SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SM_b21218 FitnessBrowser__Smeli:SM_b21218 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 10 hits to proteins with known functional sites (download)

Q06210 Glutamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing] 1; D-fructose-6-phosphate amidotransferase 1; Glutamine:fructose-6-phosphate amidotransferase 1; GFAT 1; GFAT1; Hexosephosphate aminotransferase 1; EC 2.6.1.16 from Homo sapiens (Human) (see paper)
23% identity, 81% coverage: 43:318/339 of query aligns to 381:676/699 of Q06210

query
sites
Q06210
L
 
I
K
 
Q
S
 
R
T
 
C
G
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
I
L
 
L
L
 
I
G
 
A
M
 
C
G
 
G
G
x
T
S
|
S
H
 
Y
A
 
H
V
 
A
G
 
G
R
 
V
A
 
A
V
 
T
E
 
R
P
 
Q
L
 
V
Y
 
L
R
 
E
A
 
E
L
 
L
G
 
T
I
 
E
E
 
L
A
 
P
V
 
V
A
 
M
V
 
V
P
 
E
L
 
L
S
 
A
E
 
S
Q
 
D
L
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
R
G
 
N
E
 
T
P
 
P
L
 
V
S
 
-
I
 
F
E
 
R
G
 
D
K
 
D
T
 
V
I
 
C
L
 
F
V
 
F
T
 
L
S
|
S
Q
|
Q
S
|
S
G
 
G
E
 
E
S
x
T
A
 
A
E
 
D
V
 
T
L
 
L
R
 
M
W
 
G
F
 
L
R
 
R
E
 
Y
T
 
C
D
 
K
G
 
E
G
 
R
T
 
G
S
 
A
E
 
L
T
 
T
F
 
V
G
 
G
L
 
I
T
 
T
L
 
N
E
 
T
E
 
V
D
 
G
A
 
S
F
 
S
L
 
I
A
 
S
K
 
R
A
 
E
V
 
T
P
 
D
S
 
C
L
 
G
V
 
V
G
 
H
-
 
I
S
 
N
G
 
A
G
 
G
T
 
P
E
 
E
R
 
I
A
 
G
F
 
V
A
 
A
A
 
S
T
 
T
R
 
K
S
 
A
L
 
Y
T
 
T
V
 
S
T
 
Q
F
 
F
A
 
-
L
 
V
H
 
S
L
 
L
A
 
V
V
 
M
L
 
F
A
 
A
A
 
L
L
 
M
G
 
M
A
 
C
D
 
D
P
 
D
A
 
R
D
 
I
A
 
S
L
 
M
R
 
Q
A
 
E
L
 
R
R
 
R
D
 
K
P
 
E
E
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
I
 
I
D
 
M
G
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
K
A
 
R
L
 
L
A
 
P
D
 
D
-
 
L
V
 
I
G
 
K
A
 
E
I
 
V
V
 
L
T
 
S
S
 
M
G
 
D
R
 
D
K
 
E
L
 
I
Q
 
Q
G
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
T
A
 
E
I
 
L
-
 
Y
-
 
H
-
 
Q
-
 
K
-
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
I
-
 
M
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
Y
-
 
H
-
 
Y
-
 
A
-
 
T
-
 
C
-
 
L
-
 
E
-
 
G
A
 
A
L
 
L
G
 
K
L
 
I
T
 
K
E
 
E
L
 
I
S
 
T
R
 
Y
L
 
M
P
 
H
C
 
S
F
 
E
S
 
G
L
 
I
E
 
L
G
 
A
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
R
 
K
H
|
H
G
 
G
P
 
P
M
 
L
E
 
A
M
 
L
L
 
V
G
 
D
A
 
K
S
 
L
V
 
M
G
 
P
V
 
V
V
 
I
L
 
M
F
 
I
R
 
I
A
 
M
A
 
R
D
 
D
P
 
H
T
 
T
-
 
Y
A
 
A
K
 
K
L
 
C
V
 
Q
G
 
N
A
 
A
M
 
L
A
 
Q
T
 
Q
S
 
V
A
 
V
A
 
A
E
 
R
A
 
Q
G
 
G
S
 
R
P
 
P
V
 
V
I
 
V
V
 
I
F
 
C
D
 
D
A
 
K
S
 
E
D
 
D
-
 
T
E
 
E
S
 
T
P
 
I
A
 
K
A
 
N
G
 
T
A
 
K
T
 
R
T
 
T
I
 
I
R
 
K
F
 
V
K
 
P
P
 
H
A
 
S
A
 
V
G
 
D
-
 
C
L
 
L
A
 
Q
A
 
G
I
 
I
L
 
L
A
 
S
M
 
V
L
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
Q
Q
 
-
S
 
-
L
 
-
M
 
L
I
 
L
A
 
A
F
 
F

2zj4A Isomerase domain of human glucose:fructose-6-phosphate amidotransferase (see paper)
23% identity, 81% coverage: 43:318/339 of query aligns to 47:342/365 of 2zj4A

query
sites
2zj4A
L
 
I
K
 
Q
S
 
R
T
 
C
G
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
I
L
 
L
L
 
I
G
 
A
M
 
C
G
 
G
G
x
T
S
|
S
H
 
Y
A
 
H
V
 
A
G
 
G
R
 
V
A
 
A
V
 
T
E
 
R
P
 
Q
L
 
V
Y
 
L
R
 
E
A
 
E
L
 
L
G
 
T
I
 
E
E
 
L
A
 
P
V
 
V
A
 
M
V
 
V
P
 
E
L
 
L
S
 
A
E
 
S
Q
 
D
L
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
R
G
 
N
E
 
T
P
 
P
L
 
V
S
 
-
I
 
F
E
 
R
G
 
D
K
 
D
T
 
V
I
 
C
L
 
F
V
 
F
T
 
L
S
|
S
Q
|
Q
S
|
S
G
 
G
E
 
E
S
x
T
A
 
A
E
 
D
V
 
T
L
 
L
R
 
M
W
 
G
F
 
L
R
 
R
E
 
Y
T
 
C
D
 
K
G
 
E
G
 
R
T
 
G
S
 
A
E
 
L
T
 
T
F
 
V
G
 
G
L
 
I
T
 
T
L
 
N
E
 
T
E
 
V
D
 
G
A
 
S
F
 
S
L
 
I
A
 
S
K
 
R
A
 
E
V
 
T
P
 
D
S
 
C
L
 
G
V
 
V
G
 
H
-
 
I
S
 
N
G
 
A
G
 
G
T
 
P
E
 
E
R
 
I
A
 
G
F
x
V
A
|
A
A
 
S
T
 
T
R
 
K
S
 
A
L
 
Y
T
 
T
V
 
S
T
 
Q
F
 
F
A
 
-
L
 
V
H
 
S
L
 
L
A
 
V
V
 
M
L
 
F
A
 
A
A
 
L
L
 
M
G
 
M
A
 
C
D
 
D
P
 
D
A
 
R
D
 
I
A
 
S
L
 
M
R
 
Q
A
 
E
L
 
R
R
 
R
D
 
K
P
 
E
E
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
I
 
I
D
 
M
G
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
K
A
 
R
L
 
L
A
 
P
D
 
D
-
 
L
V
 
I
G
 
K
A
 
E
I
 
V
V
 
L
T
 
S
S
 
M
G
 
D
R
 
D
K
 
E
L
 
I
Q
 
Q
G
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
T
A
 
E
I
 
L
-
 
Y
-
 
H
-
 
Q
-
 
K
-
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
I
-
 
M
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
Y
-
 
H
-
 
Y
-
 
A
-
 
T
-
 
C
-
 
L
-
x
E
-
 
G
A
 
A
L
 
L
G
x
K
L
 
I
T
 
K
E
|
E
L
 
I
S
 
T
R
 
Y
L
 
M
P
 
H
C
 
S
F
 
E
S
 
G
L
 
I
E
 
L
G
 
A
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
R
 
K
H
|
H
G
 
G
P
 
P
M
 
L
E
 
A
M
 
L
L
 
V
G
 
D
A
 
K
S
 
L
V
 
M
G
 
P
V
 
V
V
 
I
L
 
M
F
 
I
R
 
I
A
 
M
A
 
R
D
 
D
P
 
H
T
 
T
-
 
Y
A
 
A
K
 
K
L
 
C
V
 
Q
G
 
N
A
 
A
M
 
L
A
 
Q
T
 
Q
S
 
V
A
 
V
A
 
A
E
 
R
A
 
Q
G
 
G
S
 
R
P
 
P
V
 
V
I
 
V
V
 
I
F
 
C
D
 
D
A
 
K
S
 
E
D
 
D
-
 
T
E
 
E
S
 
T
P
 
I
A
 
K
A
 
N
G
 
T
A
 
K
T
 
R
T
 
T
I
 
I
R
 
K
F
 
V
K
 
P
P
 
H
A
 
S
A
 
V
G
 
D
-
 
C
L
 
L
A
 
Q
A
 
G
I
 
I
L
 
L
A
 
S
M
 
V
L
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
Q
Q
 
-
S
 
-
L
 
-
M
 
L
I
 
L
A
 
A
F
 
F

Sites not aligning to the query:

2zj3A Isomerase domain of human glucose:fructose-6-phosphate amidotransferase (see paper)
23% identity, 81% coverage: 43:318/339 of query aligns to 47:342/365 of 2zj3A

query
sites
2zj3A
L
 
I
K
 
Q
S
 
R
T
 
C
G
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
I
L
 
L
L
 
I
G
 
A
M
 
C
G
 
G
G
x
T
S
|
S
H
 
Y
A
 
H
V
 
A
G
 
G
R
 
V
A
 
A
V
 
T
E
 
R
P
 
Q
L
 
V
Y
 
L
R
 
E
A
 
E
L
 
L
G
 
T
I
 
E
E
 
L
A
 
P
V
 
V
A
 
M
V
 
V
P
 
E
L
 
L
S
 
A
E
 
S
Q
 
D
L
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
R
G
 
N
E
 
T
P
 
P
L
 
V
S
 
-
I
 
F
E
 
R
G
 
D
K
 
D
T
 
V
I
 
C
L
 
F
V
 
F
T
 
L
S
|
S
Q
|
Q
S
|
S
G
 
G
E
 
E
S
x
T
A
 
A
E
 
D
V
 
T
L
 
L
R
 
M
W
 
G
F
 
L
R
 
R
E
 
Y
T
 
C
D
 
K
G
 
E
G
 
R
T
 
G
S
 
A
E
 
L
T
 
T
F
 
V
G
 
G
L
 
I
T
 
T
L
 
N
E
 
T
E
 
V
D
 
G
A
 
S
F
 
S
L
 
I
A
 
S
K
 
R
A
 
E
V
 
T
P
 
D
S
 
C
L
 
G
V
 
V
G
 
H
-
 
I
S
 
N
G
 
A
G
 
G
T
 
P
E
 
E
R
 
I
A
 
G
F
x
V
A
 
A
A
 
S
T
 
T
R
 
K
S
 
A
L
 
Y
T
 
T
V
 
S
T
 
Q
F
 
F
A
 
-
L
 
V
H
 
S
L
 
L
A
 
V
V
 
M
L
 
F
A
 
A
A
 
L
L
 
M
G
 
M
A
 
C
D
 
D
P
 
D
A
 
R
D
 
I
A
 
S
L
 
M
R
 
Q
A
 
E
L
 
R
R
 
R
D
 
K
P
 
E
E
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
I
 
I
D
 
M
G
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
K
A
 
R
L
 
L
A
 
P
D
 
D
-
 
L
V
 
I
G
 
K
A
 
E
I
 
V
V
 
L
T
 
S
S
 
M
G
 
D
R
 
D
K
 
E
L
 
I
Q
 
Q
G
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
T
A
 
E
I
 
L
-
 
Y
-
 
H
-
 
Q
-
 
K
-
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
I
-
 
M
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
Y
-
 
H
-
 
Y
-
 
A
-
 
T
-
 
C
-
 
L
-
x
E
-
 
G
A
 
A
L
 
L
G
x
K
L
 
I
T
 
K
E
|
E
L
 
I
S
 
T
R
 
Y
L
 
M
P
 
H
C
 
S
F
 
E
S
 
G
L
 
I
E
 
L
G
 
A
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
R
 
K
H
|
H
G
 
G
P
 
P
M
 
L
E
 
A
M
 
L
L
 
V
G
 
D
A
 
K
S
 
L
V
 
M
G
 
P
V
 
V
V
 
I
L
 
M
F
 
I
R
 
I
A
 
M
A
 
R
D
 
D
P
 
H
T
 
T
-
 
Y
A
 
A
K
 
K
L
 
C
V
 
Q
G
 
N
A
 
A
M
 
L
A
 
Q
T
 
Q
S
 
V
A
 
V
A
 
A
E
 
R
A
 
Q
G
 
G
S
 
R
P
 
P
V
 
V
I
 
V
V
 
I
F
 
C
D
 
D
A
 
K
S
 
E
D
 
D
-
 
T
E
 
E
S
 
T
P
 
I
A
 
K
A
 
N
G
 
T
A
 
K
T
 
R
T
 
T
I
 
I
R
 
K
F
 
V
K
 
P
P
 
H
A
 
S
A
 
V
G
 
D
-
 
C
L
 
L
A
 
Q
A
 
G
I
 
I
L
 
L
A
 
S
M
 
V
L
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
Q
Q
 
-
S
 
-
L
 
-
M
 
L
I
 
L
A
 
A
F
 
F

Sites not aligning to the query:

6r4gA Crystal structure of human gfat-1 in complex with udp-glcnac (see paper)
23% identity, 81% coverage: 43:318/339 of query aligns to 341:636/652 of 6r4gA

query
sites
6r4gA
L
 
I
K
 
Q
S
 
R
T
 
C
G
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
I
L
 
L
L
 
I
G
 
A
M
 
C
G
|
G
G
x
T
S
|
S
H
 
Y
A
 
H
V
 
A
G
 
G
R
 
V
A
 
A
V
 
T
E
 
R
P
 
Q
L
 
V
Y
 
L
R
 
E
A
 
E
L
 
L
G
 
T
I
 
E
E
 
L
A
 
P
V
 
V
A
 
M
V
 
V
P
 
E
L
 
L
S
 
A
E
 
S
Q
 
D
L
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
R
G
 
N
E
 
T
P
 
P
L
 
V
S
 
-
I
 
F
E
 
R
G
 
D
K
 
D
T
 
V
I
 
C
L
 
F
V
 
F
T
 
L
S
|
S
Q
|
Q
S
|
S
G
 
G
E
 
E
S
x
T
A
 
A
E
 
D
V
 
T
L
 
L
R
 
M
W
 
G
F
 
L
R
 
R
E
 
Y
T
 
C
D
 
K
G
 
E
G
 
R
T
 
G
S
 
A
E
 
L
T
 
T
F
 
V
G
|
G
L
 
I
T
|
T
L
 
N
E
 
T
E
 
V
D
 
G
A
 
S
F
 
S
L
 
I
A
x
S
K
x
R
A
 
E
V
x
T
P
 
D
S
x
C
L
x
G
V
|
V
G
x
H
-
 
I
S
 
N
G
 
A
G
 
G
T
 
P
E
 
E
R
 
I
A
 
G
F
 
V
A
 
A
A
x
S
T
 
T
R
 
K
S
 
A
L
 
Y
T
 
T
V
 
S
T
 
Q
F
 
F
A
 
-
L
 
V
H
 
S
L
 
L
A
 
V
V
 
M
L
 
F
A
 
A
A
 
L
L
 
M
G
 
M
A
 
C
D
 
D
P
 
D
A
 
R
D
 
I
A
 
S
L
 
M
R
 
Q
A
 
E
L
 
R
R
 
R
D
 
K
P
 
E
E
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
I
 
I
D
 
M
G
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
K
A
 
R
L
 
L
A
 
P
D
 
D
-
 
L
V
 
I
G
 
K
A
 
E
I
 
V
V
 
L
T
 
S
S
 
M
G
 
D
R
 
D
K
 
E
L
 
I
Q
 
Q
G
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
T
A
 
E
I
 
L
-
 
Y
-
 
H
-
 
Q
-
 
K
-
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
I
-
 
M
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
Y
-
 
H
-
 
Y
-
 
A
-
 
T
-
 
C
-
 
L
-
x
E
-
 
G
A
 
A
L
 
L
G
x
K
L
 
I
T
 
K
E
|
E
L
 
I
S
 
T
R
 
Y
L
 
M
P
 
H
C
 
S
F
 
E
S
 
G
L
 
I
E
 
L
G
 
A
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
R
 
K
H
|
H
G
 
G
P
 
P
M
 
L
E
 
A
M
 
L
L
 
V
G
 
D
A
 
K
S
 
L
V
 
M
G
 
P
V
 
V
V
 
I
L
 
M
F
 
I
R
 
I
A
 
M
A
 
R
D
 
D
P
 
H
T
 
T
-
 
Y
A
 
A
K
 
K
L
 
C
V
 
Q
G
 
N
A
 
A
M
 
L
A
 
Q
T
 
Q
S
 
V
A
 
V
A
 
A
E
 
R
A
 
Q
G
 
G
S
 
R
P
 
P
V
 
V
I
 
V
V
 
I
F
 
C
D
 
D
A
 
K
S
 
E
D
 
D
-
 
T
E
 
E
S
 
T
P
 
I
A
 
K
A
 
N
G
 
T
A
 
K
T
 
R
T
 
T
I
 
I
R
 
K
F
 
V
K
 
P
P
 
H
A
 
S
A
 
V
G
 
D
-
 
C
L
 
L
A
 
Q
A
 
G
I
 
I
L
 
L
A
 
S
M
 
V
L
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
Q
Q
 
-
S
 
-
L
 
-
M
 
L
I
 
L
A
 
A
F
 
F

Sites not aligning to the query:

6svmA Crystal structure of human gfat-1 in complex with glucose-6-phosphate, l-glu, and udp-galnac (see paper)
23% identity, 81% coverage: 43:318/339 of query aligns to 342:637/660 of 6svmA

query
sites
6svmA
L
 
I
K
 
Q
S
 
R
T
 
C
G
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
I
L
 
L
L
 
I
G
 
A
M
x
C
G
 
G
G
x
T
S
|
S
H
 
Y
A
 
H
V
 
A
G
 
G
R
 
V
A
 
A
V
 
T
E
 
R
P
 
Q
L
 
V
Y
 
L
R
 
E
A
 
E
L
 
L
G
 
T
I
 
E
E
 
L
A
 
P
V
 
V
A
 
M
V
 
V
P
 
E
L
 
L
S
 
A
E
 
S
Q
 
D
L
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
R
G
 
N
E
 
T
P
 
P
L
 
V
S
 
-
I
 
F
E
 
R
G
 
D
K
 
D
T
 
V
I
 
C
L
 
F
V
 
F
T
 
L
S
|
S
Q
|
Q
S
|
S
G
 
G
E
 
E
S
x
T
A
 
A
E
 
D
V
 
T
L
 
L
R
 
M
W
 
G
F
 
L
R
 
R
E
 
Y
T
 
C
D
 
K
G
 
E
G
 
R
T
 
G
S
 
A
E
 
L
T
 
T
F
 
V
G
|
G
L
 
I
T
|
T
L
 
N
E
 
T
E
 
V
D
 
G
A
 
S
F
 
S
L
 
I
A
x
S
K
x
R
A
 
E
V
x
T
P
 
D
S
x
C
L
x
G
V
|
V
G
x
H
-
 
I
S
 
N
G
 
A
G
 
G
T
 
P
E
 
E
R
 
I
A
 
G
F
 
V
A
 
A
A
x
S
T
 
T
R
 
K
S
 
A
L
 
Y
T
 
T
V
 
S
T
 
Q
F
 
F
A
 
-
L
 
V
H
 
S
L
 
L
A
 
V
V
 
M
L
 
F
A
 
A
A
 
L
L
 
M
G
 
M
A
 
C
D
 
D
P
 
D
A
 
R
D
 
I
A
 
S
L
 
M
R
 
Q
A
 
E
L
 
R
R
 
R
D
 
K
P
 
E
E
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
I
 
I
D
 
M
G
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
K
A
 
R
L
 
L
A
 
P
D
 
D
-
 
L
V
 
I
G
 
K
A
 
E
I
 
V
V
 
L
T
 
S
S
 
M
G
 
D
R
 
D
K
 
E
L
 
I
Q
 
Q
G
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
T
A
 
E
I
 
L
-
 
Y
-
 
H
-
 
Q
-
 
K
-
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
I
-
 
M
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
Y
-
 
H
-
 
Y
-
 
A
-
 
T
-
 
C
-
 
L
-
x
E
-
 
G
A
 
A
L
 
L
G
x
K
L
 
I
T
 
K
E
|
E
L
 
I
S
 
T
R
 
Y
L
 
M
P
 
H
C
 
S
F
 
E
S
 
G
L
 
I
E
 
L
G
 
A
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
R
 
K
H
|
H
G
 
G
P
 
P
M
 
L
E
 
A
M
 
L
L
 
V
G
 
D
A
 
K
S
 
L
V
 
M
G
 
P
V
 
V
V
 
I
L
 
M
F
 
I
R
 
I
A
 
M
A
 
R
D
 
D
P
 
H
T
 
T
-
 
Y
A
 
A
K
 
K
L
 
C
V
 
Q
G
 
N
A
 
A
M
 
L
A
 
Q
T
 
Q
S
 
V
A
 
V
A
 
A
E
 
R
A
 
Q
G
 
G
S
 
R
P
 
P
V
 
V
I
 
V
V
 
I
F
 
C
D
 
D
A
 
K
S
 
E
D
 
D
-
 
T
E
 
E
S
 
T
P
 
I
A
 
K
A
 
N
G
 
T
A
 
K
T
 
R
T
 
T
I
 
I
R
 
K
F
 
V
K
 
P
P
 
H
A
 
S
A
 
V
G
 
D
-
 
C
L
 
L
A
 
Q
A
 
G
I
 
I
L
 
L
A
 
S
M
 
V
L
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
Q
Q
 
-
S
 
-
L
 
-
M
 
L
I
 
L
A
 
A
F
 
F

Sites not aligning to the query:

6r4eA Crystal structure of human gfat-1 in complex with glucose-6-phosphate and l-glu (see paper)
23% identity, 81% coverage: 43:318/339 of query aligns to 345:640/663 of 6r4eA

query
sites
6r4eA
L
 
I
K
 
Q
S
 
R
T
 
C
G
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
I
L
 
L
L
 
I
G
 
A
M
 
C
G
 
G
G
x
T
S
|
S
H
 
Y
A
 
H
V
 
A
G
 
G
R
 
V
A
 
A
V
 
T
E
 
R
P
 
Q
L
 
V
Y
 
L
R
 
E
A
 
E
L
 
L
G
 
T
I
 
E
E
 
L
A
 
P
V
 
V
A
 
M
V
 
V
P
 
E
L
 
L
S
 
A
E
 
S
Q
 
D
L
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
R
G
 
N
E
 
T
P
 
P
L
 
V
S
 
-
I
 
F
E
 
R
G
 
D
K
 
D
T
 
V
I
 
C
L
 
F
V
 
F
T
 
L
S
|
S
Q
|
Q
S
|
S
G
 
G
E
 
E
S
x
T
A
 
A
E
 
D
V
 
T
L
 
L
R
 
M
W
 
G
F
 
L
R
 
R
E
 
Y
T
 
C
D
 
K
G
 
E
G
 
R
T
 
G
S
 
A
E
 
L
T
 
T
F
 
V
G
 
G
L
 
I
T
 
T
L
 
N
E
 
T
E
 
V
D
 
G
A
 
S
F
 
S
L
 
I
A
 
S
K
 
R
A
 
E
V
 
T
P
 
D
S
 
C
L
 
G
V
 
V
G
 
H
-
 
I
S
 
N
G
 
A
G
 
G
T
 
P
E
 
E
R
 
I
A
 
G
F
 
V
A
 
A
A
x
S
T
 
T
R
 
K
S
 
A
L
 
Y
T
 
T
V
 
S
T
 
Q
F
 
F
A
 
-
L
 
V
H
 
S
L
 
L
A
 
V
V
 
M
L
 
F
A
 
A
A
 
L
L
 
M
G
 
M
A
 
C
D
 
D
P
 
D
A
 
R
D
 
I
A
 
S
L
 
M
R
 
Q
A
 
E
L
 
R
R
 
R
D
 
K
P
 
E
E
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
I
 
I
D
 
M
G
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
K
A
 
R
L
 
L
A
 
P
D
 
D
-
 
L
V
 
I
G
 
K
A
 
E
I
 
V
V
 
L
T
 
S
S
 
M
G
 
D
R
 
D
K
 
E
L
 
I
Q
 
Q
G
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
T
A
 
E
I
 
L
-
 
Y
-
 
H
-
 
Q
-
 
K
-
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
I
-
 
M
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
Y
-
 
H
-
 
Y
-
 
A
-
 
T
-
 
C
-
 
L
-
x
E
-
 
G
A
 
A
L
 
L
G
x
K
L
 
I
T
 
K
E
|
E
L
 
I
S
 
T
R
 
Y
L
 
M
P
 
H
C
 
S
F
 
E
S
 
G
L
 
I
E
 
L
G
 
A
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
R
 
K
H
|
H
G
 
G
P
 
P
M
 
L
E
 
A
M
 
L
L
 
V
G
 
D
A
 
K
S
 
L
V
 
M
G
 
P
V
 
V
V
 
I
L
 
M
F
 
I
R
 
I
A
 
M
A
 
R
D
 
D
P
 
H
T
 
T
-
 
Y
A
 
A
K
 
K
L
 
C
V
 
Q
G
 
N
A
 
A
M
 
L
A
 
Q
T
 
Q
S
 
V
A
 
V
A
 
A
E
 
R
A
 
Q
G
 
G
S
 
R
P
 
P
V
 
V
I
 
V
V
 
I
F
 
C
D
 
D
A
 
K
S
 
E
D
 
D
-
 
T
E
 
E
S
 
T
P
 
I
A
 
K
A
 
N
G
 
T
A
 
K
T
 
R
T
 
T
I
 
I
R
 
K
F
 
V
K
 
P
P
 
H
A
 
S
A
 
V
G
 
D
-
 
C
L
 
L
A
 
Q
A
 
G
I
 
I
L
 
L
A
 
S
M
 
V
L
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
Q
Q
 
-
S
 
-
L
 
-
M
 
L
I
 
L
A
 
A
F
 
F

Sites not aligning to the query:

2v4mA The isomerase domain of human glutamine-fructose-6-phosphate transaminase 1 (gfpt1) in complex with fructose 6-phosphate
23% identity, 81% coverage: 43:318/339 of query aligns to 46:341/352 of 2v4mA

query
sites
2v4mA
L
 
I
K
 
Q
S
 
R
T
 
C
G
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
I
L
 
L
L
 
I
G
 
A
M
 
C
G
 
G
G
x
T
S
|
S
H
 
Y
A
 
H
V
 
A
G
 
G
R
 
V
A
 
A
V
 
T
E
 
R
P
 
Q
L
 
V
Y
 
L
R
 
E
A
 
E
L
 
L
G
 
T
I
 
E
E
 
L
A
 
P
V
 
V
A
 
M
V
 
V
P
 
E
L
 
L
S
 
A
E
 
S
Q
 
D
L
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
R
G
 
N
E
 
T
P
 
P
L
 
V
S
 
-
I
 
F
E
 
R
G
 
D
K
 
D
T
 
V
I
 
C
L
 
F
V
 
F
T
 
L
S
|
S
Q
|
Q
S
|
S
G
 
G
E
 
E
S
x
T
A
 
A
E
 
D
V
 
T
L
 
L
R
 
M
W
 
G
F
 
L
R
 
R
E
 
Y
T
 
C
D
 
K
G
 
E
G
 
R
T
 
G
S
 
A
E
 
L
T
 
T
F
 
V
G
 
G
L
 
I
T
 
T
L
 
N
E
 
T
E
 
V
D
 
G
A
 
S
F
 
S
L
 
I
A
 
S
K
 
R
A
 
E
V
 
T
P
 
D
S
 
C
L
 
G
V
 
V
G
 
H
-
 
I
S
 
N
G
 
A
G
 
G
T
 
P
E
 
E
R
 
I
A
 
G
F
 
V
A
|
A
A
x
S
T
 
T
R
 
K
S
 
A
L
 
Y
T
 
T
V
 
S
T
 
Q
F
 
F
A
 
-
L
 
V
H
 
S
L
 
L
A
 
V
V
 
M
L
 
F
A
 
A
A
 
L
L
 
M
G
 
M
A
 
C
D
 
D
P
 
D
A
 
R
D
 
I
A
 
S
L
 
M
R
 
Q
A
 
E
L
 
R
R
 
R
D
 
K
P
 
E
E
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
I
 
I
D
 
M
G
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
K
A
 
R
L
 
L
A
 
P
D
 
D
-
 
L
V
 
I
G
 
K
A
 
E
I
 
V
V
 
L
T
 
S
S
 
M
G
 
D
R
 
D
K
 
E
L
 
I
Q
 
Q
G
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
T
A
 
E
I
 
L
-
 
Y
-
 
H
-
 
Q
-
 
K
-
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
I
-
 
M
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
Y
-
 
H
-
 
Y
-
 
A
-
 
T
-
 
C
-
 
L
-
x
E
-
 
G
A
 
A
L
 
L
G
x
K
L
 
I
T
 
K
E
|
E
L
 
I
S
 
T
R
 
Y
L
 
M
P
 
H
C
 
S
F
 
E
S
 
G
L
 
I
E
 
L
G
 
A
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
R
 
K
H
|
H
G
 
G
P
 
P
M
 
L
E
 
A
M
 
L
L
 
V
G
 
D
A
 
K
S
 
L
V
 
M
G
 
P
V
 
V
V
 
I
L
 
M
F
 
I
R
 
I
A
 
M
A
 
R
D
 
D
P
 
H
T
 
T
-
 
Y
A
 
A
K
 
K
L
 
C
V
 
Q
G
 
N
A
 
A
M
 
L
A
 
Q
T
 
Q
S
 
V
A
 
V
A
 
A
E
 
R
A
 
Q
G
 
G
S
 
R
P
 
P
V
 
V
I
 
V
V
 
I
F
 
C
D
 
D
A
 
K
S
 
E
D
 
D
-
 
T
E
 
E
S
 
T
P
 
I
A
 
K
A
 
N
G
 
T
A
 
K
T
 
R
T
 
T
I
 
I
R
 
K
F
 
V
K
 
P
P
 
H
A
 
S
A
 
V
G
 
D
-
 
C
L
 
L
A
 
Q
A
 
G
I
 
I
L
 
L
A
 
S
M
 
V
L
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
Q
Q
 
-
S
 
-
L
 
-
M
 
L
I
 
L
A
 
A
F
 
F

8fdbA Crystal structure of nagb-ii phosphosugar isomerase from shewanella denitrificans os217 in complex with glucitolamine-6-phosphate at 3.06 a resolution. (see paper)
25% identity, 60% coverage: 49:250/339 of query aligns to 43:255/332 of 8fdbA

query
sites
8fdbA
L
 
V
L
 
M
L
 
I
L
 
V
G
|
G
M
x
R
G
|
G
G
x
S
S
|
S
H
x
D
A
 
H
V
 
A
G
 
G
R
 
V
A
 
F
V
 
A
E
 
K
P
x
Y
L
 
L
Y
 
F
R
 
E
-
 
I
-
 
E
-
 
A
A
 
S
L
 
I
G
 
P
I
 
T
E
 
F
A
 
A
V
 
A
A
|
A
V
x
P
P
x
S
L
 
V
S
 
A
E
 
S
Q
 
V
L
 
Y
G
 
G
E
 
K
P
 
T
L
 
L
S
 
K
I
 
L
E
 
A
G
 
G
K
 
G
T
 
L
I
 
V
L
 
I
V
 
V
T
x
I
S
|
S
Q
|
Q
S
|
S
G
 
G
E
 
R
S
 
S
A
 
P
E
 
D
V
 
I
L
 
L
R
 
A
W
 
Q
F
 
A
R
 
R
E
 
M
T
 
A
D
 
K
G
 
N
G
 
A
T
 
G
S
 
A
E
 
F
T
 
C
F
 
V
G
 
A
L
 
L
T
 
V
L
 
N
E
 
D
E
 
E
D
 
T
A
 
A
F
 
P
L
 
I
A
 
K
K
 
D
A
 
I
V
 
V
P
 
D
S
 
V
L
 
V
V
 
I
G
 
P
-
 
L
S
 
R
G
 
A
G
 
G
T
 
E
E
 
E
R
 
K
A
 
A
F
x
V
A
|
A
A
|
A
T
 
T
R
 
K
S
 
S
L
 
Y
T
 
L
V
 
A
T
 
T
F
 
L
A
 
S
L
 
A
H
 
L
L
 
L
A
 
Q
V
 
V
L
 
A
A
 
A
A
 
K
L
 
W
G
 
T
A
 
Q
D
 
N
P
 
E
A
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
N
-
 
S
-
 
L
-
 
P
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
L
 
A
R
 
V
D
 
D
P
 
A
E
 
E
A
 
P
P
 
Q
V
 
L
I
 
R
D
 
A
G
 
G
A
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
S
L
 
L
A
 
T
D
 
D
V
 
V
G
 
K
A
 
N
I
 
L
V
 
V
T
 
V
S
 
L
G
 
G
R
|
R
K
 
G
L
 
F
-
 
G
Q
x
Y
G
 
A
L
 
V
A
 
S
E
 
K
A
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
x
K
L
 
L
T
 
K
E
|
E
L
 
V
S
 
C
R
 
A
L
 
I
P
 
H
C
 
A
F
 
E
S
 
A
L
 
F
E
x
S
G
 
S
G
 
A
Q
 
E
L
 
F
R
 
L
H
 
H
G
 
G
P
 
P
M
 
V
E
 
T
M
 
L
L
 
V
G
 
E
A
 
K
S
 
K
V
 
L
G
 
S
V
 
I
V
 
L

8fdbB Crystal structure of nagb-ii phosphosugar isomerase from shewanella denitrificans os217 in complex with glucitolamine-6-phosphate at 3.06 a resolution. (see paper)
25% identity, 60% coverage: 49:250/339 of query aligns to 44:256/333 of 8fdbB

query
sites
8fdbB
L
 
V
L
 
M
L
 
I
L
 
V
G
 
G
M
x
R
G
|
G
G
x
S
S
|
S
H
 
D
A
 
H
V
 
A
G
 
G
R
 
V
A
 
F
V
 
A
E
 
K
P
x
Y
L
 
L
Y
 
F
R
 
E
-
 
I
-
 
E
-
 
A
A
 
S
L
 
I
G
 
P
I
 
T
E
 
F
A
 
A
V
 
A
A
|
A
V
x
P
P
x
S
L
 
V
S
 
A
E
 
S
Q
 
V
L
 
Y
G
 
G
E
 
K
P
 
T
L
 
L
S
 
K
I
 
L
E
 
A
G
 
G
K
 
G
T
 
L
I
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
I
S
|
S
Q
|
Q
S
|
S
G
 
G
E
 
R
S
 
S
A
 
P
E
 
D
V
 
I
L
 
L
R
 
A
W
 
Q
F
 
A
R
 
R
E
 
M
T
 
A
D
 
K
G
 
N
G
 
A
T
 
G
S
 
A
E
 
F
T
 
C
F
 
V
G
 
A
L
 
L
T
 
V
L
 
N
E
 
D
E
 
E
D
 
T
A
 
A
F
 
P
L
 
I
A
 
K
K
 
D
A
 
I
V
 
V
P
 
D
S
 
V
L
 
V
V
 
I
G
 
P
-
 
L
S
 
R
G
 
A
G
 
G
T
 
E
E
 
E
R
 
K
A
 
A
F
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
R
 
K
S
 
S
L
 
Y
T
 
L
V
 
A
T
 
T
F
 
L
A
 
S
L
 
A
H
 
L
L
 
L
A
 
Q
V
 
V
L
 
A
A
 
A
A
 
K
L
 
W
G
 
T
A
 
Q
D
 
N
P
 
E
A
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
N
-
 
S
-
 
L
-
 
P
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
L
 
A
R
 
V
D
 
D
P
 
A
E
 
E
A
 
P
P
 
Q
V
 
L
I
 
R
D
 
A
G
 
G
A
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
S
L
 
L
A
 
T
D
 
D
V
 
V
G
 
K
A
 
N
I
 
L
V
 
V
T
 
V
S
 
L
G
 
G
R
|
R
K
 
G
L
 
F
-
 
G
Q
x
Y
G
 
A
L
 
V
A
 
S
E
 
K
A
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
x
K
L
 
L
T
 
K
E
|
E
L
 
V
S
 
C
R
 
A
L
 
I
P
 
H
C
 
A
F
 
E
S
 
A
L
 
F
E
x
S
G
 
S
G
 
A
Q
 
E
L
 
F
R
 
L
H
 
H
G
 
G
P
 
P
M
 
V
E
 
T
M
 
L
L
 
V
G
 
E
A
 
K
S
 
K
V
 
L
G
 
S
V
 
I
V
 
L

8eymA Crystal structure of nagb-ii phosphosugar isomerase from shewanella denitrificans os217 in complex with glucitolamine-6-phosphate and n- acetylglucosamine-6-phosphate at 2.31 a resolution (see paper)
25% identity, 60% coverage: 49:250/339 of query aligns to 42:254/319 of 8eymA

query
sites
8eymA
L
 
V
L
 
M
L
 
I
L
 
V
G
 
G
M
x
R
G
|
G
G
x
S
S
 
S
H
x
D
A
 
H
V
 
A
G
 
G
R
 
V
A
 
F
V
 
A
E
 
K
P
x
Y
L
 
L
Y
 
F
R
 
E
-
 
I
-
 
E
-
 
A
A
 
S
L
 
I
G
 
P
I
 
T
E
 
F
A
|
A
V
x
A
A
 
A
V
x
P
P
x
S
L
 
V
S
 
A
E
 
S
Q
 
V
L
 
Y
G
 
G
E
 
K
P
 
T
L
 
L
S
 
K
I
 
L
E
 
A
G
 
G
K
 
G
T
 
L
I
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
I
S
|
S
Q
|
Q
S
 
S
G
 
G
E
 
R
S
 
S
A
 
P
E
 
D
V
 
I
L
 
L
R
 
A
W
 
Q
F
 
A
R
 
R
E
 
M
T
 
A
D
 
K
G
 
N
G
 
A
T
 
G
S
 
A
E
 
F
T
 
C
F
 
V
G
 
A
L
 
L
T
 
V
L
 
N
E
 
D
E
 
E
D
 
T
A
 
A
F
 
P
L
 
I
A
 
K
K
 
D
A
 
I
V
 
V
P
 
D
S
 
V
L
 
V
V
 
I
G
 
P
-
 
L
S
 
R
G
 
A
G
 
G
T
 
E
E
 
E
R
 
K
A
 
A
F
 
V
A
|
A
A
|
A
T
 
T
R
 
K
S
 
S
L
 
Y
T
 
L
V
 
A
T
 
T
F
 
L
A
 
S
L
 
A
H
 
L
L
 
L
A
 
Q
V
 
V
L
 
A
A
 
A
A
 
K
L
 
W
G
 
T
A
 
Q
D
 
N
P
 
E
A
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
N
-
 
S
-
 
L
-
 
P
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
L
 
A
R
 
V
D
 
D
P
 
A
E
 
E
A
 
P
P
 
Q
V
 
L
I
 
R
D
 
A
G
 
G
A
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
S
L
 
L
A
 
T
D
 
D
V
 
V
G
 
K
A
 
N
I
 
L
V
 
V
T
 
V
S
 
L
G
 
G
R
|
R
K
 
G
L
 
F
-
 
G
Q
 
Y
G
 
A
L
 
V
A
 
S
E
 
K
A
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
x
K
L
 
L
T
 
K
E
|
E
L
 
V
S
 
C
R
 
A
L
 
I
P
 
H
C
 
A
F
 
E
S
 
A
L
 
F
E
x
S
G
 
S
G
 
A
Q
x
E
L
 
F
R
 
L
H
 
H
G
 
G
P
 
P
M
 
V
E
 
T
M
 
L
L
 
V
G
 
E
A
 
K
S
 
K
V
 
L
G
 
S
V
 
I
V
 
L

Query Sequence

>SM_b21218 FitnessBrowser__Smeli:SM_b21218
MSISKDRPAGLIAIDREMARQHADAIASYEGATATAQRIAASLKSTGRLLLLGMGGSHAV
GRAVEPLYRALGIEAVAVPLSEQLGEPLSIEGKTILVTSQSGESAEVLRWFRETDGGTSE
TFGLTLEEDAFLAKAVPSLVGSGGTERAFAATRSLTVTFALHLAVLAALGADPADALRAL
RDPEAPVIDGALAALADVGAIVTSGRKLQGLAEAIALGLTELSRLPCFSLEGGQLRHGPM
EMLGASVGVVLFRAADPTAKLVGAMATSAAEAGSPVIVFDASDESPAAGATTIRFKPAAG
LAAILAMLPVAQSLMIAFADARVENAGTPVRSTKVTRSE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory