SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMa0335 FitnessBrowser__Smeli:SMa0335 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7do7A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NAD and l-rhamnose bound-form) (see paper)
41% identity, 97% coverage: 5:255/258 of query aligns to 1:252/256 of 7do7A

query
sites
7do7A
N
 
S
I
 
L
L
 
L
D
 
I
G
 
D
K
 
K
V
 
T
V
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
A
A
 
A
I
 
R
R
 
E
A
 
C
A
 
A
E
 
R
H
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
R
A
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
G
S
 
H
D
x
S
V
 
G
V
 
S
E
 
D
A
 
E
P
 
G
R
 
R
E
 
A
G
 
G
G
 
A
E
 
L
P
 
S
T
 
L
A
 
A
S
 
E
E
 
E
I
 
I
R
 
A
K
 
A
L
 
F
G
 
G
A
 
G
E
 
T
S
 
A
V
 
I
F
 
A
V
 
V
K
 
G
A
 
A
D
|
D
V
x
A
S
 
A
R
 
D
K
 
L
V
 
D
D
 
S
N
 
G
D
 
E
A
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
-
 
V
E
 
E
E
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
S
V
 
V
D
 
D
V
 
V
M
 
L
V
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
C
L
 
P
K
x
F
T
 
H
D
 
S
G
 
F
A
 
L
E
 
D
V
 
M
P
 
P
E
 
R
D
 
E
D
 
L
Y
 
Y
R
 
L
R
 
K
L
 
T
M
 
V
S
 
G
V
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
N
G
 
G
P
 
A
L
 
Y
F
 
F
G
 
T
A
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
M
 
M
K
 
K
A
 
E
L
 
Q
N
 
G
K
 
R
Q
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
I
L
 
A
M
x
V
A
x
S
S
|
S
M
 
I
G
x
S
G
 
A
I
 
L
S
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
A
I
 
M
T
x
Q
V
 
T
A
 
H
Y
|
Y
S
 
T
T
 
P
S
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
L
V
 
L
L
 
S
M
 
L
A
 
M
K
 
Q
S
 
S
L
 
C
A
 
A
D
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
T
 
T
I
|
I
D
 
A
T
|
T
E
 
D
L
x
I
L
x
N
R
 
K
T
 
E
S
 
D
P
 
L
G
 
S
I
 
D
A
 
L
Q
 
E
A
 
K
S
 
R
E
 
E
G
 
R
F
 
M
R
 
T
Q
 
S
R
 
R
T
 
V
P
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
E
P
 
P
A
 
D
E
 
D
V
 
L
G
 
A
D
 
G
A
 
P
V
 
I
A
 
V
F
 
F
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
|
D
L
x
M
S
 
A
S
x
R
Y
 
Y
V
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
A
A
 
S
L
 
L
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
F

7b81A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1-dehydrogenase (NAD bound-form) (see paper)
41% identity, 97% coverage: 5:255/258 of query aligns to 1:252/256 of 7b81A

query
sites
7b81A
N
 
S
I
 
L
L
 
L
D
 
I
G
 
D
K
 
K
V
 
T
V
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
A
A
 
A
I
 
R
R
 
E
A
 
C
A
 
A
E
 
R
H
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
R
A
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
G
S
 
H
D
 
S
V
 
G
V
 
S
E
 
D
A
 
E
P
 
G
R
 
R
E
 
A
G
 
G
G
 
A
E
 
L
P
 
S
T
 
L
A
 
A
S
 
E
E
 
E
I
 
I
R
 
A
K
 
A
L
 
F
G
 
G
A
 
G
E
 
T
S
 
A
V
 
I
F
 
A
V
 
V
K
 
G
A
 
A
D
|
D
V
x
A
S
 
A
R
 
D
K
 
L
V
 
D
D
 
S
N
 
G
D
 
E
A
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
-
 
V
E
 
E
E
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
S
V
 
V
D
 
D
V
 
V
M
 
L
V
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
C
L
 
P
K
 
F
T
 
H
D
 
S
G
 
F
A
 
L
E
 
D
V
 
M
P
 
P
E
 
R
D
 
E
D
 
L
Y
 
Y
R
 
L
R
 
K
L
 
T
M
 
V
S
 
G
V
x
T
N
 
N
L
 
L
D
 
N
G
 
G
P
 
A
L
 
Y
F
 
F
G
 
T
A
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
M
 
M
K
 
K
A
 
E
L
 
Q
N
 
G
K
 
R
Q
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
I
L
 
A
M
x
V
A
 
S
S
|
S
M
 
I
G
 
S
G
 
A
I
 
L
S
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
A
I
 
M
T
 
Q
V
 
T
A
 
H
Y
|
Y
S
 
T
T
 
P
S
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
L
V
 
L
L
 
S
M
 
L
A
 
M
K
 
Q
S
 
S
L
 
C
A
 
A
D
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
T
 
T
I
|
I
D
 
A
T
|
T
E
 
D
L
x
I
L
 
N
R
 
K
T
 
E
S
 
D
P
 
L
G
 
S
I
 
D
A
 
L
Q
 
E
A
 
K
S
 
R
E
 
E
G
 
R
F
 
M
R
 
T
Q
 
S
R
 
R
T
 
V
P
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
E
P
 
P
A
 
D
E
 
D
V
 
L
G
 
A
D
 
G
A
 
P
V
 
I
A
 
V
F
 
F
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
M
S
 
A
S
 
R
Y
 
Y
V
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
A
A
 
S
L
 
L
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
F

7do6A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NADP bound-form) (see paper)
42% identity, 97% coverage: 5:255/258 of query aligns to 1:243/247 of 7do6A

query
sites
7do6A
N
 
S
I
 
L
L
 
L
D
 
I
G
 
D
K
 
K
V
 
T
V
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
A
A
 
A
I
 
R
R
 
E
A
 
C
A
 
A
E
 
R
H
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
R
A
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
G
S
x
H
D
x
S
V
 
G
V
 
S
E
 
D
A
 
E
P
x
G
R
 
R
E
 
A
G
 
G
G
 
A
E
 
L
P
 
S
T
 
L
A
 
A
S
 
E
E
 
E
I
 
I
R
 
A
K
 
A
L
 
F
G
 
G
A
 
G
E
 
T
S
 
A
V
 
I
F
 
A
V
 
V
K
 
G
A
 
A
D
|
D
V
x
A
S
 
A
R
 
D
K
 
L
V
 
D
D
 
S
N
 
G
D
 
E
A
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
-
 
V
E
 
E
E
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
S
V
 
V
D
 
D
V
 
V
M
 
L
V
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
C
L
 
P
K
 
F
T
 
H
D
 
S
G
 
F
A
 
L
E
 
D
V
 
M
P
 
P
E
 
R
D
 
E
D
 
L
Y
 
Y
R
 
L
R
 
K
L
 
T
M
 
V
S
 
G
V
x
T
N
 
N
L
 
L
D
 
N
G
 
G
P
 
A
L
 
Y
F
 
F
G
 
T
A
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
M
 
M
K
 
K
A
 
E
L
 
Q
N
 
G
K
 
R
Q
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
I
L
 
A
M
 
V
A
 
S
S
|
S
M
 
I
G
 
S
G
 
A
I
 
L
S
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
A
I
 
M
T
 
Q
V
 
T
A
 
H
Y
|
Y
S
 
T
T
 
P
S
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
L
V
 
L
L
 
S
M
 
L
A
 
M
K
 
Q
S
 
S
L
 
C
A
 
A
D
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
G
T
 
T
I
|
I
-
 
A
D
 
D
T
 
L
E
 
E
L
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
S
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
K
S
 
R
E
 
E
G
 
R
F
 
M
R
 
T
Q
 
S
R
 
R
T
 
V
P
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
E
P
 
P
A
 
D
E
 
D
V
 
L
G
 
A
D
 
G
A
 
P
V
 
I
A
 
V
F
 
F
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
M
S
 
A
S
 
R
Y
 
Y
V
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
A
A
 
S
L
 
L
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
F

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
41% identity, 98% coverage: 6:257/258 of query aligns to 2:248/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
I
 
I
L
 
L
D
 
D
G
 
N
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
I
 
H
R
 
S
A
 
Y
A
 
A
E
 
K
H
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
-
V
 
V
I
 
I
V
 
V
S
 
S
D
|
D
V
x
I
V
 
N
E
 
E
A
 
-
P
 
-
R
 
-
E
 
D
G
 
H
G
 
G
E
 
N
P
 
K
T
 
A
A
 
V
S
 
E
E
 
D
I
 
I
R
 
K
K
 
A
L
 
Q
G
 
G
A
 
G
E
 
E
S
 
A
V
 
S
F
 
F
V
 
V
K
 
K
A
|
A
D
|
D
V
x
T
S
 
S
R
 
N
K
 
P
V
 
E
D
 
E
N
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
K
-
 
R
A
 
T
A
 
V
E
 
E
E
 
I
F
 
Y
G
 
G
G
 
R
V
 
L
D
 
D
V
 
I
M
 
A
V
 
C
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
G
-
 
G
L
 
E
K
 
Q
T
 
A
D
 
L
G
 
A
A
 
G
E
 
D
V
 
Y
P
 
G
E
 
L
D
 
D
D
 
S
Y
 
W
R
 
R
R
 
K
L
 
V
M
 
L
S
 
S
V
 
I
N
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
G
P
 
V
L
 
F
F
 
Y
G
 
G
A
 
C
Q
 
K
A
 
Y
A
 
E
A
 
L
R
 
E
Q
 
Q
M
 
M
K
 
E
A
 
K
L
 
-
N
 
N
K
 
G
Q
 
G
G
 
G
S
 
V
I
 
I
V
 
V
L
 
N
M
|
M
A
 
A
S
|
S
M
 
I
G
 
H
G
 
G
I
 
I
S
 
V
G
 
A
A
 
A
G
 
P
I
 
L
T
 
S
V
 
S
A
 
A
Y
|
Y
S
 
T
T
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
H
G
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
G
M
 
L
A
 
T
K
 
K
S
 
N
L
 
I
A
 
G
D
 
A
A
 
E
L
 
Y
G
 
G
P
 
Q
D
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
G
P
|
P
G
x
A
T
x
Y
I
|
I
D
 
E
T
 
T
E
 
P
L
|
L
L
 
L
R
 
E
T
 
S
S
 
L
P
 
T
G
 
-
I
 
-
A
 
K
Q
 
E
A
 
M
S
 
K
E
 
E
G
 
A
F
 
L
R
 
I
Q
 
S
R
 
K
T
 
H
P
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
A
D
 
E
A
 
L
V
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
G
 
S
S
 
S
D
 
E
L
 
K
S
 
S
S
 
S
Y
 
F
V
 
M
S
 
T
G
 
G
T
 
G
A
 
Y
L
 
Y
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
L
 
T
A
 
A
V
 
V

4urfB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
40% identity, 97% coverage: 6:256/258 of query aligns to 2:247/248 of 4urfB

query
sites
4urfB
I
 
L
L
 
L
D
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
x
G
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
I
 
I
A
 
A
I
 
L
R
 
T
A
 
Y
A
 
A
E
 
A
H
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
N
A
 
-
V
 
V
I
 
V
V
 
V
S
 
S
D
|
D
V
x
I
V
 
S
E
 
D
A
 
-
P
 
-
R
 
-
E
 
E
G
 
W
G
 
G
E
 
R
P
 
E
T
 
T
A
 
L
S
 
A
E
 
L
I
 
I
R
 
E
K
 
G
L
 
K
G
 
G
A
 
G
E
 
K
S
 
A
V
 
V
F
 
F
V
 
Q
K
 
H
A
 
A
D
|
D
V
x
T
S
 
A
R
 
H
K
 
P
V
 
E
D
 
D
N
 
H
D
 
D
A
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
K
E
 
R
-
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
R
V
 
L
D
 
D
V
 
I
M
 
A
V
 
C
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
S
L
x
G
K
 
E
-
 
F
T
 
T
D
 
P
G
 
T
A
 
A
E
 
E
V
 
T
P
 
T
E
 
D
D
 
A
D
 
Q
Y
 
W
R
 
Q
R
|
R
L
 
V
M
 
I
S
 
G
V
 
I
N
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
G
P
 
V
L
 
F
F
 
Y
G
 
G
A
 
V
Q
 
R
A
 
A
A
 
Q
A
 
I
R
 
R
Q
 
A
M
 
M
K
 
L
A
 
E
L
 
T
N
 
G
K
 
G
Q
 
-
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
N
M
x
I
A
 
S
S
|
S
M
 
I
G
 
A
G
 
G
I
 
Q
S
 
I
G
 
G
-
 
I
A
 
E
G
 
G
I
|
I
T
 
T
V
 
-
A
 
P
Y
|
Y
S
 
T
T
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
G
M
 
L
A
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
V
A
 
A
D
 
W
A
 
E
L
 
Y
G
 
G
P
 
S
D
 
K
G
 
G
I
 
I
R
|
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
G
P
|
P
G
x
A
T
 
F
I
|
I
D
 
N
T
|
T
E
 
T
L
 
L
L
 
V
R
 
Q
T
 
N
S
 
V
P
 
P
G
 
-
I
 
-
A
 
L
Q
 
E
A
 
T
S
 
R
E
 
R
G
 
Q
F
 
L
R
 
E
Q
 
Q
R
 
M
T
 
H
P
 
A
L
|
L
R
|
R
R
|
R
L
 
L
G
 
G
K
 
E
P
 
T
A
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
A
D
 
N
A
 
L
V
 
V
A
 
A
F
 
W
L
 
L
G
 
S
S
|
S
D
 
D
L
 
K
S
 
A
S
 
S
Y
 
F
V
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
S
A
 
Y
L
 
Y
L
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
L
 
L
A
 
A

4urfA Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
40% identity, 97% coverage: 6:256/258 of query aligns to 2:247/248 of 4urfA

query
sites
4urfA
I
 
L
L
 
L
D
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
x
G
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
I
 
I
A
 
A
I
 
L
R
 
T
A
 
Y
A
 
A
E
 
A
H
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
N
A
 
-
V
 
V
I
 
V
V
 
V
S
 
S
D
|
D
V
x
I
V
 
S
E
 
D
A
 
-
P
 
-
R
 
-
E
 
E
G
x
W
G
 
G
E
 
R
P
 
E
T
 
T
A
 
L
S
 
A
E
 
L
I
 
I
R
 
E
K
 
G
L
 
K
G
 
G
A
 
G
E
 
K
S
 
A
V
 
V
F
 
F
V
 
Q
K
 
H
A
 
A
D
|
D
V
x
T
S
 
A
R
 
H
K
 
P
V
 
E
D
 
D
N
 
H
D
 
D
A
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
K
E
 
R
-
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
R
V
 
L
D
 
D
V
 
I
M
 
A
V
 
C
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
x
S
L
x
G
K
x
E
-
 
F
T
|
T
D
 
P
G
 
T
A
 
A
E
|
E
V
 
T
P
x
T
E
 
D
D
 
A
D
x
Q
Y
 
W
R
 
Q
R
|
R
L
 
V
M
 
I
S
 
G
V
 
I
N
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
G
P
 
V
L
 
F
F
 
Y
G
 
G
A
 
V
Q
 
R
A
 
A
A
 
Q
A
 
I
R
 
R
Q
 
A
M
 
M
K
 
L
A
 
E
L
 
T
N
 
G
K
 
G
Q
 
-
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
N
M
x
I
A
 
S
S
|
S
M
 
I
G
 
A
G
 
G
I
 
Q
S
 
I
G
 
G
-
 
I
A
 
E
G
 
G
I
|
I
T
 
T
V
 
-
A
 
P
Y
|
Y
S
 
T
T
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
G
M
 
L
A
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
V
A
 
A
D
 
W
A
 
E
L
 
Y
G
 
G
P
x
S
D
 
K
G
|
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
G
P
|
P
G
 
A
T
 
F
I
|
I
D
 
N
T
|
T
E
 
T
L
 
L
L
 
V
R
 
Q
T
 
N
S
 
V
P
 
P
G
 
-
I
 
-
A
 
L
Q
 
E
A
 
T
S
 
R
E
 
R
G
 
Q
F
 
L
R
 
E
Q
 
Q
R
 
M
T
 
H
P
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
E
P
 
T
A
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
A
D
 
N
A
 
L
V
 
V
A
 
A
F
 
W
L
 
L
G
 
S
S
 
S
D
 
D
L
 
K
S
 
A
S
 
S
Y
 
F
V
 
V
S
 
T
G
 
G
T
x
S
A
x
Y
L
 
Y
L
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
L
 
L
A
 
A

4ureB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
40% identity, 97% coverage: 6:256/258 of query aligns to 2:247/248 of 4ureB

query
sites
4ureB
I
 
L
L
 
L
D
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
G
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
I
 
I
A
 
A
I
 
L
R
 
T
A
 
Y
A
 
A
E
 
A
H
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
N
A
 
-
V
 
V
I
 
V
V
 
V
S
 
S
D
 
D
V
 
I
V
 
S
E
 
D
A
 
-
P
 
-
R
 
-
E
 
E
G
 
W
G
 
G
E
 
R
P
 
E
T
 
T
A
 
L
S
 
A
E
 
L
I
 
I
R
 
E
K
 
G
L
 
K
G
 
G
A
 
G
E
 
K
S
 
A
V
 
V
F
 
F
V
 
Q
K
 
H
A
 
A
D
 
D
V
 
T
S
 
A
R
 
H
K
 
P
V
 
E
D
 
D
N
 
H
D
 
D
A
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
K
E
 
R
-
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
R
V
 
L
D
 
D
V
 
I
M
 
A
V
 
C
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
T
 
S
L
 
G
K
 
E
-
 
F
T
 
T
D
 
P
G
 
T
A
 
A
E
 
E
V
 
T
P
 
T
E
 
D
D
 
A
D
 
Q
Y
 
W
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
M
 
I
S
 
G
V
 
I
N
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
G
P
 
V
L
 
F
F
 
Y
G
 
G
A
 
V
Q
 
R
A
 
A
A
 
Q
A
 
I
R
 
R
Q
 
A
M
 
M
K
 
L
A
 
E
L
 
T
N
 
G
K
 
G
Q
 
-
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
N
M
 
I
A
 
S
S
|
S
M
 
I
G
 
A
G
 
G
I
 
Q
S
 
I
G
 
G
-
 
I
A
 
E
G
 
G
I
|
I
T
 
T
V
 
-
A
 
P
Y
|
Y
S
 
T
T
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
G
M
 
L
A
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
V
A
 
A
D
 
W
A
 
E
L
 
Y
G
 
G
P
 
S
D
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
G
P
|
P
G
x
A
T
 
F
I
 
I
D
 
N
T
 
T
E
 
T
L
 
L
L
 
V
R
 
Q
T
 
N
S
 
V
P
 
P
G
 
-
I
 
-
A
 
L
Q
 
E
A
 
T
S
 
R
E
 
R
G
 
Q
F
 
L
R
 
E
Q
 
Q
R
 
M
T
 
H
P
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
E
P
 
T
A
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
A
D
 
N
A
 
L
V
 
V
A
 
A
F
 
W
L
 
L
G
 
S
S
 
S
D
 
D
L
 
K
S
 
A
S
 
S
Y
 
F
V
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
S
A
 
Y
L
 
Y
L
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
L
 
L
A
 
A

1g6kA Crystal structure of glucose dehydrogenase mutant e96a complexed with NAD+
34% identity, 96% coverage: 7:254/258 of query aligns to 5:250/261 of 1g6kA

query
sites
1g6kA
L
 
L
D
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
S
 
S
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
K
A
 
S
I
 
M
A
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
F
A
 
A
E
 
T
H
 
E
G
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
N
S
 
-
D
 
-
V
 
-
V
 
Y
E
x
R
A
 
S
P
 
K
R
 
E
E
 
D
G
 
E
G
 
A
E
 
N
P
 
S
T
 
V
A
 
L
S
 
E
E
 
E
I
 
I
R
 
K
K
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
G
E
 
E
S
 
A
V
 
I
F
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
G
D
|
D
V
|
V
S
 
T
R
 
V
K
 
E
V
 
S
D
 
D
N
 
V
D
 
I
A
 
N
L
 
L
V
 
V
A
 
Q
A
 
S
A
 
A
-
 
I
E
 
K
E
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
K
V
 
L
D
 
D
V
 
V
M
 
M
V
 
I
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
L
T
 
A
L
 
N
K
 
P
T
 
V
D
 
S
G
 
S
A
 
H
E
 
E
V
 
M
P
 
S
E
 
L
D
 
S
D
 
D
Y
 
W
R
 
N
R
 
K
L
 
V
M
 
I
S
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
T
G
 
G
P
 
A
L
 
F
F
 
L
G
 
G
A
 
S
Q
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
I
R
 
K
Q
 
Y
M
 
F
K
 
V
A
 
E
L
 
N
N
 
D
K
 
I
Q
 
K
G
 
G
S
 
T
I
 
V
V
 
I
L
 
N
M
|
M
A
 
S
S
|
S
M
 
V
G
 
H
G
 
E
I
 
K
S
 
I
G
 
P
A
 
W
G
 
P
I
 
L
T
 
F
V
 
V
A
 
H
Y
|
Y
S
 
A
T
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
M
V
 
K
L
 
L
M
 
M
A
 
T
K
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
L
A
 
E
L
 
Y
G
 
A
P
 
P
D
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
N
V
 
I
A
 
G
P
|
P
G
|
G
T
 
A
I
|
I
D
 
N
T
|
T
E
 
P
L
 
I
L
 
N
R
 
A
T
 
E
S
 
K
P
 
F
G
 
A
I
 
D
A
 
P
Q
 
E
A
 
Q
S
 
R
E
 
A
G
 
D
F
 
V
R
 
E
Q
 
S
R
 
M
T
 
I
P
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
Y
L
 
I
G
 
G
K
 
E
P
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
I
G
 
A
D
 
A
A
 
V
V
 
A
A
 
A
F
 
W
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
S
L
 
E
S
 
A
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
I
A
 
T
L
 
L
L
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

P40288 Glucose 1-dehydrogenase; EC 1.1.1.47 from Priestia megaterium (Bacillus megaterium) (see 2 papers)
34% identity, 96% coverage: 7:254/258 of query aligns to 5:250/261 of P40288

query
sites
P40288
L
 
L
D
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
V
I
x
V
V
x
I
T
|
T
G
|
G
A
x
S
S
|
S
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
|
G
R
x
K
A
x
S
I
x
M
A
|
A
I
|
I
R
|
R
A
x
F
A
|
A
E
x
T
H
x
E
G
x
K
A
|
A
K
|
K
A
x
V
V
|
V
I
 
V
V
 
N
S
 
-
D
 
-
V
 
-
V
 
Y
E
 
R
A
 
S
P
 
K
R
 
E
E
 
D
G
 
E
G
 
A
E
 
N
P
 
S
T
 
V
A
 
L
S
 
E
E
 
E
I
 
I
R
 
K
K
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
G
E
 
E
S
 
A
V
 
I
F
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
G
D
 
D
V
 
V
S
 
T
R
 
V
K
 
E
V
 
S
D
 
D
N
 
V
D
 
I
A
 
N
L
 
L
V
 
V
A
 
Q
A
 
S
A
 
A
-
 
I
E
 
K
E
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
K
V
 
L
D
 
D
V
 
V
M
 
M
V
 
I
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
L
T
x
E
L
 
N
K
 
P
T
 
V
D
 
S
G
 
S
A
 
H
E
 
E
V
 
M
P
 
S
E
 
L
D
 
S
D
|
D
Y
 
W
R
 
N
R
 
K
L
x
V
M
 
I
S
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
T
G
 
G
P
 
A
L
 
F
F
 
L
G
 
G
A
 
S
Q
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
I
R
 
K
Q
 
Y
M
 
F
K
 
V
A
x
E
L
 
N
N
 
D
K
 
I
Q
 
K
G
 
G
S
 
T
I
 
V
V
 
I
L
 
N
M
 
M
A
 
S
S
 
S
M
 
V
G
 
H
G
 
E
I
 
K
S
 
I
G
 
P
A
 
W
G
 
P
I
 
L
T
 
F
V
 
V
A
 
H
Y
 
Y
S
 
A
T
 
A
S
 
S
K
 
K
G
 
G
G
 
G
V
 
M
V
 
K
L
 
L
M
 
M
A
 
T
K
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
L
A
 
E
L
 
Y
G
 
A
P
 
P
D
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
|
V
N
 
N
A
 
N
V
 
I
A
 
G
P
 
P
G
 
G
T
 
A
I
 
I
D
 
N
T
 
T
E
x
P
L
 
I
L
 
N
R
 
A
T
 
E
S
 
K
P
 
F
G
 
A
I
 
D
A
 
P
Q
 
E
A
 
Q
S
 
R
E
 
A
G
 
D
F
 
V
R
x
E
Q
 
S
R
 
M
T
 
I
P
 
P
L
 
M
R
 
G
R
x
Y
L
 
I
G
 
G
K
 
E
P
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
I
G
 
A
D
 
A
A
 
V
V
 
A
A
 
A
F
 
W
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
S
L
 
E
S
 
A
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
I
A
 
T
L
 
L
L
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

Sites not aligning to the query:

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
39% identity, 97% coverage: 7:255/258 of query aligns to 3:246/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
|
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
D
I
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
N
A
 
L
A
 
A
E
 
K
H
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
N
A
 
-
V
 
-
I
 
I
V
 
F
S
 
F
D
x
N
V
x
Y
V
x
N
E
x
G
A
x
S
P
 
P
R
 
-
E
 
E
G
 
A
G
 
A
E
 
E
P
 
E
T
 
T
A
 
A
S
 
K
E
 
L
I
 
V
R
 
A
K
 
E
L
 
H
G
 
G
A
 
V
E
 
E
S
 
V
V
 
E
F
 
A
V
 
M
K
 
K
A
 
A
D
x
N
V
|
V
S
 
A
R
 
I
K
 
A
V
 
E
D
 
D
N
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
F
V
 
F
A
 
K
A
 
Q
A
 
A
-
 
I
E
 
E
E
 
R
F
 
F
G
 
G
G
 
R
V
 
V
D
 
D
V
 
I
M
 
L
V
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
T
 
T
L
 
R
K
 
D
T
 
N
D
 
L
G
 
L
A
 
M
E
 
R
V
 
M
P
 
K
E
 
E
D
 
D
D
 
E
Y
 
W
R
 
D
R
 
D
L
 
V
M
 
I
S
 
N
V
x
I
N
 
N
L
 
L
D
 
K
G
 
G
P
 
T
L
 
F
F
 
L
G
 
C
A
 
T
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
A
 
S
R
 
R
Q
 
T
M
 
M
K
 
M
A
 
K
L
 
-
N
 
Q
K
 
R
Q
 
A
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
L
 
N
M
 
M
A
 
A
S
|
S
M
 
V
G
 
V
G
 
G
I
 
L
S
 
I
G
 
G
A
 
N
G
 
A
I
 
G
T
x
Q
V
 
A
A
 
N
Y
|
Y
S
 
V
T
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
I
L
 
G
M
 
L
A
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
T
A
 
A
D
 
R
A
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
D
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
T
 
F
I
|
I
D
 
T
T
|
T
E
 
D
L
 
M
L
 
-
R
 
-
T
 
T
S
 
D
P
 
K
G
 
L
I
 
D
A
 
E
Q
 
K
A
 
T
S
 
K
E
 
E
G
 
A
F
 
M
R
 
L
Q
 
A
R
 
Q
T
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
A
L
 
Y
G
 
G
K
 
T
P
 
T
A
 
E
E
 
D
V
 
I
G
 
A
D
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
A
S
 
S
S
 
K
Y
 
Y
V
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
L
 
V

3ay6B Crystal structure of bacillus megaterium glucose dehydrogenase 4 a258f mutant in complex with nadh and d-glucose (see paper)
34% identity, 96% coverage: 7:254/258 of query aligns to 11:256/267 of 3ay6B

query
sites
3ay6B
L
 
L
D
 
K
G
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
S
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
M
A
 
A
I
 
V
R
 
R
A
 
F
A
 
G
E
 
Q
H
 
E
G
 
E
A
 
A
K
 
K
A
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
N
S
 
Y
D
x
Y
V
 
N
V
 
N
E
 
E
A
 
-
P
 
-
R
 
-
E
 
E
G
 
E
G
 
A
E
 
L
P
 
D
T
 
A
A
 
K
S
 
K
E
 
E
I
 
V
R
 
E
K
 
E
L
 
A
G
 
G
A
 
G
E
 
Q
S
 
A
V
 
I
F
 
I
V
 
V
K
 
Q
A
 
G
D
|
D
V
|
V
S
 
T
R
 
K
K
 
E
V
 
E
D
 
D
N
 
V
D
 
V
A
 
N
L
 
L
V
 
V
A
 
Q
A
 
T
A
 
A
-
 
I
E
 
K
E
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
T
V
 
L
D
 
D
V
 
V
M
 
M
V
 
I
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
x
V
T
x
E
L
 
N
K
 
P
T
 
V
D
 
P
G
 
S
A
 
H
E
 
E
V
 
L
P
 
S
E
 
L
D
 
D
D
 
N
Y
 
W
R
 
N
R
 
K
L
 
V
M
 
I
S
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
T
G
 
G
P
 
A
L
 
F
F
 
L
G
 
G
A
 
S
Q
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
I
R
 
K
Q
 
Y
M
 
F
K
 
V
A
 
E
L
 
N
N
 
D
K
 
I
Q
 
K
G
 
G
S
 
N
I
 
V
V
 
I
L
 
N
M
|
M
A
 
S
S
|
S
M
 
V
G
x
H
G
 
E
I
 
M
S
 
I
G
 
P
A
x
W
G
 
P
I
 
L
T
 
F
V
 
V
A
 
H
Y
|
Y
S
 
A
T
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
M
V
 
K
L
 
L
M
 
M
A
 
T
K
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
L
A
 
E
L
 
Y
G
 
A
P
 
P
D
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
N
V
 
I
A
 
G
P
|
P
G
|
G
T
 
A
I
x
M
D
 
N
T
|
T
E
x
P
L
x
I
L
x
N
R
 
A
T
 
E
S
x
K
P
 
F
G
 
A
I
 
D
A
 
P
Q
 
V
A
 
Q
S
 
R
E
 
A
G
 
D
F
 
V
R
 
E
Q
 
S
R
 
M
T
 
I
P
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
Y
L
 
I
G
 
G
K
 
K
P
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
A
D
 
A
A
 
V
V
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
S
L
 
Q
S
 
A
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
I
A
 
T
L
 
L
L
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
36% identity, 97% coverage: 7:256/258 of query aligns to 5:254/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
L
 
L
D
 
T
G
 
D
K
 
K
V
 
T
V
 
V
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
I
 
-
A
 
A
I
 
V
R
 
Q
A
 
A
A
 
F
E
 
L
H
 
G
G
 
Q
A
 
Q
K
 
A
A
 
N
V
 
V
I
 
V
V
 
V
S
 
A
D
|
D
V
x
I
V
 
D
E
 
E
A
 
A
P
 
Q
R
 
G
E
 
E
G
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
-
S
 
A
E
 
M
I
 
V
R
 
R
K
 
K
L
 
E
G
 
N
A
 
N
E
 
D
S
 
R
V
 
L
-
 
H
F
 
F
V
 
V
K
 
Q
A
x
T
D
 
D
V
x
I
S
 
T
R
 
D
K
 
E
V
 
A
-
 
A
D
 
C
N
 
Q
D
 
H
A
 
A
L
 
V
V
 
E
A
 
S
A
 
A
A
 
V
E
 
H
E
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
V
M
 
L
V
 
I
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
T
 
E
L
 
I
K
 
V
T
 
A
D
 
P
G
 
I
A
 
H
E
 
E
V
 
M
P
 
E
E
 
L
D
 
S
D
 
D
Y
 
W
R
 
N
R
 
K
L
 
V
M
 
L
S
 
Q
V
 
V
N
 
N
L
 
L
D
 
T
G
 
G
P
 
M
L
 
F
F
 
L
G
 
M
A
 
S
Q
 
K
A
 
H
A
 
A
A
 
L
R
 
K
Q
 
H
M
 
M
K
 
L
A
 
A
L
 
A
N
 
G
K
 
K
Q
 
-
G
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
I
L
 
N
M
x
T
A
 
C
S
|
S
M
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
L
S
 
V
G
 
A
A
 
W
G
 
P
I
 
D
T
 
I
V
 
P
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
T
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
L
L
 
Q
M
 
L
A
 
T
K
 
K
S
 
S
L
 
M
A
 
A
D
 
V
A
 
D
L
 
Y
G
 
A
P
 
K
D
 
H
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
T
x
I
I
|
I
D
 
D
T
 
T
E
 
P
L
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
K
-
 
S
-
 
F
L
 
L
R
 
E
T
 
N
S
 
N
P
 
E
G
 
G
I
 
T
A
 
L
Q
 
E
A
 
E
S
 
I
E
 
K
G
 
K
F
 
E
R
 
K
Q
 
A
R
 
K
-
 
V
T
 
N
P
 
P
L
 
L
R
 
L
R
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
I
G
 
A
D
 
N
A
 
V
V
 
M
A
 
L
F
 
F
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
L
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
V
 
M
S
 
T
G
 
G
T
 
S
A
 
A
L
 
I
L
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
L
 
T
A
 
A

5t5qC Crystal structure of short-chain dehydrogenase/reductase sdr:glucose/ribitol dehydrogenase from brucella melitensis
38% identity, 96% coverage: 7:254/258 of query aligns to 5:242/245 of 5t5qC

query
sites
5t5qC
L
 
F
D
 
E
G
 
N
K
 
R
V
 
T
V
 
L
I
 
V
V
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
x
N
S
x
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
I
 
E
R
 
L
A
 
F
A
 
H
E
 
A
H
 
S
G
 
G
A
 
A
K
 
N
A
 
L
V
 
V
I
 
L
V
 
T
S
 
-
D
 
-
V
 
-
V
 
-
E
x
D
A
x
L
P
 
D
R
 
R
E
 
E
G
 
G
G
 
L
E
 
D
P
 
A
T
 
F
A
 
A
S
 
A
E
 
-
I
 
-
R
 
-
K
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
S
E
 
P
S
 
E
V
 
R
F
 
I
-
 
A
-
 
T
V
 
I
K
 
K
A
 
A
D
|
D
V
x
A
S
 
S
R
 
S
K
 
A
V
 
D
D
 
D
N
 
A
D
 
E
A
 
K
L
 
T
V
 
V
A
 
A
-
 
L
A
 
A
A
 
M
E
 
E
E
 
R
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
F
M
 
L
V
 
V
A
 
P
N
x
S
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
Y
L
 
Q
K
 
A
T
 
K
D
 
P
G
 
F
A
 
A
E
 
E
V
 
M
P
 
S
E
 
D
D
 
A
D
 
D
Y
 
W
R
 
H
R
 
R
L
 
T
M
 
I
S
 
S
V
x
I
N
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
G
P
 
V
L
 
F
F
 
Y
G
 
L
A
 
C
Q
 
K
A
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
R
Q
 
A
M
 
L
K
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
K
K
 
E
Q
 
D
G
 
S
S
 
S
I
 
I
V
 
V
L
 
T
M
 
L
A
 
A
S
|
S
M
 
L
G
 
A
G
 
A
I
 
Y
S
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
Y
I
 
V
T
x
N
V
 
A
A
 
H
Y
|
Y
S
 
G
T
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
M
V
 
V
L
 
S
M
 
M
A
 
T
K
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
S
D
 
R
A
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
D
 
K
G
 
-
I
 
T
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
S
P
|
P
G
 
G
T
 
I
I
|
I
D
 
E
T
|
T
-
 
P
-
x
M
-
 
T
-
 
S
E
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
K
T
 
T
S
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
Q
 
R
A
 
M
S
 
D
E
 
E
G
 
T
F
 
M
R
 
T
Q
 
Q
R
 
-
T
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
A
 
S
E
 
E
V
 
I
G
 
A
D
 
S
A
 
V
V
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
L
G
 
C
S
 
S
D
 
P
L
 
A
S
 
A
S
 
S
Y
 
F
V
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
E
A
 
T
L
 
I
L
 
Q
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
I

6y0sAAA R-specific alcohol dehydrogenase (see paper)
38% identity, 98% coverage: 4:256/258 of query aligns to 1:250/251 of 6y0sAAA

query
sites
6y0sAAA
S
 
S
N
 
N
I
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
G
S
x
T
S
 
L
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
I
 
T
R
 
K
A
 
F
A
 
V
E
 
E
H
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
V
V
 
M
I
 
I
V
 
T
-
x
G
-
 
R
-
x
H
S
 
S
D
 
D
V
|
V
V
 
G
E
 
E
-
 
K
A
 
A
P
 
A
R
 
K
E
 
S
G
 
V
G
 
G
E
 
T
P
 
P
T
 
D
A
 
Q
S
 
I
E
 
Q
I
 
-
R
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
S
 
-
V
 
-
F
 
F
V
 
F
K
 
Q
A
 
H
D
 
D
V
 
S
S
 
S
R
 
D
K
 
E
V
 
D
D
 
G
N
 
W
D
 
T
A
 
K
L
 
L
V
 
F
A
 
D
A
 
A
A
 
T
E
 
E
E
 
K
-
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
P
V
 
V
D
 
S
V
 
T
M
 
L
V
 
V
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
A
L
 
V
K
 
N
T
 
K
D
 
S
G
 
V
A
 
E
E
 
E
V
 
T
P
 
E
E
 
T
D
 
A
D
 
E
Y
 
W
R
 
R
R
 
K
L
 
L
M
 
L
S
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
G
P
 
V
L
 
F
F
 
F
G
 
G
A
 
T
Q
 
R
A
 
L
A
 
G
A
 
I
R
 
Q
Q
 
R
M
 
M
K
 
K
A
 
N
L
 
K
N
 
G
K
 
L
Q
x
G
G
x
A
S
 
S
I
 
I
V
 
I
L
 
N
M
 
M
A
 
S
S
|
S
M
 
I
G
 
E
G
 
G
I
 
F
S
 
V
G
 
G
A
 
D
G
 
P
I
 
S
T
 
L
V
 
G
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
T
 
A
S
 
S
K
 
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
V
 
R
L
 
I
M
 
M
A
 
S
K
 
K
S
 
S
-
 
A
-
 
A
L
 
L
A
 
D
D
 
C
A
 
A
L
 
L
G
 
K
P
 
D
D
 
Y
G
x
D
I
 
V
R
|
R
V
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
H
P
 
P
G
 
G
T
 
Y
I
 
I
D
 
K
T
 
T
E
 
P
L
 
L
L
 
V
R
 
D
T
 
D
S
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
-
A
 
A
Q
 
E
A
 
E
S
 
A
E
 
M
G
 
S
F
 
Q
R
 
R
Q
 
T
R
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
H
L
 
I
G
 
G
K
 
E
P
 
P
A
 
N
E
 
D
V
 
I
G
 
A
D
 
Y
A
 
I
V
 
C
A
 
V
F
 
Y
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
N
L
 
E
S
 
S
S
 
K
Y
 
F
V
 
A
S
 
T
G
 
G
T
 
S
A
 
E
L
 
F
L
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
L
 
T
A
 
A

1zk4A Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (wildtype) from lactobacillus brevis in complex with acetophenone and NADP (see paper)
38% identity, 98% coverage: 4:256/258 of query aligns to 1:250/251 of 1zk4A

query
sites
1zk4A
S
 
S
N
 
N
I
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
x
T
S
x
L
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
I
 
T
R
 
K
A
 
F
A
 
V
E
 
E
H
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
V
V
 
M
I
 
I
V
x
T
-
x
G
-
x
R
-
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
G
E
 
E
-
 
K
A
 
A
P
 
A
R
 
K
E
 
S
G
 
V
G
 
G
E
 
T
P
 
P
T
 
D
A
 
Q
S
 
I
E
 
Q
I
 
-
R
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
S
 
-
V
 
-
F
 
F
V
 
F
K
 
Q
A
x
H
D
|
D
V
 
S
S
 
S
R
 
D
K
 
E
V
 
D
D
 
G
N
 
W
D
 
T
A
 
K
L
 
L
V
 
F
A
 
D
A
 
A
A
 
T
E
 
E
E
 
K
-
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
P
V
 
V
D
 
S
V
 
T
M
 
L
V
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
x
A
L
 
V
K
 
N
T
 
K
D
 
S
G
 
V
A
 
E
E
 
E
V
 
T
P
 
T
E
 
T
D
 
A
D
 
E
Y
 
W
R
 
R
R
 
K
L
 
L
M
 
L
S
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
G
P
 
V
L
 
F
F
 
F
G
 
G
A
 
T
Q
 
R
A
 
L
A
 
G
A
 
I
R
 
Q
Q
 
R
M
 
M
K
 
K
A
 
N
L
 
K
N
 
G
K
 
L
Q
 
G
G
 
A
S
 
S
I
 
I
V
 
I
L
 
N
M
 
M
A
 
S
S
|
S
M
 
I
G
 
E
G
 
G
I
 
F
S
 
V
G
 
G
A
 
D
G
 
P
I
 
S
T
 
L
V
 
G
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
T
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
V
 
R
L
 
I
M
 
M
A
 
S
K
 
K
S
 
S
-
 
A
-
 
A
L
 
L
A
 
D
D
 
C
A
 
A
L
 
L
G
 
K
P
 
D
D
 
Y
G
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
H
P
 
P
G
|
G
T
x
Y
I
|
I
D
 
K
T
|
T
E
 
P
L
|
L
L
 
V
R
 
D
T
 
D
S
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
-
A
 
A
Q
 
E
A
 
E
S
 
A
E
 
M
G
 
S
F
 
Q
R
 
R
Q
 
T
R
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
H
L
 
I
G
 
G
K
 
E
P
 
P
A
 
N
E
 
D
V
 
I
G
 
A
D
 
Y
A
 
I
V
 
C
A
 
V
F
 
Y
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
N
L
 
E
S
 
S
S
 
K
Y
 
F
V
 
A
S
 
T
G
 
G
T
 
S
A
 
E
L
 
F
L
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
L
 
T
A
 
A

1zk1A Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (mutant g37d) from lactobacillus brevis in complex with phenylethanol and NAD (see paper)
38% identity, 98% coverage: 4:256/258 of query aligns to 1:250/251 of 1zk1A

query
sites
1zk1A
S
 
S
N
 
N
I
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
T
S
x
L
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
I
 
T
R
 
K
A
 
F
A
 
V
E
 
E
H
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
V
V
 
M
I
 
I
V
 
T
-
x
D
-
 
R
-
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
G
E
 
E
-
 
K
A
 
A
P
 
A
R
 
K
E
 
S
G
 
V
G
 
G
E
 
T
P
 
P
T
 
D
A
 
Q
S
 
I
E
 
Q
I
 
-
R
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
S
 
-
V
 
-
F
 
F
V
 
F
K
 
Q
A
x
H
D
|
D
V
x
S
S
 
S
R
 
D
K
 
E
V
 
D
D
 
G
N
 
W
D
 
T
A
 
K
L
 
L
V
 
F
A
 
D
A
 
A
A
 
T
E
 
E
E
 
K
-
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
P
V
 
V
D
 
S
V
 
T
M
 
L
V
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
T
x
A
L
 
V
K
x
N
T
 
K
D
 
S
G
 
V
A
 
E
E
 
E
V
 
T
P
 
T
E
 
T
D
 
A
D
 
E
Y
 
W
R
 
R
R
 
K
L
 
L
M
 
L
S
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
G
P
 
V
L
 
F
F
 
F
G
 
G
A
 
T
Q
 
R
A
 
L
A
 
G
A
 
I
R
 
Q
Q
 
R
M
 
M
K
 
K
A
 
N
L
 
K
N
 
G
K
 
L
Q
 
G
G
 
A
S
 
S
I
 
I
V
 
I
L
 
N
M
|
M
A
 
S
S
|
S
M
 
I
G
 
E
G
 
G
I
 
F
S
 
V
G
 
G
A
 
D
G
 
P
I
 
S
T
 
L
V
 
G
A
 
A
Y
|
Y
S
 
N
T
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
V
 
R
L
 
I
M
 
M
A
 
S
K
 
K
S
 
S
-
 
A