SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS28450 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS28450 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 17 hits to proteins with known functional sites (download)

P00926 D-serine dehydratase; D-serine deaminase; DSD; EC 4.3.1.18 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
47% identity, 94% coverage: 21:451/457 of query aligns to 15:440/442 of P00926

query
sites
P00926
L
 
L
R
 
V
A
 
K
S
 
D
L
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
L
T
 
K
P
 
E
L
 
T
L
 
T
W
 
W
C
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
G
R
 
T
A
 
T
V
 
S
T
 
L
P
 
A
P
 
E
P
 
G
V
 
L
Q
 
P
A
 
Y
A
 
V
G
 
G
E
 
-
H
 
-
S
 
-
I
 
L
S
 
T
L
 
E
A
 
Q
D
 
D
V
 
V
E
 
Q
A
 
D
A
 
A
Q
 
H
A
 
A
R
 
R
F
 
L
A
 
S
R
 
R
F
 
F
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
L
 
L
S
 
A
A
 
K
L
 
A
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
T
A
 
A
G
 
A
T
 
T
H
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
I
E
 
E
S
 
S
P
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
I
P
 
P
S
 
A
M
 
M
Q
 
Q
T
 
K
A
 
R
L
 
L
G
 
E
L
 
K
P
 
E
H
 
Y
S
 
Q
Q
 
Q
-
 
P
-
 
I
-
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
W
 
L
V
 
L
K
 
K
A
 
K
D
 
D
H
 
S
S
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
I
A
 
S
G
 
G
S
 
S
I
 
I
K
|
K
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
I
 
I
H
 
Y
E
 
E
V
 
V
L
 
L
E
 
A
F
 
H
A
 
A
E
 
E
N
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
E
H
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
L
G
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
T
E
 
L
P
 
D
E
 
D
H
 
D
Y
 
Y
L
 
S
A
 
K
L
 
L
R
 
L
E
 
S
P
 
P
A
 
E
A
 
F
R
 
K
A
 
Q
L
 
F
F
 
F
G
 
S
R
 
Q
Y
 
Y
Q
 
S
V
 
I
A
 
A
V
 
V
G
 
G
S
 
S
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
I
 
I
G
 
G
V
 
I
M
 
M
A
 
S
S
 
A
A
 
R
L
 
I
G
 
G
F
 
F
R
 
K
A
 
V
A
 
T
V
 
V
H
 
H
M
 
M
S
 
S
S
 
A
D
 
D
A
 
A
K
 
R
A
 
A
W
 
W
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
K
L
 
L
R
 
R
N
 
S
R
 
H
G
 
G
V
 
V
E
 
T
V
 
V
V
 
V
E
 
E
H
 
Y
A
 
E
G
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
E
 
G
D
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
E
G
 
G
R
 
R
R
 
K
Q
 
A
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
S
D
 
D
E
 
P
F
 
N
T
 
C
Y
 
F
F
 
F
V
 
I
D
 
D
D
 
D
E
 
E
R
 
N
S
 
S
L
 
R
S
 
T
L
 
L
L
 
F
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
A
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
Q
H
 
R
L
 
L
R
 
K
Q
 
A
Q
 
Q
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
H
 
Q
A
 
G
I
 
R
R
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
D
H
 
N
P
 
P
L
 
L
F
 
F
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
C
 
C
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
G
P
 
P
A
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
L
R
 
K
Q
 
L
L
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
D
H
 
H
V
 
V
H
 
H
C
 
C
V
 
F
F
 
F
A
 
A
E
 
E
P
 
P
V
 
T
Q
 
H
S
 
S
P
 
P
C
 
C
F
 
M
L
 
L
V
 
L
Q
 
G
M
 
V
M
 
H
A
 
T
G
 
G
A
 
L
G
 
H
N
 
D
P
 
Q
-
 
I
S
 
S
V
 
V
Y
 
Q
D
 
D
F
 
I
G
 
G
L
 
I
S
 
D
N
 
N
S
 
L
T
 
T
Q
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
P
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
S
E
 
G
L
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
R
V
 
A
M
 
M
R
 
E
P
 
R
L
 
L
L
 
L
S
 
D
G
 
G
V
 
F
F
 
Y
T
 
T
V
 
L
A
 
S
D
 
D
D
 
Q
T
 
T
L
 
M
F
 
Y
E
 
D
H
 
M
L
 
L
A
 
G
L
 
W
A
 
L
W
 
A
R
 
Q
T
 
E
Q
 
E
G
 
G
L
 
I
R
 
R
I
 
L
E
 
E
P
 
P
S
 
S
A
 
A
A
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
M
S
 
A
G
 
G
P
 
P
R
 
Q
M
 
R
L
 
V
C
 
C
E
 
A
S
 
S
P
 
V
A
 
S
G
 
-
R
 
-
D
 
-
Y
 
Y
L
 
Q
A
 
Q
R
 
M
H
 
H
Q
 
G
L
 
F
E
 
S
A
 
A
-
 
E
M
 
Q
M
 
L
P
 
R
Q
 
N
A
 
T
T
 
T
H
 
H
L
 
L
V
 
V
W
 
W
T
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
G
F
 
M
V
 
V
P
 
P
P
 
E
A
 
E
E
 
E
Y
 
M
Q
 
N
G
 
Q
F
 
Y
L
 
L
D
 
A
K
 
K

3ss7X Crystal structure of holo d-serine dehydratase from escherichia coli at 1.55 a resolution (see paper)
47% identity, 94% coverage: 21:451/457 of query aligns to 10:435/437 of 3ss7X

query
sites
3ss7X
L
 
L
R
 
V
A
 
K
S
 
D
L
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
L
T
 
K
P
 
E
L
 
T
L
 
T
W
 
W
C
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
G
R
 
T
A
 
T
V
 
S
T
 
L
P
 
A
P
 
E
P
 
G
V
 
L
Q
 
P
A
 
Y
A
 
V
G
 
G
E
 
-
H
 
-
S
 
-
I
 
L
S
 
T
L
 
E
A
 
Q
D
 
D
V
 
V
E
 
Q
A
 
D
A
 
A
Q
 
H
A
 
A
R
 
R
F
 
L
A
 
S
R
 
R
F
 
F
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
L
 
L
S
 
A
A
 
K
L
 
A
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
T
A
 
A
G
 
A
T
 
T
H
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
I
E
 
E
S
 
S
P
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
I
P
 
P
S
 
A
M
 
M
Q
 
Q
T
 
K
A
 
R
L
 
L
G
 
E
L
 
K
P
 
E
H
 
Y
S
 
Q
Q
 
Q
-
 
P
-
 
I
-
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
W
 
L
V
 
L
K
 
K
A
 
K
D
 
D
H
 
S
S
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
I
A
 
S
G
 
G
S
 
S
I
 
I
K
|
K
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
I
 
I
H
 
Y
E
 
E
V
 
V
L
 
L
E
 
A
F
 
H
A
 
A
E
 
E
N
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
E
H
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
L
G
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
T
E
 
L
P
 
D
E
 
D
H
 
D
Y
 
Y
L
 
S
A
 
K
L
 
L
R
 
L
E
 
S
P
 
P
A
 
E
A
 
F
R
 
K
A
 
Q
L
 
F
F
 
F
G
 
S
R
 
Q
Y
 
Y
Q
 
S
V
 
I
A
 
A
V
 
V
G
 
G
S
 
S
T
 
T
G
 
G
N
|
N
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
I
 
I
G
 
G
V
 
I
M
 
M
A
 
S
S
 
A
A
 
R
L
 
I
G
 
G
F
 
F
R
 
K
A
 
V
A
 
T
V
 
V
H
 
H
M
 
M
S
 
S
S
 
A
D
 
D
A
 
A
K
 
R
A
 
A
W
 
W
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
K
L
 
L
R
 
R
N
 
S
R
 
H
G
 
G
V
 
V
E
 
T
V
 
V
V
 
V
E
 
E
H
 
Y
A
 
E
G
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
E
 
G
D
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
E
G
 
G
R
 
R
R
 
K
Q
 
A
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
S
D
 
D
E
 
P
F
 
N
T
 
C
Y
 
F
F
 
F
V
 
I
D
 
D
D
 
D
E
 
E
R
 
N
S
 
S
L
 
R
S
 
T
L
 
L
L
 
F
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
A
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
Q
H
 
R
L
 
L
R
 
K
Q
 
A
Q
 
Q
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
H
 
Q
A
 
G
I
 
R
R
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
D
H
 
N
P
 
P
L
 
L
F
 
F
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
C
 
C
G
|
G
V
|
V
G
|
G
G
 
G
A
x
G
P
|
P
A
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
L
R
 
K
Q
 
L
L
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
D
H
 
H
V
 
V
H
 
H
C
 
C
V
 
F
F
 
F
A
 
A
E
 
E
P
 
P
V
 
T
Q
 
H
S
 
S
P
 
P
C
 
C
F
 
M
L
 
L
V
 
L
Q
 
G
M
 
V
M
 
H
A
 
T
G
 
G
A
 
L
G
 
H
N
 
D
P
 
Q
-
 
I
S
 
S
V
 
V
Y
 
Q
D
 
D
F
 
I
G
 
G
L
 
I
S
 
D
N
 
N
S
 
L
T
 
T
Q
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
P
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
S
E
 
G
L
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
R
V
 
A
M
 
M
R
 
E
P
 
R
L
 
L
L
 
L
S
 
D
G
 
G
V
 
F
F
 
Y
T
 
T
V
 
L
A
 
S
D
 
D
D
 
Q
T
 
T
L
 
M
F
 
Y
E
 
D
H
 
M
L
 
L
A
 
G
L
 
W
A
 
L
W
 
A
R
 
Q
T
 
E
Q
 
E
G
 
G
L
 
I
R
 
R
I
 
L
E
|
E
P
 
P
S
 
S
A
 
A
A
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
M
S
 
A
G
 
G
P
 
P
R
 
Q
M
 
R
L
 
V
C
 
C
E
 
A
S
 
S
P
 
V
A
 
S
G
 
-
R
 
-
D
 
-
Y
 
Y
L
 
Q
A
 
Q
R
 
M
H
 
H
Q
 
G
L
 
F
E
 
S
A
 
A
-
 
E
M
 
Q
M
 
L
P
 
R
Q
 
N
A
 
T
T
 
T
H
 
H
L
 
L
V
 
V
W
 
W
T
 
A
T
|
T
G
 
G
G
 
G
L
 
G
F
 
M
V
 
V
P
 
P
P
 
E
A
 
E
E
 
E
Y
 
M
Q
 
N
G
 
Q
F
 
Y
L
 
L
D
 
A
K
 
K

3r0xA Crystal structure of selenomethionine incorporated apo d-serine deaminase from salmonella tyhimurium (see paper)
47% identity, 94% coverage: 21:451/457 of query aligns to 13:438/438 of 3r0xA

query
sites
3r0xA
L
 
L
R
 
V
A
 
E
S
 
D
L
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
L
T
 
K
P
 
E
L
 
T
L
 
T
W
 
W
C
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
G
R
 
A
A
 
T
V
 
S
T
 
L
P
 
A
P
 
Q
P
 
G
V
 
L
Q
 
P
A
 
Y
A
 
V
G
 
G
E
 
-
H
 
-
S
 
-
I
 
L
S
 
T
L
 
E
A
 
Q
D
 
D
V
 
V
E
 
N
A
 
A
A
 
A
Q
 
H
A
 
D
R
 
R
F
 
L
A
 
A
R
 
R
F
 
F
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
L
 
L
S
 
A
A
 
K
L
 
A
F
 
F
P
 
P
E
 
Q
L
 
T
A
 
A
G
 
A
T
 
A
H
 
G
G
 
G
V
 
M
I
 
I
E
 
E
S
 
S
P
 
D
L
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
I
P
 
P
S
 
A
M
 
M
Q
 
Q
T
 
K
A
 
R
L
 
L
G
 
E
L
 
K
P
 
E
H
 
Y
S
 
G
Q
 
Q
-
 
T
-
 
I
-
 
N
G
 
G
R
 
E
L
 
M
W
 
L
V
 
L
K
 
K
A
 
K
D
 
D
H
 
S
S
 
H
L
 
L
P
 
A
V
 
I
A
 
S
G
 
G
S
 
S
I
 
I
K
 
K
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
I
 
I
H
 
Y
E
 
E
V
 
V
L
 
L
E
 
T
F
 
H
A
 
A
E
 
E
N
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
E
H
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
L
G
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
T
E
 
T
P
 
D
E
 
D
H
 
D
Y
 
Y
L
 
S
A
 
V
L
 
L
R
 
L
E
 
S
P
 
P
A
 
E
A
 
F
R
 
K
A
 
Q
L
 
F
F
 
F
G
 
S
R
 
Q
Y
 
Y
Q
 
S
V
 
I
A
 
A
V
 
V
G
 
G
S
 
S
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
I
 
I
G
 
G
V
 
I
M
 
M
A
 
S
S
 
A
A
 
C
L
 
I
G
 
G
F
 
F
R
 
K
A
 
V
A
 
T
V
 
V
H
 
H
M
 
M
S
 
S
S
 
A
D
 
D
A
 
A
K
 
R
A
 
A
W
 
W
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
K
L
 
L
R
 
R
N
 
S
R
 
H
G
 
G
V
 
V
E
 
T
V
 
V
V
 
V
E
 
E
H
 
Y
A
 
E
G
 
D
D
 
D
Y
 
Y
E
 
G
D
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
R
 
R
R
 
K
Q
 
A
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
S
D
 
D
E
 
P
F
 
N
T
 
C
Y
 
F
F
 
F
V
 
I
D
 
D
D
 
D
E
 
E
R
 
N
S
 
S
L
 
R
S
 
T
L
 
L
L
 
F
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
S
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
Q
H
 
R
L
 
L
R
 
K
Q
 
A
Q
 
Q
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
H
 
Q
A
 
G
I
 
R
R
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
S
H
 
H
P
 
P
L
 
L
F
 
F
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
C
|
C
G
|
G
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
G
P
 
P
A
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
L
R
 
K
Q
 
L
L
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
D
H
 
N
V
 
V
H
 
H
C
 
C
V
 
F
F
 
F
A
 
A
E
|
E
P
 
P
V
 
T
Q
 
H
S
|
S
P
 
P
C
|
C
F
 
M
L
 
L
V
 
L
Q
 
G
M
 
V
M
 
Y
A
 
T
G
 
G
A
 
L
G
 
H
N
 
D
P
 
A
-
 
I
S
 
S
V
 
V
Y
 
Q
D
 
D
F
 
I
G
 
G
L
 
I
S
 
D
N
 
N
S
 
L
T
 
T
Q
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
L
|
L
A
 
A
V
|
V
P
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
S
E
 
G
L
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
R
V
 
A
M
 
M
R
 
E
P
 
R
L
 
L
L
 
L
S
 
D
G
 
G
V
 
L
F
 
Y
T
 
T
V
 
L
A
 
D
D
 
D
D
 
Q
T
 
T
L
 
M
F
 
Y
E
 
D
H
 
M
L
 
L
A
 
G
L
 
W
A
 
L
W
 
A
R
 
Q
T
 
E
Q
 
E
G
 
G
L
 
I
R
 
R
I
 
L
E
 
E
P
 
P
S
 
S
A
 
A
A
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
M
S
 
A
G
 
G
P
 
P
R
 
Q
M
 
R
L
 
I
C
 
C
E
 
A
S
 
S
P
 
V
A
 
A
G
 
-
R
 
-
D
 
-
Y
 
Y
L
 
Q
A
 
Q
R
 
R
H
 
H
Q
 
G
L
 
F
-
 
S
E
 
Q
A
 
T
M
 
Q
M
 
L
P
 
G
Q
 
N
A
 
A
T
 
T
H
 
H
L
 
L
V
 
V
W
 
W
T
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
G
F
 
M
V
 
V
P
 
P
P
 
E
A
 
D
E
 
E
Y
 
M
Q
 
E
G
 
Q
F
 
Y
L
 
L
D
 
A
K
 
K

5ygrD Crystal structure of plp bound diaminopropionate ammonia lyase from salmonella typhimurium (see paper)
24% identity, 56% coverage: 156:411/457 of query aligns to 92:336/388 of 5ygrD

query
sites
5ygrD
Y
 
F
L
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
N
E
 
T
P
 
P
A
 
E
A
 
I
R
 
K
A
 
E
L
 
K
F
 
I
G
 
K
R
 
D
Y
 
C
Q
 
V
V
 
F
A
 
V
V
 
T
G
 
A
S
x
T
T
x
D
G
 
G
N
|
N
L
x
H
G
 
G
L
 
R
S
 
G
I
 
V
G
 
A
V
 
W
M
 
A
A
 
A
S
 
E
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
F
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
V
V
 
V
H
 
Y
M
 
M
S
 
P
S
 
K
D
 
G
A
 
S
K
 
S
A
 
L
W
 
I
K
 
R
K
 
A
A
 
E
R
 
N
L
 
I
R
 
R
N
 
H
R
 
H
G
 
G
V
 
A
E
 
E
V
 
C
V
 
T
E
 
I
H
 
T
A
 
D
G
 
L
D
 
N
Y
 
Y
E
 
D
D
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
L
G
 
A
R
 
H
R
 
R
Q
 
M
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
T
D
 
K
E
 
G
F
 
W
T
 
V
Y
 
L
F
 
L
V
 
Q
D
 
D
-
 
T
-
 
A
-
 
W
-
 
T
-
 
G
-
 
Y
D
 
E
E
 
E
R
 
I
S
 
P
L
 
T
S
 
W
L
 
I
L
 
M
L
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
S
 
M
A
 
T
A
 
L
A
 
A
L
 
V
H
 
E
L
 
A
R
 
Y
Q
 
E
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
-
H
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
E
V
 
T
D
 
N
A
 
S
E
 
P
H
 
L
P
 
P
L
 
T
F
 
H
V
 
L
Y
 
I
L
 
L
P
 
Q
C
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
-
 
S
-
 
F
-
 
A
G
 
G
A
 
S
P
 
V
A
 
M
G
 
G
I
 
Y
T
 
F
F
 
V
G
 
E
M
 
K
R
 
M
Q
 
Q
L
 
E
F
 
N
G
 
I
P
 
P
H
 
N
V
 
I
H
 
-
C
 
-
V
 
I
F
 
V
A
 
V
E
 
E
P
 
P
V
 
H
Q
 
Q
S
 
A
P
 
N
C
 
C
F
 
L
L
 
Y
V
 
Q
Q
 
S
M
 
A
M
 
V
A
 
M
G
 
D
A
 
D
G
 
G
N
 
Q
P
 
P
S
 
H
V
 
C
Y
 
V
D
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
-
N
 
T
S
 
A
T
 
T
Q
 
I
A
 
M
D
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
C
P
 
G
R
 
E
A
 
P
S
 
N
E
 
I
L
 
I
A
 
S
A
 
W
G
 
P
V
 
I
M
 
I
R
 
R
P
 
D
L
 
N
L
 
T
S
 
S
G
 
-
V
 
C
F
 
F
T
 
I
V
 
S
A
 
A
D
 
D
D
 
D
T
 
C
L
 
L
F
 
-
E
 
-
H
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
W
 
-
R
 
A
T
 
A
Q
 
K
G
 
G
L
 
M
R
 
R
I
 
I
E
 
S
P
 
A
S
 
A
A
 
P
A
 
R
A
 
P
G
 
G
F
 
T
S
 
D
G
x
T
P
 
P
R
 
F
M
 
I
L
 
S
C
 
G
E
 
E
S
 
S
P
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7nbgDDD structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z52314092, XChem fragment screen (see paper)
26% identity, 52% coverage: 163:401/457 of query aligns to 60:283/310 of 7nbgDDD

query
sites
7nbgDDD
A
 
A
A
 
V
R
 
R
A
 
S
L
 
L
F
 
V
G
 
R
R
 
K
Y
 
P
Q
 
K
V
 
A
A
 
V
V
 
V
G
 
T
-
 
H
S
 
S
T
x
S
G
 
G
N
|
N
L
 
H
G
 
G
L
x
Q
S
 
A
I
 
L
G
 
T
V
 
Y
M
 
A
A
 
A
S
 
K
A
 
L
L
 
E
G
 
G
F
 
I
R
 
P
A
 
A
A
 
Y
V
x
I
H
 
V
M
 
V
S
 
P
S
 
Q
D
 
T
A
 
A
K
 
P
A
 
D
W
 
C
K
 
K
K
 
K
A
 
L
R
 
A
L
 
I
R
 
Q
N
 
A
R
x
Y
G
 
G
V
 
A
E
 
S
V
 
I
V
 
V
E
 
Y
H
 
C
A
 
E
G
 
P
D
 
S
Y
 
D
E
 
E
D
 
S
A
 
R
V
 
E
A
 
N
A
 
V
G
 
A
R
 
K
R
 
R
Q
 
V
A
 
T
Q
 
E
Q
 
E
D
 
T
E
 
E
F
 
-
T
 
G
Y
 
I
F
 
M
V
 
V
D
 
H
D
 
P
E
 
N
R
 
Q
S
 
E
L
 
P
S
 
A
L
 
V
L
 
I
L
 
A
G
 
G
Y
 
Q
S
 
G
A
 
T
A
 
I
A
 
A
L
 
L
H
 
E
L
 
V
R
 
L
Q
 
N
Q
 
Q
L
 
V
A
 
P
A
 
L
H
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
-
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
-
H
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
-
V
 
L
Y
 
V
L
 
V
P
 
P
C
 
V
G
|
G
V
x
G
G
|
G
G
|
G
A
x
M
P
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
A
F
 
I
G
 
T
M
 
V
R
 
K
Q
 
A
L
 
L
F
 
-
G
 
K
P
 
P
H
 
S
V
 
V
H
 
K
C
 
V
V
 
Y
F
 
A
A
 
A
E
|
E
P
 
P
V
 
S
Q
 
N
S
x
A
P
 
D
C
x
D
F
 
C
L
 
Y
V
 
Q
Q
 
S
M
 
K
M
 
L
A
 
K
G
 
G
A
 
K
G
 
L
N
 
M
P
 
P
S
 
N
V
 
L
Y
 
Y
D
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
P
N
 
P
S
 
E
T
 
T
Q
 
I
A
 
A
D
 
D
G
|
G
L
x
V
A
 
K
V
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
S
E
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
L
G
x
N
-
 
T
-
 
W
-
 
P
V
 
I
M
 
I
R
 
R
P
 
D
L
 
L
L
 
V
S
 
D
G
 
D
V
 
I
F
 
F
T
 
T
V
 
V
A
 
T
D
 
E
D
 
D
T
 
E
L
 
I
F
 
K
E
 
C
H
 
A
L
 
T
A
 
Q
L
 
L
A
 
V
W
 
W
R
 
E
T
 
R
Q
 
M
G
 
K
L
 
L
R
 
L
I
 
I
E
|
E
P
 
P
S
x
T
A
 
A
A
 
G
A
 
V
G
 
G
F
 
V
S
 
A

Sites not aligning to the query:

3l6bA X-ray crystal structure of human serine racemase in complex with malonate a potent inhibitor (see paper)
26% identity, 52% coverage: 163:401/457 of query aligns to 61:284/322 of 3l6bA

query
sites
3l6bA
A
 
A
A
 
V
R
 
R
A
 
S
L
 
L
F
 
V
G
 
R
R
 
K
Y
 
P
Q
 
K
V
 
A
A
 
V
V
 
V
G
 
T
-
 
H
S
|
S
T
x
S
G
 
G
N
|
N
L
x
H
G
 
G
L
 
Q
S
 
A
I
 
L
G
 
T
V
 
Y
M
 
A
A
 
A
S
 
K
A
 
L
L
 
E
G
 
G
F
 
I
R
 
P
A
 
A
A
 
Y
V
 
I
H
 
V
M
 
V
S
 
P
S
 
Q
D
 
T
A
 
A
K
 
P
A
 
D
W
 
C
K
 
K
K
 
K
A
 
L
R
 
A
L
 
I
R
 
Q
N
 
A
R
 
Y
G
 
G
V
 
A
E
 
S
V
 
I
V
 
V
E
 
Y
H
 
C
A
 
E
G
 
P
D
 
S
Y
 
D
E
 
E
D
 
S
A
x
R
V
 
E
A
 
N
A
 
V
G
 
A
R
 
K
R
 
R
Q
 
V
A
 
T
Q
 
E
Q
 
E
D
 
T
E
 
E
F
 
-
T
 
G
Y
 
I
F
 
M
V
 
V
D
 
H
D
 
P
E
 
N
R
 
Q
S
 
E
L
 
P
S
 
A
L
 
V
L
 
I
L
 
A
G
 
G
Y
 
Q
S
 
G
A
 
T
A
 
I
A
 
A
L
 
L
H
 
E
L
 
V
R
 
L
Q
 
N
Q
 
Q
L
 
V
A
 
P
A
 
L
H
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
-
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
-
H
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
-
V
 
L
Y
 
V
L
 
V
P
 
P
C
 
V
G
|
G
V
x
G
G
|
G
G
|
G
A
x
M
P
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
A
F
 
I
G
 
T
M
 
V
R
 
K
Q
 
A
L
 
L
F
 
-
G
 
K
P
 
P
H
 
S
V
 
V
H
 
K
C
 
V
V
 
Y
F
 
A
A
 
A
E
|
E
P
 
P
V
 
S
Q
 
N
S
x
A
P
 
D
C
x
D
F
 
C
L
 
Y
V
 
Q
Q
 
S
M
 
K
M
 
L
A
 
K
G
 
G
A
 
K
G
 
L
N
 
M
P
 
P
S
 
N
V
 
L
Y
 
Y
D
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
P
N
 
P
S
 
E
T
 
T
Q
 
I
A
 
A
D
 
D
G
|
G
L
x
V
A
 
K
V
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
S
E
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
L
G
 
N
-
 
T
-
 
W
-
 
P
V
 
I
M
 
I
R
 
R
P
 
D
L
 
L
L
 
V
S
 
D
G
 
D
V
 
I
F
 
F
T
 
T
V
 
V
A
 
T
D
 
E
D
 
D
T
 
E
L
 
I
F
 
K
E
 
C
H
 
A
L
 
T
A
 
Q
L
 
L
A
 
V
W
 
W
R
 
E
T
 
R
Q
 
M
G
 
K
L
 
L
R
 
L
I
 
I
E
|
E
P
 
P
S
x
T
A
 
A
A
 
G
A
 
V
G
 
G
F
 
V
S
 
A

Sites not aligning to the query:

7nbhAAA structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z26781964, XChem fragment screen (see paper)
25% identity, 50% coverage: 173:401/457 of query aligns to 76:288/320 of 7nbhAAA

query
sites
7nbhAAA
V
 
V
A
 
V
V
 
T
G
 
H
S
 
S
T
x
S
G
 
G
N
 
N
L
 
H
G
|
G
L
x
Q
S
 
A
I
 
L
G
 
T
V
 
Y
M
 
A
A
 
A
S
 
K
A
 
L
L
 
E
G
 
G
F
 
I
R
 
P
A
 
A
A
 
Y
V
 
I
H
 
V
M
 
V
S
 
P
S
 
Q
D
 
T
A
 
A
K
 
P
A
 
D
W
 
C
K
|
K
K
 
K
A
 
L
R
 
A
L
x
I
R
 
Q
N
 
A
R
x
Y
G
 
G
V
 
A
E
 
S
V
 
I
V
 
V
E
 
Y
H
 
C
A
 
E
G
 
P
D
 
S
Y
 
D
E
 
E
D
 
S
A
 
R
V
 
E
A
 
N
A
 
V
G
 
A
R
 
K
R
 
R
Q
 
V
A
 
T
Q
 
E
Q
 
E
D
 
T
E
 
E
F
 
-
T
 
G
Y
 
I
F
 
M
V
 
V
D
 
H
D
 
P
E
 
N
R
 
Q
S
 
E
L
 
P
S
 
A
L
 
V
L
 
I
L
 
A
G
 
G
Y
 
Q
S
 
G
A
 
T
A
 
I
A
 
A
L
 
L
H
 
E
L
 
V
R
 
L
Q
 
N
Q
 
Q
L
 
V
A
 
P
A
 
L
H
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
-
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
-
H
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
-
V
 
L
Y
 
V
L
 
V
P
 
P
C
 
V
G
 
G
V
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
M
P
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
A
F
 
I
G
 
T
M
 
V
R
 
K
Q
 
A
L
 
L
F
 
-
G
 
K
P
 
P
H
 
S
V
 
V
H
 
K
C
 
V
V
 
Y
F
 
A
A
 
A
E
|
E
P
 
P
V
 
S
Q
 
N
S
x
A
P
 
D
C
x
D
F
 
C
L
 
Y
V
 
Q
Q
 
S
M
 
K
M
 
L
A
 
K
G
 
G
A
 
K
G
 
L
N
 
M
P
 
P
S
 
N
V
 
L
Y
 
Y
D
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
P
N
 
P
S
 
E
T
 
T
Q
 
I
A
 
A
D
|
D
G
|
G
L
 
V
A
 
K
V
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
S
E
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
L
G
 
N
-
 
T
-
 
W
-
 
P
V
 
I
M
 
I
R
 
R
P
 
D
L
 
L
L
 
V
S
 
D
G
 
D
V
 
I
F
 
F
T
 
T
V
 
V
A
 
T
D
 
E
D
 
D
T
 
E
L
 
I
F
 
K
E
 
C
H
 
A
L
 
T
A
 
Q
L
 
L
A
 
V
W
 
W
R
 
E
T
 
R
Q
 
M
G
 
K
L
 
L
R
 
L
I
 
I
E
 
E
P
|
P
S
 
T
A
 
A
A
 
G
A
 
V
G
 
G
F
 
V
S
 
A

Sites not aligning to the query:

7nbgAAA structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z52314092, XChem fragment screen (see paper)
25% identity, 50% coverage: 173:401/457 of query aligns to 76:288/322 of 7nbgAAA

query
sites
7nbgAAA
V
 
V
A
 
V
V
 
T
G
 
H
S
 
S
T
x
S
G
 
G
N
|
N
L
 
H
G
|
G
L
x
Q
S
 
A
I
 
L
G
 
T
V
 
Y
M
 
A
A
 
A
S
 
K
A
 
L
L
 
E
G
 
G
F
 
I
R
 
P
A
 
A
A
 
Y
V
x
I
H
 
V
M
 
V
S
 
P
S
 
Q
D
 
T
A
 
A
K
 
P
A
 
D
W
 
C
K
|
K
K
 
K
A
 
L
R
 
A
L
x
I
R
 
Q
N
 
A
R
x
Y
G
 
G
V
 
A
E
 
S
V
 
I
V
 
V
E
 
Y
H
 
C
A
 
E
G
 
P
D
 
S
Y
 
D
E
 
E
D
 
S
A
 
R
V
 
E
A
 
N
A
 
V
G
 
A
R
 
K
R
 
R
Q
 
V
A
 
T
Q
 
E
Q
 
E
D
 
T
E
 
E
F
 
-
T
 
G
Y
 
I
F
 
M
V
 
V
D
 
H
D
 
P
E
 
N
R
 
Q
S
 
E
L
 
P
S
 
A
L
 
V
L
 
I
L
 
A
G
 
G
Y
 
Q
S
 
G
A
 
T
A
 
I
A
 
A
L
 
L
H
 
E
L
 
V
R
 
L
Q
 
N
Q
 
Q
L
 
V
A
 
P
A
 
L
H
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
-
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
-
H
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
-
V
 
L
Y
 
V
L
 
V
P
 
P
C
 
V
G
|
G
V
x
G
G
|
G
G
|
G
A
x
M
P
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
A
F
 
I
G
 
T
M
 
V
R
 
K
Q
 
A
L
 
L
F
 
-
G
 
K
P
 
P
H
 
S
V
 
V
H
 
K
C
 
V
V
 
Y
F
 
A
A
 
A
E
|
E
P
 
P
V
 
S
Q
 
N
S
x
A
P
 
D
C
x
D
F
 
C
L
 
Y
V
 
Q
Q
 
S
M
 
K
M
 
L
A
 
K
G
 
G
A
 
K
G
 
L
N
 
M
P
 
P
S
 
N
V
 
L
Y
 
Y
D
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
P
N
 
P
S
 
E
T
 
T
Q
 
I
A
 
A
D
 
D
G
|
G
L
x
V
A
 
K
V
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
S
E
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
L
G
 
N
-
 
T
-
 
W
-
 
P
V
 
I
M
 
I
R
 
R
P
 
D
L
 
L
L
 
V
S
 
D
G
 
D
V
 
I
F
 
F
T
 
T
V
 
V
A
 
T
D
 
E
D
 
D
T
 
E
L
 
I
F
 
K
E
 
C
H
 
A
L
 
T
A
 
Q
L
 
L
A
 
V
W
 
W
R
 
E
T
 
R
Q
 
M
G
 
K
L
 
L
R
 
L
I
 
I
E
 
E
P
 
P
S
x
T
A
 
A
A
 
G
A
 
V
G
 
G
F
 
V
S
 
A

Sites not aligning to the query:

7nbfAAA structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z126932614, XChem fragment screen (see paper)
25% identity, 50% coverage: 173:401/457 of query aligns to 76:288/323 of 7nbfAAA

query
sites
7nbfAAA
V
 
V
A
 
V
V
 
T
G
 
H
S
 
S
T
x
S
G
 
G
N
|
N
L
 
H
G
 
G
L
 
Q
S
 
A
I
 
L
G
 
T
V
 
Y
M
 
A
A
 
A
S
 
K
A
 
L
L
 
E
G
 
G
F
 
I
R
 
P
A
 
A
A
 
Y
V
 
I
H
 
V
M
 
V
S
 
P
S
 
Q
D
 
T
A
 
A
K
 
P
A
 
D
W
 
C
K
 
K
K
 
K
A
 
L
R
 
A
L
 
I
R
 
Q
N
 
A
R
 
Y
G
 
G
V
 
A
E
 
S
V
 
I
V
 
V
E
 
Y
H
 
C
A
 
E
G
 
P
D
 
S
Y
 
D
E
 
E
D
 
S
A
 
R
V
 
E
A
 
N
A
 
V
G
 
A
R
 
K
R
 
R
Q
 
V
A
 
T
Q
 
E
Q
 
E
D
 
T
E
 
E
F
 
-
T
 
G
Y
 
I
F
 
M
V
 
V
D
 
H
D
 
P
E
 
N
R
 
Q
S
 
E
L
 
P
S
 
A
L
 
V
L
 
I
L
 
A
G
 
G
Y
 
Q
S
 
G
A
 
T
A
 
I
A
 
A
L
 
L
H
 
E
L
 
V
R
 
L
Q
 
N
Q
 
Q
L
 
V
A
 
P
A
 
L
H
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
-
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
-
H
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
-
V
 
L
Y
 
V
L
 
V
P
 
P
C
 
V
G
|
G
V
x
G
G
|
G
G
|
G
A
x
M
P
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
A
F
 
I
G
 
T
M
 
V
R
 
K
Q
 
A
L
 
L
F
 
-
G
 
K
P
 
P
H
 
S
V
 
V
H
 
K
C
 
V
V
 
Y
F
 
A
A
 
A
E
|
E
P
 
P
V
 
S
Q
 
N
S
x
A
P
 
D
C
x
D
F
 
C
L
 
Y
V
 
Q
Q
 
S
M
 
K
M
 
L
A
 
K
G
 
G
A
 
K
G
 
L
N
 
M
P
 
P
S
 
N
V
 
L
Y
 
Y
D
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
P
N
 
P
S
 
E
T
 
T
Q
 
I
A
 
A
D
 
D
G
|
G
L
x
V
A
 
K
V
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
S
E
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
L
G
x
N
-
 
T
-
 
W
-
 
P
V
 
I
M
 
I
R
 
R
P
 
D
L
 
L
L
 
V
S
 
D
G
 
D
V
 
I
F
 
F
T
 
T
V
 
V
A
 
T
D
 
E
D
 
D
T
 
E
L
 
I
F
 
K
E
 
C
H
 
A
L
 
T
A
 
Q
L
 
L
A
 
V
W
 
W
R
 
E
T
 
R
Q
 
M
G
 
K
L
 
L
R
 
L
I
 
I
E
 
E
P
 
P
S
x
T
A
 
A
A
 
G
A
 
V
G
 
G
F
 
V
S
 
A

Sites not aligning to the query:

7nbdAAA structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z235449082, XChem fragment screen (see paper)
25% identity, 50% coverage: 173:401/457 of query aligns to 76:288/323 of 7nbdAAA

query
sites
7nbdAAA
V
 
V
A
 
V
V
 
T
G
 
H
S
 
S
T
x
S
G
 
G
N
|
N
L
 
H
G
 
G
L
 
Q
S
 
A
I
 
L
G
 
T
V
 
Y
M
 
A
A
 
A
S
 
K
A
 
L
L
 
E
G
 
G
F
 
I
R
 
P
A
 
A
A
 
Y
V
 
I
H
 
V
M
 
V
S
 
P
S
 
Q
D
 
T
A
 
A
K
 
P
A
 
D
W
 
C
K
 
K
K
 
K
A
 
L
R
 
A
L
 
I
R
 
Q
N
 
A
R
 
Y
G
 
G
V
 
A
E
 
S
V
 
I
V
 
V
E
 
Y
H
 
C
A
 
E
G
 
P
D
 
S
Y
 
D
E
 
E
D
 
S
A
 
R
V
 
E
A
 
N
A
 
V
G
 
A
R
 
K
R
 
R
Q
 
V
A
 
T
Q
 
E
Q
 
E
D
 
T
E
 
E
F
 
-
T
 
G
Y
 
I
F
 
M
V
 
V
D
 
H
D
 
P
E
 
N
R
 
Q
S
 
E
L
 
P
S
 
A
L
 
V
L
 
I
L
 
A
G
 
G
Y
 
Q
S
 
G
A
 
T
A
 
I
A
 
A
L
 
L
H
 
E
L
 
V
R
 
L
Q
 
N
Q
 
Q
L
 
V
A
 
P
A
 
L
H
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
-
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
-
H
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
-
V
 
L
Y
 
V
L
 
V
P
 
P
C
 
V
G
|
G
V
x
G
G
|
G
G
|
G
A
x
M
P
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
A
F
 
I
G
 
T
M
 
V
R
 
K
Q
 
A
L
 
L
F
 
-
G
 
K
P
 
P
H
 
S
V
 
V
H
 
K
C
 
V
V
 
Y
F
 
A
A
 
A
E
|
E
P
 
P
V
 
S
Q
 
N
S
x
A
P
 
D
C
x
D
F
 
C
L
 
Y
V
 
Q
Q
 
S
M
 
K
M
 
L
A
 
K
G
 
G
A
 
K
G
 
L
N
 
M
P
 
P
S
 
N
V
 
L
Y
 
Y
D
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
P
N
 
P
S
 
E
T
 
T
Q
 
I
A
 
A
D
 
D
G
|
G
L
x
V
A
 
K
V
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
S
E
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
L
G
x
N
-
 
T
-
 
W
-
 
P
V
 
I
M
 
I
R
 
R
P
 
D
L
 
L
L
 
V
S
 
D
G
 
D
V
 
I
F
 
F
T
 
T
V
 
V
A
 
T
D
 
E
D
 
D
T
 
E
L
 
I
F
 
K
E
 
C
H
 
A
L
 
T
A
 
Q
L
 
L
A
 
V
W
|
W
R
 
E
T
 
R
Q
 
M
G
 
K
L
 
L
R
x
L
I
 
I
E
|
E
P
 
P
S
x
T
A
 
A
A
 
G
A
 
V
G
 
G
F
 
V
S
 
A

Sites not aligning to the query:

7nbcCCC structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z2856434779, XChem fragment screen (see paper)
25% identity, 50% coverage: 173:401/457 of query aligns to 76:288/323 of 7nbcCCC

query
sites
7nbcCCC
V
 
V
A
 
V
V
x
T
G
x
H
S
 
S
T
x
S
G
 
G
N
|
N
L
x
H
G
 
G
L
 
Q
S
 
A
I
 
L
G
 
T
V
 
Y
M
 
A
A
 
A
S
 
K
A
 
L
L
 
E
G
 
G
F
 
I
R
 
P
A
 
A
A
 
Y
V
 
I
H
 
V
M
 
V
S
 
P
S
 
Q
D
 
T
A
 
A
K
 
P
A
 
D
W
 
C
K
 
K
K
 
K
A
 
L
R
 
A
L
 
I
R
 
Q
N
 
A
R
 
Y
G
 
G
V
 
A
E
 
S
V
 
I
V
 
V
E
 
Y
H
 
C
A
 
E
G
 
P
D
 
S
Y
 
D
E
 
E
D
 
S
A
 
R
V
 
E
A
 
N
A
 
V
G
 
A
R
 
K
R
 
R
Q
 
V
A
 
T
Q
 
E
Q
 
E
D
 
T
E
 
E
F
 
-
T
 
G
Y
 
I
F
 
M
V
|
V
D
x
H
D
x
P
E
 
N
R
 
Q
S
 
E
L
 
P
S
 
A
L
 
V
L
 
I
L
 
A
G
 
G
Y
 
Q
S
 
G
A
 
T
A
 
I
A
 
A
L
 
L
H
 
E
L
 
V
R
 
L
Q
 
N
Q
 
Q
L
 
V
A
 
P
A
 
L
H
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
-
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
-
H
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
-
V
 
L
Y
 
V
L
 
V
P
 
P
C
 
V
G
|
G
V
x
G
G
|
G
G
|
G
A
x
M
P
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
A
F
 
I
G
 
T
M
 
V
R
 
K
Q
 
A
L
 
L
F
 
-
G
 
K
P
 
P
H
 
S
V
 
V
H
 
K
C
 
V
V
 
Y
F
 
A
A
 
A
E
|
E
P
 
P
V
 
S
Q
 
N
S
x
A
P
 
D
C
x
D
F
 
C
L
 
Y
V
 
Q
Q
 
S
M
 
K
M
 
L
A
 
K
G
 
G
A
 
K
G
 
L
N
 
M
P
 
P
S
 
N
V
 
L
Y
 
Y
D
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
P
N
 
P
S
 
E
T
 
T
Q
 
I
A
 
A
D
 
D
G
|
G
L
x
V
A
 
K
V
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
S
E
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
L
G
 
N
-
 
T
-
 
W
-
 
P
V
 
I
M
 
I
R
 
R
P
 
D
L
 
L
L
 
V
S
 
D
G
 
D
V
 
I
F
 
F
T
 
T
V
 
V
A
 
T
D
 
E
D
 
D
T
 
E
L
 
I
F
 
K
E
 
C
H
 
A
L
 
T
A
 
Q
L
 
L
A
 
V
W
 
W
R
 
E
T
 
R
Q
 
M
G
 
K
L
 
L
R
 
L
I
 
I
E
 
E
P
 
P
S
x
T
A
 
A
A
 
G
A
 
V
G
 
G
F
 
V
S
 
A

Sites not aligning to the query:

7nbcAAA structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z2856434779, XChem fragment screen (see paper)
25% identity, 50% coverage: 173:401/457 of query aligns to 76:288/323 of 7nbcAAA

query
sites
7nbcAAA
V
 
V
A
 
V
V
 
T
G
 
H
S
 
S
T
x
S
G
 
G
N
|
N
L
 
H
G
 
G
L
 
Q
S
 
A
I
 
L
G
 
T
V
 
Y
M
 
A
A
 
A
S
 
K
A
 
L
L
 
E
G
 
G
F
 
I
R
 
P
A
 
A
A
 
Y
V
 
I
H
 
V
M
 
V
S
 
P
S
 
Q
D
 
T
A
 
A
K
 
P
A
 
D
W
 
C
K
 
K
K
 
K
A
 
L
R
 
A
L
 
I
R
 
Q
N
 
A
R
 
Y
G
 
G
V
 
A
E
 
S
V
 
I
V
 
V
E
 
Y
H
 
C
A
 
E
G
 
P
D
 
S
Y
 
D
E
 
E
D
 
S
A
 
R
V
 
E
A
 
N
A
 
V
G
 
A
R
 
K
R
 
R
Q
 
V
A
 
T
Q
 
E
Q
 
E
D
 
T
E
 
E
F
 
-
T
 
G
Y
 
I
F
 
M
V
 
V
D
 
H
D
 
P
E
 
N
R
 
Q
S
 
E
L
 
P
S
 
A
L
 
V
L
 
I
L
 
A
G
 
G
Y
 
Q
S
 
G
A
 
T
A
 
I
A
 
A
L
 
L
H
 
E
L
 
V
R
 
L
Q
 
N
Q
 
Q
L
 
V
A
 
P
A
 
L
H
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
-
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
-
H
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
-
V
 
L
Y
 
V
L
 
V
P
 
P
C
 
V
G
|
G
V
x
G
G
|
G
G
|
G
A
x
M
P
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
A
F
 
I
G
 
T
M
 
V
R
 
K
Q
 
A
L
 
L
F
 
-
G
 
K
P
 
P
H
 
S
V
 
V
H
 
K
C
 
V
V
 
Y
F
 
A
A
 
A
E
|
E
P
 
P
V
 
S
Q
 
N
S
x
A
P
 
D
C
x
D
F
 
C
L
 
Y
V
 
Q
Q
 
S
M
 
K
M
 
L
A
 
K
G
 
G
A
 
K
G
 
L
N
 
M
P
 
P
S
 
N
V
 
L
Y
 
Y
D
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
P
N
 
P
S
 
E
T
 
T
Q
 
I
A
 
A
D
 
D
G
|
G
L
x
V
A
 
K
V
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
S
E
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
L
G
x
N
-
 
T
-
 
W
-
 
P
V
 
I
M
 
I
R
 
R
P
 
D
L
 
L
L
 
V
S
 
D
G
 
D
V
 
I
F
 
F
T
 
T
V
 
V
A
 
T
D
 
E
D
 
D
T
 
E
L
 
I
F
 
K
E
 
C
H
 
A
L
 
T
A
 
Q
L
 
L
A
 
V
W
 
W
R
 
E
T
 
R
Q
 
M
G
 
K
L
 
L
R
 
L
I
 
I
E
 
E
P
 
P
S
x
T
A
 
A
A
 
G
A
 
V
G
 
G
F
 
V
S
 
A

Sites not aligning to the query:

6zspAAA serine racemase bound to atp and malonate. (see paper)
25% identity, 50% coverage: 173:401/457 of query aligns to 69:281/320 of 6zspAAA

query
sites
6zspAAA
V
 
V
A
 
V
V
 
T
G
 
H
S
|
S
T
x
S
G
 
G
N
|
N
L
x
H
G
 
G
L
x
Q
S
 
A
I
 
L
G
 
T
V
 
Y
M
 
A
A
 
A
S
 
K
A
 
L
L
 
E
G
 
G
F
 
I
R
 
P
A
 
A
A
 
Y
V
 
I
H
 
V
M
 
V
S
 
P
S
 
Q
D
 
T
A
 
A
K
 
P
A
 
D
W
 
C
K
 
K
K
 
K
A
 
L
R
 
A
L
 
I
R
 
Q
N
 
A
R
x
Y
G
 
G
V
 
A
E
 
S
V
 
I
V
 
V
E
 
Y
H
 
C
A
 
E
G
 
P
D
 
S
Y
 
D
E
 
E
D
 
S
A
x
R
V
 
E
A
 
N
A
 
V
G
 
A
R
 
K
R
 
R
Q
 
V
A
 
T
Q
 
E
Q
 
E
D
 
T
E
 
E
F
 
-
T
 
G
Y
 
I
F
 
M
V
 
V
D
 
H
D
 
P
E
 
N
R
 
Q
S
 
E
L
 
P
S
 
A
L
 
V
L
 
I
L
 
A
G
 
G
Y
 
Q
S
 
G
A
 
T
A
 
I
A
 
A
L
 
L
H
 
E
L
 
V
R
 
L
Q
 
N
Q
 
Q
L
 
V
A
 
P
A
 
L
H
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
-
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
-
H
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
-
V
 
L
Y
 
V
L
 
V
P
 
P
C
 
V
G
 
G
V
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
M
P
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
A
F
 
I
G
 
T
M
 
V
R
 
K
Q
 
A
L
 
L
F
 
-
G
 
K
P
 
P
H
 
S
V
 
V
H
 
K
C
 
V
V
 
Y
F
 
A
A
 
A
E
|
E
P
 
P
V
 
S
Q
 
N
S
x
A
P
 
D
C
x
D
F
 
C
L
 
Y
V
 
Q
Q
 
S
M
 
K
M
 
L
A
 
K
G
 
G
A
 
K
G
 
L
N
 
M
P
 
P
S
 
N
V
 
L
Y
 
Y
D
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
P
N
 
P
S
 
E
T
 
T
Q
 
I
A
 
A
D
 
D
G
|
G
L
 
V
A
 
K
V
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
S
|
S
E
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
L
G
 
N
-
 
T
-
 
W
-
 
P
V
 
I
M
 
I
R
 
R
P
 
D
L
 
L
L
 
V
S
 
D
G
 
D
V
 
I
F
 
F
T
 
T
V
 
V
A
 
T
D
 
E
D
 
D
T
 
E
L
 
I
F
 
K
E
 
C
H
 
A
L
 
T
A
 
Q
L
 
L
A
 
V
W
 
W
R
x
E
T
x
R
Q
 
M
G
x
K
L
 
L
R
 
L
I
 
I
E
 
E
P
 
P
S
 
T
A
 
A
A
 
G
A
 
V
G
 
G
F
 
V
S
 
A

Sites not aligning to the query:

5ygrB Crystal structure of plp bound diaminopropionate ammonia lyase from salmonella typhimurium (see paper)
25% identity, 42% coverage: 177:368/457 of query aligns to 102:309/365 of 5ygrB

query
sites
5ygrB
S
x
T
T
x
D
G
 
G
N
|
N
L
x
H
G
 
G
L
 
R
S
 
G
I
 
V
G
 
A
V
 
W
M
 
A
A
 
A
S
 
E
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
F
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
V
V
 
V
H
 
Y
M
 
M
S
 
P
S
 
K
D
 
G
A
 
S
K
 
S
A
 
L
W
 
I
K
 
R
K
 
A
A
 
E
R
 
N
L
 
I
R
 
R
N
 
H
R
 
H
G
 
G
V
 
A
E
 
E
V
 
C
V
 
T
E
 
I
H
 
T
A
 
D
G
 
L
D
 
N
Y
 
Y
E
 
D
D
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
L
G
 
A
R
 
H
R
 
R
Q
 
M
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
T
D
 
K
E
 
G
F
 
W
T
 
V
Y
 
L
F
 
L
V
 
Q
D
 
D
-
 
T
-
 
A
-
 
W
-
 
T
-
 
G
-
 
Y
D
 
E
E
 
E
R
 
I
S
 
P
L
 
T
S
 
W
L
 
I
L
 
M
L
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
S
 
M
A
 
T
A
 
L
A
 
A
L
 
V
H
 
E
L
 
A
R
 
Y
Q
 
E
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
E
H
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
N
A
 
S
E
 
P
H
 
L
P
 
P
L
 
T
F
 
H
V
 
L
Y
 
I
L
 
L
P
 
Q
C
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
-
 
S
-
 
F
-
 
A
G
 
G
A
 
S
P
 
V
A
 
M
G
 
G
I
 
Y
T
 
F
F
 
V
G
 
E
M
 
K
R
 
M
Q
 
Q
L
 
E
F
 
N
G
 
I
P
 
P
H
 
N
V
 
I
H
 
-
C
 
-
V
 
I
F
 
V
A
 
V
E
 
E
P
 
P
V
 
H
Q
 
Q
S
 
A
P
 
N
C
 
C
F
 
L
L
 
Y
-
 
Q
-
 
S
-
 
A
V
 
V
Q
 
M
M
 
I
M
 
M
A
 
A
G
 
G
-
 
L
-
 
A
A
 
C
G
 
G
N
 
E
P
 
P
S
 
N
V
 
I
Y
 
I
D
 
S
F
 
W
-
 
P
-
 
I
-
 
I
-
 
R
-
 
D
G
 
N
L
 
T
S
 
S
N
 
C
S
 
F
T
 
I
Q
 
S
A
 
A
D
 
D
G
 
D
L
 
C
A
 
L
V
 
A
P
 
A
R
 
K
A
 
G
S
 
M
E
 
R
L
 
I
A
 
S
A
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
R
-
 
P
G
 
G
V
 
T
M
 
D
R
 
T
P
 
P
L
 
F
L
 
I
S
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P66899 Diaminopropionate ammonia-lyase; DAPAL; 2,3-diaminopropionate ammonia-lyase; Alpha,beta-diaminopropionate ammonia-lyase; Diaminopropionatase; EC 4.3.1.15 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
21% identity, 47% coverage: 161:374/457 of query aligns to 103:314/398 of P66899

query
sites
P66899
E
 
E
P
 
H
A
 
L
A
 
K
R
 
N
A
 
A
L
 
I
F
 
G
G
 
E
R
 
K
Y
 
M
Q
 
T
V
 
F
A
 
A
V
 
T
G
 
T
S
 
T
T
x
D
G
 
G
N
 
N
L
 
H
G
 
G
L
 
R
S
 
G
I
 
V
G
 
A
V
 
W
M
 
A
A
 
A
S
 
Q
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
F
 
Q
R
 
N
A
 
A
A
 
V
V
 
I
H
 
Y
M
 
M
S
 
P
S
 
K
D
 
G
A
 
S
K
 
A
A
 
Q
W
 
E
K
 
R
K
 
V
A
 
D
R
 
A
L
 
I
R
 
L
N
 
N
R
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
E
V
 
C
V
 
I
E
 
V
H
 
T
A
 
D
G
 
M
D
 
N
Y
 
Y
E
 
D
D
 
D
A
 
T
V
 
V
A
 
R
A
 
L
G
 
T
R
 
M
R
 
Q
Q
 
H
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
D
 
H
E
 
G
F
 
W
T
 
E
Y
 
V
F
 
V
V
 
Q
D
|
D
-
 
T
-
 
A
-
 
W
-
 
E
-
 
G
-
 
Y
D
 
T
E
 
K
R
 
I
S
 
P
L
 
T
S
 
W
L
 
I
L
 
M
L
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
S
 
A
A
 
T
A
 
L
A
 
A
L
 
D
H
 
E
L
 
A
R
 
V
Q
 
E
Q
 
Q
L
 
M
A
 
R
A
 
E
H
 
M
A
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
H
 
-
P
 
P
L
 
T
F
 
H
V
 
V
Y
 
L
L
 
L
P
 
Q
C
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
A
A
 
M
P
 
A
A
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
L
F
 
G
G
 
Y
M
 
L
R
 
V
Q
 
D
L
 
V
F
 
Y
G
 
S
P
 
P
-
 
Q
H
 
N
V
 
L
H
 
H
C
 
S
V
 
I
F
 
I
A
 
V
E
 
E
P
 
P
V
 
D
Q
 
K
S
 
A
P
 
D
C
|
C
F
 
I
L
 
Y
V
 
R
Q
 
S
M
 
G
M
 
V
A
 
K
G
 
G
A
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
S
 
D
V
 
I
Y
 
V
D
 
N
F
 
V
G
 
G
L
 
G
S
 
D
N
 
M
S
 
A
T
 
T
Q
 
I
A
 
M
D
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
x
C
P
 
G
R
 
E
A
 
P
S
 
N
E
 
P
L
 
L
A
 
G
A
 
W
G
 
E
V
 
I
M
 
L
R
 
R
P
 
N
L
 
C
L
 
A
S
 
T
G
 
Q
V
 
F
F
 
I
T
 
S
V
 
C
A
 
Q
D
 
D

Sites not aligning to the query:

P04968 L-threonine dehydratase biosynthetic IlvA; Threonine deaminase; EC 4.3.1.19 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
26% identity, 51% coverage: 173:404/457 of query aligns to 82:297/514 of P04968

query
sites
P04968
V
 
V
A
 
I
V
 
T
G
 
A
S
 
S
T
 
A
G
 
G
N
|
N
L
 
H
G
 
A
L
 
Q
S
 
G
I
 
V
G
 
A
V
 
F
M
 
S
A
 
S
S
 
A
A
 
R
L
 
L
G
 
G
F
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
L
V
 
I
H
 
V
M
 
M
S
 
P
S
 
T
D
 
A
A
 
T
K
 
A
A
 
D
W
 
I
K
 
K
K
 
V
A
 
D
R
 
A
L
 
V
R
 
R
N
 
G
R
 
F
G
 
G
V
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
L
E
 
L
H
 
H
A
 
G
G
 
A
D
 
N
Y
 
F
E
 
D
D
 
E
A
 
A
V
 
K
A
 
A
A
 
K
G
 
A
R
 
I
R
 
E
Q
 
L
A
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
D
 
Q
E
 
G
F
 
F
T
 
T
Y
 
W
F
 
V
V
 
P
D
 
P
D
 
F
E
 
D
R
 
H
S
 
P
L
 
M
S
 
-
L
 
V
L
 
I
L
 
A
G
 
G
Y
 
Q
S
 
G
A
 
T
A
 
L
A
 
A
L
 
L
H
 
E
L
 
L
R
 
L
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
-
A
 
D
A
 
A
H
 
H
A
 
L
I
 
D
R
 
R
V
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
H
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
-
V
 
V
Y
 
F
L
 
V
P
 
P
C
 
V
G
|
G
V
x
G
G
|
G
G
|
G
A
x
L
P
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
A
F
 
V
G
 
L
M
 
I
R
 
K
Q
 
Q
L
 
L
F
 
M
G
 
-
P
 
P
H
 
Q
V
 
I
H
 
K
C
 
V
V
 
I
F
 
A
A
 
V
E
 
E
P
 
A
V
 
E
Q
 
D
S
 
S
P
 
A
C
 
C
F
 
L
L
 
K
V
 
A
Q
 
A
M
 
L
M
 
D
A
 
A
G
 
G
-
 
H
-
 
P
A
 
V
G
 
D
N
 
L
P
 
P
S
 
R
V
 
V
Y
 
G
D
 
L
F
 
F
G
 
-
L
 
-
S
 
-
N
 
-
S
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
A
D
 
E
G
 
G
L
 
V
A
 
A
V
 
V
P
 
K
R
 
R
A
 
I
S
 
G
E
 
D
L
 
E
A
 
T
A
 
F
G
 
R
V
 
L
M
 
C
R
 
Q
P
 
E
L
 
Y
L
 
L
S
 
D
G
 
D
V
 
I
F
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
D
D
 
S
D
 
D
T
 
A
L
 
I
F
 
C
E
 
A
H
 
A
L
 
M
A
 
K
L
 
D
A
 
L
W
 
F
R
 
E
T
 
D
Q
 
V
G
 
R
L
 
A
R
 
V
I
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
A
 
G
A
 
A
A
 
L
G
 
A
F
 
L
S
 
A
G
 
G
P
 
M
R
 
K

Sites not aligning to the query:

1tdjA Threonine deaminase (biosynthetic) from e. Coli (see paper)
25% identity, 54% coverage: 173:421/457 of query aligns to 78:301/494 of 1tdjA

query
sites
1tdjA
V
 
V
A
 
I
V
 
T
G
 
A
S
 
S
T
x
A
G
 
G
N
|
N
L
 
H
G
 
A
L
 
Q
S
 
G
I
 
V
G
 
A
V
 
F
M
 
S
A
 
S
S
 
A
A
 
R
L
 
L
G
 
G
F
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
L
V
 
I
H
 
V
M
 
M
S
 
P
S
 
T
D
 
A
A
 
T
K
 
A
A
 
D
W
 
I
K
 
K
K
 
V
A
 
D
R
 
A
L
 
V
R
 
R
N
 
G
R
 
F
G
 
G
V
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
L
E
 
L
H
 
H
A
 
G
G
 
A
D
 
N
Y
 
F
E
 
D
D
 
E
A
 
A
V
 
K
A
 
A
A
 
K
G
 
A
R
 
I
R
 
E
Q
 
L
A
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
D
 
Q
E
 
G
F
 
F
T
 
T
Y
 
W
F
 
V
V
 
P
D
 
P
D
 
F
E
 
D
R
 
H
S
 
P
L
 
M
S
 
-
L
 
V
L
 
I
L
 
A
G
 
G
Y
 
Q
S
 
G
A
 
T
A
 
L
A
 
A
L
 
L
H
 
E
L
 
L
R
 
L
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
-
A
 
D
A
 
A
H
 
H
A
 
L
I
 
D
R
 
R
V
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
H
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
-
V
 
V
Y
 
F
L
 
V
P
 
P
C
 
V
G
|
G
V
x
G
G
|
G
G
|
G
A
 
L
P
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
A
F
 
V
G
 
L
M
 
I
R
 
K
Q
 
Q
L
 
L
F
 
M
G
 
-
P
 
P
H
 
Q
V
 
I
H
 
K
C
 
V
V
 
I
F
 
A
A
 
V
E
|
E
P
 
A
V
 
E
Q
 
D
S
|
S
P
 
A
C
|
C
F
 
L
L
 
K
V
 
A
Q
 
A
M
 
L
M
 
D
A
 
A
G
 
G
-
 
H
-
 
P
A
 
V
G
 
D
N
 
L
P
 
P
S
 
R
V
 
V
Y
 
G
D
 
L
F
 
F
G
 
-
L
 
-
S
 
-
N
 
-
S
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
A
D
 
E
G
|
G
L
 
V
A
 
A
V
 
V
P
 
K
R
 
R
A
 
I
S
 
G
E
 
D
L
 
E
A
 
T
A
 
F
G
 
R
V
 
L
M
 
C
R
 
Q
P
 
E
L
 
Y
L
 
L
S
 
D
G
 
D
V
 
I
F
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
D
D
 
S
D
 
D
T
 
A
L
 
I
F
 
C
E
 
A
H
 
A
L
 
M
A
 
K
L
 
D
A
 
L
W
 
F
R
 
E
T
 
D
Q
 
V
G
 
R
L
 
A
R
 
V
I
 
A
E
|
E
P
 
P
S
 
S
A
 
G
A
 
A
A
 
L
G
 
A
F
 
L
S
 
A
G
 
G
P
 
M
R
 
-
M
 
-
L
 
-
C
 
-
E
 
-
S
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
K
D
 
K
Y
 
Y
L
 
I
A
 
A
R
 
L
H
 
H
Q
 
N
L
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>RR42_RS28450 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS28450
MNQPLAMNPSTAAGPHAAAALRASLAAATPLLWCNPARAVTPPPVQAAGEHSISLADVEA
AQARFARFAPLLSALFPELAGTHGVIESPLVAVPSMQTALGLPHSQGRLWVKADHSLPVA
GSIKARGGIHEVLEFAENLALRHGLVGPGRNEPEHYLALREPAARALFGRYQVAVGSTGN
LGLSIGVMASALGFRAAVHMSSDAKAWKKARLRNRGVEVVEHAGDYEDAVAAGRRQAQQD
EFTYFVDDERSLSLLLGYSAAALHLRQQLAAHAIRVDAEHPLFVYLPCGVGGAPAGITFG
MRQLFGPHVHCVFAEPVQSPCFLVQMMAGAGNPSVYDFGLSNSTQADGLAVPRASELAAG
VMRPLLSGVFTVADDTLFEHLALAWRTQGLRIEPSAAAGFSGPRMLCESPAGRDYLARHQ
LEAMMPQATHLVWTTGGLFVPPAEYQGFLDKAAALAA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory