SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMc01047 FitnessBrowser__Smeli:SMc01047 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3daaA Crystallographic structure of d-amino acid aminotransferase inactivated by pyridoxyl-d-alanine (see paper)
38% identity, 94% coverage: 8:278/287 of query aligns to 6:272/277 of 3daaA

query
sites
3daaA
N
 
N
G
 
D
T
 
Q
Y
 
I
V
 
V
R
 
K
H
 
D
A
 
E
E
 
E
A
 
V
A
 
K
I
 
I
H
 
D
V
 
K
E
 
E
D
 
D
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
F
 
F
A
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
|
Y
E
 
E
V
|
V
C
 
V
E
 
K
V
 
V
R
 
Y
H
 
N
G
 
G
F
 
E
I
 
M
I
 
F
D
 
T
L
 
V
T
 
N
R
 
E
H
 
H
L
 
I
D
 
D
R
|
R
L
 
L
G
 
Y
R
 
A
S
 
S
L
 
A
G
 
E
E
 
K
L
 
I
R
 
R
I
 
I
G
 
T
W
 
I
P
 
P
M
 
Y
S
 
T
R
 
K
A
 
D
A
 
K
L
 
F
I
 
H
H
 
Q
V
 
L
I
 
L
R
 
H
E
 
E
V
 
L
L
 
V
R
 
E
R
 
K
N
 
N
R
 
E
V
 
L
R
 
N
N
 
T
G
 
G
L
 
H
F
 
I
Y
 
Y
L
 
F
Q
 
Q
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
T
A
 
S
R
 
P
R
 
R
D
 
A
H
 
H
V
 
Q
F
 
F
P
 
P
D
 
E
A
 
N
D
 
T
T
 
V
P
 
K
P
 
P
S
 
V
I
 
I
V
 
I
V
 
G
T
 
Y
A
 
T
K
 
K
R
 
E
T
 
-
D
 
N
P
 
P
G
 
R
A
 
P
I
 
L
A
 
-
R
 
-
K
 
E
N
 
N
A
 
L
E
 
E
-
 
K
G
 
G
I
 
V
S
 
K
A
 
A
I
 
T
T
 
F
V
 
V
P
 
E
E
 
D
N
 
I
R
 
R
W
 
W
D
 
L
R
 
R
V
 
C
D
 
D
I
 
I
K
|
K
S
 
S
V
 
L
G
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
G
N
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
A
K
 
H
E
 
E
A
 
K
G
 
G
A
 
C
Q
 
Y
E
 
E
A
 
A
I
 
I
F
 
-
V
 
L
D
 
H
V
 
R
D
 
N
G
 
N
M
 
T
V
 
V
K
 
T
E
|
E
G
 
G
A
 
S
A
x
S
T
x
S
N
 
N
V
 
V
W
 
F
I
 
G
V
 
I
D
 
-
R
 
K
E
 
D
G
 
G
T
 
I
L
 
L
R
 
Y
T
 
T
R
 
H
P
 
P
A
 
A
E
 
N
S
 
N
G
 
M
I
 
I
L
|
L
R
 
K
G
|
G
V
x
I
T
|
T
R
 
R
T
 
D
T
 
V
L
 
V
M
 
I
D
 
A
V
 
C
A
 
A
K
 
N
P
 
E
L
 
I
G
 
N
L
 
M
A
 
P
I
 
V
E
 
K
E
 
E
T
 
I
A
 
P
F
 
F
S
 
T
V
 
T
E
 
H
E
 
E
M
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
M
R
 
D
E
 
E
V
 
L
F
 
F
I
 
V
T
 
T
A
x
S
A
x
T
T
 
T
S
 
S
I
 
E
C
 
I
F
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
E
V
 
I
D
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
L
I
 
I
G
 
R
N
 
D
G
 
G
H
 
K
P
 
V
G
 
G
S
 
E
I
 
W
A
 
T
Q
 
R
N
 
K
I
 
L
R
 
Q
E
 
K
T
 
Q
F
 
F

2daaA Crystallographic structure of d-amino acid aminotransferase inactivated by d-cycloserine
38% identity, 94% coverage: 8:278/287 of query aligns to 6:272/277 of 2daaA

query
sites
2daaA
N
 
N
G
 
D
T
 
Q
Y
 
I
V
 
V
R
 
K
H
 
D
A
 
E
E
 
E
A
 
V
A
 
K
I
 
I
H
 
D
V
 
K
E
 
E
D
 
D
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
F
 
F
A
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
|
Y
E
 
E
V
|
V
C
 
V
E
 
K
V
 
V
R
 
Y
H
 
N
G
 
G
F
 
E
I
 
M
I
 
F
D
 
T
L
 
V
T
 
N
R
 
E
H
 
H
L
 
I
D
 
D
R
|
R
L
 
L
G
 
Y
R
 
A
S
 
S
L
 
A
G
 
E
E
 
K
L
 
I
R
 
R
I
 
I
G
 
T
W
 
I
P
 
P
M
 
Y
S
 
T
R
 
K
A
 
D
A
 
K
L
 
F
I
 
H
H
 
Q
V
 
L
I
 
L
R
 
H
E
 
E
V
 
L
L
 
V
R
 
E
R
 
K
N
 
N
R
 
E
V
 
L
R
 
N
N
 
T
G
 
G
L
 
H
F
 
I
Y
 
Y
L
 
F
Q
 
Q
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
T
A
 
S
R
 
P
R
|
R
D
 
A
H
|
H
V
 
Q
F
 
F
P
 
P
D
 
E
A
 
N
D
 
T
T
 
V
P
 
K
P
 
P
S
 
V
I
 
I
V
 
I
V
 
G
T
 
Y
A
 
T
K
 
K
R
 
E
T
 
-
D
 
N
P
 
P
G
 
R
A
 
P
I
 
L
A
 
-
R
 
-
K
 
E
N
 
N
A
 
L
E
 
E
-
 
K
G
 
G
I
 
V
S
 
K
A
 
A
I
 
T
T
 
F
V
 
V
P
 
E
E
 
D
N
 
I
R
 
R
W
 
W
D
 
L
R
 
R
V
 
C
D
 
D
I
 
I
K
|
K
S
 
S
V
 
L
G
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
G
N
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
A
K
 
H
E
 
E
A
 
K
G
 
G
A
 
C
Q
 
Y
E
 
E
A
 
A
I
 
I
F
 
-
V
 
L
D
 
H
V
 
R
D
 
N
G
 
N
M
 
T
V
 
V
K
 
T
E
|
E
G
 
G
A
 
S
A
x
S
T
x
S
N
|
N
V
 
V
W
 
F
I
 
G
V
 
I
D
 
-
R
 
K
E
 
D
G
 
G
T
 
I
L
 
L
R
 
Y
T
 
T
R
 
H
P
 
P
A
 
A
E
 
N
S
 
N
G
 
M
I
 
I
L
|
L
R
 
K
G
|
G
V
x
I
T
|
T
R
 
R
T
 
D
T
 
V
L
 
V
M
 
I
D
 
A
V
 
C
A
 
A
K
 
N
P
 
E
L
 
I
G
 
N
L
 
M
A
 
P
I
 
V
E
 
K
E
 
E
T
 
I
A
 
P
F
 
F
S
 
T
V
 
T
E
 
H
E
 
E
M
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
M
R
 
D
E
 
E
V
 
L
F
 
F
I
 
V
T
 
T
A
 
S
A
x
T
T
 
T
S
 
S
I
 
E
C
 
I
F
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
E
V
 
I
D
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
L
I
 
I
G
 
R
N
 
D
G
 
G
H
 
K
P
 
V
G
 
G
S
 
E
I
 
W
A
 
T
Q
 
R
N
 
K
I
 
L
R
 
Q
E
 
K
T
 
Q
F
 
F

1daaA Crystallographic structure of d-amino acid aminotransferase complexed with pyridoxal-5'-phosphate (see paper)
38% identity, 94% coverage: 8:278/287 of query aligns to 6:272/277 of 1daaA

query
sites
1daaA
N
 
N
G
 
D
T
 
Q
Y
 
I
V
 
V
R
 
K
H
 
D
A
 
E
E
 
E
A
 
V
A
 
K
I
 
I
H
 
D
V
 
K
E
 
E
D
 
D
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
F
 
F
A
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
|
Y
E
 
E
V
|
V
C
 
V
E
 
K
V
 
V
R
 
Y
H
 
N
G
 
G
F
 
E
I
 
M
I
 
F
D
 
T
L
 
V
T
 
N
R
 
E
H
 
H
L
 
I
D
 
D
R
|
R
L
 
L
G
 
Y
R
 
A
S
 
S
L
 
A
G
 
E
E
 
K
L
 
I
R
 
R
I
 
I
G
 
T
W
 
I
P
 
P
M
 
Y
S
 
T
R
 
K
A
 
D
A
 
K
L
 
F
I
 
H
H
 
Q
V
 
L
I
 
L
R
 
H
E
 
E
V
 
L
L
 
V
R
 
E
R
 
K
N
 
N
R
 
E
V
 
L
R
 
N
N
 
T
G
 
G
L
 
H
F
 
I
Y
 
Y
L
 
F
Q
 
Q
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
T
A
 
S
R
 
P
R
 
R
D
 
A
H
 
H
V
 
Q
F
 
F
P
 
P
D
 
E
A
 
N
D
 
T
T
 
V
P
 
K
P
 
P
S
 
V
I
 
I
V
 
I
V
 
G
T
 
Y
A
 
T
K
 
K
R
 
E
T
 
-
D
 
N
P
 
P
G
 
R
A
 
P
I
 
L
A
 
-
R
 
-
K
 
E
N
 
N
A
 
L
E
 
E
-
 
K
G
 
G
I
 
V
S
 
K
A
 
A
I
 
T
T
 
F
V
 
V
P
 
E
E
 
D
N
 
I
R
 
R
W
 
W
D
 
L
R
 
R
V
 
C
D
 
D
I
 
I
K
|
K
S
 
S
V
 
L
G
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
G
N
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
A
K
 
H
E
 
E
A
 
K
G
 
G
A
 
C
Q
 
Y
E
 
E
A
 
A
I
 
I
F
 
-
V
 
L
D
 
H
V
 
R
D
 
N
G
 
N
M
 
T
V
 
V
K
 
T
E
|
E
G
 
G
A
 
S
A
x
S
T
x
S
N
 
N
V
 
V
W
 
F
I
 
G
V
 
I
D
 
-
R
 
K
E
 
D
G
 
G
T
 
I
L
 
L
R
 
Y
T
 
T
R
 
H
P
 
P
A
 
A
E
 
N
S
 
N
G
 
M
I
 
I
L
|
L
R
 
K
G
|
G
V
x
I
T
|
T
R
 
R
T
 
D
T
 
V
L
 
V
M
 
I
D
 
A
V
 
C
A
 
A
K
 
N
P
 
E
L
 
I
G
 
N
L
 
M
A
 
P
I
 
V
E
 
K
E
 
E
T
 
I
A
 
P
F
 
F
S
 
T
V
 
T
E
 
H
E
 
E
M
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
M
R
 
D
E
 
E
V
 
L
F
 
F
I
 
V
T
 
T
A
x
S
A
x
T
T
 
T
S
 
S
I
 
E
C
 
I
F
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
E
V
 
I
D
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
L
I
 
I
G
 
R
N
 
D
G
 
G
H
 
K
P
 
V
G
 
G
S
 
E
I
 
W
A
 
T
Q
 
R
N
 
K
I
 
L
R
 
Q
E
 
K
T
 
Q
F
 
F

P19938 D-alanine aminotransferase; D-amino acid aminotransferase; D-amino acid transaminase; DAAT; D-aspartate aminotransferase; EC 2.6.1.21 from Bacillus sp. (strain YM-1) (see 5 papers)
38% identity, 94% coverage: 8:278/287 of query aligns to 7:273/283 of P19938

query
sites
P19938
N
 
N
G
 
D
T
 
Q
Y
 
I
V
 
V
R
 
K
H
 
D
A
 
E
E
 
E
A
 
V
A
 
K
I
 
I
H
 
D
V
 
K
E
 
E
D
 
D
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
F
 
F
A
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
|
Y
E
 
E
V
 
V
C
 
V
E
 
K
V
 
V
R
 
Y
H
 
N
G
 
G
F
 
E
I
 
M
I
 
F
D
 
T
L
 
V
T
 
N
R
 
E
H
 
H
L
 
I
D
 
D
R
|
R
L
 
L
G
 
Y
R
 
A
S
 
S
L
 
A
G
 
E
E
 
K
L
 
I
R
 
R
I
 
I
G
 
T
W
 
I
P
 
P
M
 
Y
S
 
T
R
 
K
A
 
D
A
 
K
L
 
F
I
 
H
H
 
Q
V
 
L
I
 
L
R
 
H
E
 
E
V
 
L
L
 
V
R
 
E
R
 
K
N
 
N
R
 
E
V
 
L
R
 
N
N
 
T
G
 
G
L
 
H
F
 
I
Y
 
Y
L
 
F
Q
 
Q
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
T
A
 
S
R
 
P
R
|
R
D
 
A
H
|
H
V
 
Q
F
 
F
P
 
P
D
 
E
A
 
N
D
 
T
T
 
V
P
 
K
P
 
P
S
 
V
I
 
I
V
 
I
V
 
G
T
 
Y
A
 
T
K
 
K
R
 
E
T
 
-
D
 
N
P
 
P
G
 
R
A
 
P
I
 
L
A
 
-
R
 
-
K
 
E
N
 
N
A
 
L
E
 
E
-
 
K
G
 
G
I
 
V
S
 
K
A
 
A
I
 
T
T
 
F
V
 
V
P
 
E
E
 
D
N
 
I
R
 
R
W
 
W
D
 
L
R
 
R
V
 
C
D
 
D
I
 
I
K
|
K
S
 
S
V
 
L
G
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
G
N
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
A
K
 
H
E
 
E
A
 
K
G
 
G
A
 
C
Q
 
Y
E
 
E
A
 
A
I
 
I
F
 
-
V
 
L
D
 
H
V
 
R
D
 
N
G
 
N
M
 
T
V
 
V
K
 
T
E
|
E
G
 
G
A
 
S
A
 
S
T
 
S
N
 
N
V
 
V
W
 
F
I
 
G
V
 
I
D
 
-
R
 
K
E
 
D
G
 
G
T
 
I
L
 
L
R
 
Y
T
 
T
R
 
H
P
 
P
A
 
A
E
 
N
S
 
N
G
 
M
I
 
I
L
|
L
R
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
T
R
 
R
T
 
D
T
 
V
L
 
V
M
 
I
D
 
A
V
 
C
A
 
A
K
 
N
P
 
E
L
 
I
G
 
N
L
 
M
A
 
P
I
 
V
E
 
K
E
 
E
T
 
I
A
 
P
F
 
F
S
 
T
V
 
T
E
 
H
E
 
E
M
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
M
R
 
D
E
 
E
V
 
L
F
 
F
I
 
V
T
 
T
A
 
S
A
 
T
T
 
T
S
 
S
I
 
E
C
 
I
F
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
E
V
 
I
D
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
L
I
 
I
G
 
R
N
 
D
G
 
G
H
 
K
P
 
V
G
 
G
S
 
E
I
 
W
A
 
T
Q
 
R
N
 
K
I
 
L
R
 
Q
E
 
K
T
 
Q
F
 
F

Sites not aligning to the query:

3lqsA Complex structure of d-amino acid aminotransferase and 4-amino-4,5- dihydro-thiophenecarboxylic acid (adta) (see paper)
38% identity, 94% coverage: 8:278/287 of query aligns to 6:272/280 of 3lqsA

query
sites
3lqsA
N
 
N
G
 
D
T
 
Q
Y
 
I
V
 
V
R
 
K
H
 
D
A
 
E
E
 
E
A
 
V
A
 
K
I
 
I
H
 
D
V
 
K
E
 
E
D
 
D
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
F
 
F
A
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
|
Y
E
 
E
V
|
V
C
 
V
E
 
K
V
 
V
R
 
Y
H
 
N
G
 
G
F
 
E
I
 
M
I
 
F
D
 
T
L
 
V
T
 
N
R
 
E
H
 
H
L
 
I
D
 
D
R
|
R
L
 
L
G
 
Y
R
 
A
S
 
S
L
 
A
G
 
E
E
 
K
L
 
I
R
 
R
I
 
I
G
 
T
W
 
I
P
 
P
M
 
Y
S
 
T
R
 
K
A
 
D
A
 
K
L
 
F
I
 
H
H
 
Q
V
 
L
I
 
L
R
 
H
E
 
E
V
 
L
L
 
V
R
 
E
R
 
K
N
 
N
R
 
E
V
 
L
R
 
N
N
 
T
G
 
G
L
 
H
F
 
I
Y
 
Y
L
 
F
Q
 
Q
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
T
A
 
S
R
 
P
R
 
R
D
 
A
H
 
H
V
 
Q
F
 
F
P
 
P
D
 
E
A
 
N
D
 
T
T
 
V
P
 
K
P
 
P
S
 
V
I
 
I
V
 
I
V
 
G
T
 
Y
A
 
T
K
 
K
R
 
E
T
 
-
D
 
N
P
 
P
G
 
R
A
 
P
I
 
L
A
 
-
R
 
-
K
 
E
N
 
N
A
 
L
E
 
E
-
 
K
G
 
G
I
 
V
S
 
K
A
 
A
I
 
T
T
 
F
V
 
V
P
 
E
E
 
D
N
 
I
R
 
R
W
 
W
D
 
L
R
 
R
V
 
C
D
 
D
I
 
I
K
|
K
S
 
S
V
 
L
G
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
G
N
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
A
K
 
H
E
 
E
A
 
K
G
 
G
A
 
C
Q
 
Y
E
 
E
A
 
A
I
 
I
F
 
-
V
 
L
D
 
H
V
 
R
D
 
N
G
 
N
M
 
T
V
 
V
K
 
T
E
|
E
G
 
G
A
 
S
A
x
S
T
x
S
N
|
N
V
 
V
W
 
F
I
 
G
V
 
I
D
 
-
R
 
K
E
 
D
G
 
G
T
 
I
L
 
L
R
 
Y
T
 
T
R
 
H
P
 
P
A
 
A
E
 
N
S
 
N
G
 
M
I
 
I
L
|
L
R
 
K
G
|
G
V
x
I
T
|
T
R
 
R
T
 
D
T
 
V
L
 
V
M
 
I
D
 
A
V
 
C
A
 
A
K
 
N
P
 
E
L
 
I
G
 
N
L
 
M
A
 
P
I
 
V
E
 
K
E
 
E
T
 
I
A
 
P
F
 
F
S
 
T
V
 
T
E
 
H
E
 
E
M
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
M
R
 
D
E
 
E
V
 
L
F
 
F
I
 
V
T
 
T
A
x
S
A
x
T
T
|
T
S
 
S
I
 
E
C
 
I
F
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
E
V
 
I
D
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
L
I
 
I
G
 
R
N
 
D
G
 
G
H
 
K
P
 
V
G
 
G
S
 
E
I
 
W
A
 
T
Q
 
R
N
 
K
I
 
L
R
 
Q
E
 
K
T
 
Q
F
 
F

1a0gB L201a mutant of d-amino acid aminotransferase complexed with pyridoxamine-5'-phosphate (see paper)
36% identity, 94% coverage: 8:278/287 of query aligns to 6:272/282 of 1a0gB

query
sites
1a0gB
N
 
N
G
 
D
T
 
Q
Y
 
I
V
 
V
R
 
K
H
 
D
A
 
E
E
 
E
A
 
V
A
 
K
I
 
I
H
 
D
V
 
K
E
 
E
D
 
D
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
F
 
F
A
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
|
Y
E
 
E
V
|
V
C
 
V
E
 
K
V
 
V
R
 
Y
H
 
N
G
 
G
F
 
E
I
 
M
I
 
F
D
 
T
L
 
V
T
 
N
R
 
E
H
 
H
L
 
I
D
 
D
R
|
R
L
 
L
G
 
Y
R
 
A
S
 
S
L
 
A
G
 
E
E
 
K
L
 
I
R
 
R
I
 
I
G
 
T
W
 
I
P
 
P
M
 
Y
S
 
T
R
 
K
A
 
D
A
 
K
L
 
F
I
 
H
H
 
Q
V
 
L
I
 
L
R
 
H
E
 
E
V
 
L
L
 
V
R
 
E
R
 
K
N
 
N
R
 
E
V
 
L
R
 
N
N
 
T
G
 
G
L
 
H
F
 
I
Y
 
Y
L
 
F
Q
 
Q
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
T
A
 
S
R
 
P
R
 
R
D
 
A
H
 
H
V
 
Q
F
 
F
P
 
P
D
 
E
A
 
N
D
 
T
T
 
V
P
 
K
P
 
P
S
 
-
I
 
V
V
 
I
V
 
I
T
 
G
A
 
Y
K
 
T
R
 
K
T
 
E
D
 
N
P
 
P
G
 
R
A
 
P
I
 
L
A
 
-
R
 
-
K
 
E
N
 
N
A
 
L
E
 
E
-
 
K
G
 
G
I
 
V
S
 
K
A
 
A
I
 
T
T
 
F
V
 
V
P
 
E
E
 
D
N
 
I
R
 
R
W
 
W
D
 
L
R
 
R
V
 
C
D
 
D
I
 
I
K
|
K
S
 
S
V
 
L
G
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
G
N
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
A
K
 
H
E
 
E
A
 
K
G
 
G
A
 
C
Q
 
Y
E
 
E
A
 
A
I
 
I
F
 
-
V
 
L
D
 
H
V
 
R
D
 
N
G
 
N
M
 
T
V
 
V
K
 
T
E
|
E
G
 
G
A
 
S
A
x
S
T
x
S
N
 
N
V
 
V
W
 
F
I
 
G
V
 
I
D
 
-
R
 
K
E
 
D
G
 
G
T
 
I
L
 
L
R
 
Y
T
 
T
R
 
H
P
 
P
A
 
A
E
 
N
S
 
N
G
 
M
I
 
I
L
x
A
R
 
K
G
|
G
V
x
I
T
|
T
R
 
R
T
 
D
T
 
V
L
 
V
M
 
I
D
 
A
V
 
C
A
 
A
K
 
N
P
 
E
L
 
I
G
 
N
L
 
M
A
 
P
I
 
V
E
 
K
E
 
E
T
 
I
A
 
P
F
 
F
S
 
T
V
 
T
E
 
H
E
 
E
M
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
M
R
 
D
E
 
E
V
 
L
F
 
F
I
 
V
T
 
T
A
x
S
A
x
T
T
 
T
S
 
S
I
 
E
C
 
I
F
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
E
V
 
I
D
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
L
I
 
I
G
 
R
N
 
D
G
 
G
H
 
K
P
 
V
G
 
G
S
 
E
I
 
W
A
 
T
Q
 
R
N
 
K
I
 
L
R
 
Q
E
 
K
T
 
Q
F
 
F

5mr0D Thermophilic archaeal branched-chain amino acid transaminases from geoglobus acetivorans and archaeoglobus fulgidus: biochemical and structural characterisation (see paper)
33% identity, 97% coverage: 6:283/287 of query aligns to 5:282/290 of 5mr0D

query
sites
5mr0D
Y
 
Y
V
 
M
N
 
D
G
 
G
T
 
E
Y
 
F
V
 
V
R
 
P
H
 
E
A
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
K
I
 
V
H
 
S
V
 
I
E
 
F
D
 
D
R
 
H
G
 
G
Y
 
F
Q
 
L
F
 
Y
A
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
x
F
E
 
E
V
x
G
C
 
I
E
 
R
V
 
A
R
 
Y
H
 
N
G
 
G
F
 
R
I
 
V
I
 
F
D
 
R
L
 
L
T
 
K
R
 
E
H
 
H
L
 
I
D
 
D
R
|
R
L
 
L
G
 
Y
R
 
D
S
 
S
L
 
A
G
 
K
E
 
A
L
 
I
R
 
D
I
 
L
G
 
E
W
 
I
P
 
P
M
 
I
S
 
T
R
 
K
A
 
E
A
 
E
L
 
F
I
 
M
H
 
E
V
 
I
I
 
I
R
 
L
E
 
E
V
 
T
L
 
L
R
 
R
R
 
K
N
 
N
R
 
N
V
 
L
R
 
R
N
 
D
G
 
A
L
 
Y
F
 
I
Y
 
R
L
 
P
Q
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
I
A
 
G
R
 
D
R
 
L
D
 
-
H
x
G
V
x
L
F
 
D
P
 
P
D
 
R
A
 
K
D
 
C
T
 
Q
P
 
N
P
 
P
S
 
S
I
 
I
V
 
I
V
 
V
T
 
I
A
 
T
K
 
K
R
 
P
T
 
W
D
 
G
P
 
K
-
 
L
-
 
Y
G
 
G
A
 
D
I
 
L
A
 
Y
R
 
E
K
 
K
N
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
G
I
 
L
S
 
T
A
 
A
I
 
I
T
 
T
V
 
V
P
 
A
-
 
V
-
 
R
E
 
R
N
 
N
R
 
S
W
 
F
D
 
D
R
 
A
V
 
L
-
 
P
-
 
P
D
 
N
I
 
I
K
|
K
S
 
S
V
 
L
G
 
N
L
x
Y
L
 
L
P
 
N
N
 
N
V
 
I
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
I
Q
 
E
A
 
A
K
 
N
E
 
A
A
 
K
G
 
G
A
 
G
Q
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
I
F
 
F
V
 
L
D
 
D
V
 
R
D
 
N
G
 
G
M
 
Y
V
 
V
K
 
S
E
|
E
G
 
G
A
 
S
A
x
G
T
x
D
N
 
N
V
 
I
W
 
F
I
 
V
V
 
V
D
 
-
R
 
K
E
 
N
G
 
G
T
 
A
L
 
I
R
 
T
T
 
T
R
 
P
P
 
P
A
 
T
E
 
I
S
 
N
G
 
N
I
 
-
L
|
L
R
 
R
G
 
G
V
x
I
T
|
T
R
 
R
T
 
E
T
 
A
L
 
V
M
 
I
D
 
E
V
 
I
A
 
I
K
 
N
P
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
P
I
 
F
E
 
K
E
 
E
T
 
T
A
 
N
F
 
I
S
 
G
V
 
L
E
 
Y
E
 
D
M
 
L
L
 
Y
A
 
T
A
 
A
R
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
F
I
 
V
T
 
T
A
x
G
A
x
T
T
 
A
S
 
A
I
 
E
C
 
I
F
 
A
P
 
P
V
 
I
V
 
V
S
 
V
V
 
I
D
 
D
G
 
G
K
 
R
T
 
K
I
 
I
G
 
G
N
 
D
G
 
G
H
 
K
P
 
P
G
 
G
S
 
E
I
 
I
A
 
T
Q
 
R
N
 
K
I
 
L
R
 
M
E
 
E
T
 
E
F
 
F
F
 
S
D
 
K
I
 
L
A
 
T
E
 
E

5e25A Crystal structure of branched-chain aminotransferase from thermophilic archaea geoglobus acetivorans complexed with alpha-ketoglutarate (see paper)
32% identity, 96% coverage: 4:278/287 of query aligns to 4:278/290 of 5e25A

query
sites
5e25A
I
 
L
A
 
V
Y
 
Y
V
 
M
N
 
N
G
 
G
T
 
E
Y
 
F
V
 
V
R
 
P
H
 
E
A
 
S
E
 
Q
A
 
A
A
 
K
I
 
V
H
 
S
V
 
V
E
 
F
D
 
D
R
 
H
G
 
G
Y
 
F
Q
 
L
F
 
Y
A
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
x
F
E
 
E
V
x
G
C
 
I
E
 
R
V
 
A
R
 
Y
H
 
N
G
 
G
F
 
K
I
 
V
I
 
F
D
 
K
L
 
L
T
 
Y
R
 
E
H
 
H
L
 
I
D
 
D
R
|
R
L
 
L
G
 
Y
R
 
D
S
 
C
L
 
A
G
 
R
E
 
V
L
 
I
R
 
D
I
 
L
G
 
K
W
 
I
P
 
P
M
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
E
A
 
E
L
 
F
I
 
A
H
 
E
V
 
A
I
 
I
R
 
L
E
 
E
V
 
T
L
 
L
R
 
R
R
 
R
N
 
N
R
 
N
V
 
L
R
 
R
N
 
D
G
 
A
L
x
Y
F
 
I
Y
 
R
L
 
P
Q
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
A
A
 
G
R
 
D
R
 
L
D
 
G
H
 
-
V
 
L
F
 
D
P
 
P
D
 
R
A
 
K
D
 
C
T
 
P
P
 
S
P
 
P
S
 
N
I
 
V
V
 
I
V
 
I
T
 
I
A
 
T
K
 
K
R
 
P
T
 
W
D
 
G
P
 
K
-
 
L
-
 
Y
G
 
G
A
 
D
I
 
L
A
 
Y
R
 
E
K
 
K
N
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
G
I
 
L
S
 
K
A
 
A
I
 
I
T
 
T
V
 
V
P
 
A
-
 
I
-
 
R
E
 
R
N
 
N
R
 
A
W
 
I
D
 
D
R
 
S
V
 
L
-
 
P
-
 
P
D
 
N
I
 
I
K
|
K
S
 
S
V
 
L
G
 
N
L
x
Y
L
 
L
P
 
N
N
 
N
V
 
I
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
I
Q
 
E
A
 
A
K
 
N
E
 
A
A
 
K
G
 
G
A
 
G
Q
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
I
F
 
F
V
 
L
D
 
D
V
 
H
D
 
N
G
 
G
M
 
Y
V
 
I
K
 
S
E
|
E
G
 
G
A
 
S
A
x
G
T
x
D
N
 
N
V
 
I
W
 
F
I
 
I
V
 
V
D
 
-
R
 
K
E
 
N
G
 
G
T
 
T
L
 
I
R
 
T
T
 
T
R
 
P
P
 
P
A
 
T
E
 
L
S
 
N
G
 
N
I
 
-
L
|
L
R
 
K
G
|
G
V
x
I
T
|
T
R
 
R
T
 
Q
T
 
V
L
 
V
M
 
I
D
 
E
V
 
L
A
 
I
K
 
N
P
 
E
L
 
L
G
 
E
L
 
I
A
 
P
I
 
F
E
 
R
E
 
E
T
 
A
A
 
N
F
 
I
S
 
G
V
 
L
E
 
F
E
 
D
M
 
L
L
 
Y
A
 
S
A
 
A
R
 
D
E
 
E
V
 
I
F
 
F
I
 
V
T
 
T
A
x
G
A
x
T
T
x
A
S
 
A
I
 
E
C
 
I
F
 
A
P
 
P
V
 
V
V
 
T
S
 
Y
V
 
I
D
 
D
G
 
G
K
 
R
T
 
T
I
 
V
G
 
G
N
 
N
G
 
G
H
 
K
P
 
P
G
 
G
S
 
K
I
 
V
A
 
T
Q
 
K
N
 
M
I
 
L
R
 
M
E
 
E
T
 
K
F
 
F

7p3tB Transaminase of gamma-proteobacterium (see paper)
33% identity, 98% coverage: 4:283/287 of query aligns to 5:284/299 of 7p3tB

query
sites
7p3tB
I
 
I
A
 
I
Y
 
Y
V
 
I
N
 
N
G
 
G
T
 
D
Y
 
Y
V
 
L
R
 
P
H
 
L
A
 
S
E
 
Q
A
 
A
A
 
R
I
 
V
H
 
S
V
 
P
E
 
V
D
 
D
R
 
Q
G
 
G
Y
 
F
Q
 
L
F
 
L
A
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
E
 
D
V
 
V
C
 
V
E
 
S
V
 
A
R
 
W
H
 
K
G
 
G
F
 
N
I
 
I
I
 
F
D
 
K
L
 
L
T
 
D
R
 
A
H
 
H
L
 
L
D
 
D
R
|
R
L
 
F
G
 
F
R
 
D
S
 
S
L
 
I
G
 
Q
E
 
A
L
 
A
R
 
R
I
 
L
G
 
N
W
 
H
P
 
D
M
 
M
S
 
S
R
 
R
A
 
D
A
 
A
L
 
W
I
 
K
H
 
E
V
 
A
I
 
I
R
 
I
E
 
E
V
 
T
L
 
T
R
 
R
R
 
R
N
 
N
R
 
G
V
 
L
R
 
D
N
 
D
G
 
A
L
 
S
F
 
I
Y
 
R
L
 
F
Q
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
E
A
 
P
R
 
K
R
 
G
D
 
V
H
 
V
V
 
A
F
 
D
P
 
P
D
 
R
A
 
D
D
 
F
T
 
K
P
 
P
P
 
T
S
 
C
I
 
I
V
 
V
V
 
W
T
 
V
A
 
A
-
 
P
-
 
Y
-
 
I
-
 
F
-
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
E
K
 
K
R
 
R
T
 
R
D
 
N
P
 
G
G
 
I
A
 
R
I
 
L
A
 
M
R
 
I
K
 
S
N
 
A
A
 
T
E
 
R
G
 
G
I
 
F
S
 
P
A
 
A
I
 
D
T
 
T
V
 
L
P
 
-
E
 
D
N
 
P
R
 
R
W
 
Y
D
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
K
|
K
S
 
C
V
 
L
G
 
D
L
x
R
L
 
L
P
 
H
N
 
S
V
 
Q
L
 
L
A
 
I
R
 
R
Q
 
L
Q
 
E
A
 
A
K
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
Y
Q
 
D
E
 
D
A
 
A
I
 
L
F
 
W
V
 
L
D
 
D
V
 
H
D
 
S
G
 
G
M
 
H
V
 
V
K
 
S
E
|
E
G
x
S
A
|
A
A
|
A
T
x
S
N
 
N
V
 
L
W
 
F
I
 
I
V
 
V
D
 
-
R
 
K
E
 
N
G
 
G
T
 
V
L
 
L
R
 
Y
T
 
T
R
 
P
P
 
S
A
 
A
E
 
-
S
 
-
G
 
G
I
 
I
L
 
L
R
 
R
G
|
G
V
x
I
T
|
T
R
 
R
T
 
D
T
 
T
L
 
I
M
 
L
D
 
E
V
 
L
A
 
A
K
 
T
P
 
E
L
 
L
G
 
D
L
 
I
A
 
P
I
 
W
E
 
K
E
 
E
T
 
R
A
 
Q
F
 
L
S
 
S
V
 
A
E
 
F
E
 
D
M
 
V
L
 
Y
A
 
I
A
 
A
R
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
F
I
 
T
T
 
C
A
 
S
A
x
T
T
 
A
S
 
G
I
 
G
C
 
A
F
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
R
S
 
E
V
 
V
D
 
A
G
 
G
K
 
R
T
 
T
I
 
I
G
 
R
N
 
G
G
 
T
H
 
T
P
 
P
G
 
G
S
 
P
I
 
I
A
 
T
Q
 
Q
N
 
A
I
 
I
R
 
D
E
 
N
T
 
A
F
 
Y
F
 
W
D
 
A
I
 
M
A
 
R
E
 
E

8raiA Crystal structure of d-amino acid transaminase from haliscomenobacter hydrossis point mutant r90i complexed with phenylhydrazine
29% identity, 97% coverage: 1:278/287 of query aligns to 2:271/282 of 8raiA

query
sites
8raiA
M
 
M
P
 
I
R
 
K
I
 
Y
A
 
Y
Y
 
N
V
 
I
N
 
N
G
 
G
T
 
Q
Y
 
Q
V
 
V
R
 
P
H
 
V
A
 
E
E
 
N
A
 
A
A
 
T
I
 
L
H
 
H
V
 
V
E
 
S
D
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
I
-
 
L
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
G
V
 
I
Y
x
F
E
 
D
V
 
Y
C
 
F
E
 
L
V
 
A
R
 
R
H
 
E
G
 
G
F
 
H
I
 
P
I
 
L
D
 
F
L
 
L
T
 
D
R
 
D
H
 
Y
L
 
L
D
 
N
R
|
R
L
 
F
G
 
Y
R
 
R
S
 
S
L
 
A
G
 
A
E
 
E
L
 
L
R
 
Y
I
 
L
G
 
E
W
 
I
P
 
P
M
 
F
S
 
D
R
 
K
A
 
A
A
 
E
L
 
L
I
 
R
H
 
R
V
 
Q
I
 
I
R
 
Y
E
 
A
V
 
L
L
 
L
R
 
Q
R
 
A
N
 
N
R
 
E
V
 
V
R
 
R
N
 
E
G
 
A
L
 
G
F
 
I
Y
 
I
L
 
L
Q
 
V
V
 
L
T
 
T
R
 
G
G
 
G
V
 
Y
A
 
S
R
 
-
R
 
-
D
 
-
H
 
-
V
 
-
F
 
-
P
 
P
D
 
D
A
 
G
D
 
Y
T
 
T
P
 
P
-
 
V
-
 
N
P
 
P
S
 
N
I
 
L
V
 
L
V
 
I
T
 
M
A
 
M
K
 
Y
R
 
D
T
 
L
D
 
-
P
 
P
G
 
A
A
 
S
I
 
A
A
 
W
R
 
E
K
 
F
N
 
S
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
I
 
I
S
 
K
A
 
I
I
 
I
T
 
T
V
 
H
P
 
P
E
 
F
N
 
Q
R
|
R
W
 
-
D
 
E
R
 
L
V
 
P
D
 
E
I
 
V
K
|
K
S
 
T
V
 
I
G
 
N
L
x
Y
L
 
S
P
 
T
N
 
G
V
 
I
L
 
R
A
 
M
R
 
L
Q
 
K
Q
 
T
A
 
I
K
 
K
E
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
E
 
D
A
 
L
I
 
I
F
 
Y
V
 
V
D
 
D
V
 
Q
D
 
G
G
 
E
M
 
W
V
 
I
K
 
R
E
|
E
G
 
S
A
|
A
A
x
R
T
x
S
N
|
N
V
 
F
W
 
F
I
 
L
V
 
V
D
 
M
R
 
P
E
 
D
G
 
N
T
 
T
L
 
I
R
 
V
T
 
T
R
 
-
P
 
-
A
 
A
E
 
D
S
 
E
G
 
K
I
 
I
L
|
L
R
 
W
G
|
G
V
x
I
T
|
T
R
 
R
T
 
R
T
 
Q
L
 
V
M
 
I
D
 
D
V
 
A
A
 
A
K
 
R
P
 
E
L
 
A
G
 
G
L
 
Y
A
 
A
I
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
R
A
 
R
F
 
I
S
 
H
V
 
I
E
 
T
E
 
E
M
 
L
L
 
D
A
 
Q
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
A
F
 
F
I
 
F
T
 
T
A
 
S
A
x
T
T
 
I
S
 
K
I
 
G
C
 
V
F
 
M
P
 
A
V
 
I
V
 
G
S
 
Q
V
 
I
D
 
D
G
 
D
K
 
R
T
 
V
I
 
F
G
 
G
N
 
D
G
 
G
H
 
T
P
 
I
G
 
G
S
 
K
I
 
V
A
 
T
Q
 
Q
N
 
E
I
 
L
R
 
Q
E
 
D
T
 
L
F
 
F

7p7xA Crystal structure of d-amino acid transaminase from haliscomenobacter hydrossis (holo form). (see paper)
29% identity, 97% coverage: 1:278/287 of query aligns to 2:271/282 of 7p7xA

query
sites
7p7xA
M
 
M
P
 
I
R
 
K
I
 
Y
A
 
Y
Y
 
N
V
 
I
N
 
N
G
 
G
T
 
Q
Y
 
Q
V
 
V
R
 
P
H
 
V
A
 
E
E
 
N
A
 
A
A
 
T
I
 
L
H
 
H
V
 
V
E
 
S
D
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
I
-
 
L
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
G
V
 
I
Y
 
F
E
 
D
V
 
Y
C
 
F
E
 
L
V
 
A
R
 
R
H
 
E
G
 
G
F
 
H
I
 
P
I
 
L
D
 
F
L
|
L
T
x
D
R
 
D
H
 
Y
L
 
L
D
 
N
R
|
R
L
 
F
G
 
Y
R
 
R
S
 
S
L
 
A
G
 
A
E
 
E
L
 
L
R
 
Y
I
 
L
G
 
E
W
 
I
P
 
P
M
 
F
S
 
D
R
 
K
A
 
A
A
 
E
L
 
L
I
x
R
H
 
R
V
 
Q
I
 
I
R
 
Y
E
 
A
V
 
L
L
 
L
R
 
Q
R
 
A
N
 
N
R
 
E
V
 
V
R
 
R
N
 
E
G
 
A
L
 
G
F
 
I
Y
 
R
L
 
L
Q
 
V
V
 
L
T
 
T
R
 
G
G
 
G
V
 
Y
A
 
S
R
 
-
R
 
-
D
 
-
H
 
-
V
 
-
F
 
-
P
 
P
D
 
D
A
 
G
D
 
Y
T
 
T
P
 
P
-
 
V
-
 
N
P
 
P
S
 
N
I
 
L
V
 
L
V
 
I
T
 
M
A
 
M
K
 
Y
R
 
D
T
 
L
D
 
-
P
 
P
G
 
A
A
 
S
I
 
A
A
 
W
R
 
E
K
 
F
N
 
S
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
I
 
I
S
 
K
A
 
I
I
 
I
T
 
T
V
 
H
P
 
P
E
 
F
N
 
Q
R
|
R
W
 
-
D
 
E
R
 
L
V
 
P
D
 
E
I
 
V
K
|
K
S
 
T
V
 
I
G
 
N
L
x
Y
L
 
S
P
 
T
N
 
G
V
 
I
L
 
R
A
 
M
R
 
L
Q
 
K
Q
 
T
A
 
I
K
 
K
E
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
E
 
D
A
 
L
I
 
I
F
 
Y
V
 
V
D
 
D
V
 
Q
D
 
G
G
 
E
M
 
W
V
 
I
K
 
R
E
|
E
G
 
S
A
|
A
A
x
R
T
x
S
N
 
N
V
 
F
W
 
F
I
 
L
V
 
V
D
 
M
R
 
P
E
 
D
G
 
N
T
 
T
L
 
I
R
 
V
T
 
T
R
 
-
P
 
-
A
 
A
E
 
D
S
 
E
G
 
K
I
 
I
L
|
L
R
 
W
G
|
G
V
x
I
T
|
T
R
 
R
T
 
R
T
 
Q
L
 
V
M
 
I
D
 
D
V
 
A
A
 
A
K
 
R
P
 
E
L
 
A
G
 
G
L
 
Y
A
 
A
I
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
R
A
 
R
F
 
I
S
 
H
V
 
I
E
 
T
E
 
E
M
 
L
L
 
D
A
 
Q
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
A
F
 
F
I
 
F
T
 
T
A
 
S
A
x
T
T
 
I
S
 
K
I
 
G
C
 
V
F
 
M
P
 
A
V
 
I
V
 
G
S
 
Q
V
 
I
D
 
D
G
 
D
K
 
R
T
 
V
I
 
F
G
 
G
N
 
D
G
 
G
H
 
T
P
 
I
G
 
G
S
 
K
I
 
V
A
 
T
Q
 
Q
N
 
E
I
 
L
R
 
Q
E
 
D
T
 
L
F
 
F

Sites not aligning to the query:

8ahuA Crystal structure of d-amino acid aminotrensferase from haliscomenobacter hydrossis complexed with d-cycloserine
29% identity, 97% coverage: 1:278/287 of query aligns to 3:272/283 of 8ahuA

query
sites
8ahuA
M
 
M
P
 
I
R
 
K
I
 
Y
A
 
Y
Y
 
N
V
 
I
N
 
N
G
 
G
T
 
Q
Y
 
Q
V
 
V
R
 
P
H
 
V
A
 
E
E
 
N
A
 
A
A
 
T
I
 
L
H
 
H
V
 
V
E
 
S
D
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
I
-
 
L
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
G
V
 
I
Y
x
F
E
 
D
V
 
Y
C
 
F
E
 
L
V
 
A
R
 
R
H
 
E
G
 
G
F
 
H
I
 
P
I
 
L
D
 
F
L
 
L
T
 
D
R
 
D
H
 
Y
L
 
L
D
 
N
R
|
R
L
 
F
G
 
Y
R
 
R
S
 
S
L
 
A
G
 
A
E
 
E
L
 
L
R
 
Y
I
 
L
G
 
E
W
 
I
P
 
P
M
 
F
S
 
D
R
 
K
A
 
A
A
 
E
L
 
L
I
 
R
H
 
R
V
 
Q
I
 
I
R
 
Y
E
 
A
V
 
L
L
 
L
R
 
Q
R
 
A
N
 
N
R
 
E
V
 
V
R
 
R
N
 
E
G
 
A
L
 
G
F
 
I
Y
 
R
L
 
L
Q
 
V
V
 
L
T
 
T
R
 
G
G
 
G
V
 
Y
A
 
S
R
 
-
R
 
-
D
 
-
H
 
-
V
 
-
F
 
-
P
 
P
D
 
D
A
 
G
D
 
Y
T
 
T
P
 
P
-
 
V
-
 
N
P
 
P
S
 
N
I
 
L
V
 
L
V
 
I
T
 
M
A
 
M
K
 
Y
R
 
D
T
 
L
D
 
-
P
 
P
G
 
A
A
 
S
I
 
A
A
 
W
R
 
E
K
 
F
N
 
S
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
I
 
I
S
 
K
A
 
I
I
 
I
T
 
T
V
 
H
P
 
P
E
 
F
N
 
Q
R
|
R
W
 
-
D
 
E
R
 
L
V
 
P
D
 
E
I
 
V
K
|
K
S
 
T
V
 
I
G
 
N
L
x
Y
L
 
S
P
 
T
N
 
G
V
 
I
L
 
R
A
 
M
R
 
L
Q
 
K
Q
 
T
A
 
I
K
 
K
E
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
E
 
D
A
 
L
I
 
I
F
 
Y
V
 
V
D
 
D
V
 
Q
D
 
G
G
 
E
M
 
W
V
 
I
K
 
R
E
|
E
G
 
S
A
|
A
A
x
R
T
x
S
N
 
N
V
 
F
W
 
F
I
 
L
V
 
V
D
 
M
R
 
P
E
 
D
G
 
N
T
 
T
L
 
I
R
 
V
T
 
T
R
 
-
P
 
-
A
 
A
E
 
D
S
 
E
G
 
K
I
 
I
L
|
L
R
 
W
G
|
G
V
x
I
T
|
T
R
 
R
T
 
R
T
 
Q
L
 
V
M
 
I
D
 
D
V
 
A
A
 
A
K
 
R
P
 
E
L
 
A
G
 
G
L
 
Y
A
 
A
I
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
R
A
 
R
F
 
I
S
 
H
V
 
I
E
 
T
E
 
E
M
 
L
L
 
D
A
 
Q
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
A
F
 
F
I
 
F
T
 
T
A
x
S
A
x
T
T
 
I
S
 
K
I
 
G
C
 
V
F
 
M
P
 
A
V
 
I
V
 
G
S
 
Q
V
 
I
D
 
D
G
 
D
K
 
R
T
 
V
I
 
F
G
 
G
N
 
D
G
 
G
H
 
T
P
 
I
G
 
G
S
 
K
I
 
V
A
 
T
Q
 
Q
N
 
E
I
 
L
R
 
Q
E
 
D
T
 
L
F
 
F

7z79B Crystal structure of aminotransferase-like protein from variovorax paradoxus
31% identity, 90% coverage: 4:262/287 of query aligns to 17:277/306 of 7z79B

query
sites
7z79B
I
 
L
A
 
V
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
G
 
G
T
 
Q
Y
 
F
V
 
V
R
 
P
H
 
R
A
 
H
E
 
Q
A
 
A
A
 
V
I
 
V
H
 
S
V
 
V
E
 
F
D
 
D
R
 
A
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
V
F
 
C
A
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
x
W
E
 
E
V
 
G
C
 
V
E
 
R
V
 
L
R
 
V
H
 
D
G
 
G
F
 
R
I
 
I
I
 
V
D
 
S
L
 
F
T
 
D
R
 
A
H
 
H
L
 
I
D
 
D
R
|
R
L
 
M
G
 
Y
R
 
E
S
 
G
L
 
A
G
 
K
E
 
S
L
 
I
R
 
A
I
 
L
G
 
D
W
 
I
P
 
G
M
 
M
S
 
T
R
 
R
A
 
A
A
 
Q
L
 
T
I
 
K
H
 
Q
V
 
V
I
 
V
R
 
V
E
 
D
V
 
T
L
 
F
R
 
L
R
 
R
N
 
N
R
 
G
V
 
M
R
 
R
N
 
D
G
 
G
L
 
A
F
 
H
Y
 
A
-
 
R
L
 
L
Q
 
M
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
K
R
 
K
R
 
T
D
 
-
H
 
-
V
 
-
F
 
-
P
 
P
D
 
N
A
 
Q
D
 
D
T
 
P
-
 
R
-
 
F
-
 
I
-
 
I
-
 
G
P
 
G
P
 
A
S
 
T
I
 
V
V
 
V
V
 
C
T
 
V
A
 
A
K
 
E
R
 
H
T
 
K
D
 
V
P
 
V
G
 
T
A
 
P
I
 
E
A
 
A
R
 
K
K
 
R
N
 
N
A
 
G
E
 
L
G
 
K
I
 
L
S
 
F
A
 
T
I
 
S
T
 
T
V
 
L
P
 
R
E
 
C
N
 
S
R
 
G
W
 
P
D
 
D
R
 
V
V
 
F
D
 
D
I
 
L
K
 
R
-
 
L
-
x
N
S
 
S
V
 
H
G
 
S
L
 
R
L
 
L
P
 
N
N
 
L
V
 
I
L
 
Q
A
 
A
R
 
L
Q
 
I
Q
 
Q
A
 
A
K
 
I
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
L
F
 
M
V
 
L
D
 
D
V
 
P
D
 
N
G
 
G
M
 
F
V
 
V
K
 
S
E
 
S
G
 
C
A
 
N
A
x
S
T
|
T
N
 
N
V
 
F
W
 
F
I
 
A
V
 
V
D
 
-
R
 
R
E
 
N
G
 
G
T
 
A
L
 
L
R
 
W
T
 
T
R
 
S
P
 
S
A
 
G
E
 
R
S
 
Y
G
 
-
I
 
C
L
x
F
R
 
N
G
|
G
V
x
I
T
|
T
R
 
R
T
 
A
T
 
T
L
 
V
M
 
V
D
 
R
V
 
L
A
 
A
K
 
R
P
 
E
L
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
P
I
 
V
E
 
H
E
 
E
T
 
G
A
 
D
F
 
F
S
 
T
V
 
L
E
 
A
E
 
E
M
 
V
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
D
E
 
E
V
 
A
F
 
F
I
 
V
T
 
T
A
x
G
A
x
T
T
 
L
S
 
A
I
 
G
C
 
L
F
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
S
S
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
R
T
 
A
I
 
L

1iyeA Crystal structure of eschelichia coli branched-chain amino acid aminotransferase (see paper)
29% identity, 96% coverage: 6:281/287 of query aligns to 6:288/304 of 1iyeA

query
sites
1iyeA
Y
 
W
V
 
F
N
 
N
G
 
G
T
 
E
Y
 
M
V
 
V
R
 
R
H
 
W
A
 
E
E
 
D
A
 
A
A
 
K
I
 
V
H
 
H
V
 
V
E
 
M
D
 
S
R
 
H
G
 
A
Y
 
L
Q
 
H
F
 
Y
A
 
G
D
 
T
G
 
S
V
 
V
Y
x
F
E
 
E
V
x
G
-
 
I
-
 
R
C
 
C
E
 
Y
V
 
D
R
 
S
H
 
H
-
 
K
G
 
G
F
 
P
I
 
V
I
 
V
D
 
F
L
 
R
T
 
H
R
 
R
-
 
E
H
 
H
L
 
M
D
 
Q
R
|
R
L
 
L
G
 
H
R
 
D
S
 
S
L
 
A
G
 
K
E
 
I
L
 
Y
R
 
R
I
 
F
G
 
P
W
 
V
P
 
S
M
 
Q
S
 
S
R
 
I
A
 
D
A
 
E
L
 
L
I
 
M
H
 
E
V
 
A
I
 
C
R
 
R
E
 
D
V
 
V
L
 
I
R
 
R
R
 
K
N
 
N
R
 
N
-
 
L
-
 
T
-
 
S
-
 
A
-
x
Y
V
 
I
R
 
R
N
 
P
G
 
L
L
 
I
F
 
F
Y
 
V
L
 
G
Q
 
D
V
 
V
T
 
G
R
 
M
G
 
G
V
 
V
A
 
N
R
 
-
R
 
-
D
 
-
H
 
-
V
 
-
F
 
-
P
 
P
D
 
P
A
 
A
D
 
G
T
 
Y
P
 
S
P
 
T
S
 
D
I
 
V
V
 
I
V
 
I
T
 
A
A
 
A
K
 
F
R
 
P
T
 
W
D
 
G
P
 
A
G
x
Y
A
 
L
I
 
G
A
 
A
R
 
E
K
 
A
N
 
L
A
 
E
E
 
Q
G
 
G
I
 
I
S
 
D
A
 
A
I
 
M
T
 
V
V
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
S
R
 
S
W
 
W
D
 
N
R
 
R
V
 
A
D
 
A
I
 
P
K
 
N
S
 
T
V
 
I
-
 
P
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
x
K
-
x
A
-
 
G
-
 
G
G
 
N
L
x
Y
L
 
L
P
 
S
N
 
S
V
 
L
L
 
L
A
 
V
R
 
G
Q
 
S
Q
 
E
A
 
A
K
 
R
E
 
R
A
 
H
G
 
G
A
 
Y
Q
 
Q
E
 
E
A
 
G
I
 
I
F
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
V
D
 
N
G
 
G
M
 
Y
V
 
I
K
 
S
E
|
E
G
 
G
A
 
A
A
x
G
T
x
E
N
|
N
V
 
L
W
 
F
I
 
E
V
 
V
D
 
-
R
 
K
E
 
D
G
 
G
T
 
V
L
 
L
R
 
F
T
 
T
R
 
P
P
 
P
A
 
F
E
 
T
S
 
S
G
 
S
I
 
A
L
|
L
R
 
P
G
|
G
V
x
I
T
|
T
R
 
R
T
 
D
T
 
A
L
 
I
M
 
I
D
 
K
V
 
L
A
 
A
K
 
K
P
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
E
I
 
V
E
 
R
E
 
E
T
 
Q
A
 
V
F
 
L
S
 
S
V
 
R
E
 
E
E
 
S
M
 
L
L
 
Y
A
 
L
A
 
A
R
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
F
I
 
M
T
 
S
A
x
G
A
x
T
T
x
A
S
 
A
I
 
E
C
 
I
F
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
R
S
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
I
T
 
Q
I
 
V
G
 
G
N
 
E
G
 
G
H
 
R
P
 
C
G
 
G
S
 
P
I
 
V
A
 
T
Q
 
K
N
 
R
I
 
I
R
 
Q
E
 
Q
T
 
A
F
 
F
F
 
F
D
 
G
I
 
L

1iydA Crystal structure of eschelichia coli branched-chain amino acid aminotransferase (see paper)
29% identity, 96% coverage: 6:281/287 of query aligns to 6:288/304 of 1iydA

query
sites
1iydA
Y
 
W
V
 
F
N
 
N
G
 
G
T
 
E
Y
 
M
V
 
V
R
 
R
H
 
W
A
 
E
E
 
D
A
 
A
A
 
K
I
 
V
H
 
H
V
 
V
E
 
M
D
 
S
R
 
H
G
 
A
Y
 
L
Q
 
H
F
 
Y
A
 
G
D
 
T
G
 
S
V
 
V
Y
x
F
E
 
E
V
x
G
-
 
I
-
 
R
C
 
C
E
 
Y
V
 
D
R
 
S
H
 
H
-
 
K
G
 
G
F
 
P
I
 
V
I
 
V
D
 
F
L
 
R
T
 
H
R
 
R
-
 
E
H
 
H
L
 
M
D
 
Q
R
|
R
L
 
L
G
 
H
R
 
D
S
 
S
L
 
A
G
 
K
E
 
I
L
 
Y
R
 
R
I
 
F
G
 
P
W
 
V
P
 
S
M
 
Q
S
 
S
R
 
I
A
 
D
A
 
E
L
 
L
I
 
M
H
 
E
V
 
A
I
 
C
R
 
R
E
 
D
V
 
V
L
 
I
R
 
R
R
 
K
N
 
N
R
 
N
-
 
L
-
 
T
-
 
S
-
 
A
-
x
Y
V
 
I
R
 
R
N
 
P
G
 
L
L
 
I
F
 
F
Y
 
V
L
 
G
Q
 
D
V
 
V
T
 
G
R
 
M
G
 
G
V
 
V
A
 
N
R
 
-
R
 
-
D
 
-
H
 
-
V
 
-
F
 
-
P
 
P
D
 
P
A
 
A
D
 
G
T
 
Y
P
 
S
P
 
T
S
 
D
I
 
V
V
 
I
V
 
I
T
 
A
A
 
A
K
 
F
R
 
P
T
 
W
D
 
G
P
 
A
G
x
Y
A
 
L
I
 
G
A
 
A
R
 
E
K
 
A
N
 
L
A
 
E
E
 
Q
G
 
G
I
 
I
S
 
D
A
 
A
I
 
M
T
 
V
V
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
S
R
 
S
W
 
W
D
 
N
R
 
R
V
 
A
D
 
A
I
 
P
K
 
N
S
 
T
V
 
I
-
 
P
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
x
K
-
x
A
-
 
G
-
 
G
G
 
N
L
x
Y
L
 
L
P
 
S
N
 
S
V
 
L
L
 
L
A
 
V
R
 
G
Q
 
S
Q
 
E
A
 
A
K
 
R
E
 
R
A
 
H
G
 
G
A
 
Y
Q
 
Q
E
 
E
A
 
G
I
 
I
F
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
V
D
 
N
G
 
G
M
 
Y
V
 
I
K
 
S
E
|
E
G
 
G
A
 
A
A
x
G
T
x
E
N
 
N
V
 
L
W
 
F
I
 
E
V
 
V
D
 
-
R
 
K
E
 
D
G
 
G
T
 
V
L
 
L
R
 
F
T
 
T
R
 
P
P
 
P
A
 
F
E
 
T
S
 
S
G
 
S
I
 
A
L
|
L
R
 
P
G
|
G
V
x
I
T
|
T
R
 
R
T
 
D
T
 
A
L
 
I
M
 
I
D
 
K
V
 
L
A
 
A
K
 
K
P
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
E
I
 
V
E
 
R
E
 
E
T
 
Q
A
 
V
F
 
L
S
 
S
V
 
R
E
 
E
E
 
S
M
 
L
L
 
Y
A
 
L
A
 
A
R
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
F
I
 
M
T
 
S
A
 
G
A
x
T
T
x
A
S
 
A
I
 
E
C
 
I
F
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
R
S
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
I
T
 
Q
I
 
V
G
 
G
N
 
E
G
 
G
H
 
R
P
 
C
G
 
G
S
 
P
I
 
V
A
 
T
Q
 
K
N
 
R
I
 
I
R
 
Q
E
 
Q
T
 
A
F
 
F
F
 
F
D
 
G
I
 
L

1i1mA Crystal structure of escherichia coli branched-chain amino acid aminotransferase. (see paper)
29% identity, 96% coverage: 6:281/287 of query aligns to 6:288/304 of 1i1mA

query
sites
1i1mA
Y
 
W
V
 
F
N
 
N
G
 
G
T
 
E
Y
 
M
V
 
V
R
 
R
H
 
W
A
 
E
E
 
D
A
 
A
A
 
K
I
 
V
H
 
H
V
 
V
E
 
M
D
 
S
R
 
H
G
 
A
Y
 
L
Q
 
H
F
 
Y
A
 
G
D
 
T
G
 
S
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
V
 
G
-
 
I
-
 
R
C
 
C
E
 
Y
V
 
D
R
 
S
H
 
H
-
 
K
G
 
G
F
 
P
I
 
V
I
 
V
D
 
F
L
 
R
T
 
H
R
 
R
-
 
E
H
 
H
L
 
M
D
 
Q
R
|
R
L
 
L
G
 
H
R
 
D
S
 
S
L
 
A
G
 
K
E
 
I
L
 
Y
R
 
R
I
 
F
G
 
P
W
 
V
P
 
S
M
 
Q
S
 
S
R
 
I
A
 
D
A
 
E
L
 
L
I
 
M
H
 
E
V
 
A
I
 
C
R
 
R
E
 
D
V
 
V
L
 
I
R
 
R
R
 
K
N
 
N
R
 
N
-
 
L
-
 
T
-
 
S
-
 
A
-
x
Y
V
 
I
R
 
R
N
 
P
G
 
L
L
 
I
F
 
F
Y
 
V
L
 
G
Q
 
D
V
 
V
T
 
G
R
 
M
G
 
G
V
 
V
A
 
N
R
 
-
R
 
-
D
 
-
H
 
-
V
 
-
F
 
-
P
 
P
D
 
P
A
 
A
D
 
G
T
 
Y
P
 
S
P
 
T
S
 
D
I
 
V
V
 
I
V
 
I
T
 
A
A
 
A
K
 
F
R
 
P
T
 
W
D
 
G
P
 
A
G
 
Y
A
 
L
I
 
G
A
 
A
R
 
E
K
 
A
N
 
L
A
 
E
E
 
Q
G
 
G
I
 
I
S
 
D
A
 
A
I
 
M
T
 
V
V
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
S
R
 
S
W
 
W
D
 
N
R
 
R
V
 
A
D
 
A
I
 
P
K
 
N
S
 
T
V
 
I
-
 
P
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
x
K
-
 
A
-
 
G
-
 
G
G
 
N
L
x
Y
L
 
L
P
 
S
N
 
S
V
 
L
L
 
L
A
 
V
R
 
G
Q
 
S
Q
 
E
A
 
A
K
 
R
E
 
R
A
 
H
G
 
G
A
 
Y
Q
 
Q
E
 
E
A
 
G
I
 
I
F
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
V
D
 
N
G
 
G
M
 
Y
V
 
I
K
 
S
E
|
E
G
 
G
A
 
A
A
x
G
T
x
E
N
 
N
V
 
L
W
 
F
I
 
E
V
 
V
D
 
-
R
 
K
E
 
D
G
 
G
T
 
V
L
 
L
R
 
F
T
 
T
R
 
P
P
 
P
A
 
F
E
 
T
S
 
S
G
 
S
I
 
A
L
|
L
R
 
P
G
|
G
V
x
I
T
|
T
R
 
R
T
 
D
T
 
A
L
 
I
M
 
I
D
 
K
V
 
L
A
 
A
K
 
K
P
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
E
I
 
V
E
 
R
E
 
E
T
 
Q
A
 
V
F
 
L
S
 
S
V
 
R
E
 
E
E
 
S
M
 
L
L
 
Y
A
 
L
A
 
A
R
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
F
I
 
M
T
 
S
A
x
G
A
x
T
T
x
A
S
 
A
I
 
E
C
 
I
F
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
R
S
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
I
T
 
Q
I
 
V
G
 
G
N
 
E
G
 
G
H
 
R
P
 
C
G
 
G
S
 
P
I
 
V
A
 
T
Q
 
K
N
 
R
I
 
I
R
 
Q
E
 
Q
T
 
A
F
 
F
F
 
F
D
 
G
I
 
L

1i1lA Crystal structure of eschelichia coli branched-chain amino acid aminotransferase. (see paper)
29% identity, 96% coverage: 6:281/287 of query aligns to 6:288/304 of 1i1lA

query
sites
1i1lA
Y
 
W
V
 
F
N
 
N
G
 
G
T
 
E
Y
 
M
V
 
V
R
 
R
H
 
W
A
 
E
E
 
D
A
 
A
A
 
K
I
 
V
H
 
H
V
 
V
E
 
M
D
 
S
R
 
H
G
 
A
Y
 
L
Q
 
H
F
 
Y
A
 
G
D
 
T
G
 
S
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
V
 
G
-
 
I
-
 
R
C
 
C
E
 
Y
V
 
D
R
 
S
H
 
H
-
 
K
G
 
G
F
 
P
I
 
V
I
 
V
D
 
F
L
 
R
T
 
H
R
 
R
-
 
E
H
 
H
L
 
M
D
 
Q
R
|
R
L
 
L
G
 
H
R
 
D
S
 
S
L
 
A
G
 
K
E
 
I
L
 
Y
R
 
R
I
 
F
G
 
P
W
 
V
P
 
S
M
 
Q
S
 
S
R
 
I
A
 
D
A
 
E
L
 
L
I
 
M
H
 
E
V
 
A
I
 
C
R
 
R
E
 
D
V
 
V
L
 
I
R
 
R
R
 
K
N
 
N
R
 
N
-
 
L
-
 
T
-
 
S
-
 
A
-
x
Y
V
 
I
R
 
R
N
 
P
G
 
L
L
 
I
F
 
F
Y
 
V
L
 
G
Q
 
D
V
 
V
T
 
G
R
 
M
G
 
G
V
 
V
A
 
N
R
 
-
R
 
-
D
 
-
H
 
-
V
 
-
F
 
-
P
 
P
D
 
P
A
 
A
D
 
G
T
 
Y
P
 
S
P
 
T
S
 
D
I
 
V
V
 
I
V
 
I
T
 
A
A
 
A
K
 
F
R
 
P
T
 
W
D
 
G
P
 
A
G
 
Y
A
 
L
I
 
G
A
 
A
R
 
E
K
 
A
N
 
L
A
 
E
E
 
Q
G
 
G
I
 
I
S
 
D
A
 
A
I
 
M
T
 
V
V
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
S
R
 
S
W
 
W
D
 
N
R
 
R
V
 
A
D
 
A
I
 
P
K
 
N
S
 
T
V
 
I
-
 
P
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
x
K
-
 
A
-
 
G
-
 
G
G
 
N
L
x
Y
L
 
L
P
 
S
N
 
S
V
 
L
L
 
L
A
 
V
R
 
G
Q
 
S
Q
 
E
A
 
A
K
 
R
E
 
R
A
 
H
G
 
G
A
 
Y
Q
 
Q
E
 
E
A
 
G
I
 
I
F
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
V
D
 
N
G
 
G
M
 
Y
V
 
I
K
 
S
E
|
E
G
 
G
A
 
A
A
x
G
T
 
E
N
 
N
V
 
L
W
 
F
I
 
E
V
 
V
D
 
-
R
 
K
E
 
D
G
 
G
T
 
V
L
 
L
R
 
F
T
 
T
R
 
P
P
 
P
A
 
F
E
 
T
S
 
S
G
 
S
I
 
A
L
 
L
R
 
P
G
|
G
V
x
I
T
|
T
R
 
R
T
 
D
T
 
A
L
 
I
M
 
I
D
 
K
V
 
L
A
 
A
K
 
K
P
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
E
I
 
V
E
 
R
E
 
E
T
 
Q
A
 
V
F
 
L
S
 
S
V
 
R
E
 
E
E
 
S
M
 
L
L
 
Y
A
 
L
A
 
A
R
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
F
I
 
M
T
 
S
A
 
G
A
x
T
T
x
A
S
 
A
I
 
E
C
 
I
F
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
R
S
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
I
T
 
Q
I
 
V
G
 
G
N
 
E
G
 
G
H
 
R
P
 
C
G
 
G
S
 
P
I
 
V
A
 
T
Q
 
K
N
 
R
I
 
I
R
 
Q
E
 
Q
T
 
A
F
 
F
F
 
F
D
 
G
I
 
L

7dbeB Structure of a novel transaminase
29% identity, 98% coverage: 5:284/287 of query aligns to 41:322/332 of 7dbeB

query
sites
7dbeB
A
 
A
Y
 
W
V
 
I
N
 
E
G
 
G
T
 
A
Y
 
F
V
 
V
R
 
P
H
 
A
A
 
A
E
 
A
A
 
A
A
 
R
I
 
I
H
 
S
V
 
I
E
 
F
D
 
D
R
 
A
G
 
G
Y
 
F
Q
 
G
F
 
H
A
 
S
D
 
D
G
 
V
V
 
T
Y
 
Y
E
 
T
V
 
V
C
 
A
E
 
H
V
 
V
R
 
W
H
 
H
G
 
G
F
 
N
I
 
F
I
 
F
D
 
R
L
 
L
T
 
E
R
 
D
H
 
H
L
 
V
D
 
E
R
|
R
L
 
F
G
 
L
R
 
A
S
 
G
L
 
A
G
 
E
E
 
K
L
 
M
R
 
R
I
 
I
G
 
P
W
 
M
P
 
P
M
 
A
S
 
T
R
 
K
A
 
A
A
 
E
L
 
I
I
 
M
H
 
D
V
 
L
I
 
M
R
 
R
E
 
G
V
 
C
L
 
V
R
 
S
R
 
K
N
 
S
R
 
G
V
 
L
R
 
R
N
 
E
G
 
A
L
 
Y
F
 
V
Y
 
N
L
 
V
Q
 
C
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
Y
A
 
G
R
 
R
R
 
K
D
 
P
H
 
G
V
 
E
F
 
K
P
 
T
D
 
L
A
 
E
D
 
A
T
 
L
P
 
E
P
 
S
S
 
Q
I
 
L
V
 
Y
V
 
V
T
 
Y
A
 
A
K
 
I
R
 
P
T
 
Y
D
 
L
P
 
W
G
 
V
A
 
F
I
 
S
A
 
P
R
 
I
K
 
R
N
 
Q
A
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
I
S
 
D
A
 
A
I
 
V
T
 
I
V
 
A
-
 
Q
-
 
S
-
 
V
-
 
R
-
 
R
-
 
S
P
 
P
E
 
A
N
 
N
R
 
V
W
 
M
D
 
D
R
 
P
V
 
W
D
 
-
I
 
I
K
|
K
S
 
N
V
 
Y
G
 
Q
L
 
W
L
 
G
P
 
D
N
 
L
V
 
V
L
 
R
A
 
A
R
 
T
Q
 
F
Q
 
E
A
 
A
K
 
Q
E
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
E
 
T
A
 
A
I
 
F
F
 
L
V
 
L
D
 
D
V
 
S
D
 
D
G
 
G
M
 
F
V
 
V
K
 
T
E
|
E
G
 
G
A
 
P
A
x
G
T
x
F
N
|
N
V
 
V
W
 
L
I
 
M
V
 
V
D
 
-
R
 
K
E
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
V
R
 
F
T
 
T
R
 
-
P
 
-
A
 
A
E
 
A
S
 
R
G
 
N
I
 
V
L
|
L
R
 
P
G
|
G
V
x
I
T
|
T
R
 
R
T
 
R
T
 
T
L
 
A
M
 
L
D
 
E
V
 
I
A
 
A
K
 
R
P
 
D
L
 
F
G
 
G
L
 
L
A
 
Q
I
 
T
E
 
V
E
 
I
T
 
G
A
 
D
F
 
V
S
 
T
V
 
P
E
 
E
E
 
M
M
 
L
L
 
R
A
 
G
A
 
A
R
 
D
E
 
E
V
 
I
F
 
F
I
 
A
T
 
A
A
 
T
A
x
T
T
 
A
S
 
G
I
 
G
C
 
V
F
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
V
S
 
A
V
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
A
T
 
P
I
 
V
G
 
G
N
 
A
G
 
G
H
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
D
I
 
W
A
 
T
Q
 
R
N
 
K
I
 
I
R
 
R
E
 
T
T
 
R
F
 
Y
F
 
W
D
 
Q
I
 
M
A
 
M
E
 
D
K
 
E

6xu3C (R)-selective amine transaminase from shinella sp. (see paper)
28% identity, 97% coverage: 4:280/287 of query aligns to 29:306/322 of 6xu3C

query
sites
6xu3C
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
N
 
A
G
 
G
T
 
E
Y
 
Y
V
 
V
R
 
P
H
 
L
A
 
H
E
 
E
A
 
A
A
 
R
I
 
I
H
 
P
V
 
I
E
 
L
D
 
D
R
 
Q
G
 
G
Y
 
F
Q
 
L
F
 
H
A
 
S
D
 
D
G
 
L
V
 
T
Y
|
Y
E
 
D
V
|
V
C
 
P
E
 
A
V
 
V
R
 
W
H
 
N
G
 
G
F
 
R
I
 
F
I
 
F
D
 
R
L
 
L
T
 
E
R
 
D
H
 
H
L
 
L
D
 
D
R
|
R
L
 
F
G
 
E
R
 
K
S
 
S
L
 
C
G
 
A
E
 
Q
L
 
L
R
 
R
I
 
L
G
 
K
W
 
S
P
 
P
M
 
L
S
 
S
R
 
R
A
 
E
A
 
E
L
 
I
I
 
R
H
 
D
V
 
R
I
 
L
R
 
V
E
 
E
V
 
M
L
 
T
R
 
V
R
 
K
N
 
S
R
 
G
V
 
I
R
 
R
N
 
D
G
 
A
L
 
Y
F
 
V
Y
 
M
L
 
M
Q
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
L
A
 
R
R
 
F
-
 
V
R
 
R
D
 
Q
H
 
Y
V
 
A
F
 
P
P
 
E
D
 
E
A
 
C
D
 
D
T
 
N
P
 
F
P
 
C
S
 
Y
I
 
L
V
 
M
V
 
V
T
 
M
A
 
P
K
 
Y
R
 
L
T
 
W
D
 
V
P
 
M
G
 
D
A
 
E
I
 
A
A
 
T
R
 
Q
K
 
K
N
 
N
A
 
G
E
 
-
G
 
G
I
 
S
S
 
A
A
 
V
I
 
I
T
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
V
-
 
R
-
 
R
V
 
V
P
 
P
E
 
P
N
 
G
R
 
A
W
 
I
D
 
D
R
 
P
V
 
T
D
 
-
I
 
V
K
|
K
S
 
N
V
 
L
G
 
Q
L
 
W
L
 
G
P
 
D
N
x
F
V
 
T
L
 
R
A
 
G
R
 
L
Q
 
M
Q
 
E
A
 
A
K
 
R
E
 
D
A
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
M
E
 
Y
A
 
P
I
 
I
F
 
L
V
 
T
D
 
D
V
 
G
D
 
D
G
 
A
M
 
N
V
 
L
K
 
T
E
|
E
G
 
G
A
 
S
A
x
G
T
 
F
N
|
N
V
 
V
W
 
-
I
 
I
V
 
L
D
 
I
R
 
K
E
 
D
G
 
G
T
 
K
L
 
L
R
 
Y
T
 
T
R
 
-
P
 
-
A
 
P
E
 
R
S
 
K
G
 
G
I
 
V
L
|
L
R
 
E
G
|
G
V
|
V
T
|
T
R
 
R
T
 
K
T
 
S
L
 
V
M
 
L
D
 
A
V
 
V
A
 
A
K
 
E
P
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
A
 
P
I
 
Y
E
 
T
E
 
I
T
 
D
A
 
D
F
 
V
S
 
P
V
 
V
E
 
E
E
 
L
M
 
A
L
 
Y
A
 
Q
A
 
C
R
 
D
E
 
E
V
 
I
F
 
L
I
 
F
T
 
V
A
x
T
A
x
T
T
x
A
S
 
G
I
 
G
C
 
V
F
 
M
P
 
P
V
 
I
V
 
T
S
 
T
V
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
T
 
P
I
 
V
G
 
G
N
 
D
G
 
G
H
 
Q
P
 
V
G
 
G
S
 
P
I
 
I
A
 
S
Q
 
K
N
 
A
I
 
L
R
 
W
E
 
K
T
 
G
F
 
Y
F
 
W
D
 
D

6xu3A (R)-selective amine transaminase from shinella sp. (see paper)
28% identity, 97% coverage: 4:280/287 of query aligns to 27:304/320 of 6xu3A

query
sites
6xu3A
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
N
 
A
G
 
G
T
 
E
Y
 
Y
V
 
V
R
 
P
H
 
L
A
 
H
E
 
E
A
 
A
A
 
R
I
 
I
H
 
P
V
 
I
E
 
L
D
 
D
R
 
Q
G
 
G
Y
 
F
Q
 
L
F
 
H
A
 
S
D
 
D
G
 
L
V
 
T
Y
|
Y
E
 
D
V
 
V
C
 
P
E
 
A
V
 
V
R
 
W
H
 
N
G
 
G
F
 
R
I
 
F
I
 
F
D
 
R
L
 
L
T
 
E
R
 
D
H
 
H
L
 
L
D
 
D
R
|
R
L
 
F
G
 
E
R
 
K
S
 
S
L
 
C
G
 
A
E
 
Q
L
 
L
R
 
R
I
 
L
G
 
K
W
 
S
P
 
P
M
 
L
S
 
S
R
 
R
A
 
E
A
 
E
L
 
I
I
 
R
H
 
D
V
 
R
I
 
L
R
 
V
E
 
E
V
 
M
L
 
T
R
 
V
R
 
K
N
 
S
R
 
G
V
 
I
R
 
R
N
 
D
G
 
A
L
 
Y
F
 
V
Y
 
M
L
 
M
Q
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
L
A
 
R
R
 
F
-
 
V
R
 
R
D
 
Q
H
 
Y
V
 
A
F
 
P
P
 
E
D
 
E
A
 
C
D
 
D
T
 
N
P
 
F
P
 
C
S
 
Y
I
 
L
V
 
M
V
 
V
T
 
M
A
 
P
K
 
Y
R
 
L
T
 
W
D
 
V
P
 
M
G
 
D
A
 
E
I
 
A
A
 
T
R
 
Q
K
 
K
N
 
N
A
 
G
E
 
-
G
 
G
I
 
S
S
 
A
A
 
V
I
 
I
T
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
V
-
 
R
-
 
R
V
 
V
P
 
P
E
 
P
N
 
G
R
 
A
W
 
I
D
 
D
R
 
P
V
 
T
D
 
-
I
 
V
K
|
K
S
 
N
V
 
L
G
 
Q
L
 
W
L
 
G
P
 
D
N
x
F
V
 
T
L
 
R
A
 
G
R
 
L
Q
 
M
Q
 
E
A
 
A
K
 
R
E
 
D
A
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
M
E
 
Y
A
 
P
I
 
I
F
 
L
V
 
T
D
 
D
V
 
G
D
 
D
G
 
A
M
 
N
V
 
L
K
 
T
E
|
E
G
 
G
A
 
S
A
x
G
T
x
F
N
 
N
V
 
V
W
 
-
I
 
I
V
 
L
D
 
I
R
 
K
E
 
D
G
 
G
T
 
K
L
 
L
R
 
Y
T
 
T
R
 
-
P
 
-
A
 
P
E
 
R
S
 
K
G
 
G
I
 
V
L
|
L
R
 
E
G
|
G
V
|
V
T
|
T
R
 
R
T
 
K
T
 
S
L
 
V
M
 
L
D
 
A
V
 
V
A
 
A
K
 
E
P
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
A
 
P
I
 
Y
E
 
T
E
 
I
T
 
D
A
 
D
F
 
V
S
 
P
V
 
V
E
 
E
E
 
L
M
 
A
L
 
Y
A
 
Q
A
 
C
R
 
D
E
 
E
V
 
I
F
 
L
I
 
F
T
 
V
A
 
T
A
x
T
T
 
A
S
 
G
I
 
G
C
 
V
F
 
M
P
 
P
V
 
I
V
 
T
S
 
T
V
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
T
 
P
I
 
V
G
 
G
N
 
D
G
 
G
H
 
Q
P
 
V
G
 
G
S
 
P
I
 
I
A
 
S
Q
 
K
N
 
A
I
 
L
R
 
W
E
 
K
T
 
G
F
 
Y
F
 
W
D
 
D

Query Sequence

>SMc01047 FitnessBrowser__Smeli:SMc01047
MPRIAYVNGTYVRHAEAAIHVEDRGYQFADGVYEVCEVRHGFIIDLTRHLDRLGRSLGEL
RIGWPMSRAALIHVIREVLRRNRVRNGLFYLQVTRGVARRDHVFPDADTPPSIVVTAKRT
DPGAIARKNAEGISAITVPENRWDRVDIKSVGLLPNVLARQQAKEAGAQEAIFVDVDGMV
KEGAATNVWIVDREGTLRTRPAESGILRGVTRTTLMDVAKPLGLAIEETAFSVEEMLAAR
EVFITAATSICFPVVSVDGKTIGNGHPGSIAQNIRETFFDIAEKTVI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory