SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS31670 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS31670 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
39% identity, 96% coverage: 9:252/254 of query aligns to 4:243/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
R
 
R
L
 
L
T
 
Q
G
 
D
Q
 
K
V
 
V
T
 
A
V
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
E
L
 
A
A
 
A
H
 
R
T
 
V
F
 
F
A
 
M
G
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
I
L
 
A
D
|
D
T
x
F
N
 
N
G
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
G
E
 
K
Q
 
E
V
 
-
A
 
A
N
 
V
E
 
E
I
 
A
G
 
N
S
 
P
M
 
G
A
 
V
Q
 
V
H
 
F
A
 
I
V
 
R
A
x
V
D
|
D
V
|
V
S
 
S
N
 
D
E
 
R
D
 
E
A
 
S
I
 
V
E
 
H
S
 
R
V
 
L
M
 
V
E
 
E
D
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
E
Q
 
R
H
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
F
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
N
 
T
R
 
R
R
x
D
N
 
S
T
 
M
S
 
L
F
 
S
D
x
K
L
 
M
T
 
T
I
 
V
A
 
D
D
 
Q
W
 
F
N
 
Q
A
 
Q
V
 
V
V
 
I
A
 
N
V
 
V
N
|
N
M
 
L
T
 
T
G
 
G
M
 
V
F
 
F
L
 
H
C
 
C
A
 
T
R
 
Q
A
 
A
A
 
V
A
 
L
R
 
P
H
 
Y
M
 
M
R
 
A
D
 
E
G
 
Q
G
 
G
G
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
|
T
A
 
S
S
|
S
I
 
V
L
 
T
G
 
G
I
 
T
S
 
Y
G
 
G
G
x
N
W
 
-
Y
x
V
P
 
G
N
x
Q
I
 
T
V
 
N
Y
|
Y
Q
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
V
 
I
N
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
K
S
 
T
W
 
W
A
 
A
V
 
K
E
 
E
W
 
L
A
 
A
P
 
R
Y
 
K
N
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
S
 
G
I
x
F
I
x
T
R
 
E
T
|
T
P
 
A
M
|
M
T
 
V
E
 
A
A
 
E
L
 
V
T
 
P
S
 
E
Q
 
K
P
 
-
D
 
-
V
 
V
V
 
I
A
 
E
K
|
K
F
 
M
E
 
K
A
 
A
L
 
Q
T
 
V
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
L
C
 
G
E
 
K
P
 
P
A
 
E
D
 
D
M
 
I
T
 
A
G
 
N
P
 
A
V
 
Y
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
T
 
S
A
 
H
A
 
E
S
 
S
S
 
D
M
 
Y
V
 
V
T
 
N
G
 
G
H
 
H
I
 
V
L
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
I
L
 
M

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
37% identity, 97% coverage: 8:254/254 of query aligns to 3:255/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
F
 
M
R
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
D
Q
 
K
V
 
T
T
 
V
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
Y
A
 
A
L
 
A
A
 
V
H
 
Q
T
 
A
F
 
F
A
 
L
G
 
G
A
 
Q
G
 
Q
A
 
A
R
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
A
D
|
D
T
x
I
N
 
D
G
 
E
A
 
A
A
 
Q
A
 
G
E
 
E
Q
 
A
V
 
M
A
 
V
N
 
R
E
 
K
I
 
E
G
 
N
S
 
N
M
 
D
A
 
R
Q
 
L
H
 
H
A
 
F
V
 
V
-
 
Q
A
x
T
D
 
D
V
x
I
S
 
T
N
 
D
E
 
E
D
 
A
A
 
A
I
 
C
E
 
Q
S
 
H
V
 
A
M
 
V
E
 
E
D
 
S
V
 
A
A
 
V
R
 
H
Q
 
T
H
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
 
I
N
 
E
R
 
I
R
 
V
N
 
A
T
 
P
S
 
I
F
 
H
D
 
E
L
 
M
T
 
E
I
 
L
A
 
S
D
 
D
W
 
W
N
 
N
A
 
K
V
 
V
V
 
L
A
 
Q
V
 
V
N
 
N
M
 
L
T
 
T
G
 
G
M
 
M
F
 
F
L
 
L
C
 
M
A
 
S
R
 
K
A
 
H
A
 
A
A
 
L
R
 
K
H
 
H
M
 
M
R
 
L
D
 
A
G
 
A
G
 
G
G
 
K
G
 
G
R
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
|
T
A
 
C
S
|
S
I
 
V
L
 
G
G
 
G
I
 
L
S
 
V
G
 
A
G
 
-
W
 
-
Y
 
W
P
 
P
N
 
D
I
 
I
-
 
P
V
 
A
Y
|
Y
Q
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
V
V
 
L
N
 
Q
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
W
 
M
A
 
A
V
 
V
E
 
D
W
 
Y
A
 
A
P
 
K
Y
 
H
N
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
A
 
C
P
|
P
S
x
G
I
|
I
I
|
I
R
 
D
T
 
T
P
 
P
M
 
L
T
 
N
E
 
E
A
 
K
L
 
S
T
 
F
S
 
L
Q
 
E
-
 
N
-
 
N
-
 
E
-
 
G
-
 
T
-
 
L
P
 
E
D
 
E
V
 
I
V
 
K
A
 
K
K
 
E
F
 
K
E
 
A
A
 
K
L
 
V
T
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
L
R
 
R
L
 
L
C
 
G
E
 
K
P
 
P
A
 
E
D
 
E
M
 
I
T
 
A
G
 
N
P
 
V
V
 
M
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
T
 
S
A
 
D
A
 
L
S
 
S
S
 
S
M
 
Y
V
 
M
T
 
T
G
 
G
H
 
S
I
 
A
L
 
I
P
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
L
 
T
A
 
A
Q
 
Q

3uf0A Crystal structure of a putative NAD(p) dependent gluconate 5- dehydrogenase from beutenbergia cavernae(efi target efi-502044) with bound NADP (low occupancy)
42% identity, 97% coverage: 8:254/254 of query aligns to 3:249/249 of 3uf0A

query
sites
3uf0A
F
 
F
R
 
S
L
 
L
T
 
A
G
 
G
Q
 
R
V
 
T
T
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
H
 
H
T
 
G
F
 
Y
A
 
A
G
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
H
V
 
V
V
 
L
V
 
A
L
 
W
D
 
G
-
x
R
T
 
T
N
 
D
G
 
G
A
 
V
A
 
-
A
 
-
E
 
K
Q
 
E
V
 
V
A
 
A
N
 
D
E
 
E
I
 
I
-
 
A
-
 
D
-
 
G
G
 
G
S
 
G
M
 
S
A
 
A
Q
 
E
H
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
A
D
|
D
V
x
L
S
 
A
N
 
D
E
 
L
D
 
E
A
 
G
I
 
A
E
 
A
S
 
N
V
 
V
M
 
A
E
 
E
D
 
E
V
 
L
A
 
A
R
 
A
Q
 
T
H
 
R
G
 
-
R
 
R
I
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
x
I
N
 
I
R
 
A
R
 
R
N
 
A
T
 
P
S
 
A
F
 
E
D
 
E
L
 
V
T
 
S
I
 
L
A
 
G
D
 
R
W
 
W
N
 
R
A
 
E
V
 
V
V
 
L
A
 
T
V
 
V
N
 
N
M
 
L
T
 
D
G
 
A
M
 
A
F
 
W
L
 
V
C
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
S
A
 
F
A
 
G
R
 
T
H
 
A
M
 
M
R
 
L
D
 
A
G
 
H
G
 
G
G
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
T
T
x
I
A
|
A
S
|
S
I
 
M
L
 
L
G
 
S
I
 
F
S
 
Q
G
 
G
G
 
G
W
 
-
Y
 
-
P
 
R
N
 
N
I
x
V
V
 
A
-
 
A
Y
|
Y
Q
 
A
A
 
A
T
 
S
K
|
K
G
 
H
A
 
A
V
 
V
V
 
V
N
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
W
 
L
A
 
A
V
 
S
E
 
E
W
 
W
A
 
A
P
 
G
Y
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
G
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
A
 
A
P
|
P
S
x
G
I
 
Y
I
x
V
R
 
V
T
|
T
P
 
A
M
x
N
T
|
T
E
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
R
S
 
A
Q
 
D
P
 
D
D
 
E
V
 
R
V
 
A
A
 
A
K
 
E
F
 
I
E
 
T
A
 
A
L
 
R
T
 
I
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
W
C
 
A
E
 
T
P
 
P
A
 
E
D
 
D
M
 
M
T
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
A
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
T
 
S
A
 
D
A
 
A
S
 
A
S
 
S
M
 
Y
V
 
V
T
 
H
G
 
G
H
 
Q
I
 
V
L
 
L
P
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
W
L
 
L
A
 
A
Q
 
S

4wecA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from mycobacterium smegmatis
37% identity, 96% coverage: 9:251/254 of query aligns to 7:250/258 of 4wecA

query
sites
4wecA
R
 
R
L
 
L
T
 
A
G
 
G
Q
 
K
V
 
V
T
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
L
 
T
A
 
G
H
 
R
T
 
R
F
 
L
A
 
R
G
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
G
D
|
D
T
x
I
N
 
D
G
 
P
A
 
T
A
 
T
A
 
G
E
 
K
Q
 
A
V
 
A
A
 
A
N
 
D
E
 
E
I
 
L
G
 
E
S
 
G
M
 
L
A
 
-
Q
 
-
H
 
F
A
 
V
V
 
P
A
x
V
D
|
D
V
|
V
S
 
S
N
 
E
E
 
Q
D
 
E
A
 
A
I
 
V
E
 
D
S
 
N
V
 
L
M
 
F
E
 
D
D
 
T
V
 
A
A
 
A
R
 
S
Q
 
T
H
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
A
F
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
N
 
S
R
 
P
R
 
P
N
 
E
T
 
D
S
 
D
F
 
L
-
 
I
-
 
E
D
 
N
L
 
T
T
 
D
I
 
L
A
 
P
D
 
A
W
 
W
N
 
Q
A
 
R
V
 
V
V
 
Q
A
 
D
V
 
I
N
 
N
M
 
L
T
 
K
G
 
S
M
 
V
F
 
Y
L
 
L
C
 
S
A
 
C
R
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
L
R
 
R
H
 
H
M
 
M
R
 
V
D
 
P
G
 
A
G
 
G
G
 
K
G
 
G
R
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
|
T
A
 
A
S
|
S
I
 
F
L
 
V
G
 
A
I
 
V
S
 
M
G
 
G
G
 
S
W
 
A
Y
 
T
P
 
S
N
x
Q
I
 
I
V
 
S
Y
|
Y
Q
 
T
A
 
A
T
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
V
V
 
L
N
 
A
M
 
M
T
 
S
R
 
R
S
 
E
W
 
L
A
 
G
V
 
V
E
 
Q
W
 
Y
A
 
A
P
 
R
Y
 
Q
N
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
A
 
C
P
|
P
S
 
G
I
x
P
I
x
V
R
 
N
T
 
T
P
 
P
M
 
L
T
 
L
E
 
Q
A
 
E
L
 
L
T
 
F
S
 
A
Q
 
K
-
 
D
P
 
P
D
 
E
V
 
R
V
 
A
A
 
A
K
 
R
F
 
R
E
 
L
A
 
V
L
 
H
T
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
F
C
 
A
E
 
E
P
 
P
A
 
E
D
 
E
M
 
L
T
 
A
G
 
A
P
 
A
V
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
T
 
S
A
 
D
A
 
D
S
 
A
S
 
S
M
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
H
 
S
I
 
T
L
 
F
P
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
I

1vl8B Crystal structure of gluconate 5-dehydrogenase (tm0441) from thermotoga maritima at 2.07 a resolution
37% identity, 96% coverage: 8:250/254 of query aligns to 2:248/252 of 1vl8B

query
sites
1vl8B
F
 
F
R
 
D
L
 
L
T
 
R
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
T
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
S
S
x
R
G
|
G
I
x
L
G
 
G
K
 
F
A
 
G
L
 
I
A
 
A
H
 
Q
T
 
G
F
 
L
A
 
A
G
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
C
R
 
S
V
 
V
V
 
V
V
 
V
-
 
A
-
x
S
-
x
R
-
 
N
L
 
L
D
 
E
T
 
E
N
 
A
G
 
S
A
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
Q
 
K
V
 
L
A
 
T
N
 
E
E
 
K
I
 
Y
G
 
G
S
 
V
M
 
E
A
 
T
Q
 
M
H
 
A
A
 
F
V
 
R
A
x
C
D
|
D
V
|
V
S
 
S
N
 
N
E
 
Y
D
 
E
A
 
E
I
 
V
E
 
K
S
 
K
V
 
L
M
 
L
E
 
E
D
 
A
V
 
V
A
 
K
R
 
E
Q
 
K
H
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
L
D
 
D
V
 
T
L
 
V
F
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
V
x
I
N
 
N
R
 
R
R
 
R
N
 
H
T
 
P
S
 
A
F
 
E
D
 
E
L
 
F
T
 
P
I
 
L
A
 
D
D
 
E
W
 
F
N
 
R
A
 
Q
V
 
V
V
 
I
A
 
E
V
|
V
N
 
N
M
 
L
T
 
F
G
 
G
M
 
T
F
 
Y
L
 
Y
C
 
V
A
 
C
R
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
F
R
 
S
H
 
L
M
 
L
R
 
R
D
 
E
G
 
S
G
 
D
G
 
N
G
 
P
R
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
x
I
A
 
G
S
|
S
I
 
-
L
 
L
G
 
T
I
 
V
S
 
E
G
 
E
G
 
V
W
 
T
Y
 
M
P
 
P
N
 
N
I
|
I
-
 
S
V
 
A
Y
|
Y
Q
 
A
A
 
A
T
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
V
V
 
A
N
 
S
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
A
W
 
L
A
 
A
V
 
K
E
 
E
W
 
W
A
 
G
P
 
R
Y
 
Y
N
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
I
A
 
A
P
|
P
S
x
G
I
 
W
I
x
Y
R
 
R
T
|
T
P
 
K
M
|
M
T
|
T
E
 
E
A
 
A
L
 
V
T
 
F
S
 
S
Q
 
D
P
 
P
D
 
E
V
 
K
V
 
L
A
 
D
K
 
Y
F
 
M
E
 
L
A
 
K
L
 
R
T
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
T
C
 
G
E
 
V
P
 
P
A
 
E
D
 
D
M
 
L
T
 
K
G
 
G
P
 
V
V
 
A
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
T
 
S
A
 
E
A
 
E
S
 
A
S
 
K
M
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
H
 
Q
I
 
I
L
 
I
P
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3lqfA Crystal structure of the short-chain dehydrogenase galactitol- dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD and erythritol (see paper)
40% identity, 96% coverage: 8:250/254 of query aligns to 7:250/254 of 3lqfA

query
sites
3lqfA
F
 
F
R
 
R
L
 
L
T
 
D
G
 
G
Q
 
A
V
 
C
T
 
A
V
 
A
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
E
L
 
I
A
 
C
H
 
R
T
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
L
V
 
I
V
 
L
L
 
I
D
|
D
T
x
R
N
 
E
G
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
L
E
 
D
Q
 
R
V
 
A
A
 
A
N
 
Q
E
 
E
I
 
L
G
 
G
S
 
A
-
 
A
M
 
V
A
 
A
Q
 
A
H
 
R
A
 
I
V
 
V
A
 
A
D
|
D
V
|
V
S
 
T
N
 
D
E
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
M
E
 
T
S
 
A
V
 
A
M
 
A
E
 
A
D
 
E
V
 
A
A
 
E
R
 
A
Q
 
V
H
 
A
G
 
-
R
 
P
I
 
V
D
 
S
V
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
x
S
A
 
A
G
 
G
V
 
I
N
 
A
R
 
R
R
 
L
N
 
H
T
 
D
S
 
A
F
 
L
D
 
E
L
 
T
T
 
D
I
 
D
A
 
A
D
 
T
W
 
W
N
 
R
A
 
Q
V
 
V
V
 
M
A
 
A
V
 
V
N
 
N
M
 
V
T
 
D
G
 
G
M
 
M
F
 
F
L
 
W
C
 
A
A
 
S
R
 
R
A
 
A
A
 
F
A
 
G
R
 
R
H
 
A
M
 
M
R
 
V
D
 
A
G
 
R
G
 
G
G
 
A
G
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
x
L
A
 
G
S
|
S
I
 
M
L
 
S
G
 
G
I
 
T
S
 
I
G
 
V
G
x
N
W
 
-
Y
 
R
P
 
P
N
 
Q
I
 
F
V
 
A
-
 
S
-
 
S
Y
|
Y
Q
 
M
A
 
A
T
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
H
N
 
Q
M
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
W
 
L
A
 
A
V
 
A
E
 
E
W
 
W
A
 
A
P
 
G
Y
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
A
 
A
P
|
P
S
 
G
I
x
Y
I
x
V
R
 
A
T
|
T
P
 
E
M
|
M
T
|
T
E
 
L
A
 
K
L
x
M
T
 
R
S
 
E
Q
 
R
P
 
P
D
 
E
V
 
L
V
 
F
A
 
E
K
 
T
F
 
W
E
 
L
A
 
D
L
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
C
C
 
G
E
 
E
P
 
P
A
 
S
D
 
E
M
 
I
T
 
A
G
 
A
P
 
A
V
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
T
 
S
A
 
P
A
 
A
S
 
A
S
 
S
M
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
H
 
A
I
 
I
L
 
L
P
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

2wsbA Crystal structure of the short-chain dehydrogenase galactitol-dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD (see paper)
40% identity, 96% coverage: 8:250/254 of query aligns to 7:250/254 of 2wsbA

query
sites
2wsbA
F
 
F
R
 
R
L
 
L
T
 
D
G
 
G
Q
 
A
V
 
C
T
 
A
V
 
A
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
E
L
 
I
A
 
C
H
 
R
T
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
L
V
 
I
V
 
L
L
 
I
D
|
D
T
x
R
N
 
E
G
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
L
E
 
D
Q
 
R
V
 
A
A
 
A
N
 
Q
E
 
E
I
 
L
G
 
G
S
 
A
-
 
A
M
 
V
A
 
A
Q
 
A
H
 
R
A
 
I
V
 
V
A
 
A
D
|
D
V
|
V
S
 
T
N
 
D
E
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
M
E
 
T
S
 
A
V
 
A
M
 
A
E
 
A
D
 
E
V
 
A
A
 
E
R
 
A
Q
 
V
H
 
A
G
 
-
R
 
P
I
 
V
D
 
S
V
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
x
S
A
|
A
G
 
G
V
 
I
N
 
A
R
 
R
R
 
L
N
 
H
T
 
D
S
 
A
F
 
L
D
 
E
L
 
T
T
 
D
I
 
D
A
 
A
D
 
T
W
 
W
N
 
R
A
 
Q
V
 
V
V
 
M
A
 
A
V
 
V
N
 
N
M
 
V
T
 
D
G
 
G
M
 
M
F
 
F
L
 
W
C
 
A
A
 
S
R
 
R
A
 
A
A
 
F
A
 
G
R
 
R
H
 
A
M
 
M
R
 
V
D
 
A
G
 
R
G
 
G
G
 
A
G
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
x
L
A
 
G
S
|
S
I
x
M
L
 
S
G
 
G
I
 
T
S
 
I
G
 
V
G
x
N
W
 
-
Y
 
R
P
 
P
N
 
Q
I
 
F
V
 
A
-
 
S
-
 
S
Y
|
Y
Q
 
M
A
 
A
T
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
H
N
 
Q
M
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
W
 
L
A
 
A
V
 
A
E
 
E
W
 
W
A
 
A
P
 
G
Y
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
A
 
A
P
|
P
S
 
G
I
x
Y
I
x
V
R
 
A
T
|
T
P
 
E
M
|
M
T
|
T
E
 
L
A
 
K
L
 
M
T
 
R
S
 
E
Q
 
R
P
 
P
D
 
E
V
 
L
V
 
F
A
 
E
K
 
T
F
 
W
E
 
L
A
 
D
L
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
C
C
 
G
E
 
E
P
 
P
A
 
S
D
 
E
M
 
I
T
 
A
G
 
A
P
 
A
V
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
T
 
S
A
 
P
A
 
A
S
 
A
S
 
S
M
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
H
 
A
I
 
I
L
 
L
P
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

2wdzA Crystal structure of the short chain dehydrogenase galactitol-dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD+ and 1,2-pentandiol (see paper)
40% identity, 96% coverage: 8:250/254 of query aligns to 7:250/254 of 2wdzA

query
sites
2wdzA
F
 
F
R
 
R
L
 
L
T
 
D
G
 
G
Q
 
A
V
 
C
T
 
A
V
 
A
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
E
L
 
I
A
 
C
H
 
R
T
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
L
V
 
I
V
 
L
L
 
I
D
|
D
T
x
R
N
 
E
G
x
A
A
 
A
A
 
A
A
 
L
E
x
D
Q
 
R
V
 
A
A
 
A
N
 
Q
E
 
E
I
 
L
G
 
G
S
 
A
-
 
A
M
 
V
A
 
A
Q
 
A
H
x
R
A
 
I
V
 
V
A
|
A
D
|
D
V
|
V
S
 
T
N
 
D
E
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
M
E
 
T
S
 
A
V
 
A
M
 
A
E
 
A
D
 
E
V
 
A
A
 
E
R
 
A
Q
 
V
H
 
A
G
 
-
R
 
P
I
 
V
D
 
S
V
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
x
S
A
|
A
G
 
G
V
 
I
N
 
A
R
 
R
R
 
L
N
 
H
T
 
D
S
 
A
F
 
L
D
 
E
L
 
T
T
 
D
I
 
D
A
 
A
D
 
T
W
 
W
N
 
R
A
 
Q
V
 
V
V
 
M
A
 
A
V
 
V
N
 
N
M
 
V
T
 
D
G
 
G
M
 
M
F
 
F
L
 
W
C
 
A
A
 
S
R
 
R
A
 
A
A
 
F
A
 
G
R
 
R
H
 
A
M
 
M
R
 
V
D
 
A
G
 
R
G
 
G
G
 
A
G
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
x
L
A
 
G
S
|
S
I
 
M
L
x
S
G
 
G
I
 
T
S
 
I
G
 
V
G
 
N
W
 
-
Y
 
R
P
 
P
N
 
Q
I
 
F
V
 
A
-
 
S
-
 
S
Y
|
Y
Q
 
M
A
 
A
T
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
H
N
 
Q
M
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
W
 
L
A
 
A
V
 
A
E
 
E
W
 
W
A
 
A
P
 
G
Y
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
A
 
A
P
|
P
S
 
G
I
 
Y
I
x
V
R
 
A
T
|
T
P
 
E
M
|
M
T
|
T
E
 
L
A
 
K
L
 
M
T
 
R
S
 
E
Q
 
R
P
 
P
D
 
E
V
 
L
V
 
F
A
 
E
K
 
T
F
 
W
E
 
L
A
 
D
L
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
C
C
 
G
E
 
E
P
 
P
A
 
S
D
 
E
M
 
I
T
 
A
G
 
A
P
 
A
V
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
T
 
S
A
 
P
A
 
A
S
 
A
S
 
S
M
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
H
 
A
I
 
I
L
 
L
P
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

C0KTJ6 Galactitol 2-dehydrogenase (L-tagatose-forming); Galactitol dehydrogenase; GDH; GatDH; Galactitol:NAD(+) 5-oxidoreductase; EC 1.1.1.406 from Cereibacter sphaeroides (Rhodobacter sphaeroides) (see paper)
40% identity, 96% coverage: 8:250/254 of query aligns to 7:250/254 of C0KTJ6

query
sites
C0KTJ6
F
 
F
R
 
R
L
 
L
T
 
D
G
 
G
Q
 
A
V
 
C
T
 
A
V
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
E
L
 
I
A
 
C
H
 
R
T
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
L
V
 
I
V
 
L
L
 
I
D
|
D
T
 
R
N
 
E
G
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
L
E
 
D
Q
 
R
V
 
A
A
 
A
N
 
Q
E
 
E
I
 
L
G
 
G
S
 
A
-
 
A
M
 
V
A
 
A
Q
 
A
H
 
R
A
 
I
V
 
V
A
 
A
D
|
D
V
|
V
S
 
T
N
 
D
E
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
M
E
 
T
S
 
A
V
 
A
M
 
A
E
 
A
D
 
E
V
 
A
A
 
E
R
 
A
Q
 
V
H
 
A
G
 
-
R
 
P
I
 
V
D
 
S
V
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
I
N
 
A
R
 
R
R
 
L
N
 
H
T
 
D
S
 
A
F
 
L
D
 
E
L
 
T
T
 
D
I
 
D
A
 
A
D
 
T
W
 
W
N
 
R
A
 
Q
V
 
V
V
 
M
A
 
A
V
 
V
N
 
N
M
 
V
T
 
D
G
 
G
M
 
M
F
 
F
L
 
W
C
 
A
A
 
S
R
 
R
A
 
A
A
 
F
A
 
G
R
 
R
H
 
A
M
 
M
R
 
V
D
 
A
G
 
R
G
 
G
G
 
A
G
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
L
A
 
G
S
 
S
I
 
M
L
 
S
G
 
G
I
 
T
S
 
I
G
 
V
G
 
N
W
 
-
Y
 
R
P
 
P
N
 
Q
I
 
F
V
 
A
-
 
S
-
 
S
Y
|
Y
Q
 
M
A
 
A
T
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
H
N
 
Q
M
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
W
 
L
A
 
A
V
 
A
E
 
E
W
 
W
A
 
A
P
 
G
Y
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
A
 
A
P
 
P
S
 
G
I
 
Y
I
x
V
R
x
A
T
|
T
P
 
E
M
 
M
T
 
T
E
 
L
A
 
K
L
 
M
T
 
R
S
 
E
Q
 
R
P
 
P
D
 
E
V
 
L
V
 
F
A
 
E
K
 
T
F
 
W
E
 
L
A
 
D
L
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
C
C
 
G
E
 
E
P
 
P
A
 
S
D
 
E
M
 
I
T
 
A
G
 
A
P
 
A
V
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
T
 
S
A
 
P
A
 
A
S
 
A
S
 
S
M
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
H
 
A
I
 
I
L
 
L
P
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

H9XP47 Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; BDH; meso-2,3-BDH; (R,S)-butane-2,3-diol dehydrogenase; NAD(H)-dependent meso-2,3-BDH; SmBdh; EC 1.1.1.- from Serratia marcescens (see paper)
38% identity, 97% coverage: 8:254/254 of query aligns to 1:244/251 of H9XP47

query
sites
H9XP47
F
 
M
R
 
R
L
 
F
T
 
D
G
 
N
Q
 
K
V
 
V
T
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
G
S
x
N
G
 
G
I
x
M
G
 
G
K
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
A
H
 
R
T
 
R
F
 
F
A
 
S
G
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
L
L
 
A
D
|
D
T
 
W
N
 
A
G
 
K
A
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
D
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
N
 
A
E
 
S
I
 
L
-
 
P
-
 
K
-
 
G
G
 
R
S
 
A
M
 
M
A
 
A
Q
 
V
H
 
H
A
 
I
V
 
-
A
 
-
D
|
D
V
|
V
S
 
S
N
 
D
E
 
H
D
 
V
A
 
A
I
 
V
E
 
E
S
 
K
V
 
M
M
 
M
E
 
N
D
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
E
Q
 
K
H
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
L
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
H
R
 
V
R
 
A
N
 
G
T
 
S
S
 
V
F
 
L
D
 
E
L
 
T
T
 
S
I
 
I
A
 
D
D
 
D
W
 
W
N
 
R
A
 
R
V
 
I
V
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
D
M
 
I
T
 
D
G
 
G
M
 
V
F
 
V
L
 
F
C
 
C
A
 
S
R
 
K
A
 
F
A
 
A
A
 
L
R
 
P
H
 
H
M
 
L
R
 
L
D
 
K
G
 
T
G
 
K
G
 
G
G
 
C
R
 
-
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
T
A
 
A
S
|
S
I
x
V
L
x
S
G
 
G
I
 
L
S
 
G
G
 
G
G
 
D
W
 
W
Y
 
G
P
 
A
N
 
-
I
 
A
V
 
Y
Y
|
Y
Q
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
V
N
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
W
 
M
A
 
A
V
 
L
E
 
D
W
 
H
A
 
G
P
 
G
Y
 
D
N
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
C
P
 
P
S
 
S
I
 
L
I
x
V
R
 
K
T
|
T
P
 
N
M
 
M
T
 
T
E
 
N
A
 
G
L
 
W
T
 
P
S
 
Q
Q
 
E
P
 
-
D
 
-
V
 
I
V
x
R
A
x
D
K
|
K
F
 
F
E
 
N
A
 
E
L
 
R
T
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
A
C
 
A
E
 
E
P
 
P
A
 
E
D
 
E
M
 
V
T
 
A
G
 
A
P
 
V
V
 
M
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
T
 
S
A
 
D
A
 
D
S
 
A
S
 
S
M
 
F
V
 
I
T
 
N
G
 
G
H
 
A
I
 
N
L
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
A
L
 
T
A
 
A
Q
 
S

Sites not aligning to the query:

6vspA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
39% identity, 97% coverage: 9:254/254 of query aligns to 2:244/251 of 6vspA

query
sites
6vspA
R
 
R
L
 
F
T
 
D
G
 
N
Q
 
K
V
 
V
T
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
S
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
K
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
A
H
 
R
T
 
R
F
 
F
A
 
S
G
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
L
L
 
A
D
|
D
T
x
W
N
x
A
G
 
K
A
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
D
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
N
 
A
E
 
S
I
 
L
-
 
P
-
 
K
-
 
G
G
 
R
S
 
A
M
 
M
A
 
A
Q
 
V
H
 
H
A
x
I
V
 
-
A
 
-
D
|
D
V
|
V
S
 
S
N
 
D
E
 
H
D
 
V
A
 
A
I
 
V
E
 
E
S
 
K
V
 
M
M
 
M
E
 
N
D
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
E
Q
 
K
H
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
L
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
|
V
N
 
H
R
 
V
R
 
A
N
 
G
T
 
S
S
 
V
F
 
L
D
 
E
L
 
T
T
 
S
I
 
I
A
 
D
D
 
D
W
 
W
N
 
R
A
 
R
V
 
I
V
 
A
A
 
G
V
|
V
N
 
D
M
 
I
T
 
D
G
 
G
M
 
V
F
 
V
L
 
F
C
 
C
A
 
S
R
 
K
A
 
F
A
 
A
A
 
L
R
 
P
H
 
H
M
 
L
R
 
L
D
 
K
G
 
T
G
 
K
G
 
G
G
 
C
R
 
-
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
|
T
A
 
A
S
|
S
I
 
V
L
 
S
G
 
G
I
 
L
S
 
G
G
 
G
G
 
D
W
 
W
Y
 
G
P
 
A
N
 
-
I
 
A
V
 
Y
Y
|
Y
Q
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
V
N
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
W
 
M
A
 
A
V
 
L
E
 
D
W
 
H
A
 
G
P
 
G
Y
 
D
N
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
C
P
|
P
S
|
S
I
x
L
I
x
V
R
 
K
T
|
T
P
x
N
M
|
M
T
|
T
E
 
N
A
 
G
L
 
W
T
 
P
S
 
Q
Q
 
E
P
 
-
D
 
-
V
 
I
V
 
R
A
 
D
K
 
K
F
 
F
E
 
N
A
 
E
L
 
R
T
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
A
C
 
A
E
 
E
P
 
P
A
 
E
D
 
E
M
 
V
T
 
A
G
 
A
P
 
V
V
 
M
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
T
 
S
A
 
D
A
 
D
S
 
A
S
 
S
M
 
F
V
 
I
T
 
N
G
 
G
H
 
A
I
 
N
L
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
A
L
 
T
A
 
A
Q
 
S

6xewA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
39% identity, 97% coverage: 9:254/254 of query aligns to 2:244/251 of 6xewA

query
sites
6xewA
R
 
R
L
 
F
T
 
D
G
 
N
Q
 
K
V
 
V
T
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
S
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
K
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
A
H
 
R
T
 
R
F
 
F
A
 
S
G
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
L
L
 
A
D
|
D
T
x
W
N
x
A
G
 
K
A
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
D
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
N
 
A
E
 
S
I
 
L
-
 
P
-
 
K
-
 
G
G
 
R
S
 
A
M
 
M
A
 
A
Q
 
V
H
 
H
A
x
I
V
 
-
A
 
-
D
|
D
V
|
V
S
 
S
N
 
D
E
 
H
D
 
V
A
 
A
I
 
V
E
 
E
S
 
K
V
 
M
M
 
M
E
 
N
D
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
E
Q
 
K
H
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
L
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
V
N
 
H
R
 
V
R
 
A
N
 
G
T
 
S
S
 
V
F
 
L
D
 
E
L
 
T
T
 
S
I
 
I
A
 
D
D
 
D
W
 
W
N
 
R
A
 
R
V
 
I
V
 
A
A
 
G
V
|
V
N
 
D
M
 
I
T
 
D
G
 
G
M
 
V
F
 
V
L
 
F
C
 
C
A
 
S
R
 
K
A
 
F
A
 
A
A
 
L
R
 
P
H
 
H
M
 
L
R
 
L
D
 
K
G
 
T
G
 
K
G
 
G
G
 
C
R
 
-
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
|
T
A
 
A
S
|
S
I
 
V
L
x
S
G
 
G
I
 
L
S
 
G
G
 
G
G
 
D
W
 
W
Y
 
G
P
 
A
N
 
-
I
 
A
V
 
Y
Y
|
Y
Q
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
V
N
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
W
 
M
A
 
A
V
 
L
E
 
D
W
 
H
A
 
G
P
 
G
Y
 
D
N
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
C
P
 
P
S
|
S
I
x
L
I
x
V
R
 
K
T
|
T
P
x
N
M
|
M
T
|
T
E
 
N
A
 
G
L
 
W
T
 
P
S
 
Q
Q
 
E
P
 
-
D
 
-
V
 
I
V
 
R
A
 
D
K
 
K
F
 
F
E
 
N
A
 
E
L
 
R
T
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
A
C
 
A
E
 
E
P
 
P
A
 
E
D
 
E
M
 
V
T
 
A
G
 
A
P
 
V
V
 
M
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
T
 
S
A
 
D
A
 
D
S
 
A
S
 
S
M
 
F
V
 
I
T
 
N
G
 
G
H
 
A
I
 
N
L
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
A
L
 
T
A
 
A
Q
 
S

6vspB Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
39% identity, 97% coverage: 9:254/254 of query aligns to 4:246/252 of 6vspB

query
sites
6vspB
R
 
R
L
 
F
T
 
D
G
 
N
Q
 
K
V
 
V
T
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
S
x
N
G
|
G
I
 
M
G
 
G
K
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
A
H
 
R
T
 
R
F
 
F
A
 
S
G
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
L
L
 
A
D
|
D
T
x
W
N
 
A
G
 
K
A
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
D
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
N
 
A
E
 
S
I
 
L
-
 
P
-
 
K
-
 
G
G
 
R
S
 
A
M
 
M
A
 
A
Q
 
V
H
 
H
A
x
I
V
 
-
A
 
-
D
|
D
V
|
V
S
 
S
N
 
D
E
 
H
D
 
V
A
 
A
I
 
V
E
 
E
S
 
K
V
 
M
M
 
M
E
 
N
D
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
E
Q
 
K
H
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
L
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
V
 
V
N
 
H
R
 
V
R
 
A
N
 
G
T
 
S
S
 
V
F
 
L
D
 
E
L
 
T
T
 
S
I
 
I
A
 
D
D
 
D
W
 
W
N
 
R
A
 
R
V
 
I
V
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
D
M
 
I
T
 
D
G
 
G
M
 
V
F
 
V
L
 
F
C
 
C
A
 
S
R
 
K
A
 
F
A
 
A
A
 
L
R
 
P
H
 
H
M
 
L
R
 
L
D
 
K
G
 
T
G
 
K
G
 
G
G
 
C
R
 
-
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
T
A
 
A
S
|
S
I
 
V
L
 
S
G
 
G
I
 
L
S
 
G
G
 
G
G
 
D
W
 
W
Y
 
G
P
 
A
N
 
-
I
 
A
V
 
Y
Y
|
Y
Q
 
C
A
 
A
T
 
A
K
 
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
V
N
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
W
 
M
A
 
A
V
 
L
E
 
D
W
 
H
A
 
G
P
 
G
Y
 
D
N
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
C
P
 
P
S
 
S
I
 
L
I
 
V
R
 
K
T
 
T
P
 
N
M
 
M
T
 
T
E
 
N
A
 
G
L
 
W
T
 
P
S
 
Q
Q
 
E
P
 
-
D
 
-
V
 
I
V
 
R
A
 
D
K
 
K
F
 
F
E
 
N
A
 
E
L
 
R
T
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
A
C
 
A
E
 
E
P
 
P
A
 
E
D
 
E
M
 
V
T
 
A
G
 
A
P
 
V
V
 
M
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
T
 
S
A
 
D
A
 
D
S
 
A
S
 
S
M
 
F
V
 
I
T
 
N
G
 
G
H
 
A
I
 
N
L
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
A
L
 
T
A
 
A
Q
 
S

5u9pB Crystal structure of a gluconate 5-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia j2315 in complex with NADP and tartrate
38% identity, 99% coverage: 1:251/254 of query aligns to 5:257/261 of 5u9pB

query
sites
5u9pB
M
 
M
P
 
T
H
 
H
P
 
A
F
 
L
P
 
D
D
 
R
F
 
F
R
 
R
L
 
L
T
 
D
G
 
G
Q
 
R
V
 
R
T
 
A
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
G
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
T
L
 
L
A
 
A
H
 
R
T
 
G
F
 
L
A
 
A
G
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
I
V
 
V
V
 
I
L
 
N
D
 
D
T
x
R
N
 
N
G
 
E
A
 
E
A
 
K
A
 
A
E
 
A
Q
 
T
V
 
L
A
 
A
N
 
R
E
 
R
I
 
F
-
 
R
-
 
D
-
 
E
G
 
G
S
 
F
M
 
A
A
 
A
Q
 
D
H
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
F
D
|
D
V
|
V
S
 
A
N
 
E
E
 
H
D
 
A
A
 
Q
I
 
V
E
 
R
S
 
A
V
 
A
M
 
I
E
 
D
D
 
E
V
 
F
A
 
E
R
 
A
Q
 
R
H
 
V
G
 
G
R
 
A
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
N
 
Q
R
 
R
R
 
R
N
 
A
T
 
P
S
 
L
F
 
D
D
 
A
L
 
F
T
 
E
I
 
P
A
 
D
D
 
D
W
 
W
N
 
H
A
 
A
V
 
L
V
 
M
A
 
R
V
 
V
N
 
N
M
 
L
T
 
D
G
 
G
M
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
V
A
 
A
R
 
Q
A
 
A
A
 
V
A
 
A
R
 
R
H
 
H
M
 
M
R
 
I
D
 
A
G
 
R
G
 
G
G
 
H
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
x
I
A
 
C
S
|
S
I
 
V
L
 
Q
G
 
-
I
 
-
S
 
S
G
 
E
G
 
L
W
 
A
Y
 
R
P
 
P
N
 
T
I
 
I
V
 
A
-
 
P
Y
|
Y
Q
 
A
A
 
A
T
 
T
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
R
N
 
M
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
G
W
 
M
A
 
C
V
 
A
E
 
D
W
 
W
A
 
A
P
 
R
Y
 
Y
N
 
G
I
 
I
R
 
Q
V
 
A
N
 
N
A
 
G
V
 
L
A
 
A
P
|
P
S
 
G
I
 
Y
I
x
F
R
 
E
T
|
T
P
 
E
M
x
L
T
x
N
E
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
V
S
 
D
Q
 
D
P
 
A
D
 
A
V
 
F
V
 
S
A
 
D
K
 
W
F
 
L
E
 
C
A
 
K
L
 
R
T
 
T
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
W
C
 
G
E
 
Q
P
 
V
A
 
D
D
 
E
M
 
L
T
 
C
G
 
G
P
 
A
V
 
A
L
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
A
T
 
S
A
 
A
A
 
A
S
 
S
S
 
D
M
 
F
V
 
V
T
 
N
G
 
G
H
 
Q
I
 
T
L
 
L
P
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
L

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
37% identity, 96% coverage: 10:253/254 of query aligns to 3:247/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
L
 
L
T
 
D
G
 
N
Q
 
K
V
 
V
T
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
A
H
 
H
T
 
S
F
 
Y
A
 
A
G
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
V
L
 
S
D
|
D
T
x
I
N
 
N
G
 
E
A
 
D
A
 
H
A
 
G
E
 
N
Q
 
K
V
 
A
A
 
V
N
 
E
E
 
D
I
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
Q
G
 
G
S
 
G
M
 
E
A
 
A
Q
 
S
H
 
F
A
 
V
V
 
K
A
|
A
D
|
D
V
x
T
S
 
S
N
 
N
E
 
P
D
 
E
A
 
E
I
 
V
E
 
E
S
 
A
V
 
L
M
 
V
E
 
K
D
 
R
V
 
T
A
 
V
R
 
E
Q
 
I
H
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
F
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
-
 
G
N
 
G
R
 
E
R
 
Q
N
 
A
T
 
L
S
 
A
F
 
G
D
 
D
L
 
Y
T
 
G
I
 
L
A
 
D
D
 
S
W
 
W
N
 
R
A
 
K
V
 
V
V
 
L
A
 
S
V
 
I
N
 
N
M
 
L
T
 
D
G
 
G
M
 
V
F
 
F
L
 
Y
C
 
G
A
 
C
R
 
K
A
 
Y
A
 
E
A
 
L
R
 
E
H
 
Q
M
 
M
R
 
E
D
 
K
G
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
x
M
A
 
A
S
|
S
I
 
I
L
 
H
G
 
G
I
 
I
S
 
V
G
 
A
G
 
A
W
 
P
Y
 
L
P
 
S
N
 
S
I
 
-
V
 
A
Y
|
Y
Q
 
T
A
 
S
T
 
A
K
|
K
G
 
H
A
 
A
V
 
V
V
 
V
N
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
N
W
 
I
A
 
G
V
 
A
E
 
E
W
 
Y
A
 
G
P
 
Q
Y
 
K
N
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
G
P
|
P
S
x
A
I
x
Y
I
|
I
R
 
E
T
 
T
P
 
P
M
x
L
T
 
L
E
 
E
A
 
S
L
 
L
T
 
T
S
 
K
Q
 
E
P
 
M
D
 
K
V
 
-
V
 
-
A
 
-
K
 
-
F
 
-
E
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
I
-
 
S
-
 
K
-
 
H
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
L
C
 
G
E
 
K
P
 
P
A
 
E
D
 
E
M
 
V
T
 
A
G
 
E
P
 
L
V
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
S
T
 
S
A
 
E
A
 
K
S
 
S
S
 
S
M
 
F
V
 
M
T
 
T
G
 
G
H
 
G
I
 
Y
L
 
Y
P
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
L
 
T
A
 
A

2d1yA Crystal structure of tt0321 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
41% identity, 96% coverage: 10:253/254 of query aligns to 3:238/240 of 2d1yA

query
sites
2d1yA
L
 
F
T
 
A
G
 
G
Q
 
K
V
 
G
T
 
V
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
H
 
Q
T
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
L
V
 
V
V
 
A
V
 
L
L
 
C
D
|
D
T
x
L
N
x
R
G
 
-
A
 
P
A
 
E
A
 
G
E
 
K
Q
 
E
V
 
V
A
 
A
N
 
E
E
 
A
I
 
I
G
 
G
S
 
G
M
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
A
 
A
V
 
F
A
 
F
D
 
Q
V
|
V
S
x
D
N
x
L
E
 
E
D
 
D
A
 
E
I
 
R
E
 
E
S
 
R
V
 
V
-
 
R
-
 
F
M
 
V
E
 
E
D
 
E
V
 
A
A
 
A
R
 
Y
Q
 
A
H
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
A
V
x
I
N
 
A
R
 
A
R
 
P
N
 
G
T
 
S
S
 
A
F
 
L
D
 
T
L
 
V
T
 
R
I
 
L
A
 
P
D
 
E
W
 
W
N
 
R
A
 
R
V
 
V
V
 
L
A
 
E
V
 
V
N
 
N
M
 
L
T
 
T
G
 
A
M
 
P
F
 
M
L
 
H
C
 
L
A
 
S
R
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
R
H
 
E
M
 
M
R
 
R
D
 
K
G
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
x
V
A
 
A
S
|
S
I
 
V
L
 
Q
G
 
G
I
 
L
S
 
F
G
 
-
G
 
A
W
 
E
Y
 
Q
P
 
E
N
|
N
I
 
A
V
 
A
Y
|
Y
Q
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
L
V
 
V
N
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
S
W
 
L
A
 
A
V
 
L
E
 
D
W
 
L
A
 
A
P
 
P
Y
 
L
N
 
R
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
S
x
G
I
 
A
I
|
I
R
 
A
T
|
T
P
 
E
M
x
A
T
x
V
E
 
L
A
 
E
L
 
A
T
 
I
S
 
A
Q
 
R
P
 
R
D
 
D
V
 
-
V
 
-
A
 
-
K
 
-
F
 
W
E
 
E
A
 
D
L
 
L
T
 
H
P
 
A
L
 
L
G
 
R
R
 
R
L
 
L
C
 
G
E
 
K
P
 
P
A
 
E
D
 
E
M
 
V
T
 
A
G
 
E
P
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
T
 
S
A
 
E
A
 
K
S
 
A
S
 
S
M
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
H
 
A
I
 
I
L
 
L
P
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
M
L
 
T
A
 
A

5itvD Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
37% identity, 97% coverage: 8:254/254 of query aligns to 3:227/227 of 5itvD

query
sites
5itvD
F
 
M
R
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
D
Q
 
K
V
 
T
T
 
V
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
Y
A
 
A
L
 
A
A
 
V
H
 
Q
T
 
A
F
 
F
A
 
L
G
 
G
A
 
Q
G
 
Q
A
 
A
R
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
A
D
|
D
T
x
I
N
 
D
G
 
E
A
 
A
A
 
Q
A
 
G
E
 
E
Q
 
A
V
 
M
A
 
V
N
 
R
E
 
K
I
 
E
G
 
N
S
 
N
M
 
D
A
 
R
Q
 
L
H
 
H
A
 
F
V
 
V
-
 
Q
A
x
T
D
|
D
V
x
I
S
 
T
N
 
D
E
 
E
D
 
A
A
 
A
I
 
C
E
 
Q
S
 
H
V
 
A
M
 
V
E
 
E
D
 
S
V
 
A
A
 
V
R
 
H
Q
 
T
H
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
N
 
E
R
 
I
R
 
V
N
 
A
T
 
P
S
 
I
F
 
H
D
 
E
L
 
M
T
 
E
I
 
L
A
 
S
D
 
D
W
 
W
N
 
N
A
 
K
V
 
V
V
 
L
A
 
Q
V
 
V
N
 
N
M
 
L
T
 
T
G
 
G
M
 
M
F
 
F
L
 
L
C
 
M
A
 
S
R
 
K
A
 
H
A
 
A
A
 
L
R
 
K
H
 
H
M
 
M
R
 
L
D
 
A
G
 
A
G
 
G
G
 
K
G
 
G
R
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
|
T
A
 
C
S
|
S
I
 
V
L
 
G
G
 
G
I
 
L
S
 
V
G
 
A
G
 
-
W
 
-
Y
 
W
P
 
P
N
 
D
I
 
I
-
 
P
V
 
A
Y
|
Y
Q
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
V
V
 
L
N
 
Q
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
W
 
M
A
 
A
V
 
V
E
 
D
W
 
Y
A
 
A
P
 
K
Y
 
H
N
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
A
 
C
P
|
P
S
x
G
I
 
I
I
|
I
R
 
D
T
 
T
P
 
L
M
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
T
 
-
S
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
K
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
R
L
 
L
C
 
G
E
 
K
P
 
P
A
 
E
D
 
E
M
 
I
T
 
A
G
 
N
P
 
V
V
 
M
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
T
 
S
A
 
D
A
 
L
S
 
S
S
 
S
M
 
Y
V
 
M
T
 
T
G
 
G
H
 
S
I
 
A
L
 
I
P
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
L
 
T
A
 
A
Q
 
Q

Q9LBG2 Levodione reductase; (6R)-2,2,6-trimethyl-1,4-cyclohexanedione reductase; EC 1.1.1.- from Leifsonia aquatica (Corynebacterium aquaticum) (see paper)
37% identity, 96% coverage: 6:250/254 of query aligns to 7:262/267 of Q9LBG2

query
sites
Q9LBG2
P
 
P
D
 
T
F
 
T
R
 
R
L
 
F
T
 
T
G
 
D
Q
 
R
V
 
V
T
 
V
V
x
L
V
x
I
T
|
T
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
G
|
G
I
x
L
G
|
G
K
x
R
A
|
A
L
x
T
A
|
A
H
x
V
T
x
R
F
x
L
A
|
A
G
x
A
A
x
E
G
|
G
A
|
A
R
x
K
V
x
L
V
x
S
V
x
L
L
 
V
D
 
D
T
 
V
N
 
S
G
 
S
A
 
E
A
 
G
A
 
L
E
 
E
Q
 
A
V
 
S
A
 
K
N
 
A
E
 
A
I
 
V
G
 
L
S
 
E
M
 
T
A
 
A
Q
 
P
H
 
D
A
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
L
-
 
T
-
 
T
V
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
V
S
 
S
N
 
D
E
 
E
D
 
A
A
 
Q
I
 
V
E
 
E
S
 
A
V
 
Y
M
 
V
E
 
T
D
 
A
V
 
T
A
 
T
R
 
E
Q
 
R
H
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
G
L
 
F
F
 
F
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
N
x
E
-
 
G
R
 
K
R
 
Q
N
 
N
T
 
P
S
 
T
F
 
E
D
 
S
L
 
F
T
 
T
I
 
A
A
 
A
D
 
E
W
 
F
N
 
D
A
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
S
V
 
I
N
 
N
M
 
L
T
 
R
G
 
G
M
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
G
A
 
L
R
 
E
A
 
K
A
 
V
A
 
L
R
 
K
H
 
I
M
 
M
R
 
R
D
 
E
G
 
Q
G
 
G
G
 
S
G
 
G
R
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
T
A
 
A
S
 
S
I
 
V
L
 
G
G
 
G
I
 
I
S
 
R
G
 
G
G
 
I
W
 
G
Y
 
N
P
 
Q
N
 
S
I
 
-
V
 
G
Y
 
Y
Q
 
A
A
 
A
T
 
A
K
 
K
G
 
H
A
 
G
V
 
V
V
 
V
N
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
N
W
 
S
A
 
A
V
 
V
E
 
E
W
 
Y
A
 
G
P
 
R
Y
 
Y
N
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
A
P
 
P
S
 
G
I
 
A
I
 
I
R
 
W
T
 
T
P
 
P
M
 
M
T
 
V
E
 
E
A
 
N
L
 
S
T
 
M
S
 
K
Q
 
Q
P
 
L
D
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
N
-
 
P
-
 
R
-
 
K
V
 
A
V
 
A
A
 
E
K
 
E
F
 
F
E
 
I
A
 
Q
L
 
V
T
 
N
P
 
P
L
 
S
G
 
K
R
 
R
L
 
Y
C
 
G
E
 
E
P
 
A
A
 
P
D
 
E
M
 
I
T
 
A
G
 
A
P
 
V
V
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
L
T
 
S
A
 
D
A
 
D
S
 
A
S
 
S
M
 
Y
V
 
V
T
 
N
G
 
A
H
 
T
I
 
V
L
 
V
P
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
39% identity, 95% coverage: 10:250/254 of query aligns to 2:241/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
T
 
Q
G
 
N
Q
 
R
V
 
V
T
 
A
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
A
S
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
K
 
K
A
 
Q
L
 
T
A
 
A
H
 
L
T
 
R
F
 
F
A
 
A
G
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
I
L
 
N
D
|
D
T
x
I
N
 
D
G
 
A
A
 
E
A
 
K
A
 
V
E
 
R
Q
 
A
V
 
T
A
 
V
N
 
D
E
 
E
I
 
F
G
 
S
S
 
A
M
 
R
A
 
G
Q
 
H
H
 
R
-
 
V
-
 
L
-
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
D
V
x
I
S
 
G
N
 
N
E
 
K
D
 
A
A
 
A
I
 
V
E
 
D
S
 
G
V
 
M
M
 
V
E
 
K
D
 
Q
V
 
T
A
 
I
R
 
D
Q
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
 
M
N
 
E
R
 
R
R
 
A
N
 
G
T
 
A
S
 
L
F
 
R
D
 
K
L
 
L
T
 
S
I
 
E
A
 
A
D
 
D
W
 
W
N
 
D
A
 
V
V
 
T
V
 
I
A
 
N
V
 
V
N
 
N
M
 
L
T
 
K
G
 
G
M
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
A
 
T
R
 
Q
A
 
A
A
 
V
A
 
H
R
 
G
H
 
H
M
 
M
R
 
V
D
 
E
G
 
N
G
 
K
G
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
x
I
A
 
A
S
|
S
I
 
R
L
 
A
G
 
W
I
 
L
S
 
G
G
 
G
-
 
A
G
 
G
W
 
Q
Y
 
T
P
 
P
N
 
-
I
 
-
V
 
-
Y
|
Y
Q
 
S
A
 
S
T
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
V
 
V
N
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
R
S
 
A
W
 
L
A
 
A
V
 
I
E
 
E
W
 
L
A
 
G
P
 
R
Y
 
A
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
G
I
 
L
I
|
I
R
 
H
T
 
T
P
 
P
M
 
M
T
 
W
E
 
D
A
 
E
L
 
L
T
 
-
S
 
-
Q
 
-
P
 
P
D
 
E
V
 
K
V
 
D
A
 
Q
K
 
Q
F
 
F
-
 
L
E
 
L
A
 
S
L
 
R
T
 
Q
P
 
P
L
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
L
C
 
G
E
 
E
P
 
P
A
 
D
D
 
D
M
 
I
T
 
A
G
 
N
P
 
T
V
 
L
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
T
 
D
A
 
D
A
 
D
S
 
S
S
 
G
M
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
H
 
Q
I
 
V
L
 
L
P
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
37% identity, 96% coverage: 10:252/254 of query aligns to 3:246/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
T
 
Q
G
 
G
Q
 
K
V
 
V
T
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
D
L
 
I
A
 
A
H
 
I
T
 
N
F
 
L
A
 
A
G
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
N
V
 
I
V
 
F
V
 
-
L
 
F
D
x
N
T
x
Y
N
|
N
G
|
G
A
x
S
-
 
P
-
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
V
 
T
A
 
A
N
 
K
E
 
L
I
 
V
G
 
-
S
 
-
M
 
-
A
 
A
Q
 
E
H
 
H
A
 
G
V
 
V
-
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
M
-
 
K
A
 
A
D
x
N
V
|
V
S
 
A
N
 
I
E
 
A
D
 
E
A
 
D
I
 
V
E
 
D
S
 
A
V
 
F
M
 
F
E
 
K
D
 
Q
V
 
A
A
 
I
R
 
E
Q
 
R
H
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
x
I
N
 
T
R
 
R
R
 
D
N
 
N
T
 
L
S
 
L
F
 
M
D
 
R
L
 
M
T
 
K
I
 
E
A
 
D
D
 
E
W
 
W
N
 
D
A
 
D
V
 
V
V
 
I
A
 
N
V
x
I
N
 
N
M
 
L
T
 
K
G
 
G
M
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
A
 
T
R
 
K
A
 
A
A
 
V
A
 
S
R
 
R
H
 
T
M
 
M
R
 
M
D
 
K
G
 
Q
G
 
R
G
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
 
M
A
 
A
S
|
S
I
 
V
L
 
V
G
 
G
I
 
L
S
 
I
G
 
G
G
 
N
W
 
A
Y
 
-
P
 
G
N
x
Q
I
 
A
V
 
N
Y
|
Y
Q
 
V
A
 
A
T
 
S
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
V
 
I
N
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
T
W
 
T
A
 
A
V
 
R
E
 
E
W
 
L
A
 
A
P
 
P
Y
 
R
N
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
S
 
G
I
 
F
I
|
I
R
 
T
T
|
T
P
 
D
M
 
M
T
 
T
E
 
D
A
 
K
L
 
L
T
 
D
S
 
E
Q
 
K
P
 
T
D
 
K
V
 
-
V
 
-
A
 
E
K
 
A
F
 
M
E
 
L
A
 
A
L
 
Q
T
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
A
L
 
Y
C
 
G
E
 
T
P
 
T
A
 
E
D
 
D
M
 
I
T
 
A
G
 
N
P
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
T
 
S
A
 
D
A
 
A
S
 
S
S
 
K
M
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
H
 
Q
I
 
T
L
 
L
P
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
M
L
 
V

Query Sequence

>RR42_RS31670 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS31670
MPHPFPDFRLTGQVTVVTGGGSGIGKALAHTFAGAGARVVVLDTNGAAAEQVANEIGSMA
QHAVADVSNEDAIESVMEDVARQHGRIDVLFNNAGVNRRNTSFDLTIADWNAVVAVNMTG
MFLCARAAARHMRDGGGGRIVNTASILGISGGWYPNIVYQATKGAVVNMTRSWAVEWAPY
NIRVNAVAPSIIRTPMTEALTSQPDVVAKFEALTPLGRLCEPADMTGPVLFLATAASSMV
TGHILPVDGGVLAQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory