SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS33665 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS33665 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 19 hits to proteins with known functional sites (download)

4gnaA Mouse smp30/gnl-xylitol complex (see paper)
32% identity, 93% coverage: 18:296/300 of query aligns to 15:295/297 of 4gnaA

query
sites
4gnaA
G
 
G
E
|
E
S
 
S
P
 
P
F
 
V
W
 
W
D
 
E
T
 
E
Q
 
A
T
 
S
Q
 
Q
C
 
S
L
 
L
Y
 
L
W
 
F
S
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
S
R
 
K
T
 
I
L
 
I
F
 
C
E
 
R
W
 
W
R
 
D
A
 
T
A
 
V
N
 
S
A
 
N
A
 
Q
I
 
V
R
 
Q
T
 
R
W
 
V
E
 
A
L
 
V
P
 
D
E
 
A
M
 
P
A
 
V
G
 
S
C
 
S
I
 
V
A
 
A
P
 
L
A
 
R
S
 
Q
A
 
L
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
T
M
 
I
Q
 
G
S
 
T
G
 
K
L
 
F
F
 
C
H
 
A
L
 
L
Q
 
N
P
 
W
Q
 
E
P
 
N
D
 
Q
G
 
S
S
 
V
M
 
F
A
 
V
S
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
A
S
 
M
V
 
V
A
 
D
H
 
E
P
 
D
A
 
K
P
 
K
S
 
N
M
 
N
R
|
R
F
 
F
N
|
N
D
 
D
G
 
G
R
 
K
C
 
V
D
 
D
R
 
P
Q
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
W
 
F
A
 
A
G
 
G
T
 
T
M
 
M
H
 
A
L
 
E
D
x
E
M
 
T
H
 
A
P
 
P
A
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
E
Q
 
R
S
 
H
I
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
L
Y
 
Y
R
 
S
-
 
L
F
 
F
D
 
P
A
 
D
R
 
H
G
 
S
L
 
V
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
Y
I
 
F
E
 
D
G
 
Q
L
 
V
I
 
D
V
 
I
P
 
S
N
|
N
G
 
G
M
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
S
P
 
L
D
 
D
G
 
H
R
 
K
T
 
I
M
 
F
Y
 
Y
L
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
S
H
 
L
P
 
S
D
 
-
V
 
-
Q
 
Y
A
 
T
I
 
V
W
 
D
A
 
A
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
L
A
 
Q
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
I
S
 
S
R
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
I
W
 
V
I
 
Y
D
 
K
M
 
M
R
 
E
Q
 
K
Y
 
D
P
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
M
A
 
C
V
 
I
D
 
D
V
 
A
D
 
E
G
 
G
C
 
K
Y
 
L
W
 
W
I
 
V
C
 
A
G
 
C
N
x
Y
D
 
N
A
 
G
G
 
G
V
 
R
V
 
V
H
 
I
R
 
R
F
 
L
T
 
D
P
 
P
E
 
E
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
R
D
 
L
R
 
Q
S
 
T
I
 
V
A
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
V
K
 
D
K
 
K
P
 
T
A
 
T
M
 
S
C
 
C
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
K
D
 
D
M
 
Y
K
 
S
T
 
E
L
 
M
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
C
I
 
A
R
 
R
P
 
D
A
 
G
-
 
L
D
 
N
A
 
A
S
 
E
V
 
G
Q
 
L
A
 
L
E
 
R
Q
 
Q
P
 
P
L
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
N
V
 
I
F
 
F
A
 
K
V
 
I
R
 
T
-
 
G
P
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
P
R
 
Y
A
 
S
F
 
Y

4gn9A Mouse smp30/gnl-glucose complex (see paper)
32% identity, 93% coverage: 18:296/300 of query aligns to 15:295/297 of 4gn9A

query
sites
4gn9A
G
 
G
E
|
E
S
 
S
P
 
P
F
 
V
W
 
W
D
 
E
T
 
E
Q
 
A
T
 
S
Q
 
Q
C
 
S
L
 
L
Y
 
L
W
 
F
S
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
S
R
 
K
T
 
I
L
 
I
F
 
C
E
 
R
W
 
W
R
 
D
A
 
T
A
 
V
N
 
S
A
 
N
A
 
Q
I
 
V
R
 
Q
T
 
R
W
 
V
E
 
A
L
 
V
P
 
D
E
 
A
M
 
P
A
 
V
G
 
S
C
 
S
I
 
V
A
 
A
P
 
L
A
 
R
S
 
Q
A
 
L
G
 
G
G
|
G
F
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
T
M
 
I
Q
 
G
S
 
T
G
 
K
L
 
F
F
 
C
H
 
A
L
 
L
Q
 
N
P
x
W
Q
x
E
P
 
N
D
 
Q
G
 
S
S
 
V
M
 
F
A
 
V
S
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
A
S
 
M
V
 
V
A
x
D
H
x
E
P
 
D
A
 
K
P
 
K
S
 
N
M
 
N
R
|
R
F
 
F
N
|
N
D
 
D
G
 
G
R
 
K
C
 
V
D
 
D
R
 
P
Q
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
W
 
F
A
 
A
G
 
G
T
 
T
M
 
M
H
 
A
L
 
E
D
x
E
M
 
T
H
 
A
P
 
P
A
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
E
Q
 
R
S
 
H
I
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
L
Y
|
Y
R
 
S
-
 
L
F
 
F
D
 
P
A
 
D
R
 
H
G
 
S
L
 
V
Q
 
K
Q
x
K
Q
 
Y
I
 
F
E
 
D
G
 
Q
L
 
V
I
 
D
V
 
I
P
 
S
N
|
N
G
 
G
M
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
S
P
 
L
D
 
D
G
 
H
R
 
K
T
 
I
M
 
F
Y
 
Y
L
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
|
S
H
 
L
P
 
S
D
 
-
V
 
-
Q
 
Y
A
 
T
I
 
V
W
 
D
A
 
A
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
L
A
 
Q
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
I
S
 
S
R
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
I
W
 
V
I
 
Y
D
 
K
M
 
M
R
 
E
Q
 
K
Y
 
D
P
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
M
A
 
C
V
 
I
D
 
D
V
 
A
D
 
E
G
 
G
C
 
K
Y
 
L
W
 
W
I
 
V
C
 
A
G
 
C
N
x
Y
D
 
N
A
 
G
G
 
G
V
 
R
V
 
V
H
 
I
R
 
R
F
 
L
T
 
D
P
 
P
E
 
E
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
R
D
 
L
R
 
Q
S
 
T
I
 
V
A
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
V
K
 
D
K
 
K
P
 
T
A
 
T
M
 
S
C
 
C
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
K
D
 
D
M
 
Y
K
 
S
T
 
E
L
 
M
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
C
I
 
A
R
 
R
P
 
D
A
 
G
-
 
L
D
 
N
A
 
A
S
 
E
V
 
G
Q
 
L
A
 
L
E
 
R
Q
 
Q
P
 
P
L
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
N
V
 
I
F
 
F
A
 
K
V
 
I
R
 
T
-
 
G
P
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
P
R
 
Y
A
 
S
F
 
Y

4gn8A Mouse smp30/gnl-1,5-ag complex (see paper)
32% identity, 93% coverage: 18:296/300 of query aligns to 15:295/297 of 4gn8A

query
sites
4gn8A
G
 
G
E
|
E
S
 
S
P
 
P
F
 
V
W
 
W
D
 
E
T
 
E
Q
 
A
T
 
S
Q
 
Q
C
 
S
L
 
L
Y
 
L
W
 
F
S
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
S
R
 
K
T
 
I
L
 
I
F
 
C
E
 
R
W
 
W
R
 
D
A
 
T
A
 
V
N
 
S
A
 
N
A
 
Q
I
 
V
R
 
Q
T
 
R
W
 
V
E
 
A
L
 
V
P
 
D
E
 
A
M
 
P
A
 
V
G
 
S
C
 
S
I
 
V
A
 
A
P
 
L
A
 
R
S
x
Q
A
 
L
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
T
M
 
I
Q
 
G
S
 
T
G
 
K
L
 
F
F
 
C
H
 
A
L
 
L
Q
 
N
P
 
W
Q
 
E
P
 
N
D
 
Q
G
 
S
S
 
V
M
 
F
A
 
V
S
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
A
S
 
M
V
 
V
A
 
D
H
 
E
P
 
D
A
 
K
P
 
K
S
 
N
M
 
N
R
|
R
F
 
F
N
|
N
D
 
D
G
 
G
R
 
K
C
 
V
D
 
D
R
 
P
Q
x
A
G
|
G
R
 
R
F
 
Y
W
 
F
A
 
A
G
 
G
T
 
T
M
 
M
H
 
A
L
 
E
D
x
E
M
 
T
H
 
A
P
|
P
A
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
E
Q
 
R
S
 
H
I
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
L
Y
 
Y
R
 
S
-
 
L
F
 
F
D
 
P
A
 
D
R
 
H
G
 
S
L
 
V
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
Y
I
 
F
E
 
D
G
 
Q
L
 
V
I
 
D
V
 
I
P
 
S
N
|
N
G
 
G
M
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
S
P
 
L
D
 
D
G
 
H
R
 
K
T
 
I
M
 
F
Y
|
Y
L
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
S
H
 
L
P
 
S
D
 
-
V
 
-
Q
 
Y
A
 
T
I
 
V
W
 
D
A
|
A
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
D
|
D
A
 
L
A
x
Q
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
I
S
 
S
R
 
N
R
 
R
R
|
R
L
 
I
W
x
V
I
 
Y
D
 
K
M
 
M
R
 
E
Q
 
K
Y
 
D
P
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
M
A
 
C
V
 
I
D
 
D
V
 
A
D
 
E
G
 
G
C
 
K
Y
 
L
W
 
W
I
 
V
C
 
A
G
 
C
N
x
Y
D
 
N
A
 
G
G
 
G
V
 
R
V
 
V
H
 
I
R
 
R
F
 
L
T
 
D
P
|
P
E
 
E
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
R
D
 
L
R
 
Q
S
 
T
I
 
V
A
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
V
K
 
D
K
 
K
P
 
T
A
 
T
M
 
S
C
 
C
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
K
D
 
D
M
 
Y
K
 
S
T
 
E
L
 
M
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
C
I
 
A
R
 
R
P
 
D
A
 
G
-
 
L
D
 
N
A
 
A
S
 
E
V
 
G
Q
 
L
A
 
L
E
 
R
Q
 
Q
P
 
P
L
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
N
V
 
I
F
 
F
A
 
K
V
 
I
R
 
T
-
 
G
P
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
P
R
x
Y
A
x
S
F
 
Y

4gn7A Mouse smp30/gnl (see paper)
32% identity, 93% coverage: 18:296/300 of query aligns to 15:295/297 of 4gn7A

query
sites
4gn7A
G
 
G
E
|
E
S
 
S
P
 
P
F
 
V
W
 
W
D
 
E
T
 
E
Q
 
A
T
 
S
Q
 
Q
C
 
S
L
 
L
Y
 
L
W
 
F
S
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
S
R
 
K
T
 
I
L
 
I
F
 
C
E
 
R
W
 
W
R
 
D
A
 
T
A
 
V
N
 
S
A
 
N
A
 
Q
I
 
V
R
 
Q
T
 
R
W
 
V
E
 
A
L
 
V
P
 
D
E
 
A
M
 
P
A
 
V
G
 
S
C
 
S
I
 
V
A
 
A
P
 
L
A
 
R
S
 
Q
A
 
L
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
T
M
 
I
Q
 
G
S
 
T
G
 
K
L
 
F
F
 
C
H
 
A
L
 
L
Q
 
N
P
 
W
Q
 
E
P
 
N
D
 
Q
G
 
S
S
 
V
M
 
F
A
 
V
S
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
A
S
 
M
V
 
V
A
 
D
H
 
E
P
 
D
A
 
K
P
 
K
S
 
N
M
 
N
R
 
R
F
 
F
N
 
N
D
 
D
G
 
G
R
 
K
C
 
V
D
 
D
R
 
P
Q
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
W
 
F
A
 
A
G
 
G
T
 
T
M
 
M
H
 
A
L
 
E
D
 
E
M
 
T
H
 
A
P
 
P
A
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
E
Q
 
R
S
 
H
I
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
L
Y
 
Y
R
 
S
-
 
L
F
 
F
D
 
P
A
 
D
R
 
H
G
 
S
L
 
V
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
Y
I
 
F
E
 
D
G
 
Q
L
 
V
I
 
D
V
 
I
P
 
S
N
|
N
G
 
G
M
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
S
P
 
L
D
 
D
G
 
H
R
 
K
T
 
I
M
 
F
Y
 
Y
L
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
S
H
 
L
P
 
S
D
 
-
V
 
-
Q
 
Y
A
 
T
I
 
V
W
 
D
A
 
A
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
L
A
 
Q
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
I
S
 
S
R
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
I
W
 
V
I
 
Y
D
 
K
M
 
M
R
 
E
Q
 
K
Y
 
D
P
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
M
A
 
C
V
 
I
D
 
D
V
 
A
D
 
E
G
 
G
C
 
K
Y
 
L
W
 
W
I
 
V
C
 
A
G
 
C
N
 
Y
D
 
N
A
 
G
G
 
G
V
 
R
V
 
V
H
 
I
R
 
R
F
 
L
T
 
D
P
 
P
E
 
E
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
R
D
 
L
R
 
Q
S
 
T
I
 
V
A
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
V
K
 
D
K
 
K
P
 
T
A
 
T
M
 
S
C
 
C
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
K
D
 
D
M
 
Y
K
 
S
T
 
E
L
 
M
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
C
I
 
A
R
 
R
P
 
D
A
 
G
-
 
L
D
 
N
A
 
A
S
 
E
V
 
G
Q
 
L
A
 
L
E
 
R
Q
 
Q
P
 
P
L
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
N
V
 
I
F
 
F
A
 
K
V
 
I
R
 
T
-
 
G
P
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
P
R
 
Y
A
 
S
F
 
Y

7pldB Caulobacter crescentus xylonolactonase with (r)-4-hydroxy-2- pyrrolidone (see paper)
34% identity, 98% coverage: 5:299/300 of query aligns to 3:289/289 of 7pldB

query
sites
7pldB
A
 
A
P
 
Q
I
 
V
D
 
T
L
 
C
I
 
V
A
 
W
D
 
D
V
 
L
R
 
K
N
 
A
A
 
T
V
x
L
G
 
G
E
|
E
S
 
G
P
 
P
F
 
I
W
 
W
D
 
H
T
 
G
Q
 
D
T
 
T
Q
 
-
C
 
-
L
 
L
Y
 
W
W
 
F
S
 
V
D
 
D
I
|
I
P
 
K
A
 
Q
R
 
R
T
 
K
L
 
I
F
 
H
E
 
N
W
 
Y
R
 
H
A
 
P
A
 
A
N
 
T
A
 
G
A
 
E
I
 
R
R
 
F
T
 
S
W
 
F
E
 
D
L
 
A
P
 
P
E
 
D
M
 
Q
A
 
V
G
 
T
C
 
F
I
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
I
A
 
V
S
 
G
A
|
A
G
 
T
G
|
G
F
|
F
V
 
V
A
 
V
G
 
G
M
 
L
Q
 
K
S
 
T
G
 
G
L
 
I
F
 
H
H
 
R
L
 
F
Q
 
H
P
|
P
Q
 
A
P
 
T
D
 
G
G
 
F
S
 
S
M
 
L
A
 
-
S
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
L
S
 
E
V
 
V
A
 
E
H
 
D
P
 
A
A
 
A
P
 
L
S
 
N
M
 
N
R
|
R
F
 
P
N
|
N
D
 
D
G
 
A
R
 
T
C
 
V
D
 
D
R
 
A
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
F
 
L
W
 
W
A
 
F
G
 
G
T
 
T
M
 
M
H
 
H
L
 
-
D
 
D
M
 
G
H
x
E
P
 
E
A
 
N
Q
 
N
S
 
S
I
 
-
G
 
G
S
 
S
V
 
L
Y
 
Y
R
 
R
F
 
M
D
 
D
A
 
L
R
 
T
G
 
G
L
 
V
Q
 
A
Q
 
R
Q
 
M
I
x
D
E
 
R
G
 
D
L
 
I
I
 
C
V
 
I
P
 
T
N
|
N
G
 
G
M
 
P
A
 
C
W
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
R
 
K
T
 
T
M
 
F
Y
 
Y
L
 
H
S
 
T
D
 
D
S
 
T
H
 
L
P
 
E
D
 
-
V
 
-
Q
 
K
A
 
T
I
 
I
W
 
Y
A
 
A
F
 
F
D
 
D
Y
 
L
D
 
-
A
 
A
A
 
E
N
 
D
G
 
G
V
 
L
A
 
L
S
 
S
R
 
N
R
x
K
R
 
R
L
 
V
W
 
F
I
 
V
D
 
Q
M
 
F
R
 
A
Q
 
L
Y
 
G
P
 
D
G
 
D
-
 
V
R
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
S
A
 
V
V
 
V
D
 
D
V
 
S
D
 
E
G
 
G
C
 
Y
Y
 
L
W
 
W
I
 
T
C
 
A
G
 
L
N
x
W
D
 
G
A
 
G
G
 
F
V
 
G
V
 
A
H
 
V
R
 
R
F
 
F
T
 
S
P
 
P
E
 
Q
G
 
G
R
 
D
L
 
A
D
 
V
R
 
T
S
 
R
I
 
I
A
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
A
K
 
P
K
 
N
P
 
V
A
 
T
M
 
K
C
 
P
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
P
D
 
D
M
 
L
K
 
K
T
 
T
L
 
L
F
 
Y
V
 
F
T
 
T
S
 
T
I
 
A
R
 
R
P
 
K
A
 
G
-
 
L
D
 
S
A
 
D
S
 
E
V
 
T
Q
 
L
A
 
A
E
 
Q
Q
 
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
A
V
 
V
R
 
P
P
 
V
G
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
Q
A
 
P
E
 
Q
R
 
H
A
 
E
F
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
V

7plbB Caulobacter crescentus xylonolactonase with d-xylose (see paper)
34% identity, 98% coverage: 5:299/300 of query aligns to 3:289/289 of 7plbB

query
sites
7plbB
A
 
A
P
 
Q
I
 
V
D
 
T
L
 
C
I
 
V
A
 
W
D
 
D
V
 
L
R
 
K
N
 
A
A
 
T
V
x
L
G
 
G
E
|
E
S
 
G
P
 
P
F
 
I
W
 
W
D
 
H
T
 
G
Q
 
D
T
 
T
Q
 
-
C
 
-
L
 
L
Y
 
W
W
 
F
S
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
K
A
 
Q
R
 
R
T
 
K
L
 
I
F
 
H
E
 
N
W
 
Y
R
 
H
A
 
P
A
 
A
N
 
T
A
 
G
A
 
E
I
 
R
R
 
F
T
 
S
W
 
F
E
 
D
L
 
A
P
 
P
E
 
D
M
 
Q
A
 
V
G
 
T
C
 
F
I
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
I
A
 
V
S
 
G
A
|
A
G
 
T
G
|
G
F
|
F
V
 
V
A
 
V
G
 
G
M
 
L
Q
 
K
S
 
T
G
 
G
L
 
I
F
 
H
H
 
R
L
 
F
Q
 
H
P
|
P
Q
 
A
P
 
T
D
 
G
G
 
F
S
 
S
M
 
L
A
 
-
S
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
L
S
x
E
V
|
V
A
 
E
H
x
D
P
 
A
A
 
A
P
 
L
S
 
N
M
 
N
R
|
R
F
 
P
N
|
N
D
 
D
G
 
A
R
 
T
C
 
V
D
 
D
R
 
A
Q
 
Q
G
 
G
R
|
R
F
 
L
W
 
W
A
 
F
G
 
G
T
 
T
M
 
M
H
 
H
L
 
-
D
 
D
M
 
G
H
 
E
P
 
E
A
 
N
Q
 
N
S
 
S
I
 
-
G
 
G
S
 
S
V
 
L
Y
 
Y
R
 
R
F
 
M
D
|
D
A
 
L
R
 
T
G
 
G
L
 
V
Q
 
A
Q
 
R
Q
 
M
I
 
D
E
 
R
G
 
D
L
 
I
I
 
C
V
 
I
P
 
T
N
|
N
G
 
G
M
 
P
A
 
C
W
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
R
 
K
T
 
T
M
 
F
Y
 
Y
L
 
H
S
 
T
D
 
D
S
 
T
H
 
L
P
 
E
D
 
-
V
 
-
Q
 
K
A
 
T
I
 
I
W
 
Y
A
 
A
F
 
F
D
 
D
Y
 
L
D
 
-
A
 
A
A
 
E
N
x
D
G
 
G
V
 
L
A
 
L
S
 
S
R
 
N
R
 
K
R
 
R
L
 
V
W
 
F
I
 
V
D
 
Q
M
 
F
R
 
A
Q
 
L
Y
 
G
P
 
D
G
 
D
-
 
V
R
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
S
A
 
V
V
 
V
D
 
D
V
 
S
D
 
E
G
 
G
C
 
Y
Y
 
L
W
 
W
I
 
T
C
 
A
G
 
L
N
 
W
D
 
G
A
 
G
G
 
F
V
 
G
V
 
A
H
 
V
R
 
R
F
 
F
T
 
S
P
 
P
E
 
Q
G
 
G
R
 
D
L
 
A
D
 
V
R
 
T
S
 
R
I
 
I
A
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
A
K
 
P
K
 
N
P
 
V
A
 
T
M
 
K
C
 
P
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
P
D
 
D
M
 
L
K
 
K
T
 
T
L
 
L
F
 
Y
V
 
F
T
 
T
S
 
T
I
 
A
R
 
R
P
 
K
A
 
G
-
 
L
D
 
S
A
 
D
S
 
E
V
 
T
Q
 
L
A
 
A
E
 
Q
Q
 
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
A
V
 
V
R
 
P
P
 
V
G
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
Q
A
 
P
E
 
Q
R
 
H
A
 
E
F
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
V

Q9A9Z1 D-xylonolactone lactonase; Xylono-1,5-lactonase; EC 3.1.1.110 from Caulobacter vibrioides (strain ATCC 19089 / CB15) (Caulobacter crescentus) (see paper)
34% identity, 98% coverage: 5:299/300 of query aligns to 3:289/289 of Q9A9Z1

query
sites
Q9A9Z1
A
 
A
P
 
Q
I
 
V
D
 
T
L
 
C
I
 
V
A
 
W
D
 
D
V
 
L
R
 
K
N
 
A
A
 
T
V
 
L
G
 
G
E
|
E
S
 
G
P
 
P
F
 
I
W
 
W
D
 
H
T
 
G
Q
 
D
T
 
T
Q
 
-
C
 
-
L
 
L
Y
 
W
W
 
F
S
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
K
A
 
Q
R
 
R
T
 
K
L
 
I
F
 
H
E
 
N
W
 
Y
R
 
H
A
 
P
A
 
A
N
 
T
A
 
G
A
 
E
I
 
R
R
 
F
T
 
S
W
 
F
E
 
D
L
 
A
P
 
P
E
 
D
M
 
Q
A
 
V
G
 
T
C
 
F
I
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
I
A
 
V
S
 
G
A
 
A
G
 
T
G
 
G
F
 
F
V
 
V
A
 
V
G
 
G
M
 
L
Q
 
K
S
 
T
G
 
G
L
 
I
F
 
H
H
 
R
L
 
F
Q
 
H
P
 
P
Q
 
A
P
 
T
D
 
G
G
 
F
S
 
S
M
 
L
A
 
-
S
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
L
S
 
E
V
 
V
A
 
E
H
 
D
P
 
A
A
 
A
P
 
L
S
 
N
M
 
N
R
 
R
F
 
P
N
 
N
D
 
D
G
 
A
R
 
T
C
 
V
D
 
D
R
 
A
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
F
 
L
W
 
W
A
 
F
G
 
G
T
 
T
M
 
M
H
 
H
L
 
-
D
 
D
M
 
G
H
 
E
P
 
E
A
 
N
Q
 
N
S
 
S
I
 
-
G
 
G
S
 
S
V
 
L
Y
 
Y
R
 
R
F
 
M
D
 
D
A
 
L
R
 
T
G
 
G
L
 
V
Q
 
A
Q
 
R
Q
 
M
I
 
D
E
 
R
G
 
D
L
 
I
I
 
C
V
 
I
P
 
T
N
|
N
G
 
G
M
 
P
A
 
C
W
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
R
 
K
T
 
T
M
 
F
Y
 
Y
L
 
H
S
 
T
D
 
D
S
 
T
H
 
L
P
 
E
D
 
-
V
 
-
Q
 
K
A
 
T
I
 
I
W
 
Y
A
 
A
F
 
F
D
 
D
Y
 
L
D
 
-
A
 
A
A
 
E
N
 
D
G
 
G
V
 
L
A
 
L
S
 
S
R
 
N
R
 
K
R
 
R
L
 
V
W
 
F
I
 
V
D
 
Q
M
 
F
R
 
A
Q
 
L
Y
 
G
P
 
D
G
 
D
-
 
V
R
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
S
A
 
V
V
 
V
D
 
D
V
 
S
D
 
E
G
 
G
C
 
Y
Y
 
L
W
 
W
I
 
T
C
 
A
G
 
L
N
 
W
D
 
G
A
 
G
G
 
F
V
 
G
V
 
A
H
 
V
R
 
R
F
 
F
T
 
S
P
 
P
E
 
Q
G
 
G
R
 
D
L
 
A
D
 
V
R
 
T
S
 
R
I
 
I
A
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
A
K
 
P
K
 
N
P
 
V
A
 
T
M
 
K
C
 
P
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
P
D
 
D
M
 
L
K
 
K
T
 
T
L
 
L
F
 
Y
V
 
F
T
 
T
S
 
T
I
 
A
R
 
R
P
 
K
A
 
G
-
 
L
D
 
S
A
 
D
S
 
E
V
 
T
Q
 
L
A
 
A
E
 
Q
Q
 
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
A
V
 
V
R
 
P
P
 
V
G
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
Q
A
 
P
E
 
Q
R
 
H
A
 
E
F
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
V

Q15493 Regucalcin; RC; Gluconolactonase; GNL; Senescence marker protein 30; SMP-30; EC 3.1.1.17 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
31% identity, 93% coverage: 18:296/300 of query aligns to 17:297/299 of Q15493

query
sites
Q15493
G
 
G
E
|
E
S
 
S
P
 
P
F
 
V
W
 
W
D
 
E
T
 
E
Q
 
V
T
 
S
Q
 
N
C
 
S
L
 
L
Y
 
L
W
 
F
S
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
A
R
 
K
T
 
K
L
 
V
F
 
C
E
 
R
W
 
W
R
 
D
A
 
S
A
 
F
N
 
T
A
 
K
A
 
Q
I
 
V
R
 
Q
T
 
R
W
 
V
E
 
T
L
 
M
P
 
D
E
 
A
M
 
P
A
 
V
G
 
S
C
 
S
I
 
V
A
 
A
P
 
L
A
 
R
S
 
Q
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
T
M
 
I
Q
 
G
S
 
T
G
 
K
L
 
F
F
 
C
H
 
A
L
 
L
Q
 
N
P
 
W
Q
 
K
P
 
E
D
 
Q
G
 
S
S
 
A
M
 
V
A
 
V
S
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
A
S
 
T
V
 
V
A
 
D
H
 
N
P
 
D
A
 
K
P
 
K
S
 
N
M
 
N
R
 
R
F
 
F
N
|
N
D
 
D
G
 
G
R
 
K
C
 
V
D
 
D
R
 
P
Q
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
W
 
F
A
 
A
G
 
G
T
 
T
M
 
M
H
 
A
L
 
E
D
 
E
M
 
T
H
 
A
P
 
P
A
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
E
Q
 
R
S
 
H
I
 
Q
G
 
G
S
 
A
V
 
L
Y
 
Y
R
 
S
-
 
L
F
 
F
D
 
P
A
 
D
R
 
H
G
 
H
L
 
V
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
Y
I
 
F
E
 
D
G
 
Q
L
 
V
I
 
D
V
 
I
P
 
S
N
|
N
G
 
G
M
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
S
P
 
L
D
 
D
G
 
H
R
 
K
T
 
I
M
 
F
Y
 
Y
L
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
S
H
 
L
P
 
S
D
 
-
V
 
-
Q
 
Y
A
 
S
I
 
V
W
 
D
A
 
A
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
L
A
 
Q
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
I
S
 
S
R
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
S
W
 
V
I
 
Y
D
 
K
M
 
L
R
 
E
Q
 
K
Y
 
E
P
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
M
A
 
C
V
 
I
D
 
D
V
 
A
D
 
E
G
 
G
C
 
K
Y
 
L
W
 
W
I
 
V
C
 
A
G
 
C
N
 
Y
D
 
N
A
 
G
G
 
G
V
 
R
V
 
V
H
 
I
R
 
R
F
 
L
T
 
D
P
 
P
-
 
V
E
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
R
D
 
L
R
 
Q
S
 
T
I
 
V
A
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
V
K
 
D
K
 
K
P
 
T
A
 
T
M
 
S
C
 
C
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
K
D
 
N
M
 
Y
K
 
S
T
 
E
L
 
M
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
C
I
 
A
R
 
R
P
 
D
A
 
G
-
 
M
D
 
D
A
 
P
S
 
E
V
 
G
Q
 
L
A
 
L
E
 
R
Q
 
Q
P
 
P
L
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
I
F
 
F
A
 
K
V
 
I
R
 
T
-
 
G
P
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
P
R
 
Y
A
 
S
F
 
Y

4gncA Human smp30/gnl-1,5-ag complex (see paper)
31% identity, 93% coverage: 18:296/300 of query aligns to 16:296/298 of 4gncA

query
sites
4gncA
G
 
G
E
|
E
S
 
S
P
 
P
F
 
V
W
 
W
D
 
E
T
 
E
Q
 
V
T
 
S
Q
 
N
C
 
S
L
 
L
Y
 
L
W
 
F
S
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
A
R
 
K
T
 
K
L
 
V
F
 
C
E
 
R
W
 
W
R
 
D
A
 
S
A
 
F
N
 
T
A
 
K
A
 
Q
I
 
V
R
 
Q
T
 
R
W
 
V
E
 
T
L
 
M
P
 
D
E
 
A
M
 
P
A
 
V
G
 
S
C
 
S
I
 
V
A
 
A
P
 
L
A
 
R
S
 
Q
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
T
M
 
I
Q
 
G
S
 
T
G
 
K
L
 
F
F
 
C
H
 
A
L
 
L
Q
 
N
P
 
W
Q
 
K
P
 
E
D
 
Q
G
 
S
S
 
A
M
 
V
A
 
V
S
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
A
S
 
T
V
 
V
A
 
D
H
 
N
P
 
D
A
 
K
P
 
K
S
 
N
M
 
N
R
|
R
F
 
F
N
|
N
D
|
D
G
 
G
R
 
K
C
 
V
D
 
D
R
 
P
Q
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
W
 
F
A
 
A
G
 
G
T
 
T
M
 
M
H
 
A
L
 
E
D
 
E
M
 
T
H
 
A
P
 
P
A
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
E
Q
 
R
S
 
H
I
 
Q
G
 
G
S
 
A
V
 
L
Y
 
Y
R
 
S
-
 
L
F
 
F
D
 
P
A
 
D
R
 
H
G
 
H
L
 
V
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
Y
I
 
F
E
 
D
G
 
Q
L
 
V
I
 
D
V
 
I
P
 
S
N
|
N
G
 
G
M
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
S
P
 
L
D
 
D
G
 
H
R
 
K
T
 
I
M
 
F
Y
 
Y
L
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
S
H
 
L
P
 
S
D
 
-
V
 
-
Q
 
Y
A
 
S
I
 
V
W
 
D
A
 
A
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
L
A
 
Q
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
I
S
 
S
R
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
S
W
 
V
I
 
Y
D
 
K
M
 
L
R
 
E
Q
 
K
Y
 
E
P
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
M
A
 
C
V
 
I
D
 
D
V
 
A
D
 
E
G
 
G
C
 
K
Y
 
L
W
 
W
I
 
V
C
 
A
G
 
C
N
 
Y
D
 
N
A
 
G
G
 
G
V
 
R
V
 
V
H
 
I
R
 
R
F
 
L
T
 
D
P
 
P
-
 
V
E
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
R
D
 
L
R
 
Q
S
 
T
I
 
V
A
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
V
K
 
D
K
 
K
P
 
T
A
x
T
M
 
S
C
 
C
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
K
D
x
N
M
x
Y
K
 
S
T
 
E
L
 
M
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
C
I
 
A
R
 
R
P
 
D
A
 
G
-
 
M
D
 
D
A
 
P
S
 
E
V
 
G
Q
 
L
A
 
L
E
 
R
Q
 
Q
P
 
P
L
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
I
F
 
F
A
 
K
V
 
I
R
 
T
-
 
G
P
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
K
G
|
G
I
|
I
A
 
A
E
 
P
R
 
Y
A
 
S
F
 
Y

3g4hA Crystal structure of human senescence marker protein-30 (zinc bound) (see paper)
31% identity, 93% coverage: 18:296/300 of query aligns to 15:295/297 of 3g4hA

query
sites
3g4hA
G
 
G
E
|
E
S
 
S
P
 
P
F
 
V
W
 
W
D
 
E
T
 
E
Q
 
V
T
 
S
Q
 
N
C
 
S
L
 
L
Y
 
L
W
 
F
S
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
A
R
 
K
T
 
K
L
 
V
F
 
C
E
 
R
W
 
W
R
 
D
A
 
S
A
 
F
N
 
T
A
 
K
A
 
Q
I
 
V
R
 
Q
T
 
R
W
 
V
E
 
T
L
 
M
P
 
D
E
 
A
M
 
P
A
 
V
G
 
S
C
 
S
I
 
V
A
 
A
P
 
L
A
 
R
S
 
Q
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
T
M
 
I
Q
 
G
S
 
T
G
 
K
L
 
F
F
 
C
H
 
A
L
 
L
Q
 
N
P
 
W
Q
 
K
P
 
E
D
 
Q
G
 
S
S
 
A
M
 
V
A
 
V
S
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
A
S
 
T
V
 
V
A
 
D
H
 
N
P
 
D
A
 
K
P
 
K
S
 
N
M
 
N
R
 
R
F
 
F
N
 
N
D
 
D
G
 
G
R
 
K
C
 
V
D
 
D
R
 
P
Q
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
W
 
F
A
 
A
G
 
G
T
 
T
M
 
M
H
 
A
L
 
E
D
 
E
M
 
T
H
 
A
P
 
P
A
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
E
Q
 
R
S
 
H
I
 
Q
G
 
G
S
 
A
V
 
L
Y
 
Y
R
 
S
-
 
L
F
 
F
D
 
P
A
 
D
R
 
H
G
 
H
L
 
V
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
Y
I
 
F
E
 
D
G
 
Q
L
 
V
I
 
D
V
 
I
P
 
S
N
|
N
G
 
G
M
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
S
P
 
L
D
 
D
G
 
H
R
 
K
T
 
I
M
 
F
Y
 
Y
L
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
S
H
 
L
P
 
S
D
 
-
V
 
-
Q
 
Y
A
 
S
I
 
V
W
 
D
A
 
A
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
L
A
 
Q
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
I
S
 
S
R
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
S
W
 
V
I
 
Y
D
 
K
M
 
L
R
 
E
Q
 
K
Y
 
E
P
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
M
A
 
C
V
 
I
D
 
D
V
 
A
D
 
E
G
 
G
C
 
K
Y
 
L
W
 
W
I
 
V
C
 
A
G
 
C
N
 
Y
D
 
N
A
 
G
G
 
G
V
 
R
V
 
V
H
 
I
R
 
R
F
 
L
T
 
D
P
 
P
-
 
V
E
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
R
D
 
L
R
 
Q
S
 
T
I
 
V
A
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
V
K
 
D
K
 
K
P
 
T
A
 
T
M
 
S
C
 
C
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
K
D
 
N
M
 
Y
K
 
S
T
 
E
L
 
M
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
C
I
 
A
R
 
R
P
 
D
A
 
G
-
 
M
D
 
D
A
 
P
S
 
E
V
 
G
Q
 
L
A
 
L
E
 
R
Q
 
Q
P
 
P
L
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
I
F
 
F
A
 
K
V
 
I
R
 
T
-
 
G
P
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
P
R
 
Y
A
 
S
F
 
Y

5gx1A Luciferin-regenerating enzyme collected with serial synchrotron rotational crystallography with accumulated dose of 1.1 mgy (1st measurement) (see paper)
29% identity, 86% coverage: 7:263/300 of query aligns to 4:270/307 of 5gx1A

query
sites
5gx1A
I
 
V
D
 
E
L
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
E
V
 
L
-
 
G
R
 
K
N
 
Y
A
 
T
V
 
V
G
 
G
E
|
E
S
 
G
P
 
P
F
 
H
W
 
W
D
 
D
T
 
H
Q
 
E
T
 
T
Q
 
Q
C
 
T
L
 
L
Y
 
Y
W
 
F
S
 
V
D
 
D
I
 
T
P
 
V
A
 
E
R
 
K
T
 
T
L
 
F
F
 
H
E
 
K
W
 
Y
R
 
V
A
 
P
A
 
S
N
 
Q
A
 
K
A
 
K
I
 
Y
R
 
T
T
 
F
W
x
C
E
 
K
L
 
V
P
 
D
E
 
K
M
 
L
A
 
V
G
 
S
C
 
F
I
 
I
A
 
I
P
 
P
-
 
L
-
 
A
A
 
G
S
 
S
A
 
P
G
 
G
G
 
R
F
 
F
V
 
V
A
 
V
G
 
S
M
 
L
Q
 
E
S
 
R
G
 
E
L
 
I
F
 
A
H
 
I
L
|
L
Q
 
-
P
 
-
Q
 
T
P
x
W
D
 
D
G
 
G
-
 
V
S
 
S
M
 
A
A
 
A
S
 
P
R
 
T
R
 
S
L
 
I
A
 
E
S
 
A
V
 
I
A
 
V
H
 
N
P
 
V
A
 
E
P
 
P
S
 
H
M
 
I
-
 
K
-
 
N
-
 
N
R
 
R
F
 
L
N
 
N
D
 
D
G
 
G
R
 
K
C
 
A
D
 
D
R
 
P
Q
 
L
G
 
G
R
 
N
F
 
L
W
 
W
A
 
T
G
 
G
T
 
T
M
 
M
H
 
A
L
 
I
D
 
D
-
 
A
-
 
G
M
 
L
H
 
P
P
 
I
A
 
G
Q
 
P
S
 
V
I
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
L
Y
 
Y
R
 
H
F
 
L
D
 
G
A
 
A
-
 
D
R
 
K
G
 
K
L
 
V
Q
 
K
Q
 
M
Q
 
H
I
 
E
E
 
S
G
 
N
L
 
I
I
 
A
V
 
I
P
 
A
N
|
N
G
 
G
M
 
L
A
 
A
W
 
W
S
 
S
P
 
N
D
 
D
G
 
L
R
 
K
T
 
K
M
 
M
Y
 
Y
L
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
S
H
 
G
P
 
K
D
 
-
V
 
-
Q
 
R
A
 
R
I
 
V
W
 
D
A
 
E
F
 
Y
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
S
N
 
T
-
 
L
G
 
S
V
 
I
A
 
S
S
 
N
R
 
Q
R
 
R
R
 
P
L
 
L
W
 
F
-
 
T
I
 
F
D
 
E
M
 
K
R
 
H
Q
 
E
Y
 
V
P
 
P
G
 
G
R
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
Q
A
 
T
V
 
I
D
 
D
V
 
E
D
 
E
G
 
G
C
 
N
Y
 
L
W
 
W
I
 
V
C
 
A
-
 
V
-
 
F
-
 
Q
G
 
G
N
 
Q
D
 
R
A
 
I
G
 
I
V
 
K
V
 
I
H
 
S
R
 
T
F
 
Q
T
 
Q
P
 
P
E
 
E
G
 
V
R
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
-
S
 
T
I
 
V
A
 
K
L
 
I
P
 
P
V
 
D
K
 
P
K
 
Q
P
 
V
A
 
T
M
 
S
C
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
P
D
 
N
M
 
L
K
 
D
T
 
E
L
 
L
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
S

5d9bA Luciferin-regenerating enzyme solved by siras using xfel (refined against native data) (see paper)
29% identity, 86% coverage: 7:263/300 of query aligns to 4:270/307 of 5d9bA

query
sites
5d9bA
I
 
V
D
 
E
L
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
E
V
 
L
-
 
G
R
 
K
N
 
Y
A
 
T
V
 
V
G
 
G
E
|
E
S
 
G
P
 
P
F
 
H
W
 
W
D
 
D
T
 
H
Q
 
E
T
 
T
Q
 
Q
C
 
T
L
 
L
Y
 
Y
W
 
F
S
 
V
D
 
D
I
 
T
P
 
V
A
 
E
R
 
K
T
 
T
L
 
F
F
 
H
E
 
K
W
 
Y
R
 
V
A
 
P
A
 
S
N
 
Q
A
 
K
A
 
K
I
 
Y
R
 
T
T
 
F
W
 
C
E
 
K
L
 
V
P
 
D
E
 
K
M
 
L
A
 
V
G
 
S
C
 
F
I
 
I
A
 
I
P
 
P
-
 
L
-
 
A
A
 
G
S
 
S
A
 
P
G
 
G
G
 
R
F
 
F
V
 
V
A
 
V
G
 
S
M
 
L
Q
 
E
S
 
R
G
 
E
L
 
I
F
 
A
H
 
I
L
 
L
Q
 
-
P
 
-
Q
 
T
P
 
W
D
 
D
G
 
G
-
 
V
S
 
S
M
 
A
A
 
A
S
 
P
R
 
T
R
 
S
L
 
I
A
 
E
S
 
A
V
 
I
A
 
V
H
 
N
P
 
V
A
 
E
P
 
P
S
 
H
M
 
I
-
 
K
-
 
N
-
 
N
R
 
R
F
 
L
N
 
N
D
 
D
G
 
G
R
 
K
C
 
A
D
 
D
R
 
P
Q
 
L
G
 
G
R
 
N
F
 
L
W
 
W
A
 
T
G
 
G
T
 
T
M
 
M
H
 
A
L
 
I
D
 
D
-
 
A
-
 
G
M
 
L
H
 
P
P
 
I
A
 
G
Q
 
P
S
 
V
I
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
L
Y
 
Y
R
 
H
F
 
L
D
 
G
A
 
A
-
 
D
R
 
K
G
 
K
L
 
V
Q
 
K
Q
 
M
Q
 
H
I
 
E
E
 
S
G
 
N
L
 
I
I
 
A
V
 
I
P
 
A
N
|
N
G
 
G
M
 
L
A
 
A
W
 
W
S
 
S
P
 
N
D
 
D
G
 
L
R
 
K
T
 
K
M
 
M
Y
 
Y
L
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
S
H
 
G
P
 
K
D
 
-
V
 
-
Q
 
R
A
 
R
I
 
V
W
 
D
A
 
E
F
 
Y
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
S
N
 
T
-
 
L
G
 
S
V
 
I
A
 
S
S
 
N
R
 
Q
R
 
R
R
 
P
L
 
L
W
 
F
-
 
T
I
 
F
D
 
E
M
 
K
R
 
H
Q
 
E
Y
 
V
P
 
P
G
 
G
R
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
Q
A
 
T
V
 
I
D
 
D
V
 
E
D
 
E
G
 
G
C
 
N
Y
 
L
W
 
W
I
 
V
C
 
A
-
 
V
-
 
F
-
 
Q
G
 
G
N
 
Q
D
 
R
A
 
I
G
 
I
V
 
K
V
 
I
H
 
S
R
 
T
F
 
Q
T
 
Q
P
 
P
E
 
E
G
 
V
R
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
-
S
 
T
I
 
V
A
 
K
L
 
I
P
 
P
V
 
D
K
 
P
K
 
Q
P
 
V
A
 
T
M
 
S
C
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
P
D
 
N
M
 
L
K
 
D
T
 
E
L
 
L
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
S

7rizA Crystal structure of rpa3624, a beta-propeller lactonase from rhodopseudomonas palustris, with active-site bound 2-hydroxyquinoline (see paper)
25% identity, 52% coverage: 107:262/300 of query aligns to 120:282/306 of 7rizA

query
sites
7rizA
N
|
N
D
 
D
G
 
L
R
 
V
C
 
F
D
 
D
R
 
K
Q
 
H
G
 
G
R
 
G
F
 
L
W
 
W
A
 
F
G
 
T
T
 
D
M
 
L
H
 
G
L
 
K
D
 
R
M
 
R
H
 
A
P
 
R
A
 
D
Q
 
M
S
 
D
I
 
V
G
 
G
S
 
A
V
 
A
Y
 
Y
R
 
Y
F
 
I
D
 
K
-
 
P
-
 
G
A
 
M
R
 
T
G
 
E
L
 
I
Q
 
T
Q
 
E
Q
 
Q
I
 
V
E
 
F
G
 
G
L
 
T
I
 
L
V
 
P
P
 
L
N
|
N
G
 
G
M
 
I
A
 
G
W
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
E
R
 
A
T
 
T
M
 
M
Y
 
Y
L
 
A
S
 
A
D
 
E
S
 
T
H
 
P
P
 
-
D
 
-
V
 
T
Q
 
G
A
 
R
I
 
L
W
 
W
A
 
A
F
 
F
D
 
D
Y
 
L
D
 
S
A
 
G
A
 
P
N
 
G
G
 
E
V
 
V
A
 
K
S
 
P
R
 
R
R
 
D
R
 
V
L
 
I
W
 
Y
I
 
-
D
 
-
M
 
-
R
 
R
Q
 
G
Y
 
E
P
 
K
G
 
G
R
 
K
P
 
P
-
 
I
-
 
C
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
 
Q
-
 
M
-
 
F
D
|
D
G
x
S
A
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
E
V
 
A
D
 
S
G
 
G
C
 
N
Y
 
V
W
 
C
I
 
V
C
 
A
G
 
T
N
 
L
D
 
V
A
 
S
G
 
G
V
 
C
V
 
I
H
 
S
R
 
V
F
 
I
T
 
A
P
 
P
E
 
D
G
 
G
R
 
T
L
 
L
D
 
V
R
 
E
S
 
Q
I
 
V
A
 
P
L
 
T
P
 
G
V
 
D
K
 
R
K
 
V
P
 
T
A
 
T
M
 
N
C
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
P
D
 
D
M
 
L
K
 
K
T
 
T
L
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T

Sites not aligning to the query:

8dk0A Crystal structure of rpa3624, a beta-propeller lactonase from rhodopseudomonas palustris, with active-site bound (s)gamma- valerolactone (see paper)
25% identity, 52% coverage: 107:262/300 of query aligns to 115:269/293 of 8dk0A

query
sites
8dk0A
N
|
N
D
 
D
G
 
L
R
 
V
C
 
F
D
 
D
R
 
K
Q
 
H
G
 
G
R
 
G
F
 
L
W
 
W
A
 
F
G
 
T
T
 
D
M
 
L
H
 
G
L
 
K
D
 
R
M
 
R
H
 
A
P
 
R
A
 
D
Q
 
M
S
 
D
I
 
V
G
 
G
S
 
A
V
 
A
Y
 
Y
R
 
Y
F
 
I
D
 
K
-
 
P
-
 
G
A
 
M
R
 
T
G
 
E
L
 
I
Q
 
T
Q
 
E
Q
 
Q
I
 
V
E
 
F
G
 
G
L
 
T
I
 
L
V
 
P
P
 
L
N
|
N
G
 
G
M
 
I
A
 
G
W
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
E
R
 
A
T
 
T
M
 
M
Y
 
Y
L
 
A
S
 
A
D
 
E
S
 
T
H
 
P
P
 
-
D
 
-
V
 
T
Q
 
G
A
 
R
I
 
L
W
 
W
A
 
A
F
 
F
D
 
D
Y
 
L
D
 
S
A
 
G
A
 
P
N
 
G
G
 
E
V
 
V
A
 
K
S
 
P
R
 
K
R
 
G
R
 
K
L
 
P
W
 
I
I
 
C
D
 
G
M
 
L
R
 
G
Q
 
G
Y
 
Y
P
 
Q
G
 
-
R
 
M
P
 
F
D
|
D
G
x
S
A
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
E
V
 
A
D
 
S
G
 
G
C
 
N
Y
 
V
W
 
C
I
 
V
C
 
A
G
 
T
N
 
L
D
 
V
A
 
S
G
 
G
V
 
C
V
 
I
H
 
S
R
 
V
F
 
I
T
 
A
P
 
P
E
 
D
G
 
G
R
 
T
L
 
L
D
 
V
R
 
E
S
 
Q
I
 
V
A
 
P
L
 
T
P
 
G
V
 
D
K
 
R
K
 
V
P
 
T
A
x
T
M
 
N
C
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
P
D
 
D
M
 
L
K
 
K
T
 
T
L
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T

Sites not aligning to the query:

8djzA Crystal structure of rpa3624, a beta-propeller lactonase from rhodopseudomonas palustris, with active-site bound product (see paper)
25% identity, 52% coverage: 107:262/300 of query aligns to 115:269/293 of 8djzA

query
sites
8djzA
N
|
N
D
 
D
G
 
L
R
 
V
C
 
F
D
 
D
R
 
K
Q
 
H
G
 
G
R
 
G
F
 
L
W
 
W
A
 
F
G
 
T
T
 
D
M
 
L
H
 
G
L
 
K
D
 
R
M
 
R
H
 
A
P
 
R
A
 
D
Q
 
M
S
 
D
I
 
V
G
 
G
S
 
A
V
 
A
Y
 
Y
R
 
Y
F
 
I
D
 
K
-
 
P
-
 
G
A
 
M
R
 
T
G
 
E
L
 
I
Q
 
T
Q
 
E
Q
 
Q
I
 
V
E
 
F
G
 
G
L
 
T
I
 
L
V
 
P
P
 
L
N
|
N
G
 
G
M
 
I
A
 
G
W
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
E
R
 
A
T
 
T
M
 
M
Y
 
Y
L
 
A
S
 
A
D
 
E
S
 
T
H
 
P
P
 
-
D
 
-
V
 
T
Q
 
G
A
 
R
I
 
L
W
 
W
A
 
A
F
 
F
D
 
D
Y
 
L
D
 
S
A
 
G
A
 
P
N
 
G
G
 
E
V
 
V
A
 
K
S
 
P
R
 
K
R
 
G
R
 
K
L
 
P
W
 
I
I
 
C
D
 
G
M
 
L
R
 
G
Q
 
G
Y
 
Y
P
 
Q
G
 
-
R
 
M
P
 
F
D
|
D
G
x
S
A
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
E
V
 
A
D
 
S
G
 
G
C
 
N
Y
 
V
W
 
C
I
 
V
C
 
A
G
 
T
N
 
L
D
 
V
A
 
S
G
 
G
V
 
C
V
 
I
H
 
S
R
 
V
F
 
I
T
 
A
P
 
P
E
 
D
G
 
G
R
 
T
L
 
L
D
 
V
R
 
E
S
 
Q
I
 
V
A
 
P
L
 
T
P
 
G
V
 
D
K
 
R
K
 
V
P
 
T
A
 
T
M
 
N
C
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
P
D
 
D
M
 
L
K
 
K
T
 
T
L
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T

Sites not aligning to the query:

8djfA Crystal structure of rpa3624, a beta-propeller lactonase from rhodopseudomonas palustris, with active-site bound tetrahedral intermediate (see paper)
25% identity, 52% coverage: 107:262/300 of query aligns to 115:269/293 of 8djfA

query
sites
8djfA
N
|
N
D
 
D
G
 
L
R
 
V
C
 
F
D
 
D
R
 
K
Q
 
H
G
 
G
R
 
G
F
 
L
W
 
W
A
 
F
G
 
T
T
 
D
M
 
L
H
 
G
L
 
K
D
 
R
M
 
R
H
 
A
P
 
R
A
 
D
Q
 
M
S
 
D
I
 
V
G
 
G
S
 
A
V
 
A
Y
 
Y
R
 
Y
F
 
I
D
 
K
-
 
P
-
 
G
A
 
M
R
 
T
G
 
E
L
 
I
Q
 
T
Q
 
E
Q
 
Q
I
 
V
E
 
F
G
 
G
L
 
T
I
 
L
V
 
P
P
 
L
N
|
N
G
 
G
M
 
I
A
 
G
W
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
E
R
 
A
T
 
T
M
 
M
Y
 
Y
L
 
A
S
 
A
D
 
E
S
 
T
H
 
P
P
 
-
D
 
-
V
 
T
Q
 
G
A
 
R
I
 
L
W
 
W
A
 
A
F
 
F
D
 
D
Y
 
L
D
 
S
A
 
G
A
 
P
N
 
G
G
 
E
V
 
V
A
 
K
S
 
P
R
 
K
R
 
G
R
 
K
L
 
P
W
 
I
I
 
C
D
 
G
M
 
L
R
 
G
Q
 
G
Y
 
Y
P
 
Q
G
 
-
R
 
M
P
 
F
D
|
D
G
x
S
A
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
E
V
 
A
D
 
S
G
 
G
C
 
N
Y
 
V
W
 
C
I
 
V
C
 
A
G
 
T
N
 
L
D
 
V
A
 
S
G
 
G
V
 
C
V
 
I
H
 
S
R
 
V
F
 
I
T
 
A
P
 
P
E
 
D
G
 
G
R
 
T
L
 
L
D
 
V
R
 
E
S
 
Q
I
 
V
A
 
P
L
 
T
P
 
G
V
 
D
K
 
R
K
 
V
P
 
T
A
 
T
M
 
N
C
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
P
D
 
D
M
 
L
K
 
K
T
 
T
L
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T

Sites not aligning to the query:

7risA Crystal structure of rpa3624, a beta-propeller lactonase from rhodopseudomonas palustris, with active-site bound phosphate (see paper)
25% identity, 52% coverage: 107:262/300 of query aligns to 111:269/293 of 7risA

query
sites
7risA
N
|
N
D
 
D
G
 
L
R
 
V
C
 
F
D
 
D
R
 
K
Q
 
H
G
 
G
R
 
G
F
 
L
W
 
W
A
 
F
G
 
T
T
 
D
M
 
L
H
 
G
L
 
K
D
 
R
M
 
R
H
 
A
P
 
R
A
 
D
Q
 
M
S
 
D
I
 
V
G
 
G
S
 
A
V
 
A
Y
 
Y
R
 
Y
F
 
I
D
 
K
-
 
P
-
 
G
A
 
M
R
 
T
G
 
E
L
 
I
Q
 
T
Q
 
E
Q
 
Q
I
 
V
E
 
F
G
 
G
L
 
T
I
 
L
V
 
P
P
 
L
N
|
N
G
 
G
M
 
I
A
 
G
W
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
E
R
 
A
T
 
T
M
 
M
Y
 
Y
L
 
A
S
 
A
D
 
E
S
 
T
H
 
P
P
 
-
D
 
-
V
 
T
Q
 
G
A
 
R
I
 
L
W
 
W
A
 
A
F
 
F
D
 
D
Y
 
L
D
 
S
A
 
G
A
 
P
N
 
G
G
 
E
V
 
V
A
 
K
S
 
P
R
 
R
R
 
-
R
 
-
L
 
-
W
 
-
I
 
-
D
 
D
M
 
G
R
 
E
Q
 
K
Y
 
-
P
 
-
G
 
G
R
 
K
P
 
P
-
 
I
-
 
C
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
 
Q
-
 
M
-
 
F
D
|
D
G
x
S
A
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
E
V
 
A
D
 
S
G
 
G
C
 
N
Y
 
V
W
 
C
I
 
V
C
 
A
G
 
T
N
 
L
D
 
V
A
 
S
G
 
G
V
 
C
V
 
I
H
 
S
R
 
V
F
 
I
T
 
A
P
 
P
E
 
D
G
 
G
R
 
T
L
 
L
D
 
V
R
 
E
S
 
Q
I
 
V
A
 
P
L
 
T
P
 
G
V
 
D
K
 
R
K
 
V
P
 
T
A
x
T
M
 
N
C
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
P
D
 
D
M
 
L
K
 
K
T
 
T
L
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T

Sites not aligning to the query:

3e5zA X-ray structure of the putative gluconolactonase in protein family pf08450. Northeast structural genomics consortium target drr130.
28% identity, 43% coverage: 135:262/300 of query aligns to 154:273/290 of 3e5zA

query
sites
3e5zA
V
 
V
Y
 
F
R
 
R
F
 
L
D
 
A
A
 
P
R
 
D
G
 
G
-
 
T
L
 
L
Q
 
S
Q
 
A
Q
 
P
I
 
I
E
 
R
G
 
D
L
 
R
I
 
V
V
 
K
P
 
P
N
|
N
G
 
G
M
 
L
A
 
A
W
 
F
S
 
L
P
 
P
D
 
S
G
 
G
R
 
-
T
 
N
M
 
L
Y
 
L
L
 
V
S
 
S
D
 
D
S
 
T
H
 
G
P
 
D
D
 
N
V
 
A
Q
 
T
A
 
H
I
 
R
W
 
Y
A
 
C
F
 
L
D
 
-
Y
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
N
G
 
A
V
 
R
A
 
G
S
 
E
R
 
T
R
 
E
R
 
Y
L
 
Q
W
 
G
I
 
V
D
 
H
M
 
F
R
 
T
Q
 
V
Y
 
E
P
 
P
G
 
G
R
 
K
P
 
T
D
|
D
G
 
G
A
 
L
A
 
R
V
 
V
D
 
D
V
 
A
D
 
G
G
 
G
C
 
L
Y
 
I
W
 
W
I
 
A
C
 
S
G
 
A
N
 
G
D
 
D
A
 
G
G
 
-
V
 
-
V
 
V
H
 
H
R
 
V
F
 
L
T
 
T
P
 
P
E
 
D
G
 
G
R
 
D
L
 
E
D
 
L
R
 
G
S
 
R
I
 
V
A
 
L
L
 
T
P
 
P
V
 
Q
K
 
T
K
 
T
P
 
S
A
 
N
M
 
L
C
 
C
A
 
-
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
P
D
 
E
M
 
G
K
 
R
T
 
T
L
 
L
F
 
Y
V
 
M
T
 
T

Sites not aligning to the query:

3dr2A Structural and functional analyses of xc5397 from xanthomonas campestris: a gluconolactonase important in glucose secondary metabolic pathways (see paper)
26% identity, 81% coverage: 19:262/300 of query aligns to 45:288/299 of 3dr2A

query
sites
3dr2A
E
|
E
S
 
G
P
 
P
F
 
A
W
 
W
D
 
W
T
 
E
Q
 
A
T
 
Q
Q
 
R
C
 
T
L
 
L
Y
 
V
W
 
W
S
 
S
D
 
D
I
 
L
P
 
V
A
 
G
R
 
R
T
 
R
L
 
V
F
 
L
E
 
G
W
 
W
R
 
R
A
 
E
A
 
D
N
 
G
A
 
T
A
 
V
I
 
D
R
 
V
T
 
L
W
 
L
E
 
D
L
 
-
P
 
-
E
 
-
M
 
-
A
 
-
G
 
-
C
 
-
I
 
-
A
 
A
P
 
T
A
 
A
S
 
F
A
 
T
G
 
N
G
 
G
F
 
N
V
 
A
A
 
V
G
 
D
M
 
A
Q
 
Q
S
 
Q
G
 
R
L
 
L
F
 
V
H
 
H
L
 
C
Q
 
E
-
 
H
-
 
G
-
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
I
P
 
T
Q
 
R
P
 
S
D
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
A
-
 
H
-
 
L
-
 
L
-
 
V
G
 
G
S
 
R
M
 
Y
A
 
A
S
 
G
R
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
N
S
 
S
V
 
P
A
 
-
H
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
-
S
 
-
M
 
-
R
 
-
F
 
-
N
|
N
D
 
D
G