SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMc00508 FitnessBrowser__Smeli:SMc00508 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P12047 Adenylosuccinate lyase; ASL; Adenylosuccinase; ASase; Glutamyl--tRNA ligase regulatory factor; EC 4.3.2.2 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
53% identity, 99% coverage: 1:431/435 of query aligns to 1:428/431 of P12047

query
sites
P12047
M
 
M
I
 
I
S
 
E
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
P
 
P
E
 
E
M
 
M
V
 
S
A
 
A
I
 
I
W
 
W
S
 
T
P
 
D
E
 
E
T
 
N
K
 
R
F
 
F
R
 
Q
I
 
A
W
 
W
F
 
L
E
 
E
I
 
V
E
 
E
A
 
I
H
 
L
A
 
A
C
 
C
D
 
E
A
 
A
L
 
W
A
 
A
E
 
E
I
 
L
G
 
G
V
 
V
I
 
I
P
 
P
K
 
K
E
 
E
A
 
D
A
 
V
K
 
K
T
 
V
I
 
M
W
 
R
E
 
E
K
 
N
G
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
A
T
 
S
F
 
F
D
 
D
V
 
I
A
 
N
R
 
R
I
 
I
D
 
L
E
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
K
V
 
D
T
 
T
K
 
R
H
 
H
D
 
D
V
 
V
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
T
T
 
R
H
 
A
L
 
V
A
 
S
E
 
E
F
 
S
V
 
L
G
 
G
P
 
E
D
 
E
S
 
R
R
 
K
F
 
W
I
 
V
H
|
H
Q
 
Y
G
 
G
M
 
L
T
 
T
S
 
S
S
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
C
 
A
F
 
L
N
 
S
I
 
Y
Q
 
L
L
 
L
V
 
K
R
 
Q
A
 
A
T
 
N
D
 
D
L
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
E
K
 
R
L
 
F
L
 
V
E
 
D
A
 
I
L
 
I
K
 
K
R
 
E
R
 
K
A
 
A
F
 
K
E
 
E
H
 
H
K
 
K
D
 
Y
T
 
T
V
 
V
T
 
M
I
 
M
G
 
G
R
 
R
S
 
T
H
|
H
G
 
G
I
 
V
H
 
H
A
 
A
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
T
F
 
F
G
 
G
V
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
W
Y
 
H
A
 
E
E
 
E
F
 
M
D
 
K
R
 
R
C
 
N
K
 
L
Q
 
E
R
 
R
L
 
F
L
 
K
A
 
Q
A
 
A
R
 
K
E
 
A
E
 
G
I
 
I
A
 
E
T
 
V
C
 
G
A
 
K
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
A
 
A
N
 
N
I
 
I
D
 
D
P
 
P
R
 
F
V
 
V
E
 
E
E
 
Q
H
 
Y
V
 
V
A
 
C
E
 
E
A
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
K
P
 
A
E
 
A
P
 
P
V
 
I
S
 
S
T
 
T
Q
|
Q
V
 
T
I
 
L
P
 
Q
R
 
R
D
 
D
R
 
R
H
 
H
A
 
A
M
 
D
Y
 
Y
F
 
M
A
 
A
T
 
T
L
 
L
G
 
A
V
 
L
V
 
I
A
 
A
S
 
T
S
 
S
I
 
I
E
 
E
R
 
K
L
 
F
A
 
A
T
 
V
E
 
E
I
 
I
R
 
R
H
 
G
L
 
L
Q
 
Q
R
 
K
T
 
S
E
 
E
V
 
T
L
 
R
E
 
E
A
 
V
E
 
E
E
 
E
Y
 
F
F
 
F
S
 
A
P
 
K
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
S
 
S
S
 
S
A
 
A
M
 
M
P
 
P
H
 
H
K
 
K
R
 
R
N
|
N
P
 
P
V
 
I
L
 
G
T
 
S
E
 
E
N
 
N
L
 
M
T
 
T
G
 
G
L
 
M
S
 
A
R
 
R
M
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
G
F
 
Y
V
 
M
V
 
M
P
 
T
A
 
A
M
 
Y
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
P
L
 
L
W
 
W
H
 
H
E
 
E
R
|
R
D
 
D
I
 
I
S
 
S
H
 
H
S
 
S
S
 
S
V
 
A
E
 
E
R
 
R
M
 
I
I
 
I
G
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
A
T
 
T
V
 
I
T
 
A
L
 
L
D
 
N
F
 
Y
A
 
M
L
 
L
A
 
N
R
 
R
L
 
F
T
 
S
G
 
N
V
 
I
I
 
V
D
 
K
K
 
N
L
 
L
L
 
T
V
 
V
Y
 
F
P
 
P
D
 
E
N
 
N
M
 
M
L
 
K
K
 
R
N
 
N
M
 
M
N
 
D
K
 
R
F
 
T
R
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
I
H
 
Y
S
 
S
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
I
Q
 
D
A
 
T
G
 
G
V
 
L
S
 
T
R
 
R
E
 
E
D
 
E
A
 
A
Y
 
Y
R
 
D
L
 
T
V
 
V
Q
 
Q
R
 
P
N
 
K
A
 
A
M
 
M
K
 
E
V
 
A
W
 
W
E
 
E
Q
 
K
G
 
Q
K
 
V
D
 
P
F
 
F
L
 
R
E
 
E
E
 
L
L
 
V
L
 
E
A
 
A
D
 
E
T
 
E
E
 
K
V
 
I
R
 
T
A
 
S
A
 
R
L
 
L
S
 
S
E
 
P
E
 
E
D
 
K
I
 
I
R
 
A
E
 
D
K
 
C
F
 
F
D
 
D
L
 
Y
G
 
N
Y
 
Y
H
 
H
T
 
L
K
 
K
H
 
N
V
 
V
D
 
D
T
 
L
I
 
I
F
 
F
R
 
E
R
 
R
V
 
L

Q9X0I0 Adenylosuccinate lyase; ASL; Adenylosuccinase; ASase; EC 4.3.2.2 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
53% identity, 99% coverage: 1:430/435 of query aligns to 1:427/431 of Q9X0I0

query
sites
Q9X0I0
M
 
M
I
 
V
S
 
E
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
L
P
 
S
E
 
P
M
 
M
V
 
K
A
 
D
I
 
L
W
 
W
S
 
T
P
 
E
E
 
E
T
 
A
K
 
K
F
 
Y
R
 
R
I
 
R
W
 
W
F
 
L
E
 
E
I
 
V
E
 
E
A
 
L
H
 
A
A
 
V
C
 
T
D
 
R
A
 
A
L
 
Y
A
 
E
E
 
E
I
 
L
G
 
G
V
 
M
I
 
I
P
 
P
K
 
K
E
 
G
A
 
V
A
 
T
K
 
E
T
 
R
I
 
I
W
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
R
G
 
N
A
 
N
A
 
A
T
 
K
F
 
I
D
 
D
V
 
V
A
 
E
R
 
L
I
 
F
D
 
K
E
 
K
I
 
I
E
 
E
A
 
E
V
 
K
T
 
T
K
 
N
H
 
H
D
 
D
V
 
V
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
V
T
 
E
H
 
G
L
 
I
A
 
G
E
 
S
F
 
M
V
 
I
G
 
G
P
 
E
D
 
D
S
 
S
R
 
R
F
 
F
I
 
F
H
 
H
Q
 
Y
G
 
G
M
 
L
T
 
T
S
 
S
S
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
D
T
 
T
C
 
A
F
 
N
N
 
S
I
 
L
Q
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
E
A
 
A
T
 
G
D
 
K
L
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
E
D
 
S
L
 
L
D
 
K
K
 
E
L
 
F
L
 
C
E
 
D
A
 
V
L
 
L
K
 
W
R
 
E
R
 
V
A
 
A
F
 
N
E
 
R
H
 
Y
K
 
K
D
 
H
T
 
T
V
 
P
T
 
T
I
 
I
G
 
G
R
 
R
S
 
T
H
|
H
G
 
G
I
 
V
H
 
H
A
 
A
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
F
 
F
G
 
G
V
 
L
K
 
K
L
 
V
A
 
L
L
 
G
A
 
W
Y
 
Y
A
 
S
E
 
E
F
 
M
D
 
K
R
 
R
C
 
N
K
 
V
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
L
 
E
A
 
R
A
 
A
R
 
I
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
S
T
 
Y
C
 
G
A
 
K
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
N
F
 
Y
A
 
A
N
 
N
I
 
V
D
 
P
P
 
P
R
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
H
 
K
V
 
A
A
 
L
E
 
S
A
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
E
P
 
P
V
 
V
S
 
S
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
I
 
V
P
 
P
R
 
R
D
 
D
R
 
R
H
 
H
A
 
A
M
 
F
Y
 
Y
F
 
L
A
 
S
T
 
T
L
 
L
G
 
A
V
 
I
V
 
V
A
 
A
S
 
A
S
 
G
I
 
I
E
 
E
R
 
R
L
 
I
A
 
A
T
 
V
E
 
E
I
 
I
R
 
R
H
 
H
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
T
 
T
E
 
E
V
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
V
E
 
E
E
 
E
Y
 
P
F
 
F
S
 
R
P
 
K
G
 
G
Q
 
Q
K
 
R
G
 
G
S
 
S
S
 
S
A
 
A
M
 
M
P
 
P
H
 
H
K
 
K
R
 
K
N
 
N
P
 
P
V
 
I
L
 
T
T
 
C
E
 
E
N
 
R
L
 
L
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
R
 
R
M
 
M
V
 
M
R
 
R
A
 
A
F
 
Y
V
 
V
V
 
D
P
 
P
A
 
S
M
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
H
 
H
E
 
E
R
 
R
D
 
D
I
 
I
S
 
S
H
 
H
S
 
S
S
 
S
V
 
V
E
 
E
R
 
R
M
 
Y
I
 
V
G
 
F
P
 
P
D
 
D
A
 
A
T
 
T
V
 
Q
T
 
T
L
 
L
D
 
Y
F
 
Y
A
 
M
L
 
I
A
 
V
R
 
T
L
 
A
T
 
T
G
 
N
V
 
V
I
 
V
D
 
R
K
 
N
L
 
M
L
 
K
V
 
V
Y
 
N
P
 
E
D
 
E
N
 
R
M
 
M
L
 
K
K
 
K
N
 
N
M
 
I
N
 
D
K
 
L
F
 
T
R
 
K
G
 
G
L
 
L
V
 
V
H
 
F
S
 
S
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
K
L
 
L
T
 
I
Q
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
L
S
 
T
R
 
R
E
 
K
D
 
E
A
 
A
Y
 
Y
R
 
D
L
 
I
V
 
V
Q
 
Q
R
 
R
N
 
N
A
 
A
M
 
L
K
 
K
V
 
T
W
 
W
E
 
N
Q
 
S
G
 
E
K
 
K
D
 
H
F
 
F
L
 
L
E
 
E
E
 
Y
L
 
L
L
 
L
A
 
E
D
 
D
T
 
E
E
 
E
V
 
V
R
 
K
A
 
K
A
 
L
L
 
V
S
 
T
E
 
K
E
 
E
D
 
E
I
 
L
R
 
E
E
 
E
K
 
L
F
 
F
D
 
D
L
 
I
G
 
S
Y
 
Y
H
 
Y
T
 
L
K
 
K
H
 
H
V
 
V
D
 
D
T
 
H
I
 
I
F
 
F
R
 
E
R
 
R

2x75A Staphylococcus aureus adenylosuccinate lyase (see paper)
49% identity, 99% coverage: 2:430/435 of query aligns to 1:423/427 of 2x75A

query
sites
2x75A
I
 
I
S
 
E
R
|
R
Y
|
Y
S
 
S
R
 
R
P
 
E
E
 
E
M
 
M
V
 
S
A
 
N
I
 
I
W
 
W
S
 
T
P
 
D
E
 
Q
T
 
N
K
 
R
F
 
Y
R
 
E
I
 
A
W
 
W
F
 
L
E
 
E
I
 
V
E
 
E
A
 
I
H
 
L
A
 
A
C
 
C
D
 
E
A
 
A
L
 
W
A
 
S
E
 
E
I
 
L
G
 
G
V
 
H
I
 
I
P
 
P
K
 
K
E
 
A
A
 
D
A
 
V
K
 
Q
T
 
K
I
 
I
W
 
R
E
 
Q
K
 
N
G
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
A
T
 
K
F
 
V
D
 
N
V
 
V
A
 
E
R
 
R
I
 
A
D
 
Q
E
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
Q
V
 
E
T
 
T
K
 
R
H
|
H
D
 
D
V
 
V
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
T
T
 
R
H
 
Q
L
 
V
A
 
S
E
 
E
F
 
T
V
 
L
G
 
G
P
 
E
D
 
E
S
 
R
R
 
K
F
 
W
I
 
V
H
 
H
Q
 
Y
G
 
G
M
 
L
T
 
T
S
 
S
S
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
C
 
A
F
 
L
N
 
S
I
 
F
Q
 
V
L
 
I
V
 
K
R
 
Q
A
 
A
T
 
N
D
 
D
L
 
I
L
 
I
L
 
E
A
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
E
K
 
R
L
 
F
L
 
I
E
 
D
A
 
V
L
 
L
K
 
A
R
 
E
R
 
K
A
 
A
F
 
K
E
 
N
H
 
Y
K
 
K
D
 
Y
T
 
T
V
 
L
T
 
M
I
 
M
G
 
G
R
 
R
S
x
T
H
|
H
G
 
G
I
 
V
H
 
H
A
 
A
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
T
F
 
F
G
 
G
V
 
V
K
 
K
L
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
W
Y
 
Y
A
 
T
E
 
E
F
 
M
D
 
Q
R
 
R
C
 
N
K
 
L
Q
 
Q
R
 
R
L
 
F
L
 
K
A
 
Q
A
 
V
R
 
R
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
E
T
 
V
C
 
G
A
 
K
I
 
M
S
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
F
A
 
A
N
 
N
I
 
I
D
 
P
P
 
P
R
 
E
V
 
I
E
 
E
E
 
S
H
 
Y
V
 
V
A
 
C
E
 
K
A
 
H
L
 
L
G
 
G
L
 
I
K
 
G
P
 
T
E
 
A
P
 
P
V
 
V
S
 
S
T
 
T
Q
 
Q
V
 
T
I
 
L
P
 
Q
R
 
R
D
 
D
R
 
R
H
 
H
A
 
A
M
 
Y
Y
 
Y
F
 
I
A
 
A
T
 
T
L
 
L
G
 
A
V
 
L
V
 
I
A
 
A
S
 
T
S
 
S
I
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
F
A
 
A
T
 
V
E
 
E
I
 
I
R
 
R
H
 
N
L
 
L
Q
 
Q
R
 
K
T
 
T
E
 
E
V
 
T
L
 
R
E
 
E
A
 
V
E
 
E
E
 
E
Y
 
A
F
 
F
S
 
A
P
 
K
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
S
|
S
S
|
S
A
 
A
M
 
M
P
 
P
H
 
H
K
|
K
R
 
R
N
 
N
P
 
P
V
 
I
L
 
G
T
 
S
E
|
E
N
|
N
L
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
I
S
 
S
R
 
R
M
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
G
F
 
Y
V
 
I
V
 
T
P
 
T
A
 
A
M
 
Y
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
P
L
 
L
W
 
W
H
 
H
E
 
E
R
 
R
D
 
D
I
 
I
S
 
S
H
 
H
S
 
S
S
 
S
V
 
A
E
 
E
R
 
R
M
 
I
I
 
M
G
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
V
T
 
T
V
 
I
T
 
A
L
 
L
D
 
D
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
A
 
N
R
 
R
L
 
F
T
 
T
G
 
N
V
 
I
I
 
V
D
 
D
K
 
R
L
 
L
L
 
T
V
 
V
Y
 
F
P
 
E
D
 
D
N
 
N
M
 
M
L
 
R
K
 
N
N
 
N
M
 
I
N
 
D
K
 
K
F
 
T
R
 
F
G
 
G
L
 
L
V
 
I
H
 
F
S
 
S
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
I
Q
 
N
A
 
K
G
 
G
V
 
M
S
 
V
R
 
R
E
 
E
D
 
E
A
 
A
Y
 
Y
R
 
D
L
 
K
V
 
V
Q
 
Q
R
 
P
N
 
K
A
 
A
M
 
M
K
 
I
V
 
S
W
 
W
E
 
E
Q
 
T
G
 
K
K
 
T
D
 
P
F
 
F
L
 
R
E
 
E
E
 
L
L
 
I
L
 
E
A
 
Q
D
 
D
T
 
E
E
 
S
V
 
I
R
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
T
S
 
T
E
 
K
E
 
E
D
 
E
I
 
L
R
 
D
E
 
E
K
 
C
F
 
F
D
 
D
L
 
P
G
 
K
Y
 
H
H
 
H
T
 
L
K
 
N
H
 
Q
V
 
V
D
 
D
T
 
T
I
 
I
F
 
F
R
 
E
R
 
R

4eeiB Crystal structure of adenylosuccinate lyase from francisella tularensis complexed with amp and succinate
41% identity, 88% coverage: 1:383/435 of query aligns to 1:368/423 of 4eeiB

query
sites
4eeiB
M
 
M
I
 
I
S
 
K
R
 
R
Y
 
Y
S
 
D
R
 
V
P
 
A
E
 
E
M
 
I
V
 
S
A
 
K
I
 
I
W
 
W
S
 
A
P
 
D
E
 
E
T
 
N
K
 
K
F
 
Y
R
 
A
I
 
K
W
 
M
F
 
L
E
 
E
I
 
V
E
 
E
A
 
L
H
 
A
A
 
I
C
 
L
D
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
-
E
 
E
I
 
D
G
 
R
V
 
M
I
 
V
P
 
P
K
 
K
E
 
G
A
 
T
A
 
A
K
 
A
T
 
E
I
 
I
W
 
R
E
 
A
K
 
R
G
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
A
T
 
Q
F
 
I
D
 
R
V
 
P
A
 
E
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
K
V
 
V
T
 
T
K
|
K
H
|
H
D
|
D
V
 
I
I
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
C
T
 
T
H
 
S
L
 
I
A
 
A
E
 
E
-
 
Q
F
 
F
V
 
T
G
 
A
P
 
E
D
 
T
S
 
G
R
 
K
F
 
F
I
 
F
H
 
H
Q
 
F
G
 
G
M
 
V
T
 
T
S
 
S
S
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
I
D
 
D
T
 
S
C
 
A
F
 
L
N
 
S
I
 
L
Q
 
Q
L
 
I
V
 
R
R
 
D
A
 
S
T
 
M
D
 
S
L
 
Y
L
 
V
L
 
I
A
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
E
K
 
A
L
 
L
L
 
C
E
 
D
A
 
S
L
 
L
K
 
L
R
 
T
R
 
K
A
 
A
F
 
E
E
 
E
H
 
T
K
 
K
D
 
E
T
 
I
V
 
I
T
 
T
I
 
M
G
 
G
R
 
R
S
|
S
H
|
H
G
 
G
I
 
M
H
 
F
A
 
A
E
 
E
P
 
P
T
 
M
T
 
S
F
 
F
G
 
G
V
 
Q
K
 
K
L
 
F
A
 
L
L
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
K
R
 
R
C
 
R
K
 
L
Q
 
K
R
 
D
L
 
L
L
 
K
A
 
D
A
 
F
R
 
Q
E
 
K
E
 
D
I
 
G
A
 
L
T
 
T
C
 
V
A
 
Q
I
 
F
S
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
N
F
 
Y
A
 
C
N
 
I
I
 
L
D
 
T
P
 
T
R
 
E
V
 
D
E
 
E
E
 
K
H
 
K
V
 
A
A
 
A
E
 
D
A
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
P
P
 
V
E
 
E
P
 
E
V
 
V
S
 
S
T
 
T
Q
|
Q
V
 
V
I
 
I
P
 
P
R
 
R
D
 
D
R
 
R
H
 
I
A
 
A
M
 
K
Y
 
L
F
 
I
A
 
S
T
 
I
L
 
H
G
 
G
V
 
L
V
 
I
A
 
A
S
 
S
S
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
A
T
 
V
E
 
E
I
 
I
R
 
R
H
 
H
L
 
L
Q
 
H
R
 
R
T
 
S
E
 
D
V
 
V
L
 
F
E
 
E
A
 
V
E
 
Y
E
 
E
Y
 
G
F
 
F
S
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
-
K
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
-
M
 
-
P
 
-
H
 
-
K
|
K
R
 
K
N
 
N
P
 
P
V
 
I
L
 
S
T
 
T
E
|
E
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
L
 
M
S
 
A
R
 
R
M
 
M
V
 
L
R
 
R
A
 
S
F
 
H
V
 
V
V
 
S
P
 
I
A
 
A
M
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
C
A
 
V
L
 
L
W
 
W
H
 
H
E
 
E
R
|
R
D
 
D
I
|
I
S
 
S
H
 
H
S
|
S
S
 
S
V
 
A
E
 
E
R
|
R
M
 
F
I
 
Y
G
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
N
T
 
F
V
 
G
T
 
I
L
 
M
D
 
V
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
A
 
R
R
 
R
L
 
M
T
 
K
G
 
N
V
 
T
I
 
I
D
 
D
K
 
N
L
 
L
L
 
V
V
 
V
Y
 
Q
P
 
R
D
 
D
N
 
I
M
 
I
L
 
E
K
 
D
N
 
R
M
 
V
N
 
R
K
 
S
F
 
T
R
 
S
G
 
A
L
 
Y
V
 
L
H
 
S
S
 
S
Q
 
F
R
 
Y
V
 
L
L
 
H
L
 
F
A
 
L
L
 
V
T
 
A
Q
 
N
A
 
T
G
 
P
V
 
F
S
 
M
R
 
R
E
 
E
D
 
D
A
 
C
Y
 
Y
R
 
K
L
 
I
V
 
V
Q
 
Q
R
 
Q
N
 
V
A
 
A
M
 
F

5hw2A Crystal structure of adenylosuccinate lyase from francisella tularensis complexed with fumaric acid
41% identity, 87% coverage: 1:380/435 of query aligns to 1:365/419 of 5hw2A

query
sites
5hw2A
M
 
M
I
 
I
S
 
K
R
 
R
Y
 
Y
S
 
D
R
 
V
P
 
A
E
 
E
M
 
I
V
 
S
A
 
K
I
 
I
W
 
W
S
 
A
P
 
D
E
 
E
T
 
N
K
 
K
F
 
Y
R
 
A
I
 
K
W
 
M
F
 
L
E
 
E
I
 
V
E
 
E
A
 
L
H
 
A
A
 
I
C
 
L
D
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
-
E
 
E
I
 
D
G
 
R
V
 
M
I
 
V
P
 
P
K
 
K
E
 
G
A
 
T
A
 
A
K
 
A
T
 
E
I
 
I
W
 
R
E
 
A
K
 
R
G
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
A
T
 
Q
F
 
I
D
 
R
V
 
P
A
 
E
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
K
V
 
V
T
 
T
K
 
K
H
|
H
D
 
D
V
 
I
I
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
C
T
 
T
H
 
S
L
 
I
A
 
A
E
 
E
-
 
Q
F
 
F
V
 
T
G
 
A
P
 
E
D
 
T
S
 
G
R
 
K
F
 
F
I
 
F
H
|
H
Q
 
F
G
 
G
M
 
V
T
|
T
S
|
S
S
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
I
D
 
D
T
 
S
C
 
A
F
 
L
N
 
S
I
 
L
Q
 
Q
L
 
I
V
 
R
R
 
D
A
 
S
T
 
M
D
 
S
L
 
Y
L
 
V
L
 
I
A
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
E
K
 
A
L
 
L
L
 
C
E
 
D
A
 
S
L
 
L
K
 
L
R
 
T
R
 
K
A
 
A
F
 
E
E
 
E
H
 
T
K
 
K
D
 
E
T
 
I
V
 
I
T
 
T
I
 
M
G
 
G
R
 
R
S
|
S
H
|
H
G
 
G
I
 
M
H
 
F
A
 
A
E
 
E
P
 
P
T
 
M
T
 
S
F
 
F
G
 
G
V
 
Q
K
 
K
L
 
F
A
 
L
L
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
K
R
 
R
C
 
R
K
 
L
Q
 
K
R
 
D
L
 
L
L
 
K
A
 
D
A
 
F
R
 
Q
E
 
K
E
 
D
I
 
G
A
 
L
T
 
T
C
 
V
A
 
Q
I
 
F
S
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
N
F
 
Y
A
 
C
N
 
I
I
 
L
D
 
T
P
 
T
R
 
E
V
 
D
E
 
E
E
 
K
H
 
K
V
 
A
A
 
A
E
 
D
A
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
P
P
 
V
E
 
E
P
 
E
V
 
V
S
 
S
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
I
 
I
P
 
P
R
 
R
D
 
D
R
 
R
H
 
I
A
 
A
M
 
K
Y
 
L
F
 
I
A
 
S
T
 
I
L
 
H
G
 
G
V
 
L
V
 
I
A
 
A
S
 
S
S
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
A
T
 
V
E
 
E
I
 
I
R
 
R
H
 
H
L
 
L
Q
 
H
R
 
R
T
 
S
E
 
D
V
 
V
L
 
F
E
 
E
A
 
V
E
 
Y
E
 
E
Y
 
G
F
 
F
S
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
-
K
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
-
M
 
-
P
 
-
H
 
-
K
|
K
R
 
K
N
 
N
P
 
P
V
 
I
L
 
S
T
 
T
E
|
E
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
L
 
M
S
 
A
R
 
R
M
 
M
V
 
L
R
 
R
A
 
S
F
 
H
V
 
V
V
 
S
P
 
I
A
 
A
M
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
C
A
 
V
L
 
L
W
 
W
H
 
H
E
 
E
R
 
R
D
 
D
I
 
I
S
 
S
H
 
H
S
 
S
S
 
S
V
 
A
E
 
E
R
 
R
M
 
F
I
 
Y
G
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
N
T
 
F
V
 
G
T
 
I
L
 
M
D
 
V
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
A
 
R
R
 
R
L
 
M
T
 
K
G
 
N
V
 
T
I
 
I
D
 
D
K
 
N
L
 
L
L
 
V
V
 
V
Y
 
Q
P
 
R
D
 
D
N
 
I
M
 
I
L
 
E
K
 
D
N
 
R
M
 
V
N
 
R
K
 
S
F
 
T
R
 
S
G
 
A
L
 
Y
V
 
L
H
 
S
S
 
S
Q
 
F
R
 
Y
V
 
L
L
 
H
L
 
F
A
 
L
L
 
V
T
 
A
Q
 
N
A
 
T
G
 
P
V
 
F
S
 
M
R
 
R
E
 
E
D
 
D
A
 
C
Y
 
Y
R
 
K
L
 
I
V
 
V
Q
 
Q
R
 
Q

5nx9D Crystal structure of neanderthal adenylosuccinate lyase (adsl) in complex with its products amp and fumarate (see paper)
29% identity, 92% coverage: 1:399/435 of query aligns to 10:423/477 of 5nx9D

query
sites
5nx9D
M
 
L
I
 
A
S
 
S
R
|
R
Y
|
Y
S
 
A
R
 
S
P
 
P
E
 
E
M
 
M
V
 
C
A
 
F
I
 
V
W
 
F
S
 
S
P
 
D
E
 
R
T
 
Y
K
 
K
F
 
F
R
 
R
I
 
T
W
 
W
F
 
R
E
 
Q
I
 
L
E
 
W
A
 
L
H
 
W
A
 
L
C
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
E
A
 
Q
E
 
T
I
 
L
G
 
G
V
 
-
I
 
L
P
 
P
K
 
I
E
 
T
A
 
D
A
 
E
K
 
Q
T
 
I
I
 
Q
W
 
E
E
 
M
K
 
K
G
 
S
G
 
N
A
 
L
A
 
E
T
 
N
F
 
I
D
 
D
V
 
F
A
 
K
R
 
M
I
 
A
D
 
A
E
 
E
I
 
E
E
 
E
A
 
K
V
 
R
T
 
L
K
x
R
H
|
H
D
|
D
V
 
V
I
 
M
A
 
A
F
 
H
L
 
V
T
 
H
H
 
T
L
 
F
A
 
G
E
 
H
F
 
C
V
 
C
G
 
P
P
 
K
D
 
A
S
 
A
R
 
G
F
 
I
I
 
I
H
 
H
Q
 
L
G
 
G
M
 
A
T
 
T
S
|
S
S
 
C
D
 
Y
V
 
V
L
 
G
D
 
D
T
 
N
C
 
T
F
 
D
N
 
L
I
 
I
Q
 
I
L
 
L
V
 
R
R
 
N
A
 
A
T
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
P
D
 
K
L
 
L
D
 
A
K
 
R
L
 
V
L
 
I
E
 
S
A
 
R
L
 
L
K
 
A
R
 
D
R
 
F
A
 
A
F
 
K
E
 
E
H
 
R
K
 
A
D
 
S
T
 
L
V
 
P
T
 
T
I
 
L
G
 
G
R
 
F
S
x
T
H
|
H
G
 
F
I
 
Q
H
 
P
A
 
A
E
 
Q
P
 
L
T
 
T
T
 
T
F
 
V
G
 
G
V
 
K
K
 
R
L
 
C
A
 
C
L
 
L
A
 
W
Y
 
I
A
 
Q
E
 
D
F
 
L
D
 
C
R
 
M
C
 
D
K
 
L
Q
 
Q
R
 
N
L
 
L
L
 
K
A
 
R
A
 
V
R
 
R
E
 
D
E
 
D
I
 
L
A
 
R
T
 
F
C
 
R
A
 
G
I
 
V
S
 
K
G
 
G
A
 
T
V
 
T
G
 
G
T
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
S
-
 
F
-
 
L
-
 
Q
-
 
L
F
 
F
A
 
E
N
 
G
I
 
D
D
 
D
P
 
H
R
 
K
V
 
V
E
 
E
E
 
Q
-
 
L
-
 
D
-
 
K
H
 
M
V
 
V
A
 
T
E
 
E
A
 
K
L
 
A
G
 
G
L
 
F
K
 
K
P
 
R
E
 
A
P
 
F
V
 
I
S
 
I
T
 
T
-
 
G
Q
|
Q
V
 
T
I
 
Y
P
 
T
R
 
R
D
 
K
R
 
V
H
 
D
A
 
I
M
 
E
Y
 
V
F
 
L
A
 
S
T
 
V
L
 
L
G
 
A
V
 
S
V
 
L
A
 
G
S
 
A
S
 
S
I
 
V
E
 
H
R
 
K
L
 
I
A
 
C
T
 
T
E
 
D
I
 
I
R
 
R
H
 
L
L
 
L
Q
 
-
R
 
-
T
 
A
E
 
N
V
 
L
L
 
K
E
 
E
A
 
M
E
 
E
E
 
E
Y
 
P
F
 
F
S
 
E
P
 
K
G
 
Q
Q
 
Q
K
 
I
G
 
G
S
|
S
S
|
S
A
 
A
M
 
M
P
 
P
H
 
Y
K
|
K
R
 
R
N
 
N
P
 
P
V
 
M
L
 
R
T
 
S
E
|
E
N
x
R
L
 
C
T
 
C
G
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
R
M
 
H
V
 
L
R
 
M
A
 
T
F
 
L
V
 
V
V
 
M
P
 
D
A
 
P
M
 
L
E
 
Q
N
 
T
V
 
A
A
 
S
L
 
V
-
 
Q
W
 
W
H
 
F
E
 
E
R
 
R
D
 
T
I
x
L
S
 
D
H
 
D
S
|
S
S
x
A
V
 
N
E
 
R
R
|
R
M
 
I
I
 
C
G
 
L
P
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
F
V
 
L
T
 
T
L
 
A
D
 
D
F
 
T
A
 
I
L
 
L
A
 
N
R
 
T
L
 
L
T
 
Q
G
 
N
V
 
I
I
 
S
D
 
E
K
 
G
L
 
L
L
 
V
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
D
 
K
N
 
V
M
 
I
L
 
E
K
 
R
N
 
R
M
 
I
N
 
R
K
 
Q
F
 
E
R
 
L
G
 
P
L
 
F
V
 
M
H
 
A
S
 
T
Q
 
E
R
 
N
V
 
I
L
 
I
L
 
M
A
 
A
L
 
M
T
 
V
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
G
S
 
S
R
 
R
E
 
Q
D
 
D
A
 
C
Y
 
H
R
 
E
-
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
V
L
 
L
V
 
S
Q
 
Q
R
 
Q
N
 
A
A
 
A
M
 
S
K
 
V
V
 
V
W
 
K
E
 
Q
Q
 
E
G
 
G
-
 
G
-
 
D
K
 
N
D
 
D
F
 
L
L
 
I
E
 
E
E
 
R
L
 
I
L
 
Q
A
 
A
D
 
D

Q05911 Adenylosuccinate lyase; ASL; Adenylosuccinase; ASase; EC 4.3.2.2 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
28% identity, 91% coverage: 3:399/435 of query aligns to 13:427/482 of Q05911

query
sites
Q05911
S
 
S
R
 
R
Y
 
Y
S
 
A
R
 
S
P
 
K
E
 
E
M
 
M
V
 
S
A
 
A
I
 
T
W
 
F
S
 
S
P
 
L
E
 
R
T
 
N
K
 
R
F
 
F
R
 
S
I
 
T
W
 
W
F
 
R
E
 
K
I
 
L
E
 
W
A
 
L
H
 
N
A
 
L
C
 
A
D
 
I
A
 
A
L
 
E
A
 
K
E
 
E
I
 
L
G
 
G
-
 
L
-
 
T
V
 
V
I
 
V
P
 
T
K
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
I
K
 
E
T
 
Q
I
 
M
W
 
R
E
 
K
K
 
H
G
 
V
G
 
E
A
 
I
A
 
T
T
 
D
F
 
D
D
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
K
I
 
A
D
 
S
E
 
A
I
 
Q
E
 
E
A
 
A
V
 
I
T
 
V
K
 
R
H
 
H
D
 
D
V
 
V
I
 
M
A
 
A
F
 
H
L
 
V
T
 
H
H
 
T
L
 
F
A
 
G
E
 
E
F
 
T
V
 
C
G
 
P
P
 
A
D
 
A
S
 
A
R
 
G
F
 
I
I
 
I
H
 
H
Q
 
L
G
 
G
M
 
A
T
 
T
S
 
S
S
 
C
D
 
F
V
 
V
L
 
T
D
 
D
T
 
N
C
 
A
F
 
D
N
 
L
I
 
I
Q
 
F
L
 
I
V
 
R
R
 
D
A
 
A
T
 
Y
D
 
D
L
 
I
L
 
I
L
 
I
A
 
P
D
 
K
L
 
L
D
 
V
K
 
N
L
 
V
L
 
I
E
 
N
A
 
R
L
 
L
K
 
A
R
 
K
R
 
F
A
 
A
F
 
M
E
 
E
H
 
Y
K
 
K
D
 
D
T
 
L
V
 
P
T
 
V
I
 
L
G
 
G
R
 
W
S
 
T
H
 
H
G
 
F
I
 
Q
H
 
P
A
 
A
E
 
Q
P
 
L
T
 
T
T
 
T
F
 
L
G
 
G
V
 
K
K
 
R
L
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
W
Y
 
I
A
 
Q
E
 
E
F
 
L
D
 
L
R
 
W
C
 
D
K
 
L
Q
 
R
R
 
N
L
 
F
L
 
E
A
 
R
A
 
A
R
 
R
E
 
N
E
 
D
I
 
I
A
 
G
T
 
L
C
 
R
A
 
G
I
 
V
S
x
K
G
 
G
A
 
T
V
 
T
G
 
G
T
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
S
-
 
F
-
 
L
-
 
A
-
 
L
F
 
F
A
 
H
N
 
G
I
 
N
D
 
H
P
 
D
R
 
K
V
 
V
E
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
D
E
 
E
H
 
R
V
 
V
A
 
T
E
 
E
A
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
F
-
 
D
K
 
K
P
 
V
E
 
Y
P
 
P
V
 
V
S
 
T
T
 
G
Q
 
Q
V
 
T
I
 
Y
P
 
S
R
 
R
D
 
K
R
 
I
H
 
D
A
 
I
M
 
D
Y
 
V
F
 
L
A
 
A
T
 
P
L
 
L
G
 
S
V
 
S
V
 
F
A
 
A
S
 
A
S
 
T
I
 
A
E
 
H
R
 
K
L
 
M
A
 
A
T
 
T
E
 
D
I
 
I
R
 
R
H
 
L
L
 
L
Q
 
-
R
 
-
T
 
A
E
 
N
V
 
L
L
 
K
E
 
E
A
 
V
E
 
E
E
 
E
Y
 
P
F
 
F
S
 
E
P
 
K
G
 
S
Q
 
Q
K
 
I
G
 
G
S
 
S
S
 
S
A
 
A
M
 
M
P
 
A
H
 
Y
K
 
K
R
 
R
N
 
N
P
 
P
V
 
M
L
 
R
T
 
C
E
 
E
N
 
R
L
 
V
T
 
C
G
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
R
M
 
H
V
 
L
R
 
G
A
 
S
F
 
L
V
 
F
V
 
S
P
 
D
A
 
A
M
 
V
E
 
Q
N
 
T
V
 
A
A
 
S
L
 
V
-
 
Q
W
 
W
H
 
F
E
 
E
R
 
R
D
 
T
I
 
L
S
 
D
H
 
D
S
 
S
S
 
A
V
 
I
E
 
R
R
 
R
M
 
I
I
 
S
G
 
L
P
 
P
D
 
S
A
 
A
T
 
F
V
 
L
T
 
T
L
 
A
D
 
D
F
 
I
A
 
L
L
 
L
A
 
S
R
 
T
L
 
L
T
 
L
G
 
N
V
 
I
I
 
S
D
 
S
K
 
G
L
 
L
L
 
V
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
D
 
K
N
 
V
M
 
I
L
 
E
K
 
R
N
 
R
M
 
I
N
 
K
K
 
G
F
 
E
R
 
L
G
 
P
L
 
F
V
 
M
H
 
A
S
 
T
Q
 
E
R
 
N
V
 
I
L
 
I
L
 
M
A
 
A
L
 
M
T
 
V
Q
 
E
A
 
K
G
 
N
V
 
A
S
 
S
R
 
R
E
 
Q
D
 
E
A
 
V
Y
 
H
R
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
R
-
 
V
L
 
L
V
 
S
Q
 
H
R
 
Q
N
 
A
A
 
A
M
 
A
K
 
V
V
 
V
W
 
K
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
-
 
G
-
 
E
K
 
N
D
 
D
F
 
L
L
 
I
E
 
E
E
 
R
L
 
V
L
 
K
A
 
R
D
 
D

P30566 Adenylosuccinate lyase; ADSL; ASL; Adenylosuccinase; ASase; EC 4.3.2.2 from Homo sapiens (Human) (see 13 papers)
28% identity, 94% coverage: 1:407/435 of query aligns to 17:434/484 of P30566

query
sites
P30566
M
 
L
I
 
A
S
 
S
R
 
R
Y
 
Y
S
 
A
R
 
S
P
 
P
E
 
E
M
|
M
V
 
C
A
 
F
I
 
V
W
 
F
S
 
S
P
 
D
E
 
R
T
 
Y
K
 
K
F
 
F
R
 
R
I
 
T
W
 
W
F
 
R
E
 
Q
I
 
L
E
 
W
A
 
L
H
 
W
A
 
L
C
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
E
A
 
Q
E
 
T
I
 
L
G
 
G
V
 
-
I
 
L
P
 
P
K
 
I
E
 
T
A
 
D
A
 
E
K
 
Q
T
 
I
I
 
Q
W
 
E
E
 
M
K
 
K
G
 
S
G
 
N
A
 
L
A
 
E
T
 
N
F
x
I
D
 
D
V
 
F
A
 
K
R
 
M
I
 
A
D
 
A
E
 
E
I
 
E
E
 
E
A
 
K
V
 
R
T
 
L
K
 
R
H
 
H
D
 
D
V
 
V
I
 
M
A
 
A
F
 
H
L
 
V
T
 
H
H
 
T
L
 
F
A
 
G
E
 
H
F
 
C
V
 
C
G
x
P
P
 
K
D
 
A
S
 
A
R
 
G
F
 
I
I
 
I
H
 
H
Q
 
L
G
 
G
M
 
A
T
 
T
S
 
S
S
 
C
D
x
Y
V
 
V
L
 
G
D
 
D
T
 
N
C
 
T
F
 
D
N
 
L
I
 
I
Q
 
I
L
 
L
V
 
R
R
 
N
A
 
A
T
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
P
D
 
K
L
 
L
D
 
A
K
 
R
L
 
V
L
 
I
E
 
S
A
x
R
L
 
L
K
 
A
R
 
D
R
 
F
A
 
A
F
 
K
E
 
E
H
 
R
K
 
A
D
 
S
T
 
L
V
 
P
T
 
T
I
 
L
G
 
G
R
 
F
S
 
T
H
|
H
G
 
F
I
 
Q
H
 
P
A
 
A
E
 
Q
P
 
L
T
 
T
T
 
T
F
 
V
G
 
G
V
 
K
K
 
R
L
 
C
A
 
C
L
 
L
A
 
W
Y
 
I
A
 
Q
E
 
D
F
 
L
D
 
C
R
 
M
C
 
D
K
 
L
Q
 
Q
R
 
N
L
 
L
L
 
K
A
 
R
A
 
V
R
|
R
E
 
D
E
 
D
I
 
L
A
x
R
T
 
F
C
 
R
A
 
G
I
 
V
S
 
K
G
 
G
A
 
T
V
 
T
G
 
G
T
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
S
-
 
F
-
 
L
-
 
Q
-
 
L
F
 
F
A
 
E
N
 
G
I
 
D
D
 
D
P
 
H
R
 
K
V
 
V
E
 
E
E
 
Q
-
 
L
-
 
D
-
 
K
H
 
M
V
 
V
A
 
T
E
 
E
A
 
K
L
 
A
G
 
G
L
 
F
K
 
K
P
 
R
E
 
A
P
 
F
V
 
I
S
 
I
T
 
T
-
 
G
Q
 
Q
V
 
T
I
 
Y
P
 
T
R
 
R
D
x
K
R
 
V
H
 
D
A
 
I
M
 
E
Y
 
V
F
 
L
A
 
S
T
 
V
L
 
L
G
 
A
V
 
S
V
 
L
A
 
G
S
 
A
S
 
S
I
 
V
E
 
H
R
 
K
L
 
I
A
 
C
T
 
T
E
x
D
I
 
I
R
 
R
H
 
L
L
 
L
Q
 
-
R
 
-
T
 
A
E
 
N
V
 
L
L
 
K
E
 
E
A
 
M
E
 
E
E
 
E
Y
 
P
F
 
F
S
 
E
P
 
K
G
 
Q
Q
 
Q
K
 
I
G
 
G
S
|
S
S
 
S
A
 
A
M
 
M
P
 
P
H
 
Y
K
 
K
R
 
R
N
 
N
P
 
P
V
 
M
L
 
R
T
 
S
E
 
E
N
x
R
L
 
C
T
 
C
G
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
R
M
 
H
V
x
L
R
 
M
A
 
T
F
 
L
V
 
V
V
 
M
P
 
D
A
x
P
M
 
L
E
 
Q
N
 
T
V
 
A
A
 
S
L
 
V
-
 
Q
W
 
W
H
 
F
E
 
E
R
 
R
D
 
T
I
 
L
S
 
D
H
 
D
S
 
S
S
 
A
V
 
N
E
 
R
R
 
R
M
 
I
I
 
C
G
 
L
P
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
F
V
 
L
T
 
T
L
 
A
D
 
D
F
 
T
A
 
I
L
 
L
A
 
N
R
 
T
L
 
L
T
 
Q
G
 
N
V
 
I
I
 
S
D
 
E
K
 
G
L
 
L
L
 
V
V
|
V
Y
 
Y
P
 
P
D
 
K
N
 
V
M
 
I
L
 
E
K
 
R
N
 
R
M
 
I
N
x
R
K
 
Q
F
 
E
R
 
L
G
 
P
L
 
F
V
 
M
H
 
A
S
 
T
Q
 
E
R
 
N
V
 
I
L
 
I
L
 
M
A
 
A
L
 
M
T
 
V
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
G
S
|
S
R
|
R
E
 
Q
D
 
D
A
 
C
Y
 
H
R
 
E
-
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
V
L
 
L
V
 
S
Q
 
Q
R
 
Q
N
 
A
A
 
A
M
 
S
K
 
V
V
 
V
W
 
K
E
 
Q
Q
 
E
G
 
G
K
 
G
D
 
D
F
 
-
L
 
-
E
 
N
E
x
D
L
|
L
L
 
I
A
 
E
D
x
R
T
 
I
E
 
Q
V
 
V
R
x
D
A
 
A
A
 
Y
L
 
F
S
 
S

Sites not aligning to the query:

5vkwB Crystal structure of adenylosuccinate lyase ade13 from candida albicans
27% identity, 92% coverage: 3:401/435 of query aligns to 13:421/469 of 5vkwB

query
sites
5vkwB
S
 
S
R
 
R
Y
 
Y
S
 
A
R
 
S
P
 
E
E
 
E
M
 
M
V
 
S
A
 
K
I
 
I
W
 
F
S
 
S
P
 
L
E
 
R
T
 
N
K
 
R
F
 
F
R
 
S
I
 
T
W
 
W
F
 
R
E
 
K
I
 
L
E
 
W
A
 
L
H
 
N
A
 
L
C
 
A
D
 
I
A
 
A
L
 
E
A
 
K
E
 
E
I
 
V
G
 
G
-
 
L
-
 
S
V
 
V
I
 
I
P
 
T
K
x
D
E
 
E
A
 
A
A
 
I
K
x
E
T
 
Q
I
 
M
W
 
K
E
 
Q
K
 
H
G
 
L
G
 
E
A
 
I
A
 
T
T
 
D
F
 
K
D
 
E
V
 
I
A
 
Q
R
 
D
I
 
A
D
 
A
E
 
V
I
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
K
T
 
V
K
 
R
H
|
H
D
 
D
V
 
V
I
 
M
A
 
A
F
 
H
L
 
V
T
 
H
H
 
V
L
 
F
A
 
G
E
 
E
F
 
T
V
 
C
G
 
P
P
 
S
D
 
A
S
 
A
R
 
G
F
 
I
I
 
I
H
 
H
Q
 
L
G
 
G
M
 
A
T
 
T
S
 
S
S
 
C
D
 
F
V
 
V
L
 
T
D
 
D
T
 
N
C
 
A
F
 
D
N
 
L
I
 
I
Q
 
F
L
 
L
V
 
R
R
 
D
A
 
A
T
 
Y
D
 
D
L
 
V
L
 
L
L
 
I
A
 
P
D
 
K
L
 
L
D
 
V
K
 
N
L
 
V
L
 
I
E
 
D
A
 
R
L
 
L
K
 
S
R
 
K
R
 
F
A
 
A
F
 
L
E
 
E
H
 
Y
K
 
K
D
 
D
T
 
L
V
 
P
T
 
V
I
 
L
G
 
G
R
 
W
S
x
T
H
|
H
G
 
F
I
 
Q
H
 
P
A
 
A
E
 
Q
P
 
L
T
 
T
T
 
T
F
 
V
G
 
G
V
 
K
K
 
R
L
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
W
Y
 
L
A
 
Q
E
 
E
F
 
L
D
 
L
R
 
W
C
 
D
K
 
L
Q
 
R
R
 
N
L
 
M
L
 
V
A
 
R
A
 
A
R
 
R
E
 
N
E
 
D
I
 
I
A
 
G
T
 
L
C
 
R
A
 
G
I
 
V
S
 
K
G
 
G
A
 
T
V
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
Q
A
 
A
N
 
S
I
 
F
-
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
F
-
 
H
-
 
G
-
 
D
D
 
H
P
 
D
R
 
K
V
 
V
E
 
E
E
 
E
-
 
L
-
 
D
-
 
K
H
 
R
V
 
V
A
 
V
E
 
E
A
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
F
K
 
D
-
 
I
P
 
V
E
 
Y
P
 
P
V
 
V
S
 
T
T
 
G
Q
 
Q
V
 
T
I
 
Y
P
 
S
R
 
R
D
 
K
R
 
I
H
 
D
A
 
I
M
 
D
Y
 
V
F
 
L
A
 
S
T
 
P
L
 
L
G
 
A
V
 
S
V
 
F
A
 
G
S
 
A
S
 
T
I
 
A
E
 
H
R
 
K
L
 
F
A
 
A
T
 
T
E
 
D
I
 
I
R
 
R
H
 
L
L
 
L
Q
 
A
R
 
N
T
 
L
E
 
K
V
 
-
L
 
-
E
 
E
A
 
I
E
 
E
E
 
E
Y
 
P
F
 
F
S
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
-
K
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
E
A
 
K
M
 
M
P
 
A
H
 
Y
K
|
K
R
 
R
N
 
N
P
 
P
V
 
M
L
 
R
T
 
C
E
|
E
N
 
R
L
 
V
T
 
C
G
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
R
M
 
H
V
 
L
R
 
G
A
 
G
F
 
L
V
 
F
V
 
N
P
 
D
A
 
A
M
 
V
E
 
Q
N
 
T
V
 
A
A
 
S
L
 
V
-
 
Q
W
 
W
H
 
F
E
 
E
R
 
R
D
 
T
I
 
L
S
 
D
H
 
D
S
 
S
S
 
A
V
 
I
E
 
R
R
 
R
M
 
I
I
 
S
G
 
L
P
 
P
D
 
S
A
 
A
T
 
F
V
 
L
T
 
T
L
 
V
D
 
D
F
 
I
A
 
L
L
 
L
A
 
S
R
 
T
L
 
M
T
 
L
G
 
N
V
 
I
I
 
T
D
 
S
K
 
G
L
 
L
L
 
V
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
D
 
K
N
 
V
M
 
I
L
 
E
K
 
R
N
 
R
M
 
I
N
 
N
K
 
S
F
 
E
R
 
L
G
 
P
L
 
F
V
 
M
H
 
A
S
 
T
Q
 
E
R
 
N
V
 
I
L
 
I
L
 
M
A
 
A
L
 
M
T
 
V
Q
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
G
S
 
S
R
 
R
E
 
Q
D
 
D
A
 
C
Y
 
H
R
 
E
L
 
E
V
 
I
-
 
R
-
 
V
-
 
L
-
 
S
-
 
H
Q
 
Q
R
 
A
N
 
S
A
 
A
M
 
V
K
 
V
V
 
K
W
 
Q
E
 
E
Q
 
G
G
 
G
K
 
D
D
 
N
F
 
D
L
 
L
E
 
I
E
 
E
L
 
R
L
 
I
A
 
K
D
 
S
T
 
T
E
 
E

Sites not aligning to the query:

5nxaA Crystal structure of neanderthal adenylosuccinate lyase (adsl)in complex with its products aicar and fumarate (see paper)
26% identity, 92% coverage: 1:399/435 of query aligns to 10:410/464 of 5nxaA

query
sites
5nxaA
M
 
L
I
 
A
S
 
S
R
|
R
Y
|
Y
S
 
A
R
 
S
P
 
P
E
 
E
M
 
M
V
 
C
A
 
F
I
 
V
W
 
F
S
 
S
P
 
D
E
 
R
T
 
Y
K
 
K
F
 
F
R
 
R
I
 
T
W
 
W
F
 
R
E
 
Q
I
 
L
E
 
W
A
 
L
H
 
W
A
 
L
C
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
E
A
 
Q
E
 
T
I
 
L
G
 
G
V
 
-
I
 
L
P
 
P
K
 
I
E
 
T
A
 
D
A
 
E
K
 
Q
T
 
I
I
 
Q
W
 
E
E
 
M
K
 
K
G
 
S
G
 
N
A
 
L
A
 
E
T
 
N
F
 
I
D
 
D
V
 
F
A
 
K
R
 
M
I
 
A
D
 
A
E
 
E
I
 
E
E
 
E
A
 
K
V
 
R
T
 
L
K
x
R
H
|
H
D
|
D
V
 
V
I
 
M
A
 
A
F
 
H
L
 
V
T
 
H
H
 
T
L
 
F
A
 
G
E
 
H
F
 
C
V
 
C
G
 
P
P
 
K
D
 
A
S
 
A
R
 
G
F
 
I
I
 
I
H
 
H
Q
 
L
G
 
G
M
 
A
T
|
T
S
|
S
S
 
C
D
 
Y
V
 
V
L
 
G
D
 
D
T
 
N
C
 
T
F
 
D
N
 
L
I
 
I
Q
 
I
L
 
L
V
 
R
R
 
N
A
 
A
T
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
P
D
 
K
L
 
L
D
 
A
K
 
R
L
 
V
L
 
I
E
 
S
A
 
R
L
 
L
K
 
A
R
 
D
R
 
F
A
 
A
F
 
K
E
 
E
H
 
R
K
 
A
D
 
S
T
 
L
V
 
P
T
 
T
I
 
L
G
 
G
R
 
F
S
x
T
H
|
H
G
 
F
I
 
Q
H
 
P
A
 
A
E
 
Q
P
 
L
T
 
T
T
 
T
F
 
V
G
 
G
V
 
K
K
 
R
L
 
C
A
 
C
L
 
L
A
 
W
Y
 
I
A
 
Q
E
 
D
F
 
L
D
 
C
R
 
M
C
 
D
K
 
L
Q
 
Q
R
 
N
L
 
L
L
 
K
A
 
R
A
 
V
R
 
R
E
 
D
E
 
D
I
 
L
A
 
R
T
 
F
C
 
R
A
 
G
I
 
V
S
 
K
G
 
G
A
 
T
V
 
T
G
 
G
T
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
S
-
 
F
-
 
L
-
 
Q
-
 
L
F
 
F
A
 
E
N
 
G
I
 
D
D
 
D
P
 
H
R
 
K
V
 
V
E
 
E
E
 
Q
-
 
L
-
 
D
-
 
K
H
 
M
V
 
V
A
 
T
E
 
E
A
 
K
L
 
A
G
 
G
L
 
F
K
 
K
P
 
R
E
 
A
P
 
F
V
 
I
S
 
I
T
 
T
-
 
G
Q
|
Q
V
 
T
I
 
Y
P
 
T
R
 
R
D
 
K
R
 
V
H
 
D
A
 
I
M
 
E
Y
 
V
F
 
L
A
 
S
T
 
V
L
 
L
G
 
A
V
 
S
V
 
L
A
 
G
S
 
A
S
 
S
I
 
V
E
 
H
R
 
K
L
 
I
A
 
C
T
 
T
E
 
D
I
 
I
R
 
R
H
 
L
L
 
L
Q
 
A
R
 
N
T
 
L
E
 
K
V
 
E
L
 
M
E
 
E
A
 
E
E
 
P
E
 
-
Y
 
-
F
 
-
S
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
-
K
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
-
M
 
-
P
 
-
H
 
-
K
|
K
R
 
R
N
 
N
P
 
P
V
 
M
L
 
R
T
 
S
E
|
E
N
x
R
L
 
C
T
 
C
G
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
R
M
 
H
V
 
L
R
 
M
A
 
T
F
 
L
V
 
V
V
 
M
P
 
D
A
 
P
M
 
L
E
 
Q
N
 
T
V
 
A
A
 
S
L
 
V
-
 
Q
W
 
W
H
 
F
E
 
E
R
 
R
D
 
T
I
x
L
S
 
D
H
 
D
S
|
S
S
x
A
V
 
N
E
 
R
R
|
R
M
 
I
I
 
C
G
 
L
P
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
F
V
 
L
T
 
T
L
 
A
D
 
D
F
 
T
A
 
I
L
 
L
A
 
N
R
 
T
L
 
L
T
 
Q
G
 
N
V
 
I
I
 
S
D
 
E
K
 
G
L
 
L
L
 
V
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
D
 
K
N
 
V
M
 
I
L
 
E
K
 
R
N
 
R
M
 
I
N
 
R
K
 
Q
F
 
E
R
 
L
G
 
P
L
 
F
V
 
M
H
 
A
S
 
T
Q
 
E
R
 
N
V
 
I
L
 
I
L
 
M
A
 
A
L
 
M
T
 
V
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
G
S
 
S
R
 
R
E
 
Q
D
 
D
A
 
C
Y
 
H
R
 
E
-
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
V
L
 
L
V
 
S
Q
 
Q
R
 
Q
N
 
A
A
 
A
M
 
S
K
 
V
V
 
V
W
 
K
E
 
Q
Q
 
E
G
 
G
-
 
G
-
 
D
K
 
N
D
 
D
F
 
L
L
 
I
E
 
E
E
 
R
L
 
I
L
 
Q
A
 
A
D
 
D

5nxaB Crystal structure of neanderthal adenylosuccinate lyase (adsl)in complex with its products aicar and fumarate (see paper)
29% identity, 70% coverage: 94:399/435 of query aligns to 40:361/415 of 5nxaB

query
sites
5nxaB
G
 
G
M
 
A
T
 
T
S
|
S
S
 
C
D
 
Y
V
 
V
L
 
G
D
 
D
T
 
N
C
 
T
F
 
D
N
 
L
I
 
I
Q
 
I
L
 
L
V
 
R
R
 
N
A
 
A
T
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
P
D
 
K
L
 
L
D
 
A
K
 
R
L
 
V
L
 
I
E
 
S
A
 
R
L
 
L
K
 
A
R
 
D
R
 
F
A
 
A
F
 
K
E
 
E
H
 
R
K
 
A
D
 
S
T
 
L
V
 
P
T
 
T
I
 
L
G
 
G
R
 
F
S
x
T
H
|
H
G
 
F
I
 
Q
H
 
P
A
 
A
E
 
Q
P
 
L
T
 
T
T
 
T
F
 
V
G
 
G
V
 
K
K
 
R
L
 
C
A
 
C
L
 
L
A
 
W
Y
 
I
A
 
Q
E
 
D
F
 
L
D
 
C
R
 
M
C
 
D
K
 
L
Q
 
Q
R
 
N
L
 
L
L
 
K
A
 
R
A
 
V
R
 
R
E
 
D
E
 
D
I
 
L
A
 
R
T
 
F
C
 
R
A
 
G
I
 
V
S
 
K
G
 
G
A
 
T
V
 
T
G
 
G
T
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
S
-
 
F
-
 
L
-
 
Q
-
 
L
F
 
F
A
 
E
N
 
G
I
 
D
D
 
D
P
 
H
R
 
K
V
 
V
E
 
E
E
 
Q
-
 
L
-
 
D
-
 
K
H
 
M
V
 
V
A
 
T
E
 
E
A
 
K
L
 
A
G
 
G
L
 
F
K
 
K
P
 
R
E
 
A
P
 
F
V
 
I
S
 
I
T
 
T
-
 
G
Q
|
Q
V
 
T
I
 
Y
P
 
T
R
 
R
D
 
K
R
 
V
H
 
D
A
 
I
M
 
E
Y
 
V
F
 
L
A
 
S
T
 
V
L
 
L
G
 
A
V
 
S
V
 
L
A
 
G
S
 
A
S
 
S
I
 
V
E
 
H
R
 
K
L
 
I
A
 
C
T
 
T
E
 
D
I
 
I
R
 
R
H
 
L
L
 
L
Q
 
-
R
 
-
T
 
A
E
 
N
V
 
L
L
 
K
E
 
E
A
 
M
E
 
E
E
 
E
Y
 
P
F
 
F
S
 
E
P
 
K
G
 
Q
Q
 
Q
K
 
I
G
 
G
S
|
S
S
|
S
A
 
A
M
|
M
P
 
P
H
 
Y
K
|
K
R
 
R
N
|
N
P
 
P
V
x
M
L
 
R
T
 
S
E
|
E
N
x
R
L
 
C
T
 
C
G
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
R
M
 
H
V
 
L
R
 
M
A
 
T
F
 
L
V
 
V
V
 
M
P
 
D
A
 
P
M
 
L
E
 
Q
N
 
T
V
 
A
A
 
S
L
 
V
-
 
Q
W
 
W
H
 
F
E
 
E
R
 
R
D
 
T
I
x
L
S
 
D
H
 
D
S
|
S
S
x
A
V
 
N
E
 
R
R
|
R
M
 
I
I
 
C
G
 
L
P
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
F
V
 
L
T
 
T
L
 
A
D
 
D
F
 
T
A
 
I
L
 
L
A
 
N
R
 
T
L
 
L
T
 
Q
G
 
N
V
 
I
I
 
S
D
 
E
K
 
G
L
 
L
L
 
V
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
D
 
K
N
 
V
M
 
I
L
 
E
K
 
R
N
 
R
M
 
I
N
 
R
K
 
Q
F
 
E
R
 
L
G
 
P
L
 
F
V
 
M
H
 
A
S
 
T
Q
 
E
R
 
N
V
 
I
L
 
I
L
 
M
A
 
A
L
 
M
T
 
V
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
G
S
 
S
R
 
R
E
 
Q
D
 
D
A
 
C
Y
 
H
R
 
E
-
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
V
L
 
L
V
 
S
Q
 
Q
R
 
Q
N
 
A
A
 
A
M
 
S
K
 
V
V
 
V
W
 
K
E
 
Q
Q
 
E
G
 
G
-
 
G
-
 
D
K
 
N
D
 
D
F
 
L
L
 
I
E
 
E
E
 
R
L
 
I
L
 
Q
A
 
A
D
 
D

Sites not aligning to the query:

5eytA Crystal structure of adenylosuccinate lyase from schistosoma mansoni in complex with amp (see paper)
24% identity, 88% coverage: 1:382/435 of query aligns to 9:395/472 of 5eytA

query
sites
5eytA
M
 
L
I
 
T
S
 
K
R
|
R
Y
|
Y
S
 
A
R
 
S
P
 
R
E
 
E
M
 
M
V
 
V
A
 
C
I
 
N
W
 
F
S
 
G
P
 
E
E
 
K
T
 
R
K
 
K
F
 
V
R
 
I
I
 
L
W
 
W
F
 
R
E
 
Q
I
 
L
E
 
W
A
 
I
H
 
W
A
 
L
C
 
A
D
 
E
A
 
T
L
 
Q
A
 
K
E
 
E
I
 
L
G
 
G
V
 
F
-
 
D
I
 
I
P
 
T
K
 
D
E
 
E
A
 
Q
A
 
I
K
 
N
T
 
E
I
 
M
W
 
K
E
 
S
K
 
Q
G
 
R
G
 
D
A
 
S
A
 
V
T
 
D
F
 
F
D
 
G
V
 
T
A
 
A
R
 
A
I
 
A
D
 
E
E
 
E
I
 
-
E
 
-
A
 
K
V
 
A
T
 
R
K
 
R
H
|
H
D
 
D
V
 
V
I
 
M
A
 
A
F
 
H
L
 
V
T
 
Y
H
 
T
L
 
F
A
 
A
E
 
L
F
 
A
V
 
C
G
 
P
P
 
K
D
 
A
S
 
A
R
 
P
F
 
I
I
 
I
H
 
H
Q
 
L
G
 
G
M
 
A
T
 
T
S
 
S
S
 
C
D
 
F
V
 
V
L
 
G
D
 
D
T
 
N
C
 
A
F
 
D
N
 
L
I
 
I
Q
 
M
L
 
L
V
 
K
R
 
D
A
 
G
T
 
L
D
 
N
L
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
P
D
 
K
L
 
V
D
 
A
K
 
R
L
 
C
L
 
I
E
 
D
A
 
R
L
 
L
K
 
A
R
 
K
R
 
K
A
 
A
F
 
M
E
 
L
H
 
H
K
 
K
D
 
S
T
 
L
V
 
I
T
 
C
I
 
L
G
 
A
R
 
R
S
x
T
H
|
H
G
 
L
I
 
Q
H
 
P
A
 
A
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
T
 
T
F
 
M
G
 
G
V
 
R
K
 
R
L
 
I
A
 
C
L
 
M
A
 
W
Y
 
I
A
 
Q
E
 
D
F
 
L
D
 
L
R
 
L
C
 
D
K
 
L
Q
 
E
R
 
N
L
 
L
L
 
E
A
 
R
A
 
L
R
 
K
E
 
N
E
 
H
-
 
T
I
 
I
A
 
R
T
 
F
C
 
R
A
 
G
I
 
A
S
 
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
Q
A
 
A
N
 
S
I
 
F
D
 
M
P
 
D
-
 
L
-
 
F
-
 
Q
-
 
G
-
 
D
-
 
H
-
 
Q
-
 
K
-
 
V
-
 
I
R
 
K
V
 
L
E
 
D
E
 
E
H
 
I
V
 
L
A
 
T
E
 
K
A
 
K
L
 
S
G
 
G
L
 
F
K
 
Q
P
 
R
E
 
S
-
 
W
P
 
C
V
 
V
S
 
T
T
 
G
Q
 
Q
V
 
T
I
 
Y
P
 
P
R
 
R
D
 
K
R
 
V
H
 
D
A
 
I
M
 
E
Y
 
I
F
 
T
A
 
N
T
 
A
L
 
L
G
 
S
V
 
N
V
 
I
A
 
G
S
 
A
S
 
T
I
 
V
E
 
H
R
 
K
L
 
I
A
 
C
T
 
T
E
 
D
I
 
I
R
 
R
H
 
L
L
 
L
Q
 
-
R
 
-
T
 
S
E
 
S
V
 
F
L
 
H
E
 
E
A
 
V
E
 
E
E
 
E
Y
 
P
F
 
F
S
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
-
K
 
-
G
 
-
S
 
E
S
 
T
A
 
K
M
 
M
P
 
P
H
 
Y
K
|
K
R
 
R
N
 
N
P
 
P
V
 
I
L
 
R
T
 
S
E
|
E
N
x
R
L
 
A
T
 
C
G
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
R
M
 
Y
V
 
L
R
 
M
A
 
H
F
 
I
V
 
S
V
 
T
P
 
S
A
 
M
M
 
V
E
 
S
N
 
T
V
 
V
A
 
S
L
 
V
-
 
Q
W
 
W
H
 
L
E
 
E
R
 
R
D
 
S
I
 
L
S
 
D
H
 
D
S
 
S
S
 
A
V
 
I
E
 
R
R
 
R
M
 
I
I
 
V
G
 
L
P
 
P
D
 
E
A
 
A
T
 
F
V
 
L
T
 
A
L
 
A
D
 
D
F
 
A
A
 
C
L
 
L
A
 
T
R
 
L
L
 
L
T
 
Q
G
 
N
V
 
I
I
 
A
D
 
E
K
 
G
L
 
L
L
 
I
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
D
 
M
N
 
V
M
 
M
L
 
E
K
 
A
N
 
N
M
 
L
N
 
N
K
 
S
F
 
E
R
 
L
G
 
P
L
 
F
V
 
L
H
 
V
S
 
V
Q
 
E
R
 
R
V
 
I
L
 
L
L
 
V
A
 
K
L
 
M
T
 
V
Q
 
S
A
 
E
G
 
G
-
 
A
V
 
A
S
 
N
R
 
R
E
 
Q
D
 
E
A
 
C
Y
 
H
R
 
E
L
 
R
V
 
L
Q
 
R
R
 
K
N
 
H
A
 
S

5nxaC Crystal structure of neanderthal adenylosuccinate lyase (adsl)in complex with its products aicar and fumarate (see paper)
26% identity, 84% coverage: 1:366/435 of query aligns to 9:372/418 of 5nxaC

query
sites
5nxaC
M
 
L
I
 
A
S
 
S
R
|
R
Y
|
Y
S
 
A
R
 
S
P
 
P
E
 
E
M
 
M
V
 
C
A
 
F
I
 
V
W
 
F
S
 
S
P
 
D
E
 
R
T
 
Y
K
 
K
F
 
F
R
 
R
I
 
T
W
 
W
F
 
R
E
 
Q
I
 
L
E
 
W
A
 
L
H
 
W
A
 
L
C
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
E
A
 
Q
E
 
T
I
 
L
G
 
G
V
 
-
I
 
L
P
 
P
K
 
I
E
 
T
A
 
D
A
 
E
K
 
Q
T
 
I
I
 
Q
W
 
E
E
 
M
K
 
K
G
 
S
G
 
N
A
 
L
A
 
E
T
 
N
F
 
I
D
 
D
V
 
F
A
 
K
R
 
M
I
 
A
D
 
A
E
 
E
I
 
E
E
 
E
A
 
K
V
 
R
T
 
L
K
x
R
H
|
H
D
|
D
V
 
V
I
 
M
A
 
A
F
 
H
L
 
V
T
 
H
H
 
T
L
 
F
A
 
G
E
 
H
F
 
C
V
 
C
G
 
P
P
 
K
D
 
A
S
 
A
R
 
G
F
 
I
I
 
I
H
 
H
Q
 
L
G
 
G
M
 
A
T
|
T
S
|
S
S
 
C
D
 
Y
V
 
V
L
 
G
D
 
D
T
 
N
C
 
T
F
 
D
N
 
L
I
 
I
Q
 
I
L
 
L
V
 
R
R
 
N
A
 
A
T
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
P
D
 
K
L
 
L
D
 
A
K
 
R
L
 
V
L
 
I
E
 
S
A
 
R
L
 
L
K
 
A
R
 
D
R
 
F
A
 
A
F
 
K
E
 
E
H
 
R
K
 
A
D
 
S
T
 
L
V
 
P
T
 
T
I
 
L
G
 
G
R
 
F
S
x
T
H
|
H
G
 
F
I
 
Q
H
 
P
A
 
A
E
 
Q
P
 
L
T
 
T
T
 
T
F
 
V
G
 
G
V
 
K
K
 
R
L
 
C
A
 
C
L
 
L
A
 
W
Y
 
I
A
 
Q
E
 
D
F
 
L
D
 
C
R
 
M
C
 
D
K
 
L
Q
 
Q
R
 
N
L
 
L
L
 
K
A
 
R
A
 
V
R
 
R
E
 
D
E
 
D
I
 
L
A
 
R
T
 
F
C
 
R
A
 
G
I
 
V
S
 
K
G
 
G
A
 
T
V
 
T
G
 
G
T
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
S
-
 
F
-
 
L
-
 
Q
-
 
L
F
 
F
A
 
E
N
 
G
I
 
D
D
 
D
P
 
H
R
 
K
V
 
V
E
 
E
E
 
Q
-
 
L
-
 
D
-
 
K
H
 
M
V
 
V
A
 
T
E
 
E
A
 
K
L
 
A
G
 
G
L
 
F
K
 
K
P
 
R
E
 
A
P
 
F
V
 
I
S
 
I
T
 
T
-
 
G
Q
|
Q
V
 
T
I
 
Y
P
 
T
R
 
R
D
 
K
R
 
V
H
 
D
A
 
I
M
 
E
Y
 
V
F
 
L
A
 
S
T
 
V
L
 
L
G
 
A
V
 
S
V
 
L
A
 
G
S
 
A
S
 
S
I
 
V
E
 
H
R
 
K
L
 
I
A
 
C
T
 
T
E
 
D
I
 
I
R
 
R
H
 
L
L
 
L
Q
 
-
R
 
-
T
 
A
E
 
N
V
 
L
L
 
K
E
 
E
A
 
M
E
 
E
E
 
E
Y
 
P
F
 
F
S
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
-
K
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
-
M
 
-
P
 
-
H
 
E
K
|
K
R
 
R
N
 
N
P
 
P
V
 
M
L
 
R
T
 
S
E
|
E
N
x
R
L
 
C
T
 
C
G
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
R
M
 
H
V
 
L
R
 
M
A
 
T
F
 
L
V
 
V
V
 
M
P
 
D
A
 
P
M
 
L
E
 
Q
N
 
T
V
 
A
A
 
S
L
 
V
-
 
Q
W
 
W
H
 
F
E
 
E
R
 
R
D
 
T
I
x
L
S
 
D
H
 
D
S
|
S
S
x
A
V
 
N
E
 
R
R
|
R
M
 
I
I
 
C
G
 
L
P
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
F
V
 
L
T
 
T
L
 
A
D
 
D
F
 
T
A
 
I
L
 
L
A
 
N
R
 
T
L
 
L
T
 
Q
G
 
N
V
 
I
I
 
S
D
 
E
K
 
G
L
 
L
L
 
V
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
D
 
K
N
 
V
M
 
I
L
 
E
K
 
R
N
 
R
M
 
I
N
 
R
K
 
Q
F
 
E
R
 
L
G
 
P
L
 
F
V
 
M
H
 
A
S
 
T
Q
 
E
R
 
N
V
 
I
L
 
I
L
 
M
A
 
A
L
 
M
T
 
V
Q
 
K

5nx9C Crystal structure of neanderthal adenylosuccinate lyase (adsl) in complex with its products amp and fumarate (see paper)
25% identity, 92% coverage: 1:399/435 of query aligns to 9:399/441 of 5nx9C

query
sites
5nx9C
M
 
L
I
 
A
S
 
S
R
|
R
Y
|
Y
S
 
A
R
 
S
P
 
P
E
 
E
M
 
M
V
 
C
A
 
F
I
 
V
W
 
F
S
 
S
P
 
D
E
 
R
T
 
Y
K
 
K
F
 
F
R
 
R
I
 
T
W
 
W
F
 
R
E
 
Q
I
 
L
E
 
W
A
 
L
H
 
W
A
 
L
C
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
E
A
 
Q
E
 
T
I
 
L
G
 
G
V
 
-
I
 
L
P
 
P
K
 
I
E
 
T
A
 
D
A
 
E
K
 
Q
T
 
I
I
 
Q
W
 
E
E
 
M
K
 
K
G
 
S
G
 
N
A
 
L
A
 
E
T
 
N
F
 
I
D
 
D
V
 
F
A
 
K
R
 
M
I
 
A
D
 
A
E
 
E
I
 
E
E
 
E
A
 
K
V
 
R
T
 
L
K
x
R
H
|
H
D
|
D
V
 
V
I
 
M
A
 
A
F
 
H
L
 
V
T
 
H
H
 
T
L
 
F
A
 
G
E
 
H
F
 
C
V
 
C
G
 
P
P
 
K
D
 
A
S
 
A
R
 
G
F
 
I
I
 
I
H
 
H
Q
 
L
G
 
G
M
 
A
T
|
T
S
|
S
S
 
C
D
 
Y
V
 
V
L
 
G
D
 
D
T
 
N
C
 
T
F
 
D
N
 
L
I
 
I
Q
 
I
L
 
L
V
 
R
R
 
N
A
 
A
T
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
P
D
 
K
L
 
L
D
 
A
K
 
R
L
 
V
L
 
I
E
 
S
A
 
R
L
 
L
K
 
A
R
 
D
R
 
F
A
 
A
F
 
K
E
 
E
H
 
R
K
 
A
D
 
S
T
 
L
V
 
P
T
 
T
I
 
L
G
 
G
R
 
F
S
x
T
H
|
H
G
 
F
I
 
Q
H
 
P
A
 
A
E
 
Q
P
 
L
T
 
T
T
 
T
F
 
V
G
 
G
V
 
K
K
 
R
L
 
C
A
 
C
L
 
L
A
 
W
Y
 
I
A
 
Q
E
 
D
F
 
L
D
 
C
R
 
M
C
 
D
K
 
L
Q
 
Q
R
 
N
L
 
L
L
 
K
A
 
R
A
 
V
R
 
R
E
 
D
E
 
D
I
 
L
A
 
R
T
 
F
C
 
R
A
 
G
I
 
V
S
 
K
G
 
G
A
 
T
V
 
T
G
 
G
T
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
S
-
 
F
-
 
L
-
 
Q
-
 
L
F
 
F
A
 
E
N
 
G
I
 
D
D
 
D
P
 
H
R
 
K
V
 
V
E
 
E
E
 
Q
-
 
L
-
 
D
-
 
K
H
 
M
V
 
V
A
 
T
E
 
E
A
 
K
L
 
A
G
 
G
L
 
F
K
 
K
P
 
R
E
 
A
P
 
F
V
 
I
S
 
I
T
 
T
-
 
G
Q
|
Q
V
 
T
I
 
Y
P
 
T
R
 
R
D
 
K
R
 
V
H
 
D
A
 
I
M
 
E
Y
 
V
F
 
L
A
 
S
T
 
V
L
 
L
G
 
A
V
 
S
V
 
L
A
 
G
S
 
A
S
 
S
I
 
V
E
 
H
R
 
K
L
 
I
A
 
C
T
 
T
E
 
D
I
 
I
R
 
R
H
 
L
L
 
L
Q
 
A
R
 
N
T
 
L
E
 
K
V
 
E
L
 
M
E
 
E
A
 
-
E
 
-
E
 
-
Y
 
-
F
 
-
S
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
-
K
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
-
M
 
-
P
 
-
H
 
E
K
 
P
R
 
R
N
 
N
P
 
P
V
x
M
L
 
R
T
 
S
E
|
E
N
x
R
L
 
C
T
 
C
G
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
R
M
 
H
V
 
L
R
 
M
A
 
T
F
 
L
V
 
V
V
 
M
P
 
D
A
 
P
M
 
L
E
 
Q
N
 
T
V
 
A
A
 
S
L
 
V
-
 
Q
W
 
W
H
 
F
E
 
E
R
 
R
D
 
T
I
x
L
S
 
D
H
 
D
S
|
S
S
x
A
V
 
N
E
 
R
R
|
R
M
 
I
I
 
C
G
 
L
P
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
F
V
 
L
T
 
T
L
 
A
D
 
D
F
 
T
A
 
I
L
 
L
A
 
N
R
 
T
L
 
L
T
 
Q
G
 
N
V
 
I
I
 
S
D
 
E
K
 
G
L
 
L
L
 
V
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
D
 
K
N
 
V
M
 
I
L
 
E
K
 
R
N
 
R
M
 
I
N
 
R
K
 
Q
F
 
E
R
 
L
G
 
P
L
 
F
V
 
M
H
 
A
S
 
T
Q
 
E
R
 
N
V
 
I
L
 
I
L
 
M
A
 
A
L
 
M
T
 
V
Q
 
H
A
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
R
 
-
E
 
E
D
 
K
A
 
I
Y
 
R
R
 
V
L
 
L
V
 
S
Q
 
Q
R
 
Q
N
 
A
A
 
A
M
 
S
K
 
V
V
 
V
W
 
K
E
 
Q
Q
 
E
G
 
G
-
 
G
-
 
D
K
 
N
D
 
D
F
 
L
L
 
I
E
 
E
E
 
R
L
 
I
L
 
Q
A
 
A
D
 
D

A0A0K2JL82 Nitrosuccinate lyase; EC 4.3.99.5 from Streptomyces cremeus (see paper)
30% identity, 78% coverage: 69:409/435 of query aligns to 91:445/476 of A0A0K2JL82

query
sites
A0A0K2JL82
T
 
T
K
 
A
H
x
N
D
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
G
F
 
L
L
 
V
T
 
A
H
 
A
L
 
L
A
 
T
E
 
A
F
 
A
V
 
V
G
 
R
P
 
R
D
 
D
-
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
A
S
 
A
R
 
E
F
 
Y
I
 
V
H
 
H
Q
 
R
G
 
G
M
 
S
T
 
T
S
 
S
S
 
Q
D
|
D
V
 
V
L
 
L
D
 
D
T
 
T
C
 
G
F
 
A
N
 
M
I
 
L
Q
 
V
L
 
A
V
 
R
R
|
R
A
 
A
T
 
L
D
x
R
L
 
L
L
 
I
L
 
G
A
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
D
K
 
R
L
 
A
L
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
A
R
 
A
R
 
L
A
 
A
F
 
A
E
 
D
H
 
H
K
 
R
D
 
D
T
 
T
V
 
P
T
 
M
I
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
T
H
 
L
G
 
A
I
 
L
H
 
H
A
 
A
E
 
V
P
 
P
T
 
T
T
 
T
F
 
F
G
 
G
V
 
L
K
 
K
L
 
A
A
 
A
L
 
G
A
 
W
Y
 
L
A
 
E
E
 
L
F
 
V
D
 
S
R
 
E
C
 
A
K
 
A
Q
 
G
R
 
R
L
 
V
L
 
A
A
 
R
A
 
L
R
|
R
E
 
D
E
 
G
I
 
L
A
 
-
T
 
P
C
 
F
A
 
S
I
 
L
S
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
A
G
 
G
T
 
T
F
 
L
A
 
A
N
 
G
I
 
Y
-
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
R
-
 
T
-
 
D
-
 
R
-
 
G
D
 
D
P
 
P
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
L
-
 
D
R
 
R
V
 
L
E
 
L
E
 
D
H
 
A
V
 
Y
A
 
A
E
 
A
A
 
E
L
 
T
G
 
G
L
 
L
K
 
A
P
 
-
E
 
R
P
 
P
V
 
V
S
 
L
T
 
P
Q
 
W
V
x
H
I
 
V
P
 
L
R
 
R
D
 
T
R
 
P
H
 
V
A
 
A
M
 
D
Y
 
L
F
 
A
A
 
A
T
 
V
L
 
L
G
 
A
V
 
F
V
 
T
A
 
A
S
 
G
S
 
A
I
 
L
E
 
G
R
 
K
L
 
I
A
 
A
T
 
V
E
 
D
I
 
V
R
 
Q
H
 
S
L
 
L
Q
 
A
R
 
R
T
 
T
E
 
E
V
 
V
L
 
A
E
 
E
A
 
V
E
 
A
E
 
E
Y
 
P
F
 
A
S
 
V
P
 
E
G
 
G
Q
 
R
K
 
G
G
 
A
S
|
S
S
 
S
A
 
A
M
 
M
P
 
P
H
 
H
K
|
K
R
 
R
N
|
N
P
 
P
V
 
V
L
 
-
T
 
-
E
 
-
N
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
L
S
 
S
R
 
T
M
 
L
V
 
I
R
 
R
-
 
S
-
 
A
A
 
A
F
 
L
V
 
Q
V
 
V
P
 
P
A
 
A
M
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
Q
-
 
C
-
 
L
-
 
V
-
 
S
-
 
E
-
 
D
-
 
E
E
x
R
N
 
S
V
 
A
A
 
G
L
 
A
W
 
W
H
 
H
E
 
A
R
 
E
D
 
W
I
 
Q
S
 
P
H
 
L
S
 
R
S
 
E
V
 
C
E
 
L
R
 
R
M
 
L
I
 
T
G
 
G
P
 
G
D
 
A
A
 
A
T
 
R
V
 
T
T
 
A
L
 
V
D
 
E
F
 
L
A
 
A
L
 
A
A
 
G
R
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
-
K
 
-
L
 
L
L
 
E
V
 
V
Y
 
D
P
 
A
D
 
A
N
 
R
M
 
M
L
 
R
K
 
A
N
 
N
M
 
L
N
 
D
K
 
L
F
 
T
R
 
D
G
 
G
L
 
R
V
 
I
H
 
V
S
 
S
Q
 
E
R
 
S
V
 
V
L
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
T
Q
 
P
A
 
L
G
 
-
V
 
L
S
 
G
R
 
R
E
 
Q
D
 
A
A
 
A
Y
 
K
R
 
E
L
 
L
V
 
L
Q
 
T
R
 
R
N
 
A
A
 
A
M
 
F
K
 
T
V
 
A
W
 
G
E
 
H
Q
 
E
G
 
G
K
 
R
D
 
T
F
 
L
L
 
G
E
 
E
E
 
V
L
 
L
L
 
G
A
 
E
D
 
L
T
 
P
E
 
E
V
 
L
R
 
D
A
 
G
A
 
V
L
 
L
S
 
P
E
 
K
E
 
E

P0AB89 Adenylosuccinate lyase; ASL; Adenylosuccinase; ASase; EC 4.3.2.2 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
31% identity, 76% coverage: 19:349/435 of query aligns to 34:379/456 of P0AB89

query
sites
P0AB89
K
 
K
F
 
F
R
 
R
I
 
V
W
 
Q
F
 
V
E
 
E
I
 
V
E
 
R
-
 
W
A
 
L
H
 
Q
A
 
K
C
 
L
D
 
A
A
 
A
L
 
H
A
 
A
E
 
A
I
 
I
G
 
K
V
 
E
I
 
V
P
 
P
K
 
A
E
 
F
A
 
A
A
 
A
K
 
D
T
 
A
I
 
I
-
 
G
W
 
Y
E
 
L
K
 
D
G
 
A
G
 
I
A
 
V
A
 
A
T
 
S
F
 
F
-
 
S
-
 
E
-
 
E
D
 
D
V
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
I
D
 
K
E
 
T
I
 
I
E
 
E
A
 
R
V
 
T
T
 
T
K
x
N
H
|
H
D
|
D
V
 
V
I
x
K
A
 
A
F
 
V
L
 
E
T
 
Y
H
 
F
L
 
L
A
 
K
E
 
E
F
 
K
V
 
V
G
 
A
-
 
E
-
 
I
P
 
P
D
 
E
-
 
L
-
 
H
-
 
A
-
 
V
S
 
S
R
 
E
F
 
F
I
 
I
H
 
H
Q
 
F
G
 
A
M
 
C
T
|
T
S
|
S
S
 
E
D
 
D
V
 
I
L
 
N
D
 
N
T
 
L
C
 
S
F
 
H
N
 
A
I
 
L
Q
 
M
L
 
L
V
 
K
R
 
T
A
 
A
T
 
R
D
 
D
-
 
E
L
 
V
L
 
I
L
 
L
A
 
P
D
 
Y
L
 
W
D
 
R
K
 
Q
L
 
L
L
 
I
E
 
D
A
 
G
L
 
I
K
 
K
R
 
D
R
 
L
A
 
A
F
 
V
E
 
Q
H
 
Y
K
 
R
D
 
D
T
 
I
V
 
P
T
 
L
I
 
L
G
 
S
R
 
R
S
 
T
H
|
H
G
 
G
I
 
Q
H
 
P
A
 
A
E
 
T
P
 
P
T
 
S
T
 
T
F
 
I
G
 
G
V
 
K
K
 
E
L
 
M
A
 
A
L
 
N
A
 
V
Y
 
A
A
 
Y
E
 
R
F
 
M
D
 
E
R
 
R
C
 
Q
K
 
Y
Q
 
R
R
 
Q
L
 
L
L
 
-
A
 
-
A
 
N
R
 
Q
E
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
-
T
 
L
C
 
G
A
 
K
I
 
I
S
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
N
F
 
Y
-
 
N
A
 
A
N
 
H
I
 
I
D
 
A
-
 
A
-
 
Y
P
 
P
R
 
E
V
 
V
E
 
D
E
 
W
H
 
H
-
 
Q
-
 
F
-
 
S
-
 
E
-
 
E
V
 
F
A
 
V
E
 
T
A
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
I
K
 
Q
P
 
W
E
 
N
P
 
P
V
 
Y
S
 
T
T
 
T
Q
|
Q
V
 
I
I
 
E
P
 
P
R
 
H
D
 
D
R
 
Y
H
 
I
A
 
A
M
 
E
Y
 
L
F
 
F
-
 
D
-
 
C
-
 
V
A
 
A
T
 
R
L
 
F
G
 
N
V
 
T
V
 
I
A
 
L
S
 
I
S
 
D
I
 
F
E
 
D
R
 
R
L
 
D
A
 
V
-
 
W
-
 
G
-
 
Y
T
 
I
E
 
A
I
 
L
R
 
N
H
 
H
L
 
F
Q
 
K
R
 
Q
T
 
K
E
 
T
V
 
I
L
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
Y
 
-
F
 
-
S
 
-
P
 
A
G
 
G
Q
 
E
K
 
I
G
 
G
S
|
S
S
|
S
A
 
T
M
 
M
P
 
P
H
 
H
K
|
K
R
x
V
N
|
N
P
 
P
V
 
I
L
 
D
T
 
F
E
 
E
N
|
N
L
 
S
T
 
E
-
 
G
-
 
N
-
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
R
 
N
M
 
A
V
 
V
R
 
L
A
 
Q
F
 
H
V
 
L
V
 
A
P
 
S
A
 
K
M
 
L
E
 
P
N
 
-
V
 
V
A
 
S
L
 
R
W
 
W
H
 
-
E
 
Q
R
|
R
D
 
D
I
 
L
S
 
T
H
 
D
S
|
S
S
x
T
V
|
V
E
x
L
R
|
R
M
 
N
I
 
L
G
 
G
P
 
V
D
 
G
A
 
I
T
 
G
V
 
Y
T
 
A
L
 
L
D
 
I
F
 
A
A
 
Y
L
 
Q
A
 
S
R
 
T
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
I
 
-
D
 
S
K
|
K
L
 
L
L
 
E
V
 
V
Y
 
N
P
 
R
D
 
D
N
 
H
M
 
L
L
 
L
K
 
D
N
 
E
M
 
L
N
 
D

Sites not aligning to the query:

3gzhA Crystal structure of phosphate-bound adenylosuccinate lyase from e. Coli (see paper)
31% identity, 76% coverage: 19:349/435 of query aligns to 47:392/469 of 3gzhA

query
sites
3gzhA
K
 
K
F
 
F
R
 
R
I
 
V
W
 
Q
F
 
V
E
 
E
I
 
V
E
 
R
-
 
W
A
 
L
H
 
Q
A
 
K
C
 
L
D
 
A
A
 
A
L
 
H
A
 
A
E
 
A
I
 
I
G
 
K
V
 
E
I
 
V
P
 
P
K
 
A
E
 
F
A
 
A
A
 
A
K
 
D
T
 
A
I
 
I
-
 
G
W
 
Y
E
 
L
K
 
D
G
 
A
G
 
I
A
 
V
A
 
A
T
 
N
F
 
F
-
 
S
-
 
E
-
 
E
D
 
D
V
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
I
D
 
K
E
 
T
I
 
I
E
 
E
A
 
R
V
 
T
T
 
T
K
 
N
H
|
H
D
 
D
V
 
V
I
 
K
A
 
A
F
 
V
L
 
E
T
 
Y
H
 
F
L
 
L
A
 
K
E
 
E
F
 
K
V
 
V
G
 
A
-
 
E
-
 
I
P
 
P
D
 
E
-
 
L
-
 
H
-
 
A
-
 
V
S
 
S
R
 
E
F
 
F
I
 
I
H
 
H
Q
 
F
G
 
A
M
 
C
T
|
T
S
|
S
S
 
E
D
 
D
V
 
I
L
 
N
D
 
N
T
 
L
C
 
S
F
 
H
N
 
A
I
 
L
Q
 
M
L
 
L
V
 
K
R
 
T
A
 
A
T
 
R
D
 
D
-
 
E
L
 
V
L
 
I
L
 
L
A
 
P
D
 
Y
L
 
W
D
 
R
K
 
Q
L
 
L
L
 
I
E
 
D
A
 
G
L
 
I
K
 
K
R
 
D
R
 
L
A
 
A
F
 
V
E
 
Q
H
 
Y
K
 
R
D
 
D
T
 
I
V
 
P
T
 
L
I
 
L
G
 
S
R
 
R
S
x
T
H
|
H
G
 
G
I
 
Q
H
 
P
A
 
A
E
 
T
P
 
P
T
 
S
T
 
T
F
 
I
G
 
G
V
 
K
K
 
E
L
 
M
A
 
A
L
 
N
A
 
V
Y
 
A
A
 
Y
E
 
R
F
 
M
D
 
E
R
 
R
C
 
Q
K
 
Y
Q
 
R
R
 
Q
L
 
L
L
 
-
A
 
-
A
 
N
R
 
Q
E
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
-
T
 
L
C
 
G
A
 
K
I
 
I
S
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
N
F
 
Y
-
 
N
A
 
A
N
 
H
I
 
I
D
 
A
-
 
A
-
 
Y
P
 
P
R
 
E
V
 
V
E
 
D
E
 
W
H
 
H
-
 
Q
-
 
F
-
 
S
-
 
E
-
 
E
V
 
F
A
 
V
E
 
T
A
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
I
K
 
Q
P
 
W
E
 
N
P
 
P
V
 
Y
S
 
T
T
 
T
Q
 
Q
V
 
I
I
 
E
P
 
P
R
 
H
D
 
D
R
 
Y
H
 
I
A
 
A
M
 
E
Y
 
L
F
 
F
-
 
D
-
 
C
-
 
V
A
 
A
T
 
R
L
 
F
G
 
N
V
 
T
V
 
I
A
 
L
S
 
I
S
 
D
I
 
F
E
 
D
R
 
R
L
 
D
A
 
V
-
 
W
-
 
G
-
 
Y
T
 
I
E
 
A
I
 
L
R
 
N
H
 
H
L
 
F
Q
 
K
R
 
Q
T
 
K
E
 
T
V
 
I
L
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
Y
 
-
F
 
-
S
 
-
P
 
A
G
 
G
Q
 
E
K
 
I
G
 
G
S
 
S
S
|
S
A
 
T
M
 
M
P
 
P
H
 
H
K
|
K
R
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
I
L
 
D
T
 
F
E
|
E
N
 
N
L
 
S
T
 
E
-
 
G
-
 
N
-
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
R
 
N
M
 
A
V
 
V
R
 
L
A
 
Q
F
 
H
V
 
L
V
 
A
P
 
S
A
 
K
M
 
L
E
 
P
N
 
-
V
 
V
A
 
S
L
 
R
W
 
W
H
 
-
E
 
Q
R
 
R
D
 
D
I
 
L
S
 
T
H
 
D
S
|
S
S
x
T
V
 
V
E
 
L
R
|
R
M
 
N
I
 
L
G
 
G
P
 
V
D
 
G
A
 
I
T
 
G
V
 
Y
T
 
A
L
 
L
D
 
I
F
 
A
A
 
Y
L
 
Q
A
 
S
R
 
T
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
I
 
-
D
 
S
K
 
K
L
 
L
L
 
E
V
 
V
Y
 
N
P
 
R
D
 
D
N
 
H
M
 
L
L
 
L
K
 
D
N
 
E
M
 
L
N
 
D

2ptqA Crystal structure of escherichia coli adenylosuccinate lyase mutant h171n with bound amp and fumarate (see paper)
31% identity, 76% coverage: 19:349/435 of query aligns to 34:379/459 of 2ptqA

query
sites
2ptqA
K
 
K
F
 
F
R
 
R
I
 
V
W
 
Q
F
 
V
E
 
E
I
 
V
E
 
R
-
 
W
A
 
L
H
 
Q
A
 
K
C
 
L
D
 
A
A
 
A
L
 
H
A
 
A
E
 
A
I
 
I
G
 
K
V
 
E
I
 
V
P
 
P
K
 
A
E
 
F
A
 
A
A
 
A
K
 
D
T
 
A
I
 
I
-
 
G
W
 
Y
E
 
L
K
 
D
G
 
A
G
 
I
A
 
V
A
 
A
T
 
S
F
 
F
-
 
S
-
 
E
-
 
E
D
 
D
V
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
I
D
 
K
E
 
T
I
 
I
E
 
E
A
 
R
V
 
T
T
 
T
K
x
N
H
|
H
D
 
D
V
 
V
I
 
K
A
 
A
F
 
V
L
 
E
T
 
Y
H
 
F
L
 
L
A
 
K
E
 
E
F
 
K
V
 
V
G
 
A
-
 
E
-
 
I
P
 
P
D
 
E
-
 
L
-
 
H
-
 
A
-
 
V
S
 
S
R
 
E
F
 
F
I
 
I
H
 
H
Q
 
F
G
 
A
M
 
C
T
|
T
S
|
S
S
 
E
D
 
D
V
 
I
L
 
N
D
 
N
T
 
L
C
 
S
F
 
H
N
 
A
I
 
L
Q
 
M
L
 
L
V
 
K
R
 
T
A
 
A
T
 
R
D
 
D
-
 
E
L
 
V
L
 
I
L
 
L
A
 
P
D
 
Y
L
 
W
D
 
R
K
 
Q
L
 
L
L
 
I
E
 
D
A
 
G
L
 
L
K
 
K
R
 
D
R
 
L
A
 
A
F
 
V
E
 
Q
H
 
Y
K
 
R
D
 
D
T
 
I
V
 
P
T
 
L
I
 
L
G
 
S
R
 
R
S
x
T
H
x
N
G
 
G
I
 
Q
H
 
P
A
 
A
E
 
T
P
 
P
T
 
S
T
 
T
F
 
I
G
 
G
V
 
K
K
 
E
L
 
M
A
 
A
L
 
N
A
 
V
Y
 
A
A
 
Y
E
 
R
F
 
M
D
 
E
R
 
R
C
 
Q
K
 
Y
Q
 
R
R
 
Q
L
 
L
L
 
-
A
 
-
A
 
N
R
 
Q
E
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
-
T
 
L
C
 
G
A
 
K
I
 
I
S
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
N
F
 
Y
-
 
N
A
 
A
N
 
H
I
 
I
D
 
A
-
 
A
-
 
Y
P
 
P
R
 
E
V
 
V
E
 
D
E
 
W
H
 
H
-
 
Q
-
 
F
-
 
S
-
 
E
-
 
E
V
 
F
A
 
V
E
 
T
A
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
I
K
 
Q
P
 
W
E
 
N
P
 
P
V
 
Y
S
 
T
T
 
T
Q
|
Q
V
 
I
I
 
E
P
 
P
R
 
H
D
 
D
R
 
Y
H
 
I
A
 
A
M
 
E
Y
 
L
F
 
F
-
 
D
-
 
C
-
 
V
A
 
A
T
 
R
L
 
F
G
 
N
V
 
T
V
 
I
A
 
L
S
 
I
S
 
D
I
 
F
E
 
D
R
 
R
L
 
D
A
 
V
-
 
W
-
 
G
-
 
Y
T
 
I
E
 
A
I
 
L
R
 
N
H
 
H
L
 
F
Q
 
K
R
 
Q
T
 
K
E
 
T
V
 
I
L
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
Y
 
-
F
 
-
S
 
-
P
 
A
G
 
G
Q
 
E
K
 
I
G
 
G
S
|
S
S
|
S
A
 
T
M
|
M
P
 
P
H
 
H
K
|
K
R
 
V
N
|
N
P
 
P
V
 
I
L
 
D
T
 
F
E
|
E
N
|
N
L
 
S
T
 
E
-
 
G
-
 
N
-
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
R
 
N
M
 
A
V
 
V
R
 
L
A
 
Q
F
 
H
V
 
L
V
 
A
P
 
S
A
 
K
M
 
L
E
 
P
N
 
-
V
 
V
A
 
S
L
 
R
W
 
W
H
 
-
E
 
Q
R
|
R
D
 
D
I
x
L
S
 
T
H
 
D
S
|
S
S
x
T
V
 
V
E
 
L
R
|
R
M
 
N
I
 
L
G
 
G
P
 
V
D
 
G
A
 
I
T
 
G
V
 
Y
T
 
A
L
 
L
D
 
I
F
 
A
A
 
Y
L
 
Q
A
 
S
R
 
T
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
I
 
-
D
 
S
K
 
K
L
 
L
L
 
E
V
 
V
Y
 
N
P
 
R
D
 
D
N
 
H
M
 
L
L
 
L
K
 
D
N
 
E
M
 
L
N
 
D

Sites not aligning to the query:

2ptrA Crystal structure of escherichia coli adenylosuccinate lyase mutant h171a with bound adenylosuccinate substrate (see paper)
31% identity, 76% coverage: 19:349/435 of query aligns to 34:379/454 of 2ptrA

query
sites
2ptrA
K
 
K
F
 
F
R
 
R
I
 
V
W
 
Q
F
 
V
E
 
E
I
 
V
E
 
R
-
 
W
A
 
L
H
 
Q
A
 
K
C
 
L
D
 
A
A
 
A
L
 
H
A
 
A
E
 
A
I
 
I
G
 
K
V
 
E
I
 
V
P
 
P
K
 
A
E
 
F
A
 
A
A
 
A
K
 
D
T
 
A
I
 
I
-
 
G
W
 
Y
E
 
L
K
 
D
G
 
A
G
 
I
A
 
V
A
 
A
T
 
S
F
 
F
-
 
S
-
 
E
-
 
E
D
 
D
V
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
I
D
 
K
E
 
T
I
 
I
E
 
E
A
 
R
V
 
T
T
 
T
K
 
N
H
|
H
D
|
D
V
 
V
I
 
K
A
 
A
F
 
V
L
 
E
T
 
Y
H
 
F
L
 
L
A
 
K
E
 
E
F
 
K
V
 
V
G
 
A
-
 
E
-
 
I
P
 
P
D
 
E
-
 
L
-
 
H
-
 
A
-
 
V
S
 
S
R
 
E
F
 
F
I
 
I
H
 
H
Q
 
F
G
 
A
M
 
C
T
|
T
S
|
S
S
 
E
D
 
D
V
 
I
L
 
N
D
 
N
T
 
L
C
 
S
F
 
H
N
 
A
I
 
L
Q
 
M
L
 
L
V
 
K
R
 
T
A
 
A
T
 
R
D
 
D
-
 
E
L
 
V
L
 
I
L
 
L
A
 
P
D
 
Y
L
 
W
D
 
R
K
 
Q
L
 
L
L
 
I
E
 
D
A
 
G
L
 
L
K
 
K
R
 
D
R
 
L
A
 
A
F
 
V
E
 
Q
H
 
Y
K
 
R
D
 
D
T
 
I
V
 
P
T
 
L
I
 
L
G
 
S
R
 
R
S
x
T
H
x
A
G
 
G
I
 
Q
H
 
P
A
 
A
E
 
T
P
 
P
T
 
S
T
 
T
F
 
I
G
 
G
V
 
K
K
 
E
L
 
M
A
 
A
L
 
N
A
 
V
Y
 
A
A
 
Y
E
 
R
F
 
M
D
 
E
R
 
R
C
 
Q
K
 
Y
Q
 
R
R
 
Q
L
 
L
L
 
-
A
 
-
A
 
N
R
 
Q
E
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
-
T
 
L
C
 
G
A
 
K
I
 
I
S
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
N
F
 
Y
-
 
N
A
 
A
N
 
H
I
 
I
D
 
A
-
 
A
-
 
Y
P
 
P
R
 
E
V
 
V
E
 
D
E
 
W
H
 
H
-
 
Q
-
 
F
-
 
S
-
 
E
-
 
E
V
 
F
A
 
V
E
 
T
A
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
I
K
 
Q
P
 
W
E
 
N
P
 
P
V
 
Y
S
 
T
T
 
T
Q
|
Q
V
 
I
I
 
E
P
 
P
R
 
H
D
 
D
R
 
Y
H
 
I
A
 
A
M
 
E
Y
 
L
F
 
F
-
 
D
-
 
C
-
 
V
A
 
A
T
 
R
L
 
F
G
 
N
V
 
T
V
 
I
A
 
L
S
 
I
S
 
D
I
 
F
E
 
D
R
 
R
L
 
D
A
 
V
-
 
W
-
 
G
-
 
Y
T
 
I
E
 
A
I
 
L
R
 
N
H
 
H
L
 
F
Q
 
K
R
 
Q
T
 
K
E
 
T
V
 
I
L
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
Y
 
-
F
 
-
S
 
-
P
 
A
G
 
G
Q
 
E
K
 
I
G
 
G
S
|
S
S
|
S
A
 
T
M
|
M
P
 
P
H
 
H
K
|
K
R
 
V
N
|
N
P
 
P
V
 
I
L
 
D
T
 
F
E
|
E
N
|
N
L
 
S
T
 
E
-
 
G
-
 
N
-
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
R
 
N
M
 
A
V
 
V
R
 
L
A
 
Q
F
 
H
V
 
L
V
 
A
P
 
S
A
 
K
M
 
L
E
 
P
N
 
-
V
 
V
A
 
S
L
 
R
W
 
W
H
 
-
E
 
Q
R
|
R
D
 
D
I
x
L
S
 
T
H
 
D
S
|
S
S
x
T
V
 
V
E
 
L
R
|
R
M
 
N
I
 
L
G
 
G
P
 
V
D
 
G
A
 
I
T
 
G
V
 
Y
T
 
A
L
 
L
D
 
I
F
 
A
A
 
Y
L
 
Q
A
 
S
R
 
T
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
I
 
-
D
 
S
K
 
K
L
 
L
L
 
E
V
 
V
Y
 
N
P
 
R
D
 
D
N
 
H
M
 
L
L
 
L
K
 
D
N
 
E
M
 
L
N
 
D

Sites not aligning to the query:

5xnzA Crystal structure of cred complex with fumarate (see paper)
29% identity, 78% coverage: 69:409/435 of query aligns to 77:414/439 of 5xnzA

query
sites
5xnzA
T
 
T
K
 
A
H
x
N
D
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
G
F
 
L
L
 
V
T
 
A
H
 
A
L
 
L
A
 
T
E
 
A
F
 
A
V
 
V
G
 
R
P
 
R
D
 
D
-
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
A
S
 
A
R
 
E
F
 
Y
I
 
V
H
 
H
Q
 
R
G
 
G
M
 
S
T
 
T
S
 
S
S
 
Q
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
D
T
 
T
C
 
G
F
 
A
N
 
M
I
 
L
Q
 
V
L
 
A
V
 
R
R
|
R
A
 
A
T
 
L
D
x
R
L
 
L
L
 
I
L
 
G
A
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
D
K
 
R
L
 
A
L
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
A
R
 
A
R
 
L
A
 
A
F
 
A
E
 
D
H
 
H
K
 
R
D
 
D
T
 
T
V
 
P
T
 
M
I
 
A
G
 
G
R
 
R
S
x
T
H
x
L
G
 
A
I
 
L
H
 
H
A
 
A
E
 
V
P
 
P
T
 
T
T
 
T
F
 
F
G
 
G
V
 
L
K
 
K
L
 
A
A
 
A
L
 
G
A
 
W
Y
 
L
A
 
E
E
 
L
F
 
V
D
 
S
R
 
E
C
 
A
K
 
A
Q
 
G
R
 
R
L
 
V
L
 
A
A
 
R
A
 
L
R
|
R
E
 
D
E
 
G
I
 
L
A
 
-
T
 
P
C
 
F
A
 
S
I
 
L
S
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
A
G
 
G
T
 
T
F
 
L
A
 
A
N
 
G
-
 
Y
I
 
F
D
 
D
P
 
P
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
L
-
 
D
R
 
R
V
 
L
E
 
L
E
 
D
H
 
A
V
 
Y
A
 
A
E
 
A
A
 
E
L
 
T
G
 
G
L
 
L
K
 
A
P
 
-
E
 
R
P
 
P
V
 
V
S
 
L
T
 
P
Q
 
W
V
 
H
I
 
V
P
 
L
R
 
R
D
 
T
R
 
P
H
 
V
A
 
A
M
 
D
Y
 
L
F
 
A
A
 
A
T
 
V
L
 
L
G
 
A
V
 
F
V
 
T
A
 
A
S
 
G
S
 
A
I
 
L
E
 
G
R
 
K
L
 
I
A
 
A
T
 
V
E
 
D
I
 
V
R
 
Q
H
 
S
L
 
L
Q
 
A
R
 
R
T
 
T
E
 
E
V
 
V
L
 
A
E
 
E
A
 
V
E
 
A
E
 
E
Y
 
-
F
 
-
S
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
-
K
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
P
M
 
A
P
 
P
H
 
H
K
|
K
R
 
R
N
|
N
P
 
P
V
 
V
L
 
-
T
 
-
E
 
-
N
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
L
S
 
S
R
x
T
M
 
L
V
 
I
R
 
R
-
 
S
-
 
A
A
 
A
F
 
L
V
 
Q
V
 
V
P
 
P
A
 
A
M
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
Q
-
 
C
-
 
L
-
 
V
-
 
S
-
 
E
-
 
D
-
 
E
E
 
R
N
 
S
V
 
A
A
 
G
L
 
A
W
 
W
H
 
H
E
 
A
R
 
E
D
 
W
I
 
Q
S
 
P
H
 
L
S
 
R
S
 
E
V
 
C
E
 
L
R
 
R
M
 
L
I
 
T
G
 
G
P
 
G
D
 
A
A
 
A
T
 
R
V
 
T
T
 
A
L
 
V
D
 
E
F
 
L
A
 
A
L
 
A
A
 
G
R
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
-
K
 
-
L
 
L
L
 
E
V
 
V
Y
 
D
P
 
A
D
 
A
N
 
R
M
 
M
L
 
R
K
 
A
N
 
N
M
 
L
N
 
D
K
 
L
F
 
T
R
 
D
G
 
G
L
 
R
V
 
I
H
 
V
S
 
S
Q
 
E
R
 
S
V
 
V
L
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
T
Q
 
P
A
 
L
G
 
-
V
 
L
S
 
G
R
 
R
E
 
Q
D
 
A
A
 
A
Y
 
K
R
 
E
L
 
L
V
 
L
Q
 
T
R
 
R
N
 
A
A
 
A
M
 
F
K
 
T
V
 
A
W
 
G
E
 
H
Q
 
E
G
 
G
K
 
R
D
 
T
F
 
L
L
 
G
E
 
E
E
 
V
L
 
L
L
 
G
A
 
E
D
 
L
T
 
P
E
 
E
V
 
L
R
 
D
A
 
G
A
 
V
L
 
L
S
 
P
E
 
K
E
 
E

Query Sequence

>SMc00508 FitnessBrowser__Smeli:SMc00508
MISRYSRPEMVAIWSPETKFRIWFEIEAHACDALAEIGVIPKEAAKTIWEKGGAATFDVA
RIDEIEAVTKHDVIAFLTHLAEFVGPDSRFIHQGMTSSDVLDTCFNIQLVRATDLLLADL
DKLLEALKRRAFEHKDTVTIGRSHGIHAEPTTFGVKLALAYAEFDRCKQRLLAAREEIAT
CAISGAVGTFANIDPRVEEHVAEALGLKPEPVSTQVIPRDRHAMYFATLGVVASSIERLA
TEIRHLQRTEVLEAEEYFSPGQKGSSAMPHKRNPVLTENLTGLSRMVRAFVVPAMENVAL
WHERDISHSSVERMIGPDATVTLDFALARLTGVIDKLLVYPDNMLKNMNKFRGLVHSQRV
LLALTQAGVSREDAYRLVQRNAMKVWEQGKDFLEELLADTEVRAALSEEDIREKFDLGYH
TKHVDTIFRRVFGSV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory