SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMc00268 FitnessBrowser__Smeli:SMc00268 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7krmC Putative fabg bound to nadh from acinetobacter baumannii
60% identity, 98% coverage: 5:252/252 of query aligns to 2:244/244 of 7krmC

query
sites
7krmC
L
 
L
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
N
 
K
F
 
V
A
 
A
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
S
|
S
R
 
E
R
 
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
E
L
 
I
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
H
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
I
I
 
I
L
 
V
D
|
D
L
|
L
D
 
D
E
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
S
R
 
Q
E
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
K
S
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
E
R
 
G
H
 
H
V
 
M
G
 
G
M
 
L
A
 
A
C
x
A
N
|
N
V
|
V
T
 
A
D
 
N
L
 
E
A
 
E
S
 
Q
V
 
V
R
 
K
T
 
A
V
 
A
M
 
V
D
 
E
A
 
Q
L
 
A
V
 
L
S
 
Q
Q
 
H
W
 
Y
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
Q
 
Q
P
 
P
L
 
I
K
 
K
I
 
T
M
 
L
E
 
D
I
 
I
A
 
Q
P
 
R
E
 
S
N
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
R
V
 
V
L
 
L
D
 
D
V
|
V
N
 
S
L
 
L
R
 
R
G
 
G
T
 
T
L
 
L
Y
 
I
C
 
M
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
H
 
S
M
 
M
R
 
K
S
 
A
R
 
N
K
 
G
Q
 
G
G
 
G
K
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
C
L
 
L
S
 
S
S
|
S
V
 
V
S
 
S
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
P
H
 
H
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
A
K
 
K
A
 
A
M
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
F
A
 
G
P
 
G
D
 
D
N
 
Q
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
L
C
 
T
P
 
P
G
 
G
F
 
L
I
|
I
A
 
Q
T
|
T
D
 
D
I
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
M
T
 
N
P
 
D
E
 
D
K
 
R
L
 
R
E
 
H
E
 
D
I
 
I
K
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
M
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
L
G
 
G
T
 
K
A
 
A
D
 
Q
D
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
N
C
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
L
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
V
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
V
E
 
T
V
 
L
D
 
D
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
S
 
M
L
 
L
I
 
I
H
 
H

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
42% identity, 98% coverage: 6:251/252 of query aligns to 5:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
L
 
L
E
 
Q
G
 
D
N
 
K
F
 
V
A
 
A
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
S
x
N
R
 
-
R
 
-
G
|
G
L
x
I
G
 
G
K
 
L
A
 
E
T
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
V
F
 
F
A
 
M
E
 
K
H
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
I
L
 
A
D
|
D
L
x
F
D
 
N
E
 
E
A
 
A
D
 
A
A
 
G
R
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
E
S
 
A
L
 
-
G
 
N
P
 
P
R
 
G
H
 
V
V
 
V
G
 
F
M
 
I
A
 
R
C
x
V
N
x
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
L
 
R
A
 
E
S
 
S
V
 
V
R
 
H
T
 
R
V
 
L
M
 
V
D
 
E
A
 
N
L
 
V
V
 
A
S
 
E
Q
 
R
W
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
Q
 
R
P
x
D
L
 
S
K
 
M
I
 
L
M
 
S
E
x
K
I
 
M
A
 
T
P
 
V
E
 
D
N
 
Q
Y
 
F
D
 
Q
A
 
Q
V
 
V
L
 
I
D
 
N
V
 
V
N
|
N
L
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
V
L
 
F
Y
 
H
C
 
C
S
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
L
P
 
P
H
 
Y
M
 
M
R
 
A
S
 
E
R
 
Q
K
 
G
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
T
S
 
S
S
|
S
V
 
V
S
 
T
A
 
G
Q
 
T
R
 
Y
G
 
G
G
x
N
G
 
-
I
 
-
F
x
V
G
 
G
G
x
Q
P
 
T
H
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
K
A
 
T
M
 
W
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
R
D
 
K
N
 
G
V
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
F
|
F
I
x
T
A
 
E
T
|
T
D
 
A
I
x
M
T
 
V
G
 
A
G
 
E
L
 
V
L
 
-
T
 
-
P
 
P
E
 
E
K
 
K
-
 
V
L
 
I
E
 
E
E
x
K
I
 
M
K
 
K
A
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
M
G
 
G
R
 
R
P
 
L
G
 
G
T
 
K
A
 
P
D
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
N
C
 
A
A
 
Y
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
L
 
E
S
 
S
A
 
D
Y
 
Y
V
 
V
T
 
N
G
 
G
S
 
H
E
 
V
V
 
L
D
 
H
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
S
 
I
L
 
M
I
 
M

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
43% identity, 96% coverage: 6:248/252 of query aligns to 6:243/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
N
 
K
F
 
V
A
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
 
-
R
 
-
R
|
R
G
 
G
L
x
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
E
L
 
L
F
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
I
I
 
G
L
 
T
D
 
A
L
x
T
D
 
S
E
 
E
A
 
S
D
 
G
A
 
A
R
 
Q
E
 
A
A
 
I
A
 
S
A
 
D
S
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
D
R
 
N
H
 
G
V
 
K
G
 
G
M
 
M
A
 
A
C
 
L
N
|
N
V
|
V
T
 
T
D
 
N
L
 
P
A
 
E
S
 
S
V
 
I
R
 
E
T
 
A
V
 
V
M
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
T
S
 
D
Q
 
E
W
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
T
 
T
Q
 
R
P
 
D
L
 
N
K
 
L
I
 
L
M
 
M
E
 
R
I
 
M
A
 
K
P
 
E
E
 
E
N
 
E
Y
 
W
D
 
S
A
 
D
V
 
I
L
 
M
D
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
S
T
 
I
L
 
F
Y
 
R
C
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
L
P
 
R
H
 
G
M
 
M
R
 
M
S
 
K
R
 
K
K
 
R
Q
 
Q
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
V
S
 
G
S
|
S
V
 
V
S
 
V
A
 
G
Q
 
T
R
 
M
G
 
G
G
 
N
G
 
A
I
 
-
F
 
-
G
 
G
G
 
Q
P
 
A
H
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
S
M
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
S
D
 
R
N
 
G
V
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
A
 
E
T
|
T
D
 
D
I
x
M
T
 
T
G
 
K
G
 
A
L
 
-
L
 
L
T
 
N
P
 
D
E
 
E
K
 
Q
L
 
R
E
 
T
E
 
A
I
 
T
K
 
L
A
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
L
G
 
G
T
 
D
A
 
P
D
 
R
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
S
C
 
A
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
L
 
E
S
 
A
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
E
 
T
V
 
L
D
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
41% identity, 98% coverage: 6:251/252 of query aligns to 3:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
N
 
K
F
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
S
S
 
-
R
 
-
R
|
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
K
 
R
A
 
D
T
 
I
A
 
A
R
 
I
L
 
N
F
 
L
A
 
A
E
 
K
H
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
N
V
 
I
A
 
F
I
 
F
L
x
N
D
x
Y
L
x
N
D
x
G
E
x
S
A
 
P
D
 
E
A
 
A
R
 
A
E
 
E
A
 
E
A
 
T
A
 
A
S
 
K
L
 
L
G
 
V
P
 
A
R
 
E
H
 
H
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
V
V
 
E
G
 
A
M
 
M
A
 
K
C
 
A
N
|
N
V
|
V
T
 
A
D
 
I
L
 
A
A
 
E
S
 
D
V
 
V
R
 
D
T
 
A
V
 
F
M
 
F
D
 
K
A
 
Q
L
 
A
V
 
I
S
 
E
Q
 
R
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
T
 
T
Q
 
R
P
 
D
L
 
N
K
 
L
I
 
L
M
 
M
E
 
R
I
 
M
A
 
K
P
 
E
E
 
D
N
 
E
Y
 
W
D
 
D
A
 
D
V
 
V
L
 
I
D
 
N
V
x
I
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
T
L
 
F
Y
 
L
C
 
C
S
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
S
P
 
R
H
 
T
M
 
M
R
 
M
S
 
K
R
 
Q
K
 
R
Q
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
M
S
 
A
S
|
S
V
 
V
S
 
V
A
 
G
Q
 
L
R
 
I
G
 
G
G
 
N
G
 
A
I
 
-
F
 
-
G
 
G
G
x
Q
P
 
A
H
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
T
M
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
D
 
R
N
 
G
V
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
A
 
T
T
|
T
D
 
D
I
 
M
T
 
T
G
 
D
G
 
K
L
 
L
L
 
D
T
 
E
P
 
K
E
 
T
K
 
K
L
 
-
E
 
E
E
 
A
I
 
M
K
 
L
A
 
A
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
M
 
L
G
 
G
R
 
A
P
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
T
D
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
N
C
 
A
A
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
A
S
 
S
A
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
Q
E
 
T
V
 
L
D
 
S
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
S
 
M
L
 
V
I
 
M

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
42% identity, 96% coverage: 6:248/252 of query aligns to 6:239/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
N
 
K
F
 
V
A
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
 
-
R
 
-
R
|
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
E
L
 
L
F
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
I
I
 
G
L
 
T
D
 
A
L
x
T
D
 
S
E
 
E
A
 
S
D
 
G
A
 
A
R
 
Q
E
 
A
A
 
I
A
 
S
A
 
D
S
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
D
R
 
N
H
 
G
V
 
K
G
 
G
M
 
M
A
 
A
C
 
L
N
|
N
V
|
V
T
 
T
D
 
N
L
 
P
A
 
E
S
 
S
V
 
I
R
 
E
T
 
A
V
 
V
M
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
T
S
 
D
Q
 
E
W
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
Q
 
R
P
 
D
L
 
N
K
 
L
I
 
L
M
 
M
E
 
R
I
 
M
A
 
K
P
 
E
E
 
E
N
 
E
Y
 
W
D
 
S
A
 
D
V
 
I
L
 
M
D
 
E
V
 
T
N
|
N
L
 
L
R
 
T
G
 
S
T
 
I
L
 
F
Y
 
R
C
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
L
P
 
R
H
 
G
M
 
M
R
 
M
S
 
K
R
 
K
K
 
R
Q
 
Q
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
V
S
x
G
S
|
S
V
 
V
S
 
V
A
 
G
Q
 
T
R
 
M
G
 
G
G
 
N
G
 
A
I
 
-
F
 
-
G
 
G
G
x
Q
P
 
A
H
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
S
M
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
S
D
 
R
N
 
G
V
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
 
I
A
 
E
T
|
T
D
 
D
I
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
M
T
 
N
P
 
D
E
 
E
K
 
Q
L
 
R
E
 
T
E
 
A
I
 
T
K
 
L
A
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
L
G
 
G
T
 
D
A
 
P
D
 
R
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
S
C
 
A
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
L
 
E
S
 
A
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
E
 
T
V
 
L
D
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
43% identity, 98% coverage: 6:251/252 of query aligns to 6:247/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
L
 
L
E
 
A
G
 
S
N
 
K
F
 
T
A
 
A
V
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
S
 
-
R
 
-
R
|
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
K
 
F
A
 
G
T
 
I
A
 
A
R
 
Q
L
 
V
F
 
L
A
 
A
E
 
R
H
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
R
V
 
V
A
 
I
I
 
I
L
 
A
D
|
D
L
x
R
D
 
D
E
 
-
A
 
A
D
 
H
A
 
G
R
 
E
E
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
S
G
 
G
P
 
A
R
 
Q
H
 
A
V
 
L
G
 
F
M
 
I
A
 
S
C
|
C
N
 
N
V
x
I
T
 
A
D
 
E
L
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
K
T
 
T
V
 
Q
M
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
F
S
 
S
Q
 
Q
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
A
W
 
F
G
 
G
R
 
P
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
T
 
N
Q
 
R
P
 
D
L
 
A
K
 
M
I
 
L
M
 
H
E
 
K
I
 
L
A
 
T
P
 
E
E
 
A
N
 
D
Y
 
W
D
 
D
A
 
T
V
 
V
L
 
I
D
 
D
V
|
V
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
T
L
 
F
Y
 
L
C
 
C
S
 
M
Q
 
Q
A
 
Q
V
 
A
I
 
A
P
 
I
H
 
R
M
 
M
R
 
R
S
 
E
R
 
R
K
 
G
Q
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
I
S
 
A
S
 
S
V
 
A
S
 
S
A
 
W
Q
 
L
R
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
G
I
 
N
F
 
V
G
 
G
G
 
Q
P
 
T
H
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
K
A
 
T
M
 
A
A
 
C
R
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
K
D
 
K
N
 
G
V
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
A
 
D
T
|
T
D
 
D
I
 
M
T
|
T
G
 
R
G
 
G
L
 
V
L
 
-
T
 
-
P
 
P
E
 
E
K
 
N
L
 
V
E
 
W
E
 
Q
I
 
I
K
 
M
-
 
V
A
 
S
G
 
K
I
 
I
P
 
P
M
 
A
G
 
G
R
 
Y
P
 
A
G
 
G
T
 
E
A
 
A
D
 
K
D
 
D
V
 
V
A
 
G
G
 
E
C
 
C
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
G
S
 
A
A
 
R
Y
 
Y
V
 
I
T
 
N
G
 
G
S
 
E
E
 
V
V
 
I
D
 
N
V
 
V
N
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
M
L
 
V
I
 
L

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
43% identity, 96% coverage: 6:248/252 of query aligns to 3:236/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
L
 
L
E
 
E
G
 
G
N
 
K
F
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
S
 
-
R
 
-
R
x
K
G
|
G
L
|
L
G
 
G
K
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
L
L
 
A
F
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
I
I
 
A
L
 
G
D
|
D
L
|
L
D
 
G
E
 
D
A
 
L
D
 
T
A
 
Y
R
 
S
E
 
H
A
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
P
R
 
N
H
 
V
V
 
E
G
 
G
M
 
M
A
 
Y
C
x
L
N
|
N
V
|
V
T
 
T
D
 
D
L
 
V
A
 
T
S
 
G
V
 
V
R
 
E
T
 
K
V
 
F
M
 
Y
D
 
Q
A
 
S
L
 
V
V
 
I
S
 
D
Q
 
K
W
 
Y
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
T
 
T
Q
 
K
P
 
D
L
 
A
K
 
M
I
 
T
M
 
R
E
 
K
I
 
M
A
 
T
P
 
E
E
 
A
N
 
Q
Y
 
W
D
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
I
D
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
F
Y
 
N
C
 
L
S
 
T
Q
 
R
A
 
L
V
 
V
I
 
G
P
 
P
H
 
Q
M
 
M
R
 
Q
S
 
T
R
 
N
K
 
G
Q
 
Y
G
 
G
K
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
I
S
 
S
S
|
S
V
 
V
S
 
V
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
G
I
 
V
F
 
F
G
 
G
G
 
N
-
 
I
-
 
G
-
 
Q
P
 
A
H
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
M
A
 
T
M
 
W
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
F
A
 
A
P
 
L
D
 
K
-
 
G
-
 
A
N
 
N
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
Y
I
|
I
A
 
M
T
|
T
D
 
D
I
 
I
T
 
L
G
 
K
G
 
T
L
 
V
L
 
-
T
 
-
P
 
P
E
 
Q
K
 
D
L
 
L
E
 
L
E
 
D
I
 
K
K
 
F
A
 
A
G
 
A
I
 
L
P
 
T
M
 
M
-
 
L
G
 
N
R
 
R
P
 
L
G
 
G
T
 
Q
A
 
P
D
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
K
C
 
V
A
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
D
S
 
A
A
 
S
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
Q
E
 
T
V
 
I
D
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
40% identity, 96% coverage: 6:248/252 of query aligns to 3:240/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
L
 
F
E
 
E
G
 
G
N
 
K
F
 
I
A
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
|
A
A
x
S
S
 
-
R
 
-
R
|
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
E
L
 
T
F
 
L
A
 
A
E
 
A
H
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
I
I
 
G
L
 
T
D
 
A
L
x
T
D
 
S
E
 
E
A
 
N
D
 
G
A
 
A
R
 
Q
E
 
A
A
 
I
A
 
S
A
 
D
S
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
A
R
 
N
H
 
G
V
 
K
G
 
G
M
 
L
A
 
M
C
 
L
N
|
N
V
|
V
T
 
T
D
 
D
L
 
P
A
 
A
S
 
S
V
 
I
R
 
E
T
 
S
V
 
V
M
 
L
D
 
E
A
 
K
L
 
I
V
 
R
S
 
A
Q
 
E
W
 
F
G
 
G
R
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
Q
 
R
P
 
D
L
 
N
K
 
L
I
 
L
M
 
M
E
 
R
I
 
M
A
 
K
P
 
D
E
 
E
N
 
E
Y
 
W
D
 
N
A
 
D
V
 
I
L
 
I
D
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
S
G
 
S
T
 
V
L
 
F
Y
 
R
C
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
M
P
 
R
H
 
A
M
 
M
R
 
M
S
 
K
R
 
K
K
 
R
Q
 
H
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
L
 
I
S
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
V
A
 
G
Q
 
T
R
 
M
G
 
G
G
 
N
G
 
G
I
 
-
F
 
-
G
 
G
G
 
Q
P
 
A
H
 
N
Y
|
Y
S
x
A
A
|
A
A
|
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
S
M
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
S
D
 
R
N
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
A
 
E
T
 
T
D
 
D
I
 
M
T
 
T
G
 
R
G
 
A
L
 
-
L
 
L
T
 
S
P
 
D
E
 
D
K
 
Q
L
 
R
E
 
A
E
 
G
I
 
I
K
 
L
A
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
L
G
 
G
T
 
G
A
 
A
D
 
Q
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
N
C
 
A
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
E
S
 
A
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
x
E
E
 
T
V
 
L
D
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
40% identity, 96% coverage: 6:248/252 of query aligns to 2:239/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
L
 
F
E
 
E
G
 
G
N
 
K
F
 
I
A
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
 
-
R
 
-
R
|
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
E
L
 
T
F
 
L
A
 
A
E
 
A
H
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
I
I
 
G
L
 
T
D
 
A
L
x
T
D
 
S
E
 
E
A
 
N
D
 
G
A
 
A
R
 
Q
E
 
A
A
 
I
A
 
S
A
 
D
S
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
A
R
 
N
H
 
G
V
 
K
G
 
G
M
 
L
A
 
M
C
 
L
N
|
N
V
|
V
T
 
T
D
 
D
L
 
P
A
 
A
S
 
S
V
 
I
R
 
E
T
 
S
V
 
V
M
 
L
D
 
E
A
 
K
L
 
I
V
 
R
S
 
A
Q
 
E
W
 
F
G
 
G
R
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
Q
 
R
P
 
D
L
 
N
K
 
L
I
 
L
M
 
M
E
 
R
I
 
M
A
 
K
P
 
D
E
 
E
N
x
E
Y
 
W
D
 
N
A
 
D
V
 
I
L
 
I
D
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
S
G
 
S
T
 
V
L
 
F
Y
 
R
C
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
M
P
 
R
H
 
A
M
 
M
R
 
M
S
 
K
R
 
K
K
 
R
Q
 
H
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
L
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
S
 
V
A
 
G
Q
 
T
R
 
M
G
 
G
G
 
N
G
 
G
I
 
-
F
 
-
G
 
G
G
x
Q
P
 
A
H
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
S
M
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
S
D
 
R
N
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
A
 
E
T
 
T
D
 
D
I
 
M
T
 
T
G
 
R
G
 
A
L
 
-
L
 
L
T
 
S
P
 
D
E
 
D
K
 
Q
L
 
R
E
 
A
E
 
G
I
 
I
K
 
L
A
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
L
G
 
G
T
 
G
A
 
A
D
 
Q
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
N
C
 
A
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
E
S
 
A
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
x
E
E
x
T
V
 
L
D
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
40% identity, 94% coverage: 11:248/252 of query aligns to 7:243/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
A
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
S
 
-
R
 
-
R
 
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
S
T
 
I
A
 
A
R
 
L
L
 
Q
F
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
E
G
 
G
A
 
Y
T
 
N
V
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
N
E
 
Y
A
 
A
D
 
G
A
 
S
R
 
K
E
 
E
A
 
K
A
 
A
A
 
E
S
 
A
L
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
K
G
 
G
P
 
V
R
 
D
H
 
S
V
 
F
G
 
A
M
 
I
A
 
Q
C
 
A
N
 
N
V
 
V
T
 
A
D
 
D
L
 
A
A
 
D
S
 
E
V
 
V
R
 
K
T
 
A
V
 
M
M
 
I
D
 
K
A
 
E
L
 
V
V
 
V
S
 
S
Q
 
Q
W
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
Q
 
R
P
 
D
L
 
N
K
 
L
I
 
L
M
 
M
E
 
R
I
 
M
A
 
K
P
 
E
E
 
Q
N
 
E
Y
 
W
D
 
D
A
 
D
V
 
V
L
 
I
D
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
F
Y
 
N
C
 
C
S
 
I
Q
 
Q
A
 
K
V
 
A
I
 
T
P
 
P
H
 
Q
M
 
M
R
 
L
S
 
R
R
 
Q
K
 
R
Q
 
S
G
 
G
K
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
L
S
 
S
S
|
S
V
 
V
S
 
V
A
 
G
Q
 
A
R
 
V
G
 
G
G
 
N
G
 
P
I
 
-
F
 
-
G
 
G
G
x
Q
P
 
A
H
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
M
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
S
D
 
R
N
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
A
 
V
T
 
S
D
 
D
I
 
M
T
 
T
G
 
D
G
 
A
L
 
-
L
 
L
T
 
S
P
 
D
E
 
E
K
 
L
L
 
K
E
 
E
E
 
Q
I
 
M
K
 
L
A
 
T
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
M
 
L
G
 
A
R
 
R
P
 
F
G
 
G
T
 
Q
A
 
D
D
 
T
D
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
N
C
 
T
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
K
S
 
A
A
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
Q
E
 
T
V
 
I
D
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G

1q7cA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase y151f mutant in complex with NADPH fragment (see paper)
39% identity, 96% coverage: 6:248/252 of query aligns to 2:239/243 of 1q7cA

query
sites
1q7cA
L
 
F
E
 
E
G
 
G
N
 
K
F
 
I
A
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
 
-
R
 
-
R
|
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
E
L
 
T
F
 
L
A
 
A
E
 
A
H
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
I
I
 
G
L
 
T
D
x
A
L
x
T
D
 
S
E
 
E
A
 
N
D
 
G
A
 
A
R
 
Q
E
 
A
A
 
I
A
 
S
A
 
D
S
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
A
R
 
N
H
 
G
V
 
K
G
 
G
M
 
L
A
 
M
C
x
L
N
|
N
V
|
V
T
 
T
D
 
D
L
 
P
A
 
A
S
 
S
V
 
I
R
 
E
T
 
S
V
 
V
M
 
L
D
 
E
A
 
K
L
 
I
V
 
R
S
 
A
Q
 
E
W
 
F
G
 
G
R
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
Q
 
R
P
 
D
L
 
N
K
 
L
I
 
L
M
 
M
E
 
R
I
 
M
A
 
K
P
 
D
E
 
E
N
 
E
Y
 
W
D
 
N
A
 
D
V
 
I
L
 
I
D
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
S
G
 
S
T
 
V
L
 
F
Y
 
R
C
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
M
P
 
R
H
 
A
M
 
M
R
 
M
S
 
K
R
 
K
K
 
R
Q
 
H
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
L
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
S
 
V
A
 
G
Q
 
T
R
 
M
G
 
G
G
 
N
G
 
G
I
 
-
F
 
-
G
 
G
G
x
Q
P
 
A
H
 
N
Y
x
F
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
S
M
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
S
D
 
R
N
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
A
 
E
T
 
T
D
 
D
I
 
M
T
 
T
G
 
R
G
 
A
L
 
-
L
 
L
T
 
S
P
 
D
E
 
D
K
 
Q
L
 
R
E
 
A
E
 
G
I
 
I
K
 
L
A
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
L
G
 
G
T
 
G
A
 
A
D
 
Q
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
N
C
 
A
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
E
S
 
A
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
E
 
T
V
 
L
D
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
38% identity, 96% coverage: 6:248/252 of query aligns to 3:240/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
L
 
F
E
 
E
G
 
G
N
 
K
F
 
I
A
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
 
-
R
 
-
R
|
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
E
L
 
T
F
 
L
A
 
V
E
 
A
H
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
I
I
 
G
L
 
T
D
 
A
L
x
T
D
 
S
E
 
E
A
 
S
D
 
G
A
 
A
R
 
Q
E
 
A
A
 
I
A
 
S
A
 
D
S
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
A
R
 
N
H
 
G
V
 
K
G
 
G
M
 
L
A
 
M
C
x
L
N
|
N
V
|
V
T
 
T
D
 
D
L
 
P
A
 
A
S
 
S
V
 
I
R
 
E
T
 
S
V
 
V
M
 
L
D
 
E
A
 
N
L
 
V
V
 
R
S
 
A
Q
 
E
W
 
F
G
 
G
R
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
Q
 
R
P
 
D
L
 
N
K
 
L
I
 
L
M
 
M
E
 
R
I
 
M
A
 
K
P
 
D
E
 
D
N
 
E
Y
 
W
D
 
N
A
 
D
V
 
I
L
 
I
D
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
S
G
 
S
T
 
V
L
 
F
Y
 
R
C
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
M
P
 
R
H
 
A
M
 
M
R
 
M
S
 
K
R
 
K
K
 
R
Q
 
H
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
L
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
S
 
V
A
 
G
Q
 
T
R
 
M
G
 
G
G
 
N
G
 
A
I
 
-
F
 
-
G
 
G
G
 
Q
P
 
A
H
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
S
M
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
S
D
 
R
N
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
A
 
E
T
 
T
D
 
D
I
 
M
T
 
T
G
 
R
G
 
A
L
 
-
L
 
L
T
 
T
P
 
D
E
 
E
K
 
Q
L
 
R
E
 
A
E
 
G
I
 
T
K
 
L
A
 
A
G
 
A
I
 
V
P
 
P
M
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
P
D
 
N
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
S
C
 
A
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
E
S
 
A
A
 
S
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
E
 
T
V
 
L
D
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
40% identity, 94% coverage: 11:248/252 of query aligns to 4:236/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
A
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
 
-
R
 
-
R
|
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
K
 
R
A
 
S
T
 
I
A
 
A
R
 
L
L
 
Q
F
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
E
G
 
G
A
 
Y
T
 
N
V
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
-
D
 
-
L
 
-
D
x
N
E
x
Y
A
|
A
D
x
G
A
x
S
R
 
K
E
 
E
A
 
K
A
 
A
A
 
E
S
 
A
L
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
K
G
 
G
P
 
V
R
 
D
H
 
S
V
 
F
G
 
A
M
 
I
A
 
Q
C
x
A
N
|
N
V
|
V
T
 
A
D
 
D
L
 
A
A
 
D
S
 
E
V
 
V
R
 
K
T
 
A
V
 
M
M
 
I
D
 
K
A
 
E
L
 
V
V
 
V
S
 
S
Q
 
Q
W
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
Q
 
R
P
 
D
L
 
N
K
 
L
I
 
L
M
 
M
E
 
R
I
 
M
A
 
K
P
 
E
E
 
Q
N
 
E
Y
 
W
D
 
D
A
 
D
V
 
V
L
 
I
D
 
D
V
x
T
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
F
Y
 
N
C
 
C
S
 
I
Q
 
Q
A
 
K
V
 
A
I
 
T
P
 
P
H
 
Q
M
 
M
R
 
L
S
 
R
R
 
Q
K
 
R
Q
 
S
G
 
G
K
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
L
S
 
S
S
|
S
V
 
V
S
 
V
A
 
G
Q
 
A
R
 
V
G
 
G
G
 
N
G
 
P
I
 
-
F
 
-
G
 
G
G
x
Q
P
 
A
H
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
M
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
S
D
 
R
N
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
 
I
A
 
V
T
 
S
D
 
D
I
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
M
T
 
T
P
 
D
E
 
E
K
 
L
L
 
K
E
 
E
E
 
Q
I
 
M
K
 
L
A
 
T
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
M
 
L
G
 
A
R
 
R
P
 
F
G
 
G
T
 
Q
A
 
D
D
 
T
D
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
N
C
 
T
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
K
S
 
A
A
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
Q
E
 
T
V
 
I
D
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G

7emgB Carbonyl reductase variant 4 (r123c/l209p/f183y/v61k) from serratia marcescens complexed with NADP+ (see paper)
38% identity, 96% coverage: 6:248/252 of query aligns to 2:239/243 of 7emgB

query
sites
7emgB
L
 
F
E
 
E
G
 
G
N
 
K
F
 
I
A
 
V
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
 
-
R
 
-
R
|
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
E
L
 
T
F
 
F
A
 
V
E
 
A
H
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
I
I
 
G
L
 
T
D
 
A
L
x
T
D
 
S
E
 
E
A
 
S
D
 
G
A
 
A
R
 
E
E
 
A
A
 
I
A
 
S
A
 
G
S
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
A
R
 
N
H
 
G
V
 
K
G
 
G
M
 
F
A
 
M
C
 
L
N
|
N
V
|
V
T
 
K
D
 
D
L
 
A
A
 
Q
S
 
S
V
 
I
R
 
D
T
 
S
V
 
V
M
 
L
D
 
A
A
 
S
L
 
I
V
 
R
S
 
A
Q
 
E
W
 
F
G
 
G
R
 
E
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
|
I
T
 
T
Q
 
R
P
 
D
L
 
N
K
 
L
I
 
L
M
 
M
E
 
R
I
 
M
A
 
K
P
 
D
E
 
D
N
 
E
Y
 
W
D
 
E
A
 
D
V
 
I
L
 
L
D
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
S
T
 
V
L
 
F
Y
 
R
C
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
M
P
 
C
H
 
A
M
 
M
R
 
M
S
 
K
R
 
K
K
 
R
Q
 
F
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
L
 
I
S
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
V
A
 
G
Q
 
T
R
 
M
G
 
G
G
 
N
G
 
A
I
 
-
F
 
-
G
 
G
G
 
Q
P
 
A
H
 
N
Y
 
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
S
M
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
S
D
 
R
N
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
I
 
I
A
 
E
T
 
T
D
 
D
I
 
M
T
 
T
G
 
R
G
 
A
L
 
-
L
 
L
T
 
T
P
 
D
E
 
D
K
 
Q
L
 
R
E
 
A
E
 
G
I
 
I
K
 
L
A
 
S
G
 
S
I
 
V
P
 
P
M
 
A
G
 
N
R
 
R
P
 
P
G
 
G
T
 
D
A
 
A
D
 
K
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
S
C
 
A
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
E
S
 
A
A
 
G
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
E
 
T
V
 
L
D
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
38% identity, 96% coverage: 6:248/252 of query aligns to 3:240/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
L
 
F
E
 
E
G
 
G
N
 
K
F
 
I
A
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
S
 
-
R
 
-
R
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
E
L
 
T
F
 
L
A
 
V
E
 
A
H
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
I
I
 
G
L
 
T
D
 
A
L
 
T
D
 
S
E
 
E
A
 
N
D
 
G
A
 
A
R
 
K
E
 
N
A
 
I
A
 
S
A
 
D
S
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
A
R
 
N
H
 
G
V
 
K
G
 
G
M
 
L
A
 
M
C
 
L
N
 
N
V
 
V
T
 
T
D
 
D
L
 
P
A
 
A
S
 
S
V
 
I
R
 
E
T
 
S
V
 
V
M
 
L
D
 
E
A
 
N
L
 
I
V
 
R
S
 
A
Q
 
E
W
 
F
G
 
G
R
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
Q
 
R
P
 
D
L
 
N
K
 
L
I
 
L
M
 
M
E
 
R
I
 
M
A
 
K
P
 
D
E
 
D
N
 
E
Y
 
W
D
 
N
A
 
D
V
 
I
L
 
I
D
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
S
G
 
S
T
 
V
L
 
F
Y
 
R
C
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
M
P
 
R
H
 
A
M
|
M
R
 
M
S
 
K
R
 
K
K
 
R
Q
 
C
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
L
 
I
S
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
V
A
 
G
Q
 
T
R
 
M
G
 
G
G
 
N
G
 
A
I
 
-
F
 
-
G
 
G
G
 
Q
P
 
A
H
 
N
Y
 
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
S
M
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
S
D
 
R
N
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
A
 
E
T
 
T
D
 
D
I
 
M
T
 
T
G
 
R
G
 
A
L
 
-
L
 
L
T
 
S
P
 
D
E
 
D
K
 
Q
L
 
R
E
 
A
E
 
G
I
 
I
K
 
L
A
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
L
G
 
G
T
 
G
A
 
A
D
 
Q
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
S
C
 
A
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
|
A
S
|
S
D
 
D
L
 
E
S
 
A
A
 
S
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
E
 
T
V
 
L
D
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G

3tzcA Crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg)(y155f) from vibrio cholerae (see paper)
41% identity, 96% coverage: 6:248/252 of query aligns to 6:222/224 of 3tzcA

query
sites
3tzcA
L
 
L
E
 
E
G
 
G
N
 
K
F
 
V
A
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
 
-
R
 
-
R
|
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
E
L
 
L
F
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
I
I
 
G
L
 
T
D
x
A
L
x
T
D
 
S
E
 
E
A
 
S
D
 
G
A
 
A
R
 
Q
E
 
A
A
 
I
A
 
S
A
 
D
S
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
D
R
 
N
H
 
G
V
 
K
G
 
G
M
 
M
A
 
A
C
 
L
N
|
N
V
|
V
T
 
T
D
 
N
L
 
P
A
 
E
S
 
S
V
 
I
R
 
E
T
 
A
V
 
V
M
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
T
S
 
D
Q
 
E
W
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
Q
 
R
P
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
M
 
M
E
 
R
I
 
M
A
 
K
P
 
E
E
 
E
N
 
E
Y
 
W
D
 
S
A
 
D
V
 
I
L
 
M
D
 
E
V
x
T
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
S
T
 
I
L
 
F
Y
 
R
C
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
L
P
 
R
H
 
G
M
 
M
R
 
M
S
 
K
R
 
K
K
 
R
Q
 
Q
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
V
S
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
-
F
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
H
 
-
Y
 
-
S
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
S
M
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
S
D
 
R
N
 
G
V
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
A
 
E
T
 
T
D
 
D
I
 
M
T
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
D
E
 
E
K
 
Q
L
 
R
E
 
T
E
 
A
I
 
T
K
 
L
A
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
L
G
 
G
T
 
D
A
 
P
D
 
R
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
S
C
 
A
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
L
 
E
S
 
A
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
E
 
T
V
 
L
D
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G

4nbwA Crystal structure of fabg from plesiocystis pacifica (see paper)
41% identity, 96% coverage: 11:251/252 of query aligns to 4:251/253 of 4nbwA

query
sites
4nbwA
A
 
A
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
S
x
N
R
 
-
R
 
-
G
|
G
L
x
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
L
L
 
E
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
H
 
A
G
 
G
A
 
Y
T
 
H
V
 
V
A
 
V
I
 
A
L
 
W
D
|
D
L
|
L
D
 
A
E
 
E
A
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
E
A
 
A
A
 
G
A
 
A
S
 
A
L
 
L
G
 
-
P
 
I
R
 
A
H
 
E
V
 
I
G
 
A
M
 
D
A
 
A
C
 
G
N
 
G
V
 
S
T
 
A
D
 
D
L
 
F
A
 
A
S
 
R
V
|
V
-
x
D
-
x
V
-
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
S
-
 
V
R
 
E
T
 
A
V
 
A
M
 
V
D
 
A
A
 
E
L
 
I
V
 
I
S
 
A
Q
 
E
W
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
T
 
L
Q
 
H
P
 
D
L
 
G
K
 
Q
I
 
L
M
 
V
E
 
K
I
 
V
-
 
K
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
V
-
 
K
-
 
K
-
 
M
A
 
A
P
 
E
E
 
A
N
 
Q
Y
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
I
D
 
S
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
F
Y
 
L
C
 
C
S
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
A
P
 
P
H
 
H
M
 
M
R
 
I
S
 
A
R
 
A
K
 
K
Q
 
Y
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
L
N
 
N
L
 
A
S
 
S
S
|
S
V
 
V
S
 
V
A
 
G
Q
 
L
R
 
Y
G
 
G
G
 
N
G
 
-
I
 
-
F
 
F
G
 
G
G
 
Q
P
 
T
H
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
S
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
K
A
 
V
M
 
W
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
R
D
 
Y
N
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
A
 
A
T
|
T
D
 
E
I
 
M
T
 
V
G
 
Q
G
 
Q
L
 
M
L
 
-
T
 
-
P
 
P
E
 
E
K
 
R
-
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
A
I
 
M
K
 
V
A
 
A
G
 
R
I
 
T
P
 
P
M
 
V
G
 
G
R
 
R
P
 
I
G
 
G
T
 
D
A
 
P
D
 
V
D
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
R
C
 
A
A
 
Y
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D