SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SM_b21508 FitnessBrowser__Smeli:SM_b21508 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4dxvA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with mg and cl ions at 1.80 a resolution
34% identity, 88% coverage: 16:282/304 of query aligns to 11:273/291 of 4dxvA

query
sites
4dxvA
T
 
T
P
 
P
A
 
M
D
 
L
M
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
G
V
 
V
S
 
D
E
 
W
D
 
K
A
 
S
L
 
L
S
 
E
R
 
K
L
 
L
L
 
V
E
 
E
R
 
W
I
 
H
R
 
I
V
 
E
A
 
Q
R
 
G
A
 
T
D
 
N
S
 
S
I
 
I
G
 
V
L
 
A
L
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
A
 
E
Y
 
A
A
 
S
F
 
T
L
 
L
S
 
S
R
 
M
G
 
E
E
 
E
R
 
H
R
 
T
R
 
Q
A
 
V
V
 
I
E
 
K
T
 
E
A
 
I
V
 
I
E
 
R
C
 
V
V
 
A
G
 
N
G
 
K
R
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
I
I
 
I
V
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
N
R
 
S
T
 
T
D
 
R
E
 
E
A
 
A
Q
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
T
R
 
K
D
 
A
A
 
A
K
 
K
E
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
V
P
x
T
V
 
P
S
 
Y
Y
|
Y
T
 
N
P
 
K
L
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
E
 
G
V
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
F
 
Y
V
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
E
A
 
A
S
 
V
D
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
C
 
I
I
 
L
Y
|
Y
N
|
N
N
x
V
P
|
P
G
 
G
T
x
R
T
|
T
K
 
G
F
 
V
V
 
D
F
 
L
S
 
S
E
 
N
E
 
D
L
 
T
I
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
A
Q
 
E
V
 
I
P
 
P
N
 
N
I
 
I
A
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
M
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
D
F
 
A
E
 
T
G
 
G
E
 
D
I
 
V
A
 
P
R
 
R
L
 
G
R
 
K
A
 
A
K
 
L
T
 
I
S
 
D
A
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
G
A
 
K
F
 
M
A
 
A
I
 
V
G
 
-
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
W
 
D
G
 
E
A
 
T
A
 
A
-
 
W
D
 
E
A
 
L
L
 
M
L
 
L
S
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
G
W
 
N
F
x
I
S
 
S
V
 
V
V
 
T
G
 
A
G
 
N
L
 
I
L
 
A
P
 
P
A
 
K
P
 
A
A
 
M
S
 
S
K
 
E
L
 
V
A
 
C
R
 
A
A
 
V
A
 
A
K
 
I
A
 
A
G
 
K
D
 
D
R
 
E
A
 
Q
E
 
Q
A
 
A
H
 
K
R
 
T
I
 
L
D
 
N
M
 
N
A
 
K
F
 
I
Q
 
A
P
 
N
L
 
L
W
 
H
A
 
N
-
 
I
L
 
L
F
 
F
K
 
C
E
 
E
F
 
S
G
 
N
S
 
P
F
 
I
R
 
P
V
 
V
M
 
K
Y
 
W
A
 
A
I
 
L
G
 
H
S
 
E
I
 
-
L
 
M
G
 
G
L
 
L
F
 
I
Q
 
D
A
 
T
L
 
G
P
 
I
P
 
R
R
 
L
P
 
P
I
 
L
L
 
T
P
 
P
L
 
L

3u8gA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with oxalic acid at 1.80 a resolution
34% identity, 88% coverage: 16:282/304 of query aligns to 11:273/291 of 3u8gA

query
sites
3u8gA
T
 
T
P
 
P
A
 
M
D
 
L
M
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
G
V
 
V
S
 
D
E
 
W
D
 
K
A
 
S
L
 
L
S
 
E
R
 
K
L
 
L
L
 
V
E
 
E
R
 
W
I
 
H
R
 
I
V
 
E
A
 
Q
R
 
G
A
 
T
D
 
N
S
 
S
I
 
I
G
 
V
L
 
A
L
 
V
G
|
G
S
x
T
T
|
T
G
 
G
A
 
E
Y
 
A
A
 
S
F
 
T
L
 
L
S
 
S
R
 
M
G
 
E
E
 
E
R
 
H
R
 
T
R
 
Q
A
 
V
V
 
I
E
 
K
T
 
E
A
 
I
V
 
I
E
 
R
C
 
V
V
 
A
G
 
N
G
 
K
R
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
I
I
 
I
V
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
N
R
 
S
T
 
T
D
 
R
E
 
E
A
 
A
Q
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
T
R
 
K
D
 
A
A
 
A
K
 
K
E
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
A
L
|
L
L
 
L
A
 
V
P
 
T
V
 
P
S
 
Y
Y
|
Y
T
 
N
P
 
K
L
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
E
 
G
V
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
F
 
Y
V
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
E
A
 
A
S
 
V
D
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
C
 
I
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
G
 
G
T
x
R
T
 
T
K
 
G
F
 
V
V
 
D
F
 
L
S
 
S
E
 
N
E
 
D
L
 
T
I
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
A
Q
 
E
V
 
I
P
 
P
N
 
N
I
 
I
A
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
M
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
D
F
 
A
E
 
T
G
 
G
E
 
D
I
 
V
A
 
P
R
 
R
L
 
G
R
 
K
A
 
A
K
 
L
T
 
I
S
 
D
A
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
G
A
 
K
F
 
M
A
 
A
I
 
V
G
 
-
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
W
 
D
G
 
E
A
 
T
A
 
A
-
 
W
D
 
E
A
 
L
L
 
M
L
 
L
S
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
G
W
 
N
F
x
I
S
 
S
V
 
V
V
 
T
G
 
A
G
 
N
L
 
I
L
 
A
P
 
P
A
 
K
P
 
A
A
 
M
S
 
S
K
 
E
L
 
V
A
 
C
R
 
A
A
 
V
A
 
A
K
 
I
A
 
A
G
 
K
D
 
D
R
 
E
A
 
Q
E
 
Q
A
 
A
H
 
K
R
 
T
I
 
L
D
 
N
M
 
N
A
 
K
F
 
I
Q
 
A
P
 
N
L
 
L
W
 
H
A
 
N
-
 
I
L
 
L
F
 
F
K
 
C
E
 
E
F
 
S
G
 
N
S
 
P
F
 
I
R
 
P
V
 
V
M
 
K
Y
 
W
A
 
A
I
 
L
G
 
H
S
 
E
I
 
-
L
 
M
G
 
G
L
 
L
F
 
I
Q
 
D
A
 
T
L
 
G
P
 
I
P
 
R
R
 
L
P
 
P
I
 
L
L
 
T
P
 
P
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3tdfA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 2-ketobutanoic acid at 1.99 a resolution
34% identity, 88% coverage: 16:282/304 of query aligns to 11:273/291 of 3tdfA

query
sites
3tdfA
T
 
T
P
 
P
A
 
M
D
 
L
M
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
G
V
 
V
S
 
D
E
 
W
D
 
K
A
 
S
L
 
L
S
 
E
R
 
K
L
 
L
L
 
V
E
 
E
R
 
W
I
 
H
R
 
I
V
 
E
A
 
Q
R
 
G
A
 
T
D
 
N
S
 
S
I
 
I
G
 
V
L
 
A
L
 
V
G
 
G
S
x
T
T
|
T
G
 
G
A
 
E
Y
 
A
A
 
S
F
 
T
L
 
L
S
 
S
R
 
M
G
 
E
E
 
E
R
 
H
R
 
T
R
 
Q
A
 
V
V
 
I
E
 
K
T
 
E
A
 
I
V
 
I
E
 
R
C
 
V
V
 
A
G
 
N
G
 
K
R
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
I
I
 
I
V
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
N
R
 
S
T
 
T
D
 
R
E
 
E
A
 
A
Q
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
T
R
 
K
D
 
A
A
 
A
K
 
K
E
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
V
P
 
T
V
 
P
S
 
Y
Y
|
Y
T
 
N
P
 
K
L
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
E
 
G
V
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
F
 
Y
V
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
E
A
 
A
S
 
V
D
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
C
 
I
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
G
 
G
T
x
R
T
 
T
K
 
G
F
 
V
V
 
D
F
 
L
S
 
S
E
 
N
E
 
D
L
 
T
I
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
A
Q
 
E
V
 
I
P
 
P
N
 
N
I
 
I
A
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
M
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
D
F
 
A
E
 
T
G
 
G
E
 
D
I
 
V
A
 
P
R
 
R
L
 
G
R
 
K
A
 
A
K
 
L
T
 
I
S
 
D
A
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
G
A
 
K
F
 
M
A
 
A
I
 
V
G
 
-
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
W
 
D
G
 
E
A
 
T
A
 
A
-
 
W
D
 
E
A
 
L
L
 
M
L
 
L
S
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
G
W
 
N
F
x
I
S
 
S
V
 
V
V
 
T
G
 
A
G
 
N
L
 
I
L
 
A
P
 
P
A
 
K
P
 
A
A
 
M
S
 
S
K
 
E
L
 
V
A
 
C
R
 
A
A
 
V
A
 
A
K
 
I
A
 
A
G
 
K
D
 
D
R
 
E
A
 
Q
E
 
Q
A
 
A
H
 
K
R
 
T
I
 
L
D
 
N
M
 
N
A
 
K
F
 
I
Q
 
A
P
 
N
L
 
L
W
 
H
A
 
N
-
 
I
L
 
L
F
 
F
K
 
C
E
 
E
F
 
S
G
 
N
S
 
P
F
 
I
R
 
P
V
 
V
M
 
K
Y
 
W
A
 
A
I
 
L
G
 
H
S
 
E
I
 
-
L
 
M
G
 
G
L
 
L
F
 
I
Q
 
D
A
 
T
L
 
G
P
 
I
P
 
R
R
 
L
P
 
P
I
 
L
L
 
T
P
 
P
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3tceA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 5-hydroxylysine at 2.6 a resolution
34% identity, 88% coverage: 16:282/304 of query aligns to 11:273/291 of 3tceA

query
sites
3tceA
T
 
T
P
 
P
A
 
M
D
 
L
M
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
G
V
 
V
S
 
D
E
 
W
D
 
K
A
 
S
L
 
L
S
 
E
R
 
K
L
 
L
L
 
V
E
 
E
R
 
W
I
 
H
R
 
I
V
 
E
A
 
Q
R
 
G
A
 
T
D
 
N
S
 
S
I
 
I
G
 
V
L
 
A
L
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
A
 
E
Y
 
A
A
x
S
F
 
T
L
|
L
S
 
S
R
 
M
G
 
E
E
 
E
R
x
H
R
 
T
R
 
Q
A
 
V
V
 
I
E
 
K
T
 
E
A
 
I
V
 
I
E
 
R
C
 
V
V
 
A
G
 
N
G
 
K
R
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
I
I
 
I
V
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
N
R
 
S
T
 
T
D
 
R
E
 
E
A
 
A
Q
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
T
R
 
K
D
 
A
A
 
A
K
 
K
E
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
V
P
 
T
V
 
P
S
x
Y
Y
|
Y
T
 
N
P
 
K
L
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
E
 
G
V
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
F
 
Y
V
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
E
A
 
A
S
 
V
D
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
C
 
I
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
G
 
G
T
x
R
T
 
T
K
 
G
F
 
V
V
 
D
F
 
L
S
 
S
E
 
N
E
 
D
L
 
T
I
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
A
Q
 
E
V
 
I
P
 
P
N
 
N
I
 
I
A
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
M
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
D
F
 
A
E
 
T
G
 
G
E
 
D
I
 
V
A
 
P
R
 
R
L
 
G
R
 
K
A
 
A
K
 
L
T
 
I
S
 
D
A
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
G
A
 
K
F
 
M
A
 
A
I
 
V
G
 
-
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
W
 
D
G
 
E
A
 
T
A
 
A
-
 
W
D
 
E
A
 
L
L
 
M
L
 
L
S
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
G
W
 
N
F
x
I
S
 
S
V
 
V
V
 
T
G
 
A
G
 
N
L
 
I
L
 
A
P
 
P
A
 
K
P
 
A
A
 
M
S
 
S
K
 
E
L
 
V
A
 
C
R
 
A
A
 
V
A
 
A
K
 
I
A
 
A
G
 
K
D
 
D
R
 
E
A
 
Q
E
 
Q
A
 
A
H
 
K
R
 
T
I
 
L
D
 
N
M
 
N
A
 
K
F
 
I
Q
 
A
P
 
N
L
 
L
W
 
H
A
 
N
-
 
I
L
 
L
F
 
F
K
 
C
E
 
E
F
 
S
G
 
N
S
 
P
F
 
I
R
 
P
V
 
V
M
 
K
Y
 
W
A
 
A
I
 
L
G
 
H
S
 
E
I
 
-
L
 
M
G
 
G
L
 
L
F
 
I
Q
 
D
A
 
T
L
 
G
P
 
I
P
 
R
R
 
L
P
 
P
I
 
L
L
 
T
P
 
P
L
 
L

3rk8A Crystal structure of the chloride inhibited dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with pyruvate at 1.8 a resolution
34% identity, 88% coverage: 16:282/304 of query aligns to 11:273/291 of 3rk8A

query
sites
3rk8A
T
 
T
P
 
P
A
 
M
D
 
L
M
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
G
V
 
V
S
 
D
E
 
W
D
 
K
A
 
S
L
 
L
S
 
E
R
 
K
L
 
L
L
 
V
E
 
E
R
 
W
I
 
H
R
 
I
V
 
E
A
 
Q
R
 
G
A
 
T
D
 
N
S
 
S
I
 
I
G
 
V
L
 
A
L
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
A
 
E
Y
 
A
A
 
S
F
 
T
L
 
L
S
 
S
R
 
M
G
 
E
E
 
E
R
 
H
R
 
T
R
 
Q
A
 
V
V
 
I
E
 
K
T
 
E
A
 
I
V
 
I
E
 
R
C
 
V
V
 
A
G
 
N
G
 
K
R
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
I
I
 
I
V
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
N
R
 
S
T
 
T
D
 
R
E
 
E
A
 
A
Q
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
T
R
 
K
D
 
A
A
 
A
K
 
K
E
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
V
P
 
T
V
 
P
S
 
Y
Y
|
Y
T
 
N
P
 
K
L
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
E
 
G
V
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
F
 
Y
V
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
E
A
 
A
S
 
V
D
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
C
 
I
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
G
 
G
T
x
R
T
 
T
K
 
G
F
 
V
V
 
D
F
 
L
S
 
S
E
 
N
E
 
D
L
 
T
I
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
A
Q
 
E
V
 
I
P
 
P
N
 
N
I
 
I
A
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
M
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
D
F
 
A
E
 
T
G
 
G
E
 
D
I
 
V
A
 
P
R
 
R
L
 
G
R
 
K
A
 
A
K
 
L
T
 
I
S
 
D
A
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
G
A
 
K
F
 
M
A
 
A
I
 
V
G
 
-
Y
 
Y
S
 
S
G
|
G
D
 
D
W
 
D
G
 
E
A
 
T
A
 
A
-
 
W
D
 
E
A
 
L
L
 
M
L
 
L
S
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
G
W
 
N
F
x
I
S
 
S
V
 
V
V
 
T
G
 
A
G
 
N
L
 
I
L
 
A
P
 
P
A
 
K
P
 
A
A
 
M
S
 
S
K
 
E
L
 
V
A
 
C
R
 
A
A
 
V
A
 
A
K
 
I
A
 
A
G
 
K
D
 
D
R
 
E
A
 
Q
E
 
Q
A
 
A
H
 
K
R
 
T
I
 
L
D
 
N
M
 
N
A
 
K
F
 
I
Q
 
A
P
 
N
L
 
L
W
 
H
A
 
N
-
 
I
L
 
L
F
|
F
K
 
C
E
 
E
F
 
S
G
 
N
S
 
P
F
 
I
R
 
P
V
 
V
M
 
K
Y
 
W
A
 
A
I
 
L
G
 
H
S
 
E
I
 
-
L
 
M
G
 
G
L
 
L
F
 
I
Q
 
D
A
 
T
L
 
G
P
 
I
P
 
R
R
 
L
P
 
P
I
 
L
L
 
T
P
 
P
L
 
L

3pueB Crystal structure of the complex of dhydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with lysine at 2.6a resolution
34% identity, 88% coverage: 16:282/304 of query aligns to 11:273/291 of 3pueB

query
sites
3pueB
T
 
T
P
 
P
A
 
M
D
 
L
M
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
G
V
 
V
S
 
D
E
 
W
D
 
K
A
 
S
L
 
L
S
 
E
R
 
K
L
 
L
L
 
V
E
 
E
R
 
W
I
 
H
R
 
I
V
 
E
A
 
Q
R
 
G
A
 
T
D
 
N
S
 
S
I
 
I
G
 
V
L
 
A
L
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
A
 
E
Y
 
A
A
 
S
F
 
T
L
 
L
S
 
S
R
 
M
G
 
E
E
 
E
R
 
H
R
 
T
R
 
Q
A
 
V
V
 
I
E
 
K
T
 
E
A
 
I
V
 
I
E
 
R
C
 
V
V
 
A
G
 
N
G
 
K
R
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
I
I
 
I
V
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
N
R
 
S
T
 
T
D
 
R
E
 
E
A
 
A
Q
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
T
R
 
K
D
 
A
A
 
A
K
 
K
E
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
V
P
 
T
V
 
P
S
 
Y
Y
|
Y
T
 
N
P
 
K
L
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
E
 
G
V
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
F
 
Y
V
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
E
A
 
A
S
 
V
D
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
C
 
I
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
G
 
G
T
x
R
T
 
T
K
 
G
F
 
V
V
 
D
F
 
L
S
 
S
E
 
N
E
 
D
L
 
T
I
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
A
Q
 
E
V
 
I
P
 
P
N
 
N
I
 
I
A
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
M
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
D
F
 
A
E
 
T
G
 
G
E
 
D
I
 
V
A
 
P
R
 
R
L
 
G
R
 
K
A
 
A
K
 
L
T
 
I
S
 
D
A
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
G
A
 
K
F
 
M
A
 
A
I
 
V
G
 
-
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
W
 
D
G
 
E
A
 
T
A
 
A
-
 
W
D
 
E
A
 
L
L
 
M
L
 
L
S
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
G
W
 
N
F
x
I
S
 
S
V
 
V
V
 
T
G
 
A
G
 
N
L
 
I
L
 
A
P
 
P
A
 
K
P
 
A
A
 
M
S
 
S
K
 
E
L
 
V
A
 
C
R
 
A
A
 
V
A
 
A
K
 
I
A
 
A
G
 
K
D
 
D
R
 
E
A
 
Q
E
 
Q
A
 
A
H
 
K
R
 
T
I
 
L
D
 
N
M
 
N
A
 
K
F
 
I
Q
 
A
P
 
N
L
 
L
W
 
H
A
 
N
-
 
I
L
 
L
F
|
F
K
 
C
E
 
E
F
 
S
G
x
N
S
 
P
F
 
I
R
 
P
V
 
V
M
 
K
Y
 
W
A
 
A
I
 
L
G
 
H
S
 
E
I
 
-
L
 
M
G
 
G
L
 
L
F
 
I
Q
 
D
A
 
T
L
 
G
P
 
I
P
 
R
R
 
L
P
 
P
I
 
L
L
 
T
P
 
P
L
 
L

3na8A Crystal structure of a putative dihydrodipicolinate synthetase from pseudomonas aeruginosa
34% identity, 76% coverage: 7:238/304 of query aligns to 3:231/291 of 3na8A

query
sites
3na8A
F
 
I
E
 
H
G
 
G
L
 
I
S
 
I
A
 
G
F
 
Y
P
 
T
P
 
I
T
 
T
P
 
P
A
 
F
D
 
A
M
 
A
D
 
D
G
 
G
K
 
G
V
 
L
S
 
D
E
 
L
D
 
P
A
 
A
L
 
L
S
 
G
R
 
R
L
 
S
L
 
I
E
 
E
R
 
R
I
 
L
R
 
I
V
 
D
A
 
G
R
 
G
A
 
V
D
 
H
S
 
A
I
 
I
G
 
A
L
 
P
L
 
L
G
 
G
S
|
S
T
 
T
G
 
G
A
 
E
Y
 
G
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
S
 
S
R
 
D
G
 
P
E
 
E
R
 
W
R
 
D
R
 
E
A
 
V
V
 
V
E
 
D
T
 
F
A
 
T
V
 
L
E
 
K
C
 
T
V
 
V
G
 
A
G
 
H
R
 
R
V
 
V
P
 
P
L
 
T
I
 
I
V
 
V
G
 
S
V
 
V
G
 
S
A
 
D
L
 
L
R
 
T
T
 
T
D
 
A
E
 
K
A
 
T
Q
 
V
A
 
R
L
 
R
A
 
A
R
 
Q
D
 
F
A
 
A
K
 
E
E
 
S
A
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
E
G
 
A
L
 
V
L
 
M
L
 
V
A
 
L
P
 
P
V
 
I
S
 
S
Y
|
Y
T
 
W
P
 
K
L
 
L
T
 
N
E
 
E
E
 
A
E
 
E
V
 
V
Y
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
Y
V
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
G
G
 
E
A
 
A
S
 
I
D
 
G
L
 
V
P
 
P
L
 
V
C
 
M
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
N
 
N
P
 
P
G
 
G
T
|
T
T
 
S
K
 
G
F
 
I
V
 
D
F
 
M
S
 
S
E
 
V
E
 
E
L
 
L
I
 
I
V
 
L
R
 
R
L
 
I
-
x
V
S
 
R
Q
 
E
V
|
V
P
x
D
N
 
N
I
x
V
A
 
T
A
 
M
V
 
V
K
|
K
M
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
E
A
 
S
D
 
T
G
 
G
D
 
D
F
 
I
E
 
Q
G
 
-
E
 
R
I
 
M
A
 
H
R
 
K
L
 
L
R
 
R
A
 
L
K
 
L
T
 
G
S
 
E
A
 
G
A
 
R
F
 
V
A
 
P
I
 
F
G
 
Y
Y
 
N
S
 
G
G
 
C
D
 
N
W
 
P
G
 
L
A
 
A
A
 
L
D
 
E
A
 
A
L
 
F
L
 
V
S
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
K
A
 
G
W
 
W
F
x
C
S
 
S
V
 
A
V
 
A
G
 
P
G
 
N
L
 
L
L
 
I
P
 
P
A
 
T
P
 
L
A
 
N
S
 
G
K
 
Q
L
 
L
A
 
Y
R
 
Q
A
 
A
A
 
V
K
 
L
A
 
D
G
 
G
D
 
D
R
 
L
A
 
E
E
 
K
A
 
A

4fhaA Structure of dihydrodipicolinate synthase from streptococcus pneumoniae,bound to pyruvate and lysine
32% identity, 93% coverage: 16:299/304 of query aligns to 16:292/307 of 4fhaA

query
sites
4fhaA
T
 
T
P
 
P
A
 
F
D
 
H
M
 
E
D
 
D
G
 
G
K
 
S
V
 
I
S
 
N
E
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
I
S
 
P
R
 
A
L
 
L
L
 
I
E
 
E
R
 
H
I
 
L
R
 
L
V
 
A
A
 
H
R
 
H
A
 
T
D
 
D
S
 
G
I
 
I
G
 
L
L
 
L
L
 
A
G
 
G
S
 
T
T
 
T
G
 
A
A
 
E
Y
x
S
A
x
P
F
 
T
L
|
L
S
 
T
R
x
H
G
 
D
E
 
E
R
x
E
R
 
L
R
 
E
A
 
L
V
 
F
E
 
A
T
 
A
A
 
V
V
 
Q
E
 
K
C
 
V
V
 
V
G
 
N
G
 
G
R
 
R
V
 
V
P
 
P
L
 
L
I
 
I
V
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
T
L
 
N
R
 
D
T
 
T
D
 
R
E
 
D
A
 
S
Q
 
I
A
 
E
L
 
F
A
 
V
R
 
K
D
 
E
A
 
V
K
 
A
E
 
E
A
 
F
G
 
G
-
 
G
-
 
F
A
 
A
D
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
A
L
 
I
A
 
V
P
 
P
V
x
Y
S
 
Y
Y
 
N
T
 
K
P
 
P
L
 
-
T
 
S
E
 
Q
E
 
E
E
 
G
V
 
M
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
V
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
D
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
I
C
 
I
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
N
 
I
P
 
P
G
 
G
T
 
R
T
 
V
K
 
V
F
 
V
V
 
E
F
 
L
S
 
T
E
 
P
E
 
E
L
 
T
I
 
M
V
 
L
R
 
R
L
 
L
S
 
A
Q
 
D
V
 
H
P
 
P
N
 
N
I
 
I
A
 
I
A
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
E
G
 
C
D
 
T
F
 
S
E
 
L
G
 
A
E
 
N
I
 
M
A
 
A
R
 
Y
L
 
L
R
 
I
A
 
E
K
 
H
T
 
K
S
 
P
A
 
E
A
 
E
F
 
F
A
 
L
I
 
I
G
 
Y
Y
 
T
S
 
G
G
 
E
D
 
D
W
 
G
G
 
D
A
 
A
A
 
F
D
 
H
A
 
A
L
 
M
L
 
N
S
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
G
W
 
V
F
 
I
S
 
S
V
 
V
V
 
A
G
 
S
G
 
H
L
 
T
L
 
N
P
 
G
A
 
D
P
 
E
A
 
M
S
 
H
K
 
E
L
 
M
A
 
F
R
 
T
A
 
A
A
 
I
K
 
A
A
 
E
G
 
S
D
 
D
R
 
M
A
 
K
E
 
K
A
 
A
H
 
A
R
 
A
I
 
I
D
 
Q
M
 
R
A
 
K
F
 
F
Q
 
I
P
 
P
L
 
K
W
 
V
A
 
N
L
 
A
F
 
L
K
 
F
E
 
S
F
 
Y
G
 
P
S
 
S
F
 
P
R
 
A
V
 
P
M
 
V
Y
 
K
A
 
A
I
 
I
G
 
L
S
 
N
I
 
Y
L
 
M
G
 
G
L
 
-
F
 
F
Q
 
E
A
 
A
L
 
G
P
 
P
P
 
T
R
 
R
P
 
-
I
 
-
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
V
P
 
P
G
 
A
D
 
P
S
 
E
V
 
E
R
 
D
V
 
V
K
 
K
Q
 
R
A
 
I
V
 
I
Q
 
K
E
 
V
L
 
V
I
 
V
D
 
D

Q07607 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; Protein MosA; EC 4.3.3.7 from Rhizobium meliloti (Ensifer meliloti) (Sinorhizobium meliloti) (see paper)
31% identity, 96% coverage: 6:296/304 of query aligns to 1:287/292 of Q07607

query
sites
Q07607
L
 
M
F
 
F
E
 
E
G
 
G
L
 
S
S
 
I
A
 
T
F
 
A
P
 
L
P
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
F
D
 
-
M
 
A
D
 
D
G
 
D
K
 
R
V
 
I
S
 
D
E
 
E
D
 
V
A
 
A
L
 
L
S
 
H
R
 
D
L
 
L
L
 
V
E
 
E
R
 
W
I
 
-
R
 
-
V
 
Q
A
 
I
R
 
E
A
 
E
D
 
G
S
 
S
I
 
F
G
 
G
L
 
L
L
 
V
-
 
P
-
 
C
G
 
G
S
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
E
Y
 
S
A
 
P
F
 
T
L
 
L
S
 
S
R
 
K
G
 
S
E
 
E
R
 
H
R
 
E
R
 
Q
A
 
V
V
 
V
E
 
E
T
 
I
A
 
T
V
 
I
E
 
K
C
 
T
V
 
A
G
 
N
G
 
G
R
 
R
V
 
V
P
 
P
L
 
V
I
 
I
V
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
A
 
S
L
 
N
R
 
S
T
 
T
D
 
A
E
 
E
A
 
A
Q
 
I
A
 
A
L
 
F
A
 
V
R
 
R
D
 
H
A
 
A
K
 
Q
E
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
V
L
 
L
L
 
I
A
 
V
P
 
S
V
 
P
S
 
Y
Y
 
Y
T
 
N
P
 
K
L
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
E
 
G
V
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
V
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
D
G
 
A
A
 
A
S
 
S
D
 
T
L
 
I
P
 
P
L
 
I
C
 
I
I
 
V
Y
 
Y
N
 
N
N
 
I
P
 
P
G
 
G
T
 
R
T
 
S
K
 
A
F
 
I
V
 
E
F
 
I
S
 
H
E
 
V
E
 
E
L
 
T
I
 
L
V
 
A
R
 
R
L
 
I
-
 
F
S
 
E
Q
 
D
V
 
C
P
 
P
N
 
N
I
 
V
A
 
K
A
 
G
V
 
V
K
|
K
M
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
D
F
 
A
E
 
T
G
 
G
E
 
N
I
 
L
A
 
L
R
 
R
-
 
P
-
 
S
-
 
L
L
 
E
R
 
R
A
 
M
K
 
A
T
 
C
S
 
G
A
 
E
A
 
D
F
 
F
A
 
N
I
 
L
G
 
L
Y
 
T
S
 
G
G
 
E
D
 
D
W
 
G
G
 
T
A
 
A
A
 
L
D
 
G
A
 
Y
L
 
M
L
 
A
S
 
H
G
 
G
A
 
G
D
 
H
A
 
G
W
 
C
F
 
I
S
 
S
V
 
V
V
 
T
G
 
A
G
 
N
L
 
V
L
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
L
A
 
C
S
 
A
K
 
D
L
 
F
A
 
Q
R
 
Q
A
 
A
A
 
C
K
 
L
A
 
N
G
 
G
D
 
D
R
 
F
A
 
A
E
 
A
A
 
A
H
 
L
R
 
K
I
 
L
D
 
Q
M
 
D
A
 
R
F
 
L
Q
 
M
P
 
P
L
 
L
W
 
H
-
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
F
K
 
L
E
 
E
F
 
T
G
 
N
S
 
P
F
 
A
R
 
G
V
 
A
M
 
K
Y
 
Y
A
 
A
I
 
L
G
 
Q
S
 
R
I
 
-
L
 
L
G
 
G
L
 
R
F
 
M
Q
 
R
A
 
G
L
 
D
P
 
L
P
 
R
R
 
L
P
 
P
I
 
L
L
 
V
P
 
T
L
 
I
G
 
S
P
 
P
G
 
S
D
 
F
S
 
Q
V
 
E
R
 
E
V
 
I
K
 
D
Q
 
D
A
 
A
V
 
M
Q
 
R
E
 
H

7kg2A Dihydrodipicolinate synthase (dhdps) from c.Jejuni, h59k mutant with pyruvate bound in the active site and l-histidine bound at the allosteric site
34% identity, 86% coverage: 21:282/304 of query aligns to 17:273/296 of 7kg2A

query
sites
7kg2A
D
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
V
S
 
D
E
 
E
D
 
Q
A
 
S
L
 
Y
S
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
I
E
 
K
R
 
R
I
 
Q
R
 
I
V
 
E
A
 
N
R
 
G
A
 
I
D
 
D
S
 
A
I
 
V
G
 
V
L
 
P
L
 
V
G
 
G
S
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
E
Y
x
S
A
|
A
F
 
T
L
|
L
S
 
T
R
 
H
G
 
E
E
 
E
R
x
K
R
 
R
R
 
T
A
 
C
V
 
I
E
 
E
T
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
E
-
 
T
C
 
C
V
 
K
G
 
G
G
 
T
R
 
K
V
 
V
P
 
K
L
 
V
I
 
L
V
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
A
 
S
L
x
N
R
 
A
T
 
T
D
 
H
E
|
E
A
 
A
Q
 
V
A
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
K
D
 
F
A
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
L
L
 
S
A
 
V
P
 
A
V
 
P
S
x
Y
Y
 
Y
T
 
N
P
 
K
L
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
Q
E
 
G
V
 
L
Y
 
Y
Q
 
E
H
 
H
F
 
Y
V
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
Q
A
 
S
S
 
V
D
 
D
L
 
I
P
 
P
L
 
V
C
 
L
I
 
L
Y
 
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
R
T
 
T
K
 
G
F
 
C
V
 
E
F
 
I
S
 
S
E
 
T
E
 
D
L
 
T
I
 
I
V
 
I
R
 
K
L
 
L
-
 
F
S
 
R
Q
 
D
V
 
C
P
 
E
N
 
N
I
 
I
A
 
Y
A
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
E
A
 
A
D
 
S
G
 
G
D
 
N
F
 
I
E
 
D
G
 
-
E
 
K
I
 
C
A
 
V
R
 
D
L
 
L
R
 
L
A
 
A
K
 
H
T
 
E
S
 
P
A
 
R
A
 
M
F
 
M
A
 
L
I
 
I
G
 
-
Y
 
-
S
 
S
G
 
G
D
 
E
W
 
D
G
 
A
A
 
I
A
 
N
D
 
Y
A
 
P
L
 
I
L
 
L
S
 
S
-
 
N
G
 
G
A
 
G
D
 
K
A
 
G
W
 
V
F
 
I
S
 
S
V
 
V
V
 
T
G
 
S
G
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
D
P
 
M
A
 
I
S
 
S
K
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
H
A
 
F
A
 
A
K
 
L
A
 
D
G
 
E
D
 
N
R
 
Y
A
 
K
E
 
E
A
 
A
H
 
K
R
 
K
I
 
I
-
 
N
D
 
D
M
 
E
A
 
L
F
 
Y
Q
 
N
P
 
I
L
 
N
W
 
K
A
 
I
L
 
L
F
 
F
K
 
C
E
 
E
F
 
S
G
 
N
S
 
P
F
 
I
R
 
P
V
 
I
M
 
K
Y
 
T
A
 
A
I
 
M
G
 
-
S
 
Y
I
 
L
L
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
I
Q
 
E
A
 
S
L
 
L
P
 
E
P
 
F
R
 
R
P
 
-
I
 
-
L
 
L
P
 
P
L
 
L

7kkdB Dihydrodipicolinate synthase (dhdps) from c.Jejuni, n84a mutant with pyruvate bound in the active site and r,r-bislysine bound at the allosteric site
33% identity, 86% coverage: 21:282/304 of query aligns to 27:283/306 of 7kkdB

query
sites
7kkdB
D
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
V
S
 
D
E
 
E
D
 
Q
A
 
S
L
 
Y
S
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
I
E
 
K
R
 
R
I
 
Q
R
 
I
V
 
E
A
 
N
R
 
G
A
 
I
D
 
D
S
 
A
I
 
V
G
 
V
L
 
P
L
 
V
G
 
G
S
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
E
Y
x
S
A
 
A
F
 
T
L
|
L
S
 
T
R
 
H
G
 
E
E
 
E
R
x
H
R
 
R
R
 
T
A
 
C
V
 
I
E
 
E
T
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
E
-
 
T
C
 
C
V
 
K
G
 
G
G
 
T
R
 
K
V
 
V
P
 
K
L
 
V
I
 
L
V
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
A
 
S
L
 
A
R
 
A
T
 
T
D
 
H
E
|
E
A
 
A
Q
 
V
A
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
K
D
 
F
A
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
L
L
 
S
A
 
V
P
 
A
V
 
P
S
x
Y
Y
 
Y
T
 
N
P
 
K
L
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
Q
E
 
G
V
 
L
Y
 
Y
Q
 
E
H
 
H
F
 
Y
V
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
Q
A
 
S
S
 
V
D
 
D
L
 
I
P
 
P
L
 
V
C
 
L
I
 
L
Y
 
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
R
T
 
T
K
 
G
F
 
C
V
 
E
F
 
I
S
 
S
E
 
T
E
 
D
L
 
T
I
 
I
V
 
I
R
 
K
L
 
L
-
 
F
S
 
R
Q
 
D
V
 
C
P
 
E
N
 
N
I
 
I
A
 
Y
A
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
E
A
 
A
D
 
S
G
 
G
D
 
N
F
 
I
E
 
D
G
 
K
E
 
C
I
 
V
A
 
D
R
 
L
L
 
L
R
 
A
A
 
H
K
 
E
-
 
P
-
 
R
-
 
M
-
 
M
-
 
L
T
 
I
S
 
S
A
 
G
A
 
E
F
 
D
A
 
A
I
 
I
G
 
N
Y
 
Y
S
 
P
G
 
-
D
 
-
W
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
I
L
 
L
L
 
S
S
 
N
G
 
G
A
 
G
D
 
K
A
 
G
W
 
V
F
 
I
S
 
S
V
 
V
V
 
T
G
 
S
G
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
D
P
 
M
A
 
I
S
 
S
K
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
H
A
 
F
A
 
A
K
 
L
A
 
D
G
 
E
D
 
N
R
 
Y
A
 
K
E
 
E
A
 
A
H
 
K
R
 
K
I
 
I
-
 
N
D
 
D
M
 
E
A
 
L
F
 
Y
Q
 
N
P
 
I
L
 
N
W
 
K
A
 
I
L
 
L
F
 
F
K
 
C
E
 
E
F
 
S
G
 
N
S
 
P
F
 
I
R
 
P
V
 
I
M
 
K
Y
 
T
A
 
A
I
 
M
G
 
-
S
 
Y
I
 
L
L
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
I
Q
 
E
A
 
S
L
 
L
P
 
E
P
 
F
R
 
R
P
 
-
I
 
-
L
 
L
P
 
P
L
 
L

4m19A Dihydrodipicolinate synthase from c. Jejuni with pyruvate bound to the active site and lysine bound to allosteric site (see paper)
34% identity, 86% coverage: 21:282/304 of query aligns to 17:273/296 of 4m19A

query
sites
4m19A
D
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
V
S
 
D
E
 
E
D
 
Q
A
 
S
L
 
Y
S
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
I
E
 
K
R
 
R
I
 
Q
R
 
I
V
 
E
A
 
N
R
 
G
A
 
I
D
 
D
S
 
A
I
 
V
G
 
V
L
 
P
L
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
A
 
E
Y
x
S
A
|
A
F
 
T
L
|
L
S
 
T
R
x
H
G
 
E
E
 
E
R
x
H
R
 
R
R
 
T
A
 
C
V
 
I
E
 
E
T
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
E
-
 
T
C
 
C
V
 
K
G
 
G
G
 
T
R
 
K
V
 
V
P
 
K
L
 
V
I
 
L
V
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
A
 
S
L
x
N
R
 
A
T
 
T
D
 
H
E
|
E
A
 
A
Q
 
V
A
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
K
D
 
F
A
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
L
L
 
S
A
 
V
P
 
A
V
 
P
S
x
Y
Y
|
Y
T
 
N
P
 
K
L
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
Q
E
 
G
V
 
L
Y
 
Y
Q
 
E
H
 
H
F
 
Y
V
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
Q
A
 
S
S
 
V
D
 
D
L
 
I
P
 
P
L
 
V
C
 
L
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
G
 
G
T
x
R
T
 
T
K
 
G
F
 
C
V
 
E
F
 
I
S
 
S
E
 
T
E
 
D
L
 
T
I
 
I
V
 
I
R
 
K
L
 
L
-
 
F
S
 
R
Q
 
D
V
 
C
P
 
E
N
 
N
I
 
I
A
 
Y
A
 
G
V
 
V
K
|
K
M
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
E
A
 
A
D
 
S
G
 
G
D
 
N
F
 
I
E
 
D
G
 
-
E
 
K
I
 
C
A
 
V
R
 
D
L
 
L
R
 
L
A
 
A
K
 
H
T
 
E
S
 
P
A
 
R
A
 
M
F
 
M
A
 
L
I
 
I
G
 
-
Y
 
-
S
 
S
G
 
G
D
 
E
W
 
D
G
 
A
A
 
I
A
 
N
D
 
Y
A
 
P
L
 
I
L
 
L
S
 
S
-
 
N
G
 
G
A
 
G
D
 
K
A
 
G
W
 
V
F
x
I
S
 
S
V
 
V
V
 
T
G
 
S
G
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
D
P
 
M
A
 
I
S
 
S
K
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
H
A
 
F
A
 
A
K
 
L
A
 
D
G
 
E
D
 
N
R
 
Y
A
 
K
E
 
E
A
 
A
H
 
K
R
 
K
I
 
I
-
 
N
D
 
D
M
 
E
A
 
L
F
 
Y
Q
 
N
P
 
I
L
 
N
W
 
K
A
 
I
L
 
L
F
 
F
K
 
C
E
 
E
F
 
S
G
 
N
S
 
P
F
 
I
R
 
P
V
 
I
M
 
K
Y
 
T
A
 
A
I
 
M
G
 
-
S
 
Y
I
 
L
L
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
I
Q
 
E
A
 
S
L
 
L
P
 
E
P
 
F
R
 
R
P
 
-
I
 
-
L
 
L
P
 
P
L
 
L

6u01B Dihydrodipicolinate synthase (dhdps) from c.Jejuni, n84d mutant with pyruvate bound in the active site (see paper)
34% identity, 86% coverage: 21:282/304 of query aligns to 17:273/296 of 6u01B

query
sites
6u01B
D
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
V
S
 
D
E
 
E
D
 
Q
A
 
S
L
 
Y
S
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
I
E
 
K
R
 
R
I
 
Q
R
 
I
V
 
E
A
 
N
R
 
G
A
 
I
D
 
D
S
 
A
I
 
V
G
 
V
L
 
P
L
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
A
 
E
Y
 
S
A
 
A
F
 
T
L
 
L
S
 
T
R
 
H
G
 
E
E
 
E
R
 
H
R
 
R
R
 
T
A
 
C
V
 
I
E
 
E
T
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
E
-
 
T
C
 
C
V
 
K
G
 
G
G
 
T
R
 
K
V
 
V
P
 
K
L
 
V
I
 
L
V
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
A
 
S
L
 
D
R
 
A
T
 
T
D
 
H
E
 
E
A
 
A
Q
 
V
A
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
K
D
 
F
A
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
L
L
 
S
A
 
V
P
 
A
V
 
P
S
 
Y
Y
|
Y
T
 
N
P
 
K
L
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
Q
E
 
G
V
 
L
Y
 
Y
Q
 
E
H
 
H
F
 
Y
V
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
Q
A
 
S
S
 
V
D
 
D
L
 
I
P
 
P
L
 
V
C
 
L
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
G
 
G
T
x
R
T
 
T
K
 
G
F
 
C
V
 
E
F
 
I
S
 
S
E
 
T
E
 
D
L
 
T
I
 
I
V
 
I
R
 
K
L
 
L
-
 
F
S
 
R
Q
 
D
V
 
C
P
 
E
N
 
N
I
 
I
A
 
Y
A
 
G
V
 
V
K
|
K
M
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
E
A
 
A
D
 
S
G
 
G
D
 
N
F
 
I
E
 
D
G
 
-
E
 
K
I
 
C
A
 
V
R
 
D
L
 
L
R
 
L
A
 
A
K
 
H
T
 
E
S
 
P
A
 
R
A
 
M
F
 
M
A
 
L
I
 
I
G
 
-
Y
 
-
S
|
S
G
 
G
D
x
E
W
x
D
G
 
A
A
 
I
A
x
N
D
 
Y
A
 
P
L
 
I
L
 
L
S
 
S
-
 
N
G
 
G
A
 
G
D
 
K
A
 
G
W
 
V
F
x
I
S
 
S
V
 
V
V
 
T
G
 
S
G
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
D
P
 
M
A
 
I
S
 
S
K
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
H
A
 
F
A
 
A
K
 
L
A
 
D
G
 
E
D
 
N
R
 
Y
A
 
K
E
 
E
A
 
A
H
 
K
R
 
K
I
 
I
-
 
N
D
 
D
M
 
E
A
 
L
F
 
Y
Q
 
N
P
 
I
L
 
N
W
 
K
A
 
I
L
 
L
F
 
F
K
 
C
E
 
E
F
 
S
G
 
N
S
 
P
F
 
I
R
 
P
V
 
I
M
 
K
Y
 
T
A
 
A
I
 
M
G
 
-
S
 
Y
I
 
L
L
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
I
Q
 
E
A
 
S
L
 
L
P
 
E
P
 
F
R
 
R
P
 
-
I
 
-
L
 
L
P
 
P
L
 
L

3s8hA Structure of dihydrodipicolinate synthase complexed with 3- hydroxypropanoic acid(hpa)at 2.70 a resolution
35% identity, 92% coverage: 16:296/304 of query aligns to 11:287/292 of 3s8hA

query
sites
3s8hA
T
 
T
P
 
P
A
 
F
D
 
D
M
 
A
D
 
Q
G
 
G
K
 
R
V
 
L
S
 
D
E
 
W
D
 
D
A
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
K
L
 
L
L
 
V
E
 
D
R
 
F
I
 
H
R
 
L
V
 
Q
A
 
D
R
 
G
A
 
T
D
 
N
S
 
A
I
 
I
G
x
V
L
 
A
L
 
V
G
|
G
S
x
T
T
|
T
G
|
G
A
 
E
Y
 
S
A
 
A
F
 
T
L
 
L
S
 
D
R
 
V
G
 
E
E
 
E
R
 
H
R
 
I
R
 
Q
A
 
V
V
 
V
E
 
R
T
 
R
A
 
V
V
 
V
E
 
D
C
 
Q
V
 
V
G
 
K
G
 
G
R
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
V
I
 
I
V
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
N
R
 
S
T
 
T
D
 
R
E
 
E
A
 
A
Q
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
E
D
 
A
A
 
A
K
 
K
E
 
S
A
 
G
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
C
L
 
L
L
 
L
A
 
V
P
 
T
V
 
P
S
 
Y
Y
|
Y
T
 
N
P
 
K
L
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
E
 
G
V
 
M
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
V
 
R
A
 
H
V
 
I
A
 
A
G
 
E
A
 
A
S
 
V
D
 
A
L
 
I
P
 
P
L
 
Q
C
 
I
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
G
 
G
T
x
R
T
 
T
K
 
S
F
 
C
V
 
D
F
 
M
S
 
L
E
 
P
E
 
E
L
 
T
I
 
V
V
 
E
R
 
R
L
 
L
S
 
S
Q
 
K
V
 
V
P
 
P
N
 
N
I
 
I
A
 
I
A
 
G
V
 
I
K
|
K
M
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
E
A
 
A
D
 
T
G
 
G
D
 
D
F
 
L
E
 
Q
G
 
-
E
 
R
I
 
A
A
 
K
R
 
E
L
 
V
R
 
I
A
 
E
K
 
R
T
 
V
S
 
G
A
 
K
A
 
D
F
 
F
A
 
L
I
 
V
G
 
-
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
W
 
D
G
 
A
A
 
T
A
 
A
-
 
V
D
 
E
A
 
L
L
 
M
L
 
L
S
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
K
A
 
G
W
 
N
F
x
I
S
 
S
V
 
V
V
 
T
G
 
A
G
 
N
L
 
V
L
 
A
P
 
P
A
 
R
P
 
A
A
 
M
S
 
S
K
 
D
L
 
L
A
 
C
R
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
M
A
 
R
G
 
G
D
 
D
R
 
A
A
 
A
E
 
A
A
 
A
H
 
R
R
 
A
I
 
I
D
 
N
M
 
D
A
 
R
F
 
L
Q
 
M
P
 
P
L
 
L
W
 
H
-
 
K
A
 
A
L
 
L
F
 
F
K
 
I
E
 
E
F
 
S
G
 
N
S
 
P
F
 
I
R
 
P
V
 
V
M
 
K
Y
 
W
A
 
A
I
 
L
G
 
H
S
 
E
I
 
-
L
 
M
G
 
G
L
 
L
F
 
I
Q
 
P
A
 
E
L
 
G
P
 
I
P
 
R
R
 
L
P
 
P
I
 
L
L
 
T
P
 
W
L
 
L
G
 
S
P
 
P
G
 
H
D
 
C
S
 
H
V
 
D
R
 
P
V
 
L
K
 
R
Q
 
Q
A
 
A
V
 
M
Q
 
R
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

3puoA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from pseudomonas aeruginosa(psdhdps)complexed with l-lysine at 2.65a resolution (see paper)
35% identity, 92% coverage: 16:296/304 of query aligns to 11:287/292 of 3puoA

query
sites
3puoA
T
 
T
P
 
P
A
 
F
D
 
D
M
 
A
D
 
Q
G
 
G
K
 
R
V
 
L
S
 
D
E
 
W
D
 
D
A
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
K
L
 
L
L
 
V
E
 
D
R
 
F
I
 
H
R
 
L
V
 
Q
A
 
D
R
 
G
A
 
T
D
 
N
S
 
A
I
 
I
G
 
V
L
 
A
L
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
A
 
E
Y
x
S
A
|
A
F
 
T
L
|
L
S
x
D
R
x
V
G
 
E
E
 
E
R
 
H
R
 
I
R
 
Q
A
 
V
V
 
V
E
 
R
T
 
R
A
 
V
V
 
V
E
 
D
C
 
Q
V
 
V
G
 
K
G
 
G
R
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
V
I
 
I
V
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
N
R
 
S
T
 
T
D
 
R
E
 
E
A
 
A
Q
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
E
D
 
A
A
 
A
K
 
K
E
 
S
A
 
G
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
C
L
 
L
L
 
L
A
 
V
P
 
T
V
 
P
S
 
Y
Y
|
Y
T
 
N
P
 
K
L
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
E
 
G
V
 
M
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
V
 
R
A
 
H
V
 
I
A
 
A
G
 
E
A
 
A
S
 
V
D
 
A
L
 
I
P
 
P
L
 
Q
C
 
I
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
G
 
G
T
x
R
T
 
T
K
 
S
F
 
C
V
 
D
F
 
M
S
 
L
E
 
P
E
 
E
L
 
T
I
 
V
V
 
E
R
 
R
L
 
L
S
 
S
Q
 
K
V
 
V
P
 
P
N
 
N
I
 
I
A
 
I
A
 
G
V
 
I
K
|
K
M
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
E
A
 
A
D
 
T
G
 
G
D
 
D
F
 
L
E
 
Q
G
 
-
E
 
R
I
 
A
A
 
K
R
 
E
L
 
V
R
 
I
A
 
E
K
 
R
T
 
V
S
 
G
A
 
K
A
 
D
F
 
F
A
 
L
I
 
V
G
 
-
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
W
 
D
G
 
A
A
 
T
A
 
A
-
 
V
D
 
E
A
 
L
L
 
M
L
 
L
S
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
K
A
 
G
W
 
N
F
x
I
S
 
S
V
 
V
V
 
T
G
 
A
G
 
N
L
 
V
L
 
A
P
 
P
A
 
R
P
 
A
A
 
M
S
 
S
K
 
D
L
 
L
A
 
C
R
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
M
A
 
R
G
 
G
D
 
D
R
 
A
A
 
A
E
 
A
A
 
A
H
 
R
R
 
A
I
 
I
D
 
N
M
 
D
A
 
R
F
 
L
Q
 
M
P
 
P
L
 
L
W
 
H
-
 
K
A
 
A
L
 
L
F
 
F
K
 
I
E
 
E
F
 
S
G
 
N
S
 
P
F
 
I
R
 
P
V
 
V
M
 
K
Y
 
W
A
 
A
I
 
L
G
 
H
S
 
E
I
 
-
L
 
M
G
 
G
L
 
L
F
 
I
Q
 
P
A
 
E
L
 
G
P
x
I
P
 
R
R
x
L
P
 
P
I
x
L
L
x
T
P
 
W
L
 
L
G
 
S
P
 
P
G
 
H
D
 
C
S
 
H
V
 
D
R
 
P
V
 
L
K
 
R
Q
 
Q
A
 
A
V
 
M
Q
 
R
E
 
Q

2atsA Dihydrodipicolinate synthase co-crystallised with (s)-lysine
30% identity, 91% coverage: 6:283/304 of query aligns to 1:278/292 of 2atsA

query
sites
2atsA
L
 
M
F
 
F
E
 
T
G
 
G
L
 
S
S
 
I
A
 
V
F
 
A
P
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
M
D
 
D
M
 
E
D
 
K
G
 
G
K
 
N
V
 
V
S
 
C
E
 
R
D
 
A
A
 
S
L
 
L
S
 
K
R
 
K
L
 
L
L
 
I
E
 
D
R
 
Y
I
 
H
R
 
V
V
 
A
A
 
S
R
 
G
A
 
T
D
 
S
S
 
A
I
 
I
G
 
V
L
 
S
L
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
A
 
E
Y
 
S
A
|
A
F
 
T
L
|
L
S
 
N
R
x
H
G
 
D
E
 
E
R
x
H
R
 
A
R
 
D
A
 
V
V
 
V
E
 
M
T
 
M
A
 
T
V
 
L
E
 
D
C
 
L
V
 
A
G
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
V
I
 
I
V
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
A
 
A
L
x
N
R
 
A
T
 
T
D
 
A
E
|
E
A
 
A
Q
 
I
A
 
S
L
 
L
A
 
T
R
 
Q
D
 
R
A
 
F
K
 
N
E
 
D
A
 
S
G
 
G
A
 
I
D
 
V
G
 
G
L
 
C
L
 
L
L
 
T
A
 
V
P
 
T
V
 
P
S
x
Y
Y
|
Y
T
 
N
P
 
R
L
 
P
T
 
S
E
 
Q
E
 
E
E
 
G
V
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
V
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
E
A
 
H
S
 
T
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
Q
C
 
I
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
G
 
S
T
x
R
T
 
T
K
 
G
F
 
C
V
 
D
F
 
L
S
 
L
E
 
P
E
 
E
L
 
T
I
 
V
V
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
A
Q
 
K
V
 
V
P
 
K
N
 
N
I
 
I
A
 
I
A
 
G
V
 
I
K
|
K
M
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
E
A
 
A
D
 
T
G
 
G
D
 
N
F
 
L
E
 
T
G
 
-
E
 
R
I
 
V
A
 
N
R
 
Q
L
 
I
R
 
K
A
 
E
K
 
L
T
 
V
S
 
S
A
 
D
A
 
D
F
 
F
A
 
V
I
 
L
G
 
L
Y
 
S
S
 
G
G
 
D
D
 
D
W
 
A
G
 
S
A
 
A
A
 
L
D
 
D
A
 
F
L
 
M
L
 
Q
S
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
H
A
 
G
W
 
V
F
x
I
S
 
S
V
 
V
V
 
T
G
 
A
G
 
N
L
 
V
L
 
A
P
 
A
A
 
R
P
 
D
A
 
M
S
 
A
K
 
Q
L
 
M
A
 
C
R
 
K
A
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
E
G
 
G
D
 
H
R
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
A
H
 
R
R
 
V
I
 
I
D
 
N
M
 
Q
A
 
R
F
 
L
Q
 
M
P
 
P
L
 
L
W
 
H
-
 
N
A
 
K
L
 
L
F
 
F
K
 
V
E
 
E
F
 
P
G
 
N
S
 
P
F
 
I
R
 
P
V
 
V
M
 
K
Y
 
W
A
 
A
I
 
C
G
 
K
S
 
E
I
 
-
L
 
L
G
 
G
L
 
L
F
 
V
Q
 
A
A
 
T
-
 
D
-
 
T
-
 
L
-
 
R
L
 
L
P
 
P
P
 
M
R
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
T
P
 
D
L
 
S
G
 
G

P0A6L2 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Escherichia coli (strain K12) (see 7 papers)
30% identity, 91% coverage: 6:283/304 of query aligns to 1:278/292 of P0A6L2

query
sites
P0A6L2
L
 
M
F
 
F
E
 
T
G
 
G
L
 
S
S
 
I
A
 
V
F
 
A
P
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
M
D
 
D
M
 
E
D
 
K
G
 
G
K
 
N
V
 
V
S
 
C
E
 
R
D
 
A
A
 
S
L
 
L
S
 
K
R
 
K
L
 
L
L
 
I
E
 
D
R
 
Y
I
 
H
R
 
V
V
 
A
A
 
S
R
 
G
A
 
T
D
 
S
S
 
A
I
 
I
G
 
V
L
 
S
L
 
V
G
 
G
S
x
T
T
|
T
G
 
G
A
 
E
Y
 
S
A
 
A
F
 
T
L
 
L
S
 
N
R
 
H
G
 
D
E
 
E
R
 
H
R
 
A
R
 
D
A
 
V
V
 
V
E
 
M
T
 
M
A
 
T
V
 
L
E
 
D
C
 
L
V
 
A
G
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
V
I
 
I
V
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
N
R
 
A
T
 
T
D
 
A
E
 
E
A
 
A
Q
 
I
A
 
S
L
 
L
A
 
T
R
 
Q
D
 
R
A
 
F
K
 
N
E
 
D
A
 
S
G
 
G
A
 
I
D
 
V
G
 
G
L
 
C
L
 
L
L
 
T
A
 
V
P
 
T
V
 
P
S
 
Y
Y
|
Y
T
 
N
P
 
R
L
 
P
T
 
S
E
 
Q
E
 
E
E
 
G
V
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
V
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
E
A
 
H
S
 
T
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
Q
C
 
I
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
G
 
S
T
x
R
T
 
T
K
 
G
F
 
C
V
 
D
F
 
L
S
 
L
E
 
P
E
 
E
L
 
T
I
 
V
V
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
A
Q
 
K
V
 
V
P
 
K
N
 
N
I
 
I
A
 
I
A
 
G
V
 
I
K
|
K
M
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
E
A
 
A
D
 
T
G
 
G
D
 
N
F
 
L
E
 
T
G
 
-
E
 
R
I
 
V
A
 
N
R
 
Q
L
 
I
R
 
K
A
 
E
K
 
L
T
 
V
S
 
S
A
 
D
A
 
D
F
 
F
A
 
V
I
 
L
G
 
L
Y
 
S
S
 
G
G
 
D
D
 
D
W
 
A
G
 
S
A
 
A
A
 
L
D
 
D
A
 
F
L
 
M
L
 
Q
S
x
L
G
 
G
A
 
G
D
 
H
A
 
G
W
 
V
F
x
I
S
 
S
V
 
V
V
 
T
G
 
A
G
 
N
L
 
V
L
 
A
P
 
A
A
 
R
P
 
D
A
 
M
S
 
A
K
 
Q
L
 
M
A
 
C
R
 
K
A
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
E
G
 
G
D
 
H
R
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
A
H
 
R
R
 
V
I
 
I
D
 
N
M
 
Q
A
 
R
F
 
L
Q
 
M
P
 
P
L
 
L
W
 
H
-
 
N
A
 
K
L
 
L
F
 
F
K
 
V
E
 
E
F
 
P
G
 
N
S
 
P
F
 
I
R
 
P
V
 
V
M
 
K
Y
 
W
A
 
A
I
 
C
G
 
K
S
 
E
I
 
-
L
 
L
G
 
G
L
 
L
F
 
V
Q
 
A
A
 
T
-
 
D
-
 
T
-
 
L
-
 
R
L
 
L
P
 
P
P
 
M
R
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
T
P
 
D
L
 
S
G
 
G

5t25A Kinetic, spectral and structural characterization of the slow binding inhibitor acetopyruvate with dihydrodipicolinate synthase from escherichia coli.
30% identity, 91% coverage: 6:283/304 of query aligns to 2:279/293 of 5t25A

query
sites
5t25A
L
 
M
F
 
F
E
 
T
G
 
G
L
 
S
S
 
I
A
 
V
F
 
A
P
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
M
D
 
D
M
 
E
D
 
K
G
 
G
K
 
N
V
 
V
S
 
C
E
 
R
D
 
A
A
 
S
L
 
L
S
 
K
R
 
K
L
 
L
L
 
I
E
 
D
R
 
Y
I
 
H
R
 
V
V
 
A
A
 
S
R
 
G
A
 
T
D
 
S
S
 
A
I
 
I
G
 
V
L
 
S
L
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
A
 
E
Y
 
S
A
|
A
F
 
T
L
|
L
S
 
N
R
x
H
G
 
D
E
 
E
R
 
H
R
 
A
R
 
D
A
 
V
V
 
V
E
 
M
T
 
M
A
 
T
V
 
L
E
 
D
C
 
L
V
 
A
G
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
V
I
 
I
V
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
A
 
A
L
x
N
R
 
A
T
 
T
D
 
A
E
|
E
A
 
A
Q
 
I
A
 
S
L
 
L
A
 
T
R
 
Q
D
 
R
A
 
F
K
 
N
E
 
D
A
 
S
G
 
G
A
 
I
D
 
V
G
 
G
L
 
C
L
 
L
L
 
T
A
 
V
P
 
T
V
 
P
S
x
Y
Y
|
Y
T
 
N
P
 
R
L
 
P
T
 
S
E
 
Q
E
 
E
E
 
G
V
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
V
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
E
A
 
H
S
 
T
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
Q
C
 
I
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
G
 
S
T
x
R
T
 
T
K
 
G
F
 
C
V
 
D
F
 
L
S
 
L
E
 
P
E
 
E
L
 
T
I
 
V
V
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
A
Q
 
K
V
 
V
P
 
K
N
 
N
I
 
I
A
 
I
A
 
G
V
 
I
K
|
K
M
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
E
A
 
A
D
 
T
G
 
G
D
 
N
F
 
L
E
 
T
G
 
-
E
 
R
I
 
V
A
 
N
R
 
Q
L
 
I
R
 
K
A
 
E
K
 
L
T
 
V
S
 
S
A
 
D
A
 
D
F
 
F
A
 
V
I
 
L
G
 
L
Y
 
S
S
 
G
G
 
D
D
 
D
W
 
A
G
 
S
A
 
A
A
 
L
D
 
D
A
 
F
L
 
M
L
 
Q
S
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
H
A
 
G
W
 
V
F
x
I
S
 
S
V
 
V
V
 
T
G
 
A
G
 
N
L
 
V
L
 
A
P
 
A
A
 
R
P
 
D
A
 
M
S
 
A
K
 
Q
L
 
M
A
 
C
R
 
K
A
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
E
G
 
G
D
 
H
R
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
A
H
 
R
R
 
V
I
 
I
D
 
N
M
 
Q
A
 
R
F
 
L
Q
 
M
P
 
P
L
 
L
W
 
H
-
 
N
A
 
K
L
 
L
F
 
F
K
 
V
E
 
E
F
 
P
G
 
N
S
 
P
F
 
I
R
 
P
V
 
V
M
 
K
Y
 
W
A
 
A
I
 
C
G
 
K
S
 
E
I
 
-
L
 
L
G
 
G
L
 
L
F
 
V
Q
 
A
A
 
T
-
 
D
-
 
T
-
 
L
-
 
R
L
 
L
P
 
P
P
 
M
R
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
T
P
 
D
L
 
S
G
 
G

3i7sA Dihydrodipicolinate synthase mutant - k161a - with the substrate pyruvate bound in the active site. (see paper)
29% identity, 91% coverage: 6:283/304 of query aligns to 1:278/292 of 3i7sA

query
sites
3i7sA
L
 
M
F
 
F
E
 
T
G
 
G
L
 
S
S
 
I
A
 
V
F
x
A
P
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
M
D
 
D
M
 
E
D
 
K
G
 
G
K
 
N
V
 
V
S
 
C
E
 
R
D
 
A
A
 
S
L
 
L
S
 
K
R
 
K
L
 
L
L
 
I
E
 
D
R
 
Y
I
 
H
R
 
V
V
 
A
A
 
S
R
 
G
A
 
T
D
 
S
S
 
A
I
 
I
G
 
V
L
 
S
L
 
V
G
 
G
S
x
T
T
|
T
G
 
G
A
 
E
Y
 
S
A
 
A
F
 
T
L
 
L
S
 
N
R
 
H
G
 
D
E
 
E
R
 
H
R
 
A
R
 
D
A
 
V
V
 
V
E
 
M
T
 
M
A
 
T
V
 
L
E
 
D
C
 
L
V
 
A
G
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
V
I
 
I
V
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
N
R
 
A
T
 
T
D
 
A
E
 
E
A
 
A
Q
 
I
A
 
S
L
 
L
A
 
T
R
 
Q
D
 
R
A
 
F
K
 
N
E
 
D
A
 
S
G
 
G
A
 
I
D
 
V
G
 
G
L
 
C
L
 
L
L
 
T
A
 
V
P
 
T
V
 
P
S
 
Y
Y
|
Y
T
 
N
P
 
R
L
 
P
T
 
S
E
 
Q
E
 
E
E
 
G
V
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
V
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
E
A
 
H
S
 
T
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
Q
C
 
I
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
N
 
V
P
 
P
G
 
S
T
x
R
T
 
T
K
 
G
F
 
C
V
 
D
F
 
L
S
 
L
E
 
P
E
 
E
L
 
T
I
 
V
V
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
A
Q
 
K
V
 
V
P
 
K
N
 
N
I
 
I
A
 
I
A
 
G
V
 
I
K
x
R
M
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
E
A
 
A
D
 
T
G
 
G
D
 
N
F
 
L
E
 
T
G
 
-
E
 
R
I
 
V
A
 
N
R
 
Q
L
 
I
R
 
K
A
 
E
K
 
L
T
 
V
S
 
S
A
 
D
A
 
D
F
 
F
A
 
V
I
 
L
G
 
L
Y
 
S
S
 
G
G
 
D
D
 
D
W
 
A
G
 
S
A
 
A
A
 
L
D
 
D
A
 
F
L
 
M
L
 
Q
S
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
H
A
 
G
W
 
V
F
x
I
S
 
S
V
 
V
V
 
T
G
 
A
G
 
N
L
 
V
L
 
A
P
 
A
A
 
R
P
 
D
A
 
M
S
 
A
K
 
Q
L
 
M
A
 
C
R
 
K
A
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
E
G
 
G
D
 
H
R
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
A
H
 
R
R
 
V
I
 
I
D
 
N
M
 
Q
A
 
R
F
 
L
Q
 
M
P
 
P
L
 
L
W
 
H
-
 
N
A
 
K
L
 
L
F
 
F
K
 
V
E
 
E
F
 
P
G
 
N
S
 
P
F
 
I
R
 
P
V
 
V
M
 
K
Y
 
W
A
 
A
I
 
C
G
 
K
S
 
E
I
 
-
L
 
L
G
 
G
L
 
L
F
 
V
Q
 
A
A
 
T
-
 
D
-
 
T
-
 
L
-
 
R
L
 
L
P
 
P
P
 
M
R
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
T
P
 
D
L
 
S
G
 
G

Q8UGL3 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Agrobacterium fabrum (strain C58 / ATCC 33970) (Agrobacterium tumefaciens (strain C58)) (see paper)
33% identity, 87% coverage: 6:269/304 of query aligns to 1:262/294 of Q8UGL3

query
sites
Q8UGL3
L
 
M
F
 
F
E
 
K
G
 
G
L
 
S
S
 
I
A
 
P
F
 
A
P
 
L
P
 
I
T
 
T
P
 
P
A
 
F
D
 
T
M
 
D
D
 
N
G
 
G
K
 
S
V
 
V
S
 
D
E
 
E
D
 
K
A
 
A
L
 
F
S
 
A
R
 
A
L
 
H
L
 
V
E
 
E
R
 
W
I
 
Q
R
 
I
V
 
A
A
 
E
R
 
G
A
 
S
D
 
N
S
 
G
I
 
L
G
 
V
L
 
P
L
 
V
G
 
G
S
 
T
T
|
T
G
 
G
A
 
E
Y
 
S
A
x
P
F
 
T
L
 
L
S
 
S
R
 
H
G
 
D
E
 
E
R
x
H
R
 
K
R
 
R
A
 
V
V
 
V
E
 
E
T
 
L
A
 
C
V
 
I
E
 
E
C
 
V
V
 
A
G
 
A
G
 
K
R
 
R
V
 
V
P
 
P
L
 
V
I
 
I
V
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
A
 
S
L
x
N
R
 
N
T
 
T
D
 
D
E
|
E
A
 
A
Q
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
L
D
 
H
A
 
A
K
 
Q
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
V
P
 
T
V
 
P
S
x
Y
Y
 
Y
T
 
N
P
 
K
L
 
P
T
 
T
E
 
Q
E
 
K
E
 
G
V
 
L
Y
 
F
Q
 
A
H
 
H
F
 
F
V
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
E
A
 
A
S
 
V
D
 
K
L
 
L
P
 
P
L
 
I
C
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
N
 
I
P
 
P
G
 
P
T
 
R
T
 
S
K
 
V
F
 
V
V
 
D
F
 
M
S
 
S
E
 
P
E
 
E
L
 
T
I
 
M
V
 
G
R
 
A
L
 
L
S
 
V
Q
 
K
V
 
A
-
 
H
P
 
K
N
 
N
I
 
I
A
 
I
A
 
G
V
 
V
K
|
K
M
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
D
F
 
A
E
 
T
G
 
G
E
 
K
I
 
L
A
 
D
R
 
R
L
 
V
-
 
S
-
 
E
-
 
Q
R
 
R
A
 
I
K
 
S
T
 
C
S
 
G
A
 
K
A
 
D
F
 
F
A
 
-
I
 
V
G
 
Q
Y
 
L
S
 
S
G
 
G
D
 
E
W
 
D
G
 
G
A
 
T
A
 
A
D
 
L
A
 
G
L
 
F
-
 
N
L
 
A
S
 
H
G
 
G
A
 
G
D
 
V
A
 
G
W
 
C
F
 
I
S
 
S
V
 
V
V
 
T
G
 
A
G
 
N
L
 
V
L
 
A
P
 
P
A
 
R
P
 
L
A
 
C
S
 
S
K
 
E
L
 
F
A
 
Q
R
 
A
A
 
A
A
 
M
K
 
L
A
 
A
G
 
G
D
 
D
R
 
Y
A
 
A
E
 
K
A
 
A
H
 
L
R
 
E
I
 
Y
D
 
Q
M
 
D
A
 
R
F
 
L
Q
 
M
P
 
P
L
 
L
W
 
H
-
 
R
A
 
A
L
 
I
F
 
F
K
 
M
E
 
E
F
 
P
G
 
G
S
 
V
F
 
C
R
 
G
V
 
T
M
 
K
Y
 
Y
A
 
A
I
 
L
G
 
S
S
 
K
I
 
T
L
 
R
G
 
G

Query Sequence

>SM_b21508 FitnessBrowser__Smeli:SM_b21508
MAPAVLFEGLSAFPPTPADMDGKVSEDALSRLLERIRVARADSIGLLGSTGAYAFLSRGE
RRRAVETAVECVGGRVPLIVGVGALRTDEAQALARDAKEAGADGLLLAPVSYTPLTEEEV
YQHFVAVAGASDLPLCIYNNPGTTKFVFSEELIVRLSQVPNIAAVKMPLPADGDFEGEIA
RLRAKTSAAFAIGYSGDWGAADALLSGADAWFSVVGGLLPAPASKLARAAKAGDRAEAHR
IDMAFQPLWALFKEFGSFRVMYAIGSILGLFQALPPRPILPLGPGDSVRVKQAVQELIDI
QECS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory