SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS23505 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS23505 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2xsrA Crystal structure of wild type acinetobacter radioresistens catechol 1,2 dioxygenase (see paper)
65% identity, 99% coverage: 5:304/304 of query aligns to 8:309/309 of 2xsrA

query
sites
2xsrA
E
 
Q
I
 
I
E
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
V
K
 
K
A
 
Q
F
 
M
I
 
N
L
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
A
S
 
K
G
 
G
K
 
P
A
 
V
D
 
D
A
 
E
R
 
R
V
 
I
Q
 
Q
S
 
Q
V
 
V
V
 
V
V
 
V
R
 
R
L
 
L
T
 
L
T
 
G
D
 
D
L
 
L
F
 
F
K
 
Q
A
 
A
I
 
I
E
 
E
D
 
D
L
 
L
D
 
D
L
 
I
S
 
Q
A
 
P
S
 
S
E
 
E
V
 
V
W
 
W
K
 
K
G
 
G
I
 
L
E
 
E
Y
|
Y
F
x
L
A
 
T
E
x
D
A
 
A
G
 
G
P
 
Q
-
 
A
-
 
N
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
|
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
R
 
H
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
I
 
L
R
 
R
A
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
D
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
E
S
 
S
E
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
L
 
M
D
 
D
D
 
D
G
 
G
S
 
S
E
 
E
D
 
S
G
 
D
Q
 
K
G
 
V
E
 
D
V
 
T
L
 
L
F
 
I
M
 
I
Q
 
E
G
 
G
T
 
T
V
 
V
F
 
T
D
 
D
T
 
T
S
 
E
G
 
G
K
 
N
P
 
I
L
 
I
P
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
V
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
L
 
S
L
 
L
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
F
 
F
F
 
F
D
 
D
K
 
K
T
 
S
Q
 
Q
S
 
S
D
 
D
F
 
F
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
R
T
 
T
I
 
I
T
 
L
T
 
T
D
 
D
S
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
K
Y
 
Y
Q
 
V
F
 
A
R
 
L
S
 
T
I
 
T
V
 
M
P
 
P
M
 
V
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
Q
 
E
G
 
G
T
|
T
T
 
T
Q
 
Q
R
x
A
L
 
L
L
 
L
D
 
N
L
 
K
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
R
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
S
H
|
H
I
 
V
H
|
H
F
 
Y
F
 
F
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
G
 
G
H
 
Y
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
F
N
 
N
I
 
I
D
 
E
G
 
G
D
 
D
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
W
 
W
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
T
R
 
R
E
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
P
 
A
A
 
T
L
 
A
R
 
T
H
 
D
V
 
V
E
 
T
S
 
D
P
 
E
R
 
A
A
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
R
H
 
R
G
 
E
L
 
L
D
 
D
K
 
K
P
 
P
F
 
F
A
 
K
S
 
H
I
 
I
D
 
T
F
 
F
D
 
N
F
 
V
R
 
E
L
 
L
Y
 
V
A
 
K
D
 
E
C
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
A
P
 
P
V
 
S
P
 
S
E
 
E
V
 
V
E
 
E
R
 
R
T
 
R
R
 
R
A
 
A
A
 
S
A
 
A

2azqA Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase from pseudomonas arvilla c-1 (see paper)
57% identity, 95% coverage: 15:304/304 of query aligns to 19:305/309 of 2azqA

query
sites
2azqA
L
 
L
D
 
D
T
 
H
A
 
A
S
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
P
D
 
-
A
 
-
R
 
R
V
 
F
Q
 
K
S
 
Q
V
 
I
V
 
I
V
 
L
R
 
R
L
 
V
T
 
L
T
 
Q
D
 
D
L
 
T
F
 
A
K
 
R
A
 
L
I
 
I
E
 
E
D
 
D
L
 
L
D
 
E
L
 
I
S
 
T
A
 
E
S
 
D
E
 
E
V
 
F
W
 
W
K
 
H
G
 
A
I
 
V
E
 
D
Y
 
Y
F
 
L
A
 
N
E
 
R
A
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
R
P
 
N
E
 
E
L
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
I
E
 
E
R
 
H
F
 
F
L
 
L
D
 
D
I
 
L
R
 
L
A
 
Q
D
 
D
E
 
A
A
 
K
E
 
D
A
 
A
K
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
L
S
 
A
E
 
Q
G
 
G
F
 
E
A
 
V
R
 
R
L
 
M
D
 
D
D
 
D
G
 
G
S
 
T
E
 
D
D
 
-
G
 
-
Q
 
P
G
 
G
E
 
V
V
 
V
L
 
M
F
 
F
M
 
L
Q
 
Q
G
 
G
T
 
Q
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
A
S
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
P
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
T
V
 
V
E
 
D
V
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
L
 
T
L
 
Q
G
 
G
N
 
T
Y
|
Y
S
 
S
F
 
Y
F
 
F
D
 
D
K
 
S
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
D
 
E
F
 
F
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
R
T
 
R
I
 
I
T
 
I
T
 
T
D
 
D
S
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
R
F
 
A
R
 
R
S
 
S
I
 
I
V
 
V
P
 
P
M
 
S
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
D
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
T
 
P
T
 
T
Q
 
Q
R
 
E
L
 
C
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
R
 
Q
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
V
H
|
H
F
 
F
F
 
F
V
 
I
S
 
S
A
 
A
P
 
F
G
 
G
H
 
H
R
 
R
K
 
H
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
I
 
F
D
 
A
G
 
G
D
 
D
E
 
K
Y
 
Y
L
 
L
W
 
W
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
S
 
T
R
 
R
E
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
I
P
 
G
A
 
E
L
 
L
R
 
R
H
 
F
V
 
V
E
 
E
S
 
D
P
 
A
R
 
A
A
 
A
L
 
A
A
 
R
E
 
D
H
 
R
G
 
G
L
 
V
D
 
Q
-
 
G
K
 
E
P
 
R
F
 
F
A
 
A
S
 
E
I
 
L
D
 
S
F
 
F
D
 
D
F
 
F
R
 
R
L
 
L
Y
 
Q
A
 
G
D
 
-
C
 
-
A
 
A
A
 
Q
A
 
S
P
 
P
V
 
D
P
 
A
E
 
E
V
 
A
E
 
R
R
 
S
T
 
H
R
 
R
A
 
P
A
 
R
A
 
A

P07773 Catechol 1,2-dioxygenase; 1,2-CTD; EC 1.13.11.1 from Acinetobacter baylyi (strain ATCC 33305 / BD413 / ADP1) (see paper)
53% identity, 93% coverage: 23:304/304 of query aligns to 27:311/311 of P07773

query
sites
P07773
D
 
N
A
 
P
R
 
R
V
 
V
Q
 
K
S
 
Q
V
 
I
V
 
I
V
 
H
R
 
R
L
 
V
T
 
L
T
 
S
D
 
D
L
 
L
F
 
Y
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
E
D
 
D
L
 
L
D
 
N
L
 
I
S
 
T
A
 
S
S
 
D
E
 
E
V
 
Y
W
 
W
K
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
A
Y
 
Y
F
 
L
A
 
N
E
 
Q
A
 
L
G
 
G
-
 
A
-
 
N
P
 
Q
E
 
E
L
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
S
A
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
F
E
 
D
R
 
H
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
I
 
M
R
 
R
A
 
M
D
 
D
E
 
A
A
 
E
E
 
D
A
 
A
K
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
E
G
 
N
G
 
A
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
E
S
 
S
E
 
V
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
R
 
R
L
 
M
D
 
D
D
 
D
G
 
G
S
 
S
E
 
-
D
 
D
G
 
P
Q
 
N
G
 
G
E
 
H
V
 
T
L
 
L
F
 
I
M
 
L
Q
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
I
F
 
F
D
 
D
T
 
A
S
 
D
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
P
 
P
G
 
N
A
 
A
S
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
I
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
L
 
T
L
 
K
G
 
G
N
 
F
Y
|
Y
S
 
S
F
 
H
F
 
F
D
 
D
K
 
P
T
 
T
-
 
G
-
 
E
Q
 
Q
S
 
Q
D
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
M
R
 
R
R
 
R
T
 
S
I
 
I
T
 
I
T
 
T
D
 
D
S
 
E
E
 
N
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
Q
 
R
F
 
V
R
 
R
S
 
T
I
 
I
V
 
L
P
 
P
M
 
A
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
Q
 
E
G
 
G
T
 
P
T
 
T
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
N
L
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
R
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
|
I
H
|
H
F
 
Y
F
 
F
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
D
G
 
G
H
 
H
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
I
 
V
D
 
A
G
 
G
D
 
D
E
 
P
Y
 
Y
L
 
T
W
 
Y
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
S
 
T
R
 
R
E
 
E
G
 
G
L
 
L
-
 
V
V
 
V
P
 
D
A
 
A
L
 
V
R
 
E
H
 
H
V
 
T
E
 
D
S
 
-
P
 
P
R
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
K
E
 
A
H
 
N
G
 
D
L
 
V
D
 
E
K
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
A
S
 
E
I
 
M
D
 
V
F
 
F
D
 
D
F
 
L
R
 
K
L
 
L
Y
 
T
A
 
R
D
 
L
C
 
V
A
 
D
A
 
G
A
 
V
P
 
D
V
 
N
P
 
Q
E
 
V
V
 
V
E
 
D
R
 
R
T
 
P
R
 
R
A
 
L
A
 
A
A
 
V

1dmhA Structure of catechol 1,2-dioxygenase from acinetobacter sp. Adp1 with bound 4-methylcatechol (see paper)
53% identity, 93% coverage: 23:304/304 of query aligns to 25:309/309 of 1dmhA

query
sites
1dmhA
D
 
N
A
 
P
R
 
R
V
 
V
Q
 
K
S
 
Q
V
 
I
V
 
I
V
 
H
R
 
R
L
 
V
T
 
L
T
 
S
D
 
D
L
 
L
F
 
Y
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
E
D
 
D
L
 
L
D
 
N
L
 
I
S
 
T
A
 
S
S
 
D
E
 
E
V
 
Y
W
 
W
K
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
A
Y
 
Y
F
 
L
A
 
N
E
 
Q
A
 
L
G
 
G
-
 
A
-
 
N
P
 
Q
E
 
E
L
 
A
G
 
G
L
|
L
L
 
L
A
 
S
A
x
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
F
E
 
D
R
 
H
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
I
 
M
R
 
R
A
 
M
D
 
D
E
 
A
A
 
E
E
 
D
A
 
A
K
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
E
G
 
N
G
 
A
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
|
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
E
S
 
S
E
 
V
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
R
 
R
L
 
M
D
 
D
D
 
D
G
 
G
S
 
S
E
 
-
D
 
D
G
 
P
Q
 
N
G
 
G
E
 
H
V
 
T
L
 
L
F
 
I
M
 
L
Q
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
I
F
 
F
D
 
D
T
 
A
S
 
D
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
P
 
P
G
 
N
A
 
A
S
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
I
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
L
 
T
L
 
K
G
 
G
N
 
F
Y
|
Y
S
 
S
F
 
H
F
 
F
D
 
D
K
 
P
T
 
T
-
 
G
-
 
E
Q
 
Q
S
 
Q
D
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
M
R
 
R
R
 
R
T
 
S
I
 
I
T
 
I
T
 
T
D
 
D
S
 
E
E
 
N
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
Q
 
R
F
 
V
R
 
R
S
 
T
I
 
I
V
 
L
P
 
P
M
 
A
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
Q
 
E
G
 
G
T
 
P
T
 
T
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
N
L
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
R
 
N
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
I
H
|
H
F
 
Y
F
 
F
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
D
G
 
G
H
 
H
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
I
 
V
D
 
A
G
 
G
D
 
D
E
 
P
Y
 
Y
L
 
T
W
 
Y
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
S
 
T
R
 
R
E
 
E
G
 
G
L
 
L
-
 
V
V
 
V
P
 
D
A
 
A
L
 
V
R
 
E
H
 
H
V
 
T
E
 
D
S
 
-
P
 
P
R
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
K
E
 
A
H
 
N
G
 
D
L
 
V
D
 
E
K
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
A
S
 
E
I
 
M
D
 
V
F
 
F
D
 
D
F
 
L
R
 
K
L
 
L
Y
 
T
A
 
R
D
 
L
C
 
V
A
 
D
A
 
G
A
 
V
P
 
D
V
 
N
P
 
Q
E
 
V
V
 
V
E
 
D
R
 
R
T
 
P
R
 
R
A
 
L
A
 
A
A
 
V

1dltA Structure of catechol 1,2-dioxygenase from acinetobacter sp. Adp1 with bound catechol (see paper)
53% identity, 93% coverage: 23:304/304 of query aligns to 25:309/309 of 1dltA

query
sites
1dltA
D
 
N
A
 
P
R
 
R
V
 
V
Q
 
K
S
 
Q
V
 
I
V
 
I
V
 
H
R
 
R
L
 
V
T
 
L
T
 
S
D
 
D
L
 
L
F
 
Y
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
E
D
 
D
L
 
L
D
 
N
L
 
I
S
 
T
A
 
S
S
 
D
E
 
E
V
 
Y
W
 
W
K
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
A
Y
 
Y
F
 
L
A
 
N
E
 
Q
A
 
L
G
 
G
-
 
A
-
 
N
P
 
Q
E
 
E
L
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
S
A
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
F
E
 
D
R
 
H
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
I
 
M
R
 
R
A
 
M
D
 
D
E
 
A
A
 
E
E
 
D
A
 
A
K
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
E
G
 
N
G
 
A
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
E
S
 
S
E
 
V
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
R
 
R
L
 
M
D
 
D
D
 
D
G
 
G
S
 
S
E
 
-
D
 
D
G
 
P
Q
 
N
G
 
G
E
 
H
V
 
T
L
 
L
F
 
I
M
 
L
Q
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
I
F
 
F
D
 
D
T
 
A
S
 
D
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
P
 
P
G
 
N
A
 
A
S
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
I
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
L
 
T
L
 
K
G
 
G
N
 
F
Y
|
Y
S
 
S
F
 
H
F
 
F
D
 
D
K
 
P
T
 
T
-
 
G
-
 
E
Q
 
Q
S
 
Q
D
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
M
R
 
R
R
 
R
T
 
S
I
 
I
T
 
I
T
 
T
D
 
D
S
 
E
E
 
N
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
Q
 
R
F
 
V
R
 
R
S
 
T
I
 
I
V
 
L
P
 
P
M
 
A
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
Q
 
E
G
 
G
T
 
P
T
 
T
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
N
L
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
R
 
N
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
I
H
|
H
F
 
Y
F
 
F
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
D
G
 
G
H
 
H
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
I
 
V
D
 
A
G
 
G
D
 
D
E
 
P
Y
 
Y
L
 
T
W
 
Y
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
S
 
T
R
 
R
E
 
E
G
 
G
L
 
L
-
 
V
V
 
V
P
 
D
A
 
A
L
 
V
R
 
E
H
 
H
V
 
T
E
 
D
S
 
-
P
 
P
R
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
K
E
 
A
H
 
N
G
 
D
L
 
V
D
 
E
K
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
A
S
 
E
I
 
M
D
 
V
F
 
F
D
 
D
F
 
L
R
 
K
L
 
L
Y
 
T
A
 
R
D
 
L
C
 
V
A
 
D
A
 
G
A
 
V
P
 
D
V
 
N
P
 
Q
E
 
V
V
 
V
E
 
D
R
 
R
T
 
P
R
 
R
A
 
L
A
 
A
A
 
V

1dlmA Structure of catechol 1,2-dioxygenase from acinetobacter calcoaceticus native data (see paper)
53% identity, 93% coverage: 23:304/304 of query aligns to 25:309/309 of 1dlmA

query
sites
1dlmA
D
 
N
A
 
P
R
 
R
V
 
V
Q
 
K
S
 
Q
V
 
I
V
 
I
V
 
H
R
 
R
L
 
V
T
 
L
T
 
S
D
 
D
L
 
L
F
 
Y
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
E
D
 
D
L
 
L
D
 
N
L
 
I
S
 
T
A
 
S
S
 
D
E
 
E
V
 
Y
W
 
W
K
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
A
Y
 
Y
F
 
L
A
 
N
E
 
Q
A
 
L
G
 
G
-
 
A
-
 
N
P
 
Q
E
 
E
L
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
S
A
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
F
E
 
D
R
 
H
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
I
 
M
R
 
R
A
 
M
D
 
D
E
 
A
A
 
E
E
 
D
A
 
A
K
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
E
G
 
N
G
 
A
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
E
S
 
S
E
 
V
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
R
 
R
L
 
M
D
 
D
D
 
D
G
 
G
S
 
S
E
 
-
D
 
D
G
 
P
Q
 
N
G
 
G
E
 
H
V
 
T
L
 
L
F
 
I
M
 
L
Q
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
I
F
 
F
D
 
D
T
 
A
S
 
D
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
P
 
P
G
 
N
A
 
A
S
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
I
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
L
 
T
L
 
K
G
 
G
N
 
F
Y
|
Y
S
 
S
F
 
H
F
 
F
D
 
D
K
 
P
T
 
T
-
 
G
-
 
E
Q
 
Q
S
 
Q
D
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
M
R
 
R
R
 
R
T
 
S
I
 
I
T
 
I
T
 
T
D
 
D
S
 
E
E
 
N
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
Q
 
R
F
 
V
R
 
R
S
 
T
I
 
I
V
 
L
P
 
P
M
 
A
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
Q
 
E
G
 
G
T
 
P
T
 
T
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
N
L
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
R
 
N
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
I
H
|
H
F
 
Y
F
 
F
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
D
G
 
G
H
 
H
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
I
 
V
D
 
A
G
 
G
D
 
D
E
 
P
Y
 
Y
L
 
T
W
 
Y
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
S
 
T
R
 
R
E
 
E
G
 
G
L
 
L
-
 
V
V
 
V
P
 
D
A
 
A
L
 
V
R
 
E
H
 
H
V
 
T
E
 
D
S
 
-
P
 
P
R
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
K
E
 
A
H
 
N
G
 
D
L
 
V
D
 
E
K
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
A
S
 
E
I
 
M
D
 
V
F
 
F
D
 
D
F
 
L
R
 
K
L
 
L
Y
 
T
A
 
R
D
 
L
C
 
V
A
 
D
A
 
G
A
 
V
P
 
D
V
 
N
P
 
Q
E
 
V
V
 
V
E
 
D
R
 
R
T
 
P
R
 
R
A
 
L
A
 
A
A
 
V

5umhB Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase protein from burkholderia multivorans
52% identity, 99% coverage: 5:304/304 of query aligns to 9:308/310 of 5umhB

query
sites
5umhB
E
 
E
I
 
V
E
 
Q
A
 
D
L
 
L
V
 
L
K
 
K
A
 
A
F
 
-
I
 
A
L
 
A
D
 
N
T
 
L
A
 
N
S
 
G
G
 
D
K
 
A
A
 
G
D
 
N
A
 
A
R
 
R
V
 
F
Q
 
R
S
 
Q
V
 
I
V
 
V
V
 
H
R
 
R
L
 
L
T
 
L
T
 
S
D
 
D
L
 
L
F
 
F
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
D
L
 
I
S
 
T
A
 
P
S
 
D
E
 
E
V
 
V
W
 
W
K
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
N
Y
 
Y
F
 
L
A
 
N
E
 
K
A
 
L
G
 
G
P
 
Q
-
 
D
-
 
G
E
 
E
L
 
A
G
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
R
 
K
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
I
 
I
R
 
R
A
 
M
D
 
D
E
 
A
A
 
A
E
 
D
A
 
R
K
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
V
S
 
R
E
 
D
G
 
G
F
 
V
A
 
A
R
 
K
L
 
I
D
 
D
D
 
-
G
 
L
S
 
D
E
 
D
D
 
D
G
 
A
Q
 
D
G
 
A
E
 
G
V
 
P
L
 
L
F
 
V
M
 
I
Q
 
R
G
 
G
T
 
T
V
 
V
F
 
T
D
 
G
T
 
T
S
 
D
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
P
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
C
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
L
 
S
L
 
K
G
 
G
N
 
F
Y
|
Y
S
 
S
F
 
H
F
 
F
D
 
D
K
 
P
T
 
T
-
 
G
-
 
A
Q
 
Q
S
 
T
D
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
T
 
A
I
 
V
T
 
R
T
 
T
D
 
D
S
 
A
E
 
N
G
 
G
R
 
K
Y
 
Y
Q
 
E
F
 
F
R
 
R
S
 
T
I
 
L
V
 
M
P
 
P
M
 
V
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
T
 
A
T
 
T
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
N
L
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
R
 
N
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
V
H
|
H
F
 
F
F
 
F
V
 
V
S
 
S
A
 
G
P
 
D
G
 
G
H
 
H
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
F
N
 
N
I
 
I
D
 
E
G
 
G
D
 
D
E
 
P
Y
 
L
L
 
I
W
 
W
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
S
 
T
R
 
R
E
 
E
G
 
E
L
 
L
V
 
I
P
 
P
A
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
H
V
 
V
E
 
V
S
 
D
P
 
K
R
 
T
A
 
G
L
 
G
A
 
A
E
 
A
H
 
L
G
 
G
L
 
M
D
 
K
K
 
S
-
 
D
P
 
A
F
 
Y
A
 
K
S
 
E
I
 
I
D
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
I
R
 
V
L
 
L
Y
 
T
A
 
P
D
 
L
C
 
L
A
 
D
A
 
G
A
 
R
P
 
D
V
 
N
P
 
Q
E
 
V
V
 
V
E
 
H
R
 
R
T
 
P
R
 
R
A
 
A
A
 
S
A
 
A

5td3A Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase from burkholderia vietnamiensis
51% identity, 98% coverage: 5:303/304 of query aligns to 8:306/307 of 5td3A

query
sites
5td3A
E
 
E
I
 
V
E
 
Q
A
 
D
L
 
L
V
 
L
K
 
K
A
 
A
F
 
A
I
 
S
L
 
S
D
 
A
T
 
N
A
 
A
S
 
S
G
 
-
K
 
T
A
 
G
D
 
D
A
 
A
R
 
R
V
 
T
Q
 
Q
S
 
Q
V
 
I
V
 
V
V
 
L
R
 
R
L
 
L
T
 
L
T
 
G
D
 
D
L
 
L
F
 
F
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
D
L
 
I
S
 
T
A
 
P
S
 
D
E
 
E
V
 
V
W
 
W
K
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
N
Y
 
Y
F
 
L
A
 
N
E
 
K
A
 
L
G
 
G
P
 
Q
E
 
D
L
 
G
G
 
E
L
 
A
L
 
A
A
 
L
A
 
L
G
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
G
-
 
L
-
 
E
R
 
K
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
I
 
I
R
 
R
A
 
M
D
 
D
E
 
A
A
 
A
E
 
D
A
 
A
K
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
V
S
 
R
E
 
D
G
 
G
F
 
V
A
 
A
R
 
K
L
 
I
D
 
D
D
 
L
G
 
D
S
 
A
E
 
D
D
 
A
G
 
G
Q
 
A
G
 
G
E
 
P
V
 
-
L
 
L
F
 
V
M
 
I
Q
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
V
F
 
K
D
 
D
T
 
L
S
 
D
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
V
P
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
C
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
L
 
S
L
 
H
G
 
G
N
 
F
Y
|
Y
S
 
S
F
 
H
F
 
F
D
 
D
K
 
P
T
 
T
-
 
G
-
 
A
Q
 
Q
S
 
R
D
 
D
F
 
F
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
T
 
A
I
 
V
T
 
R
T
 
T
D
 
G
S
 
A
E
 
D
G
 
G
R
 
T
Y
 
Y
Q
 
A
F
 
F
R
 
R
S
 
T
I
 
L
V
 
M
P
 
P
M
 
V
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
T
 
A
T
 
T
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
R
 
N
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
V
H
|
H
F
 
F
F
 
F
V
 
V
S
 
T
A
 
S
P
 
D
G
 
G
H
 
H
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
F
N
 
N
I
 
I
D
 
E
G
 
G
D
 
D
E
 
P
Y
 
L
L
 
I
W
 
W
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
S
 
T
R
 
R
E
 
E
G
 
E
L
 
L
V
 
I
P
 
P
A
 
P
L
 
V
R
 
T
H
 
T
V
 
K
E
 
T
S
 
G
P
 
G
R
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
G
E
 
L
H
 
K
G
 
A
L
 
-
D
 
-
K
 
D
P
 
A
F
 
Y
A
 
Q
S
 
D
I
 
I
D
 
T
F
 
F
D
 
D
F
 
F
R
 
V
L
 
L
Y
 
T
A
 
P
D
 
R
C
 
V
A
 
G
A
 
G
A
 
A
P
 
D
V
 
N
P
 
Q
E
 
I
V
 
V
E
 
E
R
 
R
T
 
P
R
 
R
A
 
A
A
 
S

5vxtB Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase from burkholderia ambifaria
51% identity, 92% coverage: 25:304/304 of query aligns to 31:311/312 of 5vxtB

query
sites
5vxtB
R
 
R
V
 
T
Q
 
Q
S
 
Q
V
 
I
V
 
V
V
 
H
R
 
R
L
 
L
T
 
L
T
 
G
D
 
D
L
 
L
F
 
F
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
D
L
 
I
S
 
T
A
 
P
S
 
D
E
 
E
V
 
V
W
 
W
K
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
N
Y
 
Y
F
 
L
A
 
N
E
 
K
A
 
L
G
 
G
P
 
Q
E
 
D
L
 
G
G
 
E
L
 
A
L
 
A
A
 
L
A
 
L
G
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
G
-
 
L
-
 
E
R
 
K
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
I
 
I
R
 
R
A
 
M
D
 
D
E
 
A
A
 
E
E
 
D
A
 
E
K
 
A
A
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
|
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
V
S
 
R
E
 
D
G
 
G
F
 
V
A
 
A
R
 
K
L
 
I
D
 
D
D
 
L
G
 
D
S
 
A
E
 
D
D
 
E
G
 
G
Q
 
A
G
 
G
E
 
P
V
 
-
L
 
L
F
 
V
M
 
I
Q
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
V
F
 
T
D
 
G
T
 
L
S
 
D
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
V
P
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
C
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
L
 
S
L
 
H
G
 
G
N
 
F
Y
|
Y
S
 
S
F
 
H
F
 
F
D
 
D
K
 
P
T
 
T
-
 
G
-
 
K
Q
 
Q
S
 
S
D
 
D
F
 
F
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
T
 
A
I
 
V
T
 
K
T
 
T
D
 
G
S
 
A
E
 
D
G
 
G
R
 
K
Y
 
Y
Q
 
E
F
 
F
R
 
R
S
 
T
I
 
L
V
 
M
P
 
P
M
 
V
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
T
 
A
T
 
T
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
R
 
N
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
V
H
|
H
F
 
F
F
 
F
V
 
V
S
 
T
A
 
S
P
 
D
G
 
G
H
 
H
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
F
N
 
N
I
 
I
D
 
E
G
 
G
D
 
D
E
 
P
Y
 
L
L
 
I
W
 
W
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
S
 
T
R
 
R
E
 
E
G
 
E
L
 
L
V
 
I
P
 
P
A
 
P
L
 
V
R
 
T
H
 
A
V
 
K
E
 
A
S
 
G
P
 
G
R
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
G
E
 
L
H
 
K
G
 
A
L
 
-
D
 
-
K
 
D
P
 
A
F
 
Y
A
 
Q
S
 
D
I
 
I
D
 
E
F
 
F
D
 
N
F
 
F
R
 
V
L
 
L
Y
 
T
A
 
P
D
 
R
C
 
V
A
 
E
A
 
G
A
 
K
P
 
D
V
 
N
P
 
Q
E
 
I
V
 
V
E
 
E
R
 
R
T
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
S
A
 
A

3i51A Crystal structure determination of catechol 1,2-dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with 4,5-dichlorocatechol (see paper)
38% identity, 61% coverage: 72:255/304 of query aligns to 53:234/256 of 3i51A

query
sites
3i51A
L
 
L
G
 
F
L
 
L
E
x
D
R
x
V
F
 
F
L
 
I
D
 
E
I
 
H
R
 
S
A
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
V
E
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
S
G
 
-
L
 
-
A
 
R
G
 
K
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
x
Y
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
G
 
N
A
 
S
P
 
P
A
 
E
S
 
L
E
 
P
G
 
S
F
 
K
A
 
C
R
 
T
L
 
L
D
 
P
D
 
M
G
 
R
S
 
E
E
 
E
D
 
D
G
 
E
Q
 
K
G
 
I
E
 
T
V
 
P
L
 
L
F
 
V
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
T
 
Q
V
 
V
F
 
T
D
 
D
T
 
L
S
 
D
G
 
G
K
 
N
P
 
G
L
 
L
P
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
D
L
 
N
L
 
D
G
 
G
N
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
F
 
Q
F
 
F
D
 
A
K
 
P
T
 
H
Q
 
L
S
 
P
D
 
E
F
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
T
 
T
I
 
I
T
 
I
T
 
A
D
 
D
S
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
E
F
 
I
R
 
T
S
 
T
I
 
I
V
 
Q
P
 
P
M
 
A
G
 
P
Y
|
Y
G
 
Q
C
 
I
P
 
P
P
 
T
Q
 
D
G
 
G
T
 
P
T
 
T
Q
 
G
R
 
Q
L
 
F
L
 
I
D
 
E
L
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
R
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
G
 
G
H
 
K
R
 
E
K
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
I
 
F
D
 
K
G
 
G
D
 
G
E
 
E
Y
 
W
L
 
I
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
F
 
S
A
 
A
S
 
T
R
 
K
E
 
P
G
 
E
L
 
L
V
 
I

3i4yA Crystal structure determination of catechol 1,2-dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with 3,5-dichlorocatechol (see paper)
38% identity, 61% coverage: 72:255/304 of query aligns to 53:234/256 of 3i4yA

query
sites
3i4yA
L
|
L
G
 
F
L
 
L
E
 
D
R
x
V
F
 
F
L
 
I
D
 
E
I
 
H
R
 
S
A
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
V
E
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
S
G
 
-
L
 
-
A
 
R
G
 
K
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
|
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
x
Y
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
G
 
N
A
 
S
P
 
P
A
 
E
S
 
L
E
 
P
G
 
S
F
 
K
A
 
C
R
 
T
L
 
L
D
 
P
D
 
M
G
 
R
S
 
E
E
 
E
D
 
D
G
 
E
Q
 
K
G
 
I
E
 
T
V
 
P
L
 
L
F
 
V
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
T
 
Q
V
 
V
F
 
T
D
 
D
T
 
L
S
 
D
G
 
G
K
 
N
P
 
G
L
 
L
P
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
D
L
 
N
L
 
D
G
 
G
N
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
F
 
Q
F
 
F
D
 
A
K
 
P
T
 
H
Q
 
L
S
 
P
D
 
E
F
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
T
 
T
I
 
I
T
 
I
T
 
A
D
 
D
S
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
E
F
 
I
R
 
T
S
 
T
I
 
I
V
 
Q
P
 
P
M
 
A
G
 
P
Y
|
Y
G
 
Q
C
 
I
P
 
P
P
 
T
Q
 
D
G
 
G
T
 
P
T
 
T
Q
 
G
R
 
Q
L
 
F
L
 
I
D
 
E
L
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
R
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
G
 
G
H
 
K
R
 
E
K
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
I
 
F
D
 
K
G
 
G
D
 
G
E
 
E
Y
 
W
L
 
I
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
F
 
S
A
 
A
S
 
T
R
 
K
E
 
P
G
 
E
L
 
L
V
 
I

3i4vA Crystal structure determination of catechol 1,2-dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with 3-chlorocatechol (see paper)
38% identity, 61% coverage: 72:255/304 of query aligns to 53:234/256 of 3i4vA

query
sites
3i4vA
L
 
L
G
 
F
L
 
L
E
 
D
R
 
V
F
 
F
L
 
I
D
 
E
I
 
H
R
 
S
A
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
V
E
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
S
G
 
-
L
 
-
A
 
R
G
 
K
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
|
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
x
Y
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
G
 
N
A
 
S
P
 
P
A
 
E
S
 
L
E
 
P
G
 
S
F
 
K
A
 
C
R
 
T
L
 
L
D
 
P
D
 
M
G
 
R
S
 
E
E
 
E
D
 
D
G
 
E
Q
 
K
G
 
I
E
 
T
V
 
P
L
 
L
F
 
V
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
T
 
Q
V
 
V
F
 
T
D
 
D
T
 
L
S
 
D
G
 
G
K
 
N
P
 
G
L
 
L
P
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
D
L
 
N
L
 
D
G
 
G
N
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
F
 
Q
F
 
F
D
 
A
K
 
P
T
 
H
Q
 
L
S
 
P
D
 
E
F
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
T
 
T
I
 
I
T
 
I
T
 
A
D
 
D
S
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
E
F
 
I
R
 
T
S
 
T
I
 
I
V
 
Q
P
 
P
M
 
A
G
 
P
Y
|
Y
G
 
Q
C
 
I
P
 
P
P
 
T
Q
 
D
G
 
G
T
 
P
T
 
T
Q
 
G
R
 
Q
L
 
F
L
 
I
D
 
E
L
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
R
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
G
 
G
H
 
K
R
 
E
K
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
I
 
F
D
 
K
G
 
G
D
 
G
E
 
E
Y
 
W
L
 
I
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
F
 
S
A
 
A
S
 
T
R
 
K
E
 
P
G
 
E
L
 
L
V
 
I

3hjsA Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with 4-methylcatechol (see paper)
38% identity, 61% coverage: 72:255/304 of query aligns to 53:234/256 of 3hjsA

query
sites
3hjsA
L
 
L
G
 
F
L
 
L
E
x
D
R
x
V
F
 
F
L
 
I
D
 
E
I
 
H
R
 
S
A
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
V
E
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
S
G
 
-
L
 
-
A
 
R
G
 
K
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
x
Y
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
G
 
N
A
 
S
P
 
P
A
 
E
S
 
L
E
 
P
G
 
S
F
 
K
A
 
C
R
 
T
L
 
L
D
 
P
D
 
M
G
 
R
S
 
E
E
 
E
D
 
D
G
 
E
Q
 
K
G
 
I
E
 
T
V
 
P
L
 
L
F
 
V
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
T
 
Q
V
 
V
F
 
T
D
 
D
T
 
L
S
 
D
G
 
G
K
 
N
P
 
G
L
 
L
P
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
D
L
 
N
L
 
D
G
 
G
N
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
F
 
Q
F
 
F
D
 
A
K
 
P
T
 
H
Q
 
L
S
 
P
D
 
E
F
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
T
 
T
I
 
I
T
 
I
T
 
A
D
 
D
S
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
E
F
 
I
R
 
T
S
 
T
I
 
I
V
 
Q
P
 
P
M
 
A
G
 
P
Y
|
Y
G
 
Q
C
 
I
P
 
P
P
 
T
Q
 
D
G
 
G
T
 
P
T
 
T
Q
 
G
R
 
Q
L
 
F
L
 
I
D
 
E
L
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
R
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
G
 
G
H
 
K
R
 
E
K
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
I
 
F
D
 
K
G
 
G
D
 
G
E
 
E
Y
 
W
L
 
I
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
F
 
S
A
 
A
S
 
T
R
 
K
E
 
P
G
 
E
L
 
L
V
 
I

3hjqA Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with 3-methylcatechol (see paper)
38% identity, 61% coverage: 72:255/304 of query aligns to 53:234/256 of 3hjqA

query
sites
3hjqA
L
 
L
G
 
F
L
 
L
E
 
D
R
x
V
F
 
F
L
 
I
D
 
E
I
 
H
R
 
S
A
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
V
E
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
S
G
 
-
L
 
-
A
 
R
G
 
K
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
|
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
x
Y
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
G
 
N
A
 
S
P
 
P
A
 
E
S
 
L
E
 
P
G
 
S
F
 
K
A
 
C
R
 
T
L
 
L
D
 
P
D
 
M
G
 
R
S
 
E
E
 
E
D
 
D
G
 
E
Q
 
K
G
 
I
E
 
T
V
 
P
L
 
L
F
 
V
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
T
 
Q
V
 
V
F
 
T
D
 
D
T
 
L
S
 
D
G
 
G
K
 
N
P
 
G
L
 
L
P
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
D
L
 
N
L
 
D
G
 
G
N
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
F
 
Q
F
 
F
D
 
A
K
 
P
T
 
H
Q
 
L
S
 
P
D
 
E
F
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
T
 
T
I
 
I
T
 
I
T
 
A
D
 
D
S
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
E
F
 
I
R
 
T
S
 
T
I
 
I
V
 
Q
P
 
P
M
 
A
G
 
P
Y
|
Y
G
 
Q
C
 
I
P
 
P
P
 
T
Q
 
D
G
 
G
T
 
P
T
 
T
Q
 
G
R
 
Q
L
 
F
L
 
I
D
 
E
L
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
R
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
G
 
G
H
 
K
R
 
E
K
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
I
 
F
D
 
K
G
 
G
D
 
G
E
 
E
Y
 
W
L
 
I
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
F
 
S
A
 
A
S
 
T
R
 
K
E
 
P
G
 
E
L
 
L
V
 
I

3hhyA Crystal structure determination of catechol 1,2-dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with catechol (see paper)
38% identity, 61% coverage: 72:255/304 of query aligns to 53:234/256 of 3hhyA

query
sites
3hhyA
L
 
L
G
 
F
L
 
L
E
 
D
R
x
V
F
 
F
L
 
I
D
 
E
I
 
H
R
 
S
A
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
V
E
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
S
G
 
-
L
 
-
A
 
R
G
 
K
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
x
Y
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
G
 
N
A
 
S
P
 
P
A
 
E
S
 
L
E
 
P
G
 
S
F
 
K
A
 
C
R
 
T
L
 
L
D
 
P
D
 
M
G
 
R
S
 
E
E
 
E
D
 
D
G
 
E
Q
 
K
G
 
I
E
 
T
V
 
P
L
 
L
F
 
V
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
T
 
Q
V
 
V
F
 
T
D
 
D
T
 
L
S
 
D
G
 
G
K
 
N
P
 
G
L
 
L
P
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
D
L
 
N
L
 
D
G
 
G
N
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
F
 
Q
F
 
F
D
 
A
K
 
P
T
 
H
Q
 
L
S
 
P
D
 
E
F
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
T
 
T
I
 
I
T
 
I
T
 
A
D
 
D
S
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
E
F
 
I
R
 
T
S
 
T
I
 
I
V
 
Q
P
 
P
M
 
A
G
 
P
Y
|
Y
G
 
Q
C
 
I
P
 
P
P
 
T
Q
 
D
G
 
G
T
 
P
T
 
T
Q
 
G
R
 
Q
L
 
F
L
 
I
D
 
E
L
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
R
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
G
 
G
H
 
K
R
 
E
K
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
I
 
F
D
 
K
G
 
G
D
 
G
E
 
E
Y
 
W
L
 
I
W
x
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
F
 
S
A
 
A
S
x
T
R
 
K
E
 
P
G
 
E
L
 
L
V
 
I

3hhxA Crystal structure determination of catechol 1,2-dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with pyrogallol (see paper)
38% identity, 61% coverage: 72:255/304 of query aligns to 53:234/256 of 3hhxA

query
sites
3hhxA
L
 
L
G
 
F
L
 
L
E
 
D
R
x
V
F
 
F
L
 
I
D
 
E
I
 
H
R
 
S
A
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
V
E
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
S
G
 
-
L
 
-
A
 
R
G
 
K
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
|
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
x
Y
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
G
 
N
A
 
S
P
 
P
A
 
E
S
 
L
E
 
P
G
 
S
F
 
K
A
 
C
R
 
T
L
 
L
D
 
P
D
 
M
G
 
R
S
 
E
E
 
E
D
 
D
G
 
E
Q
 
K
G
 
I
E
 
T
V
 
P
L
 
L
F
 
V
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
T
 
Q
V
 
V
F
 
T
D
 
D
T
 
L
S
 
D
G
 
G
K
 
N
P
 
G
L
 
L
P
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
D
L
 
N
L
 
D
G
 
G
N
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
F
 
Q
F
 
F
D
 
A
K
 
P
T
 
H
Q
 
L
S
 
P
D
 
E
F
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
T
 
T
I
 
I
T
 
I
T
 
A
D
 
D
S
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
E
F
 
I
R
 
T
S
 
T
I
 
I
V
 
Q
P
 
P
M
 
A
G
 
P
Y
|
Y
G
 
Q
C
 
I
P
 
P
P
 
T
Q
 
D
G
 
G
T
 
P
T
 
T
Q
 
G
R
 
Q
L
 
F
L
 
I
D
 
E
L
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
R
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
G
 
G
H
 
K
R
 
E
K
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
I
 
F
D
 
K
G
 
G
D
 
G
E
 
E
Y
 
W
L
 
I
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
F
 
S
A
 
A
S
 
T
R
 
K
E
 
P
G
 
E
L
 
L
V
 
I

3hj8A Crystal structure determination of catechol 1,2-dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with 4-chlorocatechol (see paper)
38% identity, 61% coverage: 72:255/304 of query aligns to 54:235/257 of 3hj8A

query
sites
3hj8A
L
 
L
G
 
F
L
 
L
E
x
D
R
x
V
F
 
F
L
 
I
D
 
E
I
 
H
R
 
S
A
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
V
E
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
S
G
 
-
L
 
-
A
 
R
G
 
K
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
x
Y
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
G
 
N
A
 
S
P
 
P
A
 
E
S
 
L
E
 
P
G
 
S
F
 
K
A
 
C
R
 
T
L
 
L
D
 
P
D
 
M
G
 
R
S
 
E
E
 
E
D
 
D
G
 
E
Q
 
K
G
 
I
E
 
T
V
 
P
L
 
L
F
 
V
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
T
 
Q
V
 
V
F
 
T
D
 
D
T
 
L
S
 
D
G
 
G
K
 
N
P
 
G
L
 
L
P
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
D
L
 
N
L
 
D
G
 
G
N
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
F
 
Q
F
 
F
D
 
A
K
 
P
T
 
H
Q
 
L
S
 
P
D
 
E
F
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
T
 
T
I
 
I
T
 
I
T
 
A
D
 
D
S
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
E
F
 
I
R
 
T
S
 
T
I
 
I
V
 
Q
P
 
P
M
 
A
G
 
P
Y
|
Y
G
 
Q
C
 
I
P
 
P
P
 
T
Q
 
D
G
 
G
T
 
P
T
 
T
Q
 
G
R
 
Q
L
 
F
L
 
I
D
 
E
L
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
R
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
G
 
G
H
 
K
R
 
E
K
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
I
 
F
D
 
K
G
 
G
D
 
G
E
 
E
Y
 
W
L
 
I
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
F
 
S
A
 
A
S
 
T
R
 
K
E
 
P
G
 
E
L
 
L
V
 
I

3hgiA Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase from the gram-positive rhodococcus opacus 1cp (see paper)
38% identity, 61% coverage: 72:255/304 of query aligns to 55:236/258 of 3hgiA

query
sites
3hgiA
L
 
L
G
 
F
L
 
L
E
 
D
R
 
V
F
 
F
L
 
I
D
 
E
I
 
H
R
 
S
A
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
V
E
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
S
G
 
-
L
 
-
A
 
R
G
 
K
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
Y
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
G
 
N
A
 
S
P
 
P
A
 
E
S
 
L
E
 
P
G
 
S
F
 
K
A
 
C
R
 
T
L
 
L
D
 
P
D
 
M
G
 
R
S
 
E
E
 
E
D
 
D
G
 
E
Q
 
K
G
 
I
E
 
T
V
 
P
L
 
L
F
 
V
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
T
 
Q
V
 
V
F
 
T
D
 
D
T
 
L
S
 
D
G
 
G
K
 
N
P
 
G
L
 
L
P
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
L
W
 
W
H
|
H
A
|
A
N
 
D
L
 
N
L
 
D
G
 
G
N
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
F
 
Q
F
 
F
D
 
A
K
 
P
T
 
H
Q
 
L
S
 
P
D
 
E
F
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
T
 
T
I
 
I
T
 
I
T
 
A
D
 
D
S
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
E
F
 
I
R
 
T
S
 
T
I
 
I
V
 
Q
P
 
P
M
 
A
G
 
P
Y
|
Y
G
 
Q
C
 
I
P
 
P
P
 
T
Q
 
D
G
 
G
T
 
P
T
 
T
Q
 
G
R
 
Q
L
 
F
L
 
I
D
 
E
L
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
R
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
G
 
G
H
 
K
R
 
E
K
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
I
 
F
D
 
K
G
 
G
D
 
G
E
 
E
Y
 
W
L
 
I
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
F
 
S
A
 
A
S
 
T
R
 
K
E
 
P
G
 
E
L
 
L
V
 
I

3n9tA Cryatal structure of hydroxyquinol 1,2-dioxygenase from pseudomonas putida dll-e4
28% identity, 93% coverage: 6:288/304 of query aligns to 4:286/286 of 3n9tA

query
sites
3n9tA
I
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
I
K
 
S
A
 
D
F
 
Q
I
 
A
L
 
V
D
 
D
T
 
S
A
 
F
S
 
E
G
 
T
K
 
S
A
 
P
D
 
N
A
 
P
R
 
R
V
 
F
Q
 
K
S
 
Q
V
 
I
V
 
M
V
 
Q
R
 
S
L
 
L
T
 
V
T
 
R
D
 
H
L
 
L
F
 
H
K
 
D
A
 
F
I
 
V
E
 
S
D
 
E
L
 
V
D
 
E
L
 
L
S
 
T
A
 
E
S
 
Q
E
 
E
V
 
W
W
 
F
K
 
E
G
 
G
I
 
I
E
 
R
Y
 
F
F
 
L
A
 
T
E
 
A
A
 
T
G
 
G
P
 
Q
-
 
K
-
 
C
-
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
V
-
 
R
-
 
Q
E
 
E
L
 
F
G
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
S
A
 
D
G
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
V
E
 
S
R
 
M
F
 
L
L
 
V
D
 
D
I
 
A
R
 
I
A
 
N
D
 
H
E
 
R
A
 
Q
E
 
S
A
 
T
K
 
N
A
 
A
G
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
T
 
T
P
 
E
R
 
T
T
 
T
I
 
V
E
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
F
Y
 
F
V
 
I
A
 
E
G
 
G
A
 
M
P
 
P
-
 
D
-
 
R
-
 
G
A
 
Y
S
 
G
E
 
E
G
 
N
F
 
M
A
 
A
R
 
L
L
 
T
D
 
D
D
 
-
G
 
-
S
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
Q
 
-
G
 
G
E
 
V
V
 
P
L
 
A
F
 
L
M
 
V
Q
 
Y
G
 
G
T
 
R
V
 
V
F
 
L
D
 
D
T
 
V
S
 
Q
G
 
G
K
 
R
P
 
P
L
 
V
P
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
V
V
 
L
E
 
D
V
 
V
W
 
W
H
 
Q
A
 
T
N
 
A
L
 
D
L
 
N
G
 
G
N
 
M
Y
|
Y
S
 
S
F
 
G
F
 
Q
D
 
D
K
 
P
T
 
D
Q
 
Q
S
 
P
D
 
F
F
 
G
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
T
 
R
I
 
Y
T
 
R
T
 
S
D
 
D
S
 
N
E
 
D
G
 
G
R
 
C
Y
 
F
Q
 
A
F
 
I
R
 
Q
S
 
T
I
 
T
V
 
V
P
 
P
M
 
V
G
 
C
Y
|
Y
G
 
P
C
 
I
P
 
P
P
 
T
Q
 
D
G
 
G
T
 
P
T
 
V
Q
 
G
R
 
E
L
 
M
L
 
L
D
 
D
L
 
A
L
 
A
G
 
N
R
 
R
H
 
H
G
 
A
R
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
F
F
 
M
V
 
I
S
 
Q
A
 
A
P
 
P
G
 
G
H
 
Y
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
V
T
 
T
Q
 
H
I
 
L
N
 
F
I
 
N
D
 
S
G
 
D
D
 
D
E
 
P
Y
 
Y
L
 
L
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
A
A
 
V
F
 
F
A
 
G
S
 
V
R
 
K
E
 
G
G
 
S
L
 
L
V
 
-
P
 
-
A
 
Q
L
 
V
R
 
K
H
 
Y
V
 
E
E
 
D
S
 
R
P
 
P
R
 
A
A
 
H
L
 
D
A
 
E
E
 
D
H
 
A
G
 
G
-
 
G
-
 
L
-
 
D
L
 
M
D
 
P
K
 
Y
P
 
P
F
 
Y
A
 
K
S
 
S
I
 
A
D
 
Y
F
 
Y
D
 
E
F
 
F
R
 
V
L
 
M
Y
 
E
A
 
A
D
 
E

3o6rA Crystal structure of 4-chlorocatechol dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with pyrogallol (see paper)
36% identity, 63% coverage: 72:262/304 of query aligns to 48:238/256 of 3o6rA

query
sites
3o6rA
L
 
L
G
 
W
L
 
L
E
 
D
R
 
A
F
 
F
L
 
F
D
 
E
I
 
T
R
 
T
A
 
V
D
 
D
E
 
S
A
 
V
E
 
-
A
 
-
K
 
S
A
 
Y
G
 
G
L
 
K
A
 
G
G
 
N
G
 
W
T
 
T
P
 
S
R
 
S
T
 
A
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
P
|
P
L
x
F
Y
 
F
V
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
L
S
 
L
E
 
T
G
 
G
F
 
K
A
 
P
R
 
A
L
 
T
D
 
L
D
 
P
G
 
M
S
 
R
E
 
A
D
 
D
G
 
E
Q
 
P
G
 
G
E
 
D
V
 
R
L
 
M
F
 
R
M
 
F
Q
 
T
G
 
G
T
 
S
V
 
V
F
 
R
D
 
D
T
 
T
S
 
S
G
 
G
K
 
T
P
 
P
L
 
I
P
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
V
V
 
I
E
 
D
V
 
V
W
 
W
H
 
H
A
 
S
N
 
T
L
 
N
L
 
D
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
F
 
F
F
 
F
D
 
S
K
 
P
T
 
A
Q
 
L
S
 
P
D
 
D
-
 
Q
F
 
Y
N
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
G
T
 
R
I
 
V
T
 
V
T
 
P
D
 
A
S
 
E
E
 
D
G
 
G
R
 
S
Y
 
I
Q
 
E
F
 
F
R
 
H
S
 
S
I
 
I
V
 
R
P
 
P
M
 
V
G
 
P
Y
|
Y
G
 
E
C
 
I
P
 
P
P
 
K
Q
 
A
G
 
G
T
 
P
T
 
T
Q
 
G
R
 
Q
L
 
L
L
 
M
D
 
N
-
 
S
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
S
R
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
I
H
|
H
F
 
I
F
 
R
V
 
I
S
 
T
A
 
A
P
 
D
G
 
G
H
 
Y
R
 
R
K
 
P
L
 
L
T
 
I
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
I
 
F
D
 
E
G
 
G
D
 
D
E
 
P
Y
 
Y
L
 
L
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
S
A
x
C
F
 
S
A
 
A
S
 
V
R
 
K
E
 
S
G
 
E
L
 
L
V
 
V
P
 
L
A
 
P
L
 
V
R
 
N
H
 
K
V
 
I
E
 
D

Query Sequence

>RR42_RS23505 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS23505
MTHPEIEALVKAFILDTASGKADARVQSVVVRLTTDLFKAIEDLDLSASEVWKGIEYFAE
AGPELGLLAAGLGLERFLDIRADEAEAKAGLAGGTPRTIEGPLYVAGAPASEGFARLDDG
SEDGQGEVLFMQGTVFDTSGKPLPGASVEVWHANLLGNYSFFDKTQSDFNLRRTITTDSE
GRYQFRSIVPMGYGCPPQGTTQRLLDLLGRHGRRPAHIHFFVSAPGHRKLTTQINIDGDE
YLWDDFAFASREGLVPALRHVESPRALAEHGLDKPFASIDFDFRLYADCAAAPVPEVERT
RAAA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory