SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS32885 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS32885 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2ioyA Crystal structure of thermoanaerobacter tengcongensis ribose binding protein (see paper)
37% identity, 83% coverage: 37:301/321 of query aligns to 11:274/274 of 2ioyA

query
sites
2ioyA
T
 
N
N
|
N
P
 
P
F
|
F
F
|
F
Q
 
V
V
 
T
V
 
L
R
 
K
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
E
A
 
K
A
 
A
K
 
K
S
 
E
M
 
L
N
 
G
A
 
Y
R
 
K
V
 
I
T
 
-
H
 
-
Y
 
I
I
 
V
P
 
E
T
 
D
K
 
S
P
 
Q
D
 
N
S
 
D
I
 
S
P
 
S
E
 
K
Q
 
E
M
 
L
S
 
S
Q
 
N
I
 
V
E
 
E
D
 
D
V
 
L
I
 
I
V
 
Q
K
 
Q
K
 
K
A
 
V
D
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
L
F
 
I
V
 
N
P
 
P
V
 
V
D
 
D
Y
 
S
K
 
D
A
 
A
M
 
V
G
 
V
P
 
T
G
 
A
V
 
I
K
 
K
K
 
E
I
 
A
N
 
N
A
 
S
A
 
K
N
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
T
V
 
I
T
x
D
D
x
R
K
 
S
S
 
A
D
 
N
V
 
G
G
 
G
N
 
D
F
 
V
V
 
V
S
 
C
F
 
H
I
 
I
G
 
A
A
 
S
S
 
D
D
 
N
Y
 
V
D
 
K
L
 
G
G
 
G
L
 
E
K
 
M
T
 
A
A
 
A
T
 
E
H
 
F
L
 
I
F
 
A
K
 
K
A
 
A
M
 
L
G
 
K
G
 
G
K
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
I
K
 
P
G
 
G
S
 
A
L
 
S
T
x
A
N
 
A
I
 
R
D
 
D
R
|
R
V
 
G
R
 
K
G
 
G
M
 
F
H
 
D
D
 
E
A
 
A
L
 
I
K
 
A
A
 
K
F
 
Y
P
 
P
G
 
D
I
 
I
K
 
K
L
 
I
V
 
V
A
 
A
S
 
K
Q
 
Q
P
 
A
A
 
A
N
 
D
Y
x
F
Q
 
D
R
 
R
L
 
S
Q
 
K
A
 
G
L
 
L
Q
 
S
V
 
V
M
 
M
E
 
E
N
 
N
L
 
I
M
 
L
Q
 
Q
S
 
A
Y
 
Q
P
 
P
Q
 
K
I
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
V
F
 
F
A
 
A
T
 
Q
N
|
N
D
 
D
A
 
E
M
 
M
A
 
A
I
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
E
 
K
A
 
A
L
 
I
Q
 
E
G
 
A
A
 
A
N
 
N
R
 
R
K
 
Q
A
 
G
-
 
I
L
 
I
V
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
F
N
x
D
G
 
G
T
 
T
Q
 
E
E
 
D
A
 
A
I
 
L
D
 
K
A
 
A
I
 
I
K
 
K
A
 
E
G
 
G
T
 
K
M
 
M
L
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
I
D
 
A
Y
x
Q
N
 
Q
G
 
P
F
 
A
A
 
L
Q
 
M
G
 
G
C
 
S
L
 
L
G
 
G
M
 
V
T
 
E
A
 
M
A
 
A
I
 
D
R
 
K
K
 
Y
L
 
L
R
 
K
G
 
G
M
 
E
P
 
K
V
 
I
T
 
P
Q
 
N
S
 
F
I
 
I
V
 
P
L
 
A
P
 
E
A
 
L
T
 
K
V
 
L
V
 
I
D
 
T
K
 
K
T
 
E
N
 
N
Y
 
V
Q
 
Q

5dteB Crystal structure of an abc transporter periplasmic solute binding protein (ipr025997) from actinobacillus succinogenes 130z(asuc_0081, target efi-511065) with bound d-allose
35% identity, 81% coverage: 25:284/321 of query aligns to 1:268/287 of 5dteB

query
sites
5dteB
D
 
D
G
 
K
E
 
P
R
 
Q
I
 
I
A
 
A
V
 
L
F
 
L
T
 
M
K
|
K
N
 
T
Q
 
L
T
 
S
N
|
N
P
 
E
F
x
Y
F
 
F
Q
 
I
V
 
S
V
 
M
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
E
A
 
T
A
 
A
K
 
K
S
 
Q
M
 
K
N
 
D
A
 
I
R
 
D
V
 
L
T
 
I
H
 
V
Y
 
Q
I
 
V
P
 
A
T
 
E
K
 
K
P
 
E
D
 
D
S
 
S
I
 
T
P
 
E
E
 
Q
Q
 
L
M
 
V
S
 
G
Q
 
L
I
 
V
E
 
E
D
 
N
V
 
M
I
 
I
V
 
A
K
 
K
K
 
K
A
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
I
F
 
V
V
 
T
P
 
P
V
 
N
D
 
D
Y
 
S
K
 
I
A
 
A
M
 
F
G
 
I
P
 
P
G
 
A
V
 
F
K
 
Q
K
 
K
I
 
A
N
 
E
A
 
K
A
 
A
N
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
I
V
 
I
N
 
D
V
 
L
T
x
D
D
 
V
K
 
R
S
 
L
D
 
D
V
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
A
G
 
G
N
 
L
F
 
K
V
 
F
S
 
N
F
 
Y
I
 
V
G
 
G
A
 
V
S
 
D
D
 
N
Y
 
F
D
 
N
L
 
G
G
 
G
L
 
Y
K
 
L
T
 
E
A
 
A
T
 
K
H
 
N
L
 
L
F
 
A
K
 
E
A
 
A
M
 
I
G
 
G
G
 
K
K
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
V
V
 
A
L
 
I
L
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
I
K
 
P
G
 
G
S
 
V
L
 
D
T
x
N
N
 
G
I
 
E
D
 
Q
R
|
R
V
 
K
R
 
G
G
 
G
M
 
A
H
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
F
K
 
A
A
 
E
F
 
Y
P
 
P
G
 
D
I
 
I
K
 
K
L
 
I
V
 
V
A
 
A
S
 
S
Q
 
Q
P
 
S
A
 
A
N
 
N
Y
x
W
Q
 
E
R
 
T
L
 
E
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
N
V
 
V
M
 
T
E
 
T
N
 
N
L
 
I
M
 
L
Q
 
T
S
 
A
Y
 
N
P
 
P
Q
 
N
I
 
I
D
 
N
A
 
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
T
 
A
N
 
N
D
 
D
A
 
N
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
V
E
 
T
A
 
A
L
 
V
Q
 
E
G
 
N
A
 
A
N
 
G
R
 
L
-
 
A
-
 
G
K
 
K
A
 
V
L
 
L
V
 
V
S
 
S
G
 
G
I
 
Y
N
x
D
G
 
G
T
 
I
Q
 
P
E
 
L
A
 
A
I
 
I
D
 
E
A
 
Y
I
 
V
K
 
K
A
 
Q
G
 
G
T
 
K
M
 
M
L
 
Q
A
 
N
T
 
T
G
 
I
D
 
D
Y
x
Q
N
 
L
G
 
P
F
 
K
A
 
K
Q
 
Q
G
 
V
C
 
A
L
 
I
G
 
A
M
 
I
T
 
E
A
 
H
A
 
A
I
 
L
R
 
K
K
 
Q
L
 
I
R
 
N
G
 
K
M
 
Q
P
 
E
V
 
I

A0QYB5 D-threitol-binding protein from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
31% identity, 93% coverage: 11:310/321 of query aligns to 19:318/349 of A0QYB5

query
sites
A0QYB5
G
 
G
L
 
L
L
 
T
A
 
A
L
 
C
G
 
G
I
 
A
L
 
G
A
 
D
A
 
P
P
 
A
A
 
A
H
 
N
A
 
S
D
 
D
G
 
T
E
 
T
R
 
R
I
 
I
A
 
G
V
 
V
F
 
T
T
 
V
K
x
Y
N
 
D
Q
 
M
T
 
S
N
 
S
P
 
-
F
 
F
F
 
I
Q
 
T
V
 
A
V
 
G
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
Y
A
 
A
K
 
K
S
 
D
M
 
N
N
 
N
A
 
I
R
 
E
V
 
L
T
 
I
H
 
W
Y
 
N
I
 
S
P
 
A
T
 
N
K
 
L
P
 
-
D
 
-
S
 
D
I
 
V
P
 
S
E
 
T
Q
 
Q
M
 
A
S
 
S
Q
 
Q
I
 
V
E
 
D
D
 
S
V
 
M
I
 
I
V
 
N
K
 
Q
K
 
G
A
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
I
F
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
Q
Y
 
A
K
 
D
A
 
S
M
 
L
G
 
A
P
 
P
G
 
Q
V
 
V
K
 
A
K
 
S
I
 
A
N
 
K
A
 
A
A
 
K
N
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
L
V
 
V
N
 
P
V
 
V
T
x
N
D
 
A
K
 
A
S
 
L
D
 
D
V
 
S
G
 
K
N
 
D
F
 
I
V
 
A
S
 
G
F
 
N
I
 
V
G
 
Q
A
 
P
S
 
D
D
 
D
Y
 
V
D
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
A
K
 
Q
T
 
E
A
 
M
T
 
Q
H
 
M
L
 
M
F
 
A
K
 
D
A
 
R
M
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
I
V
 
V
L
 
I
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
I
 
P
K
 
L
G
 
G
S
 
Q
L
 
S
T
 
G
N
 
E
I
 
L
D
 
D
R
|
R
V
 
S
R
 
K
G
 
G
M
 
I
H
 
E
D
 
Q
A
 
V
L
 
L
K
 
A
A
 
K
F
 
Y
P
 
P
G
 
D
I
 
I
K
 
K
L
 
V
V
 
L
A
 
A
S
 
K
Q
 
D
P
 
T
A
 
A
N
 
N
Y
 
W
Q
 
K
R
 
R
L
 
D
Q
 
E
A
 
A
L
 
V
Q
 
N
V
 
K
M
 
M
E
 
K
N
 
N
L
 
W
M
 
I
Q
 
S
S
 
G
Y
 
F
-
 
G
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
G
I
 
V
F
 
V
A
 
A
T
 
Q
N
|
N
D
 
D
A
 
D
M
 
M
A
 
G
I
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
L
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
G
 
E
A
 
S
N
 
G
R
 
R
K
 
T
A
 
G
L
 
V
-
 
P
V
 
I
S
 
V
G
 
G
I
 
I
N
x
D
G
 
G
T
 
I
Q
 
E
E
 
D
A
 
G
I
 
L
D
 
N
A
 
A
I
 
V
K
 
K
A
 
S
G
 
G
T
 
D
M
 
F
L
 
I
A
 
G
T
 
T
G
 
S
D
 
L
Y
x
Q
N
 
N
G
 
G
F
 
T
A
 
V
Q
 
E
G
 
L
C
 
A
L
 
A
G
 
G
M
 
L
T
 
A
A
 
V
A
 
A
I
 
N
R
 
R
K
 
L
L
 
A
R
 
K
G
 
G
M
 
E
P
 
P
V
 
V
T
 
N
Q
 
K
S
 
E
-
 
P
-
 
V
I
 
Y
V
 
I
L
 
M
P
 
P
A
 
A
T
 
I
V
 
T
V
 
K
D
 
D
K
 
N
T
 
V
N
 
D
Y
 
V
Q
 
-
S
 
A
I
 
I
D
 
E
I
 
H
P
 
V
V
 
V
S
 
T
K
 
E
R
 
R

4rsmA Crystal structure of carbohydrate transporter msmeg_3599 from mycobacterium smegmatis str. Mc2 155, target efi-510970, in complex with d-threitol (see paper)
30% identity, 89% coverage: 25:310/321 of query aligns to 1:286/315 of 4rsmA

query
sites
4rsmA
D
 
D
G
 
T
E
 
T
R
 
R
I
 
I
A
 
G
V
 
V
F
 
T
T
 
V
K
x
Y
N
 
D
Q
 
M
T
 
S
N
 
S
P
 
-
F
 
F
F
 
I
Q
 
T
V
 
A
V
 
G
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
Y
A
 
A
K
 
K
S
 
D
M
 
N
N
 
N
A
 
I
R
 
E
V
 
L
T
 
I
H
 
W
Y
 
N
I
 
S
P
 
A
T
 
N
K
 
L
P
 
-
D
 
-
S
 
D
I
 
V
P
 
S
E
 
T
Q
 
Q
M
 
A
S
 
S
Q
 
Q
I
 
V
E
 
D
D
 
S
V
 
M
I
 
I
V
 
N
K
 
Q
K
 
G
A
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
I
F
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
Q
Y
 
A
K
 
D
A
 
S
M
 
L
G
 
A
P
 
P
G
 
Q
V
 
V
K
 
A
K
 
S
I
 
A
N
 
K
A
 
A
A
 
K
N
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
L
V
 
V
N
 
P
V
 
V
T
x
N
D
 
A
K
 
A
S
 
L
D
 
D
V
 
S
G
 
K
N
 
D
F
 
I
V
 
A
S
 
G
F
 
N
I
 
V
G
 
Q
A
 
P
S
 
D
D
 
D
Y
 
V
D
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
A
K
 
Q
T
 
E
A
 
M
T
 
Q
H
 
M
L
 
M
F
 
A
K
 
D
A
 
R
M
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
I
V
 
V
L
 
I
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
I
 
P
K
 
L
G
 
G
S
 
Q
L
 
S
T
 
G
N
 
E
I
 
L
D
 
D
R
|
R
V
 
S
R
 
K
G
 
G
M
 
I
H
 
E
D
 
Q
A
 
V
L
 
L
K
 
A
A
 
K
F
 
Y
P
 
P
G
 
D
I
 
I
K
 
K
L
 
V
V
 
L
A
 
A
S
 
K
Q
 
D
P
 
T
A
 
A
N
 
N
Y
x
W
Q
 
K
R
 
R
L
 
D
Q
 
E
A
 
A
L
 
V
Q
 
N
V
 
K
M
 
M
E
 
K
N
 
N
L
 
W
M
 
I
Q
 
S
S
 
G
Y
 
F
-
 
G
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
G
I
 
V
F
 
V
A
 
A
T
 
Q
N
|
N
D
 
D
A
 
D
M
 
M
A
 
G
I
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
L
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
G
 
E
A
 
S
N
 
G
R
 
R
K
 
T
A
 
G
L
 
V
-
 
P
V
 
I
S
 
V
G
 
G
I
 
I
N
x
D
G
 
G
T
 
I
Q
 
E
E
 
D
A
 
G
I
 
L
D
 
N
A
 
A
I
 
V
K
 
K
A
 
S
G
 
G
T
 
D
M
 
F
L
 
I
A
 
G
T
 
T
G
 
S
D
 
L
Y
x
Q
N
 
N
G
 
G
F
 
T
A
 
V
Q
 
E
G
 
L
C
 
A
L
 
A
G
 
G
M
 
L
T
 
A
A
 
V
A
 
A
I
 
N
R
 
R
K
 
L
L
 
A
R
 
K
G
 
G
M
 
E
P
 
P
V
 
V
T
 
N
Q
 
K
S
 
E
-
 
P
-
 
V
I
 
Y
V
 
I
L
 
M
P
 
P
A
 
A
T
 
I
V
 
T
V
 
K
D
 
D
K
 
N
T
 
V
N
 
D
Y
 
V
Q
 
-
S
 
A
I
 
I
D
 
E
I
 
H
P
 
V
V
 
V
S
 
T
K
 
E
R
 
R

7e7mC Crystal structure analysis of the streptococcus agalactiae ribose binding protein rbsb
30% identity, 85% coverage: 28:301/321 of query aligns to 10:280/284 of 7e7mC

query
sites
7e7mC
R
 
K
I
 
L
A
 
G
V
 
V
F
 
S
T
 
I
K
 
S
N
 
T
Q
 
T
T
 
N
N
|
N
P
 
P
F
x
Y
F
|
F
Q
 
V
V
 
A
V
 
M
R
 
K
Q
 
D
G
 
G
A
 
I
D
 
D
A
 
K
A
 
Y
A
 
A
K
 
S
S
 
-
M
 
-
N
 
N
A
 
K
R
 
K
V
 
I
T
 
S
H
 
I
Y
 
K
I
 
V
P
 
A
T
 
D
K
 
A
P
 
Q
D
 
D
S
 
D
I
 
A
P
 
A
E
 
R
Q
 
Q
M
 
A
S
 
D
Q
 
D
I
 
V
E
 
Q
D
 
N
V
 
F
I
 
I
V
 
S
K
 
Q
K
 
N
A
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
L
F
 
I
V
 
N
P
 
P
V
 
V
D
 
D
Y
 
S
K
 
K
A
 
A
M
 
I
G
 
V
P
 
T
G
 
A
V
 
I
K
 
K
K
 
S
I
 
A
N
 
N
A
 
N
A
 
A
N
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
L
V
 
M
T
x
D
D
x
R
K
 
G
S
 
S
D
 
E
V
 
G
G
 
G
N
 
K
F
 
V
V
 
L
S
 
T
F
 
T
I
 
V
G
 
A
A
 
S
S
 
D
D
 
N
Y
 
V
D
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
K
K
 
M
T
 
A
A
 
A
T
 
D
H
 
Y
L
 
A
F
 
V
K
 
K
A
 
K
M
 
L
G
 
G
G
 
K
K
 
K
G
 
A
N
 
K
V
 
A
V
 
F
L
 
E
L
 
L
E
 
S
G
 
G
I
 
V
K
 
P
G
 
G
S
 
A
L
 
S
T
 
A
N
 
T
I
 
V
D
 
D
R
|
R
V
 
G
R
 
K
G
 
G
M
 
F
H
 
H
D
 
S
A
 
V
L
 
A
K
 
K
A
 
S
F
 
-
P
 
-
G
 
K
I
 
L
K
 
D
L
 
M
V
 
L
A
 
S
S
 
S
Q
 
Q
P
 
S
A
 
A
N
 
N
Y
x
F
Q
 
D
R
 
R
L
 
A
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
N
V
 
T
M
 
T
E
 
Q
N
 
N
L
 
M
M
 
I
Q
 
Q
S
 
G
Y
 
H
P
 
K
Q
 
D
I
 
V
D
 
Q
A
 
I
I
 
I
F
 
F
A
 
A
T
 
Q
N
|
N
D
 
D
A
 
E
M
 
M
A
 
A
I
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
A
E
 
Q
A
 
A
L
 
V
Q
 
K
G
 
S
A
 
A
N
 
G
-
 
L
R
 
Q
K
 
N
A
 
V
L
 
L
V
 
I
S
 
V
G
 
G
I
 
I
N
x
D
G
 
G
T
 
Q
Q
 
P
E
 
D
A
 
A
I
 
H
D
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
K
A
 
K
G
 
G
T
 
D
M
 
I
L
 
S
A
 
A
T
 
T
G
 
I
D
 
A
Y
x
Q
N
 
Q
G
 
P
F
 
A
A
 
K
Q
 
M
G
 
G
C
 
E
L
 
I
G
 
A
M
 
I
T
 
Q
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
D
K
 
Y
L
 
Y
R
 
K
G
 
G
M
 
K
P
 
K
V
 
V
T
 
E
Q
 
K
S
 
E
I
 
T
V
 
I
L
 
S
P
 
P
A
 
I
T
 
Y
V
 
L
V
 
V
D
 
T
K
 
K
T
 
D
N
 
N
Y
 
V
Q
 
E

A0QYB3 Xylitol-binding protein from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
30% identity, 93% coverage: 14:310/321 of query aligns to 22:318/349 of A0QYB3

query
sites
A0QYB3
A
 
A
L
 
C
G
 
G
I
 
A
L
 
G
A
 
D
A
 
T
P
 
A
A
 
A
H
 
N
A
 
S
D
 
D
G
 
T
E
 
K
R
 
R
I
 
I
A
 
G
V
 
V
F
 
T
T
 
V
K
x
Y
N
 
D
Q
 
M
T
 
S
N
 
S
P
 
-
F
 
F
F
 
I
Q
 
T
V
 
E
V
 
G
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
M
D
 
D
A
 
T
A
 
Y
A
 
A
K
 
K
S
 
A
M
 
N
N
 
N
A
 
I
R
 
E
V
 
L
T
 
V
H
 
W
Y
 
N
I
 
-
P
 
-
T
 
S
K
 
A
P
 
N
D
 
N
S
 
D
I
 
V
P
 
S
E
 
T
Q
 
Q
M
 
A
S
 
S
Q
 
Q
I
 
V
E
 
D
D
 
S
V
 
L
I
 
I
V
 
N
K
 
Q
K
 
G
A
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
I
F
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
Q
Y
 
A
K
 
D
A
 
S
M
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
Q
V
 
V
K
 
A
K
 
S
I
 
A
N
 
K
A
 
S
A
 
K
N
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
L
V
 
L
N
 
A
V
 
V
T
x
N
D
 
A
K
 
A
S
 
L
D
 
E
V
 
T
G
 
P
N
 
D
F
 
L
V
 
A
S
 
G
F
 
N
I
 
V
G
 
Q
A
 
P
S
 
D
D
 
D
Y
 
V
D
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
A
K
 
Q
T
 
E
A
 
M
T
 
Q
H
 
M
L
 
M
F
 
A
K
 
D
A
 
R
M
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
I
V
 
V
L
 
I
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
I
 
P
K
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
S
T
 
G
N
 
E
I
 
I
D
 
N
R
|
R
V
 
G
R
 
K
G
 
G
M
 
I
H
 
D
D
 
Q
A
 
V
L
 
L
K
 
A
A
 
K
F
 
Y
P
 
P
G
 
D
I
 
I
K
 
K
L
 
V
V
 
L
A
 
A
S
 
K
Q
 
D
P
 
T
A
 
A
N
 
N
Y
 
W
Q
 
K
R
 
R
L
 
D
Q
 
E
A
 
A
L
 
V
Q
 
N
V
 
K
M
 
M
E
 
K
N
 
N
L
 
W
M
 
I
Q
 
S
S
 
S
Y
 
F
-
 
G
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
G
I
 
V
F
 
V
A
 
A
T
 
Q
N
|
N
D
 
D
A
 
D
M
 
M
A
 
G
I
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
L
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
G
 
E
A
 
A
N
 
G
R
 
R
K
 
T
A
 
G
L
 
V
-
 
P
V
 
I
S
 
V
G
 
G
I
 
I
N
x
D
G
 
G
T
 
I
Q
 
E
E
 
D
A
 
G
I
 
L
D
 
N
A
 
A
I
 
V
K
 
K
A
 
S
G
 
G
T
 
D
M
 
F
L
 
I
A
 
G
T
 
T
G
 
S
D
 
L
Y
x
Q
N
 
N
G
 
G
F
 
T
A
 
V
Q
 
E
G
 
L
C
 
S
L
 
A
G
 
G
M
 
L
T
 
A
A
 
V
A
 
A
I
 
D
R
 
A
K
 
L
L
 
V
R
 
K
G
 
G
M
 
E
P
 
D
V
 
V
T
 
K
Q
 
T
S
 
D
-
 
P
-
 
V
I
 
Y
V
 
V
L
 
M
P
 
P
A
 
A
T
 
I
V
 
T
V
 
K
D
 
D
K
 
N
T
 
V
N
 
D
Y
 
V
Q
 
-
S
 
A
I
 
I
D
 
E
I
 
H
P
 
V
V
 
V
S
 
T
K
 
E
R
 
R

4rs3A Crystal structure of carbohydrate transporter a0qyb3 from mycobacterium smegmatis str. Mc2 155, target efi-510969, in complex with xylitol (see paper)
30% identity, 88% coverage: 27:310/321 of query aligns to 2:285/315 of 4rs3A

query
sites
4rs3A
E
 
K
R
 
R
I
 
I
A
 
G
V
 
V
F
 
T
T
 
V
K
x
Y
N
 
D
Q
 
M
T
 
S
N
 
S
P
 
-
F
 
F
F
 
I
Q
 
T
V
x
E
V
 
G
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
M
D
 
D
A
 
T
A
 
Y
A
 
A
K
 
K
S
 
A
M
 
N
N
 
N
A
 
I
R
 
E
V
 
L
T
 
V
H
 
W
Y
 
N
I
 
-
P
 
-
T
 
S
K
 
A
P
 
N
D
 
N
S
 
D
I
 
V
P
 
S
E
 
T
Q
 
Q
M
 
A
S
 
S
Q
 
Q
I
 
V
E
 
D
D
 
S
V
 
L
I
 
I
V
 
N
K
 
Q
K
 
G
A
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
I
F
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
Q
Y
 
A
K
 
D
A
 
S
M
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
Q
V
 
V
K
 
A
K
 
S
I
 
A
N
 
K
A
 
S
A
 
K
N
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
L
V
 
L
N
 
A
V
 
V
T
x
N
D
 
A
K
 
A
S
 
L
D
 
E
V
 
T
G
 
P
N
 
D
F
 
L
V
 
A
S
 
G
F
 
N
I
 
V
G
 
Q
A
 
P
S
 
D
D
 
D
Y
 
V
D
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
A
K
 
Q
T
 
E
A
 
M
T
 
Q
H
 
M
L
 
M
F
 
A
K
 
D
A
 
R
M
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
I
V
 
V
L
 
I
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
I
 
P
K
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
S
T
 
G
N
 
E
I
 
I
D
 
N
R
|
R
V
 
G
R
 
K
G
 
G
M
 
I
H
 
D
D
 
Q
A
 
V
L
 
L
K
 
A
A
 
K
F
 
Y
P
 
P
G
 
D
I
 
I
K
 
K
L
 
V
V
 
L
A
 
A
S
 
K
Q
 
D
P
 
T
A
 
A
N
 
N
Y
x
W
Q
 
K
R
 
R
L
 
D
Q
 
E
A
 
A
L
 
V
Q
 
N
V
 
K
M
 
M
E
 
K
N
 
N
L
 
W
M
 
I
Q
 
S
S
 
S
Y
 
F
-
 
G
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
G
I
 
V
F
 
V
A
 
A
T
 
Q
N
|
N
D
 
D
A
 
D
M
 
M
A
 
G
I
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
L
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
G
 
E
A
 
A
N
 
G
R
 
R
K
 
T
A
 
G
L
 
V
-
 
P
V
 
I
S
 
V
G
 
G
I
 
I
N
x
D
G
 
G
T
 
I
Q
x
E
E
 
D
A
 
G
I
 
L
D
 
N
A
 
A
I
 
V
K
 
K
A
 
S
G
 
G
T
 
D
M
 
F
L
 
I
A
 
G
T
 
T
G
 
S
D
 
L
Y
x
Q
N
 
N
G
 
G
F
 
T
A
 
V
Q
 
E
G
 
L
C
 
S
L
 
A
G
 
G
M
 
L
T
 
A
A
 
V
A
 
A
I
 
D
R
 
A
K
 
L
L
 
V
R
 
K
G
 
G
M
 
E
P
 
D
V
 
V
T
 
K
Q
 
T
S
 
D
-
 
P
-
 
V
I
 
Y
V
 
V
L
 
M
P
 
P
A
 
A
T
 
I
V
 
T
V
 
K
D
 
D
K
 
N
T
 
V
N
 
D
Y
 
V
Q
 
-
S
 
A
I
 
I
D
 
E
I
 
H
P
 
V
V
 
V
S
 
T
K
 
E
R
 
R

5hkoA Crystal structure of abc transporter solute binding protein msmeg_3598 from mycobacterium smegmatis str. Mc2 155, target efi-510969, in complex with l-sorbitol
30% identity, 88% coverage: 27:310/321 of query aligns to 2:285/314 of 5hkoA

query
sites
5hkoA
E
 
K
R
 
R
I
 
I
A
 
G
V
 
V
F
 
T
T
x
V
K
x
Y
N
 
D
Q
 
M
T
 
S
N
 
S
P
 
-
F
 
F
F
 
I
Q
 
T
V
x
E
V
 
G
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
M
D
 
D
A
 
T
A
 
Y
A
 
A
K
 
K
S
 
A
M
 
N
N
 
N
A
 
I
R
 
E
V
 
L
T
 
V
H
 
W
Y
 
N
I
 
-
P
 
-
T
 
S
K
 
A
P
 
N
D
 
N
S
x
D
I
 
V
P
x
S
E
 
T
Q
 
Q
M
 
A
S
 
S
Q
 
Q
I
 
V
E
 
D
D
 
S
V
 
L
I
 
I
V
 
N
K
 
Q
K
 
G
A
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
I
F
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
Q
Y
 
A
K
 
D
A
 
S
M
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
Q
V
 
V
K
 
A
K
 
S
I
 
A
N
 
K
A
 
S
A
 
K
N
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
L
V
 
L
N
 
A
V
 
V
T
x
N
D
x
A
K
 
A
S
 
L
D
 
E
V
 
T
G
 
P
N
 
D
F
 
L
V
 
A
S
 
G
F
 
N
I
 
V
G
 
Q
A
 
P
S
 
D
D
 
D
Y
 
V
D
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
A
K
 
Q
T
 
E
A
 
M
T
 
Q
H
 
M
L
 
M
F
 
A
K
 
D
A
 
R
M
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
I
V
 
V
L
 
I
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
I
 
P
K
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
S
T
 
G
N
 
E
I
 
I
D
 
N
R
|
R
V
 
G
R
 
K
G
 
G
M
 
I
H
 
D
D
 
Q
A
 
V
L
 
L
K
 
A
A
 
K
F
 
Y
P
 
P
G
 
D
I
 
I
K
 
K
L
 
V
V
 
L
A
 
A
S
 
K
Q
 
D
P
 
T
A
 
A
N
 
N
Y
x
W
Q
 
K
R
 
R
L
 
D
Q
 
E
A
 
A
L
 
V
Q
 
N
V
 
K
M
 
M
E
 
K
N
 
N
L
 
W
M
 
I
Q
 
S
S
 
S
Y
 
F
-
 
G
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
G
I
 
V
F
 
V
A
 
A
T
 
Q
N
|
N
D
 
D
A
 
D
M
 
M
A
 
G
I
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
L
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
G
 
E
A
 
A
N
 
G
R
 
R
K
 
T
A
 
G
L
 
V
-
 
P
V
 
I
S
 
V
G
 
G
I
 
I
N
x
D
G
 
G
T
 
I
Q
x
E
E
 
D
A
 
G
I
 
L
D
 
N
A
 
A
I
 
V
K
 
K
A
 
S
G
 
G
T
 
D
M
 
F
L
 
I
A
 
G
T
 
T
G
 
S
D
 
L
Y
x
Q
N
 
N
G
 
G
F
 
T
A
 
V
Q
 
E
G
 
L
C
 
S
L
 
A
G
 
G
M
 
L
T
 
A
A
 
V
A
 
A
I
 
D
R
 
A
K
 
L
L
 
V
R
 
K
G
 
G
M
 
E
P
 
D
V
 
V
T
 
K
Q
 
T
S
 
D
-
 
P
-
 
V
I
 
Y
V
 
V
L
 
M
P
 
P
A
 
A
T
 
I
V
 
T
V
 
K
D
 
D
K
 
N
T
 
V
N
 
D
Y
 
V
Q
 
-
S
 
A
I
 
I
D
 
E
I
 
H
P
 
V
V
 
V
S
 
T
K
 
E
R
 
R

4zjpA Structure of an abc-transporter solute binding protein (sbp_ipr025997) from actinobacillus succinogenes (asuc_0197, target efi-511067) with bound beta-d-ribopyranose
32% identity, 84% coverage: 27:295/321 of query aligns to 3:268/270 of 4zjpA

query
sites
4zjpA
E
 
E
R
 
T
I
 
I
A
 
A
V
 
L
F
 
T
T
 
V
K
 
S
N
 
T
Q
 
L
T
 
D
N
|
N
P
 
P
F
|
F
F
|
F
Q
 
V
V
 
S
V
 
L
R
 
K
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
Q
A
 
K
A
 
K
A
 
A
K
 
T
S
 
E
M
 
L
N
 
G
A
 
Y
R
 
K
V
 
L
T
 
V
H
 
-
Y
 
V
I
 
L
P
 
D
T
 
S
K
 
Q
P
 
N
D
 
D
S
 
P
I
 
S
P
 
K
E
 
E
Q
 
-
M
 
L
S
 
S
Q
 
N
I
 
V
E
 
E
D
 
D
V
 
L
I
 
T
V
 
V
K
 
R
K
 
G
A
 
A
D
 
K
A
 
V
I
 
L
V
 
L
F
 
I
V
 
N
P
 
P
V
 
T
D
 
D
Y
 
S
K
 
A
A
 
A
M
 
V
G
 
S
P
 
N
G
 
A
V
 
V
K
 
A
K
 
I
I
 
A
N
 
N
A
 
R
A
 
N
N
 
K
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
T
V
 
L
T
x
D
D
x
R
K
 
G
S
 
A
D
 
A
V
 
K
G
 
G
N
 
E
F
 
V
V
 
V
S
 
S
F
 
H
I
 
I
G
 
A
A
 
S
S
 
D
D
 
N
Y
 
V
D
 
A
L
 
G
G
 
G
L
 
K
K
 
M
T
 
A
A
 
G
T
 
D
H
 
F
L
 
I
F
 
A
K
 
Q
A
 
K
M
 
L
G
 
G
G
 
D
K
 
G
G
 
A
N
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
Q
L
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
L
K
 
A
G
 
G
S
 
T
L
 
S
T
 
A
N
 
A
I
 
R
D
 
E
R
|
R
V
 
G
R
 
E
G
 
G
M
 
F
H
 
K
D
 
Q
A
 
A
L
 
I
K
 
E
A
 
A
F
 
H
P
 
K
G
 
-
I
 
F
K
 
D
L
 
V
V
 
L
A
 
A
S
 
S
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
N
 
D
Y
x
F
Q
 
D
R
 
R
L
 
T
Q
 
K
A
 
G
L
 
L
Q
 
N
V
 
V
M
 
T
E
 
E
N
 
N
L
 
L
M
 
L
Q
 
A
S
 
S
Y
 
K
P
 
G
Q
 
S
I
 
V
D
 
Q
A
 
A
I
 
I
F
 
F
A
 
A
T
 
Q
N
|
N
D
 
D
A
 
E
M
 
M
A
 
A
I
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
I
Q
 
S
G
 
A
A
 
A
N
 
G
R
 
K
K
 
K
A
 
V
L
 
L
V
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
F
N
x
D
G
 
G
T
 
T
Q
 
E
E
 
D
A
 
G
I
 
V
D
 
K
A
 
A
I
 
V
K
 
K
A
 
S
G
 
G
T
 
K
M
 
L
L
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
V
D
 
A
Y
x
Q
N
 
Q
G
 
P
F
 
E
A
 
L
Q
 
I
G
 
G
C
 
S
L
 
L
G
 
G
M
 
V
T
 
E
A
 
T
A
 
A
I
 
D
R
 
K
K
 
I
L
 
L
R
 
K
G
 
G
M
 
E
P
 
K
V
 
V
T
 
D
Q
 
A
S
 
K
I
 
I
V
 
P
L
 
V
P
 
A
A
 
L
T
 
K
V
 
V
V
 
V

2rjoA Crystal structure of twin-arginine translocation pathway signal protein from burkholderia phytofirmans
31% identity, 90% coverage: 29:316/321 of query aligns to 6:307/322 of 2rjoA

query
sites
2rjoA
I
 
L
A
 
A
V
 
C
F
 
S
T
 
F
K
x
R
N
 
S
Q
 
L
T
 
T
N
|
N
P
 
P
F
 
Y
F
x
Y
Q
 
T
V
 
A
V
 
F
R
 
N
Q
 
K
G
 
G
A
 
A
D
 
Q
A
 
S
A
 
F
A
 
A
K
 
K
S
 
S
M
 
V
N
 
G
A
 
-
R
 
-
V
 
-
T
 
L
H
 
P
Y
 
Y
I
 
V
P
 
P
T
 
L
K
 
T
P
 
T
D
 
E
S
 
G
I
 
S
P
 
S
E
 
E
Q
 
K
-
 
G
M
 
I
S
 
A
Q
 
D
I
 
I
E
 
R
D
 
A
V
 
L
I
 
L
V
 
Q
K
 
K
K
 
T
A
 
G
D
 
G
A
 
N
I
 
L
V
 
V
F
 
L
V
 
N
-
 
V
-
x
D
P
 
P
V
 
N
D
 
D
Y
 
S
K
 
A
A
 
D
M
 
A
G
 
R
P
 
V
G
 
I
V
 
V
K
 
E
K
 
A
I
 
C
N
 
S
A
 
K
A
 
A
N
 
G
I
 
A
P
 
Y
V
 
V
V
 
T
N
 
T
V
 
I
T
x
W
D
x
N
K
 
K
-
 
P
S
 
K
D
 
D
V
 
L
G
 
H
-
 
P
-
 
W
-
 
D
-
 
Y
-
 
N
-
 
P
N
 
N
F
 
Y
V
 
V
S
 
A
F
 
H
I
 
L
G
 
S
A
 
Y
S
 
D
D
 
G
Y
 
V
D
 
A
L
 
Y
G
 
G
L
 
E
K
 
E
T
 
T
A
 
A
T
 
T
H
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
K
A
 
S
M
 
M
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
N
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
A
L
 
L
E
 
G
G
 
G
I
 
I
K
 
F
G
 
S
S
x
N
L
 
V
T
x
P
N
 
A
I
 
I
D
 
E
R
|
R
V
 
K
R
 
A
G
 
G
M
 
L
H
 
D
D
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
K
F
 
F
P
 
P
G
 
G
I
 
I
K
 
Q
L
 
L
V
 
L
A
 
D
S
 
F
Q
 
Q
P
 
V
A
 
A
N
 
D
Y
x
W
Q
 
N
R
 
S
L
 
Q
Q
 
K
A
 
A
L
 
F
Q
 
P
V
 
I
M
 
M
E
 
Q
N
 
A
L
 
W
M
 
M
Q
 
T
S
 
R
Y
 
F
-
 
N
P
 
S
Q
 
K
I
 
I
D
 
K
A
 
G
I
 
V
F
 
W
A
 
A
T
 
A
N
 
N
D
 
D
A
 
D
M
 
M
A
 
A
I
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
-
 
R
-
 
A
Q
 
E
G
 
G
A
 
L
N
 
A
R
 
G
K
 
Q
A
 
I
L
 
P
V
 
V
S
 
T
G
 
G
I
 
M
N
x
D
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
E
 
P
A
 
G
I
 
L
D
 
V
A
 
A
I
 
I
K
 
K
A
 
S
G
 
G
T
 
E
M
 
L
L
 
V
A
 
A
T
 
S
G
 
V
D
 
D
Y
 
W
N
 
D
G
 
P
F
 
F
A
 
W
Q
 
L
G
 
G
C
 
G
L
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
S
A
 
M
A
 
G
I
 
L
R
 
Q
-
 
A
-
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
K
-
 
I
K
 
D
L
 
L
R
 
A
G
 
T
M
 
L
P
 
P
V
 
K
-
 
D
T
 
R
Q
 
R
S
 
E
I
 
S
V
 
F
L
 
C
P
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
F
V
 
V
D
 
T
K
 
K
T
 
T
N
 
N
Y
 
V
Q
 
Q
S
 
D
I
 
V
D
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
I
S
 
A
K
 
R
R
 
A
A
 
A
C
 
S
P
 
P
R
 
K
W
 
A
E
 
E

1dbpA Identical mutations at corresponding positions in two homologous proteins with non-identical effects (see paper)
32% identity, 80% coverage: 27:284/321 of query aligns to 2:257/271 of 1dbpA

query
sites
1dbpA
E
 
D
R
 
T
I
 
I
A
 
A
V
 
L
F
 
V
T
 
V
K
 
S
N
 
T
Q
 
L
T
 
N
N
|
N
P
 
P
F
|
F
F
 
F
Q
 
V
V
 
S
V
 
L
R
 
K
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
Q
A
 
K
A
 
E
A
 
A
K
 
D
S
 
K
M
 
L
N
 
G
A
 
Y
R
 
N
V
 
L
T
 
V
H
 
-
Y
 
-
I
 
V
P
 
L
T
 
D
K
 
S
P
 
Q
D
 
N
S
 
N
I
 
P
P
 
A
E
 
K
Q
 
E
M
 
L
S
 
A
Q
 
N
I
 
V
E
 
Q
D
 
D
V
 
L
I
 
T
V
 
V
K
 
R
K
 
G
A
 
T
D
 
K
A
 
I
I
 
L
V
 
L
F
 
I
V
 
N
P
 
P
V
 
T
D
 
D
Y
 
S
K
 
D
A
 
A
M
 
V
G
 
D
P
 
N
G
 
A
V
 
V
K
 
K
K
 
M
I
 
A
N
 
N
A
 
Q
A
 
A
N
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
T
V
 
L
T
x
D
D
x
R
K
 
Q
S
 
A
D
 
T
V
 
K
G
 
G
N
 
E
F
 
V
V
 
V
S
 
S
F
 
H
I
 
I
G
 
-
A
 
A
S
 
S
D
 
D
Y
 
N
D
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
G
K
 
K
T
 
I
A
 
A
T
 
G
H
 
D
L
 
Y
F
 
I
K
 
A
A
 
K
M
 
K
G
 
A
G
 
G
K
 
E
G
 
G
-
 
A
N
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
E
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
I
 
I
K
 
A
G
 
G
S
 
T
L
 
S
T
 
A
N
 
A
I
 
R
D
 
E
R
|
R
V
 
G
R
 
E
G
 
G
M
 
F
H
 
Q
D
 
Q
A
 
A
L
 
V
K
 
A
A
 
A
F
 
H
P
 
K
G
 
-
I
 
F
K
 
N
L
 
V
V
 
L
A
 
A
S
 
S
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
N
 
D
Y
x
F
Q
 
D
R
 
R
L
 
I
Q
 
K
A
 
G
L
 
L
Q
 
N
V
 
V
M
 
M
E
 
Q
N
 
N
L
 
L
M
 
L
Q
 
T
S
 
A
Y
 
H
P
 
P
Q
 
D
I
 
V
D
 
Q
A
 
A
I
 
V
F
 
F
A
 
A
T
 
Q
N
|
N
D
 
D
A
 
E
M
 
M
A
 
A
I
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
G
 
T
A
 
A
N
 
G
R
 
K
K
 
S
-
 
D
A
 
V
L
 
M
V
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
F
N
x
D
G
 
G
T
 
T
Q
 
P
E
 
D
A
 
G
I
 
E
D
 
K
A
 
A
I
 
V
K
 
N
A
 
D
G
 
G
T
 
K
M
 
L
L
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
-
D
 
-
Y
 
-
N
 
-
G
 
-
F
 
I
A
 
A
Q
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
D
-
 
Q
-
 
I
G
 
G
C
 
A
L
 
K
G
 
G
M
 
V
T
 
E
A
 
T
A
 
A
I
 
D
R
 
K
K
 
V
L
 
L
R
 
K
G
 
G
M
 
E
P
 
K
V
 
V

1rpjA Crystal structure of d-allose binding protein from escherichia coli (see paper)
32% identity, 76% coverage: 30:272/321 of query aligns to 5:257/288 of 1rpjA

query
sites
1rpjA
A
 
A
V
 
V
F
 
V
T
 
L
K
|
K
N
 
T
Q
 
L
T
 
S
N
|
N
P
 
P
F
|
F
F
 
W
Q
 
V
V
 
D
V
 
M
R
 
K
Q
 
K
G
 
G
A
 
I
D
 
E
A
 
D
A
 
E
A
 
A
K
 
K
S
 
T
M
 
L
N
 
G
A
 
V
R
 
S
V
 
V
T
 
D
H
 
I
Y
 
F
I
 
A
P
 
S
T
 
P
K
 
S
P
x
E
D
 
G
S
 
D
I
 
F
P
 
Q
E
 
S
Q
 
Q
M
 
L
S
 
Q
Q
 
L
I
 
F
E
 
E
D
 
D
V
 
L
I
 
S
V
 
N
K
 
K
K
 
N
A
 
Y
D
 
K
A
 
G
I
 
I
V
 
A
F
 
F
V
 
A
P
 
P
V
 
L
D
 
S
Y
 
S
K
 
V
A
 
N
M
 
L
G
 
V
P
 
M
G
 
P
V
 
V
K
 
A
K
 
R
I
 
A
N
 
W
A
 
K
A
 
K
N
 
G
I
 
I
P
 
Y
V
 
L
V
 
V
N
 
N
V
 
L
T
x
D
D
 
E
K
 
K
S
 
I
D
 
D
V
 
M
-
 
D
-
 
N
-
 
L
-
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
G
G
 
G
N
 
N
F
 
V
V
 
E
S
 
A
F
 
F
I
 
V
G
 
T
A
 
T
S
 
D
D
 
N
Y
 
V
D
 
A
L
 
V
G
 
G
L
 
A
K
 
K
T
 
G
A
 
A
T
 
S
H
 
F
L
 
I
F
 
I
K
 
D
A
 
K
M
 
L
G
 
G
G
 
A
K
 
E
G
 
G
-
 
G
N
 
E
V
 
V
V
 
A
L
 
I
L
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
K
K
 
A
G
 
G
S
 
N
L
 
A
T
x
S
N
 
G
I
 
E
D
 
A
R
|
R
V
 
R
R
 
N
G
 
G
M
 
A
H
 
T
D
 
E
A
 
A
L
 
F
K
 
K
A
 
K
F
 
A
P
 
S
G
 
Q
I
 
I
K
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
S
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
N
 
D
Y
x
W
Q
 
D
R
 
R
L
 
I
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
V
 
V
M
 
A
E
 
T
N
 
N
L
 
V
M
 
L
Q
 
Q
S
 
R
Y
 
N
P
 
P
Q
 
N
I
 
I
D
 
K
A
 
A
I
 
I
F
 
Y
A
 
C
T
 
A
N
|
N
D
 
D
A
 
T
M
 
M
A
 
A
I
 
M
G
 
G
A
 
V
I
 
A
E
 
Q
A
 
A
L
 
V
Q
 
A
G
 
N
A
 
A
N
 
G
R
 
K
-
 
T
-
 
G
K
 
K
A
 
V
L
 
L
V
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
T
N
x
D
G
 
G
T
 
I
Q
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
R
D
 
K
A
 
M
I
 
V
K
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
Q
M
 
M
L
 
T
A
 
A
T
 
T
G
 
V
D
 
A
Y
x
Q
N
 
N
G
 
P
F
 
A
A
 
D
Q
 
I
G
 
G
C
 
A
L
 
T
G
 
G
M
 
L

1gudA Hinge-bending motion of d-allose binding protein from escherichia coli: three open conformations (see paper)
32% identity, 76% coverage: 30:272/321 of query aligns to 5:257/288 of 1gudA

query
sites
1gudA
A
 
A
V
 
V
F
 
V
T
 
L
K
 
K
N
 
T
Q
 
L
T
 
S
N
 
N
P
 
P
F
 
F
F
 
W
Q
 
V
V
 
D
V
 
M
R
 
K
Q
 
K
G
 
G
A
 
I
D
 
E
A
 
D
A
 
E
A
 
A
K
 
K
S
 
T
M
 
L
N
 
G
A
 
V
R
 
S
V
 
V
T
x
D
H
 
I
Y
 
F
I
 
A
P
 
S
T
 
P
K
 
S
P
 
E
D
 
G
S
 
D
I
 
F
P
 
Q
E
 
S
Q
 
Q
M
 
L
S
 
Q
Q
 
L
I
 
F
E
 
E
D
 
D
V
 
L
I
 
S
V
 
N
K
 
K
K
 
N
A
 
Y
D
 
K
A
 
G
I
 
I
V
 
A
F
 
F
V
 
A
P
 
P
V
 
L
D
 
S
Y
 
S
K
 
V
A
 
N
M
 
L
G
 
V
P
 
M
G
 
P
V
 
V
K
 
A
K
 
R
I
 
A
N
 
W
A
 
K
A
 
K
N
 
G
I
 
I
P
 
Y
V
 
L
V
 
V
N
 
N
V
 
L
T
 
D
D
 
E
K
 
K
S
 
I
D
 
D
V
 
M
-
 
D
-
 
N
-
 
L
-
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
G
G
 
G
N
 
N
F
 
V
V
 
E
S
 
A
F
 
F
I
 
V
G
 
T
A
 
T
S
 
D
D
 
N
Y
 
V
D
 
A
L
 
V
G
 
G
L
 
A
K
 
K
T
 
G
A
 
A
T
 
S
H
 
F
L
 
I
F
 
I
K
 
D
A
 
K
M
 
L
G
 
G
G
 
A
K
 
E
G
 
G
-
 
G
N
 
E
V
 
V
V
 
A
L
 
I
L
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
K
K
 
A
G
 
G
S
 
N
L
 
A
T
 
S
N
 
G
I
 
E
D
 
A
R
 
R
V
 
R
R
 
N
G
 
G
M
 
A
H
 
T
D
 
E
A
 
A
L
 
F
K
 
K
A
 
K
F
 
A
P
 
S
G
 
Q
I
 
I
K
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
S
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
N
 
D
Y
 
W
Q
 
D
R
 
R
L
 
I
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
V
 
V
M
 
A
E
 
T
N
 
N
L
 
V
M
 
L
Q
 
Q
S
 
R
Y
 
N
P
 
P
Q
 
N
I
 
I
D
 
K
A
 
A
I
 
I
F
 
Y
A
 
C
T
 
A
N
 
N
D
 
D
A
 
T
M
 
M
A
 
A
I
 
M
G
 
G
A
 
V
I
 
A
E
 
Q
A
 
A
L
 
V
Q
 
A
G
 
N
A
 
A
N
 
G
R
 
K
-
 
T
-
 
G
K
 
K
A
 
V
L
 
L
V
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
T
N
 
D
G
 
G
T
 
I
Q
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
R
D
 
K
A
 
M
I
 
V
K
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
Q
M
 
M
L
 
T
A
 
A
T
 
T
G
 
V
D
 
A
Y
 
Q
N
 
N
G
 
P
F
 
A
A
 
D
Q
 
I
G
 
G
C
 
A
L
 
T
G
 
G
M
 
L

Sites not aligning to the query:

5ibqA Crystal structure of an abc solute binding protein from rhizobium etli cfn 42 (rhe_pf00037,target efi-511357) in complex with alpha-d-apiose
35% identity, 77% coverage: 29:275/321 of query aligns to 5:251/287 of 5ibqA

query
sites
5ibqA
I
 
I
A
 
A
V
 
I
F
 
I
T
 
T
K
 
P
N
 
A
Q
 
H
T
 
D
N
|
N
P
 
P
F
|
F
F
 
F
Q
 
K
V
 
A
V
 
E
R
 
A
Q
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
A
A
 
K
A
 
A
K
 
K
S
 
E
M
 
L
N
 
G
A
 
Y
R
 
E
V
 
T
T
 
-
H
 
-
Y
 
L
I
 
V
P
 
M
T
 
T
K
 
H
P
 
D
D
 
D
S
 
D
I
 
A
P
 
N
E
 
K
Q
 
Q
M
 
S
S
 
E
Q
 
M
I
 
I
E
 
D
D
 
T
V
 
A
I
 
I
V
 
G
K
 
R
K
 
G
A
 
A
D
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
I
F
 
L
V
 
D
P
 
N
V
 
A
D
 
G
Y
 
A
K
 
D
A
 
A
M
 
S
G
 
V
P
 
A
G
 
A
V
 
V
K
 
K
K
 
K
I
 
A
N
 
K
A
 
D
A
 
A
N
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
S
V
 
F
N
 
L
V
 
I
T
x
D
D
x
R
K
 
E
S
 
I
D
 
N
-
 
A
V
 
T
G
 
G
N
 
V
F
 
A
V
 
V
S
 
A
F
 
Q
I
 
I
G
 
V
A
 
S
S
 
N
D
 
N
Y
 
Y
D
 
Q
L
 
G
G
 
A
L
 
Q
K
 
L
T
 
G
A
 
A
T
 
Q
H
 
E
L
 
F
F
 
V
K
 
K
A
 
L
M
 
M
G
 
G
G
 
E
K
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
Y
V
 
V
L
 
E
L
 
L
E
 
V
G
 
G
I
 
-
K
 
K
G
 
E
S
 
S
L
x
D
T
 
T
N
|
N
I
 
A
D
 
G
-
 
I
R
|
R
V
 
S
R
 
Q
G
 
G
M
 
Y
H
 
H
D
|
D
A
 
V
L
 
I
K
x
D
A
x
D
F
 
Y
P
 
P
G
 
E
I
 
M
K
 
K
L
 
S
V
 
V
A
 
A
S
 
K
Q
 
Q
P
 
S
A
 
A
N
 
N
Y
x
W
Q
 
S
R
 
Q
L
 
T
Q
 
E
A
 
A
L
 
Y
Q
 
S
V
 
K
M
 
M
E
 
E
N
 
T
L
 
I
M
 
L
Q
 
Q
S
 
A
Y
 
N
P
 
P
Q
 
D
I
 
I
D
 
K
A
 
G
I
 
V
F
 
I
A
 
S
T
 
G
N
|
N
D
 
D
A
 
T
M
 
M
A
 
A
I
 
M
G
 
G
A
 
A
I
 
I
E
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
G
 
A
A
 
A
N
 
G
R
 
R
K
 
K
-
 
D
A
 
V
L
 
I
V
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
F
N
x
D
G
 
G
T
 
S
Q
 
N
E
 
D
A
 
V
I
 
R
D
 
D
A
 
S
I
 
I
K
 
K
A
 
S
G
 
G
T
 
G
M
 
I
L
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
V
D
 
L
Y
 
Q
N
 
P
G
 
A
F
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
G
 
A
C
 
Q
L
 
L
G
 
A
M
 
V
T
 
E
A
 
Q
A
 
A

4ry0A Crystal structure of ribose transporter solute binding protein rhe_pf00037 from rhizobium etli cfn 42, target efi-511357, in complex with d-ribose
35% identity, 77% coverage: 29:275/321 of query aligns to 5:251/287 of 4ry0A

query
sites
4ry0A
I
 
I
A
 
A
V
 
I
F
 
I
T
 
T
K
 
P
N
 
A
Q
 
H
T
 
D
N
|
N
P
 
P
F
 
F
F
|
F
Q
 
K
V
 
A
V
 
E
R
 
A
Q
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
A
A
 
K
A
 
A
K
 
K
S
 
E
M
 
L
N
 
G
A
 
Y
R
 
E
V
 
T
T
 
-
H
 
-
Y
 
L
I
 
V
P
 
M
T
 
T
K
 
H
P
 
D
D
 
D
S
 
D
I
 
A
P
 
N
E
 
K
Q
 
Q
M
 
S
S
 
E
Q
 
M
I
 
I
E
 
D
D
 
T
V
 
A
I
 
I
V
 
G
K
 
R
K
 
G
A
 
A
D
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
I
F
 
L
V
 
D
P
 
N
V
 
A
D
 
G
Y
 
A
K
 
D
A
 
A
M
 
S
G
 
V
P
 
A
G
 
A
V
 
V
K
 
K
K
 
K
I
 
A
N
 
K
A
 
D
A
 
A
N
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
S
V
 
F
N
 
L
V
 
I
T
x
D
D
x
R
K
 
E
S
 
I
D
 
N
-
 
A
V
 
T
G
 
G
N
 
V
F
 
A
V
 
V
S
 
A
F
 
Q
I
 
I
G
 
V
A
 
S
S
 
N
D
 
N
Y
 
Y
D
 
Q
L
 
G
G
 
A
L
 
Q
K
 
L
T
 
G
A
 
A
T
 
Q
H
 
E
L
 
F
F
 
V
K
 
K
A
 
L
M
 
M
G
 
G
G
 
E
K
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
Y
V
 
V
L
 
E
L
 
L
E
 
V
G
 
G
I
 
-
K
 
K
G
 
E
S
 
S
L
x
D
T
 
T
N
 
N
I
 
A
D
 
G
-
 
I
R
|
R
V
 
S
R
 
Q
G
 
G
M
 
Y
H
 
H
D
|
D
A
 
V
L
 
I
K
x
D
A
x
D
F
 
Y
P
 
P
G
 
E
I
 
M
K
 
K
L
 
S
V
 
V
A
 
A
S
 
K
Q
 
Q
P
 
S
A
 
A
N
 
N
Y
x
W
Q
 
S
R
 
Q
L
 
T
Q
 
E
A
 
A
L
 
Y
Q
 
S
V
 
K
M
 
M
E
 
E
N
 
T
L
 
I
M
 
L
Q
 
Q
S
 
A
Y
 
N
P
 
P
Q
 
D
I
 
I
D
 
K
A
 
G
I
 
V
F
 
I
A
 
S
T
 
G
N
|
N
D
 
D
A
 
T
M
 
M
A
 
A
I
 
M
G
 
G
A
 
A
I
 
I
E
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
G
 
A
A
 
A
N
 
G
R
 
R
K
 
K
-
 
D
A
 
V
L
 
I
V
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
F
N
x
D
G
 
G
T
 
S
Q
 
N
E
 
D
A
 
V
I
 
R
D
 
D
A
 
S
I
 
I
K
 
K
A
 
S
G
 
G
T
 
G
M
 
I
L
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
V
D
 
L
Y
x
Q
N
 
P
G
 
A
F
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
G
 
A
C
 
Q
L
 
L
G
 
A
M
 
V
T
 
E
A
 
Q
A
 
A

8wlbA X-ray structure of enterobacter cloacae allose-binding protein in complex with d-psicose (see paper)
31% identity, 72% coverage: 30:259/321 of query aligns to 5:244/288 of 8wlbA

query
sites
8wlbA
A
 
A
V
 
V
F
 
V
T
 
L
K
|
K
N
 
T
Q
 
L
T
 
S
N
|
N
P
 
P
F
|
F
F
x
W
Q
 
V
V
 
D
V
 
M
R
 
K
Q
 
K
G
 
G
A
 
I
D
 
E
A
 
D
A
 
E
A
 
A
K
 
K
S
 
T
M
 
L
N
 
G
A
 
V
R
 
S
V
 
V
T
 
D
H
 
I
Y
 
F
I
 
A
P
 
S
T
 
P
K
 
S
P
 
E
D
 
G
S
 
D
I
 
F
P
 
Q
E
 
S
Q
 
Q
M
 
L
S
 
Q
Q
 
L
I
 
F
E
 
E
D
 
D
V
 
L
I
 
S
V
 
N
K
 
K
K
 
K
A
 
Y
D
 
K
A
 
G
I
 
I
V
 
A
F
 
F
V
 
A
P
 
P
V
 
L
D
 
S
Y
 
S
K
 
V
A
 
N
M
 
L
G
 
V
P
 
M
G
 
P
V
 
V
K
 
A
K
 
R
I
 
A
N
 
W
A
 
Q
A
 
K
N
 
G
I
 
L
P
 
Y
V
 
L
V
 
V
N
 
N
V
 
L
T
x
D
D
x
E
K
 
K
S
 
I
D
 
D
V
 
M
-
 
D
-
 
N
-
 
L
-
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
G
G
 
G
N
 
N
F
 
V
V
 
E
S
 
G
F
 
F
I
 
V
G
 
T
A
 
T
S
 
D
D
 
N
Y
 
V
D
 
A
L
 
V
G
 
G
L
 
A
K
 
K
T
 
G
A
 
A
T
 
D
H
 
F
L
 
I
F
 
I
K
 
N
A
 
K
M
 
L
G
 
G
G
 
A
K
 
E
G
 
G
-
 
G
N
 
E
V
 
V
V
 
A
L
 
I
L
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
K
K
 
A
G
 
G
S
 
N
L
 
A
T
x
S
N
 
G
I
 
E
D
 
A
R
|
R
V
 
R
R
 
N
G
 
G
M
 
A
H
 
T
D
 
E
A
 
A
L
 
F
K
 
K
A
 
K
F
 
A
P
 
N
G
 
Q
I
 
I
K
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
S
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
N
 
D
Y
 
W
Q
 
D
R
 
R
L
 
I
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
V
 
V
M
 
A
E
 
T
N
 
N
L
 
V
M
 
L
Q
 
Q
S
 
R
Y
 
N
P
 
P
Q
 
N
I
 
L
D
 
K
A
 
A
I
 
F
F
 
Y
A
 
C
T
 
A
N
|
N
D
 
D
A
 
T
M
 
M
A
 
A
I
 
M
G
 
G
A
 
V
I
 
A
E
 
Q
A
 
A
L
 
V
Q
 
A
G
 
N
A
 
A
N
 
G
R
 
K
-
 
I
-
 
G
K
 
K
A
 
V
L
 
L
V
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
T
N
x
D
G
 
G
T
 
I
Q
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
R
D
 
K
A
 
M
I
 
V
K
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
Q
M
 
M
L
 
T
A
 
A
T
 
T

Sites not aligning to the query:

8wl9A X-ray structure of enterobacter cloacae allose-binding protein in complex with d-ribose (see paper)
31% identity, 72% coverage: 30:259/321 of query aligns to 5:244/288 of 8wl9A

query
sites
8wl9A
A
 
A
V
 
V
F
 
V
T
 
L
K
 
K
N
 
T
Q
 
L
T
 
S
N
|
N
P
 
P
F
|
F
F
 
W
Q
 
V
V
 
D
V
 
M
R
 
K
Q
 
K
G
 
G
A
 
I
D
 
E
A
 
D
A
 
E
A
 
A
K
 
K
S
 
T
M
 
L
N
 
G
A
 
V
R
 
S
V
 
V
T
 
D
H
 
I
Y
 
F
I
 
A
P
 
S
T
 
P
K
 
S
P
 
E
D
 
G
S
 
D
I
 
F
P
 
Q
E
 
S
Q
 
Q
M
 
L
S
 
Q
Q
 
L
I
 
F
E
 
E
D
 
D
V
 
L
I
 
S
V
 
N
K
 
K
K
 
K
A
 
Y
D
 
K
A
 
G
I
 
I
V
 
A
F
 
F
V
 
A
P
 
P
V
 
L
D
 
S
Y
 
S
K
 
V
A
 
N
M
 
L
G
 
V
P
 
M
G
 
P
V
 
V
K
 
A
K
 
R
I
 
A
N
 
W
A
 
Q
A
 
K
N
 
G
I
 
L
P
 
Y
V
 
L
V
 
V
N
 
N
V
 
L
T
x
D
D
 
E
K
 
K
S
 
I
D
 
D
V
 
M
-
 
D
-
 
N
-
 
L
-
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
G
G
 
G
N
 
N
F
 
V
V
 
E
S
 
G
F
 
F
I
 
V
G
 
T
A
 
T
S
 
D
D
 
N
Y
 
V
D
 
A
L
 
V
G
 
G
L
 
A
K
 
K
T
 
G
A
 
A
T
 
D
H
 
F
L
 
I
F
 
I
K
 
N
A
 
K
M
 
L
G
 
G
G
 
A
K
 
E
G
 
G
-
 
G
N
 
E
V
 
V
V
 
A
L
 
I
L
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
K
K
 
A
G
 
G
S
 
N
L
 
A
T
 
S
N
 
G
I
 
E
D
 
A
R
|
R
V
 
R
R
 
N
G
 
G
M
 
A
H
 
T
D
 
E
A
 
A
L
 
F
K
 
K
A
 
K
F
 
A
P
 
N
G
 
Q
I
 
I
K
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
S
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
N
 
D
Y
x
W
Q
 
D
R
 
R
L
 
I
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
V
 
V
M
 
A
E
 
T
N
 
N
L
 
V
M
 
L
Q
 
Q
S
 
R
Y
 
N
P
 
P
Q
 
N
I
 
L
D
 
K
A
 
A
I
 
F
F
 
Y
A
 
C
T
 
A
N
|
N
D
 
D
A
 
T
M
 
M
A
 
A
I
 
M
G
 
G
A
 
V
I
 
A
E
 
Q
A
 
A
L
 
V
Q
 
A
G
 
N
A
 
A
N
 
G
R
 
K
-
 
I
-
 
G
K
 
K
A
 
V
L
 
L
V
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
T
N
x
D
G
 
G
T
 
I
Q
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
R
D
 
K
A
 
M
I
 
V
K
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
Q
M
 
M
L
 
T
A
 
A
T
 
T

Sites not aligning to the query:

4yo7A Crystal structure of an abc transporter solute binding protein (ipr025997) from bacillus halodurans c-125 (bh2323, target efi- 511484) with bound myo-inositol
29% identity, 72% coverage: 72:302/321 of query aligns to 50:282/287 of 4yo7A

query
sites
4yo7A
E
 
Q
Q
 
Q
M
 
M
S
 
A
Q
 
Q
I
 
V
E
 
E
D
 
N
V
 
F
I
 
I
V
 
S
K
 
R
K
 
N
A
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
I
F
 
V
V
 
N
P
 
P
V
 
V
D
 
D
Y
 
T
K
 
T
A
 
S
M
 
A
G
 
V
P
 
D
G
 
I
V
 
V
K
 
N
K
 
M
I
 
V
N
 
N
A
 
D
A
 
A
N
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
I
V
 
I
N
 
I
V
 
A
T
x
N
D
x
R
K
 
T
S
 
F
D
 
D
-
 
G
V
 
V
G
 
D
N
 
Q
F
 
A
V
 
T
S
 
A
F
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
S
S
 
E
D
 
S
Y
 
I
D
 
Q
L
 
S
G
 
G
L
 
L
K
 
L
T
 
Q
A
 
M
T
 
E
H
 
E
L
 
V
F
 
A
K
 
K
A
 
L
M
 
L
G
 
N
G
 
N
K
 
E
G
 
G
N
 
N
V
 
I
V
 
A
L
 
I
L
 
M
E
 
D
G
 
G
I
 
E
K
 
L
G
 
G
S
 
H
L
 
E
T
 
A
N
 
Q
I
 
I
D
 
M
R
|
R
V
 
T
R
 
E
G
 
G
M
 
N
H
 
K
D
 
Q
A
 
I
L
 
I
K
 
E
A
 
E
F
 
H
P
 
D
G
 
G
I
 
L
K
 
E
L
 
V
V
 
V
A
 
L
S
 
Q
Q
 
G
P
 
T
A
 
A
N
 
K
Y
 
F
Q
 
D
R
 
R
L
 
S
Q
 
E
A
 
G
L
 
M
Q
 
R
V
 
L
M
 
M
E
 
E
N
 
N
L
 
W
M
 
L
Q
 
N
S
 
S
Y
 
G
P
 
T
Q
 
E
I
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
V
F
 
V
A
 
A
T
 
N
N
|
N
D
 
D
A
 
E
M
 
M
A
 
A
I
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
E
 
L
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
G
 
A
A
 
V
N
 
G
R
 
K
-
x
L
-
 
D
K
 
D
A
x
V
L
 
I
V
 
V
S
 
A
G
 
G
I
 
I
N
x
D
G
 
A
T
 
T
Q
 
P
E
 
A
A
 
A
I
 
L
D
 
E
A
 
A
I
 
M
K
 
K
A
 
E
G
 
G
T
 
K
M
 
L
L
 
D
A
 
V
T
 
T
G
 
V
D
 
F
Y
x
Q
N
 
D
G
 
A
F
 
K
A
 
G
Q
 
Q
G
 
G
C
 
A
L
 
T
G
 
S
M
 
V
T
 
K
A
 
V
A
 
A
I
 
V
R
 
Q
K
 
A
L
 
A
R
 
N
G
 
G
M
 
E
P
 
D
V
 
V
T
 
E
Q
 
D
S
 
A
I
 
M
V
 
I
L
 
-
P
 
P
A
 
Y
T
 
E
V
 
L
V
 
V
D
 
T
K
 
P
T
 
E
N
 
N
Y
 
V
Q
 
E
S
 
E

Sites not aligning to the query:

6hyhA Crystal structure of msmeg_1712 from mycobacterium smegmatis in complex with beta-d-fucofuranose (see paper)
33% identity, 70% coverage: 72:297/321 of query aligns to 45:279/304 of 6hyhA

query
sites
6hyhA
E
 
K
Q
 
Q
M
 
I
S
 
S
Q
 
A
I
 
I
E
 
R
D
 
S
V
 
F
I
 
I
V
 
Q
K
 
Q
K
 
G
A
 
V
D
 
D
A
 
V
I
 
I
V
 
A
F
 
F
V
 
S
P
 
P
V
 
V
D
 
V
Y
 
R
K
 
T
A
 
G
M
 
W
G
x
D
P
 
A
G
 
V
V
 
L
K
 
Q
K
 
E
I
 
T
N
 
K
A
 
N
A
 
A
N
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
-
 
L
-
 
T
-
x
D
N
x
R
V
 
A
T
 
V
D
 
D
K
 
T
S
 
Q
D
|
D
V
 
T
G
 
D
N
 
V
F
 
Y
V
 
K
S
 
T
F
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
D
D
x
F
Y
 
I
D
 
E
L
 
E
G
 
G
L
 
R
K
 
R
T
 
A
A
 
G
T
 
Q
H
 
W
L
 
V
-
 
A
-
 
D
-
 
Q
F
 
Y
K
 
A
A
 
S
M
 
A
G
 
T
G
 
G
K
 
P
G
 
V
N
 
N
V
 
I
V
 
V
L
 
Q
L
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
T
K
 
T
G
 
G
S
 
A
L
x
D
T
x
P
N
 
A
I
 
I
D
|
D
R
|
R
V
 
K
R
 
T
G
 
G
M
 
F
H
 
A
D
 
E
A
 
G
L
 
I
K
 
S
A
 
K
F
 
N
P
 
P
G
 
N
I
 
L
K
 
K
L
 
I
V
 
V
A
 
A
S
 
S
Q
 
Q
P
 
T
A
 
G
N
 
D
Y
x
F
Q
 
T
R
 
R
L
 
S
Q
 
G
A
 
G
L
 
K
Q
 
Q
V
 
V
M
 
M
E
 
E
N
 
A
L
 
F
M
 
L
Q
 
K
S
 
S
Y
 
T
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
V
I
 
V
F
 
F
A
 
A
T
 
Q
N
|
N
D
 
D
A
 
D
M
 
M
A
 
G
I
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
M
E
 
E
A
 
A
L
 
I
Q
 
E
G
 
A
A
 
A
N
 
G
R
 
K
K
 
K
A
 
-
L
 
-
V
 
-
S
 
P
G
 
G
I
 
T
N
 
D
G
 
I
T
 
K
Q
 
I
E
 
V
A
 
A
I
 
V
D
|
D
A
 
A
I
 
T
K
 
H
A
 
D
G
 
G
T
 
M
M
 
Q
-
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
D
G
 
G
D
 
K
Y
 
F
N
 
N
G
 
Y
F
 
I
A
 
V
Q
x
E
G
 
-
C
 
C
-
 
N
-
 
P
-
 
L
L
 
L
G
 
G
-
 
P
-
 
E
-
 
L
M
 
M
T
 
D
A
 
L
A
 
A
I
 
K
R
 
K
K
 
V
L
 
A
R
 
A
G
 
G
M
 
E
P
 
P
V
 
V
T
 
P
Q
 
E
S
 
R
I
 
V
V
 
V
L
 
T
P
 
P
A
 
D
T
x
E
V
 
A
V
 
F
D
 
D
K
 
Q

Sites not aligning to the query:

6hbmA Crystal structure of msmeg_1712 from mycobacterium smegmatis in complex with alpha-l-arabinofuranose (see paper)
33% identity, 70% coverage: 72:297/321 of query aligns to 45:279/304 of 6hbmA

query
sites
6hbmA
E
 
K
Q
 
Q
M
 
I
S
 
S
Q
 
A
I
 
I
E
 
R
D
 
S
V
 
F
I
 
I
V
 
Q
K
 
Q
K
 
G
A
 
V
D
 
D
A
 
V
I
 
I
V
 
A
F
 
F
V
 
S
P
 
P
V
 
V
D
 
V
Y
 
R
K
 
T
A
 
G
M
 
W
G
x
D
P
 
A
G
 
V
V
 
L
K
 
Q
K
 
E
I
 
T
N
 
K
A
 
N
A
 
A
N
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
-
 
L
-
 
T
-
x
D
N
x
R
V
 
A
T
 
V
D
 
D
K
 
T
S
 
Q
D
|
D
V
 
T
G
 
D
N
 
V
F
 
Y
V
 
K
S
 
T
F
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
D
D
 
F
Y
 
I
D
 
E
L
 
E
G
 
G
L
 
R
K
 
R
T
 
A
A
 
G
T
 
Q
H
 
W
L
 
V
-
 
A
-
 
D
-
 
Q
F
 
Y
K
 
A
A
 
S
M
 
A
G
 
T
G
 
G
K
 
P
G
 
V
N
 
N
V
 
I
V
 
V
L
 
Q
L
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
T
K
 
T
G
 
G
S
 
A
L
 
D
T
 
P
N
 
A
I
 
I
D
 
D
R
|
R
V
 
K
R
 
T
G
 
G
M
 
F
H
 
A
D
 
E
A
 
G
L
 
I
K
 
S
A
 
K
F
 
N
P
 
P
G
 
N
I
 
L
K
 
K
L
 
I
V
 
V
A
 
A
S
 
S
Q
 
Q
P
 
T
A
 
G
N
 
D
Y
 
F
Q
 
T
R
 
R
L
 
S
Q
 
G
A
 
G
L
 
K
Q
 
Q
V
 
V
M
 
M
E
 
E
N
 
A
L
 
F
M
 
L
Q
 
K
S
 
S
Y
 
T
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
V
I
 
V
F
 
F
A
 
A
T
 
Q
N
|
N
D
 
D
A
 
D
M
 
M
A
 
G
I
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
M
E
 
E
A
 
A
L
 
I
Q
 
E
G
 
A
A
 
A
N
 
G
R
 
K
K
 
K
A
 
-
L
 
-
V
 
-
S
 
P
G
 
G
I
 
T
N
 
D
G
 
I
T
 
K
Q
 
I
E
 
V
A
 
A
I
 
V
D
|
D
A
 
A
I
 
T
K
 
H
A
 
D
G
 
G
T
 
M
M
 
Q
-
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
D
G
 
G
D
 
K
Y
 
F
N
 
N
G
 
Y
F
 
I
A
 
V
Q
x
E
G
 
-
C
 
C
-
 
N
-
 
P
-
 
L
L
 
L
G
 
G
-
 
P
-
 
E
-
 
L
M
 
M
T
 
D
A
 
L
A
 
A
I
 
K
R
 
K
K
 
V
L
 
A
R
 
A
G
 
G
M
 
E
P
 
P
V
 
V
T
 
P
Q
 
E
S
 
R
I
 
V
V
 
V
L
 
T
P
 
P
A
 
D
T
x
E
V
 
A
V
 
F
D
 
D
K
 
Q

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>RR42_RS32885 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS32885
MNVRNLKPLAGLLALGILAAPAHADGERIAVFTKNQTNPFFQVVRQGADAAAKSMNARVT
HYIPTKPDSIPEQMSQIEDVIVKKADAIVFVPVDYKAMGPGVKKINAANIPVVNVTDKSD
VGNFVSFIGASDYDLGLKTATHLFKAMGGKGNVVLLEGIKGSLTNIDRVRGMHDALKAFP
GIKLVASQPANYQRLQALQVMENLMQSYPQIDAIFATNDAMAIGAIEALQGANRKALVSG
INGTQEAIDAIKAGTMLATGDYNGFAQGCLGMTAAIRKLRGMPVTQSIVLPATVVDKTNY
QSIDIPVSKRACPRWEDAAKA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory