SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS29850 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS29850 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P16640 Putidaredoxin reductase CamA; Pdr; Putidaredoxin--NAD(+) reductase; EC 1.18.1.5 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see 2 papers)
34% identity, 99% coverage: 1:367/369 of query aligns to 1:374/422 of P16640

query
sites
P16640
M
 
M
N
 
N
S
 
A
P
 
N
E
 
D
H
 
N
I
 
V
V
 
V
V
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
T
S
 
G
A
 
L
A
|
A
G
 
G
I
 
V
T
 
E
A
 
V
A
 
A
R
 
F
A
 
G
L
 
L
R
 
R
A
 
A
Q
 
S
G
 
G
W
 
W
G
 
E
G
 
G
R
 
N
L
 
I
T
 
R
L
 
L
I
 
V
G
 
G
K
x
D
E
 
A
G
 
T
G
 
V
M
 
I
P
 
P
Y
 
H
D
 
H
R
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
S
 
S
K
|
K
R
 
A
L
 
Y
M
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
K
C
 
A
P
 
T
V
 
A
E
 
E
A
 
S
L
 
L
N
 
Y
L
 
L
V
 
R
S
 
T
E
 
P
D
 
D
G
 
A
M
 
Y
K
 
A
A
 
A
L
 
Q
N
 
N
L
 
I
H
 
Q
Y
 
L
L
 
L
D
 
G
G
 
G
T
 
T
S
 
Q
A
x
V
T
 
T
G
 
A
L
 
I
D
 
N
T
 
R
D
 
D
A
 
R
S
 
Q
S
 
Q
L
 
V
Q
 
I
L
 
L
S
 
S
N
 
D
G
 
G
S
 
R
T
 
A
L
 
L
Q
 
D
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
L
L
 
V
I
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
G
D
 
R
A
 
P
R
 
R
V
 
P
I
 
L
P
 
P
N
 
V
L
 
A
S
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
G
Q
 
K
A
 
A
A
 
N
N
 
N
C
 
F
Y
 
R
S
 
Y
L
 
L
R
|
R
N
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
E
A
 
C
I
 
I
R
 
R
E
 
R
H
 
Q
L
 
L
T
 
I
A
 
A
G
 
D
K
 
N
R
 
R
V
 
L
L
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
F
 
Y
I
 
I
G
 
G
T
 
L
E
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
T
A
 
A
K
 
I
T
 
K
S
 
A
G
 
N
C
 
M
E
 
H
V
 
V
T
 
T
V
 
L
I
 
L
D
 
D
K
 
T
S
 
A
K
 
A
V
 
R
P
 
V
L
 
L
G
 
E
A
 
R
R
 
V
V
 
T
G
 
A
D
 
P
I
 
P
V
 
V
G
 
S
K
 
A
R
 
F
I
 
Y
E
 
E
K
 
H
L
 
L
H
 
H
E
 
R
A
 
E
N
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
D
F
 
I
H
 
R
N
 
T
D
 
G
C
 
T
E
 
Q
L
 
V
-
 
C
-
 
G
R
 
F
E
 
E
V
 
M
K
 
S
W
 
T
R
 
D
D
 
Q
R
 
Q
T
 
K
I
 
V
T
 
T
E
 
A
V
 
V
R
 
L
L
 
C
D
 
E
T
 
D
G
 
G
V
 
T
V
 
R
I
 
L
A
 
P
C
 
A
D
 
D
V
 
L
I
 
V
V
 
I
V
 
A
A
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
L
V
 
I
P
 
P
S
 
N
V
 
C
Q
 
E
W
 
L
C
 
A
S
 
S
-
 
A
-
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
Q
I
 
V
R
 
D
S
 
N
G
 
G
V
 
I
V
 
V
C
 
I
N
 
N
E
 
E
Y
 
H
C
 
M
E
 
Q
A
 
T
A
 
S
-
 
D
P
 
P
N
 
L
V
 
I
Y
 
M
A
 
A
A
 
V
G
 
G
D
|
D
A
 
C
A
 
A
E
 
R
W
 
F
F
 
H
H
 
S
K
 
Q
G
 
L
Y
 
Y
G
 
D
E
 
R
H
 
W
M
 
V
R
 
R
I
 
I
E
 
E
H
 
S
R
x
V
T
 
P
N
 
N
A
 
A
S
 
L
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
M
 
R
A
 
K
A
 
I
A
 
A
K
 
A
N
 
I
M
 
L
L
 
C
G
 
G
S
 
K
R
 
V
V
 
P
E
 
R
Y
 
D
A
 
E
P
 
A
L
 
A
P
 
P
F
 
W
F
 
F
W
 
W
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
E
V
 
I
Q
 
G
I
 
L
H
 
K
S
 
M
Y
 
V
G
 
G
R
 
-
I
 
L
G
 
S
P
 
E
Q
 
G
Y
 
Y
T
 
D
V
 
R
E
 
I
V
 
I
V
 
V
E
 
R
G
 
G
D
 
S
Q
 
L
L
 
A
K
 
Q
D
 
P
D
 
D
S
 
F
C
 
S
I
 
V
F
 
F
R
 
-
Y
 
Y
Y
 
L
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
V
 
R
L
 
V
M
 
L
G
 
A
V
 
V

1q1wA Crystal structure of putidaredoxin reductase from pseudomonas putida (see paper)
34% identity, 99% coverage: 2:367/369 of query aligns to 1:373/422 of 1q1wA

query
sites
1q1wA
N
 
N
S
 
A
P
 
N
E
 
D
H
 
N
I
 
V
V
 
V
V
 
I
V
 
V
G
|
G
A
 
T
S
x
G
A
x
L
A
|
A
G
 
G
I
 
V
T
 
E
A
 
V
A
 
A
R
 
F
A
 
G
L
 
L
R
 
R
A
 
A
Q
 
S
G
 
G
W
 
W
G
 
E
G
 
G
R
 
N
L
 
I
T
 
R
L
 
L
I
 
V
G
|
G
K
x
D
E
 
A
G
 
T
G
 
V
M
 
I
P
 
P
Y
 
H
D
 
H
R
x
L
P
|
P
P
 
P
L
 
L
S
 
S
K
|
K
R
 
A
L
 
Y
M
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
K
C
 
A
P
 
T
V
 
A
E
 
E
A
 
S
L
 
L
N
 
Y
L
 
L
V
 
R
S
 
T
E
 
P
D
 
D
G
 
A
M
 
Y
K
 
A
A
 
A
L
 
Q
N
 
N
L
 
I
H
 
Q
Y
 
L
L
 
L
D
 
G
G
 
G
T
 
T
S
 
Q
A
x
V
T
 
T
G
 
A
L
 
I
D
 
N
T
 
R
D
 
D
A
 
R
S
 
Q
S
 
Q
L
 
V
Q
 
I
L
 
L
S
 
S
N
 
D
G
 
G
S
 
R
T
 
A
L
 
L
Q
 
D
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
L
L
 
V
I
 
L
A
|
A
T
|
T
G
|
G
A
 
G
D
 
R
A
 
P
R
 
R
V
 
P
I
 
L
P
 
P
N
 
V
L
 
A
S
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
G
Q
 
K
A
 
A
A
 
N
N
 
N
C
 
F
Y
 
R
S
 
Y
L
 
L
R
|
R
N
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
E
A
 
C
I
 
I
R
 
R
E
 
R
H
 
Q
L
 
L
T
 
I
A
 
A
G
 
D
K
 
N
R
 
R
V
 
L
L
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
F
 
Y
I
|
I
G
 
G
T
 
L
E
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
T
A
 
A
K
 
I
T
 
K
S
 
A
G
 
N
C
 
M
E
 
H
V
 
V
T
 
T
V
 
L
I
 
L
D
 
D
K
 
T
S
 
A
K
 
A
V
 
R
P
 
V
L
 
L
G
 
E
A
 
R
R
 
V
V
 
T
G
 
A
D
 
P
I
 
P
V
 
V
G
 
S
K
 
A
R
 
F
I
 
Y
E
 
E
K
 
H
L
 
L
H
 
H
E
 
R
A
 
E
N
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
D
F
 
I
H
 
R
N
 
T
D
 
G
C
 
T
E
 
Q
L
 
V
-
 
C
-
 
G
R
 
F
E
 
E
V
 
M
K
 
S
W
 
T
R
 
D
D
 
Q
R
 
Q
T
 
K
I
 
V
T
 
T
E
 
A
V
 
V
R
 
L
L
 
C
D
 
E
T
 
D
G
 
G
V
 
T
V
 
R
I
 
L
A
 
P
C
 
A
D
 
D
V
 
L
I
 
V
V
 
I
V
 
A
A
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
L
V
 
I
P
 
P
S
 
N
V
 
C
Q
 
E
W
 
L
C
 
A
S
 
S
-
 
A
-
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
Q
I
 
V
R
 
D
S
 
N
G
 
G
V
 
I
V
 
V
C
 
I
N
 
N
E
 
E
Y
 
H
C
 
M
E
 
Q
A
 
T
A
 
S
-
 
D
P
 
P
N
 
L
V
 
I
Y
 
M
A
 
A
A
 
V
G
 
G
D
|
D
A
 
C
A
 
A
E
 
R
W
 
F
F
 
H
H
 
S
K
 
Q
G
 
L
Y
 
Y
G
 
D
E
 
R
H
 
W
M
 
V
R
 
R
I
 
I
E
 
E
H
x
S
R
x
V
T
 
P
N
 
N
A
 
A
S
x
L
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
M
 
R
A
 
K
A
 
I
A
 
A
K
 
A
N
 
I
M
 
L
L
 
C
G
 
G
S
 
K
R
 
V
V
 
P
E
 
R
Y
 
D
A
 
E
P
 
A
L
 
A
P
 
P
F
 
W
F
 
F
W
|
W
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
E
V
 
I
Q
 
G
I
 
L
H
 
K
S
 
M
Y
 
V
G
 
G
R
 
-
I
 
L
G
 
S
P
 
E
Q
 
G
Y
 
Y
T
 
D
V
 
R
E
 
I
V
 
I
V
 
V
E
 
R
G
 
G
D
 
S
Q
 
L
L
 
A
K
 
Q
D
 
P
D
 
D
S
 
F
C
 
S
I
 
V
F
 
F
R
 
-
Y
 
Y
Y
 
L
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
V
 
R
L
 
V
M
 
L
G
 
A
V
 
V

6tukB Crystal structure of fdr9 (see paper)
35% identity, 93% coverage: 5:347/369 of query aligns to 2:337/393 of 6tukB

query
sites
6tukB
E
 
E
H
 
R
I
 
I
V
 
V
V
 
I
V
|
V
G
|
G
A
x
G
S
x
G
A
 
L
A
|
A
G
 
A
I
 
S
T
 
R
A
 
T
A
 
C
R
 
E
A
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
S
Q
 
R
G
 
G
W
 
Y
G
 
E
G
 
G
R
 
E
L
 
L
T
 
V
L
 
M
I
 
L
G
 
C
K
x
A
E
|
E
G
 
P
G
 
H
M
 
P
P
 
P
Y
 
Y
D
 
D
R
|
R
P
|
P
P
 
P
L
 
L
S
 
S
K
|
K
R
 
A
L
 
A
M
 
L
A
 
L
G
 
E
E
 
E
C
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
E
A
 
H
L
 
D
N
 
S
L
 
T
V
 
F
S
 
P
E
 
T
D
 
D
G
 
Y
M
 
A
K
 
Q
A
 
-
L
 
L
N
 
S
L
 
V
H
 
D
Y
 
V
L
 
R
D
 
L
G
 
G
T
 
V
S
x
A
A
|
A
T
 
T
G
 
G
L
 
L
D
 
V
T
 
P
D
 
D
A
 
A
S
 
R
S
 
T
L
 
V
Q
 
Q
L
 
T
S
 
T
N
 
D
G
 
G
S
 
E
T
 
-
L
 
L
Q
 
S
Y
 
Y
D
 
D
R
 
A
L
 
L
L
 
V
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
D
 
S
A
 
P
R
 
I
V
 
R
I
 
L
P
 
P
N
 
G
L
 
-
S
 
-
Q
 
-
A
 
P
A
 
G
N
 
R
C
 
Q
Y
 
F
S
 
T
L
x
V
R
|
R
N
 
T
L
 
V
N
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
A
A
 
Q
I
 
L
R
 
R
E
 
A
H
 
E
L
 
L
T
 
K
A
 
P
G
 
G
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
L
 
V
V
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
S
F
 
W
I
 
I
G
 
S
T
 
A
E
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
T
I
 
A
A
 
A
K
 
L
T
 
R
S
 
R
G
 
G
C
 
C
E
 
S
V
 
V
T
 
T
V
 
C
I
 
I
D
 
E
K
 
A
S
 
G
K
 
P
V
 
A
P
 
P
L
 
L
G
 
S
A
 
A
R
 
A
V
 
L
G
 
G
D
 
A
I
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
R
 
R
I
 
F
E
 
-
K
 
-
L
 
L
H
 
P
E
 
W
A
 
W
N
 
S
G
 
E
V
 
V
V
 
D
F
 
L
H
 
R
N
 
L
D
 
D
C
 
T
E
 
G
L
 
V
R
 
A
E
 
E
V
 
V
K
 
-
W
 
-
R
 
-
D
 
-
R
 
-
T
 
T
I
 
E
T
 
T
E
 
G
V
 
V
R
 
Q
L
 
L
D
 
A
T
 
N
G
 
G
V
 
E
V
 
Q
I
 
V
A
 
D
C
 
A
D
 
D
V
 
V
I
 
V
V
 
V
V
 
T
A
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
V
V
 
R
P
 
P
S
 
A
V
 
V
Q
 
D
W
 
W
C
 
L
-
 
S
-
 
G
S
 
S
G
 
G
L
 
I
N
 
A
I
 
L
R
 
D
S
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
V
C
 
V
N
 
D
E
 
E
Y
 
H
C
 
L
E
 
R
A
 
T
A
 
S
-
 
L
P
 
P
N
 
G
V
 
I
Y
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
D
|
D
A
 
V
A
 
A
E
 
V
W
 
R
F
 
W
H
 
S
K
 
P
G
 
R
Y
 
W
G
 
N
E
 
T
H
 
R
M
 
I
R
 
R
I
 
V
E
 
E
H
|
H
R
x
W
T
 
D
N
 
D
A
 
A
S
 
R
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
M
 
R
A
 
T
A
 
L
A
 
A
K
 
G
N
 
V
M
 
L
L
 
L
G
 
H
S
 
D
R
 
P
V
 
S
E
 
S
Y
 
Q
A
 
D
P
 
P
L
 
L
-
 
P
-
 
V
-
 
H
-
 
D
-
 
P
-
 
V
P
 
P
F
 
Y
F
|
F
W
|
W
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
F
Q
 
G
V
 
H
Q
 
K
I
 
I
H
 
Q
S
 
Y
Y
 
V
G
 
G
R
 
H
I
 
H
G
 
S
P
 
P
Q
 
E
Y
 
D
T
 
T
V
 
L
E
 
-
V
 
V
V
 
I
E
 
R
G
 
G
D
 
D

4h4uA Crystal structure of ferredoxin reductase, bpha4 t176r mutant (reduced form)
35% identity, 89% coverage: 7:333/369 of query aligns to 6:328/401 of 4h4uA

query
sites
4h4uA
I
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
S
x
G
A
x
L
A
|
A
G
 
S
I
 
V
T
 
S
A
 
F
A
 
V
R
 
A
A
 
E
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
Q
 
A
G
 
G
W
 
Y
G
 
Q
G
 
G
R
 
L
L
 
I
T
 
T
L
 
V
I
 
V
G
 
G
K
x
D
E
 
E
G
 
A
G
 
E
M
 
R
P
 
P
Y
 
Y
D
 
D
R
|
R
P
|
P
P
 
P
L
 
L
S
 
S
K
 
K
R
 
D
L
 
F
M
 
M
A
 
A
G
 
-
E
 
H
C
 
G
P
 
D
V
 
A
E
 
E
A
 
K
L
 
I
N
 
R
L
 
L
V
 
-
S
 
-
E
 
-
D
 
D
G
 
C
M
 
K
K
 
R
A
 
A
L
 
P
N
 
E
L
 
V
H
 
E
Y
 
W
L
 
L
D
 
L
G
 
G
T
 
V
S
 
T
A
|
A
T
 
Q
G
 
S
L
 
F
D
 
D
T
 
P
D
 
Q
A
 
A
S
 
H
S
 
T
L
 
V
Q
 
A
L
 
L
S
 
S
N
 
D
G
 
G
S
 
R
T
 
T
L
 
L
Q
 
P
Y
 
Y
D
 
G
R
 
T
L
 
L
L
 
V
I
 
L
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
D
 
A
A
 
P
R
 
R
V
 
A
I
 
L
P
 
P
N
 
T
L
 
L
S
 
Q
Q
 
G
A
 
A
A
 
T
-
 
M
N
 
P
C
 
V
Y
 
H
S
 
T
L
|
L
R
|
R
N
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
R
A
 
R
I
 
I
R
 
Q
E
 
A
H
 
G
L
 
L
T
 
R
A
 
P
G
 
Q
K
 
S
R
 
R
V
 
L
L
 
L
V
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
G
F
x
V
I
|
I
G
 
G
T
 
L
E
|
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
T
A
 
A
K
 
R
T
 
T
S
 
A
G
 
G
C
 
V
E
 
H
V
 
V
T
 
S
V
 
L
I
 
V
D
x
E
K
x
R
S
x
Q
K
 
P
V
 
R
P
 
L
L
 
M
G
 
S
A
 
R
R
 
A
V
 
A
G
 
P
D
 
A
I
 
T
V
 
L
G
 
A
K
 
D
R
 
F
I
 
V
E
 
A
K
 
R
L
 
Y
H
 
H
E
 
A
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
V
 
-
F
 
-
H
 
-
N
 
-
D
 
-
C
 
-
E
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
F
V
 
-
K
 
-
W
 
-
R
 
-
D
 
E
R
 
R
T
 
S
I
 
V
T
 
T
E
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
V
V
 
V
R
 
L
L
 
L
D
 
D
T
 
D
G
 
G
V
 
T
V
 
R
I
 
I
A
 
A
C
 
A
D
 
D
V
 
M
I
 
V
V
 
V
V
 
V
A
x
G
I
|
I
G
|
G
A
 
V
V
 
L
P
 
A
-
 
N
-
 
D
S
 
A
V
 
L
Q
 
A
W
 
R
C
 
A
S
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
A
I
 
C
R
 
D
S
 
D
G
 
G
V
 
I
V
 
F
C
 
V
N
 
D
E
 
A
Y
 
Y
C
 
G
E
 
R
A
 
T
A
 
T
-
 
C
P
 
P
N
 
D
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
D
|
D
A
 
V
A
 
T
E
 
R
W
 
Q
F
 
R
H
 
N
K
 
P
G
 
L
Y
 
S
G
 
G
E
 
R
H
 
F
M
 
E
R
 
R
I
|
I
E
|
E
H
x
T
R
x
W
T
 
S
N
 
N
A
|
A
S
x
Q
E
 
N
Q
 
Q
A
 
G
M
 
I
A
 
A
A
 
V
A
 
A
K
 
R
N
 
H
M
 
L
L
 
V
G
 
D
S
 
P
R
 
T
V
 
A
E
 
P
-
 
G
Y
 
Y
A
 
A
P
 
E
L
 
L
P
 
P
F
 
W
F
x
Y
W
|
W
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
G
Q
 
A
V
 
L
Q
 
R
I
 
I
H
 
Q
S
 
V
Y
 
A
G
 
G

2gr2A Crystal structure of ferredoxin reductase, bpha4 (oxidized form)
35% identity, 89% coverage: 7:333/369 of query aligns to 5:327/401 of 2gr2A

query
sites
2gr2A
I
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
S
x
G
A
x
L
A
|
A
G
 
S
I
 
V
T
 
S
A
 
F
A
 
V
R
 
A
A
 
E
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
Q
 
A
G
 
G
W
 
Y
G
 
Q
G
 
G
R
 
L
L
 
I
T
 
T
L
 
V
I
 
V
G
 
G
K
x
D
E
|
E
G
 
A
G
 
E
M
 
R
P
 
P
Y
 
Y
D
 
D
R
|
R
P
|
P
P
 
P
L
 
L
S
 
S
K
|
K
R
 
D
L
 
F
M
 
M
A
 
A
G
 
-
E
 
H
C
 
G
P
 
D
V
 
A
E
 
E
A
 
K
L
 
I
N
 
R
L
 
L
V
 
-
S
 
-
E
 
-
D
 
D
G
 
C
M
 
K
K
 
R
A
 
A
L
 
P
N
 
E
L
 
V
H
 
E
Y
 
W
L
 
L
D
 
L
G
 
G
T
 
V
S
 
T
A
|
A
T
 
Q
G
 
S
L
 
F
D
 
D
T
 
P
D
 
Q
A
 
A
S
 
H
S
 
T
L
 
V
Q
 
A
L
 
L
S
 
S
N
 
D
G
 
G
S
 
R
T
 
T
L
 
L
Q
 
P
Y
 
Y
D
 
G
R
 
T
L
 
L
L
 
V
I
 
L
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
D
 
A
A
 
P
R
|
R
V
 
A
I
 
L
P
 
P
N
 
T
L
 
L
S
 
Q
Q
 
G
A
 
A
A
 
T
-
 
M
N
 
P
C
 
V
Y
 
H
S
 
T
L
 
L
R
|
R
N
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
R
A
 
R
I
 
I
R
 
Q
E
 
A
H
 
G
L
 
L
T
 
R
A
 
P
G
 
Q
K
 
S
R
 
R
V
 
L
L
 
L
V
 
I
V
|
V
G
|
G
A
 
G
G
|
G
F
x
V
I
|
I
G
 
G
T
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
T
A
 
A
K
 
R
T
 
T
S
 
A
G
 
G
C
 
V
E
 
H
V
 
V
T
 
S
V
 
L
I
 
V
D
x
E
K
x
T
S
 
Q
K
 
P
V
 
R
P
 
L
L
 
M
G
 
S
A
x
R
R
 
A
V
 
A
G
 
P
D
 
A
I
 
T
V
 
L
G
 
A
K
 
D
R
 
F
I
 
V
E
 
A
K
 
R
L
 
Y
H
 
H
E
 
A
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
V
 
-
F
 
-
H
 
-
N
 
-
D
 
-
C
 
-
E
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
F
V
 
-
K
 
-
W
 
-
R
 
-
D
 
E
R
 
R
T
 
S
I
 
V
T
 
T
E
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
V
V
 
V
R
 
L
L
 
L
D
 
D
T
 
D
G
 
G
V
 
T
V
 
R
I
 
I
A
 
A
C
 
A
D
 
D
V
 
M
I
 
V
V
 
V
V
 
V
A
x
G
I
|
I
G
|
G
A
 
V
V
 
L
P
 
A
-
 
N
-
 
D
S
 
A
V
 
L
Q
 
A
W
 
R
C
 
A
S
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
A
I
 
C
R
 
D
S
 
D
G
 
G
V
 
I
V
 
F
C
 
V
N
 
D
E
 
A
Y
 
Y
C
 
G
E
 
R
A
 
T
A
 
T
-
 
C
P
 
P
N
 
D
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
D
|
D
A
 
V
A
 
T
E
 
R
W
 
Q
F
 
R
H
 
N
K
 
P
G
 
L
Y
 
S
G
 
G
E
 
R
H
 
F
M
 
E
R
 
R
I
 
I
E
|
E
H
x
T
R
x
W
T
 
S
N
 
N
A
|
A
S
x
Q
E
 
N
Q
 
Q
A
 
G
M
 
I
A
 
A
A
 
V
A
 
A
K
 
R
N
 
H
M
 
L
L
 
V
G
 
D
S
 
P
R
 
T
V
 
A
E
 
P
-
 
G
Y
 
Y
A
 
A
P
 
E
L
 
L
P
 
P
F
 
W
F
 
Y
W
|
W
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
G
Q
 
A
V
 
L
Q
 
R
I
 
I
H
 
Q
S
 
V
Y
 
A
G
 
G

2gr0A Crystal structure of ferredoxin reductase, bpha4 (oxidized form, NAD+ complex) (see paper)
35% identity, 89% coverage: 7:333/369 of query aligns to 5:327/401 of 2gr0A

query
sites
2gr0A
I
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
S
x
G
A
x
L
A
|
A
G
 
S
I
 
V
T
 
S
A
 
F
A
 
V
R
 
A
A
 
E
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
Q
 
A
G
 
G
W
 
Y
G
 
Q
G
 
G
R
 
L
L
 
I
T
 
T
L
 
V
I
 
V
G
 
G
K
x
D
E
|
E
G
 
A
G
 
E
M
 
R
P
 
P
Y
 
Y
D
 
D
R
|
R
P
|
P
P
 
P
L
 
L
S
 
S
K
|
K
R
 
D
L
 
F
M
 
M
A
 
A
G
 
-
E
 
H
C
 
G
P
 
D
V
 
A
E
 
E
A
 
K
L
 
I
N
 
R
L
 
L
V
 
-
S
 
-
E
 
-
D
 
D
G
 
C
M
 
K
K
 
R
A
 
A
L
 
P
N
 
E
L
 
V
H
 
E
Y
 
W
L
 
L
D
 
L
G
 
G
T
 
V
S
x
T
A
|
A
T
 
Q
G
 
S
L
 
F
D
 
D
T
 
P
D
 
Q
A
 
A
S
 
H
S
 
T
L
 
V
Q
 
A
L
 
L
S
 
S
N
 
D
G
 
G
S
 
R
T
 
T
L
 
L
Q
 
P
Y
 
Y
D
 
G
R
 
T
L
 
L
L
 
V
I
 
L
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
D
 
A
A
 
P
R
 
R
V
 
A
I
 
L
P
 
P
N
 
T
L
 
L
S
 
Q
Q
 
G
A
 
A
A
 
T
-
 
M
N
 
P
C
 
V
Y
 
H
S
 
T
L
 
L
R
|
R
N
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
R
A
 
R
I
 
I
R
 
Q
E
 
A
H
 
G
L
 
L
T
 
R
A
 
P
G
 
Q
K
 
S
R
 
R
V
 
L
L
 
L
V
 
I
V
|
V
G
|
G
A
 
G
G
|
G
F
 
V
I
|
I
G
 
G
T
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
T
A
 
A
K
 
R
T
 
T
S
 
A
G
 
G
C
 
V
E
 
H
V
 
V
T
 
S
V
 
L
I
 
V
D
x
E
K
x
T
S
 
Q
K
 
P
V
 
R
P
 
L
L
 
M
G
 
S
A
x
R
R
 
A
V
 
A
G
 
P
D
 
A
I
 
T
V
 
L
G
 
A
K
 
D
R
 
F
I
 
V
E
 
A
K
 
R
L
 
Y
H
 
H
E
 
A
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
V
 
-
F
 
-
H
 
-
N
 
-
D
 
-
C
 
-
E
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
F
V
 
-
K
 
-
W
 
-
R
 
-
D
 
E
R
 
R
T
 
S
I
 
V
T
 
T
E
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
V
V
 
V
R
 
L
L
 
L
D
 
D
T
 
D
G
 
G
V
 
T
V
 
R
I
 
I
A
 
A
C
 
A
D
 
D
V
 
M
I
 
V
V
 
V
V
 
V
A
x
G
I
|
I
G
|
G
A
 
V
V
 
L
P
 
A
-
 
N
-
 
D
S
 
A
V
 
L
Q
 
A
W
 
R
C
 
A
S
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
A
I
 
C
R
 
D
S
 
D
G
 
G
V
 
I
V
 
F
C
 
V
N
 
D
E
 
A
Y
 
Y
C
 
G
E
 
R
A
 
T
A
 
T
-
 
C
P
 
P
N
 
D
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
D
|
D
A
 
V
A
 
T
E
 
R
W
 
Q
F
 
R
H
 
N
K
 
P
G
 
L
Y
 
S
G
 
G
E
 
R
H
 
F
M
 
E
R
 
R
I
 
I
E
|
E
H
x
T
R
x
W
T
 
S
N
 
N
A
|
A
S
x
Q
E
 
N
Q
 
Q
A
 
G
M
 
I
A
 
A
A
 
V
A
 
A
K
 
R
N
 
H
M
 
L
L
 
V
G
 
D
S
 
P
R
 
T
V
 
A
E
 
P
-
 
G
Y
 
Y
A
 
A
P
 
E
L
 
L
P
 
P
F
 
W
F
 
Y
W
|
W
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
G
Q
 
A
V
 
L
Q
 
R
I
 
I
H
 
Q
S
 
V
Y
 
A
G
 
G

1f3pA Ferredoxin reductase (bpha4)-nadh complex (see paper)
35% identity, 89% coverage: 7:333/369 of query aligns to 6:328/401 of 1f3pA

query
sites
1f3pA
I
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
G
A
x
L
A
|
A
G
 
S
I
 
V
T
 
S
A
 
F
A
 
V
R
 
A
A
 
E
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
Q
 
A
G
 
G
W
 
Y
G
 
Q
G
 
G
R
 
L
L
 
I
T
 
T
L
 
V
I
x
V
G
 
G
K
x
D
E
|
E
G
 
A
G
 
E
M
 
R
P
 
P
Y
 
Y
D
 
D
R
|
R
P
|
P
P
 
P
L
 
L
S
 
S
K
 
K
R
 
D
L
 
F
M
 
M
A
 
A
G
 
-
E
 
H
C
 
G
P
 
D
V
 
A
E
 
E
A
 
K
L
 
I
N
 
R
L
 
L
V
 
-
S
 
-
E
 
-
D
 
D
G
 
C
M
 
K
K
 
R
A
 
A
L
 
P
N
 
E
L
 
V
H
 
E
Y
 
W
L
 
L
D
 
L
G
 
G
T
 
V
S
 
T
A
|
A
T
 
Q
G
 
S
L
 
F
D
 
D
T
 
P
D
 
Q
A
 
A
S
 
H
S
 
T
L
 
V
Q
 
A
L
 
L
S
 
S
N
 
D
G
 
G
S
 
R
T
 
T
L
 
L
Q
 
P
Y
 
Y
D
 
G
R
 
T
L
 
L
L
 
V
I
 
L
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
D
 
A
A
 
P
R
 
R
V
 
A
I
 
L
P
 
P
N
 
T
L
 
L
S
 
Q
Q
 
G
A
 
A
A
 
T
-
 
M
N
 
P
C
 
V
Y
 
H
S
 
T
L
 
L
R
|
R
N
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
R
A
 
R
I
 
I
R
 
Q
E
 
A
H
 
G
L
 
L
T
 
R
A
 
P
G
 
Q
K
 
S
R
 
R
V
 
L
L
 
L
V
 
I
V
|
V
G
|
G
A
 
G
G
|
G
F
x
V
I
|
I
G
 
G
T
 
L
E
|
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
T
A
 
A
K
 
R
T
 
T
S
 
A
G
 
G
C
 
V
E
 
H
V
 
V
T
 
S
V
 
L
I
 
V
D
x
E
K
x
T
S
 
Q
K
 
P
V
 
R
P
 
L
L
 
M
G
 
S
A
x
R
R
 
A
V
 
A
G
 
P
D
 
A
I
 
T
V
 
L
G
 
A
K
 
D
R
 
F
I
 
V
E
 
A
K
 
R
L
 
Y
H
 
H
E
 
A
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
V
 
-
F
 
-
H
 
-
N
 
-
D
 
-
C
 
-
E
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
F
V
 
-
K
 
-
W
 
-
R
 
-
D
 
E
R
 
R
T
 
S
I
 
V
T
 
T
E
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
V
V
 
V
R
 
L
L
 
L
D
 
D
T
 
D
G
 
G
V
 
T
V
 
R
I
 
I
A
 
A
C
 
A
D
 
D
V
 
M
I
 
V
V
 
V
V
 
V
A
x
G
I
|
I
G
|
G
A
x
V
V
 
L
P
 
A
-
 
N
-
 
D
S
 
A
V
 
L
Q
 
A
W
 
R
C
 
A
S
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
A
I
 
C
R
 
D
S
 
D
G
 
G
V
 
I
V
 
F
C
 
V
N
 
D
E
 
A
Y
 
Y
C
 
G
E
 
R
A
 
T
A
 
T
-
 
C
P
 
P
N
 
D
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
D
|
D
A
 
V
A
 
T
E
 
R
W
 
Q
F
 
R
H
 
N
K
 
P
G
 
L
Y
 
S
G
 
G
E
 
R
H
 
F
M
 
E
R
 
R
I
 
I
E
|
E
H
x
T
R
x
W
T
 
S
N
 
N
A
|
A
S
x
Q
E
 
N
Q
 
Q
A
 
G
M
 
I
A
 
A
A
 
V
A
 
A
K
 
R
N
 
H
M
 
L
L
 
V
G
 
D
S
 
P
R
 
T
V
 
A
E
 
P
-
 
G
Y
 
Y
A
 
A
P
 
E
L
 
L
P
 
P
F
 
W
F
 
Y
W
|
W
S
|
S
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
G
Q
 
A
V
 
L
Q
 
R
I
 
I
H
 
Q
S
 
V
Y
 
A
G
 
G

2yvjA Crystal structure of the ferredoxin-ferredoxin reductase (bpha3-bpha4)complex (see paper)
35% identity, 89% coverage: 7:333/369 of query aligns to 6:328/402 of 2yvjA

query
sites
2yvjA
I
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
L
G
|
G
A
 
A
S
x
G
A
x
L
A
 
A
G
 
S
I
 
V
T
 
S
A
 
F
A
 
V
R
 
A
A
 
E
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
Q
 
A
G
 
G
W
 
Y
G
 
Q
G
 
G
R
 
L
L
 
I
T
 
T
L
 
V
I
 
V
G
|
G
K
x
D
E
|
E
G
 
A
G
 
E
M
 
R
P
 
P
Y
 
Y
D
 
D
R
|
R
P
|
P
P
 
P
L
 
L
S
 
S
K
 
K
R
 
D
L
 
F
M
 
M
A
 
A
G
 
-
E
 
H
C
 
G
P
 
D
V
 
A
E
 
E
A
 
K
L
 
I
N
 
R
L
 
L
V
 
-
S
 
-
E
 
-
D
 
D
G
 
C
M
 
K
K
 
R
A
 
A
L
 
P
N
 
E
L
 
V
H
 
E
Y
 
W
L
 
L
D
 
L
G
 
G
T
 
V
S
 
T
A
|
A
T
 
Q
G
 
S
L
 
F
D
 
D
T
 
P
D
 
Q
A
 
A
S
 
H
S
 
T
L
 
V
Q
 
A
L
 
L
S
 
S
N
 
D
G
 
G
S
 
R
T
 
T
L
 
L
Q
 
P
Y
 
Y
D
 
G
R
 
T
L
 
L
L
 
V
I
 
L
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
D
 
A
A
 
P
R
 
R
V
 
A
I
 
L
P
 
P
N
 
T
L
 
L
S
 
Q
Q
 
G
A
 
A
A
 
T
-
 
M
N
 
P
C
 
V
Y
 
H
S
 
T
L
 
L
R
|
R
N
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
R
A
 
R
I
 
I
R
 
Q
E
 
A
H
 
G
L
 
L
T
 
R
A
 
P
G
 
Q
K
 
S
R
 
R
V
 
L
L
 
L
V
 
I
V
|
V
G
|
G
A
x
G
G
|
G
F
 
V
I
|
I
G
 
G
T
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
T
A
 
A
K
 
R
T
 
T
S
 
A
G
 
G
C
 
V
E
 
H
V
 
V
T
 
S
V
 
L
I
x
V
D
x
E
K
x
T
S
 
Q
K
 
P
V
 
R
P
 
L
L
 
M
G
 
S
A
x
R
R
 
A
V
 
A
G
 
P
D
 
A
I
 
T
V
 
L
G
 
A
K
 
D
R
 
F
I
 
V
E
 
A
K
 
R
L
 
Y
H
 
H
E
 
A
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
V
 
-
F
 
-
H
 
-
N
 
-
D
 
-
C
 
-
E
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
F
V
 
-
K
 
-
W
 
-
R
 
-
D
 
E
R
 
R
T
 
S
I
 
V
T
 
T
E
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
V
V
 
V
R
 
L
L
 
L
D
 
D
T
 
D
G
 
G
V
 
T
V
 
R
I
 
I
A
 
A
C
 
A
D
 
D
V
 
M
I
 
V
V
 
V
V
 
V
A
x
G
I
|
I
G
|
G
A
x
V
V
 
L
P
 
A
-
 
N
-
 
D
S
 
A
V
 
L
Q
 
A
W
 
R
C
 
A
S
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
A
I
 
C
R
 
D
S
 
D
G
 
G
V
 
I
V
 
F
C
 
V
N
 
D
E
 
A
Y
 
Y
C
 
G
E
 
R
A
 
T
A
 
T
-
 
C
P
 
P
N
 
D
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
D
|
D
A
 
V
A
 
T
E
 
R
W
 
Q
F
 
R
H
 
N
K
 
P
G
 
L
Y
 
S
G
 
G
E
 
R
H
 
F
M
 
E
R
 
R
I
 
I
E
|
E
H
x
T
R
x
W
T
 
S
N
 
N
A
|
A
S
x
Q
E
 
N
Q
 
Q
A
 
G
M
 
I
A
 
A
A
 
V
A
 
A
K
 
R
N
 
H
M
 
L
L
 
V
G
 
D
S
 
P
R
 
T
V
 
A
E
 
P
-
 
G
Y
 
Y
A
 
A
P
 
E
L
 
L
P
 
P
F
 
W
F
 
Y
W
|
W
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
G
Q
 
A
V
 
L
Q
 
R
I
 
I
H
 
Q
S
 
V
Y
 
A
G
 
G

8pxkA Structure of nadh-dependent ferredoxin reductase, bpha4, solved at wavelength 5.76 a (see paper)
35% identity, 89% coverage: 7:333/369 of query aligns to 7:329/403 of 8pxkA

query
sites
8pxkA
I
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
S
x
G
A
 
L
A
|
A
G
 
S
I
 
V
T
 
S
A
 
F
A
 
V
R
 
A
A
 
E
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
Q
 
A
G
 
G
W
 
Y
G
 
Q
G
 
G
R
 
L
L
 
I
T
 
T
L
 
V
I
 
V
G
 
G
K
x
D
E
|
E
G
 
A
G
 
E
M
 
R
P
 
P
Y
 
Y
D
 
D
R
|
R
P
|
P
P
 
P
L
 
L
S
 
S
K
|
K
R
 
D
L
 
F
M
 
M
A
 
A
G
 
-
E
 
H
C
 
G
P
 
D
V
 
A
E
 
E
A
 
K
L
 
I
N
 
R
L
 
L
V
 
-
S
 
-
E
 
-
D
 
D
G
 
C
M
 
K
K
 
R
A
 
A
L
 
P
N
 
E
L
 
V
H
 
E
Y
 
W
L
 
L
D
 
L
G
 
G
T
 
V
S
 
T
A
|
A
T
 
Q
G
 
S
L
 
F
D
 
D
T
 
P
D
 
Q
A
 
A
S
 
H
S
 
T
L
 
V
Q
 
A
L
 
L
S
 
S
N
 
D
G
 
G
S
 
R
T
 
T
L
 
L
Q
 
P
Y
 
Y
D
 
G
R
 
T
L
 
L
L
 
V
I
 
L
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
D
 
A
A
 
P
R
 
R
V
 
A
I
 
L
P
 
P
N
 
T
L
 
L
S
 
Q
Q
 
G
A
 
A
A
 
T
-
 
M
N
 
P
C
 
V
Y
 
H
S
 
T
L
 
L
R
|
R
N
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
R
A
 
R
I
 
I
R
 
Q
E
 
A
H
 
G
L
 
L
T
 
R
A
 
P
G
 
Q
K
 
S
R
 
R
V
 
L
L
 
L
V
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
G
F
 
V
I
|
I
G
 
G
T
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
T
A
 
A
K
 
R
T
 
T
S
 
A
G
 
G
C
 
V
E
 
H
V
 
V
T
 
S
V
 
L
I
 
V
D
 
E
K
 
T
S
 
Q
K
 
P
V
 
R
P
 
L
L
 
M
G
 
S
A
 
R
R
 
A
V
 
A
G
 
P
D
 
A
I
 
T
V
 
L
G
 
A
K
 
D
R
 
F
I
 
V
E
 
A
K
 
R
L
 
Y
H
 
H
E
 
A
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
V
 
-
F
 
-
H
 
-
N
 
-
D
 
-
C
 
-
E
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
F
V
 
-
K
 
-
W
 
-
R
 
-
D
 
E
R
 
R
T
 
S
I
 
V
T
 
T
E
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
V
V
 
V
R
 
L
L
 
L
D
 
D
T
 
D
G
 
G
V
 
T
V
 
R
I
 
I
A
 
A
C
 
A
D
 
D
V
 
M
I
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
V
V
 
L
P
 
A
-
 
N
-
 
D
S
 
A
V
 
L
Q
 
A
W
 
R
C
 
A
S
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
A
I
 
C
R
 
D
S
 
D
G
 
G
V
 
I
V
 
F
C
 
V
N
 
D
E
 
A
Y
 
Y
C
 
G
E
 
R
A
 
T
A
 
T
-
 
C
P
 
P
N
 
D
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
D
|
D
A
 
V
A
 
T
E
 
R
W
 
Q
F
 
R
H
 
N
K
 
P
G
 
L
Y
 
S
G
 
G
E
 
R
H
 
F
M
 
E
R
 
R
I
 
I
E
|
E
H
x
T
R
x
W
T
 
S
N
 
N
A
|
A
S
 
Q
E
 
N
Q
 
Q
A
 
G
M
 
I
A
 
A
A
 
V
A
 
A
K
 
R
N
 
H
M
 
L
L
 
V
G
 
D
S
 
P
R
 
T
V
 
A
E
 
P
-
 
G
Y
 
Y
A
 
A
P
 
E
L
 
L
P
 
P
F
 
W
F
 
Y
W
|
W
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
G
Q
 
A
V
 
L
Q
 
R
I
 
I
H
 
Q
S
 
V
Y
 
A
G
 
G

4h4wA Crystal structure of ferredoxin reductase, bpha4 e175c/t176r/q177g mutant (reduced form)
35% identity, 89% coverage: 7:333/369 of query aligns to 5:327/399 of 4h4wA

query
sites
4h4wA
I
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
S
x
G
A
x
L
A
|
A
G
 
S
I
 
V
T
 
S
A
 
F
A
 
V
R
 
A
A
 
E
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
Q
 
A
G
 
G
W
 
Y
G
 
Q
G
 
G
R
 
L
L
 
I
T
 
T
L
 
V
I
 
V
G
 
G
K
x
D
E
 
E
G
 
A
G
 
E
M
 
R
P
 
P
Y
 
Y
D
 
D
R
|
R
P
|
P
P
 
P
L
 
L
S
 
S
K
 
K
R
 
D
L
 
F
M
 
M
A
 
A
G
 
-
E
 
H
C
 
G
P
 
D
V
 
A
E
 
E
A
 
K
L
 
I
N
 
R
L
 
L
V
 
-
S
 
-
E
 
-
D
 
D
G
 
C
M
 
K
K
 
R
A
 
A
L
 
P
N
 
E
L
 
V
H
 
E
Y
 
W
L
 
L
D
 
L
G
 
G
T
 
V
S
 
T
A
|
A
T
 
Q
G
 
S
L
 
F
D
 
D
T
 
P
D
 
Q
A
 
A
S
 
H
S
 
T
L
 
V
Q
 
A
L
 
L
S
 
S
N
 
D
G
 
G
S
 
R
T
 
T
L
 
L
Q
 
P
Y
 
Y
D
 
G
R
 
T
L
 
L
L
 
V
I
 
L
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
D
 
A
A
 
P
R
 
R
V
 
A
I
 
L
P
 
P
N
 
T
L
 
L
S
 
Q
Q
 
G
A
 
A
A
 
T
-
 
M
N
 
P
C
 
V
Y
 
H
S
 
T
L
 
L
R
|
R
N
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
R
A
 
R
I
 
I
R
 
Q
E
 
A
H
 
G
L
 
L
T
 
R
A
 
P
G
 
Q
K
 
S
R
 
R
V
 
L
L
 
L
V
 
I
V
 
V
G
 
G
A
x
G
G
 
G
F
 
V
I
|
I
G
 
G
T
 
L
E
|
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
T
A
 
A
K
 
R
T
 
T
S
 
A
G
 
G
C
 
V
E
 
H
V
 
V
T
 
S
V
 
L
I
 
V
D
 
C
K
x
R
S
 
G
K
 
P
V
 
R
P
 
L
L
 
M
G
x
S
A
x
R
R
 
A
V
 
A
G
 
P
D
 
A
I
 
T
V
 
L
G
 
A
K
 
D
R
 
F
I
 
V
E
 
A
K
 
R
L
 
Y
H
 
H
E
 
A
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
V
 
-
F
 
-
H
 
-
N
 
-
D
 
-
C
 
-
E
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
F
V
 
-
K
 
-
W
 
-
R
 
-
D
 
E
R
 
R
T
 
S
I
 
V
T
 
T
E
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
V
V
 
V
R
 
L
L
 
L
D
 
D
T
 
D
G
 
G
V
 
T
V
 
R
I
 
I
A
 
A
C
 
A
D
 
D
V
 
M
I
 
V
V
 
V
V
 
V
A
x
G
I
|
I
G
|
G
A
 
V
V
 
L
P
 
A
-
 
N
-
 
D
S
 
A
V
 
L
Q
 
A
W
 
R
C
 
A
S
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
A
I
 
C
R
 
D
S
 
D
G
 
G
V
 
I
V
 
F
C
 
V
N
 
D
E
 
A
Y
 
Y
C
 
G
E
 
R
A
 
T
A
 
T
-
 
C
P
 
P
N
 
D
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
D
|
D
A
 
V
A
 
T
E
 
R
W
 
Q
F
 
R
H
 
N
K
 
P
G
 
L
Y
 
S
G
 
G
E
 
R
H
 
F
M
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
E
H
x
T
R
x
W
T
 
S
N
 
N
A
|
A
S
x
Q
E
 
N
Q
 
Q
A
 
G
M
 
I
A
 
A
A
 
V
A
 
A
K
 
R
N
 
H
M
 
L
L
 
V
G
 
D
S
 
P
R
 
T
V
 
A
E
 
P
-
 
G
Y
 
Y
A
 
A
P
 
E
L
 
L
P
 
P
F
 
W
F
 
Y
W
|
W
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
G
Q
 
A
V
 
L
Q
 
R
I
 
I
H
 
Q
S
 
V
Y
 
A
G
 
G

3lxdA Crystal structure of ferredoxin reductase arr from novosphingobium aromaticivorans (see paper)
33% identity, 89% coverage: 7:333/369 of query aligns to 6:338/409 of 3lxdA

query
sites
3lxdA
I
 
V
V
 
V
V
 
I
V
|
V
G
|
G
A
 
A
S
x
G
A
x
H
A
x
G
G
 
G
I
 
A
T
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
Q
 
N
G
 
G
W
 
F
G
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
V
T
 
L
L
 
V
I
 
I
G
 
G
K
x
R
E
|
E
G
 
P
G
 
E
M
 
I
P
 
P
Y
 
Y
D
 
E
R
|
R
P
|
P
P
 
P
L
 
L
S
|
S
K
|
K
R
 
E
L
 
Y
M
 
L
A
 
A
G
 
R
E
 
E
C
 
K
P
 
T
V
 
F
E
 
E
A
 
R
L
 
I
N
 
C
L
 
I
V
 
R
S
 
P
E
 
A
D
 
Q
G
 
F
M
 
W
K
 
E
A
 
D
L
 
K
N
 
A
L
 
V
H
 
E
Y
 
M
L
 
K
D
 
L
G
 
G
T
 
A
S
x
E
A
x
V
T
 
V
G
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
P
D
 
A
A
 
A
S
 
H
S
 
T
L
 
V
Q
 
K
L
 
L
S
 
G
N
 
D
G
 
G
S
 
S
T
 
A
L
 
I
Q
 
E
Y
 
Y
D
 
G
R
 
K
L
 
L
L
 
I
I
 
W
A
 
A
T
|
T
G
 
G
A
 
G
D
 
D
A
 
P
R
 
R
V
 
R
I
 
L
P
 
S
N
 
C
L
 
V
-
 
G
S
 
A
Q
 
D
A
 
L
A
 
A
N
 
G
C
 
V
Y
 
H
S
 
A
L
 
V
R
 
R
N
 
T
L
 
K
N
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
D
A
 
R
I
 
L
R
 
M
E
 
A
H
 
E
L
 
L
T
 
D
A
 
A
G
 
G
-
 
A
K
 
K
R
 
N
V
 
A
L
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
F
 
Y
I
|
I
G
 
G
T
 
L
E
 
E
L
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
L
K
 
T
T
 
K
S
 
F
G
 
G
C
 
V
E
 
N
V
 
V
T
 
T
V
 
L
I
 
L
D
 
E
K
 
A
S
 
L
K
 
P
V
 
R
P
 
V
L
 
L
G
 
A
A
 
R
R
 
V
V
 
A
G
 
G
D
 
E
I
 
A
V
 
L
G
 
S
K
 
E
R
 
F
I
 
Y
E
 
Q
K
 
A
L
 
E
H
 
H
E
 
R
A
 
A
N
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
D
F
 
L
H
 
R
N
 
T
D
 
G
C
 
A
E
 
A
L
 
M
R
 
D
E
 
C
V
 
I
K
 
E
W
 
G
R
 
D
D
 
G
R
 
T
T
 
K
I
 
V
T
 
T
E
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
M
D
 
Q
T
 
D
G
 
G
V
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
P
C
 
A
D
 
D
V
 
I
I
 
V
V
 
I
V
 
V
A
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
I
V
 
V
P
 
P
S
 
C
V
 
V
Q
 
G
-
 
A
-
 
L
W
 
I
C
 
S
S
 
A
G
 
G
L
 
A
N
 
S
I
 
G
R
 
G
S
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
D
C
 
V
N
 
D
E
 
E
Y
 
F
C
 
C
E
 
R
A
 
T
A
 
S
-
 
L
P
 
T
N
 
D
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
A
 
I
G
|
G
D
|
D
-
 
C
A
 
A
A
 
A
E
 
H
W
 
A
F
 
N
H
 
D
K
 
F
G
 
A
Y
 
D
G
 
G
E
 
A
H
 
V
M
 
I
R
 
R
I
 
L
E
 
E
H
x
S
R
x
V
T
 
Q
N
 
N
A
 
A
S
x
N
E
 
D
Q
 
M
A
 
A
M
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
N
 
D
M
 
I
L
 
C
G
 
G
S
 
A
R
 
P
V
 
V
E
 
P
Y
 
Y
A
 
K
P
 
A
L
 
T
P
 
P
F
 
W
F
|
F
W
|
W
S
 
S
D
 
N
Q
 
Q
Y
 
Y
Q
 
D
V
 
L
Q
 
K
I
 
L
H
 
Q
S
 
T
Y
 
V
G
 
G

3fg2P Crystal structure of ferredoxin reductase for the cyp199a2 system from rhodopseudomonas palustris (see paper)
30% identity, 87% coverage: 5:324/369 of query aligns to 2:324/404 of 3fg2P

query
sites
3fg2P
E
 
D
H
 
T
I
 
V
V
 
L
V
 
I
V
 
A
G
|
G
A
 
A
S
x
G
A
x
H
A
|
A
G
 
G
I
 
F
T
 
Q
A
 
V
A
 
A
R
 
V
A
 
S
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
Q
 
A
G
 
K
W
 
Y
G
 
P
G
 
G
R
 
R
L
 
I
T
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
N
K
x
D
E
|
E
G
 
K
G
 
H
M
 
L
P
 
P
Y
 
Y
D
 
Q
R
|
R
P
|
P
P
 
P
L
 
L
S
|
S
K
|
K
R
 
A
L
 
Y
M
 
L
A
 
K
G
 
S
E
 
G
C
 
G
P
 
D
V
 
P
E
 
N
A
 
S
L
 
L
N
 
M
L
 
F
V
 
R
S
 
P
E
 
E
D
 
K
G
 
F
M
 
F
K
 
Q
A
 
D
L
 
Q
N
 
A
L
 
I
H
 
E
Y
 
L
L
 
I
D
 
S
G
 
D
T
x
R
S
x
M
A
 
V
T
 
S
G
 
-
L
 
I
D
 
D
T
 
R
D
 
E
A
 
G
S
 
R
S
 
K
L
 
L
Q
 
L
L
 
L
S
 
A
N
 
S
G
 
G
S
 
T
T
 
A
L
 
I
Q
 
E
Y
 
Y
D
 
G
R
 
H
L
 
L
L
 
V
I
 
L
A
 
A
T
|
T
G
 
G
A
 
A
D
 
R
A
 
N
R
 
R
V
 
M
-
 
L
-
 
D
I
 
V
P
 
P
N
 
N
L
 
A
S
 
S
Q
 
L
A
 
P
A
 
D
N
 
V
C
 
L
Y
 
Y
S
 
-
L
 
L
R
|
R
N
 
T
L
 
L
N
 
D
D
 
E
A
 
S
L
 
E
A
 
V
I
 
L
R
 
R
E
 
Q
H
 
R
L
 
M
T
 
P
A
 
D
G
 
K
K
 
K
R
 
H
V
 
V
L
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
I
|
I
G
 
G
T
 
L
E
 
E
L
 
F
A
 
A
A
 
A
I
 
T
A
 
A
K
 
R
T
 
A
S
 
K
G
 
G
C
 
L
E
 
E
V
 
V
T
 
D
V
 
V
I
 
V
D
 
E
K
 
L
S
 
A
K
 
P
V
 
R
P
 
V
L
 
M
G
 
A
A
 
R
R
 
V
V
 
V
G
 
T
D
 
P
I
 
E
V
 
I
G
 
S
K
 
S
R
 
Y
I
 
F
E
 
H
K
 
D
L
 
R
H
 
H
E
 
S
A
 
G
N
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
R
F
 
M
H
 
H
N
 
Y
D
 
G
C
 
V
E
 
R
L
 
A
R
 
T
E
 
E
V
 
I
K
 
A
W
 
A
R
 
E
D
 
G
R
 
D
T
 
R
I
 
V
T
 
T
E
 
G
V
 
V
R
 
V
L
 
L
D
 
S
T
 
D
G
 
G
V
 
N
V
 
T
I
 
L
A
 
P
C
 
C
D
 
D
V
 
L
I
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
V
V
 
I
P
 
P
S
 
N
V
 
V
Q
 
E
W
 
I
C
 
A
S
 
A
G
 
A
L
 
A
N
 
G
I
 
L
R
 
P
S
 
T
G
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
I
V
 
I
V
 
V
C
 
D
N
 
Q
E
 
Q
Y
 
L
C
 
L
E
 
T
A
 
S
A
 
D
P
 
P
N
 
H
V
 
I
Y
 
S
A
 
A
A
 
I
G
 
G
D
|
D
A
 
C
A
 
A
E
 
L
W
 
F
F
 
E
H
 
S
K
 
V
G
 
R
Y
 
F
G
 
G
E
 
E
H
 
T
M
 
M
R
 
R
I
 
V
E
 
E
H
x
S
R
x
V
T
 
Q
N
 
N
A
 
A
S
 
T
E
 
D
Q
 
Q
A
 
A
M
 
R
A
 
C
A
 
V
A
 
A
K
 
A
N
 
R
M
 
L
L
 
T
G
 
G
S
 
D
R
 
A
V
 
K
E
 
P
Y
 
Y
A
 
D
P
 
G
L
 
Y
P
 
P
F
 
W
F
 
F
W
|
W
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q

4emjA Complex between the reductase and ferredoxin components of toluene dioxygenase (see paper)
32% identity, 90% coverage: 6:337/369 of query aligns to 4:337/406 of 4emjA

query
sites
4emjA
H
 
H
I
 
V
V
 
A
V
 
I
V
 
I
G
 
G
A
 
N
S
x
G
A
x
V
A
x
G
G
 
G
I
 
F
T
 
T
A
 
T
A
 
A
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
W
 
F
G
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
I
T
 
S
L
 
L
I
 
I
G
 
G
K
x
D
E
|
E
G
 
P
G
 
H
M
 
L
P
 
P
Y
 
Y
D
 
D
R
|
R
P
|
P
P
 
S
L
 
L
S
|
S
K
|
K
R
 
A
L
 
V
M
 
L
A
 
D
G
 
G
E
 
S
C
 
L
P
 
E
V
 
R
E
 
P
A
 
P
L
 
I
N
 
-
L
 
L
V
 
A
S
 
E
E
 
A
D
 
D
G
 
W
M
 
Y
K
 
G
A
 
E
L
 
A
N
 
R
L
 
I
H
 
D
Y
 
M
L
 
L
D
 
T
G
 
G
T
 
P
S
 
E
A
x
V
T
 
T
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
D
 
Q
A
 
T
S
 
R
S
 
T
L
 
I
Q
 
S
L
 
L
S
 
D
N
 
D
G
 
G
S
 
T
T
 
T
L
 
L
Q
 
S
Y
 
A
D
 
D
R
 
A
L
 
I
L
 
V
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
S
D
 
R
A
 
A
R
 
R
V
 
T
-
 
M
-
 
A
I
 
L
P
 
P
N
 
G
L
 
-
S
 
S
Q
 
Q
A
 
L
A
 
P
N
 
G
C
 
V
Y
 
V
S
 
T
L
 
L
R
|
R
N
 
T
L
 
Y
N
 
G
D
 
D
A
 
V
L
 
Q
A
 
V
I
 
L
R
 
R
E
 
D
H
 
S
L
 
W
T
 
T
A
 
S
G
 
A
K
 
T
R
 
R
V
 
L
L
 
L
V
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
G
F
 
L
I
 
I
G
 
G
T
 
C
E
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
T
I
 
T
A
 
A
K
 
R
T
 
K
S
 
L
G
 
G
C
 
L
E
 
S
V
 
V
T
 
T
V
 
I
I
 
L
D
 
E
K
 
A
S
 
G
K
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
V
V
 
R
P
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
R
R
 
R
V
 
I
G
 
G
D
 
A
I
 
W
V
 
L
G
 
R
K
 
G
R
 
L
I
 
L
E
 
T
K
 
E
L
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
-
 
V
H
 
E
E
 
L
A
 
G
N
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
V
-
 
G
F
 
F
H
 
S
N
 
G
D
 
E
C
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
E
E
 
Q
V
 
V
K
 
M
W
 
A
R
 
S
D
 
D
R
 
-
T
 
-
I
 
-
T
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
G
V
 
R
V
 
S
I
 
F
A
 
V
C
 
A
D
 
D
V
 
S
I
 
A
V
 
L
V
 
I
A
 
C
I
 
V
G
 
G
A
 
A
V
 
E
P
 
P
S
 
A
V
 
D
Q
 
Q
W
 
L
C
 
A
-
 
R
-
 
Q
S
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
A
I
 
C
R
 
D
S
 
R
G
 
G
V
 
V
V
 
I
C
 
V
N
 
D
E
 
-
Y
 
H
C
 
C
E
 
G
A
 
A
-
 
T
-
 
L
A
 
A
P
 
K
N
 
G
V
 
V
Y
 
F
A
 
A
A
 
V
G
|
G
D
|
D
A
 
V
A
 
A
E
 
S
W
 
W
F
 
P
H
 
L
K
 
R
G
 
A
Y
 
G
G
 
G
E
 
R
H
 
R
M
 
-
R
 
S
I
 
L
E
 
E
H
x
T
R
x
Y
T
 
M
N
 
N
A
 
A
S
 
Q
E
 
R
Q
 
Q
A
 
A
M
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
A
K
 
A
N
 
A
M
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
K
R
 
N
V
 
V
E
 
S
Y
 
A
A
 
P
P
 
Q
L
 
L
P
 
P
F
 
V
F
x
S
W
|
W
S
 
T
D
 
E
Q
 
I
Y
 
A
Q
 
G
V
 
H
Q
 
R
I
 
M
H
 
Q
S
 
M
Y
 
A
G
 
G
R
 
D
I
 
I
-
 
E
G
 
G
P
 
P

4emiA Toluene dioxygenase reductase in reduced state in complex with NAD+ (see paper)
32% identity, 90% coverage: 6:337/369 of query aligns to 3:336/402 of 4emiA

query
sites
4emiA
H
 
H
I
 
V
V
 
A
V
 
I
V
 
I
G
 
G
A
 
N
S
x
G
A
x
V
A
x
G
G
 
G
I
 
F
T
 
T
A
 
T
A
 
A
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
W
 
F
G
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
I
T
 
S
L
 
L
I
 
I
G
 
G
K
x
D
E
|
E
G
 
P
G
 
H
M
 
L
P
 
P
Y
 
Y
D
 
D
R
|
R
P
|
P
P
 
S
L
 
L
S
 
S
K
|
K
R
 
A
L
 
V
M
 
L
A
 
D
G
 
G
E
 
S
C
 
L
P
 
E
V
 
R
E
 
P
A
 
P
L
 
I
N
 
-
L
 
L
V
 
A
S
 
E
E
 
A
D
 
D
G
 
W
M
 
Y
K
 
G
A
 
E
L
 
A
N
 
R
L
 
I
H
 
D
Y
 
M
L
 
L
D
 
T
G
 
G
T
 
P
S
x
E
A
x
V
T
 
T
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
D
 
Q
A
 
T
S
 
R
S
 
T
L
 
I
Q
 
S
L
 
L
S
 
D
N
 
D
G
 
G
S
 
T
T
 
T
L
 
L
Q
 
S
Y
 
A
D
 
D
R
 
A
L
 
I
L
 
V
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
S
D
 
R
A
 
A
R
|
R
V
 
T
-
 
M
-
 
A
I
 
L
P
 
P
N
 
G
L
 
-
S
 
S
Q
 
Q
A
 
L
A
 
P
N
 
G
C
 
V
Y
 
V
S
 
T
L
 
L
R
 
R
N
 
T
L
 
Y
N
 
G
D
 
D
A
 
V
L
 
Q
A
 
V
I
 
L
R
 
R
E
 
D
H
 
S
L
 
W
T
 
T
A
 
S
G
 
A
K
 
T
R
 
R
V
 
L
L
 
L
V
 
I
V
 
V
G
|
G
A
 
G
G
 
G
F
x
L
I
|
I
G
 
G
T
 
C
E
|
E
L
 
V
A
 
A
A
 
T
I
 
T
A
 
A
K
 
R
T
 
K
S
 
L
G
 
G
C
 
L
E
 
S
V
 
V
T
 
T
V
 
I
I
 
L
D
x
E
K
x
A
S
 
G
K
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
V
V
x
R
P
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
R
R
 
R
V
 
I
G
 
G
D
 
A
I
 
W
V
 
L
G
 
R
K
 
G
R
 
L
I
 
L
E
 
T
K
 
E
L
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
-
 
V
H
 
E
E
 
L
A
 
G
N
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
V
-
 
G
F
 
F
H
 
S
N
 
G
D
 
E
C
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
E
E
 
Q
V
 
V
K
 
M
W
 
A
R
 
S
D
 
D
R
 
-
T
 
-
I
 
-
T
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
G
V
 
R
V
 
S
I
 
F
A
 
V
C
 
A
D
 
D
V
 
S
I
 
A
V
 
L
V
 
I
A
 
C
I
x
V
G
|
G
A
|
A
V
 
E
P
 
P
S
 
A
V
 
D
Q
 
Q
W
 
L
C
 
A
-
 
R
-
 
Q
S
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
A
I
 
C
R
 
D
S
 
R
G
 
G
V
 
V
V
 
I
C
 
V
N
 
D
E
 
-
Y
 
H
C
 
C
E
 
G
A
 
A
-
 
T
-
 
L
A
 
A
P
 
K
N
 
G
V
 
V
Y
 
F
A
 
A
A
 
V
G
|
G
D
|
D
A
 
V
A
 
A
E
 
S
W
 
W
F
 
P
H
 
L
K
 
R
G
 
A
Y
 
G
G
 
G
E
 
R
H
 
R
M
 
-
R
 
S
I
 
L
E
|
E
H
x
T
R
x
Y
T
 
M
N
 
N
A
 
A
S
 
Q
E
 
R
Q
 
Q
A
 
A
M
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
A
K
 
A
N
 
A
M
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
K
R
 
N
V
 
V
E
 
S
Y
 
A
A
 
P
P
 
Q
L
 
L
P
 
P
F
 
V
F
 
S
W
|
W
S
x
T
D
 
E
Q
 
I
Y
 
A
Q
 
G
V
 
H
Q
 
R
I
 
M
H
 
Q
S
 
M
Y
 
A
G
 
G
R
 
D
I
 
I
-
 
E
G
 
G
P
 
P

8c0zE Cryoem structure of a tungsten-containing aldehyde oxidoreductase from aromatoleum aromaticum (see paper)
30% identity, 82% coverage: 8:309/369 of query aligns to 4:310/424 of 8c0zE

query
sites
8c0zE
V
 
V
V
 
I
V
 
L
G
|
G
A
 
N
S
 
G
A
x
P
A
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
I
A
 
A
A
 
A
R
 
E
A
 
T
L
 
L
R
 
R
A
 
R
Q
 
A
G
 
A
W
 
P
G
 
T
G
 
D
R
 
D
L
 
I
T
 
L
L
 
L
I
 
F
G
 
G
K
 
S
E
 
E
G
 
D
G
 
A
M
 
P
P
 
P
Y
 
Y
D
 
S
R
|
R
P
x
M
P
 
A
L
 
I
S
x
P
K
 
Y
R
 
-
L
 
L
M
 
L
A
 
E
G
 
G
E
 
N
C
 
I
P
 
D
V
 
E
E
 
S
A
 
G
L
 
T
N
 
W
L
 
L
V
 
R
S
 
K
E
 
S
D
 
P
G
 
G
-
 
H
M
 
F
K
 
D
A
 
R
L
 
L
N
 
R
L
 
I
H
 
H
Y
 
E
L
 
M
D
 
R
G
 
G
T
 
-
S
 
R
A
 
A
T
 
V
G
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
S
D
 
E
A
 
R
S
 
R
S
 
R
L
 
I
Q
 
L
L
 
F
S
 
D
N
 
D
G
 
G
S
 
H
T
 
F
L
 
E
Q
 
S
Y
 
W
D
 
D
R
 
R
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
 
G
A
 
S
D
 
H
A
 
P
R
 
V
V
 
R
I
 
P
P
 
P
-
 
I
-
 
P
-
 
G
-
 
I
N
 
D
L
 
L
S
 
P
Q
 
E
A
 
V
A
 
Q
N
 
T
C
 
C
Y
x
W
S
 
T
L
 
L
R
 
-
N
 
-
L
 
-
N
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
R
A
 
A
I
 
I
R
 
A
E
 
R
H
 
F
L
 
A
T
 
T
A
 
P
G
 
G
K
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
Q
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
|
F
I
 
I
G
 
G
T
 
C
E
 
I
L
 
I
A
 
M
A
 
E
I
 
A
A
 
L
K
 
A
T
 
A
S
 
R
G
 
G
C
 
V
E
 
E
V
 
L
T
 
T
V
 
V
I
 
V
D
 
E
K
 
M
S
 
G
K
 
D
V
 
R
P
 
M
L
 
V
G
 
P
A
 
R
R
 
M
V
 
M
G
 
T
D
 
P
I
 
T
V
 
A
G
 
G
K
 
G
R
 
M
I
 
I
E
 
R
K
 
K
L
 
W
H
 
V
E
 
E
A
 
D
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
V
 
R
F
 
V
H
 
V
N
 
T
D
 
N
C
 
A
E
 
G
L
 
V
R
 
S
E
 
R
V
 
I
K
 
D
W
 
C
R
 
R
-
 
A
-
 
S
D
 
N
R
 
D
T
 
A
I
 
P
T
 
L
E
 
D
V
 
V
R
 
T
L
 
L
D
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
E
V
 
V
I
 
V
A
 
V
C
 
A
D
 
D
V
 
L
I
 
V
V
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
A
P
 
P
S
 
N
V
 
I
Q
 
A
W
 
F
-
 
L
-
 
E
C
 
A
S
 
T
G
 
P
L
 
V
N
 
H
I
 
V
R
 
A
S
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
L
C
 
V
N
 
D
E
 
D
Y
 
R
C
 
L
E
 
Q
A
 
T
A
 
S
-
 
V
P
 
P
N
 
G
V
 
I
Y
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
D
|
D
A
 
V
A
 
A
E
 
E
W
 
A
F
 
P
H
 
D
K
 
L
G
 
F
Y
 
T
G
 
G
E
 
A
H
 
H
M
 
L
R
 
V
I
 
A
E
 
A
H
 
I
R
 
Q
T
 
P
N
 
N
A
 
A
S
 
A
E
 
D
Q
 
Q
A
 
A
M
 
R
A
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
L
N
 
N
M
 
M
L
 
A
G
 
G

Q9LK94 Monodehydroascorbate reductase 4, peroxisomal; AtMDAR4; EC 1.6.5.4 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
29% identity, 82% coverage: 30:333/369 of query aligns to 31:356/488 of Q9LK94

query
sites
Q9LK94
G
 
G
R
 
E
L
 
L
T
 
C
L
 
I
I
 
I
G
 
S
K
 
E
E
 
E
G
 
P
G
 
V
M
 
A
P
 
P
Y
 
Y
D
 
E
R
 
R
P
 
P
P
 
A
L
 
L
S
 
S
K
 
K
R
 
G
L
 
F
M
 
L
A
 
L
G
 
P
E
 
E
C
 
A
P
 
P
V
 
A
E
 
R
A
 
L
L
 
P
N
 
S
L
 
F
-
 
H
-
 
T
-
 
C
V
 
V
S
 
G
E
 
A
D
 
N
G
 
D
M
 
E
K
 
K
A
 
L
L
 
T
N
 
P
L
 
K
H
 
W
Y
 
Y
L
 
K
D
 
D
-
 
H
-
 
G
-
 
I
-
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
L
G
 
G
T
 
T
S
 
R
A
 
V
T
 
K
G
 
S
L
 
V
D
 
D
T
 
V
D
 
R
A
 
R
S
 
K
S
 
T
L
 
L
Q
 
L
L
 
S
S
 
S
N
 
T
G
 
G
S
 
E
T
 
T
L
 
I
Q
 
S
Y
 
Y
D
 
K
R
 
F
L
 
L
L
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
R
A
 
A
R
 
L
V
 
K
I
 
L
P
 
E
N
 
E
L
 
F
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
G
S
 
S
Q
 
D
A
 
A
A
 
E
N
 
N
C
 
V
Y
 
C
S
 
Y
L
 
L
R
 
R
N
 
D
L
 
L
N
 
A
D
 
D
A
 
A
-
 
N
-
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
T
R
 
V
E
 
I
H
 
Q
L
 
S
T
 
S
A
 
S
G
 
N
K
 
G
R
 
N
V
 
A
L
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
F
 
Y
I
 
I
G
 
G
T
 
M
E
 
E
L
 
C
A
 
A
A
 
A
I
 
S
A
 
L
K
 
V
T
 
I
S
 
N
G
 
K
C
 
I
E
 
N
V
 
V
T
 
T
V
 
M
I
 
V
D
 
F
K
 
P
S
 
E
K
 
A
V
 
H
P
 
C
L
 
M
G
 
A
A
 
R
R
 
L
V
 
F
G
 
T
D
 
P
I
 
K
V
 
I
G
 
A
K
 
S
R
 
L
I
 
Y
E
 
E
K
 
D
L
 
Y
H
 
Y
E
 
R
A
 
A
N
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
K
F
 
F
H
 
I
N
 
K
D
 
G
C
 
T
E
 
V
L
 
L
R
 
T
E
 
S
V
 
F
K
 
E
W
 
F
-
 
D
R
 
S
D
 
N
R
 
K
T
 
K
I
 
V
T
 
T
E
 
A
V
 
V
R
 
N
L
 
L
D
 
K
T
 
D
G
 
G
V
 
S
V
 
H
I
 
L
A
 
P
C
 
A
D
 
D
V
 
L
I
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
I
V
 
R
P
 
P
S
 
N
V
 
T
Q
 
S
W
 
L
C
 
F
S
 
E
G
 
G
-
 
Q
L
 
L
N
 
T
I
 
I
-
 
E
R
 
K
S
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
K
C
 
V
N
 
N
E
 
S
Y
 
R
C
 
M
E
 
Q
A
 
S
A
 
S
-
 
D
P
 
S
N
 
S
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
A
 
I
G
 
G
D
 
D
A
 
V
A
 
A
E
 
T
W
 
F
F
 
P
H
 
V
K
 
K
G
 
L
Y
 
F
G
 
G
E
 
E
H
 
M
M
 
R
R
 
R
I
 
L
E
 
E
H
 
H
R
 
V
T
 
D
N
 
S
A
 
A
S
 
R
E
 
K
Q
 
S
A
 
A
M
 
R
A
 
H
A
 
A
A
 
V
K
 
S
N
 
A
M
 
I
L
 
M
G
 
D
-
 
P
-
 
I
S
 
K
R
 
T
V
 
G
E
 
D
Y
 
F
A
 
D
P
 
Y
L
 
L
P
 
P
F
 
F
F
 
F
W
 
Y
S
 
S
D
 
R
Q
 
V
Y
 
F
Q
 
A
V
 
F
Q
 
S
I
 
W
H
 
Q
S
 
F
Y
 
Y
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q9Z0X1 Apoptosis-inducing factor 1, mitochondrial; Programmed cell death protein 8; EC 1.6.99.- from Mus musculus (Mouse) (see 4 papers)
26% identity, 88% coverage: 1:323/369 of query aligns to 125:484/612 of Q9Z0X1

query
sites
Q9Z0X1
M
 
I
N
 
R
S
 
A
P
 
P
E
 
S
H
 
H
I
 
V
-
 
P
-
 
F
V
 
L
V
 
L
V
 
I
G
|
G
A
x
G
S
x
G
A
x
T
A
|
A
G
 
A
I
 
F
T
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
S
L
 
I
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
G
 
D
W
 
P
G
 
G
G
 
A
R
 
R
L
 
V
T
 
L
L
 
I
I
 
V
G
 
S
K
x
E
E
x
D
G
 
P
G
 
E
M
 
L
P
 
P
Y
 
Y
D
 
M
R
|
R
P
 
P
P
 
P
L
 
L
S
 
S
K
|
K
R
 
E
L
 
L
M
 
W
A
 
F
G
 
S
E
 
D
C
 
D
P
 
P
-
 
N
-
 
V
V
 
T
E
 
K
A
 
T
L
 
L
N
 
Q
L
 
F
V
 
R
S
 
Q
E
x
W
D
 
N
G
 
G
M
 
-
K
 
K
A
 
E
L
 
R
N
 
S
L
 
I
H
 
Y
Y
 
F
-
 
Q
-
 
P
-
 
P
-
 
S
-
 
F
-
 
Y
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
Q
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
N
-
 
I
-
 
E
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
V
L
 
L
D
 
T
G
 
G
T
 
K
S
 
K
A
x
V
T
 
V
G
 
H
L
 
L
D
 
D
T
 
V
D
 
R
A
 
G
S
 
N
S
 
M
L
 
V
Q
 
K
L
 
L
S
 
N
N
 
D
G
 
G
S
 
S
T
 
Q
L
 
I
Q
 
T
Y
 
F
D
 
E
R
x
K
L
 
C
L
 
L
I
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
G
D
 
T
A
 
P
R
|
R
V
 
S
I
 
L
P
 
S
N
 
A
L
 
I
S
 
D
Q
 
R
A
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
K
A
 
S
N
 
R
C
 
T
Y
 
T
S
 
L
L
 
F
R
|
R
N
 
K
L
 
I
N
 
G
D
 
D
A
 
F
L
 
R
A
 
A
I
 
L
R
 
E
E
 
K
H
 
I
L
 
S
T
 
R
A
 
E
G
 
V
K
 
K
R
 
S
V
 
I
L
 
T
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
x
G
G
|
G
F
|
F
I
x
L
G
 
G
T
 
S
E
|
E
L
 
L
A
 
A
A
 
C
I
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
R
-
 
K
A
 
S
K
 
Q
T
 
A
S
 
S
G
 
G
C
 
I
E
 
E
V
 
V
T
 
I
V
 
Q
I
 
L
D
 
F
K
 
P
S
x
E
K
 
K
V
 
G
P
 
N
L
 
M
G
 
G
A
x
K
R
 
I
V
 
L
G
 
P
D
 
Q
I
 
Y
V
 
L
G
 
S
K
 
N
R
 
W
I
 
T
E
 
M
K
 
E
L
 
K
H
 
V
E
 
K
A
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
V
V
 
K
F
 
V
H
 
M
N
 
P
D
 
N
C
 
A
E
 
I
L
 
V
R
 
Q
E
 
S
V
 
V
K
 
G
W
 
V
R
 
S
D
 
G
R
 
G
T
 
R
I
 
L
T
 
L
E
 
-
V
 
I
R
 
K
L
 
L
D
 
K
T
 
D
G
 
G
V
 
R
V
 
K
I
 
V
A
 
E
C
 
T
D
 
D
V
 
H
I
 
I
V
 
V
V
 
T
A
 
A
I
 
V
G
|
G
A
 
L
V
 
E
P
 
P
S
 
N
V
 
V
Q
 
E
W
 
L
C
 
A
S
 
K
-
 
T
-
 
G
G
 
G
L
 
L
N
 
E
I
 
I
R
 
D
S
 
S
-
 
D
-
 
F
-
 
G
G
 
G
V
 
F
V
 
R
C
 
V
N
 
N
E
 
A
Y
 
E
C
 
L
E
 
Q
A
 
A
A
 
R
P
 
S
N
 
N
V
 
I
Y
 
W
A
 
V
A
 
A
G
 
G
D
|
D
A
 
A
A
 
A
E
 
C
W
 
F
F
 
Y
H
 
D
K
 
I
G
 
K
Y
 
L
G
 
G
E
 
R
H
 
R
M
 
-
R
 
R
I
 
V
E
|
E
H
|
H
R
x
H
T
 
D
N
 
H
A
 
A
S
 
V
E
 
V
Q
 
S
A
 
G
M
 
R
A
 
L
A
 
A
A
 
G
K
 
E
N
 
N
M
 
M
L
 
T
G
 
G
S
 
A
R
 
A
V
 
K
E
 
P
Y
 
Y
A
 
W
P
 
H
L
 
Q
P
 
S
F
 
M
F
 
F
W
|
W
S
 
S
D
 
D

Sites not aligning to the query:

8d3jA Crystal structure of human apoptosis-inducing factor (aif) complexed with 6-fluoro-2-methylquinolin-4-amine
26% identity, 87% coverage: 2:323/369 of query aligns to 1:356/436 of 8d3jA

query
sites
8d3jA
N
 
K
S
 
A
P
 
P
E
 
S
H
 
H
I
 
V
-
 
P
-
 
F
V
 
L
V
 
L
V
 
I
G
|
G
A
 
G
S
 
G
A
 
T
A
|
A
G
 
A
I
 
F
T
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
S
L
 
I
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
G
 
D
W
 
P
G
 
G
G
 
A
R
 
R
L
 
V
T
 
L
L
 
I
I
 
V
G
 
S
K
x
E
E
x
D
G
 
P
G
 
E
M
 
L
P
 
P
Y
 
Y
D
 
M
R
|
R
P
|
P
P
 
P
L
 
L
S
 
S
K
|
K
R
 
E
L
 
L
M
 
W
A
 
F
G
 
S
E
 
D
C
 
D
P
 
P
V
 
N
E
 
V
A
 
T
L
 
K
N
 
T
L
 
L
V
 
R
S
 
F
E
 
K
D
 
Q
G
 
K
M
 
E
K
 
R
A
 
S
L
 
I
N
 
Y
L
 
F
H
 
Q
-
 
P
-
 
P
-
 
S
-
 
F
-
 
Y
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
Q
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
H
-
 
I
-
 
E
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
A
Y
 
V
L
 
L
D
 
T
G
 
G
T
 
K
S
x
K
A
x
V
T
 
V
G
 
Q
L
 
L
D
 
D
T
 
V
D
 
R
A
 
D
S
 
N
S
 
M
L
 
V
Q
 
K
L
 
L
S
 
N
N
 
D
G
 
G
S
 
S
T
 
Q
L
 
I
Q
 
T
Y
 
Y
D
 
E
R
 
K
L
 
C
L
 
L
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
 
G
A
 
G
D
 
T
A
 
P
R
 
R
V
 
S
I
 
L
P
 
S
N
 
A
L
 
I
S
 
D
Q
 
R
A
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
K
A
 
S
N
 
R
C
 
T
Y
 
T
S
 
L
L
x
F
R
|
R
N
 
K
L
 
I
N
 
G
D
 
D
A
 
F
L
 
R
A
 
S
I
 
L
R
 
E
E
 
K
H
 
I
L
 
S
T
 
R
A
 
E
G
 
V
K
 
K
R
 
S
V
 
I
L
 
T
V
 
I
V
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
F
|
F
I
x
L
G
 
G
T
 
S
E
|
E
L
 
L
A
 
A
A
 
C
I
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
R
-
 
K
A
 
A
K
 
R
T
 
A
S
 
L
G
 
G
C
 
T
E
 
E
V
 
V
T
 
I
V
 
Q
I
 
L
D
 
F
K
 
P
S
 
E
K
 
K
V
 
G
P
 
N
L
 
M
G
 
G
A
 
K
R
 
I
V
 
L
G
 
P
D
 
E
I
 
Y
V
 
L
G
 
S
K
 
N
R
 
W
I
 
T
E
 
M
K
 
E
L
 
K
H
 
V
E
 
R
A
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
V
V
 
K
F
 
V
H
 
M
N
 
P
D
 
N
C
 
A
E
 
I
L
 
V
R
 
Q
E
 
S
V
 
V
K
 
G
W
 
V
R
 
S
D
 
S
R
 
G
T
 
K
I
 
L
T
 
L
E
 
-
V
 
I
R
 
K
L
 
L
D
 
K
T
 
D
G
 
G
V
 
R
V
 
K
I
 
V
A
 
E
C
 
T
D
 
D
V
 
H
I
 
I
V
 
V
V
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
G
A
 
L
V
 
E
P
 
P
S
 
N
V
 
V
Q
 
E
W
 
L
C
 
A
S
 
K
-
 
T
-
 
G
G
 
G
L
 
L
N
 
E
I
 
I
R
 
D
S
 
S
-
 
D
-
 
F
-
 
G
G
 
G
V
 
F
V
 
R
C
 
V
N
 
N
E
 
A
Y
 
E
C
 
L
E
 
Q
A
 
A
A
 
R
P
 
S
N
 
N
V
 
I
Y
 
W
A
 
V
A
 
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
A
 
A
E
 
C
W
 
F
F
 
Y
H
 
D
K
 
I
G
 
K
Y
 
L
G
 
G
E
 
R
H
 
R
M
 
-
R
 
R
I
 
V
E
|
E
H
|
H
R
x
H
T
 
D
N
 
H
A
 
A
S
 
V
E
 
V
Q
 
S
A
 
G
M
 
R
A
 
L
A
 
A
A
 
G
K
 
E
N
 
N
M
 
M
L
 
T
G
 
G
S
 
A
R
 
A
V
 
K
E
 
P
Y
 
Y
A
 
W
P
 
H
L
 
Q
P
 
S
F
 
M
F
|
F
W
|
W
S
|
S
D
 
D

8d3iA Crystal structure of human apoptosis-inducing factor (aif) w196a mutant complexed with quinolin-4-amine
26% identity, 87% coverage: 2:323/369 of query aligns to 1:359/439 of 8d3iA

query
sites
8d3iA
N
 
K
S
 
A
P
 
P
E
 
S
H
 
H
I
 
V
-
 
P
-
 
F
V
 
L
V
 
L
V
 
I
G
|
G
A
 
G
S
 
G
A
 
T
A
|
A
G
 
A
I
 
F
T
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
S
L
 
I
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
G
 
D
W
 
P
G
 
G
G
 
A
R
 
R
L
 
V
T
 
L
L
 
I
I
 
V
G
 
S
K
x
E
E
x
D
G
 
P
G
 
E
M
 
L
P
 
P
Y
 
Y
D
 
M
R
|
R
P
|
P
P
 
P
L
 
L
S
 
S
K
|
K
R
 
E
L
 
L
M
 
W
A
 
F
G
 
S
E
 
D
C
 
D
P
 
P
-
 
N
-
 
V
V
 
T
E
 
K
A
 
T
L
 
L
N
 
R
L
 
F
V
 
K
S
 
Q
E
 
A
D
 
N
G
 
G
M
 
-
K
 
K
A
 
E
L
 
R
N
 
S
L
 
I
H
 
Y
Y
 
F
-
 
Q
-
 
P
-
 
P
-
 
S
-
 
F
-
 
Y
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
Q
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
H
-
 
I
-
 
E
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
V
L
 
L
D
 
T
G
 
G
T
 
K
S
x
K
A
x
V
T
 
V
G
 
Q
L
 
L
D
 
D
T
 
V
D
 
R
A
 
D
S
 
N
S
 
M
L
 
V
Q
 
K
L
 
L
S
 
N
N
 
D
G
 
G
S
 
S
T
 
Q
L
 
I
Q
 
T
Y
 
Y
D
 
E
R
 
K
L
 
C
L
 
L
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
 
G
A
 
G
D
 
T
A
 
P
R
 
R
V
 
S
I
 
L
P
 
S
N
 
A
L
 
I
S
 
D
Q
 
R
A
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
K
A
 
S
N
 
R
C
 
T
Y
 
T
S
 
L
L
x
F
R
 
R
N
 
K
L
 
I
N
 
G
D
 
D
A
 
F
L
 
R
A
 
S
I
 
L
R
 
E
E
 
K
H
 
I
L
 
S
T
 
R
A
 
E
G
 
V
K
 
K
R
 
S
V
 
I
L
 
T
V
 
I
V
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
F
|
F
I
x
L
G
 
G
T
 
S
E
|
E
L
 
L
A
 
A
A
 
C
I
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
R
-
 
K
A
 
A
K
 
R
T
 
A
S
 
L
G
 
G
C
 
T
E
 
E
V
 
V
T
 
I
V
 
Q
I
 
L
D
 
F
K
 
P
S
 
E
K
 
K
V
 
G
P
 
N
L
 
M
G
 
G
A
 
K
R
 
I
V
 
L
G
 
P
D
 
E
I
 
Y
V
 
L
G
 
S
K
 
N
R
 
W
I
 
T
E
 
M
K
 
E
L
 
K
H
 
V
E
 
R
A
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
V
V
 
K
F
 
V
H
 
M
N
 
P
D
 
N
C
 
A
E
 
I
L
 
V
R
 
Q
E
 
S
V
 
V
K
 
G
W
 
V
R
 
S
D
 
S
R
 
G
T
 
K
I
 
L
T
 
L
E
 
-
V
 
I
R
 
K
L
 
L
D
 
K
T
 
D
G
 
G
V
 
R
V
 
K
I
 
V
A
 
E
C
 
T
D
 
D
V
 
H
I
 
I
V
 
V
V
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
G
A
 
L
V
 
E
P
 
P
S
 
N
V
 
V
Q
 
E
W
 
L
C
 
A
S
 
K
-
 
T
-
 
G
G
 
G
L
 
L
N
 
E
I
 
I
R
 
D
S
 
S
-
 
D
-
 
F
-
 
G
G
 
G
V
 
F
V
 
R
C
 
V
N
 
N
E
 
A
Y
 
E
C
 
L
E
 
Q
A
 
A
A
 
R
P
 
S
N
 
N
V
 
I
Y
 
W
A
 
V
A
 
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
A
 
A
E
 
C
W
 
F
F
 
Y
H
 
D
K
 
I
G
 
K
Y
 
L
G
 
G
E
 
R
H
 
R
M
 
-
R
 
R
I
 
V
E
|
E
H
|
H
R
x
H
T
 
D
N
 
H
A
 
A
S
 
V
E
 
V
Q
 
S
A
 
G
M
 
R
A
 
L
A
 
A
A
 
G
K
 
E
N
 
N
M
 
M
L
 
T
G
 
G
S
 
A
R
 
A
V
 
K
E
 
P
Y
 
Y
A
 
W
P
 
H
L
 
Q
P
 
S
F
 
M
F
 
F
W
|
W
S
 
S
D
 
D

1gv4A Murine apoptosis-inducing factor (aif) (see paper)
26% identity, 88% coverage: 1:323/369 of query aligns to 5:364/490 of 1gv4A

query
sites
1gv4A
M
 
I
N
 
R
S
 
A
P
 
P
E
 
S
H
 
H
I
 
V
-
 
P
-
 
F
V
 
L
V
 
L
V
 
I
G
|
G
A
 
G
S
x
G
A
x
T
A
|
A
G
 
A
I
 
F
T
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
S
L
 
I
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
G
 
D
W
 
P
G
 
G
G
 
A
R
 
R
L
 
V
T
 
L
L
 
I
I
 
V
G
 
S
K
x
E
E
x
D
G
 
P
G
 
E
M
 
L
P
 
P
Y
 
Y
D
 
M
R
|
R
P
|
P
P
 
P
L
 
L
S
 
S
K
|
K
R
 
E
L
 
L
M
 
W
A
 
F
G
 
S
E
 
D
C
 
D
P
 
P
-
 
N
-
 
V
V
 
T
E
 
K
A
 
T
L
 
L
N
 
Q
L
 
F
V
 
R
S
 
Q
E
 
W
D
 
N
G
 
G
M
 
-
K
 
K
A
 
E
L
 
R
N
 
S
L
 
I
H
 
Y
Y
 
F
-
 
Q
-
 
P
-
 
P
-
 
S
-
 
F
-
 
Y
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
Q
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
N
-
 
I
-
 
E
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
V
L
 
L
D
 
T
G
 
G
T
 
K
S
x
K
A
x
V
T
 
V
G
 
H
L
 
L
D
 
D
T
 
V
D
 
R
A
 
G
S
 
N
S
 
M
L
 
V
Q
 
K
L
 
L
S
 
N
N
 
D
G
 
G
S
 
S
T
 
Q
L
 
I
Q
 
T
Y
 
F
D
 
E
R
 
K
L
 
C
L
 
L
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
G
D
 
T
A
 
P
R
 
R
V
 
S
I
 
L
P
 
S
N
 
A
L
 
I
S
 
D
Q
 
R
A
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
K
A
 
S
N
 
R
C
 
T
Y
 
T
S
 
L
L
x
F
R
|
R
N
 
K
L
 
I
N
 
G
D
 
D
A
 
F
L
 
R
A
 
A
I
 
L
R
 
E
E
 
K
H
 
I
L
 
S
T
 
R
A
 
E
G
 
V
K
 
K
R
 
S
V
 
I
L
 
T
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
F
 
F
I
 
L
G
 
G
T
 
S
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
C
I
 
A
-
x
L
-
 
G
-
 
R
-
 
K
A
 
S
K
 
Q
T
 
A
S
 
S
G
 
G
C
 
I
E
 
E
V
 
V
T
 
I
V
 
Q
I
 
L
D
 
F
K
 
P
S
 
E
K
 
K
V
 
G
P
 
N
L
 
M
G
 
G
A
 
K
R
 
I
V
 
L
G
 
P
D
 
Q
I
 
Y
V
 
L
G
 
S
K
 
N
R
 
W
I
 
T
E
 
M
K
 
E
L
 
K
H
 
V
E
 
K
A
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
V
V
 
K
F
 
V
H
 
M
N
 
P
D
 
N
C
 
A
E
 
I
L
 
V
R
 
Q
E
 
S
V
 
V
K
 
G
W
 
V
R
 
S
D
 
G
R
 
G
T
 
R
I
 
L
T
 
L
E
 
-
V
 
I
R
 
K
L
 
L
D
 
K
T
 
D
G
 
G
V
 
R
V
 
K
I
 
V
A
 
E
C
 
T
D
 
D
V
 
H
I
 
I
V
 
V
V
 
T
A
 
A
I
 
V
G
 
G
A
 
L
V
 
E
P
 
P
S
 
N
V
 
V
Q
 
E
W
 
L
C
 
A
S
 
K
-
 
T
-
 
G
G
 
G
L
 
L
N
 
E
I
 
I
R
 
D
S
 
S
-
 
D
-
 
F
-
 
G
G
 
G
V
 
F
V
 
R
C
 
V
N
 
N
E
 
A
Y
 
E
C
 
L
E
 
Q
A
 
A
A
 
R
P
 
S
N
 
N
V
 
I
Y
 
W
A
 
V
A
 
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
A
 
A
E
 
C
W
 
F
F
 
Y
H
 
D
K
 
I
G
 
K
Y
 
L
G
 
G
E
 
R
H
 
R
M
 
-
R
 
R
I
 
V
E
|
E
H
|
H
R
x
H
T
 
D
N
 
H
A
 
A
S
 
V
E
 
V
Q
 
S
A
 
G
M
 
R
A
 
L
A
 
A
A
 
G
K
 
E
N
 
N
M
 
M
L
 
T
G
 
G
S
 
A
R
 
A
V
 
K
E
 
P
Y
 
Y
A
 
W
P
 
H
L
 
Q
P
 
S
F
 
M
F
|
F
W
|
W
S
 
S
D
 
D

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>RR42_RS29850 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS29850
MNSPEHIVVVGASAAGITAARALRAQGWGGRLTLIGKEGGMPYDRPPLSKRLMAGECPVE
ALNLVSEDGMKALNLHYLDGTSATGLDTDASSLQLSNGSTLQYDRLLIATGADARVIPNL
SQAANCYSLRNLNDALAIREHLTAGKRVLVVGAGFIGTELAAIAKTSGCEVTVIDKSKVP
LGARVGDIVGKRIEKLHEANGVVFHNDCELREVKWRDRTITEVRLDTGVVIACDVIVVAI
GAVPSVQWCSGLNIRSGVVCNEYCEAAPNVYAAGDAAEWFHKGYGEHMRIEHRTNASEQA
MAAAKNMLGSRVEYAPLPFFWSDQYQVQIHSYGRIGPQYTVEVVEGDQLKDDSCIFRYYQ
GDVLMGVLS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory