SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS22655 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS22655 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3cb3A Crystal structure of l-talarate dehydratase from polaromonas sp. Js666 complexed with mg and l-glucarate
83% identity, 97% coverage: 12:384/385 of query aligns to 1:373/373 of 3cb3A

query
sites
3cb3A
N
 
S
D
 
D
N
 
R
I
 
I
A
 
T
S
 
W
I
 
V
R
 
R
L
 
I
S
 
S
S
 
S
V
 
C
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
A
T
 
T
P
 
P
I
 
I
S
 
S
D
 
D
A
 
A
K
|
K
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
K
 
K
P
 
P
M
 
M
T
 
T
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
I
L
 
L
F
 
F
A
 
A
E
 
E
I
 
I
E
 
E
T
 
T
E
 
A
G
 
G
G
 
G
D
 
H
K
 
Q
G
 
G
L
 
L
G
 
G
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
A
x
S
K
 
K
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
D
A
 
P
N
 
S
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
K
L
 
L
W
 
W
N
 
D
K
 
K
L
 
L
I
 
C
W
 
W
A
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
S
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
A
F
 
F
D
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
L
 
L
K
 
K
A
 
A
R
 
K
R
 
R
A
 
A
N
 
G
L
 
L
P
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
S
H
 
Y
R
 
R
D
 
D
S
 
S
V
 
V
K
 
R
C
 
C
Y
 
Y
N
 
N
T
|
T
S
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
L
 
L
H
 
H
T
 
T
P
 
P
L
 
I
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
L
 
M
M
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
S
K
 
A
S
 
S
V
 
I
E
 
E
K
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
I
K
|
K
L
 
L
K
|
K
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
C
 
G
A
 
A
A
 
L
D
 
D
I
 
I
Q
 
A
R
 
R
V
 
V
E
 
T
T
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
K
H
 
H
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
A
F
 
V
A
 
P
L
 
L
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
A
N
|
N
Q
 
Q
Q
 
Q
W
 
W
D
 
D
R
 
R
P
 
P
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
M
 
M
C
 
C
R
 
R
I
 
I
L
 
F
E
 
E
Q
 
P
F
 
F
N
 
N
L
 
L
I
 
V
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
S
 
H
E
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
|
A
A
 
L
Q
 
Q
F
|
F
D
 
D
T
 
T
P
 
P
I
 
I
A
 
A
T
 
T
G
|
G
E
|
E
M
 
M
L
 
L
T
 
T
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
H
W
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
I
R
 
R
H
 
H
R
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
M
|
M
P
 
P
D
|
D
G
 
A
P
 
P
R
 
R
V
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
L
 
L
T
 
K
V
 
I
A
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
A
D
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
L
M
 
M
I
 
L
A
 
A
P
 
P
H
|
H
F
|
F
A
|
A
M
 
M
E
 
E
L
 
L
H
 
H
V
 
V
H
 
H
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
E
 
E
P
 
P
W
 
W
V
 
V
E
|
E
H
 
H
F
 
F
E
 
E
W
 
W
L
 
L
E
 
E
P
 
P
L
 
L
F
 
F
N
 
N
E
 
E
R
 
R
L
 
I
E
 
E
I
 
I
K
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
R
M
 
M
L
 
L
V
 
V
P
 
P
T
 
T
R
 
R
P
 
P
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
L
S
 
T
L
 
L
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
A
 
K
G
 
A
W
 
W
T
 
T
R
 
R
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
E
 
Q
F
 
V
G
 
G
A
 
T
K
 
R

2og9A Crystal structure of mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme from polaromonas sp. Js666
80% identity, 97% coverage: 12:384/385 of query aligns to 2:362/363 of 2og9A

query
sites
2og9A
N
 
S
D
 
D
N
 
R
I
 
I
A
 
T
S
 
W
I
 
V
R
 
R
L
 
I
S
 
S
S
 
S
V
 
C
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
A
T
 
T
P
 
P
I
 
I
S
 
-
D
 
-
A
 
-
K
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
Q
 
-
K
 
-
P
 
-
M
 
M
T
 
T
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
I
L
 
L
F
 
F
A
 
A
E
 
E
I
 
I
E
 
E
T
 
T
E
 
A
G
 
G
G
 
G
D
 
H
K
 
Q
G
 
G
L
 
L
G
 
G
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
A
x
S
K
 
K
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
D
A
 
P
N
 
S
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
K
L
 
L
W
 
W
N
 
D
K
 
K
L
 
L
I
 
C
W
 
W
A
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
S
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
A
F
 
F
D
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
L
 
L
K
 
K
A
 
A
R
 
K
R
 
R
A
 
A
N
 
G
L
 
L
P
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
S
H
 
Y
R
 
R
D
 
D
S
 
S
V
 
V
K
 
R
C
 
C
Y
 
Y
N
 
N
T
|
T
S
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
L
 
L
H
 
H
T
 
T
P
 
P
L
 
I
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
L
 
M
M
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
S
K
 
A
S
 
S
V
 
I
E
 
E
K
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
I
K
|
K
L
 
L
K
|
K
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
C
 
G
A
 
A
A
 
L
D
 
D
I
 
I
Q
 
A
R
 
R
V
 
V
E
 
T
T
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
K
H
 
H
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
A
F
 
V
A
 
P
L
 
L
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
A
N
|
N
Q
 
Q
Q
 
Q
W
 
W
D
 
D
R
 
R
P
 
P
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
M
 
M
C
 
C
R
 
R
I
 
I
L
 
F
E
 
E
Q
 
P
F
 
F
N
 
N
L
 
L
I
 
V
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
S
 
H
E
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
|
A
A
 
L
Q
 
Q
F
|
F
D
 
D
T
 
T
P
 
P
I
 
I
A
 
A
T
 
T
G
|
G
E
|
E
M
 
M
L
 
L
T
 
T
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
H
W
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
I
R
 
R
H
 
H
R
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
M
|
M
P
 
P
D
|
D
G
 
A
P
 
P
R
 
R
V
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
L
 
L
T
 
K
V
 
I
A
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
A
D
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
L
M
 
M
I
 
L
A
 
A
P
 
P
H
|
H
F
|
F
A
|
A
M
 
M
E
 
E
L
 
L
H
 
H
V
 
V
H
 
H
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
E
 
E
P
 
P
W
 
W
V
 
V
E
|
E
H
 
H
F
 
F
E
 
E
W
 
W
L
 
L
E
 
E
P
 
P
L
 
L
F
 
F
N
 
N
E
 
E
R
 
R
L
 
I
E
 
E
I
 
I
K
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
R
M
 
M
L
 
L
V
 
V
P
 
P
T
 
T
R
 
R
P
 
P
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
L
S
 
T
L
 
L
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
A
 
K
G
 
A
W
 
W
T
 
T
R
 
R
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
E
 
Q
F
 
V
G
 
G
A
 
T
K
 
R

Q8ZL58 L-talarate/galactarate dehydratase; TalrD/GalrD; StTGD; EC 4.2.1.156; EC 4.2.1.42 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
66% identity, 99% coverage: 2:384/385 of query aligns to 17:397/398 of Q8ZL58

query
sites
Q8ZL58
T
 
N
T
 
T
Q
 
R
H
 
T
Q
 
A
P
 
A
K
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
-
N
 
-
D
 
D
N
 
R
I
 
I
A
 
E
S
 
W
I
 
V
R
 
K
L
 
L
S
 
S
S
 
L
V
 
A
Y
 
F
L
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
A
T
 
T
P
 
P
I
 
V
S
 
S
D
|
D
A
|
A
K
|
K
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
K
 
K
P
 
P
M
 
L
T
 
T
E
 
E
I
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
I
F
 
I
A
 
A
E
 
E
I
 
I
E
 
R
T
 
S
E
 
R
G
 
D
G
 
G
D
 
F
K
 
E
G
 
G
L
 
V
G
 
G
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
A
 
S
K
|
K
R
|
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
Q
G
 
G
Q
 
I
F
 
Y
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
D
A
 
N
L
 
L
I
 
L
G
 
G
E
 
E
D
 
D
A
 
P
N
 
N
D
 
D
I
 
I
A
 
D
R
 
K
L
 
I
W
 
Y
N
 
T
K
 
K
L
 
L
I
 
L
W
 
W
A
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
R
S
 
S
G
 
G
L
 
M
A
 
A
T
 
V
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
G
 
S
A
 
P
F
 
I
D
 
D
V
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
L
 
M
K
 
K
A
 
A
R
 
K
R
 
R
A
 
A
N
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
H
R
 
R
D
 
D
S
 
S
V
 
V
K
 
Q
C
 
C
Y
 
Y
N
 
N
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
L
 
L
H
 
H
T
 
T
P
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
Q
L
 
V
L
 
L
M
 
K
N
 
N
A
 
V
S
 
V
K
 
I
S
 
S
V
 
R
E
 
E
K
 
N
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
I
K
|
K
L
 
L
K
|
K
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
D
 
N
C
 
C
A
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
I
Q
 
R
R
 
R
V
 
L
E
 
T
T
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
E
H
 
A
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
E
F
 
F
A
 
P
L
 
L
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
A
N
|
N
Q
 
Q
Q
 
Q
W
 
W
D
 
D
R
 
R
P
 
E
T
 
T
A
 
A
Q
 
I
R
 
R
M
 
M
C
 
G
R
 
R
I
 
K
L
 
M
E
 
E
Q
 
Q
F
 
F
N
 
N
L
 
L
I
 
I
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
S
 
I
E
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
A
F
 
L
D
 
D
T
 
T
P
 
P
I
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
E
|
E
M
 
M
L
 
L
T
 
T
S
 
S
V
 
F
A
 
R
E
 
E
H
 
H
W
 
E
D
 
Q
L
 
L
I
 
I
R
 
L
H
 
G
R
 
N
A
 
A
A
 
S
D
 
D
Y
 
F
L
 
V
M
 
Q
P
 
P
D
 
D
G
 
A
P
 
P
R
 
R
V
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
S
P
 
P
F
 
F
L
 
L
T
 
K
V
 
I
A
 
M
T
 
D
L
 
L
A
 
A
D
 
A
H
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
R
M
 
K
I
 
L
A
 
A
P
 
P
H
|
H
F
 
F
A
 
A
M
 
M
E
 
E
L
 
V
H
 
H
V
 
L
H
 
H
L
 
L
A
 
S
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
R
 
L
E
 
E
P
 
P
W
 
W
V
 
L
E
|
E
H
 
H
F
 
F
E
 
E
W
 
W
L
 
L
E
 
N
P
 
P
L
 
L
F
 
F
N
 
N
E
 
E
R
 
Q
L
 
L
E
 
E
I
 
L
K
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
R
M
 
M
L
 
W
V
 
I
P
 
S
T
 
D
R
 
R
P
 
H
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
F
S
 
T
L
 
L
S
 
S
G
 
E
Q
 
Q
V
 
A
A
 
R
G
 
R
W
 
W
T
 
T
R
 
Q
E
 
L
Q
 
T
A
 
C
E
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
K
K
 
R

2pp1A Crystal structure of l-talarate/galactarate dehydratase from salmonella typhimurium lt2 liganded with mg and l-lyxarohydroxamate (see paper)
66% identity, 99% coverage: 2:384/385 of query aligns to 14:394/395 of 2pp1A

query
sites
2pp1A
T
 
N
T
 
T
Q
 
R
H
 
T
Q
 
A
P
 
A
K
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
-
N
 
-
D
 
D
N
 
R
I
 
I
A
 
E
S
 
W
I
 
V
R
 
K
L
 
L
S
 
S
S
 
L
V
 
A
Y
 
F
L
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
A
T
 
T
P
 
P
I
 
V
S
 
S
D
|
D
A
 
A
K
|
K
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
K
 
K
P
 
P
M
 
L
T
 
T
E
 
E
I
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
I
F
 
I
A
 
A
E
 
E
I
 
I
E
 
R
T
 
S
E
 
R
G
 
D
G
 
G
D
 
F
K
 
E
G
 
G
L
 
V
G
 
G
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
A
x
S
K
|
K
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
Q
G
 
G
Q
 
I
F
 
Y
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
D
A
 
N
L
 
L
I
 
L
G
 
G
E
 
E
D
 
D
A
 
P
N
 
N
D
 
D
I
 
I
A
 
D
R
 
K
L
 
I
W
 
Y
N
 
T
K
 
K
L
 
L
I
 
L
W
 
W
A
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
R
S
 
S
G
 
G
L
 
M
A
 
A
T
 
V
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
G
 
S
A
 
P
F
 
I
D
 
D
V
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
L
 
M
K
 
K
A
 
A
R
 
K
R
 
R
A
 
A
N
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
H
R
 
R
D
 
D
S
 
S
V
 
V
K
 
Q
C
 
C
Y
 
Y
N
 
N
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
G
F
|
F
L
 
L
H
 
H
T
 
T
P
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
Q
L
 
V
L
 
L
M
 
K
N
 
N
A
 
V
S
 
V
K
 
I
S
 
S
V
 
R
E
 
E
K
 
N
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
I
K
|
K
L
 
L
K
|
K
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
D
 
N
C
 
C
A
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
I
Q
 
R
R
 
R
V
 
L
E
 
T
T
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
E
H
 
A
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
E
F
 
F
A
 
P
L
 
L
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
A
N
|
N
Q
 
Q
Q
 
Q
W
 
W
D
 
D
R
 
R
P
 
E
T
 
T
A
 
A
Q
 
I
R
 
R
M
 
M
C
 
G
R
 
R
I
 
K
L
 
M
E
 
E
Q
 
Q
F
 
F
N
 
N
L
 
L
I
 
I
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
S
 
I
E
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
A
F
 
L
D
 
D
T
 
T
P
 
P
I
 
I
A
 
A
T
 
T
G
|
G
E
|
E
M
 
M
L
 
L
T
 
T
S
 
S
V
 
F
A
 
R
E
 
E
H
 
H
W
 
E
D
 
Q
L
 
L
I
 
I
R
 
L
H
 
G
R
 
N
A
 
A
A
 
S
D
 
D
Y
 
F
L
 
V
M
 
Q
P
 
P
D
|
D
G
 
A
P
 
P
R
 
R
V
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
S
P
 
P
F
 
F
L
 
L
T
 
K
V
 
I
A
 
M
T
 
D
L
 
L
A
 
A
D
 
A
H
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
R
M
 
K
I
 
L
A
 
A
P
 
P
H
|
H
F
 
F
A
 
A
M
 
M
E
 
E
L
 
V
H
 
H
V
 
L
H
 
H
L
 
L
A
 
S
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
R
 
L
E
 
E
P
 
P
W
 
W
V
 
L
E
|
E
H
 
H
F
 
F
E
 
E
W
 
W
L
 
L
E
 
N
P
 
P
L
 
L
F
 
F
N
 
N
E
 
E
R
 
Q
L
 
L
E
 
E
I
 
L
K
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
R
M
 
M
L
 
W
V
 
I
P
 
S
T
 
D
R
 
R
P
 
H
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
F
S
 
T
L
 
L
S
 
S
G
 
E
Q
 
Q
V
 
A
A
 
R
G
 
R
W
 
W
T
 
T
R
 
Q
E
 
L
Q
 
T
A
 
C
E
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
K
K
 
R

2pp3A Crystal structure of l-talarate/galactarate dehydratase mutant k197a liganded with mg and l-glucarate (see paper)
66% identity, 99% coverage: 2:384/385 of query aligns to 14:394/395 of 2pp3A

query
sites
2pp3A
T
 
N
T
 
T
Q
 
R
H
 
T
Q
 
A
P
 
A
K
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
-
N
 
-
D
 
D
N
 
R
I
 
I
A
 
E
S
 
W
I
 
V
R
 
K
L
 
L
S
 
S
S
 
L
V
 
A
Y
 
F
L
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
A
T
 
T
P
 
P
I
 
V
S
 
S
D
|
D
A
 
A
K
|
K
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
K
 
K
P
 
P
M
 
L
T
 
T
E
 
E
I
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
I
F
 
I
A
 
A
E
 
E
I
 
I
E
 
R
T
 
S
E
 
R
G
 
D
G
 
G
D
 
F
K
 
E
G
 
G
L
 
V
G
 
G
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
A
x
S
K
|
K
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
Q
G
 
G
Q
 
I
F
 
Y
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
D
A
 
N
L
 
L
I
 
L
G
 
G
E
 
E
D
 
D
A
 
P
N
 
N
D
 
D
I
 
I
A
 
D
R
 
K
L
 
I
W
 
Y
N
 
T
K
 
K
L
 
L
I
 
L
W
 
W
A
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
R
S
 
S
G
 
G
L
 
M
A
 
A
T
 
V
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
G
 
S
A
 
P
F
 
I
D
 
D
V
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
L
 
M
K
 
K
A
 
A
R
 
K
R
 
R
A
 
A
N
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
H
R
 
R
D
 
D
S
 
S
V
 
V
K
 
Q
C
 
C
Y
 
Y
N
 
N
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
L
 
L
H
 
H
T
 
T
P
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
Q
L
 
V
L
 
L
M
 
K
N
 
N
A
 
V
S
 
V
K
 
I
S
 
S
V
 
R
E
 
E
K
 
N
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
I
K
|
K
L
 
L
K
x
A
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
D
 
N
C
 
C
A
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
I
Q
 
R
R
 
R
V
 
L
E
 
T
T
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
E
H
 
A
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
E
F
 
F
A
 
P
L
 
L
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
A
N
|
N
Q
 
Q
Q
 
Q
W
 
W
D
 
D
R
 
R
P
 
E
T
 
T
A
 
A
Q
 
I
R
 
R
M
 
M
C
 
G
R
 
R
I
 
K
L
 
M
E
 
E
Q
 
Q
F
 
F
N
 
N
L
 
L
I
 
I
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
S
 
I
E
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
A
F
 
L
D
 
D
T
 
T
P
 
P
I
 
I
A
 
A
T
 
T
G
|
G
E
|
E
M
 
M
L
 
L
T
 
T
S
 
S
V
 
F
A
 
R
E
 
E
H
 
H
W
 
E
D
 
Q
L
 
L
I
 
I
R
 
L
H
 
G
R
 
N
A
 
A
A
 
S
D
 
D
Y
 
F
L
 
V
M
 
Q
P
 
P
D
|
D
G
 
A
P
 
P
R
 
R
V
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
S
P
 
P
F
 
F
L
 
L
T
 
K
V
 
I
A
 
M
T
 
D
L
 
L
A
 
A
D
 
A
H
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
R
M
 
K
I
 
L
A
 
A
P
 
P
H
|
H
F
 
F
A
 
A
M
 
M
E
 
E
L
 
V
H
 
H
V
 
L
H
 
H
L
 
L
A
 
S
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
R
 
L
E
 
E
P
 
P
W
 
W
V
 
L
E
|
E
H
 
H
F
|
F
E
 
E
W
 
W
L
 
L
E
 
N
P
 
P
L
 
L
F
 
F
N
 
N
E
 
E
R
 
Q
L
 
L
E
 
E
I
 
L
K
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
R
M
 
M
L
 
W
V
 
I
P
 
S
T
 
D
R
 
R
P
 
H
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
F
S
 
T
L
 
L
S
 
S
G
 
E
Q
 
Q
V
 
A
A
 
R
G
 
R
W
 
W
T
 
T
R
 
Q
E
 
L
Q
 
T
A
 
C
E
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
K
K
 
R

4h19A Crystal structure of an enolase (mandelate racemase subgroup, target efi-502087) from agrobacterium tumefaciens, with bound mg and d- ribonohydroxamate, ordered loop
36% identity, 91% coverage: 14:362/385 of query aligns to 2:354/372 of 4h19A

query
sites
4h19A
N
 
K
I
 
I
A
 
T
S
 
A
I
 
V
R
 
E
L
 
P
S
 
F
S
 
I
V
 
L
Y
 
H
L
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
T
T
 
S
-
 
E
P
 
S
I
|
I
S
 
S
D
|
D
A
 
S
K
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
Q
 
T
K
x
H
P
 
S
M
 
I
T
 
T
E
 
H
I
 
W
A
 
G
I
 
V
L
 
V
F
 
G
A
 
A
E
 
K
I
 
I
E
 
T
T
 
T
E
 
S
G
 
D
G
 
G
D
 
I
K
 
E
G
 
G
L
 
Y
G
 
G
F
 
F
S
 
T
Y
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
G
G
x
T
P
x
H
G
 
A
Q
 
H
F
 
L
A
 
P
H
 
S
A
 
D
R
 
R
E
 
L
I
 
I
-
 
T
-
 
S
-
 
C
-
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
C
-
 
Y
A
 
A
P
 
P
A
 
L
L
 
L
I
 
L
G
 
G
E
 
E
D
 
D
A
 
A
N
 
S
D
 
D
I
 
H
A
 
S
R
 
R
L
 
L
W
 
W
N
 
T
K
 
K
L
 
L
I
 
A
-
 
R
-
 
Y
-
 
P
-
 
S
-
 
L
-
 
Q
W
 
W
A
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
V
G
 
G
R
 
R
S
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
T
T
 
H
Q
 
L
A
 
A
I
 
L
G
 
A
A
 
A
F
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
L
 
I
K
 
K
A
 
A
R
 
K
R
 
K
A
 
A
N
 
G
L
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
W
K
 
H
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
G
H
 
A
R
 
R
D
 
T
S
 
A
-
 
G
V
 
V
K
 
E
C
 
A
Y
 
Y
N
 
N
T
|
T
S
 
D
G
 
I
G
 
G
F
 
W
L
 
L
H
 
S
T
 
F
P
 
T
L
 
L
D
 
E
Q
 
D
L
 
L
L
 
L
M
 
A
N
 
G
A
 
S
S
 
A
K
 
R
S
 
A
V
 
V
E
 
E
K
 
E
-
 
D
G
 
G
I
 
F
G
 
T
G
 
R
I
 
L
K
|
K
L
 
I
K
|
K
V
 
V
G
 
G
Q
 
H
P
 
D
D
 
D
C
 
P
A
 
N
A
 
I
D
 
D
I
 
I
Q
 
A
R
 
R
V
 
L
E
 
T
T
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
E
H
 
R
L
 
V
G
 
D
D
 
S
G
 
A
F
 
V
A
 
R
L
 
I
M
 
A
V
 
I
D
|
D
A
 
G
N
|
N
Q
 
G
Q
 
K
W
 
W
D
 
D
R
 
L
P
 
P
T
 
T
A
 
C
Q
 
Q
R
 
R
M
 
F
C
 
C
R
 
A
I
 
A
L
 
A
E
 
K
Q
 
D
F
 
L
N
 
D
L
 
I
I
 
Y
W
 
W
I
 
F
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
D
 
W
A
 
Y
Y
 
D
D
 
D
S
 
V
E
 
T
G
 
S
H
 
H
A
 
A
A
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
R
Q
 
N
F
 
T
D
 
S
T
 
I
P
 
P
I
 
I
A
 
A
T
 
L
G
|
G
E
|
E
M
 
Q
L
 
L
T
 
Y
S
 
T
V
 
V
A
 
D
E
 
A
H
 
F
W
 
R
D
 
S
L
 
F
I
 
I
R
x
D
H
 
A
R
 
G
A
 
A
A
 
V
D
 
A
Y
 
Y
L
 
V
M
x
Q
P
 
P
D
|
D
G
 
V
P
 
T
R
 
R
V
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
T
P
 
E
F
 
Y
L
 
I
T
 
Q
V
 
V
A
 
A
T
 
D
L
 
L
A
 
A
D
 
L
H
 
A
A
x
H
G
 
R
L
 
L
M
 
P
I
 
V
A
 
V
P
 
P
H
|
H
F
x
A
A
x
G
-
 
E
-
 
M
M
 
S
E
 
Q
L
 
V
H
 
H
V
 
V
H
 
H
L
 
L
A
 
S
A
 
Y
A
 
W
Y
 
H
P
 
P
R
 
A
E
 
S
P
 
T
W
 
I
V
 
L
E
|
E
H
 
Y
F
 
I
E
 
P
W
 
W
L
 
I
E
 
K
P
 
D
L
 
H
F
 
F
N
 
E
E
 
E
R
 
P
L
 
I
E
 
H
I
 
V
K
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
V
M
 
Y
L
 
K
V
 
R
P
 
P
T
 
E
R
 
Q
P
 
P
G
 
G

Q9RKF7 3,6-anhydro-alpha-L-galactonate cycloisomerase; AHGA cycloisomerase; EC 5.5.1.25 from Streptomyces coelicolor (strain ATCC BAA-471 / A3(2) / M145)
35% identity, 93% coverage: 15:373/385 of query aligns to 2:356/361 of Q9RKF7

query
sites
Q9RKF7
I
 
I
A
 
E
S
 
R
I
 
V
R
 
R
L
 
T
S
 
D
S
 
L
V
 
Y
Y
 
R
L
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
P
T
 
T
P
 
R
I
 
L
S
 
T
D
 
D
A
 
S
K
 
T
V
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
Q
 
H
K
 
G
P
 
A
M
 
M
T
 
M
E
 
D
I
 
F
A
 
E
I
 
L
L
 
I
F
 
T
A
 
V
E
 
R
I
 
I
E
 
E
T
 
D
E
 
S
G
 
D
G
 
G
D
 
A
K
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
F
 
Y
S
 
T
Y
 
Y
A
 
T
K
 
V
R
 
N
A
 
H
G
 
G
G
 
G
P
 
A
G
 
A
Q
 
V
F
 
A
A
 
T
H
 
M
A
 
V
-
 
D
R
 
K
E
 
D
I
 
L
A
 
R
P
 
G
A
 
C
L
 
L
I
 
L
G
 
G
E
 
A
D
 
D
A
 
A
N
 
E
D
 
Q
I
 
I
A
 
E
R
 
K
L
 
I
W
 
W
N
 
Q
K
 
S
L
 
M
I
 
W
W
 
W
A
 
R
G
 
L
A
 
H
S
 
Y
V
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
G
G
 
G
L
 
H
A
 
A
T
 
T
Q
 
S
A
 
A
I
 
I
G
 
S
A
 
A
F
 
V
D
 
D
V
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
L
 
L
K
 
K
A
 
G
R
 
I
R
 
R
A
 
A
N
 
R
L
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
W
K
 
K
L
 
L
L
 
F
G
 
G
A
 
G
H
 
Y
R
 
D
D
 
P
S
 
V
V
 
V
K
 
P
C
 
V
Y
 
Y
N
 
-
T
 
-
S
 
A
G
 
G
G
 
G
F
 
I
-
 
D
L
 
L
H
 
E
T
 
L
P
 
P
L
 
V
D
 
A
Q
 
D
L
 
L
L
 
K
M
 
T
N
 
Q
A
 
A
S
 
D
K
 
R
S
 
F
V
 
L
E
 
A
K
 
G
G
 
G
I
 
F
G
 
R
G
 
A
I
 
I
K
 
K
L
 
M
K
 
K
V
 
V
G
 
G
Q
 
R
P
 
P
D
 
D
C
 
L
A
 
K
A
 
E
D
 
D
I
 
V
Q
 
D
R
 
R
V
 
V
E
 
S
T
 
A
V
 
L
R
 
R
K
 
E
H
 
H
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
S
F
 
F
A
 
P
L
 
L
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
A
N
 
N
Q
 
M
Q
 
K
W
 
W
D
 
T
R
 
V
P
 
D
T
 
G
A
 
A
Q
 
I
R
 
R
M
 
A
C
 
A
R
 
R
I
 
A
L
 
L
E
 
A
Q
 
P
F
 
F
N
 
D
L
 
L
I
 
H
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
T
D
 
I
A
 
P
Y
 
D
D
 
D
S
 
L
E
 
V
G
 
G
H
 
N
A
 
A
A
 
R
L
 
I
A
 
V
A
 
R
Q
 
E
F
 
S
D
 
G
T
 
H
P
 
T
I
 
I
A
 
A
T
 
G
G
 
G
E
|
E
M
 
N
L
 
L
T
 
H
S
 
T
V
 
L
A
 
Y
E
 
D
H
 
F
W
 
H
D
 
N
L
 
A
I
 
V
R
 
R
H
 
A
R
 
G
A
 
S
A
 
L
D
 
T
Y
 
L
L
 
P
M
 
E
P
 
P
D
 
D
G
 
V
P
 
S
R
 
N
V
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
Y
T
 
T
P
 
T
F
 
F
L
 
R
T
 
K
V
 
V
A
 
A
T
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
E
H
 
A
A
 
N
G
 
N
L
 
M
M
 
L
I
 
L
A
 
T
P
 
S
H
 
H
F
 
G
A
 
V
M
 
H
E
 
D
L
 
L
H
 
T
V
 
V
H
 
H
L
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
S
Y
 
V
P
 
P
R
 
H
E
 
R
P
 
T
W
 
Y
V
 
M
E
 
E
-
 
A
H
 
H
F
 
G
E
 
F
W
 
G
L
 
L
E
 
H
P
 
A
L
 
Y
F
 
M
N
 
A
E
 
E
R
 
P
L
 
M
E
 
A
I
 
V
K
 
T
D
 
D
G
 
G
R
 
C
M
 
V
L
 
S
V
 
A
P
 
P
T
 
D
R
 
R
P
 
P
G
 
G
I
 
H
G
 
G
V
 
V
S
 
V
L
 
L
S
 
D
G
 
F
Q
 
E
V
 
R
A
 
L
G
 
G

3ck5A Crystal structure of a racemase from streptomyces coelicolor a3(2) with bound magnesium
35% identity, 93% coverage: 15:373/385 of query aligns to 2:353/357 of 3ck5A

query
sites
3ck5A
I
 
I
A
 
E
S
 
R
I
 
V
R
 
R
L
 
T
S
 
D
S
 
L
V
 
Y
Y
 
R
L
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
P
T
 
T
P
 
R
I
 
L
S
x
T
D
 
D
A
 
S
K
 
T
V
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
Q
 
H
K
 
G
P
 
A
M
 
M
T
 
M
E
 
D
I
 
F
A
 
E
I
 
L
L
 
I
F
 
T
A
 
V
E
 
R
I
 
I
E
 
E
T
 
D
E
 
S
G
 
D
G
 
G
D
 
A
K
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
F
 
Y
S
 
T
Y
 
Y
A
x
T
K
 
V
R
 
N
A
 
H
G
 
G
G
 
G
P
 
A
G
 
A
Q
 
V
F
 
A
A
 
T
H
 
M
A
 
V
-
 
D
R
 
K
E
 
D
I
 
L
A
 
R
P
 
G
A
 
C
L
 
L
I
 
L
G
 
G
E
 
A
D
 
D
A
 
A
N
 
E
D
 
Q
I
 
I
A
 
E
R
 
K
L
 
I
W
 
W
N
 
Q
K
 
S
L
 
M
I
 
W
W
 
W
A
 
R
G
 
L
A
 
H
S
 
Y
V
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
G
G
 
G
L
 
H
A
 
A
T
 
T
Q
 
S
A
 
A
I
 
I
G
 
S
A
 
A
F
 
V
D
 
D
V
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
L
 
L
K
 
K
A
 
G
R
 
I
R
 
R
A
 
A
N
 
R
L
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
W
K
 
K
L
 
L
L
 
F
G
 
G
A
 
G
H
 
Y
R
 
D
D
 
P
S
 
V
V
 
V
K
 
P
C
 
V
Y
 
Y
N
 
-
T
 
-
S
 
A
G
|
G
G
 
G
F
 
I
-
 
D
L
 
L
H
 
E
T
 
L
P
 
P
L
 
V
D
 
A
Q
 
D
L
 
L
L
 
K
M
 
T
N
 
Q
A
 
A
S
 
D
K
 
R
S
 
F
V
 
L
E
 
A
K
 
G
G
 
G
I
 
F
G
 
R
G
 
A
I
 
I
K
|
K
L
 
M
K
|
K
V
 
V
G
 
G
Q
 
R
P
 
P
D
 
D
C
 
L
A
 
K
A
 
E
D
 
D
I
 
V
Q
 
D
R
 
R
V
 
V
E
 
S
T
 
A
V
 
L
R
 
R
K
 
E
H
 
H
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
S
F
 
F
A
 
P
L
 
L
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
A
N
|
N
Q
 
M
Q
 
K
W
 
W
D
 
T
R
 
V
P
 
D
T
 
G
A
 
A
Q
 
I
R
 
R
M
 
A
C
 
A
R
 
R
I
 
A
L
 
L
E
 
A
Q
 
P
F
 
F
N
 
D
L
 
L
I
 
H
W
 
W
I
|
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
T
D
 
I
A
 
P
Y
 
D
D
 
D
S
 
L
E
 
V
G
 
G
H
 
N
A
 
A
A
 
R
L
 
I
A
 
V
A
 
R
Q
 
E
F
 
S
D
 
G
T
 
H
P
 
T
I
|
I
A
 
A
T
 
G
G
|
G
E
|
E
M
 
N
L
 
L
T
 
H
S
 
T
V
 
L
A
 
Y
E
 
D
H
 
F
W
 
H
D
 
N
L
 
A
I
 
V
R
 
R
H
 
A
R
 
G
A
 
S
A
 
L
D
 
T
Y
 
L
L
 
P
M
x
E
P
 
P
D
|
D
G
 
V
P
 
S
R
 
N
V
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
Y
T
 
T
P
 
T
F
 
F
L
 
R
T
 
K
V
 
V
A
 
A
T
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
E
H
 
A
A
 
N
G
 
N
L
 
M
M
 
L
I
 
L
A
 
T
P
 
S
H
|
H
F
x
G
A
x
V
M
 
H
E
 
D
L
 
L
H
 
T
V
 
V
H
 
H
L
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
S
Y
 
V
P
 
P
R
 
H
E
 
R
P
 
T
W
x
Y
V
 
M
E
|
E
H
 
A
F
 
H
E
 
-
W
 
-
L
 
L
E
 
H
P
 
A
L
 
Y
F
 
M
N
 
A
E
 
E
R
 
P
L
 
M
E
 
A
I
 
V
K
 
T
D
 
D
G
 
G
R
 
C
M
 
V
L
 
S
V
 
A
P
 
P
T
 
D
R
 
R
P
 
P
G
 
G
I
 
H
G
 
G
V
 
V
S
 
V
L
 
L
S
 
D
G
 
F
Q
 
E
V
 
R
A
 
L
G
 
G

5xd8B Crystal structure analysis of 3,6-anhydro-l-galactonate cycloisomerase (see paper)
34% identity, 75% coverage: 82:368/385 of query aligns to 68:353/367 of 5xd8B

query
sites
5xd8B
E
 
D
I
 
I
A
 
Q
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
K
D
 
D
A
 
A
N
 
T
D
 
Q
I
 
I
A
 
E
R
 
E
L
 
I
W
 
Y
N
 
D
K
 
F
L
 
M
I
 
E
W
 
W
A
 
H
G
 
I
A
 
H
S
 
Y
V
 
V
G
 
G
R
 
R
S
 
G
G
 
G
L
 
I
A
 
S
T
 
T
Q
 
F
A
 
A
I
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
V
D
 
D
V
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
L
 
L
K
 
K
A
 
G
R
 
K
R
 
R
A
 
E
N
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
W
K
 
K
L
 
M
L
 
A
G
 
G
A
 
G
H
 
K
R
 
N
D
 
N
S
 
T
V
 
C
K
 
K
C
 
A
Y
 
Y
N
 
-
T
 
-
S
 
C
G
|
G
G
 
G
F
 
I
-
 
D
L
 
L
H
 
Q
T
 
F
P
 
P
L
 
L
D
 
E
Q
 
K
L
 
L
L
 
L
M
 
N
N
 
N
A
 
I
S
 
C
K
 
G
S
 
Y
V
 
L
E
 
E
K
 
S
G
 
G
I
 
F
G
 
N
G
 
A
I
 
V
K
|
K
L
 
I
K
|
K
V
 
I
G
 
G
Q
 
R
P
 
E
D
 
N
C
 
M
A
 
Q
A
 
E
D
 
D
I
 
I
Q
 
D
R
 
R
V
 
I
E
 
K
T
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
E
H
 
L
L
 
I
G
 
G
D
 
P
G
 
D
F
 
I
A
 
T
L
 
F
M
 
M
V
 
I
D
|
D
A
 
A
N
|
N
Q
 
Y
Q
 
S
W
 
L
D
 
T
R
 
V
P
 
E
T
 
Q
A
 
A
Q
 
I
R
 
K
M
 
L
C
 
S
R
 
K
I
 
A
L
 
V
E
 
E
Q
 
Q
F
 
Y
N
 
D
L
 
I
I
 
T
W
 
W
I
 
F
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
T
D
 
L
A
 
P
Y
 
D
D
 
D
S
 
Y
E
 
K
G
 
G
H
 
F
A
 
A
A
 
E
L
 
I
A
 
A
A
 
D
Q
 
N
F
 
T
D
 
A
T
 
I
P
 
P
I
 
L
A
 
A
T
 
M
G
|
G
E
|
E
M
 
N
L
 
L
T
 
H
S
 
T
V
 
I
A
 
H
E
 
E
H
 
F
W
 
G
D
 
Y
L
 
A
I
 
M
R
 
D
H
 
Q
R
 
A
A
 
K
A
 
L
D
 
G
Y
 
Y
L
 
C
M
x
Q
P
 
P
D
|
D
G
 
A
P
 
S
R
 
N
V
 
C
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
T
P
 
G
F
 
W
L
 
L
T
 
K
V
 
A
A
 
A
T
 
D
L
 
L
A
 
I
D
 
T
H
 
E
A
 
H
G
 
N
L
 
I
M
 
P
I
 
V
A
 
C
P
 
T
H
|
H
F
x
G
A
x
M
M
 
Q
E
 
E
L
 
L
H
 
H
V
 
V
H
 
S
L
 
L
A
 
V
A
 
S
A
 
A
Y
 
F
P
 
D
R
 
T
E
 
-
P
 
G
W
|
W
V
 
L
E
|
E
H
 
V
F
 
H
E
 
S
W
 
F
L
x
P
E
 
I
P
 
D
L
 
E
F
 
Y
N
 
T
E
 
K
R
 
R
-
 
P
L
 
L
E
 
V
I
 
V
K
 
E
D
 
N
G
 
F
R
 
R
M
 
A
L
 
V
V
 
A
P
 
S
T
 
N
R
 
E
P
 
P
G
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
V
S
 
E
L
 
F
S
 
D

Sites not aligning to the query:

3ugvF Crystal structure of an enolase from alpha pretobacterium bal199 (efi target efi-501650) with bound mg
31% identity, 87% coverage: 37:371/385 of query aligns to 20:357/364 of 3ugvF

query
sites
3ugvF
L
x
V
T
 
T
G
 
A
R
 
R
Q
 
I
K
 
A
P
 
T
M
 
I
T
 
P
E
 
D
I
 
W
A
 
P
I
 
L
L
 
I
F
 
L
A
 
I
E
 
D
I
 
I
E
 
E
T
 
T
E
 
E
G
 
E
G
 
G
D
 
V
K
 
P
G
 
G
L
 
R
G
 
A
F
 
Y
-
 
L
-
 
E
S
x
P
Y
 
Y
A
 
V
K
x
P
R
 
K
A
 
A
G
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
-
F
 
-
A
 
-
H
 
-
A
 
M
R
 
K
E
 
Y
I
 
L
A
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
-
G
 
-
E
 
H
D
 
D
A
 
M
N
 
S
D
 
D
I
 
M
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
P
A
 
A
R
 
E
L
 
I
W
 
Y
N
 
D
K
 
K
L
 
T
I
 
R
W
 
K
A
 
S
G
 
L
A
 
H
S
 
F
V
 
V
G
 
G
R
 
Y
S
x
A
G
 
G
L
 
L
A
 
S
T
 
M
Q
 
I
A
 
A
I
 
A
G
 
S
A
 
G
F
 
V
D
 
D
V
 
M
A
 
A
L
 
V
W
 
W
D
 
D
L
 
A
K
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
A
A
 
A
N
 
N
L
 
M
P
 
P
L
 
L
A
 
C
K
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
G
H
 
T
R
 
P
D
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
K
C
 
A
Y
 
Y
N
 
N
T
x
S
S
 
N
G
 
G
G
 
L
F
 
W
L
 
L
H
 
K
T
 
S
P
 
P
L
 
A
D
 
E
Q
 
V
L
 
-
L
 
-
M
 
-
N
 
-
A
 
A
S
 
A
K
 
E
S
 
A
V
 
V
E
 
E
-
 
L
-
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
G
-
 
Q
-
 
G
K
 
T
G
 
G
I
 
F
G
 
K
G
 
G
I
 
L
K
|
K
L
 
L
K
x
R
V
 
M
G
 
G
Q
 
R
P
 
D
D
 
D
C
 
P
A
 
A
A
 
V
D
 
D
I
 
I
Q
 
E
R
 
T
V
 
A
E
 
E
T
 
A
V
 
V
R
 
W
K
 
D
H
 
A
L
 
V
G
 
G
D
 
R
G
 
D
F
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
F
N
|
N
Q
 
Q
Q
 
G
W
 
L
D
 
D
R
 
M
P
 
A
T
 
E
A
 
A
Q
 
M
R
 
H
M
 
R
C
 
T
R
 
R
I
 
Q
L
 
I
E
 
D
Q
 
D
F
 
L
N
 
G
L
 
L
I
 
E
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
V
D
 
V
A
 
Y
Y
 
D
D
 
N
S
 
F
E
 
D
G
 
G
H
 
Y
A
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
x
R
A
 
H
Q
 
D
F
x
L
D
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
L
A
 
M
T
 
I
G
|
G
E
|
E
M
x
N
L
 
F
T
 
Y
S
 
G
V
 
P
A
 
R
E
 
E
H
 
M
W
 
H
D
 
Q
L
 
A
I
 
L
R
 
Q
H
 
A
R
 
G
A
 
A
A
 
C
D
 
D
Y
 
L
L
 
V
M
|
M
P
 
P
D
|
D
G
 
F
P
 
M
R
 
R
V
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
S
P
 
G
F
 
W
L
 
M
T
 
R
V
 
A
A
 
A
T
 
G
L
 
V
A
 
A
D
 
G
H
x
A
A
 
W
G
 
G
L
 
I
M
 
P
I
 
M
A
 
S
P
 
T
H
|
H
F
x
L
A
x
Y
M
 
P
E
 
E
L
 
V
H
 
G
V
 
A
H
 
H
L
 
V
A
 
M
A
 
R
A
 
V
Y
 
T
P
 
E
R
 
T
E
 
A
P
 
H
W
 
W
V
 
L
E
|
E
H
 
W
F
 
Q
E
 
S
W
 
W
L
 
A
E
 
D
P
 
P
L
 
I
F
 
L
N
 
Q
E
 
E
R
 
P
L
 
Y
E
 
A
I
 
L
K
 
S
D
 
D
G
 
G
R
 
D
M
 
L
L
 
I
V
 
V
P
 
P
T
 
D
R
 
K
P
 
P
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
L
S
 
D
L
 
W
S
 
D
G
 
E
Q
 
D
V
 
V

P11444 Mandelate racemase; MR; EC 5.1.2.2 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see 3 papers)
28% identity, 91% coverage: 15:365/385 of query aligns to 6:347/359 of P11444

query
sites
P11444
I
 
I
A
 
T
S
 
G
I
 
L
R
 
R
L
 
T
S
 
R
S
 
A
V
 
V
Y
 
N
L
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
T
 
Y
P
 
P
I
 
V
S
 
H
D
 
T
A
 
A
K
 
-
V
 
V
L
 
G
T
 
T
G
 
V
R
 
G
Q
 
T
K
 
A
P
 
P
M
 
L
T
 
V
E
 
L
I
 
I
A
 
-
I
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
D
I
 
L
E
 
A
T
 
T
E
 
S
G
 
A
G
 
G
D
 
V
K
 
V
G
 
G
L
 
H
G
 
S
F
 
Y
S
 
L
Y
 
F
A
 
A
K
 
Y
R
 
T
A
 
P
G
 
V
G
 
A
P
 
L
G
 
K
Q
 
S
F
 
L
A
 
K
H
 
Q
A
 
L
R
 
L
E
 
D
I
 
D
A
 
M
P
 
A
A
 
A
L
 
M
I
 
I
G
 
V
E
 
N
D
 
E
A
 
P
N
 
L
D
 
A
I
 
P
A
 
V
R
 
S
L
 
L
W
 
E
N
 
A
K
 
M
L
 
L
I
 
A
W
 
K
A
 
R
G
 
F
A
 
C
S
 
L
V
 
A
G
 
G
R
 
Y
S
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
I
T
 
R
Q
 
M
A
 
A
I
 
A
G
 
A
A
 
G
F
 
I
D
 
D
V
 
M
A
 
A
L
 
A
W
 
W
D
 
D
L
 
A
K
 
L
A
 
G
R
 
K
R
 
V
A
 
H
N
 
E
L
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
V
K
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
N
R
 
A
D
 
R
S
 
P
V
 
V
K
 
Q
C
 
A
Y
 
Y
N
 
D
T
 
S
S
 
H
G
 
S
G
 
-
F
 
-
L
 
-
H
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
L
D
 
D
Q
 
G
L
 
V
L
 
K
M
 
L
N
 
A
A
 
T
S
 
E
K
 
R
S
 
A
V
 
V
-
 
T
-
 
A
-
 
A
E
 
E
K
 
L
G
 
G
I
 
F
G
 
R
G
 
A
I
 
V
K
 
K
L
 
T
K
|
K
V
 
I
G
 
G
Q
 
Y
P
 
P
D
 
A
C
 
L
A
 
D
A
 
Q
D
 
D
I
 
L
Q
 
A
R
 
V
V
 
V
E
 
R
T
 
S
V
 
I
R
 
R
K
 
Q
H
 
A
L
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
D
F
 
F
A
 
G
L
 
I
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
Y
N
 
N
Q
 
Q
Q
 
S
W
 
L
D
 
D
R
 
V
P
 
P
T
 
A
A
 
A
Q
 
I
R
 
K
M
 
R
C
 
S
R
 
Q
I
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
F
 
E
N
 
G
L
 
V
I
 
T
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
T
D
 
L
A
 
Q
Y
 
H
D
 
D
S
 
Y
E
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
Q
A
 
R
L
 
I
A
 
Q
A
 
S
Q
 
K
F
 
L
D
 
N
T
 
V
P
 
P
I
 
V
A
 
Q
T
 
M
G
 
G
E
|
E
M
 
N
L
 
W
T
 
L
S
 
G
V
 
P
A
 
E
E
 
E
H
 
M
W
 
F
D
 
K
L
 
A
I
 
L
R
 
S
H
 
I
R
 
G
A
 
A
A
 
C
D
 
R
Y
 
L
L
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
D
G
 
A
P
 
M
R
 
K
V
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
T
P
 
G
F
 
W
L
 
I
T
 
R
V
 
A
A
 
S
T
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
H
 
Q
A
 
F
G
 
G
L
 
I
M
 
P
I
 
M
A
 
S
P
 
S
H
|
H
F
 
L
A
 
F
M
 
Q
E
 
E
L
 
I
H
 
S
V
 
A
H
 
H
L
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
T
P
 
P
R
 
T
E
 
A
P
 
H
W
 
W
V
 
L
E
|
E
H
 
R
F
 
L
E
 
D
W
 
L
L
 
A
E
 
G
P
 
S
L
 
V
F
 
I
N
 
E
E
 
P
R
 
T
L
 
L
E
 
T
I
 
F
K
 
E
D
 
G
G
 
G
R
 
N
M
 
A
L
 
V
V
 
I
P
 
P
T
 
D
R
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
V
 
I

7mqxE P. Putida mandelate racemase forms an oxobenzoxaborole adduct with 2- formylphenylboronic acid (see paper)
28% identity, 91% coverage: 15:365/385 of query aligns to 5:346/358 of 7mqxE

query
sites
7mqxE
I
 
I
A
 
T
S
 
G
I
 
L
R
 
R
L
 
T
S
 
R
S
 
A
V
 
V
Y
 
N
L
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
T
 
Y
P
 
P
I
x
V
S
 
H
D
 
T
A
 
A
K
 
-
V
 
V
L
 
G
T
 
T
G
 
V
R
 
G
Q
 
T
K
 
A
P
 
P
M
 
L
T
 
V
E
 
L
I
 
I
A
 
-
I
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
D
I
 
L
E
 
A
T
 
T
E
 
S
G
 
A
G
 
G
D
 
V
K
 
V
G
 
G
L
 
H
G
 
S
F
 
Y
S
 
L
Y
 
F
A
 
A
K
 
Y
R
 
T
A
 
P
G
 
V
G
 
A
P
 
L
G
 
K
Q
 
S
F
 
L
A
 
K
H
 
Q
A
 
L
R
 
L
E
 
D
I
 
D
A
 
M
P
 
A
A
 
A
L
 
M
I
 
I
G
 
V
E
 
N
D
 
E
A
 
P
N
 
L
D
 
A
I
 
P
A
 
V
R
 
S
L
 
L
W
 
E
N
 
A
K
 
M
L
 
L
I
 
A
W
 
K
A
 
R
G
 
F
A
 
C
S
 
L
V
 
A
G
 
G
R
 
Y
S
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
I
T
 
R
Q
 
M
A
 
A
I
 
A
G
 
A
A
 
G
F
 
I
D
 
D
V
 
M
A
 
A
L
 
A
W
 
W
D
 
D
L
 
A
K
 
L
A
 
G
R
 
K
R
 
V
A
 
H
N
 
E
L
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
V
K
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
N
R
 
A
D
 
R
S
 
P
V
 
V
K
 
Q
C
 
A
Y
 
Y
N
 
D
T
 
S
S
 
H
G
 
S
G
 
-
F
 
-
L
 
-
H
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
L
D
 
D
Q
 
G
L
 
V
L
 
K
M
 
L
N
 
A
A
 
T
S
 
E
K
 
R
S
 
A
V
 
V
-
 
T
-
 
A
-
 
A
E
 
E
K
 
L
G
 
G
I
 
F
G
 
R
G
 
A
I
 
V
K
 
K
L
 
T
K
|
K
V
 
I
G
 
G
Q
 
Y
P
 
P
D
 
A
C
 
L
A
 
D
A
 
Q
D
 
D
I
 
L
Q
 
A
R
 
V
V
 
V
E
 
R
T
 
S
V
 
I
R
 
R
K
 
Q
H
 
A
L
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
D
F
 
F
A
 
G
L
 
I
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
Y
N
|
N
Q
 
Q
Q
 
S
W
 
L
D
 
D
R
 
V
P
 
P
T
 
A
A
 
A
Q
 
I
R
 
K
M
 
R
C
 
S
R
 
Q
I
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
F
 
E
N
 
G
L
 
V
I
 
T
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
T
D
 
L
A
 
Q
Y
 
H
D
 
D
S
 
Y
E
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
Q
A
 
R
L
 
I
A
 
Q
A
 
S
Q
 
K
F
 
L
D
 
N
T
 
V
P
 
P
I
 
V
A
 
Q
T
 
M
G
 
G
E
|
E
M
 
N
L
 
W
T
 
L
S
 
G
V
 
P
A
 
E
E
 
E
H
 
M
W
 
F
D
 
K
L
 
A
I
 
L
R
 
S
H
 
I
R
 
G
A
 
A
A
 
C
D
 
R
Y
 
L
L
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
D
G
 
A
P
 
M
R
 
K
V
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
T
P
 
G
F
 
W
L
 
I
T
 
R
V
 
A
A
 
S
T
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
H
 
Q
A
 
F
G
 
G
L
 
I
M
 
P
I
 
M
A
 
S
P
 
S
H
|
H
F
 
L
A
 
F
M
 
Q
E
 
E
L
 
I
H
 
S
V
 
A
H
 
H
L
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
T
P
 
P
R
 
T
E
 
A
P
 
H
W
 
W
V
 
L
E
|
E
H
 
R
F
 
L
E
 
D
W
 
L
L
 
A
E
 
G
P
 
S
L
 
V
F
 
I
N
 
E
E
 
P
R
 
T
L
 
L
E
 
T
I
 
F
K
 
E
D
 
G
G
 
G
R
 
N
M
 
A
L
 
V
V
 
I
P
 
P
T
 
D
R
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
V
 
I

6vimA P. Putida mandelate racemase co-crystallized with phenylboronic acid (see paper)
28% identity, 91% coverage: 15:365/385 of query aligns to 4:345/357 of 6vimA

query
sites
6vimA
I
 
I
A
 
T
S
 
G
I
 
L
R
 
R
L
 
T
S
 
R
S
 
A
V
 
V
Y
 
N
L
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
T
 
Y
P
 
P
I
x
V
S
 
H
D
 
T
A
 
A
K
 
-
V
 
V
L
 
G
T
 
T
G
 
V
R
 
G
Q
 
T
K
 
A
P
 
P
M
 
L
T
 
V
E
 
L
I
 
I
A
 
-
I
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
D
I
 
L
E
 
A
T
 
T
E
 
S
G
 
A
G
 
G
D
 
V
K
 
V
G
 
G
L
 
H
G
 
S
F
 
Y
S
 
L
Y
 
F
A
 
A
K
 
Y
R
 
T
A
 
P
G
 
V
G
 
A
P
 
L
G
 
K
Q
 
S
F
 
L
A
 
K
H
 
Q
A
 
L
R
 
L
E
 
D
I
 
D
A
 
M
P
 
A
A
 
A
L
 
M
I
 
I
G
 
V
E
 
N
D
 
E
A
 
P
N
 
L
D
 
A
I
 
P
A
 
V
R
 
S
L
 
L
W
 
E
N
 
A
K
 
M
L
 
L
I
 
A
W
 
K
A
 
R
G
 
F
A
 
C
S
 
L
V
 
A
G
 
G
R
 
Y
S
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
I
T
 
R
Q
 
M
A
 
A
I
 
A
G
 
A
A
 
G
F
 
I
D
 
D
V
 
M
A
 
A
L
 
A
W
 
W
D
 
D
L
 
A
K
 
L
A
 
G
R
 
K
R
 
V
A
 
H
N
 
E
L
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
V
K
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
N
R
 
A
D
 
R
S
 
P
V
 
V
K
 
Q
C
 
A
Y
 
Y
N
 
D
T
x
S
S
 
H
G
 
S
G
 
-
F
 
-
L
 
-
H
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
L
D
 
D
Q
 
G
L
 
V
L
 
K
M
 
L
N
 
A
A
 
T
S
 
E
K
 
R
S
 
A
V
 
V
-
 
T
-
 
A
-
 
A
E
 
E
K
 
L
G
 
G
I
 
F
G
 
R
G
 
A
I
 
V
K
|
K
L
 
T
K
|
K
V
 
I
G
 
G
Q
 
Y
P
 
P
D
 
A
C
 
L
A
 
D
A
 
Q
D
 
D
I
 
L
Q
 
A
R
 
V
V
 
V
E
 
R
T
 
S
V
 
I
R
 
R
K
 
Q
H
 
A
L
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
D
F
 
F
A
 
G
L
 
I
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
Y
N
|
N
Q
 
Q
Q
 
S
W
 
L
D
 
D
R
 
V
P
 
P
T
 
A
A
 
A
Q
 
I
R
 
K
M
 
R
C
 
S
R
 
Q
I
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
F
 
E
N
 
G
L
 
V
I
 
T
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
T
D
 
L
A
 
Q
Y
 
H
D
 
D
S
 
Y
E
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
Q
A
 
R
L
 
I
A
 
Q
A
 
S
Q
 
K
F
 
L
D
 
N
T
 
V
P
 
P
I
 
V
A
 
Q
T
 
M
G
|
G
E
|
E
M
 
N
L
 
W
T
 
L
S
 
G
V
 
P
A
 
E
E
 
E
H
 
M
W
 
F
D
 
K
L
 
A
I
 
L
R
 
S
H
 
I
R
 
G
A
 
A
A
 
C
D
 
R
Y
 
L
L
 
A
M
 
M
P
 
P
D
|
D
G
 
A
P
 
M
R
 
K
V
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
T
P
 
G
F
 
W
L
 
I
T
 
R
V
 
A
A
 
S
T
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
H
 
Q
A
 
F
G
 
G
L
 
I
M
 
P
I
 
M
A
 
S
P
 
S
H
|
H
F
x
L
A
x
F
M
 
Q
E
 
E
L
 
I
H
 
S
V
 
A
H
 
H
L
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
T
P
 
P
R
 
T
E
 
A
P
 
H
W
 
W
V
 
L
E
|
E
H
 
R
F
x
L
E
 
D
W
 
L
L
 
A
E
 
G
P
 
S
L
 
V
F
 
I
N
 
E
E
 
P
R
 
T
L
 
L
E
 
T
I
 
F
K
 
E
D
 
G
G
 
G
R
 
N
M
 
A
L
 
V
V
 
I
P
 
P
T
 
D
R
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
V
 
I

4x2pA P. Putida mandelate racemase in complex with 3-hydroxypyruvate (see paper)
28% identity, 91% coverage: 15:365/385 of query aligns to 4:345/357 of 4x2pA

query
sites
4x2pA
I
 
I
A
 
T
S
 
G
I
 
L
R
 
R
L
 
T
S
 
R
S
 
A
V
 
V
Y
 
N
L
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
T
 
Y
P
 
P
I
x
V
S
 
H
D
 
T
A
 
A
K
 
-
V
 
V
L
 
G
T
 
T
G
 
V
R
 
G
Q
 
T
K
 
A
P
 
P
M
 
L
T
 
V
E
 
L
I
 
I
A
 
-
I
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
D
I
 
L
E
 
A
T
 
T
E
 
S
G
 
A
G
 
G
D
 
V
K
 
V
G
 
G
L
 
H
G
 
S
F
 
Y
S
 
L
Y
 
F
A
 
A
K
 
Y
R
 
T
A
 
P
G
 
V
G
 
A
P
 
L
G
 
K
Q
 
S
F
 
L
A
 
K
H
 
Q
A
 
L
R
 
L
E
 
D
I
 
D
A
 
M
P
 
A
A
 
A
L
 
M
I
 
I
G
 
V
E
 
N
D
 
E
A
 
P
N
 
L
D
 
A
I
 
P
A
 
V
R
 
S
L
 
L
W
 
E
N
 
A
K
 
M
L
 
L
I
 
A
W
 
K
A
 
R
G
 
F
A
 
C
S
 
L
V
 
A
G
 
G
R
 
Y
S
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
I
T
 
R
Q
 
M
A
 
A
I
 
A
G
 
A
A
 
G
F
 
I
D
 
D
V
 
M
A
 
A
L
 
A
W
 
W
D
 
D
L
 
A
K
 
L
A
 
G
R
 
K
R
 
V
A
 
H
N
 
E
L
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
V
K
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
N
R
 
A
D
 
R
S
 
P
V
 
V
K
 
Q
C
 
A
Y
 
Y
N
 
D
T
x
S
S
 
H
G
 
S
G
 
-
F
 
-
L
 
-
H
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
L
D
 
D
Q
 
G
L
 
V
L
 
K
M
 
L
N
 
A
A
 
T
S
 
E
K
 
R
S
 
A
V
 
V
-
 
T
-
 
A
-
 
A
E
 
E
K
 
L
G
 
G
I
 
F
G
 
R
G
 
A
I
 
V
K
|
K
L
 
T
K
|
K
V
 
I
G
 
G
Q
 
Y
P
 
P
D
 
A
C
 
L
A
 
D
A
 
Q
D
 
D
I
 
L
Q
 
A
R
 
V
V
 
V
E
 
R
T
 
S
V
 
I
R
 
R
K
 
Q
H
 
A
L
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
D
F
 
F
A
 
G
L
 
I
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
Y
N
|
N
Q
 
Q
Q
 
S
W
 
L
D
 
D
R
 
V
P
 
P
T
 
A
A
 
A
Q
 
I
R
 
K
M
 
R
C
 
S
R
 
Q
I
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
F
 
E
N
 
G
L
 
V
I
 
T
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
T
D
 
L
A
 
Q
Y
 
H
D
 
D
S
 
Y
E
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
Q
A
 
R
L
 
I
A
 
Q
A
 
S
Q
 
K
F
 
L
D
 
N
T
 
V
P
 
P
I
 
V
A
 
Q
T
 
M
G
|
G
E
|
E
M
 
N
L
 
W
T
 
L
S
 
G
V
 
P
A
 
E
E
 
E
H
 
M
W
 
F
D
 
K
L
 
A
I
 
L
R
 
S
H
 
I
R
 
G
A
 
A
A
 
C
D
 
R
Y
 
L
L
 
A
M
 
M
P
 
P
D
|
D
G
 
A
P
 
M
R
 
K
V
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
T
P
 
G
F
 
W
L
 
I
T
 
R
V
 
A
A
 
S
T
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
H
 
Q
A
 
F
G
 
G
L
 
I
M
 
P
I
x
M
A
 
S
P
 
S
H
|
H
F
x
L
A
x
F
M
 
Q
E
 
E
L
 
I
H
 
S
V
 
A
H
 
H
L
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
T
P
 
P
R
 
T
E
x
A
P
 
H
W
 
W
V
 
L
E
|
E
H
 
R
F
 
L
E
 
D
W
 
L
L
 
A
E
 
G
P
 
S
L
 
V
F
 
I
N
 
E
E
 
P
R
 
T
L
 
L
E
 
T
I
 
F
K
 
E
D
 
G
G
 
G
R
 
N
M
 
A
L
 
V
V
 
I
P
 
P
T
 
D
R
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
V
 
I

4m6uA P. Putida mandelate racemase co-crystallized with tartronic acid (see paper)
28% identity, 91% coverage: 15:365/385 of query aligns to 4:345/357 of 4m6uA

query
sites
4m6uA
I
 
I
A
 
T
S
 
G
I
 
L
R
 
R
L
 
T
S
 
R
S
 
A
V
 
V
Y
 
N
L
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
T
 
Y
P
 
P
I
x
V
S
 
H
D
 
T
A
 
A
K
 
-
V
 
V
L
 
G
T
 
T
G
 
V
R
 
G
Q
 
T
K
 
A
P
 
P
M
 
L
T
 
V
E
 
L
I
 
I
A
 
-
I
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
D
I
 
L
E
 
A
T
 
T
E
 
S
G
 
A
G
 
G
D
 
V
K
 
V
G
 
G
L
 
H
G
 
S
F
 
Y
S
 
L
Y
 
F
A
 
A
K
 
Y
R
 
T
A
 
P
G
 
V
G
 
A
P
 
L
G
 
K
Q
 
S
F
 
L
A
 
K
H
 
Q
A
 
L
R
 
L
E
 
D
I
 
D
A
 
M
P
 
A
A
 
A
L
 
M
I
 
I
G
 
V
E
 
N
D
 
E
A
 
P
N
 
L
D
 
A
I
 
P
A
 
V
R
 
S
L
 
L
W
 
E
N
 
A
K
 
M
L
 
L
I
 
A
W
 
K
A
 
R
G
 
F
A
 
C
S
 
L
V
 
A
G
 
G
R
 
Y
S
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
I
T
 
R
Q
 
M
A
 
A
I
 
A
G
 
A
A
 
G
F
 
I
D
 
D
V
 
M
A
 
A
L
 
A
W
 
W
D
 
D
L
 
A
K
 
L
A
 
G
R
 
K
R
 
V
A
 
H
N
 
E
L
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
V
K
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
N
R
 
A
D
 
R
S
 
P
V
 
V
K
 
Q
C
 
A
Y
 
Y
N
 
D
T
x
S
S
 
H
G
 
S
G
 
-
F
 
-
L
 
-
H
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
L
D
 
D
Q
 
G
L
 
V
L
 
K
M
 
L
N
 
A
A
 
T
S
 
E
K
 
R
S
 
A
V
 
V
-
 
T
-
 
A
-
 
A
E
 
E
K
 
L
G
 
G
I
 
F
G
 
R
G
 
A
I
 
V
K
|
K
L
 
T
K
|
K
V
 
I
G
 
G
Q
 
Y
P
 
P
D
 
A
C
 
L
A
 
D
A
 
Q
D
 
D
I
 
L
Q
 
A
R
 
V
V
 
V
E
 
R
T
 
S
V
 
I
R
 
R
K
 
Q
H
 
A
L
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
D
F
 
F
A
 
G
L
 
I
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
Y
N
|
N
Q
 
Q
Q
 
S
W
 
L
D
 
D
R
 
V
P
 
P
T
 
A
A
 
A
Q
 
I
R
 
K
M
 
R
C
 
S
R
 
Q
I
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
F
 
E
N
 
G
L
 
V
I
 
T
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
T
D
 
L
A
 
Q
Y
 
H
D
 
D
S
 
Y
E
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
Q
A
 
R
L
 
I
A
 
Q
A
 
S
Q
 
K
F
 
L
D
 
N
T
 
V
P
 
P
I
 
V
A
 
Q
T
 
M
G
|
G
E
|
E
M
 
N
L
 
W
T
 
L
S
 
G
V
 
P
A
 
E
E
 
E
H
 
M
W
 
F
D
 
K
L
 
A
I
 
L
R
 
S
H
 
I
R
 
G
A
 
A
A
 
C
D
 
R
Y
 
L
L
 
A
M
 
M
P
 
P
D
|
D
G
 
A
P
 
M
R
 
K
V
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
T
P
 
G
F
 
W
L
 
I
T
 
R
V
 
A
A
 
S
T
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
H
 
Q
A
 
F
G
 
G
L
 
I
M
 
P
I
x
M
A
 
S
P
 
S
H
|
H
F
x
L
A
x
F
M
 
Q
E
 
E
L
 
I
H
 
S
V
 
A
H
 
H
L
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
T
P
 
P
R
 
T
E
x
A
P
 
H
W
 
W
V
 
L
E
|
E
H
 
R
F
 
L
E
 
D
W
 
L
L
 
A
E
 
G
P
 
S
L
 
V
F
 
I
N
 
E
E
 
P
R
 
T
L
 
L
E
 
T
I
 
F
K
 
E
D
 
G
G
 
G
R
 
N
M
 
A
L
 
V
V
 
I
P
 
P
T
 
D
R
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
V
 
I

4fp1A P. Putida mandelate racemase co-crystallized with 3,3,3-trifluoro-2- hydroxy-2-(trifluoromethyl) propionic acid (see paper)
28% identity, 91% coverage: 15:365/385 of query aligns to 4:345/357 of 4fp1A

query
sites
4fp1A
I
 
I
A
 
T
S
 
G
I
 
L
R
 
R
L
 
T
S
 
R
S
 
A
V
 
V
Y
 
N
L
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
T
 
Y
P
 
P
I
x
V
S
 
H
D
 
T
A
 
A
K
 
-
V
 
V
L
 
G
T
 
T
G
 
V
R
 
G
Q
 
T
K
 
A
P
 
P
M
 
L
T
 
V
E
 
L
I
 
I
A
 
-
I
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
D
I
 
L
E
 
A
T
 
T
E
 
S
G
 
A
G
 
G
D
 
V
K
 
V
G
 
G
L
 
H
G
 
S
F
 
Y
S
 
L
Y
 
F
A
 
A
K
 
Y
R
 
T
A
 
P
G
 
V
G
 
A
P
 
L
G
 
K
Q
 
S
F
 
L
A
 
K
H
 
Q
A
 
L
R
 
L
E
 
D
I
 
D
A
 
M
P
 
A
A
 
A
L
 
M
I
 
I
G
 
V
E
 
N
D
 
E
A
 
P
N
 
L
D
 
A
I
 
P
A
 
V
R
 
S
L
 
L
W
 
E
N
 
A
K
 
M
L
 
L
I
 
A
W
 
K
A
 
R
G
 
F
A
 
C
S
 
L
V
 
A
G
 
G
R
 
Y
S
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
I
T
 
R
Q
 
M
A
 
A
I
 
A
G
 
A
A
 
G
F
 
I
D
 
D
V
 
M
A
 
A
L
 
A
W
 
W
D
 
D
L
 
A
K
 
L
A
 
G
R
 
K
R
 
V
A
 
H
N
 
E
L
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
V
K
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
N
R
 
A
D
 
R
S
 
P
V
 
V
K
 
Q
C
 
A
Y
 
Y
N
 
D
T
x
S
S
 
H
G
 
S
G
 
-
F
 
-
L
 
-
H
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
L
D
 
D
Q
 
G
L
 
V
L
 
K
M
 
L
N
 
A
A
 
T
S
 
E
K
 
R
S
 
A
V
 
V
-
 
T
-
 
A
-
 
A
E
 
E
K
 
L
G
 
G
I
 
F
G
 
R
G
 
A
I
 
V
K
|
K
L
 
T
K
|
K
V
 
I
G
 
G
Q
 
Y
P
 
P
D
 
A
C
 
L
A
 
D
A
 
Q
D
 
D
I
 
L
Q
 
A
R
 
V
V
 
V
E
 
R
T
 
S
V
 
I
R
 
R
K
 
Q
H
 
A
L
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
D
F
 
F
A
 
G
L
 
I
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
Y
N
|
N
Q
 
Q
Q
 
S
W
 
L
D
 
D
R
 
V
P
 
P
T
 
A
A
 
A
Q
 
I
R
 
K
M
 
R
C
 
S
R
 
Q
I
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
F
 
E
N
 
G
L
 
V
I
 
T
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
T
D
 
L
A
 
Q
Y
 
H
D
 
D
S
 
Y
E
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
Q
A
 
R
L
 
I
A
 
Q
A
 
S
Q
 
K
F
 
L
D
 
N
T
 
V
P
 
P
I
 
V
A
 
Q
T
 
M
G
|
G
E
|
E
M
 
N
L
 
W
T
 
L
S
 
G
V
 
P
A
 
E
E
 
E
H
 
M
W
 
F
D
 
K
L
 
A
I
 
L
R
 
S
H
 
I
R
 
G
A
 
A
A
 
C
D
 
R
Y
 
L
L
 
A
M
 
M
P
 
P
D
|
D
G
 
A
P
 
M
R
 
K
V
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
T
P
 
G
F
 
W
L
 
I
T
 
R
V
 
A
A
 
S
T
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
H
 
Q
A
 
F
G
 
G
L
 
I
M
 
P
I
x
M
A
 
S
P
 
S
H
|
H
F
x
L
A
x
F
M
 
Q
E
 
E
L
 
I
H
 
S
V
 
A
H
 
H
L
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
T
P
 
P
R
 
T
E
x
A
P
 
H
W
 
W
V
 
L
E
|
E
H
 
R
F
 
L
E
 
D
W
 
L
L
 
A
E
 
G
P
 
S
L
 
V
F
 
I
N
 
E
E
 
P
R
 
T
L
 
L
E
 
T
I
 
F
K
 
E
D
 
G
G
 
G
R
 
N
M
 
A
L
 
V
V
 
I
P
 
P
T
 
D
R
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
V
 
I

3uxlA P. Putida mandelate racemase co-crystallized with the intermediate analogue cupferron (see paper)
28% identity, 91% coverage: 15:365/385 of query aligns to 4:345/357 of 3uxlA

query
sites
3uxlA
I
 
I
A
 
T
S
 
G
I
 
L
R
 
R
L
 
T
S
 
R
S
 
A
V
 
V
Y
 
N
L
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
T
 
Y
P
 
P
I
x
V
S
 
H
D
 
T
A
 
A
K
 
-
V
 
V
L
 
G
T
 
T
G
 
V
R
 
G
Q
 
T
K
 
A
P
 
P
M
 
L
T
 
V
E
 
L
I
 
I
A
 
-
I
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
D
I
 
L
E
 
A
T
 
T
E
 
S
G
 
A
G
 
G
D
 
V
K
 
V
G
 
G
L
 
H
G
 
S
F
 
Y
S
 
L
Y
 
F
A
 
A
K
 
Y
R
 
T
A
 
P
G
 
V
G
 
A
P
 
L
G
 
K
Q
 
S
F
 
L
A
 
K
H
 
Q
A
 
L
R
 
L
E
 
D
I
 
D
A
 
M
P
 
A
A
 
A
L
 
M
I
 
I
G
 
V
E
 
N
D
 
E
A
 
P
N
 
L
D
 
A
I
 
P
A
 
V
R
 
S
L
 
L
W
 
E
N
 
A
K
 
M
L
 
L
I
 
A
W
 
K
A
 
R
G
 
F
A
 
C
S
 
L
V
 
A
G
 
G
R
 
Y
S
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
I
T
 
R
Q
 
M
A
 
A
I
 
A
G
 
A
A
 
G
F
 
I
D
 
D
V
 
M
A
 
A
L
 
A
W
 
W
D
 
D
L
 
A
K
 
L
A
 
G
R
 
K
R
 
V
A
 
H
N
 
E
L
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
V
K
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
N
R
 
A
D
 
R
S
 
P
V
 
V
K
 
Q
C
 
A
Y
 
Y
N
 
D
T
x
S
S
 
H
G
 
S
G
 
-
F
 
-
L
 
-
H
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
L
D
 
D
Q
 
G
L
 
V
L
 
K
M
 
L
N
 
A
A
 
T
S
 
E
K
 
R
S
 
A
V
 
V
-
 
T
-
 
A
-
 
A
E
 
E
K
 
L
G
 
G
I
 
F
G
 
R
G
 
A
I
 
V
K
|
K
L
 
T
K
|
K
V
 
I
G
 
G
Q
 
Y
P
 
P
D
 
A
C
 
L
A
 
D
A
 
Q
D
 
D
I
 
L
Q
 
A
R
 
V
V
 
V
E
 
R
T
 
S
V
 
I
R
 
R
K
 
Q
H
 
A
L
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
D
F
 
F
A
 
G
L
 
I
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
Y
N
|
N
Q
 
Q
Q
 
S
W
 
L
D
 
D
R
 
V
P
 
P
T
 
A
A
 
A
Q
 
I
R
 
K
M
 
R
C
 
S
R
 
Q
I
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
F
 
E
N
 
G
L
 
V
I
 
T
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
T
D
 
L
A
 
Q
Y
 
H
D
 
D
S
 
Y
E
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
Q
A
 
R
L
 
I
A
 
Q
A
 
S
Q
 
K
F
 
L
D
 
N
T
 
V
P
 
P
I
 
V
A
 
Q
T
 
M
G
|
G
E
|
E
M
 
N
L
 
W
T
 
L
S
 
G
V
 
P
A
 
E
E
 
E
H
 
M
W
 
F
D
 
K
L
 
A
I
 
L
R
 
S
H
 
I
R
 
G
A
 
A
A
 
C
D
 
R
Y
 
L
L
 
A
M
 
M
P
 
P
D
|
D
G
 
A
P
 
M
R
 
K
V
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
T
P
 
G
F
 
W
L
 
I
T
 
R
V
 
A
A
 
S
T
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
H
 
Q
A
 
F
G
 
G
L
 
I
M
 
P
I
x
M
A
 
S
P
 
S
H
|
H
F
x
L
A
x
F
M
 
Q
E
 
E
L
 
I
H
 
S
V
 
A
H
 
H
L
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
T
P
 
P
R
 
T
E
x
A
P
 
H
W
 
W
V
 
L
E
|
E
H
 
R
F
 
L
E
 
D
W
 
L
L
 
A
E
 
G
P
 
S
L
 
V
F
 
I
N
 
E
E
 
P
R
 
T
L
 
L
E
 
T
I
 
F
K
 
E
D
 
G
G
 
G
R
 
N
M
 
A
L
 
V
V
 
I
P
 
P
T
 
D
R
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
V
 
I

3uxkA P. Putida mandelate racemase co-crystallized with the intermediate analogue benzohydroxamate (see paper)
28% identity, 91% coverage: 15:365/385 of query aligns to 4:345/357 of 3uxkA

query
sites
3uxkA
I
 
I
A
 
T
S
 
G
I
 
L
R
 
R
L
 
T
S
 
R
S
 
A
V
 
V
Y
 
N
L
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
T
 
Y
P
 
P
I
x
V
S
 
H
D
 
T
A
 
A
K
 
-
V
 
V
L
 
G
T
 
T
G
 
V
R
 
G
Q
 
T
K
 
A
P
 
P
M
 
L
T
 
V
E
 
L
I
 
I
A
 
-
I
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
D
I
 
L
E
 
A
T
 
T
E
 
S
G
 
A
G
 
G
D
 
V
K
 
V
G
 
G
L
 
H
G
 
S
F
 
Y
S
 
L
Y
 
F
A
 
A
K
 
Y
R
 
T
A
 
P
G
 
V
G
 
A
P
 
L
G
 
K
Q
 
S
F
 
L
A
 
K
H
 
Q
A
 
L
R
 
L
E
 
D
I
 
D
A
 
M
P
 
A
A
 
A
L
 
M
I
 
I
G
 
V
E
 
N
D
 
E
A
 
P
N
 
L
D
 
A
I
 
P
A
 
V
R
 
S
L
 
L
W
 
E
N
 
A
K
 
M
L
 
L
I
 
A
W
 
K
A
 
R
G
 
F
A
 
C
S
 
L
V
 
A
G
 
G
R
 
Y
S
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
I
T
 
R
Q
 
M
A
 
A
I
 
A
G
 
A
A
 
G
F
 
I
D
 
D
V
 
M
A
 
A
L
 
A
W
 
W
D
 
D
L
 
A
K
 
L
A
 
G
R
 
K
R
 
V
A
 
H
N
 
E
L
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
V
K
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
N
R
 
A
D
 
R
S
 
P
V
 
V
K
 
Q
C
 
A
Y
 
Y
N
 
D
T
x
S
S
 
H
G
 
S
G
 
-
F
 
-
L
 
-
H
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
L
D
 
D
Q
 
G
L
 
V
L
 
K
M
 
L
N
 
A
A
 
T
S
 
E
K
 
R
S
 
A
V
 
V
-
 
T
-
 
A
-
 
A
E
 
E
K
 
L
G
 
G
I
 
F
G
 
R
G
 
A
I
 
V
K
|
K
L
 
T
K
|
K
V
 
I
G
 
G
Q
 
Y
P
 
P
D
 
A
C
 
L
A
 
D
A
 
Q
D
 
D
I
 
L
Q
 
A
R
 
V
V
 
V
E
 
R
T
 
S
V
 
I
R
 
R
K
 
Q
H
 
A
L
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
D
F
 
F
A
 
G
L
 
I
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
Y
N
|
N
Q
 
Q
Q
 
S
W
 
L
D
 
D
R
 
V
P
 
P
T
 
A
A
 
A
Q
 
I
R
 
K
M
 
R
C
 
S
R
 
Q
I
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
F
 
E
N
 
G
L
 
V
I
 
T
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
T
D
 
L
A
 
Q
Y
 
H
D
 
D
S
 
Y
E
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
Q
A
 
R
L
 
I
A
 
Q
A
 
S
Q
 
K
F
 
L
D
 
N
T
 
V
P
 
P
I
 
V
A
 
Q
T
 
M
G
|
G
E
|
E
M
 
N
L
 
W
T
 
L
S
 
G
V
 
P
A
 
E
E
 
E
H
 
M
W
 
F
D
 
K
L
 
A
I
 
L
R
 
S
H
 
I
R
 
G
A
 
A
A
 
C
D
 
R
Y
 
L
L
 
A
M
 
M
P
 
P
D
|
D
G
 
A
P
 
M
R
 
K
V
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
T
P
 
G
F
 
W
L
 
I
T
 
R
V
 
A
A
 
S
T
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
H
 
Q
A
 
F
G
 
G
L
 
I
M
 
P
I
x
M
A
 
S
P
 
S
H
|
H
F
x
L
A
x
F
M
 
Q
E
 
E
L
 
I
H
 
S
V
 
A
H
 
H
L
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
T
P
 
P
R
 
T
E
x
A
P
 
H
W
 
W
V
 
L
E
|
E
H
 
R
F
x
L
E
 
D
W
 
L
L
 
A
E
 
G
P
 
S
L
 
V
F
 
I
N
 
E
E
 
P
R
 
T
L
 
L
E
 
T
I
 
F
K
 
E
D
 
G
G
 
G
R
 
N
M
 
A
L
 
V
V
 
I
P
 
P
T
 
D
R
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
V
 
I

2mnrA Mechanism of the reaction catalyzed by mandelate racemase. 2. Crystal structure of mandelate racemase at 2.5 angstroms resolution: identification of the active site and possible catalytic residues (see paper)
28% identity, 91% coverage: 15:365/385 of query aligns to 4:345/357 of 2mnrA

query
sites
2mnrA
I
 
I
A
 
T
S
 
G
I
 
L
R
 
R
L
 
T
S
 
R
S
 
A
V
 
V
Y
 
N
L
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
T
 
Y
P
 
P
I
x
V
S
 
H
D
 
T
A
 
A
K
 
-
V
 
V
L
 
G
T
 
T
G
 
V
R
 
G
Q
 
T
K
 
A
P
 
P
M
 
L
T
 
V
E
 
L
I
 
I
A
 
-
I
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
D
I
 
L
E
 
A
T
 
T
E
 
S
G
 
A
G
 
G
D
 
V
K
 
V
G
 
G
L
 
H
G
 
S
F
 
Y
S
 
L
Y
 
F
A
 
A
K
 
Y
R
 
T
A
 
P
G
 
V
G
 
A
P
 
L
G
 
K
Q
 
S
F
 
L
A
 
K
H
 
Q
A
 
L
R
 
L
E
 
D
I
 
D
A
 
M
P
 
A
A
 
A
L
 
M
I
 
I
G
 
V
E
 
N
D
 
E
A
 
P
N
 
L
D
 
A
I
 
P
A
 
V
R
 
S
L
 
L
W
 
E
N
 
A
K
 
M
L
 
L
I
 
A
W
 
K
A
 
R
G
 
F
A
 
C
S
 
L
V
 
A
G
 
G
R
 
Y
S
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
I
T
 
R
Q
 
M
A
 
A
I
 
A
G
 
A
A
 
G
F
 
I
D
 
D
V
 
M
A
 
A
L
 
A
W
 
W
D
 
D
L
 
A
K
 
L
A
 
G
R
 
K
R
 
V
A
 
H
N
 
E
L
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
V
K
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
N
R
 
A
D
 
R
S
 
P
V
 
V
K
 
Q
C
 
A
Y
 
Y
N
 
D
T
x
S
S
 
H
G
 
S
G
 
-
F
 
-
L
 
-
H
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
L
D
 
D
Q
 
G
L
 
V
L
 
K
M
 
L
N
 
A
A
 
T
S
 
E
K
 
R
S
 
A
V
 
V
-
 
T
-
 
A
-
 
A
E
 
E
K
 
L
G
 
G
I
 
F
G
 
R
G
 
A
I
 
V
K
|
K
L
 
T
K
|
K
V
 
I
G
 
G
Q
 
Y
P
 
P
D
 
A
C
 
L
A
 
D
A
 
Q
D
 
D
I
 
L
Q
 
A
R
 
V
V
 
V
E
 
R
T
 
S
V
 
I
R
 
R
K
 
Q
H
 
A
L
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
D
F
 
F
A
 
G
L
 
I
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
Y
N
|
N
Q
 
Q
Q
 
S
W
 
L
D
 
D
R
 
V
P
 
P
T
 
A
A
 
A
Q
 
I
R
 
K
M
 
R
C
 
S
R
 
Q
I
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
F
 
E
N
 
G
L
 
V
I
 
T
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
T
D
 
L
A
 
Q
Y
 
H
D
 
D
S
 
Y
E
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
Q
A
 
R
L
 
I
A
 
Q
A
 
S
Q
 
K
F
 
L
D
 
N
T
 
V
P
 
P
I
 
V
A
 
Q
T
 
M
G
|
G
E
|
E
M
 
N
L
 
W
T
 
L
S
 
G
V
 
P
A
 
E
E
 
E
H
 
M
W
 
F
D
 
K
L
 
A
I
 
L
R
 
S
H
 
I
R
 
G
A
 
A
A
 
C
D
 
R
Y
 
L
L
 
A
M
 
M
P
 
P
D
|
D
G
 
A
P
 
M
R
 
K
V
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
T
P
 
G
F
 
W
L
 
I
T
 
R
V
 
A
A
 
S
T
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
H
 
Q
A
 
F
G
 
G
L
 
I
M
 
P
I
x
M
A
 
S
P
 
S
H
|
H
F
x
L
A
x
F
M
 
Q
E
 
E
L
 
I
H
 
S
V
 
A
H
 
H
L
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
T
P
 
P
R
 
T
E
x
A
P
 
H
W
 
W
V
 
L
E
|
E
H
 
R
F
 
L
E
 
D
W
 
L
L
 
A
E
 
G
P
 
S
L
 
V
F
 
I
N
 
E
E
 
P
R
 
T
L
 
L
E
 
T
I
 
F
K
 
E
D
 
G
G
 
G
R
 
N
M
 
A
L
 
V
V
 
I
P
 
P
T
 
D
R
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
V
 
I

1mdlA Mandelate racemase mutant k166r co-crystallized with (r)-mandelate (see paper)
28% identity, 91% coverage: 15:365/385 of query aligns to 4:345/357 of 1mdlA

query
sites
1mdlA
I
 
I
A
 
T
S
 
G
I
 
L
R
 
R
L
 
T
S
 
R
S
 
A
V
 
V
Y
 
N
L
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
T
 
Y
P
 
P
I
x
V
S
 
H
D
 
T
A
 
A
K
 
-
V
 
V
L
 
G
T
 
T
G
 
V
R
 
G
Q
 
T
K
 
A
P
 
P
M
 
L
T
 
V
E
 
L
I
 
I
A
 
-
I
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
D
I
 
L
E
 
A
T
 
T
E
 
S
G
 
A
G
 
G
D
 
V
K
 
V
G
 
G
L
 
H
G
 
S
F
 
Y
S
 
L
Y
x
F
A
 
A
K
 
Y
R
 
T
A
 
P
G
 
V
G
 
A
P
 
L
G
 
K
Q
 
S
F
 
L
A
 
K
H
 
Q
A
 
L
R
 
L
E
 
D
I
 
D
A
 
M
P
 
A
A
 
A
L
 
M
I
 
I
G
 
V
E
 
N
D
 
E
A
 
P
N
 
L
D
 
A
I
 
P
A
 
V
R
 
S
L
 
L
W
 
E
N
 
A
K
 
M
L
 
L
I
 
A
W
 
K
A
 
R
G
 
F
A
 
C
S
 
L
V
 
A
G
 
G
R
 
Y
S
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
I
T
 
R
Q
 
M
A
 
A
I
 
A
G
 
A
A
 
G
F
 
I
D
 
D
V
 
M
A
 
A
L
 
A
W
 
W
D
 
D
L
 
A
K
 
L
A
 
G
R
 
K
R
 
V
A
 
H
N
 
E
L
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
V
K
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
N
R
 
A
D
 
R
S
 
P
V
 
V
K
 
Q
C
 
A
Y
 
Y
N
 
D
T
x
S
S
 
H
G
 
S
G
 
-
F
 
-
L
 
-
H
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
L
D
 
D
Q
 
G
L
 
V
L
 
K
M
 
L
N
 
A
A
 
T
S
 
E
K
 
R
S
 
A
V
 
V
-
 
T
-
 
A
-
 
A
E
 
E
K
 
L
G
 
G
I
 
F
G
 
R
G
 
A
I
 
V
K
|
K
L
 
T
K
x
R
V
 
I
G
 
G
Q
 
Y
P
 
P
D
 
A
C
 
L
A
 
D
A
 
Q
D
 
D
I
 
L
Q
 
A
R
 
V
V
 
V
E
 
R
T
 
S
V
 
I
R
 
R
K
 
Q
H
 
A
L
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
D
F
 
F
A
 
G
L
 
I
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
Y
N
|
N
Q
 
Q
Q
 
S
W
 
L
D
 
D
R
 
V
P
 
P
T
 
A
A
 
A
Q
 
I
R
 
K
M
 
R
C
 
S
R
 
Q
I
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
F
 
E
N
 
G
L
 
V
I
 
T
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
T
D
 
L
A
 
Q
Y
 
H
D
 
D
S
 
Y
E
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
Q
A
 
R
L
 
I
A
 
Q
A
 
S
Q
 
K
F
 
L
D
 
N
T
 
V
P
 
P
I
 
V
A
 
Q
T
 
M
G
|
G
E
|
E
M
 
N
L
 
W
T
 
L
S
 
G
V
 
P
A
 
E
E
 
E
H
 
M
W
 
F
D
 
K
L
 
A
I
 
L
R
 
S
H
 
I
R
 
G
A
 
A
A
 
C
D
 
R
Y
 
L
L
 
A
M
 
M
P
 
P
D
|
D
G
 
A
P
 
M
R
 
K
V
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
T
P
 
G
F
 
W
L
 
I
T
 
R
V
 
A
A
 
S
T
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
H
 
Q
A
 
F
G
 
G
L
 
I
M
 
P
I
x
M
A
 
S
P
 
S
H
|
H
F
x
L
A
x
F
M
 
Q
E
 
E
L
 
I
H
 
S
V
 
A
H
 
H
L
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
T
P
 
P
R
 
T
E
x
A
P
 
H
W
 
W
V
 
L
E
|
E
H
 
R
F
 
L
E
 
D
W
 
L
L
 
A
E
 
G
P
 
S
L
 
V
F
 
I
N
 
E
E
 
P
R
 
T
L
 
L
E
 
T
I
 
F
K
 
E
D
 
G
G
 
G
R
 
N
M
 
A
L
 
V
V
 
I
P
 
P
T
 
D
R
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
V
 
I

Query Sequence

>RR42_RS22655 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS22655
MTTQHQPKTGANDNIASIRLSSVYLPLATPISDAKVLTGRQKPMTEIAILFAEIETEGGD
KGLGFSYAKRAGGPGQFAHAREIAPALIGEDANDIARLWNKLIWAGASVGRSGLATQAIG
AFDVALWDLKARRANLPLAKLLGAHRDSVKCYNTSGGFLHTPLDQLLMNASKSVEKGIGG
IKLKVGQPDCAADIQRVETVRKHLGDGFALMVDANQQWDRPTAQRMCRILEQFNLIWIEE
PLDAYDSEGHAALAAQFDTPIATGEMLTSVAEHWDLIRHRAADYLMPDGPRVGGITPFLT
VATLADHAGLMIAPHFAMELHVHLAAAYPREPWVEHFEWLEPLFNERLEIKDGRMLVPTR
PGIGVSLSGQVAGWTREQAEFGAKR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory