SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS31850 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS31850 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 8 hits to proteins with known functional sites (download)

2eb5A Crystal structure of hpcg complexed with oxalate (see paper)
38% identity, 97% coverage: 9:259/260 of query aligns to 10:258/259 of 2eb5A

query
sites
2eb5A
L
 
I
G
 
A
E
 
Q
E
 
R
L
 
L
H
 
D
Q
 
Q
A
 
A
L
 
E
T
 
K
A
 
Q
R
 
R
V
 
E
P
 
Q
V
 
I
A
 
R
P
 
A
L
 
I
S
 
S
G
 
L
R
 
D
G
 
Y
D
 
P
P
 
E
I
 
I
T
 
T
V
 
I
R
 
E
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
R
 
A
I
 
V
Q
 
Q
Q
 
R
Q
 
E
F
 
W
V
 
V
A
 
R
H
 
L
R
 
K
L
 
I
A
 
A
H
 
E
G
 
G
D
 
R
R
 
T
I
 
L
T
 
K
G
 
G
K
 
H
K
|
K
I
 
I
G
|
G
V
x
L
T
 
T
S
 
S
L
 
K
P
 
A
V
 
M
Q
 
Q
Q
 
A
M
 
S
L
 
S
D
 
Q
V
 
I
H
 
S
Q
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
Y
G
 
G
M
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
D
S
 
D
M
 
M
R
 
F
Y
 
F
P
 
H
D
 
D
G
 
G
Q
 
S
P
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
T
A
 
D
T
 
R
L
 
F
I
 
I
Q
 
V
P
 
P
R
 
R
A
 
I
E
|
E
G
 
V
E
|
E
I
 
L
A
 
A
F
 
F
F
 
V
L
 
L
K
 
A
R
 
K
D
 
P
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
N
V
 
C
T
 
T
R
 
L
A
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
Y
A
 
N
A
 
A
T
 
T
E
 
D
A
 
Y
V
 
V
S
 
I
A
 
P
C
 
A
F
 
L
E
|
E
I
 
L
V
 
I
D
 
D
S
 
A
R
 
R
I
 
C
L
 
H
D
 
N
W
 
-
R
 
-
I
 
I
R
 
K
I
 
V
E
 
F
D
 
D
T
 
T
V
 
I
A
 
S
D
 
D
N
 
N
A
 
A
S
 
A
C
 
N
G
 
A
A
 
G
Y
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
E
 
G
E
 
R
R
 
P
V
 
I
S
 
K
P
 
P
A
 
D
G
 
E
L
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
R
G
 
W
C
 
I
A
 
S
M
 
A
T
 
L
L
 
M
E
 
Y
K
 
R
N
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
I
V
 
E
A
 
E
T
 
T
G
 
G
Q
 
V
G
 
A
S
 
A
A
 
G
A
 
V
L
 
L
G
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
E
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
W
 
W
L
 
L
A
 
A
N
 
N
T
 
K
L
 
L
G
 
A
A
 
P
L
 
Y
G
 
D
I
 
V
G
 
Q
L
 
L
L
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
T
 
I
I
 
I
L
 
L
S
 
G
G
|
G
S
|
S
L
 
F
A
 
T
A
 
R
L
 
P
I
 
V
P
 
P
V
 
A
V
 
R
A
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
T
L
 
F
H
 
H
L
 
V
R
 
D
I
 
Y
D
 
G
G
 
N
I
 
M
G
 
G
S
 
S
C
 
I
S
 
S
T
 
C
R
 
R
F
 
F

2eb6A Crystal structure of hpcg complexed with mg ion (see paper)
38% identity, 97% coverage: 9:259/260 of query aligns to 10:266/267 of 2eb6A

query
sites
2eb6A
L
 
I
G
 
A
E
 
Q
E
 
R
L
 
L
H
 
D
Q
 
Q
A
 
A
L
 
E
T
 
K
A
 
Q
R
 
R
V
 
E
P
 
Q
V
 
I
A
 
R
P
 
A
L
 
I
S
 
S
G
 
L
R
 
D
G
 
Y
D
 
P
P
 
E
I
 
I
T
 
T
V
 
I
R
 
E
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
R
 
A
I
 
V
Q
 
Q
Q
 
R
Q
 
E
F
 
W
V
 
V
A
 
R
H
 
L
R
 
K
L
 
I
A
 
A
H
 
E
G
 
G
D
 
R
R
 
T
I
 
L
T
 
K
G
 
G
K
 
H
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
L
T
 
T
S
 
S
L
 
K
P
 
A
V
 
M
Q
 
Q
Q
 
A
M
 
S
L
 
S
D
 
Q
V
 
I
H
 
S
Q
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
Y
G
 
G
M
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
D
S
 
D
M
 
M
R
 
F
Y
 
F
P
 
H
D
 
D
G
 
G
Q
 
S
P
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
T
A
 
D
T
 
R
L
 
F
I
 
I
Q
 
V
P
 
P
R
 
R
A
 
I
E
|
E
G
 
V
E
|
E
I
 
L
A
 
A
F
 
F
F
 
V
L
 
L
K
 
A
R
 
K
D
 
P
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
N
V
 
C
T
 
T
R
 
L
A
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
Y
A
 
N
A
 
A
T
 
T
E
 
D
A
 
Y
V
 
V
S
 
I
A
 
P
C
 
A
F
 
L
E
|
E
I
 
L
V
 
I
D
 
D
S
 
A
R
 
R
I
 
C
L
 
H
D
 
N
-
 
I
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
T
W
 
Q
R
 
R
I
 
P
R
 
R
-
 
K
I
 
V
E
 
F
D
 
D
T
 
T
V
 
I
A
 
S
D
 
D
N
 
N
A
 
A
S
 
A
C
 
N
G
 
A
A
 
G
Y
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
E
 
G
E
 
R
R
 
P
V
 
I
S
 
K
P
 
P
A
 
D
G
 
E
L
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
R
G
 
W
C
 
I
A
 
S
M
 
A
T
 
L
L
 
M
E
 
Y
K
 
R
N
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
I
V
 
E
A
 
E
T
 
T
G
 
G
Q
 
V
G
 
A
S
 
A
A
 
G
A
 
V
L
 
L
G
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
E
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
W
 
W
L
 
L
A
 
A
N
 
N
T
 
K
L
 
L
G
 
A
A
 
P
L
 
Y
G
 
D
I
 
V
G
 
Q
L
 
L
L
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
T
 
I
I
 
I
L
 
L
S
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
F
A
 
T
A
 
R
L
 
P
I
 
V
P
 
P
V
 
A
V
 
R
A
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
T
L
 
F
H
 
H
L
 
V
R
 
D
I
 
Y
D
 
G
G
 
N
I
 
M
G
 
G
S
 
S
C
 
I
S
 
S
T
 
C
R
 
R
F
 
F

P42270 2-oxo-hept-4-ene-1,7-dioate hydratase; OHED hydratase; EC 4.2.1.163 from Escherichia coli (see paper)
38% identity, 97% coverage: 9:259/260 of query aligns to 10:266/267 of P42270

query
sites
P42270
L
 
I
G
 
A
E
 
Q
E
 
R
L
 
L
H
 
D
Q
 
Q
A
 
A
L
 
E
T
 
K
A
 
Q
R
 
R
V
 
E
P
 
Q
V
 
I
A
 
R
P
 
A
L
 
I
S
 
S
G
 
L
R
 
D
G
 
Y
D
 
P
P
 
E
I
 
I
T
 
T
V
 
I
R
 
E
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
R
 
A
I
 
V
Q
 
Q
Q
 
R
Q
 
E
F
 
W
V
 
V
A
 
R
H
 
L
R
 
K
L
 
I
A
 
A
H
 
E
G
 
G
D
 
R
R
 
T
I
 
L
T
 
K
G
 
G
K
 
H
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
L
T
 
T
S
 
S
L
 
K
P
 
A
V
 
M
Q
 
Q
Q
 
A
M
 
S
L
 
S
D
 
Q
V
 
I
H
 
S
Q
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
Y
G
 
G
M
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
D
S
 
D
M
 
M
R
 
F
Y
 
F
P
 
H
D
 
D
G
 
G
Q
 
S
P
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
T
A
 
D
T
 
R
L
 
F
I
 
I
Q
 
V
P
 
P
R
 
R
A
 
I
E
|
E
G
 
V
E
|
E
I
 
L
A
 
A
F
 
F
F
 
V
L
 
L
K
 
A
R
 
K
D
 
P
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
N
V
 
C
T
 
T
R
 
L
A
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
Y
A
 
N
A
 
A
T
 
T
E
 
D
A
 
Y
V
 
V
S
 
I
A
 
P
C
 
A
F
 
L
E
|
E
I
 
L
V
 
I
D
 
D
S
 
A
R
 
R
I
 
C
L
 
H
D
 
N
-
 
I
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
T
W
 
Q
R
 
R
I
 
P
R
 
R
-
 
K
I
 
V
E
 
F
D
 
D
T
 
T
V
 
I
A
 
S
D
 
D
N
 
N
A
 
A
S
 
A
C
 
N
G
 
A
A
 
G
Y
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
E
 
G
E
 
R
R
 
P
V
 
I
S
 
K
P
 
P
A
 
D
G
 
E
L
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
R
G
 
W
C
 
I
A
 
S
M
 
A
T
 
L
L
 
M
E
 
Y
K
 
R
N
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
I
V
 
E
A
 
E
T
 
T
G
 
G
Q
 
V
G
 
A
S
 
A
A
 
G
A
 
V
L
 
L
G
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
E
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
W
 
W
L
 
L
A
 
A
N
 
N
T
 
K
L
 
L
G
 
A
A
 
P
L
 
Y
G
 
D
I
 
V
G
 
Q
L
 
L
L
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
T
 
I
I
 
I
L
 
L
S
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
F
A
 
T
A
 
R
L
 
P
I
 
V
P
 
P
V
 
A
V
 
R
A
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
T
L
 
F
H
 
H
L
 
V
R
 
D
I
 
Y
D
 
G
G
 
N
I
 
M
G
 
G
S
 
S
C
 
I
S
 
S
T
 
C
R
 
R
F
 
F

5d2kA 4-oxalocrotonate decarboxylase from pseudomonas putida g7 - complexed with magnesium and 2-oxoadipate (see paper)
35% identity, 98% coverage: 6:259/260 of query aligns to 9:262/263 of 5d2kA

query
sites
5d2kA
I
 
V
A
 
L
S
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
E
E
 
H
L
 
I
H
 
E
Q
 
N
A
 
A
L
 
E
T
 
L
A
 
N
R
 
V
V
 
H
P
 
D
V
 
I
A
 
G
P
 
K
L
 
V
S
 
T
G
 
N
R
 
D
G
 
F
D
 
P
P
 
E
I
 
M
T
 
T
V
 
F
R
 
A
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
R
 
D
I
 
V
Q
 
Q
Q
 
W
Q
 
E
F
 
I
V
 
R
A
 
R
H
 
R
R
 
K
L
 
E
A
 
A
H
 
R
G
 
G
D
 
N
R
 
K
I
 
I
T
 
V
G
 
G
K
 
L
K
|
K
I
 
M
G
|
G
V
x
L
T
 
T
S
 
S
L
 
W
P
 
A
V
x
K
Q
 
M
Q
 
A
M
 
Q
L
x
M
D
 
G
V
 
V
H
 
E
Q
 
T
P
 
P
D
 
I
F
 
Y
G
 
G
M
 
F
L
 
L
L
 
A
A
 
D
S
 
Y
M
 
F
R
 
S
Y
 
V
P
 
P
D
 
D
G
 
G
Q
 
G
P
 
V
I
 
V
P
 
D
A
 
C
A
 
S
T
 
K
L
 
L
I
 
I
Q
 
H
P
 
P
R
 
K
A
 
I
E
|
E
G
 
A
E
|
E
I
 
I
A
 
S
F
 
V
F
 
V
L
 
T
K
 
K
R
 
A
D
 
P
L
 
L
R
 
H
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
C
T
 
H
R
 
L
A
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
I
A
 
A
A
 
A
T
 
I
E
 
D
A
 
Y
V
 
V
S
 
I
A
 
P
C
 
T
F
 
V
E
|
E
I
 
V
V
 
I
D
 
D
S
 
S
R
 
R
I
 
Y
L
 
E
D
 
N
W
 
F
R
 
K
I
x
F
R
 
D
I
 
P
E
 
I
D
 
S
T
 
V
V
 
V
A
 
A
D
 
D
N
 
N
A
|
A
S
|
S
C
 
S
G
 
T
A
 
R
Y
 
F
V
 
I
L
 
T
G
 
G
E
 
G
E
 
R
R
 
M
V
 
A
S
 
S
P
 
L
A
 
E
G
 
E
L
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
R
G
 
T
C
 
L
A
 
G
M
 
V
T
 
V
L
 
M
E
 
E
K
 
K
N
 
N
G
 
G
V
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
E
T
 
L
G
 
G
Q
 
A
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
V
L
 
L
G
 
G
H
 
H
P
 
P
A
 
L
E
 
S
A
 
S
V
 
V
A
 
A
W
 
M
L
 
L
A
 
A
N
 
N
T
 
L
L
 
L
G
 
A
A
 
E
L
 
R
G
 
G
I
 
E
G
 
H
L
 
I
L
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
T
T
 
F
I
 
I
L
 
M
S
 
T
G
|
G
S
x
G
L
 
I
A
 
T
A
 
A
L
 
A
I
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
A
A
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
N
L
 
I
H
 
T
L
 
V
R
 
R
I
 
Y
D
 
Q
G
 
G
I
 
L
G
 
G
S
 
S
C
 
V
S
 
S
T
 
A
R
 
R
F
 
F

5d2jA 4-oxalocrotonate decarboxylase from pseudomonas putida g7 - complexed with magnesium and adipate (see paper)
35% identity, 98% coverage: 6:259/260 of query aligns to 9:262/263 of 5d2jA

query
sites
5d2jA
I
 
V
A
 
L
S
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
E
E
 
H
L
 
I
H
 
E
Q
 
N
A
 
A
L
 
E
T
 
L
A
 
N
R
 
V
V
 
H
P
 
D
V
 
I
A
 
G
P
 
K
L
 
V
S
 
T
G
 
N
R
 
D
G
 
F
D
 
P
P
 
E
I
 
M
T
 
T
V
 
F
R
 
A
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
R
 
D
I
 
V
Q
 
Q
Q
 
W
Q
 
E
F
 
I
V
 
R
A
 
R
H
 
R
R
 
K
L
 
E
A
 
A
H
 
R
G
 
G
D
 
N
R
 
K
I
 
I
T
 
V
G
 
G
K
 
L
K
|
K
I
 
M
G
|
G
V
 
L
T
 
T
S
 
S
L
 
W
P
 
A
V
 
K
Q
 
M
Q
 
A
M
 
Q
L
 
M
D
 
G
V
 
V
H
 
E
Q
 
T
P
 
P
D
 
I
F
 
Y
G
 
G
M
 
F
L
 
L
L
 
A
A
 
D
S
 
Y
M
 
F
R
 
S
Y
 
V
P
 
P
D
 
D
G
 
G
Q
 
G
P
 
V
I
 
V
P
 
D
A
 
C
A
 
S
T
 
K
L
 
L
I
 
I
Q
 
H
P
 
P
R
 
K
A
 
I
E
|
E
G
 
A
E
|
E
I
 
I
A
 
S
F
 
V
F
 
V
L
 
T
K
 
K
R
 
A
D
 
P
L
 
L
R
 
H
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
C
T
 
H
R
 
L
A
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
I
A
 
A
A
 
A
T
 
I
E
 
D
A
 
Y
V
 
V
S
 
I
A
 
P
C
 
T
F
 
V
E
|
E
I
 
V
V
 
I
D
 
D
S
 
S
R
 
R
I
 
Y
L
 
E
D
 
N
W
 
F
R
 
K
I
 
F
R
 
D
I
 
P
E
 
I
D
 
S
T
 
V
V
 
V
A
 
A
D
 
D
N
 
N
A
 
A
S
|
S
C
 
S
G
 
T
A
 
R
Y
 
F
V
 
I
L
 
T
G
 
G
E
 
G
E
 
R
R
 
M
V
 
A
S
 
S
P
 
L
A
 
E
G
 
E
L
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
R
G
 
T
C
 
L
A
 
G
M
 
V
T
 
V
L
 
M
E
 
E
K
 
K
N
 
N
G
 
G
V
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
E
T
 
L
G
 
G
Q
 
A
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
V
L
 
L
G
 
G
H
 
H
P
 
P
A
 
L
E
 
S
A
 
S
V
 
V
A
 
A
W
 
M
L
 
L
A
 
A
N
 
N
T
 
L
L
 
L
G
 
A
A
 
E
L
 
R
G
 
G
I
 
E
G
 
H
L
 
I
L
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
T
T
 
F
I
 
I
L
 
M
S
 
T
G
 
G
S
 
G
L
 
I
A
 
T
A
 
A
L
 
A
I
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
A
A
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
N
L
 
I
H
 
T
L
 
V
R
 
R
I
 
Y
D
 
Q
G
 
G
I
 
L
G
 
G
S
 
S
C
 
V
S
 
S
T
 
A
R
 
R
F
 
F

5d2iA 4-oxalocrotonate decarboxylase from pseudomonas putida g7 - complexed with calcium and acetate (see paper)
35% identity, 98% coverage: 6:259/260 of query aligns to 9:262/263 of 5d2iA

query
sites
5d2iA
I
 
V
A
 
L
S
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
E
E
 
H
L
 
I
H
 
E
Q
 
N
A
 
A
L
 
E
T
 
L
A
 
N
R
 
V
V
 
H
P
 
D
V
 
I
A
 
G
P
 
K
L
 
V
S
 
T
G
 
N
R
 
D
G
 
F
D
 
P
P
 
E
I
 
M
T
 
T
V
 
F
R
 
A
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
R
 
D
I
 
V
Q
 
Q
Q
 
W
Q
 
E
F
 
I
V
 
R
A
 
R
H
 
R
R
 
K
L
 
E
A
 
A
H
 
R
G
 
G
D
 
N
R
 
K
I
 
I
T
 
V
G
 
G
K
 
L
K
|
K
I
 
M
G
|
G
V
 
L
T
 
T
S
 
S
L
 
W
P
 
A
V
 
K
Q
 
M
Q
 
A
M
 
Q
L
 
M
D
 
G
V
 
V
H
 
E
Q
 
T
P
 
P
D
 
I
F
 
Y
G
 
G
M
 
F
L
 
L
L
 
A
A
 
D
S
 
Y
M
 
F
R
 
S
Y
 
V
P
 
P
D
|
D
G
 
G
Q
 
G
P
 
V
I
 
V
P
 
D
A
 
C
A
 
S
T
 
K
L
 
L
I
 
I
Q
 
H
P
 
P
R
 
K
A
 
I
E
|
E
G
 
A
E
|
E
I
 
I
A
 
S
F
 
V
F
 
V
L
 
T
K
 
K
R
 
A
D
 
P
L
 
L
R
 
H
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
C
T
 
H
R
 
L
A
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
I
A
 
A
A
 
A
T
 
I
E
 
D
A
 
Y
V
 
V
S
 
I
A
 
P
C
 
T
F
 
V
E
|
E
I
 
V
V
 
I
D
 
D
S
 
S
R
 
R
I
 
Y
L
 
E
D
 
N
W
 
F
R
 
K
I
 
F
R
 
D
I
 
P
E
 
I
D
 
S
T
 
V
V
 
V
A
 
A
D
 
D
N
 
N
A
 
A
S
 
S
C
 
S
G
 
T
A
 
R
Y
 
F
V
 
I
L
 
T
G
 
G
E
 
G
E
 
R
R
 
M
V
 
A
S
 
S
P
 
L
A
 
E
G
 
E
L
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
R
G
 
T
C
 
L
A
 
G
M
 
V
T
 
V
L
 
M
E
 
E
K
 
K
N
 
N
G
 
G
V
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
E
T
 
L
G
 
G
Q
 
A
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
V
L
 
L
G
 
G
H
 
H
P
 
P
A
 
L
E
 
S
A
 
S
V
 
V
A
 
A
W
 
M
L
 
L
A
 
A
N
 
N
T
 
L
L
 
L
G
 
A
A
 
E
L
 
R
G
 
G
I
 
E
G
 
H
L
 
I
L
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
T
T
 
F
I
 
I
L
 
M
S
 
T
G
 
G
S
 
G
L
 
I
A
 
T
A
 
A
L
 
A
I
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
A
A
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
N
L
 
I
H
 
T
L
 
V
R
 
R
I
 
Y
D
 
Q
G
 
G
I
 
L
G
 
G
S
|
S
C
 
V
S
 
S
T
 
A
R
 
R
F
 
F

5d2hA 4-oxalocrotonate decarboxylase from pseudomonas putida g7 - complexed with magnesium and alpha-ketoglutarate (see paper)
35% identity, 98% coverage: 6:259/260 of query aligns to 9:262/263 of 5d2hA

query
sites
5d2hA
I
 
V
A
 
L
S
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
E
E
 
H
L
 
I
H
 
E
Q
 
N
A
 
A
L
 
E
T
 
L
A
 
N
R
 
V
V
 
H
P
 
D
V
 
I
A
 
G
P
 
K
L
 
V
S
 
T
G
 
N
R
 
D
G
 
F
D
 
P
P
 
E
I
 
M
T
 
T
V
 
F
R
 
A
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
R
 
D
I
 
V
Q
 
Q
Q
 
W
Q
 
E
F
 
I
V
 
R
A
 
R
H
 
R
R
 
K
L
 
E
A
 
A
H
 
R
G
 
G
D
 
N
R
 
K
I
 
I
T
 
V
G
 
G
K
 
L
K
|
K
I
 
M
G
|
G
V
x
L
T
 
T
S
 
S
L
 
W
P
 
A
V
x
K
Q
 
M
Q
 
A
M
 
Q
L
 
M
D
 
G
V
 
V
H
 
E
Q
 
T
P
 
P
D
 
I
F
 
Y
G
 
G
M
 
F
L
 
L
L
 
A
A
 
D
S
 
Y
M
 
F
R
 
S
Y
 
V
P
 
P
D
 
D
G
 
G
Q
 
G
P
 
V
I
 
V
P
 
D
A
 
C
A
 
S
T
 
K
L
 
L
I
 
I
Q
 
H
P
 
P
R
 
K
A
 
I
E
|
E
G
 
A
E
|
E
I
 
I
A
 
S
F
 
V
F
 
V
L
 
T
K
 
K
R
 
A
D
 
P
L
 
L
R
 
H
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
C
T
 
H
R
 
L
A
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
I
A
 
A
A
 
A
T
 
I
E
 
D
A
 
Y
V
 
V
S
 
I
A
 
P
C
 
T
F
 
V
E
|
E
I
 
V
V
 
I
D
 
D
S
 
S
R
 
R
I
 
Y
L
 
E
D
 
N
W
 
F
R
 
K
I
 
F
R
 
D
I
 
P
E
 
I
D
 
S
T
 
V
V
 
V
A
 
A
D
 
D
N
 
N
A
|
A
S
 
S
C
 
S
G
 
T
A
 
R
Y
 
F
V
 
I
L
 
T
G
 
G
E
 
G
E
 
R
R
 
M
V
 
A
S
 
S
P
 
L
A
 
E
G
 
E
L
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
R
G
 
T
C
 
L
A
 
G
M
 
V
T
 
V
L
 
M
E
 
E
K
 
K
N
 
N
G
 
G
V
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
E
T
 
L
G
 
G
Q
 
A
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
V
L
 
L
G
 
G
H
 
H
P
 
P
A
 
L
E
 
S
A
 
S
V
 
V
A
 
A
W
 
M
L
 
L
A
 
A
N
 
N
T
 
L
L
 
L
G
 
A
A
 
E
L
 
R
G
 
G
I
 
E
G
 
H
L
 
I
L
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
T
T
 
F
I
 
I
L
 
M
S
 
T
G
 
G
S
 
G
L
 
I
A
 
T
A
 
A
L
 
A
I
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
A
A
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
N
L
 
I
H
 
T
L
 
V
R
 
R
I
 
Y
D
 
Q
G
 
G
I
 
L
G
 
G
S
 
S
C
 
V
S
 
S
T
 
A
R
 
R
F
 
F

5d2gA 4-oxalocrotonate decarboxylase from pseudomonas putida g7 - complexed with magnesium (see paper)
35% identity, 98% coverage: 6:259/260 of query aligns to 9:262/263 of 5d2gA

query
sites
5d2gA
I
 
V
A
 
L
S
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
E
E
 
H
L
 
I
H
 
E
Q
 
N
A
 
A
L
 
E
T
 
L
A
 
N
R
 
V
V
 
H
P
 
D
V
 
I
A
 
G
P
 
K
L
 
V
S
 
T
G
 
N
R
 
D
G
 
F
D
 
P
P
 
E
I
 
M
T
 
T
V
 
F
R
 
A
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
R
 
D
I
 
V
Q
 
Q
Q
 
W
Q
 
E
F
 
I
V
 
R
A
 
R
H
 
R
R
 
K
L
 
E
A
 
A
H
 
R
G
 
G
D
 
N
R
 
K
I
 
I
T
 
V
G
 
G
K
 
L
K
 
K
I
 
M
G
 
G
V
 
L
T
 
T
S
 
S
L
 
W
P
 
A
V
 
K
Q
 
M
Q
 
A
M
 
Q
L
 
M
D
 
G
V
 
V
H
 
E
Q
 
T
P
 
P
D
 
I
F
 
Y
G
 
G
M
 
F
L
 
L
L
 
A
A
 
D
S
 
Y
M
 
F
R
 
S
Y
 
V
P
 
P
D
 
D
G
 
G
Q
 
G
P
 
V
I
 
V
P
 
D
A
 
C
A
 
S
T
 
K
L
 
L
I
 
I
Q
 
H
P
 
P
R
 
K
A
 
I
E
|
E
G
 
A
E
|
E
I
 
I
A
 
S
F
 
V
F
 
V
L
 
T
K
 
K
R
 
A
D
 
P
L
 
L
R
 
H
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
C
T
 
H
R
 
L
A
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
I
A
 
A
A
 
A
T
 
I
E
 
D
A
 
Y
V
 
V
S
 
I
A
 
P
C
 
T
F
 
V
E
|
E
I
 
V
V
 
I
D
 
D
S
 
S
R
 
R
I
 
Y
L
 
E
D
 
N
W
 
F
R
 
K
I
 
F
R
 
D
I
 
P
E
 
I
D
 
S
T
 
V
V
 
V
A
 
A
D
 
D
N
 
N
A
 
A
S
 
S
C
 
S
G
 
T
A
 
R
Y
 
F
V
 
I
L
 
T
G
 
G
E
 
G
E
 
R
R
 
M
V
 
A
S
 
S
P
 
L
A
 
E
G
 
E
L
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
R
G
 
T
C
 
L
A
 
G
M
 
V
T
 
V
L
 
M
E
 
E
K
 
K
N
 
N
G
 
G
V
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
E
T
 
L
G
 
G
Q
 
A
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
V
L
 
L
G
 
G
H
 
H
P
 
P
A
 
L
E
 
S
A
 
S
V
 
V
A
 
A
W
 
M
L
 
L
A
 
A
N
 
N
T
 
L
L
 
L
G
 
A
A
 
E
L
 
R
G
 
G
I
 
E
G
 
H
L
 
I
L
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
T
T
 
F
I
 
I
L
 
M
S
 
T
G
 
G
S
 
G
L
 
I
A
 
T
A
 
A
L
 
A
I
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
A
A
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
N
L
 
I
H
 
T
L
 
V
R
 
R
I
 
Y
D
 
Q
G
 
G
I
 
L
G
 
G
S
 
S
C
 
V
S
 
S
T
 
A
R
 
R
F
 
F

Query Sequence

>RR42_RS31850 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS31850
MKPDLIASLGEELHQALTARVPVAPLSGRGDPITVRDAYRIQQQFVAHRLAHGDRITGKK
IGVTSLPVQQMLDVHQPDFGMLLASMRYPDGQPIPAATLIQPRAEGEIAFFLKRDLRGPG
VTRADVLAATEAVSACFEIVDSRILDWRIRIEDTVADNASCGAYVLGEERVSPAGLDLAG
CAMTLEKNGVVVATGQGSAALGHPAEAVAWLANTLGALGIGLLAGETILSGSLAALIPVV
AGDRLHLRIDGIGSCSTRFT

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory