SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMc01635 FitnessBrowser__Smeli:SMc01635 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
37% identity, 100% coverage: 2:253/253 of query aligns to 2:248/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
I
 
I
L
 
L
N
 
D
N
 
N
R
 
K
I
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
G
 
V
A
 
A
A
 
H
I
 
S
M
 
Y
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
V
V
 
S
D
|
D
R
x
I
S
 
N
V
 
E
E
 
D
A
 
H
A
 
G
G
 
N
D
 
K
T
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
D
I
 
I
A
 
K
A
 
A
G
 
Q
G
 
G
G
 
G
S
 
E
A
 
A
E
 
S
A
 
F
L
 
V
A
 
K
V
x
A
D
|
D
V
x
T
T
 
S
D
 
N
D
 
P
D
 
E
A
 
E
L
 
V
A
 
E
D
 
A
G
 
L
I
 
V
A
 
K
D
 
R
I
 
T
L
 
V
Y
 
E
R
 
I
H
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
H
 
C
N
 
N
H
x
N
A
|
A
G
 
G
-
 
I
-
 
G
-
 
G
-
 
E
A
 
Q
Q
 
A
V
 
L
A
 
A
G
 
G
D
 
D
L
 
Y
E
 
-
E
 
-
V
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
G
F
 
L
D
 
D
R
 
-
S
 
S
W
 
W
-
 
R
-
 
K
-
 
V
-
 
L
N
 
S
L
 
I
N
 
N
V
 
L
R
 
D
A
 
G
H
 
V
F
 
F
M
 
Y
A
 
G
A
 
C
R
 
K
L
 
Y
V
 
E
M
 
L
P
 
E
S
 
Q
M
 
M
K
 
E
K
 
K
A
 
N
G
 
G
R
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
x
M
S
 
A
S
|
S
S
 
I
S
 
H
G
 
G
V
 
I
L
 
V
Y
 
A
D
 
A
R
 
P
E
 
L
M
 
S
I
 
S
A
 
A
Y
|
Y
T
 
T
T
 
S
T
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
N
M
 
I
A
 
G
G
 
A
D
 
E
Y
 
Y
A
 
G
K
 
Q
Y
 
K
G
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
V
C
 
G
P
|
P
G
x
A
W
x
Y
V
x
I
D
 
E
T
 
T
P
 
P
F
x
L
N
 
L
E
 
E
P
 
S
F
 
L
I
 
T
D
 
K
Q
 
E
M
 
M
G
 
-
G
 
-
R
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
I
A
 
S
Y
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
K
V
 
H
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
W
 
L
A
 
G
S
 
K
V
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
E
S
 
L
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
V
 
S
S
 
S
D
 
E
R
 
K
S
 
S
S
 
S
Y
 
F
M
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
G
I
 
Y
L
 
Y
V
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
Y
T
 
T
V
 
A
V
 
V

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
36% identity, 99% coverage: 2:251/253 of query aligns to 4:259/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
I
 
L
L
 
L
N
 
D
N
 
G
R
 
K
I
 
V
A
 
A
I
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
G
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
G
 
I
A
 
A
A
 
K
I
 
K
M
 
F
A
 
A
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
I
V
 
S
D
|
D
R
x
M
S
 
N
V
 
A
E
 
E
A
 
K
A
 
C
G
 
Q
D
 
E
T
 
T
V
 
A
A
 
N
A
 
S
I
 
L
A
 
K
A
 
E
G
 
Q
G
 
G
G
 
F
S
 
D
A
 
A
E
 
L
A
 
S
L
 
A
A
 
P
V
 
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
D
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
Y
A
 
K
D
 
Q
G
 
A
I
 
I
A
 
E
D
 
L
I
 
T
L
 
Q
Y
 
K
R
 
T
H
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
H
 
I
N
 
N
H
x
N
A
|
A
G
|
G
A
 
F
Q
|
Q
V
 
H
A
 
V
G
 
A
D
 
P
L
 
I
E
 
E
E
 
E
V
 
F
E
 
P
V
 
T
A
 
A
G
 
V
F
 
F
D
 
Q
R
 
K
S
 
L
W
 
V
N
 
Q
L
 
V
N
 
M
V
 
L
R
 
T
A
 
G
H
 
A
F
 
F
M
 
I
A
 
G
A
 
I
R
 
K
L
 
H
V
 
V
M
 
L
P
 
P
S
 
I
M
 
M
K
 
K
K
 
A
A
 
Q
G
 
K
R
 
Y
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
x
M
S
x
A
S
|
S
S
 
I
S
x
N
G
 
G
V
 
L
L
 
I
Y
 
G
D
 
F
R
 
A
E
 
G
M
x
K
I
 
A
A
 
G
Y
|
Y
T
 
N
T
 
S
T
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
V
M
 
A
A
 
A
G
 
L
D
 
E
Y
 
C
A
 
A
K
 
R
Y
 
D
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
 
Y
V
|
V
D
 
D
T
|
T
P
 
P
F
x
L
N
 
V
E
 
R
P
 
G
F
x
Q
I
 
I
D
 
A
Q
 
D
M
 
L
G
 
A
G
 
K
R
 
T
-
 
R
-
 
N
-
 
V
-
 
S
-
 
L
-
 
D
E
 
S
A
 
A
I
 
L
E
 
E
A
 
D
Y
 
V
I
 
I
R
 
L
E
 
A
R
 
M
V
 
V
P
 
P
L
 
Q
G
 
K
R
 
R
W
 
L
A
 
L
S
 
S
V
 
V
D
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
D
S
 
Y
I
 
A
L
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
S
R
 
K
S
 
A
S
 
G
Y
 
G
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
L
 
V
V
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
Y
T
 
T

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
36% identity, 99% coverage: 2:251/253 of query aligns to 3:258/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
I
 
L
L
 
L
N
 
D
N
 
G
R
 
K
I
 
V
A
 
A
I
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
G
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
G
 
I
A
 
A
A
 
K
I
 
K
M
 
F
A
 
A
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
I
V
 
S
D
|
D
R
x
M
S
 
N
V
 
A
E
 
E
A
 
K
A
 
C
G
 
Q
D
 
E
T
 
T
V
 
A
A
 
N
A
 
S
I
 
L
A
 
K
A
 
E
G
 
Q
G
 
G
G
 
F
S
 
D
A
 
A
E
 
L
A
 
S
L
 
A
A
 
P
V
 
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
D
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
Y
A
 
K
D
 
Q
G
 
A
I
 
I
A
 
E
D
 
L
I
 
T
L
 
Q
Y
 
K
R
 
T
H
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
H
 
I
N
 
N
H
x
N
A
|
A
G
|
G
A
 
F
Q
|
Q
V
 
H
A
 
V
G
 
A
D
 
P
L
 
I
E
 
E
E
 
E
V
 
F
E
 
P
V
 
T
A
 
A
G
 
V
F
 
F
D
 
Q
R
 
K
S
 
L
W
 
V
N
 
Q
L
 
V
N
 
M
V
 
L
R
 
T
A
 
G
H
 
A
F
 
F
M
 
I
A
 
G
A
 
I
R
 
K
L
 
H
V
 
V
M
 
L
P
 
P
S
 
I
M
 
M
K
 
K
K
 
A
A
 
Q
G
 
K
R
 
Y
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
x
M
S
x
A
S
|
S
S
 
I
S
 
N
G
 
G
V
 
L
L
 
I
Y
 
G
D
 
F
R
 
A
E
 
G
M
x
K
I
 
A
A
 
G
Y
|
Y
T
 
N
T
 
S
T
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
V
M
 
A
A
 
A
G
 
L
D
 
E
Y
 
C
A
 
A
K
 
R
Y
 
D
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
G
W
x
Y
V
|
V
D
 
D
T
|
T
P
 
P
F
 
L
N
 
V
E
 
R
P
 
G
F
x
Q
I
 
I
D
 
A
Q
 
D
M
 
L
G
 
A
G
 
K
R
 
T
-
 
R
-
 
N
-
 
V
-
 
S
-
 
L
-
 
D
E
 
S
A
 
A
I
 
L
E
 
E
A
 
D
Y
 
V
I
 
I
R
 
L
E
 
A
R
 
M
V
 
V
P
 
P
L
 
Q
G
 
K
R
 
R
W
 
L
A
 
L
S
 
S
V
 
V
D
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
D
S
 
Y
I
 
A
L
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
S
R
 
K
S
 
A
S
 
G
Y
 
G
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
A
L
 
V
V
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
Y
T
 
T

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
34% identity, 99% coverage: 1:251/253 of query aligns to 3:253/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
M
 
M
I
 
N
L
 
L
N
 
T
N
 
D
R
 
K
I
 
T
A
 
V
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
G
 
A
A
 
V
A
 
Q
I
 
A
M
 
F
A
 
L
R
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
H
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
A
D
|
D
R
x
I
S
 
D
V
 
-
E
 
E
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
D
 
E
T
 
A
V
 
M
A
 
V
A
 
R
I
 
-
A
 
K
A
 
E
G
 
N
G
 
N
G
 
D
S
 
R
A
 
L
E
 
H
A
 
F
L
 
V
A
 
Q
V
x
T
D
 
D
V
x
I
T
 
T
D
 
D
D
 
E
D
 
A
A
 
A
L
 
C
A
 
Q
D
 
H
G
 
A
I
 
V
A
 
E
D
 
S
I
 
A
L
 
V
Y
 
H
R
 
T
H
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
H
 
I
N
 
N
H
x
N
A
 
A
G
|
G
A
 
I
Q
 
E
V
 
I
A
 
V
G
 
A
D
 
P
L
 
I
E
 
H
E
 
E
V
 
M
E
 
E
V
 
L
A
 
S
G
 
D
F
 
W
D
 
N
R
 
K
S
 
V
W
 
L
N
 
Q
L
 
V
N
 
N
V
 
L
R
 
T
A
 
G
H
 
M
F
 
F
M
 
L
A
 
M
A
 
S
R
 
K
L
 
H
V
 
A
M
 
L
P
 
K
S
 
H
M
 
M
K
 
L
K
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
|
T
S
 
C
S
|
S
S
 
V
S
 
G
G
 
G
V
 
L
L
 
V
Y
 
A
D
 
W
R
 
P
E
 
D
M
 
I
I
 
P
A
 
A
Y
|
Y
T
 
N
T
 
A
T
 
S
K
|
K
H
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
L
A
 
Q
M
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
S
M
 
M
A
 
A
G
 
V
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
K
 
K
Y
 
H
G
 
Q
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
L
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
x
I
V
x
I
D
 
D
T
 
T
P
 
P
F
 
L
N
 
N
E
 
E
P
 
K
-
 
S
F
 
F
I
 
L
D
 
E
Q
 
N
M
 
N
G
 
E
G
 
G
R
 
-
E
 
-
A
 
T
I
 
L
E
 
E
A
 
E
Y
 
I
I
 
K
R
 
K
E
 
E
R
 
K
V
 
A
-
 
K
-
 
V
-
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
L
R
 
R
W
 
L
A
 
G
S
 
K
V
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
N
S
 
V
I
 
M
L
 
L
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
L
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
M
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
I
 
A
L
 
I
V
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
Y
T
 
T

1iy8A Crystal structure of levodione reductase (see paper)
34% identity, 98% coverage: 3:251/253 of query aligns to 2:255/258 of 1iy8A

query
sites
1iy8A
L
 
F
N
 
T
N
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
V
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
T
A
 
A
A
 
V
I
 
R
M
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
K
V
 
L
V
 
S
V
 
L
V
 
V
D
|
D
R
x
V
S
 
S
V
 
S
E
 
E
A
 
G
A
 
L
G
 
E
D
 
A
T
 
S
V
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
L
A
 
E
G
 
T
G
 
A
G
 
P
S
 
D
A
 
A
E
 
E
A
 
V
L
 
L
A
 
T
V
 
T
-
 
V
-
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
D
 
E
D
 
A
A
 
Q
L
 
V
A
 
E
D
 
A
G
 
Y
I
 
V
A
 
T
D
 
A
I
 
T
L
 
T
Y
 
E
R
 
R
H
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
G
L
 
F
H
 
F
N
 
N
H
x
N
A
 
A
G
|
G
A
x
I
Q
 
E
-
 
G
V
 
K
A
 
Q
G
 
N
D
 
P
L
 
T
E
 
E
E
 
S
V
 
F
E
 
T
V
 
A
A
 
A
G
 
E
F
 
F
D
 
D
R
 
K
S
 
V
W
 
V
N
 
S
L
 
I
N
 
N
V
 
L
R
 
R
A
 
G
H
 
V
F
 
F
M
 
L
A
 
G
A
 
L
R
 
E
L
 
K
V
 
V
M
 
L
P
 
K
S
 
I
M
 
M
K
 
R
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
R
 
S
G
 
G
V
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
|
T
S
 
A
S
|
S
S
 
V
S
 
G
G
 
G
V
 
I
L
 
R
Y
 
G
D
 
I
R
 
G
E
 
N
M
x
Q
I
 
S
A
 
G
Y
|
Y
T
 
A
T
 
A
T
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
I
 
V
A
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
R
Q
 
N
M
 
S
A
 
A
G
 
V
D
 
E
Y
 
Y
A
 
G
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
L
 
I
C
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
A
V
 
I
D
 
W
T
|
T
P
|
P
F
x
M
N
 
V
E
 
E
P
 
N
F
 
S
I
 
M
D
 
K
Q
 
Q
M
 
L
-
 
D
-
 
P
-
 
E
G
 
N
G
 
P
R
 
R
E
 
K
A
 
A
I
 
A
E
 
E
A
 
E
Y
 
F
I
 
I
R
 
Q
E
 
V
R
 
N
V
 
-
P
 
P
L
 
S
G
 
K
R
 
R
W
 
Y
A
 
G
S
 
E
V
 
A
D
 
P
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
A
S
 
V
I
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
V
 
L
S
 
S
D
 
D
R
 
D
S
 
A
S
 
S
Y
 
Y
M
 
V
T
 
N
G
 
A
Q
 
T
I
 
V
L
 
V
V
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
T
 
S

Q9LBG2 Levodione reductase; (6R)-2,2,6-trimethyl-1,4-cyclohexanedione reductase; EC 1.1.1.- from Leifsonia aquatica (Corynebacterium aquaticum) (see paper)
34% identity, 98% coverage: 3:251/253 of query aligns to 11:264/267 of Q9LBG2

query
sites
Q9LBG2
L
 
F
N
 
T
N
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
V
I
x
L
V
x
I
T
|
T
G
|
G
A
x
G
G
|
G
S
|
S
G
|
G
I
x
L
G
|
G
R
|
R
A
|
A
G
x
T
A
|
A
A
x
V
I
x
R
M
x
L
A
|
A
R
x
A
E
|
E
G
|
G
A
|
A
H
x
K
V
x
L
V
x
S
V
x
L
V
 
V
D
 
D
R
 
V
S
 
S
V
 
S
E
 
E
A
 
G
A
 
L
G
 
E
D
 
A
T
 
S
V
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
L
A
 
E
G
 
T
G
 
A
G
 
P
S
 
D
A
 
A
E
 
E
A
 
V
L
 
L
A
 
T
V
 
T
-
 
V
-
 
A
D
 
D
V
 
V
T
 
S
D
 
D
D
 
E
D
 
A
A
 
Q
L
 
V
A
 
E
D
 
A
G
 
Y
I
 
V
A
 
T
D
 
A
I
 
T
L
 
T
Y
 
E
R
 
R
H
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
G
L
 
F
H
 
F
N
 
N
H
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
I
Q
x
E
-
 
G
V
 
K
A
 
Q
G
 
N
D
 
P
L
 
T
E
 
E
E
 
S
V
 
F
E
 
T
V
 
A
A
 
A
G
 
E
F
 
F
D
 
D
R
 
K
S
 
V
W
 
V
N
 
S
L
 
I
N
 
N
V
 
L
R
 
R
A
 
G
H
 
V
F
 
F
M
 
L
A
 
G
A
 
L
R
 
E
L
 
K
V
 
V
M
 
L
P
 
K
S
 
I
M
 
M
K
 
R
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
R
 
S
G
 
G
V
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
T
S
 
A
S
 
S
S
 
V
S
 
G
G
 
G
V
 
I
L
 
R
Y
 
G
D
 
I
R
 
G
E
 
N
M
 
Q
I
 
S
A
 
G
Y
 
Y
T
 
A
T
 
A
T
 
A
K
 
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
I
 
V
A
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
R
Q
 
N
M
 
S
A
 
A
G
 
V
D
 
E
Y
 
Y
A
 
G
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
L
 
I
C
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
A
V
 
I
D
 
W
T
 
T
P
 
P
F
 
M
N
 
V
E
 
E
P
 
N
F
 
S
I
 
M
D
 
K
Q
 
Q
M
 
L
-
 
D
-
 
P
-
 
E
G
 
N
G
 
P
R
 
R
E
 
K
A
 
A
I
 
A
E
 
E
A
 
E
Y
 
F
I
 
I
R
 
Q
E
 
V
R
 
N
V
 
-
P
 
P
L
 
S
G
 
K
R
 
R
W
 
Y
A
 
G
S
 
E
V
 
A
D
 
P
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
A
S
 
V
I
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
V
 
L
S
 
S
D
 
D
R
 
D
S
 
A
S
 
S
Y
 
Y
M
 
V
T
 
N
G
 
A
Q
 
T
I
 
V
L
 
V
V
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
T
 
S

5jc8D Crystal structure of a putative short-chain dehydrogenase/reductase from burkholderia xenovorans
36% identity, 98% coverage: 3:249/253 of query aligns to 4:256/262 of 5jc8D

query
sites
5jc8D
L
 
L
N
 
Q
N
 
G
R
 
K
I
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
C
-
 
I
-
 
G
-
 
P
-
 
G
-
 
W
G
|
G
I
 
N
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
I
A
 
A
A
 
V
I
 
R
M
 
F
A
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
H
V
 
V
V
 
I
V
 
A
V
 
V
D
 
D
R
 
R
S
 
D
V
 
L
E
 
A
A
 
S
A
 
M
G
 
D
D
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
E
A
 
L
I
 
V
A
 
R
A
 
A
G
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
A
 
V
E
 
T
A
 
P
L
 
C
A
 
L
V
 
C
D
 
D
V
 
V
T
 
T
D
 
D
D
 
S
D
 
A
A
 
S
L
 
V
A
 
E
D
 
R
G
 
L
I
 
V
A
 
A
D
 
D
I
 
S
L
 
V
Y
 
A
R
 
R
H
 
C
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
H
 
V
N
 
N
H
 
N
A
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
P
V
 
S
A
 
P
G
 
G
D
 
G
L
 
P
E
 
V
E
 
A
V
 
L
E
 
D
V
 
E
A
 
A
G
 
Q
F
 
W
D
 
A
R
 
M
S
 
Q
W
 
L
N
 
E
L
 
L
N
 
N
V
 
L
R
 
T
A
 
T
H
 
A
F
 
F
M
 
L
A
 
M
A
 
C
R
 
K
L
 
Y
V
 
V
M
 
L
P
 
P
S
 
V
M
 
M
K
 
E
K
 
Q
A
 
Q
G
 
G
R
 
G
G
 
G
V
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
I
S
 
A
S
|
S
S
 
T
S
 
S
G
 
G
V
 
I
L
 
R
Y
 
W
D
 
T
-
 
G
R
 
A
E
 
A
M
 
Q
I
 
V
A
 
G
Y
|
Y
T
 
A
T
 
A
T
 
A
K
|
K
H
 
A
A
 
G
V
 
M
I
 
I
A
 
Q
M
 
M
T
 
G
R
 
R
Q
 
V
M
 
V
A
 
A
G
 
V
D
 
E
Y
 
Y
A
 
A
K
 
A
Y
 
K
G
 
N
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
L
 
V
C
 
V
P
 
P
G
 
G
W
 
L
V
 
L
D
 
H
T
 
T
P
|
P
F
x
M
N
 
V
E
 
D
P
 
T
F
 
K
I
 
I
D
 
A
Q
 
H
M
 
N
G
 
G
G
 
D
R
 
V
E
 
E
A
 
L
I
 
L
E
 
L
A
 
R
Y
 
K
I
 
R
R
 
Q
E
 
A
R
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
P
R
 
F
W
 
M
A
 
G
S
 
D
V
 
G
D
 
R
E
 
D
I
 
T
A
 
A
E
 
N
S
 
A
I
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
E
S
 
A
S
 
R
Y
 
F
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
I
 
E
L
 
I
V
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
35% identity, 98% coverage: 3:249/253 of query aligns to 5:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
L
 
L
N
 
Q
N
 
D
R
 
K
I
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
G
 
A
A
 
A
A
 
R
I
 
V
M
 
F
A
 
M
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
I
V
 
A
D
|
D
R
x
F
S
 
N
V
 
-
E
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
D
 
K
T
 
E
V
 
-
A
 
-
A
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
A
G
 
N
G
 
P
G
 
G
S
 
V
A
 
V
E
 
-
A
 
F
L
 
I
A
 
R
V
|
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
D
 
R
D
 
E
A
 
S
L
 
V
A
 
H
D
 
R
G
 
L
I
 
V
A
 
E
D
 
N
I
 
V
L
 
A
Y
 
E
R
 
R
H
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
H
 
I
N
 
N
H
x
N
A
|
A
G
|
G
A
x
I
Q
 
T
V
 
R
A
x
D
G
 
S
D
 
M
L
 
L
E
 
S
E
x
K
V
 
M
E
 
T
V
 
V
A
 
D
G
 
Q
F
 
F
D
 
Q
R
 
Q
S
 
V
W
 
I
N
 
N
L
 
V
N
|
N
V
 
L
R
 
T
A
 
G
H
 
V
F
 
F
M
 
H
A
 
C
A
 
T
R
 
Q
L
 
A
V
 
V
M
 
L
P
 
P
S
 
Y
M
 
M
K
 
A
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
|
T
S
 
S
S
|
S
S
 
V
S
 
T
G
 
G
V
 
T
L
 
Y
Y
 
G
D
x
N
R
x
V
E
 
G
M
x
Q
I
 
T
A
 
N
Y
|
Y
T
 
A
T
 
A
T
 
A
K
|
K
H
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
K
Q
 
T
M
 
W
A
 
A
G
 
K
D
 
E
Y
 
L
A
 
A
K
 
R
Y
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
W
x
F
V
x
T
D
 
E
T
|
T
P
 
A
F
x
M
-
 
V
-
 
A
-
 
E
-
 
V
N
 
P
E
 
E
P
 
K
F
 
V
I
 
I
D
 
E
Q
x
K
M
 
M
G
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
Y
 
-
I
 
-
R
 
K
E
 
A
R
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
W
 
L
A
 
G
S
 
K
V
 
P
D
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
N
S
 
A
I
 
Y
L
 
L
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
H
R
 
E
S
 
S
S
 
D
Y
 
Y
M
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
H
I
 
V
L
 
L
V
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4wecA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from mycobacterium smegmatis
34% identity, 98% coverage: 3:249/253 of query aligns to 8:249/258 of 4wecA

query
sites
4wecA
L
 
L
N
 
A
N
 
G
R
 
K
I
 
V
A
 
A
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
G
 
T
A
 
G
A
 
R
I
 
R
M
 
L
A
 
R
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
G
D
|
D
-
x
I
-
 
D
-
 
P
R
 
T
S
 
T
V
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
A
G
 
A
D
 
D
T
 
E
V
 
L
A
 
E
A
 
G
I
 
L
A
 
F
A
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
V
A
 
P
V
|
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
E
D
 
Q
D
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
D
D
 
N
G
 
L
I
 
F
A
 
D
D
 
T
I
 
A
L
 
A
Y
 
S
R
 
T
H
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
A
H
 
F
N
 
N
H
x
N
A
 
A
G
 
G
A
 
I
Q
 
S
V
 
P
A
 
P
G
 
E
D
 
D
-
 
D
-
 
L
L
 
I
E
 
E
E
 
N
V
 
T
E
 
D
V
 
L
A
 
P
G
 
A
F
 
W
D
 
Q
R
 
R
S
 
V
W
 
Q
N
 
D
L
 
I
N
 
N
V
 
L
R
 
K
A
 
S
H
 
V
F
 
Y
M
 
L
A
 
S
A
 
C
R
 
R
L
 
A
V
 
A
M
 
L
P
 
R
S
 
H
M
 
M
K
 
V
K
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
|
T
S
 
A
S
|
S
S
 
F
S
 
V
G
 
A
V
 
V
L
 
M
Y
 
G
D
 
S
-
 
A
R
 
T
E
 
S
M
x
Q
I
 
I
A
 
S
Y
|
Y
T
 
T
T
 
A
T
 
S
K
|
K
H
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
L
A
 
A
M
 
M
T
 
S
R
 
R
Q
 
E
M
 
L
A
 
G
G
 
V
D
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
K
 
R
Y
 
Q
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
C
 
C
P
|
P
G
 
G
W
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
P
|
P
F
x
V
N
 
N
E
 
T
P
 
P
F
 
L
I
 
L
D
 
Q
Q
 
E
M
 
L
G
 
F
G
 
A
R
 
K
E
 
D
A
 
P
I
 
E
E
 
R
A
 
A
Y
 
A
I
 
R
R
 
R
E
 
L
-
 
V
R
 
H
V
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
W
 
F
A
 
A
S
 
E
V
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
A
S
 
A
I
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
D
S
 
A
S
 
S
Y
 
F
M
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
I
 
T
L
 
F
V
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3uf0A Crystal structure of a putative NAD(p) dependent gluconate 5- dehydrogenase from beutenbergia cavernae(efi target efi-502044) with bound NADP (low occupancy)
39% identity, 98% coverage: 3:249/253 of query aligns to 5:245/249 of 3uf0A

query
sites
3uf0A
L
 
L
N
 
A
N
 
G
R
 
R
I
 
T
A
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
I
A
 
A
A
 
H
I
 
G
M
 
Y
A
 
A
R
 
R
E
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
H
V
 
V
V
 
L
V
 
A
V
 
W
D
 
G
R
|
R
S
 
T
V
 
-
E
 
D
A
 
G
A
 
V
G
 
K
D
 
E
T
 
V
V
 
A
A
 
D
A
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
D
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
V
V
 
A
D
|
D
V
x
L
T
 
A
D
 
D
D
 
L
D
 
E
A
 
G
L
 
A
A
 
A
D
 
N
G
 
-
I
 
V
A
 
A
D
 
E
I
 
E
L
 
L
Y
 
A
R
 
A
H
 
T
G
 
R
R
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
H
 
V
N
 
N
H
x
N
A
 
A
G
|
G
A
x
I
Q
 
I
V
 
A
A
 
R
G
 
A
D
 
P
L
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
V
E
 
S
V
 
L
A
 
G
G
 
R
F
 
W
D
 
R
R
 
E
S
 
V
W
 
L
N
 
T
L
 
V
N
 
N
V
 
L
R
 
D
A
 
A
H
 
A
F
 
W
M
 
V
A
 
L
A
 
S
R
 
R
L
 
S
V
 
F
M
 
G
P
 
T
S
 
A
M
 
M
K
 
L
K
 
A
A
 
H
G
 
G
R
 
S
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
T
T
x
I
S
x
A
S
|
S
S
 
M
S
 
L
G
 
S
V
 
F
L
 
Q
Y
 
G
D
 
G
R
 
R
E
 
N
M
x
V
I
 
A
A
 
A
Y
|
Y
T
 
A
T
 
A
T
 
S
K
|
K
H
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
R
Q
 
A
M
 
L
A
 
A
G
 
S
D
 
E
Y
 
W
A
 
A
K
 
G
Y
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
G
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
C
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
Y
V
|
V
D
 
V
T
|
T
P
 
A
F
x
N
N
x
T
E
 
A
P
 
A
F
 
L
I
 
R
D
 
A
Q
 
D
M
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
D
A
 
E
I
 
R
E
 
A
A
 
A
Y
 
E
I
 
I
R
 
T
E
 
A
R
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
W
 
W
A
 
A
S
 
T
V
 
P
D
 
E
E
 
D
I
 
M
A
 
V
E
 
G
S
 
P
I
 
A
L
 
V
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
A
S
 
A
S
 
S
Y
 
Y
M
 
V
T
 
H
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

H9XP47 Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; BDH; meso-2,3-BDH; (R,S)-butane-2,3-diol dehydrogenase; NAD(H)-dependent meso-2,3-BDH; SmBdh; EC 1.1.1.- from Serratia marcescens (see paper)
35% identity, 99% coverage: 1:251/253 of query aligns to 1:242/251 of H9XP47

query
sites
H9XP47
M
 
M
I
 
R
L
 
F
N
 
D
N
 
N
R
 
K
I
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
x
N
G
 
G
I
x
M
G
 
G
R
 
E
A
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
R
I
 
R
M
 
F
A
 
S
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
L
V
 
A
D
|
D
R
 
W
S
 
A
V
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
V
G
 
D
D
 
K
T
 
V
V
 
A
A
 
A
A
 
S
I
 
L
A
 
P
A
 
K
G
 
G
G
 
-
G
 
-
S
 
R
A
 
A
E
 
M
A
 
A
L
 
V
A
 
H
V
 
I
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
D
 
H
D
 
V
A
 
A
L
 
V
A
 
E
D
 
K
G
 
M
I
 
M
A
 
N
D
 
E
I
 
V
L
 
A
Y
 
E
R
 
K
H
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
H
 
L
N
 
N
H
x
N
A
 
A
G
 
G
A
 
V
Q
 
H
V
 
V
A
 
A
G
 
G
D
 
S
L
 
V
E
 
L
E
 
E
V
 
T
E
 
S
V
 
I
A
 
D
G
 
D
F
 
W
D
 
R
R
 
R
S
 
I
W
 
A
N
 
G
L
 
V
N
 
D
V
 
I
R
 
D
A
 
G
H
 
V
F
 
V
M
 
F
A
 
C
A
 
S
R
 
K
L
 
F
V
 
A
M
 
L
P
 
P
S
 
H
M
 
L
K
 
L
K
 
K
A
 
T
G
 
-
R
 
K
G
 
G
V
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
T
S
 
A
S
|
S
S
x
V
S
|
S
G
 
G
V
 
L
L
 
G
Y
 
G
D
 
D
R
 
W
E
 
G
M
 
A
I
 
A
A
 
Y
Y
|
Y
T
 
C
T
 
A
T
 
A
K
|
K
H
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
R
Q
 
A
M
 
M
A
 
A
G
 
L
D
 
D
Y
 
H
A
 
G
K
 
G
Y
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
S
W
 
L
V
|
V
D
 
K
T
|
T
P
 
N
F
 
M
N
 
T
E
 
N
P
 
-
F
 
-
I
 
-
D
 
-
Q
 
-
M
 
-
G
 
G
G
 
W
R
 
P
E
 
Q
A
 
E
I
 
I
E
x
R
A
x
D
Y
x
K
I
 
F
R
 
N
E
 
E
R
 
R
V
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
W
 
A
A
 
A
S
 
E
V
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
A
S
 
V
I
 
M
L
 
A
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
D
S
 
A
S
 
S
Y
 
F
M
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
I
 
N
L
 
I
V
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
A
T
 
T

Sites not aligning to the query:

6vspB Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
35% identity, 98% coverage: 3:251/253 of query aligns to 5:244/252 of 6vspB

query
sites
6vspB
L
 
F
N
 
D
N
 
N
R
 
K
I
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
S
x
N
G
|
G
I
 
M
G
 
G
R
 
E
A
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
R
I
 
R
M
 
F
A
 
S
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
L
V
 
A
D
|
D
R
x
W
S
 
A
V
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
V
G
 
D
D
 
K
T
 
V
V
 
A
A
 
A
A
 
S
I
 
L
A
 
P
A
 
K
G
 
G
G
 
-
G
 
-
S
 
R
A
 
A
E
 
M
A
 
A
L
 
V
A
 
H
V
x
I
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
D
 
H
D
 
V
A
 
A
L
 
V
A
 
E
D
 
K
G
 
M
I
 
M
A
 
N
D
 
E
I
 
V
L
 
A
Y
 
E
R
 
K
H
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
H
 
L
N
 
N
H
 
N
A
 
A
G
|
G
A
 
V
Q
 
H
V
 
V
A
 
A
G
 
G
D
 
S
L
 
V
E
 
L
E
 
E
V
 
T
E
 
S
V
 
I
A
 
D
G
 
D
F
 
W
D
 
R
R
 
R
S
 
I
W
 
A
N
 
G
L
 
V
N
 
D
V
 
I
R
 
D
A
 
G
H
 
V
F
 
V
M
 
F
A
 
C
A
 
S
R
 
K
L
 
F
V
 
A
M
 
L
P
 
P
S
 
H
M
 
L
K
 
L
K
 
K
A
 
T
G
 
-
R
 
K
G
 
G
V
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
T
S
 
A
S
|
S
S
 
V
S
 
S
G
 
G
V
 
L
L
 
G
Y
 
G
D
 
D
R
 
W
E
 
G
M
 
A
I
 
A
A
 
Y
Y
|
Y
T
 
C
T
 
A
T
 
A
K
 
K
H
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
R
Q
 
A
M
 
M
A
 
A
G
 
L
D
 
D
Y
 
H
A
 
G
K
 
G
Y
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
S
W
 
L
V
 
V
D
 
K
T
 
T
P
 
N
F
 
M
N
 
T
E
 
N
P
 
-
F
 
-
I
 
-
D
 
-
Q
 
-
M
 
-
G
 
G
G
 
W
R
 
P
E
 
Q
A
 
E
I
 
I
E
 
R
A
 
D
Y
 
K
I
 
F
R
 
N
E
 
E
R
 
R
V
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
W
 
A
A
 
A
S
 
E
V
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
A
S
 
V
I
 
M
L
 
A
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
D
S
 
A
S
 
S
Y
 
F
M
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
I
 
N
L
 
I
V
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
A
T
 
T

6xewA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
35% identity, 98% coverage: 3:251/253 of query aligns to 3:242/251 of 6xewA

query
sites
6xewA
L
 
F
N
 
D
N
 
N
R
 
K
I
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
S
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
R
 
E
A
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
R
I
 
R
M
 
F
A
 
S
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
L
V
 
A
D
|
D
R
x
W
S
x
A
V
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
V
G
 
D
D
 
K
T
 
V
V
 
A
A
 
A
A
 
S
I
 
L
A
 
P
A
 
K
G
 
G
G
 
-
G
 
-
S
 
R
A
 
A
E
 
M
A
 
A
L
 
V
A
 
H
V
x
I
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
D
 
H
D
 
V
A
 
A
L
 
V
A
 
E
D
 
K
G
 
M
I
 
M
A
 
N
D
 
E
I
 
V
L
 
A
Y
 
E
R
 
K
H
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
H
 
L
N
 
N
H
x
N
A
|
A
G
|
G
A
 
V
Q
 
H
V
 
V
A
 
A
G
 
G
D
 
S
L
 
V
E
 
L
E
 
E
V
 
T
E
 
S
V
 
I
A
 
D
G
 
D
F
 
W
D
 
R
R
 
R
S
 
I
W
 
A
N
 
G
L
x
V
N
 
D
V
 
I
R
 
D
A
 
G
H
 
V
F
 
V
M
 
F
A
 
C
A
 
S
R
 
K
L
 
F
V
 
A
M
 
L
P
 
P
S
 
H
M
 
L
K
 
L
K
 
K
A
 
T
G
 
-
R
 
K
G
 
G
V
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
|
T
S
 
A
S
|
S
S
 
V
S
|
S
G
 
G
V
 
L
L
 
G
Y
 
G
D
 
D
R
 
W
E
 
G
M
 
A
I
 
A
A
 
Y
Y
|
Y
T
 
C
T
 
A
T
 
A
K
|
K
H
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
R
Q
 
A
M
 
M
A
 
A
G
 
L
D
 
D
Y
 
H
A
 
G
K
 
G
Y
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
V
C
 
C
P
 
P
G
x
S
W
x
L
V
|
V
D
 
K
T
|
T
P
x
N
F
x
M
N
x
T
E
 
N
P
 
-
F
 
-
I
 
-
D
 
-
Q
 
-
M
 
-
G
 
G
G
 
W
R
 
P
E
 
Q
A
 
E
I
 
I
E
 
R
A
 
D
Y
 
K
I
 
F
R
 
N
E
 
E
R
 
R
V
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
W
 
A
A
 
A
S
 
E
V
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
A
S
 
V
I
 
M
L
 
A
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
D
S
 
A
S
 
S
Y
 
F
M
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
I
 
N
L
 
I
V
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
A
T
 
T

6vspA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
35% identity, 98% coverage: 3:251/253 of query aligns to 3:242/251 of 6vspA

query
sites
6vspA
L
 
F
N
 
D
N
 
N
R
 
K
I
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
S
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
R
 
E
A
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
R
I
 
R
M
 
F
A
 
S
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
L
V
 
A
D
|
D
R
x
W
S
x
A
V
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
V
G
 
D
D
 
K
T
 
V
V
 
A
A
 
A
A
 
S
I
 
L
A
 
P
A
 
K
G
 
G
G
 
-
G
 
-
S
 
R
A
 
A
E
 
M
A
 
A
L
 
V
A
 
H
V
x
I
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
D
 
H
D
 
V
A
 
A
L
 
V
A
 
E
D
 
K
G
 
M
I
 
M
A
 
N
D
 
E
I
 
V
L
 
A
Y
 
E
R
 
K
H
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
H
 
L
N
 
N
H
x
N
A
|
A
G
|
G
A
x
V
Q
 
H
V
 
V
A
 
A
G
 
G
D
 
S
L
 
V
E
 
L
E
 
E
V
 
T
E
 
S
V
 
I
A
 
D
G
 
D
F
 
W
D
 
R
R
 
R
S
 
I
W
 
A
N
 
G
L
x
V
N
 
D
V
 
I
R
 
D
A
 
G
H
 
V
F
 
V
M
 
F
A
 
C
A
 
S
R
 
K
L
 
F
V
 
A
M
 
L
P
 
P
S
 
H
M
 
L
K
 
L
K
 
K
A
 
T
G
 
-
R
 
K
G
 
G
V
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
|
T
S
 
A
S
|
S
S
 
V
S
 
S
G
 
G
V
 
L
L
 
G
Y
 
G
D
 
D
R
 
W
E
 
G
M
 
A
I
 
A
A
 
Y
Y
|
Y
T
 
C
T
 
A
T
 
A
K
|
K
H
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
R
Q
 
A
M
 
M
A
 
A
G
 
L
D
 
D
Y
 
H
A
 
G
K
 
G
Y
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
V
C
 
C
P
|
P
G
x
S
W
x
L
V
|
V
D
 
K
T
|
T
P
x
N
F
x
M
N
x
T
E
 
N
P
 
-
F
 
-
I
 
-
D
 
-
Q
 
-
M
 
-
G
 
G
G
 
W
R
 
P
E
 
Q
A
 
E
I
 
I
E
 
R
A
 
D
Y
 
K
I
 
F
R
 
N
E
 
E
R
 
R
V
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
W
 
A
A
 
A
S
 
E
V
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
A
S
 
V
I
 
M
L
 
A
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
D
S
 
A
S
 
S
Y
 
F
M
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
I
 
N
L
 
I
V
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
A
T
 
T

3o03A Quaternary complex structure of gluconate 5-dehydrogenase from streptococcus suis type 2 (see paper)
34% identity, 98% coverage: 3:249/253 of query aligns to 9:245/254 of 3o03A

query
sites
3o03A
L
 
L
N
 
K
N
 
G
R
 
K
I
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
S
S
x
Y
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
F
A
 
A
G
 
I
A
 
A
A
 
S
I
 
A
M
 
Y
A
 
A
R
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
T
V
 
I
V
 
V
V
 
F
V
 
N
D
|
D
R
x
I
S
 
N
V
 
Q
E
 
E
A
x
L
A
 
V
G
 
D
D
 
R
T
 
G
V
 
M
A
 
A
A
 
A
I
 
Y
A
 
K
A
 
A
G
 
A
G
 
G
G
 
I
S
 
N
A
 
A
E
 
H
A
 
G
L
 
Y
A
 
V
V
 
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
D
 
E
D
 
D
A
 
G
L
 
I
A
 
Q
D
 
A
G
 
M
I
 
V
A
 
A
D
 
Q
I
 
I
L
 
E
Y
 
S
R
 
E
H
 
V
G
 
G
R
 
I
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
H
 
V
N
 
N
H
x
N
A
|
A
G
|
G
A
 
I
Q
x
I
V
 
R
A
x
R
G
 
V
D
 
P
L
 
M
E
 
I
E
 
E
V
 
M
E
 
T
V
 
A
A
 
A
G
 
Q
F
 
F
D
 
R
R
 
Q
S
 
V
W
 
I
N
 
D
L
 
I
N
 
D
V
 
L
R
 
N
A
 
A
H
 
P
F
 
F
M
 
I
A
 
V
A
 
S
R
 
K
L
 
A
V
 
V
M
 
I
P
 
P
S
 
S
M
 
M
K
 
I
K
 
K
A
 
K
G
 
G
R
 
H
G
 
G
V
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
x
I
S
 
C
S
|
S
S
x
M
S
x
M
G
 
S
V
 
E
L
 
L
Y
 
G
D
x
R
R
 
E
E
 
T
M
x
V
I
 
S
A
 
A
Y
|
Y
T
 
A
T
 
A
T
 
A
K
|
K
H
 
G
A
 
G
V
 
L
I
 
K
A
 
M
M
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
N
M
 
I
A
 
A
G
 
S
D
 
E
Y
 
Y
A
 
G
K
 
E
Y
 
A
G
 
N
V
 
I
R
 
Q
V
 
C
N
 
N
A
 
G
L
 
I
C
 
G
P
|
P
G
 
G
W
 
Y
V
 
I
D
 
A
T
 
T
P
 
P
F
 
Q
N
 
T
E
 
H
P
 
P
F
 
F
I
 
-
D
 
D
Q
 
Q
M
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
Y
 
F
I
 
I
R
 
I
E
 
A
R
 
K
V
 
T
P
 
P
L
 
A
G
 
A
R
 
R
W
 
W
A
 
G
S
 
E
V
 
A
D
 
E
E
 
D
I
 
L
A
 
M
E
 
G
S
 
P
I
 
A
L
 
V
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
A
S
 
S
S
 
N
Y
 
F
M
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
H
I
 
I
L
 
L
V
 
Y
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q8JZV9 Dehydrogenase/reductase SDR family member 6; (R)-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase; 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2; 4-oxo-L-proline reductase; Oxidoreductase UCPA; Short chain dehydrogenase/reductase family 15C member 1; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.30; EC 1.1.1.104 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
34% identity, 98% coverage: 3:249/253 of query aligns to 4:242/245 of Q8JZV9

query
sites
Q8JZV9
L
 
L
N
 
D
N
 
G
R
 
K
I
 
V
A
 
I
I
 
V
V
 
L
T
 
T
G
 
A
A
 
A
G
 
A
S
 
Q
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
S
A
 
A
A
 
L
I
 
A
M
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
A
V
 
T
D
 
D
R
 
I
S
 
N
V
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
E
D
 
S
T
 
K
V
 
L
A
 
Q
A
 
E
I
 
L
A
 
E
A
 
S
G
 
Y
G
 
R
G
 
G
S
 
-
A
 
I
E
 
Q
A
 
T
L
 
R
A
 
V
V
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
T
D
 
K
D
 
K
D
 
R
A
 
Q
L
 
I
A
 
D
D
 
Q
G
 
F
I
 
A
A
 
S
D
 
E
I
 
I
L
 
-
Y
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
E
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
H
 
F
N
 
N
H
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
F
Q
 
V
V
 
H
A
 
H
G
 
G
D
 
T
L
 
I
E
 
L
E
 
D
V
 
C
E
 
E
V
 
E
A
 
K
G
 
D
F
 
W
D
 
D
R
 
F
S
 
S
W
 
M
N
 
N
L
 
L
N
 
N
V
 
V
R
 
R
A
 
S
H
 
M
F
 
F
M
 
L
A
 
M
A
 
I
R
 
K
L
 
A
V
 
F
M
 
L
P
 
P
S
 
K
M
 
M
K
 
L
K
 
A
A
 
Q
G
 
K
R
 
S
G
 
G
V
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
 
M
S
 
S
S
 
S
-
 
V
S
 
A
S
 
S
G
 
S
V
 
I
L
 
K
Y
 
G
D
 
V
R
 
E
E
 
N
M
 
R
I
 
C
A
 
V
Y
|
Y
T
 
S
T
 
A
T
 
T
K
 
K
H
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
A
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
S
M
 
V
A
 
A
G
 
A
D
 
D
Y
 
F
A
 
I
K
 
Q
Y
 
Q
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
C
L
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
W
 
T
V
 
V
D
 
D
T
 
T
P
 
P
-
 
S
F
 
L
N
 
Q
E
 
E
P
 
R
F
 
I
I
 
Q
D
 
A
Q
 
R
M
 
D
G
 
N
G
 
P
R
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
K
A
 
T
Y
 
F
I
 
L
R
 
-
E
 
N
R
 
R
V
 
Q
P
 
K
L
 
T
G
 
G
R
 
R
W
 
F
A
 
A
S
 
S
V
 
A
D
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
L
S
 
L
I
 
C
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
E
S
 
S
S
 
A
Y
 
Y
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
N
I
 
P
L
 
V
V
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4nbwA Crystal structure of fabg from plesiocystis pacifica (see paper)
37% identity, 98% coverage: 5:252/253 of query aligns to 1:251/253 of 4nbwA

query
sites
4nbwA
N
 
K
R
 
R
I
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
T
A
 
A
A
 
L
I
 
E
M
 
F
A
 
A
R
 
Q
E
 
A
G
 
G
A
 
Y
H
 
H
V
 
V
V
 
V
V
 
A
V
 
W
D
|
D
R
x
L
S
 
A
V
 
E
E
 
E
A
 
A
A
 
G
G
 
A
D
 
A
T
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
D
G
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
A
 
A
E
 
D
A
 
F
L
 
A
A
 
R
V
|
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
A
D
 
A
D
 
E
A
 
S
L
 
V
A
 
E
D
 
A
G
 
A
I
 
V
A
 
A
D
 
E
I
 
I
L
 
I
Y
 
A
R
 
E
H
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
H
 
V
N
 
N
H
x
N
A
|
A
G
|
G
A
 
I
Q
 
L
V
 
H
A
 
D
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
E
 
V
E
 
K
V
 
V
E
 
K
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
V
-
 
K
-
 
K
-
 
M
-
 
A
V
 
E
A
 
A
G
 
Q
F
 
F
D
 
D
R
 
A
S
 
V
W
 
I
N
 
S
L
 
V
N
 
N
V
 
L
R
 
K
A
 
G
H
 
V
F
 
F
M
 
L
A
 
C
A
 
T
R
 
Q
L
 
A
V
 
V
M
 
A
P
 
P
S
 
H
M
 
M
K
 
I
K
 
A
A
 
A
G
 
K
R
 
Y
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
L
N
 
N
T
 
A
S
 
S
S
|
S
S
 
V
S
 
V
G
 
G
V
 
L
L
 
Y
Y
 
G
D
 
N
R
 
F
E
 
G
M
 
Q
I
 
T
A
 
N
Y
|
Y
T
 
V
T
 
A
T
 
A
K
|
K
H
 
S
A
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
K
Q
 
V
M
 
W
A
 
A
G
 
R
D
 
E
Y
 
L
A
 
G
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
I
C
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
F
V
x
I
D
 
A
T
|
T
P
 
-
F
 
-
N
 
-
E
 
-
P
 
E
F
 
M
I
 
V
D
 
Q
Q
 
Q
M
 
M
G
 
P
G
 
E
R
 
R
E
 
-
A
 
V
I
 
L
E
 
E
A
 
A
Y
 
M
I
 
V
R
 
-
E
 
A
R
 
R
V
 
T
P
 
P
L
 
V
G
 
G
R
 
R
W
 
I
A
 
G
S
 
D
V
 
P
D
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
R
S
 
A
I
 
Y
L
 
L
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
E
R
 
E
S
 
S
S
 
G
Y
 
F
M
 
I
T
 
S
G
 
G
Q
 
T
I
 
T
L
 
L
V
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
M
T
 
V
V
 
V

2cfcA Structural basis for stereo selectivity in the (r)- and (s)-hydroxypropylethane thiosulfonate dehydrogenases (see paper)
35% identity, 98% coverage: 5:253/253 of query aligns to 2:250/250 of 2cfcA

query
sites
2cfcA
N
 
S
R
 
R
I
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
S
S
|
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
R
 
L
A
 
A
G
 
I
A
 
A
A
 
T
I
 
R
M
 
F
A
 
L
R
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
D
H
 
R
V
 
V
V
 
A
V
 
A
V
 
L
D
|
D
R
x
L
S
 
S
V
 
A
E
 
E
A
 
T
A
 
L
G
 
E
D
 
E
T
 
T
V
 
A
A
 
R
A
 
T
-
 
H
I
 
W
A
 
H
A
 
A
G
 
Y
G
 
A
G
 
D
S
 
K
A
 
V
E
 
L
A
 
R
L
 
V
A
 
R
V
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
D
D
 
E
D
 
G
A
 
D
L
 
V
A
 
N
D
 
A
G
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
A
I
 
T
L
 
M
Y
 
E
R
 
Q
H
 
F
G
 
G
R
 
A
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
H
 
V
N
 
N
H
x
N
A
|
A
G
|
G
A
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
N
Q
 
S
V
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
V
L
 
L
E
 
H
E
 
T
V
 
T
E
 
P
V
 
V
A
 
E
G
 
Q
F
 
F
D
 
D
R
 
K
S
 
V
W
 
M
N
 
A
L
 
V
N
 
N
V
 
V
R
 
R
A
 
G
H
 
I
F
 
F
M
 
L
A
 
G
A
 
C
R
 
R
L
 
A
V
 
V
M
 
L
P
 
P
S
 
H
M
 
M
K
 
L
K
 
L
A
 
Q
G
 
G
R
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
x
I
S
 
A
S
|
S
S
 
V
S
 
A
G
 
S
V
 
L
L
 
V
Y
 
A
D
x
F
R
 
P
E
 
G
M
x
R
I
 
S
A
 
A
Y
|
Y
T
 
T
T
 
T
T
 
S
K
|
K
H
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
L
A
 
Q
M
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
S
M
 
V
A
 
A
G
 
V
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
K
 
G
Y
 
S
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
x
M
V
x
I
D
 
E
T
|
T
P
|
P
F
x
M
N
x
T
E
 
Q
P
x
W
F
x
R
I
 
L
D
 
D
Q
 
Q
M
 
P
G
 
E
G
 
L
R
 
R
E
 
D
A
 
Q
I
 
V
E
 
L
A
 
A
Y
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
Q
G
 
K
R
 
E
W
 
I
A
 
G
S
 
T
V
 
A
D
 
A
E
 
Q
I
 
V
A
 
A
E
 
D
S
 
A
I
 
V
L
 
M
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
G
D
 
E
R
 
D
S
 
A
S
 
T
Y
 
Y
M
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
I
 
A
L
 
L
V
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
A
E
 
Y
T
 
T
V
 
A
V
 
I

Q56840 2-(R)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase; R-HPCDH; 2-[(R)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase; Aliphatic epoxide carboxylation component III; Epoxide carboxylase component III; RHPCDH1; EC 1.1.1.268 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 4 papers)
35% identity, 98% coverage: 5:253/253 of query aligns to 2:250/250 of Q56840

query
sites
Q56840
N
 
S
R
 
R
I
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
S
S
|
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
R
 
L
A
 
A
G
 
I
A
 
A
A
 
T
I
 
R
M
 
F
A
 
L
R
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
D
H
 
R
V
 
V
V
 
A
V
 
A
V
 
L
D
|
D
R
 
L
S
 
S
V
 
A
E
 
E
A
 
T
A
 
L
G
 
E
D
 
E
T
 
T
V
 
A
A
 
R
A
 
T
-
 
H
I
 
W
A
 
H
A
 
A
G
 
Y
G
 
A
G
 
D
S
 
K
A
 
V
E
 
L
A
 
R
L
 
V
A
 
R
V
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
D
D
 
E
D
 
G
A
 
D
L
 
V
A
 
N
D
 
A
G
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
A
I
 
T
L
 
M
Y
 
E
R
 
Q
H
 
F
G
 
G
R
 
A
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
H
 
V
N
 
N
H
x
N
A
 
A
G
 
G
A
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
N
Q
 
S
V
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
V
L
 
L
E
 
H
E
 
T
V
 
T
E
 
P
V
 
V
A
 
E
G
 
Q
F
 
F
D
 
D
R
 
K
S
 
V
W
 
M
N
 
A
L
 
V
N
 
N
V
 
V
R
 
R
A
 
G
H
 
I
F
 
F
M
 
L
A
 
G
A
 
C
R
 
R
L
 
A
V
 
V
M
 
L
P
 
P
S
 
H
M
 
M
K
 
L
K
 
L
A
 
Q
G
 
G
R
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
I
S
 
A
S
|
S
S
 
V
S
 
A
G
 
S
V
 
L
L
 
V
Y
 
A
D
 
F
R
 
P
E
 
G
M
x
R
I
 
S
A
 
A
Y
|
Y
T
 
T
T
 
T
T
 
S
K
|
K
H
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
L
A
 
Q
M
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
S
M
 
V
A
 
A
G
 
V
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
K
 
G
Y
 
S
G
 
G
V
 
I
R
|
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
W
 
M
V
x
I
D
x
E
T
|
T
P
|
P
F
x
M
N
 
T
E
 
Q
P
x
W
F
x
R
I
 
L
D
 
D
Q
 
Q
M
 
P
G
 
E
G
 
L
R
|
R
E
 
D
A
 
Q
I
 
V
E
 
L
A
 
A
Y
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
R
|
R
V
 
I
P
 
P
L
 
Q
G
 
K
R
 
E
W
 
I
A
 
G
S
 
T
V
 
A
D
 
A
E
 
Q
I
 
V
A
 
A
E
 
D
S
 
A
I
 
V
L
 
M
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
G
D
 
E
R
 
D
S
 
A
S
 
T
Y
 
Y
M
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
I
 
A
L
 
L
V
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
A
E
 
Y
T
 
T
V
 
A
V
 
I

Sites not aligning to the query:

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
34% identity, 98% coverage: 1:249/253 of query aligns to 1:244/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
M
I
 
T
L
 
L
N
 
Q
N
 
G
R
 
K
I
 
V
A
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
D
G
 
I
A
 
A
A
 
I
I
 
N
M
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
N
V
 
I
V
 
F
V
 
F
-
x
N
V
x
Y
D
x
N
R
x
G
S
|
S
V
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
E
D
 
E
T
 
T
V
 
A
A
 
K
A
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
E
G
 
H
G
 
G
G
 
V
S
 
E
A
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
M
A
 
K
V
 
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
D
 
I
D
 
A
D
 
E
A
 
D
L
 
V
A
 
D
D
 
A
G
 
F
I
 
F
A
 
K
D
 
Q
I
 
A
L
 
I
Y
 
E
R
 
R
H
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
H
 
V
N
 
N
H
x
N
A
|
A
G
 
G
A
x
I
Q
 
T
V
 
R
A
 
D
G
 
N
D
 
L
L
 
L
E
 
M
E
 
R
V
 
M
E
 
K
V
 
E
A
 
D
G
 
E
F
 
W
D
 
D
R
 
D
S
 
V
W
 
I
N
 
N
L
x
I
N
 
N
V
 
L
R
 
K
A
 
G
H
 
T
F
 
F
M
 
L
A
 
C
A
 
T
R
 
K
L
 
A
V
 
V
M
 
S
P
 
R
S
 
T
M
 
M
K
 
M
K
 
K
A
 
Q
G
 
R
R
 
A
G
 
G
V
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
 
M
S
 
A
S
|
S
S
 
V
S
 
V
G
 
G
V
 
L
L
 
I
Y
 
G
D
 
N
R
 
A
E
 
G
M
x
Q
I
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
 
V
T
 
A
T
 
S
K
|
K
H
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
T
M
 
T
A
 
A
G
 
R
D
 
E
Y
 
L
A
 
A
K
 
P
Y
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
W
 
F
V
x
I
D
 
T
T
|
T
P
 
D
F
 
M
N
 
T
E
 
D
P
 
K
F
 
L
I
 
D
D
 
E
Q
 
K
M
 
T
G
 
-
G
 
-
R
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
M
E
 
L
A
 
A
Y
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
Q
V
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
A
W
 
Y
A
 
G
S
 
T
V
 
T
D
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
N
S
 
A
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
A
S
 
S
S
 
K
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
T
L
 
L
V
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>SMc01635 FitnessBrowser__Smeli:SMc01635
MILNNRIAIVTGAGSGIGRAGAAIMAREGAHVVVVDRSVEAAGDTVAAIAAGGGSAEALA
VDVTDDDALADGIADILYRHGRIDILHNHAGAQVAGDLEEVEVAGFDRSWNLNVRAHFMA
ARLVMPSMKKAGRGVIVNTSSSSGVLYDREMIAYTTTKHAVIAMTRQMAGDYAKYGVRVN
ALCPGWVDTPFNEPFIDQMGGREAIEAYIRERVPLGRWASVDEIAESILFLVSDRSSYMT
GQILVVDGGETVV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory