SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS34970 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS34970 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3thuA Crystal structure of an enolase from sphingomonas sp. Ska58 (efi target efi-501683) with bound mg
74% identity, 100% coverage: 2:403/403 of query aligns to 5:405/405 of 3thuA

query
sites
3thuA
K
 
K
I
 
I
T
 
I
A
 
D
A
 
A
R
 
K
V
 
V
I
 
I
V
 
I
C
 
T
S
 
C
P
 
P
G
 
G
R
 
R
N
 
N
F
 
F
V
 
V
T
 
T
L
 
L
K
 
K
I
 
I
E
 
M
T
 
T
D
 
D
E
 
E
G
 
G
L
 
V
S
 
Y
G
 
G
I
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
A
T
 
T
L
|
L
N
 
N
G
 
G
R
 
R
E
|
E
L
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
E
 
T
D
 
D
H
 
H
V
 
V
A
 
I
P
 
P
C
 
C
L
 
L
I
 
I
G
 
G
R
 
R
D
 
D
P
 
A
H
 
H
Q
 
R
V
 
I
E
 
E
D
 
D
I
 
L
W
 
W
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
R
 
K
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
W
|
W
R
 
R
R
 
R
G
 
G
P
 
P
V
 
V
T
 
T
M
 
M
S
 
T
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
M
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
G
K
 
K
A
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
L
P
 
P
L
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
E
G
 
G
V
 
V
M
 
M
V
 
V
Y
 
Y
G
|
G
H
 
H
A
 
A
N
 
N
G
 
G
S
 
T
D
 
T
I
 
I
E
 
E
A
 
D
T
 
T
V
 
V
D
 
K
E
 
V
V
 
A
L
 
L
R
 
D
Y
 
Y
K
 
Q
E
 
A
L
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
R
 
K
A
 
A
V
 
I
R
|
R
A
 
L
Q
|
Q
S
 
C
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
L
 
M
N
 
A
K
 
S
V
 
T
Y
|
Y
G
 
G
V
 
V
S
 
S
S
 
K
D
 
D
R
 
K
L
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
A
 
A
S
 
D
L
 
L
P
 
P
S
 
T
E
 
E
H
 
N
D
 
I
W
 
W
S
 
N
T
 
T
E
 
S
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
D
 
R
H
 
I
T
 
V
P
 
P
R
 
E
L
 
L
F
 
F
E
 
K
K
 
A
V
 
A
R
 
R
D
 
E
A
 
S
A
 
L
G
 
G
W
 
W
D
 
D
L
 
V
H
 
H
L
 
L
L
 
L
H
 
H
D
|
D
V
 
I
H
|
H
H
 
H
R
 
R
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
Q
S
 
D
L
 
L
E
 
E
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
L
 
P
F
 
F
W
 
W
M
 
L
E
|
E
D
 
D
A
 
A
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
H
 
N
Q
 
Q
E
 
E
S
 
A
F
 
F
R
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
T
 
T
T
 
T
T
 
A
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
|
G
E
|
E
V
 
I
F
 
F
N
 
N
T
 
S
I
 
I
W
 
W
D
 
D
C
 
A
K
 
K
T
 
D
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
E
 
N
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
R
|
R
A
 
A
T
|
T
V
 
V
V
 
V
H
 
H
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
T
H
 
H
L
 
L
R
 
R
R
 
R
I
 
I
A
 
A
D
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
D
M
 
L
H
 
Y
Q
 
Q
V
 
I
R
 
R
T
 
T
G
 
G
S
 
C
H
|
H
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
D
L
 
L
S
 
S
P
 
P
V
 
V
C
 
C
M
 
M
G
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
H
 
H
F
 
F
D
 
D
L
 
L
W
 
S
V
 
V
P
 
P
N
 
N
F
 
F
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
E
|
E
Y
 
Y
M
 
M
R
 
R
H
 
H
S
 
M
E
 
P
Q
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
A
V
 
V
F
 
F
P
 
P
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
F
 
F
A
 
A
N
 
D
G
 
G
M
 
M
L
 
M
Y
 
H
P
 
P
G
 
G
D
 
D
A
 
Q
P
 
P
G
 
G
H
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
D
 
D
E
 
E
T
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
G
Y
 
Y
P
 
E
Y
 
Y
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
-
H
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
M
W
 
F
H
 
N
W
|
W

Q1NAJ2 D-mannonate dehydratase; ManD; EC 4.2.1.8 from Sphingomonas sp. (strain SKA58) (see paper)
74% identity, 100% coverage: 2:403/403 of query aligns to 3:403/403 of Q1NAJ2

query
sites
Q1NAJ2
K
 
K
I
 
I
T
 
I
A
 
D
A
 
A
R
 
K
V
 
V
I
 
I
V
 
I
C
 
T
S
 
C
P
 
P
G
 
G
R
 
R
N
 
N
F
 
F
V
 
V
T
 
T
L
 
L
K
 
K
I
 
I
E
 
M
T
 
T
D
 
D
E
 
E
G
 
G
L
 
V
S
 
Y
G
 
G
I
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
E
 
T
D
 
D
H
 
H
V
 
V
A
 
I
P
 
P
C
 
C
L
 
L
I
 
I
G
 
G
R
 
R
D
 
D
P
 
A
H
 
H
Q
 
R
V
 
I
E
 
E
D
 
D
I
 
L
W
 
W
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
R
 
K
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
R
 
R
G
 
G
P
 
P
V
 
V
T
 
T
M
 
M
S
 
T
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
M
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
G
K
 
K
A
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
L
P
 
P
L
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
E
G
 
G
V
 
V
M
 
M
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
A
 
A
N
 
N
G
 
G
S
 
T
D
 
T
I
 
I
E
 
E
A
 
D
T
 
T
V
 
V
D
 
K
E
 
V
V
 
A
L
 
L
R
 
D
Y
 
Y
K
 
Q
E
 
A
L
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
R
 
K
A
 
A
V
 
I
R
 
R
A
 
L
Q
 
Q
S
 
C
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
L
 
M
N
 
A
K
 
S
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
S
 
S
S
 
K
D
 
D
R
 
K
L
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
A
 
A
S
 
D
L
 
L
P
 
P
S
 
T
E
 
E
H
 
N
D
 
I
W
 
W
S
 
N
T
 
T
E
 
S
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
D
 
R
H
 
I
T
 
V
P
 
P
R
 
E
L
 
L
F
 
F
E
 
K
K
 
A
V
 
A
R
 
R
D
 
E
A
 
S
A
 
L
G
 
G
W
 
W
D
 
D
L
 
V
H
 
H
L
 
L
L
 
L
H
 
H
D
|
D
V
 
I
H
 
H
H
 
H
R
 
R
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
Q
S
 
D
L
 
L
E
 
E
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
L
 
P
F
 
F
W
 
W
M
 
L
E
|
E
D
 
D
A
 
A
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
H
 
N
Q
 
Q
E
 
E
S
 
A
F
 
F
R
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
T
 
T
T
 
T
T
 
A
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
E
|
E
V
 
I
F
 
F
N
 
N
T
 
S
I
 
I
W
 
W
D
 
D
C
 
A
K
 
K
T
 
D
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
E
 
N
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
R
 
R
A
 
A
T
 
T
V
 
V
V
 
V
H
 
H
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
T
H
 
H
L
 
L
R
 
R
R
 
R
I
 
I
A
 
A
D
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
D
M
 
L
H
 
Y
Q
 
Q
V
 
I
R
 
R
T
 
T
G
 
G
S
 
C
H
 
H
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
D
L
 
L
S
 
S
P
 
P
V
 
V
C
 
C
M
 
M
G
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
H
 
H
F
 
F
D
 
D
L
 
L
W
 
S
V
 
V
P
 
P
N
 
N
F
 
F
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
M
 
M
R
 
R
H
 
H
S
 
M
E
 
P
Q
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
A
V
 
V
F
 
F
P
 
P
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
F
 
F
A
 
A
N
 
D
G
 
G
M
 
M
L
 
M
Y
 
H
P
 
P
G
 
G
D
 
D
A
 
Q
P
 
P
G
 
G
H
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
D
 
D
E
 
E
T
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
G
Y
 
Y
P
 
E
Y
 
Y
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
-
H
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
M
W
 
F
H
 
N
W
 
W

4fi4A Crystal structure of mannonate dehydratase prk15072 (target efi- 502214) from caulobacter sp. K31
71% identity, 100% coverage: 1:403/403 of query aligns to 6:407/407 of 4fi4A

query
sites
4fi4A
M
 
L
K
 
K
I
 
I
T
 
I
A
 
D
A
 
A
R
 
K
V
 
V
I
 
I
V
 
V
C
 
T
S
 
C
P
 
P
G
 
G
R
 
R
N
 
N
F
 
F
V
 
V
T
 
T
L
 
L
K
 
K
I
 
I
E
 
T
T
 
T
D
 
S
E
 
D
G
 
G
L
 
V
S
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
D
 
D
A
 
A
T
 
T
L
|
L
N
 
N
G
 
G
R
|
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
V
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
E
 
R
D
 
D
H
 
H
V
 
M
A
 
I
P
 
P
C
 
C
L
 
L
I
 
I
G
 
G
R
 
R
D
 
D
P
 
A
H
 
H
Q
 
R
V
 
I
E
 
E
D
 
D
I
 
V
W
 
W
Q
 
Q
Y
 
F
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
A
 
S
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
R
 
G
G
 
G
P
 
P
V
 
V
T
 
A
M
 
M
S
 
T
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
M
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
L
A
 
A
G
 
G
M
 
M
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
A
S
 
C
R
 
R
T
 
E
G
 
G
V
 
V
M
 
M
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
H
|
H
A
 
A
N
 
N
G
 
G
S
 
E
D
 
T
I
 
I
E
 
E
A
 
D
T
 
T
V
 
I
D
 
A
E
 
E
V
 
A
L
 
R
R
 
K
Y
 
Y
K
 
Q
E
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
R
 
K
A
 
A
V
 
I
R
|
R
A
 
L
Q
|
Q
S
 
S
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
L
 
L
N
 
P
K
 
S
V
 
T
Y
|
Y
G
 
G
V
 
V
S
 
S
S
 
G
D
 
D
R
 
K
L
 
M
F
 
F
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
A
 
G
S
 
N
L
 
L
P
 
P
S
 
T
E
 
E
H
 
N
D
 
V
W
 
W
S
|
S
T
 
T
E
 
S
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
D
 
K
H
 
H
T
 
A
P
 
P
R
 
K
L
 
L
F
 
F
E
 
E
K
 
A
V
 
A
R
 
R
D
 
E
A
 
A
A
 
L
G
 
G
W
 
D
D
 
D
L
 
V
H
 
H
L
 
L
L
 
L
H
 
H
D
|
D
V
 
V
H
|
H
H
 
H
R
 
R
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
K
S
 
D
L
 
L
E
 
E
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
L
 
L
F
 
F
W
 
W
M
 
L
E
|
E
D
 
D
A
 
A
T
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
E
H
 
N
Q
 
Q
E
 
A
S
 
G
F
 
F
R
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
T
 
T
T
 
T
T
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
|
G
E
|
E
V
x
I
F
 
F
N
 
S
T
 
H
I
 
V
W
 
W
D
 
D
C
 
C
K
 
K
T
 
Q
L
 
L
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
R
|
R
A
 
A
T
|
T
V
 
V
V
 
L
H
 
H
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
T
H
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
D
M
 
L
H
 
H
Q
 
H
V
 
V
R
 
R
T
 
T
G
 
G
S
x
C
H
|
H
G
|
G
A
|
A
T
 
T
D
 
D
L
 
L
S
 
S
P
 
P
V
 
I
C
 
T
M
 
M
G
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
H
 
H
F
 
F
D
 
D
L
 
L
W
 
S
V
 
V
P
 
S
N
 
N
F
 
F
G
 
G
I
 
L
Q
 
Q
E
|
E
Y
 
Y
M
 
M
R
 
R
H
 
H
S
 
T
E
 
P
Q
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
A
V
 
V
F
 
F
P
 
P
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
T
 
S
F
 
Y
A
 
K
N
 
D
G
 
G
M
 
M
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
G
 
G
D
 
E
A
 
A
P
 
P
G
 
G
H
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
D
 
D
E
 
E
T
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
-
H
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
M
W
 
Y
H
 
N
W
|
W

B0T0B1 D-mannonate dehydratase Caul1427; ManD; EC 4.2.1.8 from Caulobacter sp. (strain K31) (see paper)
71% identity, 100% coverage: 1:403/403 of query aligns to 2:403/403 of B0T0B1

query
sites
B0T0B1
M
 
L
K
 
K
I
 
I
T
 
I
A
 
D
A
 
A
R
 
K
V
 
V
I
 
I
V
 
V
C
 
T
S
 
C
P
 
P
G
 
G
R
 
R
N
 
N
F
 
F
V
 
V
T
 
T
L
 
L
K
 
K
I
 
I
E
 
T
T
 
T
D
 
S
E
 
D
G
 
G
L
 
V
S
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
D
 
D
A
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
V
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
E
 
R
D
 
D
H
 
H
V
 
M
A
 
I
P
 
P
C
 
C
L
 
L
I
 
I
G
 
G
R
 
R
D
 
D
P
 
A
H
 
H
Q
 
R
V
 
I
E
 
E
D
 
D
I
 
V
W
 
W
Q
 
Q
Y
 
F
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
A
 
S
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
R
 
G
G
 
G
P
 
P
V
 
V
T
 
A
M
 
M
S
 
T
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
M
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
L
A
 
A
G
 
G
M
 
M
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
A
S
 
C
R
 
R
T
 
E
G
 
G
V
 
V
M
 
M
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
A
 
A
N
 
N
G
 
G
S
 
E
D
 
T
I
 
I
E
 
E
A
 
D
T
 
T
V
 
I
D
 
A
E
 
E
V
 
A
L
 
R
R
 
K
Y
 
Y
K
 
Q
E
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
R
 
K
A
 
A
V
 
I
R
 
R
A
 
L
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
L
 
L
N
 
P
K
 
S
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
S
 
S
S
 
G
D
 
D
R
 
K
L
 
M
F
 
F
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
A
 
G
S
 
N
L
 
L
P
 
P
S
 
T
E
 
E
H
 
N
D
 
V
W
 
W
S
 
S
T
 
T
E
 
S
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
D
 
K
H
 
H
T
 
A
P
 
P
R
 
K
L
 
L
F
 
F
E
 
E
K
 
A
V
 
A
R
 
R
D
 
E
A
 
A
A
 
L
G
 
G
W
 
D
D
 
D
L
 
V
H
 
H
L
 
L
L
 
L
H
 
H
D
|
D
V
 
V
H
 
H
H
 
H
R
 
R
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
K
S
 
D
L
 
L
E
 
E
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
L
 
L
F
 
F
W
 
W
M
 
L
E
|
E
D
 
D
A
 
A
T
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
E
H
 
N
Q
 
Q
E
 
A
S
 
G
F
 
F
R
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
T
 
T
T
 
T
T
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
E
|
E
V
 
I
F
 
F
N
 
S
T
 
H
I
 
V
W
 
W
D
 
D
C
 
C
K
 
K
T
 
Q
L
 
L
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
R
 
R
A
 
A
T
 
T
V
 
V
V
 
L
H
 
H
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
T
H
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
D
M
 
L
H
 
H
Q
 
H
V
 
V
R
 
R
T
 
T
G
 
G
S
 
C
H
 
H
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
D
L
 
L
S
 
S
P
 
P
V
 
I
C
 
T
M
 
M
G
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
H
 
H
F
 
F
D
 
D
L
 
L
W
 
S
V
 
V
P
 
S
N
 
N
F
 
F
G
 
G
I
 
L
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
M
 
M
R
 
R
H
 
H
S
 
T
E
 
P
Q
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
A
V
 
V
F
 
F
P
 
P
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
T
 
S
F
 
Y
A
 
K
N
 
D
G
 
G
M
 
M
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
G
 
G
D
 
E
A
 
A
P
 
P
G
 
G
H
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
D
 
D
E
 
E
T
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
-
H
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
M
W
 
Y
H
 
N
W
 
W

4gmeC Crystal structure of mannonate dehydratase (target efi-502209) from caulobacter crescentus cb15 complexed with magnesium and d-mannonate
69% identity, 100% coverage: 1:403/403 of query aligns to 2:403/403 of 4gmeC

query
sites
4gmeC
M
 
L
K
 
K
I
 
I
T
 
I
A
 
D
A
 
A
R
 
K
V
 
V
I
 
I
V
 
V
C
 
T
S
 
C
P
 
P
G
 
G
R
 
R
N
 
N
F
 
F
V
 
V
T
 
T
L
 
L
K
 
K
I
 
I
E
 
T
T
 
T
D
 
E
E
 
D
G
 
G
L
 
I
S
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
D
 
D
A
 
A
T
 
T
L
|
L
N
|
N
G
 
G
R
|
R
E
 
E
L
 
L
A
 
S
V
 
V
A
 
V
S
 
S
Y
 
F
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
H
 
H
V
 
M
A
 
V
P
 
P
C
 
S
L
 
L
I
 
I
G
 
G
R
 
R
D
 
D
P
 
A
H
 
H
Q
 
Q
V
 
I
E
 
E
D
 
D
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
Y
 
F
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
A
 
S
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
R
 
G
G
 
G
P
 
P
V
 
V
T
 
A
M
 
M
S
 
T
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
M
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
G
K
 
K
A
 
V
A
 
A
G
 
G
M
 
L
P
 
P
L
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
A
S
 
C
R
 
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
M
 
T
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
A
 
A
N
 
N
G
 
G
S
 
E
D
 
T
I
 
I
E
 
E
A
 
D
T
 
T
V
 
I
D
 
A
E
 
E
V
 
A
L
 
V
R
 
K
Y
 
Y
K
 
K
E
 
A
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
R
 
K
A
 
A
V
 
I
R
 
R
A
 
L
Q
 
Q
S
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
L
 
L
N
 
A
K
 
S
V
 
T
Y
|
Y
G
 
G
V
 
V
S
 
S
S
 
K
D
 
D
R
 
K
L
 
M
F
 
F
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
A
 
N
S
 
D
L
 
L
P
 
P
S
 
T
E
 
E
H
 
N
D
 
I
W
 
W
S
 
S
T
 
T
E
 
A
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
D
 
N
H
 
S
T
 
V
P
 
P
R
 
K
L
 
L
F
 
F
E
 
E
K
 
R
V
 
A
R
 
R
D
 
E
A
 
V
A
 
L
G
 
G
W
 
W
D
 
D
L
 
V
H
 
H
L
 
L
L
 
L
H
 
H
D
|
D
V
 
V
H
|
H
H
 
H
R
 
R
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
K
S
 
D
L
 
L
E
 
E
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
L
 
L
F
 
F
W
 
W
M
 
L
E
|
E
D
 
D
A
 
S
T
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
E
H
 
N
Q
 
Q
E
 
A
S
 
G
F
 
F
R
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
T
 
T
T
 
T
T
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
|
G
E
|
E
V
x
I
F
 
F
N
 
A
T
 
H
I
 
V
W
 
W
D
 
D
C
 
A
K
 
K
T
 
Q
L
 
L
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
R
 
R
A
 
A
T
|
T
V
 
V
V
 
L
H
 
H
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
T
H
 
N
L
 
L
R
 
K
R
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
D
M
 
L
H
 
H
Q
 
H
V
 
V
R
 
K
T
 
T
G
 
G
S
 
C
H
|
H
G
 
G
A
|
A
T
 
T
D
|
D
L
 
L
S
 
S
P
 
P
V
 
V
C
 
T
M
 
M
G
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
H
 
H
F
 
F
D
 
D
L
 
M
W
 
S
V
 
I
P
 
T
N
 
N
F
 
F
G
 
G
I
 
L
Q
 
Q
E
|
E
Y
 
Y
M
 
M
R
 
R
H
 
H
S
 
T
E
 
P
Q
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
A
V
 
V
F
 
F
P
 
P
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
F
 
F
A
 
S
N
 
D
G
 
G
M
 
M
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
G
 
G
D
 
D
A
 
K
P
 
P
G
 
G
H
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
D
 
D
E
 
E
T
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
K
Y
 
H
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
|
L
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
-
H
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
M
W
 
F
H
 
N
W
|
W

4gmeA Crystal structure of mannonate dehydratase (target efi-502209) from caulobacter crescentus cb15 complexed with magnesium and d-mannonate
69% identity, 100% coverage: 1:403/403 of query aligns to 2:403/403 of 4gmeA

query
sites
4gmeA
M
 
L
K
 
K
I
 
I
T
 
I
A
 
D
A
 
A
R
 
K
V
 
V
I
 
I
V
 
V
C
 
T
S
 
C
P
 
P
G
 
G
R
 
R
N
 
N
F
 
F
V
 
V
T
 
T
L
 
L
K
 
K
I
 
I
E
 
T
T
 
T
D
 
E
E
 
D
G
 
G
L
 
I
S
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
D
 
D
A
 
A
T
 
T
L
|
L
N
 
N
G
 
G
R
|
R
E
 
E
L
 
L
A
 
S
V
 
V
A
 
V
S
 
S
Y
 
F
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
H
 
H
V
 
M
A
 
V
P
 
P
C
 
S
L
 
L
I
 
I
G
 
G
R
 
R
D
 
D
P
 
A
H
 
H
Q
 
Q
V
 
I
E
 
E
D
 
D
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
Y
 
F
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
A
 
S
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
R
 
G
G
 
G
P
 
P
V
 
V
T
 
A
M
 
M
S
 
T
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
M
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
G
K
 
K
A
 
V
A
 
A
G
 
G
M
 
L
P
 
P
L
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
A
S
 
C
R
 
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
M
x
T
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
A
 
A
N
 
N
G
 
G
S
 
E
D
 
T
I
 
I
E
 
E
A
 
D
T
 
T
V
 
I
D
 
A
E
 
E
V
 
A
L
 
V
R
 
K
Y
 
Y
K
 
K
E
 
A
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
R
 
K
A
 
A
V
 
I
R
|
R
A
 
L
Q
|
Q
S
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
L
 
L
N
 
A
K
 
S
V
 
T
Y
|
Y
G
 
G
V
 
V
S
 
S
S
 
K
D
 
D
R
 
K
L
 
M
F
 
F
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
A
 
N
S
 
D
L
 
L
P
 
P
S
 
T
E
 
E
H
 
N
D
 
I
W
 
W
S
 
S
T
 
T
E
 
A
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
D
 
N
H
 
S
T
 
V
P
 
P
R
 
K
L
 
L
F
 
F
E
 
E
K
 
R
V
 
A
R
 
R
D
 
E
A
 
V
A
 
L
G
 
G
W
 
W
D
 
D
L
 
V
H
 
H
L
 
L
L
 
L
H
 
H
D
|
D
V
 
V
H
|
H
H
 
H
R
 
R
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
K
S
 
D
L
 
L
E
 
E
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
L
 
L
F
 
F
W
 
W
M
 
L
E
|
E
D
 
D
A
 
S
T
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
E
H
 
N
Q
 
Q
E
 
A
S
 
G
F
 
F
R
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
T
 
T
T
 
T
T
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
|
G
E
|
E
V
x
I
F
 
F
N
 
A
T
 
H
I
 
V
W
 
W
D
 
D
C
 
A
K
 
K
T
 
Q
L
 
L
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
R
|
R
A
 
A
T
|
T
V
 
V
V
 
L
H
 
H
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
T
H
 
N
L
 
L
R
 
K
R
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
D
M
 
L
H
 
H
Q
 
H
V
 
V
R
 
K
T
 
T
G
 
G
S
 
C
H
|
H
G
 
G
A
|
A
T
 
T
D
 
D
L
 
L
S
 
S
P
 
P
V
 
V
C
 
T
M
 
M
G
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
H
 
H
F
 
F
D
 
D
L
 
M
W
 
S
V
 
I
P
 
T
N
 
N
F
 
F
G
 
G
I
 
L
Q
 
Q
E
|
E
Y
 
Y
M
 
M
R
 
R
H
 
H
S
 
T
E
 
P
Q
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
A
V
 
V
F
 
F
P
 
P
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
F
 
F
A
 
S
N
 
D
G
 
G
M
 
M
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
G
 
G
D
 
D
A
 
K
P
 
P
G
 
G
H
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
D
 
D
E
 
E
T
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
K
Y
 
H
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
-
H
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
M
W
 
F
H
 
N
W
|
W

Q9AAR4 D-mannonate dehydratase CC0532; ManD; EC 4.2.1.8 from Caulobacter vibrioides (strain ATCC 19089 / CB15) (Caulobacter crescentus) (see paper)
69% identity, 100% coverage: 1:403/403 of query aligns to 2:403/403 of Q9AAR4

query
sites
Q9AAR4
M
 
L
K
 
K
I
 
I
T
 
I
A
 
D
A
 
A
R
 
K
V
 
V
I
 
I
V
 
V
C
 
T
S
 
C
P
 
P
G
 
G
R
 
R
N
 
N
F
 
F
V
 
V
T
 
T
L
 
L
K
 
K
I
 
I
E
 
T
T
 
T
D
 
E
E
 
D
G
 
G
L
 
I
S
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
D
 
D
A
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
S
V
 
V
A
 
V
S
 
S
Y
 
F
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
H
 
H
V
 
M
A
 
V
P
 
P
C
 
S
L
 
L
I
 
I
G
 
G
R
 
R
D
 
D
P
 
A
H
 
H
Q
 
Q
V
 
I
E
 
E
D
 
D
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
Y
 
F
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
A
 
S
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
R
 
G
G
 
G
P
 
P
V
 
V
T
 
A
M
 
M
S
 
T
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
M
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
G
K
 
K
A
 
V
A
 
A
G
 
G
M
 
L
P
 
P
L
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
A
S
 
C
R
 
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
M
 
T
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
A
 
A
N
 
N
G
 
G
S
 
E
D
 
T
I
 
I
E
 
E
A
 
D
T
 
T
V
 
I
D
 
A
E
 
E
V
 
A
L
 
V
R
 
K
Y
 
Y
K
 
K
E
 
A
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
R
 
K
A
 
A
V
 
I
R
 
R
A
 
L
Q
 
Q
S
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
L
 
L
N
 
A
K
 
S
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
S
 
S
S
 
K
D
 
D
R
 
K
L
 
M
F
 
F
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
A
 
N
S
 
D
L
 
L
P
 
P
S
 
T
E
 
E
H
 
N
D
 
I
W
 
W
S
 
S
T
 
T
E
 
A
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
D
 
N
H
 
S
T
 
V
P
 
P
R
 
K
L
 
L
F
 
F
E
 
E
K
 
R
V
 
A
R
 
R
D
 
E
A
 
V
A
 
L
G
 
G
W
 
W
D
 
D
L
 
V
H
 
H
L
 
L
L
 
L
H
 
H
D
|
D
V
 
V
H
 
H
H
 
H
R
 
R
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
K
S
 
D
L
 
L
E
 
E
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
L
 
L
F
 
F
W
 
W
M
 
L
E
|
E
D
 
D
A
 
S
T
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
E
H
 
N
Q
 
Q
E
 
A
S
 
G
F
 
F
R
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
T
 
T
T
 
T
T
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
E
|
E
V
 
I
F
 
F
N
 
A
T
 
H
I
 
V
W
 
W
D
 
D
C
 
A
K
 
K
T
 
Q
L
 
L
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
R
 
R
A
 
A
T
 
T
V
 
V
V
 
L
H
 
H
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
T
H
 
N
L
 
L
R
 
K
R
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
D
M
 
L
H
 
H
Q
 
H
V
 
V
R
 
K
T
 
T
G
 
G
S
 
C
H
 
H
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
D
L
 
L
S
 
S
P
 
P
V
 
V
C
 
T
M
 
M
G
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
H
 
H
F
 
F
D
 
D
L
 
M
W
 
S
V
 
I
P
 
T
N
 
N
F
 
F
G
 
G
I
 
L
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
M
 
M
R
 
R
H
 
H
S
 
T
E
 
P
Q
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
A
V
 
V
F
 
F
P
 
P
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
F
 
F
A
 
S
N
 
D
G
 
G
M
 
M
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
G
 
G
D
 
D
A
 
K
P
 
P
G
 
G
H
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
D
 
D
E
 
E
T
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
K
Y
 
H
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
-
H
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
M
W
 
F
H
 
N
W
 
W

B3PDB1 D-galactonate dehydratase family member RspA; D-mannonate dehydratase; Starvation sensing protein RspA homolog; EC 4.2.1.-; EC 4.2.1.8 from Cellvibrio japonicus (strain Ueda107) (Pseudomonas fluorescens subsp. cellulosa) (see paper)
71% identity, 100% coverage: 1:403/403 of query aligns to 1:402/402 of B3PDB1

query
sites
B3PDB1
M
 
M
K
 
K
I
 
I
T
 
V
A
 
D
A
 
A
R
 
K
V
 
V
I
 
I
V
 
V
C
 
T
S
 
C
P
 
P
G
 
G
R
 
R
N
 
N
F
 
F
V
 
V
T
 
T
L
 
L
K
 
K
I
 
I
E
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
Q
G
 
G
L
 
I
S
 
Y
G
 
G
I
 
I
G
 
G
D
 
D
A
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
R
E
 
E
L
 
K
A
 
S
V
 
V
A
 
V
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
D
 
D
H
 
Y
V
 
L
A
 
I
P
 
P
C
 
V
L
 
L
I
 
I
G
 
G
R
 
R
D
 
D
P
 
P
H
 
Q
Q
 
Q
V
 
I
E
 
E
D
 
D
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
Y
 
F
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
R
 
R
G
 
G
P
 
P
V
 
V
T
 
G
M
 
M
S
 
T
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
I
D
 
D
T
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
L
A
 
A
G
 
N
M
 
M
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
R
 
R
T
 
E
G
 
R
V
 
I
M
 
L
V
 
S
Y
 
Y
G
 
T
H
 
H
A
 
A
N
 
N
G
 
G
S
 
K
D
 
D
I
 
L
E
 
D
A
 
S
T
 
T
V
 
L
D
 
E
E
 
A
V
 
V
L
 
R
R
 
K
Y
 
A
K
 
K
E
 
D
L
 
K
G
 
G
Y
 
Y
R
 
K
A
 
A
V
 
I
R
 
R
A
 
V
Q
 
Q
S
 
C
G
 
G
V
 
I
P
 
P
G
 
G
L
 
I
N
 
A
K
 
K
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
S
 
S
S
 
T
D
 
N
R
 
T
L
 
K
F
 
S
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
A
 
A
S
 
D
L
 
L
P
 
P
S
 
S
E
 
V
H
 
E
D
 
V
W
 
W
S
 
S
T
 
T
E
 
E
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
T
 
I
P
 
P
R
 
D
L
 
V
F
 
F
E
 
A
K
 
A
V
 
V
R
 
R
D
 
K
A
 
E
A
 
F
G
 
G
W
 
P
D
 
D
L
 
I
H
 
H
L
 
L
L
 
L
H
 
H
D
|
D
V
 
V
H
 
H
H
 
H
R
 
R
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
K
S
 
A
L
 
L
E
 
E
P
 
P
F
 
Y
R
 
H
L
 
L
F
 
F
W
 
W
M
 
M
E
|
E
D
 
D
A
 
A
T
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
E
H
 
N
Q
 
Q
E
 
E
S
 
S
F
 
F
R
 
K
L
 
L
I
 
I
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
T
 
T
T
 
T
T
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
E
|
E
V
 
V
F
 
F
N
 
N
T
 
S
I
 
I
W
 
H
D
 
D
C
 
C
K
 
R
T
 
E
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
E
 
N
Q
 
Q
L
 
W
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
R
 
R
A
 
T
T
 
T
V
 
I
V
 
V
H
 
H
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
S
H
 
Q
L
 
M
R
 
R
R
 
R
I
 
I
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
A
A
 
S
M
 
L
H
 
F
Q
 
H
V
 
V
R
 
R
T
 
T
G
 
G
S
 
F
H
 
H
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
D
L
 
L
S
 
S
P
 
P
V
 
V
C
 
C
M
 
M
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
H
 
H
F
 
F
D
 
D
L
 
Y
W
 
W
V
 
V
P
 
P
N
 
N
F
 
F
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
H
M
 
M
R
 
A
H
 
H
S
 
S
E
 
E
Q
 
Q
T
 
M
D
 
N
A
 
A
V
 
V
F
 
F
P
 
P
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
F
 
F
A
 
N
N
 
D
G
 
G
M
 
Y
L
 
F
Y
 
T
P
 
P
G
 
G
D
 
E
A
 
K
P
 
P
G
 
G
H
 
H
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
D
 
D
E
 
E
T
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
Y
 
C
L
 
L
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
-
H
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
L
W
 
W
H
 
H
W
 
W

3v3wA Crystal structure of an enolase from the soil bacterium cellvibrio japonicus (target efi-502161) with bound mg and glycerol
71% identity, 100% coverage: 1:403/403 of query aligns to 1:397/397 of 3v3wA

query
sites
3v3wA
M
 
M
K
 
K
I
 
I
T
 
V
A
 
D
A
 
A
R
 
K
V
 
V
I
 
I
V
 
V
C
 
T
S
 
C
P
 
P
G
 
G
R
 
R
N
 
N
F
 
F
V
 
V
T
 
T
L
 
L
K
 
K
I
 
I
E
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
Q
G
 
G
L
 
I
S
 
Y
G
 
G
I
 
I
G
 
G
D
 
D
A
 
A
T
 
T
L
|
L
N
 
N
G
 
G
R
|
R
E
 
E
L
 
K
A
 
S
V
 
V
A
 
V
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
D
 
D
H
 
Y
V
 
L
A
 
I
P
 
P
C
 
V
L
 
L
I
 
I
G
 
G
R
 
R
D
 
D
P
 
P
H
 
Q
Q
 
Q
V
 
I
E
 
E
D
 
D
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
Y
 
F
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
R
 
R
G
 
G
P
 
P
V
 
V
T
 
G
M
 
M
S
 
T
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
I
D
 
D
T
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
L
A
 
A
G
 
N
M
 
M
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
R
 
R
T
 
E
G
 
R
V
 
I
M
 
L
V
 
S
Y
 
Y
G
 
T
H
|
H
A
 
A
N
 
N
G
 
G
S
 
K
D
 
D
I
 
L
E
 
D
A
 
S
T
 
T
V
 
L
D
 
E
E
 
A
V
 
V
L
 
R
R
 
K
Y
 
A
K
 
K
E
 
D
L
 
K
G
 
G
Y
 
Y
R
x
K
A
 
A
V
 
I
R
|
R
A
 
V
Q
|
Q
S
 
C
G
 
G
V
 
I
P
 
P
G
 
G
L
 
I
N
 
A
K
 
K
V
 
T
Y
|
Y
G
 
G
V
 
V
S
 
S
S
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
F
 
-
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
A
 
A
S
 
D
L
 
L
P
 
P
S
 
S
E
 
V
H
 
E
D
 
V
W
 
W
S
 
S
T
 
T
E
|
E
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
T
 
I
P
 
P
R
 
D
L
 
V
F
 
F
E
 
A
K
 
A
V
 
V
R
 
R
D
 
K
A
 
E
A
 
F
G
 
G
W
 
P
D
 
D
L
 
I
H
 
H
L
 
L
L
 
L
H
 
H
D
|
D
V
 
V
H
|
H
H
 
H
R
 
R
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
K
S
 
A
L
 
L
E
 
E
P
 
P
F
 
Y
R
 
H
L
 
L
F
 
F
W
 
W
M
 
M
E
|
E
D
 
D
A
 
A
T
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
E
H
 
N
Q
 
Q
E
 
E
S
 
S
F
 
F
R
 
K
L
 
L
I
 
I
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
T
 
T
T
 
T
T
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
|
G
E
|
E
V
|
V
F
 
F
N
 
N
T
 
S
I
 
I
W
 
H
D
 
D
C
 
C
K
 
R
T
 
E
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
E
 
N
Q
 
Q
L
 
W
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
R
|
R
A
 
T
T
|
T
V
 
I
V
 
V
H
 
H
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
S
H
 
Q
L
 
M
R
 
R
R
 
R
I
 
I
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
A
A
 
S
M
 
L
H
 
F
Q
 
H
V
 
V
R
 
R
T
 
T
G
 
G
S
x
F
H
|
H
G
|
G
A
|
A
T
 
T
D
 
D
L
 
L
S
 
S
P
 
P
V
 
V
C
 
C
M
 
M
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
H
 
H
F
 
F
D
 
D
L
 
Y
W
 
W
V
 
V
P
 
P
N
 
N
F
 
F
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
E
|
E
Y
 
H
M
 
M
R
 
A
H
 
H
S
 
S
E
 
E
Q
 
Q
T
 
M
D
 
N
A
 
A
V
 
V
F
 
F
P
 
P
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
F
 
F
A
 
N
N
 
D
G
 
G
M
 
Y
L
 
F
Y
 
T
P
 
P
G
 
G
D
 
E
A
 
K
P
 
P
G
 
G
H
 
H
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
D
 
D
E
 
E
T
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
Y
 
C
L
 
L
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
-
H
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
L
W
 
W
H
 
H
W
|
W

2qjjA Crystal structure of d-mannonate dehydratase from novosphingobium aromaticivorans (see paper)
73% identity, 100% coverage: 1:403/403 of query aligns to 1:402/402 of 2qjjA

query
sites
2qjjA
M
 
M
K
 
K
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
V
I
 
I
V
 
I
C
 
T
S
 
C
P
 
P
G
 
G
R
 
R
N
 
N
F
 
F
V
 
V
T
 
T
L
 
L
K
 
K
I
 
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
E
 
Q
G
 
G
L
 
V
S
 
Y
G
 
G
I
 
I
G
 
G
D
 
D
A
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
S
V
 
V
A
 
V
S
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
Q
D
 
E
H
 
H
V
 
V
A
 
A
P
 
P
C
 
C
L
 
L
I
 
I
G
 
G
R
 
M
D
 
D
P
 
P
H
 
R
Q
 
R
V
 
I
E
 
E
D
 
D
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
V
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
R
 
R
G
 
G
P
 
P
V
 
V
T
 
T
M
 
M
S
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
M
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
M
A
 
A
G
 
G
M
 
M
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
R
S
 
S
R
 
R
T
 
D
G
 
G
V
 
I
M
 
M
V
 
V
Y
 
Y
G
|
G
H
 
H
A
 
A
N
 
N
G
 
G
S
 
S
D
 
D
I
 
I
E
 
A
A
 
E
T
 
T
V
 
V
D
 
E
E
 
A
V
 
V
L
 
G
R
 
H
Y
 
Y
K
 
I
E
 
D
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
R
 
K
A
 
A
V
 
I
R
|
R
A
 
A
Q
|
Q
S
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
L
 
I
N
 
K
K
 
D
V
 
A
Y
|
Y
G
 
G
V
 
V
S
 
G
S
 
R
D
 
G
R
 
K
L
 
L
F
 
Y
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
A
 
A
S
 
S
L
 
L
P
 
P
S
 
S
E
 
V
H
 
T
D
 
G
W
 
W
S
 
D
T
 
T
E
 
R
R
 
K
Y
 
A
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
T
 
V
P
 
P
R
 
K
L
 
L
F
 
F
E
 
E
K
 
E
V
 
L
R
 
R
D
 
K
A
 
T
A
 
Y
G
 
G
W
 
F
D
 
D
L
 
H
H
 
H
L
 
L
L
 
L
H
 
H
D
|
D
V
 
G
H
|
H
H
 
H
R
 
R
L
 
Y
T
 
T
P
 
P
I
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
N
L
 
L
G
 
G
K
 
K
S
 
M
L
 
L
E
 
E
P
 
P
F
 
Y
R
 
Q
L
 
L
F
 
F
W
 
W
M
 
L
E
|
E
D
 
D
A
 
C
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
H
 
N
Q
 
Q
E
 
E
S
 
A
F
 
F
R
 
R
L
 
L
I
 
V
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
T
 
T
T
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
|
G
E
|
E
V
 
I
F
 
F
N
 
N
T
 
T
I
 
I
W
 
W
D
 
D
C
 
A
K
 
K
T
 
D
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
E
 
N
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
R
|
R
A
 
A
T
|
T
V
 
V
V
 
V
H
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
L
T
 
T
H
 
H
L
 
L
R
 
R
R
 
R
I
 
I
A
 
A
D
 
D
F
 
L
A
 
A
A
 
S
M
 
L
H
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
R
 
R
T
 
T
G
 
G
S
 
C
H
|
H
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
D
L
 
L
S
 
S
P
 
P
V
 
V
C
 
T
M
 
M
G
 
G
A
 
C
A
 
A
L
 
L
H
 
H
F
 
F
D
 
D
L
 
T
W
 
W
V
 
V
P
 
P
N
 
N
F
 
F
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
E
|
E
Y
 
Y
M
 
M
R
 
R
H
 
H
S
 
T
E
 
E
Q
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
A
V
 
V
F
 
F
P
 
P
H
 
H
A
 
D
Y
 
Y
T
 
W
F
 
F
A
 
E
N
 
K
G
 
G
M
 
E
L
 
L
Y
 
F
P
 
V
G
 
G
D
 
E
A
 
T
P
 
P
G
 
G
H
 
H
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
D
 
D
E
 
E
T
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
K
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
K
R
 
P
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
V
 
V
N
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
-
H
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
M
W
 
W
H
 
N
W
|
W

A4XF23 D-mannonate dehydratase; ManD; RspA homolog; EC 4.2.1.8 from Novosphingobium aromaticivorans (strain ATCC 700278 / DSM 12444 / CCUG 56034 / CIP 105152 / NBRC 16084 / F199) (see 2 papers)
73% identity, 100% coverage: 1:403/403 of query aligns to 1:402/402 of A4XF23

query
sites
A4XF23
M
 
M
K
 
K
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
V
I
 
I
V
 
I
C
 
T
S
 
C
P
 
P
G
 
G
R
 
R
N
 
N
F
 
F
V
 
V
T
 
T
L
 
L
K
 
K
I
 
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
E
 
Q
G
 
G
L
 
V
S
 
Y
G
 
G
I
 
I
G
 
G
D
 
D
A
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
S
V
 
V
A
 
V
S
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
Q
D
 
E
H
 
H
V
 
V
A
 
A
P
 
P
C
 
C
L
 
L
I
 
I
G
 
G
R
 
M
D
 
D
P
 
P
H
 
R
Q
 
R
V
 
I
E
 
E
D
 
D
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
V
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
R
 
R
G
 
G
P
 
P
V
 
V
T
 
T
M
 
M
S
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
M
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
M
A
 
A
G
 
G
M
 
M
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
R
S
 
S
R
 
R
T
 
D
G
 
G
V
 
I
M
 
M
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
A
 
A
N
 
N
G
 
G
S
 
S
D
 
D
I
 
I
E
 
A
A
 
E
T
 
T
V
 
V
D
 
E
E
 
A
V
 
V
L
 
G
R
 
H
Y
 
Y
K
 
I
E
 
D
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
R
 
K
A
 
A
V
 
I
R
|
R
A
 
A
Q
 
Q
S
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
L
 
I
N
 
K
K
 
D
V
 
A
Y
|
Y
G
 
G
V
|
V
S
x
G
S
x
R
D
x
G
R
x
K
L
|
L
F
x
Y
Y
|
Y
E
|
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
A
 
A
S
 
S
L
 
L
P
 
P
S
 
S
E
 
V
H
 
T
D
 
G
W
 
W
S
 
D
T
 
T
E
 
R
R
 
K
Y
 
A
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
T
 
V
P
 
P
R
 
K
L
 
L
F
 
F
E
 
E
K
 
E
V
 
L
R
 
R
D
 
K
A
 
T
A
 
Y
G
 
G
W
 
F
D
 
D
L
 
H
H
 
H
L
 
L
L
 
L
H
 
H
D
|
D
V
 
G
H
|
H
H
 
H
R
 
R
L
 
Y
T
 
T
P
 
P
I
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
N
L
 
L
G
 
G
K
 
K
S
 
M
L
 
L
E
 
E
P
 
P
F
 
Y
R
 
Q
L
 
L
F
 
F
W
 
W
M
 
L
E
|
E
D
 
D
A
 
C
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
H
 
N
Q
 
Q
E
 
E
S
 
A
F
 
F
R
 
R
L
 
L
I
 
V
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
T
 
T
T
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
E
|
E
V
 
I
F
 
F
N
 
N
T
 
T
I
 
I
W
 
W
D
 
D
C
 
A
K
|
K
T
 
D
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
E
 
N
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
R
|
R
A
 
A
T
 
T
V
 
V
V
 
V
H
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
L
T
 
T
H
 
H
L
 
L
R
 
R
R
 
R
I
 
I
A
 
A
D
 
D
F
 
L
A
 
A
A
 
S
M
 
L
H
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
R
 
R
T
 
T
G
 
G
S
 
C
H
|
H
G
 
G
A
|
A
T
 
T
D
 
D
L
 
L
S
 
S
P
 
P
V
 
V
C
 
T
M
 
M
G
 
G
A
 
C
A
 
A
L
 
L
H
 
H
F
 
F
D
 
D
L
 
T
W
 
W
V
 
V
P
 
P
N
 
N
F
 
F
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
E
|
E
Y
 
Y
M
 
M
R
 
R
H
 
H
S
 
T
E
 
E
Q
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
A
V
 
V
F
 
F
P
 
P
H
 
H
A
 
D
Y
 
Y
T
 
W
F
 
F
A
 
E
N
 
K
G
 
G
M
 
E
L
 
L
Y
 
F
P
 
V
G
 
G
D
 
E
A
 
T
P
 
P
G
 
G
H
 
H
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
D
 
D
E
 
E
T
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
K
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
K
R
 
P
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
V
 
V
N
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
-
H
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
M
W
 
W
H
 
N
W
 
W

C6D9S0 D-galactonate dehydratase family member PC1_0802; D-mannonate dehydratase; EC 4.2.1.-; EC 4.2.1.8 from Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum (strain PC1) (see paper)
70% identity, 100% coverage: 1:403/403 of query aligns to 1:404/404 of C6D9S0

query
sites
C6D9S0
M
 
M
K
 
K
I
 
I
T
 
V
A
 
S
A
 
A
R
 
E
V
 
V
I
 
F
V
 
V
C
 
T
S
 
C
P
 
P
G
 
G
R
 
R
N
 
N
F
 
F