SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SM_b21143 FitnessBrowser__Smeli:SM_b21143 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6kgyB Hocl-induced flavoprotein disulfide reductase rcla from escherichia coli (see paper)
38% identity, 96% coverage: 17:468/473 of query aligns to 1:438/441 of 6kgyB

query
sites
6kgyB
M
 
M
N
 
N
K
 
K
H
 
-
F
 
Y
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
I
I
|
I
G
 
G
A
 
F
G
|
G
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
P
 
K
S
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
V
R
 
T
L
 
L
S
 
A
G
 
K
V
 
A
G
 
G
K
 
W
T
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
|
E
R
x
Q
K
 
S
-
 
N
-
 
A
L
x
M
F
 
Y
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
V
 
I
N
 
N
T
 
I
G
|
G
C
|
C
M
 
I
P
 
P
T
|
T
K
 
K
A
 
T
M
 
L
V
 
V
A
 
H
S
 
D
A
 
A
Y
 
Q
A
 
Q
I
 
-
H
 
H
T
 
T
A
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
-
M
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
S
 
-
V
 
-
D
 
D
F
 
F
G
 
V
R
 
R
V
 
A
M
 
I
A
 
Q
R
 
R
K
 
K
E
 
N
K
 
E
V
 
V
R
 
V
L
 
N
D
 
F
A
 
L
R
 
R
S
 
N
G
 
K
V
 
N
E
 
F
K
 
H
W
 
N
L
 
L
K
 
A
G
 
D
M
 
M
K
 
P
N
 
N
C
 
I
T
 
D
V
 
V
F
 
I
E
 
D
G
 
G
H
 
Q
A
|
A
R
 
E
F
 
F
E
 
I
G
 
N
P
 
N
R
 
H
E
 
S
V
 
L
R
 
R
I
 
V
-
 
H
-
 
R
-
 
P
-
 
E
G
 
G
D
 
N
E
 
L
L
 
E
I
 
I
S
 
H
G
 
G
E
 
E
R
 
K
I
 
I
F
 
F
V
 
I
N
|
N
V
x
T
G
|
G
G
 
A
R
 
Q
A
 
T
A
 
V
V
 
V
A
 
P
D
 
P
L
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
I
N
 
T
D
 
T
V
 
T
P
 
P
Y
 
G
L
 
V
T
 
Y
N
 
D
S
 
S
S
 
T
-
 
G
I
 
L
M
 
L
D
 
N
L
 
L
A
 
K
E
 
E
L
 
L
P
 
P
E
 
G
H
 
H
L
 
L
V
 
G
V
 
I
V
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
G
Y
|
Y
I
 
I
G
 
G
L
 
V
E
|
E
F
 
F
A
 
A
Q
 
S
M
 
M
F
 
F
R
 
A
R
 
N
F
 
F
G
 
G
S
 
S
D
 
K
V
 
V
T
 
T
V
 
I
I
 
L
E
 
E
K
 
A
G
 
A
A
 
S
R
 
L
L
 
F
I
 
L
G
 
P
R
 
R
E
 
E
D
 
D
P
 
R
E
 
D
V
 
I
S
 
A
D
 
D
A
 
N
I
 
I
R
 
A
E
 
T
I
 
I
L
 
L
E
 
R
N
 
D
E
 
Q
G
 
G
V
 
V
R
 
D
I
 
I
R
 
I
T
 
L
N
 
N
A
 
A
E
 
H
C
 
V
I
 
E
R
 
R
F
 
I
S
 
S
N
 
H
H
 
H
A
 
E
D
 
N
S
 
Q
V
 
V
A
 
Q
V
 
V
G
 
H
V
 
-
D
 
-
C
 
-
T
 
-
S
 
S
G
 
E
E
 
H
P
 
A
E
 
Q
V
 
L
S
 
A
G
 
V
S
 
D
H
 
A
V
 
L
L
 
L
L
 
I
A
 
A
T
 
S
G
 
G
R
 
R
H
 
Q
P
 
P
N
 
A
T
 
T
D
 
A
D
 
S
L
 
L
G
 
H
L
 
P
D
 
E
K
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
K
 
A
T
 
V
D
 
N
E
 
E
R
 
R
G
 
G
Y
 
A
I
 
T
E
 
V
V
 
V
D
 
D
D
 
K
S
 
R
L
 
L
R
 
H
T
 
T
N
 
T
V
 
A
P
 
D
H
 
N
I
 
I
F
 
W
A
 
A
M
 
M
G
|
G
D
|
D
C
 
V
N
 
T
G
 
G
R
 
G
G
 
L
A
 
Q
F
|
F
T
|
T
H
x
Y
T
 
I
S
|
S
Y
 
L
N
 
D
D
 
D
F
 
Y
E
 
R
I
 
I
V
 
V
A
 
R
A
 
D
N
 
E
L
 
L
I
 
L
D
 
G
N
 
E
D
 
G
P
 
K
R
 
R
R
 
S
V
 
T
S
 
D
D
 
D
R
 
R
I
 
K
Q
 
N
T
 
V
-
 
P
Y
 
Y
A
 
S
L
 
V
Y
x
F
I
 
M
D
 
T
P
 
P
P
 
P
L
 
L
G
 
S
R
 
R
A
 
V
G
 
G
M
 
M
T
 
T
E
 
E
T
 
E
E
 
Q
A
 
A
R
 
R
K
 
E
K
 
S
G
 
G
H
 
A
K
 
D
L
 
I
L
 
Q
V
 
V
G
 
V
T
 
T
R
 
L
P
 
P
M
 
V
T
 
A
R
 
A
V
 
I
G
 
P
R
 
R
A
 
A
V
 
R
E
 
V
K
 
M
G
 
N
E
 
D
T
 
T
Q
 
R
G
 
G
F
 
V
M
 
L
K
 
K
V
 
A
I
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
N
E
 
K
T
 
T
D
 
Q
E
 
R
I
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
I
 
L
L
 
L
G
 
C
T
 
V
G
 
D
G
 
S
D
 
H
E
 
E
A
 
M
V
 
I
Q
 
N
S
 
I
I
 
V
L
 
K
D
 
M
V
 
V
M
 
M
Y
 
D
A
 
A
K
 
G
K
 
L
P
 
P
Y
 
Y
T
 
S
M
 
I
I
 
L
A
 
R
R
 
D
A
 
Q
V
 
I
H
 
F
I
 
T
H
|
H
P
 
P
T
 
S
V
 
M
S
 
S
E
|
E
L
 
S
I
 
L
P
 
N
T
 
D
V
 
L
F
 
F
G
 
S

6kyyA Cu(ii) complex of hocl-induced flavoprotein disulfide reductase rcla from escherichia coli (see paper)
38% identity, 94% coverage: 23:468/473 of query aligns to 2:429/432 of 6kyyA

query
sites
6kyyA
A
 
A
V
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
x
F
G
|
G
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
P
 
K
S
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
V
R
 
T
L
 
L
S
 
A
G
 
K
V
 
A
G
 
G
K
 
W
T
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
|
E
R
x
Q
K
 
S
-
 
N
-
 
A
L
x
M
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
|
T
C
|
C
V
 
I
N
 
N
T
 
I
G
 
G
C
|
C
M
 
I
P
 
P
T
|
T
K
|
K
A
 
T
M
 
L
V
 
V
A
 
H
S
 
D
A
 
A
Y
 
Q
A
 
Q
I
 
-
H
 
H
T
 
T
A
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
-
M
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
S
 
-
V
 
-
D
 
D
F
 
F
G
 
V
R
 
R
V
 
A
M
 
I
A
 
Q
R
 
R
K
 
K
E
 
N
K
 
E
V
 
V
R
 
V
L
 
N
D
 
F
A
 
L
R
 
R
S
 
N
G
 
K
V
 
N
E
 
F
K
 
H
W
 
N
L
 
L
K
 
A
G
 
D
M
 
M
K
 
P
N
 
N
C
 
I
T
 
D
V
 
V
F
 
I
E
 
D
G
 
G
H
 
Q
A
|
A
R
 
E
F
 
F
E
 
I
G
 
N
P
 
N
R
 
H
E
 
S
V
 
L
R
 
R
I
 
V
G
 
H
D
 
L
E
 
E
L
 
-
I
 
I
S
 
H
G
 
G
E
 
E
R
 
K
I
 
I
F
 
F
V
 
I
N
|
N
V
x
T
G
|
G
G
 
A
R
 
Q
A
 
T
A
 
V
V
 
V
A
 
P
D
 
P
L
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
I
N
 
T
D
 
T
V
 
T
P
 
P
Y
 
G
L
 
V
T
 
Y
N
 
D
S
 
S
S
 
T
-
 
G
I
 
L
M
 
L
D
 
N
L
 
L
A
 
K
E
 
E
L
 
L
P
 
P
E
 
G
H
 
H
L
 
L
V
 
G
V
 
I
V
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
G
Y
|
Y
I
|
I
G
 
G
L
 
V
E
|
E
F
 
F
A
 
A
Q
 
S
M
 
M
F
 
F
R
 
A
R
 
N
F
 
F
G
 
G
S
 
S
D
 
K
V
 
V
T
 
T
V
 
I
I
 
L
E
 
E
K
 
A
G
 
A
A
 
S
R
 
L
L
 
F
I
 
L
G
 
P
R
 
R
E
 
E
D
 
D
P
 
R
E
 
D
V
 
I
S
 
A
D
 
D
A
 
N
I
 
I
R
 
A
E
 
T
I
 
I
L
 
L
E
 
R
N
 
D
E
 
Q
G
 
G
V
 
V
R
 
D
I
 
I
R
 
I
T
 
L
N
 
N
A
 
A
E
 
H
C
 
V
I
 
E
R
 
R
F
 
I
S
 
S
N
 
H
H
 
H
A
 
E
D
 
N
S
 
Q
V
 
V
A
 
Q
V
 
V
G
x
H
V
 
-
D
 
-
C
 
-
T
 
-
S
 
S
G
 
E
E
x
H
P
 
A
E
 
Q
V
 
L
S
 
A
G
 
V
S
 
D
H
 
A
V
 
L
L
 
L
L
 
I
A
 
A
T
 
S
G
 
G
R
|
R
H
 
Q
P
 
P
N
 
A
T
 
T
D
 
A
D
 
S
L
 
L
G
 
H
L
 
P
D
 
E
K
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
K
 
A
T
 
V
D
 
N
E
 
E
R
 
R
G
 
G
Y
 
A
I
 
T
E
 
V
V
 
V
D
 
D
D
 
K
S
 
R
L
 
L
R
 
H
T
 
T
N
 
T
V
 
A
P
 
D
H
 
N
I
 
I
F
 
W
A
 
A
M
 
M
G
 
G
D
|
D
C
 
V
N
 
T
G
 
G
R
 
G
G
 
L
A
 
Q
F
|
F
T
|
T
H
 
Y
T
 
I
S
|
S
Y
 
L
N
 
D
D
 
D
F
 
Y
E
 
R
I
 
I
V
 
V
A
 
R
A
 
D
N
 
E
L
 
L
I
 
L
D
 
G
N
 
E
D
 
G
P
 
K
R
 
R
R
 
S
V
 
T
S
 
D
D
 
D
R
 
R
I
 
K
Q
 
N
T
 
V
-
 
P
Y
 
Y
A
 
S
L
 
V
Y
 
F
I
 
M
D
 
T
P
 
P
P
 
P
L
 
L
G
 
S
R
 
R
A
 
V
G
 
G
M
 
M
T
 
T
E
 
E
T
 
E
E
 
Q
A
 
A
R
 
R
K
 
E
K
 
S
G
 
G
H
 
A
K
 
D
L
 
I
L
 
Q
V
 
V
G
 
V
T
 
T
R
 
L
P
 
P
M
 
V
T
 
A
R
 
A
V
 
I
G
 
P
R
 
R
A
 
A
V
 
R
E
 
V
K
 
M
G
 
N
E
 
D
T
 
T
Q
 
R
G
 
G
F
 
V
M
 
L
K
 
K
V
 
A
I
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
N
E
 
K
T
 
T
D
 
Q
E
 
R
I
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
I
 
L
L
 
L
G
 
C
T
 
V
G
 
D
G
 
S
D
 
H
E
 
E
A
 
M
V
 
I
Q
 
N
S
 
I
I
 
V
L
 
K
D
 
M
V
 
V
M
 
M
Y
 
D
A
 
A
K
 
G
K
 
L
P
 
P
Y
 
Y
T
 
S
M
 
I
I
 
L
A
 
R
R
 
D
A
 
Q
V
 
I
H
 
F
I
 
T
H
|
H
P
 
P
T
 
S
V
 
M
S
 
S
E
|
E
L
 
S
I
 
L
P
 
N
T
 
D
V
 
L
F
 
F
G
 
S

8ajjA Crystal structure of the disulfide reductase mera from staphylococcus aureus (see paper)
33% identity, 95% coverage: 21:468/473 of query aligns to 2:437/442 of 8ajjA

query
sites
8ajjA
F
 
Y
D
 
D
A
 
L
V
 
I
I
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
F
G
|
G
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
P
 
K
S
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
K
R
 
Y
L
 
A
S
 
A
G
 
S
V
 
T
G
 
G
K
 
Q
T
 
H
V
 
V
A
 
A
L
 
V
I
 
I
E
|
E
R
x
Q
-
 
S
-
 
P
K
 
K
L
x
M
F
 
Y
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
V
 
I
N
 
N
T
 
I
G
 
G
C
|
C
M
 
I
P
 
P
T
 
S
K
|
K
A
 
T
M
 
L
V
 
V
A
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
A
 
-
I
 
-
H
 
H
T
 
D
A
 
G
R
 
L
R
 
E
G
 
G
A
 
K
E
 
S
Y
 
-
G
 
-
M
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
S
 
-
V
 
-
D
 
-
F
 
F
G
 
E
R
 
A
V
 
S
M
 
Y
A
 
N
R
 
R
K
 
K
E
 
N
K
 
D
V
 
V
R
 
V
L
 
N
D
 
A
A
 
L
R
 
N
S
 
N
G
 
K
V
 
N
E
 
Y
K
 
H
W
 
L
L
 
L
K
 
A
G
 
D
M
 
D
K
 
N
N
 
N
C
 
I
T
 
D
V
 
V
F
 
L
E
 
D
G
 
F
H
 
K
A
|
A
R
 
Q
F
 
F
E
 
K
G
 
S
P
 
N
R
 
T
E
 
E
V
 
V
R
 
N
I
 
L
G
 
L
D
 
D
E
 
Q
L
 
H
-
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
V
-
 
D
-
 
S
I
 
I
S
 
T
G
 
A
E
 
P
R
 
H
I
 
I
F
 
I
V
 
I
N
|
N
V
x
T
G
|
G
G
 
A
R
 
T
A
 
S
A
 
V
V
 
I
A
 
P
D
 
N
L
 
I
P
 
K
G
 
G
V
 
L
N
 
D
D
 
Q
V
 
A
P
 
K
Y
 
H
L
 
V
T
 
F
N
 
D
S
 
S
S
 
T
-
 
G
I
 
L
M
 
L
D
 
N
L
 
I
A
 
S
E
 
Y
L
 
Q
P
 
P
E
 
K
H
 
H
L
 
L
V
 
V
V
 
I
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
G
Y
 
Y
I
|
I
G
 
A
L
 
L
E
 
E
F
 
F
A
 
A
Q
 
S
M
 
M
F
 
F
R
 
A
R
 
N
F
 
L
G
 
G
S
 
S
D
 
K
V
 
V
T
 
T
V
 
V
I
 
L
E
 
E
K
 
R
G
 
G
A
 
E
R
 
S
L
 
F
I
 
M
G
 
P
R
 
R
E
 
E
D
 
D
P
 
Q
E
 
D
V
 
V
S
 
V
D
 
A
A
 
Y
I
 
G
R
 
I
E
 
T
I
 
D
L
 
L
E
 
E
N
 
N
E
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
A
I
 
L
R
 
H
T
 
T
N
 
N
A
 
V
E
 
E
C
 
T
I
 
T
R
 
E
F
 
L
S
 
S
-
 
S
-
 
D
N
 
N
H
 
H
A
 
H
D
 
T
S
 
T
V
 
V
A
 
H
V
 
T
G
 
N
V
 
V
D
 
D
C
 
N
T
 
F
S
 
E
G
 
A
E
 
D
P
 
A
E
 
-
V
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
H
 
-
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
I
G
 
G
R
 
R
H
 
K
P
 
P
N
|
N
T
 
T
D
 
D
D
 
-
L
 
L
G
 
A
L
 
L
D
 
E
K
 
N
A
 
T
G
 
D
V
 
I
K
 
E
T
 
L
D
 
G
E
 
D
R
 
R
G
 
G
Y
 
E
I
 
I
E
 
K
V
 
V
D
 
N
D
 
A
S
 
H
L
 
L
R
 
Q
T
 
T
N
 
T
V
 
V
P
 
P
H
 
H
I
 
I
F
 
Y
A
 
A
M
 
A
G
|
G
D
|
D
C
 
V
N
 
K
G
 
G
R
 
G
G
 
L
A
x
Q
F
|
F
T
|
T
H
x
Y
T
 
I
S
|
S
Y
 
L
N
 
D
D
 
D
F
 
Y
E
 
R
I
 
I
V
 
I
A
 
K
A
 
S
N
 
A
L
 
L
I
 
Y
D
 
G
N
 
N
D
 
Q
P
 
S
R
 
R
R
 
T
V
 
T
S
 
D
D
 
N
R
 
R
I
 
G
Q
 
S
T
 
V
-
 
P
Y
 
Y
A
 
T
L
 
V
Y
 
F
I
 
I
D
 
D
P
 
P
P
 
P
L
 
L
G
 
S
R
 
R
A
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
E
 
S
T
 
K
E
 
E
A
 
A
R
 
A
K
 
A
K
 
Q
G
 
H
-
 
Y
-
x
D
-
x
Y
-
 
T
-
 
E
H
 
H
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
V
 
V
G
 
S
T
 
A
R
 
I
P
 
P
M
 
R
T
 
H
R
 
K
V
 
I
G
 
N
R
 
N
A
 
-
V
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
D
T
 
P
Q
 
R
G
 
G
F
 
L
M
 
F
K
 
K
V
 
V
I
 
V
V
 
I
D
 
N
A
 
N
E
 
E
T
 
N
D
 
N
E
 
M
I
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
T
I
 
L
L
 
Y
G
 
G
T
 
K
G
 
Q
G
 
S
D
 
E
E
 
E
A
 
L
V
 
I
Q
 
N
S
 
I
I
 
I
L
 
K
D
 
L
V
 
A
M
 
I
Y
 
D
A
 
Q
K
 
N
K
 
I
P
 
P
Y
 
Y
T
 
T
M
 
V
I
 
L
A
 
R
R
 
D
A
 
N
V
 
I
H
 
Y
I
 
T
H
 
H
P
 
P
T
 
T
V
 
M
S
 
A
E
 
E
L
 
S
I
 
F
P
 
N
T
 
D
V
 
L
F
 
F
G
 
N

Sites not aligning to the query:

8ajkB Crystal structure of a c43s variant from the disulfide reductase mera from staphylococcus aureus (see paper)
33% identity, 95% coverage: 19:468/473 of query aligns to 3:440/447 of 8ajkB

query
sites
8ajkB
K
 
K
H
 
T
F
 
Y
D
 
D
A
 
L
V
 
I
I
 
V
I
 
I
G
|
G
A
 
F
G
|
G
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
P
 
K
S
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
K
R
 
Y
L
 
A
S
 
A
G
 
S
V
 
T
G
 
G
K
 
Q
T
 
H
V
 
V
A
 
A
L
 
V
I
 
I
E
|
E
R
x
Q
-
 
S
-
 
P
K
 
K
L
x
M
F
 
Y
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
 
S
V
 
I
N
 
N
T
 
I
G
|
G
C
|
C
M
 
I
P
 
P
T
 
S
K
|
K
A
 
T
M
 
L
V
 
V
A
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
A
 
-
I
 
-
H
 
H
T
 
D
A
 
G
R
 
L
R
 
E
G
 
G
A
 
K
E
 
S
Y
 
-
G
 
-
M
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
S
 
-
V
 
-
D
 
-
F
 
F
G
 
E
R
 
A
V
 
S
M
 
Y
A
 
N
R
 
R
K
 
K
E
 
N
K
 
D
V
 
V
R
 
V
L
 
N
D
 
A
A
 
L
R
 
N
S
 
N
G
 
K
V
 
N
E
 
Y
K
 
H
W
 
L
L
 
L
K
 
A
G
 
D
M
 
D
K
 
N
N
 
N
C
 
I
T
 
D
V
 
V
F
 
L
E
 
D
G
 
F
H
x
K
A
|
A
R
 
Q
F
 
F
E
 
K
G
 
S
P
 
N
R
 
T
E
 
E
V
 
V
R
 
N
I
 
L
G
 
L
D
 
D
E
 
Q
L
 
H
-
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
V
-
 
D
-
 
S
I
 
I
S
 
T
G
 
A
E
 
P
R
 
H
I
 
I
F
 
I
V
 
I
N
|
N
V
x
T
G
|
G
G
 
A
R
 
T
A
 
S
A
 
V
V
 
I
A
 
P
D
 
N
L
 
I
P
 
K
G
 
G
V
 
L
N
 
D
D
 
Q
V
 
A
P
 
K
Y
 
H
L
 
V
T
 
F
N
 
D
S
 
S
S
 
T
-
 
G
I
 
L
M
 
L
D
 
N
L
 
I
A
 
S
E
 
Y
L
 
Q
P
 
P
E
 
K
H
 
H
L
 
L
V
 
V
V
 
I
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
G
Y
 
Y
I
 
I
G
 
A
L
 
L
E
 
E
F
 
F
A
 
A
Q
 
S
M
 
M
F
 
F
R
 
A
R
 
N
F
 
L
G
 
G
S
 
S
D
 
K
V
 
V
T
 
T
V
 
V
I
 
L
E
 
E
K
 
R
G
 
G
A
 
E
R
 
S
L
 
F
I
 
M
G
 
P
R
 
R
E
 
E
D
 
D
P
 
Q
E
 
D
V
 
V
S
 
V
D
 
A
A
 
Y
I
 
G
R
 
I
E
 
T
I
 
D
L
 
L
E
 
E
N
 
N
E
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
A
I
 
L
R
 
H
T
 
T
N
 
N
A
 
V
E
 
E
C
 
T
I
 
T
R
 
E
F
 
L
S
 
S
-
 
S
-
 
D
N
 
N
H
 
H
A
 
H
D
 
T
S
 
T
V
 
V
A
 
H
V
 
T
G
 
N
V
 
V
D
 
D
C
 
N
T
 
F
S
 
E
G
 
A
E
 
D
P
 
A
E
 
-
V
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
H
 
-
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
I
G
 
G
R
 
R
H
 
K
P
 
P
N
 
N
T
 
T
D
 
D
D
 
-
L
 
L
G
 
A
L
 
L
D
 
E
K
 
N
A
 
T
G
 
D
V
 
I
K
 
E
T
 
L
D
 
G
E
 
D
R
 
R
G
 
G
Y
 
E
I
 
I
E
 
K
V
 
V
D
 
N
D
 
A
S
 
H
L
 
L
R
 
Q
T
 
T
N
 
T
V
 
V
P
 
P
H
 
H
I
 
I
F
 
Y
A
 
A
M
 
A
G
|
G
D
|
D
C
 
V
N
 
K
G
 
G
R
 
G
G
 
L
A
x
Q
F
|
F
T
|
T
H
x
Y
T
 
I
S
|
S
Y
 
L
N
 
D
D
 
D
F
 
Y
E
 
R
I
 
I
V
 
I
A
 
K
A
 
S
N
 
A
L
 
L
I
 
Y
D
 
G
N
 
N
D
 
Q
P
 
S
R
 
R
R
 
T
V
 
T
S
 
D
D
 
N
R
 
R
I
 
G
Q
 
S
T
 
V
-
 
P
Y
 
Y
A
 
T
L
 
V
Y
 
F
I
 
I
D
 
D
P
 
P
P
 
P
L
 
L
G
 
S
R
 
R
A
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
E
 
S
T
 
K
E
 
E
A
 
A
R
 
A
K
 
A
K
 
Q
G
 
H
-
 
Y
-
 
D
-
 
Y
-
 
T
-
 
E
H
 
H
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
V
 
V
G
 
S
T
 
A
R
 
I
P
 
P
M
 
R
T
 
H
R
 
K
V
 
I
G
 
N
R
 
N
A
 
-
V
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
D
T
 
P
Q
 
R
G
 
G
F
 
L
M
 
F
K
 
K
V
 
V
I
 
V
V
 
I
D
 
N
A
 
N
E
 
E
T
 
N
D
 
N
E
 
M
I
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
T
I
 
L
L
 
Y
G
 
G
T
 
K
G
 
Q
G
 
S
D
 
E
E
 
E
A
 
L
V
 
I
Q
 
N
S
 
I
I
 
I
L
 
K
D
 
L
V
 
A
M
 
I
Y
 
D
A
 
Q
K
 
N
K
 
I
P
 
P
Y
 
Y
T
 
T
M
 
V
I
 
L
A
 
R
R
 
D
A
 
N
V
 
I
H
 
Y
I
 
T
H
 
H
P
 
P
T
 
T
V
 
M
S
 
A
E
 
E
L
 
S
I
 
F
P
 
N
T
 
D
V
 
L
F
 
F
G
 
N

P16171 Mercuric reductase; Hg(II) reductase; EC 1.16.1.1 from Bacillus cereus (see paper)
30% identity, 90% coverage: 18:442/473 of query aligns to 167:584/631 of P16171

query
sites
P16171
N
 
N
K
 
Y
H
 
D
F
 
Y
D
 
D
A
 
Y
V
 
I
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
S
G
 
G
Q
 
G
A
 
A
G
 
A
P
 
F
S
 
S
L
 
S
A
 
A
G
 
I
R
 
E
L
 
A
S
 
V
G
 
A
V
 
L
G
 
N
K
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
M
I
 
I
E
 
E
R
 
R
K
 
G
L
 
T
F
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
T
C
 
C
V
 
V
N
 
N
T
 
V
G
 
G
C
 
C
M
 
V
P
 
P
T
 
S
K
 
K
A
 
T
M
 
L
V
 
L
A
 
R
S
 
A
A
 
G
Y
 
E
A
 
I
I
 
N
H
 
H
T
 
L
A
 
A
R
 
K
R
 
N
G
 
N
A
 
P
E
 
F
Y
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
H
T
 
T
G
 
S
P
 
A
V
 
S
S
 
N
V
 
V
D
 
D
F
 
L
G
 
A
R
 
P
V
 
L
M
 
V
A
 
K
R
 
Q
K
 
K
E
 
N
K
 
D
V
 
L
R
 
V
L
 
T
D
 
E
A
 
M
R
 
R
S
 
N
G
 
-
V
 
-
E
 
E
K
 
K
W
x
Y
L
 
V
K
 
N
G
 
L
M
 
I
K
 
D
N
 
D
C
 
Y
-
 
G
-
 
F
T
 
E
V
 
L
F
 
I
E
 
K
G
 
G
H
 
E
A
 
S
R
 
K
F
 
F
E
 
V
G
 
N
P
 
E
R
 
N
E
 
T
V
 
V
R
 
E
I
 
V
G
 
N
D
 
G
E
 
N
L
 
Q
I
 
I
S
 
T
G
 
A
E
 
K
R
 
R
I
 
F
F
 
L
V
 
I
N
 
A
V
 
T
G
 
G
G
 
A
R
 
S
A
 
S
A
 
T
V
 
A
A
 
P
D
 
N
L
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
L
N
 
D
D
 
E
V
 
V
P
 
D
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
N
 
S
S
 
T
S
 
S
I
 
L
M
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
K
E
 
K
L
 
V
P
 
P
E
 
N
H
 
R
L
 
L
V
 
T
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
S
S
 
G
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
L
 
M
E
 
E
F
 
L
A
 
G
Q
 
Q
M
 
L
F
 
F
R
 
H
R
 
N
F
 
L
G
 
G
S
 
S
D
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
L
I
 
I
E
 
Q
K
 
R
G
 
S
A
 
E
R
 
R
L
 
L
I
 
L
G
 
K
R
 
E
E
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
I
S
 
S
D
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
T
E
 
K
I
 
A
L
 
L
E
 
T
N
 
E
E
 
Q
G
 
G
V
 
I
R
 
N
I
 
L
R
 
V
T
 
T
N
 
G
A
 
A
E
 
T
C
 
Y
I
 
E
R
 
R
F
 
V
S
 
E
N
 
Q
H
 
D
A
 
G
D
 
D
S
 
I
V
 
K
A
 
K
V
 
V
G
 
H
V
 
V
D
 
E
C
 
I
T
 
N
S
 
G
G
 
K
E
 
K
P
 
R
E
 
I
V
 
I
S
 
E
G
 
A
S
 
E
H
 
Q
V
 
L
L
 
L
L
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
H
 
K
P
 
P
N
 
I
T
 
Q
D
 
T
D
 
S
L
 
L
G
 
N
L
 
L
D
 
H
K
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
E
T
 
V
D
 
G
E
 
S
R
 
R
G
 
G
Y
 
E
I
 
I
E
 
V
V
 
I
D
 
D
D
 
D
S
 
Y
L
 
L
R
 
K
T
 
T
N
 
T
V
 
N
P
 
S
H
 
R
I
 
I
F
 
Y
A
 
S
M
 
A
G
 
G
D
 
D
C
 
V
N
 
T
G
 
P
R
 
G
G
 
P
A
 
Q
F
 
F
T
 
V
H
 
Y
T
 
V
S
 
A
Y
 
A
N
 
Y
D
 
E
F
 
G
E
 
G
I
 
L
V
 
A
A
 
A
A
 
R
N
 
N
L
 
A
I
 
I
D
 
G
N
 
G
D
 
L
P
 
N
R
 
Q
R
 
K
V
 
V
S
 
N
D
 
L
R
 
E
I
 
V
Q
 
V
T
 
P
Y
 
G
A
 
V
L
 
T
Y
 
F
I
 
T
D
 
S
P
 
P
P
 
S
L
 
I
G
 
A
R
 
T
A
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
E
 
E
T
 
Q
E
 
Q
A
 
A
R
 
K
K
 
E
K
 
K
G
 
G
H
 
Y
K
 
E
L
 
V
L
 
K
V
 
T
G
 
S
T
 
V
R
 
L
P
 
P
M
 
L
T
 
D
R
 
A
V
 
V
G
 
P
R
 
R
A
 
A
V
 
L
E
 
V
K
 
N
G
 
R
E
 
E
T
 
T
Q
 
T
G
 
G
F
 
V
M
 
F
K
 
K
V
 
L
I
 
V
V
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
K
T
 
T
D
 
L
E
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
H
I
 
V
L
 
V
G
 
A
T
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
E
S
 
N
I
 
A
L
 
G
D
 
D
V
 
V
M
 
I
Y
 
Y
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2eq6A Crystal structure of lipoamide dehydrogenase from thermus thermophilus hb8
33% identity, 94% coverage: 19:461/473 of query aligns to 2:442/460 of 2eq6A

query
sites
2eq6A
K
 
K
H
 
T
F
 
Y
D
 
D
A
 
L
V
 
I
I
 
V
I
|
I
G
|
G
A
 
T
G
|
G
Q
x
P
A
x
G
G
 
G
P
 
Y
S
 
H
L
 
A
A
 
A
G
 
I
R
 
R
L
 
A
S
 
A
G
 
Q
V
 
L
G
 
G
K
 
L
T
 
K
V
 
V
A
 
L
L
 
A
I
 
V
E
|
E
R
x
A
K
 
G
L
 
E
F
x
V
G
 
G
G
|
G
T
x
V
C
|
C
V
 
L
N
 
N
T
 
V
G
|
G
C
|
C
M
 
I
P
 
P
T
|
T
K
|
K
A
 
A
M
 
L
V
 
L
A
 
H
S
 
A
A
 
A
Y
 
E
A
 
T
I
 
L
H
 
H
T
 
H
A
 
L
R
 
K
R
 
V
G
 
A
A
 
E
E
 
G
Y
 
F
G
 
G
M
 
L
T
 
K
T
 
A
G
 
K
P
 
P
V
 
-
S
 
E
V
 
L
D
 
D
F
 
L
G
 
K
R
 
K
V
 
L
M
 
G
A
 
G
R
 
W
K
 
R
E
 
D
K
 
Q
V
 
V
R
 
V
L
 
K
D
 
K
A
 
L
R
 
T
S
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
G
K
 
T
W
 
L
L
 
L
K
 
K
G
 
G
M
 
-
K
 
N
N
 
G
C
 
V
T
 
E
V
 
L
F
 
L
E
 
R
G
 
G
H
x
F
A
|
A
R
 
R
F
 
L
E
 
V
G
 
G
P
 
P
R
 
K
E
 
E
V
 
V
R
 
E
I
 
V
G
 
G
D
 
G
E
 
E
L
 
R
I
 
Y
S
 
G
G
 
A
E
 
K
R
 
S
I
 
L
F
 
I
V
 
L
N
x
A
V
x
T
G
|
G
G
 
S
R
 
E
A
 
P
-
 
L
A
 
E
V
 
L
A
 
K
D
 
G
L
 
F
P
 
P
G
 
F
V
 
G
N
 
E
D
 
D
V
 
V
P
 
-
Y
 
W
L
 
D
T
x
S
N
 
T
S
 
R
S
 
A
I
 
L
M
 
K
D
 
V
L
 
E
A
 
E
E
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
K
H
 
R
L
 
L
V
 
L
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
G
Y
x
A
I
 
V
G
 
G
L
 
L
E
|
E
F
 
L
A
 
G
Q
 
Q
M
 
V
F
 
Y
R
 
R
R
 
R
F
 
L
G
 
G
S
 
A
D
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
L
I
 
I
E
 
E
K
 
Y
G
 
M
A
 
P
R
 
E
L
 
I
I
 
L
G
 
P
R
 
Q
E
 
G
D
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
T
S
 
A
D
 
A
A
 
L
I
 
L
R
 
R
E
 
R
I
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
K
E
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
R
I
 
V
R
 
R
T
 
T
N
 
K
A
 
T
E
 
K
C
 
A
I
 
V
R
 
G
F
 
Y
S
 
E
N
 
K
H
 
K
A
 
K
D
 
D
S
 
G
V
 
L
A
 
H
V
 
V
G
 
R
V
 
L
D
 
E
-
 
P
-
 
A
C
 
E
T
 
G
S
 
G
G
 
E
E
 
G
P
 
E
E
 
E
V
 
V
S
 
V
G
 
V
S
 
D
H
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
R
 
R
H
 
K
P
 
P
N
x
R
T
 
T
D
 
E
D
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
E
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
T
 
V
D
 
D
E
 
E
R
 
R
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
E
 
R
V
 
V
D
 
N
D
 
A
S
 
R
L
 
M
R
 
E
T
 
T
N
 
S
V
 
V
P
 
P
H
 
G
I
 
V
F
 
Y
A
 
A
M
 
I
G
 
G
D
|
D
C
 
A
N
 
A
G
 
R
R
 
P
G
 
P
A
x
L
F
x
L
T
x
A
H
|
H
T
 
K
S
 
A
Y
 
M
N
 
R
D
 
E
F
 
G
E
 
L
I
 
I
V
 
A
A
 
A
A
 
E
N
 
N
L
 
A
I
 
A
D
 
G
N
 
K
D
 
D
P
 
-
R
 
-
R
 
S
V
 
A
S
 
F
D
 
D
R
 
Y
I
 
Q
Q
 
V
T
 
P
Y
 
S
A
 
V
L
 
V
Y
|
Y
I
 
T
D
 
S
P
 
P
P
 
E
L
 
W
G
 
A
R
 
G
A
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
E
 
E
T
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
K
K
 
R
K
 
A
G
 
G
H
 
Y
K
 
K
L
 
V
L
 
K
V
 
V
G
 
G
T
 
K
R
 
F
P
 
P
M
 
L
T
 
A
R
 
A
V
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
L
E
 
T
K
 
L
G
 
G
E
 
G
T
 
A
Q
 
E
G
 
G
F
 
M
M
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
V
V
 
G
D
 
D
A
 
E
E
 
E
T
 
T
D
 
D
E
 
L
I
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
F
I
 
I
L
 
V
G
 
G
T
 
P
G
 
Q
G
 
A
D
 
G
E
 
E
A
 
L
V
 
I
Q
 
A
S
 
E
I
 
A
L
 
A
D
 
L
V
 
A
M
 
L
Y
 
E
A
 
M
K
 
G
K
 
A
P
 
T
Y
 
L
T
 
T
M
 
D
I
 
L
A
 
A
R
 
L
A
 
T
V
 
V
H
|
H
I
 
P
H
|
H
P
 
P
T
 
T
V
 
L
S
 
S
E
|
E

Sites not aligning to the query:

6uziC Crystal structure of dihydrolipoyl dehydrogenase from elizabethkingia anophelis nuhp1
31% identity, 95% coverage: 17:463/473 of query aligns to 4:455/470 of 6uziC

query
sites
6uziC
M
 
M
N
 
N
K
 
Q
H
 
-
F
 
F
D
 
D
A
 
V
V
 
A
I
 
V
I
|
I
G
|
G
A
 
S
G
|
G
Q
x
P
A
x
G
G
 
G
P
 
Y
S
 
V
L
 
A
A
 
A
G
 
I
R
 
R
L
 
C
S
 
A
G
 
Q
V
 
L
G
 
G
-
 
F
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
I
L
 
I
I
x
E
E
x
K
R
 
Y
K
 
S
L
 
T
F
 
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
V
 
L
N
 
N
T
 
V
G
|
G
C
|
C
M
 
I
P
 
P
T
x
S
K
|
K
A
 
A
M
 
L
V
 
L
A
 
D
S
 
S
A
 
S
Y
 
E
A
 
H
I
 
F
H
 
E
T
 
N
A
 
A
R
 
K
R
 
H
G
 
T
-
 
F
A
 
A
E
 
T
Y
 
H
G
 
G
M
 
I
T
 
L
T
 
I
G
 
D
P
 
E
V
 
P
S
 
K
V
 
V
D
 
D
F
 
I
G
 
A
R
 
Q
V
 
M
M
 
I
A
 
S
R
 
R
K
 
K
E
 
N
K
 
D
V
 
V
R
 
V
L
 
D
D
 
Q
A
 
T
R
 
T
S
 
K
G
 
G
V
 
I
E
 
-
K
 
N
W
 
F
L
 
L
K
 
M
G
 
D
M
 
K
K
 
N
N
 
K
C
 
I
T
 
T
V
 
V
F
 
L
E
 
Q
G
 
G
H
x
V
A
x
G
R
 
S
F
 
F
E
 
E
G
 
S
P
 
A
R
 
T
E
 
Q
V
 
I
R
 
K
I
 
V
-
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
D
-
 
G
G
 
S
D
 
S
E
 
E
L
 
V
I
 
I
S
 
E
G
 
A
E
 
K
R
 
N
I
 
T
F
 
I
V
 
I
N
 
A
V
x
T
G
|
G
G
 
S
R
 
K
A
 
P
A
 
S
V
 
S
A
 
L
D
 
P
L
 
F
P
 
I
G
 
T
V
 
L
N
 
D
D
 
K
V
 
E
P
 
R
Y
 
V
L
 
I
T
 
T
N
 
S
S
 
T
S
 
E
I
 
A
M
 
L
D
 
N
L
 
L
A
 
K
E
 
E
L
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
H
L
 
L
V
 
I
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
G
Y
x
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
F
 
L
A
 
G
Q
 
S
M
 
V
F
 
Y
R
 
L
R
 
R
F
 
L
G
 
G
S
 
S
D
 
D
V
 
V
T
 
T
V
 
V
I
 
V
E
 
E
K
 
Y
G
 
L
A
 
D
R
 
K
L
 
I
I
 
I
G
 
P
R
 
G
E
 
M
D
 
D
P
 
G
E
 
T
V
 
L
S
 
S
D
 
K
A
 
E
I
 
L
R
 
Q
E
 
K
I
 
T
L
 
L
E
 
K
N
 
K
E
 
Q
G
 
G
V
 
M
R
 
K
I
 
F
R
 
M
T
 
L
N
 
S
A
 
T
E
 
A
C
 
V
I
 
S
R
 
G
F
 
V
S
 
E
N
 
R
H
 
N
A
 
G
D
 
D
S
 
T
V
 
V
A
 
K
V
 
V
G
 
T
V
 
A
D
 
K
C
 
D
T
 
K
S
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
D
E
 
V
V
 
V
-
 
V
S
 
E
G
 
G
S
 
D
H
 
Y
V
 
C
L
 
L
L
 
V
A
 
S
T
 
V
G
 
G
R
|
R
H
 
R
P
 
P
N
 
Y
T
 
T
D
 
D
D
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
E
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
E
T
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
R
G
 
G
Y
 
R
I
 
V
E
 
K
V
 
T
D
 
N
D
 
D
S
 
H
L
 
L
R
 
Q
T
 
T
N
 
N
V
 
V
P
 
P
H
 
N
I
 
I
F
 
Y
A
 
A
M
 
I
G
 
G
D
|
D
C
 
V
N
 
V
G
 
K
R
 
G
G
 
A
A
x
M
F
x
L
T
x
A
H
 
H
T
 
K
S
 
A
Y
 
E
N
 
E
D
 
E
F
 
G
E
 
V
I
 
F
V
 
V
A
 
A
A
 
E
N
 
T
L
 
L
I
 
A
D
 
G
N
 
E
D
 
K
P
 
P
R
 
-
R
 
H
V
 
V
S
 
N
D
 
Y
R
 
N
I
 
L
Q
 
I
T
 
P
Y
 
G
A
 
V
L
 
V
Y
 
Y
I
 
T
D
 
W
P
 
P
P
 
E
L
 
V
G
 
A
R
 
G
A
 
V
G
 
G
M
 
K
T
 
T
E
 
E
T
 
E
E
 
Q
A
 
L
R
 
K
K
 
E
K
 
A
G
 
G
H
 
V
K
 
A
L
 
Y
L
 
K
V
 
T
G
 
G
T
 
S
R
 
F
P
 
P
M
 
M
T
 
R
R
 
A
V
 
L
G
 
G
R
 
R
A
 
S
V
 
R
E
 
A
K
 
S
G
 
M
E
 
D
T
 
T
Q
 
D
G
 
G
F
 
V
M
 
I
K
 
K
V
 
I
I
 
L
V
 
A
D
 
D
A
 
E
E
 
K
T
 
T
D
 
D
E
 
E
I
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
H
I
 
M
L
 
I
G
 
G
T
 
A
G
 
R
G
 
A
D
 
A
E
 
D
A
 
M
V
 
I
Q
 
A
S
 
E
I
 
A
L
 
V
D
 
V
V
 
A
M
 
M
Y
 
E
A
 
F
K
 
R
K
 
A
P
 
S
Y
 
A
T
 
E
M
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
I
V
 
S
H
 
H
I
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
T
V
 
Y
S
 
T
E
|
E
L
 
A
I
 
I

1ebdA Dihydrolipoamide dehydrogenase complexed with the binding domain of the dihydrolipoamide acetylase (see paper)
31% identity, 93% coverage: 22:462/473 of query aligns to 5:446/455 of 1ebdA

query
sites
1ebdA
D
 
E
A
 
T
V
 
L
I
 
V
I
 
V
G
|
G
A
 
A
G
|
G
Q
x
P
A
 
G
G
 
G
P
 
Y
S
 
V
L
 
A
A
 
A
G
 
I
R
 
R
L
 
A
S
 
A
G
 
Q
V
 
L
G
 
G
K
 
Q
T
 
K
V
 
V
A
 
T
L
 
I
I
x
V
E
|
E
R
x
K
K
 
G
L
 
N
F
x
L
G
 
G
G
|
G
T
x
V
C
|
C
V
 
L
N
 
N
T
 
V
G
|
G
C
|
C
M
 
I
P
 
P
T
x
S
K
|
K
A
 
A
M
 
L
V
 
I
A
 
S
S
 
A
A
 
S
Y
 
H
A
 
R
I
 
Y
H
 
E
T
 
Q
A
 
A
R
 
K
R
 
H
G
 
S
A
 
E
E
 
E
Y
 
M
G
 
G
M
 
I
T
 
K
T
 
A
G
 
E
P
x
N
V
|
V
S
 
T
V
 
I
D
 
D
F
 
F
G
 
A
R
 
K
V
 
V
M
 
Q
A
 
E
R
 
W
K
 
K
E
 
A
K
 
S
V
 
V
R
 
V
L
 
K
D
 
K
A
 
L
R
 
T
S
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
K
 
G
W
 
L
L
 
L
K
 
K
G
 
G
M
 
N
K
 
K
N
 
-
C
 
V
T
 
E
V
 
I
F
 
V
E
 
K
G
 
G
H
x
E
A
|
A
R
 
Y
F
 
F
E
 
V
G
 
D
P
 
A
R
 
N
E
 
T
V
 
V
R
 
R
I
 
V
-
 
V
-
 
N
G
 
G
D
 
D
-
 
S
-
 
A
E
 
Q
L
 
T
I
 
Y
S
 
T
G
 
F
E
 
K
R
 
N
I
 
A
F
 
I
V
 
I
N
 
A
V
x
T
G
|
G
G
 
S
R
 
R
A
 
P
A
 
I
V
 
-
A
 
-
D
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
N
V
 
F
N
 
K
D
 
F
V
 
S
P
 
N
Y
 
R
L
 
I
T
 
L
N
 
D
S
 
S
S
 
T
-
 
G
I
 
A
M
 
L
D
 
N
L
 
L
A
 
G
E
 
E
L
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
S
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
G
Y
|
Y
I
|
I
G
 
G
L
 
I
E
|
E
F
 
L
A
 
G
Q
 
T
M
 
A
F
 
Y
R
 
A
R
 
N
F
 
F
G
 
G
S
 
T
D
 
K
V
 
V
T
 
T
V
 
I
I
 
L
E
 
E
K
 
G
G
 
A
A
 
G
R
 
E
L
 
I
I
 
L
G
 
S
R
 
G
E
 
F
D
 
E
P
 
K
E
 
Q
V
 
M
S
 
A
D
 
A
A
 
I
I
 
I
R
 
K
E
 
K
I
 
R
L
 
L
E
 
K
N
 
K
E
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
E
I
 
V
R
 
V
T
 
T
N
 
N
A
 
A
E
 
L
C
 
A
I
 
K
R
 
G
F
 
A
S
 
E
N
 
E
H
 
R
A
 
E
D
 
D
S
 
G
V
 
V
A
 
T
V
 
V
G
 
T
V
 
Y
D
 
E
C
 
A
T
 
N
S
 
G
G
 
E
E
 
T
P
 
K
E
 
T
V
 
I
S
 
D
G
 
A
S
 
D
H
 
Y
V
 
V
L
 
L
L
 
V
A
 
T
T
 
V
G
 
G
R
|
R
H
 
R
P
 
P
N
 
N
T
 
T
D
 
D
D
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
E
K
 
Q
A
 
I
G
 
G
V
 
I
K
 
K
T
 
M
D
 
T
E
 
N
R
 
R
G
 
G
Y
 
L
I
 
I
E
 
E
V
 
V
D
 
D
D
 
Q
S
 
Q
L
 
C
R
 
R
T
 
T
N
 
S
V
 
V
P
 
P
H
 
N
I
 
I
F
 
F
A
 
A
M
 
I
G
 
G
D
|
D
C
 
I
N
 
V
G
 
P
R
 
G
G
 
P
A
|
A
F
x
L
T
x
A
H
 
H
T
 
K
S
 
A
Y
x
S
N
 
Y
D
 
E
F
 
G
E
 
K
I
 
-
V
 
V
A
 
A
A
 
A
N
 
E
L
 
A
I
 
I
D
 
A
N
 
G
D
 
H
P
 
P
R
 
S
R
 
A
V
 
V
S
 
D
D
 
Y
R
 
V
I
 
A
Q
 
I
T
 
P
Y
 
A
A
 
V
L
 
V
Y
 
F
I
 
S
D
 
D
P
 
P
P
 
E
L
 
C
G
 
A
R
 
S
A
 
V
G
 
G
M
 
Y
T
 
F
E
 
E
T
 
Q
E
 
Q
A
 
A
R
 
K
K
 
D
K
 
E
G
 
G
H
 
I
K
 
D
L
 
V
L
 
I
V
 
A
G
 
A
T
 
K
R
 
F
P
 
P
M
 
F
T
 
A
R
 
A
V
 
N
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
L
E
 
A
K
 
L
G
 
N
E
 
D
T
 
T
Q
 
D
G
 
G
F
 
F
M
 
L
K
 
K
V
 
L
I
 
V
V
 
V
D
 
R
A
 
K
E
 
E
T
 
D
D
 
G
E
 
V
I
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
Q
I
 
I
L
 
I
G
 
G
T
 
P
G
 
N
G
 
A
D
 
S
E
 
D
A
 
M
V
 
I
Q
 
A
S
 
E
I
 
L
L
 
G
D
 
L
V
 
A
M
 
I
Y
 
E
A
 
A
K
 
G
K
 
M
P
 
T
Y
 
A
T
 
E
M
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
T
V
 
I
H
|
H
I
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
T
V
 
L
S
 
G
E
|
E
L
 
I

P11959 Dihydrolipoyl dehydrogenase; Dihydrolipoamide dehydrogenase; E3 component of pyruvate complex; EC 1.8.1.4 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see paper)
31% identity, 93% coverage: 22:462/473 of query aligns to 11:452/470 of P11959

query
sites
P11959
D
 
E
A
 
T
V
 
L
I
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
P
A
 
G
G
 
G
P
 
Y
S
 
V
L
 
A
A
 
A
G
 
I
R
 
R
L
 
A
S
 
A
G
 
Q
V
 
L
G
 
G
K
 
Q
T
 
K
V
 
V
A
 
T
L
 
I
I
 
V
E
|
E
R
x
K
K
x
G
L
x
N
F
x
L
G
|
G
G
|
G
T
x
V
C
|
C
V
 
L
N
 
N
T
 
V
G
 
G
C
 
C
M
 
I
P
 
P
T
 
S
K
|
K
A
 
A
M
 
L
V
 
I
A
 
S
S
 
A
A
 
S
Y
 
H
A
 
R
I
 
Y
H
 
E
T
 
Q
A
 
A
R
 
K
R
 
H
G
 
S
A
 
E
E
 
E
Y
 
M
G
 
G
M
 
I
T
 
K
T
 
A
G
 
E
P
 
N
V
 
V
S
 
T
V
 
I
D
 
D
F
 
F
G
 
A
R
 
K
V
 
V
M
 
Q
A
 
E
R
 
W
K
 
K
E
 
A
K
 
S
V
 
V
R
 
V
L
 
K
D
 
K
A
 
L
R
 
T
S
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
K
 
G
W
 
L
L
 
L
K
 
K
G
 
G
M
 
N
K
 
K
N
 
-
C
 
V
T
 
E
V
 
I
F
 
V
E
 
K
G
 
G
H
 
E
A
 
A
R
 
Y
F
 
F
E
 
V
G
 
D
P
 
A
R
 
N
E
 
T
V
 
V
R
 
R
I
 
V
-
 
V
-
 
N
G
 
G
D
 
D
-
 
S
-
 
A
E
 
Q
L
 
T
I
 
Y
S
 
T
G
 
F
E
 
K
R
 
N
I
 
A
F
 
I
V
 
I
N
 
A
V
 
T
G
 
G
G
 
S
R
 
R
A
 
P
A
 
I
V
 
-
A
 
-
D
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
N
V
 
F
N
 
K
D
 
F
V
 
S
P
 
N
Y
 
R
L
 
I
T
 
L
N
 
D
S
 
S
S
 
T
-
 
G
I
 
A
M
 
L
D
 
N
L
 
L
A
 
G
E
 
E
L
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
S
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
G
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
L
 
I
E
 
E
F
 
L
A
 
G
Q
 
T
M
 
A
F
 
Y
R
 
A
R
 
N
F
 
F
G
 
G
S
 
T
D
 
K
V
 
V
T
 
T
V
 
I
I
 
L
E
 
E
K
 
G
G
 
A
A
 
G
R
 
E
L
 
I
I
 
L
G
 
S
R
 
G
E
 
F
D
 
E
P
 
K
E
 
Q
V
 
M
S
 
A
D
 
A
A
 
I
I
 
I
R
 
K
E
 
K
I
 
R
L
 
L
E
 
K
N
 
K
E
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
E
I
 
V
R
 
V
T
 
T
N
 
N
A
 
A
E
 
L
C
 
A
I
 
K
R
 
G
F
 
A
S
 
E
N
 
E
H
 
R
A
 
E
D
 
D
S
 
G
V
 
V
A
 
T
V
 
V
G
 
T
V
 
Y
D
 
E
C
 
A
T
 
N
S
 
G
G
 
E
E
 
T
P
 
K
E
 
T
V
 
I
S
 
D
G
 
A
S
 
D
H
 
Y
V
 
V
L
 
L
L
 
V
A
 
T
T
 
V
G
 
G
R
 
R
H
 
R
P
 
P
N
 
N
T
 
T
D
 
D
D
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
E
K
 
Q
A
 
I
G
 
G
V
 
I
K
 
K
T
 
M
D
 
T
E
 
N
R
 
R
G
 
G
Y
 
L
I
 
I
E
 
E
V
 
V
D
 
D
D
 
Q
S
 
Q
L
 
C
R
 
R
T
 
T
N
 
S
V
 
V
P
 
P
H
 
N
I
 
I
F
 
F
A
 
A
M
 
I
G
 
G
D
|
D
C
 
I
N
 
V
G
 
P
R
 
G
G
 
P
A
 
A
F
 
L
T
x
A
H
 
H
T
 
K
S
 
A
Y
 
S
N
 
Y
D
 
E
F
 
G
E
 
K
I
 
-
V
 
V
A
 
A
A
 
A
N
 
E
L
 
A
I
 
I
D
 
A
N
 
G
D
 
H
P
 
P
R
 
S
R
 
A
V
 
V
S
 
D
D
 
Y
R
 
V
I
 
A
Q
 
I
T
 
P
Y
 
A
A
 
V
L
 
V
Y
 
F
I
 
S
D
 
D
P
 
P
P
 
E
L
 
C
G
 
A
R
 
S
A
 
V
G
 
G
M
 
Y
T
 
F
E
 
E
T
 
Q
E
 
Q
A
 
A
R
 
K
K
 
D
K
 
E
G
 
G
H
 
I
K
 
D
L
 
V
L
 
I
V
 
A
G
 
A
T
 
K
R
 
F
P
 
P
M
 
F
T
 
A
R
 
A
V
 
N
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
L
E
 
A
K
 
L
G
 
N
E
 
D
T
 
T
Q
 
D
G
 
G
F
 
F
M
 
L
K
 
K
V
 
L
I
 
V
V
 
V
D
 
R
A
 
K
E
 
E
T
 
D
D
 
G
E
 
V
I
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
Q
I
 
I
L
 
I
G
 
G
T
 
P
G
 
N
G
 
A
D
 
S
E
 
D
A
 
M
V
 
I
Q
 
A
S
 
E
I
 
L
L
 
G
D
 
L
V
 
A
M
 
I
Y
 
E
A
 
A
K
 
G
K
 
M
P
 
T
Y
 
A
T
 
E
M
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
T
V
 
I
H
 
H
I
 
A
H
 
H
P
 
P
T
 
T
V
 
L
S
 
G
E
 
E
L
 
I

5x1yB Structure of mercuric reductase from lysinibacillus sphaericus (see paper)
29% identity, 95% coverage: 20:466/473 of query aligns to 3:436/454 of 5x1yB

query
sites
5x1yB
H
 
N
F
 
Y
D
 
D
A
 
L
V
 
L
I
 
I
I
|
I
G
 
G
A
 
S
G
|
G
Q
x
A
A
 
A
G
 
A
P
 
F
S
 
S
L
 
S
A
 
A
G
 
I
R
 
K
L
 
A
S
 
I
G
 
E
V
 
Y
G
 
G
K
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
G
L
 
M
I
|
I
E
|
E
R
|
R
K
 
G
L
 
T
F
x
V
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
V
 
V
N
 
N
T
 
I
G
|
G
C
|
C
M
 
V
P
 
P
T
x
S
K
|
K
A
 
T
M
 
L
V
 
L
A
 
R
S
 
A
A
 
G
Y
 
E
A
 
I
I
 
I
H
 
H
T
 
L
A
 
S
R
 
K
R
 
D
G
 
N
A
 
P
E
 
F
Y
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
Q
T
 
T
G
 
S
P
x
A
V
x
G
S
 
E
V
 
V
D
 
D
F
 
L
G
 
A
R
 
S
V
 
L
M
 
I
A
 
T
R
 
Q
K
 
K
E
 
D
K
 
K
V
 
L
R
 
V
L
 
S
D
 
E
A
 
L
R
 
R
S
 
N
G
 
Q
V
 
K
E
 
Y
K
 
M
W
 
D
L
 
L
K
 
I
G
 
D
M
 
E
K
 
Y
N
 
N
C
 
F
T
 
D
V
 
L
F
 
I
E
 
K
G
 
G
H
 
E
A
|
A
R
 
K
F
 
F
E
 
V
G
 
D
P
 
A
R
 
S
E
 
T
V
 
V
R
 
E
I
 
V
G
 
N
D
 
G
E
 
A
L
 
K
I
 
L
S
 
S
G
 
A
E
 
K
R
 
R
I
 
F
F
 
L
V
 
I
N
 
A
V
x
T
G
|
G
G
 
A
R
 
S
A
 
P
A
 
S
V
 
L
A
 
P
D
 
Q
L
 
I
P
 
S
G
 
G
V
 
L
N
 
E
D
 
K
V
 
M
P
 
D
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
N
 
S
S
 
T
S
 
T
I
 
L
M
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
K
E
 
K
L
 
I
P
 
P
E
 
K
H
 
R
L
 
L
V
 
T
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
S
S
 
G
Y
|
Y
I
 
I
G
 
G
L
 
M
E
|
E
F
 
L
A
 
G
Q
 
Q
M
 
L
F
 
F
R
 
H
R
 
H
F
 
L
G
 
G
S
 
S
D
 
E
V
 
I
T
 
T
V
 
L
I
 
M
E
 
Q
K
 
R
G
 
S
A
 
E
R
 
R
L
 
L
I
 
L
G
 
K
R
 
E
E
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
I
S
 
S
D
 
E
A
 
S
I
 
V
R
 
E
E
 
K
I
 
A
L
 
L
E
 
I
N
 
E
E
 
Q
G
 
G
V
 
I
R
 
N
I
 
L
R
 
V
T
 
K
N
 
G
A
 
A
E
 
T
C
 
F
I
 
E
R
 
R
F
 
V
S
 
E
N
 
Q
H
 
S
A
 
G
D
 
E
S
 
I
V
 
K
A
 
R
V
 
V
G
 
Y
V
 
V
D
 
T
C
 
V
T
 
N
S
 
G
G
 
S
E
 
R
P
 
E
E
 
V
V
 
I
S
 
E
G
 
S
S
 
D
H
 
Q
V
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
|
R
H
 
K
P
 
P
N
 
N
T
 
T
D
 
D
D
 
S
L
 
L
G
 
N
L
 
L
D
 
S
K
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
E
T
 
T
D
 
G
E
 
K
R
 
N
G
 
N
Y
 
E
I
 
I
E
 
L
V
 
I
D
 
N
D
 
D
S
 
F
L
 
G
R
 
Q
T
 
T
N
 
S
V
 
N
P
 
E
H
 
K
I
 
I
F
 
Y
A
 
A
M
 
A
G
|
G
D
|
D
C
 
V
N
 
T
G
 
L
R
 
G
G
 
P
A
 
Q
F
|
F
T
x
V
H
 
Y
T
 
V
S
x
A
Y
x
A
N
 
Y
D
 
E
F
 
G
E
 
G
I
 
I
V
 
I
A
 
T
A
 
D
N
 
N
L
 
A
I
 
I
D
 
G
N
 
G
D
 
L
P
 
N
R
 
K
R
 
K
V
 
I
S
 
D
D
 
L
R
 
S
I
 
V
Q
 
V
T
 
P
Y
 
A
A
 
V
L
 
T
Y
 
F
I
 
T
D
 
N
P
 
P
P
 
T
L
 
V
G
 
A
R
 
T
A
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
E
 
E
T
 
E
E
 
Q
A
 
A
R
 
K
K
 
E
K
 
K
G
 
G
H
 
Y
K
 
D
L
 
V
L
 
K
V
 
T
G
 
S
T
 
V
R
 
L
P
 
P
M
 
L
T
 
D
R
 
A
V
 
V
G
 
P
R
 
R
A
 
A
V
 
I
E
 
V
K
 
N
G
 
R
E
 
E
T
 
T
Q
 
T
G
 
G
F
 
V
M
 
F
K
 
K
V
 
L
I
 
V
V
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
E
T
 
T
D
 
L
E
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
H
I
 
I
L
 
V
G
 
S
T
 
E
G
 
N
G
 
A
D
 
G
E
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
-
S
 
-
I
 
-
L
 
-
D
 
D
V
 
V
M
 
I
Y
 
Y
A
 
A
K
 
A
K
 
-
P
 
-
Y
 
-
T
 
-
M
 
-
I
 
-
A
 
S
R
 
L
A
 
A
V
 
V
H
 
K
I
 
F
H
 
G
P
 
L
T
 
T
V
 
V
S
 
E
E
 
D
L
 
L
I
 
T
P
 
E
T
 
T
V
 
L

Sites not aligning to the query:

D9J041 Mercuric reductase; Hg(II) reductase; EC 1.16.1.1 from Lysinibacillus sphaericus (Bacillus sphaericus) (see paper)
29% identity, 96% coverage: 15:466/473 of query aligns to 79:517/546 of D9J041

query
sites
D9J041
V
 
L
V
 
I
M
 
N
N
 
E
K
 
D
H
 
N
F
 
Y
D
 
D
A
 
L
V
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
S
G
 
G
Q
 
A
A
 
A
G
 
A
P
 
F
S
 
S
L
 
S
A
 
A
G
 
I
R
 
K
L
 
A
S
 
I
G
 
E
V
 
Y
G
 
G
K
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
G
L
 
M
I
 
I
E
 
E
R
 
R
K
 
G
L
 
T
F
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
T
C
|
C
V
 
V
N
 
N
T
 
I
G
 
G
C
|
C
M
 
V
P
 
P
T
 
S
K
 
K
A
 
T
M
 
L
V
 
L
A
 
R
S
 
A
A
 
G
Y
 
E
A
 
I
I
 
I
H
 
H
T
 
L
A
 
S
R
 
K
R
 
D
G
 
N
A
 
P
E
 
F
Y
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
Q
T
 
T
G
 
S
P
 
A
V
 
G
S
 
E
V
 
V
D
 
D
F
 
L
G
 
A
R
 
S
V
 
L
M
 
I
A
 
T
R
 
Q
K
 
K
E
 
D
K
 
K
V
 
L
R
 
V
L
 
S
D
 
E
A
 
L
R
 
R
S
 
N
G
 
Q
V
 
K
E
 
Y
K
 
M
W
 
D
L
 
L
K
 
I
G
 
D
M
 
E
K
 
Y
N
 
N
C
 
F
T
 
D
V
 
L
F
 
I
E
 
K
G
 
G
H
 
E
A
 
A
R
 
K
F
 
F
E
 
V
G
 
D
P
 
A
R
 
S
E
 
T
V
 
V
R
 
E
I
 
V
G
 
N
D
 
G
E
 
A
L
 
K
I
 
L
S
 
S
G
 
A
E
 
K
R
 
R
I
 
F
F
 
L
V
 
I
N
 
A
V
 
T
G
 
G
G
 
A
R
 
S
A
 
P
A
 
S
V
 
L
A
 
P
D
 
Q
L
 
I
P
 
S
G
 
G
V
 
L
N
 
E
D
 
K
V
 
M
P
 
D
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
N
 
S
S
 
T
S
 
T
I
 
L
M
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
K
E
 
K
L
 
I
P
 
P
E
 
K
H
 
R
L
 
L
V
 
T
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
S
S
 
G
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
L
 
M
E
 
E
F
 
L
A
 
G
Q
 
Q
M
 
L
F
 
F
R
 
H
R
 
H
F
 
L
G
 
G
S
 
S
D
 
E
V
 
I
T
 
T
V
 
L
I
 
M
E
 
Q
K
 
R
G
 
S
A
 
E
R
 
R
L
 
L
I
 
L
G
 
K
R
 
E
E
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
I
S
 
S
D
 
E
A
 
S
I
 
V
R
 
E
E
 
K
I
 
A
L
 
L
E
 
I
N
 
E
E
 
Q
G
 
G
V
 
I
R
 
N
I
 
L
R
 
V
T
 
K
N
 
G
A
 
A
E
 
T
C
 
F
I
 
E
R
 
R
F
 
V
S
 
E
N
 
Q
H
 
S
A
 
G
D
 
E
S
 
I
V
 
K
A
 
R
V
 
V
G
 
Y
V
 
V
D
 
T
C
 
V
T
 
N
S
 
G
G
 
S
E
 
R
P
 
E
E
 
V
V
 
I
S
 
E
G
 
S
S
 
D
H
 
Q
V
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
H
 
K
P
 
P
N
 
N
T
 
T
D
 
D
D
 
S
L
 
L
G
 
N
L
 
L
D
 
S
K
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
E
T
 
T
D
 
G
E
 
K
R
 
N
G
 
N
Y
 
E
I
 
I
E
 
L
V
 
I
D
 
N
D
 
D
S
 
F
L
 
G
R
 
Q
T
 
T
N
 
S
V
 
N
P
 
E
H
 
K
I
 
I
F
 
Y
A
 
A
M
 
A
G
 
G
D
 
D
C
 
V
N
 
T
G
 
L
R
 
G
G
 
P
A
 
Q
F
 
F
T
 
V
H
 
Y
T
 
V
S
 
A
Y
 
A
N
 
Y
D
 
E
F
 
G
E
 
G
I
 
I
V
 
I
A
 
T
A
 
D
N
 
N
L
 
A
I
 
I
D
 
G
N
 
G
D
 
L
P
 
N
R
 
K
R
 
K
V
 
I
S
 
D
D
 
L
R
 
S
I
 
V
Q
 
V
T
 
P
Y
 
A
A
 
V
L
 
T
Y
 
F
I
 
T
D
 
N
P
 
P
P
 
T
L
 
V
G
 
A
R
 
T
A
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
E
 
E
T
 
E
E
 
Q
A
 
A
R
 
K
K
 
E
K
 
K
G
 
G
H
 
Y
K
 
D
L
 
V
L
 
K
V
 
T
G
 
S
T
 
V
R
 
L
P
 
P
M
 
L
T
 
D
R
 
A
V
 
V
G
 
P
R
 
R
A
 
A
V
 
I
E
 
V
K
 
N
G
 
R
E
 
E
T
 
T
Q
 
T
G
 
G
F
 
V
M
 
F
K
 
K
V
 
L
I
 
V
V
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
E
T
 
T
D
 
L
E
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
H
I
 
I
L
 
V
G
 
S
T
 
E
G
 
N
G
 
A
D
 
G
E
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
-
S
 
-
I
 
-
L
 
-
D
 
D
V
 
V
M
 
I
Y
 
Y
A
 
A
K
 
A
K
 
-
P
 
-
Y
 
-
T
 
-
M
 
-
I
 
-
A
 
S
R
 
L
A
 
A
V
 
V
H
 
K
I
 
F
H
 
G
P
 
L
T
 
T
V
 
V
S
 
E
E
 
D
L
 
L
I
 
T
P
 
E
T
 
T
V
 
L

2yquB Crystal structures and evolutionary relationship of two different lipoamide dehydrogenase(e3s) from thermus thermophilus
34% identity, 94% coverage: 21:463/473 of query aligns to 2:441/455 of 2yquB

query
sites
2yquB
F
 
Y
D
 
D
A
 
L
V
 
L
I
 
V
I
 
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
Q
x
P
A
x
G
G
 
G
P
 
Y
S
 
V
L
 
A
A
 
A
G
 
I
R
 
R
L
 
A
S
 
A
G
 
Q
V
 
L
G
 
G
K
 
M
T
 
K
V
 
V
A
 
G
L
 
V
I
 
V
E
|
E
R
x
K
-
 
E
K
 
K
L
 
A
F
x
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
V
 
L
N
x
R
T
 
V
G
|
G
C
|
C
M
 
I
P
 
P
T
x
S
K
|
K
A
 
A
M
 
L
V
 
L
A
 
E
S
 
T
A
 
T
Y
 
E
A
 
R
I
 
I
H
 
Y
T
 
E
A
 
A
R
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
L
E
 
-
Y
 
L
G
 
G
M
 
A
T
 
K
T
 
V
G
 
K
P
x
G
V
|
V
S
 
E
V
 
L
D
 
D
F
 
L
G
 
P
R
 
A
V
 
L
M
 
M
A
 
A
R
 
H
K
 
K
E
 
D
K
 
K
V
 
V
R
 
V
L
 
Q
D
 
A
A
 
N
R
 
T
S
 
Q
G
 
G
V
 
V
E
 
E
K
 
F
W
 
L
L
 
F
K
 
K
G
 
-
M
 
-
K
 
K
N
 
N
C
 
G
T
 
I
V
 
A
-
 
R
F
 
H
E
 
Q
G
 
G
H
x
T
A
|
A
R
 
R
F
 
F
E
 
L
G
 
S
P
 
E
R
 
R
E
 
K
V
 
V
R
 
L
I
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
T
G
 
G
D
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
-
S
 
E
G
 
A
E
 
R
R
 
Y
I
 
I
F
 
L
V
 
I
N
 
A
V
x
T
G
|
G
G
 
S
R
 
A
A
 
P
A
 
L
V
 
I
A
 
P
D
 
P
L
 
W
P
 
A
G
 
Q
V
 
V
N
 
D
D
 
Y
V
 
E
P
 
R
Y
 
V
L
 
V
T
 
T
N
 
S
S
 
T
S
 
E
I
 
A
M
 
L
D
 
S
L
 
F
A
 
P
E
 
E
L
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
R
L
 
L
V
 
I
V
 
V
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
G
Y
x
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
F
 
L
A
 
G
Q
 
V
M
 
V
F
 
W
R
 
H
R
 
R
F
 
L
G
 
G
S
 
A
D
 
E
V
 
V
T
 
I
V
 
V
I
 
L
E
 
E
K
 
Y
G
 
M
A
 
D
R
 
R
L
 
I
I
 
L
G
 
P
R
 
T
E
 
M
D
 
D
P
 
L
E
 
E
V
 
V
S
 
S
D
 
R
A
 
A
I
 
A
R
 
E
E
 
R
I
 
V
L
 
F
E
 
K
N
 
K
E
 
Q
G
 
G
V
 
L
R
 
T
I
 
I
R
 
R
T
 
T
N
 
G
A
 
V
E
 
R
C
 
V
I
 
T
R
 
A
F
 
V
S
 
V
N
 
P
H
 
E
A
 
A
D
 
K
S
 
G
V
 
A
A
 
R
V
 
V
G
 
E
V
 
L
D
 
E
C
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
G
E
 
G
P
 
E
E
 
V
V
 
L
S
 
E
G
 
A
S
 
D
H
 
R
V
 
V
L
 
L
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
R
 
R
H
 
R
P
 
P
N
x
Y
T
 
T
D
 
E
D
 
G
L
 
L
G
 
S
L
 
L
D
 
E
K
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
L
K
 
S
T
 
T
D
 
D
E
 
E
R
 
R
G
 
G
Y
 
R
I
 
I
E
 
P
V
 
V
D
 
D
D
 
E
S
 
H
L
 
L
R
 
R
T
 
T
N
 
R
V
 
V
P
 
P
H
 
H
I
 
I
F
 
Y
A
 
A
M
 
I
G
|
G
D
|
D
C
 
V
N
 
V
G
 
-
R
 
R
G
 
G
A
 
P
F
x
M
T
x
L
H
x
A
T
x
H
S
 
K
Y
 
A
N
x
S
D
 
E
F
 
E
E
 
G
I
 
I
V
 
A
A
 
A
A
 
V
N
 
E
L
 
H
I
 
M
D
 
V
N
 
R
D
 
G
P
 
F
R
 
G
R
 
H
V
 
V
S
 
D
D
 
Y
R
 
Q
I
 
A
Q
 
I
T
 
P
Y
 
S
A
 
V
L
 
V
Y
 
Y
I
 
T
D
 
H
P
 
P
P
 
E
L
 
I
G
 
A
R
 
A
A
 
V
G
 
G
M
 
Y
T
 
T
E
 
E
T
 
E
E
 
E
A
 
L
R
 
K
K
 
A
K
 
Q
G
 
G
H
 
I
K
 
P
L
 
Y
L
 
K
V
 
V
G
 
G
T
 
K
R
 
F
P
 
P
M
 
Y
T
 
S
R
 
A
V
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
R
E
 
A
K
 
M
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
F
 
F
M
 
I
K
 
K
V
 
V
I
 
L
V
 
A
D
 
H
A
 
A
E
 
K
T
 
T
D
 
D
E
 
R
I
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
H
I
 
G
L
 
I
G
 
G
T
 
A
G
 
R
-
 
V
G
 
G
D
 
D
E
 
V
A
 
L
V
 
A
Q
 
E
S
 
A
I
 
A
L
 
L
D
 
A
V
 
L
M
 
F
Y
 
F
A
 
-
K
 
K
K
 
A
P
x
S
Y
 
A
T
 
E
M
x
D
I
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
P
H
|
H
I
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
S
V
 
L
S
 
S
E
|
E
L
 
I
I
 
L

2yquA Crystal structures and evolutionary relationship of two different lipoamide dehydrogenase(e3s) from thermus thermophilus
34% identity, 94% coverage: 21:463/473 of query aligns to 2:441/455 of 2yquA

query
sites
2yquA
F
 
Y
D
 
D
A
 
L
V
 
L
I
 
V
I
 
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
Q
x
P
A
x
G
G
 
G
P
 
Y
S
 
V
L
 
A
A
 
A
G
 
I
R
 
R
L
 
A
S
 
A
G
 
Q
V
 
L
G
 
G
K
 
M
T
 
K
V
 
V
A
 
G
L
 
V
I
 
V
E
|
E
R
x
K
-
 
E
K
 
K
L
 
A
F
x
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
V
 
L
N
x
R
T
 
V
G
|
G
C
|
C
M
 
I
P
 
P
T
x
S
K
|
K
A
 
A
M
 
L
V
 
L
A
 
E
S
 
T
A
 
T
Y
 
E
A
 
R
I
 
I
H
 
Y
T
 
E
A
 
A
R
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
L
E
 
-
Y
 
L
G
 
G
M
 
A
T
 
K
T
 
V
G
 
K
P
x
G
V
|
V
S
 
E
V
 
L
D
 
D
F
 
L
G
 
P
R
 
A
V
 
L
M
 
M
A
 
A
R
 
H
K
 
K
E
 
D
K
 
K
V
 
V
R
 
V
L
 
Q
D
 
A
A
 
N
R
 
T
S
 
Q
G
 
G
V
 
V
E
 
E
K
 
F
W
 
L
L
 
F
K
 
K
G
 
-
M
 
-
K
 
K
N
 
N
C
 
G
T
 
I
V
 
A
-
 
R
F
 
H
E
 
Q
G
 
G
H
x
T
A
|
A
R
 
R
F
 
F
E
 
L
G
 
S
P
 
E
R
 
R
E
 
K
V
 
V
R
 
L
I
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
T
G
 
G
D
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
-
S
 
E
G
 
A
E
 
R
R
 
Y
I
 
I
F
 
L
V
 
I
N
 
A
V
x
T
G
|
G
G
 
S
R
 
A
A
 
P
A
 
L
V
 
I
A
 
P
D
 
P
L
 
W
P
 
A
G
 
Q
V
 
V
N
 
D
D
 
Y
V
 
E
P
 
R
Y
 
V
L
 
V
T
 
T
N
x
S
S
 
T
S
 
E
I
 
A
M
 
L
D
 
S
L
 
F
A
 
P
E
 
E
L
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
R
L
 
L
V
 
I
V
 
V
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
G
Y
x
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
F
 
L
A
 
G
Q
 
V
M
 
V
F
 
W
R
 
H
R
 
R
F
 
L
G
 
G
S
 
A
D
 
E
V
 
V
T
 
I
V
 
V
I
 
L
E
 
E
K
 
Y
G
 
M
A
 
D
R
 
R
L
 
I
I
 
L
G
 
P
R
 
T
E
 
M
D
 
D
P
 
L
E
 
E
V
 
V
S
 
S
D
 
R
A
 
A
I
 
A
R
 
E
E
 
R
I
 
V
L
 
F
E
 
K
N
 
K
E
 
Q
G
 
G
V
 
L
R
 
T
I
 
I
R
 
R
T
 
T
N
 
G
A
 
V
E
 
R
C
 
V
I
 
T
R
 
A
F
 
V
S
 
V
N
 
P
H
 
E
A
 
A
D
 
K
S
 
G
V
 
A
A
 
R
V
 
V
G
 
E
V
 
L
D
 
E
C
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
G
E
 
G
P
 
E
E
 
V
V
 
L
S
 
E
G
 
A
S
 
D
H
 
R
V
 
V
L
 
L
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
R
 
R
H
 
R
P
 
P
N
x
Y
T
 
T
D
 
E
D
 
G
L
 
L
G
 
S
L
 
L
D
 
E
K
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
L
K
 
S
T
 
T
D
 
D
E
 
E
R
 
R
G
 
G
Y
 
R
I
 
I
E
 
P
V
 
V
D
 
D
D
 
E
S
 
H
L
 
L
R
 
R
T
 
T
N
 
R
V
 
V
P
 
P
H
 
H
I
 
I
F
 
Y
A
 
A
M
 
I
G
|
G
D
|
D
C
 
V
N
 
V
G
 
-
R
 
R
G
 
G
A
 
P
F
x
M
T
x
L
H
x
A
T
 
H
S
 
K
Y
 
A
N
x
S
D
 
E
F
 
E
E
 
G
I
 
I
V
 
A
A
 
A
A
 
V
N
 
E
L
 
H
I
 
M
D
 
V
N
 
R
D
 
G
P
 
F
R
 
G
R
 
H
V
 
V
S
 
D
D
 
Y
R
 
Q
I
 
A
Q
 
I
T
 
P
Y
 
S
A
 
V
L
 
V
Y
 
Y
I
 
T
D
 
H
P
 
P
P
 
E
L
 
I
G
 
A
R
 
A
A
 
V
G
 
G
M
 
Y
T
 
T
E
 
E
T
 
E
E
 
E
A
 
L
R
 
K
K
 
A
K
 
Q
G
 
G
H
 
I
K
 
P
L
 
Y
L
 
K
V
 
V
G
 
G
T
 
K
R
 
F
P
 
P
M
 
Y
T
 
S
R
 
A
V
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
R
E
 
A
K
 
M
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
F
 
F
M
 
I
K
 
K
V
 
V
I
 
L
V
 
A
D
 
H
A
 
A
E
 
K
T
 
T
D
 
D
E
 
R
I
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
H
I
 
G
L
 
I
G
 
G
T
 
A
G
 
R
-
 
V
G
 
G
D
 
D
E
 
V
A
 
L
V
 
A
Q
 
E
S
 
A
I
 
A
L
 
L
D
 
A
V
 
L
M
 
F
Y
 
F
A
 
-
K
 
K
K
 
A
P
 
S
Y
 
A
T
 
E
M
 
D
I
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
P
H
|
H
I
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
S
V
 
L
S
 
S
E
|
E
L
 
I
I
 
L

2eq7A Crystal structure of lipoamide dehydrogenase from thermus thermophilus hb8 with psbdo
33% identity, 94% coverage: 21:463/473 of query aligns to 2:441/452 of 2eq7A

query
sites
2eq7A
F
 
Y
D
 
D
A
 
L
V
 
L
I
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
|
G
Q
x
P
A
x
G
G
 
G
P
 
Y
S
 
V
L
 
A
A
 
A
G
 
I
R
 
R
L
 
A
S
 
A
G
 
Q
V
 
L
G
 
G
K
 
M
T
 
K
V
 
V
A
 
G
L
 
V
I
 
V
E
|
E
R
x
K
-
 
E
K
 
K
L
 
A
F
x
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
V
 
L
N
x
R
T
 
V
G
|
G
C
|
C
M
 
I
P
 
P
T
x
S
K
|
K
A
 
A
M
 
L
V
 
L
A
 
E
S
 
T
A
 
T
Y
 
E
A
 
R
I
 
I
H
 
Y
T
 
E
A
 
A
R
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
L
E
 
-
Y
 
L
G
 
G
M
 
A
T
 
K
T
 
V
G
 
K
P
x
G
V
|
V
S
 
E
V
 
L
D
 
D
F
 
L
G
 
P
R
 
A
V
 
L
M
 
M
A
 
A
R
 
H
K
 
K
E
 
D
K
 
K
V
 
V
R
 
V
L
 
Q
D
 
A
A
 
N
R
 
T
S
 
Q
G
 
G
V
 
V
E
 
E
K
 
F
W
 
L
L
 
F
K
 
K
G
 
-
M
 
-
K
 
K
N
 
N
C
 
G
T
 
I
V
 
A
-
 
R
F
 
H
E
 
Q
G
 
G
H
x
T
A
|
A
R
 
R
F
 
F
E
 
L
G
 
S
P
 
E
R
 
R
E
 
K
V
 
V
R
 
L
I
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
T
G
 
G
D
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
-
S
 
E
G
 
A
E
 
R
R
 
Y
I
 
I
F
 
L
V
 
I
N
 
A
V
x
T
G
|
G
G
 
S
R
 
A
A
 
P
A
 
L
V
 
I
A
 
P
D
 
P
L
x
W
P
 
A
G
 
Q
V
 
V
N
 
D
D
 
Y
V
 
E
P
 
R
Y
 
V
L
 
V
T
 
T
N
x
S
S
 
T
S
 
E
I
 
A
M
 
L
D
 
S
L
 
F
A
 
P
E
 
E
L
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
R
L
 
L
V
 
I
V
 
V
V
 
V
G
|
G
G
 
G
S
x
G
Y
x
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
F
 
L
A
 
G
Q
 
V
M
 
V
F
 
W
R
 
H
R
 
R
F
 
L
G
 
G
S
 
A
D
 
E
V
 
V
T
 
I
V
 
V
I
 
L
E
|
E
K
x
Y
G
 
M
A
 
D
R
 
R
L
 
I
I
 
L
G
 
P
R
 
T
E
 
M
D
 
D
P
 
L
E
 
E
V
 
V
S
 
S
D
 
R
A
 
A
I
 
A
R
 
E
E
 
R
I
 
V
L
 
F
E
 
K
N
 
K
E
 
Q
G
 
G
V
 
L
R
 
T
I
 
I
R
 
R
T
 
T
N
 
G
A
 
V
E
 
R
C
x
V
I
 
T
R
 
A
F
 
V
S
 
V
N
 
P
H
 
E
A
 
A
D
 
K
S
 
G
V
 
A
A
 
R
V
 
V
G
 
E
V
 
L
D
 
E
C
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
G
E
 
G
P
 
E
E
 
V
V
 
L
S
 
E
G
 
A
S
 
D
H
 
R
V
 
V
L
 
L
L
 
V
A
 
A
T
x
V
G
|
G
R
|
R
H
 
R
P
 
P
N
x
Y
T
 
T
D
 
E
D
 
G
L
 
L
G
 
S
L
 
L
D
 
E
K
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
L
K
 
S
T
 
T
D
 
D
E
 
E
R
 
R
G
 
G
Y
 
R
I
 
I
E
 
P
V
 
V
D
 
D
D
 
E
S
 
H
L
 
L
R
 
R
T
 
T
N
 
R
V
 
V
P
 
P
H
 
H
I
 
I
F
 
Y
A
 
A
M
 
I
G
 
G
D
|
D
C
 
V
N
 
V
G
 
-
R
 
R
G
 
G
A
 
P
F
x
M
T
x
L
H
x
A
T
x
H
S
 
K
Y
 
A
N
x
S
D
 
E
F
 
E
E
 
G
I
 
I
V
 
A
A
 
A
A
 
V
N
 
E
L
 
H
I
 
M
D
 
V
N
 
R
D
 
G
P
 
F
R
 
G
R
 
H
V
 
V
S
 
D
D
 
Y
R
 
Q
I
 
A
Q
 
I
T
 
P
Y
 
S
A
x
V
L
 
V
Y
|
Y
I
 
T
D
 
H
P
 
P
P
 
E
L
 
I
G
 
A
R
 
A
A
 
V
G
 
G
M
 
Y
T
 
T
E
 
E
T
 
E
E
 
E
A
 
L
R
 
K
K
 
A
K
 
Q
G
 
G
H
 
I
K
 
P
L
 
Y
L
 
K
V
 
V
G
 
G
T
 
K
R
 
F
P
 
P
M
 
Y
T
 
S
R
 
A
V
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
R
E
 
A
K
 
M
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
F
 
F
M
 
I
K
 
K
V
 
V
I
 
L
V
 
A
D
 
H
A
 
A
E
 
K
T
 
T
D
 
D
E
 
R
I
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
H
I
 
G
L
 
I
G
 
G
T
 
A
G
 
R
G
 
V
D
 
G
E
 
D
A
 
V
V
 
L
Q
 
A
S
 
E
I
 
A
L
 
A
D
 
L
V
 
A
M
 
L
Y
 
F
A
 
F
K
 
K
K
 
A
P
 
S
Y
 
A
T
 
E
M
 
D
I
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
P
H
|
H
I
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
S
V
 
L
S
 
S
E
|
E
L
 
I
I
 
L

P18925 Dihydrolipoyl dehydrogenase; Dihydrolipoamide dehydrogenase; E3 component of pyruvate complex; EC 1.8.1.4 from Azotobacter vinelandii (see 2 papers)
30% identity, 95% coverage: 17:463/473 of query aligns to 1:458/477 of P18925

query
sites
P18925
M
 
M
N
 
S
K
 
Q
H
 
K
F
 
F
D
 
D
A
 
V
V
 
I
I
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
P
A
 
G
G
 
G
P
 
Y
S
 
V
L
 
A
A
 
A
G
 
I
R
 
K
L
 
S
S
 
A
G
 
Q
V
 
L
G
 
G
K
 
L
T
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
|
E
R
x
K
-
x
Y
-
x
K
-
x
G
-
x
K
-
x
E
-
x
G
-
x
K
K
x
T
L
x
A
F
x
L
G
|
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
V
 
L
N
 
N
T
 
V
G
 
G
C
|
C
M
 
I
P
 
P
T
 
S
K
|
K
A
 
A
M
 
L
V
 
L
A
 
D
S
 
S
A
 
S
Y
 
Y
A
 
K
I
 
F
H
 
H
T
 
E
A
 
A
R
 
H
R
 
E
G
 
S
A
 
F
E
 
K
-
 
L
Y
 
H
G
 
G
M
 
I
T
 
S
T
 
T
G
 
G
P
 
E
V
 
V
S
 
A
V
 
I
D
 
D
F
 
V
G
 
P
R
 
T
V
 
M
M
 
I
A
 
A
R
 
R
K
 
K
E
 
D
K
 
Q
V
 
I
R
 
V
L
 
R
D
 
N
A
 
L
R
 
T
S
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
A
K
 
S
W
 
L
L
 
I
K
 
K
G
 
A
M
 
-
K
 
N
N
 
G
C
 
V
T
 
T
V
 
L
F
 
F
E
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
G
R
 
K
F
 
L
E
 
L
G
 
A
P
 
G
R
 
K
E
 
K
V
 
V
R
 
E
I
 
V
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
G
G
 
S
D
 
S
E
 
Q
L
 
V
I
 
L
S
 
D
G
 
T
E
 
E
R
 
N
I
 
V
F
 
I
V
 
L
N
 
A
V
 
S
G
 
G
G
 
S
R
 
K
A
 
P
A
 
V
V
 
E
A
 
I
D
 
P
L
 
P
P
 
A
G
 
P
V
 
V
N
 
D
D
 
Q
V
 
D
P
 
V
Y
 
I
L
 
V
T
 
D
N
 
S
S
 
T
S
 
G
I
 
A
M
 
L
D
 
D
L
 
F
A
 
Q
E
 
N
L
 
V
P
 
P
E
 
G
H
 
K
L
 
L
V
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
A
S
 
G
Y
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
F
 
L
A
 
G
Q
 
S
M
 
V
F
 
W
R
 
A
R
 
R
F
 
L
G
 
G
S
 
A
D
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
V
I
 
L
E
 
E
K
 
A
G
 
M
A
 
D
R
 
K
L
 
F
I
 
L
G
 
P
R
 
A
E
 
V
D
 
D
P
 
E
E
 
Q
V
 
V
S
 
A
D
 
K
A
 
E
I
 
A
R
 
Q
E
 
K
I
 
I
L
 
L
E
 
T
N
 
K
E
 
Q
G
 
G
V
 
L
R
 
K
I
 
I
R
 
L
T
 
L
N
 
G
A
 
A
E
 
R
C
 
V
I
 
T
R
 
G
F
 
T
S
 
E
N
 
V
H
 
K
A
 
N
D
 
K
S
 
Q
V
 
V
A
 
T
V
 
V
G
 
K
V
 
F
D
 
V
C
 
D
T
 
A
S
 
E
G
 
G
E
 
E
P
 
K
E
 
S
V
 
Q
S
 
A
G
 
F
S
 
D
H
 
K
V
 
L
L
 
I
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
R
 
R
H
 
R
P
 
P
N
 
V
T
 
T
D
 
T
D
 
D
L
 
L
G
 
L
L
 
A
D
 
A
K
 
D
A
 
S
G
 
G
V
 
V
K
 
T
T
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
R
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
E
 
Y
V
 
V
D
 
D
D
 
D
S
 
Y
L
 
C
R
 
A
T
 
T
N
 
S
V
 
V
P
 
P
H
 
G
I
 
V
F
 
Y
A
 
A
M
 
I
G
 
G
D
|
D
C
 
V
N
 
V
G
 
-
R
 
R
G
 
G
A
 
A
F
 
M
T
 
L
H
x
A
T
 
H
S
 
K
Y
 
A
N
 
S
D
 
E
F
 
E
E
 
G
I
 
V
V
 
V
A
 
V
A
 
A
N
 
E
L
 
R
I
 
I
D
 
A
N
 
G
D
 
H
P
 
K
R
 
A
R
 
Q
V
 
M
S
 
N
D
 
Y
R
 
D
I
 
L
Q
 
I
T
 
P
Y
 
A
A
 
V
L
 
I
Y
 
Y
I
 
T
D
 
H
P
 
P
P
 
E
L
 
I
G
 
A
R
 
G
A
 
V
G
 
G
M
 
K
T
 
T
E
 
E
T
 
Q
E
 
A
A
 
L
R
 
K
K
 
A
K
 
E
G
 
G
H
 
V
K
 
A
L
 
I
L
 
N
V
 
V
G
 
G
T
 
V
R
 
F
P
 
P
M
 
F
T
 
A
R
 
A
V
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
M
E
 
A
K
 
A
G
 
N
E
 
D
T
 
T
Q
 
A
G
 
G
F
 
F
M
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
V
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
K
T
 
T
D
 
D
E
 
R
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
H
I
 
V
L
 
I
G
 
G
T
 
P
G
 
S
G
 
A
D
 
A
E
 
E
A
 
L
V
 
V
Q
 
Q
S
 
Q
I
 
G
L
 
A
D
 
I
V
 
A
M
 
M
Y
 
E
A
 
F
K
 
G
K
 
T
P
 
S
Y
 
A
T
 
E
M
 
D
I
 
L
A
 
G
R
 
M
A
 
M
V
 
V
H
 
F
I
 
A
H
 
H
P
 
P
T
 
A
V
 
L
S
 
S
E
 
E
L
 
A
I
 
L

5u8uD Dihydrolipoamide dehydrogenase (lpdg) from pseudomonas aeruginosa (see paper)
30% identity, 95% coverage: 17:463/473 of query aligns to 3:460/477 of 5u8uD

query
sites
5u8uD
M
 
M
N
 
S
K
 
Q
H
 
K
F
 
F
D
 
D
A
 
V
V
 
V
I
 
V
I
|
I
G
 
G
A
 
A
G
|
G
Q
x
P
A
x
G
G
 
G
P
 
Y
S
 
V
L
 
A
A
 
A
G
 
I
R
 
R
L
 
A
S
 
A
G
 
Q
V
 
L
G
 
G
K
 
L
T
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
C
I
 
I
E
|
E
R
x
K
K
 
Y
L
 
I
-
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
V
-
 
A
F
x
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
V
 
L
N
 
N
T
 
V
G
|
G
C
|
C
M
 
I
P
 
P
T
x
S
K
|
K
A
 
A
M
 
L
V
 
L
A
 
D
S
 
S
A
 
S
Y
 
Y
A
 
K
I
 
Y
H
 
H
T
 
E
A
 
A
R
 
K
R
 
E
G
 
A
A
 
F
E
 
K
-
 
V
Y
 
H
G
 
G
M
 
I
T
 
E
T
 
A
G
 
K
P
x
G
V
|
V
S
 
T
V
 
I
D
 
D
F
 
V
G
 
P
R
 
A
V
 
M
M
 
V
A
 
A
R
 
R
K
 
K
E
 
A
K
 
N
V
 
I
R
 
V
L
 
K
D
 
N
A
 
L
R
 
T
S
 
G
G
 
G
V
 
I
E
 
A
K
 
T
W
 
L
L
 
F
K
 
K
G
 
A
M
 
-
K
 
N
N
 
G
C
 
V
T
 
T
V
 
S
F
 
F
E
 
E
G
 
G
H
|
H
A
x
G
R
 
K
F
 
L
E
 
L
G
 
A
P
 
N
R
 
K
E
 
Q
V
 
V
R
 
E
I
 
V
-
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
D
-
 
G
G
 
K
D
 
T
E
 
Q
L
 
V
I
 
L
S
 
E
G
 
A
E
 
E
R
 
N
I
 
V
F
 
I
V
 
I
N
x
A
V
x
S
G
|
G
G
 
S
R
 
R
-
 
P
A
 
V
A
 
E
V
 
I
A
 
P
D
 
P
L
 
A
P
 
P
G
 
L
V
 
T
N
 
D
D
 
D
V
 
I
P
 
-
Y
 
I
L
 
V
T
 
D
N
 
S
S
 
T
S
 
G
I
 
A
M
 
L
D
 
E
L
 
F
A
 
Q
E
 
A
L
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
K
L
 
L
V
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
A
S
 
G
Y
x
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
F
 
L
A
 
G
Q
 
S
M
 
V
F
 
W
R
 
A
R
 
R
F
 
L
G
 
G
S
 
A
D
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
V
I
 
L
E
 
E
K
 
A
G
 
L
A
 
D
R
 
K
L
 
F
I
 
L
G
 
P
R
 
A
E
 
A
D
 
D
P
 
E
E
 
Q
V
 
I
S
 
A
D
 
K
A
 
E
I
 
A
R
 
L
E
 
K
I
 
V
L
 
L
E
 
T
N
 
K
E
 
Q
G
 
G
V
 
L
R
 
N
I
 
I
R
 
R
T
 
L
N
 
G
A
 
A
E
 
R
C
 
V
I
 
T
R
 
A
F
 
S
S
 
E
N
 
V
H
 
K
A
 
K
D
 
K
S
 
Q
V
 
V
A
 
T
V
 
V
G
 
T
V
 
F
D
 
T
C
 
D
T
 
A
S
 
N
G
 
G
E
 
E
P
 
Q
E
 
K
V
 
E
S
 
T
G
 
F
S
 
D
H
 
K
V
 
L
L
 
I
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
R
|
R
H
 
R
P
 
P
N
 
V
T
 
T
D
 
T
D
 
D
L
 
L
G
 
L
L
 
A
D
 
A
K
 
D
A
 
S
G
 
G
V
 
V
K
 
T
T
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
R
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
E
 
Y
V
 
V
D
 
D
D
 
D
S
 
H
L
 
C
R
 
K
T
 
T
N
 
S
V
 
V
P
 
P
H
 
G
I
 
V
F
 
F
A
 
A
M
 
I
G
|
G
D
|
D
C
 
V
N
 
V
G
 
R
R
 
G
G
 
A
A
x
M
F
x
L
T
x
A
H
|
H
T
 
K
S
 
A
Y
x
S
N
 
E
D
 
E
F
 
G
E
 
V
I
 
M
V
 
V
A
 
A
A
 
E
N
 
R
L
 
I
I
 
A
D
 
G
N
 
H
D
 
K
P
 
A
R
 
Q
R
 
M
V
 
N
S
 
Y
D
 
D
R
 
L
I
 
I
Q
 
P
T
 
S
Y
 
V
A
 
-
L
 
I
Y
 
Y
I
 
T
D
 
H
P
 
P
P
 
E
L
 
I
G
 
A
R
 
W
A
 
V
G
 
G
M
 
K
T
 
T
E
 
E
T
 
Q
E
 
T
A
 
L
R
 
K
K
 
A
K
 
E
G
 
G
H
 
V
K
 
E
L
 
V
L
 
N
V
 
V
G
 
G
T
 
T
R
 
F
P
 
P
M
 
F
T
 
A
R
 
A
V
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
M
E
 
A
K
 
A
G
 
N
E
 
D
T
 
T
Q
 
T
G
 
G
F
 
L
M
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
V
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
K
T
 
T
D
 
D
E
 
R
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
H
I
 
V
L
 
I
G
 
G
T
 
P
G
 
S
G
 
A
D
 
A
E
 
E
A
 
L
V
 
V
Q
 
Q
S
 
Q
I
 
G
L
 
A
D
 
I
V
 
G
M
 
M
Y
 
E
A
 
F
K
 
G
K
 
T
P
 
S
Y
 
A
T
 
E
M
 
D
I
 
L
A
 
G
R
 
M
A
 
M
V
 
V
H
x
F
I
 
S
H
|
H
P
|
P
T
 
T
V
 
L
S
 
S
E
|
E
L
 
A
I
 
L

Sites not aligning to the query:

P14218 Dihydrolipoyl dehydrogenase; Dihydrolipoamide dehydrogenase; E3 component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex; EC 1.8.1.4 from Pseudomonas fluorescens (see 2 papers)
29% identity, 95% coverage: 17:463/473 of query aligns to 1:458/478 of P14218

query
sites
P14218
M
|
M
N
 
S
K
 
Q
H
 
K
F
 
F
D
 
D
A
 
V
V
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
P
A
 
G
G
 
G
P
 
Y
S
 
V
L
 
A
A
 
A
G
 
I
R
 
R
L
 
A
S
 
A
G
 
Q
V
 
L
G
 
G
K
 
L
T
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
C
I
 
I
E
|
E
R
x
K
K
x
Y
L
x
I
-
x
G
-
x
K
-
x
E
-
x
G
-
x
K
-
x
V
-
x
A
F
x
L
G
|
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
V
 
L
N
 
N
T
 
V
G
 
G
C
|
C
M
 
I
P
 
P
T
 
S
K
|
K
A
 
A
M
 
L
V
 
L
A
 
D
S
 
S
A
 
S
Y
 
Y
A
 
K
I
 
Y
H
 
H
T
 
E
A
 
A
R
 
K
R
 
E
G
 
A
A
 
F
E
 
K
-
 
V
Y
 
H
G
 
G
M
 
I
T
 
E
T
 
A
G
 
K
P
 
G
V
 
V
S
 
T
V
 
I
D
 
D
F
 
V
G
 
P
R
 
A
V
 
M
M
 
V
A
 
A
R
 
R
K
 
K
E
 
A
K
 
N
V
 
I
R
 
V
L
 
K
D
 
N
A
 
L
R
 
T
S
 
G
G
 
G
V
 
I
E
 
A
K
 
T
W
 
L
L
 
F
K
 
K
G
 
A
M
 
-
K
 
N
N
 
G
C
 
V
T
 
T
V
 
S
F
 
F
E
 
E
G
 
G
H
 
H
A
x
G
R
 
K
F
 
L
E
 
L
G
 
A
P
 
N
R
 
K
E
 
Q
V
 
V
R
 
E
I
 
V
-
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
D
-
 
G
G
 
K
D
 
T
E
 
Q
L
 
V
I
 
L
S
 
E
G
 
A
E
 
E
R
 
N
I
 
V
F
 
I
V
 
I
N
 
A
V
 
S
G
 
G
G
 
S
R
 
R
A
 
P
A
 
V
V
 
E
A
 
I
D
 
P
L
 
P
P
 
A
G
 
P
V
 
L
N
 
S
D
 
D
V
 
D
P
 
I
Y
 
I
L
 
V
T
 
D
N
 
S
S
 
T
S
 
G
I
 
A
M
 
L
D
 
E
L
 
F
A
 
Q
E
 
A
L
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
K
L
 
L
V
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
A
S
 
G
Y
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
F
 
L
A
 
G
Q
 
S
M
 
V
F
 
W
R
 
A
R
 
R
F
 
L
G
 
G
S
 
A
D
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
V
I
 
L
E
 
E
K
 
A
G
 
L
A
 
D
R
 
K
L
 
F
I
 
L
G
 
P
R
 
A
E
 
A
D
 
D
P
 
E
E
 
Q
V
 
I
S
 
A
D
 
K
A
 
E
I
 
A
R
 
L
E
 
K
I
 
V
L
 
L
E
 
T
N
 
K
E
 
Q
G
 
G
V
 
L
R
 
N
I
 
I
R
 
R
T
 
L
N
 
G
A
 
A
E
 
R
C
 
V
I
 
T
R
 
A
F
 
S
S
 
E
N
 
V
H
 
K
A
 
K
D
 
K
S
 
Q
V
 
V
A
 
T
V
 
V
G
 
T
V
 
F
D
 
T
C
 
D
T
 
A
S
 
N
G
 
G
E
 
E
P
 
Q
E
 
K
V
 
E
S
 
T
G
 
F
S
 
D
H
 
K
V
 
L
L
 
I
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
R
 
R
H
 
R
P
 
P
N
 
V
T
 
T
D
 
T
D
 
D
L
 
L
G
 
L
L
 
A
D
 
A
K
 
D
A
 
S
G
 
G
V
 
V
K
 
T
T
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
R
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
E
 
Y
V
 
V
D
 
D
D
 
D
S
 
H
L
 
C
R
 
K
T
 
T
N
 
S
V
 
V
P
 
P
H
 
G
I
 
V
F
 
F
A
 
A
M
 
I
G
 
G
D
|
D
C
 
V
N
 
V
G
 
R
R
 
G
G
 
A
A
 
M
F
 
L
T
x
A
H
 
H
T
 
K
S
 
A
Y
 
S
N
 
E
D
 
E
F
 
G
E
 
V
I
 
M
V
 
V
A
 
A
A
 
E
N
 
R
L
 
I
I
 
A
D
 
G
N
 
H
D
 
K
P
 
A
R
 
Q
R
 
M
V
 
N
S
 
Y
D
 
D
R
 
L
I
 
I
Q
 
P
T
 
S
Y
 
V
A
 
-
L
 
I
Y
 
Y
I
 
T
D
 
H
P
 
P
P
 
E
L
 
I
G
 
A
R
 
W
A
 
V
G
 
G
M
 
K
T
 
T
E
 
E
T
 
Q
E
 
T
A
 
L
R
 
K
K
 
A
K
 
E
G
 
G
H
 
V
K
 
E
L
 
V
L
 
N
V
 
V
G
 
G
T
 
T
R
 
F
P
 
P
M
 
F
T
 
A
R
 
A
V
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
M
E
 
A
K
 
A
G
 
N
E
 
D
T
 
T
Q
 
T
G
 
G
F
 
L
M
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
V
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
K
T
 
T
D
 
D
E
 
R
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
H
I
 
V
L
 
I
G
 
G
T
 
P
G
 
S
G
 
A
D
 
A
E
 
E
A
 
L
V
 
V
Q
 
Q
S
 
Q
I
 
G
L
 
A
D
 
I
V
 
G
M
 
M
Y
 
E
A
 
F
K
 
G
K
 
T
P
 
S
Y
 
A
T
 
E
M
 
D
I
 
L
A
 
G
R
 
M
A
 
M
V
 
V
H
 
F
I
 
S
H
 
H
P
 
P
T
 
T
V
 
L
S
 
S
E
 
E
L
 
A
I
 
L

3urhB Crystal structure of a dihydrolipoamide dehydrogenase from sinorhizobium meliloti 1021
30% identity, 94% coverage: 21:463/473 of query aligns to 1:452/465 of 3urhB

query
sites
3urhB
F
 
Y
D
 
D
A
 
L
V
 
I
I
 
V
I
|
I
G
|
G
A
 
S
G
|
G
Q
x
P
A
x
G
G
 
G
P
 
Y
S
 
V
L
 
C
A
 
A
G
 
I
R
 
K
L
 
A
S
 
A
G
 
Q
V
 
L
G
 
G
K
 
M
T
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
I
 
V
E
|
E
-
x
K
R
 
R
K
 
S
L
 
T
F
x
Y
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
V
 
L
N
 
N
T
 
V
G
|
G
C
|
C
M
 
I
P
 
P
T
x
S
K
|
K
A
 
A
M
 
L
V
 
L
A
 
H
S
 
A
A
 
S
Y
 
E
A
 
M
I
 
F
H
 
H
T
 
Q
A
 
A
R
 
Q
R
 
H
G
 
G
A
 
L
E
 
E
-
 
A
Y
 
L
G
 
G
M
 
V
T
 
E
T
 
V
G
 
A
P
 
N
V
 
P
S
 
K
V
 
L
D
 
N
F
 
L
G
 
Q
R
 
K
V
 
M
M
 
M
A
 
A
R
 
H
K
 
K
E
 
D
K
 
A
V
 
T
R
 
V
L
 
K
D
 
S
A
 
N
R
 
V
S
 
D
G
 
G
V
 
V
E
 
S
K
 
F
W
 
L
L
 
F
K
 
K
G
 
K
M
 
N
K
 
K
N
 
-
C
 
I
T
 
D
V
 
G
F
 
F
E
 
Q
G
 
G
H
x
T
A
x
G
R
 
K
F
 
V
E
 
L
G
 
G
P
 
Q
R
 
G
E
 
K
V
 
V
R
 
S
I
 
V
G
 
T
D
 
N
E
 
E
-
 
K
-
 
G
-
 
E
-
 
E
-
 
Q
L
 
V
I
 
L
S
 
E
G
 
A
E
 
K
R
 
N
I
 
V
F
 
V
V
 
I
N
x
A
V
x
T
G
|
G
G
 
-
R
 
-
A
 
S
A
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
G
L
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
V
-
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
F
N
 
D
D
 
E
V
 
K
P
 
T
Y
 
I
L
 
V
T
 
S
N
 
S
S
 
T
S
 
G
I
 
A
M
 
L
D
 
A
L
 
L
A
 
E
E
 
K
L
 
V
P
 
P
E
 
A
H
 
S
L
 
M
V
 
I
V
 
V
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
G
Y
x
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
F
 
L
A
 
G
Q
 
S
M
 
V
F
 
W
R
 
A
R
 
R
F
 
L
G
 
G
S
 
A
D
 
K
V
 
V
T
 
T
V
 
V
I
 
V
E
 
E
K
 
F
G
 
L
A
 
D
R
 
T
L
 
I
I
 
L
G
 
G
R
 
G
E
 
M
D
 
D
P
 
G
E
 
E
V
 
V
S
 
A
D
 
K
A
 
Q
I
 
L
R
 
Q
E
 
R
I
 
M
L
 
L
E
 
T
N
 
K
E
 
Q
G
 
G
V
 
I
R
 
D
I
 
F
R
 
K
T
 
L
N
 
G
A
 
A
E
 
K
C
 
V
I
 
T
R
 
G
F
 
A
S
 
V
N
 
K
H
 
S
A
 
G
D
 
D
S
 
G
V
 
A
A
 
K
V
 
V
-
 
T
-
 
F
-
 
E
-
 
P
-
 
V
-
 
K
G
 
G
V
 
G
D
 
E
C
 
A
T
 
T
S
 
T
G
 
L
E
 
D
P
 
A
E
 
E
V
 
V
S
 
-
G
 
-
S
 
-
H
 
-
V
 
V
L
 
L
L
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
|
R
H
 
K
P
 
P
N
 
S
T
 
T
D
 
D
D
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
V
T
 
L
D
 
D
E
 
S
R
 
R
G
 
G
Y
 
R
I
 
V
E
 
E
V
 
I
D
 
D
D
 
R
S
 
H
L
 
F
R
 
Q
T
 
T
N
 
S
V
 
I
P
 
A
H
 
G
I
 
V
F
 
Y
A
 
A
M
 
I
G
|
G
D
|
D
C
 
V
N
 
V
G
 
-
R
 
R
G
 
G
A
 
P
F
x
M
T
x
L
H
x
A
T
x
H
S
 
K
Y
 
A
N
 
E
D
 
D
F
 
E
E
 
G
I
 
V
V
 
A
A
 
V
A
 
A
N
 
E
L
 
I
I
 
I
D
 
A
N
 
G
D
 
Q
P
 
A
R
 
G
R
 
H
V
 
V
S
 
N
D
 
Y
R
 
D
I
 
V
Q
 
I
T
 
P
Y
 
G
A
 
V
L
 
V
Y
 
Y
I
 
T
D
 
Q
P
 
P
P
 
E
L
 
V
G
 
A
R
 
S
A
 
V
G
 
G
M
 
K
T
 
T
E
 
E
T
 
E
E
 
E
A
 
L
R
 
K
K
 
A
K
 
A
G
 
G
H
 
V
K
 
A
L
 
Y
L
 
K
V
 
I
G
 
G
T
 
K
R
 
F
P
 
P
M
 
F
T
 
T
R
 
A
V
 
N
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
R
E
 
A
K
 
M
G
 
L
E
 
Q
T
 
T
Q
 
D
G
 
G
F
 
F
M
 
V
K
 
K
V
 
I
I
 
L
V
 
A
D
 
D
A
 
K
E
 
E
T
 
T
D
 
D
E
 
R
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
G
S
 
H
I
 
I
L
 
I
G
 
G
T
 
F
G
 
G
G
 
A
D
 
G
E
 
E
A
 
M
V
 
I
Q
 
H
S
 
E
I
 
I
L
 
A
D
 
V
V
 
L
M
 
M
Y
 
E
A
 
F
K
 
G
K
 
G
P
 
S
Y
 
S
T
 
E
M
 
D
I
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
T
V
 
C
H
|
H
I
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
T
V
 
M
S
 
S
E
|
E
L
 
A
I
 
V

3ladA Refined crystal structure of lipoamide dehydrogenase from azotobacter vinelandii at 2.2 angstroms resolution. A comparison with the structure of glutathione reductase (see paper)
30% identity, 94% coverage: 18:463/473 of query aligns to 1:457/472 of 3ladA

query
sites
3ladA
N
 
S
K
 
Q
H
 
K
F
 
F
D
 
D
A
 
V
V
 
I
I
 
V
I
|
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
Q
x
P
A
 
G
G
 
G
P
 
Y
S
 
V
L
 
A
A
 
A
G
 
I
R
 
K
L
 
S
S
 
A
G
 
Q
V
 
L
G
 
G
K
 
L
T
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
|
E
R
x
K
-
 
Y
-
 
K
-
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
K
K
 
T
L
 
A
F
x
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
V
 
L
N
 
N
T
 
V
G
|
G
C
|
C
M
 
I
P
 
P
T
x
S
K
 
K
A
 
A
M
 
L
V
 
L
A
 
D
S
 
S
A
 
S
Y
 
Y
A
 
K
I
 
F
H
 
H
T
 
E
A
 
A
R
 
H
R
 
E
G
 
S
A
 
F
E
 
K
-
 
L
Y
 
H
G
 
G
M
 
I
T
 
S
T
 
T
G
 
G
P
 
E
V
 
V
S
 
A
V
 
I
D
 
D
F
 
V
G
 
P
R
 
T
V
 
M
M
 
I
A
 
A
R
 
R
K
 
K
E
 
D
K
 
Q
V
 
I
R
 
V
L
 
R
D
 
N
A
 
L
R
 
T
S
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
A
K
 
S
W
 
L
L
 
I
K
 
K
G
 
A
M
 
-
K
 
N
N
 
G
C
 
V
T
 
T
V
 
L
F
 
F
E
 
E
G
 
G
H
|
H
A
x
G
R
 
K
F
 
L
E
 
L
G
 
A
P
 
G
R
 
K
E
 
K
V
 
V
R
 
E
I
 
V
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
G
G
 
S
D
 
S
E
 
Q
L
 
V
I
 
L
S
 
D
G
 
T
E
 
E
R
 
N
I
 
V
F
 
I
V
 
L
N
x
A
V
x
S
G
|
G
G
 
S
R
 
K
A
 
P
A
 
V
V
 
E
A
 
I
D
 
P
L
 
P
P
 
A
G
 
P
V
 
V
N
 
D
D
 
Q
V
 
D
P
 
V
Y
 
I
L
 
V
T
 
D
N
 
S
S
 
T
S
 
G
I
 
A
M
 
L
D
 
D
L
 
F
A
 
Q
E
 
N
L
 
V
P
 
P
E
 
G
H
 
K
L
 
L
V
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
A
S
 
G
Y
x
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
F
 
L
A
 
G
Q
 
S
M
 
V
F
 
W
R
 
A
R
 
R
F
 
L
G
 
G
S
 
A
D
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
V
I
 
L
E
 
E
K
 
A
G
 
M
A
 
D
R
 
K
L
 
F
I
 
L
G
 
P
R
 
A
E
 
V
D
 
D
P
 
E
E
 
Q
V
 
V
S
 
A
D
 
K
A
 
E
I
 
A
R
 
Q
E
 
K
I
 
I
L
 
L
E
 
T
N
 
K
E
 
Q
G
 
G
V
 
L
R
 
K
I
 
I
R
 
L
T
 
L
N
 
G
A
 
A
E
 
R
C
 
V
I
 
T
R
 
G
F
 
T
S
 
E
N
 
V
H
 
K
A
 
N
D
 
K
S
 
Q
V
 
V
A
 
T
V
 
V
G
 
K
V
 
F
D
 
V
C
 
D
T
 
A
S
 
E
G
 
G
E
 
E
P
 
K
E
 
S
V
 
Q
S
 
A
G
 
F
S
 
D
H
 
K
V
 
L
L
 
I
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
R
|
R
H
 
R
P
 
P
N
 
V
T
 
T
D
 
T
D
 
D
L
 
L
G
 
L
L
 
A
D
 
A
K
 
D
A
 
S
G
 
G
V
 
V
K
 
T
T
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
R
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
E
 
Y
V
 
V
D
 
D
D
 
D
S
 
Y
L
 
C
R
 
A
T
 
T
N
 
S
V
 
V
P
 
P
H
 
G
I
 
V
F
 
Y
A
 
A
M
 
I
G
 
G
D
|
D
C
 
V
N
 
V
G
 
-
R
 
R
G
 
G
A
 
A
F
 
M
T
x
L
H
x
A
T
 
H
S
 
K
Y
 
A
N
 
S
D
 
E
F
 
E
E
 
G
I
 
V
V
 
V
A
 
V
A
 
A
N
 
E
L
 
R
I
 
I
D
 
A
N
 
G
D
 
H
P
 
K
R
 
A
R
 
Q
V
 
M
S
 
N
D
 
Y
R
 
D
I
 
L
Q
 
I
T
 
P
Y
 
A
A
 
V
L
 
I
Y
 
Y
I
 
T
D
 
H
P
 
P
P
 
E
L
 
I
G
 
A
R
 
G
A
 
V
G
 
G
M
 
K
T
 
T
E
 
E
T
 
Q
E
 
A
A
 
L
R
 
K
K
 
A
K
 
E
G
 
G
H
 
V
K
 
A
L
 
I
L
 
N
V
 
V
G
 
G
T
 
V
R
 
F
P
 
P
M
 
F
T
 
A
R
 
A
V
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
M
E
 
A
K
 
A
G
 
N
E
 
D
T
 
T
Q
 
A
G
 
G
F
 
F
M
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
V
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
K
T
 
T
D
 
D
E
 
R
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
H
I
 
V
L
 
I
G
 
G
T
 
P
G
 
S
G
 
A
D
 
A
E
 
E
A
 
L
V
 
V
Q
 
Q
S
 
Q
I
 
G
L
 
A
D
 
I
V
 
A
M
 
M
Y
 
E
A
 
F
K
 
G
K
 
T
P
 
S
Y
 
A
T
 
E
M
 
D
I
 
L
A
 
G
R
 
M
A
 
M
V
 
V
H
x
F
I
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
A
V
 
L
S
 
S
E
|
E
L
 
A
I
 
L

5u8wA Dihydrolipoamide dehydrogenase (lpdg) from pseudomonas aeruginosa bound to nadh (see paper)
29% identity, 94% coverage: 18:463/473 of query aligns to 1:457/473 of 5u8wA

query
sites
5u8wA
N
 
S
K
 
Q
H
 
K
F
 
F
D
 
D
A
 
V
V
 
V
I
 
V
I
|
I
G
 
G
A
 
A
G
|
G
Q
x
P
A
x
G
G
 
G
P
 
Y
S
 
V
L
 
A
A
 
A
G
 
I
R
 
R
L
 
A
S
 
A
G
 
Q
V
 
L
G
 
G
K
 
L
T
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
C
I
 
I
E
|
E
R
x
K
K
 
Y
L
 
I
-
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
V
-
 
A
F
x
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
V
 
L
N
 
N
T
 
V
G
|
G
C
|
C
M
 
I
P
 
P
T
x
S
K
|
K
A
 
A
M
 
L
V
 
L
A
 
D
S
 
S
A
 
S
Y
 
Y
A
 
K
I
 
Y
H
 
H
T
 
E
A
 
A
R
 
K
R
 
E
G
 
A
A
 
F
E
 
K
-
 
V
Y
 
H
G
 
G
M
 
I
T
 
E
T
 
A
G
 
K
P
x
G
V
|
V
S
 
T
V
 
I
D
 
D
F
 
V
G
 
P
R
 
A
V
 
M
M
 
V
A
 
A
R
 
R
K
 
K
E
 
A
K
 
N
V
 
I
R
 
V
L
 
K
D
 
N
A
 
L
R
 
T
S
 
G
G
 
G
V
 
I
E
 
A
K
 
T
W
 
L
L
 
F
K
 
K
G
 
A
M
 
-
K
 
N
N
 
G
C
 
V
T
 
T
V
 
S
F
 
F
E
 
E
G
 
G
H
|
H
A
x
G
R
 
K
F
 
L
E
 
L
G
 
A
P
 
N
R
 
K
E
 
Q
V
 
V
R
 
E
I
 
V
-
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
D
-
 
G
G
 
K
D
 
T
E
 
Q
L
 
V
I
 
L
S
 
E
G
 
A
E
 
E
R
 
N
I
 
V
F
 
I
V
 
I
N
x
A
V
x
S
G
|
G
G
 
S
R
 
R
-
 
P
A
 
V
A
 
E
V
 
I
A
 
P
D
 
P
L
 
A
P
 
P
G
 
L
V
 
T
N
 
D
D
 
D
V
 
I
P
 
-
Y
 
I
L
 
V
T
 
D
N
x
S
S
 
T
S
 
G
I
 
A
M
 
L
D
 
E
L
 
F
A
 
Q
E
 
A
L
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
K
L
 
L
V
 
G
V
 
V
V
x
I
G
 
G
G
 
A
S
x
G
Y
x
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
F
 
L
A
 
G
Q
 
S
M
 
V
F
 
W
R
 
A
R
 
R
F
 
L
G
 
G
S
 
A
D
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
V
I
 
L
E
|
E
K
x
A
G
x
L
A
 
D
R
 
K
L
 
F
I
 
L
G
 
P
R
 
A
E
 
A
D
 
D
P
 
E
E
 
Q
V
 
I
S
 
A
D
 
K
A
 
E
I
 
A
R
 
L
E
 
K
I
 
V
L
 
L
E
 
T
N
 
K
E
 
Q
G
 
G
V
 
L
R
 
N
I
 
I
R
 
R
T
 
L
N
 
G
A
 
A
E
 
R
C
 
V
I
 
T
R
 
A
F
 
S
S
 
E
N
 
V
H
 
K
A
 
K
D
 
K
S
 
Q
V
 
V
A
 
T
V
 
V
G
 
T
V
 
F
D
 
T
C
 
D
T
 
A
S
 
N
G
 
G
E
 
E
P
 
Q
E
 
K
V
 
E
S
 
T
G
 
F
S
 
D
H
 
K
V
 
L
L
 
I
L
 
V
A
|
A
T
x
V
G
|
G
R
|
R
H
 
R
P
 
P
N
 
V
T
 
T
D
 
T
D
 
D
L
 
L
G
 
L
L
 
A
D
 
A
K
 
D
A
 
S
G
 
G
V
 
V
K
 
T
T
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
R
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
E
 
Y
V
 
V
D
 
D
D
 
D
S
 
H
L
 
C
R
 
K
T
 
T
N
 
S
V
 
V
P
 
P
H
 
G
I
 
V
F
 
F
A
 
A
M
 
I
G
|
G
D
|
D
C
 
V
N
 
V
G
 
R
R
 
G
G
 
A
A
x
M
F
x
L
T
x
A
H
|
H
T
 
K
S
 
A
Y
x
S
N
 
E
D
 
E
F
 
G
E
 
V
I
 
M
V
 
V
A
 
A
A
 
E
N
 
R
L
 
I
I
 
A
D
 
G
N
 
H
D
 
K
P
 
A
R
 
Q
R
 
M
V
 
N
S
 
Y
D
 
D
R
 
L
I
 
I
Q
 
P
T
 
S
Y
x
V
A
 
-
L
 
I
Y
|
Y
I
 
T
D
 
H
P
 
P
P
 
E
L
 
I
G
 
A
R
 
W
A
 
V
G
 
G
M
 
K
T
 
T
E
 
E
T
 
Q
E
 
T
A
 
L
R
 
K
K
 
A
K
 
E
G
 
G
H
 
V
K
 
E
L
 
V
L
 
N
V
 
V
G
 
G
T
 
T
R
 
F
P
 
P
M
 
F
T
 
A
R
 
A
V
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
M
E
 
A
K
 
A
G
 
N
E
 
D
T
 
T
Q
 
T
G
 
G
F
 
L
M
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
V
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
K
T
 
T
D
 
D
E
 
R
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
H
I
 
V
L
 
I
G
 
G
T
 
P
G
 
S
G
 
A
D
 
A
E
 
E
A
 
L
V
 
V
Q
 
Q
S
 
Q
I
 
G
L
 
A
D
 
I
V
 
G
M
 
M
Y
 
E
A
 
F
K
 
G
K
 
T
P
 
S
Y
 
A
T
 
E
M
 
D
I
 
L
A
 
G
R
 
M
A
 
M
V
 
V
H
x
F
I
 
S
H
|
H
P
|
P
T
 
T
V
 
L
S
 
S
E
|
E
L
 
A
I
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>SM_b21143 FitnessBrowser__Smeli:SM_b21143
MWTTLPPGASISPEVVMNKHFDAVIIGAGQAGPSLAGRLSGVGKTVALIERKLFGGTCVN
TGCMPTKAMVASAYAIHTARRGAEYGMTTGPVSVDFGRVMARKEKVRLDARSGVEKWLKG
MKNCTVFEGHARFEGPREVRIGDELISGERIFVNVGGRAAVADLPGVNDVPYLTNSSIMD
LAELPEHLVVVGGSYIGLEFAQMFRRFGSDVTVIEKGARLIGREDPEVSDAIREILENEG
VRIRTNAECIRFSNHADSVAVGVDCTSGEPEVSGSHVLLATGRHPNTDDLGLDKAGVKTD
ERGYIEVDDSLRTNVPHIFAMGDCNGRGAFTHTSYNDFEIVAANLIDNDPRRVSDRIQTY
ALYIDPPLGRAGMTETEARKKGHKLLVGTRPMTRVGRAVEKGETQGFMKVIVDAETDEIL
GASILGTGGDEAVQSILDVMYAKKPYTMIARAVHIHPTVSELIPTVFGDLSSA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory