SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS22630 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS22630 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6iunB Crystal structure of enoyl-coa hydratase (ech) from ralstonia eutropha h16 in complex with NAD
54% identity, 99% coverage: 3:690/696 of query aligns to 1:688/692 of 6iunB

query
sites
6iunB
T
 
T
V
 
A
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
Q
R
 
V
Q
 
Q
G
 
D
R
 
G
I
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
I
L
 
T
L
 
L
D
 
D
N
 
N
P
 
P
P
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
L
 
L
G
 
G
D
 
H
T
 
S
V
 
T
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
I
F
 
V
D
 
E
G
 
G
I
 
M
A
 
T
Q
 
R
A
 
A
T
 
L
Q
 
D
D
 
D
D
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
A
F
 
F
C
 
S
G
 
G
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
 
I
R
 
R
Q
 
E
F
|
F
N
 
N
A
 
T
P
 
P
A
 
K
A
 
A
S
 
M
A
 
Q
Q
x
E
P
 
P
T
 
T
L
 
L
R
x
H
Q
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
R
R
 
V
I
 
L
E
 
E
Q
 
G
S
 
S
A
 
S
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
V
H
 
H
G
 
S
V
 
V
A
 
A
L
 
M
G
 
G
G
|
G
G
 
G
M
 
L
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
C
H
 
N
Y
 
Y
R
 
R
I
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
K
D
 
G
A
 
A
S
 
Q
L
 
I
G
 
A
L
 
L
P
 
P
E
|
E
V
 
V
N
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
L
P
 
P
G
|
G
G
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
L
P
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
A
E
 
N
L
 
M
I
 
I
Q
 
V
G
 
S
G
 
G
K
 
T
P
 
P
V
 
V
R
 
L
G
 
S
D
 
E
K
 
K
A
 
F
V
 
A
A
 
G
L
 
T
G
 
K
M
 
L
A
 
F
D
 
D
A
 
E
L
 
I
I
 
V
D
 
D
G
 
G
D
 
D
P
 
V
L
 
L
A
 
P
A
 
A
A
 
A
M
 
V
A
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
R
 
N
V
 
V
A
 
G
G
 
A
L
 
A
P
 
T
G
 
G
A
 
P
H
 
H
P
 
P
V
 
K
I
 
V
-
 
R
-
 
D
A
 
L
R
 
K
R
 
V
P
 
R
C
 
H
A
 
E
D
 
N
A
 
P
A
 
E
G
 
G
V
 
Y
D
 
L
F
 
G
A
 
F
A
 
A
R
 
R
S
 
N
A
 
T
A
 
-
V
 
V
S
 
A
A
 
A
K
 
M
A
 
A
R
 
K
N
 
N
A
 
F
L
 
P
A
 
A
Q
 
P
R
 
L
A
 
K
A
 
C
I
 
L
A
 
E
C
 
A
V
 
V
Q
 
A
A
 
G
A
 
S
T
 
L
R
 
K
L
 
-
P
 
P
I
 
F
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
D
x
K
D
 
Q
E
 
E
R
 
R
A
 
E
R
 
G
F
 
F
D
 
L
Q
 
Y
L
 
L
V
 
V
A
 
T
S
 
T
T
 
P
E
 
E
S
 
S
K
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
R
H
 
H
L
 
A
F
 
F
F
 
F
A
 
G
E
 
E
R
 
R
E
 
A
A
 
A
P
 
S
K
 
K
V
 
I
A
 
P
A
 
D
L
 
V
P
 
P
A
 
E
G
 
G
A
 
T
S
 
P
L
 
T
R
 
R
T
 
K
V
 
I
A
 
E
R
 
K
V
 
V
G
 
A
I
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
A
G
|
G
T
|
T
M
|
M
G
 
G
A
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
S
M
 
M
A
 
N
F
 
F
A
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
P
V
 
V
T
 
T
L
 
I
L
 
L
E
|
E
Q
x
T
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
V
A
 
G
M
 
I
I
 
I
R
 
R
R
 
K
N
 
N
Y
 
Y
E
 
E
I
 
N
T
 
S
A
 
A
A
 
K
K
 
K
G
 
G
K
 
K
L
 
L
T
 
T
A
 
Q
Q
 
E
E
 
K
I
 
V
A
 
E
Q
 
Q
R
 
R
M
 
M
A
 
G
C
 
L
I
 
L
T
 
S
P
 
T
T
 
T
L
 
L
A
 
S
D
x
Y
A
 
D
A
 
D
L
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
I
I
 
I
E
 
E
A
|
A
V
|
V
F
 
F
E
|
E
D
 
E
M
 
M
A
 
G
V
|
V
K
 
K
K
 
E
A
 
T
V
|
V
F
 
F
A
 
K
R
 
K
L
 
L
D
 
D
A
 
E
L
 
V
C
 
A
K
 
K
P
 
Q
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
S
N
|
N
T
 
T
S
|
S
R
 
T
L
 
L
S
 
D
I
 
V
D
 
N
V
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
S
S
 
F
T
 
T
S
 
K
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
H
|
H
F
 
F
F
 
F
S
 
S
P
 
P
A
 
A
N
 
N
V
 
V
M
 
M
K
 
K
L
 
L
L
 
L
E
|
E
V
 
V
V
 
V
Q
 
R
G
 
G
E
 
E
R
 
K
T
 
T
A
 
G
P
 
K
E
 
D
V
 
V
I
 
L
A
 
A
T
 
T
C
 
V
M
 
M
K
 
Q
M
 
V
A
 
G
R
 
K
A
 
K
I
 
I
G
 
K
K
 
K
I
 
T
P
 
A
V
 
V
L
 
V
V
 
S
R
 
G
V
 
V
C
 
C
E
 
D
G
 
G
F
 
F
V
 
I
G
 
G
N
|
N
R
 
R
M
 
M
L
 
I
T
 
E
P
 
Q
Y
 
Y
W
 
S
R
 
R
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
L
 
L
E
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
L
P
 
P
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
G
 
K
A
 
A
L
 
I
T
 
E
R
 
K
F
 
F
G
 
G
M
 
F
A
 
A
M
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
F
A
 
R
M
 
M
A
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
A
G
 
G
M
 
N
D
 
D
I
 
I
N
 
G
W
 
W
A
 
A
T
 
I
R
 
R
K
 
K
R
 
R
L
 
R
A
 
A
P
 
V
T
 
D
R
 
K
P
 
P
A
 
-
H
 
E
L
 
I
R
 
Q
Y
 
Y
S
 
S
K
 
K
V
 
T
A
 
A
D
 
D
R
 
L
I
 
L
C
 
C
E
 
E
Q
 
M
G
 
G
R
 
R
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
N
 
G
A
 
A
G
 
G
Y
 
W
Y
 
Y
R
 
D
Y
 
Y
E
 
K
A
 
A
G
 
G
S
 
D
R
 
R
A
 
K
P
 
P
L
 
Y
P
 
P
D
 
N
P
 
Q
A
 
Q
V
 
V
D
 
N
A
 
D
L
 
M
I
 
I
R
 
V
A
 
Q
C
 
H
A
 
S
A
 
K
E
 
D
A
 
L
G
 
G
I
 
I
E
 
T
R
 
R
R
 
R
E
 
K
V
 
I
S
 
S
D
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
V
 
V
E
 
E
R
 
R
C
 
L
M
 
V
L
 
F
A
 
A
L
 
L
A
 
V
N
 
N
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
S
R
 
K
A
 
A
A
 
S
D
 
D
I
 
I
D
 
D
V
 
M
V
 
V
Y
 
Y
V
 
L
H
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
P
 
P
A
 
L
W
 
F
R
 
R
G
 
G
G
 
G
P
 
P
M
 
M
F
 
L
H
 
Y
A
 
A
E
 
D
T
 
Q
I
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
Y
R
 
N
T
 
V
-
 
A
L
 
L
E
 
S
K
 
M
I
 
K
R
 
R
A
 
Y
L
 
A
N
 
K
A
 
G
I
 
Y
H
 
H
G
 
G
E
 
E
H
 
A
W
 
W
T
 
Q
P
 
V
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
L
V
 
Q
R
 
K
L
 
L
V
 
A
A
 
D
Q
 
E
G
 
G
R
 
K

Q08426 Peroxisomal bifunctional enzyme; PBE; PBFE; L-bifunctional protein; LBP; Multifunctional enzyme 1; MFE1; EC 4.2.1.17; EC 5.3.3.8; EC 1.1.1.35 from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
44% identity, 98% coverage: 5:689/696 of query aligns to 3:705/723 of Q08426

query
sites
Q08426
Q
x
E
Y
 
Y
G
 
T
R
 
R
-
 
L
Q
 
H
G
 
N
R
 
A
I
 
L
A
 
A
I
 
L
L
 
I
L
 
R
L
 
L
D
 
R
N
 
N
P
 
P
P
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
A
L
 
I
G
 
S
D
 
T
T
 
T
V
 
L
R
 
L
L
 
R
G
 
D
L
 
I
F
 
K
D
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
T
x
V
Q
x
I
D
 
D
D
 
H
A
 
T
V
 
I
A
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
C
G
 
G
A
 
A
G
 
E
K
 
G
V
 
K
F
 
F
C
 
S
G
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
R
 
R
Q
 
G
F
 
F
N
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
R
A
 
T
S
 
F
A
 
G
Q
 
L
P
 
-
T
|
T
L
 
L
R
 
G
Q
 
H
V
 
V
I
 
V
A
 
D
R
 
E
I
 
I
E
 
Q
Q
 
R
S
 
N
A
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
H
 
Q
G
 
G
V
 
M
A
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
G
 
G
M
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
C
H
 
H
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
H
A
 
A
D
 
E
A
 
A
S
 
Q
L
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
N
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
A
G
 
R
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
L
I
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
L
I
 
I
Q
 
T
G
 
S
G
 
G
K
 
R
P
 
R
V
 
I
R
 
L
G
 
A
D
 
D
K
 
E
A
 
A
V
 
L
A
x
K
L
 
L
G
 
G
M
 
I
A
 
L
D
 
D
A
x
K
L
 
V
I
 
V
D
 
N
G
 
S
D
 
D
P
 
P
L
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
M
 
I
A
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
G
 
D
L
 
Q
P
 
P
G
 
L
A
 
E
H
 
S
P
 
R
V
 
R
I
 
L
A
 
C
R
 
N
R
 
K
P
 
P
C
 
I
A
 
Q
D
 
S
A
 
L
A
 
P
G
 
N
V
 
M
D
 
D
F
 
S
A
 
I
A
 
F
R
 
S
S
 
E
A
 
A
A
 
L
V
 
L
S
 
K
A
 
M
K
 
R
A
 
R
R
 
Q
N
 
H
-
 
P
-
 
G
A
 
C
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
R
 
E
A
 
A
A
 
C
I
 
V
A
 
R
C
 
A
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
T
 
V
R
 
Q
L
 
Y
P
 
P
I
 
Y
D
 
E
A
 
V
G
 
G
L
 
I
D
 
K
D
 
K
E
 
E
R
 
E
A
 
E
R
 
L
F
 
F
D
 
L
Q
 
Y
L
 
L
V
 
L
A
 
Q
S
 
S
T
 
G
E
 
Q
S
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
H
 
Y
L
 
A
F
 
F
F
 
F
A
|
A
E
 
E
R
 
R
E
 
K
A
 
A
P
 
N
K
 
K
V
 
W
A
 
S
A
 
T
L
 
-
P
 
P
A
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
W
R
 
K
T
 
T
-
 
A
-
 
S
-
 
A
-
 
R
-
 
P
V
 
V
A
 
S
R
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
V
G
 
G
A
 
L
G
 
G
T
 
T
M
 
M
G
 
G
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
V
M
 
I
A
 
S
F
 
F
A
 
A
N
 
R
A
 
A
G
 
R
I
 
I
A
 
P
V
 
V
T
 
I
L
x
A
L
 
V
E
 
D
Q
 
S
Q
 
D
Q
 
K
A
 
N
A
 
Q
L
 
L
D
 
A
R
 
T
G
 
A
L
 
N
A
 
K
M
 
M
I
 
I
R
 
T
R
 
S
N
 
V
Y
 
L
E
 
E
I
x
K
T
 
E
A
 
A
A
 
S
K
 
K
G
 
M
K
 
Q
L
 
Q
T
 
S
A
 
G
Q
 
H
E
 
P
I
 
W
A
 
S
Q
 
G
R
 
P
M
 
K
A
 
P
C
 
R
I
 
L
T
 
T
P
 
S
T
 
S
L
 
V
A
 
K
D
 
E
A
 
-
A
 
-
L
 
L
A
 
G
D
 
G
A
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
V
 
V
F
 
F
E
 
E
D
 
E
M
 
M
A
 
S
V
 
L
K
 
K
K
 
K
A
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
A
R
 
E
L
 
L
D
 
S
A
 
A
L
 
V
C
 
C
K
 
K
P
 
P
G
 
E
A
 
A
I
 
F
L
 
L
A
 
C
T
 
T
N
 
N
T
 
T
S
 
S
R
 
A
L
 
L
S
 
D
I
 
V
D
 
D
V
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
S
S
 
S
T
 
T
S
 
D
R
 
R
P
 
P
Q
 
H
D
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
T
H
 
H
F
 
F
F
 
F
S
 
S
P
 
P
A
 
A
N
 
H
V
 
V
M
 
M
K
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
I
Q
 
P
G
 
S
E
 
Q
R
 
Y
T
 
S
A
 
S
P
 
P
E
 
T
V
 
T
I
 
I
A
 
A
T
 
T
C
 
V
M
 
M
K
 
N
M
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
K
I
 
I
G
 
K
K
 
K
I
 
I
P
 
G
V
 
V
L
 
V
V
 
V
R
 
G
V
 
N
C
 
C
E
 
F
G
 
G
F
 
F
V
 
V
G
 
G
N
 
N
R
 
R
M
 
M
L
 
L
T
 
N
P
 
P
Y
 
Y
W
 
Y
R
 
N
E
 
Q
A
 
A
G
 
Y
F
 
F
L
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
S
S
 
K
P
 
P
Q
 
E
Q
 
E
V
 
V
D
 
D
G
 
Q
A
 
V
L
 
L
T
 
E
R
 
E
F
 
F
G
 
G
M
 
F
A
 
K
M
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
F
A
 
R
M
 
V
A
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
A
G
 
G
M
 
L
D
 
D
I
 
V
N
 
G
W
 
W
A
 
K
T
 
S
R
 
R
K
 
K
-
 
G
-
 
Q
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
P
R
 
T
L
 
L
A
 
L
P
 
P
T
 
G
R
 
T
P
 
P
A
 
A
-
 
R
-
 
K
-
 
R
-
 
G
H
 
N
L
 
R
R
 
R
Y
 
Y
S
 
C
K
 
P
V
 
I
A
 
P
D
 
D
R
 
V
I
 
L
C
 
C
E
 
E
Q
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
N
 
G
A
 
K
G
 
G
Y
 
W
Y
 
Y
R
 
Q
Y
 
Y
E
 
D
A
x
K
G
 
P
-
 
L
S
 
G
R
 
R
A
 
I
P
 
H
L
 
K
P
 
P
D
 
D
P
 
P
A
 
W
V
 
L
D
 
S
A
x
K
L
 
F
I
 
L
R
 
S
A
 
R
C
 
Y
A
 
R
A
 
K
E
x
T
A
 
H
G
 
H
I
 
I
E
 
E
R
 
P
R
 
R
E
 
T
V
 
I
S
 
S
D
 
Q
E
 
D
E
 
E
I
 
I
V
 
L
E
 
E
R
 
R
C
 
C
M
 
L
L
 
Y
A
 
S
L
 
L
A
 
I
N
 
N
E
 
E
G
 
A
A
 
F
R
 
R
I
 
I
L
 
L
E
 
G
E
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
A
R
 
S
A
 
P
A
 
E
D
 
H
I
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
V
 
L
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
W
P
 
P
A
 
R
W
 
H
R
 
K
G
 
G
G
 
G
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
 
Y
A
 
A
E
 
S
T
 
T
I
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
P
R
 
T
T
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
K
I
 
L
R
 
Q
A
 
K
L
 
Y
N
 
Y
A
 
R
I
 
Q
H
 
N
G
 
P
E
 
D
-
 
I
-
 
P
H
 
Q
W
 
L
T
 
E
P
 
P
A
 
S
P
 
D
L
 
Y
L
 
L
V
 
K
R
 
K
L
 
L
V
 
A
A
 
S
Q
 
Q
G
 
G

3zwaA Crystal structure of rat peroxisomal multifunctional enzyme type 1 (rpmfe1) complexed with 3s-hydroxy-hexanoyl-coa (see paper)
46% identity, 97% coverage: 12:689/696 of query aligns to 17:710/727 of 3zwaA

query
sites
3zwaA
I
 
L
A
 
A
I
 
M
L
 
I
L
 
R
L
 
L
D
 
C
N
 
N
P
 
P
P
 
P
V
|
V
N
 
N
G
 
A
L
 
V
G
 
S
D
 
P
T
 
T
V
 
V
R
 
I
L
 
R
G
 
E
L
 
V
F
 
R
D
 
N
G
 
G
I
 
L
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
T
 
G
Q
 
S
D
 
D
D
 
H
A
 
T
V
 
V
A
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
C
G
 
G
A
 
A
G
 
N
K
 
G
V
 
N
F
 
F
C
 
C
G
x
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
R
 
H
Q
 
G
F
|
F
N
 
S
A
 
A
P
 
F
A
 
T
A
 
P
S
 
G
A
 
L
Q
 
-
P
 
-
T
 
A
L
 
L
R
x
G
Q
 
S
V
 
L
I
 
V
A
 
D
R
 
E
I
 
I
E
 
Q
Q
 
R
S
 
Y
A
 
Q
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
H
 
Q
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
|
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
M
 
L
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
C
H
 
H
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
A
D
 
K
A
 
A
S
x
R
L
 
V
G
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
N
 
T
L
|
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
P
|
P
G
|
G
G
 
A
G
 
R
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
V
I
 
V
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
V
A
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
L
I
 
I
Q
 
T
G
 
S
G
 
G
K
 
K
P
x
Y
V
 
L
R
 
S
G
 
A
D
 
D
K
 
E
A
 
A
V
 
L
A
 
R
L
 
L
G
 
G
M
 
I
A
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
V
I
 
V
D
 
K
G
 
S
D
 
D
P
 
P
L
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
M
 
I
A
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
R
 
K
V
 
I
A
 
I
G
 
D
L
 
K
P
 
P
G
 
I
A
 
E
H
 
P
P
 
R
V
 
R
I
 
I
A
 
F
R
 
N
R
 
K
P
 
P
C
 
V
A
 
P
D
 
S
A
 
L
A
 
P
G
 
N
V
 
M
D
 
D
-
 
S
-
 
V
F
 
F
A
 
A
A
 
E
R
 
A
S
 
I
A
 
A
A
 
K
V
 
V
S
 
R
A
 
K
K
 
Q
A
 
Y
R
 
P
N
 
G
A
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
P
R
 
E
A
 
T
A
 
C
I
 
V
A
 
R
C
 
S
V
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
S
T
 
V
R
 
K
L
 
H
P
 
P
I
 
Y
D
 
E
A
 
V
G
 
G
L
 
I
D
x
K
D
 
E
E
 
E
R
 
E
A
 
K
R
 
L
F
 
F
D
 
M
Q
 
Y
L
 
L
V
 
R
A
 
A
S
 
S
T
 
G
E
 
Q
S
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
H
 
Y
L
 
A
F
 
F
F
 
F
A
 
A
E
 
E
R
 
K
E
 
S
A
 
A
P
 
N
K
 
K
V
 
W
A
 
S
A
 
T
L
 
-
P
 
P
A
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
W
R
 
K
T
 
T
-
 
A
-
 
S
-
 
A
-
 
Q
-
 
P
V
 
V
A
 
S
R
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
L
G
 
G
T
 
T
M
 
M
G
 
G
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
A
M
 
I
A
 
S
F
 
F
A
 
A
N
 
R
A
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
S
V
 
V
T
 
V
L
 
A
L
 
V
E
 
E
Q
 
S
Q
 
D
Q
 
P
A
 
K
A
 
Q
L
 
L
D
 
D
R
 
A
G
 
A
L
 
K
A
 
K
M
 
I
I
 
I
R
 
T
R
 
F
N
 
T
Y
 
L
E
 
E
I
 
K
T
 
E
A
 
A
A
 
S
K
 
R
G
 
A
K
 
H
L
 
Q
T
 
N
A
 
G
Q
 
Q
E
 
A
I
 
S
A
 
A
Q
 
K
R
 
P
M
 
K
A
 
L
C
 
R
I
 
F
T
 
S
P
 
S
T
 
S
L
 
T
A
 
K
D
 
E
A
 
-
A
 
-
L
 
L
A
 
S
D
 
T
A
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
V
F
 
F
E
 
E
D
 
D
M
 
M
A
 
N
V
 
L
K
 
K
K
 
K
A
 
K
V
 
V
F
 
F
A
 
A
R
 
E
L
 
L
D
 
S
A
 
A
L
 
L
C
 
C
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
A
I
 
F
L
 
L
A
 
C
T
 
T
N
 
N
T
 
T
S
|
S
R
 
A
L
 
L
S
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
S
S
 
S
T
 
T
S
 
D
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
D
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
T
H
|
H
F
 
F
F
 
F
S
 
S
P
 
P
A
 
A
N
 
H
V
 
V
M
 
M
K
 
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
V
 
V
V
 
I
Q
 
P
G
 
S
E
 
R
R
 
Y
T
 
S
A
 
S
P
 
P
E
 
T
V
 
T
I
 
I
A
 
A
T
 
T
C
 
V
M
 
M
K
 
S
M
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
K
I
 
I
G
 
G
K
 
K
I
 
I
P
 
G
V
 
V
L
 
V
V
 
V
R
 
G
V
 
N
C
 
C
E
 
Y
G
 
G
F
 
F
V
 
V
G
 
G
N
|
N
R
 
R
M
 
M
L
 
L
T
 
A
P
 
P
Y
 
Y
W
 
Y
R
 
N
E
 
Q
A
 
G
G
 
F
F
 
F
L
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
S
S
 
K
P
 
P
Q
 
E
Q
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
L
T
 
E
R
 
E
F
 
F
G
 
G
M
 
F
A
 
K
M
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
F
A
 
R
M
 
V
A
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
A
G
 
G
M
 
L
D
 
D
I
 
V
N
 
G
W
 
W
A
 
K
T
 
I
R
 
R
K
 
K
-
 
G
-
 
Q
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
P
R
 
S
L
 
L
A
 
P
P
 
P
T
 
G
R
 
T
P
 
P
A
 
V
-
 
R
-
 
K
-
 
R
-
 
G
H
 
N
L
 
S
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
K
 
P
V
 
L
A
 
G
D
 
D
R
 
M
I
 
L
C
 
C
E
 
E
Q
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
N
 
G
A
 
K
G
 
G
Y
 
W
Y
 
Y
R
 
Q
Y
 
Y
E
 
D
A
 
K
G
 
P
-
 
L
S
 
G
R
 
R
A
 
I
P
 
H
L
 
K
P
 
P
D
 
D
P
 
P
A
 
W
V
 
L
D
 
S
A
 
T
L
 
F
I
 
L
R
 
S
A
 
Q
C
 
Y
A
 
R
A
 
E
E
 
V
A
 
H
G
 
H
I
 
I
E
 
E
R
 
Q
R
 
R
E
 
T
V
 
I
S
 
S
D
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
I
V
 
L
E
 
E
R
 
R
C
 
C
M
 
L
L
 
Y
A
 
S
L
 
L
A
 
I
N
 
N
E
 
E
G
 
A
A
 
F
R
 
R
I
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
M
A
 
A
R
 
A
R
 
R
A
 
P
A
 
E
D
 
H
I
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
V
 
L
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
W
P
 
P
A
 
R
W
 
H
R
 
K
G
 
G
G
 
G
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
 
Y
A
 
A
E
 
A
T
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
P
R
 
T
T
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
K
I
 
L
R
 
Q
A
 
K
L
 
Y
N
 
Y
A
 
R
I
 
Q
H
 
N
G
 
P
E
 
D
-
 
I
-
 
P
H
 
Q
W
 
L
T
 
E
P
 
P
A
 
S
P
 
D
L
 
Y
L
 
L
V
 
R
R
 
R
L
 
L
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G

3zw9A Crystal structure of rat peroxisomal multifunctional enzyme type 1 (rpmfe1) complexed with (2s,3s)-3-hydroxy-2- methylbutanoyl-coa (see paper)
46% identity, 97% coverage: 12:689/696 of query aligns to 14:707/723 of 3zw9A

query
sites
3zw9A
I
 
L
A
 
A
I
 
M
L
 
I
L
 
R
L
 
L
D
 
C
N
 
N
P
 
P
P
 
P
V
|
V
N
 
N
G
 
A
L
 
V
G
 
S
D
 
P
T
 
T
V
 
V
R
 
I
L
 
R
G
 
E
L
 
V
F
 
R
D
 
N
G
 
G
I
 
L
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
T
 
G
Q
 
S
D
 
D
D
 
H
A
 
T
V
 
V
A
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
C
G
 
G
A
 
A
G
 
N
K
 
G
V
 
N
F
 
F
C
 
C
G
x
A
G
|
G
A
|
A
D
 
D
I
|
I
R
 
H
Q
 
G
F
|
F
N
 
S
A
 
A
P
 
F
A
 
T
A
 
P
S
 
G
A
 
L
Q
 
-
P
 
-
T
 
A
L
 
L
R
x
G
Q
 
S
V
 
L
I
 
V
A
 
D
R
 
E
I
 
I
E
 
Q
Q
 
R
S
 
Y
A
 
Q
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
H
 
Q
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
M
 
L
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
C
H
 
H
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
A
D
 
K
A
 
A
S
 
R
L
 
V
G
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
N
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
P
|
P
G
|
G
G
 
A
G
 
R
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
V
I
 
V
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
V
A
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
L
I
 
I
Q
 
T
G
 
S
G
 
G
K
 
K
P
x
Y
V
 
L
R
 
S
G
 
A
D
 
D
K
 
E
A
 
A
V
 
L
A
 
R
L
 
L
G
 
G
M
 
I
A
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
V
I
 
V
D
 
K
G
 
S
D
 
D
P
 
P
L
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
M
 
I
A
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
R
 
K
V
 
I
A
 
I
G
 
D
L
 
K
P
 
P
G
 
I
A
 
E
H
 
P
P
 
R
V
 
R
I
 
I
A
 
F
R
 
N
R
 
K
P
 
P
C
 
V
A
 
P
D
 
S
A
 
L
A
 
P
G
 
N
V
 
M
D
 
D
-
 
S
-
 
V
F
 
F
A
 
A
A
 
E
R
 
A
S
 
I
A
 
A
A
 
K
V
 
V
S
 
R
A
 
K
K
 
Q
A
 
Y
R
 
P
N
 
G
A
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
P
R
 
E
A
 
T
A
 
C
I
 
V
A
 
R
C
 
S
V
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
S
T
 
V
R
 
K
L
 
H
P
 
P
I
 
Y
D
 
E
A
 
V
G
 
G
L
 
I
D
x
K
D
 
E
E
 
E
R
 
E
A
 
K
R
 
L
F
 
F
D
 
M
Q
 
Y
L
 
L
V
 
R
A
 
A
S
 
S
T
 
G
E
 
Q
S
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
H
 
Y
L
 
A
F
 
F
F
 
F
A
 
A
E
 
E
R
 
K
E
 
S
A
 
A
P
 
N
K
 
K
V
 
W
A
 
S
A
 
T
L
 
-
P
 
P
A
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
W
R
 
K
T
 
T
-
 
A
-
 
S
-
 
A
-
 
Q
-
 
P
V
 
V
A
 
S
R
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
V
L
|
L
G
|
G
A
 
L
G
|
G
T
|
T
M
|
M
G
 
G
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
A
M
 
I
A
 
S
F
 
F
A
 
A
N
 
R
A
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
S
V
 
V
T
 
V
L
 
A
L
 
V
E
|
E
Q
 
S
Q
 
D
Q
 
P
A
 
K
A
x
Q
L
 
L
D
 
D
R
 
A
G
 
A
L
 
K
A
 
K
M
 
I
I
 
I
R
 
T
R
 
F
N
 
T
Y
 
L
E
 
E
I
 
K
T
 
E
A
 
A
A
 
S
K
 
R
G
 
A
K
 
H
L
 
Q
T
 
N
A
 
G
Q
 
Q
E
 
A
I
 
S
A
 
A
Q
 
K
R
 
P
M
 
K
A
 
L
C
 
R
I
 
F
T
 
S
P
 
S
T
 
S
L
 
T
A
 
K
D
 
E
A
 
-
A
 
-
L
 
L
A
 
S
D
 
T
A
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
V
E
 
E
A
|
A
V
|
V
F
|
F
E
|
E
D
 
D
M
 
M
A
 
N
V
 
L
K
 
K
K
 
K
A
 
K
V
 
V
F
 
F
A
 
A
R
 
E
L
 
L
D
 
S
A
 
A
L
 
L
C
 
C
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
A
I
 
F
L
 
L
A
 
C
T
 
T
N
|
N
T
 
T
S
|
S
R
 
A
L
 
L
S
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
S
S
 
S
T
 
T
S
 
D
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
D
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
T
H
|
H
F
 
F
F
 
F
S
 
S
P
 
P
A
 
A
N
 
H
V
 
V
M
 
M
K
 
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
V
 
V
V
 
I
Q
 
P
G
 
S
E
 
R
R
 
Y
T
 
S
A
 
S
P
 
P
E
 
T
V
 
T
I
 
I
A
 
A
T
 
T
C
 
V
M
 
M
K
 
S
M
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
K
I
 
I
G
 
G
K
 
K
I
 
I
P
 
G
V
 
V
L
 
V
V
 
V
R
 
G
V
 
N
C
 
C
E
 
Y
G
 
G
F
 
F
V
 
V
G
 
G
N
|
N
R
 
R
M
 
M
L
 
L
T
 
A
P
 
P
Y
 
Y
W
 
Y
R
 
N
E
 
Q
A
 
G
G
 
F
F
 
F
L
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
S
S
 
K
P
 
P
Q
 
E
Q
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
L
T
 
E
R
 
E
F
 
F
G
 
G
M
 
F
A
 
K
M
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
F
A
 
R
M
 
V
A
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
A
G
 
G
M
 
L
D
 
D
I
 
V
N
 
G
W
 
W
A
 
K
T
 
I
R
 
R
K
 
K
-
 
G
-
 
Q
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
P
R
 
S
L
 
L
A
 
P
P
 
P
T
 
G
R
 
T
P
 
P
A
 
V
-
 
R
-
 
K
-
 
R
-
 
G
H
 
N
L
 
S
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
K
 
P
V
 
L
A
 
G
D
 
D
R
 
M
I
 
L
C
 
C
E
 
E
Q
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
N
 
G
A
 
K
G
 
G
Y
 
W
Y
 
Y
R
 
Q
Y
 
Y
E
 
D
A
 
K
G
 
P
-
 
L
S
 
G
R
 
R
A
 
I
P
 
H
L
 
K
P
 
P
D
 
D
P
 
P
A
 
W
V
 
L
D
 
S
A
 
T
L
 
F
I
 
L
R
 
S
A
 
Q
C
 
Y
A
 
R
A
 
E
E
 
V
A
 
H
G
 
H
I
 
I
E
 
E
R
 
Q
R
 
R
E
 
T
V
 
I
S
 
S
D
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
I
V
 
L
E
 
E
R
 
R
C
 
C
M
 
L
L
 
Y
A
 
S
L
 
L
A
 
I
N
 
N
E
 
E
G
 
A
A
 
F
R
 
R
I
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
M
A
 
A
R
 
A
R
 
R
A
 
P
A
 
E
D
 
H
I
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
V
 
L
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
W
P
 
P
A
 
R
W
 
H
R
 
K
G
 
G
G
 
G
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
 
Y
A
 
A
E
 
A
T
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
P
R
 
T
T
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
K
I
 
L
R
 
Q
A
 
K
L
 
Y
N
 
Y
A
 
R
I
 
Q
H
 
N
G
 
P
E
 
D
-
 
I
-
 
P
H
 
Q
W
 
L
T
 
E
P
 
P
A
 
S
P
 
D
L
 
Y
L
 
L
V
 
R
R
 
R
L
 
L
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G

5omoA Crystal structure of rat peroxisomal multifunctional enzyme type-1 (rpmfe1) complexed with with 3s-hydroxy-decanoyl-coa and 3-keto- decanoyl-coa
46% identity, 97% coverage: 12:689/696 of query aligns to 16:709/725 of 5omoA

query
sites
5omoA
I
 
L
A
 
A
I
 
M
L
 
I
L
 
R
L
 
L
D
 
C
N
 
N
P
 
P
P
|
P
V
|
V
N
 
N
G
x
A
L
 
V
G
 
S
D
x
P
T
 
T
V
 
V
R
 
I
L
 
R
G
 
E
L
 
V
F
 
R
D
 
N
G
 
G
I
 
L
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
T
 
G
Q
 
S
D
 
D
D
 
H
A
 
T
V
 
V
A
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
C
G
 
G
A
 
A
G
 
N
K
 
G
V
 
N
F
 
F
C
 
C
G
x
A
G
 
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
R
 
H
Q
 
G
F
|
F
N
 
S
A
 
A
P
 
F
A
 
T
A
 
P
S
 
G
A
 
L
Q
 
-
P
 
-
T
 
A
L
 
L
R
x
G
Q
 
S
V
 
L
I
 
V
A
 
D
R
 
E
I
 
I
E
 
Q
Q
 
R
S
 
Y
A
 
Q
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
H
 
Q
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
|
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
M
 
L
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
C
H
 
H
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
A
D
 
K
A
 
A
S
 
R
L
 
V
G
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
N
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
P
|
P
G
|
G
G
 
A
G
 
R
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
V
I
 
V
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
V
A
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
L
I
 
I
Q
 
T
G
 
S
G
 
G
K
 
K
P
x
Y
V
 
L
R
 
S
G
 
A
D
 
D
K
 
E
A
 
A
V
 
L
A
 
R
L
 
L
G
 
G
M
 
I
A
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
V
I
 
V
D
 
K
G
 
S
D
 
D
P
 
P
L
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
M
 
I
A
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
R
 
K
V
 
I
A
 
I
G
 
D
L
 
K
P
 
P
G
 
I
A
 
E
H
 
P
P
 
R
V
 
R
I
 
I
A
 
F
R
 
N
R
 
K
P
 
P
C
 
V
A
 
P
D
 
S
A
 
L
A
 
P
G
 
N
V
 
M
D
 
D
-
 
S
-
 
V
F
 
F
A
 
A
A
 
E
R
 
A
S
 
I
A
 
A
A
 
K
V
 
V
S
 
R
A
 
K
K
 
Q
A
 
Y
R
 
P
N
 
G
A
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
P
R
 
E
A
 
T
A
 
C
I
 
V
A
 
R
C
 
S
V
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
S
T
 
V
R
 
K
L
 
H
P
 
P
I
 
Y
D
 
E
A
 
V
G
 
G
L
 
I
D
x
K
D
 
E
E
 
E
R
 
E
A
 
K
R
 
L
F
|
F
D
 
M
Q
 
Y
L
 
L
V
 
R
A
 
A
S
 
S
T
 
G
E
 
Q
S
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
H
 
Y
L
 
A
F
 
F
F
 
F
A
 
A
E
 
E
R
x
K
E
 
S
A
 
A
P
 
N
K
 
K
V
 
W
A
 
S
A
 
T
L
 
-
P
 
P
A
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
W
R
 
K
T
 
T
-
 
A
-
 
S
-
 
A
-
 
Q
-
 
P
V
 
V
A
 
S
R
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
L
G
 
G
T
 
T
M
 
M
G
 
G
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
A
M
 
I
A
 
S
F
 
F
A
 
A
N
 
R
A
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
S
V
 
V
T
 
V
L
 
A
L
 
V
E
 
E
Q
 
S
Q
 
D
Q
 
P
A
 
K
A
 
Q
L
 
L
D
 
D
R
 
A
G
 
A
L
 
K
A
 
K
M
 
I
I
 
I
R
 
T
R
 
F
N
 
T
Y
 
L
E
 
E
I
 
K
T
 
E
A
 
A
A
 
S
K
 
R
G
 
A
K
 
H
L
 
Q
T
 
N
A
 
G
Q
 
Q
E
 
A
I
 
S
A
 
A
Q
 
K
R
 
P
M
 
K
A
 
L
C
 
R
I
 
F
T
 
S
P
 
S
T
 
S
L
 
T
A
 
K
D
 
E
A
 
-
A
 
-
L
 
L
A
 
S
D
 
T
A
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
V
F
 
F
E
 
E
D
 
D
M
 
M
A
 
N
V
 
L
K
 
K
K
 
K
A
 
K
V
 
V
F
 
F
A
 
A
R
 
E
L
 
L
D
 
S
A
 
A
L
 
L
C
 
C
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
A
I
 
F
L
 
L
A
 
C
T
 
T
N
 
N
T
 
T
S
|
S
R
 
A
L
 
L
S
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
S
S
 
S
T
 
T
S
 
D
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
D
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
T
H
|
H
F
 
F
F
 
F
S
 
S
P
 
P
A
 
A
N
 
H
V
 
V
M
 
M
K
 
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
V
 
V
V
 
I
Q
 
P
G
 
S
E
 
R
R
 
Y
T
 
S
A
 
S
P
 
P
E
 
T
V
 
T
I
 
I
A
 
A
T
 
T
C
 
V
M
 
M
K
 
S
M
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
K
I
 
I
G
 
G
K
 
K
I
 
I
P
 
G
V
 
V
L
 
V
V
 
V
R
 
G
V
 
N
C
 
C
E
 
Y
G
 
G
F
 
F
V
 
V
G
 
G
N
|
N
R
 
R
M
 
M
L
 
L
T
 
A
P
 
P
Y
 
Y
W
 
Y
R
 
N
E
 
Q
A
 
G
G
 
F
F
 
F
L
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
S
S
 
K
P
 
P
Q
 
E
Q
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
L
T
 
E
R
 
E
F
 
F
G
 
G
M
 
F
A
x
K
M
|
M
G
 
G
P
 
P
L
 
F
A
 
R
M
x
V
A
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
A
G
 
G
M
 
L
D
 
D
I
 
V
N
 
G
W
 
W
A
 
K
T
 
I
R
 
R
K
 
K
-
 
G
-
 
Q
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
P
R
 
S
L
 
L
A
 
P
P
 
P
T
 
G
R
 
T
P
 
P
A
 
V
-
 
R
-
 
K
-
 
R
-
 
G
H
 
N
L
 
S
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
K
 
P
V
 
L
A
 
G
D
 
D
R
 
M
I
 
L
C
 
C
E
 
E
Q
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
N
 
G
A
 
K
G
 
G
Y
 
W
Y
 
Y
R
 
Q
Y
 
Y
E
 
D
A
 
K
G
 
P
-
 
L
S
 
G
R
 
R
A
 
I
P
 
H
L
 
K
P
 
P
D
 
D
P
 
P
A
 
W
V
 
L
D
 
S
A
 
T
L
 
F
I
 
L
R
 
S
A
 
Q
C
 
Y
A
 
R
A
 
E
E
 
V
A
 
H
G
 
H
I
 
I
E
 
E
R
 
Q
R
 
R
E
 
T
V
 
I
S
 
S
D
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
I
V
 
L
E
 
E
R
 
R
C
 
C
M
 
L
L
 
Y
A
 
S
L
 
L
A
 
I
N
 
N
E
 
E
G
 
A
A
 
F
R
 
R
I
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
M
A
 
A
R
 
A
R
 
R
A
 
P
A
 
E
D
 
H
I
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
V
 
L
H
 
H
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
F
 
W
P
 
P
A
 
R
W
 
H
R
 
K
G
 
G
G
 
G
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
 
Y
A
 
A
E
 
A
T
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
P
R
 
T
T
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
K
I
 
L
R
 
Q
A
 
K
L
 
Y
N
 
Y
A
 
R
I
 
Q
H
 
N
G
 
P
E
 
D
-
 
I
-
 
P
H
 
Q
W
 
L
T
 
E
P
 
P
A
 
S
P
 
D
L
 
Y
L
 
L
V
 
R
R
 
R
L
 
L
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G

5mgbA Crystal structure of rat peroxisomal multifunctional enzyme type-1 (rpmfe1) complexed with acetoacetyl-coa and NAD (see paper)
46% identity, 97% coverage: 12:689/696 of query aligns to 16:709/725 of 5mgbA

query
sites
5mgbA
I
 
L
A
 
A
I
 
M
L
 
I
L
 
R
L
 
L
D
 
C
N
 
N
P
 
P
P
|
P
V
|
V
N
 
N
G
 
A
L
 
V
G
 
S
D
 
P
T
 
T
V
 
V
R
 
I
L
 
R
G
 
E
L
 
V
F
 
R
D
 
N
G
 
G
I
 
L
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
T
 
G
Q
 
S
D
 
D
D
 
H
A
 
T
V
 
V
A
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
C
G
 
G
A
 
A
G
 
N
K
 
G
V
 
N
F
 
F
C
 
C
G
x
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
R
 
H
Q
 
G
F
|
F
N
 
S
A
 
A
P
 
F
A
 
T
A
 
P
S
 
G
A
 
L
Q
 
-
P
 
-
T
 
A
L
 
L
R
x
G
Q
 
S
V
 
L
I
 
V
A
 
D
R
 
E
I
 
I
E
 
Q
Q
 
R
S
 
Y
A
 
Q
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
H
 
Q
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
M
 
L
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
C
H
 
H
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
A
D
 
K
A
 
A
S
 
R
L
 
V
G
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
N
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
P
|
P
G
|
G
G
 
A
G
 
R
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
V
I
 
V
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
V
A
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
L
I
 
I
Q
 
T
G
 
S
G
 
G
K
 
K
P
x
Y
V
 
L
R
 
S
G
 
A
D
 
D
K
 
E
A
 
A
V
 
L
A
 
R
L
 
L
G
 
G
M
 
I
A
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
V
I
 
V
D
 
K
G
 
S
D
 
D
P
 
P
L
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
M
 
I
A
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
R
 
K
V
 
I
A
 
I
G
 
D
L
 
K
P
 
P
G
 
I
A
 
E
H
 
P
P
 
R
V
 
R
I
 
I
A
 
F
R
 
N
R
 
K
P
 
P
C
 
V
A
 
P
D
 
S
A
 
L
A
 
P
G
 
N
V
 
M
D
 
D
-
 
S
-
 
V
F
 
F
A
 
A
A
 
E
R
 
A
S
 
I
A
 
A
A
 
K
V
 
V
S
 
R
A
 
K
K
 
Q
A
 
Y
R
 
P
N
 
G
A
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
P
R
 
E
A
 
T
A
 
C
I
 
V
A
 
R
C
 
S
V
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
S
T
 
V
R
 
K
L
 
H
P
 
P
I
 
Y
D
 
E
A
 
V
G
 
G
L
 
I
D
x
K
D
 
E
E
 
E
R
 
E
A
 
K
R
 
L
F
 
F
D
 
M
Q
 
Y
L
 
L
V
 
R
A
 
A
S
 
S
T
 
G
E
 
Q
S
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
H
 
Y
L
 
A
F
 
F
F
 
F
A
 
A
E
 
E
R
 
K
E
 
S
A
 
A
P
 
N
K
 
K
V
 
W
A
 
S
A
 
T
L
 
-
P
 
P
A
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
W
R
 
K
T
 
T
-
 
A
-
 
S
-
 
A
-
 
Q
-
 
P
V
 
V
A
 
S
R
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
V
L
|
L
G
|
G
A
 
L
G
|
G
T
|
T
M
|
M
G
 
G
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
A
M
 
I
A
 
S
F
 
F
A
 
A
N
 
R
A
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
S
V
 
V
T
 
V
L
 
A
L
 
V
E
|
E
Q
x
S
Q
 
D
Q
 
P
A
 
K
A
x
Q
L
 
L
D
 
D
R
 
A
G
 
A
L
 
K
A
 
K
M
 
I
I
 
I
R
 
T
R
 
F
N
 
T
Y
 
L
E
 
E
I
 
K
T
 
E
A
 
A
A
 
S
K
 
R
G
 
A
K
 
H
L
 
Q
T
 
N
A
 
G
Q
 
Q
E
 
A
I
 
S
A
 
A
Q
 
K
R
 
P
M
 
K
A
 
L
C
 
R
I
 
F
T
 
S
P
 
S
T
 
S
L
 
T
A
 
K
D
 
E
A
 
-
A
 
-
L
 
L
A
 
S
D
 
T
A
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
V
E
 
E
A
 
A
V
|
V
F
|
F
E
|
E
D
 
D
M
 
M
A
 
N
V
 
L
K
 
K
K
 
K
A
 
K
V
 
V
F
 
F
A
 
A
R
 
E
L
 
L
D
 
S
A
 
A
L
 
L
C
 
C
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
A
I
 
F
L
 
L
A
 
C
T
 
T
N
|
N
T
 
T
S
|
S
R
 
A
L
 
L
S
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
S
S
 
S
T
 
T
S
 
D
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
D
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
T
H
|
H
F
 
F
F
 
F
S
 
S
P
 
P
A
 
A
N
 
H
V
 
V
M
 
M
K
 
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
V
 
V
V
 
I
Q
 
P
G
 
S
E
 
R
R
 
Y
T
 
S
A
 
S
P
 
P
E
 
T
V
 
T
I
 
I
A
 
A
T
 
T
C
 
V
M
 
M
K
 
S
M
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
K
I
 
I
G
 
G
K
 
K
I
 
I
P
 
G
V
 
V
L
 
V
V
 
V
R
 
G
V
 
N
C
 
C
E
 
Y
G
 
G
F
 
F
V
 
V
G
 
G
N
|
N
R
 
R
M
 
M
L
 
L
T
 
A
P
 
P
Y
 
Y
W
 
Y
R
 
N
E
 
Q
A
 
G
G
 
F
F
 
F
L
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
S
S
 
K
P
 
P
Q
 
E
Q
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
L
T
 
E
R
 
E
F
 
F
G
 
G
M
 
F
A
 
K
M
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
F
A
 
R
M
 
V
A
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
A
G
 
G
M
 
L
D
 
D
I
 
V
N
 
G
W
 
W
A
 
K
T
 
I
R
 
R
K
 
K
-
 
G
-
 
Q
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
P
R
 
S
L
 
L
A
 
P
P
 
P
T
 
G
R
 
T
P
 
P
A
 
V
-
 
R
-
 
K
-
 
R
-
 
G
H
 
N
L
 
S
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
K
 
P
V
 
L
A
 
G
D
 
D
R
 
M
I
 
L
C
 
C
E
 
E
Q
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
N
 
G
A
 
K
G
 
G
Y
 
W
Y
 
Y
R
 
Q
Y
 
Y
E
 
D
A
 
K
G
 
P
-
 
L
S
 
G
R
 
R
A
 
I
P
 
H
L
 
K
P
 
P
D
 
D
P
 
P
A
 
W
V
 
L
D
 
S
A
 
T
L
 
F
I
 
L
R
 
S
A
 
Q
C
 
Y
A
 
R
A
 
E
E
 
V
A
 
H
G
 
H
I
 
I
E
 
E
R
 
Q
R
 
R
E
 
T
V
 
I
S
 
S
D
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
I
V
 
L
E
 
E
R
 
R
C
 
C
M
 
L
L
 
Y
A
 
S
L
 
L
A
 
I
N
 
N
E
 
E
G
 
A
A
 
F
R
 
R
I
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
M
A
 
A
R
 
A
R
 
R
A
 
P
A
 
E
D
 
H
I
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
V
 
L
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
W
P
 
P
A
 
R
W
 
H
R
 
K
G
 
G
G
 
G
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
 
Y
A
 
A
E
 
A
T
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
P
R
 
T
T
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
K
I
 
L
R
 
Q
A
 
K
L
 
Y
N
 
Y
A
 
R
I
 
Q
H
 
N
G
 
P
E
 
D
-
 
I
-
 
P
H
 
Q
W
 
L
T
 
E
P
 
P
A
 
S
P
 
D
L
 
Y
L
 
L
V
 
R
R
 
R
L
 
L
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G

3zwcA Crystal structure of rat peroxisomal multifunctional enzyme type 1 (rpmfe1) complexed with 3s-hydroxy-decanoyl-coa (see paper)
46% identity, 97% coverage: 12:689/696 of query aligns to 16:709/725 of 3zwcA

query
sites
3zwcA
I
 
L
A
 
A
I
 
M
L
 
I
L
 
R
L
 
L
D
 
C
N
 
N
P
 
P
P
 
P
V
|
V
N
 
N
G
 
A
L
 
V
G
 
S
D
 
P
T
 
T
V
 
V
R
 
I
L
 
R
G
 
E
L
 
V
F
 
R
D
 
N
G
 
G
I
 
L
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
T
 
G
Q
 
S
D
 
D
D
 
H
A
 
T
V
 
V
A
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
C
G
 
G
A
 
A
G
 
N
K
 
G
V
 
N
F
 
F
C
 
C
G
x
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
R
 
H
Q
 
G
F
|
F
N
 
S
A
 
A
P
 
F
A
 
T
A
 
P
S
x
G
A
x
L
Q
 
-
P
 
-
T
 
A
L
|
L
R
x
G
Q
 
S
V
 
L
I
 
V
A
 
D
R
 
E
I
 
I
E
 
Q
Q
 
R
S
 
Y
A
 
Q
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
H
 
Q
G
 
G
V
|
V
A
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
M
 
L
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
C
H
 
H
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
A
D
 
K
A
 
A
S
 
R
L
 
V
G
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
N
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
P
|
P
G
|
G
G
 
A
G
 
R
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
V
I
 
V
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
V
A
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
L
I
 
I
Q
 
T
G
 
S
G
 
G
K
 
K
P
 
Y
V
 
L
R
 
S
G
 
A
D
 
D
K
 
E
A
 
A
V
 
L
A
 
R
L
 
L
G
 
G
M
 
I
A
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
V
I
 
V
D
 
K
G
 
S
D
 
D
P
 
P
L
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
M
 
I
A
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
R
 
K
V
 
I
A
 
I
G
 
D
L
 
K
P
 
P
G
 
I
A
 
E
H
 
P
P
 
R
V
 
R
I
 
I
A
 
F
R
 
N
R
 
K
P
 
P
C
 
V
A
 
P
D
 
S
A
 
L
A
 
P
G
 
N
V
 
M
D
 
D
-
 
S
-
 
V
F
 
F
A
 
A
A
 
E
R
 
A
S
 
I
A
 
A
A
 
K
V
 
V
S
 
R
A
 
K
K
 
Q
A
 
Y
R
 
P
N
 
G
A
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
P
R
 
E
A
 
T
A
 
C
I