SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMa1462 FitnessBrowser__Smeli:SMa1462 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 15 hits to proteins with known functional sites (download)

7s7xA Crystal structure of icytsnfr cytisine sensor precursor binding protein with varenicline bound
37% identity, 91% coverage: 28:296/296 of query aligns to 4:274/278 of 7s7xA

query
sites
7s7xA
T
 
T
I
 
V
T
 
V
V
 
V
G
 
G
G
 
S
K
 
I
N
 
I
F
|
F
T
 
T
E
 
E
Q
 
G
L
 
I
I
 
I
I
 
V
A
 
A
E
 
N
I
 
M
T
 
V
K
 
A
Q
 
E
L
 
M
L
 
I
E
 
E
S
 
A
K
 
-
G
 
-
H
 
H
T
 
T
-
 
D
-
 
L
-
 
K
V
 
V
D
 
V
K
 
R
K
 
K
D
 
L
G
 
N
M
 
L
G
 
G
-
x
G
-
x
Y
-
 
N
-
 
V
-
 
N
-
 
F
T
 
E
K
 
A
I
 
I
V
 
K
R
 
R
A
 
G
A
 
G
L
 
A
E
 
N
N
 
N
G
 
G
E
 
-
V
 
I
D
 
D
L
 
I
Y
 
Y
W
 
V
E
 
E
Y
|
Y
T
 
T
G
 
G
T
x
H
S
 
G
L
 
L
I
 
V
T
 
D
F
 
I
N
 
L
K
 
G
V
 
F
T
 
P
E
 
A
R
 
T
L
 
T
S
 
D
P
 
P
E
 
E
E
 
G
T
 
A
Y
 
Y
N
 
E
R
 
T
V
 
V
K
 
K
-
 
K
E
 
E
L
 
Y
D
 
K
G
 
R
E
 
K
K
 
W
G
 
N
L
 
I
V
 
V
W
 
W
L
 
L
A
 
K
P
 
P
S
 
L
A
 
G
A
 
F
N
 
N
N
|
N
T
 
T
Y
|
Y
A
 
T
Y
 
L
V
 
T
V
 
V
K
 
K
P
 
D
G
 
E
N
 
L
A
 
A
K
 
K
T
 
Q
E
 
Y
G
 
N
M
 
L
E
 
K
T
 
T
I
 
F
S
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
I
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
G
 
S
K
 
D
D
 
K
I
 
L
L
 
I
M
 
L
G
 
G
T
 
A
T
 
T
A
 
M
E
 
W
F
 
F
P
 
L
K
 
E
R
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
Y
I
 
P
G
 
G
L
 
L
E
 
Q
K
 
K
V
 
L
Y
 
Y
G
 
N
F
 
F
E
 
K
T
 
F
G
 
-
R
 
-
A
 
K
N
 
H
V
 
T
R
 
K
P
 
S
M
 
M
D
 
D
L
 
M
G
 
G
L
 
I
A
 
R
Y
 
Y
N
 
T
A
 
A
L
 
I
A
 
D
N
 
N
G
 
N
D
 
E
L
 
V
D
 
Q
T
 
V
I
 
I
A
 
D
A
 
A
Q
x
W
A
 
A
T
 
T
D
 
D
G
 
G
Q
 
L
I
 
L
A
 
V
A
 
S
L
 
H
G
 
K
L
 
L
K
 
K
T
 
I
L
 
L
K
 
E
D
 
D
D
 
D
K
 
K
G
 
A
F
 
F
F
 
F
P
 
P
N
 
P
Y
 
Y
A
 
Y
L
 
A
T
 
A
P
 
P
V
 
I
V
 
I
R
 
R
K
 
Q
E
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
K
N
 
H
P
 
P
D
 
E
L
 
L
K
 
K
E
 
D
T
 
V
L
 
L
E
 
N
T
 
K
V
 
L
S
 
A
K
 
N
K
 
Q
L
 
I
D
 
S
D
 
L
A
 
E
T
 
E
M
 
M
Q
 
Q
R
 
K
L
 
L
N
 
N
S
 
Y
Q
 
K
V
 
V
D
 
D
V
 
G
E
 
E
K
 
G
K
 
Q
T
 
D
I
 
P
E
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
K
D
 
E
Y
 
F
L
 
L
K
 
K
S
 
E
L
 
K
G
 
G
M
 
L

6v1rA Crystal structure of iachsnfr fluorescent acetylcholine sensor precursor binding protein
37% identity, 91% coverage: 28:296/296 of query aligns to 4:274/278 of 6v1rA

query
sites
6v1rA
T
 
T
I
 
V
T
 
V
V
 
V
G
 
G
G
 
S
K
 
I
N
 
I
F
|
F
T
 
T
E
 
E
Q
 
G
L
 
I
I
 
I
I
 
V
A
 
A
E
 
N
I
 
M
T
 
V
K
 
A
Q
 
E
L
 
M
L
 
I
E
 
E
S
 
A
K
 
-
G
 
-
H
 
H
T
 
T
-
 
D
-
 
L
-
 
K
V
 
V
D
 
V
K
 
R
K
 
K
D
 
L
G
 
N
M
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
N
-
 
V
-
 
N
-
 
F
T
 
E
K
 
A
I
 
I
V
 
K
R
 
R
A
 
G
A
 
G
L
 
A
E
 
N
N
 
N
G
 
G
E
 
-
V
 
I
D
 
D
L
 
I
Y
 
Y
W
 
V
E
 
E
Y
|
Y
T
 
T
G
 
G
T
 
H
S
 
G
L
 
L
I
 
V
T
 
D
F
 
I
N
 
L
K
 
G
V
 
F
T
 
P
E
 
A
R
 
T
L
 
T
S
 
D
P
 
P
E
 
E
E
 
G
T
 
A
Y
 
Y
N
 
E
R
 
T
V
 
V
K
 
K
-
 
K
E
 
E
L
 
Y
D
 
K
G
 
R
E
 
K
K
 
W
G
 
N
L
 
I
V
 
V
W
 
W
L
 
L
A
 
K
P
 
P
S
 
L
A
 
G
A
 
F
N
 
N
N
|
N
T
 
T
Y
|
Y
A
 
T
Y
 
L
V
 
T
V
 
V
K
 
K
P
 
D
G
 
E
N
 
L
A
 
A
K
 
K
T
 
Q
E
 
Y
G
 
N
M
 
L
E
 
K
T
 
T
I
 
F
S
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
I
Y
 
S
N
 
D
D
 
K
G
 
-
K
 
-
D
 
-
I
 
L
L
 
I
M
 
L
G
 
G
T
 
A
T
 
T
A
 
M
E
x
F
F
 
F
P
 
L
K
 
E
R
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
Y
I
 
P
G
 
G
L
 
L
E
 
Q
K
 
K
V
 
L
Y
 
Y
G
 
N
F
 
F
E
 
K
T
 
F
G
 
-
R
 
-
A
 
K
N
 
H
V
 
T
R
 
K
P
 
S
M
 
M
D
 
D
L
 
M
G
 
G
L
 
I
A
 
R
Y
 
Y
N
 
T
A
 
A
L
 
I
A
 
D
N
 
N
G
 
N
D
 
E
L
 
V
D
 
Q
T
 
V
I
 
I
A
 
D
A
 
A
Q
x
W
A
 
A
T
 
T
D
 
D
G
 
G
Q
 
L
I
 
L
A
 
V
A
 
S
L
 
H
G
 
K
L
 
L
K
 
K
T
 
I
L
 
L
K
 
E
D
 
D
D
 
D
K
 
K
G
 
A
F
 
F
F
 
F
P
 
P
N
 
P
Y
|
Y
A
 
Y
L
 
A
T
 
A
P
 
P
V
 
I
V
 
I
R
 
R
K
 
Q
E
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
K
N
 
H
P
 
P
D
 
E
L
 
L
K
 
K
E
 
D
T
 
V
L
 
L
E
 
N
T
 
K
V
 
L
S
 
A
K
 
N
K
 
Q
L
 
I
D
 
S
D
 
L
A
 
E
T
 
E
M
 
M
Q
 
Q
R
 
K
L
 
L
N
 
N
S
 
Y
Q
 
K
V
 
V
D
 
D
V
 
G
E
 
E
K
 
G
K
 
Q
T
 
D
I
 
P
E
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
K
D
 
E
Y
 
F
L
 
L
K
 
K
S
 
E
L
 
K
G
 
G
M
 
L

B5Z7I3 Ergothioneine transport permease/ergothioneine binding protein EgtU from Helicobacter pylori (strain G27) (see paper)
36% identity, 91% coverage: 29:296/296 of query aligns to 290:553/553 of B5Z7I3

query
sites
B5Z7I3
I
 
L
T
 
V
V
 
V
G
 
A
G
 
T
K
 
K
N
 
P
F
 
S
T
 
S
E
 
E
Q
 
Q
L
 
Y
I
 
I
I
 
L
A
 
G
E
 
E
I
 
I
T
 
L
K
 
S
Q
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
K
K
 
H
G
 
H
H
 
I
T
 
P
V
 
I
D
 
K
K
 
R
K
 
A
D
 
F
G
 
G
M
 
I
G
 
G
-
 
G
-
 
G
T
 
T
K
 
M
I
 
N
V
 
I
R
 
H
A
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
I
N
 
R
G
 
G
E
 
D
V
 
F
D
 
D
L
 
L
Y
 
Y
W
 
M
E
 
E
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
T
 
T
S
 
A
L
 
W
I
 
V
T
 
N
F
 
T
-
 
L
-
 
K
N
 
N
K
 
P
V
 
L
T
 
T
E
 
Q
R
 
K
L
 
V
S
 
D
P
 
F
E
 
E
E
 
T
T
 
I
Y
 
K
N
 
K
R
 
R
V
 
Y
K
 
E
E
 
K
L
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
E
K
 
F
G
 
N
L
 
L
V
 
L
W
 
W
L
 
V
A
 
G
P
 
L
S
 
L
A
 
G
A
 
F
N
 
N
N
 
N
T
 
T
Y
|
Y
A
 
S
Y
 
L
V
 
A
V
 
I
K
 
S
P
 
K
G
 
E
N
 
D
A
 
A
K
 
Q
T
 
K
E
 
Y
G
 
A
M
 
I
E
 
E
T
 
T
I
 
F
S
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
L
A
 
-
Y
 
-
N
 
-
D
 
H
G
 
S
K
 
Q
D
 
N
I
 
F
L
 
D
M
 
F
G
 
G
T
 
A
T
 
E
A
 
F
E
 
D
F
 
F
P
 
F
K
 
E
R
 
R
P
 
E
D
 
D
G
 
A
L
 
F
I
 
K
G
 
G
L
 
L
E
 
M
K
 
K
V
 
A
Y
 
Y
G
 
R
F
 
F
E
 
H
T
 
F
G
 
-
R
 
-
A
 
R
N
 
S
V
 
L
R
 
H
P
 
E
M
 
M
D
 
D
L
 
I
G
 
N
L
 
L
A
x
R
Y
 
Y
N
 
K
A
 
S
L
 
F
A
 
E
N
 
S
G
 
H
D
 
K
L
 
I
D
 
N
T
 
A
I
 
L
A
 
D
A
 
V
Q
 
F
A
 
T
T
 
T
D
 
D
G
 
A
Q
 
Q
I
 
I
A
 
K
A
 
E
L
 
L
G
 
D
L
 
L
K
 
K
T
 
V
L
 
L
K
 
K
D
 
D
D
 
D
K
 
K
G
 
G
F
 
F
F
 
F
P
 
P
N
 
N
Y
 
Y
A
 
Q
L
 
A
T
 
G
P
 
I
V
 
V
V
 
I
R
 
R
K
 
K
E
 
E
V
 
I
L
 
I
D
 
K
A
 
K
N
 
Y
P
 
P
D
 
E
L
 
A
K
 
L
E
 
K
T
 
I
L
 
L
E
 
E
T
 
K
V
 
L
S
 
D
K
 
S
K
 
K
L
 
I
D
 
N
D
 
D
A
 
E
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
R
 
D
L
 
L
N
 
N
S
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
D
 
E
V
 
V
E
 
L
K
 
K
K
 
K
T
 
S
I
 
P
E
 
K
T
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
K
D
 
D
Y
 
F
L
 
L
K
 
E
S
 
R
L
 
L
G
 
G
M
 
L

8dp7A Structure of helicobacter pylori egtu bound to egt (see paper)
36% identity, 91% coverage: 29:296/296 of query aligns to 2:265/265 of 8dp7A

query
sites
8dp7A
I
 
L
T
 
V
V
 
V
G
 
A
G
 
T
K
|
K
N
 
P
F
 
S
T
 
S
E
 
E
Q
 
Q
L
 
Y
I
 
I
I
 
L
A
 
G
E
 
E
I
 
I
T
 
L
K
 
S
Q
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
K
K
 
H
G
 
H
H
 
I
T
 
P
V
 
I
D
 
K
K
 
R
K
 
A
D
 
F
G
 
G
M
 
I
G
 
G
-
 
G
-
 
G
T
 
T
K
 
M
I
 
N
V
 
I
R
 
H
A
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
I
N
 
R
G
 
G
E
 
D
V
 
F
D
 
D
L
 
L
Y
 
Y
W
 
V
E
 
E
Y
|
Y
T
 
T
G
 
G
T
|
T
S
 
A
L
 
W
I
 
V
T
 
N
F
 
T
-
 
L
-
 
K
N
 
N
K
 
P
V
 
L
T
 
T
E
 
Q
R
 
K
L
 
V
S
 
D
P
 
F
E
 
E
E
 
T
T
 
I
Y
 
K
N
 
K
R
 
R
V
 
Y
K
 
E
E
 
K
L
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
E
K
 
F
G
 
N
L
 
L
V
 
L
W
 
W
L
 
V
A
 
G
P
 
L
S
 
L
A
 
G
A
 
F
N
 
N
N
 
N
T
 
T
Y
 
Y
A
 
S
Y
 
L
V
 
A
V
 
I
K
 
S
P
 
K
G
 
E
N
 
D
A
 
A
K
 
Q
T
 
K
E
 
Y
G
 
A
M
 
I
E
 
E
T
 
T
I
 
F
S
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
-
A
 
-
Y
 
-
N
 
F
D
 
H
G
 
S
K
 
P
D
 
N
I
 
F
L
 
D
M
 
F
G
 
G
T
 
A
T
 
E
A
 
F
E
 
D
F
 
F
P
 
F
K
 
E
R
|
R
P
 
E
D
 
D
G
 
A
L
 
F
I
 
K
G
 
G
L
 
L
E
 
M
K
 
K
V
 
A
Y
 
Y
G
 
R
F
 
F
E
 
H
T
 
F
G
 
-
R
 
-
A
 
R
N
 
S
V
 
L
R
 
H
P
 
E
M
 
M
D
 
D
L
x
I
G
 
N
L
 
L
A
 
R
Y
 
Y
N
 
K
A
 
S
L
 
F
A
 
E
N
 
S
G
 
H
D
 
K
L
 
I
D
 
N
T
 
A
I
 
L
A
 
D
A
 
V
Q
x
F
A
 
T
T
 
T
D
 
D
G
 
A
Q
 
Q
I
 
I
A
 
K
A
 
E
L
 
L
G
 
D
L
 
L
K
 
K
T
 
V
L
 
L
K
 
K
D
 
D
D
 
D
K
 
K
G
 
G
F
 
F
F
 
F
P
 
P
N
 
N
Y
|
Y
A
 
Q
L
 
A
T
 
G
P
 
I
V
 
V
V
 
I
R
 
R
K
 
K
E
 
E
V
 
T
L
 
I
D
 
K
A
 
K
N
 
Y
P
 
P
D
 
E
L
 
A
K
 
L
E
 
K
T
 
I
L
 
L
E
 
E
T
 
K
V
 
L
S
 
D
K
 
S
K
 
K
L
 
I
D
 
N
D
 
D
A
 
E
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
R
 
D
L
 
L
N
 
N
S
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
D
 
E
V
 
V
E
 
L
K
 
K
K
 
K
T
 
S
I
 
P
E
 
K
T
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
K
D
 
D
Y
 
F
L
 
L
K
 
E
S
 
R
L
 
L
G
 
G
M
 
L

1sw1A Crystal structure of prox from archeoglobus fulgidus in complex with proline betaine (see paper)
35% identity, 91% coverage: 29:296/296 of query aligns to 3:268/270 of 1sw1A

query
sites
1sw1A
I
 
V
T
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
S
K
|
K
N
 
P
F
 
F
T
 
N
E
 
E
Q
 
Q
L
 
Y
I
 
I
I
 
L
A
 
A
E
 
N
I
 
M
T
 
I
K
 
A
Q
 
I
L
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
E
K
 
N
G
 
G
H
 
Y
T
 
K
V
 
A
D
 
E
K
 
V
K
 
K
D
 
E
G
 
G
M
 
L
G
 
G
T
 
G
K
 
T
I
 
L
V
 
V
R
 
N
-
 
Y
A
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
K
N
 
R
G
 
N
E
 
D
V
 
I
D
 
Q
L
 
L
Y
 
Y
W
 
V
E
 
E
Y
|
Y
T
 
T
G
 
G
T
|
T
S
 
A
L
 
-
I
 
-
T
 
-
F
 
Y
N
 
N
K
 
V
V
 
I
T
 
L
E
 
R
R
 
K
L
 
Q
S
 
P
P
 
P
E
 
E
-
 
L
-
 
W
-
 
D
-
 
Q
-
 
Q
E
 
Y
T
 
I
Y
 
F
N
 
D
R
 
E
V
 
V
K
 
K
E
 
K
-
 
G
L
 
L
D
 
L
G
 
E
E
 
A
K
 
D
G
 
G
L
 
V
V
 
V
W
 
V
L
 
A
A
 
A
P
 
K
S
 
L
A
 
G
A
 
F
N
 
R
N
x
D
T
 
D
Y
|
Y
A
 
A
Y
 
L
V
 
A
V
 
V
K
 
R
P
 
A
G
 
D
N
 
W
A
 
A
K
 
E
T
 
E
E
 
N
G
 
G
M
 
V
E
 
E
T
 
K
I
 
I
S
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
F
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
G
 
A
K
 
D
D
 
Q
I
 
L
L
 
V
M
 
F
G
 
G
T
 
S
T
 
D
A
 
P
E
 
E
F
 
F
P
 
A
K
 
S
R
|
R
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
P
G
 
Q
L
 
I
E
 
K
K
 
K
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
E
 
E
T
 
F
G
 
-
R
 
-
A
 
K
N
 
E
V
 
V
R
 
K
P
 
Q
M
 
M
D
 
E
L
 
P
G
 
T
L
 
L
A
 
M
Y
 
Y
N
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
K
N
 
N
G
 
K
D
 
Q
L
 
V
D
 
D
T
 
V
I
 
I
A
 
P
A
 
A
Q
x
Y
A
 
T
T
 
T
D
 
D
G
 
S
Q
 
R
I
 
V
A
 
D
A
 
L
L
 
F
G
 
N
L
 
L
K
 
K
T
 
I
L
 
L
K
 
E
D
 
D
D
 
D
K
 
K
G
 
G
F
 
A
F
 
L
P
 
P
N
 
P
Y
|
Y
A
 
D
L
 
A
T
 
I
P
 
I
V
 
I
V
 
V
R
 
N
K
 
G
E
 
N
V
 
T
L
 
A
D
 
-
A
 
K
N
 
D
P
 
E
D
 
K
L
 
L
K
 
I
E
 
S
T
 
V
L
 
L
E
 
K
T
 
L
V
 
L
S
x
E
K
x
D
K
 
R
L
 
I
D
|
D
D
 
T
A
x
D
T
 
T
M
 
M
Q
 
R
R
 
A
L
 
L
N
 
N
S
 
Y
Q
 
Q
V
 
Y
D
 
D
V
 
V
E
 
E
K
 
K
K
 
K
T
 
D
I
 
A
E
 
R
T
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
M
D
 
S
Y
 
F
L
 
L
K
 
K
S
 
E
L
 
Q
G
 
G
M
 
L

7s7tA Inicsnfr3a nicotine sensor comprising periplasmic binding sequence plus fluorescent sequence with varenicline bound (see paper)
39% identity, 67% coverage: 100:296/296 of query aligns to 315:507/509 of 7s7tA

query
sites
7s7tA
P
 
P
E
 
E
E
 
G
T
 
A
Y
 
Y
N
 
E
R
 
T
V
 
V
K
 
K
-
 
K
E
 
E
L
 
Y
D
 
K
G
 
R
E
 
K
K
 
W
G
 
N
L
 
I
V
 
V
W
 
W
L
 
L
A
 
K
P
 
P
S
 
L
A
 
G
A
 
F
N
 
N
N
|
N
T
 
T
Y
|
Y
A
 
T
Y
 
L
V
 
T
V
 
V
K
 
K
P
 
D
G
 
E
N
 
L
A
 
A
K
 
K
T
 
Q
E
 
Y
G
 
N
M
 
L
E
 
K
T
 
T
I
 
F
S
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
I
Y
 
S
N
 
D
D
 
K
G
 
-
K
 
-
D
 
-
I
 
L
L
 
I
M
 
L
G
 
G
T
 
A
T
 
T
A
 
M
E
 
F
F
 
F
P
 
L
K
 
E
R
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
Y
I
 
P
G
 
G
L
 
L
E
 
Q
K
 
K
V
 
L
Y
 
Y
G
 
N
F
 
F
E
 
K
T
 
F
G
 
-
R
 
-
A
 
K
N
 
H
V
 
T
R
 
K
P
 
S
M
 
M
D
 
D
L
 
M
G
 
G
L
 
I
A
 
R
Y
 
Y
N
 
T
A
 
A
L
 
I
A
 
D
N
 
N
G
 
N
D
 
E
L
 
V
D
 
Q
T
 
V
I
 
I
A
 
D
A
 
A
Q
 
W
A
 
A
T
 
T
D
 
D
G
 
G
Q
 
L
I
 
L
A
 
V
A
 
S
L
 
H
G
 
K
L
 
L
K
 
K
T
 
I
L
 
L
K
 
E
D
 
D
D
 
D
K
 
K
G
 
A
F
 
F
F
 
F
P
 
P
N
 
P
Y
 
Y
A
 
Y
L
 
A
T
 
A
P
 
P
V
 
I
V
 
I
R
 
R
K
 
Q
E
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
K
N
 
H
P
 
P
D
 
E
L
 
L
K
 
K
E
 
D
T
 
V
L
 
L
E
 
N
T
 
K
V
 
L
S
 
A
K
 
N
K
 
Q
L
 
I
D
 
S
D
 
L
A
 
E
T
 
E
M
 
M
Q
 
Q
R
 
K
L
 
L
N
 
N
S
 
Y
Q
 
K
V
 
V
D
 
D
V
 
G
E
 
E
K
 
G
K
 
Q
T
 
D
I
 
P
E
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
K
D
 
E
Y
 
F
L
 
L
K
 
K
S
 
E
L
 
K
G
 
G
M
 
L

Sites not aligning to the query:

3pprA Structures of the substrate-binding protein provide insights into the multiple compatible solutes binding specificities of bacillus subtilis abc transporter opuc (see paper)
35% identity, 90% coverage: 28:292/296 of query aligns to 1:265/271 of 3pprA

query
sites
3pprA
T
 
T
I
 
I
T
 
K
V
 
I
G
 
G
G
 
A
K
 
Q
N
 
S
F
 
M
T
 
T
E
 
E
Q
 
S
L
 
E
I
 
I
I
 
V
A
 
A
E
 
N
I
 
M
T
 
I
K
 
A
Q
 
Q
L
 
L
L
 
I
E
 
E
S
 
-
K
 
-
G
 
-
H
 
H
T
 
D
V
 
T
D
 
D
K
 
L
K
 
N
-
 
T
-
 
A
-
 
L
-
 
V
D
 
K
G
 
N
M
 
L
G
 
G
T
 
S
K
 
N
I
 
Y
V
 
V
R
 
Q
A
 
H
-
 
Q
A
 
A
L
 
M
E
 
L
N
 
G
G
 
G
E
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
I
Y
 
S
-
 
A
W
 
T
E
 
R
Y
|
Y
T
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
D
L
 
L
I
 
T
-
 
S
T
 
T
F
 
L
N
 
G
K
 
K
V
 
E
T
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
-
S
 
D
P
 
P
E
 
K
E
 
K
T
 
A
Y
 
L
N
 
N
R
 
I
V
 
V
K
 
Q
-
 
N
E
 
E
L
 
F
D
 
Q
G
 
K
E
 
R
K
 
F
G
 
S
L
 
Y
V
 
K
W
 
W
L
 
F
A
 
D
P
 
S
S
 
Y
A
 
G
A
 
F
N
 
D
N
|
N
T
 
T
Y
|
Y
A
 
A
Y
 
F
V
 
T
V
 
V
K
 
T
P
 
K
G
 
K
N
 
F
A
 
A
K
 
E
T
 
K
E
 
E
G
 
H
M
 
I
E
 
N
T
 
T
I
 
V
S
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
K
K
 
K
A
 
-
Y
 
-
N
 
N
D
 
A
G
 
S
K
 
Q
D
 
Y
I
 
K
L
 
L
M
 
G
G
 
V
T
 
D
T
 
N
A
 
A
E
 
W
F
 
L
P
 
K
K
 
R
R
 
K
P
 
G
D
 
D
G
 
G
L
 
Y
I
 
K
G
 
G
L
 
F
E
 
V
K
 
S
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
E
 
E
T
 
F
G
 
G
R
 
-
A
 
-
N
 
T
V
 
T
R
 
Y
P
 
P
M
 
M
D
 
Q
L
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
V
Y
 
Y
N
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
K
N
 
N
G
 
G
D
 
K
L
 
M
D
 
D
T
 
A
I
 
V
A
 
L
A
 
A
Q
x
Y
A
 
S
T
 
T
D
 
D
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
A
 
K
A
 
A
L
 
Y
G
 
D
L
 
L
K
 
K
T
 
I
L
 
L
K
 
K
D
 
D
D
 
D
K
 
K
G
 
R
F
 
F
F
 
F
P
 
P
N
 
P
Y
|
Y
A
 
D
L
 
C
T
 
S
P
 
P
V
 
V
V
 
I
R
 
P
K
 
E
E
 
K
V
 
V
L
 
L
D
 
K
A
 
E
N
 
H
P
 
P
D
 
E
L
 
L
K
 
E
E
 
G
T
 
V
L
 
I
E
 
N
T
 
K
V
 
L
S
 
I
K
 
G
K
 
Q
L
 
I
D
 
D
D
 
T
A
 
E
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
R
 
E
L
 
L
N
 
N
S
 
Y
Q
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
G
E
 
K
K
 
L
K
 
K
T
 
E
I
 
P
E
 
S
T
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
K
D
 
E
Y
 
F
L
 
L
K
 
E

3ppqA Structures of the substrate-binding protein provide insights into the multiple compatible solutes binding specificities of bacillus subtilis abc transporter opuc (see paper)
35% identity, 90% coverage: 28:292/296 of query aligns to 1:265/271 of 3ppqA

query
sites
3ppqA
T
 
T
I
 
I
T
 
K
V
 
I
G
 
G
G
 
A
K
 
Q
N
 
S
F
 
M
T
 
T
E
 
E
Q
 
S
L
 
E
I
 
I
I
 
V
A
 
A
E
 
N
I
 
M
T
 
I
K
 
A
Q
 
Q
L
 
L
L
 
I
E
 
E
S
 
-
K
 
-
G
 
-
H
 
H
T
 
D
V
 
T
D
 
D
K
 
L
K
 
N
-
 
T
-
 
A
-
 
L
-
 
V
D
 
K
G
 
N
M
 
L
G
 
G
T
 
S
K
 
N
I
 
Y
V
 
V
R
 
Q
A
 
H
-
 
Q
A
 
A
L
 
M
E
 
L
N
 
G
G
 
G
E
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
I
Y
 
S
-
 
A
W
 
T
E
 
R
Y
 
Y
T
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
D
L
 
L
I
 
T
-
 
S
T
 
T
F
 
L
N
 
G
K
 
K
V
 
E
T
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
-
S
 
D
P
 
P
E
 
K
E
 
K
T
 
A
Y
 
L
N
 
N
R
 
I
V
 
V
K
 
Q
-
 
N
E
 
E
L
 
F
D
 
Q
G
 
K
E
 
R
K
 
F
G
 
S
L
 
Y
V
 
K
W
 
W
L
 
F
A
 
D
P
 
S
S
 
Y
A
 
G
A
 
F
N
 
D
N
|
N
T
 
T
Y
|
Y
A
 
A
Y
 
F
V
 
T
V
 
V
K
 
T
P
 
K
G
 
K
N
 
F
A
 
A
K
 
E
T
 
K
E
 
E
G
 
H
M
 
I
E
 
N
T
 
T
I
 
V
S
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
K
K
 
K
A
 
-
Y
 
-
N
 
N
D
 
A
G
 
S
K
 
Q
D
 
Y
I
 
K
L
 
L
M
 
G
G
 
V
T
 
D
T
 
N
A
 
A
E
 
W
F
 
L
P
 
K
K
 
R
R
 
K
P
 
G
D
 
D
G
 
G
L
 
Y
I
 
K
G
 
G
L
 
F
E
 
V
K
 
S
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
E
 
E
T
 
F
G
 
G
R
 
-
A
 
-
N
 
T
V
 
T
R
 
Y
P
 
P
M
 
M
D
 
Q
L
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
V
Y
 
Y
N
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
K
N
 
N
G
 
G
D
 
K
L
 
M
D
 
D
T
 
A
I
 
V
A
 
L
A
 
A
Q
x
Y
A
 
S
T
 
T
D
 
D
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
A
 
K
A
 
A
L
 
Y
G
 
D
L
 
L
K
 
K
T
 
I
L
 
L
K
 
K
D
 
D
D
 
D
K
 
K
G
 
R
F
 
F
F
 
F
P
 
P
N
 
P
Y
|
Y
A
 
D
L
 
C
T
 
S
P
 
P
V
 
V
V
 
I
R
 
P
K
 
E
E
 
K
V
 
V
L
 
L
D
 
K
A
 
E
N
 
H
P
 
P
D
 
E
L
 
L
K
 
E
E
 
G
T
 
V
L
 
I
E
 
N
T
 
K
V
 
L
S
 
I
K
 
G
K
 
Q
L
 
I
D
 
D
D
 
T
A
 
E
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
R
 
E
L
 
L
N
 
N
S
 
Y
Q
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
G
E
 
K
K
 
L
K
 
K
T
 
E
I
 
P
E
 
S
T
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
K
D
 
E
Y
 
F
L
 
L
K
 
E

3ppoA Structures of the substrate-binding protein provide insights into the multiple compatible solutes binding specificities of bacillus subtilis abc transporter opuc (see paper)
35% identity, 90% coverage: 28:292/296 of query aligns to 2:266/272 of 3ppoA

query
sites
3ppoA
T
 
T
I
 
I
T
 
K
V
 
I
G
 
G
G
 
A
K
x
Q
N
 
S
F
 
M
T
 
T
E
 
E
Q
 
S
L
 
E
I
 
I
I
 
V
A
 
A
E
 
N
I
 
M
T
 
I
K
 
A
Q
 
Q
L
 
L
L
 
I
E
 
E
S
 
-
K
 
-
G
 
-
H
 
H
T
 
D
V
 
T
D
 
D
K
 
L
K
 
N
-
 
T
-
 
A
-
 
L
-
 
V
D
 
K
G
 
N
M
 
L
G
 
G
T
x
S
K
x
N
I
 
Y
V
 
V
R
 
Q
A
 
H
-
 
Q
A
 
A
L
 
M
E
 
L
N
 
G
G
 
G
E
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
I
Y
 
S
W
 
A
-
 
T
E
 
R
Y
|
Y
T
 
S
G
 
G
T
|
T
S
 
D
L
 
L
I
 
T
-
 
S
T
 
T
F
 
L
N
 
G
K
 
K
V
 
E
T
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
-
S
 
D
P
 
P
E
 
K
E
 
K
T
 
A
Y
 
L
N
 
N
R
 
I
V
 
V
K
 
Q
-
 
N
E
 
E
L
 
F
D
 
Q
G
 
K
E
 
R
K
 
F
G
 
S
L
 
Y
V
 
K
W
 
W
L
 
F
A
 
D
P
 
S
S
 
Y
A
 
G
A
 
F
N
 
D
N
|
N
T
 
T
Y
|
Y
A
 
A
Y
 
F
V
 
T
V
 
V
K
 
T
P
 
K
G
 
K
N
 
F
A
 
A
K
 
E
T
 
K
E
 
E
G
 
H
M
 
I
E
 
N
T
 
T
I
 
V
S
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
K
K
 
K
A
 
-
Y
 
-
N
 
N
D
 
A
G
 
S
K
 
Q
D
 
Y
I
 
K
L
 
L
M
 
G
G
 
V
T
 
D
T
 
N
A
 
A
E
 
W
F
 
L
P
 
K
K
 
R
R
 
K
P
 
G
D
 
D
G
 
G
L
 
Y
I
 
K
G
 
G
L
 
F
E
 
V
K
 
S
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
E
 
E
T
 
F
G
 
G
R
 
-
A
 
-
N
 
T
V
 
T
R
 
Y
P
 
P
M
 
M
D
 
Q
L
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
V
Y
 
Y
N
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
K
N
 
N
G
 
G
D
 
K
L
 
M
D
 
D
T
 
A
I
 
V
A
 
L
A
 
A
Q
x
Y
A
 
S
T
 
T
D
 
D
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
A
 
K
A
 
A
L
 
Y
G
 
D
L
 
L
K
 
K
T
 
I
L
 
L
K
 
K
D
 
D
D
 
D
K
 
K
G
 
R
F
 
F
F
 
F
P
 
P
N
 
P
Y
|
Y
A
 
D
L
 
C
T
 
S
P
 
P
V
 
V
V
 
I
R
 
P
K
 
E
E
 
K
V
 
V
L
 
L
D
 
K
A
 
E
N
 
H
P
 
P
D
 
E
L
 
L
K
 
E
E
 
G
T
 
V
L
 
I
E
 
N
T
 
K
V
 
L
S
 
I
K
 
G
K
 
Q
L
 
I
D
 
D
D
 
T
A
 
E
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
R
 
E
L
 
L
N
 
N
S
 
Y
Q
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
G
E
 
K
K
 
L
K
 
K
T
 
E
I
 
P
E
 
S
T
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
K
D
 
E
Y
 
F
L
 
L
K
 
E

A0A0H2ZQB9 Ergothioneine transporter EgtUBC from Streptococcus pneumoniae serotype 2 (strain D39 / NCTC 7466) (see paper)
33% identity, 91% coverage: 29:296/296 of query aligns to 237:503/506 of A0A0H2ZQB9

query
sites
A0A0H2ZQB9
I
 
L
T
 
I
V
 
I
G
 
A
G
 
G
K
 
K
N
 
I
F
x
G
T
 
P
E
 
E
Q
 
P
L
 
E
I
 
I
I
 
L
A
 
A
E
 
N
I
 
M
T
 
Y
K
 
K
Q
 
L
L
 
L
L
 
I
E
 
E
-
 
E
S
 
N
K
 
T
G
 
S
H
 
M
T
 
T
V
 
A
D
 
T
K
 
V
K
 
K
D
 
P
G
 
N
M
 
F
G
 
G
T
 
T
-
 
T
K
 
S
I
 
F
V
 
L
R
 
Y
A
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
K
N
 
K
G
 
G
E
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
I
Y
 
Y
W
 
P
E
 
E
Y
x
F
T
 
T
G
 
G
T
 
T
S
 
V
L
 
T
I
 
E
T
 
S
F
 
L
N
 
L
K
 
Q
V
 
P
T
 
S
E
 
P
R
 
K
L
 
V
S
 
S
-
 
H
-
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
T
 
V
Y
 
Y
N
 
Q
R
 
V
V
 
A
K
 
R
E
 
D
-
 
G
L
 
I
D
 
A
G
 
K
E
 
Q
K
 
D
G
 
H
L
 
L
V
 
A
W
 
Y
L
 
L
A
 
K
P
 
P
S
 
M
A
 
S
A
 
Y
N
 
Q
N
 
N
T
 
T
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
V
V
 
A
V
 
V
K
 
P
P
 
K
G
 
K
N
 
I
A
 
A
K
 
Q
T
 
E
E
 
Y
G
 
G
M
 
L
E
 
K
T
 
T
I
 
I
S
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
K
K
 
K
A
 
V
Y
 
E
N
 
G
D
 
Q
G
 
L
K
 
K
D
 
A
I
 
-
L
 
-
M
 
-
G
 
G
T
 
F
T
 
T
A
 
L
E
|
E
F
 
F
P
 
N
K
 
D
R
 
R
P
 
E
D
 
D
G
 
G
L
 
N
I
 
K
G
 
G
L
 
L
E
 
Q
K
 
S
V
 
M
Y
 
Y
G
 
G
F
 
L
E
 
N
T
 
L
G
 
N
R
 
V
A
 
A
N
 
T
V
 
M
R
 
Q
P
 
P
M
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
A
L
 
L
A
 
R
Y
 
Y
N
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
H
N
 
S
G
 
G
D
 
D
L
 
I
D
 
Q
T
 
I
I
 
T
A
 
D
A
 
A
Q
x
Y
A
 
S
T
 
T
D
 
D
G
 
A
Q
 
E
I
 
L
A
 
E
A
 
R
L
 
Y
G
 
D
L
 
L
K
 
Q
T
 
V
L
 
L
K
 
E
D
 
D
D
 
D
K
 
K
G
 
Q
F
 
L
F
 
F
P
 
P
N
 
P
Y
 
Y
A
 
Q
L
 
G
T
 
A
P
 
P
V
 
L
V
 
M
R
 
K
K
 
E
E
 
A
V
 
L
L
 
L
D
 
K
A
 
K
N
 
H
P
 
P
D
 
E
L
 
L
K
 
E
E
 
R
T
 
V
L
 
L
E
 
N
T
 
T
V
 
L
S
 
A
K
 
G
K
 
K
L
 
I
D
 
T
D
 
E
A
 
S
T
 
Q
M
 
M
Q
 
S
R
 
Q
L
 
L
N
 
N
S
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
D
 
G
V
 
V
E
 
E
K
 
G
K
 
K
T
 
S
I
 
A
E
 
K
T
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
K
D
 
E
Y
 
F
L
 
L
K
 
Q
S
 
E
L
 
Q
G
 
G
M
 
L

6eylA Crystal structure of opubc in complex with carnitine
35% identity, 90% coverage: 28:292/296 of query aligns to 9:273/280 of 6eylA

query
sites
6eylA
T
 
T
I
 
I
T
 
K
V
 
I
G
 
G
G
 
A
K
x
Q
N
 
S
F
 
M
T
 
S
E
 
E
Q
 
S
L
 
E
I
 
I
I
 
I
A
 
A
E
 
S
I
 
M
T
 
L
K
 
G
Q
 
Q
L
 
L
L
 
I
E
 
E
S
 
-
K
 
-
G
 
-
H
 
H
T
 
H
V
 
T
D
 
D
K
 
L
K
 
K
-
 
T
-
 
T
-
 
T
-
 
I
D
 
K
G
 
N
M
 
L
G
 
G
T
x
S
K
x
N
I
 
A
V
 
V
R
 
Q
A
 
Q
-
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
M
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
I
D
 
D
L
 
I
Y
 
A
W
 
A
-
 
T
E
 
R
Y
|
Y
T
 
T
G
 
G
T
|
T
S
 
A
L
 
L
I
 
T
T
 
G
F
 
-
N
 
-
K
 
-
V
 
-
T
 
T
E
 
L
R
 
R
L
 
M
S
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
K
T
 
D
Y
 
P
N
 
D
R
 
K
V
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
Q
K
 
R
E
 
E
L
 
F
D
 
K
G
 
K
E
 
R
K
 
Y
G
 
D
L
 
L
V
 
K
W
 
W
L
 
Y
A
 
D
P
 
S
S
 
Y
A
 
G
A
 
F
N
 
D
N
|
N
T
 
T
Y
|
Y
A
 
A
Y
 
F
V
 
T
V
 
V
K
 
S
P
 
K
G
 
E
N
 
L
A
 
A
K
 
D
T
 
Q
E
 
Y
G
 
H
M
 
L
E
 
E
T
 
T
I
 
V
S
 
S
D
 
D
L
 
V
A
 
K
K
 
K
A
 
W
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
G
 
A
K
 
P
D
 
Q
I
 
L
L
 
K
M
 
L
G
 
G
T
 
V
T
 
D
A
 
N
E
 
Y
F
 
W
P
 
M
K
 
K
-
 
L
R
 
K
P
 
G
D
 
N
G
 
G
L
 
Y
I
 
Q
G
 
D
L
 
F
E
 
T
K
 
K
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
F
 
M
E
 
T
T
 
F
G
 
G
R
 
-
A
 
-
N
 
G
V
 
T
R
 
Y
P
 
P
M
 
M
D
 
Q
L
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
V
Y
 
Y
N
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
K
N
 
S
G
 
G
D
 
K
L
 
M
D
 
D
T
 
I
I
 
V
A
 
L
A
 
A
Q
x
Y
A
 
S
T
 
T
D
 
D
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
A
 
K
A
 
S
L
 
Y
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
M
L
 
L
K
 
K
D
 
D
D
 
D
K
 
K
G
 
Q
F
 
F
F
 
F
P
 
P
N
 
P
Y
|
Y
A
 
D
L
 
C
T
 
S
P
 
P
V
 
V
V
 
V
R
 
P
K
 
E
E
 
K
V
 
V
L
 
L
D
 
K
A
 
E
N
 
H
P
 
P
D
 
E
L
 
L
K
 
E
E
 
G
T
 
I
L
 
I
E
 
K
T
 
K
V
 
M
S
 
L
K
 
G
K
 
K
L
 
I
D
 
D
D
 
T
A
 
A
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
R
 
E
L
 
L
N
 
N
S
 
Y
Q
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
G
E
 
N
K
 
L
K
 
K
T
 
E
I
 
P
E
 
S
T
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
K
D
 
E
Y
 
Y
L
 
L
K
 
E

6eyhA Structure of a opubc mutant with bound glycine betaine
35% identity, 90% coverage: 28:292/296 of query aligns to 9:273/280 of 6eyhA

query
sites
6eyhA
T
 
T
I
 
I
T
 
K
V
 
I
G
 
G
G
 
A
K
 
Q
N
 
S
F
 
M
T
 
S
E
 
E
Q
 
S
L
 
E
I
 
I
I
 
I
A
 
A
E
 
S
I
 
M
T
 
L
K
 
G
Q
 
Q
L
 
L
L
 
I
E
 
E
S
 
-
K
 
-
G
 
-
H
 
H
T
 
H
V
 
T
D
 
D
K
 
L
K
 
K
-
 
T
-
 
T
-
 
T
-
 
I
D
 
K
G
 
N
M
 
L
G
 
G
T
 
S
K
 
N
I
 
A
V
 
V
R
 
Q
A
 
Q
-
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
M
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
I
D
 
D
L
 
I
Y
 
A
W
 
A
-
 
T
E
 
R
Y
|
Y
T
 
T
G
 
G
T
|
T
S
 
A
L
 
L
I
 
T
T
 
G
F
 
-
N
 
-
K
 
-
V
 
-
T
 
T
E
 
L
R
 
R
L
 
M
S
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
K
T
 
D
Y
 
P
N
 
D
R
 
K
V
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
Q
K
 
R
E
 
E
L
 
F
D
 
K
G
 
K
E
 
R
K
 
Y
G
 
D
L
 
L
V
 
K
W
 
W
L
 
Y
A
 
D
P
 
S
S
 
Y
A
 
G
A
 
F
N
 
D
N
|
N
T
 
T
Y
|
Y
A
 
A
Y
 
F
V
 
T
V
 
V
K
 
S
P
 
K
G
 
E
N
 
L
A
 
A
K
 
D
T
 
Q
E
 
Y
G
 
H
M
 
L
E
 
E
T
 
T
I
 
V
S
 
S
D
 
D
L
 
V
A
 
K
K
 
K
A
 
W
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
G
 
A
K
 
P
D
 
Q
I
 
L
L
 
K
M
 
L
G
 
G
T
 
V
T
 
D
A
 
N
E
 
Y
F
 
W
P
 
M
K
 
K
-
 
L
R
 
K
P
 
G
D
 
N
G
 
G
L
 
Y
I
 
Q
G
 
D
L
 
F
E
 
T
K
 
K
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
F
 
M
E
 
T
T
 
F
G
 
G
R
 
-
A
 
-
N
 
G
V
 
T
R
 
Y
P
 
P
M
 
M
D
 
Q
L
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
V
Y
 
Y
N
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
K
N
 
S
G
 
G
D
 
K
L
 
M
D
 
D
T
 
I
I
 
V
A
 
L
A
 
A
Q
x
Y
A
 
S
T
 
T
D
 
D
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
A
 
K
A
 
S
L
 
Y
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
M
L
 
L
K
 
K
D
 
D
D
 
D
K
 
K
G
 
Q
F
 
F
F
 
F
P
 
P
N
 
P
Y
 
Y
A
 
D
L
 
C
T
 
S
P
 
P
V
 
V
V
 
V
R
 
P
K
 
E
E
 
K
V
 
V
L
 
L
D
 
K
A
 
E
N
 
H
P
 
P
D
 
E
L
 
L
K
 
E
E
 
G
T
 
I
L
 
I
E
 
K
T
 
K
V
 
M
S
 
L
K
 
G
K
 
K
L
 
I
D
 
D
D
 
T
A
 
A
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
R
 
E
L
 
L
N
 
N
S
 
Y
Q
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
G
E
 
N
K
 
L
K
 
K
T
 
E
I
 
P
E
 
S
T
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
K
D
 
E
Y
 
Y
L
 
L
K
 
E

7txlA Crystal structure of egtu solute binding domain from streptococcus pneumoniae d39 in complex with l-ergothioneine (see paper)
33% identity, 91% coverage: 29:296/296 of query aligns to 6:272/275 of 7txlA

query
sites
7txlA
I
 
L
T
 
I
V
 
I
G
 
A
G
 
G
K
|
K
N
x
I
F
 
G
T
 
P
E
 
E
Q
 
P
L
 
E
I
 
I
I
 
L
A
 
A
E
 
N
I
 
M
T
 
Y
K
 
K
Q
 
L
L
 
L
L
 
I
E
 
E
S
 
E
K
 
N
-
 
T
G
 
S
H
 
M
T
 
T
V
 
A
D
 
T
K
 
V
K
 
K
D
 
P
G
 
N
M
 
F
G
 
G
T
|
T
-
 
T
K
 
S
I
 
F
V
 
L
R
 
Y
A
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
K
N
 
K
G
 
G
E
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
I
Y
 
Y
W
 
P
E
 
E
Y
x
F
T
 
T
G
 
G
T
|
T
S
 
V
L
 
T
I
 
E
T
 
S
F
 
L
N
 
L
K
 
Q
V
 
P
T
 
S
E
 
P
R
 
K
L
 
V
S
 
S
-
 
H
-
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
T
 
V
Y
 
Y
N
 
Q
R
 
V
V
 
A
K
 
R
E
 
D
-
 
G
L
 
I
D
 
A
G
 
K
E
 
Q
K
 
D
G
 
H
L
 
L
V
 
A
W
 
Y
L
 
L
A
 
K
P
 
P
S
 
M
A
 
S
A
 
Y
N
 
Q
N
|
N
T
 
T
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
V
V
 
A
V
 
V
K
 
P
P
 
K
G
 
K
N
 
I
A
 
A
K
 
Q
T
 
E
E
 
Y
G
 
G
M
 
L
E
 
K
T
 
T
I
 
I
S
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
K
K
 
K
A
 
V
Y
 
E
N
 
G
D
 
Q
G
 
L
K
 
K
D
 
-
I
 
-
L
 
-
M
 
A
G
 
G
T
 
F
T
 
T
A
 
L
E
|
E
F
 
F
P
 
N
K
 
D
R
 
R
P
 
E
D
 
D
G
 
G
L
 
N
I
 
K
G
 
G
L
 
L
E
 
Q
K
 
S
V
 
M
Y
 
Y
G
 
G
F
 
L
E
 
N
T
 
L
G
 
N
R
 
V
A
 
A
N
 
T
V
 
M
R
 
Q
P
 
P
M
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
A
L
 
L
A
 
R
Y
 
Y
N
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
H
N
 
S
G
 
G
D
 
D
L
 
I
D
 
Q
T
 
I
I
 
T
A
 
D
A
 
A
Q
x
Y
A
 
S
T
 
T
D
 
D
G
 
A
Q
 
E
I
 
L
A
 
E
A
 
R
L
 
Y
G
 
D
L
 
L
K
 
Q
T
 
V
L
 
L
K
 
E
D
 
D
D
 
D
K
 
K
G
 
Q
F
 
L
F
 
F
P
 
P
N
 
P
Y
|
Y
A
 
Q
L
 
G
T
 
A
P
 
P
V
 
L
V
 
M
R
 
K
K
 
E
E
 
A
V
 
L
L
 
L
D
 
K
A
 
K
N
 
H
P
 
P
D
 
E
L
 
L
K
 
E
E
 
R
T
 
V
L
 
L
E
 
N
T
 
T
V
 
L
S
 
A
K
 
G
K
 
K
L
 
I
D
 
T
D
 
E
A
 
S
T
 
Q
M
 
M
Q
 
S
R
 
Q
L
 
L
N
 
N
S
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
D
 
G
V
 
V
E
 
E
K
 
G
K
 
K
T
 
S
I
 
A
E
 
K
T
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
K
D
 
E
Y
 
F
L
 
L
K
 
Q
S
 
E
L
 
Q
G
 
G
M
 
L

5nxyA Crystal structure of opuac from b. Subtilis in complex with arsenobetaine (see paper)
35% identity, 90% coverage: 28:292/296 of query aligns to 2:266/272 of 5nxyA

query
sites
5nxyA
T
 
T
I
 
I
T
 
K
V
 
I
G
 
G
G
 
A
K
 
Q
N
 
S
F
 
M
T
 
S
E
 
E
Q
 
S
L
 
E
I
 
I
I
 
I
A
 
A
E
 
S
I
 
M
T
 
Q
K
 
G
Q
 
Q
L
 
L
L
 
I
E
 
E
S
 
-
K
 
-
G
 
-
H
 
H
T
 
H
V
 
T
D
 
D
K
 
L
K
 
K
-
 
T
-
 
T
-
 
T
-
 
I
D
 
K
G
 
N
M
 
L
G
 
G
T
 
S
K
 
N
I
 
A
V
 
V
R
 
Q
A
 
Q
-
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
M
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
I
D
 
D
L
 
I
Y
 
A
-
 
A
W
 
T
E
 
R
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
T
x
D
S
 
A
L
 
L
I
 
T
T
 
G
F
 
-
N
 
-
K
 
-
V
 
-
T
 
T
E
 
L
R
 
R
L
 
M
S
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
K
T
 
D
Y
 
P
N
 
D
R
 
K
V
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
Q
K
 
R
E
 
E
L
 
F
D
 
K
G
 
K
E
 
R
K
 
Y
G
 
D
L
 
L
V
 
K
W
 
W
L
 
Y
A
 
D
P
 
S
S
 
Y
A
 
G
A
 
F
N
 
D
N
|
N
T
 
T
Y
|
Y
A
 
A
Y
 
F
V
 
T
V
 
V
K
 
S
P
 
K
G
 
E
N
 
L
A
 
A
K
 
D
T
 
Q
E
 
Y
G
 
H
M
 
L
E
 
E
T
 
T
I
 
V
S
 
S
D
 
D
L
 
V
A
 
K
K
 
K
A
 
W
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
G
 
A
K
 
P
D
 
Q
I
 
L
L
 
K
M
 
L
G
 
G
T
 
V
T
 
D
A
 
N
E
 
Y
F
 
W
P
 
M
K
 
K
-
 
L
R
 
K
P
 
G
D
 
N
G
 
G
L
 
Y
I
 
Q
G
 
D
L
 
F
E
 
T
K
 
K
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
F
 
M
E
 
T
T
 
F
G
 
G
R
 
-
A
 
-
N
 
G
V
 
T
R
 
Y
P
 
P
M
 
M
D
 
Q
L
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
V
Y
 
Y
N
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
K
N
 
S
G
 
G
D
 
K
L
 
M
D
 
D
T
 
I
I
 
V
A
 
L
A
 
A
Q
x
Y
A
 
S
T
 
T
D
 
D
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
A
 
K
A
 
S
L
 
Y
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
M
L
 
L
K
 
K
D
 
D
D
 
D
K
 
K
G
 
Q
F
 
F
F
 
F
P
 
P
N
 
P
Y
|
Y
A
 
D
L
 
C
T
 
S
P
 
P
V
 
V
V
 
V
R
 
P
K
 
E
E
 
K
V
 
V
L
 
L
D
 
K
A
 
E
N
 
H
P
 
P
D
 
E
L
 
L
K
 
E
E
 
G
T
 
I
L
 
I
E
 
K
T
 
K
V
 
M
S
 
L
K
 
G
K
 
K
L
 
I
D
 
D
D
 
T
A
 
A
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
R
 
E
L
 
L
N
 
N
S
 
Y
Q
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
G
E
 
N
K
 
L
K
 
K
T
 
E
I
 
P
E
 
S
T
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
K
D
 
E
Y
 
Y
L
 
L
K
 
E

3r6uA Crystal structure of choline binding protein opubc from bacillus subtilis (see paper)
35% identity, 90% coverage: 28:292/296 of query aligns to 2:266/272 of 3r6uA

query
sites
3r6uA
T
 
T
I
 
I
T
 
K
V
 
I
G
 
G
G
 
A
K
 
Q
N
 
S
F
 
M
T
 
S
E
 
E
Q
 
S
L
 
E
I
 
I
I
 
I
A
 
A
E
 
S
I
 
M
T
 
L
K
 
G
Q
 
Q
L
 
L
L
 
I
E
 
E
S
 
-
K
 
-
G
 
-
H
 
H
T
 
H
V
 
T
D
 
D
K
 
L
K
 
K
-
 
T
-
 
T
-
 
T
-
 
I
D
 
K
G
 
N
M
 
L
G
 
G
T
 
S
K
 
N
I
 
A
V
 
V
R
 
Q
A
 
Q
-
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
M
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
I
D
 
D
L
 
I
Y
 
A
W
 
A
-
 
T
E
 
R
Y
|
Y
T
 
T
G
 
G
T
x
D
S
 
A
L
 
L
I
 
T
T
 
G
F
 
-
N
 
-
K
 
-
V
 
-
T
 
T
E
 
L
R
 
R
L
 
M
S
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
K
T
 
D
Y
 
P
N
 
D
R
 
K
V
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
Q
K
 
R
E
 
E
L
 
F
D
 
K
G
 
K
E
 
R
K
 
Y
G
 
D
L
 
L
V
 
K
W
 
W
L
 
Y
A
 
D
P
 
S
S
 
Y
A
 
G
A
 
F
N
 
D
N
|
N
T
 
T
Y
|
Y
A
 
A
Y
 
F
V
 
T
V
 
V
K
 
S
P
 
K
G
 
E
N
 
L
A
 
A
K
 
D
T
 
Q
E
 
Y
G
 
H
M
 
L
E
 
E
T
 
T
I
 
V
S
 
S
D
 
D
L
 
V
A
 
K
K
 
K
A
 
W
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
G
 
A
K
 
P
D
 
Q
I
 
L
L
 
K
M
 
L
G
 
G
T
 
V
T
 
D
A
 
N
E
 
Y
F
 
W
P
 
M
K
 
K
-
 
L
R
 
K
P
 
G
D
 
N
G
 
G
L
 
Y
I
 
Q
G
 
D
L
 
F
E
 
T
K
 
K
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
F
 
M
E
 
T
T
 
F
G
 
G
R
 
-
A
 
-
N
 
G
V
 
T
R
 
Y
P
 
P
M
 
M
D
 
Q
L
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
V
Y
 
Y
N
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
K
N
 
S
G
 
G
D
 
K
L
 
M
D
 
D
T
 
I
I
 
V
A
 
L
A
 
A
Q
x
Y
A
 
S
T
 
T
D
 
D
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
A
 
K
A
 
S
L
 
Y
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
M
L
 
L
K
 
K
D
 
D
D
 
D
K
 
K
G
 
Q
F
 
F
F
 
F
P
 
P
N
 
P
Y
|
Y
A
 
D
L
 
C
T
 
S
P
 
P
V
 
V
V
 
V
R
 
P
K
 
E
E
 
K
V
 
V
L
 
L
D
 
K
A
 
E
N
 
H
P
 
P
D
 
E
L
 
L
K
 
E
E
 
G
T
 
I
L
 
I
E
 
K
T
 
K
V
 
M
S
 
L
K
 
G
K
 
K
L
 
I
D
 
D
D
 
T
A
 
A
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
R
 
E
L
 
L
N
 
N
S
 
Y
Q
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
G
E
 
N
K
 
L
K
 
K
T
 
E
I
 
P
E
 
S
T
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
K
D
 
E
Y
 
Y
L
 
L
K
 
E

Query Sequence

>SMa1462 FitnessBrowser__Smeli:SMa1462
MNFAPKLAKTLLSAAAIALVTTTAWAATITVGGKNFTEQLIIAEITKQLLESKGHTVDKK
DGMGTKIVRAALENGEVDLYWEYTGTSLITFNKVTERLSPEETYNRVKELDGEKGLVWLA
PSAANNTYAYVVKPGNAKTEGMETISDLAKAYNDGKDILMGTTAEFPKRPDGLIGLEKVY
GFETGRANVRPMDLGLAYNALANGDLDTIAAQATDGQIAALGLKTLKDDKGFFPNYALTP
VVRKEVLDANPDLKETLETVSKKLDDATMQRLNSQVDVEKKTIETVAADYLKSLGM

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory