SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMc00981 FitnessBrowser__Smeli:SMc00981 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6laaA Crystal structure of full-length cyp116b46 from tepidiphilus thermophilus (see paper)
25% identity, 94% coverage: 17:359/364 of query aligns to 436:747/753 of 6laaA

query
sites
6laaA
R
 
K
D
 
D
R
 
V
Q
 
V
H
 
R
M
 
T
L
 
M
E
 
E
C
 
V
M
 
A
S
 
A
A
 
V
V
 
E
A
 
R
E
 
P
T
 
S
A
 
E
D
 
D
V
 
I
M
 
V
T
 
V
F
 
L
T
 
H
F
 
L
-
 
T
R
 
R
S
 
P
D
 
D
K
 
R
P
 
R
A
 
P
W
 
L
F
 
P
R
 
R
Y
 
W
L
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
A
F
 
H
V
 
I
T
 
D
L
 
I
E
 
E
L
 
C
P
 
G
V
 
E
A
 
P
A
 
D
K
 
R
P
 
S
V
 
-
M
 
-
R
|
R
T
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
C
S
 
S
S
 
D
P
 
P
S
 
E
R
 
N
P
 
R
L
 
D
S
 
A
V
 
W
A
 
R
V
 
V
T
x
A
V
|
V
K
x
Q
A
 
R
Q
x
D
P
 
P
G
 
A
S
|
S
I
x
R
G
|
G
-
x
G
T
x
S
R
 
R
W
 
W
M
 
I
F
 
H
D
 
E
N
 
E
L
 
V
K
 
R
P
 
P
G
 
G
M
 
M
M
 
L
L
 
L
K
 
R
A
 
V
F
 
R
G
 
G
P
 
P
L
 
R
G
 
N
D
 
S
F
 
F
S
 
R
F
 
L
V
 
D
R
 
E
H
 
H
P
 
-
G
 
A
E
 
P
K
 
R
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
I
 
L
S
 
A
A
 
G
G
 
G
S
x
I
G
 
G
V
 
I
T
|
T
P
 
P
M
 
I
M
 
M
S
 
T
M
 
M
T
 
A
R
 
A
W
 
R
M
 
A
A
 
K
D
 
E
C
 
L
A
 
G
P
 
-
E
 
-
T
 
T
D
 
D
V
 
Y
T
 
E
F
 
L
I
 
H
S
 
Y
C
 
S
A
 
V
R
 
R
R
 
S
P
 
R
D
 
T
D
 
S
L
 
L
L
 
I
F
 
F
R
 
V
S
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
R
Q
 
Q
M
 
I
P
 
H
G
 
G
L
 
D
N
 
R
L
 
L
G
 
H
F
 
V
L
 
Y
V
 
V
E
 
S
G
 
E
H
 
E
E
 
G
A
 
V
R
 
R
H
 
N
G
 
D
W
 
L
H
 
A
G
 
A
L
 
L
R
 
I
G
 
R
R
 
R
I
 
A
D
 
S
A
 
A
A
 
G
K
 
T
L
 
-
P
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
-
F
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
Q
V
 
I
F
 
Y
C
 
A
C
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
Q
P
 
R
F
 
M
M
 
L
G
 
D
N
 
T
V
 
L
R
 
E
A
 
R
M
 
L
L
 
I
E
 
E
A
 
N
A
 
R
G
 
P
F
 
E
D
 
V
M
 
T
A
 
L
R
 
R
Y
 
V
H
x
E
Q
x
H
E
x
F
S
 
F
F
 
G
Q
 
E
P
 
P
A
 
S
A
 
H
A
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
A
E
 
K
E
 
E
L
 
R
A
 
P
I
 
F
R
 
Q
A
 
-
G
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
V
T
 
V
F
 
L
T
 
R
M
 
N
S
 
S
G
 
G
K
 
L
E
 
T
A
 
V
T
 
E
A
 
V
V
 
P
P
 
A
G
 
D
Q
 
K
T
 
T
I
 
L
L
 
L
Q
 
E
T
 
V
A
 
L
R
 
R
A
 
A
N
 
Y
G
 
N
V
 
I
R
 
E
I
 
V
G
 
Q
A
x
S
A
x
D
C
|
C
E
|
E
G
 
E
G
|
G
I
x
L
C
|
C
G
|
G
T
|
T
C
|
C
R
 
E
V
 
V
L
 
S
K
 
V
I
 
V
A
 
E
G
 
G
D
 
-
V
 
-
E
 
E
M
 
V
N
 
D
H
 
H
N
 
R
G
 
D
G
 
S
I
 
V
L
 
L
D
 
T
-
 
R
-
 
A
D
 
E
E
 
R
I
 
R
E
 
E
E
 
N
G
 
R
Y
 
R
I
 
M
L
 
M
A
 
C
C
|
C
C
 
C
S
 
S
R
 
R
P
 
A
T
 
K
S
 
T
D
 
E

Sites not aligning to the query:

1krhA X-ray structure of benzoate dioxygenase reductase (see paper)
26% identity, 65% coverage: 17:254/364 of query aligns to 102:334/337 of 1krhA

query
sites
1krhA
R
 
K
D
 
T
R
 
K
Q
 
I
H
 
H
M
 
H
L
 
F
E
 
E
C
 
G
M
 
T
S
 
L
A
 
A
V
 
R
A
 
V
E
 
E
T
 
N
A
 
L
D
 
S
V
 
D
M
 
S
T
 
T
F
 
I
T
 
T
F
 
F
R
 
D
-
 
I
-
 
Q
-
 
L
S
 
D
D
 
D
K
 
G
P
 
Q
A
 
P
W
 
D
F
 
I
R
 
H
Y
 
F
L
 
L
P
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
x
Y
V
 
V
T
 
N
L
 
V
E
 
T
L
 
L
P
 
P
V
 
G
A
 
T
A
 
T
K
 
E
P
 
-
V
 
-
M
 
T
R
|
R
T
x
S
Y
|
Y
T
x
S
L
 
F
S
 
S
S
 
S
S
 
Q
P
 
P
S
 
G
R
 
N
P
 
R
L
 
L
S
 
T
V
 
-
A
 
G
V
 
F
T
x
V
V
|
V
K
x
R
A
 
N
Q
x
V
P
 
P
G
 
Q
S
x
G
I
x
K
G
x
M
T
x
S
R
 
E
W
 
Y
M
 
L
F
 
S
D
 
V
N
 
Q
L
 
A
K
 
K
P
 
A
G
 
G
M
 
D
M
 
K
L
 
M
K
 
S
A
 
F
F
 
T
G
 
G
P
 
P
L
 
F
G
 
G
D
 
S
F
 
F
S
 
-
F
 
Y
V
 
L
R
 
R
H
 
D
P
 
V
G
 
K
E
 
R
K
 
P
Y
 
V
L
 
L
F
 
M
I
 
L
S
 
A
A
 
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
V
 
I
T
 
A
P
 
P
M
 
F
M
 
L
S
 
S
M
 
M
T
 
L
R
 
Q
W
 
V
M
 
L
A
 
E
D
 
Q
C
 
K
A
 
G
P
 
S
E
 
E
T
 
H
D
 
P
V
 
V
T
 
R
F
 
L
I
 
V
S
 
F
C
 
G
A
 
V
R
 
T
R
 
Q
P
 
D
D
 
C
D
 
D
L
 
L
L
 
V
F
 
A
R
 
L
S
 
E
E
 
Q
L
 
L
E
 
D
V
 
A
L
 
L
A
 
Q
R
 
Q
Q
 
K
M
 
L
P
 
P
G
 
W
L
 
F
N
 
E
L
 
Y
G
 
R
F
 
T
L
 
V
V
 
V
E
 
A
G
 
H
H
 
A
E
 
E
A
 
S
R
 
Q
H
 
H
G
 
E
W
 
R
H
 
K
G
 
G
-
 
Y
L
 
V
R
 
T
G
 
G
R
 
H
I
 
I
D
 
E
A
 
Y
A
 
-
K
 
-
L
 
-
P
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
D
F
 
W
L
 
L
-
 
N
-
 
G
-
 
G
E
 
E
R
 
V
T
 
D
V
 
V
F
 
Y
C
 
L
C
|
C
G
 
G
P
 
P
E
 
V
P
 
P
F
 
M
M
 
V
G
 
E
N
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
S
M
 
W
L
 
L
E
 
D
A
 
T
A
 
Q
G
 
G
F
 
I
D
 
Q
M
 
P
A
 
A
R
 
N
Y
 
F
H
 
L
Q
 
F
E
|
E
S
x
K
F
|
F

Sites not aligning to the query:

6kbhA Crystal structure of an intact type iv self-sufficient cytochrome p450 monooxygenase
27% identity, 90% coverage: 34:359/364 of query aligns to 467:759/765 of 6kbhA

query
sites
6kbhA
D
 
D
V
 
I
M
 
L
T
 
L
F
 
I
T
 
T
F
 
L
R
 
R
S
 
D
D
 
T
K
 
S
P
 
G
A
 
-
W
 
-
F
 
-
R
 
R
Y
 
P
L
 
L
P
 
P
G
 
K
Q
 
W
F
 
S
V
 
A
T
 
G
L
 
S
E
x
H
L
 
I
P
 
D
V
 
V
A
 
D
A
 
C
K
 
G
P
 
A
V
 
V
M
 
S
R
|
R
T
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
C
S
 
G
S
 
D
P
 
P
S
 
H
R
 
D
P
 
R
L
 
T
S
 
T
V
 
F
A
 
Q
V
 
V
T
x
A
V
|
V
K
x
L
A
 
H
Q
x
D
P
 
R
G
 
E
S
|
S
I
x
R
G
|
G
-
x
G
T
x
S
R
 
R
W
 
W
M
 
I
F
 
H
D
 
T
N
 
E
L
 
L
K
 
A
P
 
V
G
 
G
M
 
A
M
 
T
L
 
L
K
 
R
A
 
V
F
 
R
G
 
G
P
 
P
L
 
R
G
 
N
D
 
H
F
 
F
S
 
K
F
 
L
V
 
-
R
 
D
H
 
P
P
 
D
G
 
A
E
 
K
K
 
R
Y
 
Y
L
 
V
F
 
F
I
 
V
S
 
A
A
 
G
G
 
G
S
x
I
G
 
G
V
 
I
T
|
T
P
 
P
M
 
V
M
 
I
S
 
A
M
 
M
T
 
A
R
 
D
W
 
Q
M
 
V
A
 
K
D
 
A
C
 
A
A
 
G
P
 
G
E
 
D
T
 
Y
D
 
E
V
 
I
T
 
H
F
 
Y
I
 
A
S
 
G
C
 
R
A
 
S
R
 
R
R
 
T
P
 
S
D
 
M
D
 
A
L
 
F
L
 
L
F
 
D
R
 
R
S
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
D
M
 
H
P
 
G
G
 
-
L
 
-
N
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
E
G
 
S
H
 
V
E
 
R
A
 
V
R
 
Y
H
 
P
G
 
G
W
 
D
H
 
E
G
 
G
L
 
V
R
 
R
G
 
-
R
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
M
K
 
D
L
 
L
P
 
P
M
 
S
L
 
L
A
 
F
P
 
A
D
 
D
F
 
P
L
 
E
E
 
D
R
 
G
T
 
T
-
 
Q
V
 
V
F
 
Y
C
 
S
C
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
E
P
 
R
F
 
L
M
 
L
G
 
S
N
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
A
M
 
L
L
 
S
E
 
E
A
 
A
-
 
T
A
 
A
G
 
H
F
 
W
D
 
P
M
 
D
A
 
D
R
 
T
Y
 
L
H
 
H
Q
 
V
E
|
E
S
x
H
F
|
F
Q
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
S
P
 
S
A
 
T
A
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
D
P
 
P
T
 
S
A
 
K
D
 
E
A
 
H
G
 
G
A
 
F
G
 
D
A
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
V
T
 
V
F
 
L
T
 
K
M
 
D
S
 
S
G
 
G
K
 
I
E
 
T
A
 
V
T
 
P
A
 
V
V
 
A
P
 
A
G
 
D
Q
 
Q
T
 
T
I
 
V
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
A
 
L
R
 
R
A
 
A
N
 
A
G
 
N
V
 
I
R
 
D
I
 
A
G
 
Q
A
 
S
A
 
D
C
|
C
E
|
E
G
 
E
G
|
G
I
|
I
C
|
C
G
|
G
T
 
A
C
|
C
R
 
E
V
 
V
L
 
P
K
 
V
I
 
L
A
 
D
G
 
G
D
 
-
V
 
-
E
 
E
M
 
V
N
 
D
H
 
H
N
 
R
G
 
D
G
 
L
I
 
V
L
 
L
-
 
T
-
 
K
D
 
T
D
 
E
E
 
R
I
 
A
E
 
A
E
 
G
G
 
K
Y
 
T
I
 
M
L
 
M
A
 
T
C
|
C
C
 
C
S
 
S
R
 
R
P
 
A
T
 
C
S
 
G
D
 
D

Sites not aligning to the query:

4eh1A Crystal structure of the flavohem-like-fad/NAD binding domain of nitric oxide dioxygenase from vibrio cholerae o1 biovar el tor
29% identity, 62% coverage: 30:256/364 of query aligns to 13:237/237 of 4eh1A

query
sites
4eh1A
A
 
V
E
 
E
T
 
S
A
 
A
D
 
Y
V
 
V
M
 
T
T
 
S
F
 
F
T
 
V
F
 
L
R
 
V
-
 
P
S
 
A
D
 
D
K
 
G
P
 
G
A
 
A
W
 
V
F
 
L
R
 
D
Y
 
Y
L
 
Q
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
x
Y
V
 
I
T
 
G
L
 
I
E
 
E
L
 
V
P
 
T
V
 
P
A
 
E
A
 
G
K
 
S
P
 
D
V
 
Y
-
 
R
-
 
E
M
 
I
R
|
R
T
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
S
-
 
H
S
 
A
S
 
S
P
 
N
S
 
G
R
 
R
P
 
E
L
 
Y
S
 
R
V
 
I
A
x
S
V
|
V
T
x
K
V
 
R
K
x
E
A
 
G
-
 
V
-
 
G
-
 
S
-
 
D
Q
x
N
P
 
P
G
|
G
S
x
L
I
x
V
G
 
-
T
x
S
R
 
H
W
 
Y
M
 
L
F
 
H
D
 
N
N
 
N
L
 
V
K
 
K
P
 
V
G
 
G
M
 
D
M
 
S
L
 
V
K
 
K
A
 
L
F
 
Y
G
 
A
P
 
P
L
 
A
G
 
G
D
 
D
F
 
F
S
 
F
F
 
Y
V
 
V
R
 
E
H
 
R
P
 
E
G
 
-
E
 
R
K
 
P
Y
 
V
L
 
V
F
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
S
x
V
G
 
G
V
 
A
T
|
T
P
 
P
M
 
M
M
 
Q
S
 
A
M
 
I
T
 
L
R
 
H
W
 
T
M
 
L
A
 
A
D
 
K
C
 
-
A
 
Q
P
 
N
E
 
K
T
 
S
D
 
G
V
 
V
T
 
T
F
 
Y
I
 
L
S
 
Y
C
 
A
A
 
C
R
 
N
R
 
S
P
 
A
D
 
K
D
 
E
L
 
H
L
 
T
F
 
F
R
 
A
S
 
Q
E
 
E
L
 
T
-
 
A
E
 
Q
V
 
L
L
 
I
A
 
A
R
 
Q
Q
 
Q
M
 
G
P
 
W
G
 
M
L
 
Q
N
 
Q
L
 
V
G
 
W
F
 
Y
L
 
R
V
 
D
E
 
E
G
 
S
H
 
A
E
 
D
A
 
D
R
 
V
H
 
-
G
 
-
W
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
R
 
E
I
 
M
D
 
Q
A
 
L
A
 
A
K
 
E
L
 
L
-
 
I
-
 
L
P
 
P
M
 
I
L
 
E
A
 
D
P
 
G
D
 
D
F
 
F
L
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
-
V
 
-
F
 
Y
C
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
I
P
 
G
F
 
F
M
 
M
G
 
Q
N
 
Y
V
 
V
R
 
V
A
 
K
M
 
Q
L
 
L
E
 
L
A
 
A
A
 
L
G
 
G
F
 
V
D
 
D
M
 
K
A
 
A
R
 
R
Y
 
I
H
 
H
Q
 
Y
E
|
E
S
 
V
F
|
F
Q
 
G
P
 
P

2eixA The structure of physarum polycephalum cytochrome b5 reductase (see paper)
25% identity, 64% coverage: 13:244/364 of query aligns to 6:235/243 of 2eixA

query
sites
2eixA
L
 
L
D
 
N
P
 
P
W
 
N
R
 
E
D
 
Y
R
 
K
Q
 
K
H
 
F
M
 
M
L
 
L
E
 
R
C
 
E
M
 
K
S
 
Q
A
 
I
V
 
I
A
 
N
E
 
H
T
 
N
A
 
T
D
 
R
V
 
L
M
 
-
T
 
-
F
 
F
T
 
R
F
 
F
R
 
N
S
 
L
D
 
H
K
 
H
P
 
P
A
 
E
W
 
D
F
 
V
R
 
V
Y
 
G
L
 
L
P
 
P
-
 
I
G
 
G
Q
 
Q
F
x
H
V
 
M
T
 
S
L
 
V
E
 
K
L
 
A
P
 
T
V
 
V
A
 
D
A
 
G
K
 
K
P
 
E
V
 
I
M
 
Y
R
|
R
T
x
P
Y
|
Y
T
|
T
L
 
P
S
 
V
S
 
S
S
 
S
P
 
D
S
 
D
R
 
E
P
 
K
L
 
G
S
 
Y
V
 
F
A
 
D
V
 
L
T
x
I
V
x
I
K
 
K
A
 
V
Q
x
Y
P
x
E
G
x
K
S
x
G
I
x
Q
G
x
M
T
x
S
R
 
Q
W
 
Y
M
 
I
F
 
-
D
 
D
N
 
H
L
 
L
K
 
N
P
 
P
G
 
G
M
 
D
M
 
F
L
 
L
K
 
Q
A
 
V
F
 
R
G
 
G
P
 
P
L
 
K
G
 
G
D
 
Q
F
 
F
S
 
D
F
 
Y
V
 
K
R
 
P
H
 
N
P
 
M
G
 
V
E
 
K
K
 
E
Y
 
M
L
 
G
F
 
M
I
 
I
S
 
A
A
 
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
V
 
I
T
|
T
P
|
P
M
 
M
M
 
L
S
 
Q
M
 
V
T
 
A
R
 
R
W
 
A
M
 
I
A
 
I
D
 
K
C
 
N
A
 
P
P
 
K
E
 
E
-
 
K
T
 
T
D
 
I
V
 
I
T
 
N
F
 
L
I
 
I
S
 
F
C
 
A
A
 
N
R
 
V
R
 
N
P
 
E
D
 
D
D
 
D
L
 
I
L
 
L
F
 
L
R
 
R
S
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
D
V
 
D
L
 
M
A
 
A
R
 
K
Q
 
K
M
 
Y
P
 
S
G
 
N
L
 
F
N
 
K
L
 
V
G
 
Y
F
 
Y
L
 
V
V
 
L
E
 
N
G
 
N
H
 
P
E
 
P
A
 
A
R
 
-
H
 
-
G
 
G
W
 
W
H
 
T
G
 
G
L
 
G
R
 
V
G
 
G
R
x
F
I
x
V
D
 
S
A
 
A
A
 
D
K
 
M
L
 
I
P
 
K
M
 
Q
-
 
H
L
 
F
A
 
S
P
 
P
D
 
P
F
 
S
L
 
S
E
 
D
R
 
I
T
 
K
V
 
V
F
 
M
C
 
M
C
|
C
G
 
G
P
 
P
E
 
P
P
x
M
F
x
M
M
 
N
G
x
K
N
x
A
V
x
M
R
 
Q
A
 
G
M
 
H
L
 
L
E
 
E
A
 
T
A
 
L
G
 
G
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

P33164 Phthalate dioxygenase reductase; PDR; EC 1.-.-.- from Burkholderia cepacia (Pseudomonas cepacia) (see paper)
25% identity, 84% coverage: 53:358/364 of query aligns to 43:315/322 of P33164

query
sites
P33164
G
 
G
Q
 
A
F
 
N
V
 
L
T
 
T
L
 
V
E
 
A
L
 
V
P
 
P
V
 
N
A
 
G
A
 
S
K
 
R
P
 
-
V
 
-
M
 
-
R
|
R
T
|
T
Y
 
Y
T
 
S
L
 
L
-
 
C
S
 
N
S
 
D
S
 
S
P
 
Q
S
 
E
R
 
R
P
 
N
L
 
R
S
 
Y
V
 
V
A
 
I
V
x
A
T
x
V
V
x
K
K
 
R
A
 
D
Q
 
S
P
 
N
G
 
G
S
x
R
I
x
G
G
|
G
T
x
S
R
 
I
W
 
S
M
 
F
F
 
I
D
 
D
N
 
D
L
 
T
K
 
S
P
 
E
G
 
G
M
 
D
M
 
A
L
 
V
K
 
E
A
 
V
F
 
S
G
 
L
P
 
P
L
 
R
G
 
N
D
 
E
F
 
F
S
 
P
F
 
L
V
 
D
R
 
K
H
 
R
P
 
-
G
 
A
E
 
K
K
 
S
Y
 
F
L
 
I
F
 
L
I
 
V
S
 
A
A
 
G
G
 
G
S
 
I
G
 
G
V
 
I
T
|
T
P
 
P
M
 
M
M
 
L
S
 
S
M
 
M
T
 
A
R
 
R
W
 
Q
M
 
L
A
 
-
D
 
-
C
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
D
 
-
V
 
-
T
 
-
F
 
-
I
 
-
S
 
-
C
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
R
P
 
A
D
 
E
D
 
G
L
 
L
L
 
R
-
 
S
F
 
F
R
 
R
S
 
-
E
 
-
L
 
L
E
 
Y
V
 
Y
L
 
L
A
 
T
R
 
R
Q
 
D
M
 
P
P
 
E
G
 
G
L
 
T
N
 
A
L
 
F
G
 
F
F
 
D
L
 
E
V
 
L
E
 
T
G
 
S
H
 
D
E
 
E
A
 
W
R
 
R
-
 
S
-
 
D
-
 
V
-
 
K
-
 
I
H
 
H
G
 
H
W
 
D
H
 
H
G
 
G
L
 
D
R
 
-
G
 
-
R
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
P
 
P
M
 
T
L
 
K
A
 
A
P
 
F
D
 
D
F
 
F
-
 
W
-
 
S
-
 
V
L
 
F
E
 
E
R
 
K
T
 
S
-
 
K
-
 
P
-
 
A
-
 
Q
-
 
H
V
 
V
F
 
Y
C
 
C
C
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
Q
P
 
A
F
 
L
M
 
M
G
 
D
N
 
T
V
 
V
R
 
R
A
 
D
M
 
M
L
 
-
E
 
-
A
 
T
A
 
G
G
 
H
F
 
W
D
 
P
M
 
S
A
 
G
R
 
T
Y
 
V
H
 
H
Q
 
F
E
 
E
S
 
S
F
|
F
Q
 
G
P
 
A
A
 
T
A
 
N
A
 
T
P
 
N
A
 
A
A
 
R
E
 
E
E
 
N
L
 
T
A
 
P
I
 
F
R
 
T
A
 
-
G
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
V
T
 
R
F
 
L
T
 
S
M
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
T
E
 
S
A
 
F
T
 
E
A
 
I
V
 
P
P
 
A
G
 
N
Q
 
R
T
 
S
I
 
I
L
 
L
Q
 
E
T
 
V
A
 
L
R
 
R
A
 
D
N
 
A
G
 
N
V
 
V
R
 
R
I
 
V
G
 
P
A
 
S
A
 
S
C
|
C
E
 
E
G
x
S
G
 
G
I
 
T
C
|
C
G
 
G
T
 
S
C
|
C
R
 
K
V
 
T
L
 
A
K
 
L
I
 
C
A
 
S
G
 
G
D
 
-
V
 
-
E
 
E
M
 
A
N
 
D
H
 
H
N
 
R
G
 
D
G
 
M
I
 
V
L
 
L
D
 
R
D
 
D
E
 
D
I
 
E
E
 
K
E
 
G
G
 
T
Y
 
Q
I
 
I
L
 
M
A
 
V
C
|
C
C
 
V
S
 
S
R
 
R
P
 
A
T
 
K
S
 
S

2piaA Phthalate dioxygenase reductase: a modular structure for electron transfer from pyridine nucleotides to [2fe-2s] (see paper)
25% identity, 84% coverage: 53:358/364 of query aligns to 42:314/321 of 2piaA

query
sites
2piaA
G
 
G
Q
 
A
F
x
N
V
 
L
T
 
T
L
 
V
E
 
A
L
 
V
P
 
P
V
 
N
A
 
G
A
 
S
K
 
R
P
 
-
V
 
-
M
 
-
R
|
R
T
|
T
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
-
 
C
S
 
N
S
 
D
S
 
S
P
 
Q
S
 
E
R
 
R
P
 
N
L
 
R
S
 
Y
V
 
V
A
 
I
V
x
A
T
x
V
V
x
K
K
 
R
A
x
D
Q
 
S
P
 
N
G
|
G
S
x
R
I
x
G
G
|
G
T
x
S
R
 
I
W
 
S
M
 
F
F
 
I
D
 
D
N
 
D
L
 
T
K
 
S
P
 
E
G
 
G
M
 
D
M
 
A
L
 
V
K
 
E
A
 
V
F
 
S
G
 
L
P
 
P
L
 
R
G
 
N
D
 
E
F
 
F
S
 
P
F
 
L
V
 
D
R
 
K
H
 
R
P
 
-
G
 
A
E
 
K
K
 
S
Y
 
F
L
 
I
F
 
L
I
 
V
S
 
A
A
 
G
G
 
G
S
x
I
G
 
G
V
 
I
T
|
T
P
 
P
M
 
M
M
 
L
S
 
S
M
 
M
T
 
A
R
 
R
W
 
Q
M
 
L
A
 
-
D
 
-
C
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
D
 
-
V
 
-
T
 
-
F
 
-
I
 
-
S
 
-
C
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
R
P
 
A
D
 
E
D
 
G
L
 
L
L
 
R
-
 
S
F
 
F
R
 
R
S
 
-
E
 
-
L
 
L
E
 
Y
V
 
Y
L
 
L
A
 
T
R
 
R
Q
 
D
M
 
P
P
 
E
G
 
G
L
 
T
N
 
A
L
 
F
G
 
F
F
 
D
L
 
E
V
 
L
E
 
T
G
 
S
H
 
D
E
 
E
A
 
W
R
 
R
-
 
S
-
 
D
-
 
V
-
 
K
-
 
I
H
 
H
G
 
H
W
 
D
H
 
H
G
 
G
L
 
D
R
 
-
G
 
-
R
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
P
 
P
M
 
T
L
 
K
A
 
A
P
 
F
D
 
D
F
 
F
-
 
W
-
 
S
-
 
V
L
 
F
E
 
E
R
 
K
T
 
S
-
 
K
-
 
P
-
 
A
-
 
Q
-
 
H
V
 
V
F
 
Y
C
 
C
C
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
Q
P
 
A
F
 
L
M
 
M
G
 
D
N
 
T
V
 
V
R
 
R
A
 
D
M
 
M
L
 
-
E
 
-
A
 
T
A
 
G
G
 
H
F
 
W
D
 
P
M
 
S
A
 
G
R
 
T
Y
 
V
H
 
H
Q
 
F
E
|
E
S
|
S
F
|
F
Q
 
G
P
 
A
A
 
T
A
 
N
A
 
T
P
 
N
A
 
A
A
 
R
E
 
E
E
 
N
L
 
T
A
 
P
I
 
F
R
 
T
A
 
-
G
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
V
T
 
R
F
 
L
T
 
S
M
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
T
E
 
S
A
 
F
T
 
E
A
 
I
V
 
P
P
 
A
G
 
N
Q
 
R
T
 
S
I
 
I
L
 
L
Q
 
E
T
 
V
A
 
L
R
 
R
A
 
D
N
 
A
G
 
N
V
 
V
R
 
R
I
 
V
G
 
P
A
x
S
A
 
S
C
|
C
E
|
E
G
x
S
G
|
G
I
 
T
C
|
C
G
|
G
T
 
S
C
|
C
R
 
K
V
 
T
L
 
A
K
 
L
I
 
C
A
 
S
G
 
G
D
 
-
V
 
-
E
 
E
M
 
A
N
 
D
H
 
H
N
 
R
G
 
D
G
 
M
I
 
V
L
 
L
D
 
R
D
 
D
E
 
D
I
 
E
E
 
K
E
 
G
G
 
T
Y
 
Q
I
 
I
L
x
M
A
 
V
C
|
C
C
 
V
S
 
S
R
 
R
P
 
A
T
 
K
S
 
S

3ozwA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with ketoconazole (see paper)
28% identity, 56% coverage: 52:256/364 of query aligns to 187:398/403 of 3ozwA

query
sites
3ozwA
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
x
Y
-
 
T
-
 
S
V
 
V
T
 
A
L
 
I
E
 
D
L
 
V
P
 
P
V
 
A
A
 
L
A
 
G
K
 
L
P
 
Q
V
 
Q
M
 
I
R
|
R
T
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
S
S
 
D
S
 
M
P
 
P
S
 
N
-
 
G
R
 
R
P
 
S
L
 
Y
S
 
R
V
 
I
A
x
S
V
|
V
T
x
K
V
 
R
K
x
E
A
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
P
Q
|
Q
P
|
P
G
 
P
S
x
G
I
x
Y
G
x
V
T
x
S
R
 
N
W
 
L
M
 
L
F
 
H
D
 
D
N
 
H
L
 
V
K
 
N
P
 
V
G
 
G
M
 
D
M
 
Q
L
 
V
K
 
K
A
 
L
F
 
A
G
 
A
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
D
 
S
F
 
F
S
 
H
F
 
I
V
 
D
R
 
V
H
 
D
P
 
A
G
 
K
E
 
T
K
 
P
Y
 
I
L
 
V
F
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
G
G
 
G
S
x
V
G
 
G
V
 
L
T
|
T
P
 
P
M
 
M
M
 
V
S
 
S
M
 
M
T
 
L
R
 
K
W
 
-
M
 
V
A
 
A
D
 
L
C
 
Q
A
 
A
P
 
P
E
 
P
T
 
R
D
 
Q
V
 
V
T
 
V
F
 
F
I
 
V
S
 
H
C
 
G
A
 
A
R
 
R
R
 
N
P
 
S
D
 
A
D
 
V
L
 
H
L
 
A
F
 
M
R
 
R
S
 
D
E
 
R
L
 
L
E
 
R
V
 
E
L
 
A
A
 
A
R
 
K
Q
 
T
M
 
Y
P
 
E
G
 
N
L
 
L
N
 
D
L
 
L
G
 
F
F
 
V
L
 
F
V
 
Y
E
 
D
G
 
Q
-
 
P
-
 
L
-
 
P
H
 
E
E
 
D
A
 
V
R
 
Q
H
 
G
G
 
R
W
 
D
H
 
Y
G
 
D
L
 
Y
R
 
P
G
 
G
R
 
L
I
 
V
D
 
D
A
 
V
A
 
K
K
 
Q
L
 
I
-
 
E
-
 
K
P
 
S
M
 
I
L
 
L
A
 
L
P
 
P
D
 
D
F
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
A
T
 
D
V
 
Y
F
 
Y
C
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
I
P
 
P
F
 
F
M
 
M
G
 
R
N
 
M
V
 
Q
R
 
H
A
 
D
M
 
A
L
 
L
E
 
K
A
 
N
A
 
L
G
 
G
F
 
I
D
 
H
M
 
E
A
 
A
R
 
R
Y
 
I
H
 
H
Q
 
Y
E
|
E
S
x
V
F
|
F
Q
x
G
P
|
P

Sites not aligning to the query:

3ozvA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with econazole (see paper)
28% identity, 56% coverage: 52:256/364 of query aligns to 187:398/403 of 3ozvA

query
sites
3ozvA
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
x
Y
-
 
T
-
 
S
V
 
V
T
 
A
L
 
I
E
 
D
L
 
V
P
 
P
V
 
A
A
 
L
A
 
G
K
 
L
P
 
Q
V
 
Q
M
 
I
R
|
R
T
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
S
S
 
D
S
 
M
P
 
P
S
 
N
-
 
G
R
 
R
P
 
S
L
 
Y
S
 
R
V
 
I
A
x
S
V
|
V
T
x
K
V
 
R
K
x
E
A
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
P
Q
|
Q
P
|
P
G
x
P
S
x
G
I
x
Y
G
x
V
T
x
S
R
 
N
W
 
L
M
 
L
F
 
H
D
 
D
N
 
H
L
 
V
K
 
N
P
 
V
G
 
G
M
 
D
M
 
Q
L
 
V
K
 
K
A
 
L
F
 
A
G
 
A
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
D
 
S
F
 
F
S
 
H
F
 
I
V
 
D
R
 
V
H
 
D
P
 
A
G
 
K
E
 
T
K
 
P
Y
 
I
L
 
V
F
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
G
G
 
G
S
x
V
G
 
G
V
 
L
T
|
T
P
 
P
M
 
M
M
 
V
S
 
S
M
 
M
T
 
L
R
 
K
W
 
-
M
 
V
A
 
A
D
 
L
C
 
Q
A
 
A
P
 
P
E
 
P
T
 
R
D
 
Q
V
 
V
T
 
V
F
 
F
I
 
V
S
 
H
C
 
G
A
 
A
R
 
R
R
 
N
P
 
S
D
 
A
D
 
V
L
 
H
L
 
A
F
 
M
R
 
R
S
 
D
E
 
R
L
 
L
E
 
R
V
 
E
L
 
A
A
 
A
R
 
K
Q
 
T
M
 
Y
P
 
E
G
 
N
L
 
L
N
 
D
L
 
L
G
 
F
F
 
V
L
 
F
V
 
Y
E
 
D
G
 
Q
-
 
P
-
 
L
-
 
P
H
 
E
E
 
D
A
 
V
R
 
Q
H
 
G
G
 
R
W
 
D
H
 
Y
G
 
D
L
 
Y
R
 
P
G
 
G
R
 
L
I
 
V
D
 
D
A
 
V
A
 
K
K
 
Q
L
 
I
-
 
E
-
 
K
P
 
S
M
 
I
L
 
L
A
 
L
P
 
P
D
 
D
F
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
A
T
 
D
V
 
Y
F
 
Y
C
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
I
P
 
P
F
 
F
M
 
M
G
 
R
N
 
M
V
 
Q
R
 
H
A
 
D
M
 
A
L
 
L
E
 
K
A
 
N
A
 
L
G
 
G
F
 
I
D
 
H
M
 
E
A
 
A
R
 
R
Y
 
I
H
 
H
Q
 
Y
E
|
E
S
x
V
F
|
F
Q
x
G
P
|
P

Sites not aligning to the query:

3ozuA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with miconazole (see paper)
28% identity, 56% coverage: 52:256/364 of query aligns to 187:398/403 of 3ozuA

query
sites
3ozuA
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
x
Y
-
 
T
-
 
S
V
 
V
T
 
A
L
 
I
E
 
D
L
 
V
P
 
P
V
 
A
A
 
L
A
 
G
K
 
L
P
 
Q
V
 
Q
M
 
I
R
|
R
T
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
S
S
 
D
S
 
M
P
 
P
S
 
N
-
 
G
R
 
R
P
 
S
L
 
Y
S
 
R
V
 
I
A
x
S
V
|
V
T
x
K
V
 
R
K
x
E
A
x
G
-
 
G
-
 
G
-
 
P
Q
|
Q
P
|
P
G
x
P
S
x
G
I
x
Y
G
x
V
T
x
S
R
 
N
W
 
L
M
 
L
F
 
H
D
 
D
N
 
H
L
 
V
K
 
N
P
 
V
G
 
G
M
 
D
M
 
Q
L
 
V
K
 
K
A
 
L
F
 
A
G
 
A
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
D
 
S
F
 
F
S
 
H
F
 
I
V
 
D
R
 
V
H
 
D
P
 
A
G
 
K
E
 
T
K
 
P
Y
 
I
L
 
V
F
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
G
G
 
G
S
 
V
G
 
G
V
 
L
T
 
T
P
 
P
M
 
M
M
 
V
S
 
S
M
 
M
T
 
L
R
 
K
W
 
-
M
 
V
A
 
A
D
 
L
C
 
Q
A
 
A
P
 
P
E
 
P
T
 
R
D
 
Q
V
 
V
T
 
V
F
 
F
I
 
V
S
 
H
C
 
G
A
 
A
R
 
R
R
 
N
P
 
S
D
 
A
D
 
V
L
 
H
L
 
A
F
 
M
R
 
R
S
 
D
E
 
R
L
 
L
E
 
R
V
 
E
L
 
A
A
 
A
R
 
K
Q
 
T
M
 
Y
P
 
E
G
 
N
L
 
L
N
 
D
L
 
L
G
 
F
F
 
V
L
 
F
V
 
Y
E
 
D
G
 
Q
-
 
P
-
 
L
-
 
P
H
 
E
E
 
D
A
 
V
R
 
Q
H
 
G
G
 
R
W
 
D
H
 
Y
G
 
D
L
 
Y
R
 
P
G
 
G
R
 
L
I
 
V
D
 
D
A
 
V
A
 
K
K
 
Q
L
 
I
-
 
E
-
 
K
P
 
S
M
 
I
L
 
L
A
 
L
P
 
P
D
 
D
F
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
A
T
 
D
V
 
Y
F
 
Y
C
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
I
P
 
P
F
 
F
M
 
M
G
 
R
N
 
M
V
 
Q
R
 
H
A
 
D
M
 
A
L
 
L
E
 
K
A
 
N
A
 
L
G
 
G
F
 
I
D
 
H
M
 
E
A
 
A
R
 
R
Y
 
I
H
 
H
Q
 
Y
E
|
E
S
x
V
F
 
F
Q
x
G
P
|
P

Sites not aligning to the query:

P39662 Flavohemoprotein; FHP; Flavohemoglobin; Hemoglobin-like protein; Nitric oxide dioxygenase; NO oxygenase; NOD; EC 1.14.12.17 from Cupriavidus necator (strain ATCC 17699 / DSM 428 / KCTC 22496 / NCIMB 10442 / H16 / Stanier 337) (Ralstonia eutropha) (see paper)
28% identity, 56% coverage: 52:256/364 of query aligns to 187:398/403 of P39662

query
sites
P39662
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
Y
-
 
T
-
 
S
V
 
V
T
 
A
L
 
I
E
 
D
L
 
V
P
 
P
V
 
A
A
 
L
A
 
G
K
 
L
P
 
Q
V
 
Q
M
 
I
R
 
R
T
 
Q
Y
 
Y
T
 
S
L
 
L
S
 
S
S
 
D
S
 
M
P
 
P
S
 
N
-
 
G
R
 
R
P
 
S
L
 
Y
S
 
R
V
 
I
A
 
S
V
 
V
T
 
K
V
 
R
K
 
E
A
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
P
Q
 
Q
P
 
P
G
 
P
S
 
G
I
 
Y
G
 
V
T
 
S
R
 
N
W
 
L
M
 
L
F
 
H
D
 
D
N
 
H
L
 
V
K
 
N
P
 
V
G
 
G
M
 
D
M
 
Q
L
 
V
K
 
K
A
 
L
F
 
A
G
 
A
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
D
 
S
F
 
F
S
 
H
F
 
I
V
 
D
R
 
V
H
 
D
P
 
A
G
 
K
E
 
T
K
 
P
Y
 
I
L
 
V
F
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
G
G
 
G
S
 
V
G
 
G
V
 
L
T
 
T
P
 
P
M
 
M
M
 
V
S
 
S
M
 
M
T
 
L
R
 
K
W
 
-
M
 
V
A
 
A
D
 
L
C
 
Q
A
 
A
P
 
P
E
 
P
T
 
R
D
 
Q
V
 
V
T
 
V
F
 
F
I
 
V
S
 
H
C
 
G
A
 
A
R
 
R
R
 
N
P
 
S
D
 
A
D
 
V
L
 
H
L
 
A
F
 
M
R
 
R
S
 
D
E
 
R
L
 
L
E
 
R
V
 
E
L
 
A
A
 
A
R
 
K
Q
 
T
M
 
Y
P
 
E
G
 
N
L
 
L
N
 
D
L
 
L
G
 
F
F
 
V
L
 
F
V
 
Y
E
 
D
G
 
Q
-
 
P
-
 
L
-
 
P
H
 
E
E
 
D
A
 
V
R
 
Q
H
 
G
G
 
R
W
 
D
H
 
Y
G
 
D
L
 
Y
R
 
P
G
 
G
R
 
L
I
 
V
D
 
D
A
 
V
A
 
K
K
 
Q
L
 
I
-
 
E
-
 
K
P
 
S
M
 
I
L
 
L
A
 
L
P
 
P
D
 
D
F
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
A
T
 
D
V
 
Y
F
 
Y
C
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
I
P
 
P
F
 
F
M
 
M
G
 
R
N
 
M
V
 
Q
R
 
H
A
 
D
M
 
A
L
 
L
E
 
K
A
 
N
A
 
L
G
 
G
F
 
I
D
 
H
M
 
E
A
 
A
R
 
R
Y
 
I
H
 
H
Q
 
Y
E
 
E
S
 
V
F
 
F
Q
 
G
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1cqxA Crystal structure of the flavohemoglobin from alcaligenes eutrophus at 1.75 a resolution (see paper)
28% identity, 56% coverage: 52:256/364 of query aligns to 187:398/403 of 1cqxA

query
sites
1cqxA
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
x
Y
-
 
T
-
 
S
V
 
V
T
 
A
L
 
I
E
 
D
L
 
V
P
 
P
V
 
A
A
 
L
A
 
G
K
 
L
P
 
Q
V
 
Q
M
 
I
R
|
R
T
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
S
S
 
D
S
 
M
P
 
P
S
 
N
-
 
G
R
 
R
P
 
T
L
 
Y
S
 
R
V
 
I
A
x
S
V
|
V
T
x
K
V
 
R
K
x
E
A
x
G
-
 
G
-
 
G
-
 
P
Q
|
Q
P
|
P
G
 
P
S
x
G
I
x
Y
G
x
V
T
x
S
R
 
N
W
 
L
M
 
L
F
 
H
D
 
D
N
 
H
L
 
V
K
 
N
P
 
V
G
 
G
M
 
D
M
 
Q
L
 
V
K
 
K
A
 
L
F
 
A
G
 
A
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
D
 
S
F
 
F
S
 
H
F
 
I
V
 
D
R
 
V
H
 
D
P
 
A
G
 
K
E
 
T
K
 
P
Y
 
I
L
 
V
F
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
G
G
 
G
S
 
V
G
 
G
V
 
L
T
 
T
P
 
P
M
 
M
M
 
V
S
 
S
M
 
M
T
 
L
R
 
K
W
 
-
M
 
V
A
 
A
D
 
L
C
 
Q
A
 
A
P
 
P
E
 
P
T
 
R
D
 
Q
V
 
V
T
 
V
F
 
F
I
 
V
S
 
H
C
 
G
A
 
A
R
 
R
R
 
N
P
 
S
D
 
A
D
 
V
L
 
H
L
 
A
F
 
M
R
 
R
S
 
D
E
 
R
L
 
L
E
 
R
V
 
E
L
 
A
A
 
A
R
 
K
Q
 
T
M
 
Y
P
 
E
G
 
N
L
 
L
N
 
D
L
 
L
G
 
F
F
 
V
L
 
F
V
 
Y
E
 
D
G
 
Q
-
 
P
-
 
L
-
 
P
H
 
E
E
 
D
A
 
V
R
 
Q
H
 
G
G
 
R
W
 
D
H
 
Y
G
 
D
L
 
Y
R
 
P
G
 
G
R
 
L
I
 
V
D
 
D
A
 
V
A
 
K
K
 
Q
L
 
I
-
 
E
-
 
K
P
 
S
M
 
I
L
 
L
A
 
L
P
 
P
D
 
D
F
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
A
T
 
D
V
 
Y
F
 
Y
C
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
I
P
 
P
F
 
F
M
 
M
G
 
R
N
 
M
V
 
Q
R
 
H
A
 
D
M
 
A
L
 
L
E
 
K
A
 
N
A
 
L
G
 
G
F
 
I
D
 
H
M
 
E
A
 
A
R
 
R
Y
 
I
H
 
H
Q
 
Y
E
|
E
S
x
V
F
 
F
Q
x
G
P
|
P

Sites not aligning to the query:

6mv2A 2.05a resolution structure of the cs-b5r domains of human ncb5or (NADP+ form) (see paper)
27% identity, 54% coverage: 53:250/364 of query aligns to 143:352/356 of 6mv2A

query
sites
6mv2A
G
 
G
Q
 
Q
F
x
H
V
 
V
T
 
Y
L
 
L
E
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
I
A
 
T
A
 
G
K
 
T
P
 
E
V
 
I
M
 
V
R
x
K
T
x
P
Y
|
Y
T
|
T
-
 
P
-
 
V
-
 
S
-
 
G
-
 
S
L
 
L
S
 
L
S
 
S
S
 
E
P
 
F
S
 
K
R
 
E
P
 
P
L
 
V
-
 
L
-
 
P
-
 
N
-
 
N
-
 
K
S
 
Y
V
 
I
A
 
Y
V
 
F
T
x
L
V
x
I
K
|
K
A
 
I
Q
x
Y
P
 
P
G
x
T
S
x
G
I
x
L
G
x
F
T
|
T
R
 
P
W
 
E
M
 
L
F
 
-
D
 
D
N
 
R
L
 
L
K
 
Q
P
 
I
G
 
G
M
 
D
M
 
F
L
 
V
K
 
S
A
 
V
F
 
S
G
 
S
P
 
P
L
 
E
G
 
G
D
 
N
F
 
F
S
 
K
F
 
I
V
 
S
R
 
K
H
 
F
P
 
Q
G
 
E
E
 
L
K
 
E
Y
 
D
L
 
L
F
 
F
I
 
L
-
 
L
S
 
A
A
|
A
G
|
G
S
x
T
G
|
G
V
 
F
T
|
T
P
|
P
M
 
M
M
 
V
S
 
K
M
 
I
T
 
L
R
 
N
W
 
Y
-
 
A
M
 
L
A
 
T
D
 
D
C
 
I
A
 
P
P
 
S
E
 
L
T
 
R
D
 
K
V
 
V
T
 
K
F
 
L
I
 
M
S
 
F
C
x
F
A
x
N
R
x
K
R
 
T
P
 
E
D
 
D
D
 
D
L
 
I
L
 
I
F
 
W
R
 
R
S
 
S
E
 
Q
L
 
L
E
 
E
V
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
F
Q
 
K
M
 
D
P
 
K
G
 
R
L
 
L
N
 
D
L
 
V
G
 
E
F
 
F
L
 
V
V
 
L
E
x
S
G
 
A
H
 
P
E
 
I
A
 
S
R
 
E
H
 
-
G
 
-
W
 
W
H
 
N
G
 
G
L
 
K
R
 
Q
G
 
G
R
x
H
I
 
I
D
 
S
A
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
P
 
P
M
 
A
L
 
L
A
 
L
P
 
S
D
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
K
R
 
R
T
 
N
-
 
L
-
 
D
-
 
K
-
 
S
-
 
K
-
 
V
-
 
L
V
 
V
F
 
C
C
 
I
C
|
C
G
|
G
P
|
P
E
 
V
P
|
P
F
|
F
M
 
T
G
 
E
N
 
Q
V
 
G
R
 
V
A
 
R
M
 
L
L
 
L
E
 
H
A
 
D
A
 
L
G
 
N
F
 
F
D
 
S
M
 
K
A
 
N
R
 
E
Y
 
I
H
 
H

Sites not aligning to the query:

6mv1A 2.15a resolution structure of the cs-b5r domains of human ncb5or (NAD+ form) (see paper)
27% identity, 54% coverage: 53:250/364 of query aligns to 143:352/355 of 6mv1A

query
sites
6mv1A
G
 
G
Q
 
Q
F
x
H
V
 
V
T
 
Y
L
 
L
E
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
I
A
 
T
A
 
G
K
 
T
P
 
E
V
 
I
M
 
V
R
x
K
T
x
P
Y
|
Y
T
|
T
-
 
P
-
 
V
-
 
S
-
 
G
-
 
S
L
 
L
S
 
L
S
 
S
S
 
E
P
 
F
S
 
K
R
 
E
P
 
P
L
 
V
-
 
L
-
 
P
-
 
N
-
 
N
-
 
K
S
 
Y
V
 
I
A
 
Y
V
 
F
T
x
L
V
x
I
K
|
K
A
 
I
Q
x
Y
P
 
P
G
x
T
S
x
G
I
x
L
G
x
F
T
|
T
R
 
P
W
 
E
M
 
L
F
 
-
D
 
D
N
 
R
L
 
L
K
 
Q
P
 
I
G
 
G
M
 
D
M
 
F
L
 
V
K
 
S
A
 
V
F
 
S
G
 
S
P
 
P
L
 
E
G
 
G
D
 
N
F
 
F
S
 
K
F
 
I
V
 
S
R
 
K
H
 
F
P
 
Q
G
 
E
E
 
L
K
 
E
Y
 
D
L
 
L
F
 
F
I
 
L
-
 
L
S
 
A
A
|
A
G
|
G
S
x
T
G
|
G
V
 
F
T
|
T
P
|
P
M
 
M
M
 
V
S
 
K
M
 
I
T
 
L
R
 
N
W
 
Y
-
 
A
M
 
L
A
 
T
D
 
D
C
 
I
A
 
P
P
 
S
E
 
L
T
 
R
D
 
K
V
 
V
T
 
K
F
 
L
I
 
M
S
 
F
C
x
F
A
x
N
R
x
K
R
 
T
P
 
E
D
 
D
D
 
D
L
 
I
L
 
I
F
 
W
R
 
R
S
 
S
E
 
Q
L
 
L
E
 
E
V
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
F
Q
 
K
M
 
D
P
 
K
G
 
R
L
 
L
N
 
D
L
 
V
G
 
E
F
 
F
L
 
V
V
 
L
E
x
S
G
 
A
H
 
P
E
 
I
A
 
S
R
 
E
H
 
-
G
 
-
W
 
W
H
 
N
G
 
G
L
 
K
R
 
Q
G
 
G
R
x
H
I
 
I
D
 
S
A
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
P
 
P
M
 
A
L
 
L
A
 
L
P
 
S
D
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
K
R
 
R
T
 
N
-
 
L
-
 
D
-
 
K
-
 
S
-
 
K
-
 
V
-
 
L
V
 
V
F
 
C
C
 
I
C
|
C
G
|
G
P
|
P
E
 
V
P
|
P
F
|
F
M
 
T
G
 
E
N
 
Q
V
 
G
R
 
V
A
 
R
M
 
L
L
 
L
E
 
H
A
 
D
A
 
L
G
 
N
F
 
F
D
 
S
M
 
K
A
 
N
R
 
E
Y
 
I
H
 
H

Sites not aligning to the query:

1tvcA Fad and nadh binding domain of methane monooxygenase reductase from methylococcus capsulatus (bath) (see paper)
24% identity, 58% coverage: 49:259/364 of query aligns to 43:249/250 of 1tvcA

query
sites
1tvcA
R
 
K
Y
 
F
L
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
|
F
V
 
M
T
 
D
L
 
L
E
 
T
L
 
I
P
 
P
V
 
-
A
 
-
A
 
G
K
 
T
P
 
D
V
 
V
M
 
S
R
|
R
T
x
S
Y
|
Y
T
x
S
L
 
P
S
 
A
S
 
N
S
 
L
P
 
P
S
 
N
R
 
P
P
 
E
L
 
G
S
 
R
V
 
L
A
 
E
V
 
F
T
x
L
V
x
I
K
x
R
A
x
V
Q
x
L
P
 
P
G
 
E
S
 
G
I
x
R
G
x
F
T
 
S
R
 
D
W
 
Y
M
 
L
F
 
R
D
 
N
N
 
D
L
 
A
K
 
R
P
 
V
G
 
G
M
 
Q
M
 
V
L
 
L
K
 
S
A
 
V
F
 
K
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
G
D
x
V
F
 
F
S
 
G
F
 
L
V
 
K
R
 
E
H
 
R
P
 
G
G
 
M
E
 
A
K
 
P
Y
 
R
L
 
Y
F
 
F
I
 
V
S
 
A
A
 
G
G
 
G
S
 
T
G
|
G
V
 
L
T
 
A
P
 
P
M
 
V
M
 
V
S
 
S
M
 
M
T
 
V
R
 
R
W
 
Q
M
 
M
A
 
Q
D
 
E
-
 
W
C
 
T
A
 
A
P
 
P
E
 
N
T
 
E
D
 
T
V
 
R
T
 
I
F
 
Y
I
 
F
S
 
G
C
 
V
A
x
N
R
 
T
R
 
E
P
 
P
D
 
-
D
x
E
L
 
L
L
 
F
F
 
Y
R
 
I
S
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
K
V
 
S
L
 
L
A
 
E
R
 
R
Q
 
S
M
 
M
P
 
R
G
 
N
L
 
L
N
 
T
L
 
V
G
 
K
F
 
A
L
 
C
V
 
V
E
 
-
G
 
-
H
 
W
E
 
H
A
 
P
R
x
S
H
x
G
G
 
D
W
 
W
H
 
E
G
 
G
L
 
E
R
 
Q
G
 
G
R
 
S
-
 
P
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
L
K
 
R
L
 
E
P
 
D
M
 
L
L
 
E
A
 
S
P
 
S
D
 
D
F
 
-
L
 
A
E
 
N
R
 
P
T
 
D
V
 
I
F
 
Y
C
x
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
P
P
 
G
F
 
M
M
 
I
G
 
D
N
 
A
V
 
A
R
 
C
A
 
E
M
 
L
L
 
V
E
 
R
A
 
S
A
 
R
G
 
G
F
 
I
D
 
P
M
 
G
A
 
E
R
 
Q
Y
 
V
H
 
F
Q
 
F
E
|
E
S
 
K
F
|
F
Q
x
L
P
 
P
A
 
S
A
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1gvhA The x-ray structure of ferric escherichia coli flavohemoglobin reveals an unespected geometry of the distal heme pocket (see paper)
26% identity, 57% coverage: 49:256/364 of query aligns to 182:392/396 of 1gvhA

query
sites
1gvhA
R
 
E
Y
 
Y
L
 
R
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
x
Y
V
 
L
T
 
G
L
 
V
E
 
W
L
 
L
P
 
K
V
 
P
A
 
E
A
 
G
K
 
F
P
 
P
-
 
H
-
 
Q
V
 
E
M
 
I
R
|
R
T
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
T
S
 
R
S
 
K
P
 
P
S
 
D
R
 
G
P
 
K
L
 
-
S
 
G
V
 
Y
A
 
R
V
 
I
T
x
A
V
|
V
K
|
K
A
 
R
Q
x
E
P
x
E
G
|
G
S
x
G
I
x
Q
G
x
V
T
x
S
R
 
N
W
 
W
M
 
L
F
 
H
D
 
N
N
 
H
L
 
A
K
 
N
P
 
V
G
 
G
M
 
D
M
 
V
L
 
V
K
 
K
A
 
L
F
 
V
G
 
A
P
 
P
L
 
A
G
 
G
D
 
D
F
 
F
S
 
F
F
 
M
V
 
A
R
 
V
H
 
A
P
 
D
G
 
D
E
 
T
K
 
P
Y
 
V
L
 
T
F
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
S
x
V
G
 
G
V
 
Q
T
|
T
P
 
P
M
 
M
M
 
L
S
 
A
M
 
M
T
 
L
R
 
D
W
 
T
M
 
L
A
 
A
D
 
K
C
 
A
A
 
G
P
 
H
E
 
T
T
 
A
D
 
Q
V
 
V
T
 
N
F
 
W
I
 
F
S
 
H
C
 
A
A
 
A
R
 
E
R
 
N
P
 
G
D
 
D
D
 
V
L
 
H
L
 
A
F
 
F
R
 
A
S
 
D
E
 
E
L
 
V
E
 
K
V
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
Q
Q
 
S
M
 
L
P
 
P
G
 
R
L
 
F
N
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
H
 
-
E
 
-
A
 
T
R
 
A
H
 
H
G
 
T
W
 
W
H
 
Y
G
 
R
L
 
Q
R
 
P
G
 
S
R
 
E
I
 
A
D
 
D
A
 
R
A
 
A
K
 
K
-
 
G
-
 
Q
-
 
F
-
 
D
-
 
S
-
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
M
-
 
D
L
 
L
P
 
S
M
 
K
L
 
L
A
 
E
P
 
G
D
 
A
F
 
F
L
 
S
E
 
D
R
 
P
T
 
T
V
 
M
-
 
Q
-
 
F
F
 
Y
C
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
V
P
 
G
F
 
F
M
 
M
G
 
Q
N
 
F
V
 
T
R
 
A
A
 
K
M
 
Q
L
 
L
E
 
V
A
 
D
A
 
L
G
 
G
F
 
V
D
 
K
M
 
Q
A
 
E
R
 
N
Y
 
I
H
 
H
Q
 
Y
E