SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS23690 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS23690 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
40% identity, 99% coverage: 1:253/255 of query aligns to 2:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
M
 
M
Q
 
S
R
 
R
L
 
L
E
 
Q
G
 
D
K
 
K
T
 
V
V
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
G
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
G
 
L
A
 
E
T
 
A
C
 
A
R
 
R
R
 
V
F
 
F
A
 
M
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
I
L
 
A
D
|
D
L
x
F
N
 
N
L
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
G
Q
 
K
Q
 
E
V
 
A
A
 
V
Q
 
-
R
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
E
G
 
A
G
 
N
R
 
P
A
 
G
E
 
V
A
 
V
F
 
F
-
 
I
Q
 
R
C
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
R
 
R
A
 
E
S
 
S
V
 
V
D
 
H
A
 
R
A
 
L
V
 
V
A
 
E
A
 
N
T
 
V
T
 
A
S
 
E
Q
 
R
L
 
F
G
 
G
P
 
K
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
x
I
D
 
T
V
 
R
F
x
D
K
 
S
P
 
M
F
 
L
T
 
S
K
|
K
T
 
M
E
 
T
P
 
V
A
 
D
Q
 
Q
W
 
F
D
 
Q
R
 
Q
L
 
V
I
 
I
A
 
N
I
 
V
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
V
L
 
F
H
 
H
M
 
C
H
 
T
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
Y
M
 
M
V
 
A
E
 
E
R
 
Q
K
 
G
R
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
S
S
|
S
D
 
V
A
 
T
A
 
G
R
 
T
V
 
Y
G
 
G
S
x
N
S
x
V
G
 
G
E
x
Q
A
 
T
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
S
 
G
F
 
M
S
 
T
K
 
K
T
 
T
I
 
W
A
 
A
R
 
K
E
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
P
x
F
T
|
T
D
 
E
T
|
T
A
 
A
L
x
M
F
 
V
E
 
A
D
 
E
Y
 
V
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
V
I
 
I
E
 
E
A
x
K
F
 
M
T
 
K
R
 
A
S
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
I
P
 
A
G
 
N
A
 
A
I
 
Y
V
 
L
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
D
 
E
A
 
S
A
 
D
F
 
Y
V
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
H
V
 
V
L
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
M
M
 
M

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
38% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 2:244/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
E
 
Q
G
 
N
K
 
R
T
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
A
G
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
G
 
K
A
 
Q
T
 
T
C
 
A
R
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
R
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
V
V
 
I
L
 
N
D
|
D
L
x
I
N
 
D
L
 
A
A
 
E
A
 
K
A
 
V
Q
 
R
Q
 
A
V
 
T
A
 
V
Q
 
D
R
 
E
I
 
F
R
 
S
E
 
A
E
 
R
G
 
G
G
 
H
R
 
R
A
 
V
E
 
L
A
 
G
F
 
A
Q
 
V
C
 
A
D
 
D
I
|
I
T
 
G
D
 
N
R
 
K
A
 
A
S
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
G
A
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
Q
T
 
T
T
 
I
S
 
D
Q
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
W
 
M
D
 
E
V
 
R
F
 
A
K
 
G
P
 
A
F
 
L
T
 
R
K
 
K
T
 
L
E
 
S
P
 
E
A
 
A
Q
 
D
W
 
W
D
 
D
R
 
V
L
 
T
I
 
I
A
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
T
L
 
F
H
 
L
M
 
C
H
 
T
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
H
P
 
G
G
 
H
M
 
M
V
 
V
E
 
E
R
 
N
K
 
K
R
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
D
 
-
A
 
R
A
 
A
R
 
W
V
 
L
G
 
G
S
 
G
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
T
V
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
C
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
S
 
G
F
 
M
S
 
T
K
 
R
T
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
I
E
 
E
H
 
L
A
 
G
R
 
R
H
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
C
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
L
T
x
I
D
 
H
T
 
T
A
 
P
L
 
M
F
 
W
E
 
D
D
 
E
Y
 
L
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
D
I
 
Q
E
 
Q
A
 
F
F
 
L
T
 
L
R
 
S
S
 
R
I
 
Q
P
 
P
L
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
E
 
D
D
 
D
L
 
I
P
 
A
G
 
N
A
 
T
I
 
L
V
 
L
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
D
 
D
A
 
S
A
 
G
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
S
 
Y
V
 
V
S
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
R
T
 
S
M
 
L

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
38% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 3:245/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
L
 
I
E
 
Q
G
 
N
K
 
R
T
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
G
 
A
G
x
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
G
 
K
A
 
Q
T
 
T
C
 
A
R
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
R
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
V
V
 
I
L
 
N
D
|
D
L
 
I
N
 
D
L
 
A
A
 
E
A
 
K
A
 
V
Q
 
R
Q
 
A
V
 
T
A
 
V
Q
 
D
R
 
E
I
 
F
R
 
S
E
 
A
E
 
R
G
 
G
G
 
H
R
 
R
A
 
V
E
 
L
A
 
G
F
 
A
Q
 
V
C
 
A
D
|
D
I
|
I
T
 
G
D
 
N
R
 
K
A
 
A
S
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
G
A
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
Q
T
 
T
T
 
I
S
 
D
Q
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
W
 
M
D
 
E
V
 
R
F
 
A
K
 
G
P
 
A
F
 
L
T
 
R
K
 
K
T
 
L
E
 
S
P
 
E
A
 
A
Q
 
D
W
 
W
D
 
D
R
 
V
L
 
T
I
 
I
A
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
T
L
 
F
H
 
L
M
 
C
H
 
T
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
H
P
 
G
G
 
H
M
 
M
V
 
V
E
 
E
R
 
N
K
 
K
R
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
S
D
 
-
A
 
R
A
 
A
R
 
W
V
 
L
G
 
G
S
 
G
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
T
V
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
C
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
S
 
G
F
 
M
S
 
T
K
 
R
T
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
I
E
 
E
H
 
L
A
 
G
R
 
R
H
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
C
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
L
T
 
I
D
 
H
T
 
T
A
 
P
L
 
M
F
 
W
E
 
D
D
 
E
Y
 
L
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
D
I
 
Q
E
 
Q
A
 
F
F
 
L
T
 
L
R
 
S
S
 
R
I
 
Q
P
 
P
L
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
E
 
D
D
 
D
L
 
I
P
 
A
G
 
N
A
 
T
I
 
L
V
 
L
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
D
 
D
A
 
S
A
 
G
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
S
 
Y
V
 
V
S
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
R
T
 
S
M
 
L

Sites not aligning to the query:

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
39% identity, 98% coverage: 3:253/255 of query aligns to 5:247/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
R
 
K
L
 
L
E
 
A
G
 
S
K
 
K
T
 
T
V
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
G
 
F
A
 
G
T
 
I
C
 
A
R
 
Q
R
 
V
F
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
R
V
 
V
A
 
I
V
 
I
L
 
A
D
|
D
L
x
R
N
 
D
L
 
-
A
 
A
A
 
H
A
 
G
Q
 
E
Q
 
A
V
 
A
A
 
A
Q
 
A
R
 
S
I
 
L
R
 
R
E
 
E
E
 
S
G
 
G
G
 
A
R
 
Q
A
 
A
E
 
L
A
 
F
F
 
I
Q
 
S
C
|
C
D
 
N
I
|
I
T
 
A
D
 
E
R
 
K
A
 
T
S
 
Q
V
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
L
V
 
F
A
 
S
A
 
Q
T
 
A
T
 
E
S
 
E
Q
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
W
x
I
D
 
N
V
 
R
F
 
D
K
 
A
P
 
M
F
 
L
T
 
H
K
 
K
T
 
L
E
 
T
P
 
E
A
 
A
Q
 
D
W
 
W
D
 
D
R
 
T
L
 
V
I
 
I
A
 
D
I
x
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
T
-
 
F
L
 
L
H
 
C
M
 
M
H
 
Q
H
 
Q
A
 
A
V
 
A
L
 
I
P
 
R
G
 
-
M
 
M
V
 
R
E
 
E
R
 
R
K
 
G
R
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
S
D
 
-
A
 
A
A
 
S
R
 
W
V
 
L
G
 
G
S
 
N
S
 
V
G
 
G
E
 
Q
A
 
T
V
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
C
 
S
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
S
 
G
F
 
M
S
 
T
K
 
K
T
 
T
I
 
A
A
 
C
R
 
R
E
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
K
H
 
K
G
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
I
C
 
C
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
x
I
D
 
D
T
|
T
A
 
-
L
 
-
F
 
-
E
 
-
D
 
D
Y
 
M
K
x
T
Q
 
R
G
 
G
A
 
V
G
 
-
N
 
-
P
 
P
E
 
E
K
 
N
L
 
V
I
 
W
E
 
Q
A
 
I
F
 
M
T
 
V
R
 
S
S
 
K
I
 
I
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
Y
I
 
A
G
 
G
Q
 
E
P
 
A
E
 
K
D
 
D
L
 
V
P
 
G
G
 
E
A
 
C
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
A
A
 
R
F
 
Y
V
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
L
 
I
S
 
N
V
 
V
S
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
V
M
 
L

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
34% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 6:242/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
G
 
K
A
 
A
T
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
L
F
 
L
A
 
A
R
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
L
 
T
D
 
A
L
x
T
N
 
S
L
 
E
A
 
S
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
A
V
 
I
A
 
S
Q
 
D
R
 
Y
I
 
L
R
 
G
E
 
D
E
 
N
G
 
G
G
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
K
A
 
G
F
 
M
Q
 
A
C
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
N
R
 
P
A
 
E
S
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
L
A
 
K
A
 
A
T
 
I
T
 
T
S
 
D
Q
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
W
 
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
T
 
M
K
 
R
T
 
M
E
 
K
P
 
E
A
 
E
Q
 
E
W
 
W
D
 
S
R
 
D
L
 
I
I
 
M
A
 
E
I
 
T
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
A
 
I
L
 
F
H
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
R
G
 
G
M
 
M
V
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
R
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
V
A
x
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
G
 
G
E
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
S
 
G
F
 
F
S
 
T
K
 
K
T
 
S
I
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
V
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
T
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
F
T
 
I
D
 
E
T
|
T
A
 
D
L
 
M
F
 
N
E
 
D
D
 
E
Y
 
Q
K
 
R
Q
 
T
G
 
-
A
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
A
F
 
T
T
 
L
R
 
A
S
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
D
P
 
P
E
 
R
D
 
E
L
 
I
P
 
A
G
 
S
A
 
A
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
D
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
35% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 6:246/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
G
 
K
A
 
A
T
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
L
F
 
L
A
 
A
R
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
L
 
T
D
 
A
L
x
T
N
 
S
L
 
E
A
 
S
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
A
V
 
I
A
 
S
Q
 
D
R
 
Y
I
 
L
R
 
G
E
 
D
E
 
N
G
 
G
G
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
K
A
 
G
F
 
M
Q
 
A
C
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
N
R
 
P
A
 
E
S
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
L
A
 
K
A
 
A
T
 
I
T
 
T
S
 
D
Q
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
W
x
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
T
 
M
K
 
R
T
 
M
E
 
K
P
 
E
A
 
E
Q
 
E
W
 
W
D
 
S
R
 
D
L
 
I
I
 
M
A
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
A
 
I
L
 
F
H
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
R
G
 
G
M
 
M
V
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
R
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
V
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
S
 
G
F
 
F
S
 
T
K
 
K
T
 
S
I
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
V
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
T
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
F
T
x
I
D
 
E
T
|
T
A
 
D
L
x
M
F
 
T
E
 
K
D
 
-
Y
 
-
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
A
G
 
L
N
 
N
P
 
D
E
 
E
K
 
Q
L
 
R
I
 
T
E
 
A
A
 
T
F
 
L
T
 
A
R
 
Q
S
 
-
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
D
P
 
P
E
 
R
D
 
E
L
 
I
P
 
A
G
 
S
A
 
A
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
D
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
34% identity, 99% coverage: 1:252/255 of query aligns to 2:253/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
M
 
I
Q
 
M
R
 
N
L
 
L
E
 
T
G
 
D
K
 
K
T
 
T
V
 
V
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
G
 
Y
A
 
A
T
 
A
C
 
V
R
 
Q
R
 
A
F
 
F
A
 
L
R
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
A
 
N
V
 
V
A
 
V
V
 
V
L
 
A
D
|
D
L
x
I
N
 
D
L
 
E
A
 
A
A
 
Q
A
 
G
Q
 
E
Q
 
A
V
 
M
A
 
V
Q
 
R
R
 
K
I
 
-
R
 
-
E
 
E
E
 
N
G
 
N
G
 
D
R
 
R
A
 
L
E
 
H
A
 
F
F
 
V
Q
 
Q
C
x
T
D
 
D
I
|
I
T
 
T
D
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
A
V
 
C
D
 
Q
A
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
S
T
 
A
T
 
V
S
 
H
Q
 
T
L
 
F
G
 
G
P
 
G
I
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
W
 
I
D
 
E
V
 
I
F
 
V
K
 
A
P
 
P
F
 
I
T
 
H
K
 
E
T
 
M
E
 
E
P
 
L
A
 
S
Q
 
D
W
 
W
D
 
N
R
 
K
L
 
V
I
 
L
A
 
Q
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
M
L
 
F
H
 
L
M
 
M
H
 
S
H
 
K
A
 
H
V
 
A
L
 
L
P
 
K
G
 
H
M
 
M
V
 
L
E
 
A
R
 
A
K
 
G
R
 
K
G
 
G
R
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
C
S
|
S
D
 
V
A
 
G
A
 
G
R
 
L
V
 
V
G
 
A
S
 
W
S
 
P
G
 
D
E
 
I
A
 
P
V
 
A
Y
|
Y
A
 
N
A
 
A
C
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
L
 
V
V
 
L
S
 
Q
F
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
S
I
 
M
A
 
A
R
 
V
E
 
D
H
 
Y
A
 
A
R
 
K
H
 
H
G
 
Q
I
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
C
V
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
P
x
I
T
x
I
D
 
D
T
 
T
A
 
P
L
 
L
F
 
N
E
 
E
D
 
K
-
 
S
-
 
F
Y
 
L
K
 
E
Q
 
N
G
 
N
A
 
E
G
 
G
N
 
T
P
 
L
E
 
E
K
 
E
L
 
I
I
 
K
E
 
K
A
 
E
F
 
K
T
 
A
R
 
K
S
 
V
I
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
L
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
E
L
 
I
P
 
A
G
 
N
A
 
V
I
 
M
V
 
L
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
L
A
 
S
A
 
S
F
 
Y
V
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
A
L
 
I
S
 
T
V
 
A
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
37% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 3:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
G
 
R
A
 
D
T
 
I
C
 
A
R
 
I
R
 
N
F
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
N
V
 
I
A
 
-
V
 
F
L
 
F
D
x
N
L
x
Y
N
|
N
L
x
G
A
x
S
-
 
P
-
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
Q
 
E
V
 
T
A
 
A
Q
 
K
R
 
L
I
 
V
R
 
A
E
 
E
E
 
H
G
 
G
G
 
V
R
 
E
A
 
V
E
 
E
A
 
A
F
 
M
Q
 
K
C
 
A
D
x
N
I
x
V
T
 
A
D
 
I
R
 
A
A
 
E
S
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
F
V
 
F
A
 
K
A
 
Q
T
 
A
T
 
I
S
 
E
Q
 
R
L
 
F
G
 
G
P
 
R
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
W
x
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
T
 
M
K
 
R
T
 
M
E
 
K
P
 
E
A
 
D
Q
 
E
W
 
W
D
 
D
R
 
D
L
 
V
I
 
I
A
 
N
I
|
I
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
T
L
 
F
H
 
L
M
 
C
H
 
T
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
S
P
 
R
G
 
T
M
 
M
V
 
M
E
 
K
R
 
Q
K
 
R
R
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
A
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
L
V
 
I
G
 
G
S
 
N
S
 
A
G
 
G
E
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
C
 
S
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
S
 
G
F
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
T
I
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
P
H
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
P
 
F
T
x
I
D
 
T
T
|
T
A
 
D
L
 
M
F
 
T
E
 
D
D
 
K
Y
 
L
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
D
E
 
E
K
 
K
L
 
T
I
 
K
E
 
E
A
 
A
F
 
M
T
 
L
R
 
A
S
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
A
I
 
Y
G
 
G
Q
 
T
P
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
I
P
 
A
G
 
N
A
 
A
I
 
V
V
 
L
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
A
A
 
S
A
 
K
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
V
M
 
M

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
36% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 3:243/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
L
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
I
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
x
A
G
x
S
G
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
R
A
 
A
T
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
T
F
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
A
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
I
N
 
G
L
 
T
A
 
A
A
x
T
A
 
S
Q
 
E
Q
 
N
V
 
G
A
 
A
Q
 
Q
R
 
A
I
 
I
R
 
S
E
 
D
E
 
Y
-
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
N
A
 
G
E
 
K
A
 
G
F
 
L
Q
 
M
C
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
R
 
P
A
 
A
S
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
K
T
 
I
T
 
R
S
 
A
Q
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
W
 
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
T
 
M
K
 
R
T
 
M
E
 
K
P
 
D
A
 
E
Q
 
E
W
 
W
D
 
N
R
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
L
 
F
H
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
R
G
 
A
M
 
M
V
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
R
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
 
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
G
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
|
A
A
|
A
C
x
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
S
 
G
F
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
I
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
V
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
x
I
D
 
E
T
 
T
-
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
S
E
 
D
D
 
D
Y
 
Q
K
 
R
Q
 
A
G
 
G
A
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
I
T
 
L
R
 
A
S
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
G
P
 
A
E
 
Q
D
 
E
L
 
I
P
 
A
G
 
N
A
 
A
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
x
E
V
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
36% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 2:242/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
L
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
I
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
G
 
R
A
 
A
T
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
T
F
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
A
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
I
N
 
G
L
 
T
A
 
A
A
x
T
A
 
S
Q
 
E
Q
 
N
V
 
G
A
 
A
Q
 
Q
R
 
A
I
 
I
R
 
S
E
 
D
E
 
Y
-
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
N
A
 
G
E
 
K
A
 
G
F
 
L
Q
 
M
C
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
R
 
P
A
 
A
S
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
K
T
 
I
T
 
R
S
 
A
Q
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
x
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
T
 
M
K
 
R
T
 
M
E
 
K
P
 
D
A
 
E
Q
x
E
W
 
W
D
 
N
R
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
L
 
F
H
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
R
G
 
A
M
 
M
V
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
R
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
G
G
 
G
E
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
S
 
G
F
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
I
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
V
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
F
T
x
I
D
 
E
T
 
T
-
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
S
E
 
D
D
 
D
Y
 
Q
K
 
R
Q
 
A
G
 
G
A
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
I
T
 
L
R
 
A
S
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
G
P
 
A
E
 
Q
D
 
E
L
 
I
P
 
A
G
 
N
A
 
A
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
x
E
V
x
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

6pejA Structure of sorbitol dehydrogenase from sinorhizobium meliloti 1021 bound to sorbitol
36% identity, 100% coverage: 1:254/255 of query aligns to 1:257/257 of 6pejA

query
sites
6pejA
M
 
M
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
S
V
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
G
 
A
G
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
G
 
R
A
 
A
T
 
F
C
 
A
R
 
E
R
 
A
F
 
Y
A
 
V
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
I
L
 
A
D
 
D
L
 
I
N
 
D
L
 
I
A
 
E
A
 
R
A
 
A
Q
 
R
Q
 
Q
V
 
A
A
 
A
Q
 
A
R
 
E
I
 
I
R
 
-
E
 
-
E
 
-
G
 
G
G
 
P
R
 
A
A
 
A
E
 
Y
A
 
A
F
 
V
Q
 
Q
C
 
M
D
 
D
I
 
V
T
 
T
D
 
R
R
 
Q
A
 
D
S
 
S
V
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
T
 
T
T
 
V
S
 
E
Q
 
H
L
 
A
G
 
G
P
 
G
I
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
A
W
 
L
D
 
F
V
 
D
F
 
L
K
 
A
P
 
P
F
 
I
T
 
V
K
 
E
T
 
I
E
 
T
P
 
R
A
 
E
Q
 
S
W
 
Y
D
 
E
R
 
K
L
 
L
I
 
F
A
 
A
I
 
I
N
 
N
L
 
V
T
 
A
G
 
G
A
 
T
L
 
L
H
 
F
M
 
T
H
 
L
H
 
Q
A
 
A
V
 
A
L
 
A
P
 
R
G
 
Q
M
 
M
V
 
I
E
 
A
R
 
Q
K
 
G
R
 
R
-
 
G
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
A
S
|
S
D
x
Q
A
 
A
A
 
G
R
 
R
V
 
R
G
 
G
S
x
E
S
 
A
G
 
L
E
 
V
A
 
A
V
 
I
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
C
 
T
K
 
K
G
 
A
G
 
A
L
 
V
V
 
I
S
 
S
F
 
L
S
 
T
K
 
Q
T
 
S
I
 
A
A
 
G
R
 
L
E
 
D
H
 
L
A
 
I
R
 
K
H
 
H
G
 
R
I
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
I
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
V
T
 
V
D
 
D
-
 
G
-
 
E
-
x
H
-
x
W
-
 
D
-
 
G
-
 
V
T
 
D
A
 
A
L
 
L
F
|
F
E
 
A
D
 
R
Y
 
Y
K
 
E
-
 
N
Q
 
R
G
 
P
A
 
R
G
 
G
N
 
E
P
 
K
E
 
K
K
 
R
L
 
L
I
 
V
E
 
-
A
 
-
F
 
-
T
 
G
R
 
E
S
 
A
I
 
V
P
 
P
L
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
M
G
 
G
Q
 
T
P
 
A
E
 
E
D
 
D
L
 
L
P
 
T
G
 
G
A
 
M
I
 
A
V
 
I
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
A
D
 
E
A
 
S
A
 
D
F
 
Y
V
 
I
T
 
V
G
 
S
Q
 
Q
V
 
T
L
 
Y
S
 
N
V
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
N
T
 
W
M
 
M
N
 
S

1edoA The x-ray structure of beta-keto acyl carrier protein reductase from brassica napus complexed with NADP+ (see paper)
39% identity, 96% coverage: 9:253/255 of query aligns to 4:244/244 of 1edoA

query
sites
1edoA
V
 
V
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
G
 
K
A
 
A
T
 
I
C
 
A
R
 
L
R
 
S
F
 
L
A
 
G
R
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
C
A
 
K
V
 
V
A
 
L
V
 
V
L
 
-
D
 
-
L
 
-
N
|
N
L
x
Y
A
|
A
-
x
R
-
x
S
-
 
A
-
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
Q
 
E
V
 
V
A
 
S
Q
 
K
R
 
Q
I
 
I
R
 
E
E
 
A
E
 
Y
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
E
 
I
A
 
T
F
 
F
Q
 
G
C
 
G
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
K
R
 
E
A
 
A
S
 
D
V
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
M
V
 
M
A
 
K
A
 
T
T
 
A
T
 
I
S
 
D
Q
 
A
L
 
W
G
 
G
P
 
T
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
W
 
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
T
P
 
L
F
 
L
T
 
I
K
 
R
T
 
M
E
 
K
P
 
K
A
 
S
Q
 
Q
W
 
W
D
 
D
R
 
E
L
 
V
I
 
I
A
 
D
I
 
L
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
V
L
 
F
H
 
L
M
 
C
H
 
T
H
 
Q
A
 
A
V
 
A
L
 
T
P
 
K
G
 
I
M
 
M
V
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
R
 
K
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
L
V
 
I
G
 
G
S
 
N
S
 
I
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
S
 
G
F
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
T
I
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
G
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
N
I
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
P
 
-
T
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
F
E
x
I
D
 
A
Y
x
S
K
 
D
Q
x
M
G
 
T
A
 
A
G
 
K
N
 
L
P
 
G
E
 
E
K
 
D
L
 
M
I
 
E
E
 
K
A
 
K
F
 
I
T
 
L
R
 
G
S
 
T
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
T
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
D
 
N
L
 
V
P
 
A
G
 
G
A
 
L
I
 
V
V
 
E
F
 
F
F
 
L
A
 
A
-
 
L
S
 
S
D
 
P
D
 
A
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
L
 
F
S
 
T
V
 
I
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
A
M
 
I

7emgB Carbonyl reductase variant 4 (r123c/l209p/f183y/v61k) from serratia marcescens complexed with NADP+ (see paper)
35% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 2:242/243 of 7emgB

query
sites
7emgB
L
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
I
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
R
A
 
A
T
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
T
F
 
F
A
 
V
R
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
L
 
T
D
 
A
L
x
T
N
 
S
L
 
E
A
 
S
A
 
G
A
 
A
Q
 
E
Q
 
A
V
 
I
A
 
S
Q
 
G
R
 
Y
I
 
L
R
 
-
E
 
-
E
 
-
G
 
G
G
 
A
R
 
N
A
 
G
E
 
K
A
 
G
F
 
F
Q
 
M
C
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
K
D
 
D
R
 
A
A
 
Q
S
 
S
V
 
I
D
 
D
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
S
T
 
I
T
 
R
S
 
A
Q
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
W
x
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
T
 
M
K
 
R
T
 
M
E
 
K
P
 
D
A
 
D
Q
 
E
W
 
W
D
 
E
R
 
D
L
 
I
I
 
L
A
 
D
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
A
 
V
L
 
F
H
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
C
G
 
A
M
 
M
V
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
R
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
 
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
 
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
S
 
G
F
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
I
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
V
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
Y
T
 
I
D
 
E
T
 
T
-
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
T
E
 
D
D
 
D
Y
 
Q
K
 
R
Q
 
A
G
 
G
A
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
I
T
 
L
R
 
S
S
 
S
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
N
R
 
R
I
 
P
G
 
G
Q
 
D
P
 
A
E
 
K
D
 
E
L
 
I
P
 
A
G
 
S
A
 
A
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
G
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
35% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 3:243/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
L
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
I
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
G
 
R
A
 
A
T
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
T
F
 
L
A
 
V
R
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
A
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
I
N
 
G
L
 
T
A
 
A
A
x
T
A
 
S
Q
 
E
Q
 
S
V
 
G
A
 
A
Q
 
Q
R
 
A
I
 
I
R
 
S
E
 
D
E
 
Y
-
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
N
A
 
G
E
 
K
A
 
G
F
 
L
Q
 
M
C
x
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
R
 
P
A
 
A
S
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
N
T
 
V
T
 
R
S
 
A
Q
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
W
x
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
T
 
M
K
 
R
T
 
M
E
 
K
P
 
D
A
 
D
Q
 
E
W
 
W
D
 
N
R
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
L
 
F
H
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
R
G
 
A
M
 
M
V
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
R
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
 
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
S
 
G
F
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
I
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
V
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
I
D
 
E
T
 
T
-
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
T
E
 
D
D
 
E
Y
 
Q
K
 
R
Q
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
T
 
L
R
 
A
S
 
A
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
E
 
N
D
 
E
L
 
I
P
 
A
G
 
S
A
 
A
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

1q7cA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase y151f mutant in complex with NADPH fragment (see paper)
35% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 2:242/243 of 1q7cA

query
sites
1q7cA
L
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
I
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
G
 
R
A
 
A
T
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
T
F
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
A
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
I
N
 
G
L
 
T
A
|
A
A
x
T
A
 
S
Q
 
E
Q
 
N
V
 
G
A
 
A
Q
 
Q
R
 
A
I
 
I
R
 
S
E
 
D
E
 
Y
-
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
N
A
 
G
E
 
K
A
 
G
F
 
L
Q
 
M
C
x
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
R
 
P
A
 
A
S
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
K
T
 
I
T
 
R
S
 
A
Q
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
W
x
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
T
 
M
K
 
R
T
 
M
E
 
K
P
 
D
A
 
E
Q
 
E
W
 
W
D
 
N
R
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
L
 
F
H
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
R
G
 
A
M
 
M
V
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
R
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
G
G
 
G
E
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
x
F
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
S
 
G
F
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
I
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
V
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
I
D
 
E
T
 
T
-
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
S
E
 
D
D
 
D
Y
 
Q
K
 
R
Q
 
A
G
 
G
A
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
I
T
 
L
R
 
A
S
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
G
P
 
A
E
 
Q
D
 
E
L
 
I
P
 
A
G
 
N
A
 
A
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

A7IQH5 2-(S)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase 3; S-HPCDH 3; 2-[(S)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase 3; Aliphatic epoxide carboxylation component IV; Epoxide carboxylase component IV; SHPCDH3; EC 1.1.1.269 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 2 papers)
38% identity, 88% coverage: 28:252/255 of query aligns to 29:253/255 of A7IQH5

query
sites
A7IQH5
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
L
 
I
D
|
D
L
 
L
N
 
D
L
 
Q
A
 
G
A
 
L
A
 
A
Q
 
E
Q
 
R
V
 
S
A
 
A
Q
 
A
R
 
M
I
 
L
R
 
S
E
 
T
E
 
G
G
 
G
G
 
A
R
 
V
A
 
A
E
 
K
A
 
G
F
 
F
Q
 
G
C
 
A
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
K
R
 
A
A
 
A
S
 
D
V
 
I
D
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
T
A
 
S
T
 
A
T
 
E
S
 
Q
Q
 
T
L
 
I
G
 
G
P
 
S
I
 
L
D
 
T
V
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
W
 
I
D
 
A
V
 
G
F
 
F
K
 
G
P
 
S
F
 
V
T
 
H
K
 
D
T
 
A
E
 
D
P
 
A
A
 
A
Q
 
A
W
 
W
D
 
D
R
 
R
L
 
I
I
 
M
A
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
T
L
 
F
H
 
L
M
 
A
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
A
G
 
G
M
 
M
V
 
L
E
 
E
R
 
R
K
 
H
R
 
K
G
 
G
R
 
T
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
F
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
A
A
 
G
R
 
L
V
 
V
G
 
G
S
 
I
S
 
P
G
 
T
E
 
M
A
 
A
V
 
A
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
I
V
 
V
S
 
N
F
 
L
S
 
T
K
 
R
T
 
Q
I
 
M
A
 
A
R
 
A
E
 
D
H
 
Y
A
 
S
R
 
G
H
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
P
x
T
-
x
V
T
|
T
D
x
S
T
|
T
A
x
G
L
 
M
F
 
G
E
 
Q
D
 
Q
Y
 
L
K
 
L
Q
 
G
G
 
S
A
 
D
G
 
T
N
 
S
P
 
P
E
 
E
K
 
V
L
 
Q
I
 
A
E
 
R
A
x
R
F
 
L
T
 
A
R
x
K
S
 
-
I
x
Y
P
 
P
L
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
F
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
I
P
 
A
G
 
E
A
 
A
I
 
V
V
 
I
F
 
F
F
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
D
 
Q
A
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
A
L
 
F
S
 
A
V
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
T

Sites not aligning to the query:

1zemA Crystal structure of NAD+-bound xylitol dehydrogenase (see paper)
33% identity, 98% coverage: 2:250/255 of query aligns to 1:260/260 of 1zemA

query
sites
1zemA
Q
 
K
R
 
K
L
 
F
E
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
C
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
G
|
G
G
x
N
I
|
I
G
 
G
G
 
L
A
 
A
T
 
T
C
 
A
R
 
L
R
 
R
F
 
L
A
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
T
A
 
A
V
 
I
A
 
A
V
 
L
L
 
L
D
|
D
L
x
M
N
 
N
L
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
L
Q
 
E
Q
 
K
V
 
A
A
 
E
Q
 
A
R
 
S
I
 
V
R
 
R
E
 
E
E
 
K
G
 
G
G
 
V
R
 
E
A
 
A
E
 
R
A
 
S
F
 
Y
Q
 
V
C
 
C
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
S
R
 
E
A
 
E
S
 
A
V
 
V
D
 
I
A
 
G
A
 
T
V
 
V
A
 
D
A
 
S
T
 
V
T
 
V
S
 
R
Q
 
D
L
 
F
G
 
G
P
 
K
I
 
I
D
 
D
V
 
F
L
 
L
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
 
Y
D
 
Q
-
 
G
V
 
A
F
 
F
K
 
A
P
 
P
F
 
V
T
 
Q
K
 
D
T
 
Y
E
 
P
P
 
S
A
 
D
Q
 
D
W
 
F
D
 
A
R
 
R
L
 
V
I
 
L
A
 
T
I
 
I
N
 
N
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
F
H
 
H
M
 
V
H
 
L
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
S
P
 
R
G
 
Q
M
 
M
V
 
I
E
 
T
R
 
Q
K
 
N
R
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
D
 
M
A
 
A
A
 
G
R
 
V
V
 
K
G
 
G
S
 
P
S
 
P
G
 
N
E
 
M
A
 
A
V
 
A
Y
|
Y
A
 
G
A
 
T
C
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
I
V
 
I
S
 
A
F
 
L
S
 
T
K
 
E
T
 
T
I
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
D
H
 
L
A
 
A
R
 
P
H
 
Y
G
 
N
I
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
I
C
 
S
P
|
P
G
 
G
P
 
Y
T
x
M
D
 
G
T
 
P
A
 
G
L
 
F
F
 
M
E
 
W
D
 
E
-
 
R
-
 
Q
-
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
Q
-
 
A
-
 
K
-
 
V
-
 
G
Y
 
S
K
 
Q
Q
 
Y
G
 
F
A
 
S
G
 
T
N
x
D
P
 
P
E
 
K
K
 
V
L
 
V
I
 
A
E
 
Q
A
 
Q
F
 
M
T
 
I
R
 
G
S
 
S
I
 
V
P
 
P
L
 
M
G
 
R
R
 
R
I
 
Y
G
 
G
Q
 
D
P
 
I
E
 
N
D
 
E
L
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
V
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
L
S
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
S
A
 
S
F
 
F
V
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
V
V
 
N
L
 
L
S
 
P
V
 
I
S
 
A
G
 
G
G
 
G

4ituA Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) bound to s-hpc and nadh (see paper)
38% identity, 88% coverage: 28:252/255 of query aligns to 27:251/253 of 4ituA

query
sites
4ituA
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
L
 
I
D
|
D
L
|
L
N
 
D
L
 
Q
A
 
G
A
 
L
A
 
A
Q
 
E
Q
 
R
V
 
S
A
 
A
Q
 
A
R
 
M
I
 
L
R
 
S
E
 
T
E
 
G
G
 
G
G
 
A
R
 
V
A
 
A
E
 
K
A
 
G
F
 
F
Q
 
G
C
 
A
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
K
R
 
A
A
 
A
S
 
D
V
 
I
D
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
T
A
 
S
T
 
A
T
 
E
S
 
Q
Q
 
T
L
 
I
G
 
G
P
 
S
I
 
L
D
 
T
V
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
W
 
I
D
 
A
V
 
G
F
 
F
K
 
G
P
 
S
F
 
V
T
 
H
K
 
D
T
 
A
E
 
D
P
 
A
A
 
A
Q
 
A
W
 
W
D
 
D
R
 
R
L
 
I
I
 
M
A
 
A
I
x
V
N
|
N
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
T
L
 
F
H
 
L
M
 
A
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
A
G
 
G
M
 
M
V
 
L
E
 
E
R
 
R
K
 
H
R
 
K
G
 
G
R
 
T
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
F
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
A
A
 
G
R
 
L
V
 
V
G
 
G
S
 
I
S
 
P
G
 
T
E
 
M
A
 
A
V
 
A
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
I
V
 
V
S
 
N
F
 
L
S
 
T
K
 
R
T
 
Q
I
 
M
A
 
A
R
 
A
E
 
D
H
 
Y
A
 
S
R
 
G
H
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
C
 
C
P
|
P
G
 
G
P
x
T
-
x
V
T
 
T
D
 
S
T
|
T
A
 
G
L
x
M
F
 
G
E
 
Q
D
 
Q
Y
 
L
K
 
L
Q
 
G
G
 
S
A
 
D
G
 
T
N
 
S
P
 
P
E
 
E
K
 
V
L
 
Q
I
 
A
E
 
R
A
x
R
F
 
L
T
 
A
R
 
K
S
 
-
I
x
Y
P
 
P
L
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
F
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
I
P
 
A
G
 
E
A
 
A
I
 
V
V
 
I
F
 
F
F
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
D
 
Q
A
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
A
L
 
F
S
 
A
V
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
T

Sites not aligning to the query:

6d9yB Crystal structure of a short chain dehydrogenase/reductase sdr from burkholderia phymatum with partially occupied NAD
38% identity, 97% coverage: 4:250/255 of query aligns to 7:247/251 of 6d9yB

query
sites
6d9yB
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
R
T
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
G
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
G
 
Y
A
 
A
T
 
V
C
 
A
R
 
Q
R
 
R
F
 
A
A
 
L
R
 
R
E
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
L
L
 
W
D
|
D
L
|
L
N
 
D
L
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
A
Q
 
E
Q
 
R
V
 
L
A
 
A
Q
 
R
R
 
S
I
 
E
R
 
R
E
 
E
-
 
L
-
 
A
E
 
E
G
 
L
G
 
G
R
 
K
A
 
V
E
 
C
A
 
A
F
 
V
Q
 
T
C
x
V
D
|
D
I
x
Q
T
 
T
D
 
K
R
 
E
A
 
A
S
 
Q
V
 
I
D
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
G
A
 
K
T
 
T
T
 
L
S
 
A
Q
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
A
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
 
C
A
|
A
G
 
G
-
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
N
-
 
G
-
 
T
-
 
T
W
 
W
D
 
E
V
 
L
F
 
-
K
 
-
P
 
-
F
 
-
T
 
-
K
 
-
T
 
-
E
 
E
P
 
P
A
 
D
Q
 
V
W
 
W
D
 
R
R
 
Q
L
 
V
I
 
I
A
 
D
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
I
G
 
G
A
 
P
L
 
Y
H
 
L
M
 
V
H
 
C
H
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
V
P
 
P
G
 
Q
M
 
M
V
 
L
E
 
K
R
 
Q
K
 
G
R
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
D
 
V
A
 
A
A
 
G
R
 
K
V
 
E
G
 
G
S
 
N
S
 
P
G
 
N
E
 
A
A
 
S
V
 
H
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
C
 
S
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
S
 
G
F
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
S
I
 
L
A
 
G
R
 
K
E
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
T
H
 
K
G
 
N
I
 
I
T
 
L
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
C
 
T
P
|
P
G
x
A
P
x
A
T
x
A
D
 
K
T
|
T
A
 
E
L
 
I
F
 
F
E
 
D
D
 
S
Y
 
M
K
 
K
Q
 
Q
G
 
-
A
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
E
L
 
H
I
 
I
E
 
D
A
 
Y
F
 
M
T
 
L
R
 
S
S
 
K
I
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
N
R
 
R
I
 
F
G
 
L
Q
 
L
P
 
P
E
 
D
D
 
E
L
 
A
P
 
A
G
 
S
A
 
L
I
 
I
V
 
L
F
 
W
F
 
L
A
 
G
S
 
S
D
 
E
D
 
D
A
 
C
A
 
A
F
 
F
V
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
L
 
F
S
 
D
V
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
35% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 3:243/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
L
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
I
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
S
G
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
R
A
 
A
T
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
T
F
 
L
A
 
V
R
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
A
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
I
N
 
G
L
 
T
A
 
A
A
 
T
A
 
S
Q
 
E
Q
 
N
V
 
G
A
 
A
Q
 
K
R
 
N
I
 
I
R
 
S
E
 
D
E
 
Y
-
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
N
A
 
G
E
 
K
A
 
G
F
 
L
Q
 
M
C
 
L
D
 
N
I
 
V
T
 
T
D
 
D
R
 
P
A
 
A
S
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
N
T
 
I
T
 
R
S
 
A
Q
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
W
 
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
T
 
M
K
 
R
T
 
M
E
 
K
P
 
D
A
 
D
Q
 
E
W
 
W
D
 
N
R
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
L
 
F
H
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
R
G
 
A
M
|
M
V
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
R
 
C
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
 
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
 
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
S
 
G
F
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
I
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
V
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
I
D
 
E
T
 
T
-
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
S
E
 
D
D
 
D
Y
 
Q
K
 
R
Q
 
A
G
 
G
A
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
I
T
 
L
R
 
A
S
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
G
P
 
A
E
 
Q
D
 
E
L
 
I
P
 
A
G
 
S
A
 
A
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
A
|
A
S
|
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

Query Sequence

>RR42_RS23690 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS23690
MQRLEGKTVIVTGGGGGIGGATCRRFAREGAAVAVLDLNLAAAQQVAQRIREEGGRAEAF
QCDITDRASVDAAVAATTSQLGPIDVLVNNAGWDVFKPFTKTEPAQWDRLIAINLTGALH
MHHAVLPGMVERKRGRIVNIASDAARVGSSGEAVYAACKGGLVSFSKTIAREHARHGITV
NVVCPGPTDTALFEDYKQGAGNPEKLIEAFTRSIPLGRIGQPEDLPGAIVFFASDDAAFV
TGQVLSVSGGLTMNG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory