SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMa1347 FitnessBrowser__Smeli:SMa1347 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
35% identity, 85% coverage: 42:316/324 of query aligns to 48:327/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
A
 
A
E
 
L
I
 
V
V
 
T
I
x
M
V
x
L
R
 
S
A
 
E
P
 
R
I
 
I
P
 
D
P
 
Q
A
 
E
F
 
V
F
 
F
G
 
E
N
 
N
V
 
A
P
 
P
A
 
R
L
 
L
R
 
R
A
 
I
V
 
V
V
 
A
R
 
N
H
x
Y
G
x
A
A
x
V
G
|
G
L
 
Y
D
 
D
M
 
N
I
 
I
P
 
D
Y
 
V
D
 
E
A
 
E
A
 
A
T
 
T
A
 
R
A
 
R
G
 
G
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
A
 
T
N
 
N
V
 
T
P
 
P
A
 
D
V
 
V
N
x
L
A
 
T
P
 
N
T
 
A
V
x
T
A
 
A
E
 
D
H
 
H
V
 
A
F
 
F
M
 
A
V
 
L
T
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
T
L
 
A
R
 
R
Q
 
H
F
 
V
R
 
V
P
 
K
M
 
G
D
 
D
R
 
K
D
 
F
L
 
V
R
 
R
N
 
S
M
 
G
G
 
E
W
 
W
S
 
K
-
 
R
T
 
K
G
 
G
R
 
I
A
 
A
H
 
W
S
 
H
D
 
P
R
 
K
A
 
W
L
 
F
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
D
 
E
L
 
L
A
 
Y
G
 
G
R
 
K
I
 
T
M
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
V
G
 
G
M
x
F
G
|
G
N
x
R
V
x
I
G
 
G
K
 
Q
A
 
A
V
 
I
F
 
A
R
 
R
I
 
R
A
 
A
K
 
K
Y
 
-
G
 
G
F
 
F
Q
 
N
L
 
M
E
 
R
I
 
I
V
 
L
A
 
Y
N
 
Y
S
|
S
R
|
R
S
 
T
P
 
R
E
 
K
S
 
S
L
 
Q
P
 
A
D
 
E
-
 
K
-
 
E
-
 
L
G
 
G
V
 
A
R
 
E
F
 
Y
L
 
R
S
 
P
V
 
L
D
 
E
D
 
E
L
 
V
L
 
L
S
 
K
T
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
V
V
 
I
L
 
L
C
x
A
C
x
V
P
|
P
L
 
L
T
 
T
P
 
K
K
 
E
T
|
T
T
 
M
G
 
Y
L
 
M
L
 
I
S
 
N
R
 
E
E
 
E
R
 
R
I
 
L
A
 
K
R
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
G
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
V
x
I
S
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
D
 
T
A
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
K
R
 
E
G
 
G
R
 
W
I
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
S
 
E
T
 
E
Q
x
E
P
 
P
L
 
Y
P
 
Y
P
 
N
E
 
E
H
 
E
P
 
-
Y
 
L
F
 
F
R
 
S
Q
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
I
 
V
V
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
A
x
G
G
 
S
I
 
A
S
 
T
E
 
F
E
 
E
S
 
A
M
 
R
M
 
E
R
 
A
M
 
M
G
 
A
K
 
E
G
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
R
E
 
N
A
 
L
I
 
I
R
 
A
V
 
F
M
 
K
E
 
R
G
 
G
G
 
E
L
 
I
P
 
P
V
 
P
N
 
T
L
 
L
R
 
V
N
 
N
P
 
K
E
 
E
V
 
V
V
 
I
E
 
K

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
36% identity, 94% coverage: 1:304/324 of query aligns to 2:304/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
M
 
L
S
 
P
F
 
V
I
 
V
F
 
L
S
 
I
T
 
A
H
 
D
R
 
K
L
 
L
H
 
A
P
 
P
D
 
S
A
 
T
E
 
V
A
 
A
M
 
A
L
 
L
K
 
G
A
 
D
A
 
Q
S
 
V
D
 
E
L
 
V
R
 
R
V
 
W
A
 
V
S
 
D
A
 
G
P
 
P
D
 
D
P
 
R
E
 
D
T
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
A
E
 
A
G
 
V
E
 
P
G
 
E
A
 
A
E
 
D
I
 
A
V
 
L
I
 
L
V
 
V
R
 
R
A
 
S
-
 
A
-
 
T
P
 
T
I
 
V
P
 
D
P
 
A
A
 
E
F
 
V
F
 
L
G
 
A
N
 
A
V
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
L
R
 
K
A
 
I
V
 
V
V
 
A
R
|
R
H
 
A
G
 
G
A
x
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
M
 
N
I
 
V
P
 
D
Y
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
R
G
 
G
V
 
V
L
 
L
I
 
V
A
 
V
N
 
N
V
 
A
P
 
P
A
 
T
V
 
S
N
|
N
A
 
I
P
 
H
T
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
H
V
 
A
F
 
L
M
 
A
V
 
L
T
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
A
L
 
S
R
 
R
Q
 
Q
F
 
I
R
 
P
P
 
A
M
 
A
D
 
D
R
 
A
D
 
S
L
 
L
R
 
R
N
 
E
M
 
H
G
 
T
W
 
W
S
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
K
A
 
R
H
 
S
S
 
S
D
 
F
R
 
S
A
 
G
L
 
T
D
 
E
L
 
I
A
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
T
M
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
L
G
 
G
N
 
R
V
 
I
G
 
G
K
 
Q
A
 
L
V
 
V
F
 
A
-
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
A
K
 
A
Y
 
F
G
 
G
F
 
A
Q
 
Y
L
 
V
E
 
V
I
 
A
V
 
Y
A
 
D
N
 
P
S
 
Y
R
 
V
S
 
S
P
 
P
E
 
A
S
 
R
L
 
A
P
 
A
D
 
Q
-
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
E
F
 
L
L
 
L
S
 
S
V
 
L
D
 
D
D
 
D
L
 
L
L
 
L
S
 
A
T
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
F
V
 
I
V
 
S
L
 
V
C
 
H
C
 
L
P
 
P
L
 
K
T
 
T
P
 
P
K
 
E
T
 
T
T
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
S
 
D
R
 
K
E
 
E
R
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
K
M
 
T
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
A
S
 
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
I
E
 
T
R
 
G
G
 
G
R
 
H
I
 
V
G
 
R
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
S
 
A
T
 
T
Q
x
E
P
 
P
L
 
C
P
 
-
P
 
T
E
 
D
H
 
S
P
 
P
Y
 
L
F
 
F
R
 
E
Q
 
L
D
 
A
N
 
Q
V
 
V
I
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
L
A
 
G
G
x
A
I
 
S
S
 
T
E
 
A
E
 
E
S
 
A
M
x
Q
M
 
D
R
 
R
M
 
A
G
 
G
K
 
T
G
 
D
A
 
-
A
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
S
I
 
V
R
 
R
V
 
L
M
 
A
E
 
L
G
 
A
G
 
G

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
36% identity, 94% coverage: 1:304/324 of query aligns to 1:303/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
M
 
L
S
 
P
F
 
V
I
 
V
F
 
L
S
 
I
T
 
A
H
 
D
R
 
K
L
 
L
H
 
A
P
 
P
D
 
S
A
 
T
E
 
V
A
 
A
M
 
A
L
 
L
K
 
G
A
 
D
A
 
Q
S
 
V
D
 
E
L
 
V
R
 
R
V
 
W
A
 
V
S
 
D
A
 
G
P
 
P
D
 
D
P
 
R
E
 
D
T
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
A
E
 
A
G
 
V
E
 
P
G
 
E
A
 
A
E
 
D
I
 
A
V
 
L
I
 
L
V
 
V
R
 
R
A
 
S
-
 
A
-
 
T
P
 
T
I
 
V
P
 
D
P
 
A
A
 
E
F
 
V
F
 
L
G
 
A
N
 
A
V
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
L
R
 
K
A
 
I
V
 
V
V
 
A
R
 
R
H
 
A
G
 
G
A
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
M
 
N
I
 
V
P
 
D
Y
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
R
G
 
G
V
 
V
L
 
L
I
 
V
A
 
V
N
 
N
V
 
A
P
 
P
A
 
T
V
 
S
N
|
N
A
 
I
P
 
H
T
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
H
V
 
A
F
 
L
M
 
A
V
 
L
T
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
A
L
 
S
R
 
R
Q
 
Q
F
 
I
R
 
P
P
 
A
M
 
A
D
 
D
R
 
A
D
 
S
L
 
L
R
 
R
N
 
E
M
 
H
G
 
T
W
 
W
S
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
K
A
 
R
H
 
S
S
 
S
D
 
F
R
 
S
A
 
G
L
 
T
D
 
E
L
 
I
A
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
T
M
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
L
G
 
G
N
 
R
V
 
I
G
 
G
K
 
Q
A
 
L
V
 
V
F
 
A
-
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
A
K
 
A
Y
 
F
G
 
G
F
 
A
Q
 
Y
L
 
V
E
 
V
I
 
A
V
 
Y
A
 
D
N
 
P
S
 
Y
R
 
V
S
 
S
P
 
P
E
 
A
S
 
R
L
 
A
P
 
A
D
 
Q
-
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
E
F
 
L
L
 
L
S
 
S
V
 
L
D
 
D
D
 
D
L
 
L
L
 
L
S
 
A
T
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
F
V
 
I
V
 
S
L
 
V
C
 
H
C
 
L
P
 
P
L
 
K
T
 
T
P
 
P
K
 
E
T
 
T
T
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
S
 
D
R
 
K
E
 
E
R
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
K
M
 
T
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
A
S
 
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
I
E
 
T
R
 
G
G
 
G
R
 
H
I
 
V
G
 
R
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
S
 
A
T
 
T
Q
x
E
P
 
P
L
 
C
P
 
-
P
 
T
E
 
D
H
 
S
P
 
P
Y
 
L
F
 
F
R
 
E
Q
 
L
D
 
A
N
 
Q
V
 
V
I
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
L
A
 
G
G
 
A
I
 
S
S
 
T
E
 
A
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
M
 
D
R
 
R
M
 
A
G
 
G
K
 
T
G
 
D
A
 
-
A
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
S
I
 
V
R
 
R
V
 
L
M
 
A
E
 
L
G
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
34% identity, 91% coverage: 10:303/324 of query aligns to 9:304/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
L
 
L
H
 
H
P
 
E
D
 
K
A
 
A
E
 
I
A
 
Q
M
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
D
A
 
A
S
 
G
-
 
L
D
 
E
L
 
V
R
 
I
V
 
Y
A
 
E
S
 
E
A
 
Y
P
 
P
D
 
D
P
 
E
E
 
D
T
 
R
L
 
L
L
 
V
R
 
E
E
 
L
G
 
V
E
 
K
G
 
D
A
 
V
E
 
E
I
 
A
V
 
I
I
 
I
V
 
V
R
 
R
A
 
S
P
 
K
-
 
P
-
 
K
I
 
V
P
 
T
P
 
R
A
 
R
F
 
V
F
 
I
G
 
E
N
 
S
V
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
L
R
 
K
A
 
V
V
 
I
V
 
A
R
 
R
H
 
A
G
 
G
A
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
M
 
N
I
 
I
P
 
D
Y
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
K
A
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
I
L
 
E
I
 
V
A
 
V
N
 
N
V
 
A
P
 
P
A
 
A
V
 
A
N
x
S
A
 
S
P
 
R
T
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
H
 
L
V
 
A
F
 
V
M
 
G
V
 
L
T
 
M
L
 
F
A
 
S
L
 
V
L
 
A
R
 
R
Q
 
K
F
 
I
R
 
A
P
 
F
M
 
A
D
 
D
R
 
R
D
 
K
L
 
M
R
 
R
N
 
E
M
 
G
G
 
V
W
 
W
S
 
A
T
 
K
G
 
K
R
 
E
A
 
A
H
 
M
S
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
G
L
 
I
D
 
E
L
 
L
A
 
E
G
 
G
R
 
K
I
 
T
M
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
I
G
|
G
M
x
F
G
|
G
N
x
R
V
x
I
G
 
G
K
 
Y
A
 
Q
V
 
V
F
 
A
R
 
K
I
 
I
A
 
A
K
 
N
Y
 
-
G
 
A
F
 
L
Q
 
G
L
 
M
E
 
N
I
 
I
V
 
L
A
 
L
N
x
Y
S
x
D
R
x
P
S
 
Y
P
 
P
-
 
N
E
 
E
S
 
E
L
 
R
P
 
A
D
 
K
G
 
E
V
 
V
-
 
N
-
 
G
R
 
K
F
 
F
L
 
V
S
 
D
V
 
L
D
 
E
D
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
K
T
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
V
V
 
T
L
 
I
C
 
H
C
x
V
P
|
P
L
 
L
T
 
V
P
 
E
K
 
S
T
|
T
T
 
Y
G
 
H
L
 
L
L
 
I
S
 
N
R
 
E
E
 
E
R
 
R
I
 
L
A
 
K
R
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
K
G
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
T
S
|
S
R
|
R
G
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
D
 
T
A
 
N
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
K
R
 
E
G
 
G
R
 
W
I
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
S
 
E
T
 
E
Q
x
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
P
 
K
E
 
D
H
 
H
P
 
P
Y
 
L
F
 
T
R
 
K
Q
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
V
I
 
V
V
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
A
x
G
G
 
A
I
 
S
S
 
T
E
 
V
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
M
 
E
R
 
R
M
 
A
G
 
G
K
 
V
G
 
E
A
 
V
A
 
A
A
 
E
E
 
K
A
 
V
I
 
V
R
 
K
V
 
I
M
 
L
E
 
K
G
 
G

2gsdA NAD-dependent formate dehydrogenase from bacterium moraxella sp.C2 in complex with NAD and azide (see paper)
32% identity, 83% coverage: 23:292/324 of query aligns to 69:347/399 of 2gsdA

query
sites
2gsdA
D
 
E
L
 
L
R
 
V
V
 
V
A
 
T
S
 
S
A
 
S
P
 
K
D
 
D
-
 
G
P
 
P
E
 
D
T
 
S
L
 
E
L
 
L
R
 
E
E
 
K
G
 
H
E
 
L
G
 
H
A
 
D
E
 
A
I
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
I
R
 
S
A
 
Q
P
|
P
I
x
F
P
 
W
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
F
 
L
-
 
T
-
 
A
-
 
E
-
 
R
-
 
I
G
 
A
N
 
K
V
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
L
R
 
K
A
 
L
V
 
A
V
 
L
R
 
T
H
 
A
G
 
G
A
x
I
G
 
G
L
 
S
D
 
D
M
 
H
I
 
V
P
 
D
Y
 
L
D
 
Q
A
 
A
A
 
A
T
 
I
A
 
D
A
 
N
G
 
N
V
 
I
L
 
T
I
 
V
A
 
A
N
 
E
V
 
V
P
 
T
A
 
Y
V
 
C
N
|
N
A
 
S
P
 
N
T
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
H
 
H
V
 
V
F
 
V
M
 
M
V
 
M
T
 
V
L
 
L
A
 
G
L
 
L
L
 
V
R
 
R
Q
 
N
F
 
Y
R
 
I
P
 
P
M
 
S
D
 
H
R
 
D
D
 
W
L
 
A
R
 
R
N
 
N
M
 
G
G
 
G
W
 
W
S
 
N
T
 
I
G
 
A
R
 
D
A
 
C
H
 
V
S
 
A
D
 
-
R
 
R
A
 
S
L
 
Y
D
 
D
L
 
V
A
 
E
G
 
G
R
 
M
I
 
H
M
 
V
G
 
G
V
 
T
I
 
V
G
x
A
M
 
A
G
|
G
N
x
R
V
x
I
G
 
G
K
 
L
A
 
R
V
 
V
F
 
L
R
 
R
I
 
L
-
 
L
A
 
A
K
 
P
Y
 
F
G
 
D
F
 
M
Q
 
H
L
 
L
E
 
H
I
 
Y
V
 
T
A
x
D
N
x
R
S
 
H
R
 
R
S
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
A
L
 
V
P
 
E
D
 
K
G
 
E
V
 
L
R
 
N
F
 
L
L
 
T
-
 
W
-
 
H
-
 
A
S
 
T
V
 
R
D
 
E
D
 
D
L
 
M
L
 
Y
S
 
G
T
 
A
A
 
C
D
 
D
I
 
V
V
 
V
V
 
T
L
 
L
C
 
N
C
 
C
P
|
P
L
 
L
T
x
H
P
 
P
K
 
E
T
|
T
T
 
E
G
 
H
L
 
M
L
 
I
S
 
N
R
 
D
E
 
E
R
 
T
I
 
L
A
 
K
R
 
L
M
 
F
K
 
K
P
 
R
G
 
G
A
 
A
I
 
Y
L
 
L
V
 
V
N
 
N
V
x
T
S
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
V
 
L
V
 
C
D
 
D
D
 
R
A
 
D
A
 
A
L
 
I
I
 
V
E
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
L
 
G
D
|
D
V
 
V
F
 
W
S
 
F
T
 
P
Q
|
Q
P
 
P
L
 
A
P
 
P
P
 
N
E
 
D
H
 
H
P
 
P
Y
 
W
F
 
R
R
 
T
Q
 
M
D
 
P
N
 
H
V
 
N
I
 
G
V
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
A
x
S
G
|
G
I
 
T
S
 
S
E
 
L
E
 
S
S
 
A
M
 
Q
M
 
T
R
 
R
M
 
Y
G
 
A
K
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
35% identity, 85% coverage: 42:316/324 of query aligns to 47:326/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
A
 
A
E
 
L
I
 
V
V
 
T
I
 
M
V
 
L
R
 
S
A
 
E
P
 
K
I
 
I
P
 
D
P
 
R
A
 
E
F
 
V
F
 
F
G
 
D
N
 
A
V
 
A
P
 
P
A
 
R
L
 
L
R
 
R
A
 
I
V
 
V
V
 
A
R
 
N
H
 
Y
G
 
A
A
x
V
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
M
 
N
I
 
I
P
 
D
Y
 
I
D
 
E
A
 
E
A
 
A
T
 
T
A
 
K
A
 
R
G
 
G
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
A
 
T
N
 
N
V
 
T
P
 
P
A
 
D
V
 
V
N
x
L
A
 
T
P
 
D
T
 
A
V
x
T
A
 
A
E
 
D
H
 
L
V
 
A
F
 
W
M
 
A
V
 
L
T
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
A
L
 
A
R
 
R
Q
 
H
F
 
V
R
 
V
P
 
K
M
 
G
D
 
D
R
 
K
D
 
F
L
 
V
R
 
R
N
 
S
M
 
G
G
 
E
W
 
W
S
 
K
T
 
R
-
 
R
G
 
G
R
 
I
A
 
A
H
 
W
S
 
H
D
 
P
R
 
K
A
 
M
L
 
F
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
D
 
D
L
 
V
A
 
Y
G
 
G
R
 
K
I
 
T
M
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
V
G
|
G
M
x
F
G
|
G
N
x
R
V
x
I
G
 
G
K
 
Q
A
 
A
V
 
I
F
 
A
R
 
K
I
 
R
A
 
A
K
 
K
-
 
G
Y
 
F
G
 
G
F
 
M
Q
 
R
L
 
I
E
 
L
I
 
Y
V
 
T
A
|
A
N
x
R
S
|
S
R
 
R
S
x
K
P
 
P
E
 
E
S
 
A
L
 
E
P
 
K
D
 
E
-
 
L
G
 
G
V
 
A
R
 
E
F
 
F
L
 
K
S
 
P
V
 
L
D
 
E
D
 
E
L
 
L
L
 
L
S
 
R
T
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
V
V
 
V
L
 
L
C
 
A
C
x
V
P
|
P
L
 
L
T
 
T
P
 
K
K
x
E
T
|
T
T
 
Y
G
 
H
L
 
M
L
 
I
S
 
N
R
 
E
E
 
E
R
 
R
I
 
L
A
 
R
R
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
G
 
T
A
 
A
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
V
|
V
S
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
D
 
T
A
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
K
R
 
E
G
 
G
R
 
W
I
 
I
G
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
S
 
E
T
 
E
Q
x
E
P
 
P
L
 
Y
P
 
Y
P
 
D
E
 
E
H
 
E
P
 
-
Y
 
L
F
 
F
R
 
A
Q
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
I
 
V
V
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
A
x
G
G
 
S
I
 
A
S
 
T
E
 
F
E
 
G
S
 
A
M
 
R
M
 
E
R
 
G
M
 
M
G
 
A
K
 
E
G
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
K
E
 
N
A
 
L
I
 
I
R
 
A
V
 
F
M
 
K
E
 
N
G
 
G
G
 
E
L
 
V
P
 
P
V
 
P
N
 
T
L
 
L
R
 
V
N
 
N
P
 
R
E
 
E
V
 
V
V
 
L
E
 
K

7arzA Ternary complex of NAD-dependent formate dehydrogenase from physcomitrium patens
35% identity, 81% coverage: 29:292/324 of query aligns to 60:330/361 of 7arzA

query
sites
7arzA
A
 
G
P
 
P
D
 
D
P
 
S
E
 
E
T
 
-
L
 
L
L
 
D
R
 
K
E
 
E
G
 
L
E
 
A
G
 
D
A
 
A
E
 
H
I
 
I
V
 
L
I
 
I
V
x
T
R
 
-
A
 
T
P
|
P
I
x
F
P
 
H
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
-
 
M
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
R
F
 
L
G
 
A
N
 
K
V
 
A
P
 
K
A
 
N
L
 
L
R
 
E
A
 
L
V
x
L
V
|
V
R
x
T
H
 
A
G
|
G
A
x
V
G
 
G
L
 
S
D
 
D
M
 
H
I
 
I
P
 
D
Y
 
L
D
 
H
A
 
A
A
 
A
T
 
A
A
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
L
L
 
T
I
 
V
A
 
S
N
 
E
V
 
V
P
 
T
A
 
G
V
 
S
N
|
N
A
 
V
P
 
T
T
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
H
 
D
V
 
E
F
 
V
M
 
L
V
 
R
T
 
I
L
 
L
A
 
V
L
 
L
L
 
V
R
 
R
Q
 
N
F
 
F
R
 
A
P
 
P
M
 
G
D
 
W
R
 
K
D
 
Q
L
 
V
R
 
S
N
 
E
M
 
G
G
 
G
W
 
W
S
 
N
T
 
V
G
 
A
R
 
-
A
 
A
H
 
V
S
 
V
D
 
H
R
 
H
A
 
A
L
 
Y
D
 
D
L
 
L
A
 
I
G
 
D
R
 
R
I
 
T
M
 
V
G
 
G
V
 
T
I
 
V
G
 
G
M
 
G
G
|
G
N
x
R
V
x
I
G
 
G
K
 
Q
A
 
E
V
 
L
F
 
M
R
 
K
I
 
R
A
 
L
K
 
K
Y
 
-
G
 
G
F
 
F
Q
 
G
L
 
L
-
 
K
E
 
E
I
 
M
V
 
L
A
 
Y
N
 
Y
S
x
D
R
|
R
S
 
N
P
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
R
E
 
E
S
 
K
L
 
E
P
 
L
D
 
G
G
 
C
V
 
K
R
 
R
F
 
E
L
 
T
S
 
D
V
 
L
D
 
D
D
 
T
L
 
M
L
 
L
S
 
S
T
 
K
A
 
C
D
 
D
I
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
V
C
 
N
C
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
T
P
 
D
K
x
Q
T
 
T
T
 
R
G
 
G
L
 
L
L
 
F
S
 
N
R
 
K
E
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
A
R
 
K
M
 
M
K
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
A
I
 
Y
L
 
L
V
 
V
N
 
N
V
x
N
S
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
A
V
 
I
V
 
A
D
 
D
D
 
T
A
 
E
A
 
A
L
 
V
I
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
C
E
 
E
R
 
S
G
 
G
R
 
H
I
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
Y
A
 
G
L
 
G
D
|
D
V
 
V
F
 
W
S
 
N
T
 
A
Q
 
Q
P
 
P
L
 
A
P
 
G
P
 
K
E
 
D
H
 
H
P
 
P
Y
 
W
F
 
R
R
 
Y
Q
 
M
D
 
P
N
 
N
V
 
H
I
 
A
V
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
A
x
S
G
|
G
I
 
T
S
 
T
E
 
L
E
 
D
S
 
A
M
 
Q
M
 
K
R
 
R
M
 
F
G
 
A
K
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6t9wB Crystal structure of formate dehydrogenase fdh2 d222a/q223r enzyme from granulicella mallensis mp5actx8 in complex with NADP and azide.
34% identity, 79% coverage: 37:293/324 of query aligns to 85:348/383 of 6t9wB

query
sites
6t9wB
R
 
R
E
 
E
G
 
L
E
 
P
G
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
I
V
 
V
I
 
I
V
 
S
R
 
Q
A
 
-
P
|
P
I
x
F
P
 
W
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
F
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
E
-
 
R
-
 
I
G
 
A
N
 
K
V
 
A
P
 
K
A
 
K
L
 
L
R
 
K
A
 
L
V
 
A
V
 
V
R
 
T
H
 
A
G
|
G
A
x
I
G
 
G
L
 
S
D
 
D
M
 
H
I
 
V
P
 
D
Y
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
I
A
 
K
A
 
N
G
 
G
V
 
I
L
 
T
I
 
V
A
 
A
N
 
E
V
 
V
P
 
T
A
 
Y
V
 
S
N
|
N
A
x
S
P
 
I
T
 
S
V
|
V
A
 
S
E
 
E
H
 
H
V
 
V
F
 
V
M
 
M
V
 
M
T
 
I
L
 
L
A
 
S
L
 
L
L
 
V
R
 
R
Q
 
N
F
 
Y
R
 
I
P
 
P
M
 
S
D
 
Y
R
 
Q
D
 
W
L
 
V
R
 
I
N
 
K
M
 
G
G
 
G
W
 
W
S
 
N
T
 
I
G
 
A
R
 
D
A
 
C
H
 
-
S
 
V
D
 
E
R
 
R
A
 
S
L
 
Y
D
 
D
L
 
L
A
 
E
G
 
A
R
 
M
I
 
H
M
 
V
G
 
G
V
 
T
I
 
V
G
x
A
M
 
A
G
|
G
N
x
R
V
x
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
V
 
V
F
 
L
-
 
K
R
 
R
I
 
L
A
 
K
K
 
P
Y
 
F
G
 
D
F
 
V
Q
 
K
L
 
L
E
 
H
I
 
Y
V
x
F
A
 
A
N
x
R
S
 
H
R
 
R
S
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
S
L
 
V
P
 
E
D
 
N
-
 
E
-
 
L
G
 
G
V
 
L
R
 
T
F
 
Y
L
 
H
-
 
P
S
 
S
V
 
V
D
 
E
D
 
D
L
 
M
L
 
V
S
 
K
T
 
V
A
 
C
D
 
D
I
 
V
V
 
V
V
 
T
L
 
I
C
 
N
C
 
A
P
|
P
L
 
L
T
x
H
P
 
P
K
 
G
T
|
T
T
 
L
G
 
D
L
 
L
L
 
F
S
 
N
R
 
D
E
 
E
R
 
L
I
 
I
A
 
S
R
 
K
M
 
M
K
 
K
P
 
R
G
 
G
A
 
A
I
 
Y
L
 
L
V
 
V
N
 
N
V
x
T
S
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
V
 
I
V
 
C
D
 
N
D
 
R
A
 
D
A
 
A
L
 
V
I
 
V
E
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
L
G
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
L
 
G
D
|
D
V
 
V
F
 
W
S
 
F
T
 
P
Q
 
Q
P
 
P
L
 
A
P
 
P
P
 
K
E
 
D
H
 
H
P
 
P
Y
 
W
F
 
R
R
 
T
Q
 
M
D
 
P
N
 
H
V
 
H
I
 
G
V
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
A
x
S
G
|
G
I
 
T
S
 
S
E
 
L
E
 
S
S
 
A
M
 
Q
M
 
A
R
 
R
M
 
Y
G
 
A
K
 
A
G
 
G
A
 
T

Sites not aligning to the query:

8bxxAA Formate dehydrogenase
33% identity, 79% coverage: 37:293/324 of query aligns to 85:348/370 of 8bxxAA

query
sites
8bxxAA
R
 
R
E
 
E
G
 
L
E
 
P
G
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
I
V
 
V
I
 
I
V
 
S
R
 
Q
A
 
-
P
|
P
I
x
F
P
 
W
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
F
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
E
-
 
R
-
 
I
G
 
A
N
 
K
V
 
A
P
 
K
A
 
K
L
 
L
R
 
K
A
 
L
V
 
A
V
 
V
R
 
T
H
 
A
G
 
G
A
x
I
G
 
G
L
 
S
D
 
D
M
 
H
I
 
V
P
 
D
Y
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
I
A
 
K
A
 
N
G
 
G
V
 
I
L
 
T
I
 
V
A
 
A
N
 
E
V
 
V
P
 
T
A
 
Y
V
 
S
N
|
N
A
 
S
P
 
I
T
 
S
V
|
V
A
 
S
E
 
E
H
 
H
V
 
V
F
 
V
M
 
M
V
 
M
T
 
I
L
 
L
A
 
S
L
 
L
L
 
V
R
 
R
Q
 
N
F
 
Y
R
 
I
P
 
P
M
 
S
D
 
Y
R
 
Q
D
 
W
L
 
V
R
 
I
N
 
K
M
 
G
G
 
G
W
 
W
S
 
N
T
 
I
G
 
A
R
 
D
A
 
C
H
 
-
S
 
V
D
 
E
R
 
R
A
 
S
L
 
Y
D
 
D
L
 
L
A
 
E
G
 
A
R
 
M
I
 
H
M
 
V
G
 
G
V
 
T
I
 
V
G
x
A
M
 
A
G
|
G
N
x
R
V
x
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
V
 
V
F
 
L
-
 
K
R
 
R
I
 
L
A
 
K
K
 
P
Y
 
F
G
 
D
F
 
V
Q
 
K
L
 
L
E
 
H
I
 
Y
V
x
F
A
x
D
N
x
Q
S
 
H
R
 
R
S
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
S
L
 
V
P
 
E
D
 
N
-
 
E
-
 
L
G
 
G
V
 
L
R
 
T
F
 
Y
L
 
H
-
 
P
S
 
S
V
 
V
D
 
E
D
 
D
L
 
M
L
 
V
S
 
K
T
 
V
A
 
C
D
 
D
I
 
V
V
 
V
V
 
T
L
 
I
C
 
N
C
 
A
P
|
P
L
 
L
T
x
H
P
 
P
K
 
G
T
 
T
T
 
L
G
 
D
L
 
L
L
 
F
S
 
N
R
 
D
E
 
E
R
 
L
I
 
I
A
 
S
R
 
K
M
 
M
K
 
K
P
 
R
G
 
G
A
 
A
I
 
Y
L
 
L
V
 
V
N
 
N
V
x
T
S
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
V
 
I
V
 
C
D
 
N
D
 
R
A
 
D
A
 
A
L
 
V
I
 
V
E
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
L
G
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
L
 
G
D
|
D
V
 
V
F
 
W
S
 
F
T
 
P
Q
 
Q
P
 
P
L
 
A
P
 
P
P
 
K
E
 
D
H
 
H
P
 
P
Y
 
W
F
 
R
R
 
T
Q
 
M
D
 
P
N
 
H
V
 
H
I
 
G
V
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
A
x
S
G
|
G
I
 
T
S
 
S
E
 
L
E
 
S
S
 
A
M
 
Q
M
 
A
R
 
R
M
 
Y
G
 
A
K
 
A
G
 
G
A
 
T

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
31% identity, 84% coverage: 33:303/324 of query aligns to 35:305/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
E
 
E
T
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
A
E
 
E
G
 
L
E
 
Q
G
 
D
A
 
C
E
 
E
I
 
G
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
A
 
S
-
 
A
-
 
T
P
 
K
I
 
V
P
 
T
P
 
A
A
 
D
F
 
V
F
 
I
G
 
N
N
 
A
V
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
V
 
V
V
 
G
R
 
R
H
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
N
I
 
V
P
 
D
Y
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
R
A
 
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
M
N
 
N
V
 
T
P
 
P
A
 
N
V
 
G
N
 
N
A
 
S
P
 
L
T
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
V
 
T
F
 
C
M
 
G
V
 
M
T
 
I
L
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
Q
 
Q
F
 
I
R
 
P
P
 
Q
M
 
A
D
 
T
R
 
A
D
 
S
L
 
M
R
 
K
N
 
D
M
 
G
G
 
K
W
 
W
S
 
E
T
 
R
G
 
K
R
 
K
A
 
F
H
 
M
S
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
G
L
 
T
D
 
E
L
 
L
A
 
N
G
 
G
R
 
K
I
 
T
M
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
N
 
R
V
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
E
V
 
V
-
 
A
F
 
T
R
 
R
I
 
M
A
 
Q
K
 
S
Y
 
F
G
 
G
F
 
M
Q
 
K
L
 
T
E
 
I
I
 
G
V
x
Y
A
x
D
N
x
P
S
 
I
R
 
I
S
 
S
P
 
P
E
 
E
-
 
V
S
 
S
L
 
A
P
 
S
D
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
F
 
Q
L
 
L
S
 
P
V
x
L
D
 
E
D
 
E
L
 
I
L
 
W
S
 
P
T
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
V
 
T
L
 
V
C
x
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
K
 
S
T
 
T
T
 
T
G
 
G
L
|
L
L
 
L
S
 
N
R
 
D
E
 
N
R
 
T
I
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
D
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
R
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
S
 
T
T
 
E
Q
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
P
 
R
E
 
D
H
 
R
P
 
A
Y
 
L
F
 
V
R
 
D
Q
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
V
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
L
 
L
A
 
G
G
 
A
I
 
S
S
 
T
E
 
K
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
M
 
S
R
 
R
M
 
C
G
 
G
K
 
E
G
 
E
A
 
I
A
 
A
A
 
V
E
 
Q
A
 
F
I
 
V
R
 
D
V
 
M
M
 
V
E
 
K
G
 
G

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
31% identity, 84% coverage: 33:303/324 of query aligns to 39:309/533 of O43175

query
sites
O43175
E
 
E
T
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
A
E
 
E
G
 
L
E
 
Q
G
 
D
A
 
C
E
 
E
I
 
G
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
A
 
S
-
 
A
-
 
T
P
 
K
I
 
V
P
 
T
P
 
A
A
 
D
F
 
V
F
 
I
G
 
N
N
 
A
V
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
V
 
V
V
 
G
R
 
R
H
 
A
G
 
G
A
x
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
N
I
 
V
P
 
D
Y
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
R
A
 
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
M
N
 
N
V
 
T
P
 
P
A
 
N
V
 
G
N
 
N
A
 
S
P
 
L
T
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
V
 
T
F
 
C
M
 
G
V
 
M
T
 
I
L
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
Q
 
Q
F
 
I
R
 
P
P
 
Q
M
 
A
D
 
T
R
 
A
D
 
S
L
 
M
R
 
K
N
 
D
M
 
G
G
 
K
W
 
W
S
 
E
T
x
R
G
 
K
R
 
K
A
 
F
H
 
M
S
 
G
D
 
T
R
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
E
L
 
L
A
 
N
G
 
G
R
 
K
I
 
T
M
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
N
x
R
V
x
I
G
 
G
K
 
R
A
 
E
V
 
V
-
 
A
F
 
T
R
 
R
I
 
M
A
 
Q
K
 
S
Y
 
F
G
 
G
F
 
M
Q
 
K
L
 
T
E
 
I
I
 
G
V
 
Y
A
x
D
N
 
P
S
 
I
R
 
I
S
 
S
P
 
P
E
 
E
-
 
V
S
 
S
L
 
A
P
 
S
D
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
F
 
Q
L
 
L
S
 
P
V
 
L
D
 
E
D
 
E
L
 
I
L
 
W
S
 
P
T
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
V
 
T
L
 
V
C
 
H
C
x
T
P
 
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
K
 
S
T
 
T
T
 
T
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
N
R
 
D
E
 
N
R
 
T
I
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
V
x
C
S
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
D
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
R
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
|
D
V
|
V
F
 
F
S
 
T
T
 
E
Q
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
P
 
R
E
 
D
H
 
R
P
 
A
Y
 
L
F
 
V
R
 
D
Q
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
V
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
L
|
L
A
x
G
G
x
A
I
 
S
S
 
T
E
 
K
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
M
 
S
R
 
R
M
 
C
G
 
G
K
 
E
G
 
E
A
 
I
A
 
A
A
 
V
E
 
Q
A
 
F
I
 
V
R
 
D
V
 
M
M
 
V
E
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
31% identity, 82% coverage: 33:298/324 of query aligns to 34:299/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
E
 
E
T
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
A
E
 
E
G
 
L
E
 
Q
G
 
D
A
 
C
E
 
E
I
 
G
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
A
 
S
-
 
A
-
 
T
P
 
K
I
 
V
P
 
T
P
 
A
A
 
D
F
 
V
F
 
I
G
 
N
N
 
A
V
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
V
 
V
V
 
G
R
 
R
H
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
N
I
 
V
P
 
D
Y
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
R
A
 
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
M
N
 
N
V
 
T
P
 
P
A
 
N
V
 
G
N
 
N
A
 
S
P
 
L
T
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
V
 
T
F
 
C
M
 
G
V
 
M
T
 
I
L
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
Q
 
Q
F
 
I
R
 
P
P
 
Q
M
 
A
D
 
T
R
 
A
D
 
S
L
 
M
R
 
K
N
 
D
M
 
G
G
 
K
W
 
W
S
 
E
T
 
R
G
 
K
R
 
K
A
 
F
H
 
M
S
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
G
L
 
T
D
 
E
L
 
L
A
 
N
G
 
G
R
 
K
I
 
T
M
 
L
G
 
G
V
 
I
I
x
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
N
 
R
V
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
E
V
 
V
-
 
A
F
 
T
R
 
R
I
 
M
A
 
Q
K
 
S
Y
 
F
G
 
G
F
 
M
Q
 
K
L
 
T
E
 
I
I
 
G
V
x
Y
A
x
D
N
x
P
S
 
I
R
x
I
S
 
S
P
 
P
E
 
E
-
 
V
S
 
S
L
 
A
P
 
S
D
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
F
 
Q
L
 
L
S
 
P
V
 
L
D
 
E
D
 
E
L
 
I
L
 
W
S
 
P
T
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
V
 
T
L
 
V
C
x
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
K
 
S
T
 
T
T
 
T
G
 
G
L
|
L
L
 
L
S
 
N
R
 
D
E
 
N
R
 
T
I
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
D
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
R
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
S
 
T
T
 
E
Q
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
P
 
R
E
 
D
H
 
R
P
 
A
Y
 
L
F
 
V
R
 
D
Q
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
V
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
L
 
L
A
 
G
G
 
A
I
 
S
S
 
T
E
 
K
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
M
 
S
R
 
R
M
 
C
G
 
G
K
 
E
G
 
E
A
 
I
A
 
A
A
 
V
E
 
Q
A
 
F
I
 
V

6plgA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 15 (see paper)
31% identity, 83% coverage: 33:302/324 of query aligns to 34:303/303 of 6plgA

query
sites
6plgA
E
 
E
T
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
A
E
 
E
G
 
L
E
 
Q
G
 
D
A
 
C
E
 
E
I
 
G
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
A
 
S
-
 
A
-
 
T
P
 
K
I
 
V
P
 
T
P
 
A
A
 
D
F
 
V
F
 
I
G
 
N
N
 
A
V
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
V
 
V
V
 
G
R
 
R
H
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
N
I
 
V
P
 
D
Y
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
R
A
 
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
M
N
 
N
V
 
T
P
 
P
A
 
N
V
 
G
N
 
N
A
 
S
P
 
L
T
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
V
 
T
F
 
C
M
 
G
V
 
M
T
 
I
L
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
Q
 
Q
F
 
I
R
 
P
P
 
Q
M
 
A
D
 
T
R
 
A
D
 
S
L
 
M
R
 
K
N
 
D
M
 
G
G
 
K
W
 
W
S
 
E
T
 
R
G
 
K
R
 
K
A
 
F
H
 
M
S
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
G
L
 
T
D
 
E
L
 
L
A
 
N
G
 
G
R
 
K
I
 
T
M
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
G
 
G
M
 
L
G
|
G
N
x
R
V
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
E
V
 
V
-
 
A
F
 
T
R
 
R
I
 
M
A
 
Q
K
 
S
Y
 
F
G
 
G
F
 
M
Q
 
K
L
 
T
E
 
I
I
 
G
V
 
Y
A
x
D
N
x
P
S
x
I
R
x
I
S
 
S
P
 
P
E
 
E
-
 
V
S
 
S
L
 
A
P
 
S
D
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
F
 
Q
L
 
L
S
 
P
V
 
L
D
 
E
D
 
E
L
 
I
L
 
W
S
 
P
T
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
V
 
T
L
 
V
C
x
H
C
x
T
P
 
P
L
 
L
T
x
L
P
 
P
K
 
S
T
 
T
T
 
T
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
N
R
 
D
E
 
N
R
 
T
I
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
D
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
R
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
S
 
T
T
 
E
Q
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
P
 
R
E
 
D
H
 
R
P
 
A
Y
 
L
F
 
V
R
 
D
Q
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
V
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
L
 
L
A
 
G
G
 
A
I
 
S
S
 
T
E
 
K
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
M
 
S
R
 
R
M
 
C
G
 
G
K
 
E
G
 
E
A
 
I
A
 
A
A
 
V
E
 
Q
A
 
F
I
 
V
R
 
D
V
 
M
M
 
V
E
 
K

6rj3A Crystal structure of phgdh in complex with compound 15 (see paper)
32% identity, 81% coverage: 33:296/324 of query aligns to 33:296/297 of 6rj3A

query
sites
6rj3A
E
 
E
T
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
A
E
 
E
G
 
L
E
 
Q
G
 
D
A
 
C
E
 
E
I
 
G
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
A
 
S
-
 
A
-
 
T
P
 
K
I
 
V
P
 
T
P
 
A
A
 
D
F
 
V
F
 
I
G
 
N
N
 
A
V
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
V
 
V
V
 
G
R
 
R
H
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
N
I
 
V
P
 
D
Y
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
R
A
 
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
M
N
 
N
V
 
T
P
 
P
A
 
N
V
 
G
N
 
N
A
 
S
P
 
L
T
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
V
 
T
F
 
C
M
 
G
V
 
M
T
 
I
L
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
Q
 
Q
F
 
I
R
 
P
P
 
Q
M
 
A
D
 
T
R
 
A
D
 
S
L
 
M
R
 
K
N
 
D
M
 
G
G
 
K
W
 
W
S
 
E
T
 
R
G
 
K
R
 
K
A
 
F
H
 
M
S
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
G
L
 
T
D
 
E
L
 
L
A
 
N
G
 
G
R
 
K
I
 
T
M
 
L
G
 
G
V
 
I
I
x
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
N
 
R
V
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
E
V
 
V
-
 
A
F
 
T
R
 
R
I
 
M
A
 
Q
K
 
S
Y
 
F
G
 
G
F
 
M
Q
 
K
L
 
T
E
 
I
I
 
G
V
x
Y
A
x
D
N
x
P
S
x
I
R
x
I
S
 
S
P
 
P
E
 
E
-
 
V
S
 
S
L
 
A
P
 
S
D
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
F
 
Q
L
 
L
S
 
P
V
 
L
D
 
E
D
 
E
L
 
I
L
 
W
S
 
P
T
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
V
 
T
L
 
V
C
x
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
K
 
S
T
 
T
T
 
T
G
 
G
L
|
L
L
 
L
S
 
N
R
 
D
E
 
N
R
 
T
I
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
D
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
R
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
S
 
T
T
 
E
Q
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
P
 
R
E
 
D
H
 
R
P
 
A
Y
 
L
F
 
V
R
 
D
Q
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
V
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
L
 
L
A
 
G
G
 
A
I
 
S
S
 
T
E
 
K
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
M
 
S
R
 
R
M
 
C
G
 
G
K
 
E
G
 
E
A
 
I
A
 
A
A
 
V
E
 
Q

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
31% identity, 82% coverage: 33:298/324 of query aligns to 34:299/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
E
 
E
T
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
A
E
 
E
G
 
L
E
 
Q
G
 
D
A
 
C
E
 
E
I
 
G
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
A
 
S
-
 
A
-
 
T
P
 
K
I
 
V
P
 
T
P
 
A
A
 
D
F
 
V
F
 
I
G
 
N
N
 
A
V
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
V
 
V
V
 
G
R
 
R
H
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
N
I
 
V
P
 
D
Y
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
R
A
 
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
M
N
 
N
V
 
T
P
 
P
A
 
N
V
 
G
N
 
N
A
 
S
P
 
L
T
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
V
 
T
F
 
C
M
 
G
V
 
M
T
 
I
L
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
Q
 
Q
F
 
I
R
 
P
P
 
Q
M
 
A
D
 
T
R
 
A
D
 
S
L
 
M
R
 
K
N
 
D
M
 
G
G
 
K
W
 
W
S
 
E
T
 
R
G
 
K
R
 
K
A
 
F
H
 
M
S
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
G
L
 
T
D
 
E
L
 
L
A
 
N
G
 
G
R
 
K
I
 
T
M
 
L
G
 
G
V
 
I
I
x
L
G
|
G
M
x
L
G
|
G
N
x
R
V
x
I
G
|
G
K
 
R
A
 
E
V
 
V
-
 
A
F
 
T
R
 
R
I
 
M
A
 
Q
K
 
S
Y
 
F
G
 
G
F
 
M
Q
 
K
L
 
T
E
 
I
I
 
G
V
 
Y
A
x
D
N
 
P
S
 
I
R
 
I
S
 
S
P
 
P
E
 
E
-
 
V
S
 
S
L
 
A
P
 
S
D
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
F
 
Q
L
 
L
S
 
P
V
 
L
D
 
E
D
 
E
L
 
I
L
 
W
S
 
P
T
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
V
 
T
L
 
V
C
x
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
K
 
S
T
 
T
T
 
T
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
N
R
 
D
E
 
N
R
 
T
I
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
D
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
R
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
S
 
T
T
 
E
Q
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
P
 
R
E
 
D
H
 
R
P
 
A
Y
 
L
F
 
V
R
 
D
Q
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
V
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
L
 
L
A
 
G
G
 
A
I
 
S
S
 
T
E
 
K
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
M
 
S
R
 
R
M
 
C
G
 
G
K
 
E
G
 
E
A
 
I
A
 
A
A
 
V
E
 
Q
A
 
F
I
 
V

7dkmA Phgdh covalently linked to oridonin (see paper)
31% identity, 83% coverage: 33:302/324 of query aligns to 35:304/306 of 7dkmA

query
sites
7dkmA
E
 
E
T
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
A
E
 
E
G
 
L
E
 
Q
G
 
D
A
 
C
E
 
E
I
 
G
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
A
 
S
-
 
A
-
 
T
P
 
K
I
 
V
P
 
T
P
 
A
A
 
D
F
 
V
F
 
I
G
 
N
N
 
A
V
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
V
 
V
V
 
G
R
 
R
H
 
A
G
 
G
A
x
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
N
I
 
V
P
 
D
Y
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
R
A
 
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
M
N
 
N
V
 
T
P
 
P
A
 
N
V
 
G
N
 
N
A
 
S
P
 
L
T
 
S
V
x
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
V
 
T
F
 
C
M
 
G
V
 
M
T
 
I
L
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
Q
 
Q
F
 
I
R
 
P
P
 
Q
M
 
A
D
 
T
R
 
A
D
 
S
L
 
M
R
 
K
N
 
D
M
 
G
G
 
K
W
 
W
S
 
E
T
 
R
G
 
K
R
 
K
A
 
F
H
 
M
S
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
G
L
 
T
D
 
E
L
 
L
A
 
N
G
 
G
R
 
K
I
 
T
M
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
G
|
G
M
 
L
G
 
G
N
x
R
V
x
I
G
 
G
K
 
R
A
 
E
V
 
V
-
 
A
F
 
T
R
 
R
I
 
M
A
 
Q
K
 
S
Y
 
F
G
 
G
F
 
M
Q
 
K
L
 
T
E
 
I
I
 
G
V
x
Y
A
x
D
N
x
P
S
x
I
R
 
I
S
 
S
P
 
P
E
 
E
-
 
V
S
 
S
L
 
A
P
 
S
D
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
F
 
Q
L
 
L
S
 
P
V
 
L
D
 
E
D
 
E
L
 
I
L
 
W
S
 
P
T
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
V
 
T
L
 
V
C
x
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
K
 
S
T
|
T
T
 
T
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
N
R
 
D
E
 
N
R
 
T
I
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
V
x
C
S
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
D
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
R
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
S
 
T
T
 
E
Q
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
P
 
R
E
 
D
H
 
R
P
 
A
Y
 
L
F
 
V
R
 
D
Q
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
V
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
L
 
L
A
x
G
G
 
A
I
 
S
S
 
T
E
 
K
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
M
 
S
R
 
R
M
 
C
G
 
G
K
x
E
G
 
E
A
 
I
A
 
A
A
 
V
E
 
Q
A
 
F
I
 
V
R
 
D
V
 
M
M
 
V
E
 
K

Sites not aligning to the query:

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
31% identity, 82% coverage: 33:298/324 of query aligns to 34:299/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
E
 
E
T
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
A
E
 
E
G
 
L
E
 
Q
G
 
D
A
 
C
E
 
E
I
 
G
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
A
 
S
-
 
A
-
 
T
P
 
K
I
 
V
P
 
T
P
 
A
A
 
D
F
 
V
F
 
I
G
 
N
N
 
A
V
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
V
 
V
V
 
G
R
 
R
H
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
N
I
 
V
P
 
D
Y
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
R
A
 
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
M
N
 
N
V
 
T
P
 
P
A
 
N
V
 
G
N
 
N
A
 
S
P
 
L
T
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
V
 
T
F
 
C
M
 
G
V
 
M
T
 
I
L
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
Q
 
Q
F
 
I
R
 
P
P
 
Q
M
 
A
D
 
T
R
 
A
D
 
S
L
 
M
R
 
K
N
 
D
M
 
G
G
 
K
W
 
W
S
 
E
T
 
R
G
 
K
R
 
K
A
 
F
H
 
M
S
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
G
L
 
T
D
 
E
L
 
L
A
 
N
G
 
G
R
 
K
I
 
T
M
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
G
 
G
M
 
L
G
|
G
N
 
R
V
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
E
V
 
V
-
 
A
F
 
T
R
 
R
I
 
M
A
 
Q
K
 
S
Y
 
F
G
 
G
F
 
M
Q
 
K
L
 
T
E
 
I
I
 
G
V
x
Y
A
x
D
N
x
P
S
x
I
R
x
I
S
 
S
P
 
P
E
 
E
-
 
V
S
 
S
L
 
A
P
 
S
D
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
F
 
Q
L
 
L
S
 
P
V
 
L
D
 
E
D
 
E
L
 
I
L
 
W
S
 
P
T
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
V
 
T
L
 
V
C
 
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
K
 
S
T
 
T
T
 
T
G
 
G
L
|
L
L
 
L
S
 
N
R
 
D
E
 
N
R
 
T
I
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
D
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
R
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
S
 
T
T
 
E
Q
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
P
 
R
E
 
D
H
 
R
P
 
A
Y
 
L
F
 
V
R
 
D
Q
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
V
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
L
 
L
A
 
G
G
 
A
I
 
S
S
 
T
E
 
K
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
M
 
S
R
 
R
M
 
C
G
 
G
K
 
E
G
 
E
A
 
I
A
 
A
A
 
V
E
 
Q
A
 
F
I
 
V

6cwaA Crystal structure phgdh in complex with nadh and 3-phosphoglycerate at 1.77 a resolution (see paper)
31% identity, 82% coverage: 33:298/324 of query aligns to 33:298/299 of 6cwaA

query
sites
6cwaA
E
 
E
T
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
A
E
 
E
G
 
L
E
 
Q
G
 
D
A
 
C
E
 
E
I
 
G
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
A
 
S
-
 
A
-
 
T
P
 
K
I
 
V
P
 
T
P
 
A
A
 
D
F
 
V
F
 
I
G
 
N
N
 
A
V
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
V
 
V
V
 
G
R
 
R
H
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
N
I
 
V
P
 
D
Y
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
R
A
 
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
M
N
 
N
V
 
T
P
 
P
A
 
N
V
 
G
N
|
N
A
 
S
P
 
L
T
 
S
V
x
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
V
 
T
F
 
C
M
 
G
V
 
M
T
 
I
L
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
Q
 
Q
F
 
I
R
 
P
P
 
Q
M
 
A
D
 
T
R
 
A
D
 
S
L
 
M
R
 
K
N
 
D
M
 
G
G
 
K
W
 
W
S
 
E
T
 
R
G
 
K
R
 
K
A
 
F
H
 
M
S
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
G
L
 
T
D
 
E
L
 
L
A
 
N
G
 
G
R
 
K
I
 
T
M
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
N
x
R
V
x
I
G
 
G
K
 
R
A
 
E
V
 
V
-
 
A
F
 
T
R
 
R
I
 
M
A
 
Q
K
 
S
Y
 
F
G
 
G
F
 
M
Q
 
K
L
 
T
E
 
I
I
 
G
V
x
Y
A
x
D
N
x
P
S
x
I
R
 
I
S
 
S
P
 
P
E
 
E
-
 
V
S
 
S
L
 
A
P
 
S
D
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
F
 
Q
L
 
L
S
 
P
V
 
L
D
 
E
D
 
E
L
 
I
L
 
W
S
 
P
T
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
V
 
T
L
 
V
C
x
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
K
 
S
T
|
T
T
 
T
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
N
R
 
D
E
 
N
R
 
T
I
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
V
x
C
S
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
D
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
R
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
S
 
T
T
 
E
Q
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
P
 
R
E
 
D
H
 
R
P
 
A
Y
 
L
F
 
V
R
 
D
Q
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
V
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
L
 
L
A
x
G
G
 
A
I
 
S
S
 
T
E
 
K
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
M
 
S
R
 
R
M
 
C
G
 
G
K
 
E
G
 
E
A
 
I
A
 
A
A
 
V
E
 
Q
A
 
F
I
 
V

6rj2A Crystal structure of phgdh in complex with compound 40 (see paper)
31% identity, 82% coverage: 33:298/324 of query aligns to 31:296/299 of 6rj2A

query
sites
6rj2A
E
 
E
T
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
A
E
 
E
G
 
L
E
 
Q
G
 
D
A
 
C
E
 
E
I
 
G
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
A
 
S
-
 
A
-
 
T
P
 
K
I
 
V
P
 
T
P
 
A
A
 
D
F
 
V
F
 
I
G
 
N
N
 
A
V
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
V
 
V
V
 
G
R
 
R
H
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
N
I
 
V
P
 
D
Y
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
R
A
 
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
M
N
 
N
V
 
T
P
 
P
A
 
N
V
 
G
N
 
N
A
 
S
P
 
L
T
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
V
 
T
F
 
C
M
 
G
V
 
M
T
 
I
L
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
Q
 
Q
F
 
I
R
 
P
P
 
Q
M
 
A
D
 
T
R
 
A
D
 
S
L
 
M
R
 
K
N
 
D
M
 
G
G
 
K
W
 
W
S
 
E
T
 
R
G
 
K
R
 
K
A
 
F
H
 
M
S
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
G
L
 
T
D
 
E
L
 
L
A
 
N
G
 
G
R
 
K
I
 
T
M
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
G
 
G
M
 
L
G
|
G
N
 
R
V
x
I
G
 
G
K
 
R
A
 
E
V
 
V
-
 
A
F
 
T
R
 
R
I
 
M
A
 
Q
K
 
S
Y
 
F
G
 
G
F
 
M
Q
 
K
L
 
T
E
 
I
I
 
G
V
x
Y
A
x
D
N
x
P
S
x
I
R
x
I
S
 
S
P
 
P
E
 
E
-
 
V
S
 
S
L
 
A
P
 
S
D
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
F
 
Q
L
 
L
S
 
P
V
 
L
D
 
E
D
 
E
L
 
I
L
 
W
S
 
P
T
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
V
 
T
L
 
V
C
x
H
C
x
T
P
 
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
K
 
S
T
 
T
T
 
T
G
 
G
L
|
L
L
 
L
S
 
N
R
 
D
E
 
N
R
 
T
I
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
C
S
 
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
D
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
R
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
S
 
T
T
 
E
Q
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
P
 
R
E
 
D
H
 
R
P
 
A
Y
 
L
F
 
V
R
 
D
Q
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
V
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
L
 
L
A
 
G
G
 
A
I
 
S
S
 
T
E
 
K
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
M
 
S
R
 
R
M
 
C
G
 
G
K
 
E
G
 
E
A
 
I
A
 
A
A
 
V
E
 
Q
A
 
F
I
 
V

Q65CJ7 Hydroxyphenylpyruvate reductase; HPPR; EC 1.1.1.237 from Plectranthus scutellarioides (Coleus) (Solenostemon scutellarioides) (see paper)
35% identity, 71% coverage: 59:289/324 of query aligns to 65:291/313 of Q65CJ7

query
sites
Q65CJ7
V
 
L
P
 
P
A
 
K
L
 
L
R
 
E
A
 
I
V
 
V
V
 
S
R
 
S
H
 
F
G
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
M
 
K
I
 
V
P
 
D
Y
 
L
D
 
I
A
 
K
A
 
C
T
 
E
A
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
R
I
 
V
A
 
T
N
 
N
V
 
T
P
 
P
A
 
D
V
 
V
N
 
L
A
 
T
P
 
D
T
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
D
H
 
L
V
 
A
F
 
I
M
 
G
V
 
L
T
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
L
R
 
R
Q
 
R
F
 
I
R
 
C
P
 
E
M
 
C
D
 
D
R
 
K
D
 
Y
L
 
V
R
 
R
N
 
R
M
 
G
G
 
A
W
 
W
S
 
K
T
 
F
G
 
G
R
 
-
A
 
-
H
 
D
S
 
F
D
 
K
R
 
L
A
 
T
L
 
T
D
 
K
L
 
F
A
 
S
G
 
G
R
 
K
I
 
R
M
 
V
G
 
G
V
 
I
I
 
I
G
 
G
M
x
L
G
|
G
N
x
R
V
x
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
V
 
V
F
 
A
R
 
E
I
 
R
A
 
A
K
 
E
Y
 
-
G
 
A
F
 
F
Q
 
D
L
 
C
E
 
P
I
 
I
V
 
S
A
 
Y
N
 
F
S
|
S
R
|
R
S
|
S
P
 
K
E
 
K
S
 
P
L
 
N
P
 
T
D
 
N
G
 
Y
V
 
T
R
 
Y
F
 
Y
L
 
G
S
 
S
V
 
V
D
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
A
S
 
S
T
 
N
A
 
S
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
V
L
 
V
C
 
A
C
 
C
P
 
P
L
 
L
T
 
T
P
 
P
K
 
E
T
 
T
T
 
T
G
 
H
L
 
I
L
 
I
S
 
N
R
 
R
E
 
E
R
 
V
I
 
I
A
 
D
R
 
A
M
 
L
K
 
G
P
 
P
G
 
K
A
 
G
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
S
 
G
R
 
R
G
 
G
P
 
P
V
 
H
V
 
V
D
 
D
D
 
E
A
 
P
A
 
E
L
 
L
I
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
E
 
V
R
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
S
 
E
T
 
R
Q
 
E
P
 
P
L
 
E
P
 
V
P
 
P
E
 
E
H
 
K
P
 
-
Y
 
L
F
 
F
R
 
G
Q
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
V
V
 
L
T
 
L
P
 
P
H
 
H
L
 
V
A
 
G
G
 
S
I
 
G
S
 
T
E
 
V
E
 
E
S
 
T
M
 
R
M
 
K
R
 
V
M
 
M

Query Sequence

>SMa1347 FitnessBrowser__Smeli:SMa1347
MSFIFSTHRLHPDAEAMLKAASDLRVASAPDPETLLREGEGAEIVIVRAPIPPAFFGNVP
ALRAVVRHGAGLDMIPYDAATAAGVLIANVPAVNAPTVAEHVFMVTLALLRQFRPMDRDL
RNMGWSTGRAHSDRALDLAGRIMGVIGMGNVGKAVFRIAKYGFQLEIVANSRSPESLPDG
VRFLSVDDLLSTADIVVLCCPLTPKTTGLLSRERIARMKPGAILVNVSRGPVVDDAALIE
ALERGRIGGAALDVFSTQPLPPEHPYFRQDNVIVTPHLAGISEESMMRMGKGAAAEAIRV
MEGGLPVNLRNPEVVEHYRRRFPG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory