SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMc02181 SMc02181 bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6x9dA Structure of proline utilization a with trans-4-hydroxy-l-proline bound in the l-glutamate-gamma-semialdehyde dehydrogenase active site (see paper)
100% identity, 99% coverage: 14:1233/1233 of query aligns to 1:1218/1218 of 6x9dA

query
sites
6x9dA
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
A
P
 
P
P
 
P
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
L
 
L
R
 
R
R
 
R
A
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
E
 
E
C
 
C
L
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
K
 
K
E
 
E
I
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
T
 
T
A
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
K
H
 
H
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
V
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
M
 
M
C
 
C
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
D
T
 
T
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
-
G
 
-
S
 
S
R
 
R
S
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
W
 
W
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
V
N
 
N
D
 
D
R
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
S
R
 
R
C
 
C
G
 
G
E
 
E
P
 
P
V
 
V
I
 
I
R
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
M
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
R
M
 
M
M
 
M
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
G
 
G
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
L
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
T
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
A
 
A
I
 
I
H
 
H
A
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
K
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
V
M
 
M
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
N
 
N
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
G
 
G
L
 
L
N
 
N
I
 
I
D
|
D
A
|
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
L
S
 
S
G
 
G
W
 
W
N
 
N
G
 
G
M
 
M
G
 
G
F
 
F
V
|
V
V
 
V
Q
|
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
R
C
 
C
P
 
P
F
 
F
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
F
I
 
I
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
R
S
 
S
G
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
I
M
 
M
V
 
V
R
|
R
L
 
L
V
|
V
K
|
K
G
|
G
A
|
A
Y
|
Y
W
|
W
D
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
D
F
 
F
P
 
P
V
 
V
F
|
F
T
|
T
R
|
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
T
|
T
D
 
D
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
A
|
A
T
|
T
H
|
H
N
|
N
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
H
 
H
M
 
M
A
 
A
G
 
G
K
 
K
D
 
D
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
Q
|
Q
C
|
C
L
 
L
H
 
H
G
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
G
 
G
K
 
K
L
 
L
D
 
D
R
 
R
P
 
P
C
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
S
S
|
S
F
|
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
N
 
N
D
 
D
P
 
P
K
 
K
V
 
V
S
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
V
E
 
E
V
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
A
M
 
M
P
 
P
V
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
K
H
 
H
D
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
G
D
 
D
A
 
A
R
 
R
T
 
T
N
 
N
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
S
N
 
N
E
 
E
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
S
 
S
A
 
A
A
 
A
M
 
M
K
 
K
W
 
W
T
 
T
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
H
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
T
 
T
E
 
E
T
 
T
S
 
S
E
 
E
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
P
 
P
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
V
 
V
P
 
P
P
 
P
S
 
S
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
C
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
I
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
V
R
 
R
E
|
E
A
 
A
I
 
I
D
 
D
F
 
F
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
R
 
R
T
 
T
L
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
G
H
 
H
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
I
V
 
V
C
 
C
I
|
I
S
|
S
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
|
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
I
|
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
|
K
P
 
P
A
|
A
E
|
E
E
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
G
|
G
R
 
R
V
 
V
G
|
G
A
|
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
T
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
M
 
M
F
 
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
E
 
E
V
|
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
I
 
I
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
A
 
A
M
 
M
I
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
D
S
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
|
R
C
|
C
S
|
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
T
 
T
M
 
M
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
L
H
 
H
E
 
E
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
D
 
D
V
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
E
 
E
A
 
A
K
 
K
D
 
D
N
 
N
I
 
I
E
 
E
K
 
K
H
 
H
I
 
I
E
 
E
R
 
R
M
 
M
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
K
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
E
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
F
V
 
V
P
 
P
P
 
P
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
E
|
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
H
 
H
V
 
V
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
D
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
D
D
 
D
V
 
V
N
 
N
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
F
 
F
G
 
G
L
 
L
H
 
H
T
 
T
R
 
R
L
 
L
D
 
D
E
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
T
 
T
S
 
S
R
 
R
I
 
I
K
 
K
A
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
R
 
R
N
 
N
I
 
I
I
 
I
G
|
G
A
|
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
K
A
|
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
T
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
V
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
H
 
H
S
 
S
S
 
S
V
 
V
H
 
H
T
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
A
 
A
K
 
K
W
 
W
L
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
N
 
N
A
 
A
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
E
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
R
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
T
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
R
V
 
V
S
 
S
W
 
W
S
 
S
K
 
K
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
S
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
C
 
C
L
 
L
N
 
N
W
 
W
L
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
A
S
 
S
I
 
I
N
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
L
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
G

7mybA Structure of proline utilization a with tetrahydrothiophene-2- carboxylate bound in the proline dehydrogenase active site (see paper)
100% identity, 99% coverage: 14:1233/1233 of query aligns to 1:1217/1217 of 7mybA

query
sites
7mybA
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
A
P
 
P
P
 
P
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
L
 
L
R
 
R
R
 
R
A
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
E
 
E
C
 
C
L
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
K
 
K
E
 
E
I
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
T
 
T
A
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
K
H
 
H
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
V
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
M
 
M
C
 
C
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
D
T
 
T
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
R
S
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
W
 
W
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
V
N
 
N
D
 
D
R
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
S
R
 
R
C
 
C
G
 
G
E
 
E
P
 
P
V
 
V
I
 
I
R
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
M
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
R
M
 
M
M
 
M
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
G
 
G
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
L
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
T
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
A
 
A
I
 
I
H
 
H
A
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
|
K
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
V
M
 
M
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
N
 
N
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
G
 
G
L
 
L
N
 
N
I
 
I
D
|
D
A
|
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
L
S
 
S
G
 
G
W
 
W
N
 
N
G
 
G
M
 
M
G
 
G
F
 
F
V
|
V
V
 
V
Q
|
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
R
C
 
C
P
 
P
F
 
F
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
F
I
 
I
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
R
S
 
S
G
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
I
M
 
M
V
 
V
R
|
R
L
 
L
V
|
V
K
|
K
G
|
G
A
|
A
Y
|
Y
W
|
W
D
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
D
F
 
F
P
 
P
V
 
V
F
|
F
T
|
T
R
|
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
T
|
T
D
 
D
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
A
|
A
T
|
T
H
|
H
N
|
N
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
H
 
H
M
 
M
A
 
A
G
 
G
K
 
K
D
 
D
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
Q
 
Q
C
|
C
L
|
L
H
 
H
G
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
G
 
G
K
 
K
L
 
L
D
 
D
R
 
R
P
 
P
C
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
L
 
L
V
 
V
R
|
R
R
|
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
S
S
|
S
F
|
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
N
 
N
D
 
D
P
 
P
K
 
K
V
 
V
S
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
V
E
 
E
V
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
A
M
 
M
P
 
P
V
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
K
H
 
H
D
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
G
D
 
D
A
 
A
R
 
R
T
 
T
N
 
N
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
S
N
 
N
E
 
E
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
S
 
S
A
 
A
A
 
A
M
 
M
K
 
K
W
 
W
T
 
T
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
H
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
T
 
T
E
 
E
T
 
T
S
 
S
E
 
E
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
P
 
P
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
V
 
V
P
 
P
P
 
P
S
 
S
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
C
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
I
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
I
D
 
D
F
 
F
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
R
 
R
T
 
T
L
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
G
H
 
H
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
I
V
 
V
C
 
C
I
|
I
S
|
S
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
I
|
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
|
K
P
 
P
A
 
A
E
|
E
E
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
G
|
G
R
 
R
V
 
V
G
|
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
T
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
M
 
M
F
 
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
E
 
E
V
|
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
I
|
I
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
I
 
I
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
A
 
A
M
 
M
I
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
D
S
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
C
|
C
S
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
T
 
T
M
 
M
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
L
H
 
H
E
 
E
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
D
 
D
V
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
E
 
E
A
 
A
K
 
K
D
 
D
N
 
N
I
 
I
E
 
E
K
 
K
H
 
H
I
 
I
E
 
E
R
 
R
M
 
M
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
K
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
E
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
F
V
 
V
P
 
P
P
 
P
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
E
|
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
H
 
H
V
 
V
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
D
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
D
D
 
D
V
 
V
N
 
N
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
F
 
F
G
 
G
L
 
L
H
 
H
T
 
T
R
 
R
L
 
L
D
 
D
E
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
T
 
T
S
 
S
R
 
R
I
 
I
K
 
K
A
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
R
 
R
N
 
N
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
T
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
V
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
H
 
H
S
 
S
S
 
S
V
 
V
H
 
H
T
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
A
 
A
K
 
K
W
 
W
L
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
N
 
N
A
 
A
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
E
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
R
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
T
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
R
V
 
V
S
 
S
W
 
W
S
 
S
K
 
K
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
S
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
C
 
C
L
 
L
N
 
N
W
 
W
L
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
A
S
 
S
I
 
I
N
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
L
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
G

7myaA Structure of proline utilization a with the fad covalently-modified by 1,3-dithiolane (see paper)
100% identity, 99% coverage: 14:1233/1233 of query aligns to 1:1217/1217 of 7myaA

query
sites
7myaA
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
A
P
 
P
P
 
P
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
L
 
L
R
 
R
R
 
R
A
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
E
 
E
C
 
C
L
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
K
 
K
E
 
E
I
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
T
 
T
A
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
K
H
 
H
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
V
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
M
 
M
C
 
C
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
D
T
 
T
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
R
S
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
W
 
W
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
V
N
 
N
D
 
D
R
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
S
R
 
R
C
 
C
G
 
G
E
 
E
P
 
P
V
 
V
I
 
I
R
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
M
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
R
M
 
M
M
 
M
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
G
 
G
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
L
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
T
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
A
 
A
I
 
I
H
 
H
A
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
K
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
V
M
 
M
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
N
 
N
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
G
 
G
L
 
L
N
 
N
I
 
I
D
|
D
A
|
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
L
S
 
S
G
 
G
W
 
W
N
 
N
G
 
G
M
 
M
G
 
G
F
 
F
V
|
V
V
 
V
Q
|
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
R
C
 
C
P
 
P
F
 
F
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
F
I
 
I
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
R
S
 
S
G
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
I
M
 
M
V
 
V
R
 
R
L
 
L
V
|
V
K
|
K
G
|
G
A
|
A
Y
 
Y
W
|
W
D
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
D
F
 
F
P
 
P
V
 
V
F
|
F
T
|
T
R
|
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
T
|
T
D
 
D
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
A
|
A
T
|
T
H
|
H
N
|
N
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
H
 
H
M
 
M
A
 
A
G
 
G
K
 
K
D
 
D
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
Q
|
Q
C
|
C
L
|
L
H
 
H
G
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
G
 
G
K
 
K
L
 
L
D
 
D
R
 
R
P
 
P
C
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
S
S
 
S
F
 
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
N
 
N
D
 
D
P
 
P
K
 
K
V
 
V
S
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
V
E
 
E
V
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
A
M
 
M
P
 
P
V
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
K
H
 
H
D
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
G
D
 
D
A
 
A
R
 
R
T
 
T
N
 
N
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
S
N
 
N
E
 
E
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
S
 
S
A
 
A
A
 
A
M
 
M
K
 
K
W
 
W
T
 
T
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
H
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
T
 
T
E
 
E
T
 
T
S
 
S
E
 
E
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
P
 
P
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
V
 
V
P
 
P
P
 
P
S
 
S
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
C
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
I
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
I
D
 
D
F
 
F
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
R
 
R
T
 
T
L
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
G
H
 
H
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
I
V
 
V
C
 
C
I
|
I
S
|
S
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
I
|
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
|
K
P
 
P
A
|
A
E
|
E
E
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
G
|
G
R
 
R
V
 
V
G
|
G
A
|
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
T
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
M
 
M
F
 
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
E
 
E
V
|
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
I
 
I
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
A
 
A
M
 
M
I
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
D
S
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
C
|
C
S
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
T
 
T
M
 
M
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
L
H
 
H
E
 
E
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
D
 
D
V
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
E
 
E
A
 
A
K
 
K
D
 
D
N
 
N
I
 
I
E
 
E
K
 
K
H
 
H
I
 
I
E
 
E
R
 
R
M
 
M
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
K
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
E
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
F
V
 
V
P
 
P
P
 
P
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
E
|
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
H
 
H
V
 
V
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
D
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
D
D
 
D
V
 
V
N
 
N
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
F
 
F
G
 
G
L
 
L
H
 
H
T
 
T
R
 
R
L
 
L
D
 
D
E
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
T
 
T
S
 
S
R
 
R
I
 
I
K
 
K
A
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
R
 
R
N
 
N
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
T
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
V
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
H
 
H
S
 
S
S
 
S
V
 
V
H
 
H
T
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
A
 
A
K
 
K
W
 
W
L
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
N
 
N
A
 
A
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
E
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
R
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
T
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
R
V
 
V
S
 
S
W
 
W
S
 
S
K
 
K
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
S
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
C
 
C
L
 
L
N
 
N
W
 
W
L
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
A
S
 
S
I
 
I
N
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
L
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
|
G

7my9A Structure of proline utilization a with 1,3-dithiolane-2-carboxylate bound in the proline dehydrogenase active site (see paper)
100% identity, 99% coverage: 14:1233/1233 of query aligns to 1:1216/1216 of 7my9A

query
sites
7my9A
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
A
P
 
P
P
 
P
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
L
 
L
R
 
R
R
 
R
A
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
E
 
E
C
 
C
L
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
K
 
K
E
 
E
I
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
T
 
T
A
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
K
H
 
H
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
V
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
M
 
M
C
 
C
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
D
T
 
T
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
S
 
S
H
 
H
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
R
S
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
W
 
W
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
V
N
 
N
D
 
D
R
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
S
R
 
R
C
 
C
G
 
G
E
 
E
P
 
P
V
 
V
I
 
I
R
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
M
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
R
M
 
M
M
 
M
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
G
 
G
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
L
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
T
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
A
 
A
I
 
I
H
 
H
A
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
K
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
V
M
 
M
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
N
 
N
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
G
 
G
L
 
L
N
 
N
I
 
I
D
|
D
A
|
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
L
S
 
S
G
 
G
W
 
W
N
 
N
G
 
G
M
 
M
G
 
G
F
 
F
V
|
V
V
 
V
Q
|
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
R
C
 
C
P
 
P
F
 
F
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
F
I
 
I
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
R
S
 
S
G
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
I
M
 
M
V
 
V
R
|
R
L
 
L
V
|
V
K
|
K
G
|
G
A
|
A
Y
|
Y
W
|
W
D
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
D
F
 
F
P
 
P
V
 
V
F
|
F
T
|
T
R
|
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
T
|
T
D
 
D
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
A
|
A
T
|
T
H
|
H
N
|
N
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
H
 
H
M
 
M
A
 
A
G
 
G
K
 
K
D
 
D
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
Q
 
Q
C
|
C
L
|
L
H
 
H
G
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
G
 
G
K
 
K
L
 
L
D
 
D
R
 
R
P
 
P
C
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
L
 
L
V
 
V
R
|
R
R
|
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
S
S
|
S
F
|
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
N
 
N
D
 
D
P
 
P
K
 
K
V
 
V
S
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
V
E
 
E
V
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
A
M
 
M
P
 
P
V
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
K
H
 
H
D
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
G
D
 
D
A
 
A
R
 
R
T
 
T
N
 
N
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
S
N
 
N
E
 
E
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
S
 
S
A
 
A
A
 
A
M
 
M
K
 
K
W
 
W
T
 
T
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
H
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
T
 
T
E
 
E
T
 
T
S
 
S
E
 
E
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
P
 
P
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
V
 
V
P
 
P
P
 
P
S
 
S
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
C
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
I
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
I
D
 
D
F
 
F
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
R
 
R
T
 
T
L
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
G
H
 
H
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
I
V
 
V
C
 
C
I
|
I
S
|
S
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
I
|
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
|
K
P
 
P
A
|
A
E
|
E
E
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
G
|
G
R
 
R
V
 
V
G
|
G
A
|
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
T
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
M
 
M
F
 
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
E
 
E
V
|
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
I
 
I
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
A
 
A
M
 
M
I
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
D
S
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
C
|
C
S
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
T
 
T
M
 
M
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
L
H
 
H
E
 
E
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
D
 
D
V
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
E
 
E
A
 
A
K
 
K
D
 
D
N
 
N
I
 
I
E
 
E
K
 
K
H
 
H
I
 
I
E
 
E
R
 
R
M
 
M
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
K
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
E
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
F
V
 
V
P
 
P
P
 
P
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
E
|
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
H
 
H
V
 
V
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
D
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
D
D
 
D
V
 
V
N
 
N
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
F
 
F
G
 
G
L
 
L
H
 
H
T
 
T
R
 
R
L
 
L
D
 
D
E
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
T
 
T
S
 
S
R
 
R
I
 
I
K
 
K
A
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
R
 
R
N
 
N
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
T
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
V
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
H
 
H
S
 
S
S
 
S
V
 
V
H
 
H
T
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
A
 
A
K
 
K
W
 
W
L
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
N
 
N
A
 
A
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
E
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
R
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
T
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
R
V
 
V
S
 
S
W
 
W
S
 
S
K
 
K
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
S
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
C
 
C
L
 
L
N
 
N
W
 
W
L
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
A
S
 
S
I
 
I
N
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
L
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
G

7mycA Structure of proline utilization a with the fad covalently modified by tetrahydrothiophene (see paper)
100% identity, 99% coverage: 14:1232/1233 of query aligns to 1:1216/1216 of 7mycA

query
sites
7mycA
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
A
P
 
P
P
 
P
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
L
 
L
R
 
R
R
 
R
A
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
E
 
E
C
 
C
L
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
K
 
K
E
 
E
I
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
T
 
T
A
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
K
H
 
H
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
V
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
M
 
M
C
 
C
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
D
T
 
T
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
R
S
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
W
 
W
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
V
N
 
N
D
 
D
R
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
S
R
 
R
C
 
C
G
 
G
E
 
E
P
 
P
V
 
V
I
 
I
R
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
M
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
R
M
 
M
M
 
M
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
G
 
G
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
L
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
T
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
A
 
A
I
 
I
H
 
H
A
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
|
K
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
V
M
 
M
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
N
 
N
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
G
 
G
L
 
L
N
 
N
I
 
I
D
|
D
A
|
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
L
S
 
S
G
 
G
W
 
W
N
 
N
G
 
G
M
 
M
G
 
G
F
 
F
V
|
V
V
 
V
Q
|
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
R
C
 
C
P
 
P
F
 
F
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
F
I
 
I
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
R
S
 
S
G
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
I
M
 
M
V
 
V
R
|
R
L
 
L
V
|
V
K
|
K
G
|
G
A
|
A
Y
|
Y
W
|
W
D
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
D
F
 
F
P
 
P
V
 
V
F
|
F
T
|
T
R
|
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
T
|
T
D
 
D
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
A
|
A
T
|
T
H
|
H
N
|
N
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
H
 
H
M
 
M
A
 
A
G
 
G
K
 
K
D
 
D
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
Q
|
Q
C
|
C
L
|
L
H
 
H
G
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
G
 
G
K
 
K
L
 
L
D
 
D
R
 
R
P
 
P
C
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
S
S
|
S
F
|
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
N
 
N
D
 
D
P
 
P
K
 
K
V
 
V
S
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
V
E
 
E
V
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
A
M
 
M
P
 
P
V
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
K
H
 
H
D
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
G
D
 
D
A
 
A
R
 
R
T
 
T
N
 
N
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
S
N
 
N
E
 
E
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
S
 
S
A
 
A
A
 
A
M
 
M
K
 
K
W
 
W
T
 
T
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
H
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
T
 
T
E
 
E
T
 
T
S
 
S
E
 
E
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
P
 
P
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
V
 
V
P
 
P
P
 
P
S
 
S
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
C
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
I
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
I
D
 
D
F
 
F
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
R
 
R
T
 
T
L
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
G
H
 
H
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
I
V
 
V
C
 
C
I
|
I
S
|
S
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
I
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
|
K
P
 
P
A
 
A
E
|
E
E
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
G
|
G
R
 
R
V
 
V
G
|
G
A
|
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
T
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
M
 
M
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
E
 
E
V
|
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
I
 
I
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
E
T
|
T
G
|
G
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
A
 
A
M
 
M
I
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
D
S
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
C
|
C
S
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
T
 
T
M
 
M
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
L
H
 
H
E
 
E
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
D
 
D
V
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
E
 
E
A
 
A
K
 
K
D
 
D
N
 
N
I
 
I
E
 
E
K
 
K
H
 
H
I
 
I
E
 
E
R
 
R
M
 
M
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
K
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
E
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
F
V
 
V
P
 
P
P
 
P
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
E
|
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
H
 
H
V
 
V
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
D
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
D
D
 
D
V
 
V
N
 
N
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
F
 
F
G
 
G
L
 
L
H
 
H
T
 
T
R
 
R
L
 
L
D
 
D
E
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
T
 
T
S
 
S
R
 
R
I
 
I
K
 
K
A
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
R
 
R
N
 
N
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
T
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
V
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
H
 
H
S
 
S
S
 
S
V
 
V
H
 
H
T
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
A
 
A
K
 
K
W
 
W
L
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
N
 
N
A
 
A
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
E
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
R
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
T
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
R
V
 
V
S
 
S
W
 
W
S
 
S
K
 
K
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
S
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
C
 
C
L
 
L
N
 
N
W
 
W
L
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
A
S
 
S
I
 
I
N
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
L
M
 
M
A
 
A
I
 
I

6x99A Structure of proline utilization a with d-proline bound in the l- glutamate-gamma-semialdehyde dehydrogenase active site (see paper)
100% identity, 99% coverage: 14:1233/1233 of query aligns to 1:1216/1216 of 6x99A

query
sites
6x99A
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
A
P
 
P
P
 
P
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
L
 
L
R
 
R
R
 
R
A
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
E
 
E
C
 
C
L
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
K
 
K
E
 
E
I
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
T
 
T
A
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
K
H
 
-
S
 
-
G
 
G
S
 
S
G
 
G
V
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
M
 
M
C
 
C
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
D
T
 
T
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
-
G
 
-
S
 
S
R
 
R
S
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
W
 
W
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
V
N
 
N
D
 
D
R
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
S
R
 
R
C
 
C
G
 
G
E
 
E
P
 
P
V
 
V
I
 
I
R
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
M
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
R
M
 
M
M
 
M
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
G
 
G
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
L
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
T
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
A
 
A
I
 
I
H
 
H
A
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
K
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
V
M
 
M
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
N
 
N
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
G
 
G
L
 
L
N
 
N
I
 
I
D
|
D
A
|
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
L
S
 
S
G
 
G
W
 
W
N
 
N
G
 
G
M
 
M
G
 
G
F
 
F
V
|
V
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
R
C
 
C
P
 
P
F
 
F
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
F
I
 
I
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
R
S
 
S
G
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
I
M
 
M
V
 
V
R
|
R
L
 
L
V
|
V
K
|
K
G
|
G
A
|
A
Y
|
Y
W
|
W
D
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
D
F
 
F
P
 
P
V
 
V
F
|
F
T
|
T
R
|
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
T
|
T
D
 
D
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
A
|
A
T
|
T
H
|
H
N
|
N
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
H
 
H
M
 
M
A
 
A
G
 
G
K
 
K
D
 
D
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
Q
|
Q
C
|
C
L
 
L
H
 
H
G
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
G
 
G
K
 
K
L
 
L
D
 
D
R
 
R
P
 
P
C
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
S
S
|
S
F
|
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
N
 
N
D
 
D
P
 
P
K
 
K
V
 
V
S
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
V
E
 
E
V
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
A
M
 
M
P
 
P
V
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
K
H
 
H
D
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
G
D
 
D
A
 
A
R
 
R
T
 
T
N
 
N
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
S
N
 
N
E
 
E
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
S
 
S
A
 
A
A
 
A
M
 
M
K
 
K
W
|
W
T
|
T
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
H
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
T
 
T
E
 
E
T
 
T
S
 
S
E
 
E
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
P
 
P
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
V
 
V
P
 
P
P
 
P
S
 
S
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
C
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
I
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
V
R
 
R
E
|
E
A
 
A
I
 
I
D
 
D
F
 
F
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
R
 
R
T
 
T
L
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
G
H
 
H
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
I
V
 
V
C
 
C
I
 
I
S
 
S
P
 
P
W
 
W
N
|
N
F
|
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
I
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
|
K
P
 
P
A
 
A
E
 
E
E
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
V
R
|
R
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
T
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
M
 
M
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
T
E
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
I
 
I
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
A
 
A
M
 
M
I
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
D
S
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
|
R
C
|
C
S
|
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
T
 
T
M
 
M
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
L
H
 
H
E
 
E
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
D
 
D
V
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
E
 
E
A
 
A
K
 
K
D
 
D
N
 
N
I
 
I
E
 
E
K
 
K
H
 
H
I
 
I
E
 
E
R
 
R
M
 
M
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
K
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
E
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
F
V
 
V
P
 
P
P
 
P
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
E
|
E
V
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
H
 
H
V
 
V
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
D
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
D
D
 
D
V
 
V
N
 
N
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
F
 
F
G
 
G
L
 
L
H
 
H
T
 
T
R
 
R
L
 
L
D
 
D
E
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
T
 
T
S
 
S
R
 
R
I
 
I
K
 
K
A
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
R
 
R
N
 
N
I
 
I
I
 
I
G
|
G
A
|
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
K
A
|
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
T
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
V
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
H
 
H
S
 
S
S
 
S
V
 
V
H
 
H
T
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
A
 
A
K
 
K
W
 
W
L
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
N
 
N
A
 
A
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
E
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
R
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
T
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
R
V
 
V
S
 
S
W
 
W
S
 
S
K
 
K
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
S
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
C
 
C
L
 
L
N
 
N
W
 
W
L
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
A
S
 
S
I
 
I
N
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
L
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
G

6x9bA Structure of proline utilization a with cis-4-hydroxy-d-proline bound in the l-glutamate-gamma-semialdehyde dehydrogenase active site (see paper)
100% identity, 99% coverage: 14:1233/1233 of query aligns to 1:1214/1214 of 6x9bA

query
sites
6x9bA
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
A
P
 
P
P
 
P
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
L
 
L
R
 
R
R
 
R
A
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
E
 
E
C
 
C
L
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
K
 
K
E
 
E
I
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
T
 
T
A
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
K
H
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
S
G
 
G
V
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
M
 
M
C
 
C
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
D
T
 
T
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
R
S
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
W
 
W
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
V
N
 
N
D
 
D
R
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
S
R
 
R
C
 
C
G
 
G
E
 
E
P
 
P
V
 
V
I
 
I
R
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
M
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
R
M
 
M
M
 
M
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
G
 
G
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
L
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
T
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
A
 
A
I
 
I
H
 
H
A
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
K
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
V
M
 
M
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
N
 
N
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
G
 
G
L
 
L
N
 
N
I
 
I
D
|
D
A
|
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
L
S
 
S
G
 
G
W
 
W
N
 
N
G
 
G
M
 
M
G
 
G
F
 
F
V
|
V
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
R
C
 
C
P
 
P
F
 
F
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
F
I
 
I
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
R
S
 
S
G
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
I
M
 
M
V
 
V
R
|
R
L
 
L
V
|
V
K
|
K
G
|
G
A
|
A
Y
|
Y
W
|
W
D
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
D
F
 
F
P
 
P
V
 
V
F
|
F
T
|
T
R
|
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
T
|
T
D
 
D
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
A
|
A
T
|
T
H
|
H
N
|
N
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
H
 
H
M
 
M
A
 
A
G
 
G
K
 
K
D
 
D
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
Q
|
Q
C
|
C
L
 
L
H
 
H
G
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
G
 
G
K
 
K
L
 
L
D
 
D
R
 
R
P
 
P
C
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
S
S
|
S
F
|
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
N
 
N
D
 
D
P
 
P
K
 
K
V
 
V
S
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
V
E
 
E
V
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
A
M
 
M
P
 
P
V
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
K
H
 
H
D
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
G
D
 
D
A
 
A
R
 
R
T
 
T
N
 
N
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
S
N
 
N
E
 
E
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
S
 
S
A
 
A
A
 
A
M
 
M
K
 
K
W
 
W
T
 
T
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
H
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
T
 
T
E
 
E
T
 
T
S
 
S
E
 
E
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
P
 
P
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
V
 
V
P
 
P
P
 
P
S
 
S
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
C
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
I
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
V
R
 
R
E
|
E
A
 
A
I
 
I
D
 
D
F
 
F
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
R
 
R
T
 
T
L
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
G
H
 
H
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
I
V
 
V
C
 
C
I
|
I
S
|
S
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
|
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
I
|
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
|
K
P
 
P
A
|
A
E
|
E
E
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
G
|
G
R
 
R
V
 
V
G
|
G
A
|
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
T
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
M
 
M
F
 
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
E
 
E
V
|
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
I
|
I
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
I
 
I
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
A
 
A
M
 
M
I
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
D
S
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
C
|
C
S
|
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
T
 
T
M
 
M
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
L
H
 
H
E
 
E
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
D
 
D
V
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
E
 
E
A
 
A
K
 
K
D
 
D
N
 
N
I
 
I
E
 
E
K
 
K
H
 
H
I
 
I
E
 
E
R
 
R
M
 
M
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
K
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
E
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
F
V
 
V
P
 
P
P
 
P
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
E
|
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
H
 
H
V
 
V
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
D
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
D
D
 
D
V
 
V
N
 
N
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
F
 
F
G
 
G
L
 
L
H
 
H
T
 
T
R
 
R
L
 
L
D
 
D
E
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
T
 
T
S
 
S
R
 
R
I
 
I
K
 
K
A
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
R
 
R
N
 
N
I
 
I
I
 
I
G
|
G
A
|
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
K
A
|
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
T
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
V
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
H
 
H
S
 
S
S
 
S
V
 
V
H
 
H
T
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
A
 
A
K
 
K
W
 
W
L
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
N
 
N
A
 
A
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
E
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
R
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
T
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
R
V
 
V
S
 
S
W
 
W
S
 
S
K
 
K
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
S
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
C
 
C
L
 
L
N
 
N
W
 
W
L
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
A
S
 
S
I
 
I
N
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
L
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
G

6x9aA Structure of proline utilization a with trans-4-hydroxy-d-proline bound in the l-glutamate-gamma-semialdehyde dehydrogenase active site (see paper)
100% identity, 99% coverage: 14:1233/1233 of query aligns to 1:1214/1214 of 6x9aA

query
sites
6x9aA
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
A
P
 
P
P
 
P
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
L
 
L
R
 
R
R
 
R
A
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
E
 
E
C
 
C
L
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
K
 
K
E
 
E
I
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
T
 
T
A
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
K
H
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
G
V
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
M
 
M
C
 
C
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
D
T
 
T
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
-
G
 
-
S
 
S
R
 
R
S
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
W
 
W
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
V
N
 
N
D
 
D
R
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
S
R
 
R
C
 
C
G
 
G
E
 
E
P
 
P
V
 
V
I
 
I
R
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
M
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
R
M
 
M
M
 
M
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
G
 
G
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
L
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
T
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
A
 
A
I
 
I
H
 
H
A
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
K
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
V
M
 
M
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
N
 
N
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
G
 
G
L
 
L
N
 
N
I
 
I
D
|
D
A
|
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
L
S
 
S
G
 
G
W
 
W
N
 
N
G
 
G
M
 
M
G
 
G
F
 
F
V
|
V
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
R
C
 
C
P
 
P
F
 
F
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
F
I
 
I
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
R
S
 
S
G
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
I
M
 
M
V
 
V
R
|
R
L
 
L
V
|
V
K
|
K
G
|
G
A
|
A
Y
|
Y
W
|
W
D
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
D
F
 
F
P
 
P
V
 
V
F
|
F
T
|
T
R
|
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
T
|
T
D
 
D
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
A
|
A
T
|
T
H
|
H
N
|
N
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
H
 
H
M
 
M
A
 
A
G
 
G
K
 
K
D
 
D
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
Q
 
Q
C
|
C
L
 
L
H
 
H
G
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
G
 
G
K
 
K
L
 
L
D
 
D
R
 
R
P
 
P
C
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
S
S
|
S
F
|
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
N
 
N
D
 
D
P
 
P
K
 
K
V
 
V
S
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
V
E
 
E
V
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
A
M
 
M
P
 
P
V
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
K
H
 
H
D
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
G
D
 
D
A
 
A
R
 
R
T
 
T
N
 
N
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
S
N
 
N
E
 
E
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
S
 
S
A
 
A
A
 
A
M
 
M
K
 
K
W
|
W
T
|
T
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
H
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
T
 
T
E
 
E
T
 
T
S
 
S
E
 
E
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
P
 
P
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
V
 
V
P
 
P
P
 
P
S
 
S
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
C
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
I
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
V
R
 
R
E
|
E
A
 
A
I
 
I
D
 
D
F
 
F
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
R
 
R
T
 
T
L
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
G
H
 
H
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
I
V
 
V
C
 
C
I
 
I
S
 
S
P
 
P
W
 
W
N
|
N
F
|
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
I
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
|
K
P
 
P
A
 
A
E
 
E
E
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
V
R
|
R
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
T
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
M
 
M
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
T
E
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
I
 
I
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
A
 
A
M
 
M
I
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
D
S
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
C
|
C
S
|
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
T
 
T
M
 
M
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
L
H
 
H
E
 
E
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
D
 
D
V
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
E
 
E
A
 
A
K
 
K
D
 
D
N
 
N
I
 
I
E
 
E
K
 
K
H
 
H
I
 
I
E
 
E
R
 
R
M
 
M
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
K
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
E
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
F
V
 
V
P
 
P
P
 
P
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
E
|
E
V
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
H
 
H
V
 
V
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
D
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
D
D
 
D
V
 
V
N
 
N
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
F
 
F
G
 
G
L
 
L
H
 
H
T
 
T
R
 
R
L
 
L
D
 
D
E
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
T
 
T
S
 
S
R
 
R
I
 
I
K
 
K
A
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
R
 
R
N
 
N
I
 
I
I
 
I
G
|
G
A
|
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
K
A
|
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
T
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
V
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
H
 
H
S
 
S
S
 
S
V
 
V
H
 
H
T
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
A
 
A
K
 
K
W
 
W
L
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
N
 
N
A
 
A
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
E
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
R
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
T
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
R
V
 
V
S
 
S
W
 
W
S
 
S
K
 
K
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
S
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
C
 
C
L
 
L
N
 
N
W
 
W
L
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
A
S
 
S
I
 
I
N
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
L
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
G

6x9cA Structure of proline utilization a with l-proline bound in the l- glutamate-gamma-semialdehyde dehydrogenase active site (see paper)
100% identity, 99% coverage: 15:1229/1233 of query aligns to 1:1209/1209 of 6x9cA

query
sites
6x9cA
P
 
P
A
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
A
P
 
P
P
 
P
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
L
 
L
R
 
R
R
 
R
A
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
E
 
E
C
 
C
L
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
K
 
K
E
 
E
I
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
T
 
T
A
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
K
H
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
S
G
 
G
V
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
M
 
M
C
 
C
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
D
T
 
T
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
R
S
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
W
 
W
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
V
N
 
N
D
 
D
R
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
S
R
 
R
C
 
C
G
 
G
E
 
E
P
 
P
V
 
V
I
 
I
R
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
M
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
R
M
 
M
M
 
M
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
G
 
G
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
L
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
T
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
A
 
A
I
 
I
H
 
H
A
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
K
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
V
M
 
M
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
N
 
N
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
G
 
G
L
 
L
N
 
N
I
 
I
D
|
D
A
|
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
L
S
 
S
G
 
G
W
 
W
N
 
N
G
 
G
M
 
M
G
 
G
F
 
F
V
|
V
V
 
V
Q
|
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
R
C
 
C
P
 
P
F
 
F
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
F
I
 
I
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
R
S
 
S
G
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
I
M
 
M
V
 
V
R
|
R
L
 
L
V
|
V
K
|
K
G
|
G
A
|
A
Y
|
Y
W
|
W
D
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
D
F
 
F
P
 
P
V
 
V
F
|
F
T
|
T
R
|
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
T
|
T
D
 
D
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
A
|
A
T
|
T
H
|
H
N
|
N
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
H
 
H
M
 
M
A
 
A
G
 
G
K
 
K
D
 
D
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
Q
|
Q
C
|
C
L
 
L
H
 
H
G
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
G
 
G
K
 
K
L
 
L
D
 
D
R
 
R
P
 
P
C
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
S
S
|
S
F
|
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
N
 
N
D
 
D
P
 
P
K
 
K
V
 
V
S
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
V
E
 
E
V
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
A
M
 
M
P
 
P
V
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
K
H
 
H
D
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
G
D
 
D
A
 
A
R
 
R
T
 
T
N
 
N
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
S
N
 
N
E
 
E
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
S
 
S
A
 
A
A
 
A
M
 
M
K
 
K
W
 
W
T
 
T
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
H
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
T
 
T
E
 
E
T
 
T
S
 
S
E
 
E
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
P
 
P
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
V
 
V
P
 
P
P
 
P
S
 
S
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
C
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
I
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
I
D
 
D
F
 
F
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
R
 
R
T
 
T
L
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
G
H
 
H
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
I
V
 
V
C
 
C
I
|
I
S
|
S
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
I
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
|
K
P
 
P
A
 
A
E
|
E
E
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
G
|
G
R
 
R
V
 
V
G
|
G
A
|
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
T
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
M
 
M
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
E
 
E
V
|
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
I
 
I
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
A
 
A
M
 
M
I
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
D
S
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
|
R
C
|
C
S
|
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
T
 
T
M
 
M
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
L
H
 
H
E
 
E
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
D
 
D
V
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
E
 
E
A
 
A
K
 
K
D
 
D
N
 
N
I
 
I
E
 
E
K
 
K
H
 
H
I
 
I
E
 
E
R
 
R
M
 
M
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
K
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
E
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
F
V
 
V
P
 
P
P
 
P
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
E
|
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
H
 
H
V
 
V
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
D
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
D
D
 
D
V
 
V
N
 
N
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
F
 
F
G
 
G
L
 
L
H
 
H
T
 
T
R
 
R
L
 
L
D
 
D
E
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
T
 
T
S
 
S
R
 
R
I
 
I
K
 
K
A
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
R
 
R
N
 
N
I
 
I
I
 
I
G
|
G
A
|
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
K
A
|
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
T
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
V
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
H
 
H
S
 
S
S
 
S
V
 
V
H
 
H
T
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
A
 
A
K
 
K
W
 
W
L
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
N
 
N
A
 
A
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
E
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
R
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
T
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
R
V
 
V
S
 
S
W
 
W
S
 
S
K
 
K
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
S
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
C
 
C
L
 
L
N
 
N
W
 
W
L
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
A
S
 
S
I
 
I
N
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
L

5kf6A Structure of proline utilization a from sinorhizobium meliloti complexed with l-tetrahydrofuroic acid and NAD+ in space group p21 (see paper)
99% identity, 99% coverage: 14:1231/1233 of query aligns to 1:1207/1207 of 5kf6A

query
sites
5kf6A
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
A
P
 
P
P
 
P
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
L
 
L
R
 
R
R
 
R
A
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
E
 
E
C
 
C
L
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
K
 
K
E
 
E
I
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
T
 
T
A
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
K
H
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
G
V
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
M
 
M
C
 
C
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
D
T
 
T
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
-
S
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
R
S
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
W
 
W
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
V
N
 
N
D
 
D
R
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
S
R
 
R
C
 
C
G
 
G
E
 
E
P
 
P
V
 
V
I
 
I
R
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
M
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
R
M
 
M
M
 
M
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
G
 
G
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
L
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
T
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
A
 
A
I
 
I
H
 
H
A
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
|
K
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
V
M
 
M
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
N
 
N
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
G
 
G
L
 
L
N
 
N
I
 
I
D
|
D
A
|
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
L
S
 
S
G
 
G
W
 
W
N
 
N
G
 
G
M
 
M
G
 
G
F
 
F
V
|
V
V
 
V
Q
|
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
R
C
 
C
P
 
P
F
 
F
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
F
I
 
I
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
R
S
 
S
G
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
I
M
 
M
V
 
V
R
|
R
L
 
L
V
|
V
K
|
K
G
|
G
A
|
A
Y
|
Y
W
|
W
D
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
D
F
 
F
P
 
P
V
 
V
F
|
F
T
|
T
R
|
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
T
|
T
D
 
D
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
A
|
A
T
|
T
H
|
H
N
|
N
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
H
 
H
M
 
M
A
 
A
G
 
G
K
 
K
D
 
D
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
Q
|
Q
C
|
C
L
|
L
H
 
H
G
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
G
 
G
K
 
K
L
 
L
D
 
D
R
 
R
P
 
P
C
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
R
|
R
R
|
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
S
S
|
S
F
|
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
N
 
N
D
 
D
P
 
P
K
 
K
V
 
V
S
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
V
E
 
E
V
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
A
M
 
M
P
 
P
V
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
K
H
 
H
D
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
G
D
 
D
A
 
A
R
 
R
T
 
T
N
 
N
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
S
N
 
N
E
 
E
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
S
 
S
A
 
A
A
 
A
M
 
M
K
 
K
W
 
W
T
 
T
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
H
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
T
 
T
E
 
E
T
 
T
S
 
S
E
 
E
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
P
 
P
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
V
 
V
P
 
P
P
 
P
S
 
S
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
C
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
I
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
I
D
 
D
F
 
F
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
R
 
R
T
 
T
L
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
G
H
 
H
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
I
V
 
V
C
 
C
I
|
I
S
|
S
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
I
|
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
|
K
P
 
P
A
|
A
E
|
E
E
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
G
|
G
R
 
R
V
 
V
G
|
G
A
|
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
T
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
M
 
M
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
E
 
E
V
|
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
I
|
I
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
I
 
I
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
A
 
A
M
 
M
I
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
D
S
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
C
|
C
S
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
T
 
T
M
 
M
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
L
H
 
H
E
 
E
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
D
 
D
V
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
E
 
E
A
 
A
K
 
K
D
 
D
N
 
N
I
 
I
E
 
E
K
 
K
H
 
H
I
 
I
E
 
E
R
 
R
M
 
M
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
K
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
E
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
F
V
 
V
P
 
P
P
 
P
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
E
|
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
H
 
H
V
 
V
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
D
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
D
D
 
D
V
 
V
N
 
N
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
F
 
F
G
 
G
L
 
L
H
 
H
T
 
T
R
 
R
L
 
L
D
 
D
E
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
T
 
T
S
 
S
R
 
R
I
 
I
K
 
K
A
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
R
 
R
N
 
N
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
K
A
|
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
T
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
V
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
H
 
H
S
 
S
S
 
S
V
 
V
H
 
H
T
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
A
 
A
K
 
K
W
 
W
L
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
N
 
N
A
 
A
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
E
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
R
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
T
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
R
V
 
V
S
 
S
W
 
W
S
 
S
K
 
K
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
S
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
C
 
C
L
 
L
N
 
N
W
 
W
L
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
A
S
 
S
I
 
I
N
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
L
M
 
M
A
 
A

6ufpA Structure of proline utilization a with the fad covalently modified by l-thiazolidine-2-carboxylate and three cysteines (cys46, cys470, cys638) modified to s,s-(2-hydroxyethyl)thiocysteine (see paper)
98% identity, 99% coverage: 14:1231/1233 of query aligns to 1:1197/1197 of 6ufpA

query
sites
6ufpA
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
A
P
 
P
P
 
P
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
L
 
L
R
 
R
R
 
R
A
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
E
 
E
C
 
C
L
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
K
 
K
E
 
E
I
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
T
 
T
A
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
K
H
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
G
V
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
M
 
M
C
 
C
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
D
T
 
T
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
S
 
S
H
 
H
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
R
S
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
W
 
W
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
V
N
 
N
D
 
D
R
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
S
R
 
R
C
 
C
G
 
G
E
 
E
P
 
P
V
 
V
I
 
I
R
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
M
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
R
M
 
M
M
 
M
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
G
 
G
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
L
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
T
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
A
 
A
I
 
I
H
 
H
A
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
|
K
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
V
M
 
M
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
N
 
N
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
G
 
G
L
 
L
N
 
N
I
 
I
D
|
D
A
|
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
L
S
 
S
G
 
G
W
 
W
N
 
N
G
 
G
M
 
M
G
 
G
F
 
F
V
|
V
V
 
V
Q
|
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
R
C
 
C
P
 
P
F
 
F
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
F
I
 
I
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
R
S
 
S
G
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
I
M
 
M
V
 
V
R
|
R
L
 
L
V
|
V
K
|
K
G
|
G
A
|
A
Y
 
Y
W
|
W
D
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
D
F
 
F
P
 
P
V
 
V
F
|
F
T
|
T
R
|
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
T
|
T
D
 
D
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
A
|
A
T
|
T
H
|
H
N
|
N
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
H
 
H
M
 
M
A
 
A
G
 
G
K
 
K
D
 
D
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
Q
|
Q
C
|
C
L
|
L
H
 
H
G
 
G
M
 
M
G
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
Y
 
-
E
 
-
E
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
L
D
 
D
R
 
R
P
 
P
C
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
L
 
L
V
 
V
R
|
R
R
|
R
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
S
S
|
S
F
 
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
N
 
N
D
 
D
P
 
P
K
 
K
V
 
V
S
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
V
E
 
E
V
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
A
M
 
M
P
 
P
V
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
K
H
 
H
D
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
G
D
 
D
A
 
A
R
 
R
T
 
T
N
 
N
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
S
N
 
N
E
 
E
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
S
 
S
A
 
A
A
 
A
M
 
M
K
 
K
W
 
W
T
 
T
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
R
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
H
 
H
R
 
R
D
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
T
 
T
E
 
E
T
 
T
S
 
S
E
 
E
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
P
 
P
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
V
 
V
P
 
P
P
 
P
S
 
S
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
C
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
I
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
I
D
 
D
F
 
F
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
R
 
R
T
 
T
L
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
G
H
 
H
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
I
V
 
V
C
 
C
I
|
I
S
 
S
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
I
|
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
|
K
P
 
P
A
 
A
E
|
E
E
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
G
|
G
R
 
R
V
 
V
G
|
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
T
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
M
 
M
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
E
 
E
V
|
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
I
 
I
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
A
 
A
M
 
M
I
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
D
S
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
C
|
C
S
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
T
 
T
M
 
M
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
L
H
 
H
E
 
E
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
D
 
D
V
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
S
E
 
E
A
 
A
K
 
K
D
 
D
N
 
N
I
 
I
E
 
E
K
 
K
H
 
H
I
 
I
E
 
E
R
 
R
M
 
M
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
K
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
E
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
F
V
 
V
P
 
P
P
 
P
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
E
|
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
H
 
H
V
 
V
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
D
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
D
D
 
D
V
 
V
N
 
N
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
F
 
F
G
 
G
L
 
L
H
 
H
T
 
T
R
 
R
L
 
L
D
 
D
E
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
T
 
T
S
 
S
R
 
R
I
 
I
K
 
K
A
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
R
 
R
N
 
N
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
K
A
|
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
T
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
V
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
H
 
H
S
 
S
S
 
S
V
 
V
H
 
H
T
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
A
 
A
K
 
K
W
 
W
L
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
N
 
N
A
 
A
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
E
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
R
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
H
 
H
A
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
T
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
R
V
 
V
S
 
S
W
 
W
S
 
S
K
 
K
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
S
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
C
 
C
L
 
L
N
 
N
W
 
W
L
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
A
S
 
S
I
 
I
N
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
L
M
 
M
A
 
A

6bsnA Structure of proline utilization a (puta) with proline bound in remote sites (see paper)
48% identity, 81% coverage: 35:1037/1233 of query aligns to 8:966/973 of 6bsnA

query
sites
6bsnA
I
 
F
T
 
T
A
 
A
A
 
P
Y
 
Y
R
 
A
R
 
P
P
 
D
E
 
D
T
 
A
E
 
E
C
 
I
L
 
A
P
 
A
P
 
R
L
 
L
V
 
L
E
 
P
A
 
A
A
 
S
T
 
H
Q
 
L
S
 
S
K
 
P
E
 
P
I
 
Q
R
 
E
D
 
A
A
 
R
A
 
I
A
 
H
S
 
R
T
 
T
A
 
A
R
 
T
K
 
R
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
R
G
 
K
K
 
R
H
 
L
S
 
G
G
 
G
S
 
-
G
 
-
V
 
V
E
 
E
G
 
D
L
 
M
V
 
L
Q
 
R
E
 
E
Y
 
F
S
 
A
L
 
L
S
 
S
S
 
T
Q
 
K
E
 
E
G
 
G
V
 
L
A
 
A
L
 
L
M
 
M
C
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
I
 
V
P
 
P
D
 
D
T
 
A
A
 
R
T
 
T
R
 
A
D
 
D
A
 
Q
L
 
F
I
 
I
R
 
E
D
 
D
K
 
K
I
 
L
A
 
G
D
 
E
G
 
G
N
 
D
W
 
F
K
 
I
S
 
H
H
 
H
L
 
E
G
 
T
G
 
K
S
 
S
R
 
T
S
 
A
L
 
F
F
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
S
T
 
A
W
 
W
G
 
A
L
 
L
V
 
I
V
 
Q
T
 
P
G
 
G
K
 
E
L
 
T
T
 
P
S
 
D
T
 
-
V
 
-
N
 
-
D
 
-
R
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
G
A
 
T
L
 
I
T
 
G
R
 
R
L
 
L
I
 
V
S
 
K
R
 
R
C
 
L
G
 
G
E
 
A
P
 
P
V
 
A
I
 
V
R
 
R
R
 
T
G
 
A
V
 
T
D
 
R
M
 
Q
A
 
A
M
 
M
R
 
R
M
 
L
M
 
M
G
 
G
E
 
N
Q
 
H
F
 
F
V
 
V
T
 
L
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
E
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
K
 
E
R
 
R
S
 
G
K
 
K
E
 
P
L
 
R
E
 
S
E
 
G
K
 
Q
G
 
K
F
 
T
S
 
R
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
F
D
 
D
M
 
M
L
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
G
A
 
A
T
 
R
T
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
R
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
F
R
 
D
D
 
A
Y
 
Y
E
 
A
S
 
S
A
 
A
I
 
I
H
 
E
A
 
T
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
A
A
 
G
G
 
N
R
 
H
G
 
A
I
 
L
Y
 
P
E
 
D
G
 
R
P
 
P
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
V
K
 
K
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
F
S
 
E
R
 
A
A
 
I
Q
 
S
A
 
R
A
 
A
R
 
R
V
 
V
M
 
M
G
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
V
P
 
P
R
 
Q
V
 
L
K
 
L
A
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
Q
L
 
R
A
 
A
K
 
K
N
 
A
Y
 
H
D
 
D
I
 
L
G
 
N
L
 
F
N
 
T
I
 
V
D
|
D
A
|
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
V
L
 
I
E
 
A
V
 
A
L
 
T
C
 
L
L
 
A
D
 
D
G
 
P
D
 
S
L
 
L
S
 
K
G
 
G
W
 
W
N
 
D
G
 
G
M
 
F
G
 
G
F
 
L
V
 
A
V
 
I
Q
|
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
Q
K
 
K
R
 
R
C
 
A
P
 
S
F
 
A
V
 
V
L
 
I
D
 
D
F
 
Y
I
 
V
I
 
D
D
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
A
S
 
H
G
 
D
R
 
R
R
 
K
I
 
L
M
 
M
V
 
V
R
|
R
L
 
L
V
|
V
K
|
K
G
|
G
A
|
A
Y
|
Y
W
|
W
D
 
D
A
 
T
E
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
E
D
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
D
D
 
G
F
 
Y
P
 
P
V
 
V
F
|
F
T
|
T
R
|
R
K
|
K
I
 
A
H
 
M
T
|
T
D
 
D
V
 
L
S
 
N
Y
 
Y
I
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
S
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
L
T
 
R
D
 
P
V
 
R
V
 
I
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
A
|
A
T
|
T
H
|
H
N
|
N
A
 
A
Q
 
L
T
 
T
L
 
V
A
 
A
A
 
T
I
 
V
Y
 
L
H
 
E
M
 
M
A
 
A
G
 
E
K
 
G
D
 
S
F
 
-
H
 
-
V
 
-
G
 
S
K
 
G
Y
 
F
E
 
E
F
 
F
Q
 
Q
C
 
R
L
 
L
H
 
H
G
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
P
 
A
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
E
 
Q
V
 
-
V
 
L
G
 
A
R
 
K
G
 
D
K
 
H
L
 
A
D
 
D
R
 
I
P
 
A
C
 
Y
R
 
R
I
 
T
Y
|
Y
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
S
H
 
H
E
 
R
T
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
S
S
|
S
F
|
F
V
 
V
H
 
A
R
 
Q
I
 
A
N
 
A
D
 
D
P
 
Y
K
 
R
V
 
V
S
 
P
I
 
V
D
 
P
E
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
Q
D
 
R
P
 
P
V
 
A
E
 
D
-
 
A
V
 
I
V
 
V
R
 
R
A
 
P
M
 
Q
P
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
A
A
 
A
K
 
A
H
 
H
D
 
P
R
 
R
I
 
I
A
 
P
L
 
L
P
 
P
A
 
C
E
 
D
L
 
L
F
 
F
G
 
A
D
 
P
A
 
E
R
 
R
T
 
R
N
 
N
S
 
S
A
 
R
G
 
G
L
 
V
D
 
E
L
 
F
S
 
G
N
 
A
E
 
R
E
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
M
 
-
K
 
-
W
 
-
T
 
T
A
 
A
L
 
L
P
 
D
Q
 
Q
L
 
L
A
 
L
T
 
T
G
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
-
R
 
-
T
 
-
V
 
-
L
 
-
N
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
-
H
 
-
R
 
-
D
 
D
V
 
V
V
 
K
G
 
A
S
 
E
V
 
I
T
 
A
E
 
D
T
 
A
S
 
T
E
 
P
E
 
D
D
 
Q
A
 
A
R
 
H
R
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
R
D
 
A
A
 
G
A
 
F
P
 
A
D
 
G
W
 
W
A
 
S
A
 
R
V
 
T
P
 
P
P
 
A
S
 
G
E
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
A
L
 
L
D
 
E
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
H
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
A
 
S
R
 
R
M
 
S
P
 
A
T
 
H
L
 
F
L
 
I
G
 
A
L
 
L
I
 
L
I
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
T
A
 
L
L
 
D
N
 
D
A
 
A
I
 
L
A
 
S
E
 
E
V
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
A
D
 
D
F
 
F
L
 
C
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
T
 
G
R
 
R
R
 
K
T
 
L
L
 
F
G
 
G
P
 
S
G
 
E
H
 
T
G
 
A
P
 
M
L
 
P
G
 
G
P
 
P
-
 
T
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
N
-
 
A
-
 
L
-
 
T
-
x
M
-
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
V
I
 
F
V
 
V
C
 
A
I
 
I
S
 
S
P
 
P
W
|
W
N
|
N
F
|
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
I
 
I
F
 
F
T
 
L
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
A
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
M
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
S
V
 
V
L
 
V
A
 
A
K
 
K
P
 
P
A
 
A
E
 
E
E
 
Q
T
 
T
P
 
P
L
 
R
I
 
I
A
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
A
V
 
V
R
 
A
I
 
L
L
 
L
R
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
A
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
Y
L
 
L
L
 
V
P
 
T
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
T
A
 
A
A
 
H
A
 
P
E
 
D
T
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
V
M
 
V
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
 
T
E
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
S
I
 
I
Q
 
N
A
 
R
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
A
R
 
K
L
 
D
S
 
G
P
 
P
A
 
I
G
 
-
R
 
-
P
 
-
I
 
V
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
I
N
 
N
A
 
A
M
 
M
I
 
I
V
 
A
D
 
D
S
 
A
S
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
P
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
V
 
A
G
 
D
D
 
D
V
 
V
I
 
V
T
 
T
S
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
R
S
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
|
R
C
x
A
S
|
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
L
L
 
L
C
 
F
L
 
V
Q
 
Q
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
M
L
 
I
T
 
E
M
 
M
L
 
V
K
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
A
H
 
R
E
 
E
L
 
L
H
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
D
T
 
P
D
 
S
R
 
D
L
 
V
S
 
A
V
 
T
D
 
H
V
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
I
T
 
D
S
 
V
E
 
E
A
 
A
K
 
K
D
 
Q
N
 
R
I
 
L
E
 
D
K
 
A
H
 
H
I
 
I
E
 
A
R
 
R
M
 
M
R
 
K
G
 
T
L
 
E
G
 
A
R
 
R
K
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
I
 
L
G
 
H
L
 
F
A
 
A
S
 
G
E
 
P
T
 
A
G
 
P
V
 
E
G
 
G
T
 
C
F
 
F
V
 
V
P
 
A
P
 
P
T
 
H
I
 
I
I
 
F
E
 
E
L
 
L
E
 
T
K
 
E
L
 
A
S
 
G
D
 
Q
L
 
L
Q
 
T
R
 
E
E
 
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
I
L
 
L
H
 
H
V
 
V
I
 
V
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
R
 
P
D
 
E
D
 
N
L
 
L
D
 
E
R
 
R
L
 
V
V
 
L
D
 
R
D
 
A
V
 
I
N
 
E
A
 
R
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
F
 
L
G
 
G
L
 
V
H
 
H
T
 
S
R
 
R
L
 
I
D
 
D
E
 
D
T
 
S
I
 
I
A
 
E
H
 
A
V
 
I
T
 
I
S
 
D
R
 
R
I
 
V
K
 
Q
A
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
I
Y
 
Y
I
 
V
N
 
N
R
 
R
N
 
N
I
 
M
I
|
I
G
|
G
A
|
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
R
 
N
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
K
A
|
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
H
Y
 
Y
L
 
L
G
x
A
R
|
R
L
 
F
V
x
A
T
 
T
T
 
E
A
 
Q
P
 
T
V
 
V

3hazA Crystal structure of bifunctional proline utilization a (puta) protein (see paper)
49% identity, 81% coverage: 35:1037/1233 of query aligns to 8:975/983 of 3hazA

query
sites
3hazA
I
 
F
T
 
T
A
 
A
A
 
P
Y
 
Y
R
 
A
R
 
P
P
 
D
E
 
D
T
 
A
E
 
E
C
 
I
L
 
A
P
 
A
P
 
R
L
 
L
V
 
L
E
 
P
A
 
A
A
 
S
T
 
H
Q
 
L
S
 
S
K
 
P
E
 
P
I
 
Q
R
 
E
D
 
A
A
 
R
A
 
I
A
 
H
S
 
R
T
 
T
A
 
A
R
 
T
K
 
R
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
R
G
 
K
K
 
R
H
 
R
S
 
L
G
 
G
S
 
-
G
 
G
V
 
V
E
 
E
G
 
D
L
 
M
V
 
L
Q
 
R
E
 
E
Y
 
F
S
 
A
L
 
L
S
 
S
S
 
T
Q
 
K
E
 
E
G
 
G
V
 
L
A
 
A
L
 
L
M
 
M
C
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
I
 
V
P
 
P
D
 
D
T
 
A
A
 
R
T
 
T
R
 
A
D
 
D
A
 
Q
L
 
F
I
 
I
R
 
E
D
 
D
K
 
K
I
 
L
A
 
G
D
 
E
G
 
G
N
 
D
W
 
F
K
 
I
S
 
H
H
 
H
L
 
E
G
 
T
G
 
K
S
 
S
R
 
T
S
 
A
L
 
F
F
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
S
T
 
A
W
 
W
G
 
A
L
 
A
V
 
R
V
 
V
T
 
I
G
 
Q
K
 
P
L
 
-
T
 
-
S
 
-
T
 
-
V
 
-
N
 
-
D
 
G
R
 
E
S
 
T
L
 
P
A
 
D
A
 
G
A
 
T
L
 
I
T
 
G
R
 
R
L
 
L
I
 
V
S
 
K
R
 
R
C
 
L
G
 
G
E
 
A
P
 
P
V
 
A
I
 
V
R
 
R
R
 
T
G
 
A
V
 
T
D
 
R
M
 
Q
A
 
A
M
 
M
R
 
R
M
 
L
M
 
M
G
 
G
E
 
N
Q
 
H
F
 
F
V
 
V
T
 
L
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
E
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
K
 
E
R
 
R
S
 
G
K
 
K
E
 
P
L
 
R
E
 
S
E
 
G
K
 
Q
G
 
K
F
 
T
S
 
R
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
F
D
 
D
M
 
M
L
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
G
A
 
A
T
 
R
T
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
R
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
F
R
 
D
D
 
A
Y
 
Y
E
 
A
S
 
S
A
 
A
I
 
I
H
 
E
A
 
T
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
A
A
 
G
G
 
N
R
 
H
G
 
A
I
 
L
Y
 
P
E
 
D
G
 
R
P
 
P
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
V
K
 
K
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
F
S
 
E
R
 
A
A
 
I
Q
 
S
A
 
R
A
 
A
R
 
R
V
 
V
M
 
M
G
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
V
P
 
P
R
 
Q
V
 
L
K
 
L
A
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
Q
L
 
R
A
 
A
K
 
K
N
 
A
Y
 
H
D
 
D
I
 
L
G
 
N
L
 
F
N
 
T
I
 
V
D
|
D
A
|
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
V
L
 
I
E
 
A
V
 
A
L
 
T
C
 
L
L
 
A
D
 
D
G
 
P
D
 
S
L
 
L
S
 
K
G
 
G
W
 
W
N
 
D
G
 
G
M
 
F
G
 
G
F
 
L
V
 
A
V
 
I
Q
|
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
Q
K
 
K
R
 
R
C
 
A
P
 
S
F
 
A
V
 
V
L
 
I
D
 
D
F
 
Y
I
 
V
I
 
D
D
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
A
S
 
H
G
 
D
R
 
R
R
 
K
I
 
L
M
 
M
V
 
V
R
|
R
L
 
L
V
|
V
K
|
K
G
|
G
A
|
A
Y
|
Y
W
|
W
D
 
D
A
 
T
E
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
E
D
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
D
D
 
G
F
 
Y
P
 
P
V
 
V
F
|
F
T
|
T
R
|
R
K
|
K
I
 
A
H
 
M
T
|
T
D
 
D
V
 
L
S
 
N
Y
 
Y
I
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
S
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
L
T
 
R
D
 
P
V
 
R
V
 
I
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
A
|
A
T
|
T
H
|
H
N
|
N
A
 
A
Q
 
L
T
 
T
L
 
V
A
 
A
A
 
T
I
 
V
Y
 
L
H
 
E
M
 
M
A
 
A
G
 
E
K
 
G
D
 
S
F
 
-
H
 
-
V
 
-
G
 
S
K
 
G
Y
 
F
E
 
E
F
 
F
Q
 
Q
C
 
R
L
 
L
H
 
H
G
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
P
 
A
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
E
 
Q
V
 
-
V
 
L
G
 
A
R
 
K
G
 
D
K
 
H
L
 
A
D
 
D
R
 
I
P
 
A
C
 
Y
R
 
R
I
 
T
Y
|
Y
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
S
H
 
H
E
 
R
T
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
S
S
|
S
F
|
F
V
 
V
H
 
A
R
 
Q
I
 
A
N
 
A
D
 
D
P
 
Y
K
 
R
V
 
V
S
 
P
I
 
V
D
 
P
E
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
Q
D
 
R
P
 
P
V
 
A
E
 
D
-
 
A
V
 
I
V
 
V
R
 
R
A
 
P
M
 
Q
P
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
A
A
 
A
K
 
A
H
 
H
D
 
P
R
 
R
I
 
I
A
 
P
L
 
L
P
 
P
A
 
C
E
 
D
L
 
L
F
 
F
G
 
A
D
 
P
A
 
E
R
 
R
T
 
R
N
 
N
S
 
S
A
 
R
G
 
G
L
 
V
D
 
E
L
 
F
S
 
G
N
 
A
E
 
R
E
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
M
 
-
K
 
-
W
 
-
T
 
T
A
 
A
L
 
L
P
 
D
Q
 
Q
L
 
L
A
 
L
T
 
T
G
 
D
P
 
V
A
 
K
A
 
A
G
 
-
E
 
E
T
 
T
R
 
-
T
 
-
V
 
-
L
 
-
N
 
-
P
 
-
G
 
G
D
 
D
H
 
-
R
 
-
D
 
-
V
 
-
V
 
L
G
 
K
S
 
P
V
 
I
T
 
A
E
 
D
T
 
A
S
 
T
E
 
P
E
 
D
D
 
Q
A
 
A
R
 
H
R
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
R
D
 
A
A
 
G
A
 
F
P
 
A
D
 
G
W
 
W
A
 
S
A
 
R
V
 
T
P
 
P
P
 
A
S
 
G
E
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
A
L
 
L
D
 
E
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
H
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
A
 
S
R
 
R
M
 
S
P
 
A
T
 
H
L
 
F
L
 
I
G
 
A
L
 
L
I
 
L
I
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
T
A
 
L
L
 
D
N
 
D
A
 
A
I
 
L
A
 
S
E
 
E
V
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
A
D
 
D
F
 
F
L
 
C
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
T
 
G
R
 
R
R
 
K
T
 
L
L
 
F
G
 
G
P
 
S
G
 
E
H
 
T
G
 
A
P
 
M
L
 
P
G
 
G
P
 
P
-
 
T
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
N
-
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
M
-
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
V
I
 
F
V
 
V
C
 
A
I
|
I
S
|
S
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
I
|
I
F
 
F
T
 
L
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
A
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
M
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
S
V
 
V
L
 
V
A
 
A
K
|
K
P
|
P
A
|
A
E
 
E
E
 
Q
T
 
T
P
 
P
L
 
R
I
 
I
A
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
A
V
 
V
R
 
A
I
 
L
L
 
L
R
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
A
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
Y
L
 
L
L
 
V
P
 
T
G
 
G
D
 
D
G
|
G
R
 
R
V
 
I
G
|
G
A
|
A
A
 
A
L
 
L
V
 
T
A
 
A
A
 
H
A
 
P
E
 
D
T
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
V
M
 
V
F
 
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
E
 
E
V
|
V
A
 
A
R
 
R
L
 
S
I
|
I
Q
 
N
A
 
R
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
A
R
 
K
L
 
D
S
 
G
P
 
P
A
 
I
G
 
-
R
 
-
P
 
-
I
 
V
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
I
N
 
N
A
 
A
M
 
M
I
 
I
V
 
A
D
 
D
S
 
A
S
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
P
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
V
 
A
G
 
D
D
 
D
V
 
V
I
 
V
T
 
T
S
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
R
S
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
C
|
C
S
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
L
L
 
L
C
 
F
L
 
V
Q
 
Q
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
M
L
 
I
T
 
E
M
 
M
L
 
V
K
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
A
H
 
R
E
 
E
L
 
L
H
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
D
T
 
P
D
 
S
R
 
D
L
 
V
S
 
A
V
 
T
D
 
H
V
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
I
T
 
D
S
 
V
E
 
E
A
 
A
K
 
K
D
 
Q
N
 
R
I
 
L
E
 
D
K
 
A
H
 
H
I
 
I
E
 
A
R
 
R
M
 
M
R
 
K
G
 
T
L
 
E
G
 
A
R
 
R
K
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
I
 
L
G
 
H
L
 
F
A
 
A
S
 
G
E
 
P
T
 
A
G
 
P
V
 
E
G
 
G
T
 
C
F
 
F
V
 
V
P
 
A
P
 
P
T
 
H
I
 
I
I
 
F
E
 
E
L
 
L
E
 
T
K
 
E
L
 
A
S
 
G
D
 
Q
L
 
L
Q
 
T
R
 
E
E
|
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
I
L
 
L
H
 
H
V
 
V
I
 
V
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
R
 
P
D
 
E
D
 
N
L
 
L
D
 
E
R
 
R
L
 
V
V
 
L
D
 
R
D
 
A
V
 
I
N
 
E
A
 
R
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
F
 
L
G
 
G
L
 
V
H
 
H
T
 
S
R
 
R
L
 
I
D
 
D
E
 
D
T
 
S
I
 
I
A
 
E
H
 
A
V
 
I
T
 
I
S
 
D
R
 
R
I
 
V
K
 
Q
A
 
V
G
 
G
N
 
N
L
 
I
Y
 
Y
I
 
V
N
 
N
R
 
R
N
 
N
I
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
R
 
N
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
K
A
|
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
H
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
R
 
R
L
 
F
V
 
A
T
 
T
T
 
E
A
 
Q
P
 
T
V
 
V

7sqnA Structure of the e. Coli puta proline dehydrogenase domain (residues 86-630) complexed with (2s)-oxetane-2-carboxylic acid (see paper)
66% identity, 41% coverage: 28:537/1233 of query aligns to 1:501/503 of 7sqnA

query
sites
7sqnA
Q
 
Q
S
 
S
T
 
V
L
 
S
R
 
R
R
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
E
 
E
C
 
A
L
 
V
P
 
S
P
 
M
L
 
L
V
 
L
E
 
E
A
 
Q
A
 
A
T
 
R
Q
 
L
S
 
P
K
 
Q
E
 
P
I
 
V
R
 
A
D
 
E
A
 
Q
A
 
A
A
 
H
S
 
K
T
 
L
A
 
A
R
 
Y
K
 
Q
L
 
L
I
 
A
E
 
D
A
 
K
L
 
L
R
 
R
G
 
N
K
 
Q
H
 
K
S
 
N
G
 
A
S
 
S
G
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
M
V
 
V
E
 
Q
G
 
G
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
F
S
 
S
L
 
L
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
M
 
M
C
 
C
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
D
T
 
K
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
S
D
 
N
G
 
G
N
 
N
W
 
-
K
 
-
S
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
-
S
 
-
L
 
L
F
 
F
V
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
W
 
W
G
 
G
L
 
L
V
 
L
V
 
F
T
 
A
G
 
-
K
 
-
L
 
-
T
 
-
S
 
-
T
 
-
V
 
-
N
 
-
D
 
-
R
 
-
S
 
S
L
 
L
A
 
S
A
 
R
A
 
S
L
 
L
T
 
N
R
 
R
L
 
I
I
 
I
S
 
G
R
 
K
C
 
S
G
 
G
E
 
E
P
 
P
V
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
M
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
R
M
 
L
M
 
M
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
A
R
 
N
S
 
A
K
 
R
E
 
K
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
G
 
G
F
 
F
S
 
R
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
L
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
Q
R
 
A
Y
 
Y
Y
 
M
R
 
V
D
 
S
Y
 
Y
E
 
Q
S
 
Q
A
 
A
I
 
I
H
 
H
A
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
S
A
 
N
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
|
K
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
A
 
Y
A
 
D
R
 
R
V
 
V
M
 
M
G
 
E
E
 
E
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
R
 
R
V
 
L
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
R
N
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
G
 
G
L
 
I
N
 
N
I
 
I
D
|
D
A
|
A
E
 
E
E
 
E
A
 
S
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
I
S
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
K
L
 
L
C
 
C
L
 
F
D
 
E
G
 
P
D
 
E
L
 
L
S
 
A
G
 
G
W
 
W
N
 
N
G
 
G
M
 
I
G
 
G
F
 
F
V
|
V
V
 
I
Q
|
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
Q
K
 
K
R
 
R
C
 
C
P
 
P
F
 
L
V
 
V
L
 
I
D
 
D
F
 
Y
I
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
T
R
 
R
S
 
S
G
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
L
M
 
M
V
 
I
R
|
R
L
 
L
V
|
V
K
|
K
G
|
G
A
|
A
Y
|
Y
W
|
W
D
 
D
A
 
S
E
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
M
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
E
D
 
G
F
 
Y
P
 
P
V
 
V
F
x
Y
T
|
T
R
|
R
K
|
K
I
 
V
H
 
Y
T
|
T
D
 
D
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
I
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
K
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
V
T
 
P
D
 
N
V
 
L
V
 
I
F
 
Y
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
A
|
A
T
|
T
H
|
H
N
|
N
A
 
A
Q
 
H
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
H
 
Q
M
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
D
 
N
F
 
Y
H
 
Y
V
 
P
G
 
G
K
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
Q
 
Q
C
|
C
L
|
L
H
 
H
G
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
E
 
Q
V
 
V
V
 
T
G
 
G
R
 
K
-
 
V
-
 
A
-
 
D
G
 
G
K
 
K
L
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
C
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
R
|
R
R
|
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
T
S
|
S
F
 
F
V
 
V
H
 
N
R
 
R
I
 
I
N
 
A
D
 
D
P
 
T
K
 
S
V
 
L
S
 
P
I
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
V
E
 
T
V
 
A
V
 
V
R
 
E
A
 
K
M
 
L
P
 
A
-
 
Q
-
 
Q
-
 
E
-
 
G
V
 
Q
V
 
T
G
 
G
A
 
L
K
 
P
H
 
H
D
 
P
R
 
K
I
 
I
A
 
P
L
 
L
P
 
P

8dkoB Minimal puta proline dehydrogenase domain (design #1) complexed with s-(-)-tetrahydro-2-furoic acid (see paper)
100% identity, 27% coverage: 190:526/1233 of query aligns to 57:393/393 of 8dkoB

query
sites
8dkoB
M
 
M
M
 
M
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
G
 
G
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
L
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
T
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
A
 
A
I
 
I
H
 
H
A
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
|
K
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
V
M
 
M
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
N
 
N
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
G
 
G
L
 
L
N
 
N
I
 
I
D
|
D
A
|
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
L
S
 
S
G
 
G
W
 
W
N
 
N
G
 
G
M
 
M
G
 
G
F
 
F
V
|
V
V
 
V
Q
|
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
R
C
 
C
P
 
P
F
 
F
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
F
I
 
I
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
R
S
 
S
G
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
I
M
 
M
V
 
V
R
|
R
L
 
L
V
|
V
K
|
K
G
|
G
A
|
A
Y
|
Y
W
|
W
D
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
D
F
 
F
P
 
P
V
 
V
F
|
F
T
|
T
R
|
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
T
|
T
D
 
D
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
A
|
A
T
|
T
H
|
H
N
|
N
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
H
 
H
M
 
M
A
 
A
G
 
G
K
 
K
D
 
D
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
Q
 
Q
C
|
C
L
|
L
H
 
H
G
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
G
 
G
K
 
K
L
 
L
D
 
D
R
 
R
P
 
P
C
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
R
|
R
R
|
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
S
S
|
S
F
|
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
N
 
N
D
 
D
P
 
P
K
 
K
V
 
V
S
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
V
E
 
E
V
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
A
M
 
M
P
 
P
V
 
V

7mwvA Structure of the e. Coli puta proline dehydrogenase domain (residues 86-630) complexed with cyclopropanecarboxylic acid (see paper)
65% identity, 41% coverage: 28:537/1233 of query aligns to 1:497/499 of 7mwvA

query
sites
7mwvA
Q
 
Q
S
 
S
T
 
V
L
 
S
R
 
R
R
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
E
 
E
C
 
A
L
 
V
P
 
S
P
 
M
L
 
L
V
 
L
E
 
E
A
 
Q
A
 
A
T
 
R
Q
 
L
S
 
P
K
 
Q
E
 
P
I
 
V
R
 
A
D
 
E
A
 
Q
A
 
A
A
 
H
S
 
K
T
 
L
A
 
A
R
 
Y
K
 
Q
L
 
L
I
 
A
E
 
D
A
 
K
L
 
L
R
 
R
G
 
N
K
 
Q
H
 
K
S
 
N
G
 
A
S
 
S
G
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
M
V
 
V
E
 
Q
G
 
G
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
F
S
 
S
L
 
L
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
M
 
M
C
 
C
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
D
T
 
K
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
W
 
-
K
 
-
S
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
-
S
 
-
L
 
L
F
 
F
V
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
W
 
W
G
 
G
L
 
L
V
 
L
V
 
F
T
 
A
G
 
-
K
 
-
L
 
-
T
 
-
S
 
-
T
 
-
V
 
-
N
 
-
D
 
-
R
 
-
S
 
S
L
 
L
A
 
S
A
 
R
A
 
S
L
 
L
T
 
N
R
 
R
L
 
I
I
 
I
S
 
G
R
 
K
C
 
S
G
 
G
E
 
E
P
 
P
V
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
M
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
R
M
 
L
M
 
M
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
A
R
 
N
S
 
A
K
 
R
E
 
K
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
G
 
G
F
 
F
S
 
R
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
L
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
Q
R
 
A
Y
 
Y
Y
 
M
R
 
V
D
 
S
Y
 
Y
E
 
Q
S
 
Q
A
 
A
I
 
I
H
 
H
A
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
S
A
 
N
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
|
K
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
A
 
Y
A
 
D
R
 
R
V
 
V
M
 
M
G
 
E
E
 
E
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
R
 
R
V
 
L
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
R
N
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
G
 
G
L
 
I
N
 
N
I
 
I
D
|
D
A
|
A
E
 
E
E
 
E
A
 
S
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
I
S
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
K
L
 
L
C
 
C
L
 
F
D
 
E
G
 
P
D
 
E
L
 
L
S
 
A
G
 
G
W
 
W
N
 
N
G
 
G
M
 
I
G
 
G
F
 
F
V
|
V
V
 
I
Q
|
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
Q
K
 
K
R
 
R
C
 
C
P
 
P
F
 
L
V
 
V
L
 
I
D
 
D
F
 
Y
I
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
T
R
 
R
S
 
S
G
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
L
M
 
M
V
 
I
R
|
R
L
 
L
V
|
V
K
|
K
G
|
G
A
|
A
Y
|
Y
W
|
W
D
 
D
A
 
S
E
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
M
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
E
D
 
G
F
 
Y
P
 
P
V
 
V
F
x
Y
T
|
T
R
|
R
K
|
K
I
 
V
H
 
Y
T
|
T
D
 
D
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
I
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
K
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
V
T
 
P
D
 
N
V
 
L
V
 
I
F
 
Y
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
A
|
A
T
|
T
H
|
H
N
|
N
A
 
A
Q
 
H
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
H
 
Q
M
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
D
 
N
F
 
Y
H
 
Y
V
 
P
G
 
G
K
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
Q
 
Q
C
|
C
L
|
L
H
 
H
G
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
E
 
Q
V
 
V
V
 
T
G
 
G
R
 
K
-
 
V
-
 
A
-
 
D
G
 
G
K
 
K
L
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
C
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
L
 
L
V
 
V
R
|
R
R
|
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
T
S
|
S
F
 
F
V
 
V
H
 
N
R
 
R
I
 
I
N
 
A
D
 
D
P
 
T
K
 
S
V
 
L
S
 
P
I
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
V
E
 
T
V
 
A
V
 
V
R
 
E
A
 
K
M
 
L
P
 
A
-
 
Q
-
 
Q
-
 
E
-
 
G
V
 
Q
V
 
T
G
 
G
A
 
L
K
 
P
H
 
H
D
 
P
R
 
K
I
 
I
A
 
P
L
 
L
P
 
P

7mwuA Structure of the e. Coli puta proline dehydrogenase domain (residues 86-630) complexed with cyclobutanecarboxylic acid (see paper)
65% identity, 41% coverage: 28:537/1233 of query aligns to 1:497/499 of 7mwuA

query
sites
7mwuA
Q
 
Q
S
 
S
T
 
V
L
 
S
R
 
R
R
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
E
 
E
C
 
A
L
 
V
P
 
S
P
 
M
L
 
L
V
 
L
E
 
E
A
 
Q
A
 
A
T
 
R
Q
 
L
S
 
P
K
 
Q
E
 
P
I
 
V
R
 
A
D
 
E
A
 
Q
A
 
A
A
 
H
S
 
K
T
 
L
A
 
A
R
 
Y
K
 
Q
L
 
L
I
 
A
E
 
D
A
 
K
L
 
L
R
 
R
G
 
N
K
 
Q
H
 
K
S
 
N
G
 
A
S
 
S
G
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
M
V
 
V
E
 
Q
G
 
G
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
F
S
 
S
L
 
L
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
M
 
M
C
 
C
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
D
T
 
K
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
W
 
-
K
 
-
S
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
-
S
 
-
L
 
L
F
 
F
V
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
W
 
W
G
 
G
L
 
L
V
 
L
V
 
F
T
 
A
G
 
-
K
 
-
L
 
-
T
 
-
S
 
-
T
 
-
V
 
-
N
 
-
D
 
-
R
 
-
S
 
S
L
 
L
A
 
S
A
 
R
A
 
S
L
 
L
T
 
N
R
 
R
L
 
I
I
 
I
S
 
G
R
 
K
C
 
S
G
 
G
E
 
E
P
 
P
V
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
M
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
R
M
 
L
M
 
M
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
A
R
 
N
S
 
A
K
 
R
E
 
K
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
G
 
G
F
 
F
S
 
R
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
L
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
Q
R
 
A
Y
 
Y
Y
 
M
R
 
V
D
 
S
Y
 
Y
E
 
Q
S
 
Q
A
 
A
I
 
I
H
 
H
A
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
S
A
 
N
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
|
K
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
A
 
Y
A
 
D
R
 
R
V
 
V
M
 
M
G
 
E
E
 
E
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
R
 
R
V
 
L
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
R
N
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
G
 
G
L
 
I
N
 
N
I
 
I
D
|
D
A
|
A
E
 
E
E
 
E
A
 
S
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
I
S
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
K
L
 
L
C
 
C
L
 
F
D
 
E
G
 
P
D
 
E
L
 
L
S
 
A
G
 
G
W
 
W
N
 
N
G
 
G
M
 
I
G
 
G
F
 
F
V
|
V
V
 
I
Q
|
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
Q
K
 
K
R
 
R
C
 
C
P
 
P
F
 
L
V
 
V
L
 
I
D
 
D
F
 
Y
I
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
T
R
 
R
S
 
S
G
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
L
M
 
M
V
 
I
R
|
R
L
 
L
V
|
V
K
|
K
G
|
G
A
|
A
Y
|
Y
W
|
W
D
 
D
A
 
S
E
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
M
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
E
D
 
G
F
 
Y
P
 
P
V
 
V
F
x
Y
T
|
T
R
|
R
K
|
K
I
 
V
H
 
Y
T
|
T
D
 
D
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
I
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
K
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
V
T
 
P
D
 
N
V
 
L
V
 
I
F
 
Y
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
A
|
A
T
|
T
H
|
H
N
|
N
A
 
A
Q
 
H
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
H
 
Q
M
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
D
 
N
F
 
Y
H
 
Y
V
 
P
G
 
G
K
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
Q
 
Q
C
|
C
L
|
L
H
 
H
G
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
E
 
Q
V
 
V
V
 
T
G
 
G
R
 
K
-
 
V
-
 
A
-
 
D
G
 
G
K
 
K
L
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
C
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
L
 
L
V
 
V
R
|
R
R
|
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
T
S
|
S
F
 
F
V
 
V
H
 
N
R
 
R
I
 
I
N
 
A
D
 
D
P
 
T
K
 
S
V
 
L
S
 
P
I
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
V
E
 
T
V
 
A
V
 
V
R
 
E
A
 
K
M
 
L
P
 
A
-
 
Q
-
 
Q
-
 
E
-
 
G
V
 
Q
V
 
T
G
 
G
A
 
L
K
 
P
H
 
H
D
 
P
R
 
K
I
 
I
A
 
P
L
 
L
P
 
P

7mwtA Structure of the e. Coli puta proline dehydrogenase domain (residues 86-630) complexed with 1,1-cyclobutanedicarboxylate (see paper)
65% identity, 41% coverage: 28:537/1233 of query aligns to 1:497/499 of 7mwtA

query
sites
7mwtA
Q
 
Q
S
 
S
T
 
V
L
 
S
R
 
R
R
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
E
 
E
C
 
A
L
 
V
P
 
S
P
 
M
L
 
L
V
 
L
E
 
E
A
 
Q
A
 
A
T
 
R
Q
 
L
S
 
P
K
 
Q
E
 
P
I
 
V
R
 
A
D
 
E
A
 
Q
A
 
A
A
 
H
S
 
K
T
 
L
A
 
A
R
 
Y
K
 
Q
L
 
L
I
 
A
E
 
D
A
 
K
L
 
L
R
 
R
G
 
N
K
 
Q
H
 
K
S
 
N
G
 
A
S
 
S
G
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
M
V
 
V
E
 
Q
G
 
G
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
F
S
 
S
L
 
L
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
M
 
M
C
 
C
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
D
T
 
K
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
W
 
-
K
 
-
S
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
-
S
 
-
L
 
L
F
 
F
V
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
W
 
W
G
 
G
L
 
L
V
 
L
V
 
F
T
 
A
G
 
-
K
 
-
L
 
-
T
 
-
S
 
-
T
 
-
V
 
-
N
 
-
D
 
-
R
 
-
S
 
S
L
 
L
A
 
S
A
 
R
A
 
S
L
 
L
T
 
N
R
 
R
L
 
I
I
 
I
S
 
G
R
 
K
C
 
S
G
 
G
E
 
E
P
 
P
V
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
M
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
R
M
 
L
M
 
M
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
A
R
 
N
S
 
A
K
 
R
E
 
K
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
G
 
G
F
 
F
S
 
R
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
L
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
Q
R
 
A
Y
 
Y
Y
 
M
R
 
V
D
 
S
Y
 
Y
E
 
Q
S
 
Q
A
 
A
I
 
I
H
 
H
A
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
S
A
 
N
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
|
K
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
A
 
Y
A
 
D
R
 
R
V
 
V
M
 
M
G
 
E
E
 
E
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
R
 
R
V
 
L
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
R
N
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
G
 
G
L
 
I
N
 
N
I
 
I
D
|
D
A
|
A
E
 
E
E
 
E
A
 
S
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
I
S
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
K
L
 
L
C
 
C
L
 
F
D
 
E
G
 
P
D
 
E
L
 
L
S
 
A
G
 
G
W
 
W
N
 
N
G
 
G
M
 
I
G
 
G
F
 
F
V
|
V
V
 
I
Q
|
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
Q
K
 
K
R
 
R
C
 
C
P
 
P
F
 
L
V
 
V
L
 
I
D
 
D
F
 
Y
I
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
T
R
 
R
S
 
S
G
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
L
M
 
M
V
 
I
R
|
R
L
 
L
V
|
V
K
|
K
G
|
G
A
|
A
Y
|
Y
W
|
W
D
 
D
A
 
S
E
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
M
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
E
D
 
G
F
 
Y
P
 
P
V
 
V
F
x
Y
T
|
T
R
|
R
K
|
K
I
 
V
H
 
Y
T
|
T
D
 
D
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
I
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
K
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
V
T
 
P
D
 
N
V
 
L
V
 
I
F
 
Y
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
A
|
A
T
|
T
H
|
H
N
|
N
A
 
A
Q
 
H
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
H
 
Q
M
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
D
 
N
F
 
Y
H
 
Y
V
 
P
G
 
G
K
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
Q
 
Q
C
|
C
L
|
L
H
 
H
G
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
E
 
Q
V
 
V
V
 
T
G
 
G
R
 
K
-
 
V
-
 
A
-
 
D
G
 
G
K
 
K
L
 
L
D
 
N
R
 
R
P
 
P
C
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
L
 
L
V
 
V
R
|
R
R
|
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
T
S
|
S
F
 
F
V
 
V
H
 
N
R
 
R
I
 
I
N
 
A
D
 
D
P
 
T
K
 
S
V
 
L
S
 
P
I
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
V
E
 
T
V
 
A
V
 
V
R
 
E
A
 
K
M
 
L
P
 
A
-
 
Q
-
 
Q
-
 
E
-
 
G
V
 
Q
V
 
T
G
 
G
A
 
L
K
 
P
H
 
H
D
 
P
R
 
K
I
 
I
A
 
P
L
 
L
P
 
P

8dkqA Minimal puta proline dehydrogenase domain (design #2) complexed with 2-(furan-2-yl)acetic acid (see paper)
90% identity, 29% coverage: 162:521/1233 of query aligns to 6:381/381 of 8dkqA

query
sites
8dkqA
R
 
R
S
 
A
L
 
I
A
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
Y
T
 
R
R
 
R
L
 
P
I
 
E
S
 
T
R
 
E
C
 
C
G
 
L
E
 
P
P
 
P
V
 
L
I
 
V
R
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
T
-
 
Q
-
 
S
-
 
K
-
 
E
-
 
I
-
 
R
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
T
-
 
A
R
 
R
G
 
K
V
 
L
D
 
I
M
 
E
A
 
A
M
 
L
R
 
R
M
 
G
M
 
K
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
G
 
G
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
L
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
T
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
A
 
A
I
 
I
H
 
H
A
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
|
K
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
V
M
 
M
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
N
 
N
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
G
 
G
L
 
L
N
 
N
I
 
I
D
|
D
A
|
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
L
S
 
S
G
 
G
W
 
W
N
 
N
G
 
G
M
 
M
G
 
G
F
 
F
V
|
V
V
 
V
Q
|
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
R
C
 
C
P
 
P
F
 
F
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
F
I
 
I
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
R
S
 
S
G
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
I
M
 
M
V
 
V
R
|
R
L
 
L
V
|
V
K
|
K
G
|
G
A
|
A
Y
|
Y
W
|
W
D
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
D
F
 
F
P
 
P
V
 
V
F
|
F
T
|
T
R
|
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
T
|
T
D
 
D
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
A
|
A
T
|
T
H
|
H
N
|
N
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
H
 
H
M
 
M
A
 
A
G
 
G
K
 
K
D
 
D
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
Q
 
Q
C
|
C
L
|
L
H
 
H
G
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
G
 
G
K
 
K
L
 
L
D
 
D
R
 
R
P
 
P
C
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
R
|
R
R
|
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
S
S
|
S
F
|
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
N
 
N
D
 
D
P
 
P
K
 
K
V
 
V
S
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
V
E
 
E
V
 
V
V
 
V

8dkqB Minimal puta proline dehydrogenase domain (design #2) complexed with 2-(furan-2-yl)acetic acid (see paper)
100% identity, 27% coverage: 192:521/1233 of query aligns to 59:388/388 of 8dkqB

query
sites
8dkqB
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
G
 
G
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
L
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
T
T
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
A
 
A
I
 
I
H
 
H
A
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
|
K
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
V
M
 
M
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
N
 
N
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
G
 
G
L
 
L
N
 
N
I
 
I
D
|
D
A
|
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
V
L
 
L
C
 
C
L
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
L
S
 
S
G
 
G
W
 
W
N
 
N
G
 
G
M
 
M
G
 
G
F
 
F
V
|
V
V
 
V
Q
|
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
R
C
 
C
P
 
P
F
 
F
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
F
I
 
I
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
R
S
 
S
G
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
I
M
 
M
V
 
V
R
|
R
L
 
L
V
|
V
K
|
K
G
|
G
A
|
A
Y
|
Y
W
|
W
D
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
I
K
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
D
F
 
F
P
 
P
V
 
V
F
|
F
T
|
T
R
|
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
T
|
T
D
 
D
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
A
|
A
T
|
T
H
|
H
N
|
N
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
H
 
H
M
 
M
A
 
A
G
 
G
K
 
K
D
 
D
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
Q
|
Q
C
|
C
L
|
L
H
 
H
G
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
G
 
G
K
 
K
L
 
L
D
 
D
R
 
R
P
 
P
C
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
R
|
R
R
|
R
L
 
L
L
 
L
E
|
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
S
S
|
S
F
|
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
N
 
N
D
 
D
P
 
P
K
 
K
V
 
V
S
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
V
E
 
E
V
 
V
V
 
V

Query Sequence

>SMc02181 SMc02181 bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase
MSPNPLQKPAIDAAPAPFADFAPPVRPQSTLRRAITAAYRRPETECLPPLVEAATQSKEI
RDAAASTARKLIEALRGKHSGSGVEGLVQEYSLSSQEGVALMCLAEALLRIPDTATRDAL
IRDKIADGNWKSHLGGSRSLFVNAATWGLVVTGKLTSTVNDRSLAAALTRLISRCGEPVI
RRGVDMAMRMMGEQFVTGETIREALKRSKELEEKGFSYSYDMLGEAATTAADAERYYRDY
ESAIHAIGKASAGRGIYEGPGISIKLSALHPRYSRAQAARVMGELLPRVKALALLAKNYD
IGLNIDAEEADRLELSLDLLEVLCLDGDLSGWNGMGFVVQAYGKRCPFVLDFIIDLARRS
GRRIMVRLVKGAYWDAEIKRAQLDGLADFPVFTRKIHTDVSYIACAAKLLAATDVVFPQF
ATHNAQTLAAIYHMAGKDFHVGKYEFQCLHGMGEPLYEEVVGRGKLDRPCRIYAPVGTHE
TLLAYLVRRLLENGANSSFVHRINDPKVSIDELIADPVEVVRAMPVVGAKHDRIALPAEL
FGDARTNSAGLDLSNEETLASLTEALRESAAMKWTALPQLATGPAAGETRTVLNPGDHRD
VVGSVTETSEEDARRAVRLAADAAPDWAAVPPSERAACLDRAAELMQARMPTLLGLIIRE
AGKSALNAIAEVREAIDFLRYYAEQTRRTLGPGHGPLGPIVCISPWNFPLAIFTGQIAAA
LVAGNPVLAKPAEETPLIAAEGVRILREAGIPASALQLLPGDGRVGAALVAAAETAGVMF
TGSTEVARLIQAQLADRLSPAGRPIPLIAETGGQNAMIVDSSALAEQVVGDVITSAFDSA
GQRCSALRVLCLQEDVADRILTMLKGALHELHIGRTDRLSVDVGPVITSEAKDNIEKHIE
RMRGLGRKVEQIGLASETGVGTFVPPTIIELEKLSDLQREVFGPVLHVIRYRRDDLDRLV
DDVNATGYGLTFGLHTRLDETIAHVTSRIKAGNLYINRNIIGAVVGVQPFGGRGLSGTGP
KAGGPLYLGRLVTTAPVPPQHSSVHTDPVLLDFAKWLDGKGARAEAEAARNAGSSSALGL
DLELPGPVGERNLYTLHARGRILLVPATESGLYHQLAAALATGNSVAIDAASGLQASLKN
LPQTVGLRVSWSKDWAADGPFAGALVEGDAERIRAVNKAIAALPGPLLLVQAASSGEIAR
NPDAYCLNWLVEEVSASINTAAAGGNASLMAIG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory