SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS23450 RR42_RS23450 enoyl-CoA hydratase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6slbAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
38% identity, 97% coverage: 3:259/264 of query aligns to 1:249/257 of 6slbAAA

query
sites
6slbAAA
N
 
N
Y
 
I
S
 
G
L
 
M
I
 
I
E
 
L
L
 
K
K
 
E
Y
 
R
E
 
Q
S
 
D
G
 
G
V
 
V
A
 
L
V
 
V
I
 
L
A
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
E
K
 
K
R
x
L
N
 
N
A
|
A
M
 
I
S
 
T
D
 
G
D
 
E
M
 
L
R
 
L
T
 
D
E
 
A
F
 
L
I
 
Y
D
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
K
R
 
E
V
 
G
A
 
E
A
 
E
D
 
D
K
 
R
A
 
E
V
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
L
I
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
A
G
 
G
K
x
R
G
 
A
F
 
F
C
 
S
A
|
A
G
|
G
G
x
Q
D
|
D
V
x
L
S
 
T
G
 
E
M
x
F
K
 
G
R
 
D
R
 
R
M
 
-
E
 
-
A
 
K
P
 
P
Q
 
D
G
x
Y
E
 
E
V
 
A
G
x
H
F
x
L
N
 
R
G
 
R
W
x
Y
S
x
N
R
 
R
Q
 
-
Q
 
-
R
 
-
V
 
-
H
 
-
Y
 
-
T
 
V
Q
 
V
K
 
E
L
 
A
L
 
L
H
 
S
T
 
G
M
 
L
P
 
E
K
 
K
P
 
P
T
 
L
V
 
V
A
 
V
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
A
x
V
A
 
A
A
|
A
G
|
G
L
x
A
G
 
G
A
 
M
D
x
S
T
 
L
A
 
A
L
 
L
C
 
W
C
 
G
D
 
D
F
 
L
V
 
R
I
 
L
A
 
A
S
 
A
E
 
V
H
 
G
A
 
A
S
 
S
F
 
F
S
 
T
W
 
T
S
x
A
Y
x
F
I
 
V
N
 
R
R
x
I
G
 
G
L
|
L
I
 
V
P
|
P
D
|
D
G
 
S
G
 
G
G
 
L
M
 
S
Y
 
F
F
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
L
F
 
L
T
 
L
G
 
S
R
 
P
K
 
R
V
 
L
A
 
S
I
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
K
 
L
E
 
A
I
 
L
G
 
G
I
 
L
V
 
V
D
 
H
R
 
R
V
 
V
S
 
V
H
 
P
A
 
A
D
 
E
S
 
K
L
 
L
V
 
M
A
 
E
D
 
E
A
 
A
V
 
L
A
 
S
W
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
S
 
A
Q
 
Q
G
 
G
S
 
P
P
 
T
T
 
R
A
 
A
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
T
K
 
K
T
 
K
I
 
L
M
 
L
N
 
L
Q
 
E
S
 
T
Y
 
Y
E
 
R
L
 
L
P
 
S
A
 
L
D
 
T
Q
 
E
I
 
A
F
 
L
A
|
A
Q
 
L
G
 
E
S
 
A
Q
 
V
A
 
L
Q
 
Q
G
 
G
I
 
Q
C
 
A
Y
x
G
T
 
Q
S
 
T
A
 
Q
E
 
D
H
 
H
R
 
E
E
 
E
S
 
G
V
 
V
L
 
R
A
 
A
F
 
F
L
 
R
N
 
E
K
 
K

6slaAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
37% identity, 94% coverage: 12:259/264 of query aligns to 7:237/245 of 6slaAAA

query
sites
6slaAAA
E
 
Q
S
 
D
G
 
G
V
 
V
A
 
L
V
 
V
I
 
L
A
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
E
K
|
K
R
x
L
N
 
N
A
|
A
M
 
I
S
 
T
D
 
G
D
 
E
M
 
L
R
 
L
T
 
D
E
 
A
F
 
L
I
 
Y
D
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
K
R
 
E
V
 
G
A
 
E
A
 
E
D
 
D
K
 
R
A
 
E
V
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
L
I
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
A
G
 
G
K
x
R
G
 
A
F
 
F
C
 
S
A
|
A
G
|
G
G
x
Q
D
|
D
V
x
L
S
 
T
G
 
E
M
 
A
K
 
H
R
x
L
R
 
R
M
 
-
E
 
-
A
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
G
 
-
F
 
-
N
 
-
G
 
-
W
 
-
S
 
-
R
 
-
Q
 
-
Q
 
-
R
 
R
V
x
Y
H
x
N
Y
 
R
T
 
V
Q
 
V
K
 
E
L
 
A
L
 
L
H
 
S
T
 
G
M
 
L
P
 
E
K
 
K
P
 
P
T
 
L
V
 
V
A
 
V
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
A
x
V
A
 
A
A
|
A
G
|
G
L
x
A
G
 
G
A
 
M
D
x
S
T
 
L
A
 
A
L
 
L
C
 
W
C
 
G
D
 
D
F
 
L
V
 
R
I
 
L
A
 
A
S
 
A
E
 
V
H
 
G
A
 
A
S
 
S
F
 
F
S
 
T
W
 
T
S
x
A
Y
x
F
I
 
V
N
 
R
R
x
I
G
 
G
L
|
L
I
 
V
P
|
P
D
x
N
G
 
S
G
 
G
G
 
L
M
 
S
Y
 
F
F
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
L
F
 
L
T
 
L
G
 
S
R
 
P
K
 
R
V
 
L
A
 
S
I
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
K
 
L
E
 
A
I
 
L
G
 
G
I
 
L
V
 
V
D
 
H
R
 
R
V
 
V
S
 
V
H
 
P
A
 
A
D
 
E
S
 
K
L
 
L
V
 
M
A
 
E
D
 
E
A
 
A
V
 
L
A
 
S
W
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
S
 
A
Q
 
Q
G
 
G
S
 
P
P
 
T
T
 
R
A
 
A
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
T
K
 
K
T
 
K
I
 
L
M
 
L
N
 
L
Q
 
E
S
 
T
Y
 
Y
E
 
R
L
 
L
P
 
S
A
 
L
D
 
T
Q
 
E
I
 
A
F
 
L
A
|
A
Q
 
L
G
 
E
S
 
A
Q
 
V
A
 
L
Q
 
Q
G
 
G
I
 
Q
C
 
A
Y
x
G
T
 
Q
S
 
T
A
 
Q
E
 
D
H
 
H
R
 
E
E
 
E
S
 
G
V
 
V
L
 
R
A
 
A
F
|
F
L
 
R
N
 
E
K
|
K

5zaiC Crystal structure of 3-hydroxypropionyl-coa dehydratase from metallosphaera sedula (see paper)
32% identity, 97% coverage: 4:259/264 of query aligns to 3:251/259 of 5zaiC

query
sites
5zaiC
Y
 
F
S
 
E
L
 
T
I
 
I
E
 
E
L
 
T
K
 
K
Y
 
K
E
 
E
S
 
G
G
 
N
V
 
L
A
 
F
V
 
W
I
 
I
A
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
x
D
K
|
K
R
x
L
N
 
N
A
|
A
M
 
L
S
 
N
D
 
A
D
 
K
M
 
L
R
 
L
T
 
E
E
 
E
F
 
L
I
 
D
D
 
R
A
 
A
L
 
V
E
 
S
R
 
Q
V
 
A
A
 
E
A
 
S
D
 
D
K
 
P
A
 
E
V
 
I
R
 
R
A
 
V
L
 
I
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
N
 
K
G
 
G
K
 
K
G
 
A
F
 
F
C
 
C
A
|
A
G
|
G
G
x
A
D
|
D
V
x
I
S
 
T
G
 
Q
M
x
F
K
 
N
R
 
Q
R
 
L
M
 
T
E
 
P
A
 
A
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
G
 
-
F
 
-
N
 
E
G
 
A
W
 
W
S
 
K
R
 
F
Q
x
S
Q
 
K
R
 
K
V
 
G
H
x
R
Y
 
E
T
 
I
Q
 
M
K
 
D
L
 
K
L
 
I
H
 
E
T
 
A
M
 
L
P
 
S
K
 
K
P
 
P
T
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
M
V
 
I
N
 
N
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
A
x
L
G
|
G
L
x
G
G
 
G
A
 
L
D
x
E
T
 
L
A
 
A
L
 
L
C
 
A
C
 
C
D
 
D
F
 
I
V
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
E
H
 
E
A
 
A
S
 
Q
F
 
L
S
 
G
W
 
L
S
x
P
Y
x
E
I
 
I
N
 
N
R
 
L
G
 
G
L
x
I
I
 
Y
P
|
P
D
x
G
G
 
Y
G
 
G
G
 
G
M
 
T
Y
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
R
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
K
A
 
G
K
 
R
A
 
A
K
 
L
E
 
E
L
 
M
V
 
M
F
 
M
T
 
T
G
 
G
R
 
D
K
x
R
V
 
I
A
 
P
I
 
G
E
 
K
E
 
D
A
 
A
K
 
E
E
 
K
I
 
Y
G
 
G
I
 
L
V
 
V
D
 
N
R
 
R
V
 
V
S
 
V
H
 
P
A
 
L
D
 
A
S
 
N
L
 
L
V
 
E
A
 
Q
D
 
E
A
 
T
V
 
R
A
 
K
W
 
L
A
 
A
K
 
E
E
 
K
L
 
I
S
 
A
Q
 
K
G
 
K
S
 
S
P
 
P
T
 
I
A
 
S
I
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
I
K
 
K
T
 
E
I
 
V
M
 
V
N
 
N
Q
 
R
S
 
G
Y
 
L
E
 
D
L
 
S
P
 
P
A
 
L
D
 
L
Q
 
S
I
 
G
F
 
L
A
|
A
Q
 
L
G
 
E
S
 
S
Q
 
V
A
 
G
Q
 
W
G
 
G
I
 
V
C
 
V
Y
x
F
T
 
S
S
 
T
A
 
E
E
 
D
H
 
K
R
 
K
E
 
E
S
 
G
V
 
V
L
 
S
A
 
A
F
|
F
L
 
L
N
 
E
K
|
K

1mj3A Crystal structure analysis of rat enoyl-coa hydratase in complex with hexadienoyl-coa (see paper)
33% identity, 94% coverage: 13:259/264 of query aligns to 15:250/258 of 1mj3A

query
sites
1mj3A
S
 
S
G
 
S
V
 
V
A
 
G
V
 
L
I
 
I
A
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
x
K
K
x
A
R
x
L
N
 
N
A
|
A
M
 
L
S
 
C
D
 
N
D
 
G
M
 
L
R
 
I
T
 
E
E
 
E
F
 
L
I
 
N
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
T
V
 
F
A
 
E
A
 
E
D
 
D
K
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
L
 
I
V
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
G
G
 
E
K
|
K
G
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
|
G
G
x
A
D
|
D
V
x
I
S
x
K
G
 
E
M
|
M
K
 
Q
R
 
N
R
 
R
M
 
T
E
 
-
A
 
F
P
 
Q
Q
 
D
G
 
C
E
 
Y
V
x
S
G
 
G
F
x
L
N
 
S
G
 
H
W
|
W
S
 
D
R
 
H
Q
 
I
Q
 
T
R
 
R
V
 
I
H
 
K
Y
 
-
T
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
-
L
 
-
H
 
-
T
 
-
M
 
-
P
 
-
K
 
K
P
 
P
T
 
V
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
A
x
Y
A
 
A
A
x
L
G
|
G
L
x
G
G
 
G
A
 
C
D
x
E
T
 
L
A
 
A
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
F
 
I
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
S
 
G
E
 
E
H
 
K
A
 
A
S
 
Q
F
 
F
S
 
G
W
 
Q
S
x
P
Y
x
E
I
 
I
N
 
L
R
x
L
G
 
G
L
x
T
I
 
I
P
|
P
D
x
G
G
x
A
G
 
G
G
 
G
M
 
T
Y
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
R
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
K
A
 
S
K
 
L
A
 
A
K
 
M
E
 
E
L
 
M
V
 
V
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
D
K
 
R
V
 
I
A
 
S
I
 
A
E
 
Q
E
 
D
A
 
A
K
 
K
E
 
Q
I
 
A
G
 
G
I
 
L
V
 
V
D
 
S
R
 
K
V
 
I
S
 
F
H
 
P
A
 
V
D
 
E
S
 
T
L
 
L
V
 
V
A
 
E
D
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
W
 
C
A
 
A
K
 
E
E
 
K
L
 
I
S
 
A
Q
 
N
G
 
N
S
 
S
P
 
K
T
 
I
A
 
I
I
 
V
A
 
A
L
 
M
G
 
A
K
 
K
T
 
E
I
 
S
M
 
V
N
 
N
Q
 
A
S
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
M
P
 
T
A
 
-
D
 
-
Q
 
-
I
 
-
F
 
L
A
 
T
Q
 
E
G
 
G
S
 
N
Q
x
K
A
 
L
Q
 
E
G
 
K
I
 
K
C
 
L
Y
x
F
T
 
Y
S
 
S
A
 
T
-
x
F
-
 
A
-
 
T
-
 
D
E
 
D
H
 
R
R
 
R
E
 
E
S
 
G
V
 
M
L
 
S
A
 
A
F
|
F
L
 
V
N
 
E
K
|
K

2dubA Enoyl-coa hydratase complexed with octanoyl-coa (see paper)
32% identity, 94% coverage: 13:259/264 of query aligns to 14:246/254 of 2dubA

query
sites
2dubA
S
 
S
G
 
S
V
 
V
A
 
G
V
 
L
I
 
I
A
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
x
K
K
x
A
R
x
L
N
 
N
A
|
A
M
 
L
S
 
C
D
 
N
D
 
G
M
 
L
R
 
I
T
 
E
E
 
E
F
 
L
I
 
N
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
T
V
 
F
A
 
E
A
 
E
D
 
D
K
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
L
 
I
V
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
G
G
 
E
K
|
K
G
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
|
G
G
x
A
D
|
D
V
x
I
S
x
K
G
 
E
M
|
M
K
 
Q
R
 
N
R
 
R
M
 
T
E
 
-
A
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
F
E
 
Q
V
 
D
G
 
C
F
 
Y
N
x
S
G
 
H
W
 
W
S
 
D
R
 
H
Q
 
I
Q
 
T
R
 
R
V
 
I
H
 
K
Y
 
-
T
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
-
L
 
-
H
 
-
T
 
-
M
 
-
P
 
-
K
 
K
P
 
P
T
 
V
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
A
x
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
L
x
G
G
 
G
A
 
C
D
x
E
T
 
L
A
 
A
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
F
 
I
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
S
 
G
E
 
E
H
 
K
A
 
A
S
 
Q
F
 
F
S
 
G
W
 
Q
S
x
P
Y
x
E
I
 
I
N
 
L
R
x
L
G
 
G
L
x
T
I
 
I
P
|
P
D
x
G
G
x
A
G
 
G
G
 
G
M
 
T
Y
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
R
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
K
A
 
S
K
 
L
A
 
A
K
 
M
E
 
E
L
 
M
V
 
V
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
D
K
 
R
V
 
I
A
 
S
I
 
A
E
 
Q
E
 
D
A
 
A
K
 
K
E
 
Q
I
 
A
G
 
G
I
 
L
V
 
V
D
 
S
R
 
K
V
 
I
S
 
F
H
 
P
A
 
V
D
 
E
S
 
T
L
 
L
V
 
V
A
 
E
D
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
W
 
C
A
 
A
K
 
E
E
 
K
L
 
I
S
 
A
Q
 
N
G
 
N
S
 
S
P
 
K
T
 
I
A
 
I
I
 
V
A
 
A
L
 
M
G
 
A
K
 
K
T
 
E
I
 
S
M
 
V
N
 
N
Q
 
A
S
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
M
P
 
T
A
 
-
D
 
-
Q
 
-
I
 
-
F
 
L
A
 
T
Q
 
E
G
 
G
S
 
N
Q
x
K
A
 
L
Q
 
E
G
 
K
I
 
K
C
 
L
Y
 
F
T
 
Y
S
 
S
A
 
T
-
x
F
-
 
A
-
 
T
-
 
D
E
 
D
H
 
R
R
 
R
E
 
E
S
 
G
V
 
M
L
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
V
N
 
E
K
 
K

1ey3A Structure of enoyl-coa hydratase complexed with the substrate dac-coa (see paper)
32% identity, 94% coverage: 13:259/264 of query aligns to 13:250/258 of 1ey3A

query
sites
1ey3A
S
 
S
G
 
S
V
 
V
A
 
G
V
 
L
I
 
I
A
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
x
K
K
x
A
R
x
L
N
 
N
A
|
A
M
 
L
S
 
C
D
 
N
D
 
G
M
 
L
R
 
I
T
 
E
E
 
E
F
 
L
I
 
N
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
T
V
 
F
A
 
E
A
 
E
D
 
D
K
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
L
 
I
V
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
G
G
 
E
K
 
K
G
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
|
G
G
x
A
D
|
D
V
x
I
S
x
K
G
 
E
M
|
M
K
 
Q
R
 
N
R
 
R
-
 
T
-
 
F
M
 
Q
E
 
D
A
 
C
P
 
Y
Q
x
S
G
 
G
E
 
K
V
 
F
G
 
-
F
x
L
N
 
S
G
 
H
W
|
W
S
 
D
R
 
H
Q
 
I
Q
 
T
R
 
R
V
 
I
H
 
K
Y
 
-
T
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
-
L
 
-
H
 
-
T
 
-
M
 
-
P
 
-
K
 
K
P
 
P
T
 
V
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
A
x
Y
A
 
A
A
x
L
G
|
G
L
x
G
G
 
G
A
 
C
D
x
E
T
 
L
A
 
A
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
F
 
I
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
S
 
G
E
 
E
H
 
K
A
 
A
S
 
Q
F
 
F
S
 
G
W
 
Q
S
x
P
Y
x
E
I
 
I
N
 
L
R
x
L
G
 
G
L
x
T
I
 
I
P
|
P
D
x
G
G
x
A
G
 
G
G
 
G
M
 
T
Y
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
R
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
K
A
 
S
K
 
L
A
 
A
K
 
M
E
 
E
L
 
M
V
 
V
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
D
K
x
R
V
 
I
A
 
S
I
 
A
E
 
Q
E
 
D
A
 
A
K
 
K
E
 
Q
I
 
A
G
 
G
I
 
L
V
 
V
D
 
S
R
 
K
V
 
I
S
 
F
H
 
P
A
 
V
D
 
E
S
 
T
L
 
L
V
 
V
A
 
E
D
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
W
 
C
A
 
A
K
 
E
E
 
K
L
 
I
S
 
A
Q
 
N
G
 
N
S
 
S
P
 
K
T
 
I
A
 
I
I
 
V
A
 
A
L
 
M
G
 
A
K
 
K
T
 
E
I
 
S
M
 
V
N
 
N
Q
 
A
S
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
M
P
 
T
A
 
-
D
 
-
Q
 
-
I
 
-
F
 
L
A
 
T
Q
 
E
G
 
G
S
 
N
Q
x
K
A
 
L
Q
 
E
G
 
K
I
 
K
C
 
L
Y
x
F
T
 
Y
S
 
S
A
 
T
-
x
F
-
 
A
-
 
T
-
 
D
E
 
D
H
 
R
R
 
R
E
 
E
S
 
G
V
 
M
L
 
S
A
 
A
F
|
F
L
 
V
N
 
E
K
|
K

1dubA 2-enoyl-coa hydratase, data collected at 100 k, ph 6.5 (see paper)
32% identity, 94% coverage: 13:259/264 of query aligns to 15:252/260 of 1dubA

query
sites
1dubA
S
 
S
G
 
S
V
 
V
A
 
G
V
 
L
I
 
I
A
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
x
K
K
x
A
R
x
L
N
 
N
A
|
A
M
 
L
S
 
C
D
 
N
D
 
G
M
 
L
R
 
I
T
 
E
E
 
E
F
 
L
I
 
N
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
T
V
 
F
A
 
E
A
 
E
D
 
D
K
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
L
 
I
V
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
G
G
 
E
K
|
K
G
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
|
G
G
x
A
D
|
D
V
x
I
S
x
K
G
 
E
M
|
M
K
 
Q
R
 
N
R
 
R
-
 
T
-
 
F
M
 
Q
E
 
D
A
 
C
P
 
Y
Q
x
S
G
 
G
E
 
K
V
 
F
G
 
-
F
x
L
N
 
S
G
 
H
W
 
W
S
 
D
R
 
H
Q
 
I
Q
 
T
R
 
R
V
 
I
H
 
K
Y
 
-
T
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
-
L
 
-
H
 
-
T
 
-
M
 
-
P
 
-
K
 
K
P
 
P
T
 
V
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
A
x
Y
A
 
A
A
x
L
G
|
G
L
x
G
G
 
G
A
 
C
D
x
E
T
 
L
A
 
A
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
F
 
I
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
S
 
G
E
 
E
H
 
K
A
 
A
S
 
Q
F
 
F
S
 
G
W
 
Q
S
x
P
Y
x
E
I
 
I
N
 
L
R
x
L
G
 
G
L
x
T
I
 
I
P
|
P
D
x
G
G
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
T
Y
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
R
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
K
A
 
S
K
 
L
A
 
A
K
 
M
E
 
E
L
 
M
V
 
V
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
D
K
 
R
V
 
I
A
 
S
I
 
A
E
 
Q
E
 
D
A
 
A
K
 
K
E
 
Q
I
 
A
G
 
G
I
 
L
V
 
V
D
 
S
R
 
K
V
 
I
S
 
F
H
 
P
A
 
V
D
 
E
S
 
T
L
 
L
V
 
V
A
 
E
D
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
W
 
C
A
 
A
K
 
E
E
 
K
L
 
I
S
 
A
Q
 
N
G
 
N
S
 
S
P
 
K
T
 
I
A
 
I
I
 
V
A
 
A
L
 
M
G
 
A
K
 
K
T
 
E
I
 
S
M
 
V
N
 
N
Q
 
A
S
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
M
P
 
T
A
 
-
D
 
-
Q
 
-
I
 
-
F
 
L
A
 
T
Q
 
E
G
 
G
S
 
N
Q
x
K
A
 
L
Q
 
E
G
 
K
I
 
K
C
 
L
Y
x
F
T
 
Y
S
 
S
A
 
T
-
x
F
-
 
A
-
 
T
-
 
D
E
 
D
H
 
R
R
 
R
E
 
E
S
 
G
V
 
M
L
 
S
A
 
A
F
|
F
L
 
V
N
 
E
K
|
K

P14604 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial; mECH; mECH1; Enoyl-CoA hydratase 1; ECHS1; Short-chain enoyl-CoA hydratase; SCEH; EC 4.2.1.17; EC 5.3.3.8 from Rattus norvegicus (Rat) (see 3 papers)
32% identity, 94% coverage: 13:259/264 of query aligns to 45:282/290 of P14604

query
sites
P14604
S
 
S
G
 
S
V
 
V
A
 
G
V
 
L
I
 
I
A
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
K
K
 
A
R
 
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
S
 
C
D
 
N
D
 
G
M
 
L
R
 
I
T
 
E
E
 
E
F
 
L
I
 
N
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
T
V
 
F
A
 
E
A
 
E
D
 
D
K
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
L
 
I
V
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
G
G
 
E
K
 
K
G
 
A
F
 
F
C
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
A
D
 
D
V
 
I
S
 
K
G
 
E
M
 
M
K
 
Q
R
 
N
R
 
R
-
 
T
-
 
F
M
 
Q
E
 
D
A
 
C
P
 
Y
Q
 
S
G
 
G
E
 
K
V
 
F
G
 
-
F
 
L
N
 
S
G
 
H
W
 
W
S
 
D
R
 
H
Q
 
I
Q
 
T
R
 
R
V
 
I
H
 
K
Y
 
-
T
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
-
L
 
-
H
 
-
T
 
-
M
 
-
P
 
-
K
 
K
P
 
P
T
 
V
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
G
G
 
G
A
 
C
D
x
E
T
 
L
A
 
A
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
F
 
I
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
S
 
G
E
 
E
H
 
K
A
 
A
S
 
Q
F
 
F
S
 
G
W
 
Q
S
 
P
Y
x
E
I
 
I
N
 
L
R
 
L
G
 
G
L
 
T
I
 
I
P
 
P
D
 
G
G
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
T
Y
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
R
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
K
A
 
S
K
 
L
A
 
A
K
 
M
E
 
E
L
 
M
V
 
V
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
D
K
 
R
V
 
I
A
 
S
I
 
A
E
 
Q
E
 
D
A
 
A
K
 
K
E
 
Q
I
 
A
G
 
G
I
 
L
V
 
V
D
 
S
R
 
K
V
 
I
S
 
F
H
 
P
A
 
V
D
 
E
S
 
T
L
 
L
V
 
V
A
 
E
D
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
W
 
C
A
 
A
K
 
E
E
 
K
L
 
I
S
 
A
Q
 
N
G
 
N
S
 
S
P
 
K
T
 
I
A
 
I
I
 
V
A
 
A
L
 
M
G
 
A
K
 
K
T
 
E
I
 
S
M
 
V
N
 
N
Q
 
A
S
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
M
P
 
-
A
 
-
D
 
-
Q
 
-
I
 
T
F
 
L
A
 
T
Q
 
E
G
 
G
S
 
N
Q
 
K
A
 
L
Q
 
E
G
 
K
I
 
K
C
 
L
Y
 
F
T
 
Y
S
 
S
A
 
T
-
 
F
-
 
A
-
 
T
-
 
D
E
 
D
H
 
R
R
 
R
E
 
E
S
 
G
V
 
M
L
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
V
N
 
E
K
 
K

Sites not aligning to the query:

2hw5C The crystal structure of human enoyl-coenzyme a (coa) hydratase short chain 1, echs1
32% identity, 93% coverage: 15:259/264 of query aligns to 17:252/260 of 2hw5C

query
sites
2hw5C
V
 
V
A
 
G
V
 
L
I
 
I
A
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
x
K
K
x
A
R
x
L
N
 
N
A
|
A
M
 
L
S
 
C
D
 
D
D
 
G
M
 
L
R
 
I
T
 
D
E
 
E
F
 
L
I
 
N
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
K
R
 
I
V
 
F
A
 
E
A
 
E
D
 
D
K
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
L
 
I
V
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
G
G
 
D
K
|
K
G
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
 
G
G
x
A
D
|
D
V
x
I
S
x
K
G
 
E
M
|
M
K
 
Q
R
 
N
R
 
-
M
 
-
E
 
-
A
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
L
G
 
S
F
 
F
-
 
Q
N
 
D
G
 
C
W
 
Y
S
|
S
R
 
S
Q
 
K
Q
 
F
R
x
L
V
 
K
H
 
H
Y
 
W
T
 
D
Q
 
H
K
 
-
L
 
-
L
 
L
H
 
T
T
 
Q
M
 
V
P
 
K
K
 
K
P
 
P
T
 
V
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
A
x
Y
A
 
A
A
x
F
G
 
G
L
x
G
G
 
G
A
 
C
D
x
E
T
 
L
A
 
A
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
F
 
I
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
S
 
G
E
 
E
H
 
K
A
 
A
S
 
Q
F
 
F
S
 
A
W
 
Q
S
x
P
Y
x
E
I
 
I
N
 
L
R
 
I
G
 
G
L
x
T
I
 
I
P
|
P
D
x
G
G
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
T
Y
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
R
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
K
A
 
S
K
 
L
A
 
A
K
 
M
E
 
E
L
 
M
V
 
V
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
D
K
 
R
V
 
I
A
 
S
I
 
A
E
 
Q
E
 
D
A
 
A
K
 
K
E
 
Q
I
 
A
G
 
G
I
 
L
V
 
V
D
 
S
R
 
K
V
 
I
S
 
C
H
 
P
A
 
V
D
 
E
S
 
T
L
 
L
V
 
V
A
 
E
D
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
W
 
C
A
 
A
K
 
E
E
 
K
L
 
I
S
 
A
Q
 
S
G
 
N
S
 
S
P
 
K
T
 
I
A
 
V
I
 
V
A
 
A
L
 
M
G
 
A
K
 
K
T
 
E
I
 
S
M
 
V
N
 
N
Q
 
A
S
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
M
P
 
T
A
 
-
D
 
-
Q
 
-
I
 
-
F
 
L
A
 
T
Q
 
E
G
 
G
S
 
S
Q
x
K
A
 
L
Q
 
E
G
 
K
I
 
K
C
 
L
Y
 
F
T
 
Y
S
 
S
A
 
T
-
x
F
-
 
A
-
 
T
-
 
D
E
 
D
H
 
R
R
 
K
E
 
E
S
 
G
V
 
M
L
 
T
A
 
A
F
 
F
L
 
V
N
 
E
K
 
K

Q5HH38 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase; DHNA-CoA synthase; EC 4.1.3.36 from Staphylococcus aureus (strain COL) (see paper)
33% identity, 98% coverage: 1:259/264 of query aligns to 9:261/273 of Q5HH38

query
sites
Q5HH38
M
 
L
E
 
R
N
 
E
Y
 
Y
S
 
D
L
 
E
I
 
I
E
 
K
L
 
Y
K
 
E
Y
 
F
E
 
Y
S
 
E
G
 
G
V
 
I
A
 
A
V
 
K
I
 
V
A
 
T
L
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
E
K
 
V
R
|
R
N
 
N
A
 
A
M
 
F
S
 
T
D
 
P
D
 
K
M
 
T
R
 
V
T
 
A
E
 
E
F
 
M
I
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
F
E
 
S
R
 
R
V
 
A
A
 
R
A
 
D
D
 
D
K
 
Q
A
 
N
V
 
V
R
 
S
A
 
V
L
 
I
V
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
E
G
 
G
K
 
D
-
 
L
G
 
A
F
 
F
C
 
C
A
x
S
G
|
G
G
|
G
D
|
D
V
 
-
S
 
-
G
 
-
M
x
Q
K
 
K
R
 
K
R
 
R
M
 
-
E
 
-
A
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
G
E
 
H
V
 
G
G
 
G
F
 
Y
N
 
V
G
 
G
W
 
E
S
 
D
R
 
Q
Q
 
I
Q
 
P
R
 
R
V
 
L
H
 
N
Y
 
V
T
 
L
-
 
D
-
 
L
Q
 
Q
K
 
R
L
 
L
L
 
I
H
 
R
T
 
I
M
 
I
P
 
P
K
 
K
P
 
P
T
 
V
V
 
I
A
 
A
A
 
M
V
 
V
N
 
K
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
A
 
V
G
 
G
L
 
G
G
 
G
A
 
N
D
 
V
T
 
L
A
 
N
L
 
V
C
 
V
C
 
C
D
 
D
F
 
L
V
 
T
I
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
D
H
 
N
A
 
A
S
 
I
F
 
F
S
 
G
W
 
Q
S
 
T
Y
 
G
I
 
P
N
 
K
R
 
V
G
 
G
L
x
S
I
 
F
P
 
D
D
 
A
G
 
G
G
 
Y
G
 
G
M
 
S
Y
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
A
R
 
R
R
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
H
A
 
K
K
 
K
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
I
V
 
W
F
 
Y
T
 
L
G
 
C
R
 
R
K
 
Q
V
 
Y
A
 
N
I
 
A
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
K
 
L
E
 
D
I
 
M
G
 
G
I
 
L
V
 
V
D
 
N
R
 
T
V
 
V
S
 
V
H
 
P
A
 
L
D
 
E
S
 
K
L
 
V
V
 
E
A
 
D
D
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
W
 
W
A
 
C
K
 
K
E
 
E
L
 
I
S
 
M
Q
 
K
G
 
H
S
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
A
I
 
L
A
 
R
L
 
F
G
 
L
K
 
K
T
 
A
I
 
A
M
 
M
N
 
N
Q
 
A
S
 
D
Y
 
T
E
 
D
-
 
G
L
 
L
P
 
A
A
 
G
D
 
L
Q
 
Q
I
 
Q
F
 
M
A
 
A
Q
 
-
G
 
-
S
 
G
Q
 
D
A
 
A
Q
 
T
G
 
L
I
 
L
C
 
Y
Y
 
Y
T
 
T
S
 
T
A
 
D
E
 
E
H
 
A
R
 
K
E
 
E
S
 
G
V
 
R
L
 
D
A
 
A
F
 
F
L
 
K
N
 
E
K
 
K

3h81A Crystal structure of enoyl-coa hydratase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
32% identity, 98% coverage: 3:261/264 of query aligns to 1:250/256 of 3h81A

query
sites
3h81A
N
 
T
Y
 
Y
S
 
E
L
 
T
I
 
I
E
 
L
L
 
V
K
 
E
Y
 
R
E
 
D
S
 
Q
G
 
R
V
 
V
A
 
G
V
 
I
I
 
I
A
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
Q
K
 
A
R
 
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
S
 
N
D
 
S
D
 
Q
M
 
V
R
 
M
T
 
N
E
 
E
F
 
V
I
 
T
D
 
S
A
 
A
L
 
A
E
 
T
R
 
E
V
 
L
A
 
D
A
 
D
D
 
D
K
 
P
A
 
D
V
 
I
R
 
G
A
 
A
L
 
I
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
N
 
S
G
 
A
K
 
K
G
 
A
F
 
F
C
 
A
A
 
A
G
 
G
G
x
A
D
 
D
V
 
I
S
 
K
G
 
E
M
|
M
K
 
A
R
 
D
R
 
L
M
 
T
E
 
F
A
 
A
P
 
D
Q
 
A
G
 
F
E
x
T
V
 
A
G
 
D
F
 
F
N
x
F
G
 
A
-
 
T
W
 
W
S
 
G
R
 
K
Q
 
-
Q
 
-
R
 
-
V
 
-
H
 
-
Y
 
-
T
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
-
L
 
L
H
 
A
T
 
A
M
 
V
P
 
R
K
 
T
P
 
P
T
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
 
G
L
x
G
G
 
G
A
 
C
D
x
E
T
 
L
A
 
A
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
F
 
V
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
D
H
 
T
A
 
A
S
 
K
F
 
F
S
 
G
W
 
Q
S
x
P
Y
x
E
I
 
I
N
 
K
R
 
L
G
 
G
L
x
V
I
 
L
P
|
P
D
x
G
G
 
M
G
 
G
G
 
G
M
 
S
Y
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
R
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
M
E
 
D
L
 
L
V
 
I
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
K
 
T
V
 
M
A
 
D
I
 
A
E
 
A
E
 
E
A
 
A
K
 
E
E
x
R
I
x
S
G
 
G
I
 
L
V
 
V
D
 
S
R
 
R
V
 
V
S
 
V
H
 
P
A
 
A
D
 
D
S
 
D
L
 
L
V
 
L
A
 
T
D
 
E
A
 
A
V
 
R
A
 
A
W
 
T
A
 
A
K
 
T
E
 
T
L
 
I
S
 
S
Q
 
Q
G
 
M
S
 
S
P
 
A
T
 
S
A
 
A
I
 
A
A
 
R
L
 
M
G
 
A
K
 
K
T
 
E
I
 
A
M
 
V
N
 
N
Q
 
R
S
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
S
P
 
S
A
 
L
D
 
S
Q
 
E
I
 
G
F
 
L
A
x
L
Q
 
Y
G
 
E
S
 
R
Q
 
R
A
 
L
Q
 
F
G
 
H
I
 
S
C
 
A
Y
x
F
T
 
A
S
 
T
A
 
E
E
 
D
H
x
Q
R
 
S
E
 
E
S
 
G
V
 
M
L
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
I
N
 
E
K
 
K
L
 
R
A
 
A

3q0jA Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase in complex with the inhibitor acetoacetylcoa
32% identity, 98% coverage: 3:261/264 of query aligns to 2:251/255 of 3q0jA

query
sites
3q0jA
N
 
T
Y
 
Y
S
 
E
L
 
T
I
 
I
E
 
L
L
 
V
K
 
E
Y
 
R
E
 
D
S
 
Q
G
 
R
V
 
V
A
 
G
V
 
I
I
 
I
A
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
Q
K
 
A
R
 
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
S
 
N
D
 
S
D
 
Q
M
 
V
R
 
M
T
 
N
E
 
E
F
 
V
I
 
T
D
 
S
A
 
A
L
 
A
E
 
T
R
 
E
V
 
L
A
 
D
A
 
D
D
 
D
K
 
P
A
 
D
V
 
I
R
 
G
A
 
A
L
 
I
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
N
 
S
G
 
A
K
 
K
G
 
A
F
 
F
C
 
A
A
 
A
G
 
G
G
x
A
D
 
D
V
 
I
S
 
K
G
 
E
M
|
M
K
 
A
R
 
D
R
 
L
M
 
T
E
 
F
A
 
A
P
 
D
Q
 
A
G
 
F
E
x
T
V
 
A
G
 
D
F
 
F
N
x
F
G
 
A
-
 
T
W
 
W
S
 
G
R
 
K
Q
 
-
Q
 
-
R
 
-
V
 
-
H
 
-
Y
 
-
T
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
-
L
 
L
H
 
A
T
 
A
M
 
V
P
 
R
K
 
T
P
 
P
T
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
 
G
L
x
G
G
 
G
A
 
C
D
x
E
T
 
L
A
 
A
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
F
 
V
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
D
H
 
T
A
 
A
S
 
K
F
 
F
S
 
G
W
 
Q
S
x
P
Y
x
E
I
 
I
N
 
K
R
 
L
G
 
G
L
x
V
I
 
L
P
|
P
D
x
G
G
 
M
G
 
G
G
 
G
M
 
S
Y
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
R
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
M
E
 
D
L
 
L
V
 
I
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
K
 
T
V
 
M
A
 
D
I
 
A
E
 
A
E
 
E
A
 
A
K
 
E
E
 
R
I
 
S
G
 
G
I
 
L
V
 
V
D
 
S
R
 
R
V
 
V
S
 
V
H
 
P
A
 
A
D
 
D
S
 
D
L
 
L
V
 
L
A
 
T
D
 
E
A
 
A
V
 
R
A
 
A
W
 
T
A
 
A
K
 
T
E
 
T
L
 
I
S
 
S
Q
 
Q
G
 
M
S
 
S
P
 
A
T
 
S
A
 
A
I
 
A
A
 
R
L
 
M
G
 
A
K
 
K
T
 
E
I
 
A
M
 
V
N
 
N
Q
 
R
S
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
Q
 
-
I
 
-
F
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
S
S
 
S
Q
 
L
A
 
S
Q
 
E
G
 
G
I
 
L
C
x
L
Y
 
Y
-
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
L
-
 
F
-
 
H
-
 
S
-
 
A
-
x
F
T
 
A
S
 
T
A
 
E
E
 
D
H
 
Q
R
 
S
E
 
E
S
 
G
V
 
M
L
 
A
A
 
A
F
|
F
L
 
I
N
 
E
K
|
K
L
 
R
A
 
A

3q0gC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
32% identity, 98% coverage: 3:261/264 of query aligns to 2:251/255 of 3q0gC

query
sites
3q0gC
N
 
T
Y
 
Y
S
 
E
L
 
T
I
 
I
E
 
L
L
 
V
K
 
E
Y
 
R
E
 
D
S
 
Q
G
 
R
V
 
V
A
 
G
V
 
I
I
 
I
A
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
Q
K
x
A
R
x
L
N
 
N
A
|
A
M
 
L
S
 
N
D
 
S
D
 
Q
M
 
V
R
 
M
T
 
N
E
 
E
F
 
V
I
 
T
D
 
S
A
 
A
L
 
A
E
 
T
R
 
E
V
 
L
A
 
D
A
 
D
D
 
D
K
 
P
A
 
D
V
 
I
R
 
G
A
 
A
L
 
I
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
N
 
S
G
 
A
K
 
K
G
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
 
G
G
x
A
D
|
D
V
x
I
S
x
K
G
 
E
M
|
M
K
 
A
R
 
D
R
 
L
M
 
T
E
 
F
A
 
A
P
 
D
Q
 
A
G
 
F
E
x
T
V
 
A
G
 
D
F
 
F
N
x
F
G
 
A
-
 
T
W
 
W
S
 
G
R
 
K
Q
 
-
Q
 
-
R
 
-
V
 
-
H
 
-
Y
 
-
T
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
-
L
 
L
H
 
A
T
 
A
M
 
V
P
 
R
K
 
T
P
 
P
T
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
A
G
 
G
A
x
Y
A
 
A
A
 
L
G
 
G
L
x
G
G
 
G
A
 
C
D
x
E
T
 
L
A
 
A
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
F
 
V
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
D
H
 
T
A
 
A
S
 
K
F
 
F
S
 
G
W
 
Q
S
x
P
Y
x
E
I
 
I
N
 
K
R
x
L
G
 
G
L
x
V
I
 
L
P
|
P
D
x
G
G
 
M
G
 
G
G
 
G
M
 
S
Y
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
R
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
M
E
 
D
L
 
L
V
 
I
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
K
 
T
V
 
M
A
 
D
I
 
A
E
 
A
E
 
E
A
 
A
K
 
E
E
 
R
I
 
S
G
 
G
I
 
L
V
 
V
D
 
S
R
 
R
V
 
V
S
 
V
H
 
P
A
 
A
D
 
D
S
 
D
L
 
L
V
 
L
A
 
T
D
 
E
A
 
A
V
 
R
A
 
A
W
 
T
A
 
A
K
 
T
E
 
T
L
 
I
S
 
S
Q
 
Q
G
 
M
S
 
S
P
 
A
T
 
S
A
 
A
I
 
A
A
 
R
L
 
M
G
 
A
K
 
K
T
 
E
I
 
A
M
 
V
N
 
N
Q
 
R
S
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
Q
 
-
I
 
-
F
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
S
S
 
S
Q
 
L
A
 
S
Q
 
E
G
 
G
I
 
L
C
x
L
Y
 
Y
-
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
L
-
 
F
-
 
H
-
 
S
-
 
A
-
x
F
T
 
A
S
 
T
A
 
E
E
 
D
H
 
Q
R
 
S
E
 
E
S
 
G
V
 
M
L
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
I
N
 
E
K
 
K
L
 
R
A
 
A

2uzfA Crystal structure of staphylococcus aureus 1,4-dihydroxy-2- naphthoyl coa synthase (menb) in complex with acetoacetyl coa (see paper)
33% identity, 98% coverage: 1:259/264 of query aligns to 4:248/260 of 2uzfA

query
sites
2uzfA
M
 
L
E
 
R
N
 
E
Y
 
Y
S
 
D
L
 
E
I
 
I
E
 
K
L
 
Y
K
 
E
Y
 
F
E
 
Y
S
 
E
G
 
G
V
 
I
A
 
A
V
 
K
I
 
V
A
 
T
L
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
|
E
K
x
V
R
|
R
N
 
N
A
|
A
M
 
F
S
 
T
D
 
P
D
 
K
M
 
T
R
 
V
T
 
A
E
 
E
F
 
M
I
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
F
E
 
S
R
 
R
V
 
A
A
 
R
A
 
D
D
 
D
K
 
Q
A
 
N
V
 
V
R
 
S
A
 
V
L
 
I
V
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
E
G
 
G
K
 
D
-
 
L
G
 
A
F
 
F
C
 
C
A
x
S
G
|
G
G
|
G
D
|
D
V
 
Q
S
 
K
G
 
G
M
 
E
K
 
D
R
 
-
R
 
-
M
 
-
E
 
Q
A
 
I
P
 
P
Q
x
R
G
 
-
E
 
-
V
 
-
G
 
-
F
 
-
N
 
-
G
 
-
W
 
-
S
 
-
R
 
-
Q
 
-
Q
 
L
R
 
N
V
 
V
H
x
L
Y
 
D
T
 
L
Q
 
Q
K
 
R
L
 
L
L
 
I
H
 
R
T
 
I
M
 
I
P
 
P
K
 
K
P
 
P
T
 
V
V
 
I
A
 
A
A
 
M
V
 
V
N
 
K
G
 
G
A
x
Y
A
 
A
A
 
V
G
 
G
L
x
G
G
 
G
A
 
N
D
x
V
T
 
L
A
 
N
L
 
V
C
 
V
C
 
C
D
 
D
F
 
L
V
 
T
I
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
D
H
 
N
A
 
A
S
 
I
F
 
F
S
 
G
W
 
Q
S
x
T
Y
x
G
I
 
P
N
 
K
R
x
V
G
 
G
L
x
S
I
 
F
P
x
D
D
x
A
G
 
G
G
 
Y
G
 
G
M
 
S
Y
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
A
R
 
R
R
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
H
A
 
K
K
 
K
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
I
V
 
W
F
 
Y
T
 
L
G
 
C
R
 
R
K
 
Q
V
 
Y
A
 
N
I
 
A
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
K
 
L
E
 
D
I
 
M
G
 
G
I
 
L
V
 
V
D
 
N
R
 
T
V
 
V
S
 
V
H
 
P
A
 
L
D
 
E
S
 
K
L
 
V
V
 
E
A
 
D
D
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
W
 
W
A
 
C
K
 
K
E
 
E
L
 
I
S
 
M
Q
 
K
G
 
H
S
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
A
I
 
L
A
 
R
L
 
F
G
 
L
K
 
K
T
 
A
I
 
A
M
 
M
N
 
N
Q
 
A
S
 
D
Y
 
T
E
 
D
-
 
G
L
 
L
P
 
A
A
 
G
D
 
L
Q
 
Q
I
 
Q
F
 
M
A
|
A
Q
 
-
G
 
-
S
 
G
Q
 
D
A
 
A
Q
 
T
G
 
L
I
 
L
C
 
Y
Y
|
Y
T
 
T
S
 
T
A
 
D
E
 
E
H
 
A
R
 
K
E
 
E
S
 
G
V
 
R
L
 
D
A
 
A
F
 
F
L
 
K
N
 
E
K
 
K

3q0gD Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
32% identity, 98% coverage: 3:261/264 of query aligns to 1:246/250 of 3q0gD

query
sites
3q0gD
N
 
T
Y
 
Y
S
 
E
L
 
T
I
 
I
E
 
L
L
 
V
K
 
E
Y
 
R
E
 
D
S
 
Q
G
 
R
V
 
V
A
 
G
V
 
I
I
 
I
A
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
Q
K
 
A
R
 
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
S
 
N
D
 
S
D
 
Q
M
 
V
R
 
M
T
 
N
E
 
E
F
 
V
I
 
T
D
 
S
A
 
A
L
 
A
E
 
T
R
 
E
V
 
L
A
 
D
A
 
D
D
 
D
K
 
P
A
 
D
V
 
I
R
 
G
A
 
A
L
 
I
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
N
 
S
G
 
A
K
 
K
G
 
A
F
 
F
C
 
A
A
 
A
G
 
G
G
x
A
D
 
D
V
 
I
S
 
K
G
 
E
M
|
M
K
 
-
R
 
-
R
 
F
M
 
A
E
 
D
A
 
A
P
 
F
Q
x
T
G
 
A
E
 
D
V
 
F
G
 
-
F
|
F
N
 
A
G
 
T
W
 
W
S
 
G
R
 
K
Q
 
-
Q
 
-
R
 
-
V
 
-
H
 
-
Y
 
-
T
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
-
L
 
L
H
 
A
T
 
A
M
 
V
P
 
R
K
 
T
P
 
P
T
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
 
G
L
x
G
G
 
G
A
 
C
D
x
E
T
 
L
A
 
A
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
F
 
V
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
D
H
 
T
A
 
A
S
 
K
F
 
F
S
 
G
W
 
Q
S
x
P
Y
x
E
I
 
I
N
 
K
R
 
L
G
 
G
L
x
V
I
 
L
P
|
P
D
x
G
G
 
M
G
 
G
G
 
G
M
 
S
Y
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
R
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
M
E
 
D
L
 
L
V
 
I
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
K
 
T
V
 
M
A
 
D
I
 
A
E
 
A
E
 
E
A
 
A
K
 
E
E
 
R
I
 
S
G
 
G
I
 
L
V
 
V
D
 
S
R
 
R
V
 
V
S
 
V
H
 
P
A
 
A
D
 
D
S
 
D
L
 
L
V
 
L
A
 
T
D
 
E
A
 
A
V
 
R
A
 
A
W
 
T
A
 
A
K
 
T
E
 
T
L
 
I
S
 
S
Q
 
Q
G
 
M
S
 
S
P
 
A
T
 
S
A
 
A
I
 
A
A
 
R
L
 
M
G
 
A
K
 
K
T
 
E
I
 
A
M
 
V
N
 
N
Q
 
R
S
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
Q
 
-
I
 
-
F
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
S
S
 
S
Q
 
L
A
 
S
Q
 
E
G
 
G
I
 
L
C
x
L
Y
 
Y
-
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
L
-
x
F
-
 
H
-
 
S
-
 
A
-
x
F
T
 
A
S
 
T
A
 
E
E
 
D
H
 
Q
R
 
S
E
 
E
S
 
G
V
 
M
L
 
A
A
 
A
F
|
F
L
 
I
N
 
E
K
|
K
L
 
R
A
 
A

Q62651 Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial; EC 5.3.3.- from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
33% identity, 81% coverage: 2:214/264 of query aligns to 52:271/327 of Q62651

query
sites
Q62651
E
 
H
N
 
N
Y
 
Y
S
 
E
L
 
S
I
 
I
E
 
Q
L
 
V
K
 
T
Y
 
S
-
 
A
E
 
Q
S
 
K
G
 
H
V
 
V
A
 
L
V
 
H
I
 
V
A
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
E
K
 
K
R
 
R
N
 
N
A
 
A
M
 
M
S
 
N
D
 
R
D
 
A
M
 
F
R
 
W
T
 
R
E
 
E
F
 
L
I
 
V
D
 
E
A
 
C
L
 
F
E
 
Q
R
 
K
V
 
I
A
 
S
A
 
K
D
 
D
K
 
S
A
 
D
V
 
C
R
 
R
A
 
A
L
 
V
V
 
V
I
 
V
T
 
S
G
 
G
N
 
A
G
 
G
K
 
K
G
 
M
F
 
F
C
 
T
A
 
S
G
 
G
G
 
I
D
 
D
V
 
L
S
 
M
G
 
D
M
 
M
K
 
A
R
 
S
R
 
D
M
 
I
E
 
L
A
 
Q
P
 
P
Q
 
P
G
 
G
-
 
D
E
 
D
V
 
V
G
 
A
F
 
R
N
 
I
G
 
A
W
 
W
S
 
Y
R
 
L
Q
 
R
Q
 
D
R
 
L
V
 
I
H
 
S
Y
 
R
T
 
Y
Q
 
Q
K
 
K
-
 
T
-
 
F
-
 
T
L
 
V
L
 
I
H
 
E
T
 
K
M
 
C
P
 
P
K
 
K
P
 
P
T
 
V