SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS33880 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS33880 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q8VBT2 L-serine dehydratase/L-threonine deaminase; SDH; L-serine deaminase; L-threonine dehydratase; TDH; EC 4.3.1.17; EC 4.3.1.19 from Mus musculus (Mouse)
49% identity, 95% coverage: 11:309/314 of query aligns to 6:315/327 of Q8VBT2

query
sites
Q8VBT2
S
 
S
L
 
L
H
 
H
I
 
V
V
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
L
L
 
R
R
 
D
S
 
S
T
 
M
S
 
A
F
 
L
S
 
S
A
 
K
R
 
L
L
 
A
G
 
G
R
 
T
S
 
S
V
 
V
W
 
F
F
 
L
K
 
K
M
 
M
E
 
D
A
 
S
L
 
S
Q
 
Q
P
 
P
P
 
S
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
K
A
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
L
C
 
C
Q
 
K
T
 
M
Y
 
K
K
 
A
E
 
K
W
 
Q
G
 
G
A
 
C
K
 
R
R
 
H
L
 
F
V
 
V
C
 
C
S
 
S
S
 
S
G
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
M
A
 
A
V
 
T
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
 
A
R
 
R
L
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
A
T
 
T
V
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
N
T
 
T
T
 
T
S
 
P
A
 
A
A
 
L
A
 
T
R
 
I
E
 
E
R
 
R
I
 
L
A
 
K
A
 
N
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
T
L
 
V
V
 
E
V
 
V
Y
 
V
G
 
G
R
 
E
A
 
M
W
 
L
S
 
D
E
 
E
A
 
A
N
 
I
D
 
Q
-
 
V
-
 
A
H
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
E
L
 
K
M
 
N
R
 
N
P
 
P
E
 
G
Y
 
W
A
 
V
F
 
Y
I
 
I
H
 
S
P
 
P
F
 
F
D
 
D
D
 
D
P
 
P
L
 
L
L
 
I
W
 
W
E
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
T
T
 
S
M
 
L
I
 
V
D
 
K
E
 
E
V
 
L
A
 
K
A
 
E
A
 
T
-
 
L
G
 
S
V
 
A
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
S
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
C
 
C
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
E
 
R
R
 
E
N
 
V
G
 
G
W
 
W
H
 
E
D
 
D
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
M
E
 
E
T
 
T
V
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
H
S
 
S
Y
 
F
A
 
H
A
 
A
S
 
A
L
 
I
A
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
K
Q
 
L
V
 
V
E
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
K
I
 
I
T
 
T
S
 
S
I
 
V
A
 
A
T
 
K
S
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
V
R
 
N
S
 
T
P
 
V
C
 
G
A
 
A
K
 
Q
A
 
T
L
 
L
E
 
K
W
 
L
S
 
F
K
 
Y
V
 
E
H
 
H
S
 
P
I
 
I
V
 
F
S
 
S
E
 
E
V
 
V
V
 
I
T
 
S
D
 
D
K
 
Q
E
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
S
A
 
A
C
 
L
L
 
E
R
 
K
F
 
F
L
 
V
A
 
D
E
 
D
H
 
E
R
 
K
I
 
I
V
 
L
V
 
V
E
 
E
P
 
P
A
 
A
C
 
C
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
-
 
V
-
 
Y
-
 
S
-
 
R
-
 
V
-
 
V
-
 
C
-
 
R
L
 
L
E
 
Q
R
 
D
K
 
E
P
 
G
A
 
R
A
 
L
V
 
Q
T
 
T
A
 
P
A
 
L
S
 
A
D
 
S
V
 
L
L
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
V
C
 
C
G
 
G
G
 
G
A
 
S
G
 
N
A
 
I
T
 
S
A
 
L
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1pwhA Rat liver l-serine dehydratase- complex with pyridoxyl-(o-methyl- serine)-5-monophosphate (see paper)
49% identity, 95% coverage: 11:309/314 of query aligns to 6:315/327 of 1pwhA

query
sites
1pwhA
S
 
S
L
 
L
H
 
H
I
 
V
V
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
L
L
 
R
R
 
D
S
 
S
T
 
M
S
 
A
F
 
L
S
 
S
A
 
K
R
 
V
L
 
A
G
 
G
R
 
T
S
 
S
V
 
V
W
 
F
F
 
L
K
 
K
M
 
M
E
 
D
A
 
S
L
 
S
Q
 
Q
P
 
P
P
 
S
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
A
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
L
C
 
C
Q
 
K
T
 
M
Y
 
K
K
 
A
E
 
K
W
 
Q
G
 
G
A
 
C
K
 
K
R
 
H
L
 
F
V
 
V
C
 
C
S
 
S
S
|
S
G
x
A
G
 
G
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
M
A
 
A
V
 
T
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
 
A
R
 
R
L
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
L
P
 
P
V
 
A
T
 
T
V
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
S
T
 
T
T
 
T
S
 
P
A
 
A
A
 
L
A
 
T
R
 
I
E
 
E
R
 
R
I
 
L
A
 
K
A
 
N
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
T
L
 
V
V
 
E
V
 
V
Y
 
V
G
 
G
R
 
E
A
 
M
W
 
L
S
 
D
E
 
E
A
 
A
N
 
I
D
 
Q
H
 
L
A
 
A
L
 
K
S
 
A
L
 
L
M
 
E
R
 
K
-
 
N
-
 
N
P
 
P
E
 
G
Y
 
W
A
 
V
F
 
Y
I
 
I
H
 
S
P
 
P
F
|
F
D
 
D
D
 
D
P
 
P
L
 
L
L
 
I
W
 
W
E
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
T
T
 
S
M
 
L
I
 
V
D
 
K
E
 
E
V
 
L
A
 
K
A
 
E
A
 
T
-
 
L
G
 
S
V
 
A
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
S
 
S
V
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
G
|
G
L
 
L
L
 
L
C
 
C
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
E
 
R
R
 
E
N
 
V
G
 
G
W
 
W
H
 
E
D
 
D
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
M
E
|
E
T
 
T
V
 
F
G
 
G
A
|
A
D
 
H
S
|
S
Y
 
F
A
 
H
A
 
A
S
 
A
L
 
V
A
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
K
Q
 
L
V
 
V
E
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
K
I
 
I
T
 
T
S
 
S
I
 
V
A
 
A
T
 
K
S
x
A
L
 
L
G
|
G
A
 
V
R
 
N
S
 
T
P
 
V
C
 
G
A
 
A
K
 
Q
A
 
T
L
 
L
E
 
K
W
 
L
S
 
F
K
 
Y
V
 
E
H
 
H
S
 
P
I
 
I
V
 
F
S
 
S
E
 
E
V
 
V
V
 
I
T
 
S
D
 
D
K
 
Q
E
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
T
A
 
A
C
 
I
L
 
E
R
 
K
F
 
F
L
 
V
A
 
D
E
 
D
H
 
E
R
 
K
I
 
I
V
 
L
V
 
V
E
 
E
P
 
P
A
|
A
C
 
C
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
-
 
V
-
 
Y
-
 
S
-
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
C
-
 
R
L
 
L
E
 
Q
R
 
A
K
 
E
P
 
A
A
 
R
A
 
L
V
 
Q
T
 
T
A
 
P
A
 
L
S
 
A
D
 
S
V
 
L
L
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
V
C
|
C
G
|
G
G
 
G
A
 
S
G
 
N
A
 
I
T
 
S
A
 
L
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A

P09367 L-serine dehydratase/L-threonine deaminase; SDH; L-serine deaminase; L-threonine dehydratase; TDH; EC 4.3.1.17; EC 4.3.1.19 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
44% identity, 95% coverage: 11:309/314 of query aligns to 6:351/363 of P09367

query
sites
P09367
S
 
S
L
 
L
H
 
H
I
 
V
V
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
L
L
 
R
R
 
D
S
 
S
T
 
M
S
 
A
F
 
L
S
 
S
A
 
K
R
 
V
L
 
A
G
 
G
R
 
T
S
 
S
V
 
V
W
 
F
F
 
L
K
 
K
M
 
M
E
 
D
A
 
S
L
 
S
Q
 
Q
P
 
P
P
 
S
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
K
A
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
L
C
 
C
Q
 
K
T
 
M
Y
 
K
K
 
A
E
 
K
W
 
Q
G
 
G
A
 
C
K
 
K
R
 
H
L
 
F
V
 
V
C
 
C
S
 
S
S
 
S
-
 
V
-
 
V
-
 
Q
-
 
I
-
 
W
-
 
G
-
 
S
-
 
R
-
 
M
-
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
S
-
 
H
-
 
S
-
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
Q
-
 
P
-
 
H
-
 
V
-
 
R
-
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
P
-
 
D
-
 
T
-
 
P
-
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
T
G
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
M
A
 
A
V
 
T
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
 
A
R
 
R
L
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
L
P
 
P
V
 
A
T
 
T
V
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
S
T
 
T
T
 
T
S
 
P
A
 
A
A
 
L
A
 
T
R
 
I
E
 
E
R
 
R
I
 
L
A
 
K
A
 
N
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
T
L
 
V
V
 
E
V
 
V
Y
 
V
G
 
G
R
 
E
A
 
M
W
 
L
S
 
D
E
 
E
A
 
A
N
 
I
D
 
Q
H
 
L
A
 
A
L
 
K
S
 
A
L
 
L
M
 
E
R
 
K
-
 
N
-
 
N
P
 
P
E
 
G
Y
 
W
A
 
V
F
 
Y
I
 
I
H
 
S
P
 
P
F
 
F
D
 
D
D
 
D
P
 
P
L
 
L
L
 
I
W
 
W
E
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
T
T
 
S
M
 
L
I
 
V
D
 
K
E
 
E
V
 
L
A
 
K
A
 
E
A
 
T
-
 
L
G
 
S
V
 
A
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
S
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
C
 
C
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
E
 
R
R
 
E
N
 
V
G
 
G
W
 
W
H
 
E
D
 
D
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
M
E
 
E
T
 
T
V
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
H
S
 
S
Y
 
F
A
 
H
A
 
A
S
 
A
L
 
V
A
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
K
Q
 
L
V
 
V
E
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
K
I
 
I
T
 
T
S
 
S
I
 
V
A
 
A
T
 
K
S
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
V
R
 
N
S
 
T
P
 
V
C
 
G
A
 
A
K
 
Q
A
 
T
L
 
L
E
 
K
W
 
L
S
 
F
K
 
Y
V
 
E
H
 
H
S
 
P
I
 
I
V
 
F
S
 
S
E
 
E
V
 
V
V
 
I
T
 
S
D
 
D
K
 
Q
E
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
T
A
 
A
C
 
I
L
 
E
R
 
K
F
 
F
L
 
V
A
 
D
E
 
D
H
 
E
R
 
K
I
 
I
V
 
L
V
 
V
E
 
E
P
 
P
A
 
A
C
 
C
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
-
 
V
-
 
Y
-
 
S
-
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
C
-
 
R
L
 
L
E
 
Q
R
 
A
K
 
E
P
 
G
A
 
R
A
 
L
V
 
Q
T
 
T
A
 
P
A
 
L
S
 
A
D
 
S
V
 
L
L
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
V
C
 
C
G
 
G
G
 
G
A
 
S
G
 
N
A
 
I
T
 
S
A
 
L
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P20132 L-serine dehydratase/L-threonine deaminase; SDH; L-serine deaminase; L-threonine dehydratase; TDH; EC 4.3.1.17; EC 4.3.1.19 from Homo sapiens (Human) (see paper)
49% identity, 95% coverage: 12:309/314 of query aligns to 7:315/328 of P20132

query
sites
P20132
L
 
L
H
 
H
I
 
V
V
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
I
L
 
R
R
 
D
S
 
S
T
 
M
S
 
A
F
 
L
S
 
S
A
 
K
R
 
M
L
 
A
G
 
G
R
 
T
S
 
S
V
 
V
W
 
Y
F
 
L
K
 
K
M
 
M
E
 
D
A
 
S
L
 
A
Q
 
Q
P
 
P
P
 
S
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
K
A
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
F
C
 
C
Q
 
K
T
 
R
Y
 
W
K
 
A
E
 
K
W
 
Q
G
 
G
A
 
C
K
 
A
R
 
H
L
 
F
V
 
V
C
 
C
S
 
S
S
 
S
G
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
M
A
 
A
V
 
A
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
 
A
R
 
R
L
 
Q
L
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
A
T
 
T
V
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
S
T
 
T
T
 
T
S
 
P
A
 
A
A
 
L
A
 
T
R
 
I
E
 
E
R
 
R
I
 
L
A
 
K
A
 
N
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
T
L
 
V
V
 
K
V
 
V
Y
 
V
G
 
G
R
 
E
A
 
L
W
 
L
S
 
D
E
 
E
A
 
A
N
 
F
D
 
E
-
 
L
-
 
A
H
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
A
L
 
K
M
 
N
R
 
N
P
 
P
E
 
G
Y
 
W
A
 
V
F
 
Y
I
 
I
H
 
P
P
 
P
F
 
F
D
 
D
D
 
D
P
 
P
L
 
L
L
 
I
W
 
W
E
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
A
T
 
S
M
 
I
I
 
V
D
 
K
E
 
E
V
 
L
A
 
K
A
 
E
A
 
T
-
 
L
G
 
W
V
 
E
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
A
L
 
L
S
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
C
 
C
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
E
 
Q
R
 
E
N
 
V
G
 
G
W
 
W
H
 
G
D
 
D
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
M
E
 
E
T
 
T
V
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
H
S
 
S
Y
 
F
A
 
H
A
 
A
S
 
A
L
 
T
A
 
T
A
 
A
G
 
G
A
 
K
Q
 
L
V
 
V
E
 
S
L
 
L
P
 
P
A
 
K
I
 
I
T
 
T
S
 
S
I
 
V
A
 
A
T
 
K
S
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
V
R
 
K
S
 
T
P
 
V
C
 
G
A
 
A
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
K
W
 
L
S
 
F
K
 
Q
V
 
E
H
 
H
S
 
P
I
 
I
V
 
F
S
 
S
E
 
E
V
 
V
V
 
I
T
 
S
D
 
D
K
 
Q
E
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
A
A
 
A
C
 
I
L
 
E
R
 
K
F
 
F
L
 
V
A
 
D
E
 
D
H
 
E
R
 
K
I
 
I
V
 
L
V
 
V
E
 
E
P
 
P
A
 
A
C
 
C
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
-
 
V
-
 
Y
-
 
S
-
 
H
-
 
V
-
 
I
-
 
Q
-
 
K
L
 
L
E
 
Q
R
 
L
K
 
E
P
 
G
A
 
N
A
 
L
V
 
R
T
 
T
A
 
P
A
 
L
S
 
P
D
 
S
V
 
L
L
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
V
C
|
C
G
 
G
G
 
G
A
 
S
G
 
N
A
 
I
T
 
S
A
 
L
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
R
A
 
A

1p5jA Crystal structure analysis of human serine dehydratase (see paper)
49% identity, 95% coverage: 12:309/314 of query aligns to 4:312/319 of 1p5jA

query
sites
1p5jA
L
 
L
H
 
H
I
 
V
V
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
I
L
 
R
R
 
D
S
 
S
T
 
M
S
 
A
F
 
L
S
 
S
A
 
K
R
 
M
L
 
A
G
 
G
R
 
T
S
 
S
V
 
V
W
 
Y
F
 
L
K
 
K
M
 
M
E
 
D
A
 
S
L
 
A
Q
 
Q
P
 
P
P
 
S
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
A
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
F
C
 
C
Q
 
K
T
 
R
Y
 
W
K
 
A
E
 
K
W
 
Q
G
 
G
A
 
C
K
 
A
R
 
H
L
 
F
V
 
V
C
 
C
S
 
S
S
 
S
G
x
A
G
 
G
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
M
A
 
A
V
 
A
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
 
A
R
 
R
L
 
Q
L
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
A
T
 
T
V
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
G
T
 
T
T
 
T
S
 
P
A
 
A
A
 
L
A
 
T
R
 
I
E
 
E
R
 
R
I
 
L
A
 
K
A
 
N
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
T
L
 
C
V
 
K
V
 
V
Y
 
V
G
 
G
R
 
E
A
 
L
W
 
L
S
 
D
E
 
E
A
 
A
N
 
F
D
 
E
H
 
L
A
 
A
L
 
K
S
 
A
L
 
L
M
 
A
R
 
K
-
 
N
-
 
N
P
 
P
E
 
G
Y
 
W
A
 
V
F
 
Y
I
 
I
H
 
P
P
 
P
F
 
F
D
 
D
D
 
D
P
 
P
L
 
L
L
 
I
W
 
W
E
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
A
T
 
S
M
 
I
I
 
V
D
 
K
E
 
E
V
 
L
A
 
K
A
 
E
A
 
T
-
 
L
G
 
W
V
 
E
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
A
L
 
L
S
 
S
V
|
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
G
|
G
L
 
L
L
 
L
C
 
C
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
E
 
Q
R
 
E
N
 
C
G
 
G
W
 
W
H
 
G
D
 
D
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
M
E
|
E
T
 
T
V
 
F
G
 
G
A
|
A
D
 
H
S
|
S
Y
 
F
A
 
H
A
 
A
S
 
A
L
 
T
A
 
T
A
 
A
G
 
G
A
 
K
Q
 
L
V
 
V
E
 
S
L
 
L
P
 
P
A
 
K
I
 
I
T
 
T
S
 
S
I
 
V
A
 
A
T
 
K
S
x
A
L
 
L
G
 
G
A
 
V
R
 
K
S
 
T
P
 
V
C
 
G
A
 
S
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
K
W
 
L
S
 
F
K
 
Q
V
 
E
H
 
H
S
 
P
I
 
I
V
 
F
S
 
S
E
 
E
V
 
V
V
 
I
T
 
S
D
 
D
K
 
Q
E
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
A
A
 
A
C
 
I
L
 
E
R
 
K
F
 
F
L
 
V
A
 
D
E
 
D
H
 
E
R
 
K
I
 
I
V
 
L
V
 
V
E
 
E
P
 
P
A
 
A
C
 
C
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
-
 
V
-
 
Y
-
 
S
-
 
H
-
 
V
-
 
I
-
 
Q
-
 
K
L
 
L
E
 
Q
R
 
L
K
 
E
P
 
G
A
 
N
A
 
L
V
 
R
T
 
T
A
 
P
A
 
L
S
 
P
D
 
S
V
 
L
L
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
V
C
|
C
G
|
G
G
|
G
A
 
S
G
 
N
A
 
I
T
 
S
A
 
L
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
R
A
 
A

Q96GA7 Serine dehydratase-like; L-serine deaminase; L-serine dehydratase/L-threonine deaminase; L-threonine dehydratase; TDH; Serine dehydratase 2; SDH 2; EC 4.3.1.19; EC 4.3.1.17 from Homo sapiens (Human) (see paper)
49% identity, 98% coverage: 2:309/314 of query aligns to 4:321/329 of Q96GA7

query
sites
Q96GA7
P
 
P
H
 
V
A
 
A
N
 
E
N
 
H
A
 
A
L
 
K
P
 
Q
A
 
E
S
 
P
L
 
F
H
 
H
I
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
L
L
 
L
R
 
E
S
 
S
T
 
W
S
 
A
F
 
L
S
 
S
A
 
Q
R
 
V
L
 
A
G
 
G
R
 
M
S
 
P
V
 
V
W
 
F
F
 
L
K
 
K
M
 
C
E
 
E
A
 
N
L
 
V
Q
 
Q
P
 
P
P
 
S
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
K
A
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
F
C
 
C
Q
 
Q
T
 
E
Y
 
M
K
 
A
E
 
K
W
 
K
G
 
G
A
 
C
K
 
R
R
 
H
L
 
L
V
 
V
C
 
C
S
 
S
S
 
S
G
|
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
A
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
 
A
R
 
R
L
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
A
T
 
T
V
 
I
V
 
V
V
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
S
T
 
T
S
 
S
A
 
L
A
 
Q
A
 
V
R
 
V
E
 
Q
R
 
R
I
 
L
A
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
V
V
 
Q
V
 
L
Y
 
T
G
 
G
R
 
K
A
 
V
W
 
W
S
 
D
E
 
E
A
 
A
N
 
N
D
 
L
H
 
R
A
 
A
L
 
Q
S
 
E
L
 
L
-
 
A
M
 
K
R
 
R
P
 
D
E
 
G
Y
 
W
A
 
E
F
 
N
I
 
V
H
 
P
P
 
P
F
 
F
D
 
D
D
 
H
P
 
P
L
 
L
L
 
I
W
 
W
E
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
A
T
 
S
M
 
L
I
 
V
D
 
Q
E
 
E
V
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
V
-
 
L
G
 
R
V
 
T
K
 
P
P
 
P
G
 
G
A
 
A
V
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
C
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
L
R
 
E
N
 
V
G
 
G
W
 
W
H
 
Q
D
 
H
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
M
E
 
E
T
 
T
V
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
H
S
 
C
Y
 
F
A
 
N
A
 
A
S
 
A
L
 
I
A
 
T
A
 
A
G
 
G
A
 
K
Q
 
L
V
 
V
E
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
D
I
 
I
T
 
T
S
 
S
I
 
V
A
 
A
T
 
K
S
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
K
S
 
T
P
 
V
C
 
A
A
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
E
W
 
C
S
 
M
K
 
Q
V
 
V
H
 
C
S
 
K
I
 
I
V
 
H
S
 
S
E
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
E
D
 
D
K
 
T
E
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
S
A
 
A
C
 
V
L
 
Q
R
 
Q
F
 
L
L
 
L
A
 
D
E
 
D
H
 
E
R
 
R
I
 
M
V
 
L
V
 
V
E
 
E
P
 
P
A
 
A
C
 
C
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
-
 
I
-
 
Y
-
 
S
-
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
R
L
 
L
E
 
Q
R
 
A
K
 
E
P
 
G
A
 
C
A
 
L
V
 
P
T
 
P
A
 
S
A
 
L
S
 
T
D
 
S
V
 
V
L
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
V
C
|
C
G
 
G
G
 
G
A
 
N
G
 
N
A
 
I
T
 
N
A
 
S
E
 
R
Q
 
E
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A

2rkbA Serine dehydratase like-1 from human cancer cells (see paper)
50% identity, 95% coverage: 12:309/314 of query aligns to 4:311/318 of 2rkbA

query
sites
2rkbA
L
 
F
H
 
H
I
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
L
L
 
L
R
 
E
S
 
S
T
 
W
S
 
A
F
 
L
S
 
S
A
 
Q
R
 
V
L
 
A
G
 
G
R
 
M
S
 
P
V
 
V
W
 
F
F
 
L
K
 
K
M
 
C
E
 
E
A
 
N
L
 
V
Q
 
Q
P
 
P
P
 
S
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
A
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
F
C
 
C
Q
 
Q
T
 
E
Y
 
M
K
 
A
E
 
K
W
 
K
G
 
G
A
 
C
K
 
R
R
 
H
L
 
L
V
 
V
C
 
C
S
 
S
S
 
S
G
|
G
G
 
G
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
A
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
 
A
R
 
R
L
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
A
T
 
T
V
 
I
V
 
V
V
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
S
T
 
T
S
 
S
A
 
L
A
 
Q
A
 
V
R
 
V
E
 
Q
R
 
R
I
 
L
A
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
V
V
 
Q
V
 
L
Y
 
T
G
 
G
R
 
K
A
 
V
W
 
W
S
 
D
E
 
E
A
 
A
N
 
N
D
 
L
H
 
R
A
 
A
L
 
Q
S
 
E
L
 
L
-
 
A
M
 
K
R
 
R
P
 
D
E
 
G
Y
 
W
A
 
E
F
 
N
I
 
V
H
 
P
P
 
P
F
 
F
D
 
D
D
 
H
P
 
P
L
 
L
L
 
I
W
 
W
E
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
A
T
 
S
M
 
L
I
 
V
D
 
Q
E
 
E
V
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
V
-
 
L
G
 
R
V
 
T
K
 
P
P
 
P
G
 
G
A
 
A
V
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
A
V
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
G
|
G
L
 
L
L
 
L
C
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
L
R
 
E
N
 
V
G
 
G
W
 
W
H
 
Q
D
 
H
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
M
E
|
E
T
 
T
V
 
H
G
 
G
A
|
A
D
 
H
S
x
C
Y
 
F
A
 
N
A
 
A
S
 
A
L
 
I
A
 
T
A
 
A
G
 
G
A
 
K
Q
 
L
V
 
V
E
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
D
I
 
I
T
 
T
S
 
S
I
 
V
A
 
A
T
 
K
S
|
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
K
S
 
T
P
 
V
C
 
A
A
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
E
W
 
C
S
 
M
K
 
Q
V
 
V
H
 
C
S
 
K
I
 
I
V
 
H
S
 
S
E
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
E
D
 
D
K
 
T
E
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
S
A
 
A
C
 
V
L
 
Q
R
 
Q
F
 
L
L
 
L
A
 
D
E
 
D
H
 
E
R
 
R
I
 
M
V
 
L
V
 
V
E
 
E
P
 
P
A
|
A
C
 
C
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
-
 
I
-
 
Y
-
 
S
-
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
R
L
 
L
E
 
Q
R
 
A
K
 
E
P
 
G
A
 
C
A
 
L
V
 
P
T
 
P
A
 
S
A
 
L
S
 
T
D
 
S
V
 
V
L
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
V
C
|
C
G
 
G
G
 
G
A
 
N
G
 
N
A
 
I
T
 
N
A
 
S
E
 
R
Q
 
E
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A

5c3uA Crystal structure of a fungal l-serine ammonia-lyase from rhizomucor miehei (see paper)
37% identity, 96% coverage: 11:312/314 of query aligns to 2:312/315 of 5c3uA

query
sites
5c3uA
S
 
S
L
 
L
H
 
H
I
 
V
V
 
A
T
 
T
P
 
P
L
 
L
L
 
L
R
 
H
S
 
A
T
 
P
S
 
N
F
 
L
S
 
T
A
 
K
R
 
E
L
 
L
G
 
E
R
 
C
S
 
N
V
 
V
W
 
F
F
 
L
K
 
K
M
 
M
E
 
E
A
 
N
L
 
I
Q
 
Q
P
 
P
P
 
S
G
 
G
S
 
S
F
 
V
K
|
K
A
 
M
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
H
 
A
A
 
F
C
 
C
-
 
Y
Q
 
Q
T
 
A
Y
 
V
K
 
Q
E
 
T
W
 
R
G
 
G
A
 
T
K
 
N
-
 
I
R
 
Q
L
 
F
V
 
V
C
 
C
S
 
G
S
 
S
G
|
G
G
 
P
N
|
N
A
 
T
G
 
V
I
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
S
Y
 
Y
S
 
C
G
 
A
R
 
R
L
 
Q
L
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
E
V
 
A
T
 
I
V
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
K
T
 
A
T
 
T
S
 
N
A
 
E
A
 
R
A
 
I
R
 
C
E
 
Q
R
 
S
I
 
I
A
 
R
A
 
T
E
 
D
G
 
G
A
 
S
E
 
H
L
 
L
V
 
I
V
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
E
A
 
N
W
 
W
S
 
T
E
 
A
A
 
A
N
 
E
D
 
V
H
 
H
A
 
A
L
 
R
S
 
K
L
 
L
M
 
V
R
 
R
P
 
R
E
 
N
Y
 
G
A
 
I
F
 
Y
I
 
V
H
 
P
P
 
S
F
x
S
D
 
D
D
 
H
P
 
A
L
 
L
L
 
I
W
 
W
E
 
Q
G
 
G
H
 
H
A
 
S
T
 
T
M
 
I
I
 
V
D
 
Q
E
 
E
V
 
L
A
 
K
A
 
T
A
 
Q
-
 
L
-
 
N
G
 
D
V
 
N
K
 
P
P
 
P
G
 
A
A
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
C
S
x
P
V
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
G
|
G
L
 
L
L
 
L
C
 
N
G
 
G
V
 
V
L
 
I
A
 
M
G
 
G
L
 
L
E
 
Q
R
 
E
N
 
A
G
 
D
W
 
W
H
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
V
E
|
E
T
 
T
V
 
H
G
 
G
A
x
S
D
 
N
S
x
A
Y
 
F
A
 
Q
A
 
A
S
 
S
L
 
V
A
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
E
Q
 
L
V
 
V
E
 
I
L
 
M
P
 
E
A
 
K
I
 
N
T
 
N
S
 
T
I
 
I
A
 
A
T
 
T
S
|
S
L
 
L
G
 
I
A
 
S
R
 
K
S
 
A
P
 
V
C
 
S
A
 
S
K
 
K
A
 
S
L
 
L
E
 
E
W
 
L
S
 
S
K
 
L
V
 
N
H
 
H
S
 
P
I
 
V
V
 
V
S
 
P
E
 
F
V
 
A
V
 
V
T
 
S
D
 
D
K
 
A
E
 
M
A
 
A
V
 
A
G
 
D
A
 
A
C
 
V
L
 
R
R
 
L
F
 
F
L
 
A
A
 
E
E
 
D
H
 
F
R
 
K
I
 
M
V
 
L
V
 
V
E
 
E
P
 
A
A
 
S
C
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
S
-
 
L
-
 
C
-
 
Y
-
 
T
-
 
H
A
 
L
L
 
I
E
 
R
R
 
D
K
 
I
P
 
L
A
 
P
A
 
S
V
 
L
T
 
S
A
 
P
A
 
A
S
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
V
I
 
L
V
 
V
C
x
T
G
 
G
G
 
G
A
 
S
G
 
D
A
 
I
T
 
S
A
 
L
E
 
A
Q
 
H
L
 
L
Q
 
D
A
 
E
W
 
Y
D
 
R
R
 
K

Q7XSN8 Serine racemase; D-serine dehydratase; D-serine ammonia-lyase; L-serine dehydratase; L-serine ammonia-lyase; EC 5.1.1.18; EC 4.3.1.18; EC 4.3.1.17 from Oryza sativa subsp. japonica (Rice) (see paper)
30% identity, 90% coverage: 16:299/314 of query aligns to 38:325/339 of Q7XSN8

query
sites
Q7XSN8
T
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
L
R
 
S
S
 
S
T
 
T
S
 
S
F
 
I
S
 
D
A
 
A
R
 
I
L
 
V
G
 
G
R
 
K
S
 
Q
V
 
L
W
 
F
F
 
F
K
 
K
M
 
C
E
 
E
A
 
C
L
 
F
Q
 
Q
P
 
K
P
 
A
G
 
G
S
 
A
F
 
F
K
 
K
A
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
A
G
 
S
H
 
N
A
 
S
C
 
I
Q
 
F
T
 
A
Y
 
L
K
 
D
E
 
D
W
 
D
G
 
E
A
 
A
K
 
S
R
 
K
-
 
G
L
 
V
V
 
V
C
 
T
S
 
H
S
 
S
G
 
S
G
 
G
N
 
N
A
 
H
G
 
A
I
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
L
S
 
A
G
 
A
R
 
K
L
 
L
L
 
R
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
A
T
 
Y
V
 
I
V
 
V
V
 
I
P
 
P
E
 
R
T
 
N
T
 
A
S
 
P
A
 
A
A
 
C
A
 
K
R
 
V
E
 
D
R
 
N
I
 
V
A
 
K
A
 
R
E
 
Y
G
 
G
A
 
G
E
 
H
L
 
I
V
 
I
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
W
 
W
S
 
S
-
 
D
-
 
V
-
 
S
-
 
I
E
 
E
A
 
S
N
 
R
D
 
E
H
 
S
A
 
V
L
 
A
S
 
K
L
 
R
M
 
V
R
 
Q
P
 
E
E
 
E
Y
 
T
A
 
G
-
 
A
-
 
I
F
 
L
I
 
V
H
 
H
P
 
P
F
 
F
D
 
N
D
 
N
P
 
K
L
 
N
L
 
T
W
 
I
E
 
S
G
 
G
H
 
Q
A
 
G
T
 
T
M
 
V
I
 
S
D
 
L
E
 
E
V
 
L
A
 
L
A
 
E
A
 
E
G
 
V
V
 
P
K
 
E
P
 
I
G
 
D
A
 
T
V
 
I
V
 
I
L
 
V
S
 
P
V
 
I
G
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
I
C
 
S
G
 
G
V
 
V
-
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
A
L
 
K
E
 
A
R
 
I
N
 
N
G
 
P
W
 
-
H
 
-
D
 
S
V
 
I
P
 
R
V
 
I
I
 
L
A
 
A
A
 
A
E
|
E
T
 
P
V
 
K
G
 
G
A
 
A
D
 
D
S
x
D
Y
 
S
A
 
A
A
 
Q
S
 
S
L
 
K
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
K
Q
 
I
V
 
I
E
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
S
I
 
T
T
 
N
S
 
T
I
 
I
A
 
A
T
 
D
S
 
G
L
 
L
G
 
R
A
 
A
R
 
-
S
 
-
P
 
-
C
 
F
A
 
L
K
 
G
A
 
D
L
 
L
E
 
T
W
 
W
S
 
P
K
 
V
V
 
V
H
 
R
S
 
D
I
 
L
V
 
V
S
 
D
E
 
D
-
 
I
V
 
I
V
 
V
T
 
V
D
 
D
K
 
D
E
 
N
A
 
A
V
 
I
G
 
V
A
 
D
C
 
A
L
 
M
R
 
K
F
 
M
L
 
C
A
 
Y
E
 
E
H
 
M
-
 
L
R
 
K
I
 
V
V
 
A
V
 
V
E
 
E
P
 
P
A
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
G
C
 
L
G
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
D
L
 
E
E
 
F
R
 
K
K
 
Q
P
 
S
A
 
S
A
 
A
V
 
W
T
 
H
A
 
E
A
 
S
S
 
S
D
 
K
V
 
I
L
 
G
V
 
I
I
 
I
V
 
V
C
 
S
G
 
G
G
 
G

6zspAAA serine racemase bound to atp and malonate. (see paper)
29% identity, 97% coverage: 11:314/314 of query aligns to 19:319/320 of 6zspAAA

query
sites
6zspAAA
S
 
S
L
 
I
H
 
H
I
 
L
V
 
-
T
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
L
R
 
T
S
|
S
T
x
S
S
x
I
F
 
L
S
 
N
A
 
Q
R
 
L
L
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
N
V
 
L
W
 
F
F
 
F
K
 
K
M
 
C
E
 
E
A
 
L
L
 
F
Q
 
Q
P
x
K
P
x
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
A
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
A
G
 
L
H
 
N
A
 
A
C
 
V
Q
 
R
T
 
S
Y
 
L
K
 
K
E
 
-
W
 
-
G
 
-
A
 
P
K
 
K
R
 
A
L
 
V
V
 
V
C
 
T
S
 
H
S
|
S
G
x
S
G
 
G
N
|
N
A
x
H
G
 
G
I
x
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
T
Y
 
Y
S
 
A
G
 
A
R
 
K
L
 
L
L
 
E
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
A
T
 
Y
V
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
T
 
T
T
 
A
S
 
P
A
 
D
A
 
C
A
 
K
R
 
K
E
 
L
R
 
A
I
 
I
A
 
Q
A
 
A
E
x
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
S
L
 
-
V
 
I
V
 
V
Y
 
Y
G
 
C
R
 
E
A
 
P
W
 
S
S
 
D
E
 
E
A
 
S
N
x
R
D
 
E
H
 
N
A
 
V
L
 
A
S
 
K
L
 
R
M
 
V
R
 
T
P
 
E
E
 
E
Y
 
T
A
 
E
-
 
G
-
 
I
F
 
M
I
 
V
H
 
H
P
 
P
F
 
N
D
 
Q
D
 
E
P
 
P
L
 
A
L
 
V
W
 
I
E
 
A
G
 
G
H
 
Q
A
 
G
T
 
T
M
 
I
I
 
A
D
 
L
E
 
E
V
 
V
A
 
L
A
 
N
A
 
Q
G
 
V
V
 
P
K
 
L
P
 
V
G
 
D
A
 
A
V
 
L
V
 
V
L
 
V
S
 
P
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
M
L
 
L
C
 
A
G
 
G
V
 
I
L
 
A
A
 
I
G
 
T
L
 
V
E
 
-
R
 
K
N
 
A
G
 
L
W
 
K
H
 
P
D
 
S
V
 
V
P
 
K
V
 
V
I
 
Y
A
 
A
A
 
A
E
|
E
T
 
P
V
 
S
G
 
N
A
|
A
D
 
D
S
x
D
-
 
C
Y
 
Y
A
 
Q
A
 
S
S
 
K
L
 
L
A
 
K
A
 
G
G
 
K
A
 
L
Q
 
M
V
 
P
E
 
N
L
 
L
P
 
Y
A
 
P
I
 
P
T
 
E
S
 
T
I
 
I
A
 
A
-
 
D
-
x
G
-
 
V
-
 
K
T
x
S
S
 
S
L
 
I
G
 
G
A
 
L
R
 
N
S
 
T
P
 
-
C
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
W
 
W
S
 
P
K
 
I
V
 
I
H
 
R
S
 
D
I
 
L
V
 
V
S
 
D
E
 
D
V
 
I
V
 
F
T
 
T
D
 
V
K
 
T
E
 
E
A
 
D
V
 
E
G
 
I
A
 
K
C
 
C
L
 
A
R
 
T
F
 
Q
L
 
L
A
 
V
E
 
W
H
x
E
R
|
R
-
 
M
-
x
K
I
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
E
P
 
P
A
 
T
C
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
-
 
V
L
 
L
E
 
S
R
 
Q
K
 
H
P
 
F
A
 
Q
A
 
T
V
 
V
T
 
S
A
 
P
A
 
E
S
 
V
D
 
K
V
 
N
L
 
I
V
 
C
I
 
I
V
 
V
C
x
L
G
x
S
G
 
G
A
 
G
G
x
N
A
 
V
T
 
D
A
 
L
E
 
T
Q
 
S
L
 
S
Q
 
I
A
 
T
W
 
W
D
 
V
R
 
K
G
 
Q
A
 
A

7nbgAAA structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z52314092, XChem fragment screen (see paper)
30% identity, 86% coverage: 11:279/314 of query aligns to 19:290/322 of 7nbgAAA

query
sites
7nbgAAA
S
 
S
L
 
I
H
 
H
I
 
L
V
 
-
T
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
L
R
 
T
S
 
S
T
 
S
S
 
I
F
 
L
S
 
N
A
 
Q
R
 
L
L
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
N
V
 
L
W
 
F
F
 
F
K
 
K
M
 
C
E
 
E
A
 
L
L
 
F
Q
 
Q
P
 
K
P
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
A
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
A
G
 
L
H
 
N
A
 
A
C
 
V
Q
 
R
T
 
S
Y
 
L
-
 
V
-
 
P
-
 
D
-
 
A
K
 
L
E
 
E
W
 
R
G
 
K
A
 
P
K
 
K
R
 
A
L
 
V
V
 
V
C
 
T
S
 
H
S
 
S
G
x
S
G
 
G
N
|
N
A
 
H
G
|
G
I
x
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
T
Y
 
Y
S
 
A
G
 
A
R
 
K
L
 
L
L
 
E
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
A
T
 
Y
V
x
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
T
 
T
T
 
A
S
 
P
A
 
D
A
 
C
A
x
K
R
 
K
E
 
L
R
 
A
I
|
I
A
 
Q
A
 
A
E
x
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
S
L
 
-
V
 
I
V
 
V
Y
 
Y
G
 
C
R
 
E
A
 
P
W
 
S
S
 
D
E
 
E
A
 
S
N
 
R
D
 
E
H
 
N
A
 
V
L
 
A
S
 
K
L
 
R
M
 
V
R
 
T
P
 
E
E
 
E
Y
 
T
A
 
E
-
 
G
-
 
I
F
 
M
I
 
V
H
 
H
P
 
P
F
 
N
D
 
Q
D
 
E
P
 
P
L
 
A
L
 
V
W
 
I
E
 
A
G
 
G
H
 
Q
A
 
G
T
 
T
M
 
I
I
 
A
D
 
L
E
 
E
V
 
V
A
 
L
A
 
N
A
 
Q
G
 
V
V
 
P
K
 
L
P
 
V
G
 
D
A
 
A
V
 
L
V
 
V
L
 
V
S
 
P
V
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
G
|
G
L
x
M
L
 
L
C
 
A
G
 
G
V
 
I
L
 
-
A
 
A
G
 
I
L
 
T
E
 
V
R
 
K
N
 
A
G
 
L
W
 
K
H
 
P
D
 
S
V
 
V
P
 
K
V
 
V
I
 
Y
A
 
A
A
 
A
E
|
E
T
 
P
V
 
S
G
 
N
A
|
A
D
 
D
S
x
D
-
 
C
Y
 
Y
A
 
Q
A
 
S
S
 
K
L
 
L
A
 
K
A
 
G
G
 
K
A
 
L
Q
 
M
V
 
P
E
 
N
L
 
L
P
 
Y
A
 
P
I
 
P
T
 
E
S
 
T
I
 
I
A
 
A
-
 
D
-
x
G
-
x
V
-
 
K
T
 
S
S
 
S
L
 
I
G
 
G
A
 
L
R
 
N
S
 
T
P
 
-
C
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
W
 
W
S
 
P
K
 
I
V
 
I
H
 
R
S
 
D
I
 
L
V
 
V
S
 
D
E
 
D
V
 
I
V
 
F
T
 
T
D
 
V
K
 
T
E
 
E
A
 
D
V
 
E
G
 
I
A
 
K
C
 
C
L
 
A
R
 
T
F
 
Q
L
 
L
A
 
V
E
 
W
H
 
E
R
 
R
-
 
M
-
 
K
I
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
E
P
 
P
A
x
T
C
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

7nbhAAA structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z26781964, XChem fragment screen (see paper)
30% identity, 86% coverage: 11:279/314 of query aligns to 19:290/320 of 7nbhAAA

query
sites
7nbhAAA
S
 
S
L
 
I
H
 
H
I
 
L
V
 
-
T
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
L
R
 
T
S
 
S
T
 
S
S
 
I
F
 
L
S
 
N
A
 
Q
R
 
L
L
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
N
V
 
L
W
 
F
F
 
F
K
 
K
M
 
C
E
 
E
A
 
L
L
 
F
Q
 
Q
P
 
K
P
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
A
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
A
G
 
L
H
 
N
A
 
A
C
 
V
Q
 
R
T
 
S
Y
 
L
-
 
V
-
 
P
-
 
D
-
 
A
K
 
L
E
 
E
W
 
R
G
 
K
A
 
P
K
 
K
R
 
A
L
 
V
V
 
V
C
 
T
S
 
H
S
 
S
G
x
S
G
 
G
N
 
N
A
 
H
G
|
G
I
x
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
T
Y
 
Y
S
 
A
G
 
A
R
 
K
L
 
L
L
 
E
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
A
T
 
Y
V
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
T
 
T
T
 
A
S
 
P
A
 
D
A
 
C
A
x
K
R
 
K
E
 
L
R
 
A
I
|
I
A
 
Q
A
 
A
E
x
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
S
L
 
-
V
 
I
V
 
V
Y
 
Y
G
 
C
R
 
E
A
 
P
W
 
S
S
 
D
E
 
E
A
 
S
N
 
R
D
 
E
H
 
N
A
 
V
L
 
A
S
 
K
L
 
R
M
 
V
R
 
T
P
 
E
E
 
E
Y
 
T
A
 
E
-
 
G
-
 
I
F
 
M
I
 
V
H
 
H
P
 
P
F
 
N
D
 
Q
D
 
E
P
 
P
L
 
A
L
 
V
W
 
I
E
 
A
G
 
G
H
 
Q
A
 
G
T
 
T
M
 
I
I
 
A
D
 
L
E
 
E
V
 
V
A
 
L
A
 
N
A
 
Q
G
 
V
V
 
P
K
 
L
P
 
V
G
 
D
A
 
A
V
 
L
V
 
V
L
 
V
S
 
P
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
M
L
 
L
C
 
A
G
 
G
V
 
I
L
 
-
A
 
A
G
 
I
L
 
T
E
 
V
R
 
K
N
 
A
G
 
L
W
 
K
H
 
P
D
 
S
V
 
V
P
 
K
V
 
V
I
 
Y
A
 
A
A
 
A
E
|
E
T
 
P
V
 
S
G
 
N
A
|
A
D
 
D
S
x
D
-
 
C
Y
 
Y
A
 
Q
A
 
S
S
 
K
L
 
L
A
 
K
A
 
G
G
 
K
A
 
L
Q
 
M
V
 
P
E
 
N
L
 
L
P
 
Y
A
 
P
I
 
P
T
 
E
S
 
T
I
 
I
A
 
A
-
x
D
-
x
G
-
 
V
-
 
K
T
 
S
S
 
S
L
 
I
G
 
G
A
 
L
R
 
N
S
 
T
P
 
-
C
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
W
 
W
S
 
P
K
 
I
V
 
I
H
 
R
S
 
D
I
 
L
V
 
V
S
 
D
E
 
D
V
 
I
V
 
F
T
 
T
D
 
V
K
 
T
E
 
E
A
 
D
V
 
E
G
 
I
A
 
K
C
 
C
L
 
A
R
 
T
F
 
Q
L
 
L
A
 
V
E
 
W
H
 
E
R
 
R
-
 
M
-
 
K
I
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
E
P
|
P
A
 
T
C
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

3l6bA X-ray crystal structure of human serine racemase in complex with malonate a potent inhibitor (see paper)
29% identity, 97% coverage: 11:314/314 of query aligns to 20:322/322 of 3l6bA

query
sites
3l6bA
S
 
S
L
 
I
H
 
H
I
 
L
V
 
-
T
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
L
R
 
T
S
 
S
T
 
S
S
 
I
F
 
L
S
 
N
A
 
Q
R
 
L
L
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
N
V
 
L
W
 
F
F
 
F
K
 
K
M
 
C
E
 
E
A
 
L
L
 
F
Q
 
Q
P
 
K
P
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
A
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
A
G
 
L
H
 
N
A
 
A
C
 
V
Q
 
R
T
 
S
Y
 
L
K
 
V
E
 
R
W
 
-
G
 
K
A
 
P
K
 
K
R
 
A
L
 
V
V
 
V
C
 
T
S
 
H
S
|
S
G
x
S
G
 
G
N
|
N
A
x
H
G
 
G
I
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
T
Y
 
Y
S
 
A
G
 
A
R
 
K
L
 
L
L
 
E
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
A
T
 
Y
V
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
T
 
T
T
 
A
S
 
P
A
 
D
A
 
C
A
 
K
R
 
K
E
 
L
R
 
A
I
 
I
A
 
Q
A
 
A
E
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
S
L
 
-
V
 
I
V
 
V
Y
 
Y
G
 
C
R
 
E
A
 
P
W
 
S
S
 
D
E
 
E
A
 
S
N
x
R
D
 
E
H
 
N
A
 
V
L
 
A
S
 
K
L
 
R
M
 
V
R
 
T
P
 
E
E
 
E
Y
 
T
A
 
E
-
 
G
-
 
I
F
 
M
I
 
V
H
 
H
P
 
P
F
 
N
D
 
Q
D
 
E
P
 
P
L
 
A
L
 
V
W
 
I
E
 
A
G
 
G
H
 
Q
A
 
G
T
 
T
M
 
I
I
 
A
D
 
L
E
 
E
V
 
V
A
 
L
A
 
N
A
 
Q
G
 
V
V
 
P
K
 
L
P
 
V
G
 
D
A
 
A
V
 
L
V
 
V
L
 
V
S
 
P
V
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
G
|
G
L
x
M
L
 
L
C
 
A
G
 
G
V
 
I
L
 
-
A
 
A
G
 
I
L
 
T
E
 
V
R
 
K
N
 
A
G
 
L
W
 
K
H
 
P
D
 
S
V
 
V
P
 
K
V
 
V
I
 
Y
A
 
A
A
 
A
E
|
E
T
 
P
V
 
S
G
 
N
A
|
A
D
 
D
S
x
D
-
 
C
Y
 
Y
A
 
Q
A
 
S
S
 
K
L
 
L
A
 
K
A
 
G
G
 
K
A
 
L
Q
 
M
V
 
P
E
 
N
L
 
L
P
 
Y
A
 
P
I
 
P
T
 
E
S
 
T
I
 
I
A
 
A
-
 
D
-
x
G
-
x
V
-
 
K
T
 
S
S
 
S
L
 
I
G
 
G
A
 
L
R
 
N
S
 
T
P
 
-
C
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
W
 
W
S
 
P
K
 
I
V
 
I
H
 
R
S
 
D
I
 
L
V
 
V
S
 
D
E
 
D
V
 
I
V
 
F
T
 
T
D
 
V
K
 
T
E
 
E
A
 
D
V
 
E
G
 
I
A
 
K
C
 
C
L
 
A
R
 
T
F
 
Q
L
 
L
A
 
V
E
 
W
H
 
E
R
 
R
-
 
M
-
 
K
I
 
L
V
 
L
V
 
I
E
|
E
P
 
P
A
x
T
C
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
-
 
V
L
 
L
E
 
S
R
 
Q
K
 
H
P
 
F
A
 
Q
A
 
T
V
 
V
T
 
S
A
 
P
A
 
E
S
 
V
D
 
K
V
 
N
L
 
I
V
 
C
I
 
I
V
 
V
C
x
L
G
x
S
G
|
G
A
 
G
G
 
N
A
 
V
T
 
D
A
 
L
E
 
T
Q
 
S
L
 
S
Q
 
I
A
 
T
W
 
W
D
 
V
R
 
K
G
 
Q
A
 
A

7nbfAAA structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z126932614, XChem fragment screen (see paper)
30% identity, 86% coverage: 11:279/314 of query aligns to 19:290/323 of 7nbfAAA

query
sites
7nbfAAA
S
 
S
L
 
I
H
|
H
I
x
L
V
 
-
T
|
T
P
|
P
L
 
V
L
|
L
R
x
T
S
 
S
T
 
S
S
 
I
F
 
L
S
 
N
A
 
Q
R
 
L
L
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
N
V
 
L
W
 
F
F
 
F
K
 
K
M
 
C
E
 
E
A
 
L
L
x
F
Q
 
Q
P
 
K
P
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
A
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
A
G
 
L
H
 
N
A
 
A
C
 
V
Q
 
R
T
 
S
Y
 
L
-
 
V
-
 
P
-
 
D
-
 
A
K
 
L
E
 
E
W
 
R
G
 
K
A
 
P
K
 
K
R
 
A
L
 
V
V
 
V
C
 
T
S
 
H
S
 
S
G
x
S
G
 
G
N
|
N
A
 
H
G
 
G
I
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
T
Y
 
Y
S
 
A
G
 
A
R
 
K
L
 
L
L
 
E
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
A
T
 
Y
V
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
T
 
T
T
 
A
S
 
P
A
 
D
A
 
C
A
 
K
R
 
K
E
 
L
R
 
A
I
 
I
A
 
Q
A
 
A
E
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
S
L
 
-
V
 
I
V
 
V
Y
 
Y
G
 
C
R
 
E
A
 
P
W
 
S
S
 
D
E
 
E
A
 
S
N
 
R
D
 
E
H
 
N
A
 
V
L
 
A
S
 
K
L
 
R
M
 
V
R
 
T
P
 
E
E
 
E
Y
 
T
A
 
E
-
 
G
-
 
I
F
 
M
I
 
V
H
 
H
P
 
P
F
 
N
D
 
Q
D
 
E
P
 
P
L
 
A
L
 
V
W
 
I
E
 
A
G
 
G
H
 
Q
A
 
G
T
 
T
M
 
I
I
 
A
D
 
L
E
 
E
V
 
V
A
 
L
A
 
N
A
 
Q
G
 
V
V
 
P
K
 
L
P
 
V
G
 
D
A
 
A
V
 
L
V
 
V
L
 
V
S
 
P
V
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
G
|
G
L
x
M
L
 
L
C
 
A
G
 
G
V
 
I
L
 
-
A
 
A
G
 
I
L
 
T
E
 
V
R
 
K
N
 
A
G
 
L
W
 
K
H
 
P
D
 
S
V
 
V
P
 
K
V
 
V
I
 
Y
A
 
A
A
 
A
E
|
E
T
 
P
V
 
S
G
 
N
A
|
A
D
 
D
S
x
D
-
 
C
Y
 
Y
A
 
Q
A
 
S
S
 
K
L
 
L
A
 
K
A
 
G
G
 
K
A
 
L
Q
 
M
V
 
P
E
 
N
L
 
L
P
 
Y
A
 
P
I
 
P
T
 
E
S
 
T
I
 
I
A
 
A
-
 
D
-
x
G
-
x
V
-
 
K
T
 
S
S
 
S
L
 
I
G
 
G
A
 
L
R
x
N
S
 
T
P
 
-
C
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
W
 
W
S
 
P
K
 
I
V
 
I
H
 
R
S
 
D
I
 
L
V
 
V
S
 
D
E
 
D
V
 
I
V
 
F
T
 
T
D
 
V
K
 
T
E
 
E
A
 
D
V
 
E
G
 
I
A
 
K
C
 
C
L
 
A
R
 
T
F
 
Q
L
 
L
A
 
V
E
 
W
H
 
E
R
 
R
-
 
M
-
 
K
I
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
E
P
 
P
A
x
T
C
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

7nbdAAA structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z235449082, XChem fragment screen (see paper)
30% identity, 86% coverage: 11:279/314 of query aligns to 19:290/323 of 7nbdAAA

query
sites
7nbdAAA
S
 
S
L
 
I
H
 
H
I
 
L
V
 
-
T
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
L
R
 
T
S
 
S
T
 
S
S
 
I
F
 
L
S
 
N
A
 
Q
R
 
L
L
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
N
V
 
L
W
 
F
F
 
F
K
 
K
M
 
C
E
 
E
A
 
L
L
 
F
Q
 
Q
P
 
K
P
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
A
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
A
G
 
L
H
 
N
A
 
A
C
 
V
Q
 
R
T
 
S
Y
 
L