SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMc01500 FitnessBrowser__Smeli:SMc01500 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6pejA Structure of sorbitol dehydrogenase from sinorhizobium meliloti 1021 bound to sorbitol
100% identity, 100% coverage: 1:257/257 of query aligns to 1:257/257 of 6pejA

query
sites
6pejA
M
 
M
K
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
S
A
 
A
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
F
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
D
I
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
M
 
M
D
 
D
V
 
V
T
 
T
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
S
 
S
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
T
 
T
V
 
V
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
I
 
I
V
 
V
E
 
E
I
 
I
T
 
T
R
 
R
E
 
E
S
 
S
Y
 
Y
E
 
E
K
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
A
I
 
I
N
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
L
F
 
F
T
 
T
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
M
 
M
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
M
A
 
A
S
|
S
Q
|
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
|
E
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
I
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
S
 
S
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
I
 
I
K
 
K
H
 
H
R
 
R
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
H
|
H
W
|
W
D
 
D
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
F
|
F
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
E
 
E
N
 
N
R
 
R
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
K
 
K
K
 
K
R
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
V
P
 
P
F
 
F
G
 
G
R
 
R
M
 
M
G
 
G
T
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
D
L
 
L
T
 
T
G
 
G
M
 
M
A
 
A
I
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
A
E
 
E
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
S
 
S
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
M
 
M
S
 
S

3wyeA Crystal structure of chimeric engineered (2s,3s)-butanediol dehydrogenase complexed with NAD+
39% identity, 96% coverage: 7:253/257 of query aligns to 2:251/255 of 3wyeA

query
sites
3wyeA
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
 
G
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
F
 
I
A
 
A
E
 
L
A
 
R
Y
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
F
T
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
Y
D
 
N
I
 
D
E
 
A
R
 
T
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
S
E
 
E
I
 
I
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
G
 
G
P
 
G
A
 
H
A
 
A
Y
 
V
A
 
A
V
 
V
Q
 
K
M
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
D
Q
 
R
D
 
D
S
 
Q
I
 
V
D
 
F
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
Q
T
 
A
V
 
R
E
 
K
H
 
T
A
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
I
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
L
 
I
F
 
A
D
 
Q
L
 
I
A
 
K
P
 
P
I
 
L
V
 
L
E
 
E
I
 
V
T
 
T
R
 
E
E
 
E
S
 
D
Y
 
L
E
 
K
K
 
Q
L
 
I
F
 
Y
A
 
S
I
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
F
G
 
S
T
 
V
L
 
F
F
 
F
T
 
G
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
V
R
 
E
Q
 
A
M
 
F
I
 
K
A
 
K
Q
 
E
G
 
G
R
 
H
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
A
S
|
S
Q
 
I
A
 
A
G
 
A
R
 
I
R
 
Q
G
 
G
E
 
F
A
 
P
L
 
I
V
 
L
A
 
S
I
 
A
Y
|
Y
C
 
S
A
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
G
 
A
L
 
R
D
 
D
L
 
L
I
 
A
K
 
P
H
 
L
R
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
I
 
Y
A
 
C
P
|
P
G
|
G
V
 
I
V
|
V
D
 
G
G
x
T
E
 
G
H
x
M
W
|
W
D
 
E
G
 
Q
V
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
E
F
x
L
A
 
S
R
 
K
Y
 
I
E
 
N
N
 
G
R
 
K
P
 
P
R
 
I
G
 
G
E
 
E
K
 
N
K
 
F
R
 
K
L
 
E
V
 
Y
G
 
S
E
 
S
A
 
S
V
 
I
P
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
P
G
 
S
T
 
V
A
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
G
M
 
L
A
 
V
I
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
P
E
 
D
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
M
V
 
T
S
 
G
Q
 
Q
T
 
S
Y
 
L
N
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q48436 Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; Acetoin(diacetyl) reductase; AR; Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; EC 1.1.1.304 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
39% identity, 96% coverage: 7:253/257 of query aligns to 3:252/256 of Q48436

query
sites
Q48436
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
|
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
S
x
A
A
x
G
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
|
G
R
x
K
A
|
A
F
x
I
A
|
A
E
x
L
A
x
R
Y
x
L
V
|
V
R
x
K
E
x
D
G
|
G
A
x
F
T
x
A
V
|
V
A
|
A
I
|
I
A
|
A
D
|
D
I
 
Y
D
 
N
I
 
D
E
 
A
R
 
T
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
S
E
 
E
I
 
I
G
 
N
P
 
Q
A
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
R
A
 
A
Y
 
M
A
 
A
V
 
V
Q
 
K
M
 
V
D
|
D
V
 
V
T
 
S
R
 
D
Q
 
R
D
 
D
S
 
Q
I
 
V
D
 
F
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
Q
T
 
A
V
 
R
E
 
K
H
 
T
A
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
I
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
A
 
G
L
 
V
F
 
A
D
 
P
L
 
S
A
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
E
E
 
S
I
 
I
T
 
T
R
 
P
E
 
E
S
 
I
Y
 
V
E
 
D
K
 
K
L
 
V
F
 
Y
A
 
N
I
 
I
N
 
N
V
 
V
A
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
I
F
 
W
T
 
G
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
V
R
 
E
Q
 
A
M
 
F
I
 
K
A
 
K
Q
 
E
G
 
G
R
 
H
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
C
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
H
R
 
V
G
 
G
E
 
N
A
 
P
L
 
E
V
 
L
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
C
 
S
A
 
S
T
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
G
 
A
L
 
R
D
 
D
L
 
L
I
 
A
K
 
P
H
 
L
R
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
I
 
Y
A
 
C
P
 
P
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
K
G
 
T
E
 
P
H
 
M
W
 
W
D
 
A
G
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
R
L
 
Q
F
 
V
A
 
S
R
 
E
Y
 
A
E
 
A
N
 
G
R
 
K
P
 
P
R
 
L
G
 
G
E
 
Y
K
 
G
K
 
T
R
 
A
L
 
E
V
 
F
G
 
A
E
 
K
A
 
R
V
 
I
P
 
T
F
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
S
T
 
E
A
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
A
M
 
C
A
 
V
I
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
P
E
 
D
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
M
V
 
T
S
 
G
Q
 
Q
T
 
S
Y
 
L
N
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1gegE Cryatal structure analysis of meso-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
39% identity, 96% coverage: 7:253/257 of query aligns to 3:252/256 of 1gegE

query
sites
1gegE
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
 
G
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
F
 
I
A
 
A
E
 
L
A
 
R
Y
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
F
T
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
Y
D
 
N
I
 
D
E
 
A
R
 
T
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
S
E
 
E
I
 
I
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
G
 
G
P
 
G
A
 
H
A
 
A
Y
 
V
A
 
A
V
 
V
Q
 
K
M
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
D
Q
x
R
D
|
D
S
 
Q
I
 
V
D
x
F
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
Q
T
 
A
V
 
R
E
 
K
H
 
T
A
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
I
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
L
 
V
F
 
A
D
 
P
L
 
S
A
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
E
E
 
S
I
 
I
T
 
T
R
 
P
E
 
E
S
 
I
Y
 
V
E
 
D
K
 
K
L
 
V
F
 
Y
A
 
N
I
|
I
N
 
N
V
 
V
A
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
I
F
 
W
T
 
G
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
V
R
x
E
Q
 
A
M
 
F
I
 
K
A
 
K
Q
 
E
G
 
G
R
 
H
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
C
S
|
S
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
H
R
 
V
G
 
G
E
 
N
A
 
P
L
 
E
V
 
L
A
 
A
I
 
V
Y
|
Y
C
 
S
A
 
S
T
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
G
 
A
L
 
R
D
 
D
L
 
L
I
 
A
K
 
P
H
 
L
R
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
I
 
Y
A
 
C
P
|
P
G
 
G
V
 
I
V
|
V
D
 
K
G
x
T
E
 
P
H
x
M
W
 
W
D
 
A
G
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
R
L
 
Q
F
x
V
A
 
S
R
 
E
Y
 
A
E
 
A
N
 
G
R
 
K
P
 
P
R
 
L
G
 
G
E
 
Y
K
 
G
K
 
T
R
 
A
L
 
E
V
 
F
G
 
A
E
 
K
A
 
R
V
 
I
P
 
T
F
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
S
T
 
E
A
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
A
M
 
C
A
 
V
I
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
P
E
 
D
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
M
V
 
T
S
 
G
Q
 
Q
T
 
S
Y
 
L
N
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3a28C Crystal structure of l-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
38% identity, 96% coverage: 7:253/257 of query aligns to 2:253/257 of 3a28C

query
sites
3a28C
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
 
M
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
G
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
G
F
 
I
A
 
S
E
 
E
A
 
K
Y
 
L
V
 
A
R
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
F
T
 
D
V
 
I
A
 
A
I
 
V
A
 
A
D
|
D
I
x
L
D
 
P
I
 
-
E
 
Q
R
x
Q
A
 
E
R
 
E
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
E
E
 
T
I
 
I
-
 
K
-
 
L
-
 
I
-
 
E
-
 
A
-
 
A
G
 
D
P
 
Q
A
 
K
A
 
A
Y
 
V
A
 
F
V
 
V
Q
 
G
M
x
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
R
 
D
Q
 
K
D
 
A
S
 
N
I
 
F
D
 
D
A
 
S
A
 
A
I
 
I
A
 
D
A
 
E
T
 
A
V
 
A
E
 
E
H
 
K
A
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
L
 
I
F
 
A
D
 
Q
L
 
I
A
 
K
P
 
P
I
 
L
V
 
L
E
 
E
I
 
V
T
 
T
R
 
E
E
 
E
S
 
D
Y
 
L
E
 
K
K
 
Q
L
 
I
F
 
Y
A
 
S
I
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
F
G
 
S
T
 
V
L
 
F
F
 
F
T
 
G
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
S
R
 
R
Q
 
K
M
 
F
I
 
D
A
 
E
Q
 
L
G
 
G
R
 
V
G
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
A
S
|
S
Q
 
I
A
 
A
G
 
A
R
 
I
R
 
Q
G
 
G
E
 
F
A
 
P
L
 
I
V
 
L
A
 
S
I
 
A
Y
|
Y
C
 
S
A
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
Q
D
 
E
L
 
L
I
 
A
K
 
P
H
 
K
R
 
G
I
 
H
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
Y
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
I
V
|
V
D
 
G
G
x
T
E
 
G
H
x
M
W
|
W
D
 
E
G
 
Q
V
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
E
F
x
L
A
 
S
R
 
K
Y
 
I
E
 
N
N
 
G
R
 
K
P
 
P
R
 
I
G
 
G
E
 
E
K
 
N
K
 
F
R
 
K
L
 
E
V
 
Y
G
 
S
E
 
S
A
 
S
V
 
I
P
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
P
G
 
S
T
 
V
A
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
G
M
 
L
A
 
V
I
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
E
E
 
N
S
 
S
D
 
N
Y
 
Y
I
 
V
V
 
T
S
 
G
Q
 
Q
T
 
V
Y
 
M
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q9ZNN8 L-2,3-butanediol dehydrogenase; L-BDH; (S,S)-butanediol dehydrogenase; Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; EC 1.1.1.76; EC 1.1.1.304 from Corynebacterium glutamicum (Brevibacterium saccharolyticum) (see paper)
38% identity, 96% coverage: 7:253/257 of query aligns to 3:254/258 of Q9ZNN8

query
sites
Q9ZNN8
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
 
M
I
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
G
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
G
F
 
I
A
 
S
E
 
E
A
 
K
Y
 
L
V
 
A
R
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
F
T
 
D
V
 
I
A
 
A
I
 
V
A
 
A
D
|
D
I
 
L
D
 
P
I
 
-
E
 
Q
R
x
Q
A
 
E
R
 
E
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
E
E
 
T
I
 
I
-
 
K
-
 
L
-
 
I
-
 
E
-
 
A
-
 
A
G
 
D
P
 
Q
A
 
K
A
 
A
Y
 
V
A
 
F
V
 
V
Q
 
G
M
 
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
R
 
D
Q
 
K
D
 
A
S
 
N
I
 
F
D
 
D
A
 
S
A
 
A
I
 
I
A
 
D
A
 
E
T
 
A
V
 
A
E
 
E
H
 
K
A
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
L
 
I
F
 
A
D
 
Q
L
 
I
A
 
K
P
 
P
I
 
L
V
 
L
E
 
E
I
 
V
T
 
T
R
 
E
E
 
E
S
 
D
Y
 
L
E
 
K
K
 
Q
L
 
I
F
 
Y
A
 
S
I
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
F
G
 
S
T
 
V
L
 
F
F
 
F
T
 
G
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
S
R
 
R
Q
 
K
M
 
F
I
 
D
A
 
E
Q
 
L
G
 
G
R
 
V
G
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
A
S
 
S
Q
x
I
A
 
A
G
 
A
R
 
I
R
 
Q
G
 
G
E
x
F
A
 
P
L
 
I
V
 
L
A
 
S
I
 
A
Y
|
Y
C
 
S
A
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
Q
D
 
E
L
 
L
I
 
A
K
 
P
H
 
K
R
 
G
I
 
H
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
Y
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
x
I
V
|
V
D
x
G
G
x
T
E
 
G
H
 
M
W
 
W
D
 
E
G
 
Q
V
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
K
Y
 
I
E
 
N
N
 
G
R
 
K
P
 
P
R
 
I
G
 
G
E
 
E
K
 
N
K
 
F
R
 
K
L
 
E
V
 
Y
G
 
S
E
 
S
A
 
S
V
 
I
P
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
P
G
 
S
T
 
V
A
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
G
M
 
L
A
 
V
I
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
E
E
 
N
S
 
S
D
 
N
Y
 
Y
I
 
V
V
 
T
S
 
G
Q
 
Q
T
 
V
Y
 
M
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
36% identity, 100% coverage: 1:256/257 of query aligns to 2:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
M
 
M
K
 
S
R
 
R
L
 
L
E
 
Q
G
 
D
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
 
A
R
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
F
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
V
Y
 
F
V
 
M
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
F
D
 
N
I
 
-
E
 
E
R
 
A
A
 
A
R
 
G
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
E
I
 
A
G
 
N
P
 
P
A
 
G
A
 
V
Y
 
V
A
 
F
V
 
I
Q
 
R
M
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
D
Q
 
R
D
 
E
S
 
S
I
 
V
D
 
H
A
 
R
A
 
L
I
 
V
A
 
E
A
 
N
T
 
V
V
 
A
E
 
E
H
 
R
A
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
L
x
I
F
 
T
D
 
R
L
x
D
A
 
S
P
 
M
I
 
L
V
 
S
E
x
K
I
 
M
T
 
T
R
 
V
E
 
D
S
 
Q
Y
 
F
E
 
Q
K
 
Q
L
 
V
F
 
I
A
 
N
I
 
V
N
|
N
V
 
L
A
 
T
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
H
T
 
C
L
 
T
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
A
 
L
R
 
P
Q
 
Y
M
 
M
I
 
A
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
R
 
K
G
 
-
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
T
A
 
S
S
|
S
Q
 
V
A
 
T
G
 
G
R
 
T
R
 
Y
G
 
G
E
x
N
A
x
V
L
 
G
V
x
Q
A
 
T
I
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
L
 
M
T
 
T
Q
 
K
S
 
T
A
 
W
G
 
A
L
 
K
D
 
E
L
 
L
I
 
A
K
 
R
H
 
K
R
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
x
F
V
x
T
D
 
E
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
D
x
T
A
 
A
L
x
M
F
 
V
A
 
A
R
 
E
Y
 
V
E
 
-
N
 
-
R
 
-
P
 
P
R
 
E
G
 
K
E
 
V
K
 
I
K
 
E
R
x
K
L
 
M
V
 
K
G
 
A
E
 
Q
A
 
-
V
 
V
P
 
P
F
 
M
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
K
A
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
I
T
 
A
G
 
N
M
 
A
A
 
Y
I
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
H
E
 
E
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
V
V
 
N
S
 
G
Q
 
H
T
 
V
Y
 
L
N
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
I
W
 
M
M
 
M

3ak4A Crystal structure of nadh-dependent quinuclidinone reductase from agrobacterium tumefaciens
36% identity, 97% coverage: 4:253/257 of query aligns to 5:254/258 of 3ak4A

query
sites
3ak4A
L
 
L
E
 
S
G
 
G
K
 
R
S
 
K
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
G
A
 
S
R
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
A
A
 
A
F
 
I
A
 
A
E
 
R
A
 
A
Y
 
L
V
 
D
R
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
L
D
 
D
I
 
V
E
 
M
R
 
A
A
 
A
R
 
Q
Q
 
A
A
 
V
A
 
V
A
 
A
E
 
G
I
 
L
G
 
E
P
 
N
A
 
G
A
 
G
Y
 
F
A
 
A
V
 
V
Q
 
E
M
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
T
R
 
K
Q
 
R
D
 
A
S
 
S
I
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
I
 
M
A
 
Q
A
 
K
T
 
A
V
 
I
E
 
D
H
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
L
L
 
L
V
 
C
N
 
A
N
|
N
A
|
A
A
x
G
L
 
V
F
 
S
D
 
T
L
 
M
A
 
R
P
 
P
I
 
A
V
 
V
E
 
D
I
 
I
T
 
T
R
 
D
E
 
E
S
 
E
Y
 
W
E
 
D
K
 
F
L
 
N
F
 
F
A
 
D
I
 
V
N
 
N
V
 
A
A
 
R
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
L
T
 
A
L
 
N
Q
 
Q
A
 
I
A
 
A
A
 
C
R
 
R
Q
 
H
M
 
F
I
 
L
A
 
A
Q
 
S
G
 
N
R
 
T
G
 
K
G
 
G
K
 
V
I
 
I
I
 
V
N
 
N
M
x
T
A
 
A
S
|
S
Q
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
K
R
 
V
G
 
G
E
 
A
A
 
P
L
 
L
V
x
L
A
 
A
I
 
H
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
F
S
 
G
L
 
W
T
 
T
Q
 
Q
S
 
A
A
 
L
G
 
A
L
 
R
D
 
E
L
 
M
I
 
A
K
 
P
H
 
K
R
 
N
I
 
I
N
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
C
P
 
P
G
|
G
V
 
F
V
|
V
D
 
K
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
D
x
T
A
 
A
L
x
M
F
 
Q
A
 
E
R
 
R
-
 
E
-
 
I
-
 
I
Y
 
W
E
|
E
N
 
A
R
 
E
P
 
L
R
 
R
G
 
G
E
 
M
K
 
T
K
 
P
R
 
E
L
 
A
V
 
V
-
 
R
G
 
A
E
 
E
A
 
Y
V
 
V
-
 
S
-
 
L
-
 
T
P
 
P
F
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
I
G
 
E
T
 
E
A
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
D
M
 
V
A
 
V
I
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
E
 
A
S
 
A
D
 
R
Y
 
F
I
 
M
V
 
T
S
 
G
Q
 
Q
T
 
G
Y
 
I
N
 
N
V
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G

7do7A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NAD and l-rhamnose bound-form) (see paper)
37% identity, 98% coverage: 7:257/257 of query aligns to 6:254/256 of 7do7A

query
sites
7do7A
K
 
K
S
 
T
A
 
V
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
 
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
F
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
E
Y
 
C
V
 
A
R
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
R
V
 
V
A
 
V
I
 
I
A
 
G
D
 
H
I
x
S
D
 
G
I
 
S
E
 
D
R
 
E
A
 
G
R
 
R
Q
 
A
A
 
G
A
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
A
 
A
E
 
A
I
 
F
G
 
G
P
 
G
A
 
T
A
 
A
Y
 
I
A
 
A
V
 
V
Q
 
G
M
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
A
R
 
D
Q
 
L
D
 
D
S
 
S
I
 
G
D
 
E
A
 
K
A
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
A
V
 
V
E
 
E
H
 
A
A
 
F
G
 
G
G
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
L
x
I
F
 
C
D
 
P
L
x
F
A
 
H
P
 
S
I
 
F
V
 
L
E
 
D
I
 
M
T
 
P
R
 
R
E
 
E
S
 
L
Y
 
Y
E
 
L
K
 
K
L
 
T
F
 
V
A
 
G
I
 
T
N
 
N
V
 
L
A
 
N
G
 
G
T
 
A
L
 
Y
F
 
F
T
 
T
L
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
M
 
M
I
 
K
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
M
x
V
A
x
S
S
|
S
Q
 
I
A
x
S
G
 
A
R
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
G
A
 
A
L
 
M
V
x
Q
A
 
T
I
 
H
Y
|
Y
C
 
T
A
 
P
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
I
 
L
S
 
S
L
 
L
T
 
M
Q
 
Q
S
 
S
A
 
C
G
 
A
L
 
I
D
 
A
L
 
L
I
 
G
K
 
P
H
 
Y
R
 
G
I
 
I
N
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
V
 
T
V
x
I
D
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
A
L
x
T
F
 
D
A
x
I
R
x
N
Y
 
K
E
 
E
N
 
D
R
 
L
P
 
S
R
 
D
G
 
L
E
 
E
K
 
K
K
 
R
R
 
E
L
 
R
V
 
M
G
 
T
E
 
S
A
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
E
A
 
P
E
 
D
D
 
D
L
 
L
T
 
A
G
 
G
M
 
P
A
 
I
I
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
x
D
E
x
M
S
 
A
D
x
R
Y
 
Y
I
 
V
V
 
T
S
 
G
Q
 
A
T
 
S
Y
 
L
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
L
W
 
F
M
 
V
S
 
N

7b81A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1-dehydrogenase (NAD bound-form) (see paper)
37% identity, 98% coverage: 7:257/257 of query aligns to 6:254/256 of 7b81A

query
sites
7b81A
K
 
K
S
 
T
A
 
V
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
F
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
E
Y
 
C
V
 
A
R
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
R
V
 
V
A
 
V
I
 
I
A
 
G
D
 
H
I
 
S
D
 
G
I
 
S
E
 
D
R
 
E
A
 
G
R
 
R
Q
 
A
A
 
G
A
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
A
 
A
E
 
A
I
 
F
G
 
G
P
 
G
A
 
T
A
 
A
Y
 
I
A
 
A
V
 
V
Q
 
G
M
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
A
R
 
D
Q
 
L
D
 
D
S
 
S
I
 
G
D
 
E
A
 
K
A
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
A
V
 
V
E
 
E
H
 
A
A
 
F
G
 
G
G
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
L
x
I
F
 
C
D
 
P
L
 
F
A
 
H
P
 
S
I
 
F
V
 
L
E
 
D
I
 
M
T
 
P
R
 
R
E
 
E
S
 
L
Y
 
Y
E
 
L
K
 
K
L
 
T
F
 
V
A
 
G
I
x
T
N
 
N
V
 
L
A
 
N
G
 
G
T
 
A
L
 
Y
F
 
F
T
 
T
L
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
M
 
M
I
 
K
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
M
x
V
A
 
S
S
|
S
Q
 
I
A
 
S
G
 
A
R
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
G
A
 
A
L
 
M
V
 
Q
A
 
T
I
 
H
Y
|
Y
C
 
T
A
 
P
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
I
 
L
S
 
S
L
 
L
T
 
M
Q
 
Q
S
 
S
A
 
C
G
 
A
L
 
I
D
 
A
L
 
L
I
 
G
K
 
P
H
 
Y
R
 
G
I
 
I
N
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
V
 
T
V
x
I
D
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
A
L
x
T
F
 
D
A
x
I
R
 
N
Y
 
K
E
 
E
N
 
D
R
 
L
P
 
S
R
 
D
G
 
L
E
 
E
K
 
K
K
 
R
R
 
E
L
 
R
V
 
M
G
 
T
E
 
S
A
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
E
A
 
P
E
 
D
D
 
D
L
 
L
T
 
A
G
 
G
M
 
P
A
 
I
I
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
E
 
M
S
 
A
D
 
R
Y
 
Y
I
 
V
V
 
T
S
 
G
Q
 
A
T
 
S
Y
 
L
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
L
W
 
F
M
 
V
S
 
N

7do6A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NADP bound-form) (see paper)
37% identity, 98% coverage: 7:257/257 of query aligns to 6:245/247 of 7do6A

query
sites
7do6A
K
 
K
S
 
T
A
 
V
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
F
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
E
Y
 
C
V
 
A
R
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
R
V
 
V
A
 
V
I
 
I
A
 
G
D
x
H
I
x
S
D
 
G
I
 
S
E
 
D
R
 
E
A
x
G
R
 
R
Q
 
A
A
 
G
A
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
A
 
A
E
 
A
I
 
F
G
 
G
P
 
G
A
 
T
A
 
A
Y
 
I
A
 
A
V
 
V
Q
 
G
M
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
A
R
 
D
Q
 
L
D
 
D
S
 
S
I
 
G
D
 
E
A
 
K
A
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
A
V
 
V
E
 
E
H
 
A
A
 
F
G
 
G
G
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
L
x
I
F
 
C
D
 
P
L
 
F
A
 
H
P
 
S
I
 
F
V
 
L
E
 
D
I
 
M
T
 
P
R
 
R
E
 
E
S
 
L
Y
 
Y
E
 
L
K
 
K
L
 
T
F
 
V
A
 
G
I
x
T
N
 
N
V
 
L
A
 
N
G
 
G
T
 
A
L
 
Y
F
 
F
T
 
T
L
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
M
 
M
I
 
K
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
M
 
V
A
 
S
S
|
S
Q
 
I
A
 
S
G
 
A
R
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
G
A
 
A
L
 
M
V
 
Q
A
 
T
I
 
H
Y
|
Y
C
 
T
A
 
P
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
I
 
L
S
 
S
L
 
L
T
 
M
Q
 
Q
S
 
S
A
 
C
G
 
A
L
 
I
D
 
A
L
 
L
I
 
G
K
 
P
H
 
Y
R
 
G
I
 
I
N
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
T
V
x
I
D
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
A
R
 
D
Y
 
L
E
 
E
N
 
K
R
 
R
P
 
E
R
 
R
G
 
M
E
 
T
K
 
S
K
 
R
R
 
-
L
 
-
V
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
V
P
 
P
F
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
E
A
 
P
E
 
D
D
 
D
L
 
L
T
 
A
G
 
G
M
 
P
A
 
I
I
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
E
 
M
S
 
A
D
 
R
Y
 
Y
I
 
V
V
 
T
S
 
G
Q
 
A
T
 
S
Y
 
L
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
L
W
 
F
M
 
V
S
 
N

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
36% identity, 98% coverage: 4:256/257 of query aligns to 3:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
G
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
D
F
 
I
A
 
A
E
 
I
A
 
N
Y
 
L
V
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
N
V
 
I
A
 
F
I
 
F
-
x
N
-
x
Y
-
x
N
-
x
G
A
x
S
D
 
P
I
 
E
D
 
A
I
 
A
E
 
E
R
 
E
A
 
T
R
 
A
Q
 
K
A
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
I
 
H
G
 
G
P
 
V
A
 
E
A
 
V
Y
 
E
A
 
A
V
 
M
Q
 
K
M
 
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
R
 
I
Q
 
A
D
 
E
S
 
D
I
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
F
I
 
F
A
 
K
A
 
Q
T
 
A
V
 
I
E
 
E
H
 
R
A
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
L
x
I
F
 
T
D
 
R
L
 
D
A
 
N
P
 
L
I
 
L
V
 
M
E
 
R
I
 
M
T
 
K
R
 
E
E
 
D
S
 
E
Y
 
W
E
 
D
K
 
D
L
 
V
F
 
I
A
 
N
I
|
I
N
 
N
V
 
L
A
 
K
G
 
G
T
 
T
L
 
F
F
 
L
T
 
C
L
 
T
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
A
 
S
R
 
R
Q
 
T
M
 
M
I
 
M
A
 
K
Q
 
Q
G
 
-
R
 
R
G
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
M
A
 
A
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
L
R
 
I
G
 
G
E
 
N
A
 
A
L
 
G
V
x
Q
A
 
A
I
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
K
S
 
T
A
 
T
G
 
A
L
 
R
D
 
E
L
 
L
I
 
A
K
 
P
H
 
R
R
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
F
V
x
I
D
 
T
G
x
T
E
 
D
H
 
M
W
 
T
D
 
D
G
 
K
V
 
L
D
 
D
A
 
E
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
G
 
-
E
 
K
K
 
T
K
 
K
R
 
E
L
 
A
V
 
M
G
 
L
E
 
A
A
 
Q
V
 
I
P
 
P
F
 
L
G
 
G
R
 
A
M
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
I
T
 
A
G
 
N
M
 
A
A
 
V
I
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
E
 
A
S
 
S
D
 
K
Y
 
Y
I
 
I
V
 
T
S
 
G
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
L
N
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
M
W
 
V
M
 
M

7krmC Putative fabg bound to nadh from acinetobacter baumannii
33% identity, 97% coverage: 4:253/257 of query aligns to 3:240/244 of 7krmC

query
sites
7krmC
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
 
A
-
x
S
-
 
E
R
 
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
F
 
T
A
 
A
E
 
E
A
 
I
Y
 
F
V
 
A
R
 
Q
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
I
I
 
I
A
 
V
D
|
D
I
x
L
D
 
D
I
 
L
E
 
A
R
 
Q
A
 
S
R
 
Q
Q
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
K
E
 
A
I
 
L
G
 
G
P
 
E
A
 
G
A
 
H
Y
 
M
A
 
G
V
 
L
Q
 
A
M
x
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
R
 
N
Q
 
E
D
 
E
S
 
Q
I
 
V
D
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
E
 
Q
H
 
H
A
 
Y
G
 
G
G
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
L
 
I
F
 
T
D
 
Q
L
 
P
A
 
I
P
 
K
I
 
T
V
 
L
E
 
D
I
 
I
T
 
Q
R
 
R
E
 
S
S
 
D
Y
 
Y
E
 
D
K
 
R
L
 
V
F
 
L
A
 
D
I
x
V
N
 
S
V
 
L
A
 
R
G
 
G
T
 
T
L
 
L
F
 
I
T
 
M
L
 
S
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
A
 
I
R
 
P
Q
 
S
M
 
M
I
 
K
A
 
A
Q
 
N
G
 
G
R
 
-
G
 
G
G
 
G
K
 
S
I
 
I
I
 
V
N
 
C
M
 
L
A
 
S
S
|
S
Q
 
V
A
 
S
G
 
A
R
 
Q
R
 
R
G
 
G
E
 
G
A
 
G
L
 
I
V
 
F
A
 
G
-
 
G
-
 
P
I
 
H
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
L
S
 
G
L
 
L
T
 
A
Q
 
K
S
 
A
A
 
M
G
 
A
L
 
R
D
 
E
L
 
F
I
 
G
K
 
G
H
 
D
R
 
Q
I
 
I
N
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
L
A
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
L
V
x
I
D
 
Q
G
x
T
E
 
D
H
 
M
W
 
N
D
 
D
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
G
 
-
E
 
D
K
 
R
K
 
R
R
 
H
L
 
D
V
 
I
G
 
L
E
 
A
A
 
G
V
 
I
P
 
P
F
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
K
A
 
A
E
 
Q
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
N
M
 
A
A
 
A
I
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
E
 
L
S
 
S
D
 
A
Y
 
Y
I
 
L
V
 
T
S
 
G
Q
 
V
T
 
T
Y
 
L
N
 
D
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

8cxaA Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from mycobacterium smegmatis with bound NAD
36% identity, 98% coverage: 3:253/257 of query aligns to 2:247/251 of 8cxaA

query
sites
8cxaA
R
 
R
L
 
L
E
 
A
G
 
N
K
 
R
S
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
I
F
 
Y
A
 
A
E
 
E
A
 
R
Y
 
F
V
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
A
V
 
V
A
 
V
I
 
V
A
 
A
D
|
D
I
 
I
D
 
N
I
 
E
E
 
P
R
 
K
A
 
A
R
 
T
Q
 
E
A
 
V
A
 
A
A
 
S
E
 
S
I
 
I
-
 
T
-
 
S
-
 
L
G
 
G
P
 
G
A
 
R
A
 
A
Y
 
I
A
 
A
V
 
A
Q
 
A
M
 
V
D
 
D
V
|
V
T
 
S
R
 
D
Q
 
V
D
 
E
S
 
S
I
 
V
D
 
N
A
 
R
A
 
M
I
 
V
A
 
D
A
 
S
T
 
A
V
 
V
E
 
E
H
 
A
A
 
F
G
 
G
G
 
T
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
|
A
L
 
I
F
 
F
D
x
S
-
 
T
-
 
L
-
 
K
L
 
M
A
 
K
P
 
P
I
 
F
V
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
S
R
 
G
E
 
D
S
 
E
Y
 
W
E
 
D
K
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
A
A
 
K
G
 
G
T
 
T
L
 
F
F
 
L
T
 
C
L
 
C
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
A
 
S
R
 
P
Q
 
V
M
 
M
I
 
-
A
 
R
Q
 
K
G
 
N
R
 
Q
G
 
Y
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
I
A
x
S
S
|
S
Q
 
S
A
 
V
G
 
V
R
 
V
R
 
T
G
 
G
E
 
R
A
 
P
L
 
N
V
 
Y
A
 
A
I
 
H
Y
|
Y
C
 
I
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
W
S
 
A
L
 
L
T
 
T
Q
 
H
S
 
A
A
 
L
G
 
A
L
 
T
D
 
E
L
 
M
I
 
G
K
 
T
H
 
D
R
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
S
P
|
P
G
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
x
H
G
 
G
V
x
I
D
 
I
A
 
T
L
 
E
F
x
I
A
 
P
R
 
R
Y
 
E
E
 
T
N
 
I
R
 
S
P
 
E
R
 
E
G
 
G
E
 
W
K
 
R
K
 
R
R
 
N
L
 
L
V
 
E
G
 
E
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
P
 
K
F
 
-
G
 
-
R
 
R
M
 
K
G
 
G
T
 
D
A
 
A
E
 
S
D
 
D
L
 
L
T
 
V
G
 
G
M
 
I
A
 
L
I
 
L
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
E
 
E
S
 
S
D
 
K
Y
 
F
I
 
M
V
 
T
S
 
G
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
V
N
 
A
V
 
L
D
 
D
G
 
A
G
 
G

3pk0B Crystal structure of short-chain dehydrogenase/reductase sdr from mycobacterium smegmatis (see paper)
34% identity, 100% coverage: 1:256/257 of query aligns to 5:253/262 of 3pk0B

query
sites
3pk0B
M
 
M
K
 
F
R
 
D
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
R
S
 
S
A
 
V
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
G
A
 
T
R
 
K
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
G
F
 
I
A
 
A
E
 
T
A
 
V
Y
 
F
V
 
A
R
 
R
E
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
N
V
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
S
D
 
T
I
 
A
D
 
D
I
 
I
E
 
D
R
 
A
A
 
C
R
 
V
Q
 
A
A
 
D
A
 
L
A
x
D
E
 
Q
I
 
L
G
|
G
P
 
S
A
x
G
-
 
K
A
 
V
Y
 
I
A
 
G
V
 
V
Q
 
Q
M
 
T
D
 
D
V
 
V
T
 
S
R
 
D
Q
 
R
D
 
A
S
 
Q
I
 
C
D
 
D
A
 
A
A
 
L
I
 
A
A
 
G
A
 
R
T
 
A
V
 
V
E
 
E
H
 
E
A
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
V
V
 
C
N
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
G
L
 
V
F
 
F
D
 
P
L
 
D
A
 
A
P
 
P
I
 
L
V
 
A
E
 
T
I
 
M
T
 
T
R
 
P
E
 
E
S
 
Q
Y
 
L
E
 
N
K
 
G
L
 
I
F
 
F
A
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
N
G
 
G
T
 
T
L
 
F
F
 
Y
T
 
A
L
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
A
 
L
R
 
D
Q
 
A
M
 
L
I
 
I
A
 
A
Q
 
S
G
 
G
R
 
S
G
 
G
G
 
R
K
 
V
I
 
V
I
 
L
N
 
T
M
 
S
A
x
S
S
 
I
Q
 
T
A
 
G
G
 
P
R
 
I
R
 
T
G
 
G
E
 
Y
A
 
P
L
 
G
V
x
W
A
 
S
I
 
H
Y
|
Y
C
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
V
 
Q
I
 
L
S
 
G
L
 
F
T
 
M
Q
 
R
S
 
T
A
 
A
G
 
A
L
 
I
D
 
E
L
 
L
I
 
A
K
 
P
H
 
H
R
 
K
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
N
V
 
I
D
 
M
G
 
T
E
 
E
H
 
-
W
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
G
L
 
L
F
 
L
A
 
E
R
 
N
Y
 
G
E
 
E
N
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
G
 
-
E
 
E
K
 
Y
K
 
I
R
 
A
L
 
S
V
 
M
G
 
A
E
 
R
A
 
S
V
 
I
P
 
P
F
 
A
G
 
G
R
 
A
M
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
I
T
 
G
G
 
H
M
 
L
A
 
A
I
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
T
A
 
K
E
 
E
S
 
A
D
 
G
Y
 
Y
I
 
I
V
 
T
S
 
G
Q
 
Q
T
 
A
Y
 
I
N
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
Q
W
 
V
M
 
L

3rwbA Crystal structure of complex of 4pal (4-pyridoxolactone) and pldh (tetrameric pyridoxal 4-dehydrogenase) from mesorhizobium loti
36% identity, 98% coverage: 2:253/257 of query aligns to 2:243/247 of 3rwbA

query
sites
3rwbA
K
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
F
 
I
A
 
A
E
 
A
A
 
R
Y
 
L
V
 
A
R
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
I
I
 
V
A
 
S
D
|
D
I
|
I
D
 
N
I
 
A
E
 
E
R
 
G
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
S
I
 
I
G
 
G
P
 
K
A
 
K
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
V
 
I
Q
 
A
M
 
A
D
|
D
V
x
I
T
 
S
R
 
D
Q
 
P
D
 
G
S
 
S
I
 
V
D
 
K
A
 
A
A
 
L
I
 
F
A
 
A
A
 
E
T
 
I
V
 
Q
E
 
A
H
 
L
A
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
S
L
 
I
F
 
V
D
 
P
L
 
F
A
 
V
P
 
A
I
 
W
V
 
D
E
 
D
I
 
V
T
 
D
R
 
L
E
 
D
S
 
H
Y
 
W
E
 
R
K
 
K
L
 
I
F
 
I
A
 
D
I
 
V
N
 
N
V
 
L
A
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
F
F
 
I
T
 
V
L
 
T
Q
 
R
A
 
A
A
 
G
A
 
T
R
 
D
Q
 
Q
M
 
M
I
 
R
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
R
 
K
G
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
V
I
 
I
N
 
S
M
x
I
A
 
A
S
|
S
Q
x
N
A
x
T
G
 
F
R
 
F
R
 
A
G
 
G
E
 
T
A
 
P
L
 
N
V
x
M
A
 
A
I
 
A
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
L
 
F
T
 
T
Q
 
R
S
 
A
A
 
L
G
 
A
L
 
T
D
 
E
L
 
L
I
 
G
K
 
K
H
 
Y
R
 
N
I
 
I
N
 
T
V
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
T
P
|
P
G
 
G
V
x
L
V
x
I
D
 
E
G
x
S
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
D
G
|
G
V
|
V
D
 
K
A
 
A
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
S
P
 
P
R
x
H
G
 
N
E
 
E
K
 
A
K
 
F
R
 
G
L
 
F
V
 
V
G
 
E
E
 
M
A
 
L
V
 
Q
P
 
A
F
 
M
G
 
K
R
 
G
M
 
K
G
 
G
T
 
Q
A
 
P
E
 
E
D
 
H
L
 
I
T
 
A
G
 
D
M
 
V
A
 
V
I
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
E
 
D
S
 
A
D
 
R
Y
 
W
I
 
I
V
 
T
S
 
G
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
L
N
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
A
G
 
G

3ndrA Crystal structure of tetrameric pyridoxal 4-dehydrogenase from mesorhizobium loti
36% identity, 98% coverage: 2:253/257 of query aligns to 2:243/247 of 3ndrA

query
sites
3ndrA
K
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
F
 
I
A
 
A
E
 
A
A
 
R
Y
 
L
V
 
A
R
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
I
I
 
V
A
 
S
D
|
D
I
|
I
D
 
N
I
 
A
E
 
E
R
 
G
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
S
I
 
I
G
 
G
P
 
K
A
 
K
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
V
 
I
Q
 
A
M
 
A
D
|
D
V
x
I
T
 
S
R
 
D
Q
 
P
D
 
G
S
 
S
I
 
V
D
 
K
A
 
A
A
 
L
I
 
F
A
 
A
A
 
E
T
 
I
V
 
Q
E
 
A
H
 
L
A
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
S
L
 
I
F
 
V
D
 
P
L
 
F
A
 
V
P
 
A
I
 
W
V
 
D
E
 
D
I
 
V
T
 
D
R
 
L
E
 
D
S
 
H
Y
 
W
E
 
R
K
 
K
L
 
I
F
 
I
A
 
D
I
x
V
N
 
N
V
 
L
A
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
F
F
 
I
T
 
V
L
 
T
Q
 
R
A
 
A
A
 
G
A
 
T
R
 
D
Q
 
Q
M
 
M
I
 
R
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
R
 
K
G
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
V
I
 
I
N
 
S
M
x
I
A
 
A
S
|
S
Q
 
N
A
 
T
G
 
F
R
 
F
R
 
A
G
 
G
E
 
T
A
 
P
L
 
N
V
 
M
A
 
A
I
 
A
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
L
 
F
T
 
T
Q
 
R
S
 
A
A
 
L
G
 
A
L
 
T
D
 
E
L
 
L
I
 
G
K
 
K
H
 
Y
R
 
N
I
 
I
N
 
T
V
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
T
P
|
P
G
 
G
V
x
L
V
x
I
D
 
E
G
x
S
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
D
G
|
G
V
|
V
D
 
K
A
 
A
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
S
P
 
P
R
 
H
G
 
N
E
 
E
K
 
A
K
 
F
R
 
G
L
 
F
V
 
V
G
 
E
E
 
M
A
 
L
V
 
Q
P
 
A
F
 
M
G
 
K
R
 
G
M
 
K
G
 
G
T
 
Q
A
 
P
E
 
E
D
 
H
L
 
I
T
 
A
G
 
D
M
 
V
A
 
V
I
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
E
 
D
S
 
A
D
 
R
Y
 
W
I
 
I
V
 
T
S
 
G
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
L
N
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
A
G
 
G

5u9pB Crystal structure of a gluconate 5-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia j2315 in complex with NADP and tartrate
38% identity, 98% coverage: 3:253/257 of query aligns to 13:256/261 of 5u9pB

query
sites
5u9pB
R
 
R
L
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
R
S
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
S
A
 
G
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
T
F
 
L
A
 
A
E
 
R
A
 
G
Y
 
L
V
 
A
R
 
E
E
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
A
V
 
I
A
 
V
I
 
I
A
 
N
D
 
D
I
x
R
D
 
N
I
 
E
E
 
E
R
 
K
A
 
A
R
 
A
Q
 
T
A
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
R
I
 
F
-
 
R
-
 
D
-
 
E
G
 
G
P
 
F
A
 
A
A
 
A
Y
 
D
A
 
H
V
 
A
Q
 
V
M
 
F
D
|
D
V
|
V
T
 
A
R
 
E
Q
 
H
D
 
A
S
 
Q
I
 
V
D
 
R
A
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
D
A
 
E
T
 
F
V
 
E
E
 
A
H
 
R
A
 
V
G
 
G
G
 
A
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
L
 
I
F
 
Q
D
 
R
L
 
R
A
 
A
P
 
P
I
 
L
V
 
D
E
 
A
I
 
F
T
 
E
R
 
P
E
 
D
S
 
D
Y
 
W
E
 
H
K
 
A
L
 
L
F
 
M
A
 
R
I
 
V
N
 
N
V
 
L
A
 
D
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
N
T
 
V
L
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
A
 
A
R
 
R
Q
 
H
M
 
M
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
R
 
H
G
 
-
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
I
A
 
C
S
|
S
Q
 
V
A
 
Q
G
 
S
R
 
E
R
 
L
G
 
A
E
 
R
A
 
P
L
 
T
V
 
I
A
 
A
I
 
P
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
M
L
 
L
T
 
T
Q
 
K
S
 
G
A
 
M
G
 
C
L
 
A
D
 
D
L
 
W
I
 
A
K
 
R
H
 
Y
R
 
G
I
 
I
N
 
Q
V
 
A
N
 
N
A
 
G
I
 
L
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
Y
V
x
F
D
 
E
G
x
T
E
 
E
H
x
L
W
x
N
D
 
R
G
 
A
V
 
L
-
 
V
-
 
D
D
 
D
A
 
A
L
 
A
F
 
F
A
 
S
R
 
D
Y
 
W
E
 
-
N
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
K
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
L
G
 
C
E
 
K
A
 
R
V
 
T
P
 
P
F
 
A
G
 
G
R
 
R
M
 
W
G
 
G
T
 
Q
A
 
V
E
 
D
D
 
E
L
 
L
T
 
C
G
 
G
M
 
A
A
 
A
I
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
A
E
 
A
S
 
S
D
 
D
Y
 
F
I
 
V
V
 
N
S
 
G
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
L
N
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
37% identity, 97% coverage: 7:256/257 of query aligns to 5:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
K
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
A
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
F
 
I
A
 
A
E
 
L
A
 
Q
Y
 
L
V
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
T
 
N
V
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
N
D
 
Y
I
 
A
-
 
G
D
 
S
I
 
K
E
 
E
R
 
K
A
 
A
R
 
E
Q
 
A
A
 
V
A
 
V
A
 
E
E
 
E
I
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
K
G
 
G
P
 
V
A
 
D
A
 
S
Y
 
F
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
M
 
A
D
 
N
V
 
V
T
 
A
R
 
D
Q
 
A
D
 
D
S
 
E
I
 
V
D
 
K
A
 
A
A
 
M
I
 
I
A
 
K
A
 
E
T
 
V
V
 
V
E
 
S
H
 
Q
A
 
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
L
 
I
F
 
T
D
 
R
L
 
D
A
 
N
P
 
L
I
 
L
V
 
M
E
 
R
I
 
M
T
 
K
R
 
E
E
 
Q
S
 
E
Y
 
W
E
 
D
K
 
D
L
 
V
F
 
I
A
 
D
I
 
T
N
 
N
V
 
L
A
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
N
T
 
C
L
 
I
Q
 
Q
A
 
K
A
 
A
A
 
T
R
 
P
Q
 
Q
M
 
M
I
 
L
A
 
R
Q
 
Q
G
 
-
R
 
R
G
 
S
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
L
A
 
S
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
A
R
 
V
G
 
G
E
 
N
A
 
P
L
 
G
V
x
Q
A
 
A
I
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
K
S
 
S
A
 
A
G
 
A
L
 
R
D
 
E
L
 
L
I
 
A
K
 
S
H
 
R
R
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
F
V
 
I
D
 
V
G
 
S
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
D
G
 
M
V
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
L
F
 
-
A
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
S
G
 
D
E
 
E
K
 
L
K
 
K
R
 
E
L
 
Q
V
 
M
G
 
L
E
 
T
A
 
Q
V
 
I
P
 
P
F
 
L
G
 
A
R
 
R
M
 
F
G
 
G
T
 
Q
A
 
D
E
 
T
D
 
D
L
 
I
T
 
A
G
 
N
M
 
T
A
 
V
I
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
E
 
K
S
 
A
D
 
K
Y
 
Y
I
 
I
V
 
T
S
 
G
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
I
N
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
N
 
M
W
 
Y
M
 
M

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
33% identity, 98% coverage: 3:253/257 of query aligns to 4:251/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
R
 
N
L
 
L
E
 
T
G
 
D
K
 
K
S
 
T
A
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
G
A
 
A
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
F
 
A
A
 
V
E
 
Q
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
R
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
T
 
N
V
 
V
A
 
V
I
 
V
A
 
A
D
|
D
I
|
I
D
 
D
I
 
E
E
 
A
R
 
Q
A
 
G
R
 
E
-
 
A
Q
 
M
A
 
V
A
 
R
A
 
K
E
 
E
I
 
N
G
 
N
P
 
D
A
 
R
A
 
L
Y
 
H
A
 
F
V
 
V
Q
 
Q
M
x
T
D
 
D
V
x
I
T
 
T
R
 
D
Q
 
E
D
 
A
S
 
A
I
 
C
D
 
Q
A
 
H
A
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
S
T
 
A
V
 
V
E
 
H
H
 
T
A
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
x
G
L
 
I
F
 
E
D
 
I
L
 
V
A
 
A
P
 
P
I
 
I
V
 
H
E
 
E
I
 
M
T
 
E
R
 
L
E
 
S
S
 
D
Y
 
W
E
 
N
K
 
K
L
 
V
F
 
L
A
 
Q
I
 
V
N
 
N
V
 
L
A
 
T
G
 
G
T
 
M
L
 
F
F
 
L
T
 
M
L
 
S
Q
 
K
A
 
H
A
 
A
A
 
L
R
 
K
Q
 
H
M
 
M
I
 
L
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
R
 
K
G
 
-
G
 
G
K
 
N
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
T
A
 
C
S
|
S
Q
 
V
A
 
G
G
 
G
R
 
L
R
 
V
G
 
A
E
 
W
A
 
P
L
 
D
V
 
I
A
 
P
I
 
A
Y
|
Y
C
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
L
S
 
Q
L
 
L
T
 
T
Q
 
K
S
 
S
A
 
M
G
 
A
L
 
V
D
 
D
L
 
Y
I
 
A
K
 
K
H
 
H
R
 
Q
I
 
I
N
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
V
x
I
V
x
I
D
 
D
G
 
T
E
 
P
H
 
L
W
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
N
D
 
E
A
 
K
L
 
S
F
 
F
A
 
L
R
 
E
Y
 
N
E
 
N
N
 
E
R
 
G
P
 
T
R
 
L
G
 
E
E
 
E
K
 
I
K
 
K
R
 
K
L
 
E
V
 
K
G
 
A
E
 
K
A
 
V
V
 
N
P
 
P
F
 
L
G
 
L
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
K
A
 
P
E
 
E
D
 
E
L
 
I
T
 
A
G
 
N
M
 
V
A
 
M
I
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
E
 
L
S
 
S
D
 
S
Y
 
Y
I
 
M
V
 
T
S
 
G
Q
 
S
T
 
A
Y
 
I
N
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>SMc01500 FitnessBrowser__Smeli:SMc01500
MKRLEGKSALITGSARGIGRAFAEAYVREGATVAIADIDIERARQAAAEIGPAAYAVQMD
VTRQDSIDAAIAATVEHAGGLDILVNNAALFDLAPIVEITRESYEKLFAINVAGTLFTLQ
AAARQMIAQGRGGKIINMASQAGRRGEALVAIYCATKAAVISLTQSAGLDLIKHRINVNA
IAPGVVDGEHWDGVDALFARYENRPRGEKKRLVGEAVPFGRMGTAEDLTGMAIFLASAES
DYIVSQTYNVDGGNWMS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory