SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS25360 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS25360 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6ijbB Structure of 3-methylmercaptopropionate coa ligase mutant k523a in complex with amp and mmpa (see paper)
32% identity, 94% coverage: 19:536/554 of query aligns to 9:530/538 of 6ijbB

query
sites
6ijbB
P
 
P
L
 
L
T
 
L
P
 
I
L
 
S
H
 
S
F
 
L
L
 
I
D
 
D
R
 
H
C
 
A
A
 
A
E
 
-
Q
 
R
Y
 
Y
P
 
H
D
 
G
R
 
Q
T
 
T
A
 
E
I
 
I
I
 
V
-
 
S
-
 
V
-
 
E
-
 
T
H
 
D
G
 
G
P
 
T
V
 
V
-
 
T
R
 
R
Q
 
T
S
 
N
W
 
W
K
 
G
V
 
E
T
 
I
R
 
A
E
 
A
R
 
N
C
 
A
R
 
R
Q
 
R
L
 
M
A
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
T
K
 
K
R
 
L
G
 
G
V
 
L
G
 
Q
R
 
P
G
 
Q
D
 
D
T
 
R
V
 
I
S
 
G
I
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
W
N
 
N
T
 
N
P
 
R
A
 
R
M
 
H
V
 
L
E
 
E
A
 
I
H
 
Y
H
 
Y
G
 
A
I
 
A
P
 
S
L
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
F
V
 
V
L
 
C
N
 
H
A
 
T
I
 
I
N
 
N
C
 
P
R
 
R
L
 
L
D
 
F
A
 
P
D
 
E
G
 
Q
V
 
L
R
 
V
F
 
Y
I
 
I
V
 
I
A
 
N
H
 
H
G
 
A
E
 
Q
C
 
D
K
 
R
V
 
V
L
 
L
F
 
F
V
 
F
D
 
D
R
 
A
E
 
T
F
 
F
S
 
L
A
 
P
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
A
A
 
I
L
 
R
Q
 
D
G
 
Q
L
 
L
P
 
T
N
 
E
A
 
V
P
 
K
L
 
H
V
 
F
I
 
V
D
 
L
I
 
M
A
 
G
D
 
P
A
 
R
L
 
N
A
 
E
P
 
D
A
 
A
G
 
L
E
 
Q
P
 
Q
I
 
I
G
 
P
A
 
G
M
 
L
E
 
E
-
 
F
Y
 
Y
E
 
D
Q
 
E
F
 
L
L
 
I
R
 
E
E
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
T
D
 
D
F
 
F
P
 
E
G
 
-
V
 
-
W
 
W
P
 
P
-
 
V
D
 
F
D
 
D
E
 
E
W
 
N
N
 
T
A
 
A
I
 
S
A
 
S
L
 
L
N
 
C
Y
 
Y
T
|
T
S
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
T
S
 
G
D
 
H
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
L
P
 
Y
S
 
S
H
 
H
R
 
R
G
 
S
A
 
T
Y
 
V
L
 
L
M
x
H
S
 
S
M
 
F
L
 
A
Q
 
S
L
 
N
T
 
T
D
 
R
-
 
D
-
 
V
W
 
I
G
 
G
M
 
Y
P
 
S
R
 
A
A
 
M
P
 
D
K
 
V
Y
 
V
L
 
M
W
 
P
T
 
V
L
 
V
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
|
H
A
 
V
N
 
N
G
 
A
W
|
W
C
 
G
F
 
S
S
 
P
W
 
Y
A
 
G
V
 
C
T
 
-
A
 
A
A
 
M
A
 
S
G
 
G
T
 
A
H
 
Q
V
 
M
C
 
V
L
 
L
R
 
P
-
 
G
-
 
P
K
 
D
V
 
L
T
 
H
A
 
G
A
 
E
N
 
A
I
 
L
F
 
V
S
 
N
A
 
L
I
 
I
E
 
D
A
 
T
Y
 
Y
G
 
G
A
 
V
D
 
T
H
 
L
F
 
A
C
 
M
A
 
G
A
 
V
P
 
P
I
 
T
V
 
I
L
 
W
S
 
Q
S
 
G
L
 
L
A
 
L
T
 
A
A
 
H
T
 
A
Q
 
A
E
 
K
E
 
C
R
 
G
R
 
T
P
 
K
F
 
L
S
 
E
H
 
S
V
 
L
V
 
E
R
 
R
I
 
T
R
 
V
T
 
I
A
 
G
G
|
G
S
x
A
P
x
A
P
 
C
P
 
P
A
 
P
S
 
S
V
 
M
L
 
I
K
 
A
A
 
T
V
 
F
I
 
R
E
 
E
Q
 
K
-
 
Y
G
 
G
F
 
V
D
 
D
V
 
T
E
 
V
H
|
H
V
x
A
Y
x
W
G
|
G
I
x
M
T
x
S
E
|
E
A
 
M
S
 
S
G
 
P
T
 
L
P
 
G
V
 
T
S
 
A
S
 
N
Y
 
I
A
 
P
N
 
L
P
 
A
A
 
K
W
 
H
N
 
R
E
 
K
K
 
L
S
 
P
G
 
I
D
 
E
E
 
E
K
 
Q
A
 
H
R
 
K
L
 
L
M
 
R
A
 
E
R
 
N
Q
|
Q
G
 
G
N
 
R
R
 
P
A
 
P
A
 
F
G
 
G
L
 
V
E
 
E
G
 
-
L
 
L
R
 
K
V
 
I
A
 
V
D
 
D
P
 
D
D
 
D
T
 
G
M
 
-
E
 
N
S
 
D
V
 
L
P
 
P
W
 
H
D
 
D
G
 
G
T
 
V
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
E
 
D
L
 
L
L
 
M
L
 
V
R
 
R
G
 
G
N
 
H
I
 
W
V
 
V
M
 
L
K
 
D
G
 
S
Y
 
Y
L
 
F
K
 
Q
N
 
L
P
 
K
E
 
D
A
 
-
T
 
-
E
 
Q
A
 
E
A
 
L
F
 
L
A
 
Q
G
 
D
G
 
G
W
 
W
F
 
F
H
 
A
T
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
V
A
 
A
V
 
T
V
 
L
H
 
D
P
 
P
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
V
 
M
Q
 
T
I
 
I
T
 
R
D
 
D
R
 
R
S
 
S
K
 
K
D
 
D
V
 
I
I
 
I
I
x
K
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
N
x
W
I
 
I
S
 
S
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
L
E
 
E
D
 
N
V
 
I
L
 
A
H
 
V
Q
 
A
H
 
H
P
 
P
A
 
K
V
 
L
L
 
A
I
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
G
Q
 
V
P
 
P
H
 
H
P
 
P
K
 
K
W
 
W
G
 
D
E
 
E
S
 
R
P
 
P
C
 
L
A
 
-
F
 
L
I
 
V
E
 
A
L
 
V
K
 
K
N
 
A
G
 
E
V
 
G
A
 
E
A
 
D
P
 
P
T
 
S
E
 
E
A
 
A
E
 
E
I
 
L
I
 
L
A
 
E
F
 
F
C
 
F
R
 
D
S
 
G
R
 
K
L
 
I
A
 
A
H
 
K
Y
 
W
K
 
Q
C
 
V
P
 
P
T
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
V
Y
 
F
-
 
V
G
 
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
K
 
L
T
 
N
G
 
A
T
 
T
G
 
G
K
x
A
I
 
V
Q
 
L
K
 
K
Y
 
R
R
 
K
L
 
L
R
 
R

Q5SKN9 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase; Long-chain fatty acyl-CoA synthetase; LC-FACS; EC 6.2.1.3 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see paper)
35% identity, 92% coverage: 25:536/554 of query aligns to 23:531/541 of Q5SKN9

query
sites
Q5SKN9
F
 
F
L
 
L
D
 
E
R
 
R
C
 
A
A
 
A
E
 
A
Q
 
L
Y
 
F
P
 
G
D
 
R
R
 
K
T
 
E
A
 
V
I
 
V
-
 
S
-
 
R
I
 
L
H
 
H
-
 
T
G
 
G
P
 
E
V
 
V
-
 
H
R
 
R
Q
 
T
S
 
T
W
 
Y
K
 
A
V
 
E
T
 
V
R
 
Y
E
 
Q
R
 
R
C
 
A
R
 
R
Q
 
R
L
 
L
A
 
M
S
 
G
A
 
G
L
 
L
V
 
R
K
 
A
R
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
V
G
 
G
D
 
D
T
 
R
V
 
V
S
 
A
I
 
T
L
 
L
A
 
G
P
 
F
N
 
N
T
 
H
P
 
F
A
 
R
M
 
H
V
 
L
E
 
E
A
 
A
H
 
Y
H
 
F
G
 
A
I
 
V
P
 
P
L
 
G
S
 
M
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
N
 
H
A
 
T
I
 
A
N
 
N
C
 
P
R
 
R
L
 
L
D
 
S
A
 
P
D
 
K
G
 
E
V
 
I
R
 
A
F
 
Y
I
 
I
V
 
L
A
 
N
H
 
H
G
 
A
E
 
E
C
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
L
F
 
L
V
 
F
D
 
D
R
 
P
E
 
N
F
 
L
S
 
L
A
 
P
L
 
L
A
 
V
A
 
-
E
 
E
A
 
A
L
 
I
Q
 
R
G
 
G
L
 
E
P
 
L
N
 
K
A
 
T
P
 
V
L
 
Q
V
 
H
I
 
F
D
 
V
I
 
V
A
 
M
D
 
D
A
 
E
L
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
E
G
 
G
E
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
Y
M
 
L
E
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
E
F
 
A
L
 
L
R
 
-
E
 
-
G
 
G
D
 
E
I
 
E
D
 
A
F
 
D
P
 
P
G
 
V
V
 
R
W
 
V
P
 
P
D
 
-
D
 
-
E
 
E
W
 
R
N
 
A
A
 
A
I
 
C
A
 
G
L
 
M
N
 
A
Y
 
Y
T
|
T
S
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
T
S
 
G
D
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
V
P
 
Y
S
 
S
H
 
H
R
 
R
G
 
A
A
 
L
Y
 
V
L
 
L
M
 
H
S
 
S
M
 
L
L
 
A
Q
 
A
L
 
S
T
 
L
D
 
V
W
 
D
G
 
G
M
 
T
P
 
A
R
 
L
A
 
S
P
 
E
K
 
K
-
 
D
-
 
V
Y
 
V
L
 
L
W
 
P
T
 
V
L
 
V
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
 
H
A
 
V
N
 
N
G
 
A
W
 
W
C
 
C
F
 
L
S
 
P
W
 
Y
A
 
A
V
 
A
T
 
T
A
 
L
A
 
V
A
 
G
G
 
A
T
 
K
H
 
Q
V
 
V
C
 
L
L
 
P
R
 
G
-
 
P
K
 
R
V
 
L
T
 
D
A
 
P
A
 
A
N
 
S
I
 
L
F
 
V
S
 
E
A
 
L
I
 
F
E
 
D
A
 
G
Y
 
E
G
 
G
A
 
V
D
 
T
H
 
F
F
 
T
C
 
A
A
 
G
A
 
V
P
 
P
I
 
T
V
 
V
L
 
W
S
 
L
S
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
D
A
 
Y
T
 
L
Q
 
E
E
 
S
E
 
T
R
 
G
R
 
H
P
 
R
F
 
L
S
 
K
H
 
T
V
 
L
V
 
R
R
 
R
I
 
L
R
 
V
T
 
V
A
 
G
G
|
G
S
 
S
P
 
A
P
 
A
P
 
P
A
 
R
S
 
S
V
 
L
L
 
I
K
 
A
A
 
R
V
 
F
I
 
E
E
 
R
Q
 
M
G
 
G
F
 
V
D
 
E
V
 
V
E
 
R
H
x
Q
V
x
G
Y
 
Y
G
 
G
I
 
L
T
|
T
E
|
E
A
 
T
S
 
S
G
 
P
T
 
V
P
 
V
V
 
V
S
 
Q
S
 
N
Y
 
F
A
 
V
N
 
K
P
 
S
A
 
H
W
 
L
N
 
E
E
 
S
K
 
L
S
 
S
G
 
E
D
 
E
E
 
E
K
 
K
A
 
L
R
 
T
L
 
L
M
 
K
A
 
A
R
 
K
Q
 
T
G
 
G
N
 
-
R
 
L
A
 
P
A
 
I
G
 
P
L
 
L
E
 
V
G
 
R
L
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
D
 
D
P
 
E
D
 
E
T
 
G
M
 
-
E
 
R
S
 
P
V
 
V
P
 
P
W
 
K
D
 
D
G
 
G
T
 
K
T
 
A
Q
 
L
G
 
G
E
 
E
L
 
V
L
 
Q
L
 
L
R
 
K
G
 
G
N
 
P
I
 
W
V
 
I
M
 
T
K
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
Y
K
 
G
N
 
N
P
 
E
E
 
E
A
 
A
T
 
T
E
 
R
A
 
S
A
 
A
F
 
L
A
 
T
-
 
P
G
 
D
G
 
G
W
 
F
F
 
F
H
 
R
T
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
I
A
 
A
V
 
V
V
 
W
H
 
D
P
 
E
D
 
E
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
E
I
 
I
T
 
K
D
 
D
R
 
R
S
 
L
K
|
K
D
 
D
V
 
L
I
 
I
I
x
K
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
N
 
W
I
 
I
S
 
S
S
 
S
V
 
V
E
 
D
V
 
L
E
 
E
D
 
N
V
 
A
L
 
L
H
 
M
Q
 
G
H
 
H
P
 
P
A
 
K
V
 
V
L
 
K
I
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
Q
 
I
P
 
P
H
 
H
P
 
P
K
 
K
W
 
W
G
 
Q
E
 
E
S
 
R
P
 
P
C
 
L
A
 
A
F
 
V
I
 
V
E
 
V
L
 
P
K
 
R
N
 
G
G
 
E
V
 
K
A
 
P
A
 
T
P
 
P
T
 
E
E
 
E
A
 
L
E
 
N
I
 
-
I
 
E
A
 
H
F
 
L
C
 
L
R
 
K
S
 
A
R
 
G
L
 
F
A
 
A
H
 
K
Y
 
W
K
 
Q
C
 
L
P
 
P
T
 
D
R
 
A
V
 
Y
V
 
V
Y
 
F
G
 
A
-
 
E
A
 
E
L
 
I
P
 
P
K
 
R
T
 
T
G
 
S
T
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
F
Q
 
L
K
 
K
Y
 
R
R
 
A
L
 
L
R
 
R

6ihkB Structure of mmpa coa ligase in complex with adp (see paper)
32% identity, 94% coverage: 19:536/554 of query aligns to 9:527/533 of 6ihkB

query
sites
6ihkB
P
 
P
L
 
L
T
 
L
P
 
I
L
 
S
H
 
S
F
 
L
L
 
I
D
 
D
R
 
H
C
 
A
A
 
A
E
 
-
Q
 
R
Y
 
Y
P
 
H
D
 
G
R
 
Q
T
 
T
A
 
E
I
 
I
I
 
V
-
 
S
-
 
V
-
 
E
-
 
T
H
 
D
G
 
G
P
 
T
V
 
V
-
 
T
R
 
R
Q
 
T
S
 
N
W
 
W
K
 
G
V
 
E
T
 
I
R
 
A
E
 
A
R
 
N
C
 
A
R
 
R
Q
 
R
L
 
M
A
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
T
K
 
K
R
 
L
G
 
G
V
 
L
G
 
Q
R
 
P
G
 
Q
D
 
D
T
 
R
V
 
I
S
 
G
I
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
W
N
 
N
T
 
N
P
 
R
A
 
R
M
 
H
V
 
L
E
 
E
A
 
I
H
 
Y
H
 
Y
G
 
A
I
 
A
P
 
S
L
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
F
V
 
V
L
 
C
N
 
H
A
 
T
I
 
I
N
 
N
C
 
P
R
 
R
L
 
L
D
 
F
A
 
P
D
 
E
G
 
Q
V
 
L
R
 
V
F
 
Y
I
 
I
V
 
I
A
 
N
H
 
H
G
 
A
E
 
Q
C
 
D
K
 
R
V
 
V
L
 
L
F
 
F
V
 
F
D
 
D
R
 
A
E
 
T
F
 
F
S
 
L
A
 
P
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
A
A
 
I
L
 
R
Q
 
D
G
 
Q
L
 
L
P
 
T
N
 
E
A
 
V
P
 
K
L
 
H
V
 
F
I
 
V
D
 
L
I
 
M
A
 
G
D
 
P
A
 
R
L
 
N
A
 
E
P
 
D
A
 
A
G
 
L
E
 
Q
P
 
Q
I
 
I
G
 
P
A
 
G
M
 
L
E
 
E
-
 
F
Y
 
Y
E
 
D
Q
 
E
F
 
L
L
 
I
R
 
E
E
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
T
D
 
D
F
 
F
P
 
E
G
 
-
V
 
-
W
 
W
P
 
P
-
 
V
D
 
F
D
 
D
E
 
E
W
 
N
N
 
T
A
 
A
I
 
S
A
 
S
L
 
L
N
 
C
Y
 
Y
T
|
T
S
 
S
G
 
G
T
 
-
T
 
-
S
 
-
D
 
H
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
L
P
 
Y
S
 
S
H
 
H
R
 
R
G
 
S
A
 
T
Y
 
V
L
 
L
M
x
H
S
 
S
M
 
F
L
 
A
Q
 
S
L
 
N
T
 
T
D
 
R
-
 
D
-
 
V
W
 
I
G
 
G
M
 
Y
P
 
S
R
 
A
A
 
M
P
 
D
K
 
V
Y
 
V
L
 
M
W
 
P
T
 
V
L
 
V
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
|
H
A
 
V
N
 
N
G
 
A
W
 
W
C
 
G
F
 
S
S
 
P
W
 
Y
A
 
G
V
 
C
T
 
-
A
 
A
A
 
M
A
 
S
G
 
G
T
 
A
H
 
Q
V
 
M
C
 
V
L
 
L
R
 
P
-
 
G
-
 
P
K
 
D
V
 
L
T
 
H
A
 
G
A
 
E
N
 
A
I
 
L
F
 
V
S
 
N
A
 
L
I
 
I
E
 
D
A
 
T
Y
 
Y
G
 
G
A
 
V
D
 
T
H
 
L
F
 
A
C
 
M
A
 
G
A
 
V
P
 
P
I
 
T
V
 
I
L
 
W
S
 
Q
S
 
G
L
 
L
A
 
L
T
 
A
A
 
H
T
 
A
Q
 
A
E
 
K
E
 
C
R
 
G
R
 
T
P
 
K
F
 
L
S
 
E
H
 
S
V
 
L
V
 
E
R
 
R
I
 
T
R
 
V
T
 
I
A
 
G
G
|
G
S
x
A
P
x
A
P
 
C
P
 
P
A
 
P
S
 
S
V
 
M
L
 
I
K
 
A
A
 
T
V
 
F
I
 
R
E
 
E
Q
 
K
-
 
Y
G
 
G
F
 
V
D
 
D
V
 
T
E
 
V
H
|
H
V
x
A
Y
x
W
G
|
G
I
x
M
T
x
S
E
|
E
A
 
M
S
 
S
G
 
P
T
 
L
P
 
G
V
 
T
S
 
A
S
 
N
Y
 
I
A
 
P
N
 
L
P
 
A
A
 
K
W
 
H
N
 
R
E
 
K
K
 
L
S
 
P
G
 
I
D
 
E
E
 
E
K
 
Q
A
 
H
R
 
K
L
 
L
M
 
R
A
 
E
R
 
N
Q
|
Q
G
 
G
N
 
R
R
 
P
A
 
P
A
 
F
G
 
G
L
 
V
E
 
E
G
 
-
L
 
L
R
 
K
V
 
I
A
 
V
D
 
D
P
 
D
D
 
D
T
 
G
M
 
-
E
 
N
S
 
D
V
 
L
P
 
P
W
 
H
D
 
D
G
 
G
T
 
V
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
E
 
D
L
 
L
L
 
M
L
 
V
R
 
R
G
 
G
N
 
H
I
 
W
V
 
V
M
 
L
K
 
D
G
 
S
Y
 
Y
L
 
F
K
 
Q
N
 
L
P
 
K
E
 
D
A
 
-
T
 
-
E
 
Q
A
 
E
A
 
L
F
 
L
A
 
Q
G
 
D
G
 
G
W
 
W
F
 
F
H
 
A
T
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
V
A
 
A
V
 
T
V
 
L
H
 
D
P
 
P
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
V
 
M
Q
 
T
I
 
I
T
 
R
D
 
D
R
|
R
S
 
S
K
 
K
D
 
D
V
 
I
I
 
I
I
x
K
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
N
x
W
I
 
I
S
 
S
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
L
E
 
E
D
 
N
V
 
I
L
 
A
H
 
V
Q
 
A
H
 
H
P
 
P
A
 
K
V
 
L
L
 
A
I
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
G
Q
 
V
P
 
P
H
 
H
P
 
P
K
 
K
W
 
W
G
 
D
E
 
E
S
 
R
P
 
P
C
 
L
A
 
-
F
 
L
I
 
V
E
 
A
L
 
V
K
 
K
N
 
A
G
 
E
V
 
G
A
 
E
A
 
D
P
 
P
T
 
S
E
 
E
A
 
A
E
 
E
I
 
L
I
 
L
A
 
E
F
 
F
C
 
F
R
 
D
S
 
G
R
 
K
L
 
I
A
 
A
H
 
K
Y
 
W
K
 
Q
C
 
V
P
 
P
T
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
V
Y
 
F
-
 
V
G
 
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
K
 
L
T
 
N
G
 
A
T
 
T
G
 
G
K
|
K
I
 
V
Q
 
L
K
 
K
Y
 
R
R
 
K
L
 
L
R
 
R

1v25A Crystal structure of tt0168 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
35% identity, 83% coverage: 25:486/554 of query aligns to 16:464/491 of 1v25A

query
sites
1v25A
F
 
F
L
 
L
D
 
E
R
 
R
C
 
A
A
 
A
E
 
A
Q
 
L
Y
 
F
P
 
G
D
 
R
R
 
K
T
 
E
A
 
V
I
 
V
-
 
S
-
 
R
I
 
L
H
 
H
-
 
T
G
 
G
P
 
E
V
 
V
-
 
H
R
 
R
Q
 
T
S
 
T
W
 
Y
K
 
A
V
 
E
T
 
V
R
 
Y
E
 
Q
R
 
R
C
 
A
R
 
R
Q
 
R
L
 
L
A
 
M
S
 
G
A
 
G
L
 
L
V
 
R
K
 
A
R
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
V
G
 
G
D
 
D
T
 
R
V
 
V
S
 
A
I
 
T
L
 
L
A
 
G
P
 
F
N
 
N
T
 
H
P
 
F
A
 
R
M
 
H
V
 
L
E
 
E
A
 
A
H
 
Y
H
 
F
G
 
A
I
 
V
P
 
P
L
 
G
S
 
M
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
N
 
H
A
 
T
I
 
A
N
 
N
C
 
P
R
 
R
L
 
L
D
 
S
A
 
P
D
 
K
G
 
E
V
 
I
R
 
A
F
 
Y
I
 
I
V
 
L
A
 
N
H
 
H
G
 
A
E
 
E
C
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
L
F
 
L
V
 
F
D
 
D
R
 
P
E
 
N
F
 
L
S
 
L
A
 
P
L
 
L
A
 
V
A
 
-
E
 
E
A
 
A
L
 
I
Q
 
R
G
 
G
L
 
E
P
 
L
N
 
K
A
 
T
P
 
V
L
 
Q
V
 
H
I
 
F
D
 
V
I
 
V
A
 
M
D
 
D
A
 
E
L
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
E
G
 
G
E
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
Y
M
 
L
E
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
E
F
 
A
L
 
L
R
 
-
E
 
-
G
 
G
D
 
E
I
 
E
D
 
A
F
 
D
P
 
P
G
 
V
V
 
R
W
 
V
P
 
P
D
 
-
D
 
-
E
 
E
W
 
R
N
 
A
A
 
A
I
 
C
A
 
G
L
 
M
N
 
A
Y
 
Y
T
|
T
S
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
T
S
 
G
D
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
V
P
 
Y
S
 
S
H
 
H
R
 
R
G
 
A
A
 
L
Y
 
V
L
 
L
M
x
H
S
 
S
M
 
L
L
 
A
Q
 
A
L
 
S
T
 
L
D
 
V
W
 
D
G
 
G
M
 
T
P
 
A
R
 
L
A
 
S
P
 
E
K
 
K
-
 
D
-
 
V
Y
 
V
L
 
L
W
 
P
T
 
V
L
 
V
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
|
H
A
x
V
N
 
N
G
 
A
W
 
W
C
 
C
F
 
L
S
 
P
W
 
Y
A
 
A
V
 
A
T
 
T
A
 
L
A
 
V
A
 
G
G
 
A
T
 
K
H
 
Q
V
 
V
C
 
L
L
 
P
R
 
G
-
 
P
K
 
R
V
 
L
T
 
D
A
 
P
A
 
A
N
 
S
I
 
L
F
 
V
S
 
E
A
 
L
I
 
F
E
 
D
A
 
G
Y
 
E
G
 
G
A
 
V
D
 
T
H
 
F
F
 
T
C
 
A
A
 
G
A
 
V
P
 
P
I
 
T
V
 
V
L
 
W
S
 
L
S
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
D
A
 
Y
T
 
L
Q
 
E
E
 
S
E
 
T
R
 
G
R
 
H
P
 
R
F
 
L
S
 
K
H
 
T
V
 
L
V
 
R
R
 
R
I
 
L
R
 
V
T
 
V
A
 
G
G
|
G
S
|
S
P
x
A
P
 
A
P
 
P
A
 
R
S
 
S
V
 
L
L
 
I
K
 
A
A
 
R
V
 
F
I
 
E
E
 
R
Q
 
M
G
 
G
F
 
V
D
 
E
V
 
V
E
 
R
H
 
Q
V
 
G
Y
|
Y
G
|
G
I
x
L
T
|
T
E
|
E
A
 
T
S
 
S
G
 
P
T
 
V
P
 
V
V
 
V
S
 
Q
S
 
N
Y
 
F
A
 
V
N
 
K
P
 
S
A
 
H
W
 
L
N
 
E
E
 
S
K
 
L
S
 
S
G
 
E
D
 
E
E
 
E
K
 
K
A
 
L
R
 
T
L
 
L
M
 
K
A
 
A
R
 
K
Q
 
T
G
 
G
N
 
-
R
 
L
A
 
P
A
 
I
G
 
P
L
 
L
E
 
V
G
 
R
L
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
D
 
D
P
 
E
D
 
E
T
 
G
M
 
-
E
 
R
S
 
P
V
 
V
P
 
P
W
 
K
D
 
D
G
 
G
T
 
K
T
 
A
Q
 
L
G
 
G
E
 
E
L
 
V
L
 
Q
L
 
L
R
 
K
G
 
G
N
 
P
I
 
W
V
 
I
M
 
T
K
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
Y
K
 
G
N
 
N
P
 
E
E
 
E
A
 
A
T
 
T
E
 
R
A
 
S
A
 
A
F
 
L
A
 
T
-
 
P
G
 
D
G
 
G
W
 
F
F
 
F
H
 
R
T
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
I
A
 
A
V
 
V
V
 
W
H
 
D
P
 
E
D
 
E
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
E
I
|
I
T
 
K
D
 
D
R
 
R
S
 
L
K
 
K
D
 
D
V
 
L
I
 
I
I
x
K
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
N
x
W
I
 
I
S
 
S
S
 
S
V
 
V
E
 
D
V
 
L
E
 
E
D
 
N
V
 
-
L
 
-
H
 
-
Q
 
-
H
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
I
 
-
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
Q
 
I
P
 
P
H
 
H
P
 
P
K
 
K
W
 
W
G
 
Q
E
 
E
S
 
R
P
 
P
C
 
L
A
 
A
F
 
V
I
 
V

1v26B Crystal structure of tt0168 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
35% identity, 83% coverage: 25:484/554 of query aligns to 16:463/510 of 1v26B

query
sites
1v26B
F
 
F
L
 
L
D
 
E
R
 
R
C
 
A
A
 
A
E
 
A
Q
 
L
Y
 
F
P
 
G
D
 
R
R
 
K
T
 
E
A
 
V
I
 
V
-
 
S
-
 
R
I
 
L
H
 
H
-
 
T
G
 
G
P
 
E
V
 
V
-
 
H
R
 
R
Q
 
T
S
 
T
W
 
Y
K
 
A
V
 
E
T
 
V
R
 
Y
E
 
Q
R
 
R
C
 
A
R
 
R
Q
 
R
L
 
L
A
 
M
S
 
G
A
 
G
L
 
L
V
 
R
K
 
A
R
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
V
G
 
G
D
 
D
T
 
R
V
 
V
S
 
A
I
 
T
L
 
L
A
 
G
P
 
F
N
 
N
T
 
H
P
 
F
A
 
R
M
 
H
V
 
L
E
 
E
A
 
A
H
 
Y
H
 
F
G
 
A
I
 
V
P
 
P
L
 
G
S
 
M
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
N
 
H
A
 
T
I
 
A
N
 
N
C
 
P
R
 
R
L
 
L
D
 
S
A
 
P
D
 
K
G
 
E
V
 
I
R
 
A
F
 
Y
I
 
I
V
 
L
A
 
N
H
 
H
G
 
A
E
 
E
C
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
L
F
 
L
V
 
F
D
 
D
R
 
P
E
 
N
F
 
L
S
 
L
A
 
P
L
 
L
A
 
V
A
 
-
E
 
E
A
 
A
L
 
I
Q
 
R
G
 
G
L
 
E
P
 
L
N
 
K
A
 
T
P
 
V
L
 
Q
V
 
H
I
 
F
D
 
V
I
 
V
A
 
M
D
 
D
A
 
E
L
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
E
G
 
G
E
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
Y
M
 
L
E
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
E
F
 
A
L
 
L
R
 
-
E
 
-
G
 
G
D
 
E
I
 
E
D
 
A
F
 
D
P
 
P
G
 
V
V
 
R
W
 
V
P
 
P
D
 
-
D
 
-
E
 
E
W
 
R
N
 
A
A
 
A
I
 
C
A
 
G
L
 
M
N
 
A
Y
 
Y
T
|
T
S
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
T
S
 
G
D
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
V
P
 
Y
S
 
S
H
 
H
R
 
R
G
 
A
A
 
L
Y
 
V
L
 
L
M
x
H
S
 
S
M
 
L
L
 
A
Q
 
A
L
 
S
T
 
L
D
 
V
W
 
D
G
 
G
M
 
T
P
 
A
R
 
L
A
 
S
P
 
E
K
 
K
-
 
D
-
 
V
Y
 
V
L
 
L
W
 
P
T
 
V
L
 
V
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
|
H
A
 
V
N
 
N
G
 
A
W
 
W
C
 
C
F
 
L
S
 
P
W
 
Y
A
 
A
V
 
A
T
 
T
A
 
L
A
 
V
A
 
G
G
 
A
T
 
K
H
 
Q
V
 
V
C
 
L
L
 
P
R
 
G
-
 
P
K
 
R
V
 
L
T
 
D
A
 
P
A
 
A
N
 
S
I
 
L
F
 
V
S
 
E
A
 
L
I
 
F
E
 
D
A
 
G
Y
 
E
G
 
G
A
 
V
D
 
T
H
 
F
F
 
T
C
 
A
A
 
G
A
 
V
P
 
P
I
 
T
V
 
V
L
 
W
S
 
L
S
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
D
A
 
Y
T
 
L
Q
 
E
E
 
S
E
 
T
R
 
G
R
 
H
P
 
R
F
 
L
S
 
K
H
 
T
V
 
L
V
 
R
R
 
R
I
 
L
R
 
V
T
 
V
A
 
G
G
|
G
S
|
S
P
x
A
P
 
A
P
 
P
A
 
R
S
 
S
V
 
L
L
 
I
K
 
A
A
 
R
V
 
F
I
 
E
E
 
R
Q
 
M
G
 
G
F
 
V
D
 
E
V
 
V
E
 
R
H
 
Q
V
x
G
Y
|
Y
G
|
G
I
x
L
T
|
T
E
|
E
A
 
T
S
 
S
G
 
P
T
 
V
P
 
V
V
 
V
S
 
Q
S
 
N
Y
 
F
A
 
V
N
 
K
P
 
S
A
 
H
W
 
L
N
 
E
E
 
S
K
 
L
S
 
S
G
 
E
D
 
E
E
 
E
K
 
K
A
 
L
R
 
T
L
 
L
M
 
K
A
 
A
R
 
K
Q
 
T
G
 
G
N
 
-
R
 
L
A
 
P
A
 
I
G
 
P
L
 
L
E
 
V
G
 
R
L
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
D
 
D
P
 
E
D
 
E
T
 
G
M
 
-
E
 
R
S
 
P
V
 
V
P
 
P
W
 
K
D
 
D
G
 
G
T
 
K
T
 
A
Q
 
L
G
 
G
E
 
E
L
 
V
L
 
Q
L
 
L
R
 
K
G
 
G
N
 
P
I
 
W
V
 
I
M
 
T
K
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
Y
K
 
G
N
 
N
P
 
E
E
 
E
A
 
A
T
 
T
E
 
R
A
 
S
A
 
A
F
 
L
A
 
T
-
 
P
G
 
D
G
 
G
W
 
F
F
 
F
H
 
R
T
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
I
A
 
A
V
 
V
V
 
W
H
 
D
P
 
E
D
 
E
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
E
I
 
I
T
 
K
D
 
D
R
 
R
S
 
L
K
|
K
D
 
D
V
 
L
I
 
I
I
x
K
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
N
x
W
I
 
I
S
 
S
S
 
S
V
 
V
E
 
D
V
 
L
E
 
E
D
 
N
V
 
A
L
 
-
H
 
-
Q
 
-
H
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
I
 
-
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
Q
 
I
P
 
P
H
 
H
P
 
P
K
 
K
W
 
W
G
 
Q
E
 
E
S
 
R
P
 
P
C
 
L
A
 
A

P9WQ37 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase FadD13; Fatty acyl-CoA ligase; FACL; FACL13; Fatty acyl-CoA synthetase; ACS; FACS; Very-long-chain fatty-acyl-CoA synthetase; ACSVL; EC 6.2.1.3 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 4 papers)
29% identity, 89% coverage: 44:536/554 of query aligns to 28:494/503 of P9WQ37

query
sites
P9WQ37
V
 
V
R
 
R
Q
 
M
S
 
T
W
 
Y
K
 
A
V
 
Q
T
 
M
R
 
N
E
 
A
R
 
L
C
 
A
R
 
N
Q
 
R
L
 
C
A
 
A
S
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
T
K
 
A
R
 
L
G
 
G
V
 
I
G
 
A
R
 
K
G
 
G
D
 
D
T
 
R
V
 
V
S
 
A
I
 
L
L
 
L
A
 
M
P
 
P
N
 
N
T
 
S
P
 
V
A
 
E
M
 
F
V
 
C
E
 
C
A
 
L
H
 
F
H
 
Y
G
 
G
I
 
A
P
 
A
L
 
K
S
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
A
N
 
V
A
 
P
I
 
I
N
 
N
C
 
T
R
 
R
L
 
L
D
 
A
A
 
A
D
 
P
G
 
E
V
 
V
R
 
S
F
 
F
I
 
I
V
 
L
A
 
S
H
 
D
G
 
S
E
 
G
C
 
S
K
 
K
V
 
V
L
 
V
F
 
-
V
 
-
D
 
-
R
 
-
E
 
-
F
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
I
Q
 
Y
G
 
G
L
 
A
P
 
P
N
 
S
A
 
A
P
 
P
L
 
V
V
 
I
I
 
D
D
 
A
I
 
I
A
 
R
D
 
A
A
 
Q
L
 
A
A
 
D
P
 
P
A
 
P
G
 
G
-
 
T
-
 
V
-
 
T
E
 
D
P
 
W
I
 
I
G
 
G
A
 
A
M
 
D
E
 
S
Y
 
L
E
 
A
Q
 
E
F
 
R
L
 
L
R
 
R
E
 
S
G
 
A
D
 
A
I
 
A
D
 
D
F
 
E
P
 
P
G
 
A
V
 
V
W
 
E
P
 
C
D
 
G
D
 
G
E
 
D
W
 
D
N
 
N
A
 
-
I
 
L
A
 
F
L
 
I
N
 
M
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
T
S
 
G
D
 
H
P
 
P
K
|
K
G
 
G
V
 
V
V
 
V
P
 
H
S
 
T
H
 
H
R
 
E
G
 
S
A
 
V
Y
 
H
L
 
S
M
 
A
S
 
A
M
 
S
L
 
S
Q
 
W
L
 
A
T
 
S
D
 
T
W
 
I
G
 
D
M
 
V
P
x
R
R
 
Y
A
x
R
P
 
D
K
 
R
Y
 
L
L
 
L
W
 
L
T
 
P
L
 
L
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
 
H
A
x
V
N
 
A
G
x
A
W
 
L
C
 
T
F
x
T
S
 
V
W
 
I
A
 
F
V
 
S
T
 
A
A
 
M
A
 
R
A
 
G
G
 
V
T
 
T
H
 
L
V
 
I
C
 
S
L
 
M
R
 
P
K
 
Q
V
 
F
T
 
D
A
 
A
A
 
T
N
 
K
I
 
V
F
 
W
S
 
S
A
 
L
I
 
I
E
 
V
A
 
E
Y
 
E
G
x
R
A
 
V
D
 
C
H
 
I
F
 
G
C
 
G
A
 
A
A
 
V
P
 
P
I
 
A
V
 
I
L
 
L
S
 
N
S
 
F
L
 
M
A
 
R
T
 
Q
A
 
V
T
 
P
Q
 
E
E
 
F
E
 
A
R
 
E
R
 
L
P
 
D
F
 
A
S
 
P
H
 
D
V
 
F
V
 
R
R
 
Y
I
 
F
R
 
I
T
 
T
A
 
G
G
 
G
S
 
A
P
 
P
P
 
M
P
 
P
A
 
E
S
 
A
V
 
L
L
 
I
K
 
K
A
 
I
V
 
Y
I
 
A
E
 
A
Q
 
K
G
 
N
F
 
I
D
 
E
V
 
V
E
 
V
H
 
Q
V
 
G
Y
 
Y
G
x
A
I
 
L
T
 
T
E
 
E
A
 
S
S
 
C
G
 
G
T
 
G
P
 
G
V
 
T
S
 
L
S
 
L
Y
 
L
A
 
S
N
 
E
P
 
D
A
 
A
W
 
L
N
 
R
E
 
K
K
 
A
S
 
G
G
 
S
D
 
A
E
 
G
K
 
R
A
 
A
R
 
T
L
 
M
M
 
F
A
 
T
R
 
D
Q
 
V
G
 
A
N
 
V
R
 
R
A
 
G
A
 
D
G
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
M
 
-
E
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
-
W
 
-
D
 
D
G
 
G
T
 
V
T
 
I
-
 
R
-
 
E
-
 
H
-
 
G
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
V
L
 
V
L
 
I
R
 
K
G
 
S
N
 
D
I
 
I
V
 
L
M
 
L
K
 
K
G
 
E
Y
 
Y
L
 
W
K
 
N
N
 
R
P
 
P
E
 
E
A
 
A
T
 
T
E
 
R
A
 
D
A
 
A
F
 
F
A
 
D
G
 
N
G
 
G
W
|
W
F
 
F
H
 
R
T
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
I
A
 
G
V
 
E
V
 
I
H
 
D
P
 
D
D
 
E
G
 
G
Y
 
Y
V
 
L
Q
 
Y
I
 
I
T
 
K
D
 
D
R
|
R
S
 
L
K
 
K
D
 
D
V
 
M
I
 
I
I
 
I
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
 
E
N
 
N
I
 
V
S
 
Y
S
 
P
V
 
A
E
 
E
V
 
I
E
 
E
D
 
S
V
 
V
L
 
I
H
 
I
Q
 
G
H
 
V
P
 
P
A
 
G
V
 
V
L
 
S
I
 
E
A
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
G
Q
 
L
P
 
P
H
 
D
P
 
E
K
 
K
W
 
W
G
 
G
E
 
E
S
 
I
P
 
A
C
 
A
A
 
A
F
 
I
I
 
V
E
 
V
L
 
A
-
 
D
K
 
Q
N
 
N
G
 
E
V
 
V
A
 
-
A
 
-
P
 
-
T
 
S
E
 
E
A
 
Q
E
 
Q
I
 
I
I
 
V
A
 
E
F
 
Y
C
 
C
R
 
G
S
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
A
H
 
R
Y
 
Y
K
 
K
C
 
L
P
 
P
T
 
K
R
 
K
V
 
V
V
 
I
Y
 
F
G
 
A
-
 
E
A
 
A
L
 
I
P
 
P
K
 
R
T
 
N
G
 
P
T
 
T
G
 
G
K
|
K
I
 
I
Q
 
L
K
 
K
Y
 
T
R
 
V
L
 
L
R
 
R

Sites not aligning to the query:

5gtdA O-succinylbenzoate coa synthetase (mene) from bacillus subtilis in complex with the acyl-adenylate intermediate osb-amp (see paper)
28% identity, 92% coverage: 30:536/554 of query aligns to 12:477/484 of 5gtdA

query
sites
5gtdA
A
 
A
E
 
Q
Q
 
L
Y
 
T
P
 
P
D
 
E
R
 
R
T
 
I
A
 
A
I
 
L
I
 
I
H
 
Y
G
 
E
P
 
D
V
 
Q
R
 
T
Q
 
V
S
 
T
W
 
F
K
 
A
V
 
E
T
 
L
R
 
F
E
 
A
R
 
A
C
 
S
R
 
K
Q
 
R
L
 
M
A
 
A
S
 
E
A
 
Q
L
 
L
V
 
A
K
 
A
R
 
H
G
 
S
V
 
V
G
 
R
R
 
K
G
 
G
D
 
D
T
 
T
V
 
A
S
 
A
I
 
I
L
 
L
A
 
L
P
 
Q
N
 
N
T
 
R
P
 
A
A
 
E
M
 
M
V
 
V
E
 
Y
A
 
A
H
 
V
H
 
H
G
 
A
I
 
C
P
 
F
L
 
L
S
 
L
G
 
G
A
 
V
V
 
K
L
 
A
N
 
V
A
 
L
I
 
L
N
 
N
C
 
T
R
 
K
L
 
L
D
 
S
A
 
T
D
 
H
G
 
E
V
 
R
R
 
L
F
 
F
I
 
Q
V
 
L
A
 
E
H
 
D
G
 
S
E
 
G
C
 
S
K
 
G
V
 
F
L
 
L
F
 
L
V
 
T
D
 
D
R
 
S
E
 
S
F
 
F
S
 
E
A
 
K
L
 
K
A
 
E
A
 
Y
E
 
E
A
 
H
L
 
I
Q
 
V
G
 
Q
L
 
-
P
 
-
N
 
-
A
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
T
I
 
I
D
 
D
I
 
V
A
 
D
D
 
E
A
 
L
L
 
M
A
 
K
P
 
E
A
 
A
G
 
A
E
 
E
P
 
E
I
 
I
G
 
E
A
 
I
M
 
E
E
 
A
Y
 
Y
E
 
M
Q
 
Q
F
 
M
L
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
D
 
-
F
 
-
P
 
-
G
 
-
V
 
-
W
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
-
W
 
-
N
 
D
A
 
A
I
 
T
A
 
A
-
 
T
L
 
L
N
 
M
Y
 
Y
T
|
T
S
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
T
S
 
G
D
 
K
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
Q
P
 
Q
S
 
T
H
 
F
R
 
G
G
 
N
A
 
H
Y
 
Y
L
 
F
M
x
S
S
 
A
M
 
V
L
 
S
Q
 
S
L
 
A
T
 
L
D
 
N
W
 
L
G
 
G
M
 
I
P
 
T
R
 
E
A
 
Q
P
 
D
K
 
R
Y
 
W
L
 
L
W
 
I
T
 
A
L
 
L
P
 
P
M
 
L
F
 
F
H
|
H
A
 
I
N
x
S
G
 
G
W
 
L
C
 
S
F
 
A
S
 
L
W
 
F
A
 
K
V
 
S
T
 
V
A
 
I
A
 
Y
A
 
G
G
 
M
T
 
T
H
 
V
V
 
V
C
 
L
L
 
H
R
 
Q
K
 
R
V
 
F
T
 
S
A
 
V
A
 
S
N
 
D
I
 
V
F
 
L
S
 
H
A
 
S
I
 
I
E
 
N
A
 
R
Y
 
H
G
 
E
A
 
V
D
 
T
H
 
M
F
 
I
C
 
S
A
|
A
A
 
V
P
 
Q
I
 
T
V
 
M
L
 
L
S
 
A
S
 
S
L
 
L
A
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
L
Q
 
E
E
 
E
E
 
T
R
 
N
R
 
R
P
 
C
F
 
P
S
 
E
H
 
S
V
 
I
V
 
R
R
 
C
I
 
I
R
x
L
T
 
L
A
x
G
G
|
G
S
x
G
P
 
P
P
 
A
P
 
P
A
 
L
S
 
P
V
 
L
L
 
L
K
 
E
A
 
E
V
 
C
I
 
R
E
 
E
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
D
 
P
V
 
V
E
 
F
H
 
Q
V
 
S
Y
|
Y
G
|
G
I
x
M
T
|
T
E
|
E
A
 
T
S
 
C
G
x
S
T
x
Q
P
 
I
V
 
V
S
 
T
S
 
-
Y
 
-
A
 
L
N
 
S
P
 
P
A
 
E
W
 
F
N
 
S
E
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
M
A
 
E
R
 
K
Q
 
L
G
 
G
N
 
S
R
 
A
A
 
G
A
 
K
G
 
P
L
 
L
E
x
F
G
x
S
L
 
C
R
 
E
V
 
I
A
 
K
-
 
I
D
 
E
P
 
R
D
 
D
T
 
G
M
 
Q
E
 
V
S
 
C
V
 
E
P
 
P
W
 
Y
D
 
E
G
 
-
T
 
-
T
 
-
Q
 
H
G
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
M
L
 
V
R
 
K
G
 
G
N
 
P
I
 
N
V
 
V
M
 
M
K
 
K
G
 
S
Y
 
Y
L
 
F
K
 
N
N
 
R
P
 
E
E
 
S
A
 
A
T
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
F
A
 
Q
G
 
N
G
 
G
W
 
W
F
 
L
H
 
K
T
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
L
A
 
G
V
 
Y
V
 
L
H
 
D
P
 
N
D
 
E
G
 
G
Y
 
F
V
 
L
Q
 
Y
I
x
V
T
 
L
D
 
D
R
 
R
S
 
R
K
 
S
D
 
D
V
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
N
 
N
I
 
I
S
 
Y
S
 
P
V
 
A
E
 
E
V
 
V
E
 
E
D
 
S
V
 
V
L
 
L
H
 
L
Q
 
S
H
 
H
P
 
P
A
 
A
V
 
V
L
 
A
I
 
E
A
 
A
A
 
G
V
 
V
V
 
S
A
 
G
Q
 
A
P
 
E
H
 
D
P
 
K
K
 
K
W
 
W
G
 
G
E
 
K
S
 
V
P
 
P
C
 
H
A
 
A
F
 
Y
I
 
L
E
 
V
L
 
L
K
 
H
N
 
K
G
 
P
V
 
V
A
 
S
A
 
A
P
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
G
E
 
E
I
 
L
I
 
T
A
 
D
F
 
Y
C
 
C
R
 
K
S
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
A
H
 
K
Y
 
Y
K
 
K
C
 
I
P
 
P
T
 
A
R
 
K
-
 
F
V
 
F
V
 
V
Y
 
L
G
 
D
A
 
R
L
 
L
P
 
P
K
 
R
T
 
N
G
 
A
T
 
S
G
 
N
K
 
K
I
 
L
Q
 
L
K
 
R
Y
 
N
R
 
Q
L
 
L
R
 
K

5x8fB Ternary complex structure of a double mutant i454ra456k of o- succinylbenzoate coa synthetase (mene) from bacillus subtilis bound with amp and its product analogue osb-ncoa at 1.76 angstrom (see paper)
28% identity, 92% coverage: 30:536/554 of query aligns to 12:477/485 of 5x8fB

query
sites
5x8fB
A
 
A
E
 
Q
Q
 
L
Y
 
T
P
 
P
D
 
E
R
 
R
T
 
I
A
 
A
I
 
L
I
 
I
H
x
Y
G
x
E
P
 
D
V
 
Q
R
 
T
Q
 
V
S
 
T
W
 
F
K
 
A
V
 
E
T
 
L
R
 
F
E
 
A
R
 
A
C
 
S
R
 
K
Q
 
R
L
 
M
A
 
A
S
 
E
A
 
Q
L
 
L
V
 
A
K
 
A
R
 
H
G
 
S
V
 
V
G
 
R
R
 
K
G
 
G
D
 
D
T
 
T
V
 
A
S
 
A
I
 
I
L
 
L
A
 
L
P
 
Q
N
 
N
T
 
R
P
 
A
A
 
E
M
 
M
V
 
V
E
 
Y
A
 
A
H
 
V
H
|
H
G
 
A
I
 
C
P
 
F
L
 
L
S
 
L
G
 
G
A
 
V
V
 
K
L
 
A
N
 
V
A
 
L
I
 
L
N
 
N
C
 
T
R
x
K
L
 
L
D
 
S
A
 
T
D
 
H
G
 
E
V
 
R
R
 
L
F
 
F
I
 
Q
V
 
L
A
 
E
H
 
D
G
 
S
E
 
G
C
 
S
K
 
G
V
 
F
L
 
L
F
 
L
V
 
T
D
 
D
R
 
S
E
 
S
F
 
F
S
 
E
A
 
K
L
 
K
A
 
E
A
 
Y
E
 
E
A
 
H
L
 
I
Q
 
V
G
 
Q
L
 
-
P
 
-
N
 
-
A
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
T
I
 
I
D
 
D
I
 
V
A
 
D
D
 
E
A
 
L
L
 
M
A
 
K
P
 
E
A
 
A
G
 
A
E
 
E
P
 
E
I
 
I
G
 
E
A
 
I
M
 
E
E
 
A
Y
 
Y
E
 
M
Q
 
Q
F
 
M
L
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
D
 
-
F
 
-
P
 
-
G
 
-
V
 
-
W
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
-
W
 
-
N
 
D
A
 
A
I
 
T
A
 
A
-
 
T
L
 
L
N
 
M
Y
 
Y
T
|
T
S
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
T
S
 
G
D
 
K
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
Q
P
 
Q
S
 
T
H
 
F
R
 
G
G
 
N
A
 
H
Y
 
Y
L
 
F
M
x
S
S
 
A
M
 
V
L
 
S
Q
 
S
L
 
A
T
 
L
D
x
N
W
 
L
G
 
G
M
 
I
P
 
T
R
 
E
A
 
Q
P
 
D
K
 
R
Y
 
W
L
 
L
W
 
I
T
 
A
L
|
L
P
|
P
M
 
L
F
 
F
H
|
H
A
x
I
N
x
S
G
 
G
W
 
L
C
 
S
F
 
A
S
x
L
W
 
F
A
 
K
V
 
S
T
 
V
A
 
I
A
 
Y
A
 
G
G
 
M
T
 
T
H
 
V
V
 
V
C
x
L
L
 
H
R
 
Q
K
 
R
V
 
F
T
 
S
A
 
V
A
 
S
N
 
D
I
 
V
F
 
L
S
 
H
A
 
S
I
 
I
E
 
N
A
 
R
Y
 
H
G
 
E
A
 
V
D
 
T
H
 
M
F
 
I
C
 
S
A
|
A
A
x
V
P
 
Q
I
 
T
V
 
M
L
 
L
S
 
A
S
 
S
L
 
L
A
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
L
Q
 
E
E
 
E
E
 
T
R
 
N
R
 
R
P
 
C
F
 
P
S
 
E
H
 
S
V
 
I
V
 
R
R
 
C
I
 
I
R
x
L
T
 
L
A
x
G
G
 
G
S
 
G
P
 
P
P
 
A
P
 
P
A
 
L
S
 
P
V
 
L
L
 
L
K
 
E
A
 
E
V
 
C
I
 
R
E
 
E
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
D
 
P
V
 
V
E
 
F
H
 
Q
V
 
S
Y
 
Y
G
|
G
I
x
M
T
|
T
E
|
E
A
 
T
S
 
C
G
x
S
T
x
Q
P
 
I
V
 
V
S
x
T
S
 
-
Y
 
-
A
x
L
N
x
S
P
 
P
A
 
E
W
 
F
N
 
S
E
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
M
A
 
E
R
 
K
Q
 
L
G
 
G
N
 
S
R
 
A
A
 
G
A
 
K
G
 
P
L
 
L
E
 
F
G
 
S
L
 
C
R
 
E
V
 
I
A
 
K
-
 
I
D
 
E
P
 
R
D
 
D
T
 
G
M
 
Q
E
 
V
S
 
C
V
 
E
P
 
P
W
 
Y
D
 
E
G
 
-
T
 
-
T
 
-
Q
 
H
G
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
M
L
 
V
R
 
K
G
 
G
N
 
P
I
 
N
V
 
V
M
 
M
K
 
K
G
 
S
Y
 
Y
L
 
F
K
 
N
N
 
R
P
 
E
E
 
S
A
 
A
T
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
F
A
 
Q
G
 
N
G
 
G
W
 
W
F
 
L
H
 
K
T
 
T
G
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
G
V
 
Y
V
 
L
H
 
D
P
 
N
D
 
E
G
 
G
Y
 
F
V
 
L
Q
 
Y
I
 
V
T
 
L
D
 
D
R
 
R
S
 
R
K
 
S
D
 
D
V
 
L
I
 
I
I
|
I
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
|
E
N
|
N
I
 
I
S
 
Y
S
 
P
V
 
A
E
 
E
V
 
V
E
 
E
D
 
S
V
 
V
L
 
L
H
 
L
Q
 
S
H
 
H
P
 
P
A
 
A
V
 
V
L
 
A
I
 
E
A
 
A
A
 
G
V
 
V
V
 
S
A
 
G
Q
 
A
P
 
E
H
 
D
P
 
K
K
|
K
W
|
W
G
 
G
E
 
K
S
 
V
P
 
P
C
 
H
A
 
A
F
 
Y
I
 
L
E
 
V
L
 
L
K
 
H
N
 
K
G
 
P
V
 
V
A
 
S
A
 
A
P
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
G
E
 
E
I
 
L
I
 
T
A
 
D
F
 
Y
C
 
C
R
 
K
S
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
A
H
x
K
Y
|
Y
K
 
K
C
 
R
P
 
P
T
 
K
R
 
K
-
 
F
V
 
F
V
 
V
Y
 
L
G
 
D
A
 
R
L
 
L
P
 
P
K
 
R
T
 
N
G
 
A
T
 
S
G
 
N
K
|
K
I
 
L
Q
 
L
K
 
R
Y
 
N
R
 
Q
L
 
L
R
 
K

3r44A Mycobacterium tuberculosis fatty acyl coa synthetase (see paper)
29% identity, 89% coverage: 44:536/554 of query aligns to 31:494/502 of 3r44A

query
sites
3r44A
V
 
V
R
 
R
Q
 
M
S
 
T
W
 
Y
K
 
A
V
 
Q
T
 
M
R
 
N
E
 
A
R
 
L
C
 
A
R
 
N
Q
 
R
L
 
C
A
 
A
S
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
T
K
 
A
R
 
L
G
 
G
V
 
I
G
 
A
R
 
K
G
 
G
D
 
D
T
 
R
V
 
V
S
 
A
I
 
L
L
 
L
A
 
M
P
 
P
N
 
N
T
 
S
P
 
V
A
 
E
M
 
F
V
 
C
E
 
C
A
 
L
H
 
F
H
 
Y
G
 
G
I
 
A
P
 
A
L
 
K
S
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
A
N
 
V
A
 
P
I
 
I
N
 
N
C
 
T
R
 
R
L
 
L
D
 
A
A
 
A
D
 
P
G
 
E
V
 
V
R
 
S
F
 
F
I
 
I
V
 
L
A
 
S
H
 
D
G
 
S
E
 
G
C
 
S
K
 
K
V
 
V
L
 
V
F
 
-
V
 
-
D
 
-
R
 
-
E
 
-
F
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
I
Q
 
Y
G
 
G
L
 
A
P
 
P
N
 
S
A
 
A
P
 
P
L
 
V
V
 
I
I
 
D
D
 
A
I
 
I
A
 
R
D
 
A
A
 
Q
L
 
A
A
 
D
P
 
P
A
 
P
G
 
G
-
 
T
-
 
V
-
 
T
E
 
D
P
 
W
I
 
I
G
 
G
A
 
A
M
 
D
E
 
S
Y
 
L
E
 
A
Q
 
E
F
 
R
L
 
L
R
 
R
E
 
S
G
 
A
D
 
A
I
 
A
D
 
D
F
 
E
P
 
P
G
 
A
V
 
V
W
 
E
P
 
C
D
 
G
D
 
G
E
 
D
W
 
D
N
 
N
A
 
-
I
 
L
A
 
F
L
 
I
N
 
M
Y
 
Y
T
|
T
S
 
S
G
 
G
T
 
-
T
 
-
S
 
-
D
 
H
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
V
P
 
H
S
 
T
H
 
H
R
x
E
G
 
S
A
 
V
Y
x
H
L
 
S
M
x
A
S
 
A
M
 
S
L
 
S
Q
 
W
L
 
A
T
 
S
D
 
T
W
 
I
G
 
D
M
 
V
P
 
R
R
 
Y
A
 
R
P
 
D
K
 
R
Y
 
L
L
 
L
W
 
L
T
 
P
L
 
L
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
|
H
A
 
V
N
 
A
G
 
A
W
 
L
C
 
T
F
 
T
S
 
V
W
 
I
A
 
F
V
 
S
T
 
A
A
 
M
A
 
R
A
 
G
G
 
V
T
 
T
H
 
L
V
 
I
C
 
S
L
 
M
R
 
P
K
 
Q
V
 
F
T
 
D
A
 
A
A
 
T
N
 
K
I
 
V
F
 
W
S
 
S
A
 
L
I
 
I
E
 
V
A
 
E
Y
 
E
G
 
R
A
 
V
D
 
C
H
 
I
F
 
G
C
 
G
A
 
A
A
 
V
P
 
P
I
 
A
V
 
I
L
 
L
S
 
N
S
 
F
L
 
M
A
 
R
T
 
Q
A
 
V
T
 
P
Q
 
E
E
 
F
E
 
A
R
 
E
R
 
L
P
 
D
F
 
A
S
 
P
H
 
D
V
 
F
V
 
R
R
 
Y
I
 
F
R
 
I
T
 
T
A
 
G
G
 
G
S
 
A
P
 
P
P
 
M
P
 
P
A
 
E
S
 
A
V
 
L
L
 
I
K
 
K
A
 
I
V
 
Y
I
 
A
E
 
A
Q
 
K
G
 
N
F
 
I
D
 
E
V
 
V
E
 
V
H
 
Q
V
 
G
Y
 
Y
G
 
A
I
 
L
T
|
T
E
|
E
A
 
S
S
 
C
G
 
G
T
 
G
P
 
G
V
 
T
S
 
L
S
 
L
Y
 
L
A
 
S
N
 
E
P
 
D
A
 
A
W
 
L
N
 
R
E
 
K
K
 
A
S
 
G
G
 
S
D
 
A
E
 
G
K
 
R
A
 
A
R
 
T
L
 
M
M
 
F
A
 
T
R
 
D
Q
 
V
G
 
A
N
 
V
R
 
R
A
 
G
A
 
D
G
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
M
 
-
E
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
-
W
 
-
D
 
D
G
 
G
T
 
V
T
 
I
-
 
R
-
 
E
-
 
H
-
 
G
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
V
L
 
V
L
 
I
R
 
K
G
 
S
N
 
D
I
 
I
V
 
L
M
 
L
K
 
K
G
 
E
Y
 
Y
L
 
W
K
 
N
N
 
R
P
 
P
E
 
E
A
 
A
T
 
T
E
 
R
A
 
D
A
 
A
F
 
F
A
 
D
G
 
N
G
 
G
W
 
W
F
 
F
H
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
L
 
I
A
 
G
V
 
E
V
 
I
H
 
D
P
 
D
D
 
E
G
 
G
Y
 
Y
V
 
L
Q
 
Y
I
 
I
T
 
K
D
 
D
R
 
R
S
 
L
K
 
K
D
 
D
V
 
M
I
 
I
I
|
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
N
|
N
I
 
V
S
 
Y
S
 
P
V
 
A
E
 
E
V
 
I
E
 
E
D
 
S
V
 
V
L
 
I
H
 
I
Q