SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMc02041 FitnessBrowser__Smeli:SMc02041 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
39% identity, 94% coverage: 13:250/254 of query aligns to 5:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
F
 
L
S
 
Q
G
 
D
K
 
K
T
 
V
V
 
A
V
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
T
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
V
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
V
F
 
F
A
 
M
T
 
K
K
 
E
R
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
I
L
 
A
D
|
D
R
x
F
D
 
N
A
 
E
A
 
A
V
 
A
S
 
G
D
 
K
V
 
E
A
 
A
V
 
V
S
 
E
L
 
A
G
 
N
T
 
P
G
 
G
H
 
V
I
 
V
A
 
F
H
 
I
V
 
R
A
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
E
 
R
Q
 
E
G
 
S
V
 
V
E
 
H
R
 
R
A
 
L
V
 
V
K
 
E
S
 
N
V
 
V
T
 
A
E
 
E
A
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
G
 
T
P
 
R
L
x
D
A
 
S
P
 
M
A
 
L
E
 
S
S
x
K
Y
 
M
P
 
T
T
 
V
A
 
D
E
 
Q
W
 
F
D
 
Q
R
 
Q
T
 
V
L
 
I
A
 
N
V
 
V
N
|
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
H
M
 
C
A
 
T
R
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
Y
M
 
M
L
 
A
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
S
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
x
T
A
 
S
S
|
S
Q
 
V
A
 
T
A
 
G
I
 
T
I
 
Y
G
 
G
I
x
N
E
x
V
G
 
G
H
x
Q
V
 
T
A
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
M
T
 
T
N
 
K
C
 
T
M
 
W
A
 
A
L
 
K
E
 
E
W
 
L
G
 
A
P
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
A
P
|
P
T
 
G
V
x
F
V
x
T
E
 
E
T
|
T
E
 
-
L
 
-
G
 
A
L
x
M
T
 
V
G
 
A
W
 
E
A
 
V
G
 
P
E
 
E
K
 
K
G
 
V
-
 
I
E
 
E
R
x
K
A
 
M
R
 
K
A
 
A
A
 
Q
I
 
V
P
 
P
T
 
M
R
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
K
 
K
P
 
P
W
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
S
 
A
V
 
Y
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
G
 
H
A
 
E
A
 
S
A
 
D
M
 
Y
V
 
V
N
 
N
G
 
G
A
 
H
N
 
V
L
 
L
M
 
H
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
35% identity, 96% coverage: 10:252/254 of query aligns to 2:253/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
L
 
I
L
 
M
D
 
N
F
 
L
S
 
T
G
 
D
K
 
K
T
 
T
V
 
V
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
T
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
V
 
A
A
 
V
E
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
L
T
 
G
K
 
Q
R
 
Q
A
 
A
R
 
N
V
 
V
A
 
V
L
 
V
L
 
A
D
|
D
R
x
I
D
 
D
A
 
E
A
 
A
V
 
Q
S
 
G
D
 
E
V
 
A
A
 
M
V
 
V
S
 
R
L
 
K
G
 
E
T
 
N
G
 
N
H
 
D
I
 
R
A
 
L
H
 
H
V
 
F
-
 
V
-
 
Q
A
x
T
D
 
D
V
x
I
T
 
T
D
 
D
E
 
E
Q
 
A
G
 
A
V
 
C
E
 
Q
R
 
H
A
 
A
V
 
V
K
 
E
S
 
S
V
 
A
T
 
V
E
 
H
A
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
G
 
E
P
 
I
L
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
I
E
 
H
S
 
E
Y
 
M
P
 
E
T
 
L
A
 
S
E
 
D
W
 
W
D
 
N
R
 
K
T
 
V
L
 
L
A
 
Q
V
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
A
 
M
F
 
F
L
 
L
M
 
M
A
 
S
R
 
K
A
 
H
I
 
A
A
 
L
P
 
K
G
 
H
M
 
M
L
 
L
E
 
A
Q
 
A
G
 
G
S
 
K
G
 
G
R
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
x
T
A
 
C
S
|
S
Q
 
V
A
 
G
A
 
G
I
 
L
I
 
V
G
 
A
I
 
W
E
 
P
G
 
D
H
 
I
V
 
P
A
 
A
Y
|
Y
C
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
I
 
V
I
 
L
G
 
Q
M
 
L
T
 
T
N
 
K
C
 
S
M
 
M
A
 
A
L
 
V
E
 
D
W
 
Y
G
 
A
P
 
K
R
 
H
G
 
Q
V
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
S
 
C
P
|
P
T
x
G
V
x
I
V
x
I
E
 
D
T
 
T
E
 
P
L
 
L
G
 
N
L
 
E
T
 
K
G
 
S
W
 
F
A
 
L
G
 
E
E
 
N
-
 
N
-
 
E
-
 
G
-
 
T
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
I
K
 
K
G
 
K
E
 
E
R
 
K
A
 
A
R
 
K
A
 
V
A
 
N
I
 
-
P
 
P
T
 
L
R
 
L
R
 
R
F
 
L
A
 
G
K
 
K
P
 
P
W
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
N
S
 
V
V
 
M
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
G
 
D
A
 
L
A
 
S
A
 
S
M
 
Y
V
 
M
N
 
T
G
 
G
A
 
S
N
 
A
L
 
I
M
 
T
I
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
37% identity, 96% coverage: 10:252/254 of query aligns to 4:259/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
-
S
 
-
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
V
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
T
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
K
A
 
K
F
 
F
A
 
A
T
 
Q
K
 
E
R
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
I
L
 
S
D
|
D
R
x
M
D
 
N
A
 
A
-
 
E
A
 
K
V
 
C
S
 
Q
D
 
E
V
 
T
A
 
A
V
 
N
S
 
S
L
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
Q
G
 
G
T
 
F
G
 
D
H
 
A
I
 
L
A
 
S
H
 
A
V
 
P
A
 
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
E
 
E
Q
 
D
G
 
A
V
 
Y
E
 
K
R
 
Q
A
 
A
V
 
I
K
 
E
S
 
L
V
 
T
T
 
Q
E
 
K
A
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
F
G
x
Q
P
 
H
L
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
I
E
 
E
S
 
E
Y
 
F
P
 
P
T
 
T
A
 
A
E
 
V
W
 
F
D
 
Q
R
 
K
T
 
L
L
 
V
A
 
Q
V
 
V
N
 
M
L
 
L
K
 
T
G
 
G
A
 
A
F
 
F
L
 
I
M
 
G
A
 
I
R
 
K
A
 
H
I
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
I
M
 
M
L
 
K
E
 
A
Q
 
Q
G
 
K
S
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
|
M
A
|
A
S
|
S
Q
 
I
A
x
N
A
 
G
I
 
L
I
 
I
G
 
G
I
 
F
E
 
A
G
 
G
H
x
K
V
 
A
A
 
G
Y
|
Y
C
 
N
A
 
S
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
T
N
 
K
C
 
V
M
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
W
 
C
G
 
A
P
 
R
R
 
D
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
S
 
C
P
|
P
T
x
G
V
 
Y
V
|
V
E
 
D
T
|
T
E
 
P
L
|
L
G
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
W
 
V
A
 
R
G
 
G
E
x
Q
K
 
I
G
 
A
E
 
D
R
 
L
A
 
A
R
 
K
-
 
T
-
 
R
-
 
N
-
 
V
-
 
S
-
 
L
-
 
D
-
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
D
-
 
V
-
 
I
-
 
L
A
 
A
A
 
M
I
 
V
P
 
P
T
 
Q
R
 
K
R
 
R
F
 
L
A
 
L
K
 
S
P
 
V
W
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
D
S
 
Y
V
 
A
L
 
I
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
G
 
S
A
 
K
A
 
A
A
 
G
M
 
G
V
 
V
N
 
T
G
 
G
A
 
Q
N
 
A
L
 
V
M
 
V
I
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
37% identity, 96% coverage: 10:252/254 of query aligns to 3:258/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
-
S
 
-
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
V
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
T
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
K
A
 
K
F
 
F
A
 
A
T
 
Q
K
 
E
R
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
I
L
 
S
D
|
D
R
x
M
D
 
N
A
 
A
-
 
E
A
 
K
V
 
C
S
 
Q
D
 
E
V
 
T
A
 
A
V
 
N
S
 
S
L
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
Q
G
 
G
T
 
F
G
 
D
H
 
A
I
 
L
A
 
S
H
 
A
V
 
P
A
 
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
E
 
E
Q
 
D
G
 
A
V
 
Y
E
 
K
R
 
Q
A
 
A
V
 
I
K
 
E
S
 
L
V
 
T
T
 
Q
E
 
K
A
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
F
G
x
Q
P
 
H
L
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
I
E
 
E
S
 
E
Y
 
F
P
 
P
T
 
T
A
 
A
E
 
V
W
 
F
D
 
Q
R
 
K
T
 
L
L
 
V
A
 
Q
V
 
V
N
 
M
L
 
L
K
 
T
G
 
G
A
 
A
F
 
F
L
 
I
M
 
G
A
 
I
R
 
K
A
 
H
I
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
I
M
 
M
L
 
K
E
 
A
Q
 
Q
G
 
K
S
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
|
M
A
|
A
S
|
S
Q
 
I
A
 
N
A
 
G
I
 
L
I
 
I
G
 
G
I
 
F
E
 
A
G
 
G
H
x
K
V
 
A
A
 
G
Y
|
Y
C
 
N
A
 
S
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
T
N
 
K
C
 
V
M
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
W
 
C
G
 
A
P
 
R
R
 
D
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
S
 
C
P
 
P
T
 
G
V
x
Y
V
|
V
E
 
D
T
|
T
E
 
P
L
 
L
G
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
W
 
V
A
 
R
G
 
G
E
x
Q
K
 
I
G
 
A
E
 
D
R
 
L
A
 
A
R
 
K
-
 
T
-
 
R
-
 
N
-
 
V
-
 
S
-
 
L
-
 
D
-
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
D
-
 
V
-
 
I
-
 
L
A
 
A
A
 
M
I
 
V
P
 
P
T
 
Q
R
 
K
R
 
R
F
 
L
A
 
L
K
 
S
P
 
V
W
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
D
S
 
Y
V
 
A
L
 
I
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
G
 
S
A
 
K
A
 
A
A
 
G
M
 
G
V
 
V
N
 
T
G
 
G
A
 
Q
N
 
A
L
 
V
M
 
V
I
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T

7krmC Putative fabg bound to nadh from acinetobacter baumannii
37% identity, 95% coverage: 13:253/254 of query aligns to 3:243/244 of 7krmC

query
sites
7krmC
F
 
L
S
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
T
x
S
-
 
E
-
 
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
T
A
 
A
E
 
E
A
 
I
F
 
F
A
 
A
T
 
Q
K
 
Q
R
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
I
L
 
I
L
 
V
D
|
D
R
x
L
D
 
D
A
 
L
A
 
A
V
 
Q
S
 
S
-
 
Q
D
 
N
V
 
A
A
 
A
V
 
K
S
 
A
L
 
L
G
 
G
T
 
E
G
 
G
H
 
H
I
 
M
A
 
G
H
 
L
V
 
A
A
|
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
D
 
N
E
 
E
Q
 
E
G
 
Q
V
 
V
E
 
K
R
 
A
A
 
A
V
 
V
K
 
E
S
 
Q
V
 
A
T
 
L
E
 
Q
A
 
H
F
 
Y
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
T
P
 
Q
L
 
P
A
 
I
P
 
K
A
 
T
E
 
L
S
 
D
Y
 
I
P
 
Q
T
 
R
A
 
S
E
 
D
W
 
Y
D
 
D
R
 
R
T
 
V
L
 
L
A
 
D
V
|
V
N
 
S
L
 
L
K
 
R
G
 
G
A
 
T
F
 
L
L
 
I
M
 
M
A
 
S
R
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
I
P
 
P
G
 
S
M
 
M
L
 
K
E
 
A
Q
 
N
G
 
G
S
 
G
G
 
G
R
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
C
M
 
L
A
 
S
S
|
S
Q
 
V
A
 
S
A
 
A
I
 
Q
I
 
R
-
 
G
-
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
F
G
 
G
H
 
G
V
 
P
A
 
H
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
A
N
 
K
C
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
R
E
 
E
W
 
F
G
 
G
P
 
G
R
 
D
G
 
Q
V
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
L
S
 
T
P
 
P
T
 
G
V
 
L
V
x
I
E
 
Q
T
|
T
E
 
D
L
 
M
G
 
N
L
 
-
T
 
-
G
 
-
W
 
-
A
 
-
G
 
D
E
 
D
K
 
R
G
 
R
E
 
H
R
 
D
A
 
I
R
 
L
A
 
A
A
 
G
I
 
I
P
 
P
T
 
L
R
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
K
 
K
P
 
A
W
 
Q
E
 
D
I
 
V
A
 
A
A
 
N
S
 
A
V
 
A
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
G
 
D
A
 
L
A
 
S
A
 
A
M
 
Y
V
 
L
N
 
T
G
 
G
A
 
V
N
 
T
L
 
L
M
 
D
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
M
T
 
L
I
 
I

2cfcA Structural basis for stereo selectivity in the (r)- and (s)-hydroxypropylethane thiosulfonate dehydrogenases (see paper)
38% identity, 93% coverage: 16:252/254 of query aligns to 3:248/250 of 2cfcA

query
sites
2cfcA
K
 
R
T
 
V
V
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
S
T
x
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
R
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
E
 
T
A
 
R
F
 
F
A
 
L
T
 
A
K
 
R
R
 
G
A
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
A
L
 
L
D
|
D
R
x
L
D
 
S
A
 
A
-
 
E
A
 
T
V
 
L
S
 
E
D
 
E
V
 
T
A
 
A
V
 
R
S
 
T
L
 
H
G
 
W
T
 
H
G
 
A
H
 
Y
I
 
A
A
 
D
H
 
K
V
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
V
-
 
R
A
|
A
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
G
 
D
V
 
V
E
 
N
R
 
A
A
 
A
V
 
I
K
 
A
S
 
A
V
 
T
T
 
M
E
 
E
A
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
A
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
G
 
T
P
 
G
L
 
N
A
 
S
P
 
E
A
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
L
E
 
H
S
 
T
Y
 
T
P
 
P
T
 
V
A
 
E
E
 
Q
W
 
F
D
 
D
R
 
K
T
 
V
L
 
M
A
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
V
K
 
R
G
 
G
A
 
I
F
 
F
L
 
L
M
 
G
A
 
C
R
 
R
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
M
L
 
L
E
 
L
Q
 
Q
G
 
G
S
 
A
G
 
G
R
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
x
I
A
 
A
S
|
S
Q
 
V
A
 
A
A
 
S
I
 
L
I
 
V
G
 
A
I
x
F
E
 
P
G
 
G
H
x
R
V
 
S
A
 
A
Y
|
Y
C
 
T
A
 
T
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
A
I
 
V
I
 
L
G
 
Q
M
 
L
T
 
T
N
 
K
C
 
S
M
 
V
A
 
A
L
 
V
E
 
D
W
 
Y
G
 
A
P
 
G
R
 
S
G
 
G
V
 
I
T
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
C
P
|
P
T
x
G
V
x
M
V
x
I
E
 
E
T
|
T
E
x
P
L
 
-
G
 
-
L
x
M
T
|
T
G
 
Q
W
|
W
A
x
R
G
 
L
E
 
D
K
 
Q
G
 
P
E
 
E
-
 
L
-
 
R
-
 
D
R
 
Q
A
 
V
R
 
L
A
 
A
A
 
R
I
 
I
P
 
P
T
 
Q
R
 
K
R
 
E
F
 
I
A
 
G
K
 
T
P
 
A
W
 
A
E
 
Q
I
 
V
A
 
A
A
 
D
S
 
A
V
 
V
L
 
M
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
E
A
 
D
A
 
A
A
 
T
M
 
Y
V
 
V
N
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
A
L
 
L
M
 
V
I
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
A
Y
 
Y
T
 
T

Q56840 2-(R)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase; R-HPCDH; 2-[(R)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase; Aliphatic epoxide carboxylation component III; Epoxide carboxylase component III; RHPCDH1; EC 1.1.1.268 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 4 papers)
38% identity, 93% coverage: 16:252/254 of query aligns to 3:248/250 of Q56840

query
sites
Q56840
K
 
R
T
 
V
V
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
T
x
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
R
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
E
 
T
A
 
R
F
 
F
A
 
L
T
 
A
K
 
R
R
 
G
A
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
A
L
 
L
D
|
D
R
 
L
D
 
S
A
 
A
-
 
E
A
 
T
V
 
L
S
 
E
D
 
E
V
 
T
A
 
A
V
 
R
S
 
T
L
 
H
G
 
W
T
 
H
G
 
A
H
 
Y
I
 
A
A
 
D
H
 
K
V
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
V
-
 
R
A
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
G
 
D
V
 
V
E
 
N
R
 
A
A
 
A
V
 
I
K
 
A
S
 
A
V
 
T
T
 
M
E
 
E
A
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
A
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
T
P
 
G
L
 
N
A
 
S
P
 
E
A
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
L
E
 
H
S
 
T
Y
 
T
P
 
P
T
 
V
A
 
E
E
 
Q
W
 
F
D
 
D
R
 
K
T
 
V
L
 
M
A
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
V
K
 
R
G
 
G
A
 
I
F
 
F
L
 
L
M
 
G
A
 
C
R
 
R
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
M
L
 
L
E
 
L
Q
 
Q
G
 
G
S
 
A
G
 
G
R
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
 
I
A
 
A
S
|
S
Q
 
V
A
 
A
A
 
S
I
 
L
I
 
V
G
 
A
I
 
F
E
 
P
G
 
G
H
x
R
V
 
S
A
 
A
Y
|
Y
C
 
T
A
 
T
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
A
I
 
V
I
 
L
G
 
Q
M
 
L
T
 
T
N
 
K
C
 
S
M
 
V
A
 
A
L
 
V
E
 
D
W
 
Y
G
 
A
P
 
G
R
 
S
G
 
G
V
 
I
T
x
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
C
P
 
P
T
 
G
V
 
M
V
x
I
E
|
E
T
|
T
E
x
P
L
 
-
G
 
-
L
x
M
T
 
T
G
 
Q
W
|
W
A
x
R
G
 
L
E
 
D
K
 
Q
G
 
P
E
 
E
-
 
L
-
x
R
-
 
D
R
 
Q
A
 
V
R
 
L
A
 
A
A
x
R
I
 
I
P
 
P
T
 
Q
R
 
K
R
 
E
F
 
I
A
 
G
K
 
T
P
 
A
W
 
A
E
 
Q
I
 
V
A
 
A
A
 
D
S
 
A
V
 
V
L
 
M
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
E
A
 
D
A
 
A
A
 
T
M
 
Y
V
 
V
N
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
A
L
 
L
M
 
V
I
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
A
Y
 
Y
T
 
T

Sites not aligning to the query:

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
35% identity, 95% coverage: 9:250/254 of query aligns to 2:243/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
D
 
Q
L
 
F
L
 
M
D
 
N
F
 
L
S
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
T
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
L
F
 
L
A
 
A
T
 
E
K
 
R
R
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
-
 
I
A
 
G
L
 
T
L
 
A
D
x
T
R
 
S
D
 
E
A
 
S
A
 
G
V
 
A
S
 
Q
D
 
A
V
 
I
A
 
S
V
 
D
S
 
Y
L
 
L
G
 
G
T
 
D
G
 
N
H
 
G
I
 
K
A
 
G
H
 
M
V
 
A
A
 
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
D
 
N
E
 
P
Q
 
E
G
 
S
V
 
I
E
 
E
R
 
A
A
 
V
V
 
L
K
 
K
S
 
A
V
 
I
T
 
T
E
 
D
A
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
G
 
T
P
 
R
L
 
D
A
 
N
P
 
L
A
 
L
E
 
M
S
 
R
Y
 
M
P
 
K
T
 
E
A
 
E
E
 
E
W
 
W
D
 
S
R
 
D
T
 
I
L
 
M
A
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
S
A
 
I
F
 
F
L
 
R
M
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
 
R
G
 
G
M
 
M
L
 
M
E
 
K
Q
 
K
G
 
R
S
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
x
V
A
 
G
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
A
 
G
I
 
T
I
 
M
G
 
G
I
 
N
E
 
A
G
 
G
H
 
Q
V
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
F
T
 
T
N
 
K
C
 
S
M
 
M
A
 
A
L
 
R
E
 
E
W
 
V
G
 
A
P
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
S
 
A
P
|
P
T
x
G
V
 
F
V
x
I
E
 
E
T
|
T
E
 
D
L
x
M
G
 
-
L
 
T
T
 
K
G
 
A
W
 
L
A
 
N
G
 
D
E
 
E
K
 
Q
G
 
R
E
 
T
R
 
A
A
 
T
R
 
L
A
 
A
A
 
Q
I
 
V
P
 
P
T
 
A
R
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
K
 
D
P
 
P
W
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
S
S
 
A
V
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
G
 
P
A
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
E
N
 
T
L
 
L
M
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
35% identity, 95% coverage: 9:250/254 of query aligns to 2:239/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
D
 
Q
L
 
F
L
 
M
D
 
N
F
 
L
S
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
T
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
L
F
 
L
A
 
A
T
 
E
K
 
R
R
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
-
 
I
A
 
G
L
 
T
L
 
A
D
x
T
R
 
S
D
 
E
A
 
S
A
 
G
V
 
A
S
 
Q
D
 
A
V
 
I
A
 
S
V
 
D
S
 
Y
L
 
L
G
 
G
T
 
D
G
 
N
H
 
G
I
 
K
A
 
G
H
 
M
V
 
A
A
 
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
D
 
N
E
 
P
Q
 
E
G
 
S
V
 
I
E
 
E
R
 
A
A
 
V
V
 
L
K
 
K
S
 
A
V
 
I
T
 
T
E
 
D
A
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
G
 
T
P
 
R
L
 
D
A
 
N
P
 
L
A
 
L
E
 
M
S
 
R
Y
 
M
P
 
K
T
 
E
A
 
E
E
 
E
W
 
W
D
 
S
R
 
D
T
 
I
L
 
M
A
 
E
V
 
T
N
|
N
L
 
L
K
 
T
G
 
S
A
 
I
F
 
F
L
 
R
M
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
 
R
G
 
G
M
 
M
L
 
M
E
 
K
Q
 
K
G
 
R
S
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
 
V
A
x
G
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
A
 
G
I
 
T
I
 
M
G
 
G
I
 
N
E
 
A
G
 
G
H
x
Q
V
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
F
T
 
T
N
 
K
C
 
S
M
 
M
A
 
A
L
 
R
E
 
E
W
 
V
G
 
A
P
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
S
 
A
P
|
P
T
x
G
V
 
F
V
 
I
E
 
E
T
|
T
E
 
D
L
 
M
G
 
N
L
 
-
T
 
-
G
 
-
W
 
-
A
 
-
G
 
D
E
 
E
K
 
Q
G
 
R
E
 
T
R
 
A
A
 
T
R
 
L
A
 
A
A
 
Q
I
 
V
P
 
P
T
 
A
R
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
K
 
D
P
 
P
W
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
S
S
 
A
V
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
G
 
P
A
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
E
N
 
T
L
 
L
M
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

4fn4A Short-chain NAD(h)-dependent dehydrogenase/reductase from sulfolobus acidocaldarius (see paper)
38% identity, 95% coverage: 13:253/254 of query aligns to 5:253/254 of 4fn4A

query
sites
4fn4A
F
 
L
S
 
K
G
 
N
K
 
K
T
 
V
V
 
V
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
T
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
A
E
 
K
A
 
K
F
 
F
A
 
A
T
 
L
K
 
N
R
 
D
A
 
S
R
 
I
V
 
V
A
 
V
-
 
A
-
 
V
-
x
E
-
x
L
L
 
L
L
 
E
D
 
D
R
|
R
D
 
L
A
 
N
A
 
Q
V
 
I
S
 
V
D
 
Q
V
 
E
A
 
L
V
 
R
S
 
G
L
 
M
G
 
G
T
 
K
G
 
E
H
 
V
I
 
L
A
 
G
H
 
V
V
 
K
A
|
A
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
K
E
 
K
Q
 
K
G
 
D
V
 
V
E
 
E
R
 
E
A
 
F
V
 
V
K
 
R
S
 
R
V
 
T
T
 
F
E
 
E
A
 
T
F
 
Y
G
 
S
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
C
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
G
 
M
P
 
D
-
 
G
L
 
V
A
 
T
P
 
P
A
 
V
E
 
A
S
 
E
Y
 
V
P
 
S
T
 
D
A
 
E
E
 
L
W
 
W
D
 
E
R
 
R
T
 
V
L
 
L
A
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
Y
G
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
Y
M
 
S
A
 
S
R
 
R
A
 
A
I
 
V
A
 
I
P
 
P
G
 
I
M
 
M
L
 
L
E
 
K
Q
 
Q
G
 
G
S
 
K
G
 
G
R
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
x
T
A
 
A
S
|
S
Q
 
I
A
 
A
A
 
G
I
 
I
I
 
R
G
 
G
I
 
G
E
 
F
G
 
A
H
 
G
V
 
A
A
 
P
Y
|
Y
C
 
T
A
 
V
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
I
 
L
I
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
T
N
 
R
C
 
S
M
 
I
A
 
A
L
 
A
E
 
H
W
 
Y
G
 
G
P
 
D
R
 
Q
G
 
G
V
 
I
T
 
R
V
 
A
N
 
V
A
 
A
V
 
V
S
 
L
P
|
P
T
 
G
V
 
T
V
|
V
E
 
K
T
|
T
E
x
N
L
x
I
G
 
G
L
 
L
-
 
G
T
 
S
G
 
S
W
 
K
A
 
P
G
x
S
E
 
E
K
 
L
G
 
G
E
 
M
R
 
R
A
 
T
R
 
L
A
 
T
A
 
K
I
 
L
P
 
M
-
 
S
-
 
L
T
 
S
R
 
S
R
 
R
F
 
L
A
 
A
K
 
E
P
 
P
W
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
S
 
V
V
 
I
L
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
G
 
D
A
 
E
A
 
A
A
 
S
M
 
F
V
 
V
N
 
N
G
 
G
A
 
D
N
 
A
L
 
V
M
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
T
 
T
I
 
V

2ewmB Crystal structure of the (s)-specific 1-phenylethanol dehydrogenase of the denitrifying bacterium strain ebn1 (see paper)
38% identity, 93% coverage: 16:250/254 of query aligns to 6:243/247 of 2ewmB

query
sites
2ewmB
K
 
K
T
 
L
V
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
T
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
R
F
 
F
A
 
A
T
 
V
K
 
E
R
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
I
A
 
A
L
 
I
L
 
A
D
|
D
R
x
L
-
 
V
D
 
P
A
 
A
A
 
P
V
 
E
S
 
A
D
 
E
V
 
A
A
 
A
V
 
I
-
 
R
S
 
N
L
 
L
G
 
G
T
 
R
G
 
R
H
 
V
I
 
L
A
 
T
H
 
V
V
 
K
A
x
C
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
Q
E
 
P
Q
 
G
G
 
D
V
 
V
E
 
E
R
 
A
A
 
F
V
 
G
K
 
K
S
 
Q
V
 
V
T
 
I
E
 
S
A
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
I
P
 
P
A
 
F
E
 
D
S
 
E
Y
 
L
P
 
T
T
 
F
A
 
E
E
 
Q
W
 
W
D
 
K
R
 
K
T
 
T
L
 
F
A
 
E
V
 
I
N
 
N
L
 
V
K
 
D
G
 
S
A
 
G
F
 
F
L
 
L
M
 
M
A
 
A
R
 
K
A
 
A
I
 
F
A
 
V
P
 
P
G
 
G
M
 
M
L
 
K
E
 
R
Q
 
N
G
 
G
S
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
 
L
A
 
T
S
|
S
Q
 
T
A
 
T
A
 
Y
I
 
W
I
 
L
G
 
K
I
 
I
E
 
E
G
 
A
H
x
Y
V
 
T
A
 
H
Y
|
Y
C
 
I
A
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
A
I
 
N
I
 
I
G
 
G
M
 
F
T
 
T
N
 
R
C
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
S
E
 
D
W
 
L
G
 
G
P
 
K
R
 
D
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
S
 
A
P
|
P
T
x
S
V
x
L
V
|
V
E
 
R
-
 
T
-
 
A
-
x
T
T
 
T
E
 
E
L
 
A
G
 
S
L
 
A
T
 
L
G
 
S
W
 
A
A
 
M
G
 
F
E
 
D
K
 
V
G
 
L
E
 
P
R
 
N
A
 
M
R
 
L
A
 
Q
A
 
A
I
 
I
P
 
P
T
 
-
R
 
-
R
 
R
F
 
L
A
 
Q
K
 
V
P
 
P
W
 
L
E
 
D
I
 
L
A
 
T
A
 
G
S
 
A
V
 
A
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
G
 
D
A
 
D
A
 
A
A
 
S
M
 
F
V
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
Q
N
 
T
L
 
L
M
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q5P5I4 (S)-1-Phenylethanol dehydrogenase; EC 1.1.1.311 from Aromatoleum aromaticum (strain EbN1) (Azoarcus sp. (strain EbN1)) (see 2 papers)
38% identity, 93% coverage: 16:250/254 of query aligns to 8:245/249 of Q5P5I4

query
sites
Q5P5I4
K
 
K
T
 
L
V
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
 
A
T
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
R
F
 
F
A
 
A
T
 
V
K
 
E
R
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
I
A
 
A
L
 
I
L
 
A
D
|
D
R
 
L
-
 
V
D
 
P
A
 
A
A
 
P
V
 
E
S
 
A
D
 
E
V
 
A
A
 
A
V
 
I
-
 
R
S
 
N
L
 
L
G
 
G
T
 
R
G
 
R
H
 
V
I
 
L
A
 
T
H
 
V
V
 
K
A
x
C
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
Q
E
 
P
Q
 
G
G
 
D
V
 
V
E
 
E
R
 
A
A
 
F
V
 
G
K
 
K
S
 
Q
V
 
V
T
 
I
E
 
S
A
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
x
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
I
P
 
P
A
 
F
E
 
D
S
 
E
Y
 
L
P
 
T
T
 
F
A
 
E
E
 
Q
W
 
W
D
 
K
R
 
K
T
 
T
L
 
F
A
 
E
V
 
I
N
 
N
L
 
V
K
 
D
G
 
S
A
 
G
F
 
F
L
 
L
M
 
M
A
 
A
R
 
K
A
 
A
I
 
F
A
 
V
P
 
P
G
 
G
M
 
M
L
 
K
E
 
R
Q
 
N
G
 
G
S
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
 
L
A
 
T
S
 
S
Q
 
T
A
 
T
A
 
Y
I
 
W
I
 
L
G
 
K
I
 
I
E
 
E
G
 
A
H
 
Y
V
 
T
A
 
H
Y
 
Y
C
 
I
A
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
A
I
 
N
I
 
I
G
 
G
M
 
F
T
 
T
N
 
R
C
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
S
E
 
D
W
 
L
G
 
G
P
 
K
R
 
D
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
S
 
A
P
|
P
T
x
S
V
x
L
V
|
V
E
 
R
-
 
T
-
 
A
-
x
T
T
 
T
E
 
E
L
 
A
G
 
S
L
 
A
T
 
L
G
 
S
W
 
A
A
 
M
G
 
F
E
 
D
K
 
V
G
 
L
E
 
P
R
 
N
A
 
M
R
 
L
A
 
Q
A
 
A
I
 
I
P
 
P
T
 
-
R
 
-
R
 
R
F
 
L
A
 
Q
K
 
V
P
 
P
W
 
L
E
 
D
I
 
L
A
 
T
A
 
G
S
 
A
V
 
A
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
G
 
D
A
 
D
A
 
A
A
 
S
M
 
F
V
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
Q
N
 
T
L
 
L
M
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5itvD Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
34% identity, 96% coverage: 10:252/254 of query aligns to 2:225/227 of 5itvD

query
sites
5itvD
L
 
I
L
 
M
D
 
N
F
 
L
S
 
T
G
 
D
K
 
K
T
 
T
V
 
V
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
T
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
V
 
A
A
 
V
E
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
L
T
 
G
K
 
Q
R
 
Q
A
 
A
R
 
N
V
 
V
A
 
V
L
 
V
L
 
A
D
|
D
R
x
I
D
 
D
A
 
E
A
 
A
V
 
Q
S
 
G
D
 
E
V
 
A
A
 
M
V
 
V
S
 
R
L
 
K
G
 
E
T
 
N
G
 
N
H
 
D
I
 
R
A
 
L
H
 
H
V
 
F
-
 
V
-
 
Q
A
x
T
D
|
D
V
x
I
T
 
T
D
 
D
E
 
E
Q
 
A
G
 
A
V
 
C
E
 
Q
R
 
H
A
 
A
V
 
V
K
 
E
S
 
S
V
 
A
T
 
V
E
 
H
A
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
E
P
 
I
L
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
I
E
 
H
S
 
E
Y
 
M
P
 
E
T
 
L
A
 
S
E
 
D
W
 
W
D
 
N
R
 
K
T
 
V
L
 
L
A
 
Q
V
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
A
 
M
F
 
F
L
 
L
M
 
M
A
 
S
R
 
K
A
 
H
I
 
A
A
 
L
P
 
K
G
 
H
M
 
M
L
 
L
E
 
A
Q
 
A
G
 
G
S
 
K
G
 
G
R
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
x
T
A
 
C
S
|
S
Q
 
V
A
 
G
A
 
G
I
 
L
I
 
V
G
 
A
I
 
W
E
 
P
G
 
D
H
 
I
V
 
P
A
 
A
Y
|
Y
C
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
I
 
V
I
 
L
G
 
Q
M
 
L
T
 
T
N
 
K
C
 
S
M
 
M
A
 
A
L
 
V
E
 
D
W
 
Y
G
 
A
P
 
K
R
 
H
G
 
Q
V
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
S
 
C
P
|
P
T
x
G
V
 
I
V
x
I
E
 
D
T
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
W
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
P
 
-
T
 
T
R
 
L
R
 
R
F
 
L
A
 
G
K
 
K
P
 
P
W
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
N
S
 
V
V
 
M
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
G
 
D
A
 
L
A
 
S
A
 
S
M
 
Y
V
 
M
N
 
T
G
 
G
A
 
S
N
 
A
L
 
I
M
 
T
I
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T

1iy8A Crystal structure of levodione reductase (see paper)
37% identity, 94% coverage: 13:252/254 of query aligns to 2:255/258 of 1iy8A

query
sites
1iy8A
F
 
F
S
 
T
G
 
D
K
 
R
T
 
V
V
 
V
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
G
T
x
S
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
T
A
 
A
E
 
V
A
 
R
F
 
L
A
 
A
T
 
A
K
 
E
R
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
L
A
 
S
L
 
L
L
 
V
D
|
D
-
x
V
-
 
S
-
 
S
-
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
A
R
 
S
D
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
L
D
 
E
V
 
T
A
 
A
V
 
P
S
 
D
L
 
A
G
 
E
T
 
V
G
 
-
H
 
-
I
 
L
A
 
T
H
 
T
V
 
V
A
|
A
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
E
 
E
Q
 
A
G
 
Q
V
 
V
E
 
E
R
 
A
A
 
Y
V
 
V
K
 
T
S
 
A
V
 
T
T
 
T
E
 
E
A
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
G
L
 
F
I
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
-
 
E
G
 
G
P
 
K
L
 
Q
A
 
N
P
 
P
A
 
T
E
 
E
S
 
S
Y
 
F
P
 
T
T
 
A
A
 
A
E
 
E
W
 
F
D
 
D
R
 
K
T
 
V
L
 
V
A
 
S
V
 
I
N
 
N
L
 
L
K
 
R
G
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
L
M
 
G
A
 
L
R
 
E
A
 
K
I
 
V
A
 
L
P
 
K
G
 
I
M
 
M
L
 
R
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
G
 
G
R
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
M
x
T
A
 
A
S
|
S
Q
 
V
A
 
G
A
 
G
I
 
I
I
 
R
G
 
G
I
 
I
E
 
G
G
 
N
H
x
Q
V
 
S
A
 
G
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
N
 
R
C
 
N
M
 
S
A
 
A
L
 
V
E
 
E
W
 
Y
G
 
G
P
 
R
R
 
Y
G
 
G
V
 
I
T
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
V
 
I
S
 
A
P
|
P
T
x
G
V
 
A
V
 
I
E
 
W
T
|
T
E
x
P
L
x
M
G
 
V
L
 
E
T
 
N
G
 
S
W
 
M
A
 
K
G
 
Q
E
 
L
K
 
D
G
 
P
E
 
E
R
 
N
A
 
P
R
 
R
A
 
K
A
 
A
I
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
F
-
 
I
-
 
Q
-
 
V
-
 
N
P
 
P
T
 
S
R
 
K
R
 
R
F
 
Y
A
 
G
K
 
E
P
 
A
W
 
P
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
S
 
V
V
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
L
G
 
S
G
 
D
A
 
D
A
 
A
A
 
S
M
 
Y
V
 
V
N
 
N
G
 
A
A
 
T
N
 
V
L
 
V
M
 
P
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Q
T
 
S

Q9LBG2 Levodione reductase; (6R)-2,2,6-trimethyl-1,4-cyclohexanedione reductase; EC 1.1.1.- from Leifsonia aquatica (Corynebacterium aquaticum) (see paper)
37% identity, 94% coverage: 13:252/254 of query aligns to 11:264/267 of Q9LBG2

query
sites
Q9LBG2
F
 
F
S
 
T
G
 
D
K
 
R
T
 
V
V
 
V
V
x
L
V
x
I
T
|
T
G
|
G
A
x
G
A
x
G
T
x
S
G
|
G
I
x
L
G
|
G
R
|
R
A
|
A
V
x
T
A
|
A
E
x
V
A
x
R
F
x
L
A
|
A
T
x
A
K
x
E
R
x
G
A
|
A
R
x
K
V
x
L
A
x
S
L
|
L
L
 
V
D
 
D
-
 
V
-
 
S
-
 
S
-
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
A
R
 
S
D
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
L
D
 
E
V
 
T
A
 
A
V
 
P
S
 
D
L
 
A
G
 
E
T
 
V
G
 
-
H
 
-
I
 
L
A
 
T
H
 
T
V
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
V
T
 
S
D
 
D
E
 
E
Q
 
A
G
 
Q
V
 
V
E
 
E
R
 
A
A
 
Y
V
 
V
K
 
T
S
 
A
V
 
T
T
 
T
E
 
E
A
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
G
L
 
F
I
 
F
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
-
x
E
G
 
G
P
 
K
L
 
Q
A
 
N
P
 
P
A
 
T
E
 
E
S
 
S
Y
 
F
P
 
T
T
 
A
A
 
A
E
 
E
W
 
F
D
 
D
R
 
K
T
 
V
L
 
V
A
 
S
V
 
I
N
 
N
L
 
L
K
 
R
G
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
L
M
 
G
A
 
L
R
 
E
A
 
K
I
 
V
A
 
L
P
 
K
G
 
I
M
 
M
L
 
R
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
G
 
G
R
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
M
 
T
A
 
A
S
 
S
Q
 
V
A
 
G
A
 
G
I
 
I
I
 
R
G
 
G
I
 
I
E
 
G
G
 
N
H
 
Q
V
 
S
A
 
G
Y
 
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
N
 
R
C
 
N
M
 
S
A
 
A
L
 
V
E
 
E
W
 
Y
G
 
G
P
 
R
R
 
Y
G
 
G
V
 
I
T
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
V
 
I
S
 
A
P
 
P
T
 
G
V
 
A
V
 
I
E
 
W
T
 
T
E
 
P
L
 
M
G
 
V
L
 
E
T
 
N
G
 
S
W
 
M
A
 
K
G
 
Q
E
 
L
K
 
D
G
 
P
E
 
E
R
 
N
A
 
P
R
 
R
A
 
K
A
 
A
I
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
F
-
 
I
-
 
Q
-
 
V
-
 
N
P
 
P
T
 
S
R
 
K
R
 
R
F
 
Y
A
 
G
K
 
E
P
 
A
W
 
P
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
S
 
V
V
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
L
G
 
S
G
 
D
A
 
D
A
 
A
A
 
S
M
 
Y
V
 
V
N
 
N
G
 
A
A
 
T
N
 
V
L
 
V
M
 
P
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Q
T
 
S

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
37% identity, 96% coverage: 11:253/254 of query aligns to 1:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
M
D
 
T
F
 
L
S
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
S
T
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
D
V
 
I
A
 
A
E
 
I
A
 
N
F
 
L
A
 
A
T
 
K
K
 
E
R
 
G
A
 
A
R
 
N
V
 
I
A
 
F
L
 
F
-
x
N
L
x
Y
D
x
N
R
x
G
D
x
S
A
 
P
A
 
E
V
 
A
S
 
A
D
 
E
V
 
E
A
 
T
V
 
A
S
 
K
L
 
L
G
 
V
T
 
A
G
 
E
H
 
H
I
 
G
A
 
V
H
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
M
-
 
K
A
 
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
D
 
I
E
 
A
Q
 
E
G
 
D
V
 
V
E
 
D
R
 
A
A
 
F
V
 
F
K
 
K
S
 
Q
V
 
A
T
 
I
E
 
E
A
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
G
 
T
P
 
R
L
 
D
A
 
N
P
 
L
A
 
L
E
 
M
S
 
R
Y
 
M
P
 
K
T
 
E
A
 
D
E
 
E
W
 
W
D
 
D
R
 
D
T
 
V
L
 
I
A
 
N
V
x
I
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
T
F
 
F
L
 
L
M
 
C
A
 
T
R
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
S
P
 
R
G
 
T
M
 
M
L
 
M
E
 
K
Q
 
Q
G
 
R
S
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
 
M
A
 
A
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
A
 
G
I
 
L
I
 
I
G
 
G
I
 
N
E
 
A
G
 
G
H
x
Q
V
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
T
N
 
K
C
 
T
M
 
T
A
 
A
L
 
R
E
 
E
W
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
A
P
|
P
T
 
G
V
 
F
V
x
I
E
 
T
T
|
T
E
 
D
L
 
-
G
 
-
L
 
M
T
 
T
G
 
D
W
 
K
A
 
L
G
 
D
E
 
E
K
 
K
G
 
T
E
 
K
R
 
E
A
 
A
R
 
M
-
 
L
A
 
A
A
 
Q
I
 
I
P
 
P
T
 
L
R
 
G
R
 
A
F
 
Y
A
 
G
K
 
T
P
 
T
W
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
S
 
A
V
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
G
 
D
A
 
A
A
 
S
A
 
K
M
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
Q
N
 
T
L
 
L
M
 
S
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
M
T
 
V
I
 
M

2d1yA Crystal structure of tt0321 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
40% identity, 94% coverage: 13:252/254 of query aligns to 3:237/240 of 2d1yA

query
sites
2d1yA
F
 
F
S
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
T
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
A
T
 
R
K
 
E
R
 
G
A
 
A
R
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
C
D
|
D
R
x
L
D
x
R
A
 
P
A
 
E
V
 
G
S
 
K
D
 
E
V
 
V
A
 
A
V
 
E
S
 
A
L
 
I
G
 
G
T
 
-
G
 
G
H
 
A
I
 
F
A
 
F
H
 
Q
V
|
V
A
 
-
D
|
D
V
x
L
T
 
E
D
 
D
E
 
E
Q
 
R
G
 
E
V
 
R
E
 
V
R
 
R
A
 
F
V
 
V
K
 
E
S
 
E
V
 
A
T
 
A
E
 
Y
A
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
A
I
|
I
G
 
A
P
 
A
L
 
P
A
 
G
P
 
S
A
 
A
E
 
L
S
 
T
Y
 
V
P
 
R
T
 
L
A
 
P
E
 
E
W
 
W
D
 
R
R
 
R
T
 
V
L
 
L
A
 
E
V
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
A
A
 
P
F
 
M
L
 
H
M
 
L
A
 
S
R
 
A
A
 
L
I
 
A
A
 
A
P
 
R
G
 
E
M
 
M
L
 
R
E
 
K
Q
 
V
G
 
G
S
 
G
G
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
x
V
A
 
A
S
|
S
Q
 
V
A
 
Q
A
 
G
I
 
L
I
 
F
G
 
A
I
 
E
E
 
Q
G
 
E
H
x
N
V
 
A
A
 
A
Y
|
Y
C
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
I
 
L
I
 
V
G
 
N
M
 
L
T
 
T
N
 
R
C
 
S
M
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
D
W
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
L
G
 
R
V
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
A
P
|
P
T
x
G
V
 
A
V
x
I
E
 
A
T
|
T
E
 
E
L
x
A
G
x
V
L
 
L
T
 
E
G
 
A
W
 
I
A
 
A
G
 
R
E
 
R
K
 
D
G
 
W
E
 
E
R
 
D
A
 
L
R
 
H
A
 
A
A
 
-
I
 
-
P
 
-
T
 
L
R
 
R
R
 
R
F
 
L
A
 
G
K
 
K
P
 
P
W
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
E
S
 
A
V
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
G
 
E
A
 
K
A
 
A
A
 
S
M
 
F
V
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
A
N
 
I
L
 
L
M
 
P
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
M
T
 
T

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
37% identity, 94% coverage: 16:253/254 of query aligns to 6:245/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
K
 
R
T
 
V
V
 
A
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
A
T
x
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
R
 
K
A
 
Q
V
 
T
A
 
A
E
 
L
A
 
R
F
 
F
A
 
A
T
 
E
K
 
Q
R
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
V
A
 
V
L
 
I
L
 
N
D
|
D
R
 
I
D
 
D
A
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
R
A
 
A
V
 
T
S
 
V
D
 
D
V
 
E
A
 
F
V
 
S
S
 
A
L
 
R
G
 
G
T
 
H
G
 
R
H
 
V
I
 
L
A
 
G
H
 
A
V
 
V
A
 
A
D
|
D
V
x
I
T
 
G
D
 
N
E
 
K
Q
 
A
G
 
A
V
 
V
E
 
D
R
 
G
A
 
M
V
 
V
K
 
K
S
 
Q
V
 
T
T
 
I
E
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
M
G
 
E
P
 
R
L
 
A
A
 
G
P
 
A
A
 
L
E
 
R
S
 
K
Y
 
L
P
 
S
T
 
E
A
 
A
E
 
D
W
 
W
D
 
D
R
 
V
T
 
T
L
 
I
A
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
T
F
 
F
L
 
L
M
 
C
A
 
T
R
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
H
P
 
G
G
 
H
M
 
M
L
 
V
E
 
E
Q
 
N
G
 
K
S
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
 
I
A
 
A
S
 
S
Q
 
R
A
 
-
A
 
A
I
 
W
I
 
L
G
 
G
I
 
G
E
 
A
G
 
G
H
 
Q
V
 
T
A
 
P
Y
|
Y
C
 
S
A
 
S
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
M
T
 
T
N
 
R
C
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
E
W
 
L
G
 
G
P
 
R
R
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
S
 
A
P
 
P
T
 
G
V
 
L
V
 
I
E
 
H
T
 
T
E
 
P
L
 
M
G
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
W
 
W
A
 
-
G
 
D
E
 
E
K
 
L
G
 
P
E
 
E
R
 
K
A
 
D
R
 
Q
A
 
Q
A
 
F
I
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
R
-
 
Q
P
 
P
T
 
T
R
 
G
R
 
K
F
 
L
A
 
G
K
 
E
P
 
P
W
 
D
E
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
S
 
T
V
 
L
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
D
G
 
D
A
 
D
A
 
S
A
 
G
M
 
F
V
 
V
N
 
T
G
 
G
A
 
Q
N
 
V
L
 
L
M
 
Y
I
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
Y
 
R
T
 
S
I
 
L

Sites not aligning to the query:

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
37% identity, 94% coverage: 16:253/254 of query aligns to 5:244/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
K
 
R
T
 
V
V
 
A
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
T
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
R
 
K
A
 
Q
V
 
T
A
 
A
E
 
L
A
 
R
F
 
F
A
 
A
T
 
E
K
 
Q
R
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
V
A
 
V
L
 
I
L
 
N
D
|
D
R
x
I
D
 
D
A
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
R
A
 
A
V
 
T
S
 
V
D
 
D
V
 
E
A
 
F
V
 
S
S
 
A
L
 
R
G
 
G
T
 
H
G
 
R
H
 
V
I
 
L
A
 
G
H
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
D
V
x
I
T
 
G
D
 
N
E
 
K
Q
 
A
G
 
A
V
 
V
E
 
D
R
 
G
A
 
M
V
 
V
K
 
K
S
 
Q
V
 
T
T
 
I
E
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
M
G
 
E
P
 
R
L
 
A
A
 
G
P
 
A
A
 
L
E
 
R
S
 
K
Y
 
L
P
 
S
T
 
E
A
 
A
E
 
D
W
 
W
D
 
D
R
 
V
T
 
T
L
 
I
A
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
T
F
 
F
L
 
L
M
 
C
A
 
T
R
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
H
P
 
G
G
 
H
M
 
M
L
 
V
E
 
E
Q
 
N
G
 
K
S
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
x
I
A
 
A
S
|
S
Q
 
R
A
 
-
A
 
A
I
 
W
I
 
L
G
 
G
I
 
G
E
 
A
G
 
G
H
 
Q
V
 
T
A
 
P
Y
|
Y
C
 
S
A
 
S
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
M
T
 
T
N
 
R
C
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
E
W
 
L
G
 
G
P
 
R
R
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
S
 
A
P
 
P
T
 
G
V
 
L
V
x
I
E
 
H
T
 
T
E
 
P
L
 
M
G
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
W
 
W
A
 
-
G
 
D
E
 
E
K
 
L
G
 
P
E
 
E
R
 
K
A
 
D
R
 
Q
A
 
Q
A
 
F
I
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
R
-
 
Q
P
 
P
T
 
T
R
 
G
R
 
K
F
 
L
A
 
G
K
 
E
P
 
P
W
 
D
E
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
S
 
T
V
 
L
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
D
G
 
D
A
 
D
A
 
S
A
 
G
M
 
F
V
 
V
N
 
T
G
 
G
A
 
Q
N
 
V
L
 
L
M
 
Y
I
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
Y
 
R
T
 
S
I
 
L

H9XP47 Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; BDH; meso-2,3-BDH; (R,S)-butane-2,3-diol dehydrogenase; NAD(H)-dependent meso-2,3-BDH; SmBdh; EC 1.1.1.- from Serratia marcescens (see paper)
37% identity, 95% coverage: 11:252/254 of query aligns to 1:242/251 of H9XP47

query
sites
H9XP47
L
 
M
D
 
R
F
 
F
S
 
D
G
 
N
K
 
K
T
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
G
T
x
N
G
 
G
I
x
M
G
 
G
R
 
E
A
 
A
V
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
R
F
 
F
A
 
S
T
 
A
K
 
E
R
 
G
A
 
A
R
 
I
V
 
V
A
 
V
L
 
L
L
 
A
D
|
D
-
 
W
R
 
A
D
 
K
A
 
E
A
 
A
V
 
V
S
 
D
D
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
P
T
 
K
G
 
G
H
 
R
I
 
A
A
 
M
H
 
A
V
 
V
A
 
H
-
 
I
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
E
 
H
Q
 
V
G
 
A
V
 
V
E
 
E
R
 
K
A
 
M
V
 
M
K
 
N
S
 
E
V
 
V
T
 
A
E
 
E
A
 
K
F
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
L
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
V
G
 
H
P
 
V
L
 
A
A
 
G
P
 
S
A
 
V
E
 
L
S
 
E
Y
 
T
P
 
S
T
 
I
A
 
D
E
 
D
W
 
W
D
 
R
R
 
R
T
 
I
L
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
D
L
 
I
K
 
D
G
 
G
A
 
V
F
 
V
L
 
F
M
 
C
A
 
S
R
 
K
A
 
F
I
 
A
A
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
L
L
 
L
E
 
K
Q
 
T
G
 
-
S
 
K
G
 
G
R
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
 
T
A
 
A
S
|
S
Q
x
V
A
x
S
A
 
G
I
 
L
I
 
G
G
 
G
I
 
D
E
 
W
G
 
G
H
 
A
V
 
A
A
 
Y
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
A
I
 
V
I
 
V
G
 
N
M
 
L
T
 
T
N
 
R
C
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
L
E
 
D
W
 
H
G
 
G
P
 
G
R
 
D
G
 
G
V
 
V
T
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
V
 
V
S
 
C
P
 
P
T
 
S
V
 
L
V
|
V
E
 
K
T
|
T
E
 
N
L
 
M
G
 
-
L
 
T
T
 
N
G
 
G
W
 
W
A
 
P
G
 
Q
E
 
E
K
 
I
G
x
R
E
x
D
R
x
K
A
 
F
R
 
N
A
 
E
A
 
R
I
 
I
P
 
A
T
 
L
R
 
G
R
 
R
F
 
A
A
 
A
K
 
E
P
 
P
W
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
V
V
 
M
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
G
 
D
A
 
D
A
 
A
A
 
S
M
 
F
V
 
I
N
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
N
L
 
I
M
 
P
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
A
T
 
T

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>SMc02041 FitnessBrowser__Smeli:SMc02041
MTEIPSFDDLLDFSGKTVVVTGAATGIGRAVAEAFATKRARVALLDRDAAVSDVAVSLGT
GHIAHVADVTDEQGVERAVKSVTEAFGRIDILINNAGIGPLAPAESYPTAEWDRTLAVNL
KGAFLMARAIAPGMLEQGSGRIVNMASQAAIIGIEGHVAYCASKAGIIGMTNCMALEWGP
RGVTVNAVSPTVVETELGLTGWAGEKGERARAAIPTRRFAKPWEIAASVLYLAGGAAAMV
NGANLMIDGGYTIT

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory