SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SM_b20511 FitnessBrowser__Smeli:SM_b20511 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
34% identity, 96% coverage: 4:252/259 of query aligns to 4:242/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
R
 
R
L
 
L
K
 
Q
G
 
D
K
 
K
R
 
V
I
 
A
M
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
Q
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
E
I
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
V
F
 
F
L
 
M
S
 
K
E
 
E
R
 
G
A
 
A
A
 
K
L
 
V
F
 
V
L
 
I
L
 
A
D
|
D
R
x
F
D
 
N
G
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
E
K
 
A
E
 
A
A
 
G
K
 
K
R
 
E
L
 
A
Q
 
V
R
 
E
Q
 
A
G
 
N
Q
 
P
S
 
G
L
 
V
A
 
V
Y
 
F
A
 
I
E
 
R
A
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
A
 
R
E
 
E
A
 
S
I
 
V
E
 
H
S
 
R
T
 
L
L
 
V
S
 
E
A
 
N
A
 
V
A
 
A
S
 
E
S
 
R
I
 
F
G
 
G
P
 
K
I
 
I
N
 
D
A
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
N
 
T
V
 
R
F
x
D
S
 
S
E
 
M
P
 
L
L
 
S
E
x
K
M
 
M
S
 
T
N
 
V
A
 
D
D
 
Q
W
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
C
 
V
F
 
I
D
 
N
I
 
V
N
|
N
L
 
L
R
 
T
G
 
G
A
 
V
W
 
F
N
 
H
C
 
C
C
 
T
K
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
S
 
Y
L
 
M
I
 
A
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
I
L
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
S
S
|
S
-
 
V
T
 
T
H
 
G
A
 
T
F
 
Y
T
 
G
I
x
N
I
x
V
P
 
G
H
x
Q
T
 
T
F
 
-
P
 
N
Y
|
Y
P
 
A
V
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
A
A
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
M
T
 
T
K
 
K
A
 
T
L
 
W
G
 
A
I
 
K
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
S
 
R
K
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
x
F
V
x
T
L
 
E
T
|
T
Q
 
A
K
x
M
A
 
V
Y
 
A
D
 
E
Y
 
V
W
 
P
N
 
E
S
 
K
F
 
V
P
 
I
D
 
E
P
x
K
A
 
M
A
 
K
A
 
A
E
 
Q
A
 
V
A
 
-
T
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
-
H
 
-
P
 
P
G
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
L
A
 
G
T
 
K
A
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
N
A
 
A
A
 
Y
V
 
L
F
 
F
M
 
L
I
 
A
S
 
S
D
 
H
E
 
E
C
 
S
P
 
D
F
 
Y
M
 
V
N
 
N
A
 
G
T
 
H
C
 
V
L
 
L
T
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
I

2dtxA Structure of thermoplasma acidophilum aldohexose dehydrogenase (aldt) in complex with d-mannose (see paper)
34% identity, 97% coverage: 5:254/259 of query aligns to 5:247/255 of 2dtxA

query
sites
2dtxA
L
 
L
K
 
R
G
 
D
K
 
K
R
 
V
I
 
V
M
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
Q
 
M
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
R
F
 
F
L
 
V
S
 
D
E
 
E
R
 
G
A
 
S
A
 
K
L
 
V
F
 
I
L
 
D
L
 
L
D
 
S
R
 
I
D
 
H
G
 
D
P
 
P
L
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
G
E
 
E
A
 
A
K
 
K
R
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
-
Q
 
-
S
 
-
L
 
Y
A
 
D
Y
 
H
A
 
I
E
 
E
A
 
C
D
 
D
I
 
V
T
 
T
D
 
N
A
 
P
E
 
D
A
 
Q
I
 
V
E
 
K
S
 
A
T
 
S
L
 
I
S
 
D
A
 
H
A
 
I
A
 
F
S
 
K
S
 
E
I
 
Y
G
 
G
P
 
S
I
 
I
N
 
S
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
N
 
E
V
 
S
F
 
Y
S
 
G
E
 
K
P
 
I
L
 
E
E
 
S
M
 
M
S
 
S
N
 
M
A
 
G
D
 
E
W
 
W
Q
 
R
R
 
R
C
 
I
F
 
I
D
 
D
I
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
F
G
 
G
A
 
Y
W
 
Y
N
 
Y
C
 
A
C
 
S
K
 
K
A
 
F
V
 
A
L
 
I
P
 
P
S
 
Y
L
 
M
I
 
I
E
 
R
Q
 
S
G
 
R
G
 
D
G
 
P
A
 
S
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
|
S
T
x
V
H
x
Q
A
 
A
F
 
S
T
 
I
I
 
I
I
 
T
P
 
K
H
 
N
T
 
A
F
 
S
P
 
A
Y
|
Y
P
 
V
V
 
T
A
x
S
K
|
K
H
 
H
A
 
A
L
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
I
G
 
A
I
 
L
E
 
D
Y
 
Y
A
 
A
S
 
P
K
 
L
G
 
-
V
 
L
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
C
P
 
P
G
x
A
Y
x
T
V
 
I
-
 
D
-
 
T
-
 
P
L
 
L
T
 
V
Q
 
R
K
 
K
A
 
A
Y
 
A
D
 
E
Y
 
-
W
 
L
N
 
E
S
 
V
F
 
G
P
 
S
D
 
D
P
 
P
A
 
M
A
 
R
A
 
I
E
 
E
A
 
K
A
 
K
T
 
I
L
 
S
K
 
E
L
 
W
-
 
G
-
 
H
-
 
E
H
 
H
P
 
P
G
 
M
G
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
G
T
 
K
A
 
P
E
 
Q
E
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
S
A
 
A
A
 
V
V
 
A
F
 
F
M
 
L
I
 
A
S
 
S
D
 
R
E
 
E
C
 
A
P
 
S
F
 
F
M
 
I
N
 
T
A
 
G
T
 
T
C
 
C
L
 
L
T
 
Y
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
S
V
 
I

2dteA Structure of thermoplasma acidophilum aldohexose dehydrogenase (aldt) in complex with nadh (see paper)
34% identity, 97% coverage: 5:254/259 of query aligns to 5:247/255 of 2dteA

query
sites
2dteA
L
 
L
K
 
R
G
 
D
K
 
K
R
 
V
I
 
V
M
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
Q
x
M
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
R
F
 
F
L
 
V
S
 
D
E
 
E
R
 
G
A
 
S
A
 
K
L
 
V
F
 
I
L
 
D
L
 
L
D
x
S
R
x
I
D
 
H
G
 
D
P
 
P
L
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
G
E
 
E
A
 
A
K
 
K
R
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
-
Q
 
-
S
 
-
L
 
Y
A
 
D
Y
 
H
A
 
I
E
 
E
A
x
C
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
N
A
 
P
E
 
D
A
 
Q
I
 
V
E
 
K
S
 
A
T
 
S
L
 
I
S
 
D
A
 
H
A
 
I
A
 
F
S
 
K
S
 
E
I
 
Y
G
 
G
P
 
S
I
 
I
N
 
S
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
N
 
E
V
 
S
F
 
Y
S
 
G
E
 
K
P
 
I
L
 
E
E
 
S
M
 
M
S
 
S
N
 
M
A
 
G
D
 
E
W
 
W
Q
 
R
R
 
R
C
 
I
F
 
I
D
 
D
I
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
F
G
 
G
A
 
Y
W
 
Y
N
 
Y
C
 
A
C
 
S
K
 
K
A
 
F
V
 
A
L
 
I
P
 
P
S
 
Y
L
 
M
I
 
I
E
 
R
Q
 
S
G
 
R
G
 
D
G
 
P
A
 
S
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
T
 
V
H
 
Q
A
 
A
F
 
S
T
 
I
I
 
I
I
 
T
P
 
K
H
 
N
T
 
A
F
 
S
P
 
A
Y
|
Y
P
 
V
V
 
T
A
x
S
K
|
K
H
 
H
A
 
A
L
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
I
G
 
A
I
 
L
E
 
D
Y
 
Y
A
 
A
S
 
P
K
 
L
G
 
-
V
 
L
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
C
P
|
P
G
x
A
Y
x
T
V
x
I
-
 
D
-
x
T
-
x
P
L
|
L
T
x
V
Q
 
R
K
 
K
A
 
A
Y
 
A
D
 
E
Y
 
-
W
 
L
N
 
E
S
 
V
F
 
G
P
 
S
D
 
D
P
 
P
A
 
M
A
 
R
A
 
I
E
 
E
A
 
K
A
 
K
T
 
I
L
 
S
K
 
E
L
 
W
-
 
G
-
 
H
-
 
E
H
 
H
P
 
P
G
 
M
G
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
G
T
 
K
A
 
P
E
 
Q
E
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
S
A
 
A
A
 
V
V
 
A
F
 
F
M
 
L
I
 
A
S
 
S
D
 
R
E
 
E
C
 
A
P
 
S
F
 
F
M
 
I
N
 
T
A
 
G
T
 
T
C
 
C
L
 
L
T
 
Y
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
S
V
 
I

4fn4A Short-chain NAD(h)-dependent dehydrogenase/reductase from sulfolobus acidocaldarius (see paper)
33% identity, 97% coverage: 5:255/259 of query aligns to 5:254/254 of 4fn4A

query
sites
4fn4A
L
 
L
K
 
K
G
 
N
K
 
K
R
 
V
I
 
V
M
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
K
A
 
K
F
 
F
L
 
A
S
 
L
E
 
N
R
 
D
A
 
S
A
 
I
L
 
V
F
 
V
L
 
A
L
 
V
D
x
E
R
x
L
D
 
L
G
 
E
P
 
D
L
x
R
L
 
L
E
 
N
K
 
Q
E
 
I
A
 
V
K
 
Q
R
 
E
L
 
L
Q
 
R
R
 
G
Q
 
M
G
 
G
Q
 
K
S
 
E
L
 
V
A
 
L
Y
 
G
A
 
V
E
 
K
A
|
A
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
K
A
 
K
E
 
K
A
 
D
I
 
V
E
 
E
S
 
E
T
 
F
L
 
V
S
 
R
A
 
R
A
 
T
A
 
F
S
 
E
S
 
T
I
 
Y
G
 
S
P
 
R
I
 
I
N
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
x
I
N
 
M
V
 
D
F
 
G
S
 
V
E
 
T
P
 
P
L
 
V
-
 
A
E
 
E
M
 
V
S
 
S
N
 
D
A
 
E
D
 
L
W
 
W
Q
 
E
R
 
R
C
 
V
F
 
L
D
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
Y
G
 
S
A
 
A
W
 
F
N
 
Y
C
 
S
C
 
S
K
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
I
P
 
P
S
 
I
L
 
M
I
 
L
E
 
K
Q
 
Q
G
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
T
 
I
H
 
A
A
 
G
F
 
I
T
 
R
I
 
G
I
 
G
P
 
F
H
 
A
T
 
G
F
 
A
P
 
P
Y
|
Y
P
 
T
V
 
V
A
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
S
L
 
I
G
 
A
I
 
A
E
 
H
Y
 
Y
A
 
G
S
 
D
K
 
Q
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
A
N
 
V
A
 
A
L
 
V
A
 
L
P
|
P
G
 
G
Y
 
T
V
|
V
L
 
K
T
|
T
Q
x
N
K
 
-
A
 
-
Y
x
I
D
 
G
Y
 
L
W
 
G
N
 
S
S
 
S
F
 
K
P
 
P
D
x
S
P
 
E
A
 
L
A
 
G
A
 
M
E
 
R
A
 
T
A
 
L
T
 
T
L
 
K
K
 
L
L
 
M
H
 
S
P
 
L
G
 
S
G
 
S
R
 
R
I
 
L
A
 
A
T
 
E
A
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
N
A
 
V
A
 
I
V
 
V
F
 
F
M
 
L
I
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
C
 
A
P
 
S
F
 
F
M
 
V
N
 
N
A
 
G
T
 
D
C
 
A
L
 
V
T
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
T
V
 
V
L
 
L

7djsD Crystal structure of isopiperitenol dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa complexed with NAD
35% identity, 97% coverage: 5:255/259 of query aligns to 3:251/251 of 7djsD

query
sites
7djsD
L
 
L
K
 
S
G
 
G
K
 
Q
R
 
V
I
 
A
M
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
Q
 
A
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
I
 
T
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
F
 
F
L
 
A
S
 
A
E
 
A
R
 
G
A
 
V
A
 
K
L
 
V
F
 
V
L
 
V
L
 
A
D
|
D
R
x
L
D
 
D
G
 
S
P
 
A
L
 
G
L
 
G
E
 
E
K
 
G
E
 
T
A
 
V
K
 
E
R
 
A
L
 
I
Q
 
R
R
 
Q
Q
 
A
G
 
G
Q
 
G
S
 
E
L
 
A
A
 
V
Y
 
F
A
 
I
E
 
R
A
x
C
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
R
A
 
D
E
 
A
A
 
E
I
 
V
E
 
K
S
 
A
T
 
L
L
 
V
S
 
E
A
 
G
A
 
C
A
 
A
S
 
A
S
 
A
I
 
Y
G
 
G
P
 
R
I
 
L
N
 
D
A
 
Y
L
 
A
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
N
 
E
V
 
I
F
 
E
S
 
Q
E
 
G
P
 
K
L
 
L
E
 
A
M
 
D
S
 
G
N
 
N
-
 
E
A
 
A
D
 
E
W
 
F
Q
 
D
R
 
A
C
 
I
F
 
M
D
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
V
R
 
K
G
 
G
A
 
V
W
 
W
N
 
L
C
 
C
C
 
M
K
 
K
A
 
H
V
 
Q
L
 
I
P
 
P
S
 
L
L
 
M
I
 
L
E
 
A
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
T
 
V
H
 
A
A
 
G
F
 
L
T
 
G
I
 
A
I
 
A
P
 
P
H
 
K
T
 
M
F
 
S
P
 
I
Y
|
Y
P
 
A
V
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
H
A
 
A
L
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
A
G
 
A
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
S
 
K
K
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
C
P
 
P
G
x
A
Y
x
V
V
 
I
L
 
D
T
 
T
-
 
D
-
 
M
-
 
F
Q
 
R
K
 
R
A
 
A
Y
 
Y
D
 
E
Y
 
-
W
 
-
N
 
-
S
 
-
F
 
-
P
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
R
A
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
F
A
 
A
T
 
A
L
 
-
K
 
A
L
 
M
H
 
H
P
 
P
G
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
A
 
G
T
 
R
A
 
V
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
A
A
 
A
A
 
V
V
 
L
F
 
Y
M
 
L
I
 
C
S
 
S
D
 
D
E
 
N
C
 
A
P
 
G
F
 
F
M
 
T
N
 
T
A
 
G
T
 
I
C
 
A
L
 
L
T
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
A
S
 
T
V
 
A
L
 
I

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
31% identity, 97% coverage: 5:255/259 of query aligns to 3:248/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
L
 
L
K
 
D
G
 
N
K
 
K
R
 
V
I
 
A
M
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
E
 
H
A
 
S
F
 
Y
L
 
A
S
 
K
E
 
E
R
 
G
A
 
A
A
 
K
L
 
V
F
 
I
L
 
V
L
 
S
D
|
D
R
x
I
D
 
N
G
 
E
P
 
D
L
 
H
L
 
G
E
 
N
K
 
K
E
 
A
A
 
V
K
 
E
R
 
D
L
 
I
Q
 
K
R
 
A
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
G
S
 
E
L
 
A
A
 
S
Y
 
F
A
 
V
E
 
K
A
|
A
D
|
D
I
x
T
T
 
S
D
 
N
A
 
P
E
 
E
A
 
E
I
 
V
E
 
E
S
 
A
T
 
L
L
 
V
S
 
K
A
 
R
A
 
T
A
 
V
S
 
E
S
 
I
I
 
Y
G
 
G
P
 
R
I
 
L
N
 
D
A
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
N
 
G
V
 
G
F
 
E
S
 
Q
E
 
A
P
 
L
L
 
A
E
 
G
M
 
D
S
 
Y
N
 
G
A
 
L
D
 
D
-
 
S
W
 
W
Q
 
R
R
 
K
C
 
V
F
 
L
D
 
S
I
 
I
N
 
N
L
 
L
R
 
D
G
 
G
A
 
V
W
 
F
N
 
Y
C
 
G
C
 
C
K
 
K
A
 
Y
V
 
E
L
 
L
P
 
E
S
 
Q
L
 
M
I
 
E
E
 
K
Q
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
x
M
A
 
A
S
|
S
T
 
I
H
 
H
A
 
G
F
 
I
T
 
V
I
 
A
I
 
A
P
 
P
H
 
L
T
 
S
F
 
S
P
 
A
Y
|
Y
P
 
T
V
 
S
A
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
A
L
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
N
L
 
I
G
 
G
I
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
S
 
Q
K
 
K
G
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
G
P
|
P
G
x
A
Y
|
Y
V
x
I
L
 
E
T
 
T
Q
 
P
K
x
L
A
 
L
Y
 
E
D
 
S
Y
 
L
W
 
T
N
 
K
S
 
E
F
 
M
P
 
K
D
 
E
P
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
A
T
 
L
L
 
I
K
 
S
L
 
K
H
 
H
P
 
P
G
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
L
A
 
G
T
 
K
A
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
E
A
 
L
A
 
V
V
 
L
F
 
F
M
 
L
I
 
S
S
 
S
D
 
E
E
 
K
C
 
S
P
 
S
F
 
F
M
 
M
N
 
T
A
 
G
T
 
G
C
 
Y
L
 
Y
T
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
S
 
T
V
 
A
L
 
V

4wecA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from mycobacterium smegmatis
33% identity, 98% coverage: 1:253/259 of query aligns to 4:251/258 of 4wecA

query
sites
4wecA
M
 
L
S
 
T
D
 
Q
R
 
R
L
 
L
K
 
A
G
 
G
K
 
K
R
 
V
I
 
A
M
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
|
A
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
T
A
 
G
E
 
R
A
 
R
F
 
L
L
 
R
S
 
A
E
 
E
R
 
G
A
 
A
A
 
T
L
 
V
F
 
V
L
 
V
L
 
G
D
|
D
R
x
I
D
 
D
G
 
P
P
 
T
L
 
T
L
 
G
E
 
K
K
 
A
E
 
A
A
 
A
K
 
D
R
 
E
L
 
L
Q
 
E
R
 
G
Q
 
-
G
 
-
Q
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
L
Y
 
F
A
 
V
E
 
P
A
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
E
A
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
V
E
 
D
S
 
N
T
 
L
L
 
F
S
 
D
A
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
S
S
 
T
I
 
F
G
 
G
P
 
R
I
 
V
N
 
D
A
 
I
L
 
A
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
N
 
S
V
 
P
F
 
P
S
 
E
E
 
D
P
 
D
L
 
L
E
 
-
M
 
I
S
 
E
N
 
N
A
 
T
D
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
A
W
 
W
Q
 
Q
R
 
R
C
 
V
F
 
Q
D
 
D
I
 
I
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
S
A
 
V
W
 
Y
N
 
L
C
 
S
C
 
C
K
 
R
A
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
R
S
 
H
L
 
M
I
 
V
E
 
P
Q
 
A
G
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
T
 
F
H
 
V
A
 
A
F
 
V
T
 
M
-
 
G
I
 
S
I
 
A
P
 
T
H
 
S
T
x
Q
F
 
I
P
 
S
Y
|
Y
P
 
T
V
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
G
A
 
G
L
 
V
I
 
L
G
 
A
M
 
M
T
 
S
K
 
R
A
 
E
L
 
L
G
 
G
I
 
V
E
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
S
 
R
K
 
Q
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
C
P
|
P
G
 
G
Y
x
P
V
|
V
L
 
N
T
 
T
Q
 
P
K
 
L
A
 
L
Y
 
Q
D
 
E
Y
 
L
W
 
F
N
 
A
S
 
K
F
 
D
P
 
P
D
 
E
P
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
R
E
 
R
A
 
L
A
 
V
T
 
H
L
 
I
K
 
P
L
 
L
H
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
G
R
 
R
I
 
F
A
 
A
T
 
E
A
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
A
A
 
A
A
 
V
V
 
A
F
 
F
M
 
L
I
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
C
 
A
P
 
S
F
 
F
M
 
I
N
 
T
A
 
G
T
 
S
C
 
T
L
 
F
T
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
I
S
 
S

A7IQH5 2-(S)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase 3; S-HPCDH 3; 2-[(S)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase 3; Aliphatic epoxide carboxylation component IV; Epoxide carboxylase component IV; SHPCDH3; EC 1.1.1.269 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 2 papers)
36% identity, 98% coverage: 1:255/259 of query aligns to 1:255/255 of A7IQH5

query
sites
A7IQH5
M
 
M
S
 
S
D
 
N
R
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
N
K
 
E
R
 
V
I
 
I
M
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
 
G
Q
 
A
G
 
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
S
A
 
A
F
 
A
L
 
L
S
 
R
E
 
E
R
 
G
A
 
A
A
 
K
L
 
V
F
 
A
L
 
L
L
 
I
D
|
D
R
 
L
D
 
D
G
 
Q
P
 
G
L
 
L
L
 
A
E
 
E
K
 
R
E
 
S
A
 
A
K
 
A
R
 
M
L
 
L
Q
 
S
R
 
T
Q
 
G
G
 
G
Q
 
A
S
 
V
L
 
A
A
 
K
Y
 
G
A
 
F
E
 
G
A
 
A
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
K
A
 
A
E
 
A
A
 
D
I
 
I
E
 
T
S
 
A
T
 
A
L
 
I
S
 
T
A
 
S
A
 
A
A
 
E
S
 
Q
S
 
T
I
 
I
G
 
G
P
 
S
I
 
L
N
 
T
A
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
N
 
A
V
 
G
F
 
F
S
 
G
E
 
S
P
 
V
L
 
H
E
 
D
M
 
A
S
 
D
N
 
A
A
 
A
D
 
A
W
 
W
Q
 
D
R
 
R
C
 
I
F
 
M
D
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
V
R
 
T
G
 
G
A
 
T
W
 
F
N
 
L
C
 
A
C
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
A
S
 
G
L
 
M
I
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
H
G
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
 
F
A
 
G
S
|
S
T
 
V
H
 
A
A
 
G
F
 
L
T
 
V
I
 
G
I
 
I
P
 
P
H
 
T
T
 
M
F
 
A
P
 
A
Y
|
Y
P
 
C
V
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
G
A
 
A
L
 
I
I
 
V
G
 
N
M
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
Q
L
 
M
G
 
A
I
 
A
E
 
D
Y
 
Y
A
 
S
S
 
G
K
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
C
P
 
P
G
 
G
Y
x
T
V
|
V
L
x
T
-
x
S
T
|
T
Q
x
G
K
 
M
A
 
G
Y
 
Q
D
 
Q
Y
 
L
W
 
L
N
 
G
S
 
S
F
 
D
P
 
T
D
 
S
P
 
P
A
 
-
A
 
E
A
 
V
E
 
Q
A
 
A
A
 
R
T
x
R
L
 
L
K
 
A
L
x
K
H
x
Y
P
 
P
G
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
F
A
 
G
T
 
T
A
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
I
F
 
F
M
 
L
I
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
Q
C
 
A
P
 
A
F
 
F
M
 
V
N
 
T
A
 
G
T
 
A
C
 
A
L
 
F
T
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
T
V
 
A
L
 
I

4urfB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
31% identity, 95% coverage: 5:251/259 of query aligns to 3:244/248 of 4urfB

query
sites
4urfB
L
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
T
I
 
A
M
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
G
Q
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
L
A
 
T
F
 
Y
L
 
A
S
 
A
E
 
E
R
 
G
A
 
A
A
 
N
L
 
V
F
 
V
L
 
V
L
 
S
D
|
D
R
x
I
D
 
S
G
 
D
P
 
E
L
 
W
L
 
G
E
 
R
K
 
E
E
 
T
A
 
L
K
 
A
R
 
L
L
 
I
Q
 
E
R
 
G
Q
 
K
G
 
G
Q
 
G
S
 
K
L
 
A
A
 
V
Y
 
F
A
 
Q
E
 
H
A
 
A
D
|
D
I
x
T
T
 
A
D
 
H
A
 
P
E
 
E
A
 
D
I
 
H
E
 
D
S
 
E
T
 
L
L
 
I
S
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
K
S
 
R
S
 
A
I
 
F
G
 
G
P
 
R
I
 
L
N
 
D
A
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
N
 
S
-
x
G
V
 
E
F
 
F
S
 
T
E
 
P
P
 
T
L
 
A
E
 
E
M
 
T
S
 
T
N
 
D
A
 
A
D
 
Q
W
 
W
Q
 
Q
R
|
R
C
 
V
F
 
I
D
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
R
 
S
G
 
G
A
 
V
W
 
F
N
 
Y
C
 
G
C
 
V
K
 
R
A
 
A
V
 
Q
L
 
I
P
 
R
S
 
A
L
 
M
I
 
L
E
 
E
Q
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
T
 
I
H
 
A
A
 
G
F
 
Q
T
 
I
I
 
G
I
 
I
P
 
E
H
 
G
T
x
I
F
 
T
P
 
P
Y
|
Y
P
 
T
V
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
L
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
T
L
 
V
G
 
A
I
 
W
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
S
 
S
K
 
K
G
 
G
V
 
I
R
|
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
V
A
 
G
P
|
P
G
x
A
Y
 
F
V
x
I
L
 
N
T
|
T
Q
 
T
K
 
L
A
 
V
Y
 
Q
D
 
N
Y
 
V
W
 
-
N
 
-
S
 
-
F
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
L
A
 
E
A
 
T
E
 
R
A
 
R
A
 
Q
T
 
L
L
 
E
K
 
Q
L
 
M
H
 
H
P
 
A
G
x
L
G
x
R
R
|
R
I
 
L
A
 
G
T
 
E
A
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
N
A
 
L
A
 
V
V
 
A
F
 
W
M
 
L
I
 
S
S
|
S
D
 
D
E
 
K
C
 
A
P
 
S
F
 
F
M
 
V
N
 
T
A
 
G
T
 
S
C
 
Y
L
 
Y
T
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4urfA Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
31% identity, 95% coverage: 5:251/259 of query aligns to 3:244/248 of 4urfA

query
sites
4urfA
L
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
T
I
 
A
M
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
G
Q
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
L
A
 
T
F
 
Y
L
 
A
S
 
A
E
 
E
R
 
G
A
 
A
A
 
N
L
 
V
F
 
V
L
 
V
L
 
S
D
|
D
R
x
I
D
 
S
G
 
D
P
 
E
L
x
W
L
 
G
E
 
R
K
 
E
E
 
T
A
 
L
K
 
A
R
 
L
L
 
I
Q
 
E
R
 
G
Q
 
K
G
 
G
Q
 
G
S
 
K
L
 
A
A
 
V
Y
 
F
A
 
Q
E
 
H
A
 
A
D
|
D
I
x
T
T
 
A
D
 
H
A
 
P
E
 
E
A
 
D
I
 
H
E
 
D
S
 
E
T
 
L
L
 
I
S
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
K
S
 
R
S
 
A
I
 
F
G
 
G
P
 
R
I
 
L
N
 
D
A
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
N
x
S
-
x
G
V
x
E
F
 
F
S
x
T
E
 
P
P
 
T
L
 
A
E
|
E
M
 
T
S
x
T
N
 
D
A
 
A
D
x
Q
W
 
W
Q
 
Q
R
|
R
C
 
V
F
 
I
D
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
R
 
S
G
 
G
A
 
V
W
 
F
N
 
Y
C
 
G
C
 
V
K
 
R
A
 
A
V
 
Q
L
 
I
P
 
R
S
 
A
L
 
M
I
 
L
E
 
E
Q
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
T
 
I
H
 
A
A
 
G
F
 
Q
T
 
I
I
 
G
I
 
I
P
 
E
H
 
G
T
x
I
F
 
T
P
 
P
Y
|
Y
P
 
T
V
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
L
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
T
L
 
V
G
 
A
I
 
W
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
S
|
S
K
 
K
G
|
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
V
A
 
G
P
|
P
G
 
A
Y
 
F
V
x
I
L
 
N
T
|
T
Q
 
T
K
 
L
A
 
V
Y
 
Q
D
 
N
Y
 
V
W
 
-
N
 
-
S
 
-
F
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
L
A
 
E
A
 
T
E
 
R
A
 
R
A
 
Q
T
 
L
L
 
E
K
 
Q
L
 
M
H
 
H
P
 
A
G
 
L
G
 
R
R
 
R
I
 
L
A
 
G
T
 
E
A
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
N
A
 
L
A
 
V
V
 
A
F
 
W
M
 
L
I
 
S
S
 
S
D
 
D
E
 
K
C
 
A
P
 
S
F
 
F
M
 
V
N
 
T
A
 
G
T
x
S
C
x
Y
L
 
Y
T
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4ureB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
31% identity, 95% coverage: 5:251/259 of query aligns to 3:244/248 of 4ureB

query
sites
4ureB
L
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
T
I
 
A
M
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
G
Q
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
L
A
 
T
F
 
Y
L
 
A
S
 
A
E
 
E
R
 
G
A
 
A
A
 
N
L
 
V
F
 
V
L
 
V
L
 
S
D
 
D
R
 
I
D
 
S
G
 
D
P
 
E
L
 
W
L
 
G
E
 
R
K
 
E
E
 
T
A
 
L
K
 
A
R
 
L
L
 
I
Q
 
E
R
 
G
Q
 
K
G
 
G
Q
 
G
S
 
K
L
 
A
A
 
V
Y
 
F
A
 
Q
E
 
H
A
 
A
D
 
D
I
 
T
T
 
A
D
 
H
A
 
P
E
 
E
A
 
D
I
 
H
E
 
D
S
 
E
T
 
L
L
 
I
S
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
K
S
 
R
S
 
A
I
 
F
G
 
G
P
 
R
I
 
L
N
 
D
A
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
 
I
N
 
S
-
 
G
V
 
E
F
 
F
S
 
T
E
 
P
P
 
T
L
 
A
E
 
E
M
 
T
S
 
T
N
 
D
A
 
A
D
 
Q
W
 
W
Q
 
Q
R
 
R
C
 
V
F
 
I
D
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
R
 
S
G
 
G
A
 
V
W
 
F
N
 
Y
C
 
G
C
 
V
K
 
R
A
 
A
V
 
Q
L
 
I
P
 
R
S
 
A
L
 
M
I
 
L
E
 
E
Q
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
|
S
T
 
I
H
 
A
A
 
G
F
 
Q
T
 
I
I
 
G
I
 
I
P
 
E
H
 
G
T
x
I
F
 
T
P
 
P
Y
|
Y
P
 
T
V
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
L
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
T
L
 
V
G
 
A
I
 
W
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
S
 
S
K
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
V
A
 
G
P
|
P
G
x
A
Y
 
F
V
 
I
L
 
N
T
 
T
Q
 
T
K
 
L
A
 
V
Y
 
Q
D
 
N
Y
 
V
W
 
-
N
 
-
S
 
-
F
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
L
A
 
E
A
 
T
E
 
R
A
 
R
A
 
Q
T
 
L
L
 
E
K
 
Q
L
 
M
H
 
H
P
 
A
G
 
L
G
 
R
R
 
R
I
 
L
A
 
G
T
 
E
A
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
N
A
 
L
A
 
V
V
 
A
F
 
W
M
 
L
I
 
S
S
 
S
D
 
D
E
 
K
C
 
A
P
 
S
F
 
F
M
 
V
N
 
T
A
 
G
T
 
S
C
 
Y
L
 
Y
T
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4ituA Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) bound to s-hpc and nadh (see paper)
34% identity, 89% coverage: 25:255/259 of query aligns to 23:253/253 of 4ituA

query
sites
4ituA
E
 
S
A
 
A
F
 
A
L
 
L
S
 
R
E
 
E
R
 
G
A
 
A
A
 
K
L
 
V
F
 
A
L
 
L
L
 
I
D
|
D
R
x
L
D
 
D
G
 
Q
P
 
G
L
 
L
L
 
A
E
 
E
K
 
R
E
 
S
A
 
A
K
 
A
R
 
M
L
 
L
Q
 
S
R
 
T
Q
 
G
G
 
G
Q
 
A
S
 
V
L
 
A
A
 
K
Y
 
G
A
 
F
E
 
G
A
 
A
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
K
A
 
A
E
 
A
A
 
D
I
 
I
E
 
T
S
 
A
T
 
A
L
 
I
S
 
T
A
 
S
A
 
A
A
 
E
S
 
Q
S
 
T
I
 
I
G
 
G
P
 
S
I
 
L
N
 
T
A
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
N
 
A
V
 
G
F
 
F
S
 
G
E
 
S
P
 
V
L
 
H
E
 
D
M
 
A
S
 
D
N
 
A
A
 
A
D
 
A
W
 
W
Q
 
D
R
 
R
C
 
I
F
 
M
D
 
A
I
x
V
N
|
N
L
 
V
R
 
T
G
 
G
A
 
T
W
 
F
N
 
L
C
 
A
C
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
A
S
 
G
L
 
M
I
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
H
G
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
x
F
A
 
G
S
|
S
T
 
V
H
 
A
A
 
G
F
 
L
T
 
V
I
 
G
I
 
I
P
 
P
H
 
T
T
 
M
F
 
A
P
 
A
Y
|
Y
P
 
C
V
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
G
A
 
A
L
 
I
I
 
V
G
 
N
M
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
Q
L
 
M
G
 
A
I
 
A
E
 
D
Y
 
Y
A
 
S
S
 
G
K
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
C
P
|
P
G
 
G
Y
x
T
V
|
V
L
 
T
-
 
S
T
|
T
Q
 
G
K
x
M
A
 
G
Y
 
Q
D
 
Q
Y
 
L
W
 
L
N
 
G
S
 
S
F
 
D
P
 
T
D
 
S
P
 
P
A
 
-
A
 
E
A
 
V
E
 
Q
A
 
A
A
 
R
T
x
R
L
 
L
K
 
A
L
 
K
H
x
Y
P
 
P
G
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
F
A
 
G
T
 
T
A
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
I
F
 
F
M
 
L
I
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
Q
C
 
A
P
 
A
F
 
F
M
 
V
N
 
T
A
 
G
T
 
A
C
 
A
L
 
F
T
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
T
V
 
A
L
 
I

Sites not aligning to the query:

5u9pB Crystal structure of a gluconate 5-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia j2315 in complex with NADP and tartrate
32% identity, 97% coverage: 4:253/259 of query aligns to 13:258/261 of 5u9pB

query
sites
5u9pB
R
 
R
L
 
L
K
 
D
G
 
G
K
 
R
R
 
R
I
 
A
M
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
G
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
T
I
 
L
A
 
A
E
 
R
A
 
G
F
 
L
L
 
A
S
 
E
E
 
A
R
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
I
F
 
V
L
 
I
L
 
N
D
 
D
R
|
R
D
 
N
G
 
E
P
 
E
L
 
K
L
 
A
E
 
A
K
 
T
E
 
L
A
 
A
K
 
R
R
 
R
L
 
F
Q
 
R
R
 
D
Q
 
E
G
 
G
Q
 
F
S
 
A
L
 
A
A
 
D
Y
 
H
A
 
A
E
 
V
A
 
F
D
|
D
I
x
V
T
 
A
D
 
E
A
 
H
E
 
A
A
 
Q
I
 
V
E
 
R
S
 
A
T
 
A
L
 
I
S
 
D
A
 
E
A
 
F
A
 
E
S
 
A
S
 
R
I
 
V
G
 
G
P
 
A
I
 
I
N
 
D
A
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
N
 
Q
V
 
R
F
 
R
S
 
A
E
 
P
P
 
L
L
 
D
E
 
A
M
 
F
S
 
E
N
 
P
A
 
D
D
 
D
W
 
W
Q
 
H
R
 
A
C
 
L
F
 
M
D
 
R
I
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
D
G
 
G
A
 
V
W
 
F
N
 
N
C
 
V
C
 
A
K
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
A
P
 
R
S
 
H
L
 
M
I
 
I
E
 
A
Q
 
R
G
 
G
G
 
H
G
 
G
A
 
K
I
 
I
L
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
C
S
|
S
T
 
V
H
 
Q
A
 
S
F
 
E
T
 
L
I
 
A
I
 
R
P
 
P
H
 
T
T
 
I
F
 
A
P
 
P
Y
|
Y
P
 
A
V
 
A
A
 
T
K
|
K
H
 
G
A
 
A
L
 
V
I
 
R
G
 
M
M
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
G
L
 
M
G
 
C
I
 
A
E
 
D
Y
 
W
A
 
A
S
 
R
K
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
Q
V
 
A
N
 
N
A
 
G
L
 
L
A
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
 
Y
V
x
F
L
 
E
T
|
T
Q
 
E
K
x
L
A
x
N
Y
 
-
D
 
-
Y
 
-
W
 
-
N
 
R
S
 
A
F
 
L
P
 
V
D
 
D
P
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
F
E
 
S
A
 
D
A
 
W
T
 
L
L
 
C
K
 
K
L
 
R
H
 
T
P
 
P
G
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
W
A
 
G
T
 
Q
A
 
V
E
 
D
E
 
E
I
 
L
A
 
C
R
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
I
F
 
F
M
 
L
I
 
A
S
 
S
D
 
A
E
 
A
C
 
S
P
 
D
F
 
F
M
 
V
N
 
N
A
 
G
T
 
Q
C
 
T
L
 
L
T
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
T

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
29% identity, 97% coverage: 4:253/259 of query aligns to 4:253/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
R
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
D
K
 
K
R
 
T
I
 
V
M
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
Y
A
 
A
I
 
A
A
 
V
E
 
Q
A
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
G
E
 
Q
R
 
Q
A
 
A
A
 
N
L
 
V
F
 
V
L
 
V
L
 
A
D
|
D
R
x
I
D
 
D
G
 
E
P
 
A
L
 
-
L
 
-
E
 
Q
K
 
G
E
 
E
A
 
A
K
 
M
R
 
V
L
 
R
Q
 
K
R
 
E
Q
 
N
G
 
N
Q
 
D
S
 
R
L
 
L
A
 
H
Y
 
F
A
 
V
E
 
Q
A
x
T
D
 
D
I
|
I
T
 
T
D
 
D
A
 
E
E
 
A
A
 
A
I
 
C
E
 
Q
S
 
H
T
 
A
L
 
V
S
 
E
A
 
S
A
 
A
A
 
V
S
 
H
S
 
T
I
 
F
G
 
G
P
 
G
I
 
L
N
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
 
I
N
 
E
V
 
I
F
 
V
S
 
A
E
 
P
P
 
I
L
 
H
E
 
E
M
 
M
S
 
E
N
 
L
A
 
S
D
 
D
W
 
W
Q
 
N
R
 
K
C
 
V
F
 
L
D
 
Q
I
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
G
A
 
M
W
 
F
N
 
L
C
 
M
C
 
S
K
 
K
A
 
H
V
 
A
L
 
L
P
 
K
S
 
H
L
 
M
I
 
L
E
 
A
Q
 
A
G
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
I
L
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
C
S
|
S
T
 
V
H
 
G
A
 
G
F
 
L
T
 
V
I
 
A
I
 
W
P
 
P
H
 
D
T
 
I
F
 
P
P
 
A
Y
|
Y
P
 
N
V
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
G
A
 
G
L
 
V
I
 
L
G
 
Q
M
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
M
G
 
A
I
 
V
E
 
D
Y
 
Y
A
 
A
S
 
K
K
 
H
G
 
Q
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
L
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
Y
x
I
V
x
I
-
 
D
-
 
T
-
 
P
L
 
L
T
 
N
Q
 
E
K
 
K
A
 
S
Y
 
F
D
 
-
Y
 
L
W
 
E
N
 
N
S
 
N
F
 
E
P
 
G
D
 
T
P
 
L
A
 
E
A
 
E
A
 
I
E
 
K
A
 
K
A
 
E
T
 
K
L
 
A
K
 
K
L
 
V
H
 
N
P
 
P
G
 
L
G
 
L
R
 
R
I
 
L
A
 
G
T
 
K
A
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
N
A
 
V
A
 
M
V
 
L
F
 
F
M
 
L
I
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
L
C
 
S
P
 
S
F
 
Y
M
 
M
N
 
T
A
 
G
T
 
S
C
 
A
L
 
I
T
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
S
 
T

4gh5A Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) (see paper)
33% identity, 89% coverage: 25:255/259 of query aligns to 23:248/248 of 4gh5A

query
sites
4gh5A
E
 
S
A
 
A
F
 
A
L
 
L
S
 
R
E
 
E
R
 
G
A
 
A
A
 
K
L
 
V
F
 
A
L
 
L
L
 
I
D
|
D
R
x
L
D
 
D
G
 
Q
P
 
G
L
 
L
L
 
A
E
 
E
K
 
R
E
 
S
A
 
A
K
 
A
R
 
M
L
 
L
Q
 
S
R
 
T
Q
 
G
G
 
G
Q
 
A
S
 
V
L
 
A
A
 
K
Y
 
G
A
 
F
E
 
G
A
|
A
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
K
A
 
A
E
 
A
A
 
D
I
 
I
E
 
T
S
 
A
T
 
A
L
 
I
S
 
T
A
 
S
A
 
A
A
 
E
S
 
Q
S
 
T
I
 
I
G
 
G
P
 
S
I
 
L
N
 
T
A
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
N
 
A
V
 
G
F
 
F
S
 
G
E
 
S
P
 
V
L
 
H
E
 
D
M
 
A
S
 
D
N
 
A
A
 
A
D
 
A
W
 
W
Q
 
D
R
 
R
C
 
I
F
 
M
D
 
A
I
x
V
N
|
N
L
 
V
R
 
T
G
 
G
A
 
T
W
 
F
N
 
L
C
 
A
C
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
A
S
 
G
L
 
M
I
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
H
G
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
x
F
A
 
G
S
|
S
T
 
V
H
 
A
A
 
G
F
 
L
T
 
V
I
 
G
I
 
I
P
 
P
H
 
T
T
 
M
F
 
A
P
 
A
Y
|
Y
P
 
C
V
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
G
A
 
A
L
 
I
I
 
V
G
 
N
M
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
Q
L
 
M
G
 
A
I
 
A
E
 
D
Y
 
Y
A
 
S
S
 
G
K
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
C
P
|
P
G
 
G
Y
 
T
V
|
V
L
 
T
T
 
S
Q
x
T
K
x
G
A
x
M
Y
 
G
D
 
Q
Y
 
Q
W
 
L
N
 
-
S
 
-
F
 
L
P
 
P
D
 
E
P
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
V
E
 
Q
A
 
A
A
 
R
T
 
R
L
 
L
K
 
A
L
 
K
H
 
Y
P
 
P
G
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
F
A
 
G
T
 
T
A
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
I
F
 
F
M
 
L
I
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
Q
C
 
A
P
 
A
F
 
F
M
 
V
N
 
T
A
 
G
T
 
A
C
 
A
L
 
F
T
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
T
V
 
A
L
 
I

Sites not aligning to the query:

5ojiA Crystal structure of the dehydrogenase/reductase sdr family member 4 (dhrs4) from caenorhabditis elegans (see paper)
31% identity, 97% coverage: 4:253/259 of query aligns to 7:257/260 of 5ojiA

query
sites
5ojiA
R
 
R
L
 
F
K
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
V
I
 
A
M
 
I
V
 
V
T
 
T
G
x
A
A
 
A
A
x
T
Q
 
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
R
F
 
L
L
 
L
S
 
D
E
 
E
R
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
V
F
 
V
L
 
I
L
 
G
D
x
S
R
|
R
D
x
N
G
 
Q
P
 
K
L
x
N
L
 
V
E
 
D
K
 
E
E
 
A
A
 
I
K
 
E
R
 
Y
L
 
L
Q
 
K
R
 
N
Q
 
K
G
 
G
-
 
L
Q
 
T
S
 
K
L
 
V
A
 
A
Y
 
G
A
 
I
E
 
A
A
 
G
D
 
H
I
|
I
T
 
A
D
 
S
A
 
T
E
 
D
A
 
D
I
 
Q
E
 
K
S
 
K
T
 
L
L
 
V
S
 
D
A
 
F
A
 
T
A
 
L
S
 
Q
S
 
K
I
 
F
G
 
G
P
 
K
I
 
I
N
 
N
A
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
H
G
|
G
V
 
I
N
 
N
-
 
P
V
 
A
F
 
F
S
 
G
E
 
H
P
 
I
L
 
L
E
 
E
M
 
V
S
 
S
N
 
D
A
 
Q
D
 
V
W
 
W
Q
 
D
R
 
K
C
 
L
F
 
F
D
 
E
I
 
V
N
 
N
L
 
V
R
 
K
G
 
A
A
 
G
W
 
F
N
 
Q
C
 
M
C
 
T
K
 
K
A
 
L
V
 
V
L
 
H
P
 
P
S
 
H
L
 
I
I
 
A
E
 
K
Q
 
E
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
I
N
 
F
I
x
N
A
 
A
S
|
S
T
 
Y
H
x
S
A
 
A
F
 
Y
T
 
K
I
 
S
I
 
P
P
 
P
H
 
G
T
 
I
F
 
A
P
 
A
Y
|
Y
P
 
G
V
 
V
A
 
T
K
|
K
H
 
T
A
 
T
L
 
L
I
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
A
I
 
M
E
 
G
Y
 
L
A
 
A
S
 
K
K
 
D
G
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
L
 
I
A
 
A
P
 
P
G
|
G
Y
x
V
V
x
I
L
 
K
T
|
T
Q
 
K
K
x
M
A
x
S
Y
 
Q
D
 
V
Y
x
L
W
 
W
N
 
D
S
 
G
F
 
G
P
 
E
D
 
D
P
 
-
A
 
A
A
 
E
A
 
K
E
 
E
A
 
L
A
 
T
T
 
D
L
 
I
K
 
Q
L
 
E
H
 
I
P
 
A
G
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
L
A
 
G
T
 
V
A
 
P
E
 
D
E
 
D
I
 
C
A
 
A
R
 
G
A
 
T
A
 
V
V
 
A
F
 
Y
M
 
L
I
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
C
 
S
P
 
S
F
 
Y
M
 
I
N
 
T
A
 
G
T
 
E
C
 
M
L
 
I
T
 
I
V
 
I
D
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
V
S
 
Q

5ojgA Crystal structure of the dehydrogenase/reductase sdr family member 4 (dhrs4) from caenorhabditis elegans (see paper)
31% identity, 97% coverage: 4:253/259 of query aligns to 7:257/260 of 5ojgA

query
sites
5ojgA
R
 
R
L
 
F
K
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
V
I
 
A
M
 
I
V
 
V
T
 
T
G
x
A
A
 
A
A
x
T
Q
 
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
R
F
 
L
L
 
L
S
 
D
E
 
E
R
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
V
F
 
V
L
 
I
L
 
G
D
x
S
R
|
R
D
x
N
G
 
Q
P
 
K
L
x
N
L
 
V
E
 
D
K
 
E
E
 
A
A
 
I
K
 
E
R
 
Y
L
 
L
Q
 
K
R
 
N
Q
 
K
G
 
G
-
 
L
Q
 
T
S
 
K
L
 
V
A
 
A
Y
 
G
A
 
I
E
 
A
A
 
G
D
 
H
I
|
I
T
 
A
D
 
S
A
 
T
E
 
D
A
 
D
I
 
Q
E
 
K
S
 
K
T
 
L
L
 
V
S
 
D
A
 
F
A
 
T
A
 
L
S
 
Q
S
 
K
I
 
F
G
 
G
P
 
K
I
 
I
N
 
N
A
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
H
G
|
G
V
 
I
N
 
N
-
 
P
V
 
A
F
 
F
S
 
G
E
 
H
P
 
I
L
 
L
E
 
E
M
 
V
S
 
S
N
 
D
A
 
Q
D
 
V
W
 
W
Q
 
D
R
 
K
C
 
L
F
 
F
D
 
E
I
 
V
N
 
N
L
 
V
R
 
K
G
 
A
A
 
G
W
 
F
N
 
Q
C
 
M
C
 
T
K
 
K
A
 
L
V
 
V
L
 
H
P
 
P
S
 
H
L
 
I
I
 
A
E
 
K
Q
 
E
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
I
N
 
F
I
x
N
A
 
A
S
|
S
T
 
Y
H
 
S
A
 
A
F
 
Y
T
 
K
I
 
S
I
 
P
P
 
P
H
 
G
T
 
I
F
 
A
P
 
A
Y
|
Y
P
 
G
V
 
V
A
 
T
K
|
K
H
 
T
A
 
T
L
 
L
I
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
A
I
 
M
E
 
G
Y
 
L
A
 
A
S
 
K
K
 
D
G
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
L
 
I
A
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
 
V
V
x
I
L
 
K
T
|
T
Q
 
K
K
x
M
A
 
S
Y
 
Q
D
 
V
Y
 
L
W
 
W
N
 
D
S
 
G
F
 
G
P
 
E
D
 
D
P
 
-
A
 
A
A
 
E
A
 
K
E
 
E
A
 
L
A
 
T
T
 
D
L
 
I
K
 
Q
L
 
E
H
 
I
P
 
A
G
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
L
A
 
G
T
 
V
A
 
P
E
 
D
E
 
D
I
 
C
A
 
A
R
 
G
A
 
T
A
 
V
V
 
A
F
 
Y
M
 
L
I
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
C
 
S
P
 
S
F
 
Y
M
 
I
N
 
T
A
 
G
T
 
E
C
 
M
L
 
I
T
 
I
V
 
I
D
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
V
S
 
Q

1iy8A Crystal structure of levodione reductase (see paper)
31% identity, 98% coverage: 4:256/259 of query aligns to 1:258/258 of 1iy8A

query
sites
1iy8A
R
 
R
L
 
F
K
 
T
G
 
D
K
 
R
R
 
V
I
 
V
M
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
G
Q
x
S
G
|
G
I
x
L
G
 
G
L
 
R
A
 
A
I
 
T
A
 
A
E
 
V
A
 
R
F
 
L
L
 
A
S
 
A
E
 
E
R
 
G
A
 
A
A
 
K
L
 
L
F
 
S
L
 
L
L
 
V
D
|
D
R
x
V
D
 
S
G
 
S
P
 
E
L
 
G
L
 
L
E
 
E
-
 
A
-
 
S
K
 
K
E
 
A
A
 
A
K
 
V
R
 
L
L
 
E
Q
 
T
R
 
A
Q
 
P
G
 
D
Q
 
A
S
 
E
L
 
V
A
 
L
Y
 
T
A
 
T
E
 
V
A
|
A
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
A
 
E
E
 
A
A
 
Q
I
 
V
E
 
E
S
 
A
T
 
Y
L
 
V
S
 
T
A
 
A
A
 
T
A
 
T
S
 
E
S
 
R
I
 
F
G
 
G
P
 
R
I
 
I
N
 
D
A
 
G
L
 
F
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
x
I
N
 
E
V
 
G
F
 
K
S
 
Q
E
 
N
P
 
P
L
 
T
E
 
E
-
 
S
M
 
F
S
 
T
N
 
A
A
 
A
D
 
E
W
 
F
Q
 
D
R
 
K
C
 
V
F
 
V
D
 
S
I
 
I
N
 
N
L
 
L
R
 
R
G
 
G
A
 
V
W
 
F
N
 
L
C
 
G
C
 
L
K
 
E
A
 
K
V
 
V
L
 
L
P
 
K
S
 
I
L
 
M
I
 
R
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
G
 
S
G
 
G
A
 
M
I
 
V
L
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
T
 
V
H
 
G
A
 
G
F
 
I
T
 
R
I
 
G
I
 
I
P
 
G
H
 
N
T
x
Q
F
 
S
P
 
G
Y
|
Y
P
 
A
V
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
L
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
N
L
 
S
G
 
A
I
 
V
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
S
 
R
K
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
A
V
 
I
L
 
W
T
|
T
Q
x
P
K
x
M
A
 
V
Y
 
E
D
 
N
Y
 
S
W
 
M
N
 
K
S
 
Q
F
 
L
-
 
D
-
 
P
P
 
E
D
 
N
P
 
P
A
 
R
A
 
K
A
 
A
E
 
A
A
 
E
A
 
E
T
 
F
L
 
I
K
 
Q
L
 
V
H
 
N
P
 
P
G
 
S
G
 
K
R
 
R
I
 
Y
A
 
G
T
 
E
A
 
A
E
 
P
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
A
A
 
V
A
 
V
V
 
A
F
 
F
M
 
L
I
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
D
C
 
A
P
 
S
F
 
Y
M
 
V
N
 
N
A
 
A
T
 
T
C
 
V
L
 
V
T
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Q
S
 
S
V
 
A
L
 
A
H
 
Y

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
33% identity, 96% coverage: 4:252/259 of query aligns to 5:245/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
R
 
K
L
 
L
K
 
A
G
 
S
K
 
K
R
 
T
I
 
A
M
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
F
A
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
Q
A
 
V
F
 
L
L
 
A
S
 
R
E
 
E
R
 
G
A
 
A
A
 
R
L
 
V
F
 
I
L
 
I
L
 
A
D
|
D
R
|
R
D
 
D
G
 
A
P
 
H
L
 
G
L
 
-
E
 
E
K
 
A
E
 
A
A
 
A
K
 
A
R
 
S
L
 
L
Q
 
R
R
 
E
Q
 
S
G
 
G
Q
 
A
S
 
Q
L
 
A
A
 
L
Y
 
F
A
 
I
E
 
S
A
x
C
D
 
N
I
|
I
T
 
A
D
 
E
A
 
K
E
 
T
A
 
Q
I
 
V
E
 
E
S
 
A
T
 
L
L
 
F
S
 
S
A
 
Q
A
 
A
A
 
E
S
 
E
S
 
A
I
 
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
N
 
D
A
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
x
I
N
 
N
V
 
R
F
 
D
S
 
A
E
 
M
P
 
L
L
 
H
E
 
K
M
 
L
S
 
T
N
 
E
A
 
A
D
 
D
W
 
W
Q
 
D
R
 
T
C
 
V
F
 
I
D
 
D
I
x
V
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
A
 
T
W
 
F
N
 
L
C
 
C
C
 
M
K
 
Q
A
 
Q
V
 
A
L
 
A
P
 
I
S
 
R
L
 
M
I
 
R
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
G
 
A
G
 
G
A
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
S
T
 
A
H
 
S
A
 
W
F
 
L
T
 
G
I
 
N
I
 
V
P
 
G
H
 
Q
T
 
T
F
 
-
P
 
N
Y
|
Y
P
 
S
V
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
A
A
 
G
L
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
M
T
 
T
K
 
K
A
 
T
L
 
A
G
 
C
I
 
R
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
S
 
K
K
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
C
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
V
x
I
L
 
D
T
|
T
Q
 
-
K
 
-
A
 
-
Y
 
-
D
 
D
Y
 
M
W
x
T
N
 
R
S
 
G
F
 
V
P
 
P
D
 
E
P
 
N
A
 
-
A
 
V
A
 
W
E
 
Q
A
 
I
A
 
M
T
 
V
L
 
S
K
 
K
L
 
I
H
 
-
P
 
P
G
 
A
G
 
G
R
 
Y
I
 
A
A
 
G
T
 
E
A
 
A
E
 
K
E
 
D
I
 
V
A
 
G
R
 
E
A
 
C
A
 
V
V
 
A
F
 
F
M
 
L
I
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
G
C
 
A
P
 
R
F
 
Y
M
 
I
N
 
N
A
 
G
T
 
E
C
 
V
L
 
I
T
 
N
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
M

Q9LBG2 Levodione reductase; (6R)-2,2,6-trimethyl-1,4-cyclohexanedione reductase; EC 1.1.1.- from Leifsonia aquatica (Corynebacterium aquaticum) (see paper)
30% identity, 98% coverage: 2:256/259 of query aligns to 8:267/267 of Q9LBG2

query
sites
Q9LBG2
S
 
T
D
 
T
R
 
R
L
 
F
K
 
T
G
 
D
K
 
R
R
 
V
I
 
V
M
x
L
V
x
I
T
|
T
G
|
G
A
x
G
A
x
G
Q
x
S
G
|
G
I
x
L
G
|
G
L
x
R
A
|
A
I
x
T
A
|
A
E
x
V
A
x
R
F
x
L
L
x
A
S
x
A
E
|
E
R
x
G
A
|
A
A
x
K
L
|
L
F
x
S
L
|
L
L
 
V
D
 
D
R
 
V
D
 
S
G
 
S
P
 
E
L
 
G
L
 
L
E
 
E
-
 
A
-
 
S
K
 
K
E
 
A
A
 
A
K
 
V
R
 
L
L
 
E
Q
 
T
R
 
A
Q
 
P
G
 
D
Q
 
A
S
 
E
L
 
V
A
 
L
Y
 
T
A
 
T
E
 
V
A
 
A
D
 
D
I
 
V
T
 
S
D
 
D
A
 
E
E
 
A
A
 
Q
I
 
V
E
 
E
S
 
A
T
 
Y
L
 
V
S
 
T
A
 
A
A
 
T
A
 
T
S
 
E
S
 
R
I
 
F
G
 
G
P
 
R
I
 
I
N
 
D
A
 
G
L
 
F
V
 
F
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
N
x
E
V
 
G
F
 
K
S
 
Q
E
 
N
P
 
P
L
 
T
E
 
E
-
 
S
M
 
F
S
 
T
N
 
A
A
 
A
D
 
E
W
 
F
Q
 
D
R
 
K
C
 
V
F
 
V
D
 
S
I
 
I
N
 
N
L
 
L
R
 
R
G
 
G
A
 
V
W
 
F
N
 
L
C
 
G
C
 
L
K
 
E
A
 
K
V
 
V
L
 
L
P
 
K
S
 
I
L
 
M
I
 
R
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
G
 
S
G
 
G
A
 
M
I
 
V
L
 
V
N
 
N
I
 
T
A
 
A
S
 
S
T
 
V
H
 
G
A
 
G
F
 
I
T
 
R
I
 
G
I
 
I
P
 
G
H
 
N
T
 
Q
F
 
S
P
 
G
Y
 
Y
P
 
A
V
 
A
A
 
A
K
 
K
H
 
H
A
 
G
L
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
N
L
 
S
G
 
A
I
 
V
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
S
 
R
K
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
A
V
 
I
L
 
W
T
 
T
Q
 
P
K
 
M
A
 
V
Y
 
E
D
 
N
Y
 
S
W
 
M
N
 
K
S
 
Q
F
 
L
-
 
D
-
 
P
P
 
E
D
 
N
P
 
P
A
 
R
A
 
K
A
 
A
E
 
A
A
 
E
A
 
E
T
 
F
L
 
I
K
 
Q
L
 
V
H
 
N
P
 
P
G
 
S
G
 
K
R
 
R
I
 
Y
A
 
G
T
 
E
A
 
A
E
 
P
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
A
A
 
V
A
 
V
V
 
A
F
 
F
M
 
L
I
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
D
C
 
A
P
 
S
F
 
Y
M
 
V
N
 
N
A
 
A
T
 
T
C
 
V
L
 
V
T
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Q
S
 
S
V
 
A
L
 
A
H
 
Y

Query Sequence

>SM_b20511 FitnessBrowser__Smeli:SM_b20511
MSDRLKGKRIMVTGAAQGIGLAIAEAFLSERAALFLLDRDGPLLEKEAKRLQRQGQSLAY
AEADITDAEAIESTLSAAASSIGPINALVNNAGVNVFSEPLEMSNADWQRCFDINLRGAW
NCCKAVLPSLIEQGGGAILNIASTHAFTIIPHTFPYPVAKHALIGMTKALGIEYASKGVR
VNALAPGYVLTQKAYDYWNSFPDPAAAEAATLKLHPGGRIATAEEIARAAVFMISDECPF
MNATCLTVDGGLSVLHHPA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory