SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS28855 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS28855 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 9 hits to proteins with known functional sites (download)

4v15A Crystal structure of d-threonine aldolase from alcaligenes xylosoxidans (see paper)
25% identity, 79% coverage: 45:379/422 of query aligns to 21:325/373 of 4v15A

query
sites
4v15A
P
 
P
A
 
S
A
 
L
V
 
V
L
 
L
Y
 
D
E
 
L
E
 
P
R
 
A
L
 
F
A
 
E
H
 
A
N
 
N
L
 
L
E
 
R
W
 
A
M
 
M
R
 
Q
R
 
A
F
 
W
M
 
A
G
 
D
E
 
R
Y
 
H
G
 
E
V
 
V
Q
 
A
L
 
L
A
 
R
P
 
P
H
|
H
G
 
A
K
|
K
T
 
A
T
 
H
M
 
K
A
 
C
P
 
P
K
 
E
L
 
I
F
 
A
A
 
L
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
 
A
W
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
C
L
 
C
A
x
Q
T
 
K
A
 
V
H
 
S
Q
 
E
T
 
A
A
 
L
A
 
P
A
 
F
Y
 
V
A
 
A
H
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
D
V
 
I
L
 
H
M
 
I
A
x
S
N
 
N
Q
 
E
L
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
P
R
 
A
N
 
K
M
 
L
E
 
A
I
 
L
V
 
L
A
 
G
D
 
Q
L
 
L
L
 
A
R
 
R
D
 
A
P
 
A
D
 
K
F
 
I
E
 
S
F
 
-
F
 
-
T
 
V
L
 
C
V
 
V
D
 
D
S
 
N
A
 
A
A
 
E
L
 
N
V
 
L
D
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
S
R
 
A
Y
 
A
F
 
M
S
 
T
A
 
R
R
 
A
G
 
G
Q
 
A
K
 
E
L
 
I
Q
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
V
E
 
E
L
 
V
G
 
D
V
 
V
P
 
G
G
 
Q
G
 
G
R
 
R
T
 
C
G
 
G
V
 
V
R
 
S
G
 
D
A
 
D
Q
 
A
Q
 
T
Q
 
V
A
 
L
A
 
A
V
 
L
L
 
A
A
 
Q
A
 
Q
L
 
A
A
 
R
R
 
A
W
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
-
L
 
L
S
 
N
L
 
F
A
 
A
G
 
G
V
 
L
E
 
Q
I
 
A
Y
|
Y
E
 
H
G
 
G
V
 
S
L
 
V
Q
 
Q
-
 
H
-
 
Y
-
 
R
-
 
T
-
 
R
-
 
E
E
 
E
E
 
R
A
 
A
D
 
A
I
 
V
R
 
C
D
 
R
F
 
Q
L
 
A
R
 
A
R
 
R
T
 
I
V
 
A
A
 
A
V
 
S
T
 
Y
R
 
A
E
 
Q
L
 
L
F
 
L
A
 
R
A
 
E
G
 
S
R
 
G
F
 
I
G
 
A
R
 
C
S
 
D
P
 
T
V
 
I
V
 
T
M
 
G
S
 
G
G
|
G
A
x
T
G
 
G
S
 
S
A
 
V
W
 
E
Y
 
F
D
 
D
V
 
A
V
 
A
A
 
S
E
 
G
E
 
V
F
 
Y
A
 
T
R
 
E
T
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
L
 
L
R
x
Q
P
x
A
G
|
G
C
x
S
Y
 
Y
L
 
A
T
 
F
H
 
M
D
 
D
V
 
S
G
 
D
I
 
-
Y
|
Y
R
 
G
A
 
A
A
 
N
Q
 
E
K
 
W
R
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
N
N
 
G
P
 
P
V
 
L
A
 
-
Q
 
-
K
 
K
M
 
F
R
 
Q
E
 
N
G
 
S
L
 
L
L
 
F
P
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
-
L
 
V
W
 
L
A
 
S
Y
 
T
V
 
V
Q
 
M
S
 
S
I
 
T
P
 
P
E
 
A
P
 
P
E
 
G
R
 
R
A
 
V
I
 
I
I
 
L
G
 
D
M
 
A
G
 
G
K
 
L
R
 
K
D
 
S
A
 
T
A
 
T
F
 
A
D
 
E
A
 
C
G
 
G
M
 
-
P
 
-
I
 
-
P
 
P
A
 
P
Q
 
A
V
 
V
Y
 
Y
-
 
G
R
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
L
S
 
T
V
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
H
 
-
W
 
-
E
 
-
V
 
Y
T
 
A
G
 
A
M
 
I
M
 
N
D
 
D
Q
 
E
H
 
H
A
 
G
Y
 
V
L
 
V
A
 
R
I
 
V
R
 
E
P
 
P
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7yqaB Crystal structure of d-threonine aldolase from chlamydomonas reinhardtii (see paper)
28% identity, 44% coverage: 40:225/422 of query aligns to 19:204/398 of 7yqaB

query
sites
7yqaB
E
 
H
D
 
D
L
 
V
S
 
D
L
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
L
V
 
I
L
 
L
Y
 
D
E
 
L
E
 
D
R
 
A
L
 
F
A
 
D
H
 
R
N
 
N
L
 
C
E
 
E
W
 
K
M
 
L
R
 
K
R
 
G
F
 
V
M
 
M
G
 
A
E
 
G
Y
 
F
-
 
P
G
 
G
V
 
V
Q
 
A
L
 
V
A
 
R
P
 
P
H
 
H
G
 
A
K
 
K
T
 
A
T
 
H
M
 
K
A
 
C
P
 
A
K
 
E
L
 
V
F
 
A
A
 
R
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
A
 
Q
A
 
L
-
 
L
G
 
G
A
 
A
W
 
K
G
 
G
I
 
V
T
 
C
L
 
C
A
 
Q
T
 
K
A
 
V
H
 
I
Q
 
E
T
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
M
Y
 
A
A
 
E
H
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
S
R
 
D
V
 
L
L
 
L
M
 
L
A
 
S
N
 
N
Q
 
E
L
 
V
V
 
I
G
 
A
R
 
P
R
 
R
N
 
K
M
 
I
E
 
D
I
 
R
V
 
L
A
 
V
D
 
G
L
 
L
L
 
A
R
 
A
D
 
-
P
 
A
D
 
G
F
 
A
E
 
R
F
 
V
F
 
G
T
 
V
L
 
C
V
 
Y
D
 
E
S
 
R
A
 
E
A
 
D
L
 
N
V
 
L
D
 
R
Q
 
Q
L
 
L
G
 
N
R
 
A
Y
 
A
F
 
A
S
 
A
A
 
A
R
 
R
G
 
G
Q
 
T
K
 
H
L
 
L
Q
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
V
E
 
E
L
 
L
G
 
N
V
 
V
P
 
G
G
 
Q
G
 
D
R
 
R
T
 
C
G
 
G
V
 
V
R
 
N
G
 
S
A
 
A
Q
 
D
Q
 
E
Q
 
V
A
 
V
A
 
Q
V
 
L
L
 
A
A
 
R
A
 
A
L
 
A
A
 
A
R
 
G
W
 
L
P
 
D
G
 
N
V
 
V
L
 
-
S
 
R
L
 
F
A
 
A
G
 
G
V
 
I
E
 
Q
I
 
A
Y
 
Y
E
 
H
G
 
G
V
 
G
L
 
L
Q
 
Q
E
 
H
E
 
V
A
 
R
D
 
D
I
 
P
R
 
R
D
 
D
F
 
R
L
 
A
R
 
Q
R
 
R
T
 
V

Sites not aligning to the query:

4pb3B D-threo-3-hydroxyaspartate dehydratase h351a mutant (see paper)
30% identity, 41% coverage: 42:214/422 of query aligns to 17:187/389 of 4pb3B

query
sites
4pb3B
L
 
L
S
 
D
L
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
I
Y
 
D
E
 
L
E
 
D
R
 
R
L
 
M
A
 
Q
H
 
R
N
 
N
L
 
I
E
 
A
W
 
R
M
 
M
R
 
Q
R
 
Q
F
 
R
M
 
M
G
 
D
E
 
A
Y
 
Q
G
 
G
V
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
R
P
 
P
H
|
H
G
 
V
K
|
K
T
 
T
T
 
S
M
 
K
A
 
S
P
 
V
K
 
P
L
 
V
F
 
A
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
L
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
V
A
 
S
T
 
T
A
 
L
H
 
K
Q
 
E
T
 
A
A
 
E
A
 
Q
A
 
F
Y
 
F
A
 
A
H
 
A
G
 
G
V
 
T
R
 
T
R
 
D
V
 
I
L
 
L
M
 
Y
A
 
A
N
 
V
Q
 
S
L
 
M
V
 
A
G
 
P
R
 
H
R
 
R
N
 
L
M
 
P
E
 
Q
I
 
A
V
 
L
A
 
Q
D
 
L
L
 
R
L
 
R
R
 
R
D
 
G
P
 
C
D
 
D
F
 
L
E
 
K
F
 
L
F
 
-
T
 
-
L
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
A
 
V
A
 
A
L
 
A
V
 
A
D
 
Q
Q
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
A
Y
 
F
F
 
G
S
 
R
A
 
E
R
 
Q
G
 
G
Q
 
E
K
 
A
L
 
F
Q
 
E
V
 
V
L
 
W
L
 
I
E
 
E
L
 
I
G
 
D
V
 
T
P
 
D
G
 
G
G
 
H
R
|
R
T
 
S
G
 
G
V
 
V
R
 
-
G
 
-
A
 
G
Q
 
A
Q
 
D
Q
 
D
A
 
T
A
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
-
 
T
-
 
L
W
 
H
P
 
D
G
 
G
V
 
G
L
 
M
S
 
R
L
 
L
A
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
L
I
 
T
Y
x
H
E
 
A
G
 
G
V
 
S
L
 
S
Q
x
Y
E
 
E

Sites not aligning to the query:

3wqeA D-threo-3-hydroxyaspartate dehydratase from delftia sp. Ht23 complexed with d-allothreonine (see paper)
30% identity, 41% coverage: 42:214/422 of query aligns to 7:177/379 of 3wqeA

query
sites
3wqeA
L
 
L
S
 
D
L
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
I
Y
 
D
E
 
L
E
 
D
R
 
R
L
 
M
A
 
Q
H
 
R
N
 
N
L
 
I
E
 
A
W
 
R
M
 
M
R
 
Q
R
 
Q
F
 
R
M
 
M
G
 
D
E
 
A
Y
 
Q
G
 
G
V
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
R
P
 
P
H
|
H
G
 
V
K
|
K
T
 
T
T
 
S
M
 
K
A
 
S
P
 
V
K
 
P
L
 
V
F
 
A
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
L
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
V
A
 
S
T
 
T
A
 
L
H
 
K
Q
 
E
T
 
A
A
 
E
A
 
Q
A
 
F
Y
 
F
A
 
A
H
 
A
G
 
G
V
 
T
R
 
T
R
 
D
V
 
I
L
 
L
M
 
Y
A
 
A
N
 
V
Q
 
S
L
 
M
V
 
A
G
 
P
R
 
H
R
 
R
N
 
L
M
 
P
E
 
Q
I
 
A
V
 
L
A
 
Q
D
 
L
L
 
R
L
 
R
R
 
R
D
 
G
P
 
C
D
 
D
F
 
L
E
 
K
F
 
L
F
 
-
T
 
-
L
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
A
 
V
A
 
A
L
 
A
V
 
A
D
 
Q
Q
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
A
Y
 
F
F
 
G
S
 
R
A
 
E
R
 
Q
G
 
G
Q
 
E
K
 
A
L
 
F
Q
 
E
V
 
V
L
 
W
L
 
I
E
 
E
L
 
I
G
 
D
V
 
T
P
 
D
G
 
G
G
x
H
R
|
R
T
 
S
G
 
G
V
 
V
R
 
-
G
 
-
A
 
G
Q
 
A
Q
 
D
Q
 
D
A
 
T
A
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
-
 
T
-
 
L
W
 
H
P
 
D
G
 
G
V
 
G
L
 
M
S
 
R
L
 
L
A
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
L
I
 
T
Y
x
H
E
 
A
G
 
G
V
 
S
L
 
S
Q
x
Y
E
 
E

Sites not aligning to the query:

3wqdA D-threo-3-hydroxyaspartate dehydratase from delftia sp. Ht23 complexed with d-erythro-3-hydroxyaspartate (see paper)
30% identity, 41% coverage: 42:214/422 of query aligns to 7:177/379 of 3wqdA

query
sites
3wqdA
L
 
L
S
 
D
L
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
I
Y
 
D
E
 
L
E
 
D
R
 
R
L
 
M
A
 
Q
H
 
R
N
 
N
L
 
I
E
 
A
W
 
R
M
 
M
R
 
Q
R
 
Q
F
 
R
M
 
M
G
 
D
E
 
A
Y
 
Q
G
 
G
V
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
R
P
 
P
H
|
H
G
 
V
K
|
K
T
 
T
T
 
S
M
 
K
A
 
S
P
 
V
K
 
P
L
 
V
F
 
A
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
L
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
V
A
 
S
T
 
T
A
 
L
H
 
K
Q
 
E
T
 
A
A
 
E
A
 
Q
A
 
F
Y
 
F
A
 
A
H
 
A
G
 
G
V
 
T
R
 
T
R
 
D
V
 
I
L
 
L
M
 
Y
A
 
A
N
 
V
Q
 
S
L
 
M
V
 
A
G
 
P
R
 
H
R
 
R
N
 
L
M
 
P
E
 
Q
I
 
A
V
 
L
A
 
Q
D
 
L
L
 
R
L
 
R
R
 
R
D
 
G
P
 
C
D
 
D
F
 
L
E
 
K
F
 
L
F
 
-
T
 
-
L
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
A
 
V
A
 
A
L
 
A
V
 
A
D
 
Q
Q
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
A
Y
 
F
F
 
G
S
 
R
A
 
E
R
 
Q
G
 
G
Q
 
E
K
 
A
L
 
F
Q
 
E
V
 
V
L
 
W
L
 
I
E
 
E
L
 
I
G
 
D
V
 
T
P
 
D
G
 
G
G
 
H
R
|
R
T
 
S
G
 
G
V
 
V
R
 
-
G
 
-
A
 
G
Q
 
A
Q
 
D
Q
 
D
A
 
T
A
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
-
 
T
-
 
L
W
 
H
P
 
D
G
 
G
V
 
G
L
 
M
S
 
R
L
 
L
A
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
L
I
 
T
Y
x
H
E
 
A
G
 
G
V
 
S
L
 
S
Q
x
Y
E
 
E

Sites not aligning to the query:

3wqcA D-threo-3-hydroxyaspartate dehydratase from delftia sp. Ht23 (see paper)
30% identity, 41% coverage: 42:214/422 of query aligns to 7:177/379 of 3wqcA

query
sites
3wqcA
L
 
L
S
 
D
L
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
I
Y
 
D
E
 
L
E
 
D
R
 
R
L
 
M
A
 
Q
H
 
R
N
 
N
L
 
I
E
 
A
W
 
R
M
 
M
R
 
Q
R
 
Q
F
 
R
M
 
M
G
 
D
E
 
A
Y
 
Q
G
 
G
V
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
R
P
 
P
H
|
H
G
 
V
K
|
K
T
 
T
T
 
S
M
 
K
A
 
S
P
 
V
K
 
P
L
 
V
F
 
A
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
L
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
V
A
 
S
T
 
T
A
 
L
H
 
K
Q
 
E
T
 
A
A
 
E
A
 
Q
A
 
F
Y
 
F
A
 
A
H
 
A
G
 
G
V
 
T
R
 
T
R
 
D
V
 
I
L
 
L
M
 
Y
A
 
A
N
 
V
Q
 
S
L
 
M
V
 
A
G
 
P
R
 
H
R
 
R
N
 
L
M
 
P
E
 
Q
I
 
A
V
 
L
A
 
Q
D
 
L
L
 
R
L
 
R
R
 
R
D
 
G
P
 
C
D
 
D
F
 
L
E
 
K
F
 
L
F
 
-
T
 
-
L
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
A
 
V
A
 
A
L
 
A
V
 
A
D
 
Q
Q
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
A
Y
 
F
F
 
G
S
 
R
A
 
E
R
 
Q
G
 
G
Q
 
E
K
 
A
L
 
F
Q
 
E
V
 
V
L
 
W
L
 
I
E
 
E
L
 
I
G
 
D
V
 
T
P
 
D
G
 
G
G
 
H
R
|
R
T
 
S
G
 
G
V
 
V
R
 
-
G
 
-
A
 
G
Q
 
A
Q
 
D
Q
 
D
A
 
T
A
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
-
 
T
-
 
L
W
 
H
P
 
D
G
 
G
V
 
G
L
 
M
S
 
R
L
 
L
A
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
L
I
 
T
Y
x
H
E
 
A
G
 
G
V
 
S
L
 
S
Q
x
Y
E
 
E

Sites not aligning to the query:

4pb5A D-threo-3-hydroxyaspartate dehydratase h351a mutant complexed with l- erythro-3-hydroxyaspartate (see paper)
30% identity, 41% coverage: 42:214/422 of query aligns to 7:177/379 of 4pb5A

query
sites
4pb5A
L
 
L
S
 
D
L
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
I
Y
 
D
E
 
L
E
 
D
R
 
R
L
 
M
A
 
Q
H
 
R
N
 
N
L
 
I
E
 
A
W
 
R
M
 
M
R
 
Q
R
 
Q
F
 
R
M
 
M
G
 
D
E
 
A
Y
 
Q
G
 
G
V
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
R
P
 
P
H
|
H
G
 
V
K
|
K
T
 
T
T
 
S
M
 
K
A
 
S
P
 
V
K
 
P
L
 
V
F
 
A
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
L
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
V
A
 
S
T
 
T
A
 
L
H
 
K
Q
 
E
T
 
A
A
 
E
A
 
Q
A
 
F
Y
 
F
A
 
A
H
 
A
G
 
G
V
 
T
R
 
T
R
 
D
V
 
I
L
 
L
M
 
Y
A
 
A
N
 
V
Q
 
S
L
 
M
V
 
A
G
 
P
R
 
H
R
 
R
N
 
L
M
 
P
E
 
Q
I
 
A
V
 
L
A
 
Q
D
 
L
L
 
R
L
 
R
R
 
R
D
 
G
P
 
C
D
 
D
F
 
L
E
 
K
F
 
L
F
 
-
T
 
-
L
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
A
 
V
A
 
A
L
 
A
V
 
A
D
 
Q
Q
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
A
Y
 
F
F
 
G
S
 
R
A
 
E
R
 
Q
G
 
G
Q
 
E
K
 
A
L
 
F
Q
 
E
V
 
V
L
 
W
L
 
I
E
 
E
L
 
I
G
 
D
V
 
T
P
 
D
G
 
G
G
 
H
R
|
R
T
 
S
G
 
G
V
 
V
R
 
-
G
 
-
A
 
G
Q
 
A
Q
 
D
Q
 
D
A
 
T
A
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
-
 
T
-
 
L
W
 
H
P
 
D
G
 
G
V
 
G
L
 
M
S
 
R
L
 
L
A
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
L
I
 
T
Y
x
H
E
 
A
G
 
G
V
 
S
L
 
S
Q
x
Y
E
 
E

Sites not aligning to the query:

4pb4A D-threo-3-hydroxyaspartate dehydratase h351a mutant complexed with 2- amino maleic acid (see paper)
30% identity, 41% coverage: 42:214/422 of query aligns to 7:177/379 of 4pb4A

query
sites
4pb4A
L
 
L
S
 
D
L
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
I
Y
 
D
E
 
L
E
 
D
R
 
R
L
 
M
A
 
Q
H
 
R
N
 
N
L
 
I
E
 
A
W
 
R
M
 
M
R
 
Q
R
 
Q
F
 
R
M
 
M
G
 
D
E
 
A
Y
 
Q
G
 
G
V
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
R
P
 
P
H
|
H
G
 
V
K
|
K
T
 
T
T
 
S
M
 
K
A
 
S
P
 
V
K
 
P
L
 
V
F
 
A
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
L
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
V
A
 
S
T
 
T
A
 
L
H
 
K
Q
 
E
T
 
A
A
 
E
A
 
Q
A
 
F
Y
 
F
A
 
A
H
 
A
G
 
G
V
 
T
R
 
T
R
 
D
V
 
I
L
 
L
M
 
Y
A
 
A
N
 
V
Q
 
S
L
 
M
V
 
A
G
 
P
R
 
H
R
 
R
N
 
L
M
 
P
E
 
Q
I
 
A
V
 
L
A
 
Q
D
 
L
L
 
R
L
 
R
R
 
R
D
 
G
P
 
C
D
 
D
F
 
L
E
 
K
F
 
L
F
 
-
T
 
-
L
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
A
 
V
A
 
A
L
 
A
V
 
A
D
 
Q
Q
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
A
Y
 
F
F
 
G
S
 
R
A
 
E
R
 
Q
G
 
G
Q
 
E
K
 
A
L
 
F
Q
 
E
V
 
V
L
 
W
L
 
I
E
 
E
L
 
I
G
 
D
V
 
T
P
 
D
G
 
G
G
 
H
R
|
R
T
 
S
G
 
G
V
 
V
R
 
-
G
 
-
A
 
G
Q
 
A
Q
 
D
Q
 
D
A
 
T
A
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
-
 
T
-
 
L
W
 
H
P
 
D
G
 
G
V
 
G
L
 
M
S
 
R
L
 
L
A
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
L
I
 
T
Y
x
H
E
 
A
G
 
G
V
 
S
L
 
S
Q
x
Y
E
 
E

Sites not aligning to the query:

B2DFG5 D-threo-3-hydroxyaspartate dehydratase; D-THA DH; D-THA dehydratase; Threo-3-hydroxy-D-aspartate ammonia-lyase; EC 4.3.1.27 from Delftia sp. (strain HT23) (see paper)
30% identity, 41% coverage: 42:214/422 of query aligns to 8:178/380 of B2DFG5

query
sites
B2DFG5
L
 
L
S
 
D
L
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
I
Y
 
D
E
 
L
E
 
D
R
 
R
L
 
M
A
 
Q
H
 
R
N
 
N
L
 
I
E
 
A
W
 
R
M
 
M
R
 
Q
R
 
Q
F
 
R
M
 
M
G
 
D
E
 
A
Y
 
Q
G
 
G
V
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
R
P
 
P
H
 
H
G
 
V
K
|
K
T
 
T
T
 
S
M
 
K
A
 
S
P
 
V
K
 
P
L
 
V
F
 
A
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
L
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
V
A
 
S
T
 
T
A
 
L
H
 
K
Q
 
E
T
 
A
A
 
E
A
 
Q
A
 
F
Y
 
F
A
 
A
H
 
A
G
 
G
V
 
T
R
 
T
R
 
D
V
 
I
L
 
L
M
 
Y
A
 
A
N
 
V
Q
 
S
L
 
M
V
 
A
G
 
P
R
 
H
R
 
R
N
 
L
M
 
P
E
 
Q
I
 
A
V
 
L
A
 
Q
D
 
L
L
 
R
L
 
R
R
 
R
D
 
G
P
 
C
D
 
D
F
 
L
E
 
K
F
 
L
F
 
-
T
 
-
L
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
A
 
V
A
 
A
L
 
A
V
 
A
D
 
Q
Q
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
A
Y
 
F
F
 
G
S
 
R
A
 
E
R
 
Q
G
 
G
Q
 
E
K
 
A
L
 
F
Q
 
E
V
 
V
L
 
W
L
 
I
E
 
E
L
 
I
G
 
D
V
 
T
P
 
D
G
 
G
G
 
H
R
 
R
T
 
S
G
 
G
V
 
V
R
 
-
G
 
-
A
 
G
Q
 
A
Q
 
D
Q
 
D
A
 
T
A
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
-
 
T
-
 
L
W
 
H
P
 
D
G
 
G
V
 
G
L
 
M
S
 
R
L
 
L
A
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
L
I
 
T
Y
 
H
E
 
A
G
 
G
V
 
S
L
 
S
Q
 
Y
E
 
E

Query Sequence

>RR42_RS28855 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS28855
MLEIKYQAGTIDPLNKALGKLDAPLAPDAAGQVGWQLLAEDLSLPAAVLYEERLAHNLEW
MRRFMGEYGVQLAPHGKTTMAPKLFARQLAAGAWGITLATAHQTAAAYAHGVRRVLMANQ
LVGRRNMEIVADLLRDPDFEFFTLVDSAALVDQLGRYFSARGQKLQVLLELGVPGGRTGV
RGAQQQAAVLAALARWPGVLSLAGVEIYEGVLQEEADIRDFLRRTVAVTRELFAAGRFGR
SPVVMSGAGSAWYDVVAEEFARTDIGAPIDIVLRPGCYLTHDVGIYRAAQKRILASNPVA
QKMREGLLPALQLWAYVQSIPEPERAIIGMGKRDAAFDAGMPIPAQVYRPGASVPVAVPA
HWEVTGMMDQHAYLAIRPGDDVQVGDMVAFDISHPCLTFDKWRHIPVLDGDLRVIDLVQT
FF

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory