SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS34610 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS34610 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
41% identity, 93% coverage: 4:312/331 of query aligns to 2:304/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
T
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
A
A
 
A
P
 
P
R
 
-
L
 
L
A
 
H
P
 
E
A
 
K
G
 
A
V
 
I
R
 
Q
L
 
V
L
 
L
E
 
K
A
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
L
R
 
E
I
 
V
L
 
I
Y
 
Y
L
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
N
 
E
G
 
E
A
 
Y
N
 
P
D
 
D
A
 
E
G
 
D
E
 
R
V
 
L
A
 
V
R
 
E
I
 
L
L
 
V
A
 
-
A
 
-
E
 
K
P
 
D
V
 
V
D
 
E
A
 
A
V
 
I
I
 
I
S
 
V
R
 
R
T
 
S
V
 
K
-
 
P
A
 
K
L
 
V
S
 
T
G
 
R
A
 
R
A
 
V
I
 
I
A
 
E
A
 
S
C
 
A
P
 
P
T
 
K
L
 
L
K
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
A
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
V
 
L
S
 
D
N
 
N
I
 
I
D
 
D
V
 
V
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
K
A
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
E
V
 
V
Y
 
V
V
 
N
T
 
A
P
 
P
G
 
A
A
 
A
N
x
S
A
 
S
R
 
R
S
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
A
L
 
V
A
 
G
L
 
L
M
 
M
F
 
F
A
 
S
A
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
K
V
 
I
A
 
A
W
 
F
M
 
A
D
 
D
R
 
R
E
 
K
L
 
M
H
 
R
A
 
E
G
 
G
R
 
V
W
 
W
S
 
A
R
 
K
A
 
K
Q
 
E
D
 
A
-
 
M
G
 
G
I
 
I
E
 
E
L
 
L
H
 
E
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
L
 
I
V
 
I
G
|
G
F
|
F
G
|
G
Q
x
R
V
x
I
A
 
G
R
 
Y
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
T
 
K
V
 
I
C
 
A
L
 
N
A
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
M
P
 
N
V
 
I
V
 
L
A
 
L
F
x
Y
D
|
D
P
|
P
A
 
Y
-
 
P
L
 
N
A
 
E
G
 
E
R
 
R
A
 
A
S
 
K
P
 
E
V
 
V
A
 
N
G
 
G
V
 
K
A
 
F
L
 
V
A
 
-
D
 
-
S
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
K
A
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
V
S
 
T
L
 
I
H
 
H
V
|
V
P
|
P
L
 
L
N
 
V
Q
 
E
H
 
S
T
|
T
R
 
Y
N
 
H
M
 
L
L
 
I
A
 
N
A
 
E
P
 
E
Q
 
R
F
 
L
A
 
K
R
 
L
M
 
M
R
 
K
R
 
K
G
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
|
T
A
x
S
R
|
R
G
 
G
E
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
N
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
G
 
E
G
 
G
Q
 
W
L
 
I
Y
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
T
 
V
M
 
F
A
 
E
V
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
A
 
K
H
 
D
S
 
H
P
 
P
L
 
L
S
 
T
A
 
K
L
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
P
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
Q
A
 
E
A
 
R
M
 
A
A
 
G
S
 
V
D
 
E
A
 
V
A
 
A
R
 
E
N
 
K
V
 
V
L
 
V
G
 
K
F
 
I
L
 
L
Q
 
K
G
 
G

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
36% identity, 85% coverage: 51:330/331 of query aligns to 46:332/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
L
I
 
V
S
 
T
R
x
M
-
x
L
T
 
S
V
 
E
A
 
R
L
 
I
S
 
D
G
 
Q
A
 
E
A
 
V
I
 
F
A
 
E
A
 
N
C
 
A
P
 
P
T
 
R
L
 
L
K
 
R
V
 
I
I
 
V
S
 
A
K
 
N
H
x
Y
G
x
A
V
|
V
G
|
G
V
 
Y
S
 
D
N
 
N
I
 
I
D
 
D
V
 
V
Q
 
E
A
 
E
A
 
A
T
 
T
A
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
P
 
Y
V
 
V
Y
 
T
V
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
A
 
V
N
x
L
A
 
T
R
 
N
S
 
A
V
x
T
A
 
A
E
 
D
L
 
H
T
 
A
L
 
F
A
 
A
L
 
L
M
 
L
F
 
L
A
 
A
A
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
H
V
 
V
A
 
V
W
 
K
M
 
G
D
 
D
R
 
K
E
 
F
L
 
V
H
 
R
A
 
S
G
 
G
R
 
E
W
 
W
S
 
K
R
 
R
A
 
K
Q
 
G
D
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
-
 
W
-
 
F
-
 
L
G
 
G
I
 
Y
E
 
E
L
 
L
H
 
Y
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
L
 
I
V
 
V
G
 
G
F
|
F
G
|
G
Q
x
R
V
x
I
A
 
G
R
 
Q
R
 
A
V
 
I
A
 
A
T
 
R
V
 
R
C
 
A
L
 
K
A
 
G
L
 
F
G
 
N
M
 
M
P
 
R
V
 
I
V
 
L
A
 
Y
F
 
Y
D
x
S
P
x
R
A
 
T
L
 
R
A
 
K
G
 
S
R
 
Q
A
 
A
S
 
E
P
 
K
V
 
E
A
 
L
G
 
G
V
 
-
A
 
A
L
 
E
A
 
Y
D
 
R
S
 
P
L
 
L
D
 
E
A
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
K
A
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
S
 
I
L
 
L
H
x
A
V
|
V
P
|
P
L
 
L
N
 
T
Q
 
K
H
 
E
T
|
T
R
 
M
N
 
Y
M
 
M
L
 
I
A
 
N
A
 
E
P
 
E
Q
 
R
F
 
L
A
 
K
R
 
L
M
 
M
R
 
K
R
 
P
G
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
T
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
E
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
G
 
E
G
 
G
Q
 
W
L
 
I
Y
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
T
 
V
M
 
F
A
 
E
V
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
Y
P
 
-
A
 
Y
H
 
N
S
 
E
P
 
E
L
 
L
S
 
F
A
 
S
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
G
 
S
S
 
A
T
 
T
P
 
F
A
 
E
A
 
A
L
 
R
A
 
E
A
 
A
M
 
M
A
 
A
S
 
E
D
 
L
A
 
V
A
 
A
R
 
R
N
 
N
V
 
L
L
 
I
G
 
A
F
 
F
L
 
K
Q
 
R
G
 
G
K
 
E
P
 
I
P
 
P
A
 
P
A
 
-
T
 
-
A
 
T
C
 
L
V
 
V
N
 
N
P
 
K
Q
 
E
V
 
V
L
 
I
A
 
K
-
 
I
-
 
R
A
 
K
P
 
P
G
 
G

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
32% identity, 96% coverage: 12:328/331 of query aligns to 15:323/533 of O43175

query
sites
O43175
L
 
L
A
 
D
P
 
P
A
 
C
G
 
C
V
 
R
R
 
K
L
 
I
L
 
L
E
 
Q
A
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
L
R
 
Q
I
 
V
L
 
V
Y
 
E
L
 
K
A
 
Q
D
 
N
A
 
L
N
 
S
G
 
K
A
 
E
N
 
E
D
 
L
A
 
I
G
 
A
E
 
E
V
 
L
A
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
Q
P
 
D
V
 
C
D
 
E
A
 
G
V
 
L
I
 
I
S
 
V
R
 
R
T
 
S
-
 
A
V
 
T
A
 
K
L
 
V
S
 
T
G
 
A
A
 
D
A
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
x
T
G
 
G
V
 
V
S
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
L
V
 
V
Y
 
M
V
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
A
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
V
 
I
A
 
P
W
 
Q
M
 
A
D
 
T
R
 
A
E
 
S
L
 
M
H
 
K
A
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
S
 
E
R
|
R
A
 
K
Q
 
K
D
 
F
-
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
L
H
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
Q
x
R
V
x
I
A
 
G
R
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
T
 
T
V
 
R
C
 
M
L
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
F
 
Y
D
|
D
P
 
P
A
 
I
L
 
I
A
 
S
G
 
P
R
 
E
A
 
V
S
 
S
P
 
A
V
 
S
A
 
F
G
 
G
V
 
V
A
 
Q
L
 
Q
A
 
L
D
 
-
S
 
P
L
 
L
D
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
A
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
V
x
T
P
 
P
L
 
L
N
 
L
Q
 
P
H
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
M
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
D
P
 
N
Q
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
R
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
E
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
G
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
C
Y
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
|
D
T
x
V
M
 
F
A
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
A
 
R
H
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
S
 
V
A
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
x
L
G
|
G
G
x
A
S
 
S
T
 
T
P
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
Q
A
 
S
A
 
R
M
 
C
A
 
G
S
 
E
D
 
E
A
 
I
A
 
A
R
 
V
N
 
Q
V
 
F
L
 
V
G
 
D
F
 
M
L
 
V
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
P
 
-
P
 
-
A
 
S
A
 
L
T
 
T
A
 
G
C
 
V
V
 
V
N
 
N
P
 
A
Q
 
Q
V
 
A
L
 
L
A
 
T
A
 
S

Sites not aligning to the query:

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
41% identity, 82% coverage: 44:313/331 of query aligns to 35:305/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
R
 
K
I
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
V
P
 
P
-
 
E
V
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
L
I
 
L
S
 
V
R
 
R
T
 
S
-
 
A
V
 
T
A
 
T
L
 
V
S
 
D
G
 
A
A
 
E
A
 
V
I
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
A
P
 
P
T
 
K
L
 
L
K
 
K
V
 
I
I
 
V
S
 
A
K
x
R
H
 
A
G
 
G
V
|
V
G
 
G
V
 
L
S
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
V
Q
 
D
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
P
 
L
V
 
V
Y
 
V
V
 
N
T
 
A
P
 
P
G
 
T
A
 
S
N
|
N
A
 
I
R
 
H
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
H
T
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
M
 
L
F
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
S
R
 
R
R
 
Q
V
 
I
A
 
P
W
 
A
M
 
A
D
 
D
R
 
A
E
 
S
L
 
L
H
 
R
A
 
E
G
 
H
R
 
T
W
 
W
S
 
K
R
 
R
A
 
S
Q
 
S
-
 
F
D
 
S
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
I
H
 
F
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
L
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
L
G
 
G
Q
 
R
V
 
I
A
 
G
R
 
Q
R
 
L
V
 
V
A
 
A
T
 
Q
V
 
R
C
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
F
G
 
G
M
 
A
P
 
Y
V
 
V
V
 
V
A
 
A
F
 
Y
D
 
D
P
 
P
A
 
Y
L
 
V
A
 
S
G
 
P
R
 
A
A
 
R
S
 
A
P
 
A
V
 
Q
A
 
L
G
 
G
V
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
L
D
 
-
S
 
S
L
 
L
D
 
D
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
R
S
 
A
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
S
L
 
V
H
 
H
V
 
L
P
 
P
L
 
K
N
 
T
Q
 
P
H
 
E
T
 
T
R
 
A
N
 
G
M
 
L
L
 
I
A
 
D
A
 
K
P
 
E
Q
 
A
F
 
L
A
 
A
R
 
K
M
 
T
R
 
K
R
 
P
G
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
I
I
 
V
N
 
N
T
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
E
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
D
A
 
A
L
 
I
Q
 
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
H
L
 
V
Y
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
T
 
V
M
 
F
A
 
A
V
 
T
E
|
E
P
 
P
L
 
C
P
 
-
A
 
T
H
 
D
S
 
S
P
 
P
L
 
L
S
 
F
A
 
E
L
 
L
D
 
A
N
 
Q
V
 
V
V
 
V
L
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
 
G
G
x
A
S
 
S
T
 
T
P
 
A
A
 
E
A
 
A
L
x
Q
A
 
D
A
 
R
M
 
A
A
 
G
S
 
T
D
 
D
A
 
V
A
 
A
R
 
E
N
 
S
V
 
V
L
 
R
G
 
L
F
 
A
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
K
 
E

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
41% identity, 82% coverage: 44:313/331 of query aligns to 34:304/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
R
 
K
I
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
V
P
 
P
-
 
E
V
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
L
I
 
L
S
 
V
R
 
R
T
 
S
-
 
A
V
 
T
A
 
T
L
 
V
S
 
D
G
 
A
A
 
E
A
 
V
I
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
A
P
 
P
T
 
K
L
 
L
K
 
K
V
 
I
I
 
V
S
 
A
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
V
 
L
S
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
V
Q
 
D
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
P
 
L
V
 
V
Y
 
V
V
 
N
T
 
A
P
 
P
G
 
T
A
 
S
N
|
N
A
 
I
R
 
H
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
H
T
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
M
 
L
F
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
S
R
 
R
R
 
Q
V
 
I
A
 
P
W
 
A
M
 
A
D
 
D
R
 
A
E
 
S
L
 
L
H
 
R
A
 
E
G
 
H
R
 
T
W
 
W
S
 
K
R
 
R
A
 
S
Q
 
S
-
 
F
D
 
S
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
I
H
 
F
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
L
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
L
G
 
G
Q
 
R
V
 
I
A
 
G
R
 
Q
R
 
L
V
 
V
A
 
A
T
 
Q
V
 
R
C
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
F
G
 
G
M
 
A
P
 
Y
V
 
V
V
 
V
A
 
A
F
 
Y
D
 
D
P
 
P
A
 
Y
L
 
V
A
 
S
G
 
P
R
 
A
A
 
R
S
 
A
P
 
A
V
 
Q
A
 
L
G
 
G
V
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
L
D
 
-
S
 
S
L
 
L
D
 
D
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
R
S
 
A
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
S
L
 
V
H
 
H
V
 
L
P
 
P
L
 
K
N
 
T
Q
 
P
H
 
E
T
 
T
R
 
A
N
 
G
M
 
L
L
 
I
A
 
D
A
 
K
P
 
E
Q
 
A
F
 
L
A
 
A
R
 
K
M
 
T
R
 
K
R
 
P
G
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
I
I
 
V
N
 
N
T
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
E
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
D
A
 
A
L
 
I
Q
 
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
H
L
 
V
Y
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
T
 
V
M
 
F
A
 
A
V
 
T
E
|
E
P
 
P
L
 
C
P
 
-
A
 
T
H
 
D
S
 
S
P
 
P
L
 
L
S
 
F
A
 
E
L
 
L
D
 
A
N
 
Q
V
 
V
V
 
V
L
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
P
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
Q
A
 
D
A
 
R
M
 
A
A
 
G
S
 
T
D
 
D
A
 
V
A
 
A
R
 
E
N
 
S
V
 
V
L
 
R
G
 
L
F
 
A
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
K
 
E

Sites not aligning to the query:

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
32% identity, 91% coverage: 12:312/331 of query aligns to 11:305/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
L
 
L
A
 
D
P
 
P
A
 
C
G
 
C
V
 
R
R
 
K
L
 
I
L
 
L
E
 
Q
A
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
L
Y
 
Q
L
 
V
A
 
V
D
 
E
A
 
K
N
 
Q
G
 
N
A
 
L
N
 
S
D
 
K
A
 
E
G
 
E
E
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
E
I
 
L
L
 
Q
A
 
D
A
 
C
E
 
E
P
 
G
V
 
L
D
 
-
A
 
-
V
 
I
I
 
V
S
 
R
R
 
S
T
 
A
V
 
T
A
 
K
L
 
V
S
 
T
G
 
A
A
 
D
A
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
S
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
L
V
 
V
Y
 
M
V
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
A
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
V
 
I
A
 
P
W
 
Q
M
 
A
D
 
T
R
 
A
E
 
S
L
 
M
H
 
K
A
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
S
 
E
R
 
R
A
 
K
Q
 
K
D
 
F
-
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
L
H
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
Q
 
R
V
 
I
A
 
G
R
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
T
 
T
V
 
R
C
 
M
L
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
F
x
Y
D
|
D
P
|
P
A
 
I
L
 
I
A
 
S
G
 
P
R
 
E
A
 
V
S
 
S
P
 
A
V
 
S
A
 
F
G
 
G
V
 
V
A
 
Q
L
 
Q
A
 
L
D
 
-
S
 
P
L
|
L
D
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
A
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
Q
 
P
H
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
M
x
L
L
 
L
A
 
N
A
 
D
P
 
N
Q
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
R
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
G
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
C
Y
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
M
 
F
A
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
A
 
R
H
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
S
 
V
A
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
P
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
Q
A
 
S
A
 
R
M
 
C
A
 
G
S
 
E
D
 
E
A
 
I
A
 
A
R
 
V
N
 
Q
V
 
F
L
 
V
G
 
D
F
 
M
L
 
V
Q
 
K
G
 
G

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
32% identity, 88% coverage: 12:303/331 of query aligns to 10:295/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
L
 
L
A
 
D
P
 
P
A
 
C
G
 
C
V
 
R
R
 
K
L
 
I
L
 
L
E
 
Q
A
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
L
Y
 
Q
L
 
V
A
 
V
D
 
E
A
 
K
N
 
Q
G
 
N
A
 
L
N
 
S
D
 
K
A
 
E
G
 
E
E
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
E
I
 
L
L
 
Q
A
 
D
A
 
C
E
 
E
P
 
G
V
 
L
D
 
-
A
 
-
V
 
I
I
 
V
S
 
R
R
 
S
T
 
A
V
 
T
A
 
K
L
 
V
S
 
T
G
 
A
A
 
D
A
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
S
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
L
V
 
V
Y
 
M
V
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
A
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
V
 
I
A
 
P
W
 
Q
M
 
A
D
 
T
R
 
A
E
 
S
L
 
M
H
 
K
A
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
S
 
E
R
 
R
A
 
K
Q
 
K
D
 
F
-
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
L
H
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
x
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
Q
 
R
V
 
I
A
 
G
R
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
T
 
T
V
 
R
C
 
M
L
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
F
x
Y
D
|
D
P
|
P
A
 
I
L
x
I
A
 
S
G
 
P
R
 
E
A
 
V
S
 
S
P
 
A
V
 
S
A
 
F
G
 
G
V
 
V
A
 
Q
L
 
Q
A
 
L
D
 
-
S
 
P
L
 
L
D
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
A
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
Q
 
P
H
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
M
x
L
L
 
L
A
 
N
A
 
D
P
 
N
Q
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
R
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
G
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
C
Y
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
M
 
F
A
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
A
 
R
H
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
S
 
V
A
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
P
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
Q
A
 
S
A
 
R
M
 
C
A
 
G
S
 
E
D
 
E
A
 
I
A
 
A

P87228 Putative D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
34% identity, 83% coverage: 20:294/331 of query aligns to 72:352/466 of P87228

query
sites
P87228
L
 
L
E
 
K
A
 
D
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
Q
I
 
V
L
 
E
Y
 
F
L
 
L
A
 
K
D
 
T
A
 
S
N
 
M
G
x
S
A
 
E
N
 
D
D
 
D
A
 
L
G
 
-
E
 
-
V
 
V
A
 
E
R
 
K
I
 
I
L
 
K
A
 
G
A
 
V
E
 
H
P
 
A
V
 
I
D
 
-
A
 
G
V
 
I
I
 
R
S
 
S
R
 
K
T
 
T
V
 
-
A
 
R
L
 
L
S
 
T
G
 
R
A
 
R
A
 
V
I
 
L
A
 
E
A
 
A
C
 
A
P
 
D
T
 
S
L
 
L
K
 
I
V
 
V
I
 
I
S
 
G
K
 
C
H
 
F
G
 
C
V
 
I
G
 
G
V
 
T
S
 
N
N
 
Q
I
 
V
D
 
D
V
 
L
Q
 
D
A
 
F
A
 
A
T
 
A
A
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
I
P
 
A
V
 
V
Y
 
F
V
 
N
T
 
S
P
 
P
G
 
Y
A
 
A
N
 
N
A
 
S
R
 
R
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
V
L
 
I
A
 
G
L
 
Y
M
 
I
F
 
I
A
 
S
A
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
V
 
V
A
 
G
W
 
D
M
 
R
D
 
S
R
 
L
E
 
E
L
 
L
H
 
H
A
 
R
G
 
G
R
 
E
W
 
W
S
 
N
R
 
K
A
 
V
Q
 
S
D
 
S
G
 
G
I
 
C
-
 
W
E
 
E
L
 
I
H
 
R
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
Q
 
H
V
 
I
A
 
G
R
 
S
R
 
Q
V
 
L
A
 
S
T
 
V
V
 
L
C
 
A
L
 
E
A
 
A
L
 
M
G
 
G
M
 
L
P
 
H
V
 
V
V
 
V
A
 
Y
F
 
Y
D
 
D
-
 
I
-
 
L
P
 
P
A
 
I
L
 
M
A
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
P
 
P
V
 
L
A
 
G
G
 
S
V
 
A
A
 
K
L
 
Q
A
 
L
D
 
S
S
 
S
L
 
L
D
 
P
A
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
H
A
 
R
S
 
A
D
 
D
V
 
F
L
 
V
S
 
S
L
 
L
H
 
H
V
 
V
P
 
P
L
 
A
N
x
S
Q
 
P
H
 
E
T
 
T
R
 
K
N
 
N
M
 
M
L
 
I
A
 
S
A
 
S
P
 
K
Q
 
E
F
 
F
A
 
A
R
 
A
M
 
M
R
 
K
R
 
E
G
 
G
A
 
S
I
 
Y
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
 
A
A
 
S
R
 
R
G
 
G
E
 
T
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
I
A
 
P
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
D
A
 
A
L
 
S
Q
 
K
G
 
S
G
 
G
Q
 
K
L
 
I
Y
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
I
D
 
D
T
 
V
M
 
Y
A
 
P
V
 
S
E
 
E
P
 
P
L
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
K
-
 
F
-
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
L
-
 
N
P
 
S
A
 
W
H
 
T
S
 
S
P
 
E
L
 
L
S
 
T
A
 
H
L
 
C
D
 
K
N
 
N
V
 
I
V
 
I
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
 
H
V
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
P
 
E
A
 
E
A
 
A

7dkmA Phgdh covalently linked to oridonin (see paper)
32% identity, 88% coverage: 12:303/331 of query aligns to 11:296/306 of 7dkmA

query
sites
7dkmA
L
 
L
A
 
D
P
 
P
A
x
C
G
 
C
V
 
R
R
x
K
L
x
I
L
 
L
E
 
Q
A
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
L
Y
 
Q
L
 
V
A
 
V
D
 
E
A
 
K
N
 
Q
G
 
N
A
 
L
N
 
S
D
 
K
A
 
E
G
 
E
E
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
E
I
 
L
L
 
Q
A
 
D
A
 
C
E
 
E
P
 
G
V
 
L
D
 
-
A
 
-
V
 
I
I
 
V
S
 
R
R
 
S
T
 
A
V
 
T
A
 
K
L
 
V
S
 
T
G
 
A
A
 
D
A
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
x
T
G
 
G
V
 
V
S
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
L
V
 
V
Y
 
M
V
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
x
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
A
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
V
 
I
A
 
P
W
 
Q
M
 
A
D
 
T
R
 
A
E
 
S
L
 
M
H
 
K
A
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
S
 
E
R
 
R
A
 
K
Q
 
K
D
 
F
-
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
L
H
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
|
G
F
 
L
G
 
G
Q
x
R
V
x
I
A
 
G
R
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
T
 
T
V
 
R
C
 
M
L
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
F
x
Y
D
|
D
P
|
P
A
x
I
L
 
I
A
 
S
G
 
P
R
 
E
A
 
V
S
 
S
P
 
A
V
 
S
A
 
F
G
 
G
V
 
V
A
 
Q
L
 
Q
A
 
L
D
 
-
S
 
P
L
 
L
D
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
A
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
Q
 
P
H
 
S
T
|
T
R
 
T
N
 
G
M
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
D
P
 
N
Q
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
R
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
E
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
G
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
C
Y
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
M
 
F
A
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
A
 
R
H
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
S
 
V
A
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
|
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
P
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
Q
A
 
S
A
 
R
M
 
C
A
 
G
S
x
E
D
 
E
A
 
I
A
 
A

6rj2A Crystal structure of phgdh in complex with compound 40 (see paper)
32% identity, 88% coverage: 12:303/331 of query aligns to 7:292/299 of 6rj2A

query
sites
6rj2A
L
 
L
A
 
D
P
 
P
A
 
C
G
 
C
V
 
R
R
 
K
L
 
I
L
 
L
E
 
Q
A
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
L
Y
 
Q
L
 
V
A
 
V
D
 
E
A
 
K
N
 
Q
G
 
N
A
 
L
N
 
S
D
 
K
A
 
E
G
 
E
E
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
E
I
 
L
L
 
Q
A
 
D
A
 
C
E
 
E
P
 
G
V
 
L
D
 
-
A
 
-
V
 
I
I
 
V
S
 
R
R
 
S
T
 
A
V
 
T
A
 
K
L
 
V
S
 
T
G
 
A
A
 
D
A
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
S
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
L
V
 
V
Y
 
M
V
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
A
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
V
 
I
A
 
P
W
 
Q
M
 
A
D
 
T
R
 
A
E
 
S
L
 
M
H
 
K
A
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
S
 
E
R
 
R
A
 
K
Q
 
K
D
 
F
-
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
L
H
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
 
G
F
 
L
G
|
G
Q
 
R
V
x
I
A
 
G
R
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
T
 
T
V
 
R
C
 
M
L
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
F
x
Y
D
|
D
P
|
P
A
x
I
L
x
I
A
 
S
G
 
P
R
 
E
A
 
V
S
 
S
P
 
A
V
 
S
A
 
F
G
 
G
V
 
V
A
 
Q
L
 
Q
A
 
L
D
 
-
S
 
P
L
 
L
D
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
A
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
 
P
L
 
L
N
 
L
Q
 
P
H
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
M
x
L
L
 
L
A
 
N
A
 
D
P
 
N
Q
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
R
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
|
R
G
 
G
E
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
G
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
C
Y
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
M
 
F
A
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
A
 
R
H
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
S
 
V
A
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
P
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
Q
A
 
S
A
 
R
M
 
C
A
 
G
S
 
E
D
 
E
A
 
I
A
 
A

6plfB Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
34% identity, 88% coverage: 12:303/331 of query aligns to 9:286/292 of 6plfB

query
sites
6plfB
L
 
L
A
 
D
P
 
P
A
 
C
G
 
C
V
 
R
R
 
K
L
 
I
L
 
L
E
 
Q
A
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
L
R
 
Q
I
 
V
L
 
V
Y
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
E
V
 
K
A
 
Q
R
 
N
I
 
L
L
 
L
A
 
I
A
 
A
E
 
E
P
 
L
V
 
Q
D
 
D
A
 
C
-
 
E
-
 
G
V
 
L
I
 
I
S
 
V
R
 
R
T
 
S
V
 
A
A
 
A
L
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
D
A
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
S
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
L
V
 
V
Y
 
M
V
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
A
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
V
 
I
A
 
P
W
 
Q
M
 
A
D
 
T
R
 
A
E
 
S
L
 
M
H
 
K
A
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
S
 
E
R
 
R
A
 
K
Q
 
K
D
 
F
-
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
L
H
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
Q
x
R
V
 
I
A
 
G
R
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
T
 
T
V
 
R
C
 
M
L
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
F
x
Y
D
|
D
P
|
P
A
 
I
L
x
I
A
 
S
G
 
P
R
 
E
A
 
V
S
 
S
P
 
A
V
 
S
A
 
F
G
 
G
V
 
V
A
 
Q
L
 
Q
A
 
L
D
 
-
S
 
P
L
|
L
D
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
A
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
V
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
Q
 
P
H
x
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
M
x
L
L
 
L
A
 
N
A
 
D
P
 
N
Q
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
R
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
G
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
C
Y
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
M
 
F
A
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
A
 
R
H
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
S
 
V
A
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
P
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
Q
A
 
S
A
 
R
M
 
C
A
 
G
S
 
E
D
 
E
A
 
I
A
 
A

6cwaA Crystal structure phgdh in complex with nadh and 3-phosphoglycerate at 1.77 a resolution (see paper)
32% identity, 88% coverage: 12:303/331 of query aligns to 9:294/299 of 6cwaA

query
sites
6cwaA
L
 
L
A
 
D
P
 
P
A
 
C
G
 
C
V
 
R
R
 
K
L
 
I
L
 
L
E
 
Q
A
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
L
Y
 
Q
L
 
V
A
 
V
D
 
E
A
 
K
N
 
Q
G
 
N
A
 
L
N
 
S
D
 
K
A
 
E
G
 
E
E
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
E
I
 
L
L
 
Q
A
 
D
A
 
C
E
 
E
P
 
G
V
 
L
D
 
-
A
 
-
V
 
I
I
 
V
S
 
R
R
 
S
T
 
A
V
 
T
A
 
K
L
 
V
S
 
T
G
 
A
A
 
D
A
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
S
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
L
V
 
V
Y
 
M
V
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
N
|
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
x
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
A
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
V
 
I
A
 
P
W
 
Q
M
 
A
D
 
T
R
 
A
E
 
S
L
 
M
H
 
K
A
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
S
 
E
R
 
R
A
 
K
Q
 
K
D
 
F
-
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
L
H
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
Q
x
R
V
x
I
A
 
G
R
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
T
 
T
V
 
R
C
 
M
L
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
F
x
Y
D
|
D
P
|
P
A
x
I
L
 
I
A
 
S
G
 
P
R
 
E
A
 
V
S
 
S
P
 
A
V
 
S
A
 
F
G
 
G
V
 
V
A
 
Q
L
 
Q
A
 
L
D
 
-
S
 
P
L
 
L
D
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
A
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
Q
 
P
H
 
S
T
|
T
R
 
T
N
 
G
M
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
D
P
 
N
Q
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
R
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
E
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
G
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
C
Y
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
M
 
F
A
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
A
 
R
H
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
S
 
V
A
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
|
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
P
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
Q
A
 
S
A
 
R
M
 
C
A
 
G
S
 
E
D
 
E
A
 
I
A
 
A

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
32% identity, 88% coverage: 12:303/331 of query aligns to 10:295/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
L
 
L
A
 
D
P
 
P
A
 
C
G
 
C
V
 
R
R
 
K
L
 
I
L
 
L
E
 
Q
A
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
L
Y
 
Q
L
 
V
A
 
V
D
 
E
A
 
K
N
 
Q
G
 
N
A
 
L
N
 
S
D
 
K
A
 
E
G
 
E
E
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
E
I
 
L
L
 
Q
A
 
D
A
 
C
E
 
E
P
 
G
V
 
L
D
 
-
A
 
-
V
 
I
I
 
V
S
 
R
R
 
S
T
 
A
V
 
T
A
 
K
L
 
V
S
 
T
G
 
A
A
 
D
A
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
S
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
L
V
 
V
Y
 
M
V
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
A
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
V
 
I
A
 
P
W
 
Q
M
 
A
D
 
T
R
 
A
E
 
S
L
 
M
H
 
K
A
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
S
 
E
R
 
R
A
 
K
Q
 
K
D
 
F
-
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
L
H
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
x
L
G
|
G
F
x
L
G
|
G
Q
x
R
V
x
I
A
x
G
R
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
T
 
T
V
 
R
C
 
M
L
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
F
 
Y
D
|
D
P
 
P
A
 
I
L
 
I
A
 
S
G
 
P
R
 
E
A
 
V
S
 
S
P
 
A
V
 
S
A
 
F
G
 
G
V
 
V
A
 
Q
L
 
Q
A
 
L
D
 
-
S
 
P
L
 
L
D
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
A
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
Q
 
P
H
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
M
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
D
P
 
N
Q
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
R
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
G
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
C
Y
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
M
 
F
A
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
A
 
R
H
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
S
 
V
A
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
P
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
Q
A
 
S
A
 
R
M
 
C
A
 
G
S
 
E
D
 
E
A
 
I
A
 
A

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
32% identity, 88% coverage: 12:303/331 of query aligns to 10:295/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
L
 
L
A
 
D
P
 
P
A
 
C
G
 
C
V
 
R
R
 
K
L
 
I
L
 
L
E
 
Q
A
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
L
Y
 
Q
L
 
V
A
 
V
D
 
E
A
 
K
N
 
Q
G
 
N
A
 
L
N
 
S
D
 
K
A
 
E
G
 
E
E
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
E
I
 
L
L
 
Q
A
 
D
A
 
C
E
 
E
P
 
G
V
 
L
D
 
-
A
 
-
V
 
I
I
 
V
S
 
R
R
 
S
T
 
A
V
 
T
A
 
K
L
 
V
S
 
T
G
 
A
A
 
D
A
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
S
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
L
V
 
V
Y
 
M
V
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
A
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
V
 
I
A
 
P
W
 
Q
M
 
A
D
 
T
R
 
A
E
 
S
L
 
M
H
 
K
A
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
S
 
E
R
 
R
A
 
K
Q
 
K
D
 
F
-
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
L
H
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
 
G
F
 
L
G
|
G
Q
 
R
V
 
I
A
 
G
R
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
T
 
T
V
 
R
C
 
M
L
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
F
x
Y
D
|
D
P
|
P
A
x
I
L
x
I
A
 
S
G
 
P
R
 
E
A
 
V
S
 
S
P
 
A
V
 
S
A
 
F
G
 
G
V
 
V
A
 
Q
L
 
Q
A
 
L
D
 
-
S
 
P
L
 
L
D
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
A
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
V
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
Q
 
P
H
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
M
x
L
L
 
L
A
 
N
A
 
D
P
 
N
Q
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
R
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
G
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
C
Y
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
M
 
F
A
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
A
 
R
H
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
S
 
V
A
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
P
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
Q
A
 
S
A
 
R
M
 
C
A
 
G
S
 
E
D
 
E
A
 
I
A
 
A

6plgA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 15 (see paper)
32% identity, 88% coverage: 12:303/331 of query aligns to 10:295/303 of 6plgA

query
sites
6plgA
L
 
L
A
 
D
P
 
P
A
 
C
G
 
C
V
 
R
R
 
K
L
 
I
L
 
L
E
 
Q
A
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
L
Y
 
Q
L
 
V
A
 
V
D
 
E
A
 
K
N
 
Q
G
 
N
A
 
L
N
 
S
D
 
K
A
 
E
G
 
E
E
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
E
I
 
L
L
 
Q
A
 
D
A
 
C
E
 
E
P
 
G
V
 
L
D
 
-
A
 
-
V
 
I
I
 
V
S
 
R
R
 
S
T
 
A
V
 
T
A
 
K
L
 
V
S
 
T
G
 
A
A
 
D
A
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
S
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
L
V
 
V
Y
 
M
V
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
A
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
V
 
I
A
 
P
W
 
Q
M
 
A
D
 
T
R
 
A
E
 
S
L
 
M
H
 
K
A
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
S
 
E
R
 
R
A
 
K
Q
 
K
D
 
F
-
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
L
H
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
 
G
F
 
L
G
|
G
Q
x
R
V
 
I
A
 
G
R
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
T
 
T
V
 
R
C
 
M
L
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
F
 
Y
D
|
D
P
|
P
A
x
I
L
x
I
A
 
S
G
 
P
R
 
E
A
 
V
S
 
S
P
 
A
V
 
S
A
 
F
G
 
G
V
 
V
A
 
Q
L
 
Q
A
 
L
D
 
-
S
 
P
L
 
L
D
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
A
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
 
P
L
 
L
N
x
L
Q
 
P
H
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
M
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
D
P
 
N
Q
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
R
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
G
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
C
Y
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
M
 
F
A
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
A
 
R
H
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
S
 
V
A
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
P
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
Q
A
 
S
A
 
R
M
 
C
A
 
G
S
 
E
D
 
E
A
 
I
A
 
A

6rj3A Crystal structure of phgdh in complex with compound 15 (see paper)
32% identity, 88% coverage: 12:303/331 of query aligns to 9:294/297 of 6rj3A

query
sites
6rj3A
L
 
L
A
 
D
P
 
P
A
 
C
G
 
C
V
 
R
R
 
K
L
 
I
L
 
L
E
 
Q
A
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
L
Y
 
Q
L
 
V
A
 
V
D
 
E
A
 
K
N
 
Q
G
 
N
A
 
L
N
 
S
D
 
K
A
 
E
G
 
E
E
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
E
I
 
L
L
 
Q
A
 
D
A
 
C
E
 
E
P
 
G
V
 
L
D
 
-
A
 
-
V
 
I
I
 
V
S
 
R
R
 
S
T
 
A
V
 
T
A
 
K
L
 
V
S
 
T
G
 
A
A
 
D
A
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
S
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
L
V
 
V
Y
 
M
V
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
A
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
V
 
I
A
 
P
W
 
Q
M
 
A
D
 
T
R
 
A
E
 
S
L
 
M
H
 
K
A
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
S
 
E
R
 
R
A
 
K
Q
 
K
D
 
F
-
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
L
H
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
x
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
Q
 
R
V
 
I
A
 
G
R
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
T
 
T
V
 
R
C
 
M
L
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
F
x
Y
D
|
D
P
|
P
A
x
I
L
x
I
A
 
S
G
 
P
R
 
E
A
 
V
S
 
S
P
 
A
V
 
S
A
 
F
G
 
G
V
 
V
A
 
Q
L
 
Q
A
 
L
D
 
-
S
 
P
L
 
L
D
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
A
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
Q
 
P
H
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
M
x
L
L
 
L
A
 
N
A
 
D
P
 
N
Q
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
R
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
G
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
C
Y
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
M
 
F
A
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
A
 
R
H
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
S
 
V
A
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
P
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
Q
A
 
S
A
 
R
M
 
C
A
 
G
S
 
E
D
 
E
A
 
I
A
 
A

2p9eA Crystal structure of g336v mutant of e.Coli phosphoglycerate dehydrogenase (see paper)
37% identity, 77% coverage: 56:309/331 of query aligns to 57:311/406 of 2p9eA

query
sites
2p9eA
S
 
S
R
 
R
T
 
T
V
 
-
A
 
H
L
 
L
S
 
T
G
 
E
A
 
D
A
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
V
V
 
A
I
 
I
S
 
G
K
 
A
H
 
F
G
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
T
S
 
N
N
 
Q
I
 
V
D
 
D
V
 
L
Q
 
D
A
 
A
A
 
A
T
 
A
A
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
Y
 
F
V
 
N
T
 
A
P
 
P
G
 
F
A
 
S
N
|
N
A
 
T
R
 
R
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
V
L
 
I
A
 
G
L
 
E
M
 
L
F
 
L
A
 
L
A
 
L
A
 
L
R
 
R
R
 
G
V
 
V
A
 
P
W
 
E
M
 
A
D
 
N
R
 
A
E
 
K
L
 
A
H
 
H
A
 
R
G
 
G
R
 
V
W
 
W
S
 
N
R
 
K
-
 
L
A
 
A
Q
 
A
D
 
G
G
 
S
I
 
F
E
 
E
L
 
A
H
 
R
G
 
G
R
 
K
T
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
G
|
G
Q
x
H
V
x
I
A
 
G
R
 
T
R
 
Q
V
 
L
A
 
G
T
 
I
V
 
L
C
 
A
L
 
E
A
 
S
L
 
L
G
 
G
M
 
M
P
 
Y
V
 
V
V
 
Y
A
 
F
F
x
Y
D
|
D
P
x
I
A
 
E
L
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
N
A
 
K
S
 
L
P
 
P
V
 
L
A
 
G
G
 
N
V
 
A
A
 
T
L
 
Q
A
 
V
D
 
Q
S
 
H
L
 
L
D
 
S
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
M
S
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
V
S
 
S
L
 
L
H
|
H
V
|
V
P
|
P
L
 
E
N
 
N
Q
 
P
H
x
S
T
 
T
R
 
K
N
 
N
M
 
M
L
 
M
A
 
G
A
 
A
P
 
K
Q
 
E
F
 
I
A
 
S
R
 
L
M
 
M
R
 
K
R
 
P
G
 
G
A
 
S
I
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
x
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
E
 
T
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
I
A
 
P
A
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
D
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
G
 
S
G
 
K
Q
 
H
L
 
L
Y
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
I
D
|
D
T
 
V
M
 
F
A
 
P
V
 
T
E
|
E
P
 
P
L
 
A
-
 
T
-
 
N
-
 
S
-
 
D
P
 
P
A
 
F
H
 
T
S
 
S
P
 
P
L
 
L
S
 
A
A
 
E
L
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
P
 
Q
A
 
E
A
 
A
L
 
Q
A
 
E
A
 
N
M
 
I
A
 
G
S
 
L
D
 
E
A
 
V
A
 
A
R
 
G
N
 
K
V
 
L
L
 
I
G
 
K
F
 
Y

2eklA Structure of st1218 protein from sulfolobus tokodaii
32% identity, 92% coverage: 6:311/331 of query aligns to 8:307/312 of 2eklA

query
sites
2eklA
L
 
L
V
 
I
T
 
T
A
 
D
P
 
P
R
 
-
L
 
I
A
 
D
P
 
E
A
 
I
G
 
L
V
 
I
R
 
K
L
 
T
L
 
L
E
 
R
A
 
E
A
 
K
G
 
G
A
 
I
R
 
Q
I
 
V
L
 
D
Y
 
Y
L
 
M
A
 
P
D
 
E
A
 
I
N
 
S
G
 
K
A
 
E
N
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
E
V
 
L
A
 
L
R
 
N
I
 
I
L
 
I
A
 
G
A
 
N
E
 
Y
P
 
D
V
 
I
D
 
I
A
 
V
V
 
V
I
 
R
S
 
S
R
 
R
T
 
T
V
 
-
A
 
K
L
 
V
S
 
T
G
 
K
A
 
D
A
 
V
I
 
I
A
 
E
A
 
K
C
 
G
P
 
K
T
 
K
L
 
L
K
 
K
V
 
I
I
 
I
S
 
A
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
x
I
G
 
G
V
 
L
S
 
D
N
 
N
I
 
I
D
 
D
V
 
T
Q
 
E
A
 
E
A
 
A
T
 
E
A
 
K
R
 
R
G
 
N
I
 
I
P
 
K
V
 
V
Y
 
V
V
 
Y
T
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
A
N
x
S
A
 
T
R
 
D
S
 
S
V
 
A
A
 
V
E
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
I
A
 
G
L
 
L
M
 
M
F
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
K
V
 
M
A
 
-
W
 
Y
M
 
T
D
 
S
R
 
M
E
 
A
L
 
L
H
 
A
A
 
K
G
 
S
R
 
G
W
 
I
S
 
F
R
 
K
A
 
K
Q
 
I
D
 
E
G
 
G
I
 
L
E
 
E
L
 
L
H
 
A
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
L
 
I
V
 
V
G
|
G
F
 
F
G
|
G
Q
x
R
V
x
I
A
 
G
R
 
T
R
 
K
V
 
V
A
 
G
T
 
I
V
 
I
C
 
A
L
 
N
A
 
A
L
 
M
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
V
V
 
L
A
 
A
F
x
Y
D
|
D
P
 
-
A
x
I
L
|
L
A
 
D
G
 
I
R
 
R
A
 
E
S
 
K
P
 
A
V
 
E
A
 
K
G
 
I
V
 
N
A
 
A
L
 
K
A
 
A
D
 
V
S
 
S
L
 
L
D
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
K
A
 
N
S
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
I
S
 
S
L
 
L
H
|
H
V
|
V
P
x
T
L
 
V
N
 
S
Q
 
K
H
 
D
T
 
A
R
 
K
N
 
P
M
x
I
L
 
I
A
 
D
A
 
Y
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
A
 
E
R
 
L
M
 
M
R
 
K
R
 
D
G
 
N
A
 
V
I
 
I
L
 
I
I
 
V
N
 
N
T
|
T
A
x
S
R
|
R
G
 
A
E
 
V
V
 
A
V
 
V
D
 
N
E
 
G
A
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
D
A
 
Y
L
 
I
Q
 
K
G
 
K
G
 
G
Q
 
K
L
 
V
Y
 
Y
A
 
A
A
 
Y
G
 
A
L
 
T
D
|
D
T
 
V
M
 
F
A
 
W
V
 
N
E
|
E
P
 
P
L
 
P
P
 
K
A
 
E
H
 
E
S
 
W
P
 
E
L
 
L
S
 
E
A
 
L
L
 
L
-
 
K
-
 
H
D
 
E
N
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
V
T
 
T
P
 
T
H
|
H
V
 
I
G
|
G
G
 
A
S
 
Q
T
 
T
P
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
Q
A
 
K
A
 
R
M
 
V
A
 
A
S
 
E
D
 
M
A
 
T
A
 
T
R
 
Q
N
 
N
V
 
L
L
 
L
G
 
N
F
 
A
L
 
M
Q
 
K

1ybaA The active form of phosphoglycerate dehydrogenase (see paper)
37% identity, 77% coverage: 56:309/331 of query aligns to 57:311/406 of 1ybaA

query
sites
1ybaA
S
|
S
R
 
R
T
 
T
V
 
-
A
 
H
L
 
L
S
 
T
G
 
E
A
 
D
A
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
V
V
 
A
I
 
I
S
 
G
K
 
C
H
 
F
G
x
C
V
x
I
G
|
G
V
 
T
S
x
N
N
 
Q
I
 
V
D
 
D
V
 
L
Q
 
D
A
 
A
A
 
A
T
 
A
A
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
Y
 
F
V
 
N
T
 
A
P
 
P
G
x
F
A
 
S
N
|
N
A
 
T
R
 
R
S
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
V
L
 
I
A
 
G
L
 
E
M
 
L
F
 
L
A
 
L
A
 
L
A
 
L
R
 
R
R
 
G
V
 
V
A
 
P
W
 
E
M
 
A
D
 
N
R
 
A
E
 
K
L
 
A
H
 
H
A
 
R
G
 
G
R
 
V
W
 
W
S
 
N
R
 
K
-
 
L
A
 
A
Q
 
A
D
 
G
G
 
S
I
 
F
E
 
E
L
 
A
H
 
R
G
 
G
R
 
K
T
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
I
G
|
G
F
 
Y
G
|
G
Q
x
H
V
x
I
A
 
G
R
 
T
R
 
Q
V
 
L
A
 
G
T
 
I
V
 
L
C
 
A
L
 
E
A
 
S
L
 
L
G
 
G
M
 
M
P
 
Y
V
 
V
V
 
Y
A
 
F
F
x
Y
D
|
D
P
x
I
A
 
E
L
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
N
A
x
K
S
 
L
P
 
P
V
 
L
A
 
G
G
 
N
V
 
A
A
 
T
L
 
Q
A
 
V
D
 
Q
S
 
H
L
 
L
D
 
S
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
M
S
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
V
S
 
S
L
 
L
H
|
H
V
|
V
P
|
P
L
 
E
N
 
N
Q
 
P
H
 
S
T
 
T
R
 
K
N
 
N
M
 
M
L
 
M
A
 
G
A
 
A
P
 
K
Q
 
E
F
 
I
A
 
S
R
 
L
M
 
M
R
 
K
R
 
P
G
 
G
A
 
S
I
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
x
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
E
 
T
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
I
A
 
P
A
 
A
L
 
L
V
 
C
A
 
D
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
G
 
S
G
 
K
Q
 
H
L
 
L
Y
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
I
D
|
D
T
 
V
M
 
F
A
 
P
V
 
T
E
|
E
P
 
P
L
 
A
-
 
T
-
 
N
-
 
S
-
 
D
P
 
P
A
 
F
H
 
T
S
 
S
P
 
P
L
 
L
S
 
C
A
 
E
L
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
P
 
Q
A
 
E
A
 
A
L
 
Q
A
 
E
A
 
N
M
 
I
A
 
G
S
 
L
D
 
E
A
 
V
A
 
A
R
 
G
N
 
K
V
 
L
L
 
I
G
 
K
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

P0A9T0 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; PGDH; 2-oxoglutarate reductase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
37% identity, 77% coverage: 56:309/331 of query aligns to 61:315/410 of P0A9T0

query
sites
P0A9T0
S
 
S
R
 
R
T
 
T
V
 
-
A
 
H
L
 
L
S
 
T
G
 
E
A
 
D
A
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
C
 
A
P
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
V
V
 
A
I
 
I
S
 
G
K
 
C
H
 
F
G
 
C
V
 
I
G
 
G
V
 
T
S
 
N
N
 
Q
I
 
V
D
 
D
V
 
L
Q
 
D
A
 
A
A
 
A
T
 
A
A
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
Y
 
F
V
 
N
T
 
A
P
 
P
G
 
F
A
 
S
N
 
N
A
 
T
R
 
R
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
V
L
 
I
A
 
G
L
 
E
M
 
L
F
 
L
A
 
L
A
 
L
A
 
L
R
 
R
R
 
G
V
 
V
A
 
P
W
 
E
M
 
A
D
 
N
R
 
A
E
 
K
L
 
A
H
 
H
A
 
R
G
 
G
R
 
V
W
 
W
S
 
N
R
 
K
-
 
L
A
 
A
Q
 
A
D
 
G
G
 
S
I
 
F
E
 
E
L
 
A
H
 
R
G
 
G
R
 
K
T
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
Q
x
H
V
x
I
A
 
G
R
 
T
R
 
Q
V
 
L
A
 
G
T
 
I
V
 
L
C
 
A
L
 
E
A
 
S
L
 
L
G
 
G
M
 
M
P
 
Y
V
 
V
V
 
Y
A
 
F
F
 
Y
D
|
D
P
 
I
A
 
E
L
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
N
A
 
K
S
 
L
P
 
P
V
 
L
A
 
G
G
 
N
V
 
A
A
 
T
L
 
Q
A
 
V
D
 
Q
S
 
H
L
 
L
D
 
S
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
M
S
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
V
S
 
S
L
 
L
H
 
H
V
 
V
P
 
P
L
 
E
N
 
N
Q
 
P
H
 
S
T
 
T
R
 
K
N
 
N
M
 
M
L
 
M
A
 
G
A
 
A
P
 
K
Q
 
E
F
 
I
A
 
S
R
 
L
M
 
M
R
 
K
R
 
P
G
 
G
A
 
S
I
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
x
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
E
 
T
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
I
A
 
P
A
 
A
L
 
L
V
 
C
A
 
D
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
G
 
S
G
 
K
Q
 
H
L
 
L
Y
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
I
D
|
D
T
 
V
M
 
F
A
 
P
V
 
T
E
 
E
P
 
P
L
 
A
-
 
T
-
 
N
-
 
S
-
 
D
P
 
P
A
 
F
H
 
T
S
 
S
P
 
P
L
 
L
S
 
C
A
 
E
L
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
x
I
G
|
G
G
|
G
S
 
S
T
 
T
P
 
Q
A
 
E
A
 
A
L
 
Q
A
 
E
A
 
N
M
 
I
A
 
G
S
 
L
D
 
E
A
 
V
A
 
A
R
 
G
N
 
K
V
 
L
L
 
I
G
 
K
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>RR42_RS34610 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS34610
MPTTVLVTAPRLAPAGVRLLEAAGARILYLADANGANDAGEVARILAAEPVDAVISRTVA
LSGAAIAACPTLKVISKHGVGVSNIDVQAATARGIPVYVTPGANARSVAELTLALMFAAA
RRVAWMDRELHAGRWSRAQDGIELHGRTLGLVGFGQVARRVATVCLALGMPVVAFDPALA
GRASPVAGVALADSLDALLAASDVLSLHVPLNQHTRNMLAAPQFARMRRGAILINTARGE
VVDEAALVAALQGGQLYAAGLDTMAVEPLPAHSPLSALDNVVLTPHVGGSTPAALAAMAS
DAARNVLGFLQGKPPAATACVNPQVLAAPGA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory