SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMa1191 FitnessBrowser__Smeli:SMa1191 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3ozwA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with ketoconazole (see paper)
81% identity, 100% coverage: 1:403/403 of query aligns to 1:403/403 of 3ozwA

query
sites
3ozwA
M
 
M
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
K
 
K
D
 
D
I
 
I
V
 
V
K
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
A
 
D
I
 
I
I
 
I
Q
 
K
H
 
C
F
 
F
Y
 
Y
K
 
Q
R
 
R
M
 
M
F
 
F
Q
 
E
A
 
A
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
K
N
 
N
I
x
V
F
|
F
N
 
N
M
 
M
A
|
A
H
 
H
Q
 
Q
E
 
E
R
x
Q
G
 
G
E
 
Q
Q
|
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
A
|
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
E
N
 
N
I
 
I
E
 
E
N
 
D
P
 
P
E
 
N
S
 
S
L
 
L
S
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
K
D
 
N
I
|
I
A
 
A
H
 
N
K
 
K
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
|
L
G
 
G
V
|
V
R
 
K
P
 
P
E
 
E
Q
|
Q
Y
|
Y
P
 
P
I
 
I
V
|
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
L
|
L
L
 
L
A
 
A
S
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
D
E
 
D
I
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
W
 
W
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
|
Y
G
 
G
N
 
N
L
 
L
A
|
A
D
 
D
I
 
V
L
|
L
A
 
M
G
 
G
M
 
M
E
 
E
S
 
S
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
R
 
R
S
 
S
E
 
A
E
 
E
R
 
Q
A
 
P
G
 
G
G
 
G
W
 
W
A
 
K
G
 
G
W
 
W
R
 
R
R
 
T
F
 
F
I
 
V
V
 
I
R
 
R
E
 
E
K
 
K
N
 
R
P
 
P
E
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
F
 
F
V
 
I
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
V
D
 
N
F
 
F
E
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
A
V
 
I
Q
 
D
V
 
V
P
 
P
K
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
L
Q
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
R
|
R
Q
|
Q
Y
|
Y
S
|
S
L
 
L
S
 
S
D
 
D
S
 
M
P
 
P
N
 
N
G
 
G
R
 
R
S
 
S
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
|
S
V
|
V
K
|
K
R
 
R
E
|
E
D
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
P
G
 
Q
T
x
P
P
 
P
G
|
G
Y
|
Y
V
|
V
S
|
S
S
 
N
L
 
L
L
 
L
H
 
H
D
 
D
E
 
H
I
 
V
N
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
E
 
Q
L
 
V
K
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
G
 
G
N
 
S
F
 
F
Y
 
H
I
 
I
D
 
D
V
 
V
S
 
D
A
 
A
T
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
|
V
G
 
G
L
 
L
T
|
T
P
 
P
M
 
M
V
 
V
S
 
S
M
 
M
L
 
L
K
 
K
K
 
V
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
P
 
P
P
 
P
R
 
R
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
R
N
 
N
S
 
S
A
 
A
V
 
V
H
 
H
A
 
A
M
 
M
R
 
R
D
 
D
R
 
R
L
 
L
K
 
R
E
 
E
A
 
A
S
 
A
R
 
K
T
 
T
Y
 
Y
P
 
E
D
 
N
F
 
L
K
 
D
L
 
L
F
 
F
I
 
V
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
L
 
L
P
 
P
T
 
E
D
 
D
I
 
V
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
F
 
Y
A
 
P
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
V
 
V
E
 
K
K
 
Q
V
 
I
K
 
E
D
 
K
S
 
S
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
V
 
I
P
 
P
F
 
F
M
 
M
R
 
R
M
 
M
Q
 
Q
H
 
H
D
 
D
K
 
A
L
 
L
L
 
K
G
 
N
L
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
H
E
 
E
A
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
E
 
E
V
|
V
F
|
F
G
 
G
P
|
P
D
 
D
L
 
L
F
 
F
A
 
A
E
 
E

3ozvA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with econazole (see paper)
81% identity, 100% coverage: 1:403/403 of query aligns to 1:403/403 of 3ozvA

query
sites
3ozvA
M
 
M
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
K
 
K
D
 
D
I
 
I
V
 
V
K
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
A
 
D
I
|
I
I
 
I
Q
 
K
H
 
C
F
|
F
Y
 
Y
K
 
Q
R
 
R
M
 
M
F
 
F
Q
 
E
A
 
A
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
K
N
 
N
I
 
V
F
|
F
N
|
N
M
 
M
A
|
A
H
 
H
Q
|
Q
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
L
|
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
E
N
 
N
I
 
I
E
 
E
N
 
D
P
 
P
E
 
N
S
 
S
L
 
L
S
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
K
D
 
N
I
|
I
A
 
A
H
 
N
K
|
K
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
|
L
G
 
G
V
|
V
R
 
K
P
 
P
E
 
E
Q
|
Q
Y
|
Y
P
 
P
I
 
I
V
|
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
L
|
L
L
 
L
A
 
A
S
 
A
I
|
I
K
 
K
E
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
D
E
 
D
I
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
W
 
W
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
|
Y
G
 
G
N
 
N
L
 
L
A
|
A
D
 
D
I
 
V
L
|
L
A
 
M
G
 
G
M
 
M
E
 
E
S
 
S
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
R
 
R
S
 
S
E
 
A
E
 
E
R
 
Q
A
 
P
G
 
G
G
 
G
W
 
W
A
 
K
G
 
G
W
 
W
R
 
R
R
 
T
F
 
F
I
 
V
V
 
I
R
 
R
E
 
E
K
 
K
N
 
R
P
 
P
E
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
F
 
F
V
 
I
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
V
D
 
N
F
 
F
E
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
A
V
 
I
Q
 
D
V
 
V
P
 
P
K
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
L
Q
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
R
|
R
Q
|
Q
Y
|
Y
S
|
S
L
 
L
S
 
S
D
 
D
S
 
M
P
 
P
N
 
N
G
 
G
R
 
R
S
 
S
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
|
S
V
|
V
K
|
K
R
 
R
E
|
E
D
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
P
G
 
Q
T
x
P
P
 
P
G
|
G
Y
|
Y
V
|
V
S
|
S
S
 
N
L
 
L
L
 
L
H
 
H
D
 
D
E
 
H
I
 
V
N
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
E
 
Q
L
 
V
K
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
G
 
G
N
 
S
F
 
F
Y
 
H
I
 
I
D
 
D
V
 
V
S
 
D
A
 
A
T
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
|
V
G
 
G
L
 
L
T
|
T
P
 
P
M
 
M
V
 
V
S
 
S
M
 
M
L
 
L
K
 
K
K
 
V
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
P
 
P
P
 
P
R
 
R
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
R
N
 
N
S
 
S
A
 
A
V
 
V
H
 
H
A
 
A
M
 
M
R
 
R
D
 
D
R
 
R
L
 
L
K
 
R
E
 
E
A
 
A
S
 
A
R
 
K
T
 
T
Y
 
Y
P
 
E
D
 
N
F
 
L
K
 
D
L
 
L
F
 
F
I
 
V
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
L
 
L
P
 
P
T
 
E
D
 
D
I
 
V
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
F
 
Y
A
 
P
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
V
 
V
E
 
K
K
 
Q
V
 
I
K
 
E
D
 
K
S
 
S
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
V
 
I
P
 
P
F
 
F
M
 
M
R
 
R
M
 
M
Q
 
Q
H
 
H
D
 
D
K
 
A
L
 
L
L
 
K
G
 
N
L
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
H
E
 
E
A
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
D
 
D
L
 
L
F
 
F
A
 
A
E
 
E

3ozuA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with miconazole (see paper)
81% identity, 100% coverage: 1:403/403 of query aligns to 1:403/403 of 3ozuA

query
sites
3ozuA
M
 
M
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
K
 
K
D
 
D
I
 
I
V
 
V
K
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
A
 
D
I
 
I
I
|
I
Q
 
K
H
 
C
F
|
F
Y
 
Y
K
 
Q
R
 
R
M
 
M
F
 
F
Q
 
E
A
 
A
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
K
N
 
N
I
 
V
F
|
F
N
|
N
M
 
M
A
|
A
H
|
H
Q
 
Q
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
A
|
A
L
|
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
E
N
 
N
I
 
I
E
 
E
N
 
D
P
 
P
E
 
N
S
 
S
L
 
L
S
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
K
D
 
N
I
|
I
A
 
A
H
 
N
K
 
K
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
|
L
G
 
G
V
|
V
R
 
K
P
 
P
E
 
E
Q
|
Q
Y
|
Y
P
 
P
I
 
I
V
|
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
L
|
L
L
 
L
A
 
A
S
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
D
E
 
D
I
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
W
|
W
A
 
A
Q
 
Q
A
|
A
Y
|
Y
G
 
G
N
 
N
L
|
L
A
|
A
D
 
D
I
 
V
L
|
L
A
 
M
G
 
G
M
 
M
E
 
E
S
 
S
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
R
 
R
S
 
S
E
 
A
E
 
E
R
 
Q
A
 
P
G
 
G
G
 
G
W
 
W
A
 
K
G
 
G
W
 
W
R
 
R
R
 
T
F
 
F
I
 
V
V
 
I
R
 
R
E
 
E
K
 
K
N
 
R
P
 
P
E
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
F
 
F
V
 
I
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
V
D
 
N
F
 
F
E
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
A
V
 
I
Q
 
D
V
 
V
P
 
P
K
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
L
Q
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
R
|
R
Q
|
Q
Y
|
Y
S
|
S
L
 
L
S
 
S
D
 
D
S
 
M
P
 
P
N
 
N
G
 
G
R
 
R
S
 
S
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
|
S
V
|
V
K
|
K
R
 
R
E
|
E
D
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
P
G
 
Q
T
x
P
P
 
P
G
|
G
Y
|
Y
V
|
V
S
|
S
S
 
N
L
 
L
L
 
L
H
 
H
D
 
D
E
 
H
I
 
V
N
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
E
 
Q
L
 
V
K
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
G
 
G
N
 
S
F
 
F
Y
 
H
I
 
I
D
 
D
V
 
V
S
 
D
A
 
A
T
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
M
 
M
V
 
V
S
 
S
M
 
M
L
 
L
K
 
K
K
 
V
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
P
 
P
P
 
P
R
 
R
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
R
N
 
N
S
 
S
A
 
A
V
 
V
H
 
H
A
 
A
M
 
M
R
 
R
D
 
D
R
 
R
L
 
L
K
 
R
E
 
E
A
 
A
S
 
A
R
 
K
T
 
T
Y
 
Y
P
 
E
D
 
N
F
 
L
K
 
D
L
 
L
F
 
F
I
 
V
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
L
 
L
P
 
P
T
 
E
D
 
D
I
 
V
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
F
 
Y
A
 
P
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
V
 
V
E
 
K
K
 
Q
V
 
I
K
 
E
D
 
K
S
 
S
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
V
 
I
P
 
P
F
 
F
M
 
M
R
 
R
M
 
M
Q
 
Q
H
 
H
D
 
D
K
 
A
L
 
L
L
 
K
G
 
N
L
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
H
E
 
E
A
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
E
|
E
V
|
V
F
 
F
G
|
G
P
|
P
D
 
D
L
 
L
F
 
F
A
 
A
E
 
E

P39662 Flavohemoprotein; FHP; Flavohemoglobin; Hemoglobin-like protein; Nitric oxide dioxygenase; NO oxygenase; NOD; EC 1.14.12.17 from Cupriavidus necator (strain ATCC 17699 / DSM 428 / KCTC 22496 / NCIMB 10442 / H16 / Stanier 337) (Ralstonia eutropha) (see paper)
81% identity, 100% coverage: 1:403/403 of query aligns to 1:403/403 of P39662

query
sites
P39662
M
 
M
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
K
 
K
D
 
D
I
 
I
V
 
V
K
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
A
 
D
I
 
I
I
 
I
Q
 
K
H
 
C
F
 
F
Y
 
Y
K
 
Q
R
 
R
M
 
M
F
 
F
Q
 
E
A
 
A
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
K
N
 
N
I
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
M
A
 
A
H
 
H
Q
 
Q
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
|
A
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
E
N
 
N
I
 
I
E
 
E
N
 
D
P
 
P
E
 
N
S
 
S
L
 
L
S
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
K
D
 
N
I
 
I
A
 
A
H
 
N
K
 
K
H
 
H
A
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
K
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
V
|
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
L
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
D
E
 
D
I
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
W
 
W
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
L
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
V
L
 
L
A
 
M
G
 
G
M
 
M
E
 
E
S
 
S
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
R
 
R
S
 
S
E
 
A
E
 
E
R
 
Q
A
 
P
G
 
G
G
 
G
W
 
W
A
 
K
G
 
G
W
 
W
R
 
R
R
 
T
F
 
F
I
 
V
V
 
I
R
 
R
E
 
E
K
 
K
N
 
R
P
 
P
E
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
F
 
F
V
 
I
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
V
D
 
N
F
 
F
E
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
A
V
 
I
Q
 
D
V
 
V
P
 
P
K
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
L
Q
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
S
 
S
D
 
D
S
 
M
P
 
P
N
 
N
G
 
G
R
 
R
S
 
S
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
 
S
V
 
V
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
P
G
 
Q
T
 
P
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
S
 
N
L
 
L
L
 
L
H
 
H
D
 
D
E
 
H
I
 
V
N
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
E
 
Q
L
 
V
K
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
G
 
G
N
 
S
F
 
F
Y
 
H
I
 
I
D
 
D
V
 
V
S
 
D
A
 
A
T
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
M
 
M
V
 
V
S
 
S
M
 
M
L
 
L
K
 
K
K
 
V
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
P
 
P
P
 
P
R
 
R
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
R
N
 
N
S
 
S
A
 
A
V
 
V
H
 
H
A
 
A
M
 
M
R
 
R
D
 
D
R
 
R
L
 
L
K
 
R
E
 
E
A
 
A
S
 
A
R
 
K
T
 
T
Y
 
Y
P
 
E
D
 
N
F
 
L
K
 
D
L
 
L
F
 
F
I
 
V
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
L
 
L
P
 
P
T
 
E
D
 
D
I
 
V
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
F
 
Y
A
 
P
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
V
 
V
E
 
K
K
 
Q
V
 
I
K
 
E
D
 
K
S
 
S
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
V
 
I
P
 
P
F
 
F
M
 
M
R
 
R
M
 
M
Q
 
Q
H
 
H
D
 
D
K
 
A
L
 
L
L
 
K
G
 
N
L
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
H
E
 
E
A
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
D
 
D
L
 
L
F
 
F
A
 
A
E
 
E

1cqxA Crystal structure of the flavohemoglobin from alcaligenes eutrophus at 1.75 a resolution (see paper)
80% identity, 100% coverage: 1:403/403 of query aligns to 1:403/403 of 1cqxA

query
sites
1cqxA
M
 
M
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
K
 
K
D
 
D
I
 
I
V
 
V
K
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
A
 
D
I
 
I
I
 
I
Q
 
K
H
 
C
F
 
F
Y
 
Y
K
 
Q
R
 
R
M
 
M
F
 
F
Q
 
E
A
 
A
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
K
N
 
N
I
 
V
F
|
F
N
|
N
M
 
M
A
|
A
H
|
H
Q
 
Q
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
E
N
 
N
I
 
I
E
 
E
N
 
D
P
 
P
E
 
N
S
 
S
L
 
L
S
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
K
D
 
N
I
|
I
A
 
A
H
 
N
K
 
K
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
|
L
G
 
G
V
|
V
R
 
K
P
 
P
E
 
E
Q
|
Q
Y
|
Y
P
 
P
I
 
I
V
|
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
L
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
D
E
 
D
I
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
W
 
W
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
|
Y
G
 
G
N
 
N
L
|
L
A
|
A
D
 
D
I
 
V
L
|
L
A
 
M
G
 
G
M
 
M
E
 
E
S
 
S
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
R
 
R
S
 
S
E
 
A
E
 
E
R
 
Q
A
 
P
G
 
G
G
 
G
W
 
W
A
 
K
G
 
G
W
 
W
R
 
R
R
 
T
F
 
F
I
 
V
V
 
I
R
 
R
E
 
E
K
 
K
N
 
R
P
 
P
E
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
F
 
F
V
 
I
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
V
D
 
N
F
 
F
E
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
T
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
A
V
 
I
Q
 
D
V
 
V
P
 
P
K
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
L
Q
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
R
|
R
Q
|
Q
Y
|
Y
S
|
S
L
 
L
S
 
S
D
 
D
S
 
M
P
 
P
N
 
N
G
 
G
R
 
R
S
 
T
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
|
S
V
 
V
K
 
K
R
 
R
E
|
E
D
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
P
G
x
Q
T
x
P
P
 
P
G
|
G
Y
|
Y
V
|
V
S
|
S
S
 
N
L
 
L
L
 
L
H
 
H
D
 
D
E
 
H
I
 
V
N
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
E
 
Q
L
 
V
K
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
G
 
G
N
 
S
F
 
F
Y
 
H
I
 
I
D
 
D
V
 
V
S
 
D
A
 
A
T
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
M
 
M
V
 
V
S
 
S
M
 
M
L
 
L
K
 
K
K
 
V
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
P
 
P
P
 
P
R
 
R
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
R
N
 
N
S
 
S
A
 
A
V
 
V
H
 
H
A
 
A
M
 
M
R
 
R
D
 
D
R
 
R
L
 
L
K
 
R
E
 
E
A
 
A
S
 
A
R
 
K
T
 
T
Y
 
Y
P
 
E
D
 
N
F
 
L
K
 
D
L
 
L
F
 
F
I
 
V
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
L
 
L
P
 
P
T
 
E
D
 
D
I
 
V
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
F
 
Y
A
 
P
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
V
 
V
E
 
K
K
 
Q
V
 
I
K
 
E
D
 
K
S
 
S
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
V
 
I
P
 
P
F
 
F
M
 
M
R
 
R
M
 
M
Q
 
Q
H
 
H
D
 
D
K
 
A
L
 
L
L
 
K
G
 
N
L
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
H
E
 
E
A
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
E
 
E
V
|
V
F
 
F
G
|
G
P
|
P
D
 
D
L
 
L
F
 
F
A
 
A
E
 
E

1gvhA The x-ray structure of ferric escherichia coli flavohemoglobin reveals an unespected geometry of the distal heme pocket (see paper)
45% identity, 99% coverage: 1:398/403 of query aligns to 1:392/396 of 1gvhA

query
sites
1gvhA
M
 
M
L
 
L
T
 
D
Q
 
A
K
 
Q
T
 
T
K
 
I
D
 
A
I
 
T
V
 
V
K
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
I
P
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
V
Q
 
E
H
 
T
G
 
G
Y
 
P
A
 
K
I
 
L
I
 
T
Q
 
A
H
 
H
F
 
F
Y
 
Y
K
 
D
R
 
R
M
 
M
F
 
F
Q
 
T
A
 
H
H
 
N
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
K
N
 
E
I
 
I
F
|
F
N
 
N
M
 
M
A
x
S
H
 
N
Q
|
Q
E
 
R
R
x
N
G
 
G
E
 
D
Q
|
Q
Q
 
R
Q
 
E
A
|
A
L
|
L
A
 
F
R
 
N
A
|
A
V
x
I
Y
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
S
N
 
N
I
 
I
E
 
E
N
 
N
P
 
L
E
 
P
S
 
A
L
 
L
S
 
L
A
 
P
V
 
A
L
 
V
K
 
E
D
 
K
I
|
I
A
 
A
H
 
Q
K
|
K
H
|
H
A
 
T
S
 
S
L
 
F
G
 
Q
V
x
I
R
 
K
P
 
P
E
 
E
Q
|
Q
Y
|
Y
P
 
N
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
L
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
T
I
 
L
K
 
D
E
 
E
V
 
M
L
 
F
G
 
-
D
 
-
A
 
S
A
 
P
T
 
G
D
 
Q
E
 
E
I
 
V
I
 
L
S
 
D
A
 
A
W
 
W
A
 
G
Q
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
N
 
V
L
|
L
A
 
A
D
 
N
I
 
V
L
x
F
A
 
I
G
 
N
M
 
R
E
 
E
S
 
A
E
 
E
L
 
I
Y
 
Y
E
 
N
R
 
E
S
 
N
E
 
A
E
 
S
R
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
G
W
 
W
A
 
E
G
 
G
W
 
T
R
 
R
R
 
D
F
 
F
I
 
R
V
 
I
R
 
V
E
 
A
K
 
K
N
 
T
P
 
P
E
 
R
S
 
S
D
 
A
V
 
L
I
 
I
T
 
T
S
 
S
F
 
F
V
 
E
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
P
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
E
F
 
Y
E
 
R
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
T
 
L
S
 
G
V
 
V
A
 
W
V
 
L
Q
 
K
V
 
P
P
 
E
K
 
G
L
 
F
G
 
P
Y
 
H
Q
 
Q
Q
 
E
I
 
I
R
|
R
Q
|
Q
Y
|
Y
S
|
S
L
 
L
S
 
T
D
 
R
S
 
K
P
 
P
N
 
D
G
 
G
R
 
K
S
 
G
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
x
A
V
|
V
K
 
K
R
 
R
E
|
E
D
 
E
G
 
G
G
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
G
|
G
Y
x
Q
V
|
V
S
|
S
S
 
N
L
 
W
L
 
L
H
 
H
D
 
N
E
 
H
I
 
A
N
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
E
 
V
L
 
V
K
 
K
L
 
L
A
 
V
A
 
A
P
 
P
Y
 
A
G
 
G
N
 
D
F
 
F
Y
 
F
I
 
M
D
 
A
V
 
V
S
 
A
A
 
D
T
 
D
T
 
T
P
 
P
I
 
V
V
 
T
L
 
L
I
 
I
S
 
S
G
 
A
G
 
G
V
|
V
G
 
G
L
 
Q
T
|
T
P
 
P
M
 
M
V
 
L
S
 
A
M
 
M
-
 
L
-
 
D
-
 
T
L
 
L
K
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
G
Q
 
H
T
 
T
P
 
A
P
 
-
R
 
-
K
 
Q
V
 
V
V
 
N
F
 
W
V
 
F
H
 
H
G
 
A
A
 
A
R
 
E
N
 
N
S
 
G
A
 
D
V
 
V
H
 
H
A
 
A
M
 
F
R
 
A
D
 
D
R
 
E
L
 
V
K
 
K
E
 
E
A
 
L
S
 
G
R
 
Q
T
 
S
Y
 
L
P
 
P
D
 
R
F
 
F
K
 
T
L
 
A
F
 
H
I
 
T
F
 
W
Y
 
Y
D
 
R
E
 
Q
P
 
P
L
 
S
P
 
E
T
 
A
D
 
D
I
 
R
E
 
A
G
 
K
R
 
G
D
 
Q
Y
 
F
D
 
D
F
 
S
A
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
M
D
 
D
V
 
L
E
 
S
K
 
K
V
 
L
K
 
E
D
 
G
S
 
A
I
 
F
L
 
S
L
 
D
D
 
P
D
 
T
A
 
M
D
 
Q
Y
 
F
Y
 
Y
I
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
V
 
V
P
 
G
F
 
F
M
 
M
R
 
Q
M
 
F
Q
 
T
H
 
A
D
 
K
K
 
Q
L
 
L
L
 
V
G
 
D
L
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
K
E
 
Q
A
 
E
R
 
N
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
E
|
E
V
 
C
F
|
F
G
 
G
P
 
P

Sites not aligning to the query:

P24232 Flavohemoprotein; Flavohemoglobin; HMP; Hemoglobin-like protein; Nitric oxide dioxygenase; NO oxygenase; NOD; EC 1.14.12.17 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
45% identity, 99% coverage: 1:398/403 of query aligns to 1:392/396 of P24232

query
sites
P24232
M
 
M
L
 
L
T
 
D
Q
 
A
K
 
Q
T
 
T
K
 
I
D
 
A
I
 
T
V
 
V
K
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
I
P
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
V
Q
 
E
H
 
T
G
 
G
Y
 
P
A
 
K
I
 
L
I
 
T
Q
 
A
H
 
H
F
 
F
Y
|
Y
K
 
D
R
 
R
M
 
M
F
 
F
Q
 
T
A
 
H
H
 
N
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
K
N
 
E
I
 
I
F
 
F
N
 
N
M
 
M
A
 
S
H
 
N
Q
 
Q
E
 
R
R
 
N
G
 
G
E
 
D
Q
 
Q
Q
 
R
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
F
R
 
N
A
 
A
V
 
I
Y
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
S
N
 
N
I
 
I
E
 
E
N
 
N
P
 
L
E
 
P
S
 
A
L
 
L
S
 
L
A
 
P
V
 
A
L
 
V
K
 
E
D
 
K
I
 
I
A
 
A
H
 
Q
K
 
K
H
 
H
A
 
T
S
 
S
L
 
F
G
 
Q
V
 
I
R
 
K
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
Y
|
Y
P
 
N
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
L
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
T
I
 
L
K
 
D
E
 
E
V
 
M
L
 
F
G
 
-
D
 
-
A
 
S
A
 
P
T
 
G
D
 
Q
E
 
E
I
 
V
I
 
L
S
 
D
A
 
A
W
 
W
A
 
G
Q
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
N
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
N
I
 
V
L
 
F
A
 
I
G
 
N
M
 
R
E
|
E
S
 
A
E
 
E
L
 
I
Y
 
Y
E
 
N
R
 
E
S
 
N
E
 
A
E
 
S
R
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
G
W
 
W
A
 
E
G
 
G
W
 
T
R
 
R
R
 
D
F
 
F
I
 
R
V
 
I
R
 
V
E
 
A
K
 
K
N
 
T
P
 
P
E
 
R
S
 
S
D
 
A
V
 
L
I
 
I
T
 
T
S
 
S
F
 
F
V
 
E
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
P
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
E
F
 
Y
E
 
R
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
T
 
L
S
 
G
V
 
V
A
 
W
V
 
L
Q
 
K
V
 
P
P
 
E
K
 
G
L
 
F
G
 
P
Y
 
H
Q
 
Q
Q
 
E
I
 
I
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
S
 
T
D
 
R
S
 
K
P
 
P
N
 
D
G
 
G
R
 
K
S
 
G
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
 
A
V
 
V
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
E
G
 
G
G
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
G
Y
 
Q
V
 
V
S
 
S
S
 
N
L
 
W
L
 
L
H
 
H
D
 
N
E
 
H
I
 
A
N
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
E
 
V
L
 
V
K
 
K
L
 
L
A
 
V
A
 
A
P
 
P
Y
 
A
G
 
G
N
 
D
F
 
F
Y
 
F
I
 
M
D
 
A
V
 
V
S
 
A
A
 
D
T
 
D
T
 
T
P
 
P
I
 
V
V
 
T
L
 
L
I
 
I
S
 
S
G
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
Q
T
 
T
P
 
P
M
 
M
V
 
L
S
 
A
M
 
M
-
 
L
-
 
D
-
 
T
L
 
L
K
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
G
Q
 
H
T
 
T
P
 
A
P
 
-
R
 
-
K
 
Q
V
 
V
V
 
N
F
 
W
V
 
F
H
 
H
G
 
A
A
 
A
R
 
E
N
 
N
S
 
G
A
 
D
V
 
V
H
 
H
A
 
A
M
 
F
R
 
A
D
 
D
R
 
E
L
 
V
K
 
K
E
 
E
A
 
L
S
 
G
R
 
Q
T
 
S
Y
 
L
P
 
P
D
 
R
F
 
F
K
 
T
L
 
A
F
 
H
I
 
T
F
 
W
Y
 
Y
D
 
R
E
 
Q
P
 
P
L
 
S
P
 
E
T
 
A
D
 
D
I
 
R
E
 
A
G
 
K
R
 
G
D
 
Q
Y
 
F
D
 
D
F
 
S
A
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
M
D
 
D
V
 
L
E
 
S
K
 
K
V
 
L
K
 
E
D
 
G
S
 
A
I
 
F
L
 
S
L
 
D
D
 
P
D
 
T
A
 
M
D
 
Q
Y
 
F
Y
 
Y
I
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
V
 
V
P
 
G
F
 
F
M
 
M
R
 
Q
M
 
F
Q
 
T
H
 
A
D
 
K
K
 
Q
L
 
L
L
 
V
G
 
D
L
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
K
E
 
Q
A
 
E
R
 
N
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
E
 
E
V
 
C
F
 
F
G
 
G
P
 
P

4g1bA X-ray structure of yeast flavohemoglobin in complex with econazole (see paper)
37% identity, 99% coverage: 1:400/403 of query aligns to 1:394/398 of 4g1bA

query
sites
4g1bA
M
 
M
L
 
L
T
 
A
Q
 
E
K
 
K
T
 
T
K
 
R
D
 
S
I
 
I
V
 
I
K
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
E
Q
 
Q
H
 
Q
G
 
G
Y
 
T
A
 
V
I
 
I
I
 
T
Q
 
R
H
 
T
F
|
F
Y
|
Y
K
 
K
R
 
N
M
 
M
F
 
L
Q
 
T
A
 
E
H
 
H
P
 
T
E
 
E
L
 
L
K
 
L
N
 
N
I
|
I
F
|
F
N
|
N
M
 
R
A
x
T
H
x
N
Q
 
Q
E
 
K
R
x
V
G
 
G
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
P
Q
 
N
A
|
A
L
|
L
A
 
A
R
 
T
A
x
T
V
 
V
Y
 
L
A
 
A
Y
 
A
A
 
A
A
 
K
N
 
N
I
 
I
E
 
D
N
 
D
P
 
L
E
 
S
S
 
V
L
 
L
S
 
M
A
 
D
V
 
H
L
 
V
K
 
K
D
x
Q
I
|
I
A
 
G
H
 
H
K
|
K
H
|
H
A
 
R
S
 
A
L
|
L
G
 
Q
V
x
I
R
 
K
P
 
P
E
 
E
Q
x
H
Y
|
Y
P
 
P
I
 
I
V
|
V
G
 
G
E
 
E
H
 
Y
L
|
L
L
 
L
A
 
K
S
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
P
E
 
E
I
 
I
I
 
I
S
 
N
A
 
A
W
 
W
A
 
G
Q
 
E
A
 
A
Y
|
Y
G
 
Q
N
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
D
I
 
I
L
x
F
A
 
I
G
 
T
M
 
V
E
 
E
S
 
K
E
 
K
L
 
M
Y
 
Y
E
 
E
R
 
E
S
 
A
E
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
L
W
 
W
A
 
P
G
 
G
W
 
W
R
 
K
R
 
P
F
 
F
I
 
E
V
 
I
R
 
T
E
 
A
K
 
K
N
 
E
P
 
Y
E
 
V
S
 
A
D
 
S
V
 
D
I
 
I
T
 
V
S
 
E
F
 
F
V
 
T
L
 
V
E
 
K
P
 
P
A
 
K
D
 
F
G
 
G
G
 
S
P
 
G
V
 
I
A
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
L
D
 
P
F
 
I
E
 
T
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
T
 
I
S
 
T
V
 
V
A
 
N
V
 
T
Q
 
H
V
 
P
P
 
I
K
 
R
L
 
Q
-
 
E
-
 
N
G
 
Q
Y
 
Y
Q
 
D
Q
 
A
I
 
L
R
|
R
Q
x
H
Y
|
Y
S
|
S
L
 
L
S
 
C
D
 
S
S
 
A
P
 
S
N
 
T
G
 
K
R
 
N
S
 
G
Y
 
L
R
 
R
I
 
F
S
x
A
V
 
V
K
|
K
R
 
M
E
|
E
D
 
A
G
 
A
G
 
R
L
 
E
G
 
N
T
x
F
P
|
P
-
 
A
G
|
G
Y
x
L
V
|
V
S
|
S
S
 
E
L
 
Y
L
 
L
H
 
H
D
 
K
E
 
D
I
 
A
N
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
D
E
 
E
L
 
I
K
 
K
L
 
L
A
 
S
A
 
A
P
 
P
Y
 
A
G
 
G
N
 
D
F
 
F
Y
 
A
I
 
I
D
 
N
V
 
K
S
 
E
A
 
L
T
 
I
-
 
H
-
 
Q
-
 
N
-
 
E
T
 
V
P
 
P
I
 
L
V
 
V
L
 
L
I
 
L
S
 
S
G
 
S
G
 
G
V
|
V
G
 
G
L
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
L
V
 
L
S
 
A
M
 
M
L
 
L
K
 
E
K
 
E
A
 
Q
L
 
V
Q
 
K
T
 
C
-
 
N
P
 
P
P
 
N
R
 
R
K
 
P
V
 
I
V
 
Y
F
 
W
V
 
I
H
 
Q
G
 
S
A
 
S
R
 
Y
N
 
D
S
 
E
A
 
K
V
 
T
H
 
Q
A
 
A
M
 
F
R
 
K
D
 
K
R
 
H
L
 
V
K
 
D
E
 
E
A
 
L
S
 
L
R
 
A
T
 
E
Y
 
C
P
 
A
D
 
N
F
 
V
K
 
D
L
 
K
F
 
I
I
 
I
F
 
V
Y
 
H
D
 
T
E
 
D
P
 
T
L
 
E
P
 
P
T
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
D
 
-
Y
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
L
V
 
I
D
 
N
V
 
A
E
 
A
K
 
F
V
 
L
K
 
K
D
 
E
S
 
K
I
 
S
L
 
P
L
 
A
D
 
-
D
 
H
A
 
A
D
 
D
Y
 
V
Y
 
Y
I
 
T
C
 
C
G
 
G
P
 
S
V
 
L
P
 
A
F
 
F
M
 
M
R
 
Q
M
 
A
Q
 
M
H
 
I
D
 
G
K
 
H
L
 
L
L
 
K
G
 
E
L
 
L
G
 
E
I
 
H
T
 
R
E
 
D
A
 
D
R
 
M
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
E
 
E
V
 
P
F
|
F
G
 
G
P
|
P
D
x
K
L
x
M

Q03331 Flavohemoprotein; Flavohemoglobin; Hemoglobin-like protein; Nitric oxide dioxygenase; NO oxygenase; NOD; EC 1.14.12.17 from Candida norvegensis (Yeast) (Candida mycoderma) (see paper)
30% identity, 99% coverage: 2:398/403 of query aligns to 13:385/390 of Q03331

query
sites
Q03331
L
 
L
T
 
T
Q
 
P
K
 
T
T
 
E
K
 
I
D
 
N
I
 
F
V
 
L
K
 
Q
A
 
S
T
 
L
A
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
V
A
 
K
Q
 
E
H
 
H
G
 
G
Y
 
V
A
 
T
I
 
V
I
 
T
Q
 
S
H
 
T
F
 
M
Y
 
Y
K
 
K
R
 
Y
M
 
M
F
 
F
Q
 
Q
A
 
T
H
 
Y
P
 
P
E
 
E
L
 
V
K
 
R
N
 
S
I
 
Y
F
 
F
N
 
N
M
 
M
A
 
T
H
 
N
Q
 
Q
E
 
K
R
 
T
G
 
G
E
 
R
Q
 
Q
Q
 
P
Q
 
K
A
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
F
A
 
S
V
 
L
Y
 
Y
A
 
Q
Y
 
Y
A
 
I
A
 
L
N
 
H
I
 
L
E
 
N
N
 
D
P
 
L
E
 
T
S
 
P
L
 
I
S
 
S
A
 
G
V
 
F
L
 
V
K
 
N
D
 
Q
I
 
I
A
 
V
H
 
L
K
 
K
H
 
H
A
 
C
S
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
K
P
 
P
E
 
D
Q
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
I
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
S
L
 
L
L
 
V
A
 
Q
S
 
A
I
 
F
K
 
K
E
 
M
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
D
D
 
E
E
 
H
I
 
F
I
 
V
S
 
E
A
 
V
W
 
F
A
 
K
Q
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
I
 
T
L
 
L
A
 
I
G
 
D
M
 
A
E
 
E
S
 
A
E
 
S
L
 
V
Y
 
Y
E
 
-
R
 
-
S
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
K
A
 
T
G
 
L
G
 
A
W
 
W
A
 
E
G
 
E
W
 
F
R
 
K
R
 
D
F
 
F
I
 
R
V
 
V
R
 
T
E
 
K
K
 
L
N
 
V
P
 
K
E
 
E
S
 
A
D
 
E
V
 
D
I
 
V
T
 
T
S
 
S
F
 
V
V
 
Y
L
 
L
E
 
T
P
 
P
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
P
 
K
V
 
L
A
 
K
D
 
P
F
 
I
E
 
I
P
 
P
G
 
G
Q
 
E
Y
 
Y
T
 
I
S
 
S
V
 
F
A
 
R
-
 
W
-
 
D
V
 
I
Q
 
H
V
 
N
P
 
P
K
 
D
L
 
I
G
 
T
Y
 
D
Q
 
I
Q
 
Q
I
 
P
R
 
R
Q
 
E
Y
 
Y
S
 
S
L
 
I
S
 
S
D
 
Q
S
 
D
P
 
V
N
 
K
G
 
E
R
 
N
S
 
E
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
 
S
V
 
V
K
 
R
R
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
D
P
 
I
G
 
G
Y
 
I
V
 
V
S
 
S
S
 
D
L
 
Y
L
 
I
H
 
N
D
 
K
E
 
K
I
 
L
N
 
Q
V
 
V
G
 
G
D
 
D
E
 
I
L
 
V
K
 
P
L
 
V
A
 
H
A
 
A
P
 
P
Y
 
V
G
 
G
N
 
T
F
 
M
-
 
K
Y
 
Y
I
 
D
D
 
S
V
 
I
S
 
S
A
 
K
T
 
K
T
 
G
P
 
K
I
 
V
V
 
A
L
 
V
I
 
L
S
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
I
T
 
T
P
 
P
M
 
M
V
 
I
S
 
P
M
 
I
L
 
I
K
 
E
K
 
H
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
T
 
D
P
 
G
P
 
-
R
 
K
K
 
D
V
 
V
V
 
E
F
 
L
V
 
Y
H
 
Y
G
 
S
A
 
N
R
 
R
N
 
S
S
 
Y
A
 
Q
V
 
S
H
 
E
A
 
P
M
 
F
R
 
R
D
 
E
R
 
F
L
 
F
K
 
S
E
 
N
A
 
L
S
 
E
R
 
K
-
 
E
T
 
N
Y
 
N
P
 
G
D
 
K
F
 
F
K
 
K
L
 
L
F
 
N
I
 
N
F
 
Y
Y
 
-
D
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
T
 
-
D
 
-
I
 
I
E
 
S
G
 
A
R
 
E
D
 
N
Y
 
Q
D
 
K
F
 
L
A
 
Q
G
 
-
L
 
V
V
 
K
D
 
D
V
 
L
E
 
E
K
 
H
V
 
I
K
 
N
D
 
P
S
 
-
I
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
D
D
 
E
A
 
Y
D
 
D
Y
 
V
Y
 
Y
I
 
L
C
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
V
P
 
A
F
 
Y
M
 
M
R
 
H
M
 
E
Q
 
F
H
 
K
D
 
T
K
 
Y
L
 
L
L
 
V
G
 
G
L
 
K
G
 
G
I
 
V
T
 
S
E
 
D
A
 
L
R
 
K
I
 
M
H
 
-
Y
 
-
E
 
E
V
 
F
F
 
F
G
 
G
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4eh1A Crystal structure of the flavohem-like-fad/NAD binding domain of nitric oxide dioxygenase from vibrio cholerae o1 biovar el tor
42% identity, 61% coverage: 155:398/403 of query aligns to 4:237/237 of 4eh1A

query
sites
4eh1A
R
 
R
R
 
T
F
 
F
I
 
V
V
 
V
R
 
R
E
 
E
K
 
K
N
 
Q
P
 
V
E
 
E
S
 
S
D
 
A
V
 
Y
I
 
V
T
 
T
S
 
S
F
 
F
V
 
V
L
 
L
E
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
P
 
A
V
 
V
A
 
L
D
 
D
F
 
Y
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
T
 
I
S
 
G
V
 
I
A
 
E
V
 
V
Q
 
T
V
 
P
P
 
E
K
 
G
L
 
S
G
 
D
Y
 
Y
Q
 
R
Q
 
E
I
 
I
R
|
R
Q
|
Q
Y
|
Y
S
|
S
L
 
L
S
 
S
D
 
H
S
 
A
P
 
S
N
 
N
G
 
G
R
 
R
S
 
E
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
|
S
V
|
V
K
 
K
R
 
R
E
|
E
D
 
G
G
 
V
G
 
G
L
 
S
G
 
D
T
x
N
P
 
P
G
|
G
Y
x
L
V
|
V
S
|
S
S
 
H
L
 
Y
L
 
L
H
 
H
D
 
N
E
 
N
I
 
V
N
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
D
E
 
S
L
 
V
K
 
K
L
 
L
A
 
Y
A
 
A
P
 
P
Y
 
A
G
 
G
N
 
D
F
 
F
Y
 
F
I
 
Y
D
 
-
V
 
V
S
 
E
A
 
R
T
 
E
T
 
R
P
 
P
I
 
V
V
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
S
G
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
A
T
|
T
P
 
P
M
 
M
V
 
Q
S
 
A
M
 
I
L
 
L
K
 
H
K
 
T
A
 
L
L
 
A
Q
 
K
T
 
Q
P
 
N
P
 
K
R
 
S
K
 
G
V
 
V
V
 
T
F
 
Y
V
 
L
H
 
Y
G
 
A
A
 
C
R
 
N
N
 
S
S
 
A
A
 
K
V
 
E
H
 
H
A
 
T
M
 
F
R
 
A
D
 
Q
R
 
E
L
 
T
K
 
A
E
 
Q
A
 
L
S
 
I
R
 
A
T
 
Q
Y
 
Q
P
 
G
D
 
W
F
 
M
K
 
Q
L
 
Q
F
 
V
I
 
W
F
 
Y
Y
 
R
D
 
D
E
 
E
P
 
S
L
 
A
P
 
D
T
 
D
D
 
V
I
 
L
E
 
Q
G
 
G
R
 
-
D
 
E
Y
 
M
D
 
Q
F
 
L
A
 
A
G
 
E
L
 
L
V
 
I
D
 
-
V
 
-
E
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
S
 
-
I
 
L
L
 
P
L
 
I
D
 
E
D
 
D
A
 
G
D
 
D
Y
 
F
Y
 
Y
I
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
V
 
I
P
 
G
F
 
F
M
 
M
R
 
Q
M
 
Y
Q
 
V
H
 
V
D
 
K
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
A
L
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
D
E
 
K
A
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
E
|
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P

6o0aA Crystal structure of flavohemoglobin from malassezia yamatoensis with bound fad and heme determined by iron sad phasing (see paper)
31% identity, 98% coverage: 2:397/403 of query aligns to 3:383/383 of 6o0aA

query
sites
6o0aA
L
 
L
T
 
S
Q
 
T
K
 
K
T
 
S
K
 
Q
D
 
P
I
 
V
V
 
I
K
 
Q
A
 
A
T
 
T
A
 
L
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
Q
 
E
H
 
R
G
 
I
Y
 
P
A
 
H
I
 
I
I
 
T
Q
 
P
H
 
V
F
 
F
Y
 
Y
K
 
G
R
 
D
M
 
M
F
 
L
Q
 
Q
A
 
A
H
 
R
P
 
P
E
 
D
L
 
L
K
 
L
N
 
D
-
 
G
I
x
M
F
|
F
N
x
S
M
 
R
A
x
S
H
 
A
Q
 
Q
E
x
R
R
x
D
G
 
G
E
 
T
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
R
A
 
A
L
|
L
A
 
A
R
 
G
A
x
S
V
 
I
Y
 
A
A
 
I
Y
 
F
A
 
A
A
 
Q
N
 
W
I
 
I
-
 
L
E
 
Q
N
 
H
P
 
P
E
 
N
S
 
T
L
 
F
-
 
P
S
 
E
A
 
E
V
 
M
L
 
L
K
 
S
D
x
R
I
x
V
A
 
A
H
 
N
K
 
K
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
|
L
G
 
G
V
x
L
R
 
Q
P
 
P
E
 
D
Q
x
E
Y
|
Y
P
 
D
I
 
T
V
|
V
G
 
Y
E
 
K
H
 
Y
L
 
L
L
 
F
A
 
G
S
 
A
I
 
I
K
 
A
E
 
K
V
 
D
L
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
P
E
 
D
I
 
I
I
 
V
S
 
E
A
 
A
W
 
W
A
 
T
Q
 
E
A
 
V
Y
|
Y
G
 
W
N
 
L
L
|
L
A
 
A
D
 
R
I
 
A
L
 
L
A
 
I
G
 
N
M
 
L
E
 
E
S
 
R
E
 
K
L
 
L
Y
 
Y
E
 
-
R
 
-
S
 
-
E
 
A
E
 
Q
R
 
Q
A
 
A
G
 
N
G
 
N
W
 
I
A
 
V
G
 
R
W
 
A
R
 
K
R
 
F
F
 
K
I
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
R
K
 
T
N
 
Q
P
 
V
E
 
T
S
 
K
D
 
D
V
 
V
I
 
V
T
 
-
S
 
D
F
 
M
V
 
V
L
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
G
 
N
G
 
T
P
 
A
V
 
M
A
 
T
D
 
P
F
 
G
E
 
K
P
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
T
 
I
S
 
S
V
 
I
A
 
Y
V
 
A
Q
 
R
V
 
T
P
 
S
K
 
D
L
 
-
G
 
G
Y
 
L
Q
 
L
Q
 
Q
I
 
P
R
|
R
Q
|
Q
Y
x
F
S
x
T
L
 
L
S
 
L
D
 
P
S
 
S
P
 
E
N
 
E
G
 
T
R
 
Q
S
 
R
Y
 
-
R
 
R
I
 
I
S
 
A
V
 
I
K
|
K
R
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
L
G
x
D
T
 
P
P
x
H
G
|
G
Y
x
E
V
x
M
S
x
T
S
 
T
L
 
I
L
 
F
H
 
Q
D
 
N
E
 
Q
I
 
-
N
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
A
E
 
L
L
 
L
K
 
D
L
 
I
A
 
S
A
 
N
P
 
P
Y
 
Y
G
 
G
N
 
D
F
 
M
Y
 
T
I
 
L
D
 
E
V
 
T
S
 
L
A
 
E
T
 
T
-
 
D
-
 
P
-
 
N
T
 
S
P
 
P
I
 
L
V
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
C
G
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
V
T
|
T
P
 
P
M
 
V
V
 
L
S
 
A
M
 
F
L
 
V
K
 
E
K
 
K
-
 
L
A
 
A
L
 
A
Q
 
Q
T
 
K
P
 
S
P
 
E
R
 
R
K
 
E
V
 
V
V
 
M
F
 
I
V
 
I
H
 
A
G
 
S
A
 
S
R
 
R
N
 
S
S
 
L
A
 
A
V
 
E
H
 
A
A
 
P
M
 
L
R
 
R
D
 
G
R
 
E
L
 
L
K
 
L
E
 
E
A
 
R
S
 
A
R
 
K
T
 
E
Y
 
L
P
 
K
D
 
K
F
 
A
K
 
K
L
 
V
F
 
-
I
 
-
F
 
-
Y
 
-
D
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
L
P
 
Y
T
 
G
D
 
T
I
 
T
E
 
Q
G
 
E
R
 
K
D
 
D
Y
 
G
D
 
D
F
 
F
A
 
V
G
 
G
L
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
V
E
 
S
K
 
T
V
 
L
K
 
D
D
 
-
S
 
-
I
 
-
L
 
I
L
 
P
D
 
A
D
 
N
A
 
A
D
 
S
Y
 
V
Y
 
F
I
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
V
 
L
P
 
K
F
 
F
M
 
M
R
 
Q
M
 
E
Q
 
M
H
 
R
D
 
S
K
 
H
L
 
L
L
 
V
G
 
E
L
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
A
E
 
K
A
 
H
R
 
K
I
 
I
H
 
F
Y
 
Y
E
|
E
V
 
I
F
|
F
G
|
G

3tm9A Y29a mutant of vitreoscilla stercoraria hemoglobin (see paper)
50% identity, 36% coverage: 1:146/403 of query aligns to 1:146/146 of 3tm9A

query
sites
3tm9A
M
 
M
L
 
L
T
 
D
Q
 
Q
K
 
Q
T
 
T
K
 
I
D
 
N
I
 
I
V
 
I
K
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
K
Q
 
E
H
 
H
G
 
G
Y
 
V
A
 
T
I
 
I
I
 
T
Q
 
T
H
 
T
F
 
F
Y
 
A
K
 
K
R
 
N
M
 
L
F
 
F
Q
 
A
A
 
K
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
V
K
 
R
N
 
P
I
x
L
F
|
F
N
 
D
M
 
M
A
 
G
H
 
R
Q
 
Q
E
 
E
R
 
S
G
 
L
E
 
E
Q
|
Q
Q
 
P
Q
 
K
A
 
A
L
|
L
A
 
A
R
 
M
A
x
T
V
 
V
Y
 
L
A
 
A
Y
 
A
A
 
A
A
 
Q
N
 
N
I
 
I
E
 
E
N
 
N
P
 
L
E
 
P
S
 
A
L
 
I
S
 
L
A
 
P
V
 
A
L
 
V
K
 
K
D
 
K
I
|
I
A
 
A
H
 
V
K
|
K
H
|
H
A
 
C
S
 
Q
L
 
A
G
 
G
V
|
V
R
 
A
P
 
A
E
 
A
Q
 
H
Y
|
Y
P
 
P
I
 
I
V
|
V
G
 
G
E
 
Q
H
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
G
S
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
D
E
 
D
I
 
I
I
 
L
S
 
D
A
 
A
W
 
W
A
 
G
Q
 
K
A
 
A
Y
|
Y
G
 
G
N
 
V
L
 
I
A
 
A
D
 
D
I
 
V
L
x
F
A
 
I
G
 
Q
M
 
V
E
 
E
S
 
A
E
 
D
L
 
L
Y
 
Y
E
 
A
R
 
Q
S
 
A
E
 
V
E
 
E

4vhbA Thiocyanate adduct of the bacterial hemoglobin from vitreoscilla sp. (see paper)
49% identity, 36% coverage: 1:146/403 of query aligns to 1:138/138 of 4vhbA

query
sites
4vhbA
M
 
M
L
 
L
T
 
D
Q
 
Q
K
 
Q
T
 
T
K
 
I
D
 
N
I
 
I
V
 
I
K
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
K
Q
 
E
H
 
H
G
 
G
Y
 
V
A
 
T
I
 
I
I
 
T
Q
 
T
H
 
T
F
|
F
Y
 
Y
K
 
K
R
 
N
M
 
L
F
 
F
Q
 
A
A
 
K
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
V
K
 
R
N
 
P
I
x
L
F
|
F
N
 
-
M
 
-
A
 
-
H
 
-
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
P
Q
 
K
A
 
A
L
|
L
A
 
A
R
 
M
A
x
T
V
 
V
Y
 
L
A
 
A
Y
 
A
A
 
A
A
 
Q
N
 
N
I
 
I
E
 
E
N
 
N
P
 
L
E
 
P
S
 
A
L
 
I
S
 
L
A
 
P
V
 
A
L
 
V
K
 
K
D
 
K
I
|
I
A
 
A
H
 
V
K
|
K
H
|
H
A
 
C
S
 
Q
L
 
A
G
 
G
V
|
V
R
 
A
P
 
A
E
 
A
Q
x
H
Y
|
Y
P
 
P
I
 
I
V
|
V
G
 
G
E
 
Q
H
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
G
S
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
D
E
 
D
I
 
I
I
 
L
S
 
D
A
 
A
W
 
W
A
 
G
Q
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
N
 
V
L
 
I
A
 
A
D
 
D
I
 
V
L
x
F
A
 
I
G
 
Q
M
 
V
E
 
E
S
 
A
E
 
D
L
 
L
Y
 
Y
E
 
A
R
 
Q
S
 
A
E
 
V
E
 
E

3vhbA Imidazole adduct of the bacterial hemoglobin from vitreoscilla sp. (see paper)
48% identity, 35% coverage: 2:144/403 of query aligns to 1:134/135 of 3vhbA

query
sites
3vhbA
L
 
L
T
 
D
Q
 
Q
K
 
Q
T
 
T
K
 
I
D
 
N
I
 
I
V
 
I
K
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
K
Q
 
E
H
 
H
G
 
G
Y
 
V
A
 
T
I
 
I
I
 
T
Q
 
T
H
 
T
F
 
F
Y
|
Y
K
 
K
R
 
N
M
 
L
F
 
F
Q
 
A
A
 
K
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
V
K
 
R
N
 
P
I
 
L
F
|
F
N
 
-
M
 
-
A
 
-
H
 
-
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
Q
Q
 
P
Q
 
K
A
 
A
L
|
L
A
 
A
R
 
M
A
x
T
V
 
V
Y
 
L
A
 
A
Y
 
A
A
 
A
A
 
Q
N
 
N
I
 
I
E
 
E
N
 
N
P
 
L
E
 
P
S
 
A
L
 
I
S
 
L
A
 
P
V
 
A
L
 
V
K
 
K
D
 
K
I
|
I
A
 
A
H
 
V
K
|
K
H
|
H
A
 
C
S
 
Q
L
 
A
G
 
G
V
|
V
R
 
A
P
 
A
E
 
A
Q
x
H
Y
|
Y
P
 
P
I
 
I
V
|
V
G
 
G
E
 
Q
H
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
G
S
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
D
E
 
D
I
 
I
I
 
L
S
 
D
A
 
A
W
 
W
A
 
G
Q
 
K
A
 
A
Y
|
Y
G
 
G
N
 
V
L
 
I
A
 
A
D
 
D
I
 
V
L
x
F
A
 
I
G
 
Q
M
 
V
E
 
E
S
 
A
E
 
D
L
 
L
Y
 
Y
E
 
A
R
 
Q
S
 
A

2wy4A Structure of bacterial globin from campylobacter jejuni at 1.35 a resolution (see paper)
42% identity, 35% coverage: 3:143/403 of query aligns to 1:139/139 of 2wy4A

query
sites
2wy4A
T
 
T
Q
 
K
K
 
E
T
 
Q
K
 
I
D
 
Q
I
 
I
V
 
I
K
 
K
A
 
D
T
 
C
A
 
V
P
 
P
V
 
I
L
 
L
A
 
Q
Q
 
K
H
 
N
G
 
G
Y
 
E
A
 
D
I
 
L
I
 
T
Q
 
N
H
 
E
F
 
F
Y
 
Y
K
 
K
R
 
I
M
 
M
F
 
F
Q
 
N
A
 
D
H
 
Y
P
 
P
E
 
E
L
 
V
K
 
K
N
 
P
I
x
M
F
|
F
N
|
N
M
 
M
A
 
E
H
 
K
Q
 
Q
E
 
I
R
 
S
G
 
G
E
 
E
Q
|
Q
Q
 
P
Q
 
K
A
 
A
L
|
L
A
 
A
R
 
M
A
|
A
V
 
I
Y
 
L
A
 
M
Y
 
A
A
 
A
A
 
K
N
 
N
I
 
I
E
 
E
N
 
N
P
 
L
E
 
E
S
 
N
L
 
M
S
 
R
A
 
S
V
 
F
L
 
V
K
 
D
D
 
K
I
x
V
A
 
A
H
 
I
K
x
T
H
|
H
A
 
V
S
 
N
L
|
L
G
 
G
V
|
V
R
 
K
P
 
E
E
 
E
Q
x
H
Y
|
Y
P
 
P
I
 
I
V
|
V
G
 
G
E
 
A
H
 
C
L
 
L
L
 
L
A
 
K
S
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
N
V
 
L
L
 
L
G
 
N
-
 
P
D
 
D
A
 
E
A
 
A
T
 
T
D
 
-
E
 
-
I
 
-
I
 
L
S
 
K
A
 
A
W
 
W
A
 
E
Q
 
V
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
N
 
K
L
 
I
A
 
A
D
 
K
I
 
F
L
x
Y
A
 
I
G
 
D
M
 
I
E
 
E
S
 
K
E
 
K
L
 
L
Y
 
Y
E
 
D
R
 
K

6wk3D Engineered carbene transferase rmanod q52v, putative nitric oxide dioxygenase from rhodothermus marinus (see paper)
38% identity, 35% coverage: 2:141/403 of query aligns to 6:141/146 of 6wk3D

query
sites
6wk3D
L
 
L
T
 
S
Q
 
E
K
 
Q
T
 
T
K
 
R
D
 
Q
I
 
L
V
 
V
K
 
R
A
 
A
T
 
S
A
 
V
P
 
P
V
 
A
L
 
L
A
 
Q
Q
 
K
H
 
H
G
 
S
Y
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
S
Q
 
A
H
 
T
F
 
M
Y
 
Y
K
 
R
R
 
L
M
 
L
F
 
F
Q
 
E
A
 
R
H
 
Y
P
 
P
E
 
E
L
 
T
K
 
R
N
 
S
I
x
L
F
|
F
N
 
E
M
 
L
A
 
P
H
 
-
Q
 
-
E
|
E
R
 
R
G
 
V
E
 
I
Q
x
H
Q
 
K
Q
 
-
A
 
-
L
|
L
A
 
A
R
 
S
A
 
A
V
 
L
Y
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
R
N
 
S
I
 
I
E
 
D
N
 
N
P
 
P
E
 
S
S
 
A
L
 
L
S
 
Q
A
 
A
V
 
A
L
 
I
K
 
R
D
x
R
I
x
M
A
 
V
H
 
L
K
x
S
H
|
H
A
 
A
S
x
R
L
x
A
G
 
G
V
|
V
R
 
Q
P
 
A
E
 
V
Q
x
H
Y
|
Y
P
 
P
I
 
L
V
|
V
G
 
W
E
 
E
H
 
C
L
 
L
L
 
R
A
 
D
S
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
P
A
 
D
A
 
A
T
 
T
D
 
E
E
 
T
I
 
L
I
 
L
S
 
Q
A
 
A
W
 
W
A
 
K
Q
 
E
A
 
A
Y
|
Y
G
 
D
N
 
F
L
 
L
A
 
A
D
 
H
I
 
L
L
 
L
A
 
S
G
 
T
M
 
K
E
 
E
S
 
A
E
 
Q
L
 
V
Y
 
Y

7dihA Crystal structure of thermoglobin y29f mutant in complex with imidazole
38% identity, 35% coverage: 1:141/403 of query aligns to 1:136/139 of 7dihA

query
sites
7dihA
M
 
M
L
 
L
T
 
S
Q
 
E
K
 
E
T
 
T
K
 
I
D
 
R
I
 
V
V
 
I
K
 
K
A
 
S
T
 
T
A
 
V
P
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
K
Q
 
E
H
 
H
G
 
G
Y
 
T
A
 
E
I
 
I
I
 
T
Q
 
A
H
 
R
F
 
M
Y
 
F
K
 
E
R
 
L
M
 
L
F
 
F
Q
 
S
A
 
K
H
 
Y
P
 
P
E
 
K
L
 
T
K
 
K
N
 
E
I
x
L
F
|
F
N
 
A
M
 
G
A
|
A
H
x
S
Q
 
E
E
 
E
R
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
|
Q
Q
 
P
Q
 
K
A
 
K
L
|
L
A
 
A
R
 
N
A
 
A
V
 
I
Y
 
I
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
T
N
 
Y
I
 
I
E
 
D
N
 
R
P
 
L
E
 
E
S
 
E
L
 
L
S
 
D
A
 
N
V
 
A
L
 
I
K
 
S
D
 
T
I
|
I
A
 
A
H
 
R
K
x
S
H
|
H
A
 
V
S
 
R
L
 
R
G
 
N
V
|
V
R
 
K
P
 
P
E
 
E
Q
x
H
Y
|
Y
P
 
P
I
 
L
V
|
V
G
 
K
E
 
E
H
 
C
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
S
 
A
I
 
I
K
 
E
E
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
N
D
 
P
A
 
G
A
 
-
T
 
-
D
 
E
E
 
E
I
 
V
I
 
L
S
 
K
A
 
A
W
 
W
A
 
E
Q
 
E
A
 
A
Y
|
Y
G
 
D
N
 
F
L
|
L
A
 
A
D
 
K
I
 
T
L
 
L
A
 
I
G
 
T
M
 
L
E
 
E
S
 
K
E
 
K
L
 
L
Y
 
Y

5ogxA Crystal structure of amycolatopsis cytochrome p450 reductase gcob. (see paper)
31% identity, 53% coverage: 185:398/403 of query aligns to 127:331/333 of 5ogxA

query
sites
5ogxA
F
 
F
E
 
E
P
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
T
 
-
S
 
-
V
 
V
A
 
E
V
 
L
Q
 
V
V
 
V
P
 
P
K
 
G
L
 
S
G
 
G
Y
 
A
Q
 
R
Q
 
-
I
 
-
R
|
R
Q
|
Q
Y
|
Y
S
|
S
L
 
L
S
 
A
D
 
N
S
 
T
P
 
A
N
 
D
-
 
E
G
 
D
R
 
K
S
 
V
Y
 
L
R
 
E
I
 
L
S
x
H
V
|
V
K
 
R
R
 
R
E
x
V
D
 
P
G
 
G
G
|
G
L
x
V
G
x
A
T
|
T
P
 
D
G
 
G
Y
 
W
V
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
-
L
 
L
H
 
F
D
 
D
E
 
G
I
 
L
N
 
A
V
 
A
G
 
G
D
 
D
E
 
R
L
 
V
K
 
E
L
 
A
A
 
T
A
 
G
P
 
P
Y
 
L
G
 
G
N
 
D
F
 
F
Y
 
H
I
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
P
D
 
D
V
 
E
S
 
D
A
 
D
T
 
G
T
 
G
P
 
P
I
 
M
V
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
G
G
 
G
G
 
G
V
x
T
G
 
G
L
 
L
T
 
A
P
 
P
M
 
L
V
 
V
S
 
G
M
 
I
L
 
A
K
 
R
K
 
T
A
 
A
L
 
L
-
 
A
Q
 
R
T
 
H
P
 
P
P
 
S
R
 
R
K
 
E
V
 
V
V
 
L
F
 
L
V
 
Y
H
 
H
G
 
G
A
 
V
R
 
R
N
 
G
S
 
A
A
 
A
V
 
D
H
 
L
A
 
Y
M
 
D
R
 
L
D
 
G
R
 
R
L
 
F
K
 
A
E
 
E
A
 
I
S
 
A
R
 
E
T
 
E
Y
 
H
P
 
P
D
 
G
F
 
F
K
 
R
L
 
F
F
 
V
-
 
P
I
 
V
F
 
L
Y
 
S
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
D
P
 
P
T
 
A
D
 
Y
I
 
R
E
 
G
G
 
G
R
 
F
D
 
P
Y
 
T
D
 
D
F
 
-
A
 
A
G
 
F
L
 
V
V
 
E
D
 
D
V
 
V
E
 
P
K
 
S
V
 
G
K
 
R
D
 
G
S
 
W
I
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
S
Y
 
G
Y
 
W
I
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
V
 
P
P
 
A
F
 
M
M
 
V
R
 
E
M
 
A
Q
 
G
H
 
V
D
 
K
K
 
A
L
 
F
L
 
K
G
 
R
L
 
R
G
 
R
I
 
M
T
 
S
E
 
P
A
 
R
R
 
R
I
 
I
H
 
H
Y
 
R
E
 
E
V
 
K
F
|
F
G
 
T
P
|
P

Sites not aligning to the query:

P0DPQ8 Aromatic O-demethylase, reductase subunit; NADH--hemoprotein reductase; EC 1.6.2.- from Amycolatopsis sp. (strain ATCC 39116 / 75iv2) (see paper)
31% identity, 53% coverage: 185:398/403 of query aligns to 128:332/334 of P0DPQ8

query
sites
P0DPQ8
F
 
F
E
 
E
P
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
T
 
-
S
 
-
V
 
V
A
 
E
V
 
L
Q
 
V
V
 
V
P
 
P
K
 
G
L
 
S
G
 
G
Y
 
A
Q
 
R
Q
 
-
I
 
-
R
|
R
Q
|
Q
Y
|
Y
S
|
S
L
 
L
S
 
A
D
 
N
S
 
T
P
 
A
N
 
D
-
 
E
G
 
D
R
 
K
S
 
V
Y
 
L
R
 
E
I
 
L
S
x
H
V
|
V
K
x
R
R
 
R
E
 
V
D
 
P
G
 
G
G
 
G
L
x
V
G
x
A
T
|
T
P
 
D
G
 
G
Y
 
W
V
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
-
L
 
L
H
 
F
D
 
D
E
 
G
I
 
L
N
 
A
V
 
A
G
 
G
D
 
D
E
 
R
L
 
V
K
 
E
L
 
A
A
 
T
A
 
G
P
 
P
Y
 
L
G
 
G
N
 
D
F
 
F
Y
 
H
I
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
P
D
 
D
V
 
E
S
 
D
A
 
D
T
 
G
T
 
G
P
 
P
I
 
M
V
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
G
G
 
G
G
 
G
V
x
T
G
 
G
L
 
L
T
 
A
P
 
P
M
 
L
V
 
V
S
 
G
M
 
I
L
 
A
K
 
R
K
 
T
A
 
A
L
 
L
-
 
A
Q
 
R
T
 
H
P
 
P
P
 
S
R
 
R
K
 
E
V
 
V
V
 
L
F
 
L
V
 
Y
H
 
H
G
 
G
A
 
V
R
 
R
N
 
G
S
 
A
A
 
A
V
 
D
H
 
L
A
 
Y
M
 
D
R
 
L
D
 
G
R
 
R
L
 
F
K
 
A
E
 
E
A
 
I
S
 
A
R
 
E
T
 
E
Y
 
H
P
 
P
D
 
G
F
 
F
K
 
R
L
 
F
F
 
V
-
 
P
I
 
V
F
 
L
Y
 
S
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
D
P
 
P
T
 
A
D
 
Y
I
 
R
E
 
G
G
 
G
R
 
F
D
 
P
Y
 
T
D
 
D
F
 
-
A
 
A
G
 
F
L
 
V
V
 
E
D
 
D
V
 
V
E
 
P
K
 
S
V
 
G
K
 
R
D
 
G
S
 
W
I
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
S
Y
 
G
Y
 
W
I
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
V
 
P
P
 
A
F
 
M
M
 
V
R
 
E
M
 
A
Q
 
G
H
 
V
D
 
K
K
 
A
L
 
F
L
 
K
G
 
R
L
 
R
G
 
R
I
 
M
T
 
S
E
 
P
A
 
R
R
 
R
I
 
I
H
 
H
Y
 
R
E
 
E
V
 
K
F
|
F
G
 
T
P
 
P

Sites not aligning to the query:

2r6hC Crystal structure of the domain comprising the NAD binding and the fad binding regions of the nadh:ubiquinone oxidoreductase, na translocating, f subunit from porphyromonas gingivalis
28% identity, 41% coverage: 233:397/403 of query aligns to 124:289/289 of 2r6hC

query
sites
2r6hC
P
|
P
G
|
G
Y
x
I
V
x
S
S
|
S
S
 
S
L
 
Y
L
 
I
H
 
F
D
 
-
E
 
S
I
 
L
N
 
K
V
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
K
L
 
V
K
 
M
L
 
M
A
 
S
A
 
G
P
 
P
Y
 
Y
G
 
G
N
 
D
F
 
F
Y
 
H
I
 
I
D
 
Q
V
 
-
S
 
D
A
 
T
T
 
D
T
 
A
P
 
E
I
 
M
V
 
L
L
 
Y
I
 
I
S
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
A
G
 
G
L
 
M
T
 
A
P
 
P
M
 
L
V
 
R
S
 
A
M
 
Q
L
 
I
K
 
L
K
 
H
A
 
L
L
 
F
Q
 
R
T
 
T
-
 
L
-
 
K
P
 
T
P
 
G
R
 
R
K
 
K
V
 
V
V
 
S
F
 
Y
V
 
W
H
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
R
N
 
S
S
 
K
A
 
N
V
 
E
H
 
I
A
 
F
M
 
Y
R
 
E
D
 
E
R
 
D
L
 
F
K
 
R
E
 
E
A
 
I
S
 
E
R
 
R
T
 
E
Y
 
F
P
 
P
D
 
N
F
 
F
K
 
K
L
 
F
F
 
H
I
 
I
F
 
A
Y
 
L
D
 
S
E
 
D
P
 
P
L
 
Q
P
 
P
T
 
E
D
 
D
I
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
D
 
-
Y
 
-
D
 
N
F
 
W
A
 
T
G
 
G
L
 
Y
V
 
V
D
 
G
V
 
F
-
 
I
-
 
H
E
 
Q
K
 
V
V
 
I
K
 
Y
D
 
D
S
 
N
I
 
Y
L
 
L
L
 
K
D
 
D
-
 
H
-
 
D
-
 
A
-
 
P
-
 
E
D
 
D
A
 
I
D
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
M
C
|
C
G
 
G
P
 
P
V
 
G
P
 
P
F
 
M
M
 
A
R
 
N
M
 
A
Q
 
V
H
 
K
D
 
G
K
 
M
L
 
L
L
 
E
G
 
N
L
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
P
E
 
R
A
 
N
R
 
M
I
 
L
H
 
F
Y
 
F
E
 
D
V
 
D
F
|
F
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>SMa1191 FitnessBrowser__Smeli:SMa1191
MLTQKTKDIVKATAPVLAQHGYAIIQHFYKRMFQAHPELKNIFNMAHQERGEQQQALARA
VYAYAANIENPESLSAVLKDIAHKHASLGVRPEQYPIVGEHLLASIKEVLGDAATDEIIS
AWAQAYGNLADILAGMESELYERSEERAGGWAGWRRFIVREKNPESDVITSFVLEPADGG
PVADFEPGQYTSVAVQVPKLGYQQIRQYSLSDSPNGRSYRISVKREDGGLGTPGYVSSLL
HDEINVGDELKLAAPYGNFYIDVSATTPIVLISGGVGLTPMVSMLKKALQTPPRKVVFVH
GARNSAVHAMRDRLKEASRTYPDFKLFIFYDEPLPTDIEGRDYDFAGLVDVEKVKDSILL
DDADYYICGPVPFMRMQHDKLLGLGITEARIHYEVFGPDLFAE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory