SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS26465 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS26465 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 10 hits to proteins with known functional sites (download)

O42885 Putative inorganic phosphate transporter C8E4.01c from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
25% identity, 43% coverage: 7:238/534 of query aligns to 28:275/572 of O42885

query
sites
O42885
N
 
E
D
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
Q
V
 
E
R
 
R
K
 
R
Q
 
Y
-
 
Y
-
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
E
 
R
E
 
E
R
 
F
K
 
K
V
 
L
I
 
M
L
 
M
A
 
L
S
 
A
S
 
G
F
 
V
G
 
G
A
 
F
L
 
F
M
 
L
E
 
D
W
 
S
Y
 
Y
D
 
D
F
 
L
Y
 
F
I
 
I
Y
 
I
A
 
N
A
 
L
L
 
V
A
 
T
V
 
P
Y
 
I
F
 
F
G
 
E
A
 
Y
L
 
L
F
 
Y
-
 
W
-
 
G
-
 
G
-
 
I
-
 
E
-
 
K
-
 
G
-
 
P
-
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
H
F
 
Y
P
 
P
P
 
S
G
 
G
N
 
-
E
 
-
T
 
I
T
 
R
A
 
G
F
 
L
L
 
V
A
 
N
S
 
A
L
 
S
A
 
A
T
 
N
F
 
I
G
 
G
A
 
N
G
 
I
F
 
F
L
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
G
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
F
 
F
G
 
G
R
 
F
L
 
M
G
 
G
D
 
D
K
 
F
I
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
K
H
 
F
T
 
V
F
 
Y
L
 
G
V
 
K
T
 
E
I
 
M
L
 
V
L
 
I
M
 
V
G
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
T
V
 
V
G
 
L
V
 
V
G
 
I
L
 
A
L
 
M
P
 
P
T
 
K
Y
 
S
G
 
I
Q
 
H
I
 
S
G
 
P
I
 
L
T
 
S
A
 
K
T
 
M
I
 
M
L
 
W
L
 
V
V
 
F
V
 
C
L
 
W
R
 
R
L
 
W
L
 
L
Q
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
D
V
 
Y
G
 
P
G
 
M
A
 
S
V
 
A
T
 
A
Y
 
I
V
 
T
A
 
S
E
 
E
H
 
R
S
 
S
P
 
K
V
 
I
E
 
K
K
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
T
Y
 
L
T
 
I
S
 
S
S
 
L
L
 
I
Q
 
F
T
 
A
T
 
F
A
 
Q
T
 
G
L
 
F
G
 
G
L
 
T
L
 
L
S
 
A
S
 
G
L
 
A
L
 
I
V
 
V
V
 
T
Y
 
I
L
 
I
L
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
C
-
 
F
-
 
E
K
 
H
T
 
P
L
 
L
L
 
N
T
 
R
E
 
E
A
 
G
Q
 
H
F
 
Y
R
 
H
-
 
K
-
 
L
E
 
E
W
 
G
G
 
V
W
 
W
R
 
R
L
 
L
P
 
Q
F
 
F
L
 
G
V
 
L
S
 
A
F
 
L
L
 
V
M
 
P
L
 
A
V
 
I
V
 
G
S
 
V
V
 
L
Y
 
I
I
 
P
R
 
R
G
 
L
K
 
I
L
 
M
H
 
K
E
 
E
S
 
S
P
 
K
I
 
S
F
 
Y
A
 
E
R
 
N
M
 
S
K
 
K
A
 
A
G
 
L
N
 
N
-
 
S
A
 
A
T
 
E
S
 
G
K
 
K
S
 
D
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Q9Y7Q9 Probable metabolite transporter C2H8.02 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
24% identity, 42% coverage: 17:238/534 of query aligns to 34:260/583 of Q9Y7Q9

query
sites
Q9Y7Q9
M
 
V
T
 
T
R
 
K
E
 
K
E
 
E
R
 
A
K
 
K
V
 
L
I
 
L
L
 
A
A
 
I
S
 
A
S
 
G
F
 
T
G
 
G
A
 
F
L
 
L
M
 
L
E
 
D
W
 
S
Y
 
Y
D
 
D
F
 
L
Y
 
F
I
 
I
Y
 
I
A
 
N
A
 
L
L
 
V
A
 
S
-
 
P
-
 
I
-
 
L
-
 
A
-
 
Y
V
 
L
Y
 
Y
F
 
W
G
 
G
A
 
G
L
 
L
F
 
-
F
 
-
P
 
-
P
 
T
G
 
G
N
 
H
E
 
Q
T
 
D
T
 
Y
A
 
P
F
 
S
L
 
G
A
 
I
S
 
R
L
 
G
A
 
V
T
 
V
F
 
N
G
 
A
A
 
A
G
 
T
F
 
N
L
 
I
V
 
G
R
 
N
P
 
I
V
 
M
G
 
G
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
F
 
F
G
 
G
R
 
F
L
 
L
G
 
G
D
 
D
K
 
F
I
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
K
H
 
F
T
 
V
F
 
Y
L
 
G
V
 
K
T
 
E
I
 
M
L
 
M
L
 
V
M
 
V
G
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
T
V
 
I
G
 
L
V
 
I
G
 
I
L
 
C
L
 
L
P
 
P
T
 
D
Y
 
R
G
 
I
Q
 
P
I
 
T
G
 
P
I
 
T
T
 
A
A
 
K
T
 
M
I
 
M
L
 
W
L
 
L
V
 
F
V
 
A
L
 
F
R
 
R
L
 
V
L
 
M
Q
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
D
V
 
Y
G
 
P
G
 
M
A
 
S
V
 
A
T
 
S
Y
 
I
V
 
T
A
 
S
E
 
E
H
 
Q
S
 
S
P
 
L
V
 
I
E
 
N
K
 
R
R
 
R
G
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
L
L
 
A
Y
 
W
T
 
I
S
 
F
S
 
S
L
 
N
Q
 
Q
T
 
G
T
 
W
A
 
G
T
 
T
L
 
L
-
 
A
G
 
G
L
 
C
L
 
V
S
 
A
S
 
T
L
 
L
L
 
I
V
 
I
V
 
L
Y
 
A
L
 
C
L
 
F
K
 
E
T
 
K
L
 
P
L
 
L
T
 
N
E
 
D
-
 
R
A
 
G
Q
 
E
F
 
Y
R
 
T
E
 
K
W
 
L
G
 
N
-
 
G
-
 
V
W
 
W
R
 
R
L
 
I
P
 
Q
F
 
F
L
 
G
V
 
I
S
 
A
F
 
L
L
 
F
M
 
P
L
 
A
V
 
V
V
 
I
S
 
V
V
 
L
Y
 
I
I
 
P
R
 
R
G
 
L
K
 
R
L
 
M
H
 
Q
E
 
E
S
 
S
P
 
E
I
 
Q
F
 
F
A
 
K
R
 
N
M
 
S
K
 
K
A
 
-
G
 
-
N
 
-
A
 
-
T
 
N
S
 
M
K
 
K
S
 
S
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Q8NLB7 Gentisate transporter from Corynebacterium glutamicum (strain ATCC 13032 / DSM 20300 / BCRC 11384 / JCM 1318 / LMG 3730 / NCIMB 10025) (see paper)
23% identity, 41% coverage: 2:222/534 of query aligns to 16:222/444 of Q8NLB7

query
sites
Q8NLB7
T
 
T
I
 
L
S
 
G
L
 
A
A
 
S
N
 
N
D
 
S
G
 
S
A
 
Q
A
 
T
V
 
I
R
 
E
K
 
N
Q
 
K
G
 
G
M
 
L
T
 
T
-
 
I
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
S
R
 
G
E
 
R
E
 
R
R
 
L
K
 
A
V
 
A
I
 
V
L
 
L
A
 
I
S
 
G
S
 
W
F
 
F
G
 
F
A
 
V
L
 
I
M
 
F
E
x
D
W
 
G
Y
 
Y
D
|
D
F
 
L
Y
 
I
I
 
V
Y
 
Y
A
 
G
A
 
T
L
 
V
A
 
Q
V
 
S
Y
 
A
F
 
L
G
 
A
A
 
-
L
 
-
F
 
-
F
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
N
 
K
E
 
E
T
 
W
T
 
N
A
 
L
F
 
S
L
 
S
A
 
A
S
 
T
L
 
L
A
 
G
T
 
T
F
 
I
G
 
G
A
 
S
-
 
T
G
 
A
F
 
F
L
 
F
V
 
G
R
 
M
P
 
A
V
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
V
L
 
F
F
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
S
D
 
D
K
x
R
I
 
V
G
 
G
R
 
R
K
 
K
H
 
A
T
 
A
F
 
V
L
 
I
V
 
G
T
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
I
M
 
L
G
 
S
I
 
V
A
 
F
T
 
T
V
 
M
G
 
L
V
 
C
G
 
A
L
 
F
L
 
A
P
 
P
T
 
N
Y
 
P
G
 
W
Q
 
V
I
 
F
G
 
G
I
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
A
L
 
F
R
 
R
L
 
F
L
 
I
Q
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
G
E
 
L
V
 
V
G
 
P
G
 
S
A
 
V
V
 
N
T
 
A
Y
 
M
V
 
T
A
 
S
E
 
D
H
 
L
S
 
V
P
 
P
V
 
R
E
 
K
K
 
T
R
 
M
G
 
S
L
 
A
Y
 
W
T
 
A
S
 
T
S
 
V
L
 
M
Q
 
M
T
 
S
T
 
G
A
 
V
T
 
P
L
 
I
G
 
G
L
 
-
L
 
-
S
 
G
S
 
S
L
 
I
L
 
A
V
 
A
V
 
V
Y
 
L
L
 
A
L
 
L
K
 
V
T
 
V
L
 
V
L
 
P
T
 
S
E
 
S
A
 
-
Q
 
-
F
 
-
R
 
E
E
 
E
W
 
W
G
 
G
W
 
W
R
 
R
L
 
F
P
 
M
F
 
F
L
 
L
V
 
I
S
 
A
F
 
L
L
 
I
M
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
S
 
G
V
 
L
Y
 
P
I
 
I
R
 
A
G
 
M
K
 
K
L
 
V
H
 
I
E
 
P
S
 
S

Sites not aligning to the query:

A0A0H2VG78 Glucose transporter GlcP; Glucose/H(+) symporter from Staphylococcus epidermidis (strain ATCC 12228 / FDA PCI 1200) (see paper)
31% identity, 33% coverage: 47:223/534 of query aligns to 25:185/446 of A0A0H2VG78

query
sites
A0A0H2VG78
V
 
V
Y
 
I
F
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
L
F
 
F
-
 
I
-
 
H
-
 
K
-
 
D
-
 
I
P
 
P
P
 
L
G
 
N
N
 
S
E
 
T
T
 
T
T
 
E
A
 
G
F
 
I
L
 
V
A
 
V
S
 
S
L
 
S
A
 
M
T
 
L
F
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
-
F
 
-
L
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
G
L
 
S
F
 
S
G
 
G
R
 
P
L
 
L
G
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
R
H
 
R
T
 
-
F
 
-
L
 
-
V
 
L
T
 
V
I
 
M
L
 
L
L
 
I
M
 
A
G
 
I
I
 
V
A
 
F
T
 
I
V
 
I
G
 
G
V
 
A
G
 
L
L
 
I
L
 
L
P
 
A
T
 
A
Y
 
S
G
 
T
Q
 
N
I
 
L
G
 
A
I
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
L
L
 
L
V
 
I
V
 
I
L
 
G
R
|
R
L
 
L
L
 
I
Q
x
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
V
G
 
G
G
 
G
E
 
S
V
 
M
G
 
S
G
 
T
A
 
V
V
 
P
T
 
V
Y
 
Y
V
 
L
A
 
S
E
|
E
H
 
M
S
 
A
P
 
P
V
 
T
E
 
E
K
 
Y
R
 
R
G
 
G
L
 
S
Y
 
L
T
 
G
S
 
S
S
 
L
L
 
N
Q
|
Q
T
 
L
T
 
M
A
 
I
T
 
T
L
 
I
G
 
G
L
 
I
L
 
L
S
 
A
S
 
A
L
 
Y
L
 
L
V
 
V
V
 
N
Y
 
Y
L
 
A
L
 
F
K
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
A
Q
 
D
F
 
I
R
 
E
E
 
G
W
 
W
G
 
R
W
 
W
R
 
M
L
 
L
P
 
G
F
 
L
-
 
A
L
 
V
V
 
V
S
 
P
F
 
S
L
 
V
M
 
I
L
 
L
V
 
L
V
 
V
S
 
G
V
 
I
Y
 
Y
I
 
F
R
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
M
H
 
P
E
 
E
S
 
S
P
 
P

Sites not aligning to the query:

P36035 Carboxylic acid transporter protein homolog from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
24% identity, 30% coverage: 69:228/534 of query aligns to 178:325/616 of P36035

query
sites
P36035
T
 
T
F
 
W
G
 
G
A
 
L
G
 
G
F
 
L
L
 
V
-
 
L
-
 
F
V
 
V
R
 
R
P
 
S
V
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
V
L
 
I
F
 
F
G
 
G
R
 
L
L
 
W
G
 
T
D
 
D
K
 
K
I
 
S
G
 
S
R
 
R
K
 
K
H
 
W
T
 
P
F
 
Y
L
 
I
V
 
T
T
 
C
I
 
L
L
 
F
L
 
L
M
 
F
G
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
Q
V
 
L
G
 
C
V
 
T
G
 
P
L
 
W
L
 
C
P
 
D
T
 
T
Y
 
Y
G
 
E
Q
 
K
I
 
-
G
 
-
I
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
-
L
 
F
V
 
L
V
 
G
L
 
V
R
 
R
L
 
W
L
 
I
Q
 
T
G
 
G
L
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
G
 
G
E
 
I
V
 
Y
G
 
G
G
 
C
A
 
A
V
 
S
T
 
A
Y
 
T
V
 
A
A
 
I
E
 
E
H
 
D
S
 
A
P
 
P
V
 
V
E
 
K
K
 
A
R
 
R
G
 
S
L
 
F
Y
 
L
T
 
S
S
 
G
S
 
L
L
 
F
Q
 
F
T
 
S
T
 
A
A
 
Y
T
 
A
L
 
M
G
 
G
L
 
F
L
 
I
S
 
F
S
 
A
L
 
I
L
 
I
V
 
F
V
 
Y
Y
 
R
L
 
A
L
 
F
K
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
G
Q
 
Y
F
 
F
R
 
R
E
 
D
W
 
D
G
 
G
W
 
W
R
 
K
L
 
I
P
 
L
F
 
F
L
 
W
V
 
F
S
 
S
F
 
I
L
 
F
M
 
L
L
 
P
V
 
I
V
 
L
S
 
L
V
 
I
Y
 
F
I
 
W
R
 
R
G
 
L
K
 
L
L
 
W
H
 
P
E
 
E
S
 
T
P
 
K
I
 
Y
F
 
F
A
 
T
R
 
K
M
 
V

Sites not aligning to the query:

Q09852 Putative inorganic phosphate transporter C23D3.12 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
25% identity, 44% coverage: 3:237/534 of query aligns to 21:268/559 of Q09852

query
sites
Q09852
I
 
V
S
 
S
L
 
L
A
 
A
N
 
D
D
 
V
G
 
A
A
 
E
A
 
S
V
 
D
R
 
T
K
 
R
Q
 
R
-
 
H
-
 
W
-
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
E
 
R
E
 
E
R
 
F
K
 
K
V
 
L
I
 
M
L
 
G
A
 
F
S
 
A
S
 
G
F
 
A
G
 
G
A
 
F
L
 
F
M
 
L
E
 
D
W
 
S
Y
 
Y
D
 
D
F
 
L
Y
 
F
I
 
I
Y
 
I
A
 
N
A
 
L
L
 
V
A
 
S
-
 
P
-
 
I
-
 
Y
-
 
E
-
 
Y
V
 
L
Y
 
Y
F
 
W
G
 
G
A
 
G
L
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
K
-
 
P
F
 
H
F
 
Y
P
 
P
P
 
S
G
 
G
N
 
-
E
 
-
T
 
I
T
 
H
A
 
G
F
 
L
L
 
V
A
 
N
S
 
A
L
 
A
A
 
A
T
 
N
F
 
I
G
 
G
A
 
N
G
 
V
F
 
F
L
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
G
A
 
Q
L
 
I
L
 
L
F
 
F
G
 
G
R
 
F
L
 
M
G
 
G
D
 
D
K
 
F
I
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
K
H
 
F
T
 
V
F
 
Y
L
 
G
V
 
K
T
 
E
I
 
M
L
 
I
L
 
V
M
 
V
G
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
T
V
 
V
G
 
L
V
 
V
G
 
I
L
 
A
L
 
L
P
 
P
T
 
K
Y
 
S
G
 
I
Q
 
P
I
 
T
G
 
P
I
 
L
T
 
G
A
 
K
T
 
M
I
 
M
L
 
W
L
 
I
V
 
F
V
 
A
L
 
W
R
 
R
L
 
W
L
 
L
Q
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
D
V
 
Y
G
 
P
G
 
M
A
 
S
V
 
A
T
 
T
Y
 
I
V
 
T
A
 
S
E
 
E
H
 
R
S
 
S
P
 
L
V
 
L
E
 
S
K
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
T
Y
 
L
T
 
L
S
 
S
S
 
I
L
 
V
Q
 
F
T
 
S
T
 
F
A
 
Q
T
 
G
L
 
F
G
 
G
L
 
T
L
 
L
S
 
A
S
 
G
L
 
A
L
 
I
V
 
V
V
 
T
Y
 
I
L
 
I
L
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
C
-
 
F
-
 
E
K
 
K
T
 
P
L
 
L
L
 
N
T
 
Q
E
 
R
A
 
G
Q
 
E
F
 
Y
R
 
T
-
 
K
-
 
L
E
 
E
W
 
G
G
 
V
W
 
W
R
 
R
L
 
L
P
 
Q
F
 
M
L
 
G
V
 
L
S
 
A
F
 
L
L
 
V
M
 
P
L
 
A
V
 
L
V
 
L
S
 
V
V
 
L
Y
 
I
I
 
P
R
 
R
G
 
L
K
 
T
L
 
M
H
 
K
E
 
E
S
 
S
P
 
K
I
 
S
F
 
Y
A
 
E
R
 
Q
M
 
S
K
 
K
A
 
A
G
 
L
N
 
N
A
 
K
T
 
Y
S
 
T
K
 
D
S
 
N

Sites not aligning to the query:

8fvzA Pipt y150a
22% identity, 57% coverage: 23:328/534 of query aligns to 4:313/433 of 8fvzA

query
sites
8fvzA
K
 
K
V
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
L
S
 
A
S
 
G
F
 
V
G
 
G
A
 
F
L
 
F
M
 
L
E
 
D
W
 
A
Y
 
Y
D
 
D
F
 
L
Y
 
F
I
 
I
Y
 
I
A
 
N
A
 
Q
L
 
V
A
 
A
V
 
P
Y
 
M
F
 
L
G
 
A
A
 
Q
L
 
V
F
 
Y
F
 
F
P
 
P
P
 
K
G
 
T
N
 
G
-
 
L
-
 
P
-
 
A
E
 
Q
T
 
R
T
 
Q
A
 
D
F
 
L
L
 
M
A
 
K
S
 
A
L
 
A
A
 
A
T
 
N
F
 
I
G
 
G
A
 
C
G
 
-
F
 
-
L
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
Q
L
 
V
L
 
M
F
 
F
G
 
G
R
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
K
 
S
I
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
K
H
 
F
T
 
V
F
 
Y
L
 
G
V
 
K
T
 
E
I
 
L
L
 
I
L
 
L
M
 
I
G
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
V
 
I
G
 
F
V
 
Q
G
 
M
L
 
S
L
 
A
P
 
P
T
 
S
Y
 
H
G
 
W
Q
 
D
I
 
-
G
 
G
I
 
N
T
 
R
A
 
V
T
 
L
I
 
T
L
 
W
L
 
I
V
 
T
V
 
I
L
 
C
R
 
R
L
 
V
L
 
F
Q
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
D
V
 
A
G
 
P
G
 
M
A
 
S
V
 
A
T
 
T
Y
 
V
V
 
V
A
 
S
E
 
D
H
 
R
S
 
A
P
 
N
V
 
I
E
 
H
K
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
T
Y
 
L
T
 
L
S
 
C
S
 
F
L
 
I
Q
x
F
T
 
A
T
 
N
-
 
Q
-
 
G
-
 
W
-
 
G
A
 
S
T
 
F
L
 
V
G
 
G
L
 
S
L
 
L
S
 
V
S
 
T
L
 
I
L
 
V
V
 
T
V
 
I
Y
 
S
L
 
G
L
 
F
K
 
K
T
 
H
L
 
R
L
 
L
T
 
K
E
 
S
A
 
G
Q
 
H
F
 
T
R
 
H
-
 
D
-
 
V
E
 
D
W
 
K
G
 
A
W
 
W
R
 
R
L
 
I
P
 
L
F
 
I
L
 
G
V
 
L
S
 
S
F
 
L
L
 
I
M
 
P
L
 
A
V
 
F
V
 
G
S
 
T
V
 
L
Y
 
Y
I
 
Q
R
 
R
G
 
-
K
 
-
L
 
-
H
 
-
E
 
L
S
 
T
P
 
G
I
 
V
F
 
I
A
 
A
R
 
S
M
 
K
K
 
K
A
 
A
G
 
-
N
 
-
A
 
-
T
 
-
S
 
H
K
 
W
S
 
Q
P
 
E
I
 
F
L
 
V
D
 
A
S
 
Y
F
 
F
T
 
S
N
 
T
W
 
W
A
 
N
N
 
H
L
 
F
K
 
R
Y
 
N
V
 
L
L
 
L
L
 
-
L
 
-
F
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
G
S
 
S
G
 
M
L
 
L
G
 
G
A
x
W
I
 
F
F
 
L
G
 
V
T
x
D
G
 
I
H
 
A
F
 
F
Y
|
Y
-
 
G
-
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
N
-
 
Q
-
 
S
-
 
V
-
 
V
-
 
L
-
 
A
T
 
Q
M
 
I
F
 
G
F
 
F
V
 
A
N
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
G
H
 
D
V
 
V
P
 
Y
L
 
D
E
 
K
L
 
L
V
 
F
H
 
Q
L
 
L
L
 
A
I
 
T
G
 
G
I
 
N
A
 
I
L
 
I
V
 
V
I
 
T
A
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
F
T
 
L
P
 
P
C
 
G
Y
 
Y
L
 
Y
F
 
F
F
 
T
G
 
L
W
 
F
L
 
L
S
 
I
D
 
D
R
 
I
I
 
V
G
 
G
R
 
R
K
 
K
H
 
K
I
 
L
M
 
Q
M
 
F
A
 
M
A
 
G
C
 
F
L
 
I
L
 
M
A
 
S
A
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q9Z2I6 Synaptic vesicle glycoprotein 2C; Synaptic vesicle protein 2C from Rattus norvegicus (Rat) (see 3 papers)
28% identity, 28% coverage: 79:225/534 of query aligns to 203:346/727 of Q9Z2I6

query
sites
Q9Z2I6
V
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
F
L
 
F
F
 
W
G
 
G
R
 
G
L
 
L
G
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
V
G
 
G
R
 
R
K
 
K
H
 
Q
T
 
S
F
 
L
L
 
L
V
 
I
T
 
C
I
 
M
L
 
S
L
 
V
M
 
N
G
 
G
I
 
F
A
 
F
T
 
A
V
 
F
G
 
L
V
 
S
G
 
S
L
 
F
L
 
V
P
 
Q
T
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
-
I
 
-
G
 
-
I
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
F
L
 
F
V
 
L
V
 
L
L
 
C
R
 
R
L
 
L
L
 
L
Q
 
S
G
 
G
L
 
F
A
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
A
V
 
I
G
 
P
G
 
T
A
 
V
V
 
F
T
 
S
Y
 
Y
V
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
V
S
 
L
P
 
A
V
 
R
E
 
E
K
 
K
R
 
R
G
 
G
L
 
E
Y
 
H
T
 
L
S
 
S
S
 
W
L
 
L
Q
 
C
T
 
M
T
 
F
A
 
W
T
 
M
L
 
I
G
 
G
L
 
G
L
 
I
S
 
Y
S
 
A
L
 
S
L
 
A
V
 
M
V
 
A
Y
 
W
L
 
A
L
 
I
K
 
I
-
 
P
-
 
H
-
 
Y
-
 
G
-
 
W
-
 
S
-
 
F
T
 
S
L
 
M
L
 
G
T
 
S
E
 
A
A
 
Y
Q
 
Q
F
 
F
R
 
H
E
 
-
W
 
-
G
 
S
W
 
W
R
 
R
L
 
V
P
 
F
F
 
V
L
 
I
V
 
V
S
 
C
F
 
A
L
 
L
M
 
P
L
 
C
V
 
V
V
 
S
S
 
S
V
 
V
Y
 
V
I
 
A
R
 
L
G
 
T
K
 
F
L
 
M
H
 
P
E
 
E
S
 
S
P
 
P
I
 
R
F
 
F

Sites not aligning to the query:

Q496J9 Synaptic vesicle glycoprotein 2C from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
28% identity, 28% coverage: 79:225/534 of query aligns to 203:346/727 of Q496J9

query
sites
Q496J9
V
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
F
L
 
F
F
 
W
G
 
G
R
 
G
L
 
L
G
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
V
G
 
G
R
 
R
K
 
K
H
 
Q
T
 
S
F
 
L
L
 
L
V
 
I
T
 
C
I
 
M
L
 
S
L
 
V
M
 
N
G
 
G
I
 
F
A
 
F
T
 
A
V
 
F
G
 
L
V
 
S
G
 
S
L
 
F
L
 
V
P
 
Q
T
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
-
I
 
-
G
 
-
I
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
F
L
 
F
V
 
L
V
 
F
L
 
C
R
 
R
L
 
L
L
 
L
Q
 
S
G
 
G
L
 
F
A
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
A
V
 
I
G
 
P
G
 
T
A
 
V
V
 
F
T
 
S
Y
 
Y
V
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
V
S
 
L
P
 
A
V
 
R
E
 
E
K
 
K
R
 
R
G
 
G
L
 
E
Y
 
H
T
 
L
S
 
S
S
 
W
L
 
L
Q
 
C
T
 
M
T
 
F
A
 
W
T
 
M
L
 
I
G
 
G
L
 
G
L
 
I
S
 
Y
S
 
A
L
 
S
L
 
A
V
 
M
V
 
A
Y
 
W
L
 
A
L
 
I
K
 
I
-
 
P
-
 
H
-
 
Y
-
 
G
-
 
W
-
 
S
-
 
F
T
 
S
L
 
M
L
 
G
T
 
S
E
 
A
A
 
Y
Q
 
Q
F
 
F
R
 
H
E
 
-
W
 
-
G
 
S
W
 
W
R
 
R
L
 
V
P
 
F
F
 
V
L
 
I
V
 
V
S
 
C
F
 
A
L
 
L
M
 
P
L
 
C
V
 
V
V
 
S
S
 
S
V
 
V
Y
 
V
I
 
A
R
 
L
G
 
T
K
 
F
L
 
M
H
 
P
E
 
E
S
 
S
P
 
P
I
 
R
F
 
F

Sites not aligning to the query:

O57379 Solute carrier family 22 member 6; Organic anion transporter 1; Renal organic anion transporter 1; ROAT1; fROAT1 from Pseudopleuronectes americanus (Winter flounder) (Pleuronectes americanus) (see paper)
30% identity, 24% coverage: 79:208/534 of query aligns to 159:276/562 of O57379

query
sites
O57379
V
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
F
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
L
G
 
S
D
 
D
K
 
R
I
 
Y
G
 
G
R
 
R
K
 
R
H
 
I
T
 
L
F
 
L
L
 
L
V
 
I
T
 
S
I
 
N
L
 
L
L
 
L
M
 
M
G
 
A
I
 
V
A
 
S
T
 
G
V
 
T
G
 
C
V
 
A
G
 
A
L
 
F
L
 
S
P
 
S
T
 
S
Y
 
F
G
 
S
Q
 
-
I
 
-
G
 
-
I
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
L
L
 
F
V
 
C
V
 
V
L
 
F
R
 
R
L
 
F
L
 
G
Q
 
C
G
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
S
G
 
G
E
 
L
V
 
G
G
 
L
G
 
N
A
 
T
V
 
F
T
 
S
Y
 
L
V
 
I
A
 
V
E
 
E
H
 
W
S
 
I
P
 
P
V
 
T
E
 
R
K
 
I
R
 
R
G
 
T
L
 
A
Y
 
V
T
 
G
S
 
T
S
 
T
L
 
T
Q
 
G
T
 
Y
T
 
C
A
 
Y
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
Q
L
 
L
S
 
I
S
 
L
L
 
V
L
 
L
V
 
L
V
 
A
Y
 
Y
L
 
F
L
 
I
K
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
Q
 
-
F
 
-
R
 
R
E
 
D
W
 
W
G
 
R
W
 
W
-
 
L
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
V
R
 
S
L
 
L
P
 
P
F
 
F
L
 
Y
V
 
V
S
 
F
F
 
F
L
 
L
M
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>RR42_RS26465 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS26465
MTISLANDGAAVRKQGMTREERKVILASSFGALMEWYDFYIYAALAVYFGALFFPPGNET
TAFLASLATFGAGFLVRPVGALLFGRLGDKIGRKHTFLVTILLMGIATVGVGLLPTYGQI
GITATILLVVLRLLQGLALGGEVGGAVTYVAEHSPVEKRGLYTSSLQTTATLGLLSSLLV
VYLLKTLLTEAQFREWGWRLPFLVSFLMLVVSVYIRGKLHESPIFARMKAGNATSKSPIL
DSFTNWANLKYVLLLFVVASGLGAIFGTGHFYTMFFVNKTLHVPLELVHLLIGIALVIAT
PCYLFFGWLSDRIGRKHIMMAACLLAALTTQPIFRALTHYANPALEQFQQRNTVQLRAGD
CHFRLFAEPVSACDKVKGYLTDLGVGYEFTQIDAGAQPALRIGGTTLQGFDKAAIKQALV
AAGWTEHADPAAINRPMLFLMLLIPILLLAMVYGPLAAFMVELFPARIRYTSLSLPFHLG
AGWVGGMLSFVVTAMNVSSGNVYFGLWYPVSIAAIAFVVGMVFVPETRGRNLDT

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory