SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMa0329 FitnessBrowser__Smeli:SMa0329 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6vspA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
43% identity, 98% coverage: 4:250/253 of query aligns to 2:249/251 of 6vspA

query
sites
6vspA
R
 
R
F
 
F
D
 
D
G
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
S
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
A
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
A
N
 
R
R
 
R
L
 
F
L
 
S
E
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
I
V
 
V
M
 
V
M
 
L
S
 
A
G
x
D
R
x
W
T
x
A
E
 
K
K
 
E
R
 
A
L
 
V
S
 
D
D
 
K
V
 
V
A
 
A
S
 
A
K
 
S
M
 
L
P
 
P
A
 
K
D
 
G
R
 
R
S
 
A
G
 
M
I
 
A
F
 
V
V
 
H
A
x
I
N
x
D
V
|
V
S
 
S
S
 
D
R
 
H
P
 
V
D
 
A
C
 
V
D
 
E
A
 
K
L
 
M
V
 
M
A
 
N
A
 
E
T
 
V
V
 
A
E
 
E
R
 
K
F
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
T
 
V
V
 
L
V
 
L
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
|
G
M
x
V
N
 
H
F
 
V
V
 
A
G
 
G
T
 
S
I
 
V
Q
 
L
E
 
E
T
 
T
S
 
S
D
 
I
Q
 
D
D
 
D
W
 
W
D
 
R
E
 
R
C
 
I
I
 
A
A
 
G
S
x
V
D
 
D
L
 
I
S
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
V
Y
 
F
M
 
C
S
 
S
R
 
K
A
 
F
A
 
A
V
 
L
P
 
P
H
 
H
L
 
L
K
 
L
E
 
K
T
 
T
K
 
K
G
 
G
S
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
G
 
A
S
|
S
V
 
V
S
 
S
S
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
W
 
W
S
 
G
H
 
A
A
 
A
A
 
Y
Y
|
Y
N
 
C
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
A
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
A
 
M
A
 
A
C
 
L
D
 
D
L
 
H
G
 
G
K
 
G
F
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
A
 
I
N
 
N
T
 
S
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
x
S
L
|
L
T
x
V
V
 
K
T
|
T
G
x
N
M
|
M
V
x
T
E
 
N
A
 
G
I
 
W
M
 
P
D
 
Q
D
 
E
D
 
-
A
 
-
L
 
I
L
 
R
E
 
D
K
 
K
A
 
F
W
 
N
D
 
E
R
 
R
I
 
I
P
 
A
L
 
L
R
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
A
Q
 
E
P
 
P
-
 
E
-
 
E
-
 
V
A
 
A
S
 
A
A
 
V
V
 
M
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
A
 
S
W
 
F
I
 
I
T
 
N
G
 
G
I
 
A
V
 
N
L
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
A
T
 
T
C
 
A
T
 
S
D
 
D
G
 
G
G
 
A
P
 
P
E
 
K

6vspB Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
43% identity, 98% coverage: 4:250/253 of query aligns to 4:251/252 of 6vspB

query
sites
6vspB
R
 
R
F
 
F
D
 
D
G
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
S
x
N
G
|
G
I
 
M
G
 
G
A
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
A
N
 
R
R
 
R
L
 
F
L
 
S
E
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
I
V
 
V
M
 
V
M
 
L
S
 
A
G
x
D
R
x
W
T
 
A
E
 
K
K
 
E
R
 
A
L
 
V
S
 
D
D
 
K
V
 
V
A
 
A
S
 
A
K
 
S
M
 
L
P
 
P
A
 
K
D
 
G
R
 
R
S
 
A
G
 
M
I
 
A
F
 
V
V
 
H
A
x
I
N
x
D
V
|
V
S
 
S
S
 
D
R
 
H
P
 
V
D
 
A
C
 
V
D
 
E
A
 
K
L
 
M
V
 
M
A
 
N
A
 
E
T
 
V
V
 
A
E
 
E
R
 
K
F
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
T
 
V
V
 
L
V
 
L
N
 
N
A
 
N
A
 
A
G
|
G
M
 
V
N
 
H
F
 
V
V
 
A
G
 
G
T
 
S
I
 
V
Q
 
L
E
 
E
T
 
T
S
 
S
D
 
I
Q
 
D
D
 
D
W
 
W
D
 
R
E
 
R
C
 
I
I
 
A
A
 
G
S
 
V
D
 
D
L
 
I
S
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
V
Y
 
F
M
 
C
S
 
S
R
 
K
A
 
F
A
 
A
V
 
L
P
 
P
H
 
H
L
 
L
K
 
L
E
 
K
T
 
T
K
 
K
G
 
G
S
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
T
G
 
A
S
|
S
V
 
V
S
 
S
S
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
W
 
W
S
 
G
H
 
A
A
 
A
A
 
Y
Y
|
Y
N
 
C
A
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
A
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
A
 
M
A
 
A
C
 
L
D
 
D
L
 
H
G
 
G
K
 
G
F
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
A
 
I
N
 
N
T
 
S
V
 
V
A
 
C
P
 
P
G
 
S
L
 
L
T
 
V
V
 
K
T
 
T
G
 
N
M
 
M
V
 
T
E
 
N
A
 
G
I
 
W
M
 
P
D
 
Q
D
 
E
D
 
-
A
 
-
L
 
I
L
 
R
E
 
D
K
 
K
A
 
F
W
 
N
D
 
E
R
 
R
I
 
I
P
 
A
L
 
L
R
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
A
Q
 
E
P
 
P
-
 
E
-
 
E
-
 
V
A
 
A
S
 
A
A
 
V
V
 
M
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
A
 
S
W
 
F
I
 
I
T
 
N
G
 
G
I
 
A
V
 
N
L
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
A
T
 
T
C
 
A
T
 
S
D
 
D
G
 
G
G
 
A
P
 
P
E
 
K

H9XP47 Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; BDH; meso-2,3-BDH; (R,S)-butane-2,3-diol dehydrogenase; NAD(H)-dependent meso-2,3-BDH; SmBdh; EC 1.1.1.- from Serratia marcescens (see paper)
43% identity, 98% coverage: 4:250/253 of query aligns to 2:249/251 of H9XP47

query
sites
H9XP47
R
 
R
F
 
F
D
 
D
G
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
G
S
x
N
G
 
G
I
x
M
G
 
G
A
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
A
N
 
R
R
 
R
L
 
F
L
 
S
E
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
I
V
 
V
M
 
V
M
 
L
S
 
A
G
x
D
R
 
W
T
 
A
E
 
K
K
 
E
R
 
A
L
 
V
S
 
D
D
 
K
V
 
V
A
 
A
S
 
A
K
 
S
M
 
L
P
 
P
A
 
K
D
 
G
R
 
R
S
 
A
G
 
M
I
 
A
F
 
V
V
 
H
A
 
I
N
x
D
V
|
V
S
 
S
S
 
D
R
 
H
P
 
V
D
 
A
C
 
V
D
 
E
A
 
K
L
 
M
V
 
M
A
 
N
A
 
E
T
 
V
V
 
A
E
 
E
R
 
K
F
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
T
 
V
V
 
L
V
 
L
N
 
N
A
x
N
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
H
F
 
V
V
 
A
G
 
G
T
 
S
I
 
V
Q
 
L
E
 
E
T
 
T
S
 
S
D
 
I
Q
 
D
D
 
D
W
 
W
D
 
R
E
 
R
C
 
I
I
 
A
A
 
G
S
 
V
D
 
D
L
 
I
S
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
V
Y
 
F
M
 
C
S
 
S
R
 
K
A
 
F
A
 
A
V
 
L
P
 
P
H
 
H
L
 
L
K
 
L
E
 
K
T
 
T
K
 
K
G
 
G
S
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
T
G
 
A
S
|
S
V
|
V
S
|
S
S
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
W
 
W
S
 
G
H
 
A
A
 
A
A
 
Y
Y
|
Y
N
 
C
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
A
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
A
 
M
A
 
A
C
 
L
D
 
D
L
 
H
G
 
G
K
 
G
F
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
A
 
I
N
 
N
T
 
S
V
 
V
A
 
C
P
 
P
G
 
S
L
 
L
T
x
V
V
 
K
T
|
T
G
 
N
M
 
M
V
 
T
E
 
N
A
 
G
I
 
W
M
 
P
D
 
Q
D
 
E
D
 
-
A
 
-
L
 
I
L
x
R
E
x
D
K
|
K
A
 
F
W
 
N
D
 
E
R
 
R
I
 
I
P
 
A
L
 
L
R
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
A
Q
 
E
P
 
P
-
 
E
-
 
E
-
 
V
A
 
A
S
 
A
A
 
V
V
 
M
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
A
 
S
W
 
F
I
 
I
T
 
N
G
 
G
I
 
A
V
 
N
L
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
A
T
 
T
C
 
A
T
 
S
D
 
D
G
 
G
G
x
Q
P
 
P
E
 
K

6xewA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
43% identity, 98% coverage: 4:250/253 of query aligns to 2:249/251 of 6xewA

query
sites
6xewA
R
 
R
F
 
F
D
 
D
G
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
S
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
A
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
A
N
 
R
R
 
R
L
 
F
L
 
S
E
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
I
V
 
V
M
 
V
M
 
L
S
 
A
G
x
D
R
x
W
T
x
A
E
 
K
K
 
E
R
 
A
L
 
V
S
 
D
D
 
K
V
 
V
A
 
A
S
 
A
K
 
S
M
 
L
P
 
P
A
 
K
D
 
G
R
 
R
S
 
A
G
 
M
I
 
A
F
 
V
V
 
H
A
x
I
N
x
D
V
|
V
S
 
S
S
 
D
R
 
H
P
 
V
D
 
A
C
 
V
D
 
E
A
 
K
L
 
M
V
 
M
A
 
N
A
 
E
T
 
V
V
 
A
E
 
E
R
 
K
F
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
T
 
V
V
 
L
V
 
L
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
|
G
M
 
V
N
 
H
F
 
V
V
 
A
G
 
G
T
 
S
I
 
V
Q
 
L
E
 
E
T
 
T
S
 
S
D
 
I
Q
 
D
D
 
D
W
 
W
D
 
R
E
 
R
C
 
I
I
 
A
A
 
G
S
x
V
D
 
D
L
 
I
S
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
V
Y
 
F
M
 
C
S
 
S
R
 
K
A
 
F
A
 
A
V
 
L
P
 
P
H
 
H
L
 
L
K
 
L
E
 
K
T
 
T
K
 
K
G
 
G
S
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
G
 
A
S
|
S
V
 
V
S
|
S
S
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
W
 
W
S
 
G
H
 
A
A
 
A
A
 
Y
Y
|
Y
N
 
C
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
A
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
A
 
M
A
 
A
C
 
L
D
 
D
L
 
H
G
 
G
K
 
G
F
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
A
 
I
N
 
N
T
 
S
V
 
V
A
 
C
P
 
P
G
x
S
L
|
L
T
x
V
V
 
K
T
|
T
G
x
N
M
|
M
V
x
T
E
 
N
A
 
G
I
 
W
M
 
P
D
 
Q
D
 
E
D
 
-
A
 
-
L
 
I
L
 
R
E
 
D
K
 
K
A
 
F
W
 
N
D
 
E
R
 
R
I
 
I
P
 
A
L
 
L
R
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
A
Q
 
E
P
 
P
-
 
E
-
 
E
-
 
V
A
 
A
S
 
A
A
 
V
V
 
M
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
A
 
S
W
 
F
I
 
I
T
 
N
G
 
G
I
 
A
V
 
N
L
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
A
T
 
T
C
 
A
T
 
S
D
 
D
G
 
G
G
 
Q
P
 
P
E
 
K

1vl8B Crystal structure of gluconate 5-dehydrogenase (tm0441) from thermotoga maritima at 2.07 a resolution
40% identity, 94% coverage: 5:243/253 of query aligns to 2:250/252 of 1vl8B

query
sites
1vl8B
F
 
F
D
 
D
-
 
L
-
 
R
G
 
G
K
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
S
S
x
R
G
|
G
I
x
L
G
 
G
A
 
F
A
 
G
I
 
I
A
 
A
N
 
Q
R
 
G
L
 
L
L
 
A
E
 
E
E
 
A
G
 
G
A
 
C
S
 
S
V
 
V
M
 
V
M
 
V
S
 
A
G
x
S
R
|
R
T
 
N
E
 
L
K
 
E
R
 
E
L
 
A
S
 
S
D
 
E
V
 
A
A
 
A
S
 
Q
K
 
K
M
 
L
P
 
-
A
 
T
D
 
E
R
 
K
S
 
Y
G
 
G
I
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
M
-
 
A
F
 
F
V
 
R
A
x
C
N
x
D
V
|
V
S
 
S
S
 
N
R
 
Y
P
 
E
D
 
E
C
 
V
D
 
K
A
 
K
L
 
L
V
 
L
A
 
E
A
 
A
T
 
V
V
 
K
E
 
E
R
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
V
V
 
V
N
 
N
A
|
A
A
|
A
G
|
G
M
x
I
N
 
N
F
 
R
V
 
R
G
 
H
T
 
P
I
 
A
Q
 
E
E
 
E
T
 
F
S
 
P
D
 
L
Q
 
D
D
 
E
W
 
F
D
 
R
E
 
Q
C
 
V
I
 
I
A
 
E
S
x
V
D
 
N
L
 
L
S
 
F
G
 
G
V
 
T
F
 
Y
Y
 
Y
M
 
V
S
 
C
R
 
R
A
 
E
A
 
A
V
 
F
P
 
S
H
 
L
L
 
L
K
 
R
E
 
E
T
 
S
K
 
D
G
 
N
-
 
P
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
G
 
G
S
|
S
V
 
L
S
 
T
S
 
V
L
 
E
G
 
E
G
 
V
G
 
T
W
 
M
S
 
P
H
 
N
-
x
I
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
N
 
A
A
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
A
 
A
N
 
S
L
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
A
A
 
L
A
 
A
C
 
K
D
 
E
L
 
W
G
 
G
K
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
R
A
 
V
N
 
N
T
 
V
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
W
T
x
Y
V
 
R
T
|
T
G
 
K
M
|
M
V
x
T
E
 
E
A
 
A
I
 
V
M
 
F
D
 
S
D
 
D
D
 
P
A
 
E
L
 
K
L
 
L
E
 
D
K
 
Y
A
 
M
W
 
L
D
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
R
A
 
T
G
 
G
Q
 
V
P
 
P
A
 
E
S
 
D
-
 
L
-
 
K
-
 
G
A
 
V
V
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
E
 
E
A
 
A
A
 
K
W
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
Q
V
 
I
L
 
I
P
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
W
T
 
T

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
39% identity, 92% coverage: 8:241/253 of query aligns to 5:243/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
K
 
K
V
 
S
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
S
S
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
A
 
S
I
 
I
A
 
A
N
 
L
R
 
Q
L
 
L
L
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
S
 
N
V
 
V
M
 
A
M
 
V
S
 
N
-
 
Y
-
 
A
G
 
G
R
 
S
T
 
K
E
 
E
K
 
K
R
 
A
L
 
E
S
 
A
D
 
V
V
 
V
A
 
E
S
 
E
-
 
I
K
 
K
M
 
A
P
 
K
A
 
G
D
 
V
R
 
D
S
 
S
G
 
F
I
 
A
F
 
I
V
 
Q
A
 
A
N
 
N
V
 
V
S
 
A
S
 
D
R
 
A
P
 
D
D
 
E
C
 
V
D
 
K
A
 
A
L
 
M
V
 
I
A
 
K
A
 
E
T
 
V
V
 
V
E
 
S
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
T
 
V
V
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
 
A
G
 
G
M
 
I
N
 
T
F
 
R
V
 
D
G
 
N
T
 
L
I
 
L
Q
 
M
E
 
R
T
 
M
S
 
K
D
 
E
Q
 
Q
D
 
E
W
 
W
D
 
D
E
 
D
C
 
V
I
 
I
A
 
D
S
 
T
D
 
N
L
 
L
S
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
Y
 
N
M
 
C
S
 
I
R
 
Q
A
 
K
A
 
A
V
 
T
P
 
P
H
 
Q
-
 
M
L
 
L
K
 
R
E
 
Q
T
 
R
K
 
S
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
L
G
 
S
S
|
S
V
 
V
S
 
V
S
 
G
L
 
A
G
 
V
G
 
G
G
 
N
W
 
P
S
 
G
H
x
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
N
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
N
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
A
 
A
A
 
A
C
 
R
D
 
E
L
 
L
G
 
A
K
 
S
F
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
A
 
V
N
 
N
T
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
F
T
 
I
V
 
V
T
 
S
G
 
D
M
 
M
V
 
T
E
 
D
A
 
A
I
 
L
M
 
S
D
 
D
D
 
E
D
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
K
E
 
E
K
 
Q
A
 
M
W
 
L
D
 
T
R
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
A
R
 
R
A
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
 
D
-
 
T
-
 
D
-
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
K
A
 
A
A
 
K
W
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
I
 
Q
V
 
T
L
 
I
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
37% identity, 94% coverage: 5:241/253 of query aligns to 6:243/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
F
 
L
D
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
S
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
A
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
N
 
E
R
 
L
L
 
L
L
 
A
E
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
V
M
 
I
M
 
G
S
 
T
G
 
A
R
x
T
T
 
S
E
 
E
K
 
S
R
 
G
L
 
A
S
 
Q
D
 
A
V
 
I
A
 
S
S
 
D
K
 
Y
M
 
L
P
 
G
A
 
D
D
 
N
R
 
G
S
 
K
G
 
G
I
 
M
F
 
A
V
 
L
A
 
-
N
|
N
V
|
V
S
 
T
S
 
N
R
 
P
P
 
E
D
 
S
C
 
I
D
 
E
A
 
A
L
 
V
V
 
L
A
 
K
A
 
A
T
 
I
V
 
T
E
 
D
R
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
T
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
 
G
M
x
I
N
 
T
F
 
R
V
 
D
G
 
N
T
 
L
I
 
L
Q
 
M
E
 
R
T
 
M
S
 
K
D
 
E
Q
 
E
D
 
E
W
 
W
D
 
S
E
 
D
C
 
I
I
 
M
A
 
E
S
 
T
D
 
N
L
 
L
S
 
T
G
 
S
V
 
I
F
 
F
Y
 
R
M
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
A
A
 
V
V
 
L
P
 
R
-
 
G
H
 
M
L
 
M
K
 
K
E
 
K
T
 
R
K
 
Q
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
V
G
 
G
S
|
S
V
 
V
S
 
V
S
 
G
L
 
T
G
 
M
G
 
G
G
 
N
W
 
A
S
 
G
H
 
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
N
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
N
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
S
 
S
A
 
M
A
 
A
C
 
R
D
 
E
L
 
V
G
 
A
K
 
S
F
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
T
A
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
F
T
x
I
V
 
E
T
|
T
G
 
D
M
|
M
V
 
T
E
 
K
A
 
A
I
 
L
M
 
N
D
 
D
D
 
E
D
 
Q
A
 
R
L
 
T
L
 
A
E
 
T
K
 
L
A
 
A
W
 
-
D
 
-
R
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
R
A
 
L
G
 
G
Q
 
D
P
 
P
-
 
R
-
 
E
-
 
I
A
 
A
S
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
A
W
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
I
 
E
V
 
T
L
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
35% identity, 94% coverage: 4:241/253 of query aligns to 4:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
R
 
R
F
 
L
D
 
Q
G
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
E
I
 
A
A
 
A
N
 
R
R
 
V
L
 
F
L
 
M
E
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
V
M
 
V
M
 
I
S
 
A
G
x
D
R
x
F
T
 
N
E
 
E
K
 
A
R
 
A
L
 
G
S
 
K
D
 
E
V
 
A
A
 
V
S
 
E
K
 
A
M
 
N
P
 
P
A
 
G
D
 
V
R
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
V
F
 
F
V
 
I
-
 
R
A
x
V
N
x
D
V
|
V
S
 
S
S
 
D
R
 
R
P
 
E
D
 
S
C
 
V
D
 
H
A
 
R
L
 
L
V
 
V
A
 
E
A
 
N
T
 
V
V
 
A
E
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
T
 
I
V
 
L
V
 
I
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
|
G
M
x
I
N
 
T
F
 
R
V
x
D
G
 
S
T
 
M
I
 
L
Q
 
S
E
x
K
T
 
M
S
 
T
D
 
V
Q
 
D
D
 
Q
W
 
F
D
 
Q
E
 
Q
C
 
V
I
 
I
A
 
N
S
 
V
D
x
N
L
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
Y
 
H
M
 
C
S
 
T
R
 
Q
A
 
A
A
 
V
V
 
L
P
 
P
H
 
Y
L
 
M
K
 
A
E
 
E
T
 
Q
-
 
G
K
 
K
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
G
 
S
S
|
S
V
 
V
S
 
T
S
 
G
L
 
T
G
 
Y
G
 
G
G
x
N
W
x
V
S
 
G
H
x
Q
A
 
T
A
 
N
Y
|
Y
N
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
N
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
K
S
 
T
A
 
W
A
 
A
C
 
K
D
 
E
L
 
L
G
 
A
K
 
R
F
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
N
A
 
V
N
 
N
T
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
L
x
F
T
|
T
V
 
E
T
|
T
G
 
A
M
|
M
V
 
V
E
 
A
A
 
E
I
 
V
M
 
-
D
 
-
D
 
P
D
 
E
A
 
K
L
 
V
L
 
I
E
 
E
K
|
K
A
 
M
W
 
K
D
 
A
R
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
R
A
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
-
 
E
-
 
D
-
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
A
V
 
Y
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
E
 
E
A
 
S
A
 
D
W
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
G
I
 
H
V
 
V
L
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1zk4A Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (wildtype) from lactobacillus brevis in complex with acetophenone and NADP (see paper)
38% identity, 96% coverage: 2:244/253 of query aligns to 1:250/251 of 1zk4A

query
sites
1zk4A
S
 
S
K
 
N
R
 
R
F
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
T
S
x
L
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
N
 
T
R
 
K
L
 
F
L
 
V
E
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
V
M
 
M
M
 
I
S
x
T
G
|
G
R
|
R
T
 
H
E
 
-
K
 
-
R
 
-
L
 
-
S
 
S
D
 
D
V
 
V
A
 
G
S
 
E
K
 
K
M
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
S
-
 
V
-
 
G
P
 
T
A
 
P
D
 
D
R
 
Q
S
 
I
G
 
Q
I
 
F
F
 
F
V
 
Q
A
x
H
N
x
D
V
 
S
S
 
S
S
 
D
R
 
E
P
 
D
D
 
G
C
 
W
D
 
T
A
 
K
L
 
L
V
 
F
A
 
D
A
 
A
T
 
T
V
 
E
E
 
K
R
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
P
I
 
V
D
 
S
T
 
T
V
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
|
G
M
x
I
N
x
A
F
 
V
V
 
N
G
 
K
T
 
S
I
 
V
Q
 
E
E
 
E
T
 
T
S
 
T
D
 
T
Q
 
A
D
 
E
W
 
W
D
 
R
E
 
K
C
 
L
I
 
L
A
 
A
S
 
V
D
 
N
L
 
L
S
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
Y
 
F
M
 
G
S
 
T
R
 
R
A
 
L
A
 
G
V
 
I
P
 
Q
H
 
R
L
 
M
K
 
K
E
 
-
T
 
N
K
 
K
G
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
A
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
G
 
S
S
|
S
V
 
I
S
 
E
S
 
G
L
 
F
G
 
V
G
 
G
G
 
D
W
 
P
S
 
S
H
 
L
A
 
G
A
 
A
Y
|
Y
N
 
N
A
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
A
 
R
N
 
I
L
 
M
T
 
S
R
 
K
S
 
S
A
 
A
A
 
A
-
 
L
-
 
D
C
 
C
D
 
A
L
 
L
G
 
K
K
 
D
F
 
Y
G
 
D
V
 
V
R
 
R
A
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
A
 
H
P
 
P
G
|
G
L
x
Y
T
x
I
V
 
K
T
|
T
G
 
P
M
x
L
V
 
V
E
 
D
A
 
D
I
 
L
M
 
P
D
 
G
-
 
A
D
 
E
D
 
E
A
 
A
L
 
M
L
 
S
E
 
Q
K
 
R
A
 
T
W
 
-
D
 
-
R
 
K
I
 
T
P
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
H
A
 
I
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
-
 
N
-
 
D
-
 
I
A
 
A
S
 
Y
A
 
I
V
 
C
A
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
N
E
 
E
A
 
S
A
 
K
W
 
F
I
 
A
T
 
T
G
 
G
I
 
S
V
 
E
L
 
F
P
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
Y
T
 
T
C
 
A

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
38% identity, 94% coverage: 5:241/253 of query aligns to 3:244/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
F
 
L
D
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
I
R
 
N
L
 
L
L
 
A
E
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
N
V
 
I
M
 
F
M
 
F
S
x
N
G
x
Y
R
x
N
T
x
G
E
x
S
K
 
P
R
 
E
L
 
A
S
 
A
D
 
E
V
 
E
A
 
T
S
 
A
K
 
K
M
 
L
P
 
V
A
 
A
D
 
E
R
 
H
S
 
-
G
 
G
I
 
V
F
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
M
-
 
K
A
 
A
N
|
N
V
|
V
S
 
A
S
 
I
R
 
A
P
 
E
D
 
D
C
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
F
V
 
F
A
 
K
A
 
Q
T
 
A
V
 
I
E
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
T
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
 
G
M
x
I
N
 
T
F
 
R
V
 
D
G
 
N
T
 
L
I
 
L
Q
 
M
E
 
R
T
 
M
S
 
K
D
 
E
Q
 
D
D
 
E
W
 
W
D
 
D
E
 
D
C
 
V
I
 
I
A
 
N
S
x
I
D
 
N
L
 
L
S
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
Y
 
L
M
 
C
S
 
T
R
 
K
A
 
A
-
 
V
A
 
S
V
 
R
P
 
T
H
 
M
L
 
M
K
 
K
E
 
Q
T
 
R
K
 
A
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
G
 
A
S
|
S
V
 
V
S
 
V
S
 
G
L
 
L
G
 
I
G
 
G
G
 
N
W
 
A
S
 
G
H
x
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
N
 
V
A
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
N
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
T
A
 
T
A
 
A
C
 
R
D
 
E
L
 
L
G
 
A
K
 
P
F
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
N
A
 
V
N
 
N
T
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
L
 
F
T
x
I
V
 
T
T
|
T
G
 
D
M
 
M
V
 
T
E
 
D
A
 
K
I
 
L
M
 
-
D
 
-
D
 
D
D
 
E
A
 
K
L
 
T
L
 
K
E
 
E
K
 
A
A
 
M
W
 
L
D
 
A
R
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
A
A
 
Y
G
 
G
Q
 
T
P
 
T
-
 
E
-
 
D
-
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
A
A
 
S
A
 
K
W
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
I
 
Q
V
 
T
L
 
L
P
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

6y0sAAA R-specific alcohol dehydrogenase (see paper)
38% identity, 96% coverage: 2:244/253 of query aligns to 1:250/251 of 6y0sAAA

query
sites
6y0sAAA
S
 
S
K
 
N
R
 
R
F
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
x
T
S
 
L
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
N
 
T
R
 
K
L
 
F
L
 
V
E
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
V
M
 
M
M
 
I
S
 
T
G
|
G
R
 
R
T
x
H
E
 
-
K
 
-
R
 
-
L
 
-
S
 
S
D
 
D
V
|
V
A
 
G
S
 
E
K
 
K
M
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
S
-
 
V
-
 
G
P
 
T
A
 
P
D
 
D
R
 
Q
S
 
I
G
 
Q
I
 
F
F
 
F
V
 
Q
A
 
H
N
 
D
V
 
S
S
 
S
S
 
D
R
 
E
P
 
D
D
 
G
C
 
W
D
 
T
A
 
K
L
 
L
V
 
F
A
 
D
A
 
A
T
 
T
V
 
E
E
 
K
R
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
P
I
 
V
D
 
S
T
 
T
V
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
N
A
 
A
G
 
G
M
 
I
N
 
A
F
 
V
V
 
N
G
 
K
T
 
S
I
 
V
Q
 
E
E
 
E
T
 
T
S
 
E
D
 
T
Q
 
A
D
 
E
W
 
W
D
 
R
E
 
K
C
 
L
I
 
L
A
 
A
S
 
V
D
 
N
L
 
L
S
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
Y
 
F
M
 
G
S
 
T
R
 
R
A
 
L
A
 
G
V
 
I
P
 
Q
H
 
R
L
 
M
K
 
K
E
 
-
T
 
N
K
 
K
G
 
G
-
 
L
-
x
G
-
x
A
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
G
 
S
S
|
S
V
 
I
S
 
E
S
 
G
L
 
F
G
 
V
G
 
G
G
 
D
W
 
P
S
 
S
H
 
L
A
 
G
A
 
A
Y
|
Y
N
 
N
A
 
A
A
 
S
K
 
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
A
 
R
N
 
I
L
 
M
T
 
S
R
 
K
S
 
S
A
 
A
A
 
A
-
 
L
-
 
D
C
 
C
D
 
A
L
 
L
G
 
K
K
 
D
F
 
Y
G
x
D
V
 
V
R
|
R
A
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
A
 
H
P
 
P
G
 
G
L
 
Y
T
 
I
V
 
K
T
 
T
G
 
P
M
 
L
V
 
V
E
 
D
A
 
D
I
 
L
M
 
P
D
 
G
-
 
A
D
 
E
D
 
E
A
 
A
L
 
M
L
 
S
E
 
Q
K
 
R
A
 
T
W
 
-
D
 
-
R
 
K
I
 
T
P
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
H
A
 
I
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
-
 
N
-
 
D
-
 
I
A
 
A
S
 
Y
A
 
I
V
 
C
A
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
N
E
 
E
A
 
S
A
 
K
W
 
F
I
 
A
T
 
T
G
 
G
I
 
S
V
 
E
L
 
F
P
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
Y
T
 
T
C
 
A

5ojiA Crystal structure of the dehydrogenase/reductase sdr family member 4 (dhrs4) from caenorhabditis elegans (see paper)
38% identity, 94% coverage: 3:241/253 of query aligns to 6:255/260 of 5ojiA

query
sites
5ojiA
K
 
R
R
 
R
F
 
F
D
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
x
A
G
 
A
G
x
T
S
 
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
N
 
E
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
M
 
V
M
 
I
S
 
G
G
x
S
R
|
R
T
x
N
E
 
Q
K
 
K
R
x
N
L
 
V
S
 
D
D
 
E
-
 
A
-
 
I
-
 
E
-
 
Y
V
 
L
A
 
K
S
 
N
K
 
K
M
 
G
P
 
L
A
 
T
D
 
K
R
 
V
S
 
A
G
 
G
I
 
I
F
 
-
V
 
A
A
 
G
N
 
H
V
x
I
S
 
A
S
 
S
R
 
T
P
 
D
D
 
D
C
 
Q
D
 
K
A
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
D
A
 
F
T
 
T
V
 
L
E
 
Q
R
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
N
T
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
x
H
G
|
G
M
 
I
N
 
N
-
 
P
F
 
A
V
 
F
G
 
G
T
 
H
I
 
I
Q
 
L
E
 
E
T
 
V
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
D
 
V
W
 
W
D
 
D
E
 
K
C
 
L
I
 
F
A
 
E
S
 
V
D
 
N
L
 
V
S
 
K
G
 
A
V
 
G
F
 
F
Y
 
Q
M
 
M
S
 
T
R
 
K
A
 
L
A
 
V
V
 
H
P
 
P
H
 
H
L
 
I
-
 
A
K
 
K
E
 
E
T
 
G
K
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
F
I
x
N
G
 
A
S
|
S
V
 
Y
S
|
S
S
 
A
L
 
Y
G
 
K
G
 
S
G
 
P
W
 
P
S
 
G
H
 
I
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
N
 
G
A
 
V
A
 
T
K
|
K
G
 
T
G
 
T
V
 
L
A
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
A
 
L
A
 
A
C
 
M
D
 
G
L
 
L
G
 
A
K
 
K
F
 
D
G
 
N
V
 
I
R
 
R
A
 
V
N
 
N
T
 
G
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
|
G
L
x
V
T
x
I
V
 
K
T
|
T
G
 
K
M
|
M
V
x
S
E
 
Q
A
 
V
I
x
L
M
 
W
D
 
D
D
 
G
D
 
G
A
 
E
L
 
D
L
 
A
E
 
E
K
 
K
A
 
E
W
 
L
-
 
T
-
 
D
-
 
I
D
 
Q
R
 
E
I
 
I
P
 
A
L
 
L
R
 
G
R
 
R
A
 
L
G
 
G
Q
 
V
P
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
C
A
 
A
S
 
G
A
 
T
V
 
V
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
S
A
 
S
W
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
I
 
E
V
 
M
L
 
I
P
 
I
V
 
I
D
 
A
G
 
G
G
 
G

5ojgA Crystal structure of the dehydrogenase/reductase sdr family member 4 (dhrs4) from caenorhabditis elegans (see paper)
38% identity, 94% coverage: 3:241/253 of query aligns to 6:255/260 of 5ojgA

query
sites
5ojgA
K
 
R
R
 
R
F
 
F
D
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
x
A
G
 
A
G
x
T
S
 
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
N
 
E
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
M
 
V
M
 
I
S
 
G
G
x
S
R
|
R
T
x
N
E
 
Q
K
 
K
R
x
N
L
 
V
S
 
D
D
 
E
-
 
A
-
 
I
-
 
E
-
 
Y
V
 
L
A
 
K
S
 
N
K
 
K
M
 
G
P
 
L
A
 
T
D
 
K
R
 
V
S
 
A
G
 
G
I
 
I
F
 
-
V
 
A
A
 
G
N
 
H
V
x
I
S
 
A
S
 
S
R
 
T
P
 
D
D
 
D
C
 
Q
D
 
K
A
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
D
A
 
F
T
 
T
V
 
L
E
 
Q
R
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
N
T
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
x
H
G
|
G
M
 
I
N
 
N
-
 
P
F
 
A
V
 
F
G
 
G
T
 
H
I
 
I
Q
 
L
E
 
E
T
 
V
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
D
 
V
W
 
W
D
 
D
E
 
K
C
 
L
I
 
F
A
 
E
S
 
V
D
 
N
L
 
V
S
 
K
G
 
A
V
 
G
F
 
F
Y
 
Q
M
 
M
S
 
T
R
 
K
A
 
L
A
 
V
V
 
H
P
 
P
H
 
H
L
 
I
-
 
A
K
 
K
E
 
E
T
 
G
K
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
F
I
x
N
G
 
A
S
|
S
V
 
Y
S
 
S
S
 
A
L
 
Y
G
 
K
G
 
S
G
 
P
W
 
P
S
 
G
H
 
I
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
N
 
G
A
 
V
A
 
T
K
|
K
G
 
T
G
 
T
V
 
L
A
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
A
 
L
A
 
A
C
 
M
D
 
G
L
 
L
G
 
A
K
 
K
F
 
D
G
 
N
V
 
I
R
 
R
A
 
V
N
 
N
T
 
G
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
 
G
L
 
V
T
x
I
V
 
K
T
|
T
G
 
K
M
|
M
V
 
S
E
 
Q
A
 
V
I
 
L
M
 
W
D
 
D
D
 
G
D
 
G
A
 
E
L
 
D
L
 
A
E
 
E
K
 
K
A
 
E
W
 
L
-
 
T
-
 
D
-
 
I
D
 
Q
R
 
E
I
 
I
P
 
A
L
 
L
R
 
G
R
 
R
A
 
L
G
 
G
Q
 
V
P
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
C
A
 
A
S
 
G
A
 
T
V
 
V
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
S
A
 
S
W
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
I
 
E
V
 
M
L
 
I
P
 
I
V
 
I
D
 
A
G
 
G
G
 
G

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
39% identity, 92% coverage: 8:241/253 of query aligns to 2:236/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
K
 
K
V
 
S
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
S
I
 
I
A
 
A
N
 
L
R
 
Q
L
 
L
L
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
S
 
N
V
 
V
M
 
A
M
 
V
S
x
N
-
x
Y
-
x
A
G
|
G
R
x
S
T
 
K
E
 
E
K
 
K
R
 
A
L
 
E
S
 
A
D
 
V
V
 
V
A
 
E
S
 
E
-
 
I
K
 
K
M
 
A
P
 
K
A
 
G
D
 
V
R
 
D
S
 
S
G
 
F
I
 
A
F
 
I
V
 
Q
A
|
A
N
|
N
V
|
V
S
 
A
S
 
D
R
 
A
P
 
D
D
 
E
C
 
V
D
 
K
A
 
A
L
 
M
V
 
I
A
 
K
A
 
E
T
 
V
V
 
V
E
 
S
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
T
 
V
V
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
 
G
M
 
I
N
 
T
F
 
R
V
 
D
G
 
N
T
 
L
I
 
L
Q
 
M
E
 
R
T
 
M
S
 
K
D
 
E
Q
 
Q
D
 
E
W
 
W
D
 
D
E
 
D
C
 
V
I
 
I
A
 
D
S
x
T
D
 
N
L
 
L
S
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
Y
 
N
M
 
C
S
 
I
R
 
Q
A
 
K
A
 
A
V
 
T
P
 
P
H
 
Q
-
 
M
L
 
L
K
 
R
E
 
Q
T
 
R
K
 
S
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
L
G
 
S
S
|
S
V
 
V
S
 
V
S
 
G
L
 
A
G
 
V
G
 
G
G
 
N
W
 
P
S
 
G
H
x
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
N
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
N
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
A
 
A
A
 
A
C
 
R
D
 
E
L
 
L
G
 
A
K
 
S
F
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
A
 
V
N
 
N
T
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
F
T
 
I
V
 
V
T
 
S
G
 
D
M
 
M
V
 
T
E
 
-
A
 
-
I
 
-
M
 
-
D
 
-
D
 
-
D
 
D
A
 
E
L
 
L
L
 
K
E
 
E
K
 
Q
A
 
M
W
 
L
D
 
T
R
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
A
R
 
R
A
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
 
D
-
 
T
-
 
D
-
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
K
A
 
A
A
 
K
W
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
I
 
Q
V
 
T
L
 
I
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
36% identity, 95% coverage: 8:247/253 of query aligns to 6:248/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
K
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
G
 
A
S
|
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
A
 
K
A
 
Q
I
 
T
A
 
A
N
 
L
R
 
R
L
 
F
L
 
A
E
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
S
 
A
V
 
V
M
 
V
M
 
I
S
 
N
G
x
D
R
 
I
T
 
D
E
 
A
K
 
E
R
 
K
L
 
V
S
 
R
D
 
A
V
 
T
A
 
V
S
 
D
K
 
E
M
 
F
P
 
S
A
 
A
D
 
R
R
 
G
S
 
H
G
 
R
I
 
V
F
 
L
-
 
G
-
 
A
V
 
V
A
 
A
N
x
D
V
x
I
S
 
G
S
 
N
R
 
K
P
 
A
D
 
A
C
 
V
D
 
D
A
 
G
L
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
Q
T
 
T
V
 
I
E
 
D
R
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
T
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
 
A
G
 
G
M
 
M
N
 
E
F
 
R
V
 
A
G
 
G
T
 
A
I
 
L
Q
 
R
E
 
K
T
 
L
S
 
S
D
 
E
Q
 
A
D
 
D
W
 
W
D
 
D
E
 
V
C
 
T
I
 
I
A
 
N
S
 
V
D
 
N
L
 
L
S
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
Y
 
L
M
 
C
S
 
T
R
 
Q
A
 
A
A
 
V
V
 
H
P
 
G
H
 
H
L
 
M
K
 
V
E
 
E
T
 
N
K
 
K
-
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
G
 
A
S
 
S
V
 
R
S
 
A
S
 
W
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
A
W
 
-
S
 
G
H
 
Q
A
 
T
A
 
P
Y
|
Y
N
 
S
A
 
S
A
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
V
N
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
R
S
 
A
A
 
L
A
 
A
C
 
I
D
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
R
F
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
T
A
 
V
N
 
N
T
 
C
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
I
V
 
H
T
 
T
G
 
P
M
 
M
V
 
W
E
 
D
A
 
E
I
 
L
M
 
P
D
 
E
D
 
K
D
 
D
A
 
Q
L
 
-
L
 
-
E
 
Q
K
 
F
A
 
L
W
 
L
D
 
S
R
 
R
I
 
Q
P
 
P
L
 
T
R
 
G
R
 
K
A
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
T
V
 
L
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
E
 
D
A
 
S
A
 
G
W
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
Q
V
 
V
L
 
L
P
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
T
 
S
C
 
L
T
 
F
D
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2cfcA Structural basis for stereo selectivity in the (r)- and (s)-hydroxypropylethane thiosulfonate dehydrogenases (see paper)
38% identity, 93% coverage: 8:243/253 of query aligns to 3:248/250 of 2cfcA

query
sites
2cfcA
K
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
S
S
|
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
N
 
T
R
 
R
L
 
F
L
 
L
E
 
A
E
 
R
G
 
G
-
 
D
-
 
R
-
 
V
A
 
A
S
 
A
V
 
L
M
x
D
M
x
L
S
 
S
G
 
A
R
 
E
T
 
T
E
 
L
K
 
E
R
 
E
L
 
T
S
 
A
D
 
R
V
 
T
A
 
H
S
 
W
K
 
H
M
 
A
P
 
Y
A
 
A
D
 
D
R
 
K
S
 
V
G
 
L
I
 
R
F
 
V
V
 
R
A
|
A
N
x
D
V
|
V
S
 
A
S
 
D
R
 
E
P
 
G
D
 
D
C
 
V
D
 
N
A
 
A
L
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
T
 
T
V
 
M
E
 
E
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
A
I
 
I
D
 
D
T
 
V
V
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
|
G
M
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
N
N
 
S
F
 
E
V
 
A
G
 
G
T
 
V
I
 
L
Q
 
H
E
 
T
T
 
T
S
 
P
D
 
V
Q
 
E
D
 
Q
W
 
F
D
 
D
E
 
K
C
 
V
I
 
M
A
 
A
S
 
V
D
 
N
L
 
V
S
 
R
G
 
G
V
 
I
F
 
F
Y
 
L
M
 
G
S
 
C
R
 
R
A
 
A
A
 
V
V
 
L
P
 
P
H
 
H
-
 
M
L
 
L
K
 
L
E
 
Q
T
 
G
K
 
A
G
 
G
S
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
G
 
A
S
|
S
V
 
V
S
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
V
G
 
A
G
x
F
W
 
P
S
 
G
H
x
R
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
N
 
T
A
 
T
A
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
A
 
L
N
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
A
 
V
A
 
A
C
 
V
D
 
D
L
 
Y
G
 
A
K
 
G
F
 
S
G
 
G
V
 
I
R
 
R
A
 
C
N
 
N
T
 
A
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
L
x
M
T
x
I
V
 
E
T
|
T
G
x
P
M
|
M
V
x
T
E
 
Q
A
x
W
I
x
R
M
 
L
D
 
D
D
 
Q
D
 
P
A
 
E
L
 
L
L
 
R
E
 
D
K
 
Q
A
 
V
W
 
L
D
 
A
R
 
R
I
 
I
P
 
P
L
 
Q
R
 
K
R
 
E
A
 
I
G
 
G
-
 
T
-
 
A
-
 
A
Q
 
Q
P
 
V
A
 
A
S
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
M
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
E
E
 
D
A
 
A
A
 
T
W
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
G
I
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
A
Q
 
Y
T
 
T

Q56840 2-(R)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase; R-HPCDH; 2-[(R)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase; Aliphatic epoxide carboxylation component III; Epoxide carboxylase component III; RHPCDH1; EC 1.1.1.268 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 4 papers)
38% identity, 93% coverage: 8:243/253 of query aligns to 3:248/250 of Q56840

query
sites
Q56840
K
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
S
S
|
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
N
 
T
R
 
R
L
 
F
L
 
L
E
 
A
E
 
R
G
 
G
-
 
D
-
 
R
-
 
V
A
 
A
S
 
A
V
 
L
M
x
D
M
 
L
S
 
S
G
 
A
R
 
E
T
 
T
E
 
L
K
 
E
R
 
E
L
 
T
S
 
A
D
 
R
V
 
T
A
 
H
S
 
W
K
 
H
M
 
A
P
 
Y
A
 
A
D
 
D
R
 
K
S
 
V
G
 
L
I
 
R
F
 
V
V
 
R
A
 
A
N
x
D
V
|
V
S
 
A
S
 
D
R
 
E
P
 
G
D
 
D
C
 
V
D
 
N
A
 
A
L
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
T
 
T
V
 
M
E
 
E
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
A
I
 
I
D
 
D
T
 
V
V
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
 
A
G
 
G
M
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
N
N
 
S
F
 
E
V
 
A
G
 
G
T
 
V
I
 
L
Q
 
H
E
 
T
T
 
T
S
 
P
D
 
V
Q
 
E
D
 
Q
W
 
F
D
 
D
E
 
K
C
 
V
I
 
M
A
 
A
S
 
V
D
 
N
L
 
V
S
 
R
G
 
G
V
 
I
F
 
F
Y
 
L
M
 
G
S
 
C
R
 
R
A
 
A
A
 
V
V
 
L
P
 
P
H
 
H
-
 
M
L
 
L
K
 
L
E
 
Q
T
 
G
K
 
A
G
 
G
S
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
G
 
A
S
|
S
V
 
V
S
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
V
G
 
A
G
 
F
W
 
P
S
 
G
H
x
R
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
N
 
T
A
 
T
A
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
A
 
L
N
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
A
 
V
A
 
A
C
 
V
D
 
D
L
 
Y
G
 
A
K
 
G
F
 
S
G
 
G
V
 
I
R
|
R
A
 
C
N
 
N
T
 
A
V
 
V
A
 
C
P
 
P
G
 
G
L
 
M
T
x
I
V
x
E
T
|
T
G
x
P
M
|
M
V
 
T
E
 
Q
A
x
W
I
x
R
M
 
L
D
 
D
D
 
Q
D
 
P
A
 
E
L
 
L
L
x
R
E
 
D
K
 
Q
A
 
V
W
 
L
D
 
A
R
|
R
I
 
I
P
 
P
L
 
Q
R
 
K
R
 
E
A
 
I
G
 
G
-
 
T
-
 
A
-
 
A
Q
 
Q
P
 
V
A
 
A
S
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
M
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
E
E
 
D
A
 
A
A
 
T
W
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
G
I
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
A
Q
 
Y
T
 
T

Sites not aligning to the query:

1zk1A Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (mutant g37d) from lactobacillus brevis in complex with phenylethanol and NAD (see paper)
37% identity, 96% coverage: 2:244/253 of query aligns to 1:250/251 of 1zk1A

query
sites
1zk1A
S
 
S
K
 
N
R
 
R
F
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
T
S
x
L
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
N
 
T
R
 
K
L
 
F
L
 
V
E
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
V
M
 
M
M
 
I
S
 
T
G
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
K
x
D
R
 
R
L
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
V
A
 
G
S
 
E
K
 
K
M
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
S
-
 
V
-
 
G
P
 
T
A
 
P
D
 
D
R
 
Q
S
 
I
G
 
Q
I
 
F
F
 
F
V
 
Q
A
x
H
N
x
D
V
x
S
S
 
S
S
 
D
R
 
E
P
 
D
D
 
G
C
 
W
D
 
T
A
 
K
L
 
L
V
 
F
A
 
D
A
 
A
T
 
T
V
 
E
E
 
K
R
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
P
I
 
V
D
 
S
T
 
T
V
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
 
G
M
x
I
N
x
A
F
 
V
V
x
N
G
 
K
T
 
S
I
 
V
Q
 
E
E
 
E
T
 
T
S
 
T
D
 
T
Q
 
A
D
 
E
W
 
W
D
 
R
E
 
K
C
 
L
I
 
L
A
 
A
S
 
V
D
 
N
L
 
L
S
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
Y
 
F
M
 
G
S
 
T
R
 
R
A
 
L
A
 
G
V
 
I
P
 
Q
H
 
R
L
 
M
K
 
K
E
 
-
T
 
N
K
 
K
G
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
A
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
M
G
 
S
S
|
S
V
 
I
S
 
E
S
 
G
L
 
F
G
 
V
G
 
G
G
 
D
W
 
P
S
 
S
H
 
L
A
 
G
A
 
A
Y
|
Y
N
 
N
A
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
A
 
R
N
 
I
L
 
M
T
 
S
R
 
K
S
 
S
A
 
A
A
 
A
-
 
L
-
 
D
C
 
C
D
 
A
L
 
L
G
 
K
K
 
D
F
 
Y
G
 
D
V
 
V
R
 
R
A
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
A
 
H
P
 
P
G
|
G
L
x
Y
T
x
I
V
 
K
T
 
T
G
 
P
M
x
L
V
 
V
E
 
D
A
 
D
I
 
L
M
 
P
D
 
G
-
 
A
D
 
E
D
 
E
A
 
A
L
 
M
L
 
S
E
 
Q
K
 
R
A
 
T
W
 
-
D
 
-
R
 
K
I
 
T
P
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
H
A
 
I
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
-
 
N
-
 
D
-
 
I
A
 
A
S
 
Y
A
 
I
V
 
C
A
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
N
E
 
E
A
 
S
A
 
K
W
 
F
I
 
A
T
 
T
G
 
G
I
 
S
V
 
E
L
 
F
P
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
Y
T
 
T
C
 
A

1zjzA Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (mutant g37d) from lactobacillus brevis in complex with phenylethanol and NAD (see paper)
37% identity, 96% coverage: 2:244/253 of query aligns to 1:250/251 of 1zjzA

query
sites
1zjzA
S
 
S
K
 
N
R
 
R
F
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
T
S
x
L
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
N
 
T
R
 
K
L
 
F
L
 
V
E
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
V
M
 
M
M
 
I
S
 
T
G
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
K
x
D
R
 
R
L
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
V
A
 
G
S
 
E
K
 
K
M
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
S
-
 
V
-
 
G
P
 
T
A
 
P
D
 
D
R
 
Q
S
 
I
G
 
Q
I
 
F
F
 
F
V
 
Q
A
 
H
N
x
D
V
 
S
S
 
S
S
 
D
R
 
E
P
 
D
D
 
G
C
 
W
D
 
T
A
 
K
L
 
L
V
 
F
A
 
D
A
 
A
T
 
T
V
 
E
E
 
K
R
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
P
I
 
V
D
 
S
T
 
T
V
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
|
G
M
x
I
N
x
A
F
 
V
V
x
N
G
 
K
T
 
S
I
 
V
Q
 
E
E
 
E
T
 
T
S
 
T
D
 
T
Q
 
A
D
 
E
W
 
W
D
 
R
E
 
K
C
 
L
I
 
L
A
 
A
S
 
V
D
 
N
L
 
L
S
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
Y
 
F
M
 
G
S
 
T
R
 
R
A
 
L
A
 
G
V
 
I
P
 
Q
H
 
R
L
 
M
K
 
K
E
 
-
T
 
N
K
 
K
G
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
A
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
G
 
S
S
|
S
V
 
I
S
 
E
S
 
G
L
 
F
G
 
V
G
 
G
G
 
D
W
 
P
S
 
S
H
x
L
A
 
G
A
 
A
Y
|
Y
N
 
N
A
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
A
 
R
N
 
I
L
 
M
T
 
S
R
 
K
S
 
S
A
 
A
A
 
A
-
 
L
-
 
D
C
 
C
D
 
A
L
 
L
G
 
K
K
 
D
F
 
Y
G
 
D
V
 
V
R
 
R
A
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
A
 
H
P
 
P
G
|
G
L
 
Y
T
x
I
V
 
K
T
 
T
G
 
P
M
x
L
V
 
V
E
 
D
A
 
D
I
 
L
M
 
P
D
 
G
-
 
A
D
 
E
D
 
E
A
 
A
L
 
M
L
 
S
E
 
Q
K
 
R
A
 
T
W
 
-
D
 
-
R
 
K
I
 
T
P
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
H
A
 
I
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
-
 
N
-
 
D
-
 
I
A
 
A
S
 
Y
A
 
I
V
 
C
A
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
N
E
 
E
A
 
S
A
 
K
W
 
F
I
 
A
T
 
T
G
 
G
I
 
S
V
 
E
L
 
F
P
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
Y
T
 
T
C
 
A

1zjyA Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (mutant g37d) from lactobacillus brevis in complex with phenylethanol and nadh (see paper)
37% identity, 96% coverage: 2:244/253 of query aligns to 1:250/251 of 1zjyA

query
sites
1zjyA
S
 
S
K
 
N
R
 
R
F
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
T
S
x
L
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
N
 
T
R
 
K
L
 
F
L
 
V
E
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
V
M
 
M
M
 
I
S
 
T
G
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
K
x
D
R
 
R
L
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
V
A
 
G
S
 
E
K
 
K
M
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
S
-
 
V
-
 
G
P
 
T
A
 
P
D
 
D
R
 
Q
S
 
I
G
 
Q
I
 
F
F
 
F
V
 
Q
A
 
H
N
x
D
V
 
S
S
 
S
S
 
D
R
 
E
P
 
D
D
 
G
C
 
W
D
 
T
A
 
K
L
 
L
V
 
F
A
 
D
A
 
A
T
 
T
V
 
E
E
 
K
R
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
P
I
 
V
D
 
S
T
 
T
V
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
|
G
M
x
I
N
x
A
F
 
V
V
x
N
G
 
K
T
 
S
I
 
V
Q
 
E
E
 
E
T
 
T
S
 
T
D
 
T
Q
 
A
D
 
E
W
 
W
D
 
R
E
 
K
C
 
L
I
 
L
A
 
A
S
 
V
D
 
N
L
 
L
S
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
Y
 
F
M
 
G
S
 
T
R
 
R
A
 
L
A
 
G
V
 
I
P
 
Q
H
 
R
L
 
M
K
 
K
E
 
-
T
 
N
K
 
K
G
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
A
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
G
 
S
S
|
S
V
 
I
S
 
E
S
 
G
L
 
F
G
 
V
G
 
G
G
 
D
W
 
P
S
 
S
H
x
L
A
 
G
A
 
A
Y
|
Y
N
 
N
A
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
A
 
R
N
 
I
L
 
M
T
 
S
R
 
K
S
 
S
A
 
A
A
 
A
-
 
L
-
 
D
C
 
C
D
 
A
L
 
L
G
 
K
K
 
D
F
 
Y
G
 
D
V
 
V
R
 
R
A
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
A
 
H
P
 
P
G
|
G
L
x
Y
T
x
I
V
 
K
T
 
T
G
 
P
M
x
L
V
 
V
E
 
D
A
 
D
I
 
L
M
 
P
D
 
G
-
 
A
D
 
E
D
 
E
A
 
A
L
 
M
L
 
S
E
 
Q
K
 
R
A
 
T
W
 
-
D
 
-
R
 
K
I
 
T
P
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
H
A
 
I
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
-
 
N
-
 
D
-
 
I
A
 
A
S
 
Y
A
 
I
V
 
C
A
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
N
E
 
E
A
 
S
A
 
K
W
 
F
I
 
A
T
 
T
G
 
G
I
 
S
V
 
E
L
 
F
P
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
Y
T
 
T
C
 
A

Query Sequence

>SMa0329 FitnessBrowser__Smeli:SMa0329
MSKRFDGKVAIVTGGGSGIGAAIANRLLEEGASVMMSGRTEKRLSDVASKMPADRSGIFV
ANVSSRPDCDALVAATVERFGRIDTVVNAAGMNFVGTIQETSDQDWDECIASDLSGVFYM
SRAAVPHLKETKGSIVNIGSVSSLGGGWSHAAYNAAKGGVANLTRSAACDLGKFGVRANT
VAPGLTVTGMVEAIMDDDALLEKAWDRIPLRRAGQPASAVAFLASDEAAWITGIVLPVDG
GQTCTDGGPEWGK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory