SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMc00797 FitnessBrowser__Smeli:SMc00797 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 18 hits to proteins with known functional sites (download)

6pxsA Crystal structure of iminodiacetate oxidase (idaa) from chelativorans sp. Bnc1 (see paper)
24% identity, 98% coverage: 5:412/417 of query aligns to 3:365/370 of 6pxsA

query
sites
6pxsA
V
 
V
V
 
L
V
 
I
L
 
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
I
|
I
V
 
L
G
 
G
I
 
A
S
 
S
S
 
A
A
 
A
I
 
Y
H
 
H
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
A
S
 
Q
V
 
V
V
 
E
L
 
I
L
 
I
D
|
D
R
 
Q
R
x
N
G
x
H
A
 
P
G
 
G
E
x
K
E
x
A
T
|
T
S
 
L
Y
x
A
G
|
G
N
 
-
A
|
A
G
|
G
L
x
V
I
 
-
Q
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
V
F
 
C
P
 
P
Y
 
W
G
 
A
F
 
T
P
 
E
H
 
A
N
 
D
F
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
R
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
N
 
-
T
 
-
I
 
-
D
 
D
A
 
P
S
 
D
Y
 
W
H
 
Y
F
 
L
R
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
Y
 
-
W
 
-
W
 
-
H
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
-
T
 
-
Q
 
L
H
 
Y
Q
 
A
K
 
R
I
 
G
A
 
A
H
 
R
L
 
Y
Y
 
Y
A
 
G
P
 
T
L
 
L
I
 
I
E
 
E
H
 
E
S
 
L
I
 
R
A
 
G
E
 
Q
H
 
G
Q
 
E
D
 
T
L
 
E
I
 
L
D
 
G
A
 
Y
S
 
S
G
 
R
A
 
V
G
 
G
D
 
A
L
 
L
I
 
V
R
 
L
K
 
A
D
 
E
G
 
D
W
 
R
M
 
A
K
 
R
V
 
L
F
 
D
R
 
T
T
 
I
E
 
E
K
 
G
E
 
R
R
 
I
D
 
S
A
 
R
A
 
R
Y
 
I
K
 
K
D
 
D
A
 
A
E
 
P
R
 
E
L
 
A
S
 
G
A
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
T
H
 
V
Q
 
R
K
 
R
L
 
L
S
 
G
T
 
A
S
 
G
E
 
E
L
 
A
K
 
K
T
 
R
I
 
L
E
 
F
P
 
P
S
 
P
I
 
L
Q
 
R
A
 
D
E
 
D
L
 
L
A
 
E
G
 
A
G
 
-
L
 
-
R
 
-
W
 
I
T
 
H
D
 
I
P
 
P
W
 
G
S
 
G
I
 
A
R
 
R
D
 
V
P
 
D
H
 
G
S
 
R
L
 
L
N
 
L
K
 
A
A
 
A
Y
 
S
L
 
M
A
 
L
Y
 
R
F
 
V
Q
 
A
S
 
I
L
 
S
G
 
S
G
 
G
R
 
A
L
 
T
V
 
L
S
 
R
G
 
N
D
 
D
A
x
Y
A
 
V
T
 
S
L
 
L
E
 
-
H
 
R
I
 
L
L
 
N
E
 
D
G
 
G
A
 
R
G
 
A
W
 
E
R
 
C
V
 
L
A
 
G
T
 
S
P
 
D
D
 
G
G
 
R
P
 
P
L
 
I
E
 
P
A
 
A
R
 
D
E
 
E
V
 
I
V
 
I
V
 
V
A
 
T
L
x
A
G
 
G
P
 
A
W
|
W
A
 
A
D
 
A
T
 
Q
V
x
I
T
 
L
R
 
A
K
 
L
L
 
L
G
 
G
Y
 
L
H
 
R
F
 
H
P
 
P
L
 
V
A
 
V
V
 
P
K
 
Q
R
 
K
G
 
G
Y
 
Q
H
 
I
M
 
I
H
 
H
Y
 
L
G
 
H
I
 
L
R
 
-
E
 
P
G
 
G
A
 
V
Q
 
A
L
 
T
N
 
S
N
 
G
W
 
W
-
 
P
-
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
P
A
 
M
E
 
N
K
 
S
G
 
Y
Y
|
Y
F
 
M
L
 
L
A
 
A
-
 
F
-
 
D
-
 
D
-
 
S
P
 
R
M
 
V
L
 
V
R
 
V
G
 
G
I
 
A
R
 
T
L
 
R
T
 
E
T
 
D
G
 
G
A
 
S
E
 
G
F
 
F
A
 
D
L
 
Y
R
 
R
D
 
V
A
 
T
P
 
A
K
 
R
T
 
G
P
 
Q
V
 
L
Q
 
E
L
 
V
T
 
L
R
 
Q
A
 
A
E
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
G
R
 
L
E
 
G
F
 
I
F
 
A
P
 
P
-
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
D
R
 
A
R
 
T
D
 
H
E
 
I
E
 
E
P
 
T
W
 
R
M
 
V
G
|
G
A
 
F
R
|
R
P
 
P
C
 
A
T
 
G
P
 
S
D
 
A
M
 
M
M
 
R
P
 
P
V
 
I
I
 
L
G
 
G
K
 
R
A
 
V
P
 
P
R
 
Q
H
 
I
E
 
A
G
 
G
L
 
L
W
 
T
F
 
I
A
 
G
F
 
N
G
 
G
H
 
L
A
x
G
H
x
A
H
x
S
G
|
G
M
x
L
T
|
T
L
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
F
T
 
A
G
 
G
R
 
H
A
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
G
A
 
V
M
 
V
T
 
M
G
 
G
E
 
E
K
 
P
P
 
A
V
 
E
I
 
V
D
 
P
I
 
L
T
 
E
P
 
R
Y
 
Y
R
 
S
P
 
P

3if9A Crystal structure of glycine oxidase g51s/a54r/h244a mutant in complex with inhibitor glycolate (see paper)
25% identity, 59% coverage: 170:414/417 of query aligns to 121:363/364 of 3if9A

query
sites
3if9A
S
 
S
T
 
K
S
 
E
E
 
E
L
 
V
K
 
L
T
 
E
I
 
K
E
 
E
P
 
P
S
 
Y
I
 
A
Q
 
S
A
 
G
E
 
D
L
 
I
A
 
F
G
 
G
G
 
A
L
 
S
R
 
F
W
 
I
T
 
Q
D
 
D
P
 
D
W
 
V
S
 
H
I
 
V
R
 
-
D
 
E
P
 
P
H
 
Y
S
 
F
L
 
V
N
 
C
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
L
 
V
A
 
K
Y
 
A
F
 
A
Q
 
K
S
 
M
L
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
E
L
 
I
V
 
F
S
 
E
G
 
-
D
 
H
A
 
T
A
x
P
T
x
V
L
 
L
E
 
H
H
 
V
I
 
E
L
 
R
E
 
D
G
 
G
A
 
E
G
 
A
W
 
L
R
 
F
V
 
I
A
 
K
T
 
T
P
 
P
D
 
S
G
 
G
P
 
D
L
 
V
E
 
W
A
 
A
R
 
N
E
 
H
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
L
x
S
G
|
G
P
 
V
W
|
W
A
 
S
D
 
G
T
 
M
V
x
F
T
 
F
R
 
K
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
Y
 
L
H
 
N
F
 
N
P
 
A
L
 
F
A
 
L
V
 
P
K
 
V
R
 
K
G
 
G
Y
 
E
H
 
C
M
 
L
H
 
S
Y
 
V
G
 
W
I
 
N
R
 
D
E
 
D
G
 
I
A
 
P
Q
 
L
L
 
T
N
 
K
N
 
T
W
 
L
V
 
Y
L
 
H
D
 
D
A
 
A
E
 
-
K
 
-
G
 
-
Y
 
C
F
x
Y
L
 
I
A
 
V
P
 
P
M
 
R
L
 
K
R
 
S
G
 
G
I
 
-
R
 
R
L
 
L
T
 
V
T
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
T
F
 
M
A
 
K
L
 
P
R
 
G
D
 
D
A
 
W
P
 
S
K
 
E
T
 
T
P
 
P
V
 
D
Q
 
L
-
 
G
-
 
G
L
 
L
T
 
E
R
 
S
A
 
V
E
 
M
R
 
K
V
 
K
A
 
A
R
 
K
E
 
T
F
 
M
F
 
L
P
 
P
-
 
A
L
 
I
A
 
Q
E
 
N
R
 
M
R
 
K
D
 
V
E
 
D
E
 
R
P
 
F
W
 
W
M
 
A
G
|
G
A
 
L
R
|
R
P
 
P
C
 
G
T
 
T
P
 
K
D
 
D
M
 
G
M
 
K
P
 
P
V
 
Y
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
H
P
 
P
R
 
E
H
 
D
E
 
S
G
 
R
L
 
I
W
 
L
F
 
F
A
 
A
F
 
A
G
 
G
H
|
H
A
x
F
H
x
R
H
x
N
G
|
G
M
x
I
T
 
L
L
 
L
G
 
A
P
 
P
V
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
A
A
 
L
L
 
I
A
 
S
Q
 
D
A
 
L
M
 
I
T
 
M
G
 
N
E
 
K
K
 
E
P
 
V
V
 
N
I
 
Q
D
 
D
-
 
W
I
 
L
T
 
H
P
 
A
Y
 
F
R
 
R
P
 
I
E
 
D
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1ng3A Complex of thio (glycine oxidase) with acetyl-glycine (see paper)
26% identity, 59% coverage: 170:414/417 of query aligns to 121:363/364 of 1ng3A

query
sites
1ng3A
S
 
S
T
 
K
S
 
E
E
 
E
L
 
V
K
 
L
T
 
E
I
 
K
E
 
E
P
 
P
S
 
Y
I
 
A
Q
 
S
A
 
G
E
 
D
L
 
I
A
 
F
G
 
G
G
 
A
L
 
S
R
 
F
W
 
I
T
 
Q
D
 
D
P
 
D
W
 
V
S
 
H
I
 
V
R
 
-
D
 
E
P
 
P
H
 
Y
S
 
F
L
 
V
N
 
C
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
L
 
V
A
 
K
Y
 
A
F
 
A
Q
 
K
S
 
M
L
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
E
L
 
I
V
 
F
S
 
E
G
 
-
D
 
H
A
 
T
A
 
P
T
x
V
L
 
L
E
 
H
H
 
V
I
 
E
L
 
R
E
 
D
G
 
G
A
 
E
G
 
A
W
 
L
R
 
F
V
 
I
A
 
K
T
 
T
P
 
P
D
 
S
G
 
G
P
 
D
L
 
V
E
 
W
A
 
A
R
 
N
E
 
H
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
L
x
S
G
|
G
P
 
V
W
|
W
A
 
S
D
 
G
T
 
M
V
x
F
T
 
F
R
 
K
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
Y
 
L
H
 
N
F
 
N
P
 
A
-
 
F
L
 
L
A
 
P
V
 
V
K
 
K
R
 
-
G
 
-
Y
 
-
H
 
-
M
 
-
H
 
-
Y
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
G
A
 
E
Q
 
C
L
 
L
N
 
S
N
 
V
W
 
W
V
 
N
L
 
D
D
 
D
A
 
I
-
 
P
-
 
L
-
 
T
-
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
Y
E
 
H
K
 
D
G
 
H
Y
 
C
F
x
Y
L
 
I
A
 
V
P
 
P
M
 
R
L
 
K
R
 
S
G
 
G
I
 
-
R
|
R
L
 
L
T
 
V
T
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
T
F
 
M
A
 
K
L
 
P
R
 
G
D
 
D
A
 
W
P
 
S
K
 
E
T
 
T
P
 
P
V
 
-
Q
 
D
L
 
L
T
 
G
R
 
G
A
 
L
E
 
E
R
 
S
V
 
V
A
 
M
R
 
K
E
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
T
-
 
M
F
 
L
F
 
P
P
 
P
L
 
I
A
 
Q
E
 
N
R
 
M
R
 
K
D
 
V
E
 
D
E
 
R
P
 
F
W
 
W
M
 
A
G
|
G
A
 
L
R
|
R
P
 
P
C
 
G
T
 
T
P
 
K
D
 
D
M
 
G
M
 
K
P
 
P
V
 
Y
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
H
P
 
P
R
 
E
H
 
D
E
 
S
G
 
R
L
 
I
W
 
L
F
 
F
A
 
A
F
 
A
G
 
G
H
|
H
A
 
F
H
x
R
H
x
N
G
|
G
M
x
I
T
 
L
L
 
L
G
 
A
P
 
P
V
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
A
A
 
L
L
 
I
A
 
S
Q
 
D
A
 
L
M
 
I
T
 
M
G
 
N
E
 
K
K
 
E
P
 
V
V
 
N
I
 
Q
D
 
D
-
 
W
I
 
L
T
 
H
P
 
A
Y
 
F
R
 
R
P
 
I
E
 
D
R
 
R

Sites not aligning to the query:

O31616 Glycine oxidase; GO; EC 1.4.3.19 from Bacillus subtilis (strain 168) (see 3 papers)
26% identity, 59% coverage: 170:414/417 of query aligns to 121:363/369 of O31616

query
sites
O31616
S
 
S
T
 
K
S
 
E
E
 
E
L
 
V
K
 
L
T
 
E
I
 
K
E
 
E
P
 
P
S
 
Y
I
 
A
Q
 
S
A
 
G
E
 
D
L
 
I
A
 
F
G
 
G
G
 
A
L
 
S
R
 
F
W
 
I
T
 
Q
D
 
D
P
 
D
W
 
V
S
 
H
I
 
V
R
 
-
D
 
E
P
 
P
H
 
Y
S
 
F
L
 
V
N
 
C
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
L
 
V
A
 
K
Y
 
A
F
 
A
Q
 
K
S
 
M
L
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
E
L
 
I
V
 
F
S
 
E
G
 
-
D
 
H
A
 
T
A
 
P
T
x
V
L
 
L
E
 
H
H
 
V
I
 
E
L
 
R
E
 
D
G
 
G
A
 
E
G
 
A
W
 
L
R
 
F
V
 
I
A
 
K
T
 
T
P
 
P
D
 
S
G
 
G
P
 
D
L
 
V
E
 
W
A
 
A
R
 
N
E
 
H
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
S
G
 
G
P
 
V
W
 
W
A
 
S
D
 
G
T
 
M
V
 
F
T
 
F
R
 
K
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
Y
 
L
H
 
N
F
 
N
P
 
A
-
 
F
L
 
L
A
 
P
V
 
V
K
 
K
R
 
-
G
 
-
Y
 
-
H
 
-
M
 
-
H
 
-
Y
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
G
A
 
E
Q
 
C
L
 
L
N
 
S
N
 
V
W
 
W
V
 
N
L
 
D
D
 
D
A
 
I
-
 
P
-
 
L
-
 
T
-
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
Y
E
 
H
K
 
D
G
x
H
Y
 
C
F
 
Y
L
 
I
A
 
V
P
 
P
M
 
R
L
 
K
R
 
S
G
 
G
I
 
-
R
 
R
L
 
L
T
 
V
T
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
T
F
 
M
A
 
K
L
 
P
R
 
G
D
 
D
A
 
W
P
 
S
K
 
E
T
 
T
P
 
P
V
 
D
Q
 
L
-
 
G
-
 
G
L
 
L
T
 
E
R
 
S
A
 
V
E
 
M
R
 
K
V
 
K
A
 
A
R
 
K
E
 
T
F
 
M
F
 
L
P
 
P
-
 
A
L
 
I
A
 
Q
E
 
N
R
 
M
R
 
K
D
 
V
E
 
D
E
 
R
P
 
F
W
 
W
M
 
A
G
 
G
A
 
L
R
|
R
P
 
P
C
 
G
T
 
T
P
 
K
D
 
D
M
 
G
M
 
K
P
 
P
V
 
Y
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
H
P
 
P
R
 
E
H
 
D
E
 
S
G
 
R
L
 
I
W
 
L
F
 
F
A
 
A
F
 
A
G
 
G
H
|
H
A
x
F
H
x
R
H
x
N
G
|
G
M
x
I
T
x
L
L
 
L
G
 
A
P
 
P
V
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
A
A
 
L
L
 
I
A
 
S
Q
 
D
A
 
L
M
 
I
T
 
M
G
 
N
E
 
K
K
 
E
P
 
V
V
 
N
I
 
Q
D
 
D
-
 
W
I
 
L
T
 
H
P
 
A
Y
 
F
R
 
R
P
 
I
E
 
D
R
 
R

Sites not aligning to the query:

S5FMM4 Glycine oxidase; GO; BliGO; EC 1.4.3.19 from Bacillus licheniformis (see paper)
26% identity, 70% coverage: 122:414/417 of query aligns to 79:363/369 of S5FMM4

query
sites
S5FMM4
D
 
E
L
 
L
I
x
K
D
 
D
A
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
I
G
 
-
D
 
D
L
 
I
I
 
R
R
 
R
K
 
H
D
 
D
G
 
G
-
 
G
W
 
I
M
 
L
K
 
K
V
 
L
F
 
A
R
 
F
T
 
S
E
 
E
K
 
S
E
 
D
R
 
R
D
 
E
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
H
R
 
L
L
 
M
S
 
Q
A
 
M
G
 
G
F
 
A
G
 
L
V
 
D
N
 
S
H
 
V
Q
 
E
K
 
W
L
 
L
S
 
E
T
 
A
S
 
D
E
 
E
L
 
V
K
 
Y
T
 
K
I
 
L
E
 
E
P
 
P
S
 
N
I
 
A
Q
 
G
A
 
K
E
 
G
L
 
I
A
 
L
G
 
G
G
 
A
L
 
N
R
 
-
W
 
-
T
 
-
D
 
-
P
 
-
W
 
-
S
 
F
I
 
I
R
 
R
D
 
D
P
 
D
H
 
V
S
 
H
L
 
V
N
 
E
K
 
P
A
 
A
Y
 
A
L
 
V
A
 
C
Y
 
R
F
 
A
Q
 
F
S
 
A
L
 
R
G
 
G
G
 
A
R
 
R
L
 
M
V
 
L
S
 
G
G
 
A
D
 
D
A
 
V
A
 
F
T
 
E
L
 
Y
E
 
T
H
 
P
I
 
V
L
 
L
-
 
S
-
 
I
-
 
E
-
 
S
E
 
E
G
 
A
A
 
G
G
 
A
W
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
T
T
 
S
P
 
A
D
 
S
G
 
G
P
 
T
L
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
E
E
 
H
V
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
L
x
S
G
 
G
P
 
V
W
 
W
A
 
S
D
 
G
T
 
A
V
 
L
T
 
F
R
 
K
K
 
Q
L
 
I
G
 
G
Y
 
L
H
 
D
F
 
K
P
 
R
L
 
F
A
 
Y
V
 
P
K
 
V
R
 
K
G
 
G
Y
 
E
H
 
C
M
 
L
H
 
S
Y
 
V
G
 
-
I
 
W
R
 
N
E
 
D
G
 
G
A
 
I
Q
 
S
L
 
L
N
 
T
N
 
R
W
 
T
V
 
L
L
 
Y
D
 
-
A
 
-
E
 
H
K
 
D
G
 
H
Y
 
C
F
 
Y
L
 
I
A
 
V
P
 
P
M
 
R
L
 
H
R
 
S
G
 
G
I
 
-
R
 
R
L
 
L
T
 
V
T
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
T
F
 
M
A
 
K
L
 
P
R
 
G
D
 
D
A
 
W
P
 
N
K
 
E
T
 
Q
P
 
P
V
 
-
Q
 
E
L
 
L
T
 
G
R
 
G
A
 
I
E
 
E
-
 
E
-
 
L
-
 
I
R
 
R
V
 
K
A
 
A
R
 
K
E
 
S
F
 
M
F
 
L
P
 
P
-
 
G
L
 
I
A
 
E
E
 
S
R
 
M
R
 
K
D
 
I
E
 
D
E
 
Q
P
 
C
W
 
W
M
 
A
G
 
G
A
 
L
R
 
R
P
 
P
C
 
E
T
 
T
P
 
G
D
 
D
M
 
G
M
 
N
P
 
P
V
 
Y
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
H
P
 
P
R
 
E
H
 
N
E
 
D
G
 
R
L
 
I
W
 
L
F
 
F
A
 
A
F
 
A
G
 
G
H
 
H
A
 
F
H
 
R
H
 
N
G
 
G
M
x
I
T
 
L
L
 
L
G
 
A
P
 
P
V
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
E
A
 
M
L
x
M
A
 
A
Q
 
D
A
 
M
M
 
I
T
 
L
G
 
G
E
 
-
K
 
N
P
 
P
V
 
V
I
 
K
D
 
T
-
 
E
-
 
W
I
 
I
T
 
E
P
 
A
Y
 
F
R
 
K
P
 
A
E
 
E
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Q5L2C2 Glycine oxidase; GO; GOX; GOXK; EC 1.4.3.19 from Geobacillus kaustophilus (strain HTA426)
25% identity, 71% coverage: 121:416/417 of query aligns to 78:371/377 of Q5L2C2

query
sites
Q5L2C2
Q
 
E
D
 
E
L
 
L
I
 
R
D
 
E
A
 
R
S
 
T
G
 
G
A
 
I
G
 
D
D
 
I
L
 
G
I
 
L
R
 
V
K
 
E
D
 
K
G
 
G
W
 
L
M
 
I
K
 
K
V
 
L
F
 
A
R
 
T
T
 
T
E
 
E
K
 
E
E
 
E
R
 
A
D
 
D
A
 
D
A
 
L
Y
 
Y
K
 
R
D
 
H
A
 
Y
E
 
T
R
 
-
L
 
F
S
 
W
A
 
R
G
 
G
F
 
I
G
 
G
V
 
E
N
 
P
H
 
V
Q
 
Q
K
 
W
L
 
L
S
 
T
T
 
K
S
 
G
E
 
E
L
 
A
K
 
L
T
 
E
I
 
M
E
 
E
P
 
P
S
 
R
I
 
L
Q
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
A
A
 
L
G
 
A
G
 
G
L
 
A
R
 
M
W
 
Y
T
 
I
D
 
-
P
 
P
W
 
G
S
 
D
I
 
G
R
 
Q
D
 
V
P
 
S
H
 
A
S
 
P
L
 
D
N
 
L
K
 
A
A
 
A
Y
 
A
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
Q
 
A
S
 
A
L
 
S
G
 
A
G
 
G
R
 
A
L
 
C
V
 
L
S
 
Y
G
 
E
D
 
Y
A
 
T
A
 
E
T
x
V
L
 
F
E
 
D
H
 
I
I
 
R
L
 
S
E
 
D
G
 
S
A
 
S
G
 
G
W
 
H
R
 
V
V
 
L
A
 
D
T
 
T
P
 
T
D
 
G
G
 
G
P
 
T
L
 
F
E
 
A
A
 
A
R
 
E
E
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
L
 
S
G
 
G
P
 
A
W
 
W
A
 
A
D
 
A
T
 
R
V
 
L
T
 
G
R
 
A
K
 
R
L
 
V
G
 
G
Y
 
L
H
 
S
F
 
L
P
 
S
L
 
V
A
 
Y
V
 
P
K
 
V
R
 
K
G
 
G
Y
 
E
H
 
C
M
 
V
H
 
M
Y
 
-
G
 
-
I
 
V
R
 
R
E
 
A
G
 
P
A
 
V
Q
 
P
L
 
L
N
 
L
N
 
Q
W
 
T
V
 
T
L
 
V
D
 
F
A
 
A
E
 
K
K
 
N
G
 
G
Y
 
C
F
 
Y
L
 
I
A
 
V
P
 
P
M
 
K
L
 
-
R
 
S
G
 
G
I
 
N
R
 
R
L
 
L
T
 
L
T
 
I
G
 
G
A
 
A
E
 
T
F
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
D
 
S
A
 
T
P
 
P
K
 
G
T
 
T
P
 
F
V
 
D
Q
 
R
L
 
R
T
 
V
R
 
S
A
 
A
E
 
G
R
 
G
V
 
V
-
 
M
-
 
N
-
 
L
-
 
L
-
 
H
-
 
R
A
 
A
R
 
A
E
 
H
F
 
L
F
 
V
P
 
P
L
 
D
A
 
I
E
 
E
R
 
Q
R
 
A
D
 
E
-
 
W
E
 
V
E
 
A
P
 
S
W
 
W
M
 
S
G
 
G
A
 
I
R
|
R
P
 
P
C
 
Q
T
 
T
P
 
E
D
 
D
M
 
G
M
 
L
P
 
P
V
 
Y
I
 
L
G
 
G
K
 
E
A
 
H
P
 
P
R
 
E
H
 
R
E
 
R
G
 
G
L
 
L
W
 
F
F
 
V
A
 
A
F
 
A
G
 
G
H
|
H
A
x
Y
H
x
R
H
x
N
G
|
G
M
x
I
T
x
L
L
 
L
G
 
S
P
 
P
V
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
L
A
 
L
L
 
V
A
 
A
Q
 
D
A
 
L
M
 
V
T
 
E
G
 
R
E
 
K
K
 
E
P
 
T
V
 
A
I
 
F
D
 
D
I
 
L
T
 
A
P
 
P
Y
 
F
R
 
S
P
 
L
E
 
T
R
 
R
F
 
H
L
 
I

Sites not aligning to the query:

4yshB Crystal structure of glycine oxidase from geobacillus kaustophilus
26% identity, 71% coverage: 121:414/417 of query aligns to 77:367/368 of 4yshB

query
sites
4yshB
Q
 
E
D
 
E
L
 
L
I
 
R
D
 
E
A
 
R
S
 
T
G
 
G
A
 
I
G
 
D
D
 
I
L
 
G
I
 
L
R
 
V
K
 
E
D
 
K
G
 
G
W
 
L
M
 
I
K
 
K
V
 
L
F
 
A
R
 
T
T
 
T
E
 
E
K
 
E
E
 
E
R
 
A
D
 
D
A
 
D
A
 
L
Y
 
Y
K
 
R
D
 
H
A
 
Y
E
 
T
R
 
-
L
 
F
S
 
W
A
 
R
G
 
G
F
 
I
G
 
G
V
 
E
N
 
P
H
 
V
Q
 
Q
K
 
W
L
 
L
S
 
T
T
 
K
S
 
G
E
 
E
L
 
A
K
 
L
T
 
E
I
 
M
E
 
E
P
 
P
S
 
R
I
 
L
Q
 
A
A
 
E
E
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
A
L
 
M
R
 
Y
W
 
I
T
 
-
D
 
-
P
 
P
W
 
G
S
 
D
I
 
G
R
 
Q
D
 
V
P
 
S
H
 
A
S
 
P
L
 
D
N
 
L
K
 
A
A
 
A
Y
 
A
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
Q
 
A
S
 
A
L
 
S
G
 
A
G
 
G
R
 
A
L
 
C
V
 
L
S
 
Y
G
 
E
D
 
Y
A
 
T
A
 
E
T
x
V
L
 
F
E
 
D
H
 
I
I
 
R
L
 
S
E
 
D
G
 
S
A
 
S
G
 
G
W
 
H
R
 
V
V
 
L
A
 
D
T
 
T
P
 
T
D
 
G
G
 
G
P
 
T
L
 
F
E
 
A
A
 
A
R
 
E
E
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
L
x
S
G
 
G
P
 
A
W
|
W
A
 
A
D
 
A
T
 
R
V
 
L
T
 
G
R
 
A
K
 
R
L
 
V
G
 
G
Y
 
L
H
 
S
F
 
L
P
 
S
L
 
V
A
 
Y
V
 
P
K
 
V
R
 
K
G
 
G
Y
 
E
H
 
C
M
 
V
H
 
M
Y
 
-
G
 
-
I
 
V
R
 
R
E
 
A
G
 
P
A
 
V
Q
 
P
L
 
L
N
 
L
N
 
Q
W
 
T
V
 
T
L
 
V
D
 
F
A
 
A
E
 
K
K
 
N
G
|
G
Y
 
C
F
x
Y
L
 
I
A
 
V
P
 
P
M
 
K
L
 
-
R
 
S
G
 
G
I
 
N
R
 
R
L
 
L
T
 
L
T
x
I
G
 
G
A
|
A
E
 
T
F
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
D
 
S
A
 
T
P
 
P
K
 
G
T
 
T
P
 
F
V
 
D
Q
 
R
L
 
R
T
 
V
R
 
S
A
 
A
E
 
G
R
 
G
V
 
V
-
 
M
-
 
N
-
x
L
-
 
L
-
 
H
-
 
R
A
 
A
R
 
A
E
 
H
F
 
L
F
 
V
P
 
P
L
 
D
A
 
I
E
 
E
R
 
Q
R
 
A
D
 
E
-
 
W
E
 
V
E
 
A
P
 
S
W
 
W
M
 
S
G
|
G
A
 
I
R
|
R
P
 
P
C
 
Q
T
 
T
P
 
E
D
 
D
M
 
G
M
 
L
P
 
P
V
 
Y
I
 
L
G
 
G
K
 
E
A
 
H
P
 
P
R
 
E
H
 
R
E
 
R
G
 
G
L
 
L
W
 
F
F
 
V
A
 
A
F
 
A
G
 
G
H
|
H
A
 
Y
H
x
R
H
x
N
G
|
G
M
x
I
T
x
L
L
 
L
G
 
S
P
 
P
V
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
L
A
 
L
L
 
V
A
 
A
Q
 
D
A
 
L
M
 
V
T
 
E
G
 
R
E
 
K
K
 
E
P
 
T
V
 
A
I
 
F
D
 
D
I
 
L
T
 
A
P
 
P
Y
 
F
R
 
S
P
 
L
E
 
T
R
 
R

Sites not aligning to the query:

4yshA Crystal structure of glycine oxidase from geobacillus kaustophilus
25% identity, 71% coverage: 121:416/417 of query aligns to 77:369/370 of 4yshA

query
sites
4yshA
Q
 
E
D
 
E
L
 
L
I
 
R
D
 
E
A
 
R
S
 
T
G
 
G
A
 
I
G
 
D
D
 
I
L
 
G
I
 
L
R
 
V
K
 
E
D
 
K
G
 
G
W
 
L
M
 
I
K
 
K
V
 
L
F
 
A
R
 
T
T
 
T
E
 
E
K
 
E
E
 
E
R
 
A
D
 
D
A
 
D
A
 
L
Y
 
Y
K
 
R
D
 
H
A
 
Y
E
 
T
R
 
-
L
 
F
S
 
W
A
 
R
G
 
G
F
 
I
G
 
G
V
 
E
N
 
P
H
 
V
Q
 
Q
K
 
W
L
 
L
S
 
T
T
 
K
S
 
G
E
 
E
L
 
A
K
 
L
T
 
E
I
 
M
E
 
E
P
 
P
S
 
R
I
 
L
Q
 
A
A
 
E
E
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
A
L
 
M
R
 
Y
W
 
I
T
 
-
D
 
-
P
 
P
W
 
G
S
 
D
I
 
G
R
 
Q
D
 
V
P
 
S
H
 
A
S
 
P
L
 
D
N
 
L
K
 
A
A
 
A
Y
 
A
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
Q
 
A
S
 
A
L
 
S
G
 
A
G
 
G
R
 
A
L
 
C
V
 
L
S
 
Y
G
 
E
D
 
Y
A
 
T
A
 
E
T
x
V
L
 
F
E
 
D
H
 
I
I
 
R
L
 
S
E
 
D
G
 
S
A
 
S
G
 
G
W
 
H
R
 
V
V
 
L
A
 
D
T
 
T
P
 
T
D
 
G
G
 
G
P
 
T
L
 
F
E
 
A
A
 
A
R
 
E
E
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
L
x
S
G
|
G
P
 
A
W
|
W
A
 
A
D
 
A
T
 
R
V
 
L
T
 
G
R
 
A
K
 
R
L
 
V
G
 
G
Y
 
L
H
 
S
F
 
L
P
 
S
L
 
V
A
 
Y
V
 
P
K
 
V
R
 
K
G
 
G
Y
 
E
H
 
C
M
 
V
H
 
M
Y
 
-
G
 
-
I
 
V
R
 
R
E
 
A
G
 
P
A
 
V
Q
 
P
L
 
L
N
 
L
N
 
Q
W
 
T
V
 
T
L
 
V
D
 
F
A
 
A
E
 
K
K
 
N
G
 
G
Y
 
C
F
 
Y
L
 
I
A
 
V
P
 
P
M
 
K
L
 
-
R
 
S
G
 
G
I
 
N
R
 
R
L
 
L
T
 
L
T
x
I
G
 
G
A
 
A
E
 
T
F
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
D
 
S
A
 
T
P
 
P
K
 
G
T
 
T
P
 
F
V
 
D
Q
 
R
L
 
R
T
 
V
R
 
S
A
 
A
E
 
G
R
 
G
V
 
V
-
 
M
-
 
N
-
x
L
-
 
L
-
 
H
-
 
R
A
 
A
R
 
A
E
 
H
F
 
L
F
 
V
P
 
P
L
 
D
A
 
I
E
 
E
R
 
Q
R
 
A
D
 
E
-
 
W
E
 
V
E
 
A
P
 
S
W
 
W
M
 
S
G
|
G
A
 
I
R
|
R
P
 
P
C
 
Q
T
 
T
P
 
E
D
 
D
M
 
G
M
 
L
P
 
P
V
 
Y
I
 
L
G
 
G
K
 
E
A
 
H
P
 
P
R
 
E
H
 
R
E
 
R
G
 
G
L
 
L
W
 
F
F
 
V
A
 
A
F
 
A
G
 
G
H
|
H
A
 
Y
H
x
R
H
x
N
G
|
G
M
x
I
T
x
L
L
 
L
G
 
S
P
 
P
V
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
L
A
 
L
L
 
V
A
 
A
Q
 
D
A
 
L
M
 
V
T
 
E
G
 
R
E
 
K
K
 
E
P
 
T
V
 
A
I
 
F
D
 
D
I
 
L
T
 
A
P
 
P
Y
 
F
R
 
S
P
 
L
E
 
T
R
 
R
F
 
H
L
 
I

Sites not aligning to the query:

7cyxA Crystal strcuture of glycine oxidase from bacillus cereus atcc 14579 (see paper)
23% identity, 96% coverage: 2:402/417 of query aligns to 1:348/363 of 7cyxA

query
sites
7cyxA
K
 
K
T
 
Y
D
 
D
V
 
V
V
 
A
V
 
I
L
x
I
G
|
G
A
 
G
G
|
G
I
x
V
V
x
I
G
 
G
I
 
S
S
 
S
S
 
V
A
 
A
I
 
H
H
 
F
L
 
L
A
 
A
R
 
E
L
 
R
G
 
G
K
 
H
S
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
I
L
x
V
D
x
E
R
x
K
R
 
Q
G
 
S
A
 
I
G
 
A
E
 
S
E
|
E
T
x
A
S
|
S
Y
 
K
G
 
A
N
x
A
A
 
A
G
|
G
L
|
L
I
 
L
Q
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
F
 
-
P
 
-
Y
 
-
G
 
G
F
 
V
P
 
A
H
 
Y
N
 
N
F
 
-
G
 
-
A
 
P
L
 
L
F
 
F
R
 
E
Y
 
L
A
 
A
L
 
-
N
 
-
N
 
-
T
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
S
 
-
Y
 
-
H
 
-
F
 
-
R
 
R
A
 
E
L
 
S
P
 
R
S
 
A
L
 
I
V
 
F
P
 
P
F
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
-
Y
 
-
W
 
-
W
 
-
H
 
-
S
 
A
G
 
V
F
 
L
T
 
R
Q
 
E
H
 
K
Q
 
T
K
 
G
I
 
V
A
 
D
H
 
I
L
 
G
Y
 
Y
A
 
E
P
 
E
L
 
K
I
 
G
E
 
I
H
 
Y
S
 
R
I
 
I
A
 
A
E
 
Q
H
 
N
Q
 
E
D
 
D
L
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
W
 
-
M
 
-
K
 
-
V
 
-
F
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
E
K
 
K
E
 
E
R
 
R
D
 
I
A
 
L
A
 
H
Y
 
I
K
 
M
D
 
D
A
 
W
E
 
Q
R
 
Q
L
 
K
S
 
T
A
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
G
V
 
E
N
 
D
H
 
S
Q
 
Y
K
 
F
L
 
L
S
 
T
T
 
G
S
 
D
E
 
H
L
 
V
K
 
R
T
 
E
I
 
K
E
 
E
P
 
P
S
 
Y
I
 
L
Q
 
S
A
 
E
E
 
S
L
 
I
A
 
I
G
 
G
G
 
A
L
 
V
R
 
Y
W
 
Y
T
 
P
D
 
K
P
 
D
W
 
G
S
 
H
I
 
V
R
 
I
D
 
A
P
 
P
H
 
E
S
 
-
L
 
L
N
 
T
K
 
K
A
 
A
Y
 
F
L
 
-
A
 
A
Y
 
H
F
 
S
Q
 
A
S
 
A
L
 
I
G
 
S
G
 
G
R
 
A
L
 
D
V
 
I
S
 
Y
G
 
E
D
 
Q
A
 
T
A
 
E
T
x
V
L
 
F
E
 
D
H
 
I
I
 
R
L
 
I
E
 
E
G
 
N
A
 
N
G
 
K
W
 
V
R
 
T
-
 
G
V
 
V
A
 
I
T
 
T
P
 
S
D
 
E
G
 
G
P
 
I
L
 
V
E
 
T
A
 
C
R
 
E
E
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
L
x
G
G
|
G
P
 
S
W
|
W
A
 
S
D
 
-
T
 
-
V
 
-
T
 
T
R
 
K
K
 
L
L
 
L
G
 
S
Y
 
Y
H
 
-
F
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
V
 
-
K
 
-
R
 
-
G
 
-
Y
 
F
H
 
H
M
 
R
H
 
D
Y
 
W
G
 
G
-
 
T
-
 
Y
-
 
P
-
 
V
-
 
K
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
V
-
 
A
I
 
V
R
 
R
E
 
S
G
 
R
A
 
K
Q
 
Q
L
 
L
N
 
L
N
 
K
W
 
A
V
 
P
L
 
I
D
 
F
A
 
Q
E
 
E
K
 
R
G
 
-
Y
 
F
F
 
Y
L
 
I
A
 
T
P
 
P
M
 
K
L
 
-
R
 
R
G
 
G
I
 
G
R
 
R
L
 
Y
T
 
V
T
 
I
G
 
G
A
 
A
E
 
T
F
 
M
A
 
K
L
 
P
R
 
H
D
 
T
A
 
F
P
 
N
K
 
K
T
 
T
-
 
V
-
 
Q
P
 
P
V
 
E
Q
 
S
L
 
I
T
 
T
R
 
S
A
 
I
E
 
L
R
 
E
V
 
R
A
 
A
R
 
Y
E
 
T
F
 
I
F
 
L
P
 
P
-
 
A
L
 
L
A
 
K
E
 
E
R
 
A
R
 
E
D
 
W
E
 
E
E
 
S
P
 
T
W
 
W
M
 
A
G
|
G
A
 
L
R
|
R
P
|
P
C
 
Q
T
 
S
P
 
N
D
 
H
M
 
E
M
 
A
P
 
P
V
 
Y
I
 
M
G
 
G
K
 
E
A
 
H
P
 
E
R
 
E
H
 
I
E
 
K
G
 
G
L
 
L
W
 
Y
F
 
A
A
 
C
F
 
T
G
 
G
H
 
H
A
x
Y
H
x
R
H
x
N
G
|
G
M
x
I
T
 
L
L
 
L
G
 
S
P
 
P
V
 
I
T
 
S
G
 
G
R
 
Q
A
 
Y
L
 
M
A
 
A
Q
 
D
A
 
L
M
 
I
T
 
E
G
 
G
E
 
K
K
 
Q

5i39A High resolution structure of l-amino acid deaminase from proteus vulgaris with the deletion of the specific insertion sequence (see paper)
27% identity, 52% coverage: 199:415/417 of query aligns to 172:383/383 of 5i39A

query
sites
5i39A
D
 
D
P
 
P
H
 
E
S
 
V
L
 
A
N
 
T
K
 
F
A
 
V
Y
 
M
L
 
A
A
 
E
Y
 
Y
F
 
A
Q
 
K
S
 
K
L
 
M
G
 
G
G
 
V
R
 
R
L
 
I
V
 
Y
S
 
T
G
 
Q
D
 
C
A
|
A
A
|
A
T
 
R
L
 
G
E
 
L
H
 
E
I
 
T
L
 
Q
E
 
A
G
 
G
A
 
V
G
 
I
W
 
S
R
 
D
V
 
V
A
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
K
G
 
G
P
 
A
L
 
I
E
 
K
A
 
T
R
 
S
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
L
x
G
G
|
G
P
 
V
W
|
W
A
 
S
D
 
R
T
 
L
V
 
F
T
 
M
R
 
Q
K
 
N
L
 
L
G
 
N
Y
 
V
H
 
D
F
 
V
P
 
P
L
 
T
A
 
L
V
 
P
K
 
A
R
 
Y
G
x
Q
Y
 
S
H
x
Q
M
 
Q
H
 
L
Y
 
I
G
 
S
I
 
G
R
 
S
E
 
P
G
 
T
A
 
A
Q
 
P
L
 
G
N
 
G
N
 
N
W
 
V
V
 
A
L
 
L
D
x
P
A
 
G
E
 
-
K
 
-
G
 
G
Y
 
I
F
 
F
L
 
F
A
 
R
P
 
E
M
 
Q
L
 
A
R
 
D
G
 
G
I
 
T
R
 
Y
L
 
A
T
 
T
T
 
S
G
 
P
-
 
R
A
 
V
E
 
I
F
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
P
D
 
D
A
 
L
P
 
P
K
 
E
T
 
L
P
 
N
V
 
A
Q
 
S
L
 
L
T
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
E
R
 
K
V
 
L
A
 
K
R
 
A
E
 
E
F
 
F
F
 
P
P
 
A
L
 
F
A
 
K
E
 
E
R
 
S
R
 
K
D
 
L
E
 
I
E
 
D
P
 
Q
W
 
W
M
 
S
G
|
G
A
 
A
R
x
M
P
 
A
C
 
I
T
 
A
P
 
P
D
 
D
M
 
E
M
 
N
P
 
P
V
 
I
I
 
I
G
 
S
K
 
E
A
 
V
P
 
K
R
 
E
H
 
Y
E
 
P
G
 
G
L
 
L
W
 
V
F
 
I
A
 
N
F
 
T
G
 
A
H
x
T
A
x
G
H
x
W
H
 
-
G
|
G
M
|
M
T
|
T
L
 
E
G
 
S
P
 
P
V
 
V
T
 
S
G
 
A
R
 
E
A
 
L
L
 
T
A
 
A
Q
 
D
A
 
L
M
 
L
T
 
L
G
 
G
E
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
L
D
 
D
I
 
P
T
 
K
P
 
P
Y
 
F
R
 
S
P
 
L
E
 
Y
R
 
R
F
 
F

Sites not aligning to the query:

5hxwA L-amino acid deaminase from proteus vulgaris (see paper)
28% identity, 36% coverage: 265:415/417 of query aligns to 291:433/433 of 5hxwA

query
sites
5hxwA
G
|
G
Y
 
Y
H
 
K
F
x
Y
-
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
L
V
 
A
K
 
L
R
 
P
G
 
D
Y
 
F
H
 
P
M
 
V
H
 
H
Y
 
I
G
 
S
I
 
L
R
x
N
E
|
E
G
 
Q
-
 
L
-
 
I
-
 
N
-
 
S
-
x
F
A
x
M
Q
 
Q
L
x
S
N
 
T
N
 
H
W
 
W
V
 
N
L
 
L
D
 
D
A
 
E
E
 
-
K
 
-
G
 
-
Y
 
-
F
 
-
L
 
V
A
 
S
P
 
P
M
x
F
L
 
E
R
 
Q
G
 
F
I
 
R
R
 
N
L
 
M
T
 
T
T
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
A
L
 
L
R
 
P
D
 
D
A
 
L
P
 
P
K
 
E
T
 
L
P
 
N
V
 
A
Q
 
S
L
 
L
T
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
E
R
 
K
V
 
L
A
 
K
R
 
A
E
 
E
F
 
F
F
 
P
P
 
A
L
 
F
A
 
K
E
 
E
R
 
S
R
 
K
D
 
L
E
 
I
E
 
D
P
 
Q
W
 
W
M
 
S
G
|
G
A
 
A
R
x
M
P
 
A
C
 
I
T
 
A
P
 
P
D
 
D
M
x
E
M
 
N
P
 
P
V
 
I
I
 
I
G
 
S
K
 
E
A
 
V
P
 
K
R
 
E
H
 
Y
E
 
P
G
 
G
L
 
L
W
 
V
F
 
I
A
 
N
F
 
T
G
 
A
H
x
T
A
x
G
H
x
W
H
 
-
G
|
G
M
|
M
T
|
T
L
 
E
G
 
S
P
 
P
V
 
V
T
 
S
G
 
A
R
 
E
A
 
L
L
 
T
A
 
A
Q
 
D
A
 
L
M
 
L
T
 
L
G
 
G
E
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
L
D
 
D
I
 
P
T
 
K
P
 
P
Y
 
F
R
 
S
P
 
L
E
 
Y
R
 
R
F
 
F

Sites not aligning to the query:

1zovA Crystal structure of monomeric sarcosine oxidase from bacillus sp. Ns- 129
24% identity, 43% coverage: 237:414/417 of query aligns to 185:377/381 of 1zovA

query
sites
1zovA
V
 
I
A
 
K
T
 
T
P
 
A
D
 
K
G
 
G
P
 
S
L
 
Y
E
 
T
A
 
A
R
 
N
E
 
K
V
 
L
V
 
V
V
 
V
A
 
S
L
x
M
G
|
G
P
 
A
W
|
W
A
 
N
D
 
S
T
 
K
V
 
L
T
 
L
R
 
S
K
 
K
L
 
L
G
 
D
Y
 
V
H
 
E
F
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
Q
V
 
P
K
 
Y
R
 
R
G
 
Q
Y
 
V
H
 
V
M
 
G
H
 
F
Y
 
F
G
 
E
I
 
C
R
 
D
E
 
E
G
 
A
A
 
K
Q
 
Y
L
 
S
N
 
N
N
 
N
-
 
A
-
 
H
-
 
Y
-
 
P
-
 
A
W
 
F
V
 
M
L
 
V
D
 
E
A
 
V
E
 
E
K
 
N
G
 
G
-
 
I
Y
 
Y
F
x
Y
L
 
G
A
 
F
P
 
P
M
 
S
L
 
F
R
 
G
G
 
G
I
 
S
R
 
G
L
 
L
T
x
K
T
 
I
G
 
G
A
 
Y
-
x
H
E
 
S
F
 
Y
A
 
G
L
 
Q
R
 
Q
D
 
I
A
 
D
P
 
P
K
 
D
T
 
T
-
 
I
-
 
N
-
 
R
-
 
E
-
 
F
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
P
 
P
V
 
E
Q
 
D
L
 
E
T
 
A
R
 
N
A
 
L
E
 
R
R
 
K
V
 
F
A
 
L
R
 
E
E
 
Q
F
 
Y
F
 
M
P
 
P
L
 
G
A
 
A
E
 
N
R
 
G
R
 
E
D
 
L
E
 
K
E
 
K
P
 
G
W
 
A
M
 
V
G
x
C
A
x
M
R
x
Y
P
 
T
C
 
K
T
 
T
P
 
P
D
 
D
M
 
E
M
 
H
P
 
F
V
 
V
I
 
I
G
 
D
K
 
L
A
 
H
P
 
P
R
 
K
H
 
Y
E
 
S
G
 
N
L
 
V
W
 
A
F
 
I
A
 
A
F
 
A
G
 
G
H
x
F
A
 
S
H
x
G
H
|
H
G
|
G
M
x
F
T
x
K
L
 
F
G
 
S
P
 
S
V
 
V
T
 
V
G
 
G
R
 
E
A
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
L
M
 
A
T
 
T
G
 
T
E
 
G
K
 
K
P
 
T
V
 
E
I
 
H
D
 
D
I
 
I
T
 
S
P
 
I
Y
 
F
R
 
S
P
 
L
E
 
N
R
 
R

Sites not aligning to the query:

5fjnA Structure of l-amino acid deaminase from proteus myxofaciens in complex with anthranilate (see paper)
35% identity, 20% coverage: 332:415/417 of query aligns to 363:445/447 of 5fjnA

query
sites
5fjnA
E
 
Q
R
 
R
V
 
M
A
 
K
R
 
T
E
 
E
F
 
F
F
 
P
P
 
V
L
 
F
A
 
E
E
 
K
R
 
S
R
 
Q
D
 
I
E
 
V
E
 
E
P
 
R
W
 
W
M
 
G
G
 
A
A
 
V
R
x
V
P
 
S
C
 
P
T
 
T
P
 
F
D
 
D
M
 
E
M
 
L
P
 
P
V
 
I
I
 
I
G
 
S
K
 
E
A
 
V
P
 
K
R
 
E
H
 
Y
E
 
P
G
 
G
L
 
L
W
 
V
F
 
I
A
 
N
F
 
T
G
 
A
H
x
T
A
x
V
H
x
W
H
 
-
G
|
G
M
|
M
T
|
T
L
 
E
G
 
G
P
 
P
V
 
A
T
 
A
G
 
G
R
 
E
A
 
V
L
 
T
A
 
A
Q
 
D
A
 
I
M
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
I
D
 
D
I
 
P
T
 
T
P
 
P
Y
 
F
R
 
S
P
 
L
E
 
D
R
 
R
F
 
F

Sites not aligning to the query:

5fjmA Structure of l-amino acid deaminase from proteus myxofaciens (see paper)
35% identity, 20% coverage: 332:415/417 of query aligns to 363:445/447 of 5fjmA

query
sites
5fjmA
E
 
Q
R
 
R
V
 
M
A
 
K
R
 
T
E
 
E
F
 
F
F
 
P
P
 
V
L
 
F
A
 
E
E
 
K
R
 
S
R
 
Q
D
 
I
E
 
V
E
 
E
P
 
R
W
 
W
M
 
G
G
 
A
A
 
V
R
x
V
P
 
S
C
 
P
T
 
T
P
 
F
D
 
D
M
 
E
M
 
L
P
 
P
V
 
I
I
 
I
G
 
S
K
 
E
A
 
V
P
 
K
R
 
E
H
 
Y
E
 
P
G
 
G
L
 
L
W
 
V
F
 
I
A
 
N
F
 
T
G
 
A
H
x
T
A
x
V
H
x
W
H
 
-
G
|
G
M
|
M
T
|
T
L
 
E
G
 
G
P
 
P
V
 
A
T
 
A
G
 
G
R
 
E
A
 
V
L
 
T
A
 
A
Q
 
D
A
 
I
M
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
I
D
 
D
I
 
P
T
 
T
P
 
P
Y
 
F
R
 
S
P
 
L
E
 
D
R
 
R
F
 
F

Sites not aligning to the query:

6j39A Crystal structure of cmis2 with inhibitor (see paper)
26% identity, 68% coverage: 121:405/417 of query aligns to 74:359/368 of 6j39A

query
sites
6j39A
Q
 
K
D
 
E
L
 
L
I
 
E
D
 
A
A
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
T
G
 
S
D
 
A
L
 
G
I
 
Y
R
 
R
K
 
R
D
 
D
G
 
G
W
 
V
M
 
L
K
 
D
V
 
A
F
 
A
R
 
-
T
 
F
E
 
D
K
 
D
E
 
E
R
 
S
D
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
L
K
 
D
D
 
G
A
 
L
E
 
R
R
 
N
L
 
F
S
 
L
A
 
A
G
 
P
F
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
A
H
 
V
Q
 
A
K
 
P
L
 
L
S
 
N
T
 
A
S
 
R
E
 
R
L
 
C
K
 
R
T
 
E
I
 
H
E
 
E
P
 
P
S
 
M
I
 
L
Q
 
A
A
 
E
E
 
S
L
 
V
A
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
L
W
 
G
T
 
P
D
 
D
P
 
D
W
 
G
S
 
A
I
 
V
R
 
-
D
 
N
P
 
P
H
 
R
S
 
E
L
 
L
N
 
T
K
 
A
A
 
A
Y
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
 
A
F
 
I
Q
 
D
S
 
V
L
 
R
G
 
G
G
 
G
R
 
T
L
 
L
V
 
I
S
 
R
G
 
R
D
 
R
A
|
A
A
 
T
T
 
-
L
 
-
E
 
E
H
 
F
I
 
L
L
 
A
E
 
D
G
 
E
A
 
R
G
 
T
W
 
P
R
 
G
V
 
V
A
 
L
T
 
L
P
 
E
D
 
N
G
 
G
-
 
C
P
 
A
L
 
V
E
 
H
A
 
G
R
 
D
E
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
L
A
 
S
L
x
A
G
 
G
P
 
C
W
|
W
A
 
T
D
 
H
T
 
R
V
 
L
T
 
A
R
 
G
K
 
L
L
 
P
G
 
A
Y
 
G
H
 
A
F
 
V
P
 
P
-
 
E
L
 
I
A
 
A
V
 
P
K
 
A
R
 
K
G
 
G
Y
 
Q
H
x
I
M
 
L
H
 
R
Y
 
-
G
 
-
I
 
L
R
 
R
E
 
S
G
 
A
A
 
A
Q
 
P
L
 
F
N
 
L
N
 
R
W
 
R
V
 
A
L
 
T
D
x
R
A
 
A
E
 
V
-
 
T
-
 
R
-
 
G
K
 
S
G
 
G
Y
 
V
F
x
Y
L
 
L
A
 
V
P
 
P
M
 
R
L
 
T
R
 
D
G
 
G
I
 
-
R
 
E
L
 
L
T
 
V
T
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
T
F
x
Y
A
 
E
L
 
E
R
 
R
D
 
D
A
 
Y
P
 
D
K
 
T
T
 
T
P
 
V
V
 
T
Q
 
A
L
 
G
T
 
G
R
 
V
A
 
A
E
 
E
R
 
L
V
 
L
A
 
G
R
 
K
E
 
V
F
 
L
F
 
A
P
 
V
L
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
L
R
 
E
D
 
L
E
 
A
E
 
E
P
 
T
W
 
A
M
 
A
G
 
G
A
 
L
R
|
R
P
 
P
C
 
G
T
 
S
P
 
P
D
 
D
M
 
G
M
 
L
P
 
P
V
 
V
I
 
L
G
 
G
-
 
W
-
 
T
K
 
A
A
 
V
P
 
P
R
 
N
H
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
L
W
 
L
F
 
V
A
 
A
F
 
T
G
 
G
H
 
H
A
x
S
H
x
R
H
x
I
G
|
G
M
x
V
T
x
Q
L
 
L
G
 
A
P
 
P
V
 
I
T
 
T
G
 
A
R
 
D
A
 
V
L
 
M
A
 
G
Q
 
E
A
 
M
M
 
L
-
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
R
K
 
T
P
 
P
V
 
E
I
 
V

Sites not aligning to the query:

6j38A Crystal structure of cmis2 (see paper)
26% identity, 68% coverage: 121:405/417 of query aligns to 74:359/368 of 6j38A

query
sites
6j38A
Q
 
K
D
 
E
L
 
L
I
 
E
D
 
A
A
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
T
G
 
S
D
 
A
L
 
G
I
 
Y
R
 
R
K
 
R
D
 
D
G
 
G
W
 
V
M
 
L
K
 
D
V
 
A
F
 
A
R
 
-
T
 
F
E
 
D
K
 
D
E
 
E
R
 
S
D
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
L
K
 
D
D
 
G
A
 
L
E
 
R
R
 
N
L
 
F
S
 
L
A
 
A
G
 
P
F
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
A
H
 
V
Q
 
A
K
 
P
L
 
L
S
 
N
T
 
A
S
 
R
E
 
R
L
 
C
K
 
R
T
 
E
I
 
H
E
 
E
P
 
P
S
 
M
I
 
L
Q
 
A
A
 
E
E
 
S
L
 
V
A
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
L
W
 
G
T
 
P
D
 
D
P
 
D
W
 
G
S
 
A
I
 
V
R
 
-
D
 
N
P
 
P
H
 
R
S
 
E
L
 
L
N
 
T
K
 
A
A
 
A
Y
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
 
A
F
 
I
Q
 
D
S
 
V
L
 
R
G
 
G
G
 
G
R
 
T
L
 
L
V
 
I
S
 
R
G
 
R
D
 
R
A
|
A
A
 
T
T
 
-
L
 
-
E
 
E
H
 
F
I
 
L
L
 
A
E
 
D
G
 
E
A
 
R
G
 
T
W
 
P
R
 
G
V
 
V
A
 
L
T
 
L
P
 
E
D
 
N
G
 
G
-
 
C
P
 
A
L
 
V
E
 
H
A
 
G
R
 
D
E
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
L
A
 
S
L
x
A
G
 
G
P
 
C
W
|
W
A
 
T
D
 
H
T
 
R
V
 
L
T
 
A
R
 
G
K
 
L
L
 
P
G
 
A
Y
 
G
H
 
A
F
 
V
P
 
P
-
 
E
L
 
I
A
 
A
V
 
P
K
 
A
R
 
K
G
|
G
Y
 
Q
H
 
I
M
 
L
H
 
R
Y
 
-
G
 
-
I
 
L
R
 
R
E
 
S
G
 
A
A
 
A
Q
 
P
L
 
F
N
 
L
N
 
R
W
 
R
V
 
A
L
 
T
D
 
R
A
 
A
E
 
V
-
 
T
-
 
R
-
 
G
K
 
S
G
 
G
Y
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
V
P
 
P
M
 
R
L
 
T
R
 
D
G
 
G
I
 
-
R
 
E
L
 
L
T
 
V
T
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
T
F
 
Y
A
 
E
L
 
E
R
 
R
D
 
D
A
 
Y
P
 
D
K
 
T
T
 
T
P
 
V
V
 
T
Q
 
A
L
 
G
T
 
G
R
 
V
A
 
A
E
 
E
R
 
L
V
 
L
A
 
G
R
 
K
E
 
V
F
 
L
F
 
A
P
 
V
L
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
L
R
 
E
D
 
L
E
 
A
E
 
E
P
 
T
W
 
A
M
 
A
G
|
G
A
 
L
R
|
R
P
 
P
C
 
G
T
 
S
P
 
P
D
 
D
M
 
G
M
 
L
P
 
P
V
 
V
I
 
L
G
 
G
-
 
W
-
 
T
K
 
A
A
 
V
P
 
P
R
 
N
H
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
L
W
 
L
F
 
V
A
 
A
F
 
T
G
 
G
H
 
H
A
x
S
H
x
R
H
x
I
G
|
G
M
x
V
T
x
Q
L
 
L
G
 
A
P
 
P
V
 
I
T
 
T
G
 
A
R
 
D
A
 
V
L
 
M
A
 
G
Q
 
E
A
 
M
M
 
L
-
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
R
K
 
T
P
 
P
V
 
E
I
 
V

Sites not aligning to the query:

7exsA Thermomicrobium roseum sarcosine oxidase mutant - s320r (see paper)
28% identity, 40% coverage: 231:396/417 of query aligns to 175:351/372 of 7exsA

query
sites
7exsA
E
 
D
G
 
G
A
 
E
G
 
G
W
 
M
R
 
T
V
 
V
A
 
E
T
 
T
P
 
E
D
 
S
G
 
G
P
 
R
L
 
L
E
 
R
A
 
A
R
 
D
E
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
x
T
L
x
A
G
|
G
P
 
P
W
|
W
A
 
S
D
 
T
T
 
T
V
 
L
T
 
L
R
 
A
K
 
D
L
 
L
G
 
G
Y
 
-
H
 
-
F
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
E
V
 
V
K
 
R
R
 
R
G
 
V
Y
 
L
H
 
V
M
 
V
H
 
H
Y
 
V
G
 
Q
I
 
P
R
 
D
E
 
D
G
 
P
A
 
T
Q
 
R
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
E
-
 
V
L
 
L
N
 
P
N
 
I
W
 
F
V
 
I
L
 
M
D
 
D
A
 
V
E
 
P
K
 
E
G
 
G
-
 
E
Y
 
Y
F
x
Y
L
 
G
A
 
F
P
 
P
M
 
F
L
 
L
R
 
P
G
 
-
I
 
-
R
 
-
L
 
-
T
 
D
T
 
Q
G
 
G
A
 
V
E
 
K
F
 
F
A
 
G
L
 
R
R
 
H
D
 
D
A
 
D
P
 
G
K
 
E
-
 
V
-
 
C
T
 
T
P
 
P
V
 
E
Q
 
S
L
 
V
T
 
R
R
 
R
A
 
T
E
 
V
R
 
T
-
 
D
-
 
D
-
 
E
-
 
V
-
 
R
-
 
W
-
 
M
-
 
T
-
 
G
V
 
V
A
 
L
R
 
Q
E
 
R
F
 
Y
F
 
L
P
 
P
L
 
G
A
 
A
E
 
A
R
 
R
R
 
E
D
 
V
E
 
L
E
 
M
P
 
T
W
 
V
M
 
T
G
x
C
A
x
L
R
x
Y
P
 
T
C
 
M
T
 
T
P
 
P
D
 
D
M
 
R
M
 
H
P
 
F
V
 
M
I
 
I
G
 
D
K
 
R
A
 
H
P
 
P
R
 
E
H
 
W
E
 
P
G
 
Q
L
 
V
W
 
V
F
 
F
A
 
A
F
 
A
G
 
G
H
 
F
A
 
S
H
x
G
H
|
H
G
|
G
M
x
F
T
x
K
L
 
F
G
 
A
P
 
S
V
 
V
T
 
M
G
 
G
R
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
D

Sites not aligning to the query:

1y56B Crystal structure of l-proline dehydrogenase from p.Horikoshii (see paper)
21% identity, 69% coverage: 130:415/417 of query aligns to 78:368/374 of 1y56B

query
sites
1y56B
G
 
G
D
 
F
L
 
S
I
 
F
R
 
K
K
 
Q
D
 
T
G
 
G
W
 
Y
M
 
L
K
 
F
V
 
L
F
 
L
R
 
Y
T
 
D
E
 
D
K
 
E
E
 
E
R
 
V
D
 
K
A
 
T
A
 
F
Y
 
K
K
 
R
D
 
N
A
 
I
E
 
E
R
 
-
L
 
I
S
 
Q
A
 
N
G
 
K
F
 
F
G
 
G
V
 
V
N
 
P
H
 
T
Q
 
K
K
 
L
L
 
I
S
 
T
T
 
P
S
 
E
E
 
E
L
 
A
K
 
K
T
 
E
I
 
I
E
 
V
P
 
P
S
 
L
I
 
L
Q
 
D
A
 
I
E
 
S
L
 
E
A
 
V
G
 
I
G
 
A
L
 
A
R
 
S
W
 
W
T
 
N
D
 
P
P
 
T
W
 
D
S
 
G
I
 
K
R
 
A
D
 
D
P
 
P
H
 
F
S
 
E
L
 
A
N
 
T
K
 
T
A
 
A
Y
 
F
L
 
A
A
 
V
Y
 
K
F
 
A
Q
 
K
S
 
E
L
 
Y
G
 
G
G
 
A
R
 
K
L
 
L
V
 
L
S
 
E
G
 
Y
D
 
T
A
x
E
A
x
V
T
 
K
L
 
G
E
 
F
H
 
L
I
 
I
L
 
E
E
 
N
G
 
N
A
 
E
G
 
I
W
 
K
R
 
G
V
 
V
A
 
K
T
 
T
P
 
N
D
 
K
G
 
G
P
 
I
L
 
I
E
 
K
A
 
T
R
 
G
E
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
N
A
 
A
L
x
T
G
x
N
P
 
A
W
|
W
A
 
A
D
 
N
T
 
L
V
 
I
T
 
N
R
 
A
K
 
M
L
 
A
G
 
G
Y
 
I
H
 
K
F
 
T
P
 
K
L
 
I
A
 
P
V
 
I
K
 
E
R
 
P
G
 
Y
Y
 
K
H
|
H
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
M
 
I
H
 
T
Y
 
Q
G
 
P
I
 
I
R
 
K
E
 
R
G
 
G
A
 
T
Q
 
-
L
 
I
N
 
N
N
x
P
W
 
M
V
 
V
L
 
I
D
 
S
A
 
F
E
 
K
K
 
Y
G
 
G
Y
 
H
-
 
A
F
 
Y
L
 
L
A
 
T
P
 
Q
M
 
T
L
 
F
R
 
H
G
 
G
I
 
G
R
 
I
L
x
I
T
 
G
T
 
G
G
 
I
A
 
G
E
 
Y
F
 
E
A
 
I
L
 
G
R
 
P
D
 
T
A
 
Y
P
 
D
K
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
T
Q
 
Y
-
 
E
-
 
F
L
 
L
T
 
R
R
 
E
A
 
V
E
 
S
R
 
Y
V
 
Y
A
 
F
R
 
T
E
 
K
F
 
I
F
 
I
P
 
P
-
 
A
L
 
L
A
 
K
E
 
N
R
 
L
R
 
L
D
 
I
E
 
L
E
x
R
P
 
T
W
|
W
M
 
A
G
|
G
A
x
Y
R
x
Y
P
 
A
C
 
K
T
 
T
P
 
P
D
 
D
M
 
S
M
 
N
P
 
P
V
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
I
P
 
E
R
 
E
H
 
L
E
 
N
G
 
D
L
 
Y
W
 
Y
F
 
I
A
 
A
F
 
A
G
 
G
H
 
F
A
 
S
H
x
G
H
|
H
G
|
G
M
x
F
T
x
M
L
 
M
G
 
A
P
 
P
V
 
A
T
 
V
G
 
G
R
 
E
A
 
M
L
 
V
A
 
A
Q
 
E
A
 
L
M
 
I
T
 
T
G
 
K
E
 
G
K
 
K
P
 
T
V
 
K
I
 
L
D
 
P
I
 
V
T
 
E
P
 
W
Y
 
Y
R
 
D
P
 
P
E
 
Y
R
 
R
F
 
F

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>SMc00797 FitnessBrowser__Smeli:SMc00797
MKTDVVVLGAGIVGISSAIHLARLGKSVVLLDRRGAGEETSYGNAGLIQREGVFPYGFPH
NFGALFRYALNNTIDASYHFRALPSLVPFLARYWWHSGFTQHQKIAHLYAPLIEHSIAEH
QDLIDASGAGDLIRKDGWMKVFRTEKERDAAYKDAERLSAGFGVNHQKLSTSELKTIEPS
IQAELAGGLRWTDPWSIRDPHSLNKAYLAYFQSLGGRLVSGDAATLEHILEGAGWRVATP
DGPLEAREVVVALGPWADTVTRKLGYHFPLAVKRGYHMHYGIREGAQLNNWVLDAEKGYF
LAPMLRGIRLTTGAEFALRDAPKTPVQLTRAERVAREFFPLAERRDEEPWMGARPCTPDM
MPVIGKAPRHEGLWFAFGHAHHGMTLGPVTGRALAQAMTGEKPVIDITPYRPERFLA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory