SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMc00394 FitnessBrowser__Smeli:SMc00394 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1gpmA Escherichia coli gmp synthetase complexed with amp and pyrophosphate (see paper)
52% identity, 100% coverage: 3:520/520 of query aligns to 1:501/501 of 1gpmA

query
sites
1gpmA
Q
 
E
T
 
N
A
 
I
H
 
H
P
 
K
D
 
H
T
 
R
V
 
I
L
 
L
I
 
I
V
 
L
D
 
D
F
 
F
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
V
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
L
 
L
I
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
R
V
 
V
R
 
R
E
 
E
S
 
L
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
C
 
C
E
 
E
I
 
L
V
 
W
P
 
A
F
 
W
Q
 
D
S
 
V
A
 
T
E
 
E
E
 
A
G
 
Q
F
 
I
H
 
R
R
 
D
L
 
F
K
 
N
P
 
P
K
 
S
A
 
G
V
 
I
I
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
x
G
P
 
P
A
 
E
S
 
S
T
 
T
L
 
T
D
 
E
T
 
E
G
 
N
S
 
S
P
 
P
R
 
R
A
 
A
P
 
P
S
 
Q
V
 
Y
I
 
V
F
 
F
D
 
E
S
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
V
C
|
C
Y
|
Y
G
 
G
Q
 
M
Q
 
Q
T
 
T
M
 
M
C
 
A
A
 
M
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
H
V
 
V
E
 
E
S
 
A
G
 
S
H
 
N
H
 
E
R
 
R
E
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
F
 
Q
L
 
V
E
 
E
V
 
V
E
 
V
K
 
N
D
 
D
C
 
S
P
 
A
L
 
L
F
 
V
D
 
R
G
 
G
L
 
I
W
 
E
S
 
D
L
 
A
G
 
L
S
 
T
R
 
A
H
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
L
Q
 
D
V
 
V
W
 
W
M
 
M
S
 
S
H
 
H
G
 
G
D
 
D
R
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
I
P
 
P
E
 
S
G
 
D
F
 
F
E
 
I
V
 
T
V
 
V
A
 
A
T
 
S
S
 
T
S
 
E
N
 
S
A
 
C
P
 
P
F
 
F
A
 
A
F
 
I
I
 
M
A
 
A
D
 
N
E
 
E
K
 
E
R
 
K
K
 
R
Y
 
F
Y
 
Y
A
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E
V
 
V
V
 
T
H
 
H
T
 
T
P
 
R
D
 
Q
G
 
G
A
 
M
K
 
R
L
 
M
I
 
L
A
 
E
N
 
R
F
 
F
V
 
V
H
 
R
K
 
D
I
 
I
A
 
C
G
 
Q
I
 
C
T
 
E
G
 
A
D
 
L
W
 
W
T
 
T
M
 
P
S
 
A
A
 
K
Y
 
I
R
 
I
A
 
D
K
 
D
A
 
A
V
 
V
E
 
A
A
 
R
I
 
I
R
 
R
K
 
E
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
D
 
D
K
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
C
 
L
A
x
G
L
|
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
V
|
V
D
|
D
S
|
S
S
 
S
V
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
M
L
 
L
I
 
L
H
 
H
E
 
R
A
 
A
V
 
I
G
 
G
D
 
K
Q
 
N
L
 
L
T
 
T
C
 
C
I
 
V
L
 
F
V
|
V
D
 
D
H
 
N
G
 
G
L
 
L
M
 
L
R
 
R
K
 
L
D
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
E
N
 
Q
V
 
V
V
 
L
A
 
D
M
 
M
F
 
F
K
 
G
E
 
D
H
 
H
Y
 
F
N
 
G
L
 
L
H
 
N
L
 
I
L
 
V
H
 
H
I
 
V
D
 
P
A
 
A
S
 
E
D
 
D
R
 
R
F
 
F
I
 
L
G
 
S
E
 
A
L
 
L
E
 
A
G
 
G
V
 
E
S
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
A
K
 
K
R
 
R
K
 
K
I
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
V
F
|
F
I
 
V
E
 
E
V
 
V
F
 
F
E
 
D
E
 
E
E
 
E
A
 
A
K
 
L
K
 
K
L
 
L
G
 
E
G
 
D
A
 
V
D
 
K
F
 
W
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
I
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
V
 
V
I
 
I
E
 
E
S
 
S
V
 
A
S
 
A
F
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
-
V
 
-
T
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
H
 
-
H
 
-
N
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
R
 
-
M
 
-
N
 
K
M
 
M
Q
 
G
L
 
L
V
 
V
E
 
E
P
 
P
L
 
L
R
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
F
K
|
K
D
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
R
V
 
K
L
 
I
G
 
G
R
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
Y
S
 
D
F
 
M
I
 
L
G
 
Y
R
 
R
H
 
H
P
 
P
F
 
F
P
 
P
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
A
 
G
I
 
V
R
 
R
C
 
V
P
 
L
G
 
G
G
 
E
I
 
V
T
 
K
R
 
K
E
 
E
K
 
Y
L
 
C
E
 
D
I
 
L
L
 
L
R
 
R
E
 
R
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
Y
 
F
L
 
I
D
 
E
E
 
E
I
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
A
G
 
D
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
K
I
 
V
W
 
S
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
T
V
 
V
L
 
F
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Q
 
R
T
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
M
 
M
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
R
T
 
K
Y
 
Y
E
 
D
F
 
W
V
 
V
C
 
V
A
 
S
L
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
V
T
 
E
S
 
T
V
 
I
D
 
D
G
 
F
M
 
M
T
 
T
A
 
A
D
 
H
F
 
W
Y
 
A
H
 
H
Y
 
L
D
 
P
M
 
Y
E
 
D
F
 
F
L
 
L
G
 
G
R
 
R
A
 
V
A
 
S
T
 
N
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
E
 
E
V
 
V
R
 
N
G
 
G
I
 
I
N
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
T
 
S
S
 
G
K
 
K
P
 
P
P
 
P
G
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
E
W
 
W
E
 
E

5tw7F Crystal structure of a gmp synthase (glutamine-hydrolyzing) from neisseria gonorrhoeae
49% identity, 100% coverage: 1:520/520 of query aligns to 1:490/490 of 5tw7F

query
sites
5tw7F
M
 
M
T
 
T
Q
 
Q
T
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
D
 
D
T
 
K
V
 
I
L
 
L
I
 
I
V
 
L
D
 
D
F
 
F
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
V
 
V
T
 
T
Q
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
V
 
V
R
 
R
E
 
E
S
 
A
G
 
H
V
 
V
Y
 
Y
C
 
C
E
 
E
I
 
L
V
 
H
P
 
S
F
 
F
Q
 
D
S
 
M
A
 
P
E
 
L
E
 
D
G
 
E
F
 
I
H
 
K
R
 
A
L
 
F
K
 
N
P
 
P
K
 
K
A
 
G
V
 
I
I
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
x
G
P
 
P
A
 
N
S
 
S
T
 
V
L
 
Y
D
 
E
T
 
S
G
 
D
S
 
Y
P
 
-
R
 
Q
A
 
A
P
 
D
S
 
T
V
 
G
I
 
I
F
 
F
D
 
D
S
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
L
G
 
G
I
 
I
C
|
C
Y
|
Y
G
 
G
Q
 
M
Q
 
Q
T
 
F
M
 
M
C
 
A
A
 
H
Q
 
H
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
E
V
 
V
E
 
Q
S
 
P
G
 
G
H
 
N
H
 
Q
R
 
R
E
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
F
 
Q
L
 
V
E
 
K
V
 
T
E
 
-
K
 
I
D
 
D
C
 
S
P
 
G
L
 
L
F
 
T
D
 
R
G
 
G
L
 
I
W
 
Q
S
 
D
L
 
D
G
 
A
S
 
P
R
 
N
H
 
T
-
 
L
Q
 
D
V
 
V
W
 
W
M
 
M
S
 
S
H
 
H
G
 
G
D
 
D
R
 
K
V
 
V
T
 
S
A
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
F
 
F
E
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
G
T
 
D
S
 
T
S
 
P
N
 
S
A
 
C
P
 
P
F
 
I
A
 
A
F
 
M
I
 
M
A
 
E
D
 
N
E
 
T
K
 
E
R
 
K
K
 
Q
Y
 
F
Y
 
Y
A
 
G
V
 
I
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E
V
 
V
V
 
T
H
 
H
T
 
T
P
 
K
D
 
Q
G
 
G
A
 
R
K
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
N
N
 
R
F
 
F
V
 
V
H
 
L
K
 
D
I
 
I
A
 
C
G
 
G
I
 
A
T
 
Q
G
 
P
D
 
G
W
 
W
T
 
T
M
 
M
S
 
P
A
 
N
Y
 
Y
R
 
I
A
 
E
K
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
A
A
 
K
I
 
I
R
 
R
K
 
E
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
D
 
S
K
 
D
K
 
E
V
 
V
I
 
I
C
 
L
A
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
D
|
D
S
 
S
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
A
L
 
L
I
 
I
H
 
H
E
 
R
A
 
A
V
 
I
G
 
G
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
C
 
C
I
 
V
L
 
F
V
 
V
D
 
D
H
 
H
G
 
G
L
 
L
M
 
L
R
 
R
K
 
L
D
 
N
E
 
E
A
 
G
A
 
K
N
 
M
V
 
V
V
 
M
A
 
D
M
 
M
F
 
F
K
 
A
E
 
R
H
 
N
Y
 
L
N
 
G
L
 
V
H
 
K
L
 
V
L
 
I
H
 
H
I
 
V
D
 
D
A
 
A
S
 
E
D
 
G
R
 
Q
F
 
F
I
 
M
G
 
A
E
 
K
L
 
L
E
 
A
G
 
G
V
 
V
S
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
K
K
 
K
R
 
R
K
 
K
I
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
A
L
 
E
F
 
F
I
 
I
E
 
E
V
 
V
F
 
F
E
 
D
E
 
A
E
 
E
A
 
E
K
 
K
K
 
K
L
 
L
G
 
T
G
 
N
A
 
A
D
 
K
F
 
W
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
I
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
V
 
V
I
 
I
E
 
K
S
 
-
V
 
-
S
 
-
F
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
-
V
 
-
T
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
H
 
-
H
 
-
N
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
R
 
-
M
 
-
N
 
-
M
 
L
Q
 
K
L
 
L
V
 
L
E
 
E
P
 
P
L
 
L
R
 
R
E
 
D
L
 
L
F
 
F
K
|
K
D
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
R
V
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
V
E
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
R
S
 
E
F
 
M
I
 
V
G
 
Y
R
 
R
H
 
H
P
 
P
F
 
F
P
 
P
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
A
 
G
I
 
V
R
 
R
C
 
I
P
 
L
G
 
G
G
 
E
I
 
V
T
 
K
R
 
K
E
 
E
K
 
Y
L
 
A
E
 
D
I
 
L
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
D
I
 
I
Y
 
F
L
 
I
D
 
Q
E
 
E
I
 
L
R
 
R
K
 
N
-
 
T
-
 
T
-
 
D
-
 
E
-
 
N
-
 
G
A
 
T
G
 
S
L
 
W
Y
 
Y
D
 
D
A
 
L
I
 
T
W
 
S
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
V
L
 
F
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Q
 
K
T
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
M
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
T
 
T
Y
 
Y
E
 
D
F
 
Y
V
 
V
C
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
V
T
 
I
S
 
T
V
 
S
D
 
D
G
 
F
M
 
M
T
 
T
A
 
A
D
 
H
F
 
W
Y
 
A
H
 
E
Y
 
L
D
 
P
M
 
Y
E
 
S
F
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
R
A
 
V
A
 
S
T
 
N
R
 
R
I
 
I
I
|
I
N
 
N
E
 
E
V
|
V
R
 
K
G
 
G
I
|
I
N
 
N
R
 
R
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
T
 
S
S
 
G
K
 
K
P
 
P
P
 
P
G
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
E
W
 
W
E
 
E

Q8IJR9 GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]; PfGMPS; Glutamine amidotransferase; Guanosine monophosphate synthetase; EC 6.3.5.2 from Plasmodium falciparum (isolate 3D7) (see 3 papers)
41% identity, 99% coverage: 8:520/520 of query aligns to 7:555/555 of Q8IJR9

query
sites
Q8IJR9
D
 
D
T
 
K
V
 
I
L
 
L
I
 
V
V
 
L
D
 
N
F
 
F
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
V
x
Y
T
 
F
Q
x
H
L
 
L
I
 
I
A
 
V
R
x
K
R
|
R
V
 
L
R
 
N
E
 
N
S
 
I
G
 
K
V
 
I
Y
 
F
C
 
S
E
 
E
I
 
T
V
 
K
P
 
D
F
 
Y
Q
 
G
S
 
V
A
 
E
E
 
L
E
 
K
G
 
D
F
 
I
H
 
K
R
 
D
L
 
M
K
 
N
P
 
I
K
 
K
A
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
G
P
 
P
A
 
Y
S
 
S
T
 
V
L
 
T
D
 
E
T
 
A
G
 
G
S
 
S
P
 
P
R
 
H
A
 
L
P
 
K
S
 
K
V
 
E
I
 
V
F
 
F
D
 
E
-
 
Y
-
 
F
-
 
L
-
 
E
S
 
K
G
 
K
L
 
I
P
 
P
V
 
I
F
 
F
G
 
G
I
 
I
C
|
C
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
M
Q
|
Q
T
 
E
M
 
I
C
 
A
A
 
V
Q
 
Q
L
 
M
G
 
N
G
 
G
K
 
E
V
 
V
E
 
K
S
 
K
G
 
S
H
 
K
H
 
T
R
 
S
E
 
E
F
 
Y
G
 
G
-
x
C
-
 
T
-
 
D
-
 
V
-
 
N
-
 
I
-
 
L
-
 
R
-
 
N
-
 
D
-
 
N
-
 
I
-
 
N
-
 
N
-
 
I
-
 
T
-
 
Y
-
 
C
R
 
R
A
 
N
F
 
F
L
 
G
E
 
D
-
 
S
-
 
S
-
 
S
-
 
A
-
 
M
-
 
D
-
 
L
-
 
Y
-
 
S
-
 
N
-
 
Y
-
 
K
-
 
L
V
 
M
E
 
N
K
 
E
D
 
T
C
 
C
P
 
C
L
 
L
F
 
F
D
 
E
G
 
N
L
 
I
W
x
K
S
 
S
L
 
-
G
 
-
S
 
D
R
 
I
H
 
T
Q
 
T
V
 
V
W
|
W
M
 
M
S
x
N
H
 
H
G
 
N
D
|
D
R
 
E
V
 
V
T
 
T
A
 
K
L
 
I
P
 
P
E
 
E
G
 
N
F
 
F
E
 
Y
V
 
L
V
 
V
A
 
S
T
 
S
S
 
S
S
 
E
N
 
N
A
 
C
P
 
L
F
 
I
A
 
C
F
 
S
I
 
I
A
 
Y
D
 
N
E
 
K
K
 
E
R
 
Y
K
 
N
Y
 
I
Y
 
Y
A
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
Y
H
|
H
P
 
P
E
 
E
V
 
V
V
x
Y
H
x
E
T
 
S
P
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
E
K
 
L
L
 
M
I
 
F
A
 
Y
N
 
N
F
 
F
V
 
A
H
 
Y
K
 
N
I
 
I
A
 
C
G
 
K
I
 
C
T
 
K
G
 
K
D
 
Q
W
 
F
T
 
D
M
 
P
S
 
I
A
 
R
Y
 
Y
R
 
H
A
 
E
K
 
L
A
 
E
V
 
L
E
 
K
A
 
N
I
 
I
R
 
E
K
 
K
Q
 
Y
V
 
K
G
 
H
D
 
D
K
 
H
K
 
Y
V
 
V
I
 
I
C
 
A
A
 
A
L
 
M
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
I
D
 
D
S
 
S
S
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
A
L
 
Y
I
 
T
H
 
H
E
 
K
A
 
I
V
 
F
G
 
K
D
 
E
Q
 
R
L
 
F
T
 
F
C
 
G
I
 
I
L
 
F
V
 
I
D
 
D
H
 
N
G
 
G
L
 
L
M
 
L
R
 
R
K
 
K
D
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
Y
A
 
T
M
 
F
F
 
L
K
 
K
E
 
S
H
 
T
Y
 
F
-
 
P
N
 
D
L
 
M
H
 
N
L
 
I
L
 
T
H
 
K
I
 
I
D
 
D
A
 
A
S
 
S
D
 
E
R
 
N
F
 
F
I
 
L
G
 
S
E
 
N
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
V
 
V
S
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
Q
K
 
K
R
|
R
K
 
K
I
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
K
L
 
L
F
 
F
I
 
I
E
 
E
V
 
E
F
 
F
E
 
E
E
 
K
E
 
A
A
 
V
K
 
N
K
 
N
L
 
I
G
 
D
-
 
I
-
 
D
-
 
I
G
 
N
A
 
K
D
 
T
F
 
F
L
 
L
A
 
L
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
D
|
D
V
 
I
I
 
I
E
|
E
S
 
S
V
 
-
S
x
K
F
 
C
T
 
S
G
 
K
G
 
N
P
 
L
S
 
S
V
 
D
T
 
T
I
 
I
K
|
K
S
x
T
H
|
H
H
|
H
N
|
N
V
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
K
R
 
N
M
 
L
N
 
K
M
 
F
Q
 
K
L
 
L
V
 
F
E
 
E
P
 
P
L
 
F
R
 
K
E
 
Y
L
 
L
F
 
F
K
|
K
D
|
D
E
x
D
V
 
V
R
x
K
V
 
T
L
 
L
G
 
S
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
N
L
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
E
F
 
I
I
 
T
G
 
N
R
 
R
H
 
H
P
 
P
F
 
F
P
 
P
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
R
 
R
C
 
V
P
 
I
G
 
G
G
 
E
I
 
I
T
 
N
R
 
K
E
 
H
K
 
K
L
 
L
E
 
N
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
V
D
 
D
A
 
D
I
 
I
Y
 
F
L
 
I
D
 
N
E
 
D
I
 
L
R
 
K
K
 
Q
A
 
Y
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
N
A
 
Q
I
 
I
W
 
S
Q
|
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
S
V
 
S
Q
 
K
T
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
M
 
R
G
 
G
D
 
D
G
 
A
R
 
R
T
 
S
Y
 
Y
E
 
D
F
 
Y
V
 
V
C
 
C
A
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
V
T
 
K
S
 
T
V
 
S
D
 
S
G
 
F
M
 
M
T
 
T
A
 
A
D
 
N
F
 
W
Y
 
Y
H
 
Q
Y
 
I
D
 
P
M
 
Y
E
 
D
F
 
I
L
 
L
G
 
D
R
 
K
A
 
I
A
 
T
T
 
T
R
 
R
I
 
I
I
 
L
N
 
S
E
 
E
V
 
V
R
 
K
G
 
G
I
 
V
N
 
N
R
|
R
V
 
I
V
 
L
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
T
 
S
S
 
S
K
|
K
P
 
P
P
 
P
G
 
A
T
 
T
I
|
I
E
|
E
W
 
F
E
|
E

2ywcA Crystal structure of gmp synthetase from thermus thermophilus in complex with xmp
48% identity, 98% coverage: 10:520/520 of query aligns to 2:475/475 of 2ywcA

query
sites
2ywcA
V
 
V
L
 
L
I
 
V
V
 
L
D
 
D
F
 
F
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
V
 
Y
T
 
T
Q
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
V
 
L
R
 
R
E
 
E
S
 
L
G
 
R
V
 
A
Y
 
F
C
 
S
E
 
L
I
 
I
V
 
L
P
 
P
F
 
G
Q
 
D
S
 
A
A
 
P
E
 
L
E
 
E
G
 
E
F
 
V
H
 
L
R
 
K
L
 
H
K
 
R
P
 
P
K
 
Q
A
 
A
V
 
L
I
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
x
G
P
 
P
A
x
R
S
 
S
T
 
V
L
 
F
D
 
D
T
 
P
G
 
D
S
 
A
P
 
P
R
 
R
A
 
P
P
 
D
S
 
P
V
 
R
I
 
L
F
 
F
D
 
S
S
 
S
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
L
F
 
L
G
 
G
I
 
I
C
|
C
Y
|
Y
G
 
G
Q
 
M
Q
 
Q
T
 
L
M
 
L
C
 
A
A
 
Q
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
R
V
 
V
E
 
E
S
 
R
G
 
A
H
 
G
H
 
R
R
 
A
E
 
E
F
 
Y
G
 
G
R
 
K
A
 
A
F
 
L
L
 
L
E
 
-
V
 
T
E
 
R
K
 
H
D
 
E
C
 
G
P
 
P
L
 
L
F
 
F
D
 
R
G
 
G
L
 
L
W
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
E
S
 
G
R
 
E
H
 
V
Q
 
Q
V
 
V
W
 
W
M
 
M
S
 
S
H
 
H
G
 
Q
D
 
D
R
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
P
P
 
P
E
 
P
G
 
G
F
 
W
E
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
E
S
 
T
S
 
E
N
 
E
A
 
N
P
 
P
F
 
V
A
 
A
F
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
S
E
 
P
K
 
D
R
 
G
K
 
R
Y
 
A
Y
 
Y
A
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E
V
 
V
V
 
A
H
 
H
T
 
T
P
 
P
D
 
K
G
 
G
A
 
M
K
 
Q
L
 
I
I
 
L
A
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
L
H
 
-
K
 
E
I
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
K
G
 
R
D
 
D
W
 
W
T
 
T
M
 
P
S
 
E
A
 
H
Y
 
V
R
 
L
A
 
E
K
 
E
A
 
L
V
 
L
E
 
R
A
 
E
I
 
V
R
 
R
K
 
E
Q
 
R
V
 
A
G
 
G
D
 
K
K
 
D
K
 
R
V
 
V
I
 
L
C
 
L
A
 
A
L
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
D
|
D
S
 
S
S
 
S
V
 
T
A
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
L
H
 
A
E
 
K
A
 
A
V
 
G
G
 
V
D
 
D
Q
 
H
L
 
L
T
 
-
C
 
A
I
 
V
L
 
F
V
 
V
D
 
D
H
 
H
G
 
G
L
 
L
M
 
L
R
 
R
K
 
L
D
 
G
E
 
E
A
 
R
A
 
E
N
 
E
V
 
V
V
 
E
A
 
G
M
 
A
F
 
L
K
 
R
E
 
-
H
 
A
Y
 
L
N
 
G
L
 
V
H
 
N
L
 
L
L
 
L
H
 
V
I
 
V
D
 
D
A
 
A
S
 
K
D
 
E
R
 
R
F
 
F
I
 
L
G
 
K
E
 
A
L
 
L
E
 
K
G
 
G
V
 
V
S
 
E
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
E
K
 
K
R
|
R
K
 
K
I
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
E
F
 
F
I
 
V
E
 
A
V
 
A
F
 
F
E
 
S
E
 
Q
E
 
V
A
 
A
K
 
R
K
 
E
L
 
R
G
 
G
G
 
P
A
 
F
D
 
R
F
 
F
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
V
 
V
I
 
I
E
 
E
S
 
-
V
 
-
S
 
-
F
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
-
V
 
-
T
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
H
 
-
H
 
-
N
 
-
V
 
-
G
 
G
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
E
R
 
D
M
 
L
N
 
E
M
 
F
Q
 
E
L
 
L
V
 
L
E
 
E
P
 
P
L
 
F
R
 
R
E
 
L
L
 
L
F
 
F
K
|
K
D
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
R
V
 
E
L
 
L
G
 
A
R
 
L
E
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
D
S
 
T
F
 
L
I
 
R
G
 
L
R
 
R
H
 
H
P
 
P
F
 
F
P
|
P
G
|
G
P
|
P
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
V
R
 
R
C
 
V
P
 
L
G
 
G
G
 
E
I
 
V
T
 
T
R
 
E
E
 
E
K
 
R
L
 
L
E
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
R
A
 
A
D
 
D
A
 
D
I
 
I
Y
 
F
L
 
T
D
 
S
E
 
L
I
 
L
R
 
R
K
 
E
A
 
W
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
E
A
 
K
I
 
V
W
 
A
Q
|
Q
A
 
A
F
 
L
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
T
P
 
P
V
 
V
Q
 
G
T
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
M
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
T
 
-
Y
 
-
E
 
-
F
 
Y
V
 
V
C
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
V
T
 
T
S
 
T
V
 
E
D
 
D
G
 
F
M
 
M
T
 
T
A
 
A
D
 
D
F
 
W
Y
 
A
H
 
R
Y
 
L
D
 
P
M
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
L
G
 
D
R
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
R
R
 
R
I
 
I
I
 
T
N
 
R
E
 
R
V
 
V
R
 
P
G
 
E
I
 
I
N
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
V
 
L
T
 
T
S
 
S
K
|
K
P
 
P
P
 
P
G
 
A
T
|
T
I
|
I
E
|
E
W
 
W
E
 
E

4wioA Crystal structure of the c89a gmp synthetase inactive mutant from plasmodium falciparum in complex with glutamine (see paper)
39% identity, 99% coverage: 8:520/520 of query aligns to 1:525/525 of 4wioA

query
sites
4wioA
D
 
D
T
 
K
V
 
I
L
 
L
I
 
V
V
 
L
D
 
N
F
 
F
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
V
 
Y
T
 
F
Q
 
H
L
 
L
I
 
I
A
 
V
R
 
K
R
 
R
V
 
L
R
 
N
E
 
N
S
 
I
G
 
K
V
 
I
Y
 
F
C
 
S
E
 
E
I
 
T
V
 
K
P
 
D
F
 
Y
Q
 
G
S
 
V
A
 
E
E
 
L
E
 
K
G
 
D
F
 
I
H
 
K
R
 
D
L
 
M
K
 
N
P
 
I
K
 
K
A
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
x
G
P
 
P
A
 
Y
S
 
S
T
 
V
L
 
T
D
 
E
T
 
A
G
 
G
S
 
S
P
 
P
R
 
H
A
 
L
P
 
K
S
 
K
V
 
E
I
 
V
F
 
F
D
 
E
-
 
Y
-
 
F
-
 
L
-
 
E
S
 
K
G
 
K
L
 
I
P
 
P
V
 
I
F
 
F
G
 
G
I
 
I
C
x
A
Y
|
Y
G
 
G
Q
 
M
Q
|
Q
T
 
E
M
 
I
C
 
A
A
 
V
Q
 
Q
L
 
M
G
 
N
G
 
G
K
 
E
V
 
V
E
 
K
S
 
K
G
 
S
H
 
K
H
 
T
R
 
S
E
 
E
F
 
Y
G
 
G
R
 
C
A
 
T
F
 
D
L
 
V
E
 
N
V
 
I
E
 
L
K
 
R
D
 
N
-
 
D
-
 
N
-
 
I
-
 
N
-
 
N
-
 
I
-
 
T
-
 
Y
C
 
C
P
 
R
L
 
N
F
 
F
D
 
S
G
 
S
L
 
A
W
 
M
S
 
D
L
 
L
G
 
Y
S
 
S
R
 
N
H
 
Y
Q
 
K
-
 
L
-
 
M
-
 
N
-
 
E
-
 
C
-
 
L
-
 
F
-
 
E
-
 
N
-
 
I
-
 
K
-
 
S
-
 
D
-
 
I
-
 
T
-
 
T
V
 
V
W
 
W
M
 
M
S
x
N
H
|
H
G
x
N
D
|
D
R
 
E
V
 
V
T
 
T
A
 
K
L
 
I
P
 
P
E
 
E
G
 
N
F
 
F
E
 
Y
V
 
L
V
 
V
A
 
S
T
 
S
S
 
S
S
 
E
N
 
N
A
 
C
P
 
L
F
 
I
A
 
C
F
 
S
I
 
I
A
 
Y
D
 
N
E
 
K
K
 
E
R
 
Y
K
 
N
Y
 
I
Y
 
Y
A
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
Y
H
|
H
P
 
P
E
|
E
V
 
V
V
 
Y
H
 
E
T
 
S
P
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
E
K
 
L
L
 
M
I
 
F
A
 
Y
N
 
N
F
 
F
V
 
A
H
 
Y
K
 
N
I
 
I
A
 
C
G
 
K
I
 
C
T
 
K
G
 
K
D
 
Q
W
 
F
T
 
D
M
 
P
S
 
I
A
 
R
Y
 
Y
R
 
H
A
 
E
K
 
L
A
 
E
V
 
L
E
 
K
A
 
N
I
 
I
R
 
E
K
 
K
Q
 
Y
V
 
K
G
 
H
D
 
D
K
 
H
K
 
Y
V
 
V
I
 
I
C
 
A
A
 
A
L
 
M
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
I
D
|
D
S
 
S
S
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
A
L
 
Y
I
 
T
H
 
H
E
 
K
A
 
I
V
 
F
G
 
K
D
 
E
Q
 
R
L
 
F
T
 
F
C
 
G
I
 
I
L
 
F
V
 
I
D
 
D
H
 
N
G
 
G
L
 
L
M
 
L
R
 
R
K
 
K
D
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
Y
A
 
T
M
 
F
F
 
L
K
 
K
E
 
S
H
 
T
Y
 
F
-
 
P
N
 
D
L
 
M
H
 
N
L
 
I
L
 
T
H
 
K
I
 
I
D
 
D
A
 
A
S
 
S
D
 
E
R
 
N
F
 
F
I
 
L
G
 
S
E
 
N
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
V
 
V
S
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
Q
K
 
K
R
 
R
K
 
K
I
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
K
L
 
L
F
 
F
I
 
I
E
 
E
V
 
E
F
 
F
E
 
E
E
 
K
E
 
A
A
 
V
K
 
N
K
 
N
L
 
I
G
 
D
-
 
I
-
 
D
-
 
I
G
 
N
A
 
K
D
 
T
F
 
F
L
 
L
A
 
L
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
V
 
I
I
 
I
E
 
E
S
 
S
V
 
K
S
 
C
F
 
-
T
 
S
G
 
K
G
 
N
P
 
L
S
 
S
V
 
D
T
 
T
I
 
I
K
 
K
S
 
T
H
 
H
H
 
H
N
 
N
V
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
R
 
-
M
 
L
N
 
K
M
 
F
Q
 
K
L
 
L
V
 
F
E
 
E
P
 
P
L
 
F
R
 
K
E
 
Y
L
 
L
F
 
F
K
|
K
D
 
D
E
 
D
V
 
V
R
 
K
V
 
T
L
 
L
G
 
S
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
N
L
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
E
F
 
I
I
 
T
G
 
N
R
 
R
H
 
H
P
 
P
F
 
F
P
 
P
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
R
 
R
C
 
V
P
 
I
G
 
G
G
 
E
I
 
I
T
 
N
R
 
K
E
 
H
K
 
K
L
 
L
E
 
N
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
V
D
 
D
A
 
D
I
 
I
Y
 
F
L
 
I
D
 
N
E
 
D
I
 
L
R
 
K
K
 
Q
A
 
Y
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
N
A
 
Q
I
 
I
W
 
S
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
-
V
 
-
Q
 
-
T
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
M
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
T
 
S
Y
 
Y
E
 
D
F
 
Y
V
 
V
C
 
C
A
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
V
T
 
K
S
 
T
V
 
S
D
 
S
G
 
F
M
 
M
T
 
T
A
 
A
D
 
N
F
 
W
Y
 
Y
H
 
Q
Y
 
I
D
 
P
M
 
Y
E
 
D
F
 
I
L
 
L
G
 
D
R
 
K
A
 
I
A
 
T
T
 
T
R
 
R
I
 
I
I
 
L
N
 
S
E
 
E
V
 
V
R
 
K
G
 
G
I
 
V
N
 
N
R
 
R
V
 
I
V
 
L
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
T
 
S
S
 
S
K
 
K
P
 
P
P
 
P
G
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
E
W
 
F
E
 
E

3uowA Crystal structure of pf10_0123, a gmp synthetase from plasmodium falciparum
38% identity, 99% coverage: 8:520/520 of query aligns to 2:517/517 of 3uowA

query
sites
3uowA
D
 
D
T
 
K
V
 
I
L
 
L
I
 
V
V
 
L
D
 
N
F
 
F
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
V
 
Y
T
 
F
Q
 
H
L
 
L
I
 
I
A
 
V
R
 
K
R
 
R
V
 
L
R
 
N
E
 
N
S
 
I
G
 
K
V
 
I
Y
 
F
C
 
S
E
 
E
I
 
T
V
 
K
P
 
D
F
 
Y
Q
 
G
S
 
V
A
 
E
E
 
L
E
 
K
G
 
D
F
 
I
H
 
K
R
 
D
L
 
M
K
 
N
P
 
I
K
 
K
A
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
x
G
P
 
P
A
 
Y
S
 
S
T
 
V
L
 
T
D
 
E
T
 
A
G
 
G
S
 
S
P
 
P
R
 
H
A
 
L
P
 
K
S
 
K
V
 
E
I
 
V
F
 
F
D
 
E
-
 
Y
-
 
F
-
 
L
-
 
E
S
 
K
G
 
K
L
 
I
P
 
P
V
 
I
F
 
F
G
 
G
I
 
I
C
|
C
Y
|
Y
G
 
G
Q
 
M
Q
 
Q
T
 
E
M
 
I
C
 
A
A
 
V
Q
 
Q
L
 
M
G
 
N
G
 
G
K
 
E
V
 
V
E
 
K
S
 
K
G
 
S
H
 
K
H
 
T
R
 
S
E
 
E
F
 
Y
G
 
G
R
 
C
A
 
T
F
 
D
L
 
V
E
 
N
V
 
I
E
 
L
K
 
R
D
 
N
-
 
D
-
 
N
-
 
I
-
 
N
-
 
N
-
 
I
-
 
T
-
 
Y
C
 
C
P
 
R
L
 
N
F
 
F
D
 
S
G
 
S
L
 
A
W
 
M
S
 
D
L
 
L
G
 
Y
S
 
S
R
 
N
H
 
Y
Q
 
K
-
 
L
-
 
M
-
 
N
-
 
C
-
 
C
-
 
L
-
 
F
-
 
E
-
 
N
-
 
I
-
 
K
-
 
S
-
 
D
-
 
I
-
 
T
-
 
T
V
 
V
W
 
W
M
 
M
S
 
N
H
 
H
G
 
N
D
 
D
R
 
E
V
 
V
T
 
T
A
 
K
L
 
I
P
 
P
E
 
E
G
 
N
F
 
F
E
 
Y
V
 
L
V
 
V
A
 
S
T
 
S
S
 
S
S
 
E
N
 
N
A
 
C
P
 
L
F
 
I
A
 
C
F
 
S
I
 
I
A
 
Y
D
 
N
E
 
K
K
 
E
R
 
Y
K
 
N
Y
 
I
Y
 
Y
A
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
Y
H
|
H
P
 
P
E
|
E
V
 
V
V
 
Y
H
 
E
T
 
S
P
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
E
K
 
L
L
 
M
I
 
F
A
 
Y
N
 
N
F
 
F
V
 
A
H
 
Y
K
 
N
I
 
I
A
 
C
G
 
K
I
 
-
T
 
C
G
 
K
D
 
K
W
 
F
T
 
D
M
 
P
S
 
I
A
 
R
Y
 
Y
R
 
H
A
 
E
K
 
L
A
 
E
V
 
L
E
 
K
A
 
N
I
 
I
R
 
E
K
 
K
Q
 
Y
V
 
K
G
 
H
D
 
D
K
 
H
K
 
Y
V
 
V
I
 
I
C
 
A
A
 
A
L
 
M
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
I
D
|
D
S
 
S
S
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
A
L
 
Y
I
 
T
H
 
H
E
 
K
A
 
I
V
 
F
G
 
K
D
 
E
Q
 
R
L
 
F
T
 
F
C
 
G
I
 
I
L
 
F
V
 
I
D
 
D
H
 
N
G
 
G
L
 
L
M
 
L
R
 
R
K
 
K
D
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
Y
A
 
T
M
 
F
F
 
L
K
 
K
E
 
S
H
 
T
Y
 
F
-
 
P
N
 
D
L
 
M
H
 
N
L
 
I
L
 
T
H
 
K
I
 
I
D
 
D
A
 
A
S
 
S
D
 
E
R
 
N
F
 
F
I
 
L
G
 
S
E
 
N
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
V
 
V
S
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
Q
K
 
K
R
|
R
K
 
K
I
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
K
L
 
L
F
 
F
I
 
I
E
 
E
V
 
E
F
 
F
E
 
E
E
 
K
E
 
A
A
 
V
K
 
N
K
 
N
L
 
I
G
 
D
-
 
I
-
 
D
-
 
I
G
 
N
A
 
K
D
 
T
F
 
F
L
 
L
A
 
L
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
V
 
I
I
 
I
E
 
E
S
 
S
V
 
K
S
 
C
F
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
-
V
 
-
T
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
H
 
-
H
 
-
N
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
R
 
S
M
 
L
N
 
K
M
 
F
Q
 
K
L
 
L
V
 
F
E
 
E
P
 
P
L
 
F
R
 
K
E
 
Y
L
 
L
F
 
F
K
|
K
D
 
D
E
 
D
V
 
V
R
 
K
V
 
T
L
 
L
G
 
S
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
N
L
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
E
F
 
I
I
 
T
G
 
N
R
 
R
H
 
H
P
 
P
F
 
F
P
|
P
G
|
G
P
|
P
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
R
 
R
C
 
V
P
 
I
G
 
G
G
 
E
I
 
I
T
 
N
R
 
K
E
 
H
K
 
K
L
 
L
E
 
N
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
V
D
 
D
A
 
D
I
 
I
Y
 
F
L
 
I
D
 
N
E
 
D
I
 
L
R
 
K
K
 
Q
A
 
Y
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
N
A
 
Q
I
 
I
W
 
S
Q
|
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
S
V
 
S
Q
 
K
T
 
S
V
 
V
G
 
-
V
 
-
M
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
T
 
-
Y
 
Y
E
 
D
F
 
Y
V
 
V
C
 
C
A
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
V
T
 
K
S
 
T
V
 
S
D
 
S
G
 
F
M
 
M
T
 
T
A
 
A
D
 
N
F
 
W
Y
 
Y
H
 
Q
Y
 
I
D
 
P
M
 
Y
E
 
D
F
 
I
L
 
L
G
 
D
R
 
K
A
 
I
A
 
T
T
 
T
R
 
R
I
 
I
I
 
L
N
 
S
E
 
E
V
 
V
R
 
K
G
 
G
I
 
V
N
 
N
R
 
R
V
 
I
V
 
L
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
T
 
S
S
 
S
K
|
K
P
 
P
P
 
P
G
 
A
T
|
T
I
|
I
E
|
E
W
 
F
E
 
E

3uowB Crystal structure of pf10_0123, a gmp synthetase from plasmodium falciparum
39% identity, 98% coverage: 10:520/520 of query aligns to 2:477/477 of 3uowB

query
sites
3uowB
V
 
I
L
 
L
I
 
V
V
 
L
D
 
N
F
 
F
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
V
 
Y
T
 
F
Q
 
H
L
 
L
I
 
I
A
 
V
R
 
K
R
 
R
V
 
L
R
 
N
E
 
N
S
 
I
G
 
K
V
 
I
Y
 
F
C
 
S
E
 
E
I
 
T
V
 
K
P
 
D
F
 
Y
Q
 
K
S
 
D
A
 
I
E
 
K
E
 
D
G
 
-
F
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
M
K
 
N
P
 
I
K
 
K
A
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
x
G
P
 
P
A
 
Y
S
 
S
T
 
-
L
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
P
 
-
R
 
E
A
 
V
P
 
F
S
 
E
V
 
Y
I
 
F
F
 
L
D
 
E
S
 
K
G
 
K
L
 
I
P
 
P
V
 
I
F
 
F
G
 
G
I
 
I
C
|
C
Y
|
Y
G
 
G
Q
 
M
Q
 
Q
T
 
E
M
 
I
C
 
A
A
 
V
Q
 
Q
L
 
M
G
 
N
G
 
Y
K
 
G
V
 
C
E
 
T
S
 
D
G
 
V
H
 
N
H
 
I
R
 
N
E
 
I
F
 
N
G
 
N
R
 
I
A
 
T
F
 
Y
L
 
C
E
 
A
V
 
M
E
 
D
-
 
L
-
 
Y
-
 
S
-
 
N
-
 
Y
-
 
K
-
 
L
K
 
M
D
 
N
C
 
C
P
 
C
L
 
L
F
 
F
D
 
E
G
 
N
L
 
I
W
 
K
S
 
S
L
 
-
G
 
-
S
 
D
R
 
I
H
 
T
Q
 
T
V
 
V
W
 
W
M
 
M
S
 
N
H
 
H
G
 
N
D
 
D
R
 
E
V
 
V
T
 
T
A
 
K
L
 
I
P
 
P
E
 
E
G
 
N
F
 
F
E
 
Y
V
 
L
V
 
V
A
 
S
T
 
S
S
 
S
S
 
E
N
 
N
A
 
C
P
 
L
F
 
I
A
 
C
F
 
S
I
 
I
A
 
Y
D
 
N
E
 
K
K
 
E
R
 
Y
K
 
N
Y
 
I
Y
 
Y
A
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
Y
H
|
H
P
 
P
E
|
E
V
 
V
V
 
Y
H
 
E
T
 
S
P
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
E
K
 
L
L
 
M
I
 
F
A
 
Y
N
 
N
F
 
F
V
 
A
H
 
Y
K
 
N
I
 
I
A
 
C
G
 
K
I
 
C
T
 
K
G
 
F
D
 
D
W
 
P
T
 
I
M
 
-
S
 
-
A
 
R
Y
 
Y
R
 
H
A
 
E
K
 
L
A
 
E
V
 
L
E
 
K
A
 
N
I
 
I
R
 
E
K
 
K
Q
 
Y
V
 
K
G
 
H
D
 
D
K
 
H
K
 
Y
V
 
V
I
 
I
C
 
A
A
 
A
L
 
M
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
I
D
|
D
S
 
S
S
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
A
L
 
Y
I
 
T
H
 
H
E
 
K
A
 
I
V
 
F
G
 
K
D
 
E
Q
 
R
L
 
F
T
 
F
C
 
G
I
 
I
L
 
F
V
 
I
D
 
D
H
 
N
G
 
G
L
 
L
M
 
L
R
 
R
K
 
K
D
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
Y
A
 
T
M
 
F
F
 
L
K
 
K
E
 
S
H
 
T
Y
 
F
-
 
P
N
 
D
L
 
M
H
 
N
L
 
I
L
 
T
H
 
K
I
 
I
D
 
D
A
 
A
S
 
S
D
 
E
R
 
N
F
 
F
I
 
L
G
 
S
E
 
N
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
V
 
V
S
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
Q
K
 
K
R
|
R
K
 
K
I
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
K
L
 
L
F
 
F
I
 
I
E
 
E
V
 
E
F
 
F
E
 
E
E
 
K
E
 
A
A
 
V
K
 
N
K
 
N
L
 
I
G
 
D
G
 
D
A
 
I
D
 
N
-
 
K
-
 
T
F
 
F
L
 
L
A
 
L
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
V
 
I
I
 
I
E
 
E
S
 
S
V
 
K
S
 
K
F
 
F
T
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
-
V
 
-
T
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
H
 
-
H
 
-
N
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
R
 
-
M
 
-
N
 
-
M
 
-
Q
 
K
L
 
L
V
 
F
E
 
E
P
 
P
L
 
F
R
 
K
E
 
Y
L
 
L
F
 
F
K
|
K
D
 
D
E
 
D
V
 
V
R
 
K
V
 
T
L
 
L
G
 
S
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
N
L
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
E
F
 
I
I
 
T
G
 
N
R
 
R
H
 
H
P
 
P
F
 
F
P
|
P
G
|
G
P
|
P
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
R
 
R
C
 
V
P
 
I
G
 
G
G
 
E
I
 
I
T
 
N
R
 
K
E
 
H
K
 
K
L
 
L
E
 
N
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
V
D
 
D
A
 
D
I
 
I
Y
 
F
L
 
I
D
 
N
E
 
D
I
 
L
R
 
K
K
 
Q
A
 
Y
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
N
A
 
Q
I
 
I
W
 
S
Q
|
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
S
V
 
S
Q
 
K
T
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
-
M
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
T
 
-
Y
 
Y
E
 
D
F
 
Y
V
 
V
C
 
C
A
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
V
T
 
K
S
 
T
V
 
S
D
 
S
G
 
F
M
 
M
T
 
T
A
 
A
D
 
N
F
 
W
Y
 
Y
H
 
Q
Y
 
I
D
 
P
M
 
Y
E
 
D
F
 
I
L
 
L
G
 
D
R
 
K
A
 
I
A
 
T
T
 
T
R
 
R
I
 
I
I
 
L
N
 
S
E
 
E
V
 
V
R
 
K
G
 
G
I
 
V
N
 
N
R
 
R
V
 
I
V
 
L
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
T
 
S
S
 
S
K
|
K
P
 
P
P
 
P
G
 
A
T
|
T
I
|
I
E
|
E
W
 
F
E
 
E

6jp9A Crsytal structure of a xmp complexed atppase subunit of m. Jannaschii gmp synthetase (see paper)
51% identity, 60% coverage: 211:520/520 of query aligns to 10:298/298 of 6jp9A

query
sites
6jp9A
K
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
E
I
 
I
R
 
K
K
 
Q
Q
 
Q
V
 
I
G
 
S
D
 
D
K
 
R
K
 
K
V
 
A
I
 
I
C
 
I
A
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
D
|
D
S
 
S
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
V
L
 
L
I
 
T
H
 
H
E
 
K
A
 
A
V
 
I
G
 
G
D
 
D
Q
 
K
L
 
L
T
 
T
C
 
A
I
 
V
L
 
F
V
 
V
D
 
D
H
 
T
G
 
G
L
 
L
M
 
M
R
 
R
K
 
K
D
 
G
E
 
E
A
 
R
A
 
E
N
 
E
V
 
V
V
 
E
A
 
K
M
 
T
F
 
F
K
 
R
E
 
D
H
 
K
Y
 
L
N
 
G
L
 
L
H
 
N
L
 
L
L
 
I
H
 
V
I
 
V
D
 
D
A
 
A
S
 
K
D
 
D
R
 
R
F
 
F
I
 
L
G
 
N
E
 
A
L
 
L
E
 
K
G
 
G
V
 
V
S
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
E
K
 
K
R
|
R
K
 
K
I
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
K
L
 
L
F
 
F
I
 
I
E
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
E
 
E
E
 
I
A
 
A
K
 
E
K
 
D
L
 
I
G
 
-
G
 
K
A
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
A
 
V
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
I
Y
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
-
I
 
-
E
 
-
S
 
-
V
 
-
S
 
-
F
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
-
V
 
-
T
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
H
 
-
H
 
H
N
 
N
V
 
V
G
 
-
G
 
A
L
 
L
P
 
P
E
 
H
R
 
G
M
 
M
N
 
V
M
 
L
Q
 
E
L
 
V
V
 
V
E
 
E
P
 
P
L
 
L
R
 
R
E
 
E
L
 
L
F
 
Y
K
|
K
D
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
R
V
 
L
L
 
L
G
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
D
S
 
S
F
 
I
I
 
V
G
 
Y
R
 
R
H
 
Q
P
 
P
F
 
F
P
|
P
G
|
G
P
|
P
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
V
R
 
R
C
 
V
P
 
L
G
 
G
G
 
E
I
 
V
T
 
T
R
 
E
E
 
E
K
 
K
L
 
L
E
 
N
I
 
I
L
 
C
R
 
R
E
 
E
A
 
A
D
 
N
A
 
A
I
 
I
Y
 
V
L
 
E
D
 
E
E
 
E
I
 
V
R
 
K
K
 
K
A
 
A
G
 
N
L
 
L
Y
 
D
D
 
K
A
 
D
I
 
L
W
 
W
Q
|
Q
A
 
Y
F
 
F
A
 
A
V
 
V
L
 
V
L
 
L
P
 
D
V
 
C
Q
 
K
T
 
A
V
 
T
G
 
G
V
 
V
M
 
K
G
 
G
D
 
D
G
 
-
R
 
R
T
 
E
Y
 
Y
E
 
N
F
 
W
V
 
I
C
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
M
V
 
V
T
 
K
S
 
S
V
 
L
D
 
D
G
 
A
M
 
M
T
 
T
A
 
A
D
 
H
F
 
V
Y
 
P
H
 
E
Y
 
I
D
 
P
M
 
F
E
 
D
F
 
L
L
 
L
G
 
K
R
 
R
A
 
I
A
 
S
T
 
K
R
 
R
I
 
I
I
 
T
N
 
S
E
 
E
V
 
I
R
 
P
G
 
N
I
 
V
N
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
V
Y
 
F
D
 
D
V
 
I
T
 
T
S
 
D
K
|
K
P
 
P
P
 
P
G
 
A
T
|
T
I
|
I
E
|
E
W
 
F
E
 
E

P49915 GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]; GMP synthetase; Glutamine amidotransferase; EC 6.3.5.2 from Homo sapiens (Human) (see paper)
36% identity, 96% coverage: 10:507/520 of query aligns to 28:562/693 of P49915

query
sites
P49915
V
 
V
L
 
V
I
 
I
V
 
L
D
 
D
F
 
A
G
 
G
S
 
A
Q
 
Q
V
 
Y
T
 
G
Q
 
K
L
 
V
I
 
I
A
 
D
R
 
R
R
 
R
V
 
V
R
 
R
E
 
E
S
 
L
G
 
F
V
 
V
Y
 
Q
C
 
S
E
 
E
I
 
I
V
 
F
P
 
P
F
 
L
Q
 
E
S
 
T
-
 
P
-
 
A
-
 
F
-
 
A
-
 
I
A
 
K
E
 
E
E
 
Q
G
 
G
F
 
F
H
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
-
K
 
R
A
 
A
V
 
I
I
 
I
L
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
G
P
 
P
A
 
N
S
 
S
T
 
V
L
 
Y
D
 
A
T
 
E
G
 
D
S
 
A
P
 
P
R
 
W
A
 
F
P
 
D
S
 
P
V
 
A
I
 
I
F
 
F
D
 
T
S
 
I
G
 
G
L
 
K
P
 
P
V
 
V
F
 
L
G
 
G
I
 
I
C
|
C
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
M
Q
 
Q
T
 
M
M
 
M
C
 
N
A
 
K
Q
 
V
L
 
F
G
 
G
G
 
G
K
 
T
V
 
V
E
 
H
S
 
K
G
 
K
H
 
S
H
 
V
R
 
R
E
 
E
F
 
D
G
 
G
R
 
V
A
 
F
F
 
N
L
 
I
E
 
S
V
 
V
E
 
D
K
 
N
D
 
T
C
 
C
P
 
S
L
 
L
F
 
F
D
 
R
G
 
G
L
 
L
W
 
Q
S
 
-
L
 
-
G
 
-
S
 
K
R
 
E
H
 
E
Q
 
V
V
 
V
W
 
L
M
 
L
S
 
T
H
 
H
G
 
G
D
 
D
R
 
S
V
 
V
T
 
D
A
 
K
L
 
V
P
 
A
E
 
D
G
 
G
F
 
F
E
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
R
S
 
S
S
 
G
N
 
N
A
 
I
P
 
-
F
 
V
A
 
A
F
 
G
I
 
I
A
 
A
D
 
N
E
 
E
K
 
S
R
 
K
K
 
K
Y
 
L
Y
 
Y
A
 
G
V
 
A
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E
V
 
V
V
 
G
H
 
L
T
 
T
P
 
E
D
 
N
G
 
G
A
 
K
K
 
V
L
 
I
I
 
L
A
 
K
N
 
N
F
 
F
V
 
L
H
 
Y
K
 
D
I
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
C
T
 
S
G
 
G
D
 
T
W
 
F
T
 
T
M
 
V
S
 
Q
A
 
N
Y
 
R
R
 
E
A
 
L
K
 
E
A
 
C
V
 
I
E
 
R
A
 
E
I
 
I
R
 
K
K
 
E
Q
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
T
K
 
S
K
 
K
V
 
V
I
 
L
C
 
V
A
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
D
 
D
S
 
S
S
 
T
V
 
V
A
 
C
A
 
T
L
 
A
L
 
L
I
 
L
H
 
N
E
 
R
A
 
A
V
 
L
G
 
N
-
 
Q
D
 
E
Q
 
Q
L
 
V
T
 
I
C
 
A
I
 
V
L
 
H
V
 
I
D
 
D
H
 
N
G
 
G
L
 
F
M
 
M
R
 
R
K
 
K
D
 
R
E
 
E
A
 
S
A
 
Q
N
 
S
V
 
V
V
 
E
A
 
E
M
 
A
F
 
L
K
 
K
E
 
K
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
Q
-
 
V
-
 
K
-
 
V
-
 
I
-
 
N
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
S
H
 
F
Y
 
Y
N
 
N
-
 
G
L
 
T
H
 
T
L
 
T
L
 
L
H
 
P
I
 
I
D
 
S
A
 
D
S
 
E
D
 
D
-
 
R
-
 
T
-
 
P
-
 
R
-
 
K
R
 
R
F
 
I
I
 
S
G
 
K
E
 
T
L
 
L
E
 
N
G
 
M
V
 
T
S
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
E
T
 
E
K
 
K
R
|
R
K
 
K
I
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
D
L
 
T
F
 
F
I
 
V
E
 
K
V
 
I
F
 
A
E
 
N
E
 
E
E
 
V
A
 
I
K
 
G
K
 
E
L
 
M
G
 
N
G
 
L
A
 
K
D
 
P
-
 
E
-
 
E
-
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
L
Y
 
R
P
 
P
D
 
D
V
 
L
I
 
I
E
 
E
S
 
S
V
 
A
S
 
S
F
 
L
T
 
V
G
 
A
-
 
S
G
 
G
P
 
K
S
 
A
V
 
E
T
 
L
I
 
I
K
 
K
S
 
T
H
 
H
H
 
H
N
 
N
V
 
D
G
 
T
G
 
E
L
 
L
P
 
I
E
 
R
R
 
K
M
 
L
N
 
R
M
 
E
Q
 
E
-
 
G
-
 
K
L
 
V
V
 
I
E
 
E
P
 
P
L
 
L
R
 
K
E
 
D
L
 
F
F
 
H
K
 
K
D
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
R
V
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
E
F
 
L
I
 
V
G
 
S
R
 
R
H
 
H
P
 
P
F
 
F
P
 
P
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
R
 
R
-
 
V
-
 
I
-
 
C
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
P
-
 
Y
-
 
I
C
 
C
P
 
K
-
 
D
-
 
F
-
 
P
-
 
E
-
 
T
-
 
N
-
 
N
-
 
I
-
 
L
-
 
K
-
 
I
-
 
V
-
 
A
-
 
D
-
 
F
G
 
S
G
 
A
I
 
S
T
 
V
R
 
K
E
 
K
K
 
P
L
 
H
E
 
T
I
 
L
L
 
L
R
 
Q
E
 
R
A
 
V
D
 
K
A
 
A
I
 
C
Y
 
T
L
 
T
D
 
E
E
 
E
I
 
D
R
 
Q
-
 
E
K
 
K
A
 
L
G
 
M
L
 
Q
Y
 
I
D
 
T
A
 
S
I
 
L
W
 
H
Q
 
S
A
 
L
F
 
N
A
 
A
V
 
F
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
I
Q
 
K
T
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
V
M
 
Q
G
 
G
D
|
D
G
 
C
R
 
R
T
 
S
Y
 
Y
E
 
S
F
 
Y
V
 
V
C
 
C
A
 
G
L
 
I
R
 
S
A
 
S
V
 
K
T
 
D
S
 
E
V
 
P
D
 
D
G
 
W
M
 
E
T
 
S
A
 
-
D
 
-
F
 
-
Y
 
-
H
 
-
Y
 
-
D
 
-
M
 
L
E
 
I
F
 
F
L
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
L
A
 
I
T
 
P
R
 
R
I
 
M
I
 
C
N
 
H
E
 
N
V
 
V
R
 
-
G
 
-
I
 
-
N
 
N
R
 
R
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

2vxoB Human gmp synthetase in complex with xmp (see paper)
36% identity, 96% coverage: 10:507/520 of query aligns to 6:527/658 of 2vxoB

query
sites
2vxoB
V
 
V
L
 
V
I
 
I
V
 
L
D
 
D
F
 
A
G
 
G
S
 
A
Q
 
Q
V
 
Y
T
 
G
Q
 
K
L
 
V
I
 
I
A
 
D
R
 
R
R
 
R
V
 
V
R
 
R
E
 
E
S
 
L
G
 
F
V
 
V
Y
 
Q
C
 
S
E
 
E
I
 
I
V
 
F
P
 
P
F
 
L
Q
 
E
S
 
T
-
 
P
-
 
A
-
 
F
-
 
A
-
 
I
A
 
K
E
 
E
E
 
Q
G
 
G
F
 
F
H
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
-
K
 
R
A
 
A
V
 
I
I
 
I
L
 
I
S
 
S
G
 
G
S
x
G
P
 
P
A
 
N
S
 
S
T
 
V
L
 
Y
D
 
A
T
 
E
G
 
D
S
 
A
P
 
P
R
 
W
A
 
F
P
 
D
S
 
P
V
 
A
I
 
I
F
 
F
D
 
T
S
 
I
G
 
G
L
 
K
P
 
P
V
 
V
F
 
L
G
 
G
I
 
I
C
|
C
Y
|
Y
G
 
G
Q
 
M
Q
 
Q
T
 
M
M
 
M
C
 
N
A
 
K
Q
 
V
L
 
F
G
 
G
G
 
G
K
 
T
V
 
V
E
 
-
S
 
-
G
 
-
H
 
H
H
 
K
R
 
K
E
 
S
F
 
D
G
 
G
R
 
V
A
 
F
F
 
N
L
 
I
E
 
S
V
 
V
E
 
D
K
 
N
D
 
T
C
 
C
P
 
S
L
 
L
F
 
F
D
 
R
G
 
G
L
 
L
W
 
Q
S
 
K
L
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
E
H
 
E
Q
 
V
V
 
V
W
 
L
M
 
L
S
 
T
H
 
H
G
 
G
D
 
D
R
 
S
V
 
V
T
 
D
A
 
K
L
 
V
P
 
A
E
 
D
G
 
G
F
 
F
E
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
R
S
 
S
S
 
G
N
 
N
A
 
I
P
 
-
F
 
V
A
 
A
F
 
G
I
 
I
A
 
A
D
 
N
E
 
E
K
 
S
R
 
K
K
 
K
Y
 
L
Y
 
Y
A
 
G
V
 
A
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E
V
 
V
V
 
G
H
 
L
T
 
T
P
 
E
D
 
N
G
 
G
A
 
K
K
 
V
L
 
I
I
 
L
A
 
K
N
 
N
F
 
F
V
 
L
H
 
Y
K
 
D
I
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
C
T
 
S
G
 
G
D
 
T
W
 
F
T
 
T
M
 
V
S
 
Q
A
 
N
Y
 
R
R
 
E
A
 
L
K
 
E
A
 
C
V
 
I
E
 
R
A
 
E
I
 
I
R
 
K
K
 
E
Q
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
T
K
 
S
K
 
K
V
 
V
I
 
L
C
 
V
A
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
D
|
D
S
 
S
S
 
T
V
 
V
A
 
C
A
 
T
L
 
A
L
 
L
I
 
L
H
 
N
E
 
R
A
 
A
V
 
L
G
 
N
-
 
Q
D
 
E
Q
 
Q
L
 
V
T
 
I
C
 
A
I
 
V
L
 
H
V
 
I
D
 
D
H
 
N
G
 
G
L
 
F
M
 
M
R
 
R
K
 
K
D
 
R
E
 
E
A
 
S
A
 
Q
N
 
S
V
 
V
V
 
E
A
 
E
M
 
A
F
 
L
K
 
K
E
 
K
H
 
-
Y
 
L
N
 
G
L
 
I
H
 
Q
L
 
V
L
 
K
H
 
V
I
 
I
D
 
N
A
 
A
S
 
A
D
 
H
R
 
S
F
 
F
I
 
Y
G
 
N
-
 
G
-
 
T
-
 
T
-
 
T
-
 
L
-
 
P
-
 
R
-
 
I
-
 
S
-
 
K
E
 
T
L
 
L
E
 
N
G
 
M
V
 
T
S
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
E
T
 
E
K
 
K
R
|
R
K
 
K
I
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
D
L
 
T
F
 
F
I
 
V
E
 
K
V
 
I
F
 
A
E
 
N
E
 
E
E
 
V
A
 
I
K
 
G
K
 
E
L
 
M
G
 
N
G
 
L
A
 
K
D
 
P
-
 
E
-
 
E
-
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
L
Y
 
R
P
 
P
D
 
D
V
 
L
I
 
I
E
 
E
S
 
S
V
 
A
S
 
S
F
 
L
T
 
V
G
 
A
-
 
S
G
|
G
P
x
K
S
 
A
V
 
E
T
 
L
I
 
I
K
 
K
S
 
T
H
 
H
H
 
H
N
 
N
V
 
D
G
 
T
G
 
E
L
 
L
P
 
I
E
 
R
R
 
K
M
 
L
N
 
R
M
 
E
Q
 
E
-
 
G
-
 
K
L
 
V
V
 
I
E
 
E
P
 
P
L
 
L
R
 
K
E
 
D
L
 
F
F
 
H
K
|
K
D
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
R
V
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
E
F
 
L
I
 
V
G
 
S
R
 
R
H
 
H
P
 
P
F
 
F
P
|
P
G
|
G
P
|
P
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
R
 
R
-
 
V
-
 
I
-
 
C
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
P
-
 
Y
-
 
I
C
 
C
P
 
K
-
 
D
-
 
F
-
 
P
-
 
E
-
 
T
-
 
N
-
 
N
-
 
I
-
 
L
-
 
K
-
 
I
-
 
V
-
 
A
-
 
D
-
 
F
G
 
S
G
 
A
I
 
S
T
 
V
R
 
K
E
 
K
K
 
P
L
 
H
E
 
T
I
 
L
L
 
L
R
 
Q
E
 
R
A
 
V
D
 
K
A
 
A
I
 
C
Y
 
T
L
 
T
D
 
E
E
 
E
I
 
D
R
 
Q
-
 
E
K
 
K
A
 
L
G
 
M
L
 
Q
Y
 
I
D
 
T
A
 
S
I
 
L
W
 
H
Q
 
S
A
 
L
F
 
N
A
 
A
V
 
F
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
I
Q
 
K
T
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
V
M
 
Q
G
 
G
D
 
D
G
 
C
R
|
R
T
 
S
Y
 
Y
E
 
S
F
 
Y
V
 
V
C
 
C
A
 
G
L
 
I
R
 
S
A
 
S
V
 
K
T
 
D
S
 
E
V
 
P
D
 
D
G
 
W
M
 
E
T
 
S
A
 
-
D
 
-
F
 
-
Y
 
-
H
 
-
Y
 
-
D
 
-
M
 
L
E
 
I
F
 
F
L
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
L
A
 
I
T
 
P
R
 
R
I
 
M
I
 
C
N
 
H
E
 
N
V
 
V
R
 
-
G
 
-
I
 
-
N
 
N
R
 
R
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

7yc6A Crystal structure of d110p mutant of gatase subunit of methanocaldococcus jannaschii gmp synthetase
34% identity, 36% coverage: 10:198/520 of query aligns to 2:179/183 of 7yc6A

query
sites
7yc6A
V
 
I
L
 
V
I
 
I
V
 
L
D
 
D
F
 
N
G
 
G
S
 
G
Q
 
Q
V
 
Y
T
 
V
Q
 
H
L
 
R
I
 
I
A
 
H
R
 
R
R
 
S
V
 
L
R
 
K
E
 
Y
S
 
I
G
 
G
V
 
V
Y
 
S
C
 
S
E
 
K
I
 
I
V
 
V
P
 
P
F
 
N
Q
 
T
S
 
T
A
 
P
E
 
L
E
 
E
G
 
E
F
 
I
H
 
E
R
 
S
L
 
N
K
 
K
P
 
E
-
 
V
K
 
K
A
 
G
V
 
I
I
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
G
P
 
P
A
 
D
S
 
I
T
 
E
L
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
K
S
 
A
P
 
K
R
 
N
A
 
C
P
 
I
S
 
D
V
 
I
I
 
A
F
 
L
D
 
N
S
 
A
G
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
I
F
 
L
G
 
G
I
 
I
C
|
C
Y
 
L
G
 
G
Q
 
H
Q
 
Q
T
 
L
M
 
I
C
 
A
A
 
L
Q
 
A
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
K
 
-
V
 
-
E
 
-
S
 
-
G
 
-
H
 
-
H
 
-
R
 
-
E
 
E
F
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
A
F
 
A
L
 
L
E
 
T
-
 
K
-
 
V
-
 
Y
V
 
V
E
x
D
K
 
K
D
 
E
C
 
N
P
 
P
L
 
L
F
 
F
D
 
K
G
 
-
L
 
-
W
 
-
S
 
N
L
 
V
G
 
P
S
 
R
R
 
E
H
 
F
Q
 
N
V
 
A
W
 
W
M
 
A
S
 
S
H
 
H
G
 
K
D
 
D
R
x
E
V
 
V
T
 
K
A
 
K
L
 
V
P
 
P
E
 
E
G
 
G
F
 
F
E
 
E
V
 
I
V
 
L
A
 
A
T
x
H
S
 
S
S
 
D
N
 
I
A
x
C
P
 
Q
F
 
V
A
 
E
F
 
A
I
 
M
A
 
K
D
 
H
E
 
K
K
 
T
R
 
K
K
 
P
Y
 
I
Y
 
Y
A
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
 
E
V
 
V
V
 
A
H
 
H
T
 
T
P
 
E
D
 
Y
G
 
G
A
 
N
K
 
E
L
 
I
I
 
L
A
 
K
N
 
N
F
 
F
V
 
C
H
 
-
K
 
K
I
 
V
A
 
C
G
 
G

P00903 Aminodeoxychorismate synthase component 2; ADC synthase; ADCS; 4-amino-4-deoxychorismate synthase component 2; Aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase component; EC 2.6.1.85 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
28% identity, 28% coverage: 49:195/520 of query aligns to 42:187/187 of P00903

query
sites
P00903
L
 
L
K
 
K
P
 
P
K
 
Q
A
 
K
V
 
I
I
 
V
L
 
I
S
 
S
G
 
P
S
 
G
P
 
P
A
 
C
S
 
T
T
 
P
L
 
D
D
 
E
T
 
A
G
 
G
S
 
I
P
 
S
R
 
L
A
 
D
P
 
V
S
 
I
V
 
R
I
 
H
F
 
Y
D
 
A
S
 
G
G
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
I
F
 
L
G
 
G
I
 
V
C
|
C
Y
 
L
G
 
G
Q
 
H
Q
 
Q
T
 
A
M
 
M
C
 
A
A
 
Q
Q
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
V
E
 
V
S
 
R
G
 
A
H
 
A
H
 
K
R
 
V
E
 
M
F
 
H
G
 
G
R
 
K
A
 
T
F
 
S
L
 
P
E
 
I
V
 
T
E
 
H
K
 
N
D
 
G
C
 
E
P
 
G
L
 
V
F
 
F
D
 
R
G
 
G
L
 
L
W
 
A
S
 
N
-
 
P
-
 
L
L
 
T
G
 
V
S
 
T
R
 
R
H
 
Y
Q
 
H
V
 
S
W
 
L
M
 
V
S
 
V
H
 
E
G
 
P
D
 
D
R
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
S
L
 
L
P
 
P
E
 
A
G
 
C
F
 
F
E
 
D
V
 
V
V
 
T
A
 
A
T
 
W
S
 
S
S
 
E
N
 
T
A
 
R
P
 
E
F
 
I
A
 
M
F
 
G
I
 
I
A
 
R
D
 
H
E
 
R
K
 
Q
R
 
W
K
 
D
Y
 
L
Y
 
E
A
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E
V
 
S
V
 
I
H
 
L
T
 
S
P
 
E
D
 
Q
G
 
G
A
 
H
K
 
Q
L
 
L
I
 
L
A
 
A
N
 
N
F
 
F
V
 
L
H
 
H
K
 
R

8hx8A Crystal structure of 4-amino-4-deoxychorismate synthase from streptomyces venezuelae co-crystallized with chorismate (see paper)
28% identity, 36% coverage: 6:192/520 of query aligns to 3:187/673 of 8hx8A

query
sites
8hx8A
H
 
H
P
 
M
D
 
R
T
 
T
V
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
D
D
 
N
F
 
Y
G
 
D
S
 
S
Q
 
F
V
 
T
T
 
H
Q
 
N
L
 
L
I
 
F
A
 
Q
R
 
Y
R
 
I
V
 
G
R
 
E
E
 
A
S
 
T
G
 
G
V
 
Q
Y
 
P
C
 
P
E
 
V
I
 
V
V
 
V
P
 
P
F
 
N
Q
 
D
S
 
A
A
 
D
E
 
W
E
 
S
G
 
R
F
 
L
H
 
P
R
 
V
L
 
E
K
 
D
P
 
F
K
 
D
A
 
A
V
 
I
I
 
V
L
 
V
S
 
S
-
 
P
-
 
G
-
 
P
G
 
G
S
 
S
P
 
P
A
 
D
S
 
R
T
 
E
L
 
R
D
 
D
T
 
F
G
 
G
S
 
I
P
 
S
R
 
R
A
 
-
P
 
-
S
 
R
V
 
A
I
 
I
F
 
T
D
 
D
S
 
S
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
L
G
 
G
I
 
V
C
 
C
Y
 
L
G
 
G
Q
 
H
Q
 
Q
T
 
G
M
 
I
C
 
A
A
 
Q
Q
 
L
L
 
F
G
 
G
G
 
G
K
 
T
V
 
V
E
 
G
S
 
L
G
 
A
H
 
P
H
 
E
R
 
P
E
 
M
F
 
H
G
 
G
R
 
R
A
 
V
F
 
S
L
 
E
E
 
V
V
 
R
E
 
H
K
 
T
D
 
G
C
 
E
P
 
D
L
 
V
F
 
F
D
 
R
G
 
G
L
 
L
W
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
P
S
 
S
R
 
P
H
 
F
Q
 
T
V
 
A
W
 
V
M
 
R
S
 
Y
H
 
H
G
 
S
D
 
L
R
 
A
V
 
A
T
 
T
A
 
D
L
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
E
F
 
L
E
 
E
V
 
P
V
 
L
A
 
A
T
 
W
S
 
S
S
 
D
N
 
D
A
 
G
P
 
V
F
 
V
A
 
M
F
 
G
I
 
L
A
 
R
D
 
H
E
 
R
K
 
E
R
 
K
K
 
P
Y
 
L
Y
 
W
A
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
 
H
P
 
P
E
 
E
V
 
S
V
x
I
H
 
G
T
x
S
P
 
D
D
 
F
G
 
G
A
 
R
K
 
E
L
 
I
I
 
M
A
 
A
N
 
N
F
 
F

Sites not aligning to the query:

Q42565 Anthranilate synthase beta subunit 1, chloroplastic; Anthranilate synthase component 2-1; Anthranilate synthase, glutamine amidotransferase component 2-1; Protein TRYPTOPHAN BIOSYNTHESIS 4; Protein WEAK ETHYLENE INSENSITIVE 7; EC 4.1.3.27 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
24% identity, 35% coverage: 10:193/520 of query aligns to 75:264/276 of Q42565

query
sites
Q42565
V
 
I
L
 
I
I
 
V
V
 
I
D
 
D
F
 
N
G
 
Y
S
 
D
Q
 
S
V
 
F
T
 
T
Q
 
Y
L
 
N
I
 
L
A
 
C
R
 
Q
R
 
Y
V
 
M
R
 
G
E
 
E
S
 
L
G
 
G
V
 
C
Y
 
H
C
 
F
E
 
E
I
 
V
V
 
-
P
 
-
F
 
Y
Q
 
R
S
 
N
A
 
D
E
 
E
E
 
L
G
 
T
F
 
V
H
 
E
R
 
E
L
 
L
K
 
K
-
 
K
-
 
K
-
 
N
P
 
P
K
 
R
A
 
G
V
 
V
I
 
L
L
 
I
S
 
S
G
 
P
S
 
G
P
 
P
A
 
G
S
 
T
T
 
P
L
 
Q
D
 
D
T
 
S
G
 
G
S
 
I
P
 
S
R
 
L
A
 
Q
P
 
T
S
 
V
V
 
L
I
 
E
F
 
L
D
 
G
S
 
P
G
 
L
L
 
V
P
 
P
V
 
L
F
 
F
G
|
G
I
 
V
C
 
C
Y
 
M
G
 
G
Q
 
L
Q
 
Q
T
 
C
M
 
I
C
 
G
A
 
E
Q
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
I
E
 
V
S
 
R
G
 
S
-
 
P
-
 
F
-
 
G
-
 
V
H
 
M
H
 
H
R
x
G
E
 
K
F
 
S
G
 
S
R
 
M
A
 
V
F
 
H
L
 
Y
E
 
D
V
 
E
E
 
K
K
 
G
D
 
E
C
 
E
P
 
G
L
 
L
F
 
F
D
 
S
G
 
G
L
 
L
-
 
S
-
 
N
-
 
P
W
 
F
S
 
I
L
 
V
G
 
G
S
 
R
R
 
Y
H
 
H
Q
 
S
V
 
L
W
 
V
M
 
I
S
 
-
H
 
-
G
 
-
D
 
E
R
 
K
V
 
D
T
 
T
A
 
F
L
 
P
P
 
S
E
 
D
G
 
E
F
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
T
A
 
A
T
 
W
S
 
T
S
 
E
N
 
D
A
 
G
P
 
-
F
 
-
A
 
L
F
 
V
I
 
M
A
 
A
D
 
A
E
 
R
K
 
H
R
 
R
K
 
K
Y
 
Y
-
 
K
-
 
H
-
 
I
Y
 
Q
A
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
 
H
P
 
P
E
 
E
V
 
S
V
 
I
H
 
I
T
 
T
P
 
T
D
 
E
G
 
G
A
 
K
K
 
T
L
 
I
I
 
V
A
 
R
N
 
N
F
 
F
V
 
I

1ce8B Carbamoyl phosphate synthetase from escherichis coli with complexed with the allosteric ligand imp (see paper)
26% identity, 37% coverage: 7:196/520 of query aligns to 190:373/379 of 1ce8B

query
sites
1ce8B
P
 
P
D
 
F
T
 
H
V
 
V
L
 
V
I
 
A
V
 
Y
D
 
D
F
 
F
G
 
G
S
 
A
Q
 
K
V
 
-
T
 
-
Q
 
R
L
 
N
I
 
I
A
 
L
R
 
R
R
 
M
V
 
L
R
 
V
E
 
D
S
 
R
G
 
G
V
 
C
Y
 
R
C
 
L
E
 
T
I
 
I
V
 
V
P
 
P
F
 
A
Q
 
Q
S
 
T
A
 
S
E
 
A
E
 
E
G
 
D
F
 
V
H
 
L
R
 
K
L
 
M
K
 
N
P
 
P
K
 
D
A
 
G
V
 
I
I
 
F
L
 
L
S
 
S
G
 
N
S
 
G
P
 
P
A
 
G
S
 
D
T
 
P
L
 
A
D
 
P
T
 
C
G
 
D
-
 
Y
S
 
A
P
 
I
R
 
T
A
 
A
P
 
I
S
 
Q
V
 
K
I
 
F
F
 
L
D
 
E
S
 
T
G
 
D
L
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
I
C
|
C
Y
 
L
G
 
G
Q
 
H
Q
 
Q
T
 
L
M
 
L
C
 
A
A
 
L
Q
 
A
L
 
S
G
 
G
G
 
A
-
 
K
-
 
T
-
 
V
K
 
K
V
 
M
E
 
K
S
 
F
G
 
G
H
 
H
H
 
H
R
 
G
E
 
G
F
 
-
G
 
N
R
 
H
A
 
P
F
 
V
L
 
K
E
 
D
V
 
V
E
 
E
K
 
K
D
 
N
C
 
V
P
 
V
L
 
M
F
 
I
D
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
-
H
 
-
Q
 
-
V
 
T
W
 
A
M
 
Q
S
 
N
H
 
H
G
 
G
D
 
F
R
 
A
V
 
V
-
 
D
-
 
E
T
 
A
A
 
T
L
 
L
P
 
P
E
 
A
G
 
N
F
 
L
E
 
R
V
 
V
V
 
T
A
 
H
T
 
K
S
 
S
S
 
L
-
 
F
N
 
D
A
 
G
P
 
T
F
 
L
A
 
Q
F
 
G
I
 
I
A
 
H
D
 
R
E
 
T
K
 
D
R
 
K
K
 
P
Y
 
A
Y
 
F
A
 
S
V
 
F
Q
 
Q
F
 
G
H
|
H
P
 
P
E
|
E
V
 
A
V
 
S
H
 
P
T
 
G
P
 
P
-
 
H
D
 
D
G
 
A
A
 
A
K
 
P
L
 
L
I
 
F
A
 
D
N
 
H
F
 
F
V
 
I
H
 
E
K
 
L
I
 
I

Sites not aligning to the query:

P0A6F1 Carbamoyl phosphate synthase small chain; Carbamoyl phosphate synthetase glutamine chain; EC 6.3.5.5 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
26% identity, 37% coverage: 7:196/520 of query aligns to 191:374/382 of P0A6F1

query
sites
P0A6F1
P
 
P
D
 
F
T
 
H
V
 
V
L
 
V
I
 
A
V
 
Y
D
 
D
F
 
F
G
 
G
S
 
A
Q
 
K
V
 
-
T
 
-
Q
 
R
L
 
N
I
 
I
A
 
L
R
 
R
R
 
M
V
 
L
R
 
V
E
 
D
S
 
R
G
 
G
V
 
C
Y
 
R
C
 
L
E
 
T
I
 
I
V
 
V
P
 
P
F
 
A
Q
 
Q
S
 
T
A
 
S
E
 
A
E
 
E
G
 
D
F
 
V
H
 
L
R
 
K
L
 
M
K
 
N
P
 
P
K
 
D
A
 
G
V
 
I
I
 
F
L
 
L
S
 
S
G
 
N
S
x
G
P
 
P
A
x
G
S
 
D
T
 
P
L
 
A
D
 
P
T
 
C
G
 
D
-
 
Y
S
 
A
P
 
I
R
 
T
A
 
A
P
 
I
S
 
Q
V
 
K
I
 
F
F
 
L
D
 
E
S
 
T
G
 
D
L
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
I
C
 
C
Y
x
L
G
 
G
Q
 
H
Q
|
Q
T
 
L
M
 
L
C
 
A
A
 
L
Q
 
A
L
 
S
G
 
G
G
 
A
-
 
K
-
 
T
-
 
V
K
 
K
V
 
M
E
 
K
S
 
F
G
 
G
H
 
H
H
 
H
R
 
G
E
 
G
F
 
-
G
 
N
R
 
H
A
 
P
F
 
V
L
 
K
E
 
D
V
 
V
E
 
E
K
 
K
D
 
N
C
 
V
P
 
V
L
 
M
F
 
I
D
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
-
H
 
-
Q
 
-
V
 
T
W
 
A
M
 
Q
S
x
N
H
 
H
G
|
G
D
x
F
R
 
A
V
 
V
-
 
D
-
 
E
T
 
A
A
 
T
L
 
L
P
 
P
E
 
A
G
 
N
F
 
L
E
 
R
V
 
V
V
 
T
A
 
H
T
 
K
S
 
S
S
 
L
-
 
F
N
 
D
A
 
G
P
 
T
F
 
L
A
 
Q
F
 
G
I
 
I
A
 
H
D
 
R
E
 
T
K
 
D
R
 
K
K
 
P
Y
 
A
Y
 
F
A
 
S
V
 
F
Q
 
Q
F
 
G
H
 
H
P
 
P
E
 
E
V
 
A
V
 
S
H
 
P
T
 
G
P
 
P
-
 
H
D
 
D
G
 
A
A
 
A
K
 
P
L
 
L
I
 
F
A
 
D
N
 
H
F
 
F
V
 
I
H
 
E
K
 
L
I
 
I

Sites not aligning to the query:

P00900 Anthranilate synthase component 2; AS; ASII; Anthranilate synthase, GATase component; Anthranilate synthase, glutamine amidotransferase component; EC 4.1.3.27 from Serratia marcescens (see 3 papers)
24% identity, 35% coverage: 10:189/520 of query aligns to 4:183/193 of P00900

query
sites
P00900
V
 
I
L
 
L
I
 
L
V
 
L
D
 
D
F
 
N
G
 
V
S
 
D
Q
 
S
V
 
F
T
 
T
Q
 
Y
L
 
N
I
 
L
A
 
V
R
 
D
R
 
Q
V
 
L
R
 
R
E
 
A
S
 
S
G
 
G
-
 
H
-
 
Q
-
 
V
-
 
V
V
 
I
Y
 
Y
C
 
R
E
 
N
I
 
Q
V
 
I
P
 
G
F
 
A
Q
 
E
S
 
V
A
 
I
E
 
I
E
 
E
G
 
R
F
 
L
H
 
Q
R
 
H
L
 
M
K
 
E
P
 
Q
K
 
P
A
 
V
V
 
L
I
 
M
L
 
L
S
 
S
G
 
P
S
 
G
P
 
P
A
 
G
S
 
T
T
 
P
L
 
S
D
 
E
T
 
A
G
 
G
S
 
C
P
 
-
R
 
-
A
 
M
P
 
P
S
 
E
V
 
L
I
 
L
-
 
Q
-
 
R
F
 
L
D
 
R
S
 
G
G
 
Q
L
 
L
P
 
P
V
 
I
F
 
I
G
 
G
I
 
I
C
|
C
Y
 
L
G
 
G
Q
 
H
Q
 
Q
T
 
A
M
 
I
C
 
V
A
 
E
Q
 
A
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
K
 
Q
V
 
V
E
 
G
S
 
Q
G
 
A
H
 
G
H
 
E
R
 
I
E
 
L
F
 
H
G
 
G
R
 
K
A
 
A
F
 
S
L
 
A
E
 
I
V
 
A
E
 
H
K
 
D
D
 
G
C
 
E
P
 
G
L
 
M
F
 
F
D
 
A
G
 
G
L
 
M
W
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
A
S
 
N
R
 
P
H
 
L
Q
 
P
V
 
V
W
 
A
M
 
R
S
 
Y
H
 
H
G
 
S
D
 
L
R
 
V
V
 
G
T
 
S
A
 
N
L
 
I
P
 
P
E
 
A
G
 
D
F
 
L
E
 
T
V
 
V
V
 
N
A
 
A
T
 
R
S
 
S
S
 
G
N
 
E
A
 
M
P
 
V
F
 
M
A
 
A
F
 
-
I
 
V
A
 
R
D
 
D
E
 
D
K
 
R
R
 
R
K
 
R
Y
 
V
Y
 
C
A
 
G
V
 
F
Q
 
Q
F
 
F
H
 
H
P
 
P
E
 
E
V
 
S
V
 
I
H
 
L
T
 
T
P
 
T
D
 
H
G
 
G
A
 
A
K
 
R
L
 
L
I
 
L

Sites not aligning to the query:

Q09794 Multifunctional protein ura1; Pyrimidine-specific carbamoyl phosphate synthase-aspartate carbamoyl transferase; CPSase-ATCase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
25% identity, 35% coverage: 10:189/520 of query aligns to 265:435/2244 of Q09794

query
sites
Q09794
V
 
I
L
 
L
I
 
V
V
 
I
D
 
D
F
 
V
G
 
G
S
 
M
Q
 
K
V
 
Y
T
 
N
Q
 
Q
L
 
I
I
 
-
A
 
-
R
 
R
R
 
C
V
 
F
R
 
L
E
 
N
S
 
R
G
 
G
V
 
V
Y
 
E
C
 
L
E
 
L
I
 
V
V
 
V
P
 
P
F
 
W
Q
 
-
S
 
-
A
 
-
E
 
D
E
 
Y
G
 
D
F
 
F
H
 
T
R
 
K
L
 
E
K
 
T
P
 
Y
K
 
D
A
 
G
V
 
L
I
 
F
L
 
I
S
 
S
G
 
N
S
 
G
P
 
P
A
 
G
-
 
D
-
 
P
S
 
S
T
 
L
L
 
M
D
 
D
T
 
L
G
 
V
S
 
V
P
 
D
R
 
R
A
 
V
P
 
K
S
 
R
V
 
V
I
 
L
F
 
E
D
 
S
S
 
K
G
 
T
L
 
V
P
 
P
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
I
C
 
C
Y
 
F
G
 
G
Q
 
H
Q
 
Q
T
 
I
M
 
M
C
 
A
A
 
R
Q
 
A
L
 
A
G
 
G
G
 
A
K
 
-
V
 
-
E
 
-
S
 
S
G
 
T
H
 
T
H
 
K
R
 
M
E
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
N
A
 
R
F
 
G
L
 
H
E
 
N
V
 
I
E
 
P
K
 
C
D
 
T
C
 
C
P
 
-
L
 
M
F
 
I
D
 
S
G
 
G
L
 
R
W
 
C
S
 
Y
L
 
I
G
 
T
S
 
S
R
 
Q
H
 
N
Q
 
-
V
 
-
W
 
-
M
 
-
S
 
-
H
 
H
G
 
G
D
 
Y
R
 
A
V
 
V
T
 
D
A
 
A
-
 
S
-
 
S
L
 
L
P
 
S
E
 
N
G
 
G
F
 
W
-
 
K
E
 
E
V
 
L
V
 
F
A
 
V
T
 
N
S
 
A
S
 
N
N
 
D
A
 
G
P
 
S
F
 
N
A
 
E
F
 
G
I
 
I
A
 
Y
D
 
N
E
 
T
K
 
E
R
 
Y
K
 
P
Y
 
F
Y
 
F
A
 
S
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
 
H
P
 
P
E
 
E
V
 
S
V
 
T
H
 
P
T
 
G
P
 
P
D
 
R
G
 
D
A
 
T
K
 
E
L
 
F
I
 
L

Sites not aligning to the query:

1i7qB Anthranilate synthase from s. Marcescens (see paper)
24% identity, 35% coverage: 10:189/520 of query aligns to 3:182/192 of 1i7qB

query
sites
1i7qB
V
 
I
L
 
L
I
 
L
V
 
L
D
 
D
F
 
N
G
 
V
S
 
D
Q
 
S
V
 
F
T
 
T
Q
 
Y
L
 
N
I
 
L
A
 
V
R
 
D
R
 
Q
V
 
L
R
 
R
E
 
A
S
 
S
G
 
G
-
 
H
-
 
Q
-
 
V
-
 
V
V
 
I
Y
 
Y
C
 
R
E
 
N
I
 
Q
V
 
I
P
 
G
F
 
A
Q
 
E
S
 
V
A
 
I
E
 
I
E
 
E
G
 
R
F
 
L
H
 
Q
R
 
H
L
 
M
K
 
E
P
 
Q
K
 
P
A
 
V
V
 
L
I
 
M
L
 
L
S
 
S
G
x
P
S
x
G
P
 
P
A
x
G
S
 
T
T
 
P
L
 
S
D
 
E
T
 
A
G
 
G
S
 
C
P
 
-
R
 
-
A
 
M
P
 
P
S
 
E
V
 
L
I
 
L
-
 
Q
-
 
R
F
 
L
D
 
R
S
 
G
G
 
Q
L
 
L
P
 
P
V
 
I
F
 
I
G
 
G
I
 
I
C
|
C
Y
x
L
G
 
G
Q
 
H
Q
|
Q
T
 
A
M
 
I
C
 
V
A
 
E
Q
 
A
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
K
 
Q
V
 
V
E
 
G
S
 
Q
G
 
A
H
 
G
H
 
E
R
 
I
E
 
L
F
 
H
G
 
G
R
 
K
A
 
A
F
 
S
L
 
A
E
 
I
V
 
A
E
 
H
K
 
D
D
 
G
C
 
E
P
 
G
L
 
M
F
 
F
D
 
A
G
 
G
L
 
M
W
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
A
S
 
N
R
 
P
H
 
L
Q
 
P
V
 
V
W
 
A
M
 
R
S
 
Y
H
|
H
G
x
S
D
x
L
R
 
V
V
 
G
T
 
S
A
 
N
L
 
I
P
 
P
E
 
A
G
 
D
F
 
L
E
 
T
V
 
V
V
 
N
A
 
A
T
 
R
S
 
F
S
 
G
N
 
E
A
 
M
P
 
V
F
 
M
A
 
A
F
 
-
I
 
V
A
 
R
D
 
D
E
 
D
K
 
R
R
 
R
K
 
R
Y
 
V
Y
 
C
A
 
G
V
 
F
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E
V
 
S
V
 
I
H
 
L
T
 
T
P
 
T
D
 
H
G
 
G
A
 
A
K
 
R
L
 
L
I
 
L

1c3oB Crystal structure of the carbamoyl phosphate synthetase: small subunit mutant c269s with bound glutamine (see paper)
26% identity, 37% coverage: 7:196/520 of query aligns to 190:373/379 of 1c3oB

query
sites
1c3oB
P
 
P
D
 
F
T
 
H
V
 
V
L
 
V
I
 
A
V
 
Y
D
 
D
F
 
F
G
 
G
S
 
A
Q
x
K
V
 
-
T
 
-
Q
 
R
L
 
N
I
 
I
A
 
L
R
 
R
R
 
M
V
 
L
R
 
V
E
 
D
S
 
R
G
 
G
V
 
C
Y
 
R
C
 
L
E
 
T
I
 
I
V
 
V
P
 
P
F
 
A
Q
 
Q
S
 
T
A
 
S
E
 
A
E
 
E
G
 
D
F
 
V
H
 
L
R
 
K
L
 
M
K
 
N
P
 
P
K
 
D
A
 
G
V
 
I
I
 
F
L
 
L
S
 
S
G
x
N
S
x
G
P
 
P
A
x
G
S
 
D
T
 
P
L
 
A
D
 
P
T
 
C
G
 
D
-
 
Y
S
 
A
P
 
I
R
 
T
A
 
A
P
 
I
S
 
Q
V
 
K
I
 
F
F
 
L
D
 
E
S
 
T
G
 
D
L
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
I
C
x
S
Y
x
L
G
 
G
Q
 
H
Q
 
Q
T
 
L
M
 
L
C
 
A
A
 
L
Q
 
A
L
 
S
G
 
G
G
 
A
-
 
K
-
 
T
-
 
V
K
 
K
V
 
M
E
 
K
S
 
F
G
 
G
H
 
H
H
 
H
R
 
G
E
 
G
F
 
-
G
 
N
R
 
H
A
 
P
F
 
V
L
 
K
E
 
D
V
 
V
E
 
E
K
 
K
D
 
N
C
 
V
P
 
V
L
 
M
F
 
I
D
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
-
H
 
-
Q
 
-
V
 
T
W
 
A
M
 
Q
S
x
N
H
|
H
G
|
G
D
x
F
R
 
A
V
 
V
-
 
D
-
 
E
T
 
A
A
 
T
L
 
L
P
 
P
E
 
A
G
 
N
F
 
L
E
 
R
V
 
V
V
 
T
A
 
H
T
 
K
S
 
S
S
 
L
-
 
F
N
 
D
A
 
G
P
 
T
F
 
L
A
 
Q
F
 
G
I
 
I
A
 
H
D
 
R
E
 
T
K
 
D
R
 
K
K
 
P
Y
 
A
Y
 
F
A
 
S
V
 
F
Q
 
Q
F
 
G
H
|
H
P
 
P
E
|
E
V
 
A
V
 
S
H
 
P
T
 
G
P
 
P
-
 
H
D
 
D
G
 
A
A
 
A
K
 
P
L
 
L
I
 
F
A
 
D
N
 
H
F
 
F
V
 
I
H
 
E
K
 
L
I
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>SMc00394 FitnessBrowser__Smeli:SMc00394
MTQTAHPDTVLIVDFGSQVTQLIARRVRESGVYCEIVPFQSAEEGFHRLKPKAVILSGSP
ASTLDTGSPRAPSVIFDSGLPVFGICYGQQTMCAQLGGKVESGHHREFGRAFLEVEKDCP
LFDGLWSLGSRHQVWMSHGDRVTALPEGFEVVATSSNAPFAFIADEKRKYYAVQFHPEVV
HTPDGAKLIANFVHKIAGITGDWTMSAYRAKAVEAIRKQVGDKKVICALSGGVDSSVAAL
LIHEAVGDQLTCILVDHGLMRKDEAANVVAMFKEHYNLHLLHIDASDRFIGELEGVSDPE
TKRKIIGRLFIEVFEEEAKKLGGADFLAQGTLYPDVIESVSFTGGPSVTIKSHHNVGGLP
ERMNMQLVEPLRELFKDEVRVLGRELGLPESFIGRHPFPGPGLAIRCPGGITREKLEILR
EADAIYLDEIRKAGLYDAIWQAFAVLLPVQTVGVMGDGRTYEFVCALRAVTSVDGMTADF
YHYDMEFLGRAATRIINEVRGINRVVYDVTSKPPGTIEWE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory