SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SM_b20173 FitnessBrowser__Smeli:SM_b20173 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6oc6A Lanthanide-dependent methanol dehydrogenase xoxf from methylobacterium extorquens, in complex with lanthanum and pyrroloquinoline quinone (see paper)
78% identity, 96% coverage: 23:601/601 of query aligns to 1:579/579 of 6oc6A

query
sites
6oc6A
N
 
N
D
 
E
E
 
S
L
 
V
Q
 
L
K
 
K
L
 
G
I
 
V
D
 
A
D
 
N
P
 
P
N
 
A
Q
 
E
W
 
Q
A
 
V
I
 
L
Q
 
Q
T
 
T
G
 
V
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
L
 
T
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
K
 
K
L
 
L
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
K
 
A
D
 
S
N
 
N
V
 
V
G
 
K
K
 
N
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
W
 
W
T
 
T
F
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
S
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
N
L
 
I
M
 
M
Y
 
Y
V
 
V
H
 
H
T
 
T
P
 
P
F
 
F
P
 
P
N
 
N
T
 
I
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
D
K
 
Q
D
 
G
G
 
A
Q
 
K
I
 
I
V
 
V
W
 
W
K
 
K
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
K
 
K
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
N
 
S
V
 
V
I
 
I
P
 
P
V
 
V
M
 
M
C
|
C
C
|
C
D
 
D
T
 
T
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
N
 
G
K
 
A
I
 
I
F
 
L
L
 
L
H
 
H
Q
 
Q
A
 
A
D
 
D
T
 
T
T
 
T
V
 
L
V
 
V
A
 
S
L
 
L
D
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
N
W
 
W
S
 
S
V
 
V
K
 
K
N
 
N
G
 
G
D
 
D
A
 
P
T
 
S
K
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
N
 
N
T
|
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
M
 
L
P
 
P
V
 
V
K
 
K
D
 
D
K
 
K
I
 
V
L
 
I
V
 
V
G
 
G
I
 
I
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
G
 
C
H
 
H
V
 
V
T
 
T
A
 
A
Y
 
Y
S
 
D
M
 
L
A
 
K
D
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
K
L
 
V
W
 
W
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
M
 
I
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
D
D
 
Q
T
 
L
L
 
I
I
 
V
D
 
D
P
 
P
E
 
E
K
 
K
T
 
T
T
 
T
H
 
S
L
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
I
G
 
G
K
 
K
D
 
D
S
 
S
G
 
S
L
 
L
T
 
K
T
 
T
W
 
W
E
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
Q
W
 
W
K
 
K
I
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
C
T
 
T
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
F
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
K
E
 
L
N
 
D
L
 
L
V
 
M
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
G
 
G
N
|
N
P
 
P
S
 
S
T
 
T
W
 
W
N
 
N
P
 
P
T
 
K
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
R
 
K
W
 
W
S
 
S
M
 
M
T
 
T
I
 
I
F
 
W
A
 
A
R
 
R
D
 
N
V
 
P
D
 
D
T
 
T
G
 
G
M
 
M
A
 
A
K
 
K
W
 
W
L
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
F
D
|
D
G
 
G
V
 
I
N
 
N
E
 
E
M
 
M
I
 
I
L
 
L
T
 
T
E
 
D
Q
 
Q
Q
 
K
I
 
F
D
 
D
G
 
G
K
 
K
D
 
D
R
 
R
K
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
H
F
 
F
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
M
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
A
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
K
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
T
 
V
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
A
T
 
T
E
 
K
V
 
V
V
 
D
M
 
L
D
 
D
P
 
K
K
 
G
S
 
S
D
 
K
K
 
T
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
P
 
P
Q
 
L
V
 
V
V
 
V
A
 
S
Q
 
K
Y
 
Y
S
 
S
T
 
T
E
 
E
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
E
 
E
D
 
D
T
 
V
N
 
N
T
 
S
T
 
K
G
 
G
V
 
I
C
 
C
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
T
 
T
K
 
K
D
|
D
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
A
 
A
Y
 
F
S
 
S
P
 
P
K
 
K
T
 
T
E
 
G
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
T
 
T
N
 
N
H
 
H
V
 
V
C
 
C
M
 
M
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
F
 
F
R
 
R
V
 
V
S
 
T
Y
 
Y
T
 
T
A
 
P
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
S
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
P
 
A
K
 
P
D
 
G
S
 
S
H
 
H
G
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
N
 
N
F
 
F
I
 
I
A
 
A
W
 
W
D
 
D
N
 
N
K
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
I
K
 
K
W
 
W
S
 
S
L
 
N
P
 
P
E
 
E
P
 
Q
F
 
F
S
 
S
V
 
A
W
|
W
S
 
G
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
V
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
E
G
 
G
Y
 
F
L
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
S
A
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
R
 
K
F
 
F
K
 
K
T
 
T
P
 
P
S
 
S
G
 
G
V
 
I
I
 
I
G
 
G
N
 
N
V
 
V
M
 
M
T
 
T
Y
 
Y
A
 
E
R
 
H
E
 
K
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
H
V
 
V
A
 
A
V
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
|
G
W
|
W
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
T
N
 
D
P
 
P
T
 
N
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
S
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
S
N
 
S
Y
 
Y
T
 
T
A
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
Q
L
 
L
T
 
T
V
 
V
F
 
F
K
 
S
L
 
L
P
 
P
E
 
N

6damA Crystal structure of lanthanide-dependent methanol dehydrogenase xoxf from methylomicrobium buryatense 5g (see paper)
66% identity, 96% coverage: 23:600/601 of query aligns to 1:562/563 of 6damA

query
sites
6damA
N
 
N
D
 
S
E
 
E
L
 
V
Q
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
T
D
 
K
D
 
N
P
 
P
N
 
A
Q
 
N
W
 
W
A
 
A
I
 
T
Q
 
W
T
 
G
G
 
G
D
 
N
Y
 
Y
A
 
H
N
 
G
L
 
T
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
K
 
E
L
 
L
D
 
K
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
K
 
T
D
 
S
N
 
N
V
 
V
G
 
K
K
 
N
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
A
 
A
W
 
W
T
 
T
F
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
S
 
G
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
N
D
 
D
L
 
V
M
 
M
Y
 
Y
V
 
I
H
 
H
T
 
T
P
 
P
F
 
F
P
 
P
N
 
N
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
I
D
 
D
L
 
-
S
 
Q
K
 
K
D
 
T
G
 
Q
Q
 
A
I
 
V
V
 
I
W
 
W
K
 
E
Y
 
Y
E
 
T
P
 
P
K
 
Q
Q
 
Q
D
 
D
P
 
A
N
 
D
V
 
V
-
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
V
M
 
M
C
|
C
C
|
C
D
 
D
T
 
T
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
G
D
 
D
N
 
G
K
 
K
I
 
I
F
 
F
L
 
L
H
 
Q
Q
 
Q
A
 
S
D
 
D
T
 
T
T
 
V
V
 
L
V
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
R
I
 
V
W
 
W
S
 
S
V
 
V
K
 
Q
N
 
N
G
 
G
D
 
D
A
 
P
T
 
K
K
 
L
G
 
G
E
 
M
T
 
T
N
 
N
T
|
T
A
 
Q
T
 
A
V
 
P
M
 
L
P
 
V
V
 
V
K
 
K
D
 
D
K
 
K
I
 
V
L
 
I
V
 
T
G
 
G
I
 
I
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
H
 
F
V
 
L
T
 
A
A
 
A
Y
 
Y
S
 
N
M
 
I
A
 
R
D
 
T
G
 
G
K
 
E
V
 
L
L
 
D
W
 
W
R
 
K
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
M
 
M
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
L
I
 
I
D
 
N
P
 
P
E
 
T
K
 
K
T
 
T
T
 
T
H
 
T
L
 
W
G
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
V
K
 
Q
P
 
P
V
 
V
G
 
G
K
 
K
D
 
D
S
 
S
G
 
S
L
 
T
T
 
S
T
 
T
W
 
W
E
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
Q
W
 
W
K
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
T
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
E
E
 
L
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
G
 
G
N
|
N
P
 
P
S
 
S
T
 
T
W
 
W
N
 
N
P
 
P
T
 
A
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
R
 
K
W
 
W
S
 
S
M
 
M
T
 
S
I
 
L
F
 
W
A
 
A
R
 
R
D
 
N
V
 
A
D
 
D
T
 
T
G
 
G
M
 
E
A
 
V
K
 
K
W
 
W
L
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
|
D
G
 
G
V
 
I
N
 
N
E
 
E
M
 
V
I
 
A
L
 
L
T
 
V
E
 
D
Q
 
Q
Q
 
E
I
 
I
D
 
K
G
 
G
K
 
Q
D
 
M
R
 
R
K
 
K
L
 
T
L
 
A
T
 
V
H
 
H
F
 
F
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
M
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
K
Y
 
F
D
 
D
P
 
K
T
 
A
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
A
T
 
S
E
 
H
V
 
V
V
 
D
M
 
M
D
 
-
P
 
-
K
 
-
S
 
-
D
 
-
K
 
K
Y
 
S
G
 
G
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
A
 
S
Q
 
Q
Y
 
Y
S
 
S
T
 
T
E
 
E
Q
 
Y
N
 
N
G
 
G
E
 
E
D
 
D
T
 
V
N
 
N
T
 
T
T
 
E
G
 
G
V
 
V
C
 
C
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
T
 
S
K
 
K
D
x
N
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
A
 
V
A
 
S
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
K
 
Q
T
 
T
E
 
G
L
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
V
 
I
P
 
S
T
 
G
N
 
N
H
 
H
V
 
V
C
 
C
M
 
M
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
F
 
F
R
 
E
V
 
V
S
 
E
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
S
M
 
M
Y
 
F
P
 
P
P
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
V
-
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
K
K
 
E
D
 
D
S
 
G
H
 
S
G
 
N
G
 
N
M
 
L
G
 
G
N
 
Q
F
 
F
I
 
T
A
 
A
W
 
W
D
 
D
N
 
A
K
 
T
E
 
T
G
 
G
K
 
K
I
 
I
K
 
I
W
 
W
S
 
S
L
 
N
P
 
K
E
 
E
P
 
Q
F
 
F
S
 
S
V
 
V
W
|
W
S
 
S
G
 
G
A
 
S
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
D
 
G
V
 
V
V
 
V
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
F
 
F
K
 
K
T
 
T
P
 
P
S
 
S
G
 
G
V
 
I
I
 
I
G
 
G
N
 
N
V
 
V
M
 
N
T
 
T
Y
 
W
A
 
E
R
 
Y
E
 
E
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
A
 
G
V
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
|
G
W
|
W
A
 
-
G
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
N
 
-
P
 
-
T
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
A
 
S
L
 
L
S
 
S
N
 
S
Y
 
Y
T
 
T
A
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
L
T
 
T
V
 
V
F
 
F
K
 
A
L
 
L
P
 
P

7ce5A Methanol-pqq bound methanol dehydrogenase (mdh) from methylococcus capsulatus (bath) (see paper)
53% identity, 96% coverage: 23:599/601 of query aligns to 1:573/573 of 7ce5A

query
sites
7ce5A
N
 
N
D
 
S
E
 
E
L
 
L
Q
 
D
K
 
R
L
 
L
I
 
S
D
 
K
D
 
D
P
 
D
N
 
R
Q
 
N
W
 
W
A
 
V
I
 
M
Q
 
Q
T
 
T
G
 
K
D
 
D
Y
 
Y
A
 
S
N
 
A
L
 
T
R
 
H
Y
 
F
S
 
S
K
 
R
L
 
L
D
 
T
Q
 
E
I
 
I
N
 
N
K
 
S
D
 
H
N
 
N
V
 
V
G
 
K
K
 
N
L
 
L
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
W
 
W
T
 
T
F
 
L
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
T
L
 
L
R
 
H
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
S
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
D
D
 
G
L
 
I
M
 
M
Y
 
Y
V
 
I
H
 
H
T
 
T
P
 
P
F
 
F
P
 
P
N
 
N
T
 
N
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
V
D
 
D
L
 
L
S
 
N
K
 
D
D
 
T
G
 
R
Q
 
K
I
 
M
V
 
L
W
 
W
K
 
Q
Y
 
Y
E
 
K
P
 
P
K
 
K
Q
 
Q
D
 
N
P
 
P
N
 
A
V
 
A
I
 
R
P
 
A
V
 
V
M
 
A
C
|
C
C
|
C
D
 
D
T
 
V
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
V
D
 
P
N
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
H
-
 
G
-
 
P
-
 
A
K
 
K
I
 
I
F
 
F
L
 
L
H
 
N
Q
 
Q
A
 
L
D
 
D
T
 
G
T
 
H
V
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
N
A
 
A
K
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
E
V
 
E
I
 
I
W
 
W
S
 
K
V
 
M
K
 
E
N
 
N
G
 
S
D
 
D
A
 
I
T
 
A
K
 
M
G
 
G
E
 
S
T
 
T
N
 
L
T
|
T
A
 
G
T
 
A
V
 
P
M
 
F
P
 
V
V
 
V
K
 
K
D
 
D
K
 
K
I
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
I
 
S
S
x
A
G
|
G
G
x
A
E
|
E
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
H
 
Y
V
 
V
T
 
T
A
 
A
Y
 
Y
S
 
N
M
 
I
A
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
Q
L
 
E
W
 
W
R
 
R
G
 
A
Y
 
Y
S
 
A
M
 
T
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
E
D
 
D
T
 
L
L
 
L
I
 
L
D
 
D
P
 
K
E
 
D
-
 
F
-
 
N
-
 
K
K
 
D
T
 
N
T
 
P
H
 
H
L
 
Y
G
 
G
K
 
Q
P
 
-
V
 
-
G
 
-
K
 
F
D
 
G
S
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
S
T
 
T
W
 
W
E
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
W
 
W
K
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
N
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
S
 
A
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
K
E
 
L
N
 
D
L
 
M
V
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
G
 
G
N
|
N
P
 
P
S
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
E
T
 
T
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
R
 
K
W
 
W
S
 
T
M
 
M
T
 
T
I
 
I
F
 
W
A
 
G
R
 
R
D
 
D
V
 
A
D
 
D
T
 
T
G
 
G
M
 
R
A
 
A
K
 
K
W
 
F
L
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
N
E
 
Y
M
 
M
I
 
G
L
 
L
T
 
S
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
E
I
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
K
D
 
L
R
 
T
K
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
H
F
 
P
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
L
G
 
V
Y
 
Y
T
 
T
M
 
L
D
 
N
R
 
R
V
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
A
L
 
L
L
 
V
V
 
N
A
 
A
E
 
F
K
 
K
Y
 
I
D
 
D
P
 
D
T
 
T
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
V
T
 
K
E
 
K
V
 
V
V
 
D
M
 
L
D
 
-
P
 
-
K
 
-
S
 
-
D
 
-
K
 
K
Y
 
T
G
 
G
R
 
L
P
 
P
Q
 
I
V
 
R
V
 
D
A
 
P
Q
 
E
Y
 
Y
S
 
S
T
 
T
E
 
R
Q
 
M
N
 
-
G
 
-
E
 
-
D
 
D
T
 
H
N
 
N
T
 
A
T
 
K
G
 
G
V
 
I
C
 
C
P
 
P
A
 
S
A
 
A
L
 
M
G
 
G
T
 
Y
K
 
H
D
x
N
Q
 
Q
Q
 
G
P
 
I
A
 
E
A
 
S
Y
 
Y
S
 
D
P
 
P
K
 
D
T
 
K
E
 
K
L
 
L
F
 
F
Y
 
F
V
 
M
P
 
G
T
 
V
N
 
N
H
 
H
V
 
I
C
 
C
M
 
M
D
 
D
Y
 
W
E
 
E
P
 
P
F
 
F
R
 
M
V
 
L
S
 
P
Y
 
Y
T
 
R
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
N
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
-
 
G
P
 
P
K
 
K
D
 
-
S
 
-
H
 
-
G
 
G
G
 
M
M
 
L
G
 
G
N
 
Q
F
 
V
I
 
K
A
 
A
W
 
M
D
 
N
N
 
A
K
 
V
E
 
T
G
 
G
K
 
K
I
 
M
K
 
E
W
 
W
S
 
E
L
 
V
P
 
P
E
 
E
P
 
K
F
 
F
S
 
A
V
 
V
W
|
W
S
 
G
G
 
G
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
L
V
 
V
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
F
L
 
I
K
 
K
A
 
A
V
 
R
D
 
D
A
 
T
A
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
E
E
 
L
L
 
K
Y
 
W
R
 
Q
F
 
F
K
 
Q
T
 
L
P
 
P
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
N
 
H
V
 
P
M
 
I
T
 
T
Y
 
Y
A
 
Q
R
 
H
E
 
N
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
A
 
A
V
 
I
L
 
Y
S
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
|
G
W
|
W
A
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
V
A
 
F
G
 
D
L
 
L
T
 
K
N
 
D
P
 
P
T
 
T
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
A
Y
 
F
S
 
R
A
 
E
L
 
L
S
 
A
N
 
H
Y
 
Y
T
 
T
A
 
Q
L
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
L
 
V
T
 
F
V
 
V
F
 
F
K
 
S
L
 
L

7cdlC Holo-methanol dehydrogenase (mdh) with cys131-cys132 reduced from methylococcus capsulatus (bath) (see paper)
53% identity, 96% coverage: 23:599/601 of query aligns to 1:573/573 of 7cdlC

query
sites
7cdlC
N
 
N
D
 
S
E
 
E
L
 
L
Q
 
D
K
 
R
L
 
L
I
 
S
D
 
K
D
 
D
P
 
D
N
 
R
Q
 
N
W
 
W
A
 
V
I
 
M
Q
 
Q
T
 
T
G
 
K
D
 
D
Y
 
Y
A
 
S
N
 
A
L
 
T
R
 
H
Y
 
F
S
 
S
K
 
R
L
 
L
D
 
T
Q
 
E
I
 
I
N
 
N
K
 
S
D
 
H
N
 
N
V
 
V
G
 
K
K
 
N
L
 
L
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
W
 
W
T
 
T
F
 
L
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
T
L
 
L
R
 
H
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
S
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
D
D
 
G
L
 
I
M
 
M
Y
 
Y
V
 
I
H
 
H
T
 
T
P
 
P
F
 
F
P
 
P
N
 
N
T
 
N
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
V
D
 
D
L
 
L
S
 
N
K
 
D
D
 
T
G
 
R
Q
 
K
I
 
M
V
 
L
W
 
W
K
 
Q
Y
 
Y
E
 
K
P
 
P
K
 
K
Q
 
Q
D
 
N
P
 
P
N
 
A
V
 
A
I
 
R
P
 
A
V
 
V
M
 
A
C
 
C
C
 
C
D
 
D
T
 
V
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
V
D
 
P
N
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
H
-
 
G
-
 
P
-
 
A
K
 
K
I
 
I
F
 
F
L
 
L
H
 
N
Q
 
Q
A
 
L
D
 
D
T
 
G
T
 
H
V
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
N
A
 
A
K
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
E
V
 
E
I
 
I
W
 
W
S
 
K
V
 
M
K
 
E
N
 
N
G
 
S
D
 
D
A
 
I
T
 
A
K
 
M
G
 
G
E
 
S
T
 
T
N
 
L
T
|
T
A
 
G
T
 
A
V
 
P
M
 
F
P
 
V
V
 
V
K
 
K
D
 
D
K
 
K
I
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
I
 
S
S
x
A
G
 
G
G
x
A
E
|
E
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
H
 
Y
V
 
V
T
 
T
A
 
A
Y
 
Y
S
 
N
M
 
I
A
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
Q
L
 
E
W
 
W
R
 
R
G
 
A
Y
 
Y
S
 
A
M
 
T
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
E
D
 
D
T
 
L
L
 
L
I
 
L
D
 
D
P
 
K
E
 
D
-
 
F
-
 
N
-
 
K
K
 
D
T
 
N
T
 
P
H
 
H
L
 
Y
G
 
G
K
 
Q
P
 
-
V
 
-
G
 
-
K
 
F
D
 
G
S
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
S
T
 
T
W
 
W
E
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
W
 
W
K
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
N
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
S
 
A
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
K
E
 
L
N
 
D
L
 
M
V
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
G
 
G
N
|
N
P
 
P
S
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
E
T
 
T
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
R
 
K
W
 
W
S
 
T
M
 
M
T
 
T
I
 
I
F
 
W
A
 
G
R
 
R
D
 
D
V
 
A
D
 
D
T
 
T
G
 
G
M
 
R
A
 
A
K
 
K
W
 
F
L
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
N
E
 
Y
M
 
M
I
 
G
L
 
L
T
 
S
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
E
I
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
K
D
 
L
R
 
T
K
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
H
F
 
P
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
L
G
 
V
Y
 
Y
T
 
T
M
 
L
D
 
N
R
 
R
V
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
A
L
 
L
L
 
V
V
 
N
A
 
A
E
 
F
K
 
K
Y
 
I
D
 
D
P
 
D
T
 
T
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
V
T
 
K
E
 
K
V
 
V
V
 
D
M
 
L
D
 
-
P
 
-
K
 
-
S
 
-
D
 
-
K
 
K
Y
 
T
G
 
G
R
 
L
P
 
P
Q
 
I
V
 
R
V
 
D
A
 
P
Q
 
E
Y
 
Y
S
 
S
T
 
T
E
 
R
Q
 
M
N
 
-
G
 
-
E
 
-
D
 
D
T
 
H
N
 
N
T
 
A
T
 
K
G
 
G
V
 
I
C
 
C
P
 
P
A
 
S
A
 
A
L
 
M
G
 
G
T
 
Y
K
 
H
D
x
N
Q
 
Q
Q
 
G
P
 
I
A
 
E
A
 
S
Y
 
Y
S
 
D
P
 
P
K
 
D
T
 
K
E
 
K
L
 
L
F
 
F
Y
 
F
V
 
M
P
 
G
T
 
V
N
 
N
H
 
H
V
 
I
C
 
C
M
 
M
D
 
D
Y
 
W
E
 
E
P
 
P
F
 
F
R
 
M
V
 
L
S
 
P
Y
 
Y
T
 
R
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
N
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
-
 
G
P
 
P
K
 
K
D
 
-
S
 
-
H
 
-
G
 
G
G
 
M
M
 
L
G
 
G
N
 
Q
F
 
V
I
 
K
A
 
A
W
 
M
D
 
N
N
 
A
K
 
V
E
 
T
G
 
G
K
 
K
I
 
M
K
 
E
W
 
W
S
 
E
L
 
V
P
 
P
E
 
E
P
 
K
F
 
F
S
 
A
V
 
V
W
|
W
S
 
G
G
 
G
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
L
V
 
V
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
F
L
 
I
K
 
K
A
 
A
V
 
R
D
 
D
A
 
T
A
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
E
E
 
L
L
 
K
Y
 
W
R
 
Q
F
 
F
K
 
Q
T
 
L
P
 
P
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
N
 
H
V
 
P
M
 
I
T
 
T
Y
 
Y
A
 
Q
R
 
H
E
 
N
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
A
 
A
V
 
I
L
 
Y
S
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
|
G
W
|
W
A
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
V
A
 
F
G
 
D
L
 
L
T
 
K
N
 
D
P
 
P
T
 
T
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
A
Y
 
F
S
 
R
A
 
E
L
 
L
S
 
A
N
 
H
Y
 
Y
T
 
T
A
 
Q
L
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
L
 
V
T
 
F
V
 
V
F
 
F
K
 
S
L
 
L

4maeA Methanol dehydrogenase from methylacidiphilum fumariolicum solv (see paper)
54% identity, 96% coverage: 23:599/601 of query aligns to 1:576/577 of 4maeA

query
sites
4maeA
N
 
N
D
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
I
K
 
K
L
 
L
I
 
E
D
 
K
D
 
E
P
 
P
N
 
G
Q
 
Q
W
 
W
A
 
V
I
 
M
Q
 
Q
T
 
N
G
 
K
D
 
N
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
L
 
T
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
K
 
E
L
 
L
D
 
N
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
K
 
T
D
 
K
N
 
N
V
 
V
G
 
S
K
 
R
L
 
L
Q
 
R
V
 
L
A
 
A
W
 
W
T
 
S
F
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
S
 
G
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
T
L
 
T
M
 
M
Y
 
Y
V
 
V
H
 
H
T
 
S
P
 
A
F
 
Y
P
 
P
N
 
N
T
 
H
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
T
-
 
Q
K
 
K
D
 
P
G
 
Y
Q
 
A
I
 
I
V
 
K
W
 
W
K
 
Q
Y
 
Y
E
 
T
P
 
P
K
 
V
Q
 
Q
D
 
N
P
 
S
N
 
Q
V
 
A
I
 
V
P
 
A
V
 
V
M
 
A
C
|
C
C
|
C
D
 
D
T
 
V
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
D
 
N
N
 
G
K
 
K
I
 
I
F
 
F
L
 
M
H
 
T
Q
 
T
A
 
L
D
 
D
T
 
G
T
 
Q
V
 
I
V
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
K
 
N
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
E
I
 
L
W
 
W
S
 
K
V
 
M
K
 
K
N
 
H
G
 
A
D
 
D
A
 
V
T
 
T
K
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
N
 
I
T
|
T
A
 
G
T
 
A
V
 
P
M
 
L
P
 
V
V
 
V
K
 
K
D
 
D
K
 
K
I
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
I
 
V
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
H
 
R
V
 
V
T
 
G
A
 
A
Y
 
Y
S
 
D
M
 
I
A
 
N
D
 
T
G
 
G
K
 
N
V
 
R
L
 
V
W
 
W
R
 
L
G
 
A
Y
 
Y
S
 
S
M
 
Q
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
E
D
 
E
T
 
V
L
 
L
I
 
L
D
 
D
P
 
S
E
 
D
K
 
F
T
 
N
T
 
K
H
 
E
L
 
F
G
 
P
K
 
Q
P
 
H
V
 
G
G
 
G
K
 
P
D
 
G
S
 
D
G
 
G
L
 
T
T
 
K
T
 
T
W
 
W
E
 
P
G
 
G
D
 
E
Q
 
Q
W
 
W
K
 
K
I
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
T
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
A
E
 
L
N
 
D
L
 
L
V
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
G
 
S
N
|
N
P
 
P
S
 
G
T
 
T
W
 
W
N
 
N
P
 
A
T
 
E
Q
 
Q
R
 
R
P
 
K
-
 
G
G
 
G
D
 
D
N
 
N
R
 
K
W
 
W
S
 
S
M
 
C
T
 
T
I
 
I
F
 
F
A
 
A
R
 
R
D
 
R
V
 
P
D
 
D
T
 
T
G
 
G
M
 
K
A
 
A
K
 
R
W
 
W
L
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
 
W
D
 
D
E
 
S
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
|
D
G
 
G
V
 
V
N
 
N
E
 
E
M
 
M
I
 
I
L
 
L
T
 
P
E
 
D
Q
 
L
Q
 
T
I
 
V
D
 
K
G
 
G
K
 
K
D
 
K
R
 
T
K
 
P
L
 
C
L
 
L
T
 
V
H
 
H
F
 
F
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
T
 
V
M
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
L
 
L
L
 
I
V
 
E
A
 
A
E
 
Q
K
 
P
Y
 
F
D
 
-
P
 
V
T
 
Y
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
A
T
 
K
E
 
E
V
 
I
V
 
-
M
 
-
D
 
-
P
 
-
K
 
-
S
 
S
D
 
K
K
 
E
Y
 
N
G
 
D
R
 
R
P
 
P
Q
 
V
V
 
E
V
 
I
A
 
P
Q
 
E
Y
 
K
S
 
R
T
 
T
E
 
K
Q
 
Q
N
 
G
G
 
-
E
 
-
D
 
-
T
 
V
N
 
D
T
 
T
T
 
K
G
 
G
V
 
I
C
 
C
P
 
P
A
 
N
A
 
S
L
 
M
G
 
G
T
 
G
K
 
K
D
|
D
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
A
 
A
Y
 
F
S
 
S
P
 
P
K
 
Q
T
 
T
E
 
G
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
T
 
T
N
 
N
H
 
N
V
 
M
C
 
C
M
 
M
D
 
N
Y
 
Y
E
 
E
P
 
G
F
 
V
R
 
E
V
 
A
S
 
T
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
G
 
G
Q
 
A
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
N
L
 
V
S
 
L
M
 
M
Y
 
Y
P
 
S
-
 
G
-
 
H
-
 
E
P
 
G
K
 
K
D
 
D
S
 
D
H
 
Y
G
 
-
G
 
-
M
 
Y
G
 
G
N
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
C
W
 
Y
D
 
D
N
 
A
K
 
L
E
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
R
K
 
V
W
 
W
S
 
E
L
 
I
P
 
H
E
 
E
P
 
H
F
 
F
S
 
P
V
 
V
W
|
W
S
 
S
G
 
G
A
 
P
L
 
V
A
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
G
D
 
G
V
 
L
V
 
A
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
M
E
 
D
G
 
G
Y
 
W
L
 
F
K
 
K
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
I
A
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
E
 
V
L
 
L
Y
 
W
R
 
Q
F
 
Q
K
 
K
T
 
L
P
 
G
S
 
S
G
 
G
V
 
I
I
 
I
G
 
G
N
 
N
V
 
P
M
 
I
T
 
T
Y
 
F
-
 
L
A
 
G
R
 
P
E
 
D
G
 
K
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
V
 
V
L
 
Y
S
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
|
G
W
|
W
A
 
F
G
 
G
I
 
I
G
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
Q
G
 
N
L
 
L
T
 
P
-
 
P
-
 
D
N
 
D
P
 
P
T
 
Y
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
-
 
V
G
 
A
Y
 
Y
S
 
Q
A
 
A
-
 
G
L
 
L
S
 
P
N
 
K
Y
 
A
T
 
T
A
 
T
L
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
E
L
 
L
T
 
Y
V
 
V
F
 
F
K
 
A
L
 
L

6fkwA Europium-containing methanol dehydrogenase (see paper)
54% identity, 96% coverage: 23:599/601 of query aligns to 1:576/576 of 6fkwA

query
sites
6fkwA
N
 
N
D
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
I
K
 
K
L
 
L
I
 
E
D
 
K
D
 
E
P
 
P
N
 
G
Q
 
Q
W
 
W
A
 
V
I
 
M
Q
 
Q
T
 
N
G
 
K
D
 
N
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
L
 
T
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
K
 
E
L
 
L
D
 
N
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
K
 
T
D
 
K
N
 
N
V
 
V
G
 
S
K
 
R
L
 
L
Q
 
R
V
 
L
A
 
A
W
 
W
T
 
S
F
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
S
 
G
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
T
L
 
T
M
 
M
Y
 
Y
V
 
V
H
 
H
T
 
S
P
 
A
F
 
Y
P
 
P
N
 
N
T
 
H
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
T
-
 
Q
K
 
K
D
 
P
G
 
Y
Q
 
A
I
 
I
V
 
K
W
 
W
K
 
Q
Y
 
Y
E
 
T
P
 
P
K
 
V
Q
 
Q
D
 
N
P
 
S
N
 
Q
V
 
A
I
 
V
P
 
A
V
 
V
M
 
A
C
|
C
C
|
C
D
 
D
T
 
V
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
D
 
N
N
 
G
K
 
K
I
 
I
F
 
F
L
 
M
H
 
T
Q
 
T
A
 
L
D
 
D
T
 
G
T
 
Q
V
 
I
V
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
K
 
N
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
E
I
 
L
W
 
W
S
 
K
V
 
M
K
 
K
N
 
H
G
 
A
D
 
D
A
 
V
T
 
T
K
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
N
 
I
T
|
T
A
 
G
T
 
A
V
 
P
M
 
L
P
 
V
V
 
V
K
 
K
D
 
D
K
 
K
I
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
I
 
V
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
H
 
R
V
 
V
T
 
G
A
 
A
Y
 
Y
S
 
D
M
 
I
A
 
N
D
 
T
G
 
G
K
 
N
V
 
R
L
 
V
W
 
W
R
 
L
G
 
A
Y
 
Y
S
 
S
M
 
Q
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
E
D
 
E
T
 
V
L
 
L
I
 
L
D
 
D
P
 
S
E
 
D
K
 
F
T
 
N
T
 
K
H
 
E
L
 
F
G
 
P
K
 
Q
P
 
H
V
 
G
G
 
G
K
 
P
D
 
G
S
 
D
G
 
G
L
 
T
T
 
K
T
 
T
W
 
W
E
 
P
G
 
G
D
 
E
Q
 
Q
W
 
W
K
 
K
I
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
T
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
A
E
 
L
N
 
D
L
 
L
V
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
G
 
S
N
|
N
P
 
P
S
 
G
T
 
T
W
 
W
N
 
N
P
 
A
T
 
E
Q
 
Q
R
 
R
P
 
K
-
 
G
G
 
G
D
 
D
N
 
N
R
 
K
W
 
W
S
 
S
M
 
C
T
 
T
I
 
I
F
 
F
A
 
A
R
 
R
D
 
R
V
 
P
D
 
D
T
 
T
G
 
G
M
 
K
A
 
A
K
 
R
W
 
W
L
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
 
W
D
 
D
E
 
S
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
|
D
G
 
G
V
 
V
N
 
N
E
 
E
M
 
M
I
 
I
L
 
L
T
 
P
E
 
D
Q
 
L
Q
 
T
I
 
V
D
 
K
G
 
G
K
 
K
D
 
K
R
 
T
K
 
P
L
 
C
L
 
L
T
 
V
H
 
H
F
 
F
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
T
 
V
M
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
L
 
L
L
 
I
V
 
E
A
 
A
E
 
Q
K
 
P
Y
 
F
D
 
-
P
 
V
T
 
Y
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
A
T
 
K
E
 
E
V
 
I
V
 
-
M
 
-
D
 
-
P
 
-
K
 
-
S
 
S
D
 
K
K
 
E
Y
 
N
G
 
D
R
 
R
P
 
P
Q
 
V
V
 
E
V
 
I
A
 
P
Q
 
E
Y
 
K
S
 
R
T
 
T
E
 
K
Q
 
Q
N
 
G
G
 
-
E
 
-
D
 
-
T
 
V
N
 
D
T
 
T
T
 
K
G
 
G
V
 
I
C
 
C
P
 
P
A
 
N
A
 
S
L
 
M
G
 
G
T
 
G
K
 
K
D
|
D
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
A
 
A
Y
 
F
S
 
S
P
 
P
K
 
Q
T
 
T
E
 
G
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
T
 
T
N
 
N
H
 
N
V
 
M
C
 
C
M
 
M
D
 
N
Y
 
Y
E
 
E
P
 
G
F
 
V
R
 
E
V
 
A
S
 
T
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
G
 
G
Q
 
A
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
N
L
 
V
S
 
L
M
 
M
Y
 
Y
P
 
S
-
 
G
-
 
H
-
 
E
P
 
G
K
 
K
D
 
D
S
 
D
H
 
Y
G
 
-
G
 
-
M
 
Y
G
 
G
N
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
C
W
 
Y
D
 
D
N
 
A
K
 
L
E
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
R
K
 
V
W
 
W
S
 
E
L
 
I
P
 
H
E
 
E
P
 
H
F
 
F
S
 
P
V
 
V
W
|
W
S
 
S
G
 
G
A
 
P
L
 
V
A
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
G
D
 
G
V
 
L
V
 
A
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
M
E
 
D
G
 
G
Y
 
W
L
 
F
K
 
K
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
I
A
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
E
 
V
L
 
L
Y
 
W
R
 
Q
F
 
Q
K
 
K
T
 
L
P
 
G
S
 
S
G
 
G
V
 
I
I
 
I
G
 
G
N
 
N
V
 
P
M
 
I
T
 
T
Y
 
F
-
 
L
A
 
G
R
 
P
E
 
D
G
 
K
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
V
 
V
L
 
Y
S
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
|
G
W
|
W
A
 
F
G
 
G
I
 
I
G
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
Q
G
 
N
L
 
L
T
 
P
-
 
P
-
 
D
N
 
D
P
 
P
T
 
Y
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
-
 
V
G
 
A
Y
 
Y
S
 
Q
A
 
A
-
 
G
L
 
L
S
 
P
N
 
K
Y
 
A
T
 
T
A
 
T
L
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
E
L
 
L
T
 
Y
V
 
V
F
 
F
K
 
A
L
 
L

P12293 Methanol dehydrogenase [cytochrome c] subunit 1; MDH large subunit alpha; MEDH; EC 1.1.2.7 from Paracoccus denitrificans (see 2 papers)
50% identity, 97% coverage: 20:599/601 of query aligns to 30:611/631 of P12293

query
sites
P12293
A
|
A
F
x
T
A
|
A
N
 
N
D
 
D
E
 
Q
L
 
L
Q
 
V
K
 
E
L
 
L
I
 
A
D
 
K
D
 
D
P
 
P
N
 
A
Q
 
N
W
 
W
A
 
V
I
 
M
Q
 
T
T
 
G
G
 
R
D
 
D
Y
 
Y
A
 
N
N
 
A
L
 
Q
R
 
N
Y
 
Y
S
 
S
K
 
E
L
 
M
D
 
T
Q
 
D
I
 
I
N
 
N
K
 
K
D
 
E
N
 
N
V
 
V
G
 
K
K
 
Q
L
 
L
Q
 
R
V
 
P
A
 
A
W
 
W
T
 
S
F
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
H
G
 
G
H
 
H
E
 
E
G
 
G
S
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
R
M
 
M
Y
 
F
V
 
I
H
 
H
T
 
T
P
 
P
F
 
F
P
 
P
N
 
N
T
 
T
V
 
T
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
N
K
 
E
D
 
P
G
 
G
Q
 
K
I
 
I
V
 
L
W
 
W
K
 
Q
Y
 
N
E
 
K
P
 
P
K
 
K
Q
 
Q
D
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
A
I
 
R
P
 
T
V
 
V
M
 
A
C
|
C
C
|
C
D
 
D
T
 
V
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
-
 
W
-
 
P
A
 
G
D
 
D
N
 
D
K
 
Q
-
 
V
-
 
K
-
 
P
-
 
L
I
 
I
F
 
F
L
 
R
H
 
T
Q
 
Q
A
 
L
D
 
D
T
 
G
T
 
H
V
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
M
D
 
D
A
 
A
K
 
E
T
 
T
G
 
G
K
 
E
V
 
T
I
 
R
W
 
W
S
 
I
V
 
M
K
 
E
N
 
N
G
 
S
D
 
D
A
 
I
T
 
K
K
 
V
G
 
G
E
 
S
T
 
T
N
 
L
T
 
T
A
 
I
T
 
A
V
 
P
M
 
Y
P
 
V
V
 
I
K
 
K
D
 
D
K
 
L
I
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
I
 
S
S
 
S
G
 
G
G
 
A
E
 
E
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
H
 
Y
V
 
V
T
 
T
A
 
A
Y
 
Y
S
 
D
M
 
V
A
 
K
D
 
S
G
 
G
K
 
E
V
 
M
L
 
R
W
 
W
R
 
R
G
 
A
Y
 
F
S
 
A
M
 
T
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
E
D
 
E
T
 
L
L
 
L
I
 
L
D
 
A
P
 
E
E
 
D
-
 
F
-
 
N
-
 
A
K
 
P
T
 
N
T
 
P
H
 
H
L
 
Y
G
 
G
K
 
Q
P
 
-
V
 
-
G
 
-
K
 
K
D
 
N
S
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
E
T
 
T
W
 
W
E
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
W
 
W
K
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
N
W
 
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
S
 
A
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
E
E
 
V
N
 
D
L
 
L
V
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
G
 
G
N
 
N
P
 
P
S
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
E
T
 
T
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
R
 
K
W
 
W
S
 
T
M
 
M
T
 
A
I
 
I
F
 
W
A
 
G
R
 
R
D
 
E
V
 
A
D
 
T
T
 
T
G
 
G
M
 
E
A
 
A
K
 
K
W
 
F
L
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
 
D
Y
 
Y
D
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
N
E
 
V
M
 
M
I
 
M
L
 
L
T
 
S
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
E
-
 
D
I
 
K
D
 
Q
G
 
G
K
 
Q
D
 
M
R
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
H
F
 
P
D
 
D
R
 
R
N
 
N
G
 
G
F
 
I
G
 
V
Y
 
Y
T
 
T
M
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
T
T
 
N
G
 
G
E
 
D
L
 
L
L
 
I
V
 
S
A
 
A
E
 
D
K
 
K
Y
 
M
D
 
D
P
 
D
T
 
T
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
V
T
 
K
E
 
E
V
 
V
V
 
Q
M
 
L
D
 
D
P
 
T
K
 
-
S
 
-
D
 
-
K
 
-
Y
 
-
G
 
G
R
 
L
P
 
P
Q
 
V
V
 
R
V
 
D
A
 
P
Q
 
E
Y
 
F
S
 
G
T
 
T
E
 
R
Q
 
M
N
 
-
G
 
-
E
 
-
D
 
D
T
 
H
N
 
K
T
 
A
T
 
R
G
 
D
V
 
I
C
|
C
P
 
P
A
 
S
A
 
A
L
 
M
G
 
G
T
 
Y
K
 
H
D
 
N
Q
 
Q
Q
 
G
P
 
H
A
 
D
A
 
S
Y
 
Y
S
 
D
P
 
P
K
 
E
T
 
R
E
 
K
L
 
V
F
 
F
Y
 
M
V
 
L
P
 
G
T
 
I
N
 
N
H
 
H
V
 
I
C
|
C
M
 
M
D
 
D
Y
 
W
E
 
E
P
 
P
F
 
F
R
 
M
V
 
L
S
 
P
Y
 
Y
T
 
R
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
T
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
-
 
G
P
 
P
K
 
K
D
 
A
S
 
T
-
 
A
-
 
E
H
 
R
G
 
A
G
 
G
M
 
A
G
 
G
N
 
Q
F
 
I
I
 
K
A
 
A
W
 
Y
D
 
D
N
 
A
K
 
I
E
 
S
G
 
G
K
 
E
I
 
M
K
 
K
W
 
W
S
 
E
L
 
K
P
 
M
E
 
E
P
 
R
F
 
F
S
 
S
V
 
V
W
 
W
S
 
G
G
 
G
A
 
T
L
 
M
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
D
 
G
V
 
L
V
 
T
F
 
F
Y
 
Y
G
 
V
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
F
L
 
I
K
 
K
A
 
A
V
 
R
D
 
D
A
 
S
A
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
D
E
 
L
L
 
L
Y
 
W
R
 
K
F
 
F
K
 
K
T
 
L
P
 
P
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
N
 
H
V
 
P
M
 
M
T
 
T
Y
 
Y
A
 
K
R
 
H
E
 
D
G
 
G
K
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
V
 
I
L
 
M
S
 
Y
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
G
W
 
W
A
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
V
A
 
F
G
 
D
L
 
L
T
 
A
N
 
D
P
 
P
T
 
T
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
A
Y
 
F
S
 
K
A
 
R
L
 
L
S
 
Q
N
 
E
Y
 
F
T
 
T
A
 
Q
L
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
G
L
 
V
T
 
M
V
 
V
F
 
F
K
 
S
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1lrwA Crystal structure of methanol dehydrogenase from p. Denitrificans (see paper)
50% identity, 96% coverage: 23:599/601 of query aligns to 1:580/600 of 1lrwA

query
sites
1lrwA
N
 
N
D
 
D
E
 
Q
L
 
L
Q
 
V
K
 
E
L
 
L
I
 
A
D
 
K
D
 
D
P
 
P
N
 
A
Q
 
N
W
 
W
A
 
V
I
 
M
Q
 
T
T
 
G
G
 
R
D
 
D
Y
 
Y
A
 
N
N
 
A
L
 
Q
R
 
N
Y
 
Y
S
 
S
K
 
E
L
 
M
D
 
T
Q
 
D
I
 
I
N
 
N
K
 
K
D
 
E
N
 
N
V
 
V
G
 
K
K
 
Q
L
 
L
Q
 
R
V
 
P
A
 
A
W
 
W
T
 
S
F
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
H
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
S
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
R
M
 
M
Y
 
F
V
 
I
H
 
H
T
 
T
P
 
P
F
 
F
P
 
P
N
 
N
T
 
T
V
 
T
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
N
K
 
E
D
 
P
G
 
G
Q
 
K
I
 
I
V
 
L
W
 
W
K
 
Q
Y
 
N
E
 
K
P
 
P
K
 
K
Q
 
Q
D
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
A
I
 
R
P
 
T
V
 
V
M
 
A
C
|
C
C
|
C
D
 
D
T
 
V
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
-
 
W
-
 
P
A
 
G
D
 
D
N
 
D
K
 
Q
-
 
V
-
 
K
-
 
P
-
 
L
I
 
I
F
 
F
L
 
R
H
 
T
Q
 
Q
A
 
L
D
 
D
T
 
G
T
 
H
V
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
M
D
 
D
A
 
A
K
 
E
T
 
T
G
 
G
K
 
E
V
 
T
I
 
R
W
 
W
S
 
I
V
 
M
K
 
E
N
 
N
G
 
S
D
 
D
A
 
I
T
 
K
K
 
V
G
 
G
E
 
S
T
 
T
N
 
L
T
|
T
A
 
I
T
 
A
V
 
P
M
 
Y
P
 
V
V
 
I
K
 
K
D
 
D
K
 
L
I
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
I
 
S
S
|
S
G
|
G
G
x
A
E
|
E
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
H
 
Y
V
 
V
T
 
T
A
 
A
Y
 
Y
S
 
D
M
 
V
A
 
K
D
 
S
G
 
G
K
 
E
V
 
M
L
 
R
W
 
W
R
 
R
G
 
A
Y
 
F
S
 
A
M
 
T
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
E
D
 
E
T
 
L
L
 
L
I
 
L
D
 
A
P
 
E
E
 
D
-
 
F
-
 
N
-
 
A
K
 
P
T
 
N
T
 
P
H
 
H
L
 
Y
G
 
G
K
 
Q
P
 
-
V
 
-
G
 
-
K
 
K
D
 
N
S
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
E
T
 
T
W
 
W
E
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
W
 
W
K
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
N
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
S
 
A
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
E
E
 
V
N
 
D
L
 
L
V
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
G
 
G
N
|
N
P
 
P
S
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
E
T
 
T
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
R
 
K
W
 
W
S
 
T
M
 
M
T
 
A
I
 
I
F
 
W
A
 
G
R
 
R
D
 
E
V
 
A
D
 
T
T
 
T
G
 
G
M
 
E
A
 
A
K
 
K
W
 
F
L
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
N
E
 
V
M
 
M
I
 
M
L
 
L
T
 
S
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
E
-
 
D
I
 
K
D
 
Q
G
 
G
K
 
Q
D
 
M
R
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
H
F
 
P
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
I
G
 
V
Y
 
Y
T
 
T
M
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
T
T
 
N
G
 
G
E
 
D
L
 
L
L
 
I
V
 
S
A
 
A
E
 
D
K
 
K
Y
 
M
D
 
D
P
 
D
T
 
T
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
V
T
 
K
E
 
E
V
 
V
V
 
Q
M
 
L
D
 
D
P
 
T
K
 
-
S
 
-
D
 
-
K
 
-
Y
 
-
G
 
G
R
 
L
P
 
P
Q
 
V
V
 
R
V
 
D
A
 
P
Q
 
E
Y
 
F
S
 
G
T
 
T
E
 
R
Q
 
M
N
 
-
G
 
-
E
 
-
D
 
D
T
 
H
N
 
K
T
 
A
T
 
R
G
 
D
V
 
I
C
 
C
P
 
P
A
 
S
A
 
A
L
 
M
G
 
G
T
 
Y
K
 
H
D
 
N
Q
 
Q
Q
 
G
P
 
H
A
 
D
A
 
S
Y
 
Y
S
 
D
P
 
P
K
 
E
T
 
R
E
 
K
L
 
V
F
 
F
Y
 
M
V
 
L
P
 
G
T
 
I
N
 
N
H
 
H
V
 
I
C
 
C
M
 
M