SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMc01949 SMc01949 high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
32% identity, 87% coverage: 13:270/295 of query aligns to 4:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
I
 
I
L
 
L
K
 
R
V
 
T
E
 
E
R
 
N
L
 
I
S
 
V
M
 
K
R
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
L
x
F
M
 
K
A
 
A
I
 
L
N
 
D
D
 
G
F
 
V
S
 
S
F
 
I
E
 
S
A
 
V
E
 
C
R
 
K
G
 
G
E
 
D
I
 
V
T
 
T
A
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
F
 
I
N
 
N
C
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
F
 
F
Y
 
L
K
 
K
P
 
A
T
 
D
M
 
E
G
 
G
M
 
R
I
 
V
T
 
Y
M
 
F
R
 
E
Q
 
N
K
 
K
S
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
F
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
F
 
-
E
 
D
I
 
I
T
 
T
K
 
N
K
 
K
A
 
E
K
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
Y
-
 
H
-
 
Y
-
 
G
V
 
I
A
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
P
R
 
Q
M
 
P
F
 
L
S
 
K
G
 
E
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
I
A
 
G
Q
 
E
H
 
I
N
 
N
K
 
-
L
 
-
M
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
P
G
 
G
Y
 
E
T
 
S
I
 
P
L
 
L
G
 
N
L
 
S
F
 
L
G
 
F
F
 
Y
P
 
K
A
 
K
Y
 
W
R
 
I
E
 
P
A
 
K
S
 
E
R
 
E
E
 
E
S
 
M
I
 
V
E
 
E
L
 
K
A
 
A
R
 
F
H
 
K
W
 
I
L
 
L
E
 
E
K
 
F
A
 
L
S
 
K
L
 
L
T
 
S
E
 
H
R
 
L
A
 
Y
D
 
D
D
 
R
P
 
K
A
 
A
G
 
G
D
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
A
 
Q
Q
 
M
R
 
K
R
 
L
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
L
C
 
M
T
 
T
G
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
M
L
 
I
C
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
A
P
 
P
R
 
G
E
 
L
S
 
A
L
 
H
A
 
D
L
 
I
N
 
F
A
 
N
L
 
H
L
 
V
Q
 
L
E
 
E
I
 
L
R
 
K
R
 
A
D
 
K
T
 
-
G
 
G
T
 
I
S
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
S
 
D
V
 
I
V
 
V
M
 
L
E
 
N
I
 
Y
S
 
I
D
 
D
H
 
H
V
 
L
V
 
Y
V
 
V
L
 
M
E
 
F
Y
 
N
G
 
G
Q
 
Q
K
 
I
I
 
I
S
 
A
D
 
E
G
 
G
-
 
R
N
 
G
P
 
E
D
 
E
F
 
E
V
 
I
K
 
K
N
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
S
D
 
D
P
 
P
R
 
K
V
 
V
I
 
V
A
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp- binding cassette of an abc transporter (see paper)
32% identity, 87% coverage: 13:270/295 of query aligns to 4:253/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
I
 
I
L
 
L
K
 
R
V
 
T
E
 
E
R
 
N
L
 
I
S
 
V
M
 
K
R
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
L
x
F
M
 
K
A
 
A
I
 
L
N
 
D
D
 
G
F
 
V
S
 
S
F
 
I
E
 
S
A
 
V
E
 
N
R
 
K
G
 
G
E
 
D
I
 
V
T
 
T
A
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
F
 
I
N
 
N
C
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
F
 
F
Y
 
L
K
 
K
P
 
A
T
 
D
M
 
E
G
 
G
M
 
R
I
 
V
T
 
Y
M
 
F
R
 
E
Q
 
N
K
 
K
S
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
F
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
F
 
-
E
 
D
I
 
I
T
 
T
K
 
N
K
 
K
A
 
E
K
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
Y
-
 
H
-
 
Y
-
 
G
V
 
I
A
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
P
R
 
Q
M
 
P
F
 
L
S
 
K
G
 
E
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
I
A
 
G
Q
 
E
H
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
-
M
 
-
R
 
I
A
 
C
S
 
P
G
 
G
Y
 
E
T
 
S
I
 
P
L
 
L
G
 
N
L
 
S
F
 
L
G
 
F
F
 
Y
P
 
K
A
 
K
Y
 
W
R
 
I
E
 
P
A
 
K
S
 
E
R
 
E
E
 
E
S
 
M
I
 
V
E
 
E
L
 
K
A
 
A
R
 
F
H
 
K
W
 
I
L
 
L
E
 
E
K
 
F
A
 
L
S
 
K
L
 
L
T
 
S
E
 
H
R
 
L
A
 
Y
D
 
D
D
 
R
P
 
K
A
 
A
G
 
G
D
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
A
 
Q
Q
 
M
R
 
K
R
 
L
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
L
C
 
M
T
 
T
G
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
M
L
 
I
C
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
A
P
 
P
R
 
G
E
 
L
S
 
A
L
 
H
A
 
D
L
 
I
N
 
F
A
 
N
L
 
H
L
 
V
Q
 
L
E
 
E
I
 
L
R
 
K
R
 
A
D
 
K
T
 
-
G
 
G
T
 
I
S
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
S
 
D
V
 
I
V
 
V
M
 
L
E
 
N
I
 
Y
S
 
I
D
 
D
H
 
H
V
 
L
V
 
Y
V
 
V
L
 
M
E
 
F
Y
 
N
G
 
G
Q
 
Q
K
 
I
I
 
I
S
 
A
D
 
E
G
 
G
-
 
R
N
 
G
P
 
E
D
 
E
F
 
E
V
 
I
K
 
K
N
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
S
D
 
D
P
 
P
R
 
K
V
 
V
I
 
V
A
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

1ji0A Crystal structure analysis of the abc transporter from thermotoga maritima
30% identity, 89% coverage: 8:271/295 of query aligns to 1:239/240 of 1ji0A

query
sites
1ji0A
M
 
M
T
 
V
K
 
S
D
 
D
P
 
I
I
 
V
L
 
L
K
 
E
V
 
V
E
 
Q
R
 
S
L
 
L
S
 
H
M
 
V
R
 
Y
F
x
Y
G
 
G
G
 
A
L
x
I
M
 
H
A
|
A
I
 
I
N
 
K
D
 
G
F
 
I
S
 
D
F
 
L
E
 
K
A
 
V
E
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
T
 
V
A
 
T
L
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
|
N
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
L
N
 
S
C
 
A
I
 
I
T
 
A
G
 
G
F
 
L
Y
 
V
K
 
R
P
 
A
T
 
Q
M
 
K
G
 
G
M
 
K
I
 
I
T
 
I
M
 
F
R
 
N
Q
 
G
K
 
Q
S
 
D
G
 
-
A
 
-
E
 
-
F
 
-
L
 
-
L
 
I
E
 
T
R
 
N
L
 
K
P
 
P
D
 
A
F
 
H
E
 
V
I
 
I
T
 
N
K
 
R
K
 
M
A
 
G
K
 
-
V
 
I
A
 
A
R
 
L
T
 
V
F
 
P
Q
x
E
N
 
G
I
 
R
R
 
R
M
 
I
F
 
F
S
 
P
G
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
L
L
 
M
V
 
M
A
 
G
Q
 
-
H
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
-
M
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
A
Y
 
Y
R
 
N
E
 
R
A
 
K
S
 
D
R
 
K
E
 
E
S
 
G
I
 
I
E
 
K
L
 
R
A
 
D
R
 
L
H
 
E
W
 
W
L
 
I
E
 
F
K
 
S
-
 
L
-
 
F
A
 
P
S
 
R
L
 
L
T
 
K
E
 
E
R
 
R
A
 
L
D
 
K
D
 
Q
P
 
L
A
 
G
G
 
G
D
 
T
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
A
 
E
Q
 
Q
R
 
Q
R
 
M
L
 
L
E
 
A
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
L
C
 
M
T
 
S
G
 
R
P
 
P
E
 
K
L
 
L
L
 
L
C
 
M
L
 
M
D
|
D
E
|
E
P
 
P
A
 
S
A
 
L
G
 
G
L
 
L
N
 
A
P
 
P
R
 
I
E
 
L
S
 
V
L
 
S
A
 
E
L
 
V
N
 
F
A
 
E
L
 
V
L
 
I
Q
 
Q
E
 
K
I
 
I
R
 
N
R
 
Q
D
 
E
T
 
-
G
 
G
T
 
T
S
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
V
E
 
E
H
 
Q
D
 
N
M
 
A
S
 
L
V
 
G
V
 
A
M
 
L
E
 
K
I
 
V
S
 
A
D
 
H
H
 
Y
V
 
G
V
 
Y
V
 
V
L
 
L
E
 
E
Y
 
T
G
 
G
Q
 
Q
K
 
I
I
 
V
S
 
L
D
 
E
G
 
G
N
 
K
P
 
A
D
 
S
F
 
E
V
 
L
K
 
L
N
 
D
D
 
N
P
 
E
R
 
M
V
 
V
I
 
R
A
 
K
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
V
 
V

4yerA Crystal structure of an abc transporter atp-binding protein (tm_1403) from thermotoga maritima msb8 at 2.35 a resolution
29% identity, 91% coverage: 13:279/295 of query aligns to 4:259/285 of 4yerA

query
sites
4yerA
I
 
I
L
 
I
K
 
V
V
 
V
E
 
E
R
 
N
L
 
L
S
 
V
M
 
K
R
 
K
F
|
F
G
 
G
G
 
D
L
x
F
M
 
E
A
|
A
I
 
V
N
 
K
D
 
G
F
 
V
S
 
S
F
 
F
E
 
S
A
 
V
E
 
K
R
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
I
T
 
F
A
 
A
L
 
F
I
 
L
G
 
G
P
|
P
N
|
N
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
I
N
 
H
C
 
M
I
 
L
T
 
T
G
 
T
F
 
L
Y
 
L
K
 
K
P
 
P
T
 
T
M
 
S
G
 
G
M
 
K
I
 
A
T
 
W
M
 
V
R
 
-
Q
 
-
K
 
-
S
 
A
G
 
G
A
 
H
E
 
D
F
 
V
L
 
L
L
 
K
E
 
E
R
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
P
F
 
R
E
 
E
I
 
V
T
 
-
K
 
-
K
 
R
A
 
R
K
 
K
V
 
I
A
 
G
R
 
I
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
D
I
 
Q
R
 
S
M
 
L
F
 
D
S
 
R
G
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
M
L
 
Y
V
 
I
A
 
-
Q
 
-
H
 
H
N
 
G
K
 
K
L
 
I
M
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
Y
G
 
G
F
 
Y
P
 
G
A
 
G
Y
 
E
R
 
K
E
 
L
A
 
K
S
 
K
R
 
R
E
 
I
S
 
L
I
 
E
E
 
L
L
 
L
A
 
E
R
 
-
H
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
F
A
 
V
S
 
E
L
 
L
T
 
L
E
 
E
R
 
F
A
 
K
D
 
D
D
 
K
P
 
P
A
 
V
G
 
K
D
x
T
L
x
F
P
x
S
Y
 
G
G
 
G
A
 
M
Q
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
L
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
S
M
 
L
C
 
I
T
 
H
G
 
E
P
 
P
E
 
E
L
 
V
L
 
L
C
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
A
 
I
G
 
G
L
 
L
N
 
D
P
 
P
R
 
H
E
 
T
S
 
R
L
 
A
A
 
H
L
 
M
N
 
W
A
 
E
L
 
Y
L
 
I
Q
 
S
E
 
K
I
 
M
R
 
K
R
 
K
D
 
E
T
 
H
G
 
N
T
 
M
S
 
T
I
 
I
L
 
F
L
 
L
I
 
T
E
 
T
H
 
H
D
 
Y
M
 
M
S
 
D
V
 
E
V
 
A
M
 
E
E
 
Q
I
 
L
S
 
A
D
 
D
H
 
R
V
 
V
V
 
A
V
 
I
L
 
I
E
 
D
Y
 
H
G
 
G
Q
 
K
K
 
I
I
 
I
S
 
A
D
 
L
G
 
G
N
 
T
P
 
P
-
 
T
-
 
E
-
 
L
-
 
K
-
 
R
-
 
M
-
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
Y
-
 
V
-
 
R
D
 
D
F
 
F
V
 
I
K
 
E
N
 
S
D
 
C
P
 
R
R
 
K
V
 
L
I
 
P
A
 
D
A
 
G
Y
 
R
L
 
L
G
 
E
V
 
L
E
 
N
D
 
V
E
 
E
E
 
D
V
 
I
E
 
E
E
 
E
V
 
I

2d62A Crystal structure of multiple sugar binding transport atp- binding protein
27% identity, 87% coverage: 14:270/295 of query aligns to 7:244/375 of 2d62A

query
sites
2d62A
L
 
V
K
 
K
V
 
L
E
 
I
R
 
N
L
 
I
S
 
W
M
 
K
R
 
R
F
 
F
G
 
G
G
 
D
L
 
V
M
 
T
A
 
A
I
 
V
N
 
K
D
 
D
F
 
L
S
 
S
F
 
L
E
 
E
A
 
I
E
 
K
R
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
F
T
 
L
A
 
V
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
|
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
L
N
 
R
C
 
M
I
 
I
T
 
A
G
 
G
F
 
L
Y
 
E
K
 
E
P
 
P
T
 
T
M
 
R
G
 
G
M
 
Q
I
 
I
T
 
Y
M
 
I
R
 
E
Q
 
D
K
 
N
S
 
L
G
 
V
A
 
A
E
 
D
F
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
P
D
 
E
-
 
K
-
 
G
-
 
V
F
 
F
E
 
V
I
 
P
T
 
P
K
 
K
K
 
E
A
 
R
K
 
D
V
 
V
A
 
A
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
Y
R
 
A
M
 
L
F
 
Y
S
 
P
G
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
I
L
 
-
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
-
M
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
A
F
 
F
P
 
P
-
 
L
A
 
K
Y
 
L
R
 
R
E
 
K
A
 
V
S
 
P
R
 
K
E
 
Q
S
 
E
I
 
I
E
 
D
-
 
K
L
 
R
A
 
V
R
 
R
H
 
E
W
 
V
L
 
A
E
 
E
K
 
M
A
 
L
S
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
E
R
 
L
A
 
L
D
 
N
D
 
R
P
 
K
A
 
P
G
 
R
D
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
A
 
Q
Q
 
R
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
I
C
 
I
T
 
R
G
 
R
P
 
P
E
 
K
L
 
V
L
 
F
C
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
L
A
 
S
G
 
N
L
 
L
N
 
D
P
 
A
R
 
K
E
 
L
S
 
R
L
 
V
A
 
K
L
 
M
N
 
R
A
 
A
L
 
E
L
 
L
Q
 
K
E
 
K
I
 
L
R
 
Q
R
 
R
D
 
Q
T
 
L
G
 
G
T
 
V
S
 
T
I
 
T
L
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
S
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
E
 
T
I
 
M
S
 
G
D
 
D
H
 
R
V
 
I
V
 
A
V
 
V
L
 
M
E
 
N
Y
 
K
G
 
G
Q
 
E
K
 
L
I
 
Q
S
 
Q
D
 
V
G
 
G
N
 
T
P
 
P
D
 
D
F
 
E
V
 
V
K
 
Y
N
 
Y
D
 
K
P
 
P
-
 
V
-
 
N
R
 
T
V
 
F
I
 
V
A
 
A
A
 
G
Y
 
F
L
 
I
G
 
G

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
31% identity, 81% coverage: 26:263/295 of query aligns to 18:233/343 of P30750

query
sites
P30750
L
 
I
M
 
Q
A
 
A
I
 
L
N
 
N
D
 
N
F
 
V
S
 
S
F
 
L
E
 
H
A
 
V
E
 
P
R
 
A
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
T
 
Y
A
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
F
 
I
N
 
R
C
 
C
I
 
V
T
 
N
G
 
L
F
 
L
Y
 
E
K
 
R
P
 
P
T
 
T
M
 
E
G
 
G
M
 
S
I
 
V
T
 
L
M
 
V
R
 
-
Q
 
-
K
 
-
S
 
D
G
 
G
A
 
Q
E
 
E
F
 
-
L
 
-
L
 
L
E
 
T
R
 
T
L
 
L
P
 
S
D
 
E
F
 
S
E
 
E
I
 
L
T
 
T
K
 
K
-
 
A
K
 
R
A
 
R
K
 
Q
V
 
I
A
 
G
R
 
M
T
 
I
F
 
F
Q
 
Q
N
 
H
I
 
F
R
 
N
M
 
L
F
 
L
S
 
S
G
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
F
E
 
G
N
 
N
L
 
V
L
 
A
V
 
L
A
 
P
Q
 
-
H
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
-
M
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
L
G
 
E
L
 
L
F
 
D
G
 
N
F
 
T
P
 
P
A
 
K
Y
 
-
R
 
D
E
 
E
A
 
V
S
 
K
R
 
R
E
 
R
S
 
V
I
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
-
R
 
-
H
 
-
W
 
-
L
 
L
E
 
S
K
 
L
A
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
G
E
 
D
R
 
K
A
 
H
D
 
D
D
 
S
P
 
Y
A
 
P
G
 
S
D
 
N
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
A
 
Q
Q
 
K
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
L
C
 
A
T
 
S
G
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
V
L
 
L
C
 
L
L
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
A
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
N
 
D
P
 
P
R
 
A
E
 
T
S
 
T
L
 
R
A
 
S
L
 
I
N
 
L
A
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
E
 
D
I
 
I
R
 
N
R
 
R
D
 
R
T
 
L
G
 
G
T
 
L
S
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
S
 
D
V
 
V
V
 
V
M
 
K
E
 
R
I
 
I
S
 
C
D
 
D
H
 
C
V
 
V
V
 
A
V
 
V
L
 
I
E
 
S
Y
 
N
G
 
G
Q
 
E
K
 
L
I
 
I
S
 
E
D
 
Q
G
 
D
N
 
T
P
 
V
D
 
S
F
 
E
V
 
V
K
 
F
N
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
K

Sites not aligning to the query:

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
26% identity, 79% coverage: 23:256/295 of query aligns to 11:221/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
|
L
M
 
E
A
x
V
I
 
L
N
 
K
D
 
G
F
 
V
S
 
T
F
 
L
E
 
K
A
 
V
E
 
N
R
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
V
T
 
V
A
 
V
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
F
 
L
N
 
R
C
 
C
I
 
I
T
 
N
G
 
L
F
 
L
Y
x
E
K
 
E
P
 
P
T
 
T
M
 
K
G
 
G
M
 
E
I
 
V
T
 
F
M
 
I
R
 
-
Q
 
-
K
 
-
S
 
D
G
 
G
A
 
V
E
 
K
F
 
I
L
 
N
L
 
N
E
 
G
R
 
K
L
 
V
P
 
-
D
 
-
F
 
-
E
 
N
I
 
I
T
 
N
K
 
K
-
 
V
K
 
R
A
 
Q
K
 
K
V
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
H
I
 
F
R
 
N
M
 
L
F
 
F
S
 
P
G
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
I
E
 
E
N
 
N
L
 
I
L
 
T
V
 
L
A
 
A
Q
 
P
H
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
-
M
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
V
P
 
K
A
 
V
Y
 
K
R
 
K
E
 
M
A
 
N
S
 
K
R
 
K
E
 
E
S
 
A
I
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
V
H
 
D
W
 
L
L
 
L
E
 
A
K
 
K
A
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
L
E
 
D
R
 
K
A
 
K
D
 
D
D
 
Q
P
 
Y
A
 
P
G
 
I
D
 
K
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
A
 
Q
Q
 
K
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
L
C
 
A
T
 
M
G
 
Q
P
 
P
E
 
E
L
 
V
L
 
M
C
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
N
 
D
P
 
P
R
 
E
E
 
M
S
 
V
L
 
K
A
 
E
L
 
V
N
 
L
A
 
N
L
 
V
L
 
M
Q
 
K
E
 
Q
I
 
L
R
 
A
R
 
N
D
 
E
T
 
-
G
 
G
T
 
M
S
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
I
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
E
M
 
M
S
 
G
V
 
F
V
 
A
M
 
R
E
 
E
I
 
V
S
 
G
D
 
D
H
 
R
V
 
V
V
 
I
V
 
F
L
 
M
E
 
D
Y
 
D
G
 
G
Q
 
V
K
 
I
I
 
V
S
 
E
D
 
E
G
 
G
N
 
T
P
 
P
D
 
E

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
30% identity, 81% coverage: 26:263/295 of query aligns to 19:234/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
L
x
I
M
 
Q
A
 
A
I
 
L
N
 
N
D
 
N
F
 
V
S
 
S
F
 
L
E
 
H
A
 
V
E
 
P
R
 
A
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
T
 
Y
A
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
F
 
I
N
 
R
C
 
C
I
 
V
T
 
N
G
 
L
F
 
L
Y
 
E
K
 
R
P
 
P
T
 
T
M
 
E
G
 
G
M
 
S
I
 
V
T
 
L
M
 
V
R
 
-
Q
 
-
K
 
-
S
 
D
G
 
G
A
 
Q
E
 
E
F
 
-
L
 
-
L
 
L
E
 
T
R
 
T
L
 
L
P
 
S
D
 
E
F
 
S
E
 
E
I
 
L
T
 
T
K
 
K
-
 
A
K
 
R
A
 
R
K
 
Q
V
 
I
A
 
G
R
 
M
T
 
I
F
 
F
Q
 
Q
N
 
H
I
 
F
R
 
N
M
 
L
F
 
L
S
 
S
G
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
F
E
 
G
N
 
N
L
 
V
L
 
A
V
 
L
A
 
P
Q
 
-
H
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
-
M
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
L
G
 
E
L
 
L
F
 
D
G
 
N
F
 
T
P
 
P
A
 
K
Y
 
-
R
 
D
E
 
E
A
 
V
S
 
K
R
 
R
E
 
R
S
 
V
I
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
-
R
 
-
H
 
-
W
 
-
L
 
L
E
 
S
K
 
L
A
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
G
E
 
D
R
 
K
A
 
H
D
 
D
D
 
S
P
 
Y
A
 
P
G
 
S
D
x
N
L
|
L
P
x
S
Y
x
G
G
|
G
A
x
Q
Q
 
K
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
L
C
 
A
T
 
S
G
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
V
L
 
L
C
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
A
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
N
 
D
P
 
P
R
 
A
E
 
T
S
 
T
L
 
R
A
 
S
L
 
I
N
 
L
A
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
E
 
D
I
 
I
R
 
N
R
 
R
D
 
R
T
 
L
G
 
G
T
 
L
S
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
T
H
|
H
D
 
E
M
 
M
S
 
D
V
 
V
V
 
V
M
 
K
E
 
R
I
 
I
S
 
C
D
 
D
H
 
C
V
 
V
V
 
A
V
 
V
L
 
I
E
 
S
Y
 
N
G
 
G
Q
 
E
K
 
L
I
 
I
S
 
E
D
 
Q
G
 
D
N
 
T
P
 
V
D
 
S
F
 
E
V
 
V
K
 
F
N
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
K

Sites not aligning to the query:

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
30% identity, 81% coverage: 26:263/295 of query aligns to 19:234/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
L
 
I
M
 
Q
A
|
A
I
 
L
N
 
N
D
 
N
F
 
V
S
 
S
F
 
L
E
 
H
A
 
V
E
 
P
R
 
A
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
T
 
Y
A
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
F
 
I
N
 
R
C
 
C
I
 
V
T
 
N
G
 
L
F
 
L
Y
 
E
K
 
R
P
 
P
T
 
T
M
 
E
G
 
G
M
 
S
I
 
V
T
 
L
M
 
V
R
 
-
Q
 
-
K
 
-
S
 
D
G
 
G
A
 
Q
E
 
E
F
 
-
L
 
-
L
 
L
E
 
T
R
 
T
L
 
L
P
 
S
D
 
E
F
 
S
E
 
E
I
 
L
T
 
T
K
 
K
-
 
A
K
 
R
A
 
R
K
 
Q
V
 
I
A
 
G
R
 
M
T
 
I
F
 
F
Q
 
Q
N
 
H
I
 
F
R
 
N
M
 
L
F
 
L
S
 
S
G
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
F
E
 
G
N
 
N
L
 
V
L
 
A
V
 
L
A
 
P
Q
 
-
H
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
-
M
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
L
G
 
E
L
 
L
F
 
D
G
 
N
F
 
T
P
 
P
A
 
K
Y
 
-
R
 
D
E
 
E
A
 
V
S
 
K
R
 
R
E
 
R
S
 
V
I
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
-
R
 
-
H
 
-
W
 
-
L
 
L
E
 
S
K
 
L
A
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
G
E
 
D
R
 
K
A
 
H
D
 
D
D
 
S
P
 
Y
A
 
P
G
 
S
D
 
N
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
A
 
Q
Q
 
K
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
L
C
 
A
T
 
S
G
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
V
L
 
L
C
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
A
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
N
 
D
P
 
P
R
 
A
E
 
T
S
 
T
L
 
R
A
 
S
L
 
I
N
 
L
A
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
E
 
D
I
 
I
R
 
N
R
 
R
D
 
R
T
 
L
G
 
G
T
 
L
S
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
S
 
D
V
 
V
V
 
V
M
 
K
E
 
R
I
 
I
S
 
C
D
 
D
H
 
C
V
 
V
V
 
A
V
 
V
L
 
I
E
 
S
Y
 
N
G
 
G
Q
 
E
K
 
L
I
 
I
S
 
E
D
 
Q
G
 
D
N
 
T
P
 
V
D
 
S
F
 
E
V
 
V
K
 
F
N
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
K

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
30% identity, 81% coverage: 26:263/295 of query aligns to 19:234/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
L
 
I
M
 
Q
A
 
A
I
 
L
N
 
N
D
 
N
F
 
V
S
 
S
F
 
L
E
 
H
A
 
V
E
 
P
R
 
A
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
T
 
Y
A
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
F
 
I
N
 
R
C
 
C
I
 
V
T
 
N
G
 
L
F
 
L
Y
 
E
K
 
R
P
 
P
T
 
T
M
 
E
G
 
G
M
 
S
I
 
V
T
 
L
M
 
V
R
 
-
Q
 
-
K
 
-
S
 
D
G
 
G
A
 
Q
E
 
E
F
 
-
L
 
-
L
 
L
E
 
T
R
 
T
L
 
L
P
 
S
D
 
E
F
 
S
E
 
E
I
 
L
T
 
T
K
 
K
-
 
A
K
 
R
A
 
R
K
 
Q
V
 
I
A
 
G
R
 
M
T
 
I
F
 
F
Q
 
Q
N
 
H
I
 
F
R
 
N
M
 
L
F
 
L
S
 
S
G
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
F
E
 
G
N
 
N
L
 
V
L
 
A
V
 
L
A
 
P
Q
 
-
H
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
-
M
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
L
G
 
E
L
 
L
F
 
D
G
 
N
F
 
T
P
 
P
A
 
K
Y
 
-
R
 
D
E
 
E
A
 
V
S
 
K
R
 
R
E
 
R
S
 
V
I
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
-
R
 
-
H
 
-
W
 
-
L
 
L
E
 
S
K
 
L
A
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
G
E
 
D
R
 
K
A
 
H
D
 
D
D
 
S
P
 
Y
A
 
P
G
 
S
D
 
N
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
A
 
Q
Q
 
K
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
L
C
 
A
T
 
S
G
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
V
L
 
L
C
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
A
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
N
 
D
P
 
P
R
 
A
E
 
T
S
 
T
L
 
R
A
 
S
L
 
I
N
 
L
A
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
E
 
D
I
 
I
R
 
N
R
 
R
D
 
R
T
 
L
G
 
G
T
 
L
S
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
S
 
D
V
 
V
V
 
V
M
 
K
E
 
R
I
 
I
S
 
C
D
 
D
H
 
C
V
 
V
V
 
A
V
 
V
L
 
I
E
 
S
Y
 
N
G
 
G
Q
 
E
K
 
L
I
 
I
S
 
E
D
 
Q
G
 
D
N
 
T
P
 
V
D
 
S
F
 
E
V
 
V
K
 
F
N
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
K

Sites not aligning to the query:

1oxvD Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
28% identity, 90% coverage: 24:289/295 of query aligns to 16:250/353 of 1oxvD

query
sites
1oxvD
G
 
G
G
 
K
L
x
V
M
 
V
A
|
A
I
 
L
N
 
D
D
 
N
F
 
V
S
 
N
F
 
I
E
 
N
A
 
I
E
 
E
R
 
N
G
 
G
E
 
E
I
 
R
T
 
F
A
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
P
|
P
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
F
F
 
M
N
 
R
C
 
I
I
 
I
T
 
A
G
 
G
F
 
L
Y
 
D
K
 
V
P
 
P
T
 
S
M
 
T
G
 
G
M
 
E
I
 
L
T
 
Y
M
 
F
R
 
D
Q
 
D
K
 
R
S
 
L
G
 
V
A
 
A
E
 
S
F
 
N
L
 
G
L
 
K
E
 
L
R
 
I
L
 
V
P
 
P
D
 
-
F
 
-
E
 
-
I
 
-
T
 
P
K
 
E
K
 
D
A
 
R
K
 
K
V
 
I
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
T
I
 
W
R
 
A
M
 
L
F
 
Y
S
 
P
G
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
I
L
 
A
V
 
F
A
 
P
Q
 
L
H
 
T
N
 
N
K
 
-
L
 
-
M
 
M
R
 
K
A
 
M
S
 
S
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
 
-
R
 
K
E
 
E
A
 
E
S
 
I
R
 
R
E
 
K
S
 
R
I
 
V
E
 
E
L
 
E
A
 
V
R
 
A
H
 
K
W
 
I
L
 
L
E
 
D
K
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
I
T
 
H
E
 
H
R
 
V
A
 
L
D
 
N
D
 
H
P
 
F
A
 
P
G
 
R
D
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
L
C
 
V
T
 
K
G
 
D
P
 
P
E
 
S
L
 
L
L
 
L
C
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
F
A
 
S
G
 
N
L
 
L
N
 
D
P
 
A
R
 
R
E
 
M
S
 
R
L
 
D
A
 
S
L
 
A
N
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
Q
 
K
E
 
E
I
 
V
R
 
Q
R
 
S
D
 
R
T
 
L
G
 
G
T
 
V
S
 
T
I
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
S
 
A
V
 
D
V
 
I
M
 
F
E
 
A
I
 
I
S
 
A
D
 
D
H
 
R
V
 
V
V
 
G
V
 
V
L
 
L
E
 
V
Y
 
K
G
 
G
Q
 
K
K
 
L
I
 
V
S
 
Q
D
 
V
G
 
G
N
 
K
P
 
P
D
 
E
F
 
D
V
 
L
K
 
Y
N
 
D
D
 
N
P
 
P
R
 
V
V
 
S
I
 
I
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
-
E
 
-
E
 
Q
V
 
V
E
 
A
E
 
S
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
I
E
 
N
E
 
E
I
 
L
E
 
E
G
 
G
E
 
K

Sites not aligning to the query:

1oxvA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
28% identity, 90% coverage: 24:289/295 of query aligns to 16:250/353 of 1oxvA

query
sites
1oxvA
G
 
G
G
 
K
L
x
V
M
 
V
A
|
A
I
 
L
N
 
D
D
 
N
F
 
V
S
 
N
F
 
I
E
 
N
A
 
I
E
 
E
R
 
N
G
 
G
E
 
E
I
 
R
T
 
F
A
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
P
|
P
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
F
F
 
M
N
 
R
C
 
I
I
 
I
T
 
A
G
 
G
F
 
L
Y
 
D
K
 
V
P
 
P
T
 
S
M
 
T
G
 
G
M
 
E
I
 
L
T
 
Y
M
 
F
R
 
D
Q
 
D
K
 
R
S
 
L
G
 
V
A
 
A
E
 
S
F
 
N
L
 
G
L
 
K
E
 
L
R
 
I
L
 
V
P
 
P
D
 
-
F
 
-
E
 
-
I
 
-
T
 
P
K
 
E
K
 
D
A
 
R
K
 
K
V
 
I
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
W
R
 
A
M
 
L
F
 
Y
S
 
P
G
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
I
L
 
A
V
 
F
A
 
P
Q
 
L
H
 
T
N
 
N
K
 
-
L
 
-
M
 
M
R
 
K
A
 
M
S
 
S
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
 
-
R
 
K
E
 
E
A
 
E
S
 
I
R
 
R
E
 
K
S
 
R
I
 
V
E
 
E
L
 
E
A
 
V
R
 
A
H
 
K
W
 
I
L
 
L
E
 
D
K
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
I
T
 
H
E
 
H
R
 
V
A
 
L
D
 
N
D
 
H
P
 
F
A
 
P
G
 
R
D
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
L
C
 
V
T
 
K
G
 
D
P
 
P
E
 
S
L
 
L
L
 
L
C
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
F
A
 
S
G
 
N
L
 
L
N
 
D
P
 
A
R
 
R
E
 
M
S
 
R
L
 
D
A
 
S
L
 
A
N
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
Q
 
K
E
 
E
I
 
V
R
 
Q
R
 
S
D
 
R
T
 
L
G
 
G
T
 
V
S
 
T
I
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
S
 
A
V
 
D
V
 
I
M
 
F
E
 
A
I
 
I
S
 
A
D
 
D
H
 
R
V
 
V
V
 
G
V
 
V
L
 
L
E
 
V
Y
 
K
G
 
G
Q
 
K
K
 
L
I
 
V
S
 
Q
D
 
V
G
 
G
N
 
K
P
 
P
D
 
E
F
 
D
V
 
L
K
 
Y
N
 
D
D
 
N
P
 
P
R
 
V
V
 
S
I
 
I
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
-
E
 
-
E
 
Q
V
 
V
E
 
A
E
 
S
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
I
E
 
N
E
 
E
I
 
L
E
 
E
G
 
G
E
 
K

Sites not aligning to the query:

1oxuA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
28% identity, 90% coverage: 24:289/295 of query aligns to 16:250/353 of 1oxuA

query
sites
1oxuA
G
 
G
G
 
K
L
 
V
M
 
V
A
|
A
I
 
L
N
 
D
D
 
N
F
 
V
S
 
N
F
 
I
E
 
N
A
 
I
E
 
E
R
 
N
G
 
G
E
 
E
I
 
R
T
 
F
A
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
F
F
 
M
N
 
R
C
 
I
I
 
I
T
 
A
G
 
G
F
 
L
Y
 
D
K
 
V
P
 
P
T
 
S
M
 
T
G
 
G
M
 
E
I
 
L
T
 
Y
M
 
F
R
 
D
Q
 
D
K
 
R
S
 
L
G
 
V
A
 
A
E
 
S
F
 
N
L
 
G
L
 
K
E
 
L
R
 
I
L
 
V
P
 
P
D
 
-
F
 
-
E
 
-
I
 
-
T
 
P
K
 
E
K
 
D
A
 
R
K
 
K
V
 
I
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
W
R
 
A
M
 
L
F
 
Y
S
 
P
G
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
I
L
 
A
V
 
F
A
 
P
Q
 
L
H
 
T
N
 
N
K
 
-
L
 
-
M
 
M
R
 
K
A
 
M
S
 
S
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
 
-
R
 
K
E
 
E
A
 
E
S
 
I
R
 
R
E
 
K
S
 
R
I
 
V
E
 
E
L
 
E
A
 
V
R
 
A
H
 
K
W
 
I
L
 
L
E
 
D
K
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
I
T
 
H
E
 
H
R
 
V
A
 
L
D
 
N
D
 
H
P
 
F
A
 
P
G
 
R
D
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
L
C
 
V
T
 
K
G
 
D
P
 
P
E
 
S
L
 
L
L
 
L
C
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
S
G
 
N
L
 
L
N
 
D
P
 
A
R
 
R
E
 
M
S
 
R
L
 
D
A
 
S
L
 
A
N
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
Q
 
K
E
 
E
I
 
V
R
 
Q
R
 
S
D
 
R
T
 
L
G
 
G
T
 
V
S
 
T
I
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
S
 
A
V
 
D
V
 
I
M
 
F
E
 
A
I
 
I
S
 
A
D
 
D
H
 
R
V
 
V
V
 
G
V
 
V
L
 
L
E
 
V
Y
 
K
G
 
G
Q
 
K
K
 
L
I
 
V
S
 
Q
D
 
V
G
 
G
N
 
K
P
 
P
D
 
E
F
 
D
V
 
L
K
 
Y
N
 
D
D
 
N
P
 
P
R
 
V
V
 
S
I
 
I
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
-
E
 
-
E
 
Q
V
 
V
E
 
A
E
 
S
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
I
E
 
N
E
 
E
I
 
L
E
 
E
G
 
G
E
 
K

Sites not aligning to the query:

Q97UY8 Glucose import ATP-binding protein GlcV; EC 7.5.2.- from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
28% identity, 90% coverage: 24:289/295 of query aligns to 16:250/353 of Q97UY8

query
sites
Q97UY8
G
 
G
G
 
K
L
 
V
M
 
V
A
 
A
I
 
L
N
 
D
D
 
N
F
 
V
S
 
N
F
 
I
E
 
N
A
 
I
E
 
E
R
 
N
G
 
G
E
 
E
I
 
R
T
 
F
A
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
V
 
F
F
 
M
N
 
R
C
 
I
I
 
I
T
 
A
G
 
G
F
 
L
Y
 
D
K
 
V
P
 
P
T
 
S
M
 
T
G
 
G
M
 
E
I
 
L
T
 
Y
M
 
F
R
 
D
Q
 
D
K
 
R
S
 
L
G
 
V
A
 
A
E
 
S
F
 
N
L
 
G
L
 
K
E
 
L
R
 
I
L
 
V
P
 
P
D
 
-
F
 
-
E
 
-
I
 
-
T
 
P
K
 
E
K
 
D
A
 
R
K
 
K
V
 
I
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
W
R
 
A
M
 
L
F
 
Y
S
 
P
G
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
I
L
 
A
V
 
F
A
 
P
Q
 
L
H
 
T
N
 
N
K
 
-
L
 
-
M
 
M
R
 
K
A
 
M
S
 
S
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
 
-
R
 
K
E
 
E
A
 
E
S
 
I
R
 
R
E
 
K
S
 
R
I
 
V
E
 
E
L
 
E
A
 
V
R
 
A
H
 
K
W
 
I
L
 
L
E
 
D
K
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
I
T
 
H
E
 
H
R
 
V
A
 
L
D
 
N
D
 
H
P
 
F
A
 
P
G
 
R
D
 
E
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
|
G
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
L
C
 
V
T
 
K
G
 
D
P
 
P
E
 
S
L
 
L
L
 
L
C
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
F
A
 
S
G
 
N
L
 
L
N
 
D
P
 
A
R
 
R
E
 
M
S
 
R
L
 
D
A
 
S
L
 
A
N
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
Q
 
K
E
 
E
I
 
V
R
 
Q
R
 
S
D
 
R
T
 
L
G
 
G
T
 
V
S
 
T
I
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
S
 
A
V
 
D
V
 
I
M
 
F
E
 
A
I
 
I
S
 
A
D
 
D
H
 
R
V
 
V
V
 
G
V
 
V
L
 
L
E
 
V
Y
 
K
G
 
G
Q
 
K
K
 
L
I
 
V
S
 
Q
D
 
V
G
 
G
N
 
K
P
 
P
D
 
E
F
 
D
V
 
L
K
 
Y
N
 
D
D
 
N
P
 
P
R
 
V
V
 
S
I
 
I
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
-
E
 
-
E
 
Q
V
 
V
E
 
A
E
 
S
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
I
E
 
N
E
 
E
I
 
L
E
 
E
G
 
G
E
 
K

1g291 Malk (see paper)
27% identity, 84% coverage: 23:270/295 of query aligns to 13:241/372 of 1g291

query
sites
1g291
F
 
F
G
 
G
G
 
E
L
 
V
M
 
T
A
 
A
I
 
V
N
 
R
D
 
E
F
 
M
S
 
S
F
 
L
E
 
E
A
 
V
E
 
K
R
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
F
T
 
M
A
 
I
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
|
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
L
N
 
R
C
 
M
I
 
I
T
 
A
G
 
G
F
 
L
Y
 
E
K
 
E
P
 
P
T
 
S
M
 
R
G
 
G
M
 
Q
I
 
I
T
 
Y
M
 
I
R
 
G
Q
 
D
K
 
K
S
 
L
G
 
V
A
 
A
E
x
D
F
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
P
D
x
E
-
x
K
-
 
G
-
 
I
F
 
F
E
 
V
I
 
P
T
 
P
K
|
K
K
x
D
A
 
R
K
 
D
V
 
I
A
 
A
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
Y
R
 
A
M
 
L
F
 
Y
S
 
P
G
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
I
L
 
-
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
-
M
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
A
F
 
F
P
 
P
-
 
L
A
 
K
Y
 
L
R
 
R
E
 
K
A
 
V
S
 
P
R
 
R
E
 
Q
S
 
E
I
 
I
-
 
D
E
 
Q
L
 
R
A
 
V
R
 
R
H
 
E
W
 
V
L
 
A
E
 
E
K
 
L
A
 
L
S
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
E
R
 
L
A
 
L
D
 
N
D
 
R
P
 
K
A
 
P
G
 
R
D
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
A
 
Q
Q
 
R
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
I
C
 
V
T
 
R
G
 
K
P
 
P
E
 
Q
L
 
V
L
 
F
C
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
L
A
 
S
G
 
N
L
 
L
N
 
D
P
 
A
R
 
K
E
 
L
S
 
R
L
 
V
A
 
R
L
 
M
N
 
R
A
 
A
L
 
E
L
 
L
Q
 
K
E
 
K
I
 
L
R
 
Q
R
 
R
D
 
Q
T
 
L
G
 
G
T
 
V
S
 
T
I
 
T
L
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
S
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
E
 
T
I
 
M
S
 
G
D
 
D
H
 
R
V
 
I
V
 
A
V
 
V
L
 
M
E
 
N
Y
 
R
G
 
G
Q
 
V
K
 
L
I
 
Q
S
 
Q
D
 
V
G
 
G
N
 
S
P
 
P
D
 
D
F
 
E
V
 
V
K
x
Y
N
x
D
D
 
K
P
 
P
-
 
A
-
 
N
R
 
T
V
 
F
I
 
V
A
 
A
A
 
G
Y
 
F
L
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1vciA Crystal structure of the atp-binding cassette of multisugar transporter from pyrococcus horikoshii ot3 complexed with atp (see paper)
25% identity, 90% coverage: 14:279/295 of query aligns to 7:239/353 of 1vciA

query
sites
1vciA
L
 
V
K
 
K
V
 
L
E
 
E
R
 
N
L
 
L
S
 
T
M
 
K
R
 
R
F
|
F
G
 
G
G
 
N
L
x
F
M
 
T
A
 
A
I
 
V
N
 
N
D
 
K
F
 
L
S
 
N
F
 
L
E
 
T
A
 
I
E
 
K
R
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
F
T
 
L
A
 
V
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
|
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
L
N
 
R
C
 
M
I
 
I
T
 
A
G
 
G
F
 
L
Y
 
E
K
 
E
P
 
P
T
 
T
M
 
E
G
 
G
M
 
R
I
 
I
T
 
Y
M
 
F
R
 
G
Q
 
D
K
 
R
S
 
D
G
 
-
A
 
-
E
 
-
F
 
-
L
 
-
L
 
V
E
 
T
R
 
Y
L
 
L
P
 
P
D
 
-
F
 
-
E
 
-
I
 
-
T
 
P
K
 
K
K
 
D
A
 
R
K
 
N
V
 
I
A
 
S
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
H
I
 
-
R
 
-
M
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
I
L
 
-
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
-
M
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
A
F
 
F
P
 
P
A
 
L
Y
 
K
R
 
K
E
 
F
A
 
P
S
 
K
R
 
D
E
 
E
S
 
I
I
 
D
E
 
K
L
 
R
A
 
V
R
 
R
H
 
W
W
 
A
L
 
A
E
 
E
K
 
L
A
 
L
S
 
Q
L
 
I
T
 
E
E
 
E
R
 
L
A
 
L
D
 
N
D
 
R
P
 
Y
A
 
P
G
 
A
D
 
Q
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
A
 
Q
Q
 
R
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
I
C
 
V
T
 
V
G
 
E
P
 
P
E
 
D
L
 
V
L
 
L
C
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
L
A
 
S
G
 
N
L
 
L
N
 
D
P
 
A
R
 
K
E
 
L
S
 
R
L
 
V
A
 
A
L
 
M
N
 
R
A
 
A
L
 
E
L
 
I
Q
 
K
E
 
K
I
 
L
R
 
Q
R
 
Q
D
 
K
T
 
L
G
 
K
T
 
V
S
 
T
I
 
T
L
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
S
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
E
 
T
I
 
M
S
 
G
D
 
D
H
 
R
V
 
I
V
 
A
V
 
V
L
 
M
E
 
N
Y
 
R
G
 
G
Q
 
Q
K
 
L
I
 
L
S
 
Q
D
 
I
G
 
G
N
 
S
P
 
P
D
 
T
-
 
E
-
 
V
F
 
Y
V
 
L
K
 
R
N
 
P
D
 
N
P
 
S
R
 
V
V
 
F
I
 
V
A
 
A
A
 
T
Y
 
F
L
 
I
G
 
G
V
 
A
E
 
P
D
 
E
E
 
M
E
 
N
V
 
I
E
 
L
E
 
E
V
 
V

3d31A Modbc from methanosarcina acetivorans (see paper)
27% identity, 88% coverage: 13:273/295 of query aligns to 1:232/348 of 3d31A

query
sites
3d31A
I
 
M
L
 
I
K
 
E
V
 
I
E
 
E
R
 
S
L
 
L
S
 
S
M
 
R
R
 
K
F
 
W
G
 
K
G
 
N
L
 
F
M
 
-
A
 
S
I
 
L
N
 
D
D
 
N
F
 
L
S
 
S
F
 
L
E
 
K
A
 
V
E
 
E
R
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
Y
T
 
F
A
 
V
L
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
L
V
 
F
F
 
L
N
 
E
C
 
L
I
 
I
T
 
A
G
 
G
F
 
F
Y
 
H
K
 
V
P
 
P
T
 
D
M
 
S
G
 
G
M
 
R
I
 
I
T
 
L
M
 
L
R
 
D
Q
 
G
K
 
K
S
 
D
G
 
V
A
 
T
E
 
D
F
 
L
L
 
S
L
 
P
E
 
E
R
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
F
 
-
E
 
-
I
 
-
T
 
-
K
 
-
K
 
K
A
 
H
K
 
D
V
 
I
A
 
A
R
 
F
T
 
V
F
 
Y
Q
 
Q
N
 
N
I
 
Y
R
 
S
M
 
L
F
 
F
S
 
P
G
 
H
L
 
M
T
 
N
V
 
V
L
 
K
E
 
K
N
 
N
L
 
L
L
 
E
V
 
F
A
 
G
Q
 
M
H
 
R
N
 
M
K
 
K
L
 
K
M
 
I
R
 
K
A
 
D
S
 
P
G
 
K
Y
 
R
T
 
V
I
 
L
L
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
 
-
R
 
-
E
 
D
A
 
T
S
 
A
R
 
R
E
 
D
-
 
L
S
 
K
I
 
I
E
 
E
L
 
-
A
 
-
R
 
-
H
 
H
W
 
L
L
 
L
E
 
D
K
 
R
A
 
N
S
 
P
L
 
L
T
 
T
E
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
A
 
E
Q
 
Q
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
L
C
 
V
T
 
T
G
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
I
L
 
L
C
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
L
A
 
S
G
 
A
L
 
L
N
 
D
P
 
P
R
 
R
E
 
T
S
 
Q
L
 
E
A
 
N
L
 
A
N
 
R
A
 
E
L
 
M
L
 
L
Q
 
S
E
 
V
I
 
L
R
 
H
R
 
K
D
 
K
T
 
N
G
 
K
T
 
L
S
 
T
I
 
V
L
 
L
L
 
H
I
 
I
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
S
 
T
V
 
E
V
 
A
M
 
R
E
 
I
I
 
M
S
 
A
D
 
D
H
 
R
V
 
I
V
 
A
V
 
V
L
 
V
E
 
M
Y
 
D
G
 
G
Q
 
K
K
 
L
I
 
I
S
 
Q
D
 
V
G
 
G
N
 
K
P
 
P
D
 
E
F
 
E
V
 
I
K
 
F
N
 
E
D
 
K
P
 
P
R
 
V
-
 
E
-
 
G
V
 
R
I
 
V
A
 
A
A
 
S
Y
 
F
L
 
V
G
 
G
V
 
F
E
 
E
D
 
N

Sites not aligning to the query:

7d0aB Acinetobacter mlafedb complex in adp-vanadate trapped vclose conformation (see paper)
27% identity, 83% coverage: 13:256/295 of query aligns to 4:226/263 of 7d0aB

query
sites
7d0aB
I
 
L
L
 
I
K
 
E
V
 
V
E
 
K
R
 
N
L
 
L
S
 
S
M
 
F
R
 
N
F
x
R
G
|
G
G
 
E
L
x
R
M
 
V
A
 
I
I
 
Y
N
 
D
D
 
N
F
 
I
S
 
S
F
 
L
E
 
N
A
 
I
E
 
R
R
 
R
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
A
L
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
T
G
|
G
K
|
K
T
 
T
T
 
T
V
 
L
F
 
L
N
 
R
C
 
L
I
 
I
T
 
G
G
 
G
F
 
Q
Y
x
L
K
 
V
P
 
P
T
 
D
M
 
Q
G
 
G
M
 
E
I
 
V
T
 
L
M
 
L
R
 
D
Q
 
G
K
 
K
S
 
D
G
 
I
A
 
A
E
 
Q
F
 
M
L
 
S
L
 
R
E
 
Q
R
 
E
L
 
L
P
 
-
D
 
-
F
 
-
E
 
-
I
 
F
T
 
A
K
 
A
K
 
R
A
 
A
K
 
R
V
 
M
A
 
G
R
 
M
T
 
L
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
G
R
 
A
M
 
L
F
 
F
S
 
T
G
 
D
L
 
M
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
V
L
 
A
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
-
M
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
F
G
 
P
F
 
I
P
 
R
A
 
A
Y
 
H
R
 
T
E
 
K
A
 
L
S
 
S
R
 
E
E
 
N
S
 
L
I
 
I
-