
R
x
H
I
x
K
G
x
D
F
|
F
D
|
D
V
x
P
R
x
A
R
x
V
I
x
T
M
x
A
R
x
V
T
x
Q
R
x
K
Y
|
Y
R
x
E
I
x
D
D
|
D
T
x
D
F
x
Y
Q
|
Q
K
x
P
T
x
L
Y
|
Y
F
|
F
V
|
V
I
x
A
D
|
D
S
|
S
F
x
I

Sites not aligning to the query:

4anpA Crystal structure of human phenylalanine hydroxylase in complex with a pharmacological chaperone (see paper)
30% identity, 74% coverage: 39:268/310 of query aligns to 51:284/309 of 4anpA

query
sites
4anpA
D
 
N
F
 
Y
T
 
R
I
 
H
A
 
G
Q
 
Q
P
 
P
L
 
I
E
 
P
R
 
R
-
 
V
-
 
E
Y
 
Y
T
 
M
D
 
E
T
 
E
D
 
E
H
 
K
A
 
K
V
 
T
W
 
W
A
 
G
K
 
T
L
 
V
Y
 
F
D
 
K
R
 
T
Q
 
L
A
 
K
S
 
S
M
 
L
L
 
Y
R
 
K
G
 
T
R
 
H
V
 
A
C
 
C
D
 
Y
E
 
E
F
 
Y
L
 
N
Q
 
H
G
 
I
L
 
F
S
 
P
T
 
L
L
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
C
G
 
G
M
 
F
E
 
H
R
 
E
D
 
D
R
 
N
V
 
I
P
 
P
S
 
Q
F
 
L
D
 
E
Q
 
D
L
 
V
N
 
S
E
 
Q
T
 
F
L
 
L
M
 
Q
R
 
T
A
 
C
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Q
 
R
V
 
L
V
 
R
A
 
P
V
 
V
P
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
L
P
 
S
D
 
S
A
 
R
V
 
D
F
|
F
F
 
L
E
 
G
H
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
F
R
 
R
R
 
V
F
 
F
P
 
H
A
 
C
S
 
T
W
 
Q
W
 
Y
M
 
I
R
 
R
K
 
H
P
 
G
E
 
S
Q
 
K
L
 
P
D
 
M
Y
 
Y
L
 
T
Q
x
P
E
 
E
P
|
P
D
 
D
C
 
I
F
 
C
H
|
H
D
 
E
V
 
L
F
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
F
I
 
S
N
 
D
P
 
R
V
 
S
F
 
F
A
 
A
N
 
Q
Y
 
F
M
 
S
E
 
Q
A
 
E
Y
 
I
G
 
G
K
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
-
 
P
-
 
D
-
 
E
-
 
Y
L
 
I
D
 
E
M
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
T
L
 
I
Y
 
Y
W
|
W
Y
 
F
T
 
T
V
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
I
 
C
R
 
K
T
 
Q
P
 
G
E
 
D
G
 
S
L
 
I
R
 
K
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
L
S
|
S
S
 
S
Q
 
F
G
 
G
E
 
E
S
 
L
I
 
Q
Y
 
Y
S
 
C
L
 
L
D
 
-
S
 
S
A
 
E
S
 
K
P
 
P
N
 
K
R
 
L
I
 
L
G
 
P
F
 
L
D
 
E
V
 
L
R
 
E
R
 
K
I
 
T
M
 
A
R
 
I
T
 
Q
R
 
N
Y
 
Y
R
 
T
I
 
V
D
 
T
T
 
E
F
 
F
Q
 
Q
K
 
P
T
 
L
Y
 
Y
F
 
Y
V
 
V
I
 
A
D
 
E
S
 
S
F
 
F
D
 
N
Q
 
D
L
 
A
F
 
K
D
 
E
A
 
K
T
 
V
R
 
R

6pahA Human phenylalanine hydroxylase catalytic domain dimer with bound l- dopa (3,4-dihydroxyphenylalanine) inhibitor (see paper)
31% identity, 75% coverage: 39:272/310 of query aligns to 51:287/308 of 6pahA

query
sites
6pahA
D
 
N
F
 
Y
T
 
R
I
 
H
A
 
G
Q
 
Q
P
 
P
L
 
I
E
 
P
R
 
R
-
 
V
-
 
E
Y
 
Y
T
 
M
D
 
E
T
 
E
D
 
E
H
 
K
A
 
K
V
 
T
W
 
W
A
 
G
K
 
T
L
 
V
Y
 
F
D
 
K
R
 
T
Q
 
L
A
 
K
S
 
S
M
 
L
L
 
Y
R
 
K
G
 
T
R
 
H
V
 
A
C
 
C
D
 
Y
E
 
E
F
 
Y
L
 
N
Q
 
H
G
 
I
L
 
F
S
 
P
T
 
L
L
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
C
G
 
G
M
 
F
E
 
H
R
 
E
D
 
D
R
 
N
V
 
I
P
 
P
S
 
Q
F
 
L
D
 
E
Q
 
D
L
 
V
N
 
S
E
 
Q
T
 
F
L
 
L
M
 
Q
R
 
T
A
 
C
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Q
 
R
V
 
L
V
 
R
A
 
P
V
 
V
P
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
L
P
 
S
D
 
S
A
 
R
V
 
D
F
 
F
F
 
L
E
 
G
H
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
F
R
 
R
R
 
V
F
 
F
P
 
H
A
 
C
S
 
T
W
 
Q
W
 
Y
M
 
I
R
 
R
K
 
H
P
 
G
E
 
S
Q
 
K
L
 
P
D
 
M
Y
 
Y
L
 
T
Q
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
D
C
 
I
F
 
C
H
|
H
D
 
E
V
 
L
F
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
F
I
 
S
N
 
D
P
 
R
V
 
S
F
 
F
A
 
A
N
 
Q
Y
 
F
M
 
S
E
 
Q
A
 
E
Y
 
I
G
 
G
K
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
-
 
P
-
 
D
-
 
E
-
 
Y
L
 
I
D
 
E
M
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
T
L
 
I
Y
|
Y
W
 
W
Y
 
F
T
 
T
V
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
I
 
C
R
 
K
T
 
Q
P
 
G
E
 
D
G
 
S
L
 
I
R
 
K
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
L
S
|
S
S
 
S
Q
 
F
G
 
G
E
 
E
S
 
L
I
 
Q
Y
 
Y
S
 
C
L
 
L
D
 
-
S
 
S
A
 
E
S
 
K
P
 
P
N
 
K
R
 
L
I
 
L
G
 
P
F
 
L
D
 
E
V
 
L
R
 
E
R
 
K
I
 
T
M
 
A
R
 
I
T
 
Q
R
 
N
Y
 
Y
R
 
T
I
 
V
D
 
T
T
 
E
F
 
F
Q
 
Q
K
 
P
T
 
L
Y
 
Y
F
 
Y
V
 
V
I
 
A
D
 
E
S
 
S
F
 
F
D
 
N
Q
 
D
L
 
A
F
 
K
D
 
E
A
 
K
T
 
V
R
 
R
P
 
-
D
 
N
F
 
F
A
 
A

Query Sequence

>RR42_RS20365 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS20365
MATATHAGDAQASFSGTLTDKLKEQFDAGLLSGQELRPDFTIAQPLERYTDTDHAVWAKL
YDRQASMLRGRVCDEFLQGLSTLGMERDRVPSFDQLNETLMRATGWQVVAVPGLVPDAVF
FEHLANRRFPASWWMRKPEQLDYLQEPDCFHDVFGHVPLLINPVFANYMEAYGKGGLKAA
SLGALDMLARLYWYTVEFGLIRTPEGLRIYGAGILSSQGESIYSLDSASPNRIGFDVRRI
MRTRYRIDTFQKTYFVIDSFDQLFDATRPDFAPLYEELRAQPTLGAGDVGQSDLVLQRGS
REGWADSDDV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory