SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS29455 RR42_RS29455 ABC transporter ATP-binding protein to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1ji0A Crystal structure analysis of the abc transporter from thermotoga maritima
51% identity, 90% coverage: 9:243/261 of query aligns to 6:239/240 of 1ji0A

query
sites
1ji0A
V
 
V
L
 
L
A
 
E
L
 
V
A
 
Q
N
 
S
V
 
L
E
 
H
S
 
V
A
 
Y
Y
|
Y
G
 
G
P
 
A
V
 
I
K
 
H
A
 
A
I
 
I
R
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
D
L
 
L
A
 
K
V
 
V
Q
 
P
R
 
R
G
 
G
S
 
Q
I
 
I
A
 
V
T
 
T
V
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
I
 
T
L
 
L
K
 
S
T
 
A
I
 
I
S
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
V
D
 
R
P
 
A
T
 
Q
R
 
K
G
 
G
S
 
K
I
 
I
T
 
I
F
 
F
K
 
N
G
 
G
E
 
Q
S
 
D
I
 
I
A
 
T
A
 
N
M
 
-
D
 
K
P
 
P
A
 
A
Q
 
H
I
 
V
V
 
I
R
 
N
R
 
R
-
 
M
G
 
G
L
 
I
S
 
A
H
 
L
V
 
V
P
 
P
E
|
E
G
 
G
R
 
R
E
 
R
V
 
I
F
 
F
P
 
P
L
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
V
R
 
Y
D
 
E
N
 
N
L
 
L
L
 
M
M
 
M
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
T
 
N
R
 
R
R
 
K
D
 
D
R
 
K
D
 
E
G
 
G
V
 
I
A
 
K
R
 
R
D
 
D
M
 
L
E
 
E
M
 
W
V
 
I
Y
 
F
D
 
S
Y
 
L
F
 
F
P
 
P
V
 
R
L
 
L
R
 
K
E
 
E
R
 
R
A
 
L
A
 
K
Q
 
Q
D
 
L
A
 
G
G
 
G
L
 
T
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
M
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
M
A
 
S
A
 
R
P
 
P
E
 
K
L
 
L
I
 
L
L
 
M
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
S
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
A
P
 
P
K
 
I
L
 
L
T
 
V
K
 
S
D
 
E
I
 
V
F
 
F
E
 
E
I
 
V
V
 
I
V
 
Q
R
 
K
I
 
I
N
 
N
R
 
Q
E
 
E
R
 
-
G
 
G
T
 
T
T
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
N
 
N
A
 
A
N
 
L
M
 
G
A
 
A
L
 
L
N
 
K
A
 
V
A
 
A
D
 
H
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
V
 
V
A
 
L
E
 
E
D
 
G
T
 
K
C
 
A
A
 
S
V
 
E
L
 
L
R
 
L
E
 
D
K
 
N
D
 
E
D
 
M
I
 
V
K
 
R
E
 
K
F
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
M
 
V

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
32% identity, 83% coverage: 9:224/261 of query aligns to 4:231/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
V
 
I
L
 
L
A
 
R
L
 
T
A
 
E
N
 
N
V
 
I
E
 
V
S
 
K
A
 
Y
Y
x
F
G
 
G
P
 
E
V
x
F
K
 
K
A
 
A
I
 
L
R
 
D
G
 
G
V
 
V
S
 
S
L
 
I
A
 
S
V
 
V
Q
 
N
R
 
K
G
 
G
S
 
D
I
 
V
A
 
T
T
 
L
V
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
I
 
L
L
 
I
K
 
N
T
 
V
I
 
I
S
 
T
G
 
G
V
 
F
L
 
L
D
 
K
P
 
A
T
 
D
R
 
E
G
 
G
S
 
R
I
 
V
T
 
Y
F
 
F
K
 
E
G
 
N
E
 
K
S
 
D
I
 
I
A
 
T
A
 
N
M
 
K
D
 
E
P
 
P
A
 
A
Q
 
E
I
 
L
V
 
Y
R
 
H
R
 
Y
G
 
G
L
 
I
S
 
V
H
 
R
V
 
T
P
 
F
E
 
Q
G
 
T
R
 
P
E
 
Q
V
 
P
F
 
L
P
 
K
L
 
E
L
 
M
S
 
T
V
 
V
R
 
L
D
 
E
N
 
N
L
 
L
L
 
L
M
 
I
G
 
G
A
 
E
Y
 
I
T
 
C
R
 
P
R
 
G
D
 
E
-
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
L
-
 
F
-
 
Y
R
 
K
D
 
K
G
 
W
V
 
I
A
 
P
R
 
K
D
 
E
M
 
E
E
 
E
M
 
M
V
 
V
Y
 
E
D
 
K
Y
 
A
F
 
F
P
 
K
V
 
I
L
 
L
R
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
K
-
 
L
-
 
S
E
 
H
R
 
L
A
 
Y
A
 
D
Q
 
R
D
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
M
Q
 
K
M
 
L
L
 
V
A
 
E
I
 
I
S
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
M
A
 
T
A
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
M
I
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
I
L
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
A
P
 
P
K
 
G
L
 
L
T
 
A
K
 
H
D
 
D
I
 
I
F
 
F
E
 
N
I
 
H
V
 
V
V
 
L
R
 
E
I
 
L
N
 
-
R
 
K
E
 
A
R
 
K
G
 
G
T
 
I
T
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
V
 
I
E
 
E
Q
 
H
N
 
R
A
 
L
N
 
D
M
 
I
A
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
Y
A
 
I
D
 
D
Y
 
H
G
 
L
Y
 
Y
V
 
V
L
 
M
E
 
F
N
 
N
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
V
 
I
A
 
A
E
 
E

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
32% identity, 83% coverage: 9:224/261 of query aligns to 4:231/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
V
 
I
L
 
L
A
 
R
L
 
T
A
 
E
N
 
N
V
 
I
E
 
V
S
 
K
A
 
Y
Y
x
F
G
 
G
P
 
E
V
x
F
K
 
K
A
 
A
I
 
L
R
 
D
G
 
G
V
 
V
S
 
S
L
 
I
A
 
S
V
 
V
Q
 
C
R
 
K
G
 
G
S
 
D
I
 
V
A
 
T
T
 
L
V
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
I
 
L
L
 
I
K
 
N
T
 
V
I
 
I
S
 
T
G
 
G
V
 
F
L
 
L
D
 
K
P
 
A
T
 
D
R
 
E
G
 
G
S
 
R
I
 
V
T
 
Y
F
 
F
K
 
E
G
 
N
E
 
K
S
 
D
I
 
I
A
 
T
A
 
N
M
 
K
D
 
E
P
 
P
A
 
A
Q
 
E
I
 
L
V
 
Y
R
 
H
R
 
Y
G
 
G
L
 
I
S
 
V
H
 
R
V
 
T
P
 
F
E
 
Q
G
 
T
R
 
P
E
 
Q
V
 
P
F
 
L
P
 
K
L
 
E
L
 
M
S
 
T
V
 
V
R
 
L
D
 
E
N
 
N
L
 
L
L
 
L
M
 
I
G
 
G
A
 
E
Y
 
I
T
 
N
R
 
P
R
 
G
D
 
E
-
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
L
-
 
F
-
 
Y
R
 
K
D
 
K
G
 
W
V
 
I
A
 
P
R
 
K
D
 
E
M
 
E
E
 
E
M
 
M
V
 
V
Y
 
E
D
 
K
Y
 
A
F
 
F
P
 
K
V
 
I
L
 
L
R
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
K
-
 
L
-
 
S
E
 
H
R
 
L
A
 
Y
A
 
D
Q
 
R
D
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
M
Q
 
K
M
 
L
L
 
V
A
 
E
I
 
I
S
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
M
A
 
T
A
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
M
I
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
S
 
I
L
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
A
P
 
P
K
 
G
L
 
L
T
 
A
K
 
H
D
 
D
I
 
I
F
 
F
E
 
N
I
 
H
V
 
V
V
 
L
R
 
E
I
 
L
N
 
-
R
 
K
E
 
A
R
 
K
G
 
G
T
 
I
T
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
V
 
I
E
 
E
Q
 
H
N
 
R
A
 
L
N
 
D
M
 
I
A
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
Y
A
 
I
D
 
D
Y
 
H
G
 
L
Y
 
Y
V
 
V
L
 
M
E
 
F
N
 
N
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
V
 
I
A
 
A
E
 
E

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
32% identity, 90% coverage: 9:242/261 of query aligns to 2:235/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
V
 
I
L
 
L
A
 
K
L
 
A
A
 
Q
N
 
H
V
 
L
E
 
A
S
 
K
A
 
S
Y
 
Y
G
 
K
P
 
K
V
 
R
K
 
K
A
 
V
I
 
V
R
 
S
G
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
A
 
Q
V
 
V
Q
 
E
R
 
S
G
 
G
S
 
Q
I
 
I
A
 
V
T
 
G
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
I
 
S
L
 
F
K
 
Y
T
 
M
I
 
I
S
 
V
G
 
G
V
 
L
L
 
V
D
 
A
P
 
R
T
 
D
R
 
E
G
 
G
S
 
T
I
 
I
T
 
T
F
 
I
K
 
D
G
 
D
E
 
N
S
 
D
I
 
I
A
 
S
A
 
I
M
 
L
D
 
P
P
 
M
A
 
H
Q
 
S
I
 
R
V
 
S
R
 
R
R
 
M
G
 
G
L
 
I
S
 
G
H
 
Y
V
 
L
P
 
P
E
 
Q
G
 
E
R
 
A
E
 
S
V
 
I
F
 
F
P
 
R
L
 
K
L
 
L
S
 
S
V
 
V
R
 
E
D
 
D
N
 
N
L
 
I
L
 
M
M
 
A
G
 
V
A
 
L
Y
 
Q
T
 
T
R
 
R
R
 
E
D
 
E
R
 
L
D
 
T
G
 
H
V
x
E
A
 
E
R
 
R
D
 
Q
-
x
D
-
 
K
M
 
L
E
 
E
M
 
D
V
 
L
Y
 
L
D
 
E
Y
 
E
F
 
F
P
 
H
V
 
I
L
 
Q
R
 
H
E
 
I
R
 
R
A
 
K
A
 
S
Q
 
-
D
 
-
A
 
A
G
 
G
L
 
M
-
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
Q
 
R
Q
 
R
M
 
R
L
 
V
A
 
E
I
 
I
S
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
A
A
 
N
P
 
P
E
 
Q
L
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
S
 
F
L
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
D
P
 
P
K
 
I
L
 
S
T
 
V
K
 
I
D
 
D
I
 
I
F
 
K
E
 
K
I
 
I
V
 
I
V
 
E
R
 
H
I
 
L
N
 
-
R
 
R
E
 
D
R
 
R
G
 
G
T
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
H
N
 
N
A
 
V
N
 
R
M
 
E
A
 
T
L
 
L
N
 
D
A
 
V
A
 
C
D
 
E
Y
 
K
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
V
E
 
S
N
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
L
V
 
I
A
 
A
E
 
E
D
 
G
T
 
T
C
 
P
A
 
Q
V
 
D
L
 
V
R
 
L
E
 
N
K
 
N
D
 
E
D
 
Q
I
 
V
K
 
K
E
 
Q
F
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6s8nB Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with lipopolysaccharide (see paper)
32% identity, 89% coverage: 10:242/261 of query aligns to 3:235/238 of 6s8nB

query
sites
6s8nB
L
 
L
A
 
T
L
 
A
A
 
K
N
 
N
V
 
L
E
 
A
S
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
K
P
 
G
V
 
R
K
 
R
A
 
V
I
 
V
R
 
E
G
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
A
 
T
V
 
V
Q
 
N
R
 
S
G
 
G
S
 
E
I
 
I
A
 
V
T
 
G
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
I
 
T
L
 
F
K
 
Y
T
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
V
 
I
L
 
V
D
 
P
P
 
R
T
 
D
R
 
A
G
 
G
S
 
N
I
 
I
T
 
I
F
 
I
K
 
D
G
 
D
E
 
D
S
 
D
I
 
I
A
 
S
A
 
L
M
 
L
D
 
P
P
 
L
A
 
H
Q
 
A
I
 
R
V
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
S
 
G
H
 
Y
V
 
L
P
 
P
E
 
Q
G
 
E
R
 
A
E
 
S
V
 
I
F
 
F
P
x
R
L
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
R
 
Y
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
M
M
 
A
G
 
V
A
 
L
Y
 
Q
T
 
I
R
 
R
R
 
D
D
 
D
R
 
L
D
 
S
G
 
A
V
 
E
A
 
Q
R
 
R
D
 
E
-
 
D
-
 
R
-
 
A
M
 
N
E
 
E
M
 
L
V
 
M
Y
 
E
D
 
E
Y
 
F
-
 
H
F
 
I
P
 
E
V
 
H
L
 
L
R
 
R
E
 
D
R
 
S
A
x
M
A
x
G
Q
|
Q
D
 
S
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
Q
 
R
Q
 
R
M
 
R
L
 
V
A
 
E
I
 
I
S
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
A
A
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
F
L
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
D
P
 
P
K
 
I
L
 
S
T
 
V
K
 
I
D
 
D
I
 
I
F
 
K
E
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
E
R
 
H
I
 
L
N
 
-
R
 
R
E
 
D
R
 
S
G
 
G
T
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
H
N
 
N
A
 
V
N
 
R
M
 
E
A
 
T
L
 
L
N
 
A
A
 
V
A
 
C
D
 
E
Y
 
R
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
V
E
 
S
N
 
Q
G
 
G
R
 
H
I
 
L
V
 
I
A
 
A
E
 
H
D
 
G
T
 
T
C
 
P
A
 
T
V
 
E
L
 
I
R
 
L
E
 
Q
K
 
D
D
 
E
D
 
H
I
 
V
K
 
K
E
 
R
F
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6s8gA Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with amp-pnp (see paper)
32% identity, 89% coverage: 10:242/261 of query aligns to 3:235/238 of 6s8gA

query
sites
6s8gA
L
 
L
A
 
T
L
 
A
A
 
K
N
 
N
V
 
L
E
 
A
S
 
K
A
 
A
Y
|
Y
G
 
K
P
 
G
V
x
R
K
 
R
A
 
V
I
 
V
R
 
E
G
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
A
 
T
V
 
V
Q
 
N
R
 
S
G
 
G
S
 
E
I
 
I
A
 
V
T
 
G
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
I
 
T
L
 
F
K
 
Y
T
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
V
 
I
L
 
V
D
 
P
P
 
R
T
 
D
R
 
A
G
 
G
S
 
N
I
 
I
T
 
I
F
 
I
K
 
D
G
 
D
E
 
D
S
 
D
I
 
I
A
 
S
A
 
L
M
 
L
D
 
P
P
 
L
A
 
H
Q
 
A
I
 
R
V
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
S
 
G
H
 
Y
V
 
L
P
 
P
E
x
Q
G
 
E
R
 
A
E
 
S
V
 
I
F
 
F
P
 
R
L
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
R
 
Y
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
M
M
 
A
G
 
V
A
 
L
Y
 
Q
T
 
I
R
 
R
R
 
D
D
 
D
R
 
L
D
 
S
G
 
A
V
 
E
A
 
Q
R
 
R
D
 
E
-
 
D
-
 
R
-
 
A
M
 
N
E
 
E
M
 
L
V
 
M
Y
 
E
D
 
E
Y
 
F
-
 
H
F
 
I
P
 
E
V
 
H
L
 
L
R
 
R
E
 
D
R
 
S
A
 
M
A
 
G
Q
 
Q
D
x
S
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
x
E
Q
 
R
Q
 
R
M
 
R
L
 
V
A
 
E
I
 
I
S
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
A
A
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
F
L
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
D
P
 
P
K
 
I
L
 
S
T
 
V
K
 
I
D
 
D
I
 
I
F
 
K
E
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
E
R
 
H
I
 
L
N
 
-
R
 
R
E
 
D
R
 
S
G
 
G
T
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
H
N
 
N
A
 
V
N
 
R
M
 
E
A
 
T
L
 
L
N
 
A
A
 
V
A
 
C
D
 
E
Y
 
R
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
V
E
 
S
N
 
Q
G
 
G
R
 
H
I
 
L
V
 
I
A
 
A
E
 
H
D
 
G
T
 
T
C
 
P
A
 
T
V
 
E
L
 
I
R
 
L
E
 
Q
K
 
D
D
 
E
D
 
H
I
 
V
K
 
K
E
 
R
F
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6mhzA Vanadate trapped cryo-em structure of e.Coli lptb2fg transporter (see paper)
32% identity, 89% coverage: 10:242/261 of query aligns to 3:235/235 of 6mhzA

query
sites
6mhzA
L
 
L
A
 
T
L
 
A
A
 
K
N
 
N
V
 
L
E
 
A
S
 
K
A
 
A
Y
|
Y
G
 
K
P
 
G
V
 
R
K
 
R
A
 
V
I
 
V
R
 
E
G
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
A
 
T
V
 
V
Q
 
N
R
 
S
G
 
G
S
 
E
I
 
I
A
 
V
T
 
G
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
I
 
T
L
 
F
K
 
Y
T
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
V
 
I
L
 
V
D
 
P
P
 
R
T
 
D
R
 
A
G
 
G
S
 
N
I
 
I
T
 
I
F
 
I
K
 
D
G
 
D
E
 
D
S
 
D
I
 
I
A
 
S
A
 
L
M
 
L
D
 
P
P
 
L
A
 
H
Q
 
A
I
 
R
V
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
S
 
G
H
 
Y
V
 
L
P
 
P
E
x
Q
G
 
E
R
 
A
E
 
S
V
 
I
F
 
F
P
 
R
L
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
R
 
Y
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
M
M
 
A
G
 
V
A
 
L
Y
 
Q
T
 
I
R
 
R
R
 
D
D
 
D
R
 
L
D
 
S
G
 
A
V
 
E
A
 
Q
R
 
R
D
 
E
-
 
D
-
 
R
-
 
A
M
 
N
E
 
E
M
 
L
V
 
M
Y
 
E
D
 
E
Y
 
F
-
 
H
F
 
I
P
 
E
V
 
H
L
 
L
R
 
R
E
 
D
R
 
S
A
 
M
A
 
G
Q
 
Q
D
x
S
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
Q
 
E
Q
 
R
Q
 
R
M
 
R
L
 
V
A
 
E
I
 
I
S
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
A
A
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
S
 
F
L
 
A
G
|
G
L
 
V
S
 
D
P
 
P
K
 
I
L
 
S
T
 
V
K
 
I
D
 
D
I
 
I
F
 
K
E
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
E
R
 
H
I
 
L
N
 
-
R
 
R
E
 
D
R
 
S
G
 
G
T
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
x
H
N
 
N
A
 
V
N
 
R
M
 
E
A
 
T
L
 
L
N
 
A
A
 
V
A
 
C
D
 
E
Y
 
R
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
V
E
 
S
N
 
Q
G
 
G
R
 
H
I
 
L
V
 
I
A
 
A
E
 
H
D
 
G
T
 
T
C
 
P
A
 
T
V
 
E
L
 
I
R
 
L
E
 
Q
K
 
D
D
 
E
D
 
H
I
 
V
K
 
K
E
 
R
F
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6mbnA Lptb e163q in complex with atp (see paper)
31% identity, 90% coverage: 7:242/261 of query aligns to 1:236/241 of 6mbnA

query
sites
6mbnA
A
 
S
P
 
A
V
 
T
L
 
L
A
 
T
L
 
A
A
 
K
N
 
N
V
 
L
E
 
A
S
 
K
A
 
A
Y
|
Y
G
 
K
P
 
G
V
x
R
K
 
R
A
x
V
I
 
V
R
 
E
G
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
A
 
T
V
 
V
Q
 
N
R
 
S
G
 
G
S
 
E
I
 
I
A
 
V
T
 
G
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
I
 
T
L
 
F
K
 
Y
T
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
V
 
I
L
 
V
D
 
P
P
 
R
T
 
D
R
 
A
G
 
G
S
 
N
I
 
I
T
 
I
F
 
I
K
 
D
G
 
D
E
 
D
S
 
D
I
 
I
A
 
S
A
 
L
M
 
L
D
 
P
P
 
L
A
 
H
Q
 
A
I
 
R
V
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
S
 
G
H
 
Y
V
 
L
P
 
P
E
 
Q
G
 
E
R
 
A
E
 
S
V
 
I
F
 
F
P
 
R
L
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
R
 
Y
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
M
M
 
A
G
 
V
A
 
L
Y
 
Q
T
 
I
R
 
R
R
 
D
D
 
D
R
 
L
D
 
S
G
 
A
V
 
E
A
 
Q
R
 
R
D
 
E
-
 
D
-
 
R
-
 
A
M
 
N
E
 
E
M
 
L
V
 
M
Y
 
E
D
 
E
Y
 
F
-
 
H
F
 
I
P
 
E
V
 
H
L
 
L
R
 
R
E
 
D
R
 
S
A
 
M
A
 
G
Q
 
Q
D
 
S
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
Q
 
R
Q
 
R
M
 
R
L
 
V
A
 
E
I
 
I
S
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
A
A
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
S
 
F
L
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
D
P
 
P
K
 
I
L
 
S
T
 
V
K
 
I
D
 
D
I
 
I
F
 
K
E
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
E
R
 
H
I
 
L
N
 
-
R
 
R
E
 
D
R
 
S
G
 
G
T
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
x
H
N
 
N
A
 
V
N
 
R
M
 
E
A
 
T
L
 
L
N
 
A
A
 
V
A
 
C
D
 
E
Y
 
R
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
V
E
 
S
N
 
Q
G
 
G
R
 
H
I
 
L
V
 
I
A
 
A
E
 
H
D
 
G
T
 
T
C
 
P
A
 
T
V
 
E
L
 
I
R
 
L
E
 
Q
K
 
D
D
 
E
D
 
H
I
 
V
K
 
K
E
 
R
F
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6b89A E. Coli lptb in complex with adp and novobiocin (see paper)
31% identity, 89% coverage: 10:241/261 of query aligns to 3:234/234 of 6b89A

query
sites
6b89A
L
 
L
A
 
T
L
 
A
A
 
K
N
 
N
V
 
L
E
 
A
S
 
K
A
 
A
Y
|
Y
G
 
K
P
 
G
V
x
R
K
 
R
A
x
V
I
 
V
R
 
E
G
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
A
 
T
V
 
V
Q
 
N
R
 
S
G
 
G
S
 
E
I
 
I
A
 
V
T
 
G
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
I
 
T
L
 
F
K
 
Y
T
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
V
 
I
L
 
V
D
 
P
P
 
R
T
 
D
R
 
A
G
 
G
S
 
N
I
 
I
T
 
I
F
 
I
K
 
D
G
 
D
E
 
D
S
 
D
I
 
I
A
 
S
A
 
L
M
 
L
D
 
P
P
x
L
A
x
H
Q
 
A
I
 
R
V
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
S
 
G
H
 
Y
V
 
L
P
|
P
E
x
Q
G
 
E
R
x
A
E
x
S
V
 
I
F
|
F
P
x
R
L
x
R
L
|
L
S
 
S
V
 
V
R
 
Y
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
M
M
 
A
G
x
V
A
 
L
Y
 
Q
T
 
I
R
 
R
R
 
D
D
 
D
R
 
L
D
 
S
G
 
A
V
 
E
A
 
Q
R
 
R
D
 
E
-
 
D
-
 
R
-
 
A
M
 
N
E
 
E
M
 
L
V
 
M
Y
 
E
D
 
E
Y
 
F
-
 
H
F
 
I
P
 
E
V
 
H
L
 
L
R
 
R
E
 
D
R
 
S
A
 
M
A
 
G
Q
|
Q
D
 
S
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
Q
 
R
Q
 
R
M
 
R
L
 
V
A
 
E
I
 
I
S
 
A
R
|
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
A
A
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
F
L
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
D
P
 
P
K
 
I
L
 
S
T
 
V
K
 
I
D
 
D
I
 
I
F
 
K
E
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
E
R
 
H
I
 
L
N
 
-
R
 
R
E
 
D
R
 
S
G
 
G
T
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
H
N
 
N
A
 
V
N
 
R
M
 
E
A
 
T
L
 
L
N
 
A
A
 
V
A
 
C
D
 
E
Y
 
R
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
V
E
 
S
N
 
Q
G
 
G
R
 
H
I
 
L
V
 
I
A
 
A
E
 
H
D
 
G
T
 
T
C
 
P
A
 
T
V
 
E
L
 
I
R
 
L
E
 
Q
K
 
D
D
 
E
D
 
H
I
 
V
K
 
K
E
 
R
F
 
V
Y
 
Y
L
 
L

4p31A Crystal structure of a selenomethionine derivative of e. Coli lptb in complex with adp-magensium (see paper)
31% identity, 89% coverage: 10:241/261 of query aligns to 3:234/234 of 4p31A

query
sites
4p31A
L
 
L
A
 
T
L
 
A
A
 
K
N
 
N
V
 
L
E
 
A
S
 
K
A
 
A
Y
|
Y
G
 
K
P
 
G
V
x
R
K
 
R
A
x
V
I
 
V
R
 
E
G
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
A
 
T
V
 
V
Q
 
N
R
 
S
G
 
G
S
 
E
I
 
I
A
 
V
T
 
G
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
I
 
T
L
 
F
K
 
Y
T
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
V
 
I
L
 
V
D
 
P
P
 
R
T
 
D
R
 
A
G
 
G
S
 
N
I
 
I
T
 
I
F
 
I
K
 
D
G
 
D
E
 
D
S
 
D
I
 
I
A
 
S
A
 
L
M
 
L
D
 
P
P
 
L
A
 
H
Q
 
A
I
 
R
V
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
S
 
G
H
 
Y
V
 
L
P
 
P
E
x
Q
G
 
E
R
 
A
E
 
S
V
 
I
F
 
F
P
 
R
L
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
R
 
Y
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
M
M
 
A
G
 
V
A
 
L
Y
 
Q
T
 
I
R
 
R
R
 
D
D
 
D
R
 
L
D
 
S
G
 
A
V
 
E
A
 
Q
R
 
R
D
 
E
-
 
D
-
 
R
-
 
A
M
 
N
E
 
E
M
 
L
V
 
M
Y
 
E
D
 
E
Y
 
F
-
 
H
F
 
I
P
 
E
V
 
H
L
 
L
R
 
R
E
 
D
R
 
S
A
 
M
A
 
G
Q
 
Q
D
 
S
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
Q
 
R
Q
 
R
M
 
R
L
 
V
A
 
E
I
 
I
S
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
A
A
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
F
L
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
D
P
 
P
K
 
I
L
 
S
T
 
V
K
 
I
D
 
D
I
 
I
F
 
K
E
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
E
R
 
H
I
 
L
N
 
-
R
 
R
E
 
D
R
 
S
G
 
G
T
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
H
N
 
N
A
 
V
N
 
R
M
 
E
A
 
T
L
 
L
N
 
A
A
 
V
A
 
C
D
 
E
Y
 
R
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
V
E
 
S
N
 
Q
G
 
G
R
 
H
I
 
L
V
 
I
A
 
A
E
 
H
D
 
G
T
 
T
C
 
P
A
 
T
V
 
E
L
 
I
R
 
L
E
 
Q
K
 
D
D
 
E
D
 
H
I
 
V
K
 
K
E
 
R
F
 
V
Y
 
Y
L
 
L

6b8bA E. Coli lptb in complex with adp and a novobiocin derivative (see paper)
31% identity, 89% coverage: 10:240/261 of query aligns to 3:233/233 of 6b8bA

query
sites
6b8bA
L
 
L
A
 
T
L
 
A
A
 
K
N
 
N
V
 
L
E
 
A
S
 
K
A
 
A
Y
|
Y
G
 
K
P
 
G
V
x
R
K
 
R
A
x
V
I
 
V
R
 
E
G
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
A
 
T
V
 
V
Q
 
N
R
 
S
G
 
G
S
 
E
I
 
I
A
 
V
T
 
G
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
I
 
T
L
 
F
K
 
Y
T
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
V
 
I
L
 
V
D
 
P
P
 
R
T
 
D
R
 
A
G
 
G
S
 
N
I
 
I
T
 
I
F
 
I
K
 
D
G
 
D
E
 
D
S
 
D
I
 
I
A
 
S
A
 
L
M
 
L
D
 
P
P
 
L
A
 
H
Q
 
A
I
 
R
V
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
S
 
G
H
 
Y
V
 
L
P
 
P
E
 
Q
G
 
E
R
 
A
E
 
S
V
 
I
F
|
F
P
x
R
L
x
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
R
 
Y
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
M
M
 
A
G
 
V
A
 
L
Y
 
Q
T
 
I
R
 
R
R
 
D
D
 
D
R
 
L
D
 
S
G
 
A
V
 
E
A
 
Q
R
 
R
D
 
E
-
 
D
-
 
R
-
 
A
M
 
N
E
 
E
M
 
L
V
 
M
Y
 
E
D
 
E
Y
 
F
-
 
H
F
 
I
P
 
E
V
 
H
L
 
L
R
 
R
E
 
D
R
 
S
A
 
M
A
 
G
Q
 
Q
D
 
S
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
Q
 
R
Q
 
R
M
 
R
L
 
V
A
 
E
I
 
I
S
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
A
A
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
F
L
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
D
P
 
P
K
 
I
L
 
S
T
 
V
K
 
I
D
 
D
I
 
I
F
 
K
E
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
E
R
 
H
I
 
L
N
 
-
R
 
R
E
 
D
R
 
S
G
 
G
T
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
H
N
 
N
A
 
V
N
 
R
M
 
E
A
 
T
L
 
L
N
 
A
A
 
V
A
 
C
D
 
E
Y
 
R
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
V
E
 
S
N
 
Q
G
 
G
R
 
H
I
 
L
V
 
I
A
 
A
E
 
H
D
 
G
T
 
T
C
 
P
A
 
T
V
 
E
L
 
I
R
 
L
E
 
Q
K
 
D
D
 
E
D
 
H
I
 
V
K
 
K
E
 
R
F
 
V
Y
 
Y

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
28% identity, 83% coverage: 8:224/261 of query aligns to 1:217/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
R
L
 
I
A
 
R
N
 
N
V
 
L
E
 
H
S
 
K
A
 
W
Y
x
F
G
 
G
P
 
P
V
 
L
K
 
H
A
x
V
I
 
L
R
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
H
L
 
L
A
 
E
V
 
V
Q
 
A
R
 
P
G
 
G
S
 
E
I
 
K
A
 
L
T
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
I
 
L
L
 
I
K
 
R
T
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
R
V
 
L
L
 
E
D
 
D
P
 
F
T
 
Q
R
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
V
T
 
V
F
 
V
K
 
D
G
 
G
E
 
L
S
 
S
I
 
V
A
 
K
A
 
D
M
 
D
D
 
R
P
 
A
A
 
L
Q
 
R
I
 
E
V
 
I
R
 
R
R
 
R
G
 
E
L
 
V
S
 
G
H
 
M
V
 
V
P
 
F
E
 
Q
G
 
Q
R
 
F
E
 
N
V
 
L
F
 
F
P
 
P
L
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
R
 
L
D
 
E
N
 
N
L
 
V
L
 
T
M
 
L
G
 
A
A
 
P
Y
 
M
-
 
R
-
 
V
T
 
R
R
 
R
R
 
W
D
 
P
R
 
R
D
 
E
G
 
K
V
 
A
A
 
E
R
 
K
D
 
K
M
 
A
E
 
L
M
 
E
V
 
L
Y
 
L
D
 
E
Y
 
R
F
 
V
P
 
G
V
 
I
L
 
L
R
 
-
E
 
D
R
 
Q
A
 
A
A
 
R
Q
 
K
D
 
Y
A
 
P
G
 
A
L
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
A
 
A
I
 
I
S
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
M
A
 
E
P
 
P
E
 
K
L
 
I
I
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
T
L
 
S
G
 
A
L
 
L
S
 
D
P
 
P
K
 
E
L
 
M
T
 
V
K
 
G
D
 
E
I
 
V
F
 
L
E
 
D
I
 
-
V
 
V
V
 
M
R
 
R
I
 
D
N
 
L
R
 
A
E
 
Q
R
 
G
G
 
G
T
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
T
Q
 
H
N
 
E
A
 
M
N
 
G
M
 
F
A
 
A
L
 
R
N
 
E
A
 
V
A
 
A
D
 
D
Y
 
R
G
 
V
Y
 
V
V
 
F
L
 
M
E
 
D
N
 
G
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
V
 
V
A
 
E
E
 
E

P34358 ABC transporter ced-7; Cell death protein 7 from Caenorhabditis elegans (see 2 papers)
32% identity, 81% coverage: 23:233/261 of query aligns to 561:767/1704 of P34358

query
sites
P34358
K
 
R
A
 
A
I
 
V
R
 
D
G
 
G
V
 
L
S
 
S
L
 
L
A
 
R
V
 
A
Q
 
V
R
 
R
G
 
G
S
 
Q
I
 
C
A
 
S
T
 
I
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
H
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
T
 
S
T
 
T
I
 
T
L
 
F
K
 
S
T
 
S
I
 
I
S
 
A
G
 
G
V
 
I
L
 
I
D
 
R
P
 
P
T
 
T
R
 
N
G
 
G
S
 
R
I
 
I
T
 
T
F
 
I
K
 
C
G
 
G
E
 
Y
S
 
D
I
 
V
A
 
G
A
 
N
M
 
-
D
 
E
P
 
P
A
 
G
Q
 
E
I
 
-
V
 
T
R
 
R
R
 
R
G
 
H
L
 
I
S
 
G
H
 
M
V
 
C
P
 
P
E
 
Q
G
 
Y
R
 
N
E
 
P
V
 
L
F
 
Y
P
 
D
L
 
Q
L
 
L
S
 
T
V
 
V
R
 
S
D
x
E
N
 
H
-
 
L
-
 
K
L
 
L
L
 
V
M
 
Y
G
 
G
A
 
L
Y
 
K
T
 
G
R
 
A
R
 
R
D
 
E
R
 
K
D
 
D
G
 
-
V
 
F
A
 
K
R
 
Q
D
 
D
M
 
M
E
 
K
-
 
R
M
 
L
V
 
L
Y
 
S
D
 
D
Y
 
V
F
 
K
P
 
L
V
 
D
L
 
F
R
 
K
E
 
E
R
 
N
A
 
-
A
 
-
Q
 
E
D
 
K
A
 
A
G
 
V
L
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
Q
 
K
Q
 
R
M
 
K
L
 
L
A
 
C
I
 
V
S
 
C
R
 
M
A
 
A
L
 
L
M
 
I
A
 
G
A
 
D
P
 
S
E
 
E
L
 
V
I
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
T
L
 
A
G
 
G
L
 
M
S
 
D
P
 
P
K
 
G
L
 
A
T
 
R
K
 
Q
D
 
D
I
 
V
F
 
Q
E
 
K
I
 
L
V
 
V
V
 
E
R
 
R
I
 
E
N
 
K
R
 
A
E
 
N
R
 
R
G
 
-
T
 
-
T
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
T
E
 
T
Q
 
H
N
 
Y
A
 
M
N
 
D
M
 
E
A
 
A
L
 
E
N
 
R
A
 
L
A
 
G
D
 
D
Y
 
W
G
 
V
Y
 
F
V
 
I
L
 
M
E
 
S
N
 
H
G
 
G
R
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
A
E
 
S
D
 
G
T
 
T
C
 
N
A
 
Q
V
 
Y
L
 
L
R
 
K
E
 
Q
K
 
K

Sites not aligning to the query:

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
29% identity, 82% coverage: 14:226/261 of query aligns to 6:219/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
N
 
D
V
 
V
E
 
Y
S
 
K
A
 
N
Y
x
F
G
 
G
P
 
S
V
 
L
K
 
E
A
x
V
I
 
L
R
 
K
G
 
G
V
 
V
S
 
T
L
 
L
A
 
K
V
 
V
Q
 
N
R
 
K
G
 
G
S
 
E
I
 
V
A
 
V
T
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
I
 
L
L
 
L
K
 
R
T
 
C
I
 
I
S
 
N
G
 
L
V
 
L
L
 
E
D
 
E
P
 
P
T
 
T
R
 
K
G
 
G
S
 
E
I
 
V
T
 
F
F
 
I
K
 
D
G
 
G
E
 
V
S
 
K
I
 
I
A
 
N
-
 
N
A
 
G
M
 
K
D
 
V
P
 
N
A
 
I
Q
 
N
I
 
K
V
 
V
R
 
R
R
 
Q
G
 
K
L
 
V
S
 
G
H
 
M
V
 
V
P
 
F
E
 
Q
G
 
H
R
 
F
E
 
N
V
 
L
F
 
F
P
 
P
L
 
H
L
 
L
S
 
T
V
 
A
R
 
I
D
 
E
N
 
N
L
 
I
L
 
T
M
 
L
G
 
A
A
 
P
Y
 
V
T
 
K
R
 
V
R
 
K
D
 
K
R
 
M
D
 
N
G
 
K
V
 
K
A
 
E
R
 
A
D
 
E
M
 
-
E
 
E
M
 
L
V
 
A
Y
 
V
D
 
D
Y
 
L
F
 
L
P
 
A
V
 
K
-
 
V
-
 
G
L
 
L
R
 
L
E
 
D
R
 
K
A
 
K
A
 
D
Q
 
Q
D
 
Y
A
 
P
G
 
I
L
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
M
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
M
A
 
Q
P
 
P
E
 
E
L
 
V
I
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
S
 
T
L
 
S
G
 
A
L
 
L
S
 
D
P
 
P
K
 
E
L
 
M
T
 
V
K
 
K
D
 
E
I
 
V
F
 
L
E
 
N
I
 
V
V
 
M
V
 
K
R
 
Q
I
 
L
N
 
A
R
 
N
E
 
E
R
 
-
G
 
G
T
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
T
Q
x
H
N
 
E
A
 
M
N
 
G
M
 
F
A
 
A
L
 
R
N
 
E
A
 
V
A
 
G
D
 
D
Y
 
R
G
 
V
Y
 
I
V
 
F
L
 
M
E
 
D
N
 
D
G
 
G
R
 
V
I
 
I
V
 
V
A
 
E
E
 
E
D
 
G
T
 
T

Q5SSE9 ATP-binding cassette sub-family A member 13; EC 7.6.2.- from Mus musculus (Mouse) (see paper)
31% identity, 86% coverage: 8:232/261 of query aligns to 3808:4031/5034 of Q5SSE9

query
sites
Q5SSE9
P
 
P
V
 
G
L
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
I
N
 
S
V
 
V
E
 
T
S
 
K
A
 
E
Y
 
Y
G
 
E
P
 
D
V
 
H
K
 
K
-
 
V
A
 
A
I
 
V
R
 
Q
G
 
E
V
 
L
S
 
T
L
 
L
A
 
T
V
 
F
Q
 
H
R
 
R
G
 
D
S
 
Q
I
 
I
A
 
T
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
T
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
T
 
T
T
 
T
I
 
I
L
 
I
K
 
S
T
 
M
I
 
L
S
 
M
G
 
G
V
 
L
L
 
F
D
 
P
P
 
P
T
 
T
R
 
S
G
 
G
S
 
T
I
 
I
T
 
T
F
 
I
K
 
N
G
 
G
E
 
K
S
 
N
I
 
L
A
 
Q
A
 
T
M
 
-
D
 
D
P
 
L
A
 
S
Q
 
K
I
 
-
V
 
V
R
 
R
R
 
E
G
 
E
L
 
L
S
 
G
H
 
V
V
 
C
P
 
P
E
 
Q
G
 
Q
R
 
D
E
 
V
V
 
L
F
 
L
P
 
D
L
 
N
L
 
L
S
 
T
V
 
V
R
 
R
D
 
E
N
 
H
L
 
L
L
 
M
M
 
L
G
 
F
A
 
A
-
 
S
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
P
-
 
W
-
 
W
Y
 
T
T
 
T
R
 
K
R
 
E
D
 
L
R
 
Q
D
 
Q
G
 
Q
V
 
V
A
 
N
R
 
K
D
 
T
M
 
L
E
 
D
M
 
E
V
 
V
Y
 
E
D
 
-
Y
 
-
F
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
L
R
 
T
E
 
Q
R
 
H
A
 
Q
A
 
H
Q
 
K
D
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
Q
 
K
Q
 
R
M
 
K
L
 
L
A
 
S
I
 
I
S
 
G
R
 
I
A
 
A
L
 
F
M
 
M
A
 
G
A
 
M
P
 
S
E
 
K
L
 
T
I
 
V
L
 
V
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
S
L
 
S
G
 
G
L
 
V
S
 
D
P
 
P
K
 
C
L
 
S
T
 
R
K
 
R
D
 
S
I
 
L
F
 
W
E
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
L
R
 
K
I
 
Y
N
 
-
R
 
R
E
 
E
R
 
-
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
I
L
 
I
L
 
F
V
 
T
E
x
T
Q
 
H
N
 
H
A
 
L
N
 
D
M
 
E
A
 
A
L
 
E
N
 
M
A
 
L
A
 
S
D
 
D
Y
 
H
G
 
V
Y
 
A
V
 
V
L
 
L
E
 
Q
N
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
L
V
 
R
A
 
C
E
 
Y
D
 
A
T
 
P
C
 
P
A
 
A
V
 
D
L
 
L
R
 
K
E
 
E

Sites not aligning to the query:

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
29% identity, 84% coverage: 9:228/261 of query aligns to 1:226/343 of P30750

query
sites
P30750
V
 
M
L
 
I
A
 
K
L
 
L
A
 
S
N
 
N
V
 
I
E
 
T
S
 
K
A
 
V
Y
 
F
G
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
P
 
T
V
 
I
K
 
Q
A
 
A
I
 
L
R
 
N
G
 
N
V
 
V
S
 
S
L
 
L
A
 
H
V
 
V
Q
 
P
R
 
A
G
 
G
S
 
Q
I
 
I
A
 
Y
T
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
I
 
L
L
 
I
K
 
R
T
 
C
I
 
V
S
 
N
G
 
L
V
 
L
L
 
E
D
 
R
P
 
P
T
 
T
R
 
E
G
 
G
S
 
S
I
 
V
T
 
L
F
 
V
K
 
D
G
 
G
E
 
Q
S
 
E
I
 
L
A
 
T
A
 
T
M
 
L
D
 
S
P
 
E
A
 
S
Q
 
E
I
 
L
V
 
T
-
 
K
-
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
Q
L
 
I
S
 
G
H
 
M
V
 
I
P
 
F
E
 
Q
G
 
H
R
 
-
E
 
-
V
 
-
F
 
F
P
 
N
L
 
L
L
 
L
S
 
S
V
 
S
R
 
R
-
 
T
-
 
V
-
 
F
-
 
G
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
L
D
 
D
N
 
N
L
 
T
L
 
P
M
 
K
G
 
D
A
 
E
Y
 
V
T
 
K
R
 
R
R
 
R
D
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
V
A
 
T
R
 
E
D
 
L
M
 
L
E
 
S
M
 
L
V
 
V
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
K
Y
 
H
D
 
D
Y
 
S
F
 
Y
P
 
P
V
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
S
L
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
A
 
A
I
 
I
S
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
S
A
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
V
I
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
S
 
T
L
 
S
G
 
A
L
 
L
S
 
D
P
 
P
K
 
A
L
 
T
T
 
T
K
 
R
D
 
S
I
 
I
F
 
L
E
 
E
I
 
L
V
 
L
V
 
K
R
 
D
I
 
I
N
 
N
R
 
R
E
 
R
R
 
L
G
 
G
T
 
L
T
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
E
 
T
Q
 
H
N
 
E
A
 
M
N
 
D
M
 
V
A
 
V
L
 
K
N
 
R
A
 
I
A
 
C
D
 
D
Y
 
C
G
 
V
Y
 
A
V
 
V
L
 
I
E
 
S
N
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
L
V
 
I
A
 
E
E
 
Q
D
 
D
T
 
T
C
 
V
A
 
S

Sites not aligning to the query:

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
29% identity, 84% coverage: 9:228/261 of query aligns to 2:227/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
V
 
M
L
 
I
A
 
K
L
 
L
A
 
S
N
 
N
V
 
I
E
 
T
S
 
K
A
 
V
Y
x
F
G
 
H
-
x
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
P
 
T
V
 
I
K
 
Q
A
 
A
I
 
L
R
 
N
G
 
N
V
 
V
S
 
S
L
 
L
A
 
H
V
 
V
Q
 
P
R
 
A
G
 
G
S
 
Q
I
 
I
A
 
Y
T
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
I
 
L
L
 
I
K
 
R
T
 
C
I
 
V
S
 
N
G
 
L
V
 
L
L
 
E
D
 
R
P
 
P
T
 
T
R
 
E
G
 
G
S
 
S
I
 
V
T
 
L
F
 
V
K
 
D
G
 
G
E
 
Q
S
 
E
I
 
L
A
 
T
A
 
T
M
 
L
D
 
S
P
 
E
A
 
S
Q
 
E
I
 
L
V
 
T
-
 
K
-
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
Q
L
 
I
S
 
G
H
 
M
V
 
I
P
 
F
E
 
Q
G
 
H
R
 
-
E
 
-
V
 
-
F
 
F
P
 
N
L
 
L
L
 
L
S
 
S
V
 
S
R
 
R
-
 
T
-
 
V
-
 
F
-
 
G
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
L
D
 
D
N
 
N
L
 
T
L
 
P
M
 
K
G
 
D
A
 
E
Y
 
V
T
 
K
R
 
R
R
 
R
D
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
V
A
 
T
R
 
E
D
 
L
M
 
L
E
 
S
M
 
L
V
 
V
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
K
Y
 
H
D
 
D
Y
 
S
F
 
Y
P
 
P
V
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
S
L
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
A
 
A
I
 
I
S
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
S
A
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
V
I
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
S
 
T
L
 
S
G
 
A
L
 
L
S
 
D
P
 
P
K
 
A
L
 
T
T
 
T
K
 
R
D
 
S
I
 
I
F
 
L
E
 
E
I
 
L
V
 
L
V
 
K
R
 
D
I
 
I
N
 
N
R
 
R
E
 
R
R
 
L
G
 
G
T
 
L
T
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
E
 
T
Q
 
H
N
 
E
A
 
M
N
 
D
M
 
V
A
 
V
L
 
K
N
 
R
A
 
I
A
 
C
D
 
D
Y
 
C
G
 
V
Y
 
A
V
 
V
L
 
I
E
 
S
N
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
L
V
 
I
A
 
E
E
 
Q
D
 
D
T
 
T
C
 
V
A
 
S

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
29% identity, 84% coverage: 9:228/261 of query aligns to 2:227/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
V
 
M
L
 
I
A
 
K
L
 
L
A
 
S
N
 
N
V
 
I
E
 
T
S
 
K
A
 
V
Y
x
F
G
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
P
 
T
V
 
I
K
 
Q
A
 
A
I
 
L
R
 
N
G
 
N
V
 
V
S
 
S
L
 
L
A
 
H
V
 
V
Q
 
P
R
 
A
G
 
G
S
 
Q
I
 
I
A
 
Y
T
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
I
 
L
L
 
I
K
 
R
T
 
C
I
 
V
S
 
N
G
 
L
V
 
L
L
 
E
D
 
R
P
 
P
T
 
T
R
 
E
G
 
G
S
 
S
I
 
V
T
 
L
F
 
V
K
 
D
G
 
G
E
 
Q
S
 
E
I
 
L
A
 
T
A
 
T
M
 
L
D
 
S
P
 
E
A
 
S
Q
 
E
I
 
L
V
 
T
-
 
K
-
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
Q
L
 
I
S
 
G
H
 
M
V
 
I
P
 
F
E
 
Q
G
 
H
R
 
-
E
 
-
V
 
-
F
 
F
P
 
N
L
 
L
L
 
L
S
 
S
V
 
S
R
 
R
-
 
T
-
 
V
-
 
F
-
 
G
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
L
D
 
D
N
 
N
L
 
T
L
 
P
M
 
K
G
 
D
A
 
E
Y
 
V
T
 
K
R
 
R
R
 
R
D
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
V
A
 
T
R
 
E
D
 
L
M
 
L
E
 
S
M
 
L
V
 
V
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
K
Y
 
H
D
 
D
Y
 
S
F
 
Y
P
 
P
V
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
S
L
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
A
 
A
I
 
I
S
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
S
A
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
V
I
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
S
 
T
L
 
S
G
 
A
L
 
L
S
 
D
P
 
P
K
 
A
L
 
T
T
 
T
K
 
R
D
 
S
I
 
I
F
 
L
E
 
E
I
 
L
V
 
L
V
 
K
R
 
D
I
 
I
N
 
N
R
 
R
E
 
R
R
 
L
G
 
G
T
 
L
T
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
E
 
T
Q
 
H
N
 
E
A
 
M
N
 
D
M
 
V
A
 
V
L
 
K
N
 
R
A
 
I
A
 
C
D
 
D
Y
 
C
G
 
V
Y
 
A
V
 
V
L
 
I
E
 
S
N
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
L
V
 
I
A
 
E
E
 
Q
D
 
D
T
 
T
C
 
V
A
 
S

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
29% identity, 84% coverage: 9:228/261 of query aligns to 2:227/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
V
 
M
L
 
I
A
 
K
L
 
L
A
 
S
N
 
N
V
 
I
E
 
T
S
 
K
A
 
V
Y
x
F
G
 
H
-
x
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
P
 
T
V
x
I
K
 
Q
A
 
A
I
 
L
R
 
N
G
 
N
V
 
V
S
 
S
L
 
L
A
 
H
V
 
V
Q
 
P
R
 
A
G
 
G
S
 
Q
I
 
I
A
 
Y
T
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
I
 
L
L
 
I
K
 
R
T
 
C
I
 
V
S
 
N
G
 
L
V
 
L
L
 
E
D
 
R
P
 
P
T
 
T
R
 
E
G
 
G
S
 
S
I
 
V
T
 
L
F
 
V
K
 
D
G
 
G
E
 
Q
S
 
E
I
 
L
A
 
T
A
 
T
M
 
L
D
 
S
P
 
E
A
 
S
Q
 
E
I
 
L
V
 
T
-
 
K
-
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
Q
L
 
I
S
 
G
H
 
M
V
 
I
P
 
F
E
 
Q
G
 
H
R
 
-
E
 
-
V
 
-
F
 
F
P
 
N
L
 
L
L
 
L
S
 
S
V
 
S
R
 
R
-
 
T
-
 
V
-
 
F
-
 
G
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
L
D
 
D
N
 
N
L
 
T
L
 
P
M
 
K
G
 
D
A
 
E
Y
 
V
T
 
K
R
 
R
R
 
R
D
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
V
A
 
T
R
 
E
D
 
L
M
 
L
E
 
S
M
 
L
V
 
V
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
K
Y
 
H
D
 
D
Y
 
S
F
 
Y
P
 
P
V
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
S
L
x
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
|
Q
Q
 
K
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
A
 
A
I
 
I
S
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
S
A
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
V
I
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
S
 
T
L
 
S
G
 
A
L
 
L
S
 
D
P
 
P
K
 
A
L
 
T
T
 
T
K
 
R
D
 
S
I
 
I
F
 
L
E
 
E
I
 
L
V
 
L
V
 
K
R
 
D
I
 
I
N
 
N
R
 
R
E
 
R
R
 
L
G
 
G
T
 
L
T
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
E
 
T
Q
x
H
N
 
E
A
 
M
N
 
D
M
 
V
A
 
V
L
 
K
N
 
R
A
 
I
A
 
C
D
 
D
Y
 
C
G
 
V
Y
 
A
V
 
V
L
 
I
E
 
S
N
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
L
V
 
I
A
 
E
E
 
Q
D
 
D
T
 
T
C
 
V
A
 
S

4yerA Crystal structure of an abc transporter atp-binding protein (tm_1403) from thermotoga maritima msb8 at 2.35 a resolution
27% identity, 85% coverage: 9:231/261 of query aligns to 4:224/285 of 4yerA

query
sites
4yerA
V
 
I
L
 
I
A
 
V
L
 
V
A
 
E
N
 
N
V
 
L
E
 
V
S
 
K
A
 
K
Y
x
F
G
 
G
P
 
D
V
x
F
K
 
E
A
 
A
I
 
V
R
 
K
G
 
G
V
 
V
S
 
S
L
 
F
A
 
S
V
 
V
Q
 
K
R
 
K
G
 
G
S
 
E
I
 
I
A
 
F
T
 
A
V
 
F
L
 
L
G
 
G
A
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
I
 
T
L
 
I
K
 
H
T
 
M
I
 
L
S
 
T
G
 
T
V
 
L
L
 
L
D
 
K
P
 
P
T
 
T
R
 
S
G
 
G
S
 
K
I
 
A
T
 
W
F
 
V
K
 
A
G
 
G
E
 
H
S
 
D
I
 
V
A
 
L
A
 
K
M
 
-
D
 
E
P
 
P
A
 
R
Q
 
E
I
 
-
V
 
V
R
 
R
R
 
R
G
 
K
L
 
I
S
 
G
H
 
I
V
 
V
P
 
F
E
 
Q
G
 
D
R
 
Q
E
 
S
V
 
L
F
 
D
P
 
R
L
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
A
R
 
Y
D
 
E
N
 
N
L
 
M
L
 
Y
M
 
I
G
 
-
A
 
-
Y
 
H
T
 
G
R
 
K
R
 
I
D
 
Y
R
 
G
D
 
Y
G
 
G
V
 
G
A
 
E
R
 
K
D
 
L
M
 
K
E
 
K
M
 
R
V
 
I
Y
 
L
D
 
E
Y
 
L
F
 
L
P
 
E
V
 
F
L
 
V
R
 
E
E
 
L
R
 
L
A
 
E
A
 
F
Q
 
K
D
 
D
A
 
K
G
 
P
L
 
V
-
 
K
-
x
T
L
x
F
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
Q
 
A
Q
 
R
M
 
R
L
 
L
A
 
E
I
 
I
S
 
A
R
 
R
A
 
S
L
 
L
M
 
I
A
 
H
A
 
E
P
 
P
E
 
E
L
 
V
I
 
L
L
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
S
 
T
L
 
I
G
 
G
L
 
L
S
 
D
P
 
P
K
 
H
L
 
T
T
 
R
K
 
A
D
 
H
I
 
M
F
 
W
E
 
E
I
 
Y
V
 
I
V
 
S
R
 
K
I
 
M
N
 
K
R
 
K
E
 
E
R
 
H
G
 
N
T
 
M
T
 
T
I
 
I
L
 
F
L
 
L
V
 
T
E
 
T
Q
 
H
N
 
Y
A
 
M
N
 
D
M
 
E
A
 
A
L
 
E
N
 
Q
A
 
L
A
 
A
D
 
D
Y
 
R
G
 
V
Y
 
A
V
 
I
L
 
I
E
 
D
N
 
H
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
A
 
A
E
 
L
D
 
G
T
 
T
C
 
P
A
 
T
V
 
E
L
 
L
R
 
K

Query Sequence

>RR42_RS29455 RR42_RS29455 ABC transporter ATP-binding protein
MREIQHAPVLALANVESAYGPVKAIRGVSLAVQRGSIATVLGANGAGKTTILKTISGVLD
PTRGSITFKGESIAAMDPAQIVRRGLSHVPEGREVFPLLSVRDNLLMGAYTRRDRDGVAR
DMEMVYDYFPVLRERAAQDAGLLSGGQQQMLAISRALMAAPELILLDEPSLGLSPKLTKD
IFEIVVRINRERGTTILLVEQNANMALNAADYGYVLENGRIVAEDTCAVLREKDDIKEFY
LGMKDNGVRGERRWKKRKTWR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory